SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing SMc02322 FitnessBrowser__Smeli:SMc02322 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5itvA Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
32% identity, 37% coverage: 434:692/699 of query aligns to 4:251/255 of 5itvA

query
sites
5itvA
S
 
N
L
 
L
A
 
T
G
 
D
R
 
K
I
 
T
A
 
V
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
G
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
Y
A
 
A
T
 
A
A
 
V
N
 
Q
R
 
A
L
 
F
M
 
L
Q
 
G
E
 
Q
G
 
Q
A
 
A
C
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
V
A
 
A
D
|
D
I
|
I
D
 
D
E
 
E
T
 
A
A
 
Q
L
 
G
E
 
E
A
 
A
A
 
-
Q
 
-
T
 
-
E
 
-
L
 
M
S
 
V
T
 
R
R
 
K
Y
 
E
G
 
N
K
 
N
D
 
D
F
 
R
V
 
L
R
 
H
S
 
F
V
 
V
N
 
Q
M
x
T
N
 
D
V
x
I
T
 
T
S
 
D
E
 
E
A
 
A
A
 
A
V
 
C
E
 
Q
S
 
H
G
 
A
F
 
V
G
 
E
D
 
S
A
 
A
L
 
V
L
 
H
A
 
T
F
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
I
S
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
L
 
I
A
 
E
T
 
I
S
 
V
A
 
A
A
 
P
V
 
I
E
 
H
D
 
E
T
 
M
T
 
E
L
 
L
A
 
S
L
 
D
W
 
W
N
 
N
K
 
K
N
 
V
M
 
L
D
 
Q
I
 
V
L
 
N
A
 
L
T
 
T
G
 
G
Y
 
M
F
 
F
L
 
L
V
 
M
S
 
S
R
 
K
E
 
H
A
 
A
F
 
L
R
 
K
I
 
H
F
 
M
R
 
L
N
 
-
Q
 
A
K
 
A
A
 
G
G
 
K
G
 
G
N
 
N
V
 
I
V
 
I
F
 
N
V
x
T
A
 
C
S
|
S
K
 
V
N
 
G
G
 
G
L
 
L
A
 
V
A
 
A
S
 
W
P
 
P
G
 
D
A
 
I
S
 
P
A
 
A
Y
|
Y
C
 
N
T
 
A
A
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
G
E
 
V
I
 
L
H
 
Q
L
 
L
A
 
T
R
 
K
C
 
S
L
 
M
A
 
A
L
 
V
E
 
D
G
 
Y
A
 
A
S
 
K
A
 
H
Q
 
Q
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
V
 
C
V
 
V
N
 
C
P
|
P
D
x
G
A
x
I
V
x
I
-
 
D
-
 
T
-
 
P
-
 
L
-
 
N
-
 
E
-
 
K
-
 
S
-
 
F
L
 
L
R
 
E
G
 
N
S
 
N
K
 
E
I
 
G
W
 
T
T
 
L
G
 
E
E
 
E
W
 
I
K
 
K
E
 
K
Q
 
E
R
 
K
A
 
A
A
 
-
A
 
-
Y
 
-
K
 
-
M
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
-
E
 
-
L
 
-
E
 
-
A
 
-
H
 
-
Y
 
-
R
 
K
E
 
V
R
 
N
S
 
P
M
 
L
L
 
L
K
 
R
L
 
L
S
 
G
V
 
K
F
 
-
P
 
P
E
 
E
D
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
N
A
 
V
I
 
M
Y
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
M
 
L
S
 
S
A
 
S
K
 
Y
S
 
M
T
 
T
G
 
G
N
 
S
I
 
A
V
 
I
N
 
T
V
 
A
D
 
D
A
 
G
G
 
G

3m4rA Structure of the n-terminal class ii aldolase domain of a conserved protein from thermoplasma acidophilum
37% identity, 31% coverage: 10:225/699 of query aligns to 2:208/213 of 3m4rA

query
sites
3m4rA
L
 
M
A
 
Q
N
 
N
L
 
R
W
 
W
D
 
A
D
 
E
G
 
T
K
 
K
A
 
F
A
 
D
G
 
-
M
 
-
T
 
S
E
 
D
P
 
I
E
 
D
K
 
E
L
 
V
L
 
V
Y
 
Y
R
 
G
S
 
S
N
 
R
L
 
L
L
 
I
G
 
G
S
 
S
D
 
D
K
 
P
R
 
D
I
 
L
T
 
V
N
 
-
Y
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
N
 
N
T
 
T
S
 
S
A
 
V
K
 
K
V
 
T
M
 
T
E
 
E
K
 
R
D
 
D
P
 
H
L
 
-
T
 
A
G
 
G
E
 
R
I
 
I
V
 
I
E
 
S
V
 
V
L
 
L
W
 
R
V
 
V
K
 
K
G
 
N
S
 
S
G
 
G
G
 
S
D
 
N
V
 
L
G
 
G
T
 
T
I
 
I
K
 
D
M
 
S
D
 
R
G
 
G
F
 
F
S
 
T
T
 
G
L
 
I
Y
 
R
M
 
M
D
 
D
K
 
D
L
 
A
R
 
L
A
 
A
L
 
A
K
 
A
G
 
K
I
 
I
Y
 
D
R
 
K
G
 
M
V
 
T
E
 
D
F
 
-
E
 
-
D
 
E
E
 
A
M
 
M
V
 
V
G
 
D
Y
 
Y
L
 
L
P
 
K
H
 
K
C
 
S
T
 
M
F
 
V
N
 
N
L
 
P
N
 
S
P
 
E
R
 
P
A
 
S
A
 
P
S
 
S
I
 
V
D
x
E
T
 
T
P
 
F
L
 
L
H
 
H
A
 
A
Y
 
F
V
 
L
P
 
P
K
 
Y
P
 
K
H
 
F
V
 
V
D
 
M
H
|
H
M
 
S
H
|
H
P
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
I
I
 
L
A
 
S
I
 
I
A
 
T
A
 
N
S
 
T
K
 
D
N
 
L
S
 
P
R
 
S
E
 
D
L
 
Q
T
 
I
S
 
A
K
 
K
I
 
I
F
 
L
G
 
G
D
 
N
E
 
V
I
 
V
G
 
-
W
 
V
L
 
L
P
 
P
W
 
Y
K
 
I
R
 
P
P
 
P
G
 
G
Y
 
F
E
 
T
L
 
L
G
 
A
L
 
K
W
 
E
L
 
V
E
 
M
K
 
N
F
 
C
C
 
F
Q
 
K
E
 
K
N
 
G
P
 
I
D
 
D
A
 
-
R
 
-
G
 
G
V
 
I
V
 
V
L
 
L
E
 
R
S
 
K
H
|
H
G
 
G
L
 
L
F
 
L
T
 
T
W
 
F
G
 
G
D
 
D
T
 
T
A
 
G
K
 
K
E
 
E
A
 
A
Y
 
Y
E
 
D
T
 
R
T
 
H
I
 
I
E
 
N
I
 
I
I
 
V
N
 
S
R
 
R
A
 
A

5itvD Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
33% identity, 37% coverage: 434:692/699 of query aligns to 4:223/227 of 5itvD

query
sites
5itvD
S
 
N
L
 
L
A
 
T
G
 
D
R
 
K
I
 
T
A
 
V
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
G
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
Y
A
 
A
T
 
A
A
 
V
N
 
Q
R
 
A
L
 
F
M
 
L
Q
 
G
E
 
Q
G
 
Q
A
 
A
C
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
V
A
 
A
D
|
D
I
|
I
D
 
D
E
 
E
T
 
A
A
 
Q
L
 
G
E
 
E
A
 
A
A
 
-
Q
 
-
T
 
-
E
 
-
L
 
M
S
 
V
T
 
R
R
 
K
Y
 
E
G
 
N
K
 
N
D
 
D
F
 
R
V
 
L
R
 
H
S
 
F
V
 
V
N
 
Q
M
x
T
N
x
D
V
x
I
T
 
T
S
 
D
E
 
E
A
 
A
A
 
A
V
 
C
E
 
Q
S
 
H
G
 
A
F
 
V
G
 
E
D
 
S
A
 
A
L
 
V
L
 
H
A
 
T
F
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
I
S
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
L
 
