SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing SMc02227 FitnessBrowser__Smeli:SMc02227 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

8oqlA Structure of mycobacterium tuberculosis beta-oxidation trifunctional enzyme in complex with fragment-m-1
43% identity, 96% coverage: 1:709/737 of query aligns to 9:722/728 of 8oqlA

query
sites
8oqlA
M
 
M
S
 
P
Y
 
D
T
 
N
N
 
T
F
 
I
K
 
Q
I
 
W
E
 
D
T
 
K
D
 
D
A
 
A
D
 
D
G
 
G
I
 
I
A
 
V
L
 
T
V
 
L
T
 
T
W
 
M
D
 
D
M
 
D
P
 
P
D
 
S
K
 
G
S
 
S
M
 
T
N
 
N
V
|
V
F
 
M
T
x
N
E
 
E
E
 
A
V
 
Y
M
 
I
K
 
E
E
 
S
L
 
M
D
 
G
A
 
K
I
 
A
I
 
V
D
 
D
Q
 
R
T
 
L
T
 
V
A
 
A
D
 
E
P
 
K
-
 
D
A
 
S
V
 
I
K
 
T
G
 
G
V
 
V
V
 
V
I
 
V
T
 
A
S
 
S
G
 
A
K
 
K
S
 
K
S
 
T
F
 
F
S
 
F
G
 
A
G
|
G
A
 
G
D
|
D
L
 
-
S
 
-
M
 
-
I
x
V
K
|
K
S
 
T
M
|
M
F
 
I
T
 
Q
F
 
A
Q
 
R
A
 
P
E
 
E
E
 
D
R
 
-
K
 
-
K
 
-
D
 
-
P
 
-
D
 
-
N
 
-
A
 
-
A
 
A
R
 
G
K
 
D
L
x
V
F
 
F
D
 
N
L
x
T
V
 
V
G
 
E
R
 
T
M
 
I
T
 
K
G
 
R
L
 
Q
F
 
L
R
 
R
K
 
T
L
 
L
E
 
E
T
 
T
S
 
L
G
 
G
K
 
K
P
 
P
W
 
V
V
 
V
S
 
A
A
 
A
I
 
I
N
 
N
G
 
G
T
 
A
C
 
A
M
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
G
F
 
L
E
 
E
M
 
I
S
 
A
L
 
L
A
 
A
C
 
C
H
 
H
G
 
H
R
 
R
V
 
I
A
 
A
S
 
A
N
 
D
A
 
V
K
 
K
S
 
G
V
 
S
K
 
Q
I
 
L
A
 
G
L
 
L
P
|
P
E
|
E
V
 
V
K
 
T
V
x
L
G
 
G
I
 
L
F
 
L
P
 
P
G
 
G
A
 
G
G
 
G
G
 
G
T
 
V
Q
 
T
R
 
R
V
 
T
P
 
V
R
 
R
L
 
M
T
 
F
N
 
G
T
 
I
Q
 
Q
D
 
N
A
 
A
-
 
F
L
 
V
Q
 
S
M
 
V
M
 
L
T
 
A
T
x
Q
G
 
G
S
 
T
S
 
R
L
 
F
T
 
K
P
 
P
A
 
A
R
 
K
A
 
A
K
 
K
A
 
E
M
 
I
G
 
G
L
 
L
V
 
V
H
 
D
E
 
E
V
 
L
V
 
V
D
 
A
P
 
T
-
 
V
D
 
E
K
 
E
L
 
L
I
 
V
E
 
P
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
M
 
W
I
 
I
K
 
K
N
 
E
G
 
E
L
 
L
K
 
K
P
 
A
-
 
N
-
 
P
-
 
D
-
 
G
-
 
A
-
 
G
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
W
 
W
D
 
D
E
 
K
K
 
K
G
 
G
F
 
Y
K
 
K
L
 
M
P
 
P
G
 
G
G
 
G
G
 
T
I
 
P
W
 
S
T
 
S
P
 
P
A
 
G
S
 
L
A
 
A
Q
 
A
L
 
I
W
 
L
P
 
P
A
 
S
A
 
F
S
 
P
G
 
S
I
 
N
L
 
L
R
 
R
R
 
K
E
x
Q
T
 
L
Y
 
K
G
 
G
N
 
A
-
 
P
Y
 
M
P
 
P
G
 
A
A
 
P
I
 
R
A
 
A
I
 
I
L
 
L
K
 
A
C
 
A
V
 
A
Y
 
V
E
 
E
G
 
G
L
 
A
Q
 
Q
V
 
V
P
 
D
F
 
F
D
 
D
T
 
T
A
 
A
L
 
S
K
 
R
I
 
I
E
 
E
Q
 
S
R
 
R
Y
 
Y
F
 
F
T
 
A
E
 
S
I
 
L
L
 
V
Q
 
T
T
 
G
T
 
Q
E
 
V
A
 
A
F
 
K
S
 
N
M
 
M
I
 
M
R
 
Q
S
 
A
L
 
F
F
 
F
V
 
F
S
 
D
M
 
L
Q
 
Q
E
 
A
L
 
I
G
 
N
K
 
A
G
 
G
A
 
G
R
 
S
R
 
R
P
 
P
A
 
E
G
 
G
V
 
I
P
 
G
K
 
K
T
 
T
E
 
P
L
 
I
K
 
K
K
 
R
V
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
G
F
 
M
M
 
M
G
 
G
A
 
A
S
 
G
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
T
 
S
A
 
A
A
 
K
G
 
A
G
 
G