I
A
 
E
T
 
I
S
 
V
A
 
A
A
 
P
V
 
I
E
 
H
D
 
E
T
 
M
T
 
E
L
 
L
A
 
S
L
 
D
W
 
W
N
 
N
K
 
K
N
 
V
M
 
L
D
 
Q
I
 
V
L
 
N
A
 
L
T
 
T
G
 
G
Y
 
M
F
 
F
L
 
L
V
 
M
S
 
S
R
 
K
E
 
H
A
 
A
F
 
L
R
 
K
I
 
-
F
 
-
R
 
H
N
 
M
Q
 
L
K
 
A
A
 
A
G
 
G
-
 
K
G
 
G
N
 
N
V
 
I
V
 
I
F
 
N
V
x
T
A
 
C
S
|
S
K
 
V
N
 
G
G
 
G
L
 
L
A
 
V
A
 
A
S
 
W
P
 
P
G
 
D
A
 
I
S
 
P
A
 
A
Y
|
Y
C
 
N
T
 
A
A
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
G
E
 
V
I
 
L
H
 
Q
L
 
L
A
 
T
R
 
K
C
 
S
L
 
M
A
 
A
L
 
V
E
 
D
G
 
Y
A
 
A
S
 
K
A
 
H
Q
 
Q
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
V
 
C
V
 
V
N
 
C
P
|
P
D
x
G
A
 
I
V
x
I
-
 
D
-
 
T
L
 
L
R
 
R
G
 
L
S
 
G
K
 
K
I
 
-
W
 
-
T
 
-
G
 
-
E
 
-
W
 
-
K
 
-
E
 
-
Q
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
Y
 
-
K
 
-
M
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
-
E
 
-
L
 
-
E
 
-
A
 
-
H
 
-
Y
 
-
R
 
-
E
 
-
R
 
-
S
 
-
M
 
-
L
 
-
K
 
-
L
 
-
S
 
-
V
 
-
F
 
-
P
 
P
E
 
E
D
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
N
A
 
V
I
 
M
Y
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
M
 
L
S
 
S
A
 
S
K
 
Y
S
 
M
T
 
T
G
 
G
N
 
S
I
 
A
V
 
I
N
 
T
V
 
A
D
 
D
A
 
G
G
 
G

3rwbA Crystal structure of complex of 4pal (4-pyridoxolactone) and pldh (tetrameric pyridoxal 4-dehydrogenase) from mesorhizobium loti
33% identity, 37% coverage: 435:692/699 of query aligns to 4:243/247 of 3rwbA

query
sites
3rwbA
L
 
L
A
 
A
G
 
G
R
 
K
I
 
T
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
A
G
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
K
A
 
A
T
 
I
A
 
A
N
 
A
R
 
R
L
 
L
M
 
A
Q
 
A
E
 
D
G
 
G
A
 
A
C
 
T
V
 
V
V
 
I
L
 
V
A
 
S
D
|
D
I
|
I
D
 
N
E
 
A
T
 
E
A
 
G
L
 
A
E
 
K
A
 
A
A
 
A
Q
 
A
T
 
A
E
 
S
L
 
I
S
 
G
T
 
K
R
 
K
Y
 
-
G
 
-
K
 
-
D
 
-
F
 
-
V
 
A
R
 
R
S
 
A
V
 
I
N
 
A
M
 
A
N
x
D
V
x
I
T
 
S
S
 
D
E
 
P
A
 
G
A
 
S
V
 
V
E
 
K
S
 
A
G
 
L
F
 
F
G
 
A
D
 
E
A
 
I
L
 
Q
L
 
A
A
 
L
F
 
T
G
 
G
G
 
G
L
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
S
 
N
N
|
N
A
|
A
G
x
S
L
 
I
A
 
V
T
 
P
S
 
F
A
 
V
A
 
A
V
 
W
E
 
D
D
 
D
T
 
V
T
 
D
L
 
L
A
 
D
L
 
H
W
 
W
N
 
R
K
 
K
N
 
I
M
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
N
A
 
L
T
 
T
G
 
G
Y
 
T
F
 
F
L
 
I
V
 
V
S
 
T
R
 
R
E
 
A
A
 
G
F
 
T
R
 
D
I
 
Q
F
 
M
R
 
R
N
 
A
Q
 
A
K
 
G
A
 
K
G
 
A
G
 
G
N
 
R
V
 
V
V
 
I
F
 
S
V
x
I
A
 
A
S
|
S
K
x
N
N
x
T
G
 
F
L
 
F
A
 
A
A
 
G
S
 
T
P
 
P
G
 
N
A
x
M
S
 
A
A
 
A
Y
|
Y
C
 
V
T
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
G
A
 
G
E
 
V
I
 
I
H
 
G
L
 
F
A
 
T
R
 
R
C
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
T
E
 
E
G
 
L
A
 
G
S
 
K
A
 
Y
Q
 
N
I
 
I
R
 
T
V
 
A
N
 
N
V
 
A
V
 
V
N
 
T
P
|
P
D
 
G
A
x
L
V
x
I
L
 
-
R
 
-
G
 
-
S
 
-
K
 
-
I
 
-
W
 
-
T
 
-
G
 
-
E
 
E
W
x
S
K
 
D
E
x
G
Q
x
V
R
 
K
A
 
A
A
 
S
A
 
P
Y
x
H
K
 
-
M
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
N
E
 
E
L
 
A
E
 
F
A
 
G
H
 
F
Y
 
V
R
 
E
E
 
M
R
 
L
S
 
Q
M
 
A
L
 
M
K
 
K
L
 
G
S
 
K
V
 
G
F
 
Q
P
 
P
E
 
E
D
 
H
I
 
I
A
 
A
E
 
D
A
 
V
I
 
V
Y
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
M
 
D
S
 
A
A
 
R
K
 
W
S
 
I
T
 
T
G
 
G
N
 
Q
I
 
T
V
 
L
N
 
N
V
 
V
D
 
D
A
 
A
G
 
G

3ndrA Crystal structure of tetrameric pyridoxal 4-dehydrogenase from mesorhizobium loti
33% identity, 37% coverage: 435:692/699 of query aligns to 4:243/247 of 3ndrA

query
sites
3ndrA
L
 
L
A
 
A
G
 
G
R
 
K
I
 
T
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
A
G
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
K
A
 
A
T
 
I
A
 
A
N
 
A
R
 
R
L
 
L
M
 
A
Q
 
A
E
 
D
G
 
G
A
 
A
C
 
T
V
 
V
V
 
I
L
 
V
A
 
S
D
|
D
I
|
I
D
 
N
E
 
A
T
 
E
A
 
G
L
 
A
E
 
K
A
 
A
A
 
A
Q
 
A
T
 
A
E
 
S
L
 
I
S
 
G
T
 
K
R
 
K
Y
 
-
G
 
-
K
 
-
D
 
-
F
 
-
V
 
A
R
 
R
S
 
A
V
 
I
N
 
A
M
 
A
N
x
D
V
x
I
T
 
S
S
 
D
E
 
P
A
 
G
A
 
S
V
 
V
E
 
K
S
 
A
G
 
L
F
 
F
G
 
A
D
 
E
A
 
I
L
 
Q
L
 
A
A
 
L
F
 
T
G
 
G
G
 
G
L
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
S
 
N
N
|
N
A
|
A
G
x
S
L
 
I
A
 
V
T
 
P
S
 
F
A
 
V
A
 
A
V
 
W
E
 
D
D
 
D
T
 
V
T
 
D
L
 
L
A
 
D
L
 
H
W
 
W
N
 
R
K
 
K
N
 
I
M
 
I
D
 
D
I
x
V
L
 
N
A
 
L
T
 
T
G
 
G
Y
 
T
F
 
F
L
 
I
V
 
V
S
 
T
R
 
R
E
 
A
A
 
G
F
 
T
R
 
D
I
 
Q
F
 
M
R
 
R
N
 
A
Q
 
A
K
 
G
A
 
K
G
 
A
G
 
G
N
 
R
V
 
V
V
 
I
F
 
S
V
x
I
A
 
A
S
|
S
K
 
N
N
 
T
G
 
F
L
 
F
A
 
A
A
 
G
S
 
T
P
 
P
G
 
N
A
 
M
S
 
A
A
 
A
Y
|
Y
C
 
V
T
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
G
A
 
G
E
 
V
I
 
I
H
 
G
L
 
F
A
 
T
R
 
R
C
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
T
E
 
E
G
 
L
A
 
G
S
 
K
A
 
Y
Q
 
N
I
 
I
R
 
T
V
 
A
N
 
N
V
 
A
V
 
V
N
 
T
P
|
P
D
 
G
A
x
L
V
x
I
L
 
-
R
 
-
G
 
-
S
 
-
K
 
-
I
 
-
W
 
-
T
 
-
G
 
-
E
 
E
W
x
S
K
 
D
E
x
G
Q
x
V
R
 
K
A
 
A
A
 
S
A
 
P
Y
 
H
K
 
-
M
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
N
E
 
E
L
 
A
E
 
F
A
 
G
H
 
F
Y
 
V
R
 
E
E
 
M
R
 
L
S
 
Q
M
 
A
L
 
M
K
 
K
L
 
G
S
 
K
V
 
G
F
 
Q
P
 
P
E
 
E
D
 
H
I
 
I
A
 
A
E
 
D
A
 
V
I
 
V
Y
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
M
 
D
S
 
A
A
 
R
K
 
W
S
 
I
T
 
T
G
 
G
N
 
Q
I
 
T
V
 
L
N
 
N
V
 
V
D
 
D
A
 
A
G
 
G

3ak4A Crystal structure of nadh-dependent quinuclidinone reductase from agrobacterium tumefaciens
35% identity, 37% coverage: 435:692/699 of query aligns to 5:254/258 of 3ak4A

query
sites
3ak4A
L
 
L
A
 
S
G
 
G
R
 
R
I
 
K
A
 
A
L
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
S
G
x
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
A
A
 