I
 
Y
P
 
E
V
 
V
T
 
V
L
 
L
I
x
K
D
|
D
R
x
V
D
 
S
M
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
A
E
 
A
K
 
K
G
 
G
K
 
K
T
 
G
H
 
Y
S
 
S
E
 
E
G
 
K
L
 
L
V
 
E
K
 
A
D
 
K
A
 
A
I
 
L
G
 
E
K
 
R
G
 
G
R
 
R
L
 
T
T
 
T
K
 
Q
E
 
E
E
 
R
G
 
S
E
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
L
S
 
A
R
 
R
I
 
I
T
 
T
P
 
P
S
 
T
A
 
A
D
 
D
Y
 
A
G
 
A
D
 
D
L
 
F
R
 
K
D
 
G
A
 
V
G
 
D
L
 
F
V
 
V
I
 
I
E
 
E
A
 
A
V
 
V
F
 
F
E
 
E
D
 
N
R
 
Q
Q
 
E
V
 
L
K
 
K
K
 
H
D
 
K
V
|
V
I
 
F
E
 
G
K
 
E
V
 
I
E
 
E
A
 
D
V
 
I
I
 
V
A
 
E
E
 
P
D
 
N
A
 
A
I
 
I
F
 
L
A
 
G
S
 
S
N
 
N
T
 
T
S
 
S
T
 
T
L
 
L
P
 
P
I
 
I
T
 
T
G
 
G
L
 
L
A
 
A
R
 
T
N
 
G
S
 
V
K
 
K
R
 
R
P
 
Q
D
 
E
R
 
D
F
 
F
I
 
I
G
 
G
I
 
I
H
 
H
F
 
F
F
 
F
S
 
S
P
 
P
V
 
V
E
x
D
K
|
K
M
|
M
M
x
P
L
 
L
T
 
V
E
 
E
V
 
I
I
 
I
L
 
K
G
 
G
K
 
E
E
 
K
T
 
T
G
 
S
D
 
D
R
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
R
A
 
V
L
 
F
D
 
D
Y
 
Y
V
 
T
A
 
L
A
 
A
I
 
I
R
 
G
K
|
K
T
 
T
P
 
P
I
 
I
V
 
V
V
 
V
N
 
N
D
 
D
T
 
S
R
 
R
G
 
G
F
 
F
Y
 
F
V
 
T
N
 
S
R
 
R
C
 
V
V
 
I
F
 
G
R
 
T
Y
 
F
I
 
V
H
 
N
E
 
E
A
 
A
Y
 
L
D
 
A
M
 
M
L
 
L
I
 
G
E
 
E
G
 
G
V
 
V
P
 
E
P
 
P
A
 
A
M
 
S
I
 
I
E
 
E
N
 
Q
A
 
A
A
 
G
K
 
S
M
 
Q
A
 
A
G
 
G
M
 
Y
P
 
P
V
 
A
G
 
P
P
 
P
L
 
L
S
 
Q
L
 
L
N
 
S
D
 
D
E
 
E
V
 
L
A
 
N
I
 
L
D
 
E
L
 
L
S
 
M
Q
 
H
K
 
K
I
 
I
-
 
A
-
 
V
-
 
A
L
 
T
K
 
R
A
 
K
A
 
G
V
 
V
A
 
E
D
 
D
L
 
A
G
 
G
D
 
G
K
 
T
A
 
Y
V
 
Q
D
 
P
L
 
H
R
 
P
H
 
A
M
 
E
A
 
A
L
 
V
I
 
V
D
 
E
K
 
K
M
 
M
V
 
I
D
 
-
E
 
E
L
 
L
D
 
G
R
 
R
R
 
S
G
 
G
R
 
R
K
 
L
N
 
K
G
 
G
K
 
A
G
 
G
F
 
F
Y
 
Y
E
 
E
Y
 
Y
P
 
-
A
 
A
K
 
D
P
 
G
A
 
K
R
 
R
K
 
S
Y
 
G
L
 
L
W
 
W
P
 
P
G
 
G
L
 
L
K
 
R
E
 
E
L
 
T
Y
 
F
P
 
-
Q
 
K
K
 
S
D
 
G
A
 
S
G
 
S
E
 
Q
I
 
P
E
 
P
V
 
L
G
 
Q
V
 
D
L
 
M
K
 
I
Q
 
D
R
 
R
L
 
M
L
 
L
V
 
F
T
 
A
I
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
T
A
 
Q
R
 
K
T
 
C
I
 
L
E
 
D
E
 
E
G
 
G
I
 
V
V
 
L
T
 
T
D
 
S
P
 
T
R
 
A
E
 
D
A
 
A
D
 
N
V
 
I
G
 
G
S
 
S
I
 
I
L
 
M
G
 
G
F
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
P
P
 
P
Y
 
W
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
S
L
 
A
S
 
Q
Y
 
F
I
 
I
-
 
V
-
 
G
-
 
Y
-
 
S
-
 
G
-
 
P
D
 
A
G
 
G
M
 
T
G
 
G
A
 
K
K
 
A
A
 
A
F
 
F
V
 
V
E
 
A
L
 
R
C
 
A
E
 
R
K
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
A
H
 
Y
G
 
G
D
 
D
H
 
R
F
 
F
R
 
L
P
 
P

4b3iA Crystal structure of mycobacterium tuberculosis fatty acid beta-oxidation complex with coenzymea bound at the hydratase active sites (see paper)
43% identity, 96% coverage: 1:709/737 of query aligns to 12:725/731 of 4b3iA

query
sites
4b3iA
M
 
M
S
 
P
Y
 
D
T
 
N
N
 
T
F
 
I
K
 
Q
I
 
W
E
 
D
T
 
K
D
 
D
A
 
A
D
 
D
G
 
G
I
 
I
A
 
V
L
 
T
V
 
L
T
 
T
W
 
M
D
 
D
M
 
D
P
 
P
D
 
S
K
 
G
S
 
S
M
x
T
N
 
N
V
|
V
F
 
M
T
 
N
E
 
E
E
 
A
V
 
Y
M
 
I
K
 
E
E
 
S
L
 
M
D
 
G
A
 
K
I
 
A
I
 
V
D
 
D
Q
 
R
T
 
L
T
 
V
A
 
A
D
 
E
P
 
K
-
 
D
A
 
S
V
 
I
K
 
T
G
 
G
V
 
V
V
 
V
I
 
V
T
 
A
S
 
S
G
 
A
K
 
K
S
 
K
S
 
T
F
 
F
S
 
F
G
x
A
G
 
G
A
x
G
D
|
D
L
 
-
S
 
-
M
 
-
I
x
V
K
 
K
S
 
T
M
 
M
F
 
I
T
 
Q
F
 
A
Q
 
R
A
 
P
E
 
E
E
 
D
R
 
-
K
 
-
K
 
-
D
 
-
P
 
-
D
 
-
N
 
-
A
 
-
A
 
A
R
 
G
K
 
D
L
 
V
F
 
F
D
 
N
L
 
T
V
 
V
G
x
E
R
 
T
M
 
I
T
 
K
G
x
R
L
 
Q
F
 
L
R
 
R
K
 
T
L
 
L
E
 
E
T
 
T
S
 
L
G
 
G
K
 
K
P
 
P
W
 
V
V
 
V
S
 
A
A
 
A
I
 
I
N
 
N
G
 
G
T
 
A
C
 
A
M
 
L
G
 
G
G
|
G
A
 
G
F
 
L
E
|
E
M
 
I
S
 
A
L
 
L
A
 
A
C
 
C
H
 
H
G
 
H
R
 
R
V
 
I
A
 
A
S
 
A
N
 
D
A
 
V
K
 
K
S
 
G
V
 
S
K
 
Q
I
 
L
A
 
G
L
 
L
P
|
P
E
|
E
V
 
V
K
 
T
V
 
L
G
 
G
I
 
L
F
 
L
P
 
P
G
|
G
A
 
G
G
 
G
G
 
G
T
 
V
Q
 
T
R
 
R
V
 
T
P
 
V
R
 
R
L
 
M
T
 
F
N
 
G
T
 
I
Q
 
Q
D
 
N
A
 
A
-
 
F
L
 
V
Q
 
S
M
 
V
M
 
L
T
 
A
T
 
Q
G
 
G
S
 
T
S
 
R
L
 
F
T
 
K
P
 
P
A
 
A
R
 
K
A
 
A
K
 
K
A
 
E
M
 
I
G
 
G
L
 
L
V
 
V
H
 
D
E
 
E
V
 
L
V
 
V
D
 
A
P
 
T
-
 
V
D
 
E
K
 
E
L
 
L
I
 
V
E
 
P
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
M
 
W
I
 
I
K
 
K
N
 
E
G
 
E
L
 
L
K
 
K
P
 
A
-
 
N
-
 
P
-
 
D
-
 
G
-
 
A
-
 
G
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
W
 
W
D
 
D
E
 
K
K
 
K
G
 
G
F
 
Y
K
 
K
L
 
M
P
 
P
G
 
G
G
 
G
G
 
T
I
 
P
W
 
S
T
 
S
P
 
P
A
 
G
S
 
L
A
 
A
Q
 
A
L
 
I
W
 
L
P
 
P
A
 
S
A
 
F
S
 
P
G
 
S
I
 
N
L
 
L
R
 
R
R
 
K
E
 
Q
T
 
L
Y
 
K
G
 
G
N
 
A
-
 
P
Y
 
M
P
 
P
G
 
A
A
 
P
I
 
R
A
 
A
I
 
I
L
 
L
K
 
A
C
 
A
V
 
A
Y
 
V
E
 
E
G
 
G
L
 
A
Q
 
Q
V
 
V
P
 
D
F
 
F
D
 
D
T
 
T
A
 
A
L
 
S
K
 
R
I
 
I
E
 
E
Q
 
S
R
 
R
Y
 
Y
F
 
F
T
 
A
E
 
S
I
 
L
L
 
V
Q
 
T
T
 
G
T
 
Q
E
 
V
A
 
A
F
 
K
S
 
N
M
 
M
I
 
M
R
 
Q
S
 
A
L
 
F
F
|
F
V
 
F
S
 
D
M
 
L
Q
|
Q
E
 
A
L
 
I
G
 
N
K
 
A
G
 
G
A
 
G
R
 
S
R
 
R
P
 
P
A
 
E
G
 
G
V
 
I
P
 
G
K
 
K
T
 
T
E
 
P
L
 
I
K
 
K
K
 
R
V
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
G
F
 
M
M
 
M
G
 
G
A
 
A
S
 
G
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
T
 
S
A
 
A
A
 
K
G
 
A
G
 
G
I
 
Y
P
 
E
V
 
V
T
 
V
L
 
L
I
 
K
D
 
D
R
 
V
D
 
S
M
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
A
E
 
A
K
 
K
G
 
G
K
 
K
T
 
G
H
 
Y
S
 
S
E
 
E
G
 
K
L
 
L
V
 
E
K
 
A
D
 
K
A
 
A
I
 
L
G
 
E
K
 
R
G
 
G
R
 
R
L
 
T
T
 
T
K
 
Q
E
 
E
E
 
R
G
 
S
E
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
L
S
 
A
R
 
R
I
 
I
T
 
T
P
 
P
S
 
T
A
 
A
D
 
D
Y
 
A
G
 
A
D
 
D
L
 
F
R
 
K
D
 
G
A
 
V
G
 
D
L
 
F
V
 
V
I
 
I
E
 
E
A
 
A
V
 
V
F
 
F
E
 
E
D
 
N
R
 
Q
Q
 
E
V
 
L
K
 
K
K
 
H
D
 
K
V
 
V
I
 
F
E
 
G
K
 
E
V
 
I
E
 
E
A
 
D
V
 
I
I
 
V
A
 
E
E
 
P
D
 
N
A
 
A
I
 
I
F
 
L
A
 
G
S
 
S
N
 
N
T
 
T
S
|
S
T
 
T
L
 
L
P
 
P
I
 
I
T
 
T
G
 
G
L
 
L
A
 
A
R
 
T
N
 
G
S
 
V
K
 
K
R
 
R
P
 
Q
D
 
E
R
 
D
F
 
F
I
 
I
G
 
G
I
 
I
H
|
H
F
 
F
F
 
F
S
 
S
P
 
P
V
 
V
E
 
D
K
 
K
M
 
M
M
 
P
L
 
L
T
 
V
E
|
E
V
 
I
I
 
I
L
 
K
G
 
G
K
 
E
E
 
K
T
 
T
G
 
S
D
 
D
R
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
R
A
 
V
L
 
F
D
 
D
Y
 
Y
V
 
T
A
 
L
A
 
A
I
 
I
R
 
G
K
 
K
T
 
T
P
 
P
I
 
I
V
 
V
V
 
V
N
 
N
D
 
D
T
 
S
R
 
R
G
 
G
F
 
F
Y
 
F
V
 
T
N
x
S
R
 
R
C
 
V
V
 
I
F
 
G
R
 
T
Y
 
F
I
 
V
H
 
N
E
 
E
A
 
A
Y
 
L
D
 
A
M
 
M
L
 
L
I
 
G
E
 
E
G
 
G
V
 
V
P
 
E
P
 
P
A
 
A
M
 
S
I
 
I
E
 
E
N
 
Q
A
 
A
A
 
G
K
 
S
M
 
Q
A
 
A
G
 
G
M
 
Y
P
 
P
V
 
A
G
 
P
P
 
P
L
 
L
S
 
Q
L
 
L
N
 
S
D
 
D
E
 
E
V
 
L
A
 
N
I
 
L
D
 
E
L
 
L
S
 
M
Q
 
H
K
 
K
I
 
I
-
 
A
-
 
V
-
 
A
L
 
T
K
 
R
A
 
K
A
 
G
V
 
V
A
 
E
D
 
D
L
 
A
G
 
G
D
 
G
K
 
T
A
 
Y
V
 
Q
D
 
P
L
 
H
R
 
P
H
 
A
M
 
E
A
 
A
L
 
V
I
 
V
D
 
E
K
 
K
M
 
M
V
 
I
D
 
-
E
 
E
L
 
L
D
 
G
R
 
R
R
 
S
G
 
G
R
 
R
K
 
L
N
 
K
G
 
G
K
 
A
G
 
G
F
 
F
Y
 
Y
E
 
E
Y
 
Y
P
 
-
A
 
A
K
 
D
P
 
G
A
 
K
R
 
R
K
 
S
Y
 
G
L
 
L
W
 
W
P
 
P
G
 
G
L
 
L
K
 
R
E
 
E
L
 
T
Y
 
F
P
 
-
Q
 
K
K
 
S
D
 
G
A
 
S
G
 
S
E
x
Q
I
x
P
E
x
P
V
x
L
G
x
Q
V
 
D
L
 
M
K
 
I
Q
 
D
R
 
R
L
 
M
L
 
L
V
 
F
T
 
A
I
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
T
A
 
Q
R
 
K
T
 
C
I
 
L
E
 
D
E
 
E
G
 
G
I
 
V
V
 
L
T
 
T
D
 
S
P
 
T
R
 
A
E
 
D
A
 
A
D
 
N
V
 
I
G
 
G
S
 
S
I
 
I
L
 
M
G
 
G
F
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
P
P
 
P
Y
 
W
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
S
L
 
A
S
 
Q
Y
 
F
I
 
I
-
 
V
-
 
G
-
 
Y
-
 
S
-
 
G
-
 
P
D
 
A
G
 
G
M
 
T
G
 
G
A
 
K
K
 
A
A
 
A
F
 
F
V
 
V
E
 
A
L
 
R
C
 
A
E
 
R
K
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
A
H
 
Y
G
 
G
D
 
D
H
 
R
F
 
F
R
 
L
P
 
P

8oqsB Structure of mycobacterium tuberculosis beta-oxidation trifunctional enzyme in complex with fragment-m-83
43% identity, 96% coverage: 1:709/737 of query aligns to 16:729/735 of 8oqsB