A
T
 
I
A
 
A
N
 
R
R
 
A
L
 
L
M
 
D
Q
 
K
E
 
A
G
 
G
A
 
A
C
 
T
V
 
V
V
 
A
L
 
I
A
 
A
D
|
D
I
x
L
D
 
D
E
 
-
T
 
-
A
 
-
L
 
V
E
 
M
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
T
 
A
E
 
V
L
 
V
S
 
A
T
 
G
R
 
L
Y
 
E
G
 
N
K
 
G
D
 
G
F
 
F
V
 
-
R
 
-
S
 
A
V
 
V
N
 
E
M
x
V
N
x
D
V
|
V
T
 
T
S
 
K
E
 
R
A
 
A
A
 
S
V
 
V
E
 
D
S
 
A
G
 
A
F
 
M
G
 
Q
D
 
K
A
 
A
L
 
I
L
 
D
A
 
A
F
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
F
D
 
D
I
 
L
L
 
L
V
 
C
S
 
A
N
|
N
A
|
A
G
|
G
L
 
V
A
 
S
T
 
T
S
 
M
A
 
R
A
 
P
V
 
A
E
 
V
D
 
D
T
 
I
T
 
T
L
 
D
A
 
E
L
 
E
W
 
W
N
 
D
K
 
F
N
 
N
M
 
F
D
 
D
I
 
V
L
 
N
A
 
A
T
 
R
G
 
G
Y
 
V
F
 
F
L
 
L
V
 
A
S
 
N
R
 
Q
E
 
I
A
 
A
F
 
C
R
 
R
I
 
H
F
 
F
R
 
L
N
 
A
Q
 
S
K
 
N
A
 
T
G
 
K
G
 
G
N
 
V
V
 
I
V
 
V
F
 
N
V
x
T
A
 
A
S
|
S
K
 
L
N
 
A
G
 
A
L
 
K
A
 
V
A
 
G
S
 
A
P
 
P
G
 
L
A
x
L
S
 
A
A
 
H
Y
|
Y
C
 
S
T
 
A
A
 
S
K
|
K
A
 
F
A
 
A
E
 
V
I
 
F
H
 
G
L
 
W
A
 
T
R
 
Q
C
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
R
E
 
E
G
 
M
A
 
A
S
 
P
A
 
K
Q
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
V
 
C
V
 
V
N
 
C
P
 
P
D
x
G
A
 
F
V
|
V
L
 
K
R
x
T
G
 
A
S
x
M
K
 
Q
-
 
E
-
 
R
-
 
E
-
 
I
I
 
I
W
 
W
T
x
E
G
 
A
E
 
E
W
 
L
K
 
R
E
 
-
Q
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
Y
 
-
K
 
G
M
 
M
D
 
T
V
 
P
D
 
E
E
 
A
L
 
V
E
 
R
A
 
A
H
 
E
Y
 
Y
R
 
V
E
 
S
R
 
L
S
 
T
M
 
P
L
 
L
K
 
G
L
 
R
S
 
I
V
 
E
F
 
E
P
 
P
E
 
E
D
 
D
I
 
V
A
 
A
E
 
D
A
 
V
I
 
V
Y
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
M
 
A
S
 
A
A
 
R
K
 
F
S
 
M
T
 
T
G
 
G
N
 
Q
I
 
G
V
 
I
N
 
N
V
 
V
D
 
T
A
 
G
G
 
G

8dt1C Crystal structure of a putative d-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase from burkholderia cenocepacia j2315 in complex with NAD
36% identity, 37% coverage: 434:692/699 of query aligns to 1:255/259 of 8dt1C

query
sites
8dt1C
S
 
N
L
 
L
A
 
N
G
 
G
R
 
K
I
 
T
A
 
A
L
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
A
G
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
K
A
 
E
T
 
I
A
 
A
N
 
L
R
 
E
L
 
L
M
 
A
Q
 
K
E
 
A
G
 
G
A
 
A
C
 
A
V
 
V
V
 
A
L
 
I
A
 
A
D
|
D
I
x
L
D
 
N
E
 
Q
T
 
D
A
 
G
L
 
A
E
 
N
A
 
A
A
 
V
Q
 
A
T
 
D
E
 
E
L
 
I
S
 
N
T
 
K
R
 
A
Y
 
G
G
 
G
K
 
K
D
 
A
F
 
I
V
 
-
R
 
-
S
 
G
V
 
V
N
 
A
M
|
M
N
 
D
V
|
V
T
 
T
S
 
N
E
 
E
A
 
E
A
 
A
V
 
V
E
 
N
S
 
T
G
 
G
F
 
I
G
 
D
D
 
K
A
 
V
L
 
A
L
 
E
A
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
S
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
S
 
S
N
|
N
A
|
A
G
 
G
L
 
I
A
 
Q
T
 
I
S
 
V
A
 
N
A
 
P
V
 
I
E
 
E
D
 
N
T
 
Y
T
 
S
L
 
F
A
 
A
L
 
D
W
 
W
N
 
K
K
 
K
N
 
M
M
 
Q
D
 
A
I
 
I
L
 
H
A
 
V
T
 
D
G
 
G
Y
 
A
F
 
F
L
 
L
V
 
T
S
 
T
R
 
K
E
 
A
A
 
A
F
 
L
R
 
K
I
 
H
F
 
M
R
 
Y
N
 
K
Q
 
D
K
 
D
A
 
R
G
 
G
G
 
G
N
 
V
V
 
V
V
 
I
F
 
Y
V
x
M
A
 
G
S
 
S
K
 
V
N
 
H
G
 
S
L
 
H
A
 
E
A
 
A
S
 
S
P
 
P
G
 
L
A
 
K
S
 
S
A
 
A
Y
|
Y
C
 
V
T
 
T
A
 
A
K
|
K
A
 
H
A
 
G
E
 
L
I
 
L
H
 
G
L
 
L
A
 
A
R
 
R
C
 
V
L
 
L
A
 
A
L
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
S
 
K
A
 
H
Q
 
N
I
 
V
R
 
R
V
 
S
N
 
H
V
 
V
V
 
V
N
 
C
P
|
P
D
x
G
A
x
F
V
|
V
L
 
R
R
 
-
G
 
-
S
x
T
K
 
P
I
 
L
W
 
V
T
 
D
G
 
K
E
 
Q
W
 
I
K
 
P
E
 
E
Q
 
Q
R
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
A
Y
 
K
K
 
E
M
 
L
D
 
G
V
 
I
D
 
S
E
 
E
L
 
E
E
 
E
A
 
V
H
 
-
Y
 
-
R
 
I
E
 
K
R
 
K
S
 
V
M
 
M
L
 
L
K
 
G
L
 
N
S
 
T
V
 
V
-
 
D
-
 
G
-
 
V
-
 
F
-
 
T
F
 
T
P
 
V
E
 
Q
D
 
D
I
 
V
A
 
A
E
 
Q
A
 
T
I
 
V
Y
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
S
S
 
A
D
 
F
M
 
P
S
 
S
A
 
A
K
 
A
S
 
L
T
 
T
G
 
G
N
 
Q
I
 
S
V
 
F
N
 
I
V
 
V
D
 
S
A
 
H
G
 
G

6zzpA Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from psychrobacter arcticus complexed with NAD+ and 3-oxovalerate (see paper)
37% identity, 27% coverage: 433:619/699 of query aligns to 6:190/265 of 6zzpA

query
sites
6zzpA
K
 
Q
S
 
D
L
 
L
A
 
T
G
 
G
R
 
K
I
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
A
G
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
R
A
 
D
T
 
I
A
 
A
N
 
E
R
 
T
L
 
Y
M
 
A
Q
 
K
E
 
A
G
 
G
A
 
A
C
 
A
V
 
V
V
 
G
L
 
I
A
 
A
D
|
D
I
|
I
D
 
N
E
 
-
T
 
-
A
 
-
L
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
T
 
K
E
 
T
L
 
V
-
 
D
S
 
A
T
 
I
R
 
E
Y
 
A
G
 
A
K
 
G
D
 
G
F
 
R
V
 
A
R
 
L
S
 
A
V
 
I
N
 
A
M
|
M
N
x
D
V
|
V
T
 
T
S
 
S
E
 
E
A
 
A
A
 
A
V
 
V
E
 
N
S
 
D
G
 
G
F
 
V
G
 
Q
D
 
R
A
 
L
L
 
V
L
 
D
A
 
T
F
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
S
 
S
N
|
N
A
|
A
G
|
G
L
 
I
A
x
Q
T
 
I
S
 
I
A
 
D
A
 
P
V
 
I
E
 
H
D
 
K
T
 
M
T
 
A
L
 
F
A
 
E
L
 
D
W
 
W
N
 
K
K
 
K
N
 
M
M
 
L
D
 
A
I
 
I
L
 
H
A
 
L
T
 
D
G
 
G
Y
 
A
F
 
F
L
 
L
V
 
T
S
 
T
R
 
K
E
 
A
A
 
A
F
 
I
R
 
Q
I
 
H
F
 
M
R
 
Y
N
 
K
Q
 
D
K
 
D
A
 
K
G
 
G
G
 
G
N
 
T
V
 
V
V
 
I
F
 
Y
V
x
M
A
 
G
S
|
S
K
 
V
N
x
H
G
 
S
L
 
H
A
 
E
A
 
A
S
 
S
P
 
L
G
 
F
A
x
K
S
 
A
A
 
P
Y
|
Y
C
 
V
T
 
T
A
 
A
K
|
K
A
 
H
A
 
G
E
 
L
I
 
L
H
 
G
L
 
L
A
 
C
R
 
R
C
 
V
L
 
L
A
 
A
L
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
S
 
V
A
 
H
Q
 
N
I
 
V
R
 
R
V
 
S
N
 
H
V
 
V
V
 
I
N
 
C
P
|
P

Sites not aligning to the query:

6zzoC Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from psychrobacter arcticus complexed with NAD+ and acetoacetate (see paper)
37% identity, 27% coverage: 433:619/699 of query aligns to 6:190/265 of 6zzoC

query
sites
6zzoC
K
 
Q
S
 
D
L
 
L
A
 
T
G
 
G
R
 
K
I
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
A
G
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
R
A
 
D
T
 
I
A
 
A
N
 
E
R
 
T
L
 
Y
M
 
A
Q
 
K
E
 
A
G
 
G
A
 
A
C
 
A
V
 
V
V
 
G
L
 
I
A
 
A
D
|
D
I
|
I
D
 
N
E
 
-
T
 
-
A
 
-
L
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
T
 
K
E
 
T
L
 
V
-
 
D
S
 
A
T
 
I
R
 
E
Y
 
A
G
 
A
K
 
G
D
 
G
F
 
R
V
 
A
R
 
L
S
 
A
V
 
I
N
 
A
M
|
M
N
x
D
V
|
V
T
 
T
S
 
S
E
 
E
A
 
A
A
 
A
V
 
V
E
 
N
S
 
D
G
 
G
F
 
V
G
 
Q
D
 
R
A
 
L
L
 
V
L
 
D
A
 
T
F
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
S
 
S
N
|
N
A
|
A
G
|
G
L
 
I
A
x
Q
T
 
I
S
 
I
A
 
D
A
 
P
V
 
I
E
 
H
D
 
K
T
 
M
T
 
A
L
 
F
A
 
E
L
 
D
W
 
W
N
 
K
K
 
K
N
 
M
M
 
L
D
 
A
I
 
I
L
 
H
A
 
L
T
 
D
G
 
G
Y
 
A
F
 
F
L
 
L
V
 
T
S
 
T
R
 
K
E
 
A
A
 
A
F
 
I
R
 
Q
I
 
H
F
 
M
R
 
Y
N
 
K
Q
 
D
K
 
D
A
 
K
G
 
G
G
 
G
N
 
T
V
 
V
V
 
I
F
 
Y
V
x
M
A
 
G
S
 
S
K
 
V
N
x
H
G
 
S
L
 
H
A
 
E
A
 
A
S
 
S
P
 
L
G
 
F
A
x
K
S
 
A
A
 
P
Y
|
Y
C
 
V
T
 
T
A
 
A
K
|
K
A
 
H
A
 
G
E
 
L
I
 
L
H
 
G
L
 
L
A
 
C
R
 
R
C
 
V
L
 
L
A
 
A
L
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
S
 
V
A
 
H
Q
 
N
I
 
V
R
 
R
V
 
S
N
 
H
V
 
V
V
 
I
N
 
C
P
|
P

Sites not aligning to the query:

7ejiB Crystal structure of kred f147l/l153q/y190p/l199a/m205f/m206f variant and methyl methacrylate complex
31% identity, 37% coverage: 435:692/699 of query aligns to 4:247/251 of 7ejiB

query
sites
7ejiB
L
 
L
A
 
K
G
 
G
R
 
K
I
 
V
A
 
A
L
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
x
T
G
x
L
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
L
A
 
A
T
 
I
A
 
A
N
 
D
R
 
K
L
 
F
M
 
V
Q
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
C
 
K
V
 
V
V
 
V
L
 
I
-
 
T
-
 
G
-
x
R
-
x
H
A
 
A
D
 
D
I
 
V
D
 
G
E
 
E
T
 
K
A
 
A
L
 
A
E
 
K
A
 
S
A
 
I
Q
 
G
T
 
-
E
 
-
L
 
-
S
 
-
T
 
-
R
 
-
Y
 
-
G
 
G
K
 
T
D
 
D
F
 
V
V
 
I
R
 
R
S
 
F
V
 
V
N
 
Q
M
 
H
N
x
D
V
x
A
T
 
S
S
 
D
E
 
E
A
 
A
A
 
G
V
 
W
E
 
T
S
 
K
G
 
L
F
 
F
G
 
D
D
 
T
A
 
T
L
 
E
L
 
E
A
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
P
L
 
V
D
 
T
I
 
T
L
 
V
V
 
V
S
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
L
 
I
A
 
A
T
 
V
S
 
S
A
 
K
A
 
S
V
 
V
E
 
E
D
 
D
T
 
T
T
 
T
L
 
T
A
 
E
L
 
E
W
 
W
N
 
R
K
 
K
N
 
L
M
 
L
D
 
S
I
x
V
L
 
N
A
 
L
T
 
D
G
 
G
Y
 
V
F
 
F
L
 
F
V
 
G
S
 
T
R
 
R
E
 
L
A
 
G
F
 
I
R
 
Q
I
 
R
F
 
M
R
 
K
N
 
N
Q
 
K
K
 
G
A
 
L
G
 
G
G
 
A
N
 
S
V
 
I
V
 
I
F
 
N
V
x
M
A
 
S
S
|
S
K
x
I
N
 
E
G
 
G
L
 
L
A
 
V
A
 
G
S
 
D
P
 
P
G
 
T
A
 
Q
S
 
G
A
 
A
Y
|
Y
C
 
N
T
 
A
A
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
A
E
 
V
I
 
R
H
 
I
L
 
M
A
 
S
R
 
K
C
 
S
L
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
D
G
 
C
A
 
A
-
 
L
-
 
K
S
 
D
A
 
Y
Q
 
D
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
V
 
T
V
 
V
N
 
H
P
|
P
D
 
G
A
x
P
V
x
I
L
 
-
R
 
-
G
 
-
S
 
-
K
 
-
I
 
-
W
 
-
T
 
-
G
 
-
E
 
-
W
 
-
K
 
-
E
 
-
Q
 
-
R
 
-
A
 
K
A
x
T
A
x
P
Y
x
L
K
 
V
M
 
D
D
 
D
V
 
A
D
 
E
E
 
G
L
 
A
E
 
E
A
 
E
H
 
F
Y
x
F
R
 
S
E
 
Q
R
 
R
S
 
T
M
 
K
L
 
T
K
 
P
L
 
M
S
 
G
V
 
H
F
 
I
-
 
G
-
 
E
P
 
P
E
 
N
D
 
D
I
 
I
A
 
A
E
 
W
A
 
I
I
 
C
Y
 
V
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
M
 
E
S
 
S
A
 
K
K
 
F
S
 
A
T
 
T
G
 
G
N
 
A
I
 
E
V
 
F
N
 
V
V
 
V
D
 
D
A
 
G
G
 
G

7ejhA Crystal structure of kred mutant-f147l/l153q/y190p/l199a/m205f/m206f and 2-hydroxyisoindoline-1,3-dione complex
31% identity, 37% coverage: 435:692/699 of query aligns to 6:249/253 of 7ejhA