query
sites
8oqsB
M
|
M
S
x
P
Y
 
D
T
 
N
N
 
T
F
 
I
K
 
Q
I
 
W
E
 
D
T
 
K
D
 
D
A
 
A
D
 
D
G
 
G
I
 
I
A
 
V
L
 
T
V
 
L
T
 
T
W
 
M
D
 
D
M
 
D
P
 
P
D
 
S
K
 
G
S
 
S
M
 
T
N
 
N
V
 
V
F
x
M
T
 
N
E
 
E
E
 
A
V
 
Y
M
x
I
K
 
E
E
 
S
L
 
M
D
 
G
A
 
K
I
 
A
I
 
V
D
 
D
Q
 
R
T
 
L
T
 
V
A
 
A
D
 
E
P
 
K
-
 
D
A
 
S
V
 
I
K
 
T
G
 
G
V
 
V
V
 
V
I
 
V
T
 
A
S
 
S
G
 
A
K
 
K
S
 
K
S
 
T
F
 
F
S
 
F
G
 
A
G
|
G
A
x
G
D
|
D
L
 
-
S
 
-
M
 
-
I
 
V
K
 
K
S
x
T
M
|
M
F
 
I
T
 
Q
F
x
A
Q
 
R
A
 
P
E
 
E
E
x
D
R
 
-
K
 
-
K
 
-
D
 
-
P
 
-
D
 
-
N
 
-
A
 
-
A
 
A
R
 
G
K
x
D
L
x
V
F
 
F
D
 
N
L
x
T
V
 
V
G
 
E
R
 
T
M
 
I
T
 
K
G
 
R
L
 
Q
F
 
L
R
 
R
K
 
T
L
 
L
E
 
E
T
 
T
S
 
L
G
 
G
K
 
K
P
 
P
W
 
V
V
 
V
S
 
A
A
 
A
I
 
I
N
 
N
G
 
G
T
 
A
C
 
A
M
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
G
F
 
L
E
|
E
M
 
I
S
 
A
L
 
L
A
 
A
C
 
C
H
 
H
G
 
H
R
 
R
V
 
I
A
 
A
S
 
A
N
 
D
A
 
V
K
 
K
S
 
G
V
 
S
K
 
Q
I
 
L
A
 
G
L
 
L
P
 
P
E
|
E
V
 
V
K
 
T
V
x
L
G
 
G
I
 
L
F
 
L
P
 
P
G
 
G
A
 
G
G
 
G
G
 
G
T
 
V
Q
 
T
R
 
R
V
 
T
P
 
V
R
 
R
L
 
M
T
 
F
N
 
G
T
 
I
Q
 
Q
D
 
N
A
 
A
-
 
F
L
 
V
Q
 
S
M
 
V
M
 
L
T
 
A
T
 
Q
G
 
G
S
 
T
S
 
R
L
 
F
T
 
K
P
 
P
A
 
A
R
 
K
A
 
A
K
 
K
A
 
E
M
 
I
G
 
G
L
 
L
V
 
V
H
 
D
E
 
E
V
 
L
V
 
V
D
 
A
P
 
T
-
 
V
D
 
E
K
 
E
L
 
L
I
 
V
E
 
P
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
M
 
W
I
 
I
K
 
K
N
 
E
G
 
E
L
 
L
K
 
K
P
 
A
-
 
N
-
 
P
-
 
D
-
 
G
-
 
A
-
 
G
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
W
 
W
D
 
D
E
 
K
K
 
K
G
 
G
F
 
Y
K
 
K
L
 
M
P
 
P
G
 
G
G
 
G
G
 
T
I
 
P
W
 
S
T
 
S
P
 
P
A
 
G
S
 
L
A
 
A
Q
 
A
L
 
I
W
 
L
P
 
P
A
 
S
A
 
F
S
 
P
G
 
S
I
 
N
L
 
L
R
 
R
R
 
K
E
 
Q
T
 
L
Y
 
K
G
 
G
N
 
A
-
 
P
Y
 
M
P
 
P
G
 
A
A
 
P
I
 
R
A
 
A
I
 
I
L
 
L
K
 
A
C
 
A
V
 
A
Y
 
V
E
 
E
G
 
G
L
 
A
Q
 
Q
V
 
V
P
 
D
F
 
F
D
 
D
T
 
T
A
 
A
L
 
S
K
 
R
I
 
I
E
 
E
Q
 
S
R
 
R
Y
 
Y
F
|
F
T
 
A
E
 
S
I
 
L
L
 
V
Q
 
T
T
 
G
T
 
Q
E
 
V
A
 
A
F
 
K
S
 
N
M
 
M
I
 
M
R
 
Q
S
 
A
L
 
F
F
|
F
V
 
F
S
 
D
M
 
L
Q
 
Q
E
 
A
L
 
I
G
 
N
K
 
A
G
 
G
A
 
G
R
 
S
R
 
R
P
 
P
A
 
E
G
 
G
V
 
I
P
 
G
K
 
K
T
 
T
E
 
P
L
 
I
K
 
K
K
 
R
V
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
G
F
 
M
M
 
M
G
 
G
A
 
A
S
 
G
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
T
 
S
A
 
A
A
 
K
G
 
A
G
 
G
I
 
Y
P
 
E
V
 
V
T
 
V
L
 
L
I
 
K
D
 
D
R
 
V
D
 
S
M
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
A
E
 
A
K
 
K
G
 
G
K
 
K
T
 
G
H
 
Y
S
 
S
E
 
E
G
 
K
L
 
L
V
 
E
K
 
A
D
 
K
A
 
A
I
 
L
G
 
E
K
 
R
G
 
G
R
 
R
L
 
T
T
 
T
K
 
Q
E
 
E
E
 
R
G
 
S
E
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
L
S
 
A
R
 
R
I
 
I
T
 
T
P
 
P
S
 
T
A
 
A
D
 
D
Y
 
A
G
 
A
D
 
D
L
 
F
R
 
K
D
 
G
A
 
V
G
 
D
L
 
F
V
 
V
I
 
I
E
 
E
A
 
A
V
 
V
F
 
F
E
 
E
D
 
N
R
 
Q
Q
 
E
V
 
L
K
 
K
K
 
H
D
 
K
V
 
V
I
 
F
E
 
G
K
 
E
V
 
I
E
 
E
A
 
D
V
 
I
I
 
V
A
 
E
E
 
P
D
 
N
A
 
A
I
 
I
F
 
L
A
 
G
S
 
S
N
 
N
T
 
T
S
|
S
T
|
T
L
 
L
P
 
P
I
 
I
T
 
T
G
 
G
L
 
L
A
 
A
R
 
T
N
 
G
S
 
V
K
 
K
R
 
R
P
 
Q
D
 
E
R
 
D
F
 
F
I
 
I
G
 
G
I
 
I
H
 
H
F
 
F
F
 
F
S
 
S
P
 
P
V
 
V
E
 
D
K
 
K
M
|
M
M
x
P
L
 
L
T
 
V
E
 
E
V
 
I
I
 
I
L
 
K
G
 
G
K
 
E
E
 
K
T
 
T
G
 
S
D
 
D
R
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
R
A
 
V
L
 
F
D
 
D
Y
 
Y
V
 
T
A
 
L
A
 
A
I
 
I
R
 
G
K
 
K
T
 
T
P
 
P
I
 
I
V
 
V
V
 
V
N
 
N
D
 
D
T
 
S
R
 
R
G
|
G
F
 
F
Y
 
F
V
 
T
N
x
S
R
 
R
C
 
V
V
 
I
F
 
G
R
 
T
Y
 
F
I
 
V
H
x
N
E
 
E
A
 
A
Y
 
L
D
 
A
M
 
M
L
 
L
I
 
G
E
 
E
G
 
G
V
 
V
P
 
E
P
 
P
A
 
A
M
 
S
I
 
I
E
 
E
N
 
Q
A
 
A
A
 
G
K
 
S
M
 
Q
A
 
A
G
 
G
M
 
Y
P
|
P
V
 
A
G
 
P
P
 
P
L
 
L
S
 
Q
L
 
L
N
 
S
D
 
D
E
 
E
V
 
L
A
 
N
I
 
L
D
 
E
L
 
L
S
x
M
Q
 
H
K
 
K
I
|
I
-
 
A
-
 
V
-
 
A
L
 
T
K
 
R
A
 
K
A
 
G
V
 
V
A
 
E
D
 
D
L
 
A
G
 
G
D
 
G
K
 
T
A
 
Y
V
 
Q
D
 
P
L
 
H
R
 
P
H
 
A
M
 
E
A
 
A
L
 
V
I
 
V
D
 
E
K
 
K
M
 
M
V
 
I
D
 
-
E
 
E
L
 
L
D
 
G
R
 
R
R
 
S
G
 
G
R
 
R
K
 
L
N
 
K
G
 
G
K
 
A
G
 
G
F
 
F
Y
 
Y
E
 
E
Y
 
Y
P
 
-
A
 
A
K
 
D
P
 
G
A
 
K
R
 
R
K
 
S
Y
 
G
L
 
L
W
 
W
P
 
P
G
 
G
L
 
L
K
 
R
E
 
E
L
 
T
Y
 
F
P
 
-
Q
 
K
K
 
S
D
 
G
A
 
S
G
 
S
E
 
Q
I
 
P
E
 
P
V
 
L
G
 
Q
V
 
D
L
 
M
K
 
I
Q
 
D
R
 
R
L
 
M
L
 
L
V
 
F
T
 
A
I
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
T
A
 
Q
R
 
K
T
 
C
I
 
L
E
 
D
E
 
E
G
 
G
I
 
V
V
 
L
T
 
T
D
 
S
P
 
T
R
 
A
E
 
D
A
 
A
D
 
N
V
 
I
G
 
G
S
 
S
I
|
I
L
x
M
G
 
G
F
 
I
G
|
G
F
 
F
A
 
P
P
 
P
Y
 
W
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
S
L
 
A
S
 
Q
Y
 
F
I
 
I
-
 
V
-
 
G
-
 
Y
-
 
S
-
 
G
-
 
P
D
 
A
G
 
G
M
 
T
G
 
G
A
 
K
K
 
A
A
 
A
F
 
F
V
 
V
E
 
A
L
 
R
C
 
A
E
 
R
K
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
A
H
 
Y
G
 
G
D
 
D
H
 
R
F
 
F
R
 
L
P
 
P

Sites not aligning to the query:

8oqvA Structure of mycobacterium tuberculosis beta-oxidation trifunctional enzyme in complex with fragment-m-109
43% identity, 96% coverage: 1:709/737 of query aligns to 8:721/726 of 8oqvA