query
sites
7ejhA
L
 
L
A
 
K
G
 
G
R
 
K
I
 
V
A
 
A
L
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
x
T
G
 
L
G
 
G
I
|
I
G
 
G
K
 
L
A
 
A
T
 
I
A
 
A
N
 
D
R
 
K
L
 
F
M
 
V
Q
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
C
 
K
V
 
V
V
 
V
L
 
I
-
 
T
-
 
G
-
x
R
-
x
H
A
 
A
D
 
D
I
 
V
D
 
G
E
 
E
T
 
K
A
 
A
L
 
A
E
 
K
A
 
S
A
 
I
Q
 
G
T
 
-
E
 
-
L
 
-
S
 
-
T
 
-
R
 
-
Y
 
-
G
 
G
K
 
T
D
 
D
F
 
V
V
 
I
R
 
R
S
 
F
V
 
V
N
 
Q
M
 
H
N
x
D
V
x
A
T
 
S
S
 
D
E
 
E
A
 
A
A
 
G
V
 
W
E
 
T
S
 
K
G
 
L
F
 
F
G
 
D
D
 
T
A
 
T
L
 
E
L
 
E
A
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
P
L
 
V
D
 
T
I
 
T
L
 
V
V
 
V
S
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
L
 
I
A
 
A
T
 
V
S
 
S
A
 
K
A
 
S
V
 
V
E
 
E
D
 
D
T
 
T
T
 
T
L
 
T
A
 
E
L
 
E
W
 
W
N
 
R
K
 
K
N
 
L
M
 
L
D
 
S
I
x
V
L
 
N
A
 
L
T
 
D
G
 
G
Y
 
V
F
 
F
L
 
F
V
 
G
S
 
T
R
 
R
E
 
L
A
 
G
F
 
I
R
 
Q
I
 
R
F
 
M
R
 
K
N
 
N
Q
 
K
K
 
G
A
 
L
G
 
G
G
 
A
N
 
S
V
 
I
V
 
I
F
 
N
V
x
M
A
 
S
S
|
S
K
x
I
N
x
E
G
 
G
L
 
L
A
 
V
A
 
G
S
 
D
P
 
P
G
 
T
A
 
Q
S
 
G
A
 
A
Y
|
Y
C
 
N
T
 
A
A
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
A
E
 
V
I
 
R
H
 
I
L
 
M
A
 
S
R
 
K
C
 
S
L
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
D
G
 
C
A
 
A
-
 
L
-
 
K
S
 
D
A
 
Y
Q
 
D
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
V
 
T
V
 
V
N
 
H
P
|
P
D
x
G
A
x
P
V
x
I
L
 
-
R
 
-
G
 
-
S
 
-
K
 
-
I
 
-
W
 
-
T
 
-
G
 
-
E
 
-
W
 
-
K
 
-
E
 
-
Q
 
-
R
 
-
A
 
K
A
x
T
A
x
P
Y
x
L
K
x
V
M
 
D
D
 
D
V
 
A
D
 
E
E
 
G
L
 
A
E
 
E
A
 
E
H
 
F
Y
x
F
R
 
S
E
 
Q
R
 
R
S
 
T
M
 
K
L
 
T
K
 
P
L
 
M
S
 
G
V
 
H
F
 
I
-
 
G
-
 
E
P
 
P
E
 
N
D
 
D
I
 
I
A
 
A
E
 
W
A
 
I
I
 
C
Y
 
V
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
M
 
E
S
 
S
A
 
K
K
 
F
S
 
A
T
 
T
G
 
G
N
 
A
I
 
E
V
 
F
N
 
V
V
 
V
D
 
D
A
 
G
G
 
G

6d9yB Crystal structure of a short chain dehydrogenase/reductase sdr from burkholderia phymatum with partially occupied NAD
32% identity, 37% coverage: 435:694/699 of query aligns to 7:249/251 of 6d9yB

query
sites
6d9yB
L
 
L
A
 
E
G
 
G
R
 
R
I
 
V
A
 
V
L
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
G
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
K
 
Y
A
 
A
T
 
V
A
 
A
N
 
Q
R
 
R
L
 
A
M
 
L
Q
 
R
E
 
S
G
 
G
A
 
A
C
 
A
V
 
V
V
 
A
L
 
L
A
 
W
D
|
D
I
x
L
D
 
D
E
 
A
T
 
E
A
 
R
L
 
L
E
 
A
A
 
R
A
 
S
Q
 
E
T
 
R
E
 
E
L
 
L
S
 
A
T
 
-
R
 
E
Y
 
L
G
 
G
K
 
K
D
 
-
F
 
-
V
 
V
R
 
C
S
 
A
V
 
V
N
 
T
M
x
V
N
x
D
V
x
Q
T
 
T
S
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
Q
V
 
I
E
 
E
S
 
A
G
 
A
F
 
V
G
 
G
D
 
K
A
 
T
L
 
L
L
 
A
A
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
A
L
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
I
S
 
N
N
 
C
A
|
A
G
 
G
L
 
I
A
 
T
T
 
G
S
 
G
A
 
-
A
 
-
V
 
-
E
 
N
D
 
G
T
 
T
T
 
T
L
 
W
A
 
E
L
 
L
-
 
E
-
 
P
-
 
D
-
 
V
W
 
W
N
 
R
K
 
Q
N
 
V
M
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
N
A
 
L
T
 
I
G
 
G
Y
 
P
F
 
Y
L
 
L
V
 
V
S
 
C
R
 
R
E
 
A
A
 
V
F
 
V
R
 
P
I
 
Q
F
 
M
R
 
L
N
 
K
Q
 
Q
K
 
G
A
 
Y
G
 
-
G
 
G
N
 
R
V
 
I
V
 
V
F
 
N
V
 
I
A
 
A
S
|
S
K
 
V
N
 
A
G
 
G
L
 
K
A
 
E
A
 
G
S
 
N
P
 
P
G
 
N
A
 
A
S
 
S
A
 
H
Y
|
Y
C
 
S
T
 
A
A
 
S
K
|
K
A
 
A
A
 
G
E
 
L
I
 
I
H
 
G
L
 
L
A
 
T
R
 
K
C
 
S
L
 
L
A
 
G
L
 
K
E
 
E
G
 
L
A
 
A
S
 
T
A
 
K
Q
 
N
I
 
I
R
 
L
V
 
V
N
 
N
V
 
A
V
 
V
N
 
T
P
|
P
D
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
-
R
 
-
G
 
-
S
 
-
K
 
-
I
 
-
W
 
-
T
 
-
G
 
-
E
 
-
W
 
-
K
 
-
E
 
-
Q
 
-
R
 
-
A
|
A
A
|
A
A
|
A
Y
 
K
K
x
T
M
 
E
D
 
I
V
 
F
D
 
D
E
 
S
L
 
M
E
 
K
A
 
Q
H
 
E
Y
 
H
R
 
I
E
 
D
R
 
Y
S
 
M
M
 
L
L
 
S
K
 
K
L
 
I
S
 
P
-
 
M
-
 
N
-
 
R
-
 
F
V
 
L
F
 
L
P
 
P
E
 
D
D
 
E
I
 
A
A
 
A
E
 
S
A
 
L
I
 
I
Y
 
L
F
 
W
L
 
L
A
 
G
S
 
S
D
 
E
M
 
D
S
 
C
A
 
A
K
 
F
S
 
S
T
 
T
G
 
G
N
 
S
I
 
V
V
 
F
N
 
D
V
 
L
D
 
S
A
 
G
G
 
G
N
 
R
A
 
A

1g0oC Structure of trihydroxynaphthalene reductase in complex with NADPH and pyroquilon (see paper)
29% identity, 38% coverage: 430:692/699 of query aligns to 20:278/281 of 1g0oC

query
sites
1g0oC
P
 
P
K
 
Q
P
 
S
K
 
A
S
 
S
L
 
L
A
 
E
G
 
G
R
 
K
I
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
G
G
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
R
A
 
E
T
 
M
A
 
A
N
 
M
R
 
E
L
 
L
M
 
G
Q
 
R
E
 
R
G
 
G
A
 
-
C
 
C
V
 
K
V
 
V
L
 
I
A
 
V
D
 
N
I
 
Y
D
x
A
E
x
N
T
x
S
A
 
T
L
 
E
E
 
S
A
 
A
A
 
E
Q
 
E
T
 
V
E
 
V
L
 
A
S
 
A
T
 
I
R
 
K
Y
 
K
G
 
N
K
 
G
D
 
S
F
 
D
V
 
A
R
 
A
S
 
C
V
 
V
N
 
K
M
 
A
N
|
N
V
|
V
T
 
G
S
 
V
E
 
V
A
 
E
A
 
D
V
 
I
E
 
V
S
 
R
G
 
M
F
 
F
G
 
E
D
 
E
A
 
A
L
 
V
L
 
K
A
 
I
F
 
F
G
 
G
G
 
K
L
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
V
V
 
C
S
 
S
N
|
N
A
x
S
G
|
G
L
 
V
A
 
V
T
 
S
S
 
F
A
 
G
A
 
H
V
 
V
E
 
K
D
 
D
T
 
V
T
 
T
L
 
P
A
 
E
L
 
E
W
 
F
N
 
D
K
 
R
N
 
V
M
 
F
D
 
T
I
 
I
L
 
N
A
 
T
T
 
R
G
 
G
Y
 
Q
F
 
F
L
 
F
V
 
V
S
 
A
R
 
R
E
 
E
A
 
A
F
 
-
R
 
-
I
 
-
F
 
Y
R
 
K
N
 
H
Q
 
L
K
 
E
A
 
I
G
 
G
G
 
G
N
 
R
V
 
L
V
 
I
F
 
L
V
x
M
A
 
G
S
|
S
K
x
I
N
 
T
G
 
G
L
 
Q
A
 
A
-
 
K
A
 
A
S
 
V
P
 
P
G
 
K
A
x
H
S
 
A
A
 
V
Y
|
Y
C
 
S
T
 
G
A
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
A
E
 
I
I
 
E
H
 
T
L
 
F
A
 
A
R
 
R
C
 
C
L
 
M
A
 
A
L
 
I
E
 
D
G
 
M
A
 
A
S
 
D
A
 
K
Q
 
K
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
V
V
 
V
N
 
A
P
|
P
D
 
G
A
x
G
V
x
I
L
 
K
R
 
-
G
 
-
S
x
T
K
 
D
I
x
M
W
 
Y
T
 
H
G
 
A
E
 
V
W
 
C
K
 
R
E
 
E
Q
x
Y
R
 
I
A
 
P
A
 
N
A
 
G
Y
 
E
K
 
N
M
 
L
D
 
S
V
 
N
D
 
E
E
 
E
L
 
V
E
 
D
A
 
E
H
 
Y
Y
 
A
R
 
A
E
 
V
R
 
Q
-
 
W
S
 
S
M
 
P
L
 
L
K
 
R
L
 
R
S
 
V
V
 
G
F
 
L
P
 
P
E
 
I
D
 
D
I
 
I
A
 
A
E
 
R
A
 
V
I
 
V
Y
 
C
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
N
M
 
D
S
 
G
A
 
G
K
 
W
S
 
V
T
 
T
G
 
G
N
 
K
I
 
V
V
 
I
N
 
G
V
 
I
D
 
D
A
 
G
G
 
G

1g0nA Structure of trihydroxynaphthalene reductase in complex with NADPH and 4,5,6,7-tetrachloro-phthalide (see paper)
29% identity, 38% coverage: 430:692/699 of query aligns to 12:270/273 of 1g0nA

query
sites
1g0nA
P
 
P
K
 
Q
P
 
S
K
 
A
S
 
S
L
 
L
A
 
E
G
 
G
R
 
K
I
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
G
G
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
R
A
 
E
T
 
M
A
 
A
N
 
M
R
 
E
L
 
L
M
 
G
Q
 
R
E
 
R
G
 
G
A
 
-
C
 
C
V
 
K
V
 
V
L
 
I
A
 
V
D
 
N
I
 
Y
D
x
A
E
x
N
T
x
S
A
 
T
L
 
E
E
 
S
A
 
A
A
 
E
Q
 
E
T
 
V
E
 
V
L
 
A
S
 
A
T
 
I
R
 
K
Y
 
K
G
 
N
K
 
G
D
 
S
F
 
D
V
 
A
R
 
A
S
 
C
V
 
V
N
 
K
M
 
A
N
 
N
V
|
V
T
 
G
S
 
V
E
 
V
A
 
E
A
 
D
V
 
I
E
 
V
S
 
R
G
 
M
F
 
F
G
 
E
D
 
E
A
 
A
L
 
V
L
 
K
A
 
I
F
 
F
G
 
G
G
 
K
L
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
V
V
 
C
S
 
S
N
|
N
A
x
S
G
|
G
L
 
V
A
 
V
T
 
S
S
 
F
A
 
G
A
 
H
V
 
V
E
 
K
D
 
D
T
 
V
T
 
T
L
 
P
A
 
E
L
 
E
W
 
F
N
 
D
K
 
R
N
 
V
M
 
F
D
 
T
I
|
I
L
 
N
A
 
T
T
 
R
G
 
G
Y
 
Q
F
 
F
L
 
F
V
 
V
S
 
A
R
 
R
E
 
E
A
 
A
F
 
-
R
 
-
I
 
-
F
 
Y
R
 
K
N
 
H
Q
 
L
K
 
E
A
 
I
G
 
G
G
 
G
N
 
R
V
 
L
V
 
I
F
 
L
V
x
M
A
 
G
S
|
S
K
 
I
N
 
T
G
 
G
L
 
Q
A
 
A
-
 
K
A
 
A
S
 
V
P
 
P
G
 
K
A
x
H
S
 
A
A
 
V
Y
|
Y
C
 
S
T
 
G
A
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
A
E
 
I
I
 
E
H
 
T
L
 
F
A
 
A
R
 
R
C
 
C
L
 
M
A
 
A
L
 
I
E
 
D
G
 
M
A
 
A
S
 
D
A
 
K
Q
 
K
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
V
V
 
V
N
 
A
P
|
P
D
 
G
A
x
G
V
x
I
L
 
K
R
 
-
G
 
-
S
x
T
K
 
D
I
x
M
W
x
Y
T
 
H
G
 
A
E
 
V
W
x
C
K
 
R
E
 
E
Q
x
Y
R
 
I
A
 
P
A
 
N
A
 
G
Y
 
E
K
 
N
M
 
L
D
 
S
V
 
N
D
 
E
E
 
E
L
 
V
E
 
D
A
 
E
H
 
Y
Y
 
A
R
 
A
E
 
V
R
 
Q
-
x
W
S
 
S
M
 
P
L
 
L
K
 
R
L
 
R
S
 
V
V
 
G
F
 
L
P
 
P
E
 
I
D
 
D
I
 
I
A
 
A
E
 
R
A
 
V
I
 
V
Y
 
C
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
N
M
 
D
S
 
G
A
 
G
K
 
W
S
 
V
T
 
T
G
 
G
N
 
K
I
 
V
V
 
I
N
 
G
V
 
I
D
 
D
A
 
G
G
 
G

1dohA Structure of trihydroxynaphthalene reductase in complex with NADPH and 4-nitro-inden-1-one (see paper)
29% identity, 38% coverage: 430:692/699 of query aligns to 12:270/273 of 1dohA

query
sites
1dohA
P
 
P
K
 
Q
P
 
S
K
 
A
S
 
S
L
 
L
A
 
E
G
 
G
R
 
K
I
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
G
G
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
R
A
 
E
T
 
M
A
 
A
N
 
M
R
 
E
L
 
L
M
 
G
Q
 
R
E
 
R
G
 
G
A
 
-
C
 
C
V
 
K
V
 
V
L
 
I
A
 
V
D
 
N
I
 
Y
D
x
A
E
x
N
T
x
S
A
 
T
L
 
E
E
 
S
A
 
A
A
 
E
Q
 
E
T
 
V
E
 
V
L
 
A
S
 
A
T
 
I
R
 
K
Y
 
K
G
 
N
K
 
G
D
 
S
F
 
D
V
 
A
R
 
A
S
 
C
V
 
V
N
 
K
M
 
A
N
|
N
V
|
V
T
 
G
S
 
V
E
 
V
A
 
E
A
 
D
V
 
I
E
 
V
S
 
R
G
 
M
F
 
F
G
 
E
D
 
E
A
 
A
L
 
V
L
 
K
A
 
I
F
 
F
G
 
G
G
 
K
L
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
V
V
 
C
S
 
S
N
|
N
A
x
S
G
|
G
L
 
V
A
 
V
T
 
S
S
 
F
A
 
G
A
 
H
V
 
V
E
 
K
D
 
D
T
 
V
T
 
T
L
 
P
A
 
E
L
 
E
W
 
F
N
 
D
K
 
R
N
 
V
M
 
F
D
 
T
I
 
I
L
 
N
A
 
T
T
 
R
G
 
G
Y
 
Q
F
 
F
L
 
F
V
 
V
S
 
A
R
 
R
E
 
E
A
 
A
F
 
-
R
 
-
I
 
-
F
 
Y
R
 
K
N
 
H
Q
 
L
K
 
E
A
 
I
G
 
G
G
 
G
N
 
R
V
 
L
V
 
I
F
 
L
V
x
M
A
 
G
S
|
S
K
 
I
N
 
T
G
 
G
L
 
Q
A
 
A
-
 
K
A
 
A
S
 
V
P
 
P
G
 
K
A
x
H
S
 
A
A
 
V
Y
|
Y
C
 
S
T
 
G
A
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
A
E
 
I
I
 
E
H
 
T
L
 
F
A
 
A
R
 
R
C
 
C
L
 
M
A
 
A
L
 
I
E
 
D
G
 
M
A
 
A
S
 
D
A
 
K
Q
 
K
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
V
V
 
V
N
 
A
P
|
P
D
 
G
A
x
G
V
x
I
L
 
K
R
 
-
G
 
-
S
x
T
K
 
D
I
x
M
W
x
Y
T
 
H
G
 
A
E
 
V
W
x
C
K
 
R
E
 
E
Q
x
Y
R
 
I
A
 
P
A
 
N
A
 
G
Y
 
E
K
 
N
M
 
L
D
 
S
V
 
N
D
 
E
E
 
E
L
 
V
E
 
D
A
 
E
H
 
Y
Y
 
A
R
 
A
E
 
V
R
 
Q
-
 
W
S
 
S
M
 
P
L
 
L
K
 
R
L
 
R
S
 
V
V
 
G
F
 
L
P
 
P
E
 
I
D
 
D
I
 
I
A
 
A
E
 
R
A
 
V
I
 
V
Y
 
C
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
N
M
 
D
S
 
G
A
 
G
K
 
W
S
 
V
T
 
T
G
 
G
N
 
K
I
 
V
V
 
I
N
 
G
V
 
I
D
 
D
A
 
G
G
 
G

1ybvA Structure of trihydroxynaphthalene reductase in complex with NADPH and an active site inhibitor (see paper)
29% identity, 38% coverage: 430:692/699 of query aligns to 9:267/270 of 1ybvA

query
sites
1ybvA
P
 
P
K
 
Q
P
 
S
K
 
A
S
 
S
L
 
L
A
 
E
G
 
G
R
 
K
I
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
G
G
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
R
A
 