query
sites
8oqvA
M
 
M
S
 
P
Y
 
D
T
 
N
N
 
T
F
 
I
K
 
Q
I
 
W
E
 
D
T
 
K
D
 
D
A
 
A
D
 
D
G
 
G
I
 
I
A
 
V
L
 
T
V
 
L
T
 
T
W
 
M
D
 
D
M
 
D
P
 
P
D
 
S
K
 
G
S
 
S
M
 
T
N
 
N
V
 
V
F
 
M
T
 
N
E
|
E
E
 
A
V
 
Y
M
 
I
K
 
E
E
 
S
L
 
M
D
 
G
A
 
K
I
 
A
I
 
V
D
 
D
Q
 
R
T
 
L
T
 
V
A
 
A
D
 
E
P
 
K
-
 
D
A
 
S
V
 
I
K
 
T
G
 
G
V
 
V
V
 
V
I
 
V
T
 
A
S
 
S
G
 
A
K
 
K
S
 
K
S
 
T
F
 
F
S
 
F
G
 
A
G
|
G
A
 
G
D
 
D
L
 
-
S
 
-
M
 
-
I
 
V
K
 
K
S
 
T
M
|
M
F
 
I
T
 
Q
F
 
A
Q
 
R
A
 
P
E
 
E
E
 
D
R
 
-
K
 
-
K
 
-
D
 
-
P
 
-
D
 
-
N
 
-
A
 
-
A
 
A
R
 
G
K
 
D
L
x
V
F
 
F
D
 
N
L
x
T
V
 
V
G
 
E
R
 
T
M
 
I
T
 
K
G
 
R
L
 
Q
F
 
L
R
 
R
K
 
T
L
 
L
E
 
E
T
 
T
S
 
L
G
 
G
K
 
K
P
 
P
W
 
V
V
 
V
S
 
A
A
 
A
I
 
I
N
 
N
G
 
G
T
 
A
C
 
A
M
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
G
F
 
L
E
 
E
M
 
I
S
 
A
L
 
L
A
 
A
C
 
C
H
 
H
G
 
H
R
 
R
V
 
I
A
 
A
S
 
A
N
 
D
A
 
V
K
 
K
S
 
G
V
 
S
K
 
Q
I
 
L
A
 
G
L
 
L
P
 
P
E
|
E
V
 
V
K
 
T
V
x
L
G
 
G
I
 
L
F
 
L
P
 
P
G
 
G
A
 
G
G
 
G
G
 
G
T
 
V
Q
 
T
R
 
R
V
 
T
P
 
V
R
 
R
L
 
M
T
 
F
N
 
G
T
 
I
Q
 
Q
D
 
N
A
 
A
-
 
F
L
 
V
Q
 
S
M
 
V
M
 
L
T
 
A
T
 
Q
G
 
G
S
 
T
S
x
R
L
 
F
T
 
K
P
 
P
A
 
A
R
 
K
A
 
A
K
 
K
A
 
E
M
 
I
G
 
G
L
 
L
V
 
V
H
 
D
E
 
E
V
 
L
V
 
V
D
 
A
P
 
T
-
 
V
D
 
E
K
 
E
L
 
L
I
 
V
E
 
P
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
M
 
W
I
 
I
K
 
K
N
 
E
G
 
E
L
 
L
K
 
K
P
 
A
-
 
N
-
 
P
-
 
D
-
 
G
-
 
A
-
 
G
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
W
 
W
D
 
D
E
 
K
K
 
K
G
 
G
F
 
Y
K
 
K
L
 
M
P
 
P
G
 
G
G
 
G
G
 
T
I
 
P
W
 
S
T
 
S
P
 
P
A
 
G
S
 
L
A
 
A
Q
 
A
L
 
I
W
 
L
P
 
P
A
 
S
A
 
F
S
 
P
G
 
S
I
 
N
L
 
L
R
 
R
R
 
K
E
 
Q
T
 
L
Y
 
K
G
 
G
N
 
A
-
 
P
Y
 
M
P
 
P
G
 
A
A
 
P
I
 
R
A
 
A
I
 
I
L
 
L
K
 
A
C
 
A
V
 
A
Y
 
V
E
 
E
G
 
G
L
 
A
Q
 
Q
V
 
V
P
 
D
F
 
F
D
 
D
T
 
T
A
 
A
L
 
S
K
 
R
I
 
I
E
 
E
Q
 
S
R
 
R
Y
 
Y
F
 
F
T
 
A
E
 
S
I
 
L
L
 
V
Q
 
T
T
 
G
T
 
Q
E
 
V
A
 
A
F
 
K
S
 
N
M
 
M
I
 
M
R
 
Q
S
 
A
L
 
F
F
 
F
V
 
F
S
 
D
M
 
L
Q
 
Q
E
 
A
L
 
I
G
 
N
K
 
A
G
 
G
A
 
G
R
 
S
R
 
R
P
 
P
A
 
E
G
 
G
V
 
I
P
 
G
K
 
K
T
 
T
E
 
P
L
 
I
K
 
K
K
 
R
V
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
G
F
 
M
M
 
M
G
 
G
A
 
A
S
 
G
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
T
 
S
A
 
A
A
 
K
G
 
A
G
 
G
I
 
Y
P
 
E
V
 
V
T
 
V
L
 
L
I
 
K
D
 
D
R
 
V
D
 
S
M
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
A
E
 
A
K
 
K
G
 
G
K
 
K
T
 
G
H
 
Y
S
 
S
E
 
E
G
 
K
L
 
L
V
 
E
K
 
A
D
 
K
A
 
A
I
 
L
G
 
E
K
 
R
G
 
G
R
 
R
L
 
T
T
 
T
K
 
Q
E
 
E
E
 
R
G
 
S
E
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
L
S
 
A
R
 
R
I
 
I
T
 
T
P
 
P
S
 
T
A
 
A
D
 
D
Y
 
A
G
 
A
D
 
D
L
 
F
R
 
K
D
 
G
A
 
V
G
 
D
L
 
F
V
 
V
I
 
I
E
 
E
A
 
A
V
 
V
F
 
F
E
 
E
D
 
N
R
 
Q
Q
 
E
V
 
L
K
 
K
K
 
H
D
 
K
V
 
V
I
 
F
E
 
G
K
 
E
V
 
I
E
 
E
A
 
D
V
 
I
I
 
V
A
 
E
E
 
P
D
 
N
A
 
A
I
 
I
F
 
L
A
 
G
S
 
S
N
 
N
T
 
T
S
|
S
T
 
T
L
 
L
P
 
P
I
 
I
T
 
T
G
 
G
L
 
L
A
 
A
R
 
T
N
 
G
S
 
V
K
 
K
R
 
R
P
 
Q
D
 
E
R
 
D
F
 
F
I
 
I
G
 
G
I
 
I
H
 
H
F
 
F
F
 
F
S
 
S
P
 
P
V
 
V
E
 
D
K
 
K
M
 
M
M
 
P
L
 
L
T
 
V
E
 
E
V
 
I
I
 
I
L
 
K
G
 
G
K
 
E
E
 
K
T
 
T
G
 
S
D
 
D
R
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
R
A
 
V
L
 
F
D
 
D
Y
 
Y
V
 
T
A
 
L
A
 
A
I
 
I
R
 
G
K
 
K
T
 
T
P
 
P
I
 
I
V
 
V
V
 
V
N
 
N
D
 
D
T
 
S
R
 
R
G
 
G
F
 
F
Y
 
F
V
 
T
N
x
S
R
|
R
C
 
V
V
 
I
F
 
G
R
 
T
Y
 
F
I
 
V
H
 
N
E
 
E
A
 
A
Y
 
L
D
 
A
M
 
M
L
 
L
I
 
G
E
 
E
G
 
G
V
 
V
P
 
E
P
 
P
A
 
A
M
 
S
I
 
I
E
 
E
N
 
Q
A
 
A
A
 
G
K
 
S
M
 
Q
A
 
A
G
 
G
M
 
Y
P
 
P
V
 
A
G
 
P
P
 
P
L
 
L
S
 
Q
L
 
L
N
 
S
D
 
D
E
 
E
V
x
L
A
 
N
I
 
L
D
 
E
L
|
L
S
 
M
Q
 
H
K
 
K
I
|
I
-
 
A
-
 
V
-
 
A
L
 
T
K
 
R
A
 
K
A
 
G
V
 
V
A
 
E
D
 
D
L
 
A
G
 
G
D
 
G
K
 
T
A
 
Y
V
 
Q
D
 
P
L
 
H
R
 
P
H
 
A
M
 
E
A
 
A
L
 
V
I
 
V
D
 
E
K
 
K
M
 
M
V
 
I
D
 
-
E
 
E
L
 
L
D
 
G
R
 
R
R
 
S
G
 
G
R
 
R
K
 
L
N
 
K
G
 
G
K
 
A
G
 
G
F
 
F
Y
 
Y
E
 
E
Y
 
Y
P
 
-
A
 
A
K
 
D
P
 
G
A
 
K
R
 
R
K
 
S
Y
 
G
L
 
L
W
 
W
P
 
P
G
 
G
L
 
L
K
 
R
E
 
E
L
 
T
Y
 
F
P
 
-
Q
 
K
K
 
S
D
 
G
A
 
S
G
 
S
E
 
Q
I
 
P
E
 
P
V
 
L
G
 
Q
V
 
D
L
 
M
K
 
I
Q
 
D
R
 
R
L
 
M
L
 
L
V
 
F
T
 
A
I
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
T
A
 
Q
R
 
K
T
 
C
I
 
L
E
 
D
E
 
E
G
 
G
I
 
V
V
 
L
T
 
T
D
 
S
P
 
T
R
 
A
E
 
D
A
 
A
D
 
N
V
 
I
G
 
G
S
 
S
I
 
I
L
 
M
G
 
G
F
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
P
P
 
P
Y
 
W
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
S
L
 
A
S
 
Q
Y
 
F
I
 
I
-
 
V
-
 
G
-
 
Y
-
 
S
-
 
G
-
 
P
D
 
A
G
 
G
M
 
T
G
 
G
A
 
K
K
 
A
A
 
A
F
 
F
V
 
V
E
 
A
L
 
R
C
 
A
E
 
R
K
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
A
H
 
Y
G
 
G
D
 
D
H
 
R
F
 
F
R
 
L
P
 
P

Sites not aligning to the query:

8oqrA Structure of mycobacterium tuberculosis beta-oxidation trifunctional enzyme in complex with fragment-m-80
43% identity, 96% coverage: 1:709/737 of query aligns to 10:723/728 of 8oqrA

query
sites
8oqrA
M
 
M
S
 
P
Y
 
D
T
 
N
N
 
T
F
 
I
K
 
Q
I
 
W
E
 
D
T
 
K
D
 
D
A
 
A
D
 
D
G
 
G
I
 
I
A
 
V
L
 
T
V
 
L
T
 
T
W
 
M
D
 
D
M
 
D
P
 
P
D
 
S
K
 
G
S
 
S
M
 
T
N
 
N
V
 
V
F
 
M
T
 
N
E
 
E
E
 
A
V
 
Y
M
 
I
K
 
E
E
 
S
L
 
M
D
 
G
A
 
K
I
 
A
I
 
V
D
 
D
Q
 
R
T
 
L
T
 
V
A
 
A
D
 
E
P
 
K
-
 
D
A
 
S
V
 
I
K
 
T
G
 
G
V
 
V
V
 
V
I
 
V
T
 
A
S
 
S
G
 
A
K
 
K
S
 
K
S
 
T
F
 
F
S
 
F
G
 
A
G
|
G
A
x
G
D
 
D
L
 
-
S
 
-
M
 
-
I
 
V
K
 
K
S
x
T
M
|
M
F
 
I
T
 
Q
F
x
A
Q
 
R
A
 
P
E
 
E
E
x
D
R
 
-
K
 
-
K
 
-
D
 
-
P
 
-
D
 
-
N
 
-
A
 
-
A
 
A
R
 
G
K
 
D
L
 
V
F
 
F
D
 
N
L
x
T
V
 
V
G
 
E
R
 
T
M
 
I
T
 
K
G
 
R
L
 
Q
F
 
L
R
 
R
K
 
T
L
 
L
E
 
E
T
 
T
S
 
L
G
 
G
K
 
K
P
 
P
W
 
V
V
 
V
S
 
A
A
 
A
I
 
I
N
 
N
G
 
G
T
 
A
C
 
A
M
x
L
G
|
G
G
 
G
A
 
G
F
 
L
E
 
E
M
 
I
S
 
A
L
 
L
A
 
A
C
 
C
H
 
H
G
 
H
R
 
R
V
 
I
A
 
A
S
 
A
N
 
D
A
 
V
K
 
K
S
 
G
V
 
S
K
 
Q
I
 
L
A
 
G
L
 
L
P
|
P
E
|
E
V
 
V
K
 
T
V
 
L
G
 
G
I
 
L
F
 
L
P
 
P
G
 
G
A
 
G
G
 
G
G
 
G
T
 
V
Q
 
T
R
 
R
V
 
T
P
 
V
R
 
R
L
 
M
T
 
F
N
 
G
T
 
I
Q
 
Q
D
 
N
A
 
A
-
 
F
L
 
V
Q
 
S
M
 
V
M
 
L
T
 
A
T
 
Q
G
 
G
S
 
T
S
 
R
L
 
F
T
 
K
P
 
P
A
 
A
R
 
K
A
 
A
K
 
K
A
 
E
M
 
I
G
 
G
L
 
L
V
 
V
H
 
D
E
 
E
V
 
L
V
 
V
D
 
A
P
 
T
-
 
V
D
 
E
K
 
E
L
 
L
I
 
V
E
 
P
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
M
 
W
I
 
I
K
 
K
N
 
E
G
 
E
L
 
L
K
 
K
P
 
A
-
 
N
-
 
P
-
 
D
-
 
G
-
 
A
-
 
G
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
W
 
W
D
 
D
E
 
K
K
 
K
G
 
G
F
 
Y
K
 
K
L
 
M
P
 
P
G
 
G
G
 
G
G
 
T
I
 
P
W
 
S
T
 
S
P
 
P
A
 
G
S
 
L
A
 
A
Q
 
A
L
 
I
W
 
L
P
 
P
A
 
S
A
 
F
S
 
P
G
 
S
I
 
N
L
 
L
R
 
R
R
 
K
E
 
Q
T
 
L
Y
 
K
G
 
G
N
 
A
-
 
P
Y
 
M
P
 
P
G
 
A
A
 
P
I
 
R
A
 
A
I
 
I
L
 
L
K
 
A
C
 
A
V
 
A
Y
 
V
E
 
E
G
 
G
L
 
A
Q
 
Q
V
 
V
P
 
D
F
 
F
D
 
D
T
 
T
A
 
A
L
 
S
K
 
R
I
 
I
E
 
E
Q
 
S
R
 
R
Y
 
Y
F
 
F
T
 
A
E
 
S
I
 
L
L
 
V
Q
 
T
T
 
G
T
 
Q
E
 
V
A
 
A
F
 
K
S
 
N
M
 
M
I
 
M
R
 
Q
S
 
A
L
 
F
F
 
F
V
 
F
S
 
D
M
 
L
Q
 
Q
E
 
A
L
 
I
G
 
N
K
 
A
G
 
G
A
 
G
R
 
S
R
 
R
P
 
P
A
 
E
G
 
G
V
 
I
P
 
G
K
 
K
T
 
T
E
 
P
L
 
I
K
 
K
K
 
R
V
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
G
F
 
M
M
 
M
G
 
G
A
 
A
S
 
G
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
T
 
S
A
 
A
A
 
K
G
 
A
G
 
G
I
 
Y
P
 
E
V
 
V
T
 
V
L
 
L
I
 
K
D
 
D
R
 
V
D
x
S
M
x
L
E
|
E
A
 
A
A
 
A
E
 
A
K
 
K
G
 
G
K
 
K
T
 
G
H
 
Y
S
 
S
E
 
E
G
 
K
L
 
L
V
 
E
K
 
A
D
 
K
A
 
A
I
 
L
G
 
E
K
 
R
G
 
G
R
 
R
L
 
T
T
 
T
K
 
Q
E
 
E
E
 
R
G
 
S
E
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
L
S
 
A
R
 
R
I
 
I
T
 
T
P
 
P
S
 
T
A
 
A
D
 
D
Y
 
A
G
 
A
D
 
D
L
 
F
R
 
K
D
 
G
A
 
V
G
 
D
L
 
F
V
 
V
I
 
I
E
 
E
A
|
A
V
|
V
F
|
F
E
 
E
D
 
N
R
 
Q
Q
 
E
V
 
L
K
 
K
K
 
H
D
 
K
V
 
V
I
 
F
E
 
G
K
 
E
V
 
I
E
 
E
A
 
D
V
 
I
I
 
V
A
 
E
E
 
P
D
 
N
A
 
A
I
 
I
F
 
L
A
 
G
S
 
S
N
 
N
T
 
T
S
 
S
T
 
T
L
 
L
P
 
P
I
 
I
T
 
T
G
 
G
L
 
L
A
 
A
R
 
T
N
 
G
S
 
V
K
 
K
R
 
R
P
 
Q
D
 
E
R
 
D
F
 
F
I
 
I
G
 
G
I
 
I
H
 
H
F
 
F
F
 
F
S
 
S
P
 
P
V
 
V
E
 
D
K
 
K
M
 
M
M
 
P
L
 
L
T
 
V
E
 
E
V
 
I
I
 
I
L
 
K
G
 
G
K
 
E
E
 
K
T
 
T
G
 
S
D
 
D
R
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
R
A
 
V
L
 
F
D
 
D
Y
 
Y
V
 
T
A
 
L
A
 
A
I
 
I
R
 
G
K
 
K
T
 
T
P
 
P
I
 
I
V
 
V
V
 
V
N
 
N
D
 
D
T
 
S
R
 
R
G
 
G
F
 
F
Y
 
F
V
 
T
N
 
S
R
 
R
C
 
V
V
 
I
F
 
G
R
 
T
Y
 
F
I
 
V
H
 
N
E
 
E
A
 
A
Y
 
L
D
 
A
M
 
M
L
 
L
I
 
G
E
 
E
G
 
G
V
 
V
P
 
E
P
 
P
A
 
A
M
 
S
I
 
I
E
 
E
N
 
Q
A
 
A
A
 
G
K
 
S
M
 
Q
A
 
A
G
 
G
M
 
Y
P
 
P
V
 
A
G
 
P
P
 
P
L
 
L
S
 
Q
L
 
L
N
 
S
D
 
D
E
 
E
V
 
L
A
 
N
I
 
L
D
 
E
L
 
L
S
 
M
Q
 
H
K
 
K
I
 
I
-
 
A
-
 
V
-
 
A
L
 
T
K
 
R
A
 
K
A
 
G
V
 
V
A
 
E
D
 
D
L
 
A
G
 
G
D
 
G
K
 
T
A
 
Y
V
 
Q
D
 
P
L
 
H
R
 
P
H
 
A
M
 
E
A
 
A
L
 
V
I
 
V
D
 
E
K
 
K
M
 
M
V
 
I
D
 
-
E
 
E
L
 
L
D
 
G
R
 
R
R
 
S
G
 
G
R
 
R
K
 
L
N
 
K
G
 
G
K
 
A
G
 
G
F
 
F
Y
 
Y
E
 
E
Y
 
Y
P
 
-
A
 
A
K
 
D
P
 
G
A
 
K
R
 
R
K
 
S
Y
 
G
L
 
L
W
 
W
P
 
P
G
 
G
L
 
L
K
 
R
E
 
E
L
 
T
Y
 
F
P
 
-
Q
 
K
K
 
S
D
 
G
A
 
S
G
 
S
E
 
Q
I
 
P
E
 
P
V
 
L
G
 
Q
V
 
D
L
 
M
K
 
I
Q
 
D
R
 
R
L
 
M
L
 
L
V
 
F
T
 
A
I
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
T
A
 
Q
R
 
K
T
 
C
I
 
L
E
 
D
E
 
E
G
 
G
I
 
V
V
 
L
T
 
T
D
 
S
P
 
T
R
 
A
E
 
D
A
 
A
D
 
N
V
 
I
G
 
G
S
 
S
I
 
I
L
 
M
G
 
G
F
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
P
P
 
P
Y
 
W
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
S
L
 
A
S
 
Q
Y
 
F
I
 
I
-
 
V
-
 
G
-
 
Y
-
 
S
-
 
G
-
 
P
D
 
A
G
 
G
M
 
T
G
 
G
A
 
K
K
 
A
A
 
A
F
 
F
V
 
V
E
 
A
L
 
R
C
 
A
E
 
R
K
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
A
H
 
Y
G
 
G
D
 
D
H
 
R
F
 
F
R
 
L
P
 
P

8oqoA Structure of mycobacterium tuberculosis beta-oxidation trifunctional enzyme in complex with fragment-m-49
43% identity, 96% coverage: 1:709/737 of query aligns to 9:722/727 of 8oqoA

query
sites
8oqoA
M
 
M
S
 
P
Y
 
D
T
 
N
N
 
T
F
 
I
K
 
Q
I
 
W
E
 
D
T
 
K
D
 
D
A
 
A
D
 
D
G
 
G
I
 
I
A
 
V
L
 
T
V
 
L
T
 
T
W
 
M
D
 
D
M
 
D
P
 
P
D
 
S
K
 
G
S
 
S
M
 
T
N
 
N
V
 
V
F
 
M
T
 
N
E
 
E
E
 
A
V
 
Y
M
 
I
K
 
E
E
 
S
L
 
M
D
 
G
A
 
K
I
 
A
I
 
V
D
 
D
Q
 
R
T
 
L
T
 
V
A
 
A
D
 
E
P
 
K
-
 
D
A
 
S
V
 
I
K
 
T
G
 
G
V
 
V
V
 
V
I
 
V
T
 
A
S
 
S
G
 
A
K
 
K
S
 
K
S
 
T
F
 
F
S
 
F
G
 
A
G
|
G
A
 
G
D
 
D
L
 
-
S
 
-
M
 
-
I
 
V
K
 
K
S
 
T
M
 
M
F
 
I
T
 
Q
F
 
A
Q
 
R
A
 
P
E
 
E
E
 
D
R
 
-
K
 
-
K
 
-
D
 
-
P
 
-
D
 
-
N
 
-
A
 
-
A
 
A
R
 
G
K
 
D
L
 
V
F
 
F
D
 
N
L
 
T
V
 
V
G
 
E
R
 
T
M
 
I
T
 
K
G
 
R
L
 
Q
F
 
L
R
 
R
K
 
T
L
 
L
E
 
E
T
 
T
S
 
L
G
 
G
K
 
K
P
 
P
W
 
V
V
 
V
S
 
A
A
 
A
I
 
I
N
 
N
G
 
G
T
 
A
C
 
A
M
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
G
F
 
L
E
 
E
M
 
I
S
 
A
L
 
L
A
 
A
C
 
C
H
 
H
G
 
H
R
 
R
V
 
I
A
 
A
S
 
A
N
 
D
A
 
V
K
 
K
S
 
G
V
 
S
K
 
Q
I
 
L
A
 
G
L
 
L
P
 
P
E
|
E
V
 
V
K
 
T
V
 
L
G
 
G
I
 
L
F
 
L
P
 
P
G
 
G
A
 
G
G
 
G
G
 
G
T
 
V
Q
 
T
R
 
R
V
 
T
P
 
V
R
 
R
L
 
M
T
 
F
N
 
G
T
 
I
Q
 
Q
D
 
N
A
 
A
-
 
F
L
 
V
Q
 
S
M
 
V
M
 
L
T
 
A
T
x
Q
G
 
G
S
 
T
S
 
R
L
 
F
T
 
K
P
 
P
A
 
A
R
 
K
A
 
A
K
 
K
A
 
E
M
 
I
G
 
G
L
 
L
V
 
V
H
 
D
E
 
E
V
 
L
V
 
V
D
 
A
P
 
T
-
 
V
D
 
E
K
 
E
L
 
L
I
 
V
E
 
P
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
M
 
W
I
 
I
K
 
K
N
 
E
G
 
E
L
 
L
K
 
K
P
 
A
-
 
N
-
 
P
-
 
D
-
 
G
-
 
A
-
 
G
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
W
 
W
D
 
D
E
 
K
K
 
K
G
 
G
F
 
Y
K
 
K
L
 
M
P
 
P
G
 
G
G
 
G
G
 
T
I
 
P
W
 
S
T
 
S
P
 
P
A
 
G
S
 
L
A
 
A
Q
 
A
L
 
I
W
 
L
P
 
P
A
 
S
A
 
F
S
 
P
G
 
S
I
 
N
L
|
L
R
 
R
R
 
K
E
x
Q
T
 
L
Y
 
K
G
 
G
N
 
A
-
 
P
Y
 
M
P
 
P
G
 
A
A
 
P
I
 
R
A
 
A
I
 
I
L
 
L
K
 
A
C
 
A
V
 
A
Y
 
V
E
 
E
G
 
G
L
 
A
Q
 
Q
V
 
V
P
 
D
F
 
F
D
 
D
T
 
T
A
 
A
L
 
S
K
 
R
I
 
I
E
 
E
Q
 
S
R
 
R
Y
 
Y
F
 
F
T
 
A
E
 
S
I
 
L
L
 
V
Q
 
T
T
 
G
T
 
Q
E
 
V
A
 
A
F
 
K
S
 
N
M
 
M
I
 
M
R
 
Q
S
 
A
L
 
F
F
 
F
V
 
F
S
 
D
M
 
L
Q
 
Q
E
 
A
L
 
I
G
 
N
K
 
A
G
 
G
A
 
G
R
 
S
R
 
R
P
 
P
A
 
E
G
 
G
V
 
I
P
 
G
K
 
K
T
 
T
E
 
P
L
 
I
K
 
K
K
 
R
V
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
G
F
 
M
M
 
M
G
 
G
A
 
A
S
 
G
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
T
 
S
A
 
A
A
 
K
G
 
A
G
 
G
I
 
Y
P
 
E
V
 
V
T
 
V
L
 
L
I
 
K
D
 
D
R
 
V
D
 
S
M
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
A
E
 
A
K
 
K
G
 
G
K
 
K
T
 
G
H
 
Y
S
 
S
E
 
E
G
 
K
L
 
L
V
 
E
K
 
A
D
 
K
A
 
A
I
 
L
G
 
E
K
 
R
G
 
G
R
 
R
L
 
T
T
 
T
K
 
Q
E
 
E
E
 
R
G
 
S
E
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
L
S
 
A
R
 
R
I
 
I
T
 
T
P
 
P
S
 
T
A
 
A
D
 
D
Y
 
A
G
 
A
D
 
D
L
 
F
R
 
K
D
 
G
A
 
V
G
 
D
L
 
F
V
 
V
I
 
I
E
 
E
A
 
A
V
 
V
F
 
F
E
 
E
D
 
N
R
 
Q
Q
 
E
V
 
L
K
 
K
K
 
H
D
 
K
V
 
V
I
 
F
E
 
G
K
 
E
V
 
I
E
 
E
A
 
D
V
 
I
I
 
V
A
 
E
E
 
P
D
 
N
A
 
A
I
 
I
F
 
L
A
 
G
S
 
S
N
 
N
T
 
T
S
 
S
T
 
T
L
 
L
P
 
P
I
 
I
T
 
T
G
 
G
L
 
L
A
 
A
R
 
T
N
 
G
S
 
V
K
 
K
R
 
R
P
 
Q
D
 
E
R
 
D
F
 
F
I
 
I
G
 
G
I
 
I
H
 
H
F
 
F
F
 
F
S
 
S
P
 
P
V
 
V
E
 
D
K
 
K
M
 
M
M
 
P
L
 
L
T
 
V
E
 
E
V
 
I
I
 
I
L
 
K
G
 
G
K
 
E
E
 
K
T
 
T
G
 
S
D
 
D
R
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
R
A
 
V
L
 
F
D
 
D
Y
 
Y
V
 
T
A
 
L
A
 
A
I
 
I
R
 
G
K
 
K
T
 
T
P
 
P
I
 
I
V
 
V
V
 
V
N
 
N
D
 
D
T
 
S
R
 
R
G
 
G
F
 
F
Y
 
F
V
 
T
N
 
S
R
 
R
C
 
V
V
 
I
F
 
G
R
 
T
Y
 
F
I
 
V
H
 
N
E
 
E
A
 
A
Y
 
L
D
 
A
M
 
M
L
 
L
I
 
G
E
 
E
G
 
G
V
 
V
P
 
E
P
 
P
A
 
A
M
 
S
I
 
I
E
 
E
N
 
Q
A
 
A
A
 
G
K
 
S
M
 
Q
A
 
A
G
 
G
M
 
Y
P
 
P
V
 
A
G
 
P
P
 
P
L
 
L
S
 
Q
L
 
L
N
 
S
D
 
D
E
 
E
V
 
L
A
 
N
I
 
L
D
 
E
L
 
L
S
 
M
Q
 
H
K
 
K
I
 
I
-
 
A
-
 
V
-
 
A
L
 
T
K
 
R
A
 
K
A
 
G
V
 
V
A
 
E
D
 
D
L
 
A
G
 
G
D
 
G
K
 
T
A
 
Y
V
 
Q
D
 
P
L
 
H
R
 
P
H
 
A
M
 
E
A
 
A
L
 
V
I
 
V
D
 
E
K
 
K
M
 
M
V
 
I
D
 
-
E
 
E
L
 
L
D
 
G
R
 
R
R
 
S
G
 
G
R
 
R
K
 
L
N
 
K
G
 
G
K
 
A
G
 
G
F
 
F
Y
 
Y
E
 
E
Y
 
Y
P
 
-
A
 
A
K
 
D
P
 
G
A
 
K
R
 
R
K
 
S
Y
 
G
L
 
L
W
 
W
P
 
P
G
 
G
L
 
L
K
 
R
E
 
E
L
 
T
Y
 
F
P
 
-
Q
 
K
K
 
S
D
 
G
A
 
S
G
 
S
E
 
Q
I
 
P
E
 
P
V
 
L
G
 
Q
V
 
D
L
 
M
K
 
I
Q
 
D
R
 
R
L
 
M
L
 
L
V
 
F
T
 
A
I
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
T
A
 
Q
R
 
K
T
 
C
I
 
L
E
 
D
E
 
E
G
 
G
I
 
V
V
 
L
T
 
T
D
 
S
P
 
T
R
 
A
E
 
D
A
 
A
D
 
N
V
 
I
G
 
G
S
 
S
I
 
I
L
 
M
G
 
G
F
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
P
P
 
P
Y
 
W
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
S
L
 
A
S
 
Q
Y
 
F
I
 
I
-
 
V
-
 
G
-
 
Y
-
 
S
-
 
G
-
 
P
D
 
A
G
 
G
M
 
T
G
 
G
A
 
K
K
 
A
A
 
A
F
 
F
V
 
V
E
 
A
L
 
R
C
 
A
E
 
R
K
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
A
H
 
Y
G
 
G
D
 
D
H
 
R
F
 
F
R
 
L
P
 
P

8pf8A Structure of mycobacterium tuberculosis beta-oxidation trifunctional enzyme in complex with fragment-m-72
43% identity, 96% coverage: 1:709/737 of query aligns to 10:723/729 of 8pf8A

query
sites
8pf8A
M
 
M
S
 
P
Y
 
D
T
 
N
N
 
T
F
 
I
K
 
Q
I
 
W
E
 
D
T
 
K
D
 
D
A
 
A
D
 
D
G
 
G
I
 
I
A
 
V
L
 
T
V
 
L
T
 
T
W
 
M
D
 
D
M
 
D
P
 
P
D
 
S
K
 
G
S
 
S
M
 
T
N
 
N
V
 
V
F
x
M
T
x
N
E
|
E
E
 
A
V
 
Y
M
 
I
K
 
E
E
 
S
L
 
M
D
 
G
A
 
K
I
 
A
I
 
V
D
 
D
Q
 
R
T
 
L
T
 
V
A
 
A
D
 
E
P
 
K
-
 
D
A
 
S
V
 
I
K
 
T
G
 
G
V
 
V
V
 
V
I
 
V
T
 
A
S
 
S
G
 
A
K
 
K
S
 
K
S
 
T
F
 
F
S
 
F
G
 
A
G
|
G
A
x
G
D
|
D
L
 
-
S
 
-
M
 
-
I
 
V
K
 
K
S
x
T
M
|
M
F
 
I
T
 
Q
F
 
A
Q
 
R
A
 
P
E
 
E
E
 
D
R
 
-
K
 
-
K
 
-
D
 
-
P
 
-
D
 
-
N
 
-
A
 
-
A
 
A
R
 
G
K
x
D
L
x
V
F
 
F
D
 
N
L
 
T
V
 
V
G
 
E
R
 
T
M
 
I
T
 
K
G
 
R
L
 
Q
F
 
L
R
 
R
K
 
T
L
 
L
E
 
E
T
 
T
S
 
L
G
 
G
K
 
K
P
 
P
W
 
V
V
 
V
S
 
A
A
 
A
I
 
I
N
 
N
G
 
G
T
 
A
C
 
A
M
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
G
F
 
L
E
 
E
M
 
I
S
 
A
L
 
L
A
 
A
C
 
C
H
 
H
G
 
H
R
 
R
V
 
I
A
 
A
S
 
A
N
 
D
A
 
V
K
 
K
S
 
G
V
 
S
K
 
Q
I
 
L
A
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
E
V
 
V
K
x
T
V
 
L
G
 
G
I
 
L
F
 
L
P
 
P
G
 
G
A
 
G
G
 
G
G
 
G
T
 
V
Q
 
T
R
 
R
V
 
T
P
 
V
R
 
R
L
 
M
T
x
F
N
 
G
T
 
I
Q
 
Q
D
x
N
A
 
A
-
 
F
L
 
V
Q
x
S
M
 
V
M
 
L
T
 
A
T
 
Q
G
 
G
S
 
T
S
x
R
L
 
F
T
 
K
P
 
P
A
 
A
R
 
K
A
 
A
K
 
K
A
 
E
M
x
I
G
 
G
L
 
L
V
 
V
H