E
T
 
M
A
 
A
N
 
M
R
 
E
L
 
L
M
 
G
Q
 
R
E
 
R
G
 
G
A
 
-
C
 
C
V
 
K
V
 
V
L
 
I
A
 
V
D
 
N
I
 
Y
D
x
A
E
x
N
T
x
S
A
 
T
L
 
E
E
 
S
A
 
A
A
 
E
Q
 
E
T
 
V
E
 
V
L
 
A
S
 
A
T
 
I
R
 
K
Y
 
K
G
 
N
K
 
G
D
 
S
F
 
D
V
 
A
R
 
A
S
 
C
V
 
V
N
 
K
M
 
A
N
|
N
V
|
V
T
 
G
S
 
V
E
 
V
A
 
E
A
 
D
V
 
I
E
 
V
S
 
R
G
 
M
F
 
F
G
 
E
D
 
E
A
 
A
L
 
V
L
 
K
A
 
I
F
 
F
G
 
G
G
 
K
L
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
V
V
 
C
S
 
S
N
|
N
A
x
S
G
|
G
L
 
V
A
 
V
T
 
S
S
 
F
A
 
G
A
 
H
V
 
V
E
 
K
D
 
D
T
 
V
T
 
T
L
 
P
A
 
E
L
 
E
W
 
F
N
 
D
K
 
R
N
 
V
M
 
F
D
 
T
I
 
I
L
 
N
A
 
T
T
 
R
G
 
G
Y
 
Q
F
 
F
L
 
F
V
 
V
S
 
A
R
 
R
E
 
E
A
 
A
F
 
-
R
 
-
I
 
-
F
 
Y
R
 
K
N
 
H
Q
 
L
K
 
E
A
 
I
G
 
G
G
 
G
N
 
R
V
 
L
V
 
I
F
 
L
V
x
M
A
 
G
S
|
S
K
 
I
N
 
T
G
 
G
L
 
Q
A
 
A
-
 
K
A
 
A
S
 
V
P
 
P
G
 
K
A
x
H
S
 
A
A
 
V
Y
|
Y
C
 
S
T
 
G
A
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
A
E
 
I
I
 
E
H
 
T
L
 
F
A
 
A
R
 
R
C
 
C
L
 
M
A
 
A
L
 
I
E
 
D
G
 
M
A
 
A
S
 
D
A
 
K
Q
 
K
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
V
 
V
V
 
V
N
 
A
P
|
P
D
 
G
A
x
G
V
x
I
L
 
K
R
 
-
G
 
-
S
x
T
K
 
D
I
x
M
W
x
Y
T
 
H
G
 
A
E
 
V
W
 
C
K
 
R
E
 
E
Q
x
Y
R
 
I
A
 
P
A
 
N
A
 
G
Y
 
E
K
 
N
M
 
L
D
 
S
V
 
N
D
 
E
E
 
E
L
 
V
E
 
D
A
 
E
H
 
Y
Y
 
A
R
 
A
E
 
V
R
 
Q
-
x
W
S
 
S
M
 
P
L
 
L
K
 
R
L
 
R
S
 
V
V
 
G
F
 
L
P
 
P
E
 
I
D
 
D
I
 
I
A
 
A
E
 
R
A
 
V
I
 
V
Y
 
C
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
N
M
 
D
S
 
G
A
 
G
K
 
W
S
 
V
T
 
T
G
 
G
N
 
K
I
 
V
V
 
I
N
 
G
V
 
I
D
 
D
A
 
G
G
 
G

6xewA Structure of serratia marcescens 2,3-butanediol dehydrogenase (see paper)
30% identity, 37% coverage: 438:696/699 of query aligns to 6:244/251 of 6xewA

query
sites
6xewA
R
 
K
I
 
V
A
 
V
L
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
G
G
x
N
G
|
G
I
x
M
G
 
G
K
 
E
A
 
A
T
 
A
A
 
A
N
 
R
R
 
R
L
 
F
M
 
S
Q
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
C
 
I
V
 
V
V
 
V
L
 
L
A
 
A
D
|
D
I
x
W
D
x
A
E
 
K
T
 
E
A
 
A
L
 
V
E
 
D
A
 
K
A
 
V
Q
 
A
T
 
A
E
 
S
L
 
L
S
 
P
T
 
-
R
 
-
Y
 
-
G
 
-
K
 
K
D
 
G
F
 
R
V
 
A
R
 
M
S
 
A
V
 
V
N
 
H
M
x
I
N
x
D
V
|
V
T
 
S
S
 
D
E
 
H
A
 
V
A
 
A
V
 
V
E
 
E
S
 
K
G
 
M
F
 
M
G
 
N
D
 
E
A
 
V
L
 
A
L
 
E
A
 
K
F
 
L
G
 
G
G
 
R
L
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
L
S
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
L
 
V
A
 
H
T
 
V
S
 
A
A
 
G
A
 
S
V
 
V
E
 
L
D
 
E
T
 
T
T
 
S
L
 
I
A
 
D
L
 
D
W
 
W
N
 
R
K
 
R
N
 
I
M
 
A
D
 
G
I
x
V
L
 
D
A
 
I
T
 
D
G
 
G
Y
 
V
F
 
V
L
 
F
V
 
C
S
 
S
R
 
K
E
 
-
A
 
-
F
 
F
R
 
A
I
 
L
F
 
P
R
 
H
N
 
L
Q
 
L
K
 
K
A
 
T
G
 
K
G
 
G
N
 
C
V
 
I
V
 
V
F
 
N
V
x
T
A
 
A
S
|
S
K
 
V
N
x
S
G
 
G
L
 
L
A
 
G
A
 
G
S
 
D
P
 
W
G
 
G
A
 
A
S
 
A
A
 
Y
Y
|
Y
C
 
C
T
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
G
A
 
A
E
 
V
I
 
V
H
 
N
L
 
L
A
 
T
R
 
R
C
 
A
L
 
M
A
 
A
L
 
L
E
 
D
G
 
H
A
 
G
S
 
G
A
 
D
Q
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
I
N
 
N
V
 
S
V
 
V
N
 
C
P
 
P
D
x
S
A
x
L
V
|
V
L
 
-
R
 
-
G
 
-
S
 
K
K
x
T
I
x
N
W
x
M
T
|
T
G
 
N
E
 
G
W
 
W
K
 
P
E
 
Q
Q
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
Y
 
-
K
 
-
M
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
-
E
 
E
L
 
I
E
 
R
A
 
D
H
 
K
Y
 
F
R
 
N
E
 
E
R
 
R
S
 
I
M
 
A
L
 
L
K
 
G
L
 
R
S
 
A
V
 
A
F
 
E
P
 
P
E
 
E
D
 
E
I
 
V
A
 
A
E
 
A
A
 
V
I
 
M
Y
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
M
 
D
S
 
A
A
 
S
K
 
F
S
 
I
T
 
N
G
 
G
N
 
A
I
 
N
V
 
I
N
 
P
V
 
V
D
 
D
A
 
G
G
 
G
N
 
A
A
 
T
Q
 
A
S
 
S

H9XP47 Meso-2,3-butanediol dehydrogenase; BDH; meso-2,3-BDH; (R,S)-butane-2,3-diol dehydrogenase; NAD(H)-dependent meso-2,3-BDH; SmBdh; EC 1.1.1.- from Serratia marcescens (see paper)
30% identity, 37% coverage: 438:696/699 of query aligns to 6:244/251 of H9XP47

query
sites
H9XP47
R
 
K
I
 
V
A
 
V
L
 
V
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
A
A
 
G
G
x
N
G
 
G
I
x
M
G
 
G
K
 
E
A
 
A
T
 
A
A
 
A
N
 
R
R
 
R
L
 
F
M
 
S
Q
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
C
 
I
V
 
V
V
 
V
L
 
L
A
 
A
D
|
D
I
 
W
D
 
A
E
 
K
T
 
E
A
 
A
L
 
V
E
 
D
A
 
K
A
 
V
Q
 
A
T
 
A
E
 
S
L
 
L
S
 
P
T
 
-
R
 
-
Y
 
-
G
 
-
K
 
K
D
 
G
F
 
R
V
 
A
R
 
M
S
 
A
V
 
V
N
 
H
M
 
I
N
x
D
V
|
V
T
 
S
S
 
D
E
 
H
A
 
V
A
 
A
V
 
V
E
 
E
S
 
K
G
 
M
F
 
M
G
 
N
D
 
E
A
 
V
L
 
A
L
 
E
A
 
K
F
 
L
G
 
G
G
 
R
L
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
L
S
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
L
 
V
A
 
H
T
 
V
S
 
A
A
 
G
A
 
S
V
 
V
E
 
L
D
 
E
T
 
T
T
 
S
L
 
I
A
 
D
L
 
D
W
 
W
N
 
R
K
 
R
N
 
I
M
 
A
D
 
G
I
 
V
L
 
D
A
 
I
T
 
D
G
 
G
Y
 
V
F
 
V
L
 
F
V
 
C
S
 
S
R
 
K
E
 
-
A
 
-
F
 
F
R
 
A
I
 
L
F
 
P
R
 
H
N
 
L
Q
 
L
K
 
K
A
 
T
G
 
K
G
 
G
N
 
C
V
 
I
V
 
V
F
 
N
V
 
T
A
 
A
S
|
S
K
x
V
N
x
S
G
 
G
L
 
L
A
 
G
A
 
G
S
 
D
P
 
W
G
 
G
A
 
A
S
 
A
A
 
Y
Y
|
Y
C
 
C
T
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
G
A
 
A
E
 
V
I
 
V
H
 
N
L
 
L
A
 
T
R
 
R
C
 
A
L
 
M
A
 
A
L
 
L
E
 
D
G
 
H
A
 
G
S
 
G
A
 
D
Q
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
I
N
 
N
V
 
S
V
 
V
N
 
C
P
 
P
D
 
S
A
 
L
V
|
V
L
 
K
R
x
T
G
 
N
S
 
-
K
 
-
I
 
-
W
 
M
T
 
T
G
 
N
E
 
G
W
 
W
K
 
P
E
 
Q
Q
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
Y
 
-
K
 
-
M
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
-
E
 
E
L
 
I
E
x
R
A
x
D
H
x
K
Y
 
F
R
 
N
E
 
E
R
 
R
S
 
I
M
 
A
L
 
L
K
 
G
L
 
R
S
 
A
V
 
A
F
 
E
P
 
P
E
 
E
D
 
E
I
 
V
A
 
A
E
 
A
A
 
V
I
 
M
Y
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
M
 
D
S
 
A
A
 
S
K
 
F
S
 
I
T
 
N
G
 
G
N
 
A
I
 
N
V
 
I
N
 
P
V
 
V
D
 
D
A
 
G
G
 
G
N
 
A
A
 
T
Q
 
A
S
 
S

Sites not aligning to the query:

6vspA Structure of serratia marcescens 2,3-butanediol dehydrogenase mutant q247a (see paper)
30% identity, 37% coverage: 438:696/699 of query aligns to 6:244/251 of 6vspA

query
sites
6vspA
R
 
K
I
 
V
A
 
V
L
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
G
G
x
N
G
|
G
I
x
M
G
 
G
K
 
E
A
 
A
T
 
A
A
 
A
N
 
R
R
 
R
L
 
F
M
 
S
Q
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
C
 
I
V
 
V
V
 
V
L
 
L
A
 
A
D
|
D
I
x
W
D
x
A
E
 
K
T
 
E
A
 
A
L
 
V
E
 
D
A
 
K
A
 
V
Q
 
A
T
 
A
E
 
S
L
 
L
S
 
P
T
 
-
R
 
-
Y
 
-
G
 
-
K
 
K
D
 
G
F
 
R
V
 
A
R
 
M
S
 
A
V
 
V
N
 
H
M
x
I
N
x
D
V
|
V
T
 
S
S
 
D
E
 
H
A
 
V
A
 
A
V
 
V
E
 
E
S
 
K
G
 
M
F
 
M
G
 
N
D
 
E
A
 
V
L
 
A
L
 
E
A
 
K
F
 
L
G
 
G
G
 
R
L
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
L
S
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
L
x
V
A
 
H
T
 
V
S
 
A
A
 
G
A
 
S
V
 
V
E
 
L
D
 
E
T
 
T
T
 
S
L
 
I
A
 
D
L
 
D
W
 
W
N
 
R
K
 
R
N
 
I
M
 
A
D
 
G
I
x
V
L
 
D
A
 
I
T
 
D
G
 
G
Y
 
V
F
 
V
L
 
F
V
 
C
S
 
S
R
 
K
E
 
-
A
 
-
F
 
F
R
 
A
I
 
L
F
 
P
R
 
H
N
 
L
Q
 
L
K
 
K
A
 
T
G
 
K
G
 
G
N
 
C
V
 
I
V
 
V
F
 
N
V
x
T
A
 
A
S
|
S
K
 
V
N
 
S
G
 
G
L
 
L
A
 
G
A
 
G
S
 
D
P
 
W
G
 
G
A
 
A
S
 
A
A
 
Y
Y
|
Y
C
 
C
T
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
G
A
 
A
E
 
V
I
 
V
H
 
N
L
 
L
A
 
T
R
 
R
C
 
A
L
 
M
A
 
A
L
 
L
E
 
D
G
 
H
A
 
G
S
 
G
A
 
D
Q
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
I
N
 
N
V
 
S
V
 
V
N
 
C
P
|
P
D
x
S
A
x
L
V
|
V
L
 
-
R
 
-
G
 
-
S
 
K
K
x
T
I
x
N
W
x
M
T
|
T
G
 
N
E
 
G
W
 
W
K
 
P
E
 
Q
Q
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
Y
 
-
K
 
-
M
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
-
E
 
E
L
 
I
E
 
R
A
 
D
H
 
K
Y
 
F
R
 
N
E
 
E
R
 
R
S
 
I
M
 
A
L
 
L
K
 
G
L
 
R
S
 
A
V
 
A
F
 
E
P
 
P
E
 
E
D
 
E
I
 
V
A
 
A
E
 
A
A
 
V
I
 
M
Y
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
M
 
D
S
 
A
A
 
S
K
 
F
S
 
I
T
 
N
G
 
G
N
 
A
I
 
N
V
 
I
N
 
P
V
 
V
D
 
D
A
 
G
G
 
G
N
 
A
A
 
T
Q
 
A
S
 
S

6vspB Structure of serratia marcescens 2,3-butanediol dehydrogenase mutant q247a (see paper)
30% identity, 37% coverage: 438:696/699 of query aligns to 8:246/252 of 6vspB

query
sites
6vspB
R
 
K
I
 
V
A
 
V
L
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
G
G
x
N
G
|
G
I
 
M
G
 
G
K
 
E
A
 
A
T
 
A
A
 
A
N
 
R
R
 
R
L
 
F
M
 
S
Q
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
C
 
I
V
 
V
V
 
V
L
 
L
A
 
A
D
|
D
I
x
W
D
 
A
E
 
K
T
 
E
A
 
A
L
 
V
E
 
D
A
 
K
A
 
V
Q
 
A
T
 
A
E
 
S
L
 
L
S
 
P
T
 
-
R
 
-
Y
 
-
G
 
-
K
 
K
D
 
G
F
 
R
V
 
A
R
 
M
S
 
A
V
 
V
N
 
H
M
x
I
N
x
D
V
|
V
T
 
S
S
 
D
E
 
H
A
 
V
A
 
A
V
 
V
E
 
E
S
 
K
G
 
M
F
 
M
G
 
N
D
 
E
A
 
V
L
 
A
L
 
E
A
 
K
F
 
L
G
 
G
G
 
R
L
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
L
S
 
N
N
 
N
A
 
A
G
|
G
L
 
V
A
 
H
T
 
V
S
 
A
A
 
G
A
 
S
V
 
V
E
 
L
D
 
E
T
 
T
T
 
S
L
 
I
A
 
D
L
 
D
W
 
W
N
 
R
K
 
R
N
 
I
M
 
A
D
 
G
I
 
V
L
 
D
A
 
I
T
 
D
G
 
G
Y
 
V
F
 
V
L
 
F
V
 
C
S
 
S
R
 
K
E
 
-
A
 
-
F
 
F
R
 
A
I
 
L
F
 
P
R
 
H
N
 
L
Q
 
L
K
 
K
A
 
T
G
 
K
G
 
G
N
 
C
V
 
I
V
 
V
F
 
N
V
 
T
A
 
A
S
|
S
K
 
V
N
 
S
G
 
G
L
 
L
A
 
G
A
 
G
S
 
D
P
 
W
G
 
G
A
 
A
S
 
A
A
 
Y
Y
|
Y
C
 
C
T
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
G
A
 
A
E
 
V
I
 
V
H
 
N
L
 
L
A
 
T
R
 
R
C
 
A
L
 
M
A
 
A
L
 
L
E
 
D
G
 
H
A
 
G
S
 
G
A
 
D
Q
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
I
N
 
N
V
 
S
V
 
V
N
 
C
P
 
P
D
 
S
A
 
L
V
 
V
L
 
-
R
 
-
G
 
-
S
 
K
K
 
T
I
 
N
W
 
M
T
 
T
G
 
N
E
 
G
W
 
W
K
 
P
E
 
Q
Q
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
Y
 
-
K
 
-
M
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
-
E
 
E
L
 
I
E
 
R
A
 
D
H
 
K
Y
 
F
R
 
N
E
 
E
R
 
R
S
 
I
M
 
A
L
 
L
K
 
G
L
 
R
S
 
A
V
 
A
F
 
E
P
 
P
E
 
E
D
 
E
I
 
V
A
 
A
E
 
A
A
 
V
I
 
M
Y
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
M
 
D
S
 
A
A
 
S
K
 
F
S
 
I
T
 
N
G
 
G
N
 
A
I
 
N
V
 
I
N
 
P
V
 
V
D
 
D
A
 
G
G
 
G
N
 
A
A
 
T
Q
 
A
S
 
S

Query Sequence

>SMc02322 FitnessBrowser__Smeli:SMc02322
MLDKHQGARLANLWDDGKAAGMTEPEKLLYRSNLLGSDKRITNYGGGNTSAKVMEKDPLT
GEIVEVLWVKGSGGDVGTIKMDGFSTLYMDKLRALKGIYRGVEFEDEMVGYLPHCTFNLN
PRAASIDTPLHAYVPKPHVDHMHPDAIIAIAASKNSRELTSKIFGDEIGWLPWKRPGYEL
GLWLEKFCQENPDARGVVLESHGLFTWGDTAKEAYETTIEIINRAIAWFETENTGPAFGG
RSKPVLAAADRAAIAKKLMPVIRGLISAGESKVGHFDDSQAVLDFVTSTSLEPLAALGTS
CPDHFLRTKIRPLVVDFDPAQPDVGNTLAGLPEAIATYRADYAAYYERCKRADSPAMRDP
NAVVYLVPGVGMITFAKDKATARISAEFYVNAINVMRGASGVSTYVGLPEQEAFDIEYWL
LEEAKLQRMPKPKSLAGRIALVTGGAGGIGKATANRLMQEGACVVLADIDETALEAAQTE
LSTRYGKDFVRSVNMNVTSEAAVESGFGDALLAFGGLDILVSNAGLATSAAVEDTTLALW
NKNMDILATGYFLVSREAFRIFRNQKAGGNVVFVASKNGLAASPGASAYCTAKAAEIHLA
RCLALEGASAQIRVNVVNPDAVLRGSKIWTGEWKEQRAAAYKMDVDELEAHYRERSMLKL
SVFPEDIAEAIYFLASDMSAKSTGNIVNVDAGNAQSFTR

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory