SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing SMc02870 FitnessBrowser__Smeli:SMc02870 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6jw6A The crystal structure of kand2 in complex with NAD (see paper)
29% identity, 64% coverage: 7:233/354 of query aligns to 1:230/341 of 6jw6A

query
sites
6jw6A
P
 
P
I
 
V
R
 
R
V
 
V
L
 
G
S
 
V
A
 
V
G
 
G
L
 
A
G
|
G
N
x
F
M
|
M
G
 
G
R
 
G
S
 
V
H
 
H
A
 
A
L
 
E
A
 
V
Y
 
V
H
 
A
Q
 
A
N
 
H
P
 
P
G
 
G
F
 
A
E
 
R
I
 
L
A
 
E
G
 
A
L
 
V
V
 
H
N
x
D
R
x
L
S
 
D
K
 
P
V
 
A
A
 
A
-
 
A
-
 
R
-
 
D
L
 
L
P
 
A
E
 
E
A
 
R
L
 
F
A
 
R
G
 
A
Y
 
E
E
 
R
I
 
A
L
 
E
P
 
P
S
 
S
F
 
W
P
 
A
E
 
D
A
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
D
L
 
P
E
 
A
P
 
I
E
 
D
L
 
L
C
 
L
S
 
I
I
 
I
N
x
T
T
|
T
Y
x
P
S
x
N
D
 
G
T
x
L
H
|
H
A
 
H
D
 
R
Y
x
Q
A
 
A
V
 
A
M
 
E
A
 
A
M
 
L
E
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
K
H
 
H
V
 
V
F
 
L
V
 
V
E
|
E
K
|
K
P
 
P
L
 
L
A
 
G
T
 
V
T
 
T
V
 
P
A
 
E
D
 
Q
A
 
V
E
 
A
R
 
E
V
 
L
V
 
V
A
 
E
C
 
L
A
 
A
R
 
G
A
 
R
N
 
H
G
 
D
R
 
R
K
 
V
L
 
L
V
 
A
V
 
H
G
 
G
Y
 
S
I
x
N
L
 
F
R
 
V
H
 
H
H
 
S
P
 
P
S
 
K
W
 
F
M
 
V
R
 
R
-
 
A
-
 
R
-
 
Q
L
 
L
I
 
V
A
 
A
E
 
D
A
 
T
R
 
E
K
 
A
L
 
F
G
 
G
G
 
R
P
 
P
Y
 
H
V
 
L
F
 
V
R
 
R
M
 
V
N
 
V
L
 
F
N
 
R
Q
 
N
Q
 
S
S
 
G
S
 
P
G
 
E
P
 
A
T
 
A
W
|
W
A
 
A
T
 
A
H
 
S
K
 
K
S
 
D
L
 
L
M
 
A
Q
 
G
T
 
G
T
 
G
P
 
-
P
 
A
I
 
L
V
 
L
D
 
D
C
 
L
G
 
G
V
 
C
H
|
H
Y
 
A
V
 
V
D
 
E
V
 
L
M
 
C
C
 
R
Q
 
W
I
 
L
T
 
L
D
 
D
A
 
G
N
 
A
P
 
D
V
 
V
E
 
E
V
 
-
R
 
-
G
 
S
M
 
V
G
 
S
L
 
A
R
 
R
L
 
L
S
 
Q
N
 
R
E
 
V
I
 
R
A
 
P
A
 
P
D
 
A
M
 
L
Y
 
E
N
 
D
Y
 
Q
G
 
A
H
 
L
L
 
L
Q
 
V
V
 
M
I
 
E
F
 
F
E
 
A
D
 
D
G
 
G
S
 
A
V
 
V
G
 
G
W
 
Q
Y
 
C
E
 
D
A
 
V
G
 
S
W
 
W

Sites not aligning to the query:

6jw8A The crystal structure of kand2 in complex with nadh and 3"-deamino-3"- hydroxykanamycin b (see paper)
29% identity, 64% coverage: 7:233/354 of query aligns to 1:230/342 of 6jw8A

query
sites
6jw8A
P
 
P
I
 
V
R
 
R
V
 
V
L
 
G
S
 
V
A
 
V
G
 
G
L
 
A
G
|
G
N
x
F
M
|
M
G
 
G
R
 
G
S
 
V
H
 
H
A
 
A
L
 
E
A
 
V
Y
 
V
H
 
A
Q
 
A
N
 
H
P
 
P
G
 
G
F
 
A
E
 
R
I
 
L
A
 
E
G
 
A
L
 
V
V
 
H
N
x
D
R
x
L
S
 
D
K
 
P
V
 
A
A
 
A
-
 
A
-
 
R
-
 
D
L
 
L
P
 
A
E
 
E
A
 
R
L
 
F
A
 
R
G
 
A
Y
 
E
E
 
R
I
 
A
L
 
E
P
 
P
S
 
S
F
 
W
P
 
A
E
 
D
A
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
D
L
 
P
E
 
A
P
 
I
E
 
D
L
 
L
C
 
L
S
 
I
I
 
I
N
x
T
T
|
T
Y
x
P
S
x
N
D
 
G
T
x
L
H
|
H
A
 
H
D
 
R
Y
x
Q
A
 
A
V
 
A
M
 
E
A
 
A
M
 
L
E
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
K
H
 
H
V
 
V
F
 
L
V
 
V
E
|
E
K
|
K
P
 
P
L
 
L
A
 
G
T
 
V
T
 
T
V
 
P
A
 
E
D
 
Q
A
 
V
E
 
A
R
 
E
V
 
L
V
 
V
A
 
E
C
 
L
A
 
A
R
 
G
A
 
R
N
 
H
G
 
D
R
 
R
K
 
V
L
 
L
V
 
A
V
 
H
G
 
G
Y
 
S
I
x
N
L
 
F
R
 
V
H
 
H
H
 
S
P
 
P
S
 
K
W
 
F
M
 
V
R
 
R
-
 
A
-
 
R
-
 
Q
L
 
L
I
 
V
A
 
A
E
 
D
A
 
T
R
 
E
K
 
A
L
 
F
G
 
G
G
 
R
P
 
P
Y
 
H
V
 
L
F
 
V
R
 
R
M
 
V
N
 
V
L
x
F
N
 
R
Q
x
N
Q
 
S
S
 
G
S
 
P
G
 
E
P
 
A
T
 
A
W
|
W
A
 
A
T
 
A
H
 
S
K
 
K
S
 
D
L
 
L
M
 
A
Q
 
G
T
 
G
T
 
G
P
 
-
P
 
A
I
 
L
V
 
L
D
|
D
C
x
L
G
 
G
V
 
C
H
|
H
Y
 
A
V
 
V
D
 
E
V
 
L
M
 
C
C
 
R
Q
 
W
I
 
L
T
 
L
D
 
D
A
 
G
N
 
A
P
 
D
V
 
V
E
 
E
V
 
-
R
 
-
G
 
S
M
 
V
G
 
S
L
 
A
R
 
R
L
 
L
S
 
Q
N
 
R
E
 
V
I
 
R
A
 
P
A
 
P
D
 
A
M
 
L
Y
 
E
N
 
D
Y
 
Q
G
 
A
H
 
L
L
 
L
Q
 
V
V
 
M
I
 
E
F
 
F
E
 
A
D
 
D
G
 
G
S
 
A
V
 
V
G
 
G
W
 
Q
Y
 
C
E
 
D
A
 
V
G
 
S
W
 
W

Sites not aligning to the query:

6jw7A The crystal structure of kand2 in complex with nadh and 3"-deamino-3"- hydroxykanamycin a (see paper)
29% identity, 64% coverage: 7:233/354 of query aligns to 1:230/342 of 6jw7A

query
sites
6jw7A
P
 
P
I
 
V
R
 
R
V
 
V
L
 
G
S
 
V
A
 
V
G
|
G
L
 
A
G
|
G
N
x
F
M
|
M
G
 
G
R
 
G
S
 
V
H
 
H
A
 
A
L
 
E
A
 
V
Y
 
V
H
 
A
Q
 
A
N
 
H
P
 
P
G
 
G
F
 
A
E
 
R
I
 
L
A
 
E
G
 
A
L
 
V
V
 
H
N
x
D
R
x
L
S
 
D
K
 
P
V
 
A
A
 
A
-
 
A
-
 
R
-
 
D
L
 
L
P
 
A
E
 
E
A
 
R
L
 
F
A
 
R
G
 
A
Y
 
E
E
 
R
I
 
A
L
 
E
P
 
P
S
 
S
F
 
W
P
 
A
E
 
D
A
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
D
L
 
P
E
 
A
P
 
I
E
 
D
L
 
L
C
 
L
S
 
I
I
 
I
N
x
T
T
|
T
Y
x
P
S
x
N
D
 
G
T
x
L
H
|
H
A
 
H
D
 
R
Y
x
Q
A
 
A
V
 
A
M
 
E
A
 
A
M
 
L
E
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
K
H
 
H
V
 
V
F
 
L
V
 
V
E
|
E
K
|
K
P
 
P
L
 
L
A
 
G
T
 
V
T
 
T
V
 
P
A
 
E
D
 
Q
A
 
V
E
 
A
R
 
E
V
 
L
V
 
V
A
 
E
C
 
L
A
 
A
R
 
G
A
 
R
N
 
H
G
 
D
R
 
R
K
 
V
L
 
L
V
 
A
V
 
H
G
 
G
Y
 
S
I
x
N
L
 
F
R
 
V
H
 
H
H
 
S
P
 
P
S
 
K
W
 
F
M
 
V
R
 
R
-
 
A
-
 
R
-
 
Q
L
 
L
I
 
V
A
 
A
E
 
D
A
 
T
R
 
E
K
 
A
L
 
F
G
 
G
G
 
R
P
 
P
Y
 
H
V
 
L
F
 
V
R
 
R
M
 
V
N
 
V
L
 
F
N
 
R
Q
x
N
Q
 
S
S
 
G
S
 
P
G
 
E
P
 
A
T
 
A
W
|
W
A
 
A
T
 
A
H
 
S
K
 
K
S
 
D
L
 
L
M
 
A
Q
 
G
T
 
G
T
 
G
P
 
-
P
 
A
I
 
L
V
 
L
D
|
D
C
 
L
G
 
G
V
 
C
H
|
H
Y
 
A
V
 
V
D
 
E
V
 
L
M
 
C
C
 
R
Q
 
W
I
 
L
T
 
L
D
 
D
A
 
G
N
 
A
P
 
D
V
 
V
E
 
E
V
 
-
R
 
-
G
 
S
M
 
V
G
 
S
L
 
A
R
 
R
L
 
L
S
 
Q
N
 
R
E
 
V
I
 
R
A
 
P
A
 
P
D
 
A
M
 
L
Y
 
E
N
 
D
Y
 
Q
G
 
A
H
 
L
L
 
L
Q
 
V
V
 
M
I
 
E
F
 
F
E
 
A
D
 
D
G
 
G
S
 
A
V
 
V
G
 
G
W
 
Q
Y
 
C
E
 
D
A
 
V
G
 
S
W
 
W

Sites not aligning to the query:

3ec7A Crystal structure of putative dehydrogenase from salmonella typhimurium lt2
26% identity, 49% coverage: 14:185/354 of query aligns to 9:181/336 of 3ec7A

query
sites
3ec7A
G
 
G
L
 
I
G
|
G
N
x
M
M
x
I
G
 
G
R
 
S
S
 
D
H
 
H
A
 
L
L
 
R
A
 
R
Y
 
L
H
 
A
Q
 
N
N
 
T
-
 
V
P
 
S
G
 
G
F
 
V
E
 
E
I
 
V
A
 
V
G
 
A
L
 
V
V
 
C
N
x
D
-
x
I
-
 
V
-
 
A
-
 
G
R
|
R
S
 
A
K
 
Q
V
 
A
A
 
A
L
 
L
P
 
D
E
 
K
A
 
Y
L
 
A
A
 
I
G
 
E
Y
 
A
E
 
K
I
 
D
L
 
Y
P
 
N
S
 
D
F
 
Y
P
 
H
E
 
D
A
 
L
L
 
I
A
 
N
E
 
D
L
 
K
E
 
D
P
 
V
E
 
E
L
 
V
C
 
V
S
 
I
I
 
I
N
x
T
T
x
A
Y
x
S
S
x
N
D
 
E
T
 
A
H
|
H
A
 
A
D
 
D
Y
 
V
A
 
A
V
 
V
M
 
A
A
 
A
M
 
L
E
 
N
A
 
A
G
 
N
A
 
K
H
 
Y
V
 
V
F
 
F
V
 
C
E
|
E
K
|
K
P
 
P
L
 
L
A
 
A
T
 
V
T
 
T
V
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
C
E
 
Q
R
 
R
V
 
V
V
 
I
A
 
E
C
 
A
A
 
E
R
 
Q
A
 
K
N
 
N
G
 
G
R
 
K
K
 
R
L
 
M
V
 
V
-
 
Q
V
 
I
G
 
G
Y
 
F
I
x
M
L
 
R
R
 
R
H
 
Y
H
 
D
P
 
K
S
 
G
W
 
Y
M
 
V
R
 
Q
L
 
L
-
 
K
-
 
N
I
 
I
A
 
I
E
 
D
A
 
S
R
 
G
K
 
E
L
 
I
G
 
G
G
 
Q
P
 
P
Y
 
L
V
 
M
F
 
V
R
 
H
M
 
G
N
 
R
L
 
H
N
 
Y
Q
 
N
Q
 
A
S
 
S
S
 
T
G
 
V
P
 
P
T
 
E
W
 
Y
A
 
K
T
 
T
H
 
P
K
 
Q
S
 
A
L
 
I
M
 
Y
Q
 
E
T
 
T
T
 
L
P
 
-
P
 
-
I
 
-
V
 
-
D
 
-
C
 
-
G
 
-
V
 
I
H
|
H
Y
 
E
V
 
I
D
 
D
V
 
V
M
 
M

Sites not aligning to the query:

7xr9A Crystal structure of dgpa with glucose (see paper)
28% identity, 38% coverage: 51:184/354 of query aligns to 45:181/344 of 7xr9A

query
sites
7xr9A
G
 
G
Y
 
A
E
 
Q
I
 
V
L
 
T
P
 
A
S
x
D
F
x
Y
P
 
K
E
 
E
A
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
N
L
 
P
E
 
E
P
 
V
E
 
E
L
 
V
C
 
V
S
 
H
I
 
V
N
x
C
T
|
T
Y
x
P
S
 
N
D
 
V
T
 
S
H
|
H
A
 
S
D
 
E
Y
 
I
A
 
T
V
 
I
M
 
A
A
 
A
M
 
F
E
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
K
H
 
H
V
 
V
F
 
Y
V
 
C
E
|
E
K
|
K
P
|
P
L
 
M
A
 
S
T
 
H
T
 
S
V
 
T
A
 
E
D
 
E
A
 
A
E
 
E
R
 
K
V
 
M
V
 
V
A
 
E
C
 
A
A
 
W
R
 
K
A
 
K
N
 
S
G
 
G
R
 
K
K
 
Q
L
 
F
V
 
T
V
 
I
G
 
G
Y
 
Y
I
x
Q
L
 
N
R
 
R
H
 
F
H
 
R
P
 
E
S
 
E
W
 
V
M
 
M
R
 
N
L
 
L
I
 
K
A
 
K
E
 
S
A
 
C
R
 
D
K
 
K
-
 
G
-
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
E
P
 
I
Y
 
Y
V
 
Y
F
 
G
R
 
K
M
 
A
N
 
H
L
 
A
N
 
V
Q
x
R
Q
 
R
S
 
R
S
 
A
G
 
V
P
 
P
T
 
T
W
|
W
A
 
G
T
x
V
H
x
F
-
 
M
K
 
D
S
 
K
L
 
E
M
 
A
Q
|
Q
T
 
G
T
 
G
P
 
G
P
 
P
I
 
L
V
 
I
D
|
D
C
 
I
G
 
G
V
 
T
H
|
H
Y
 
A
V
 
L
D
 
D
V
 
I

Sites not aligning to the query:

7xreC Crystal structure of dgpa
28% identity, 37% coverage: 53:184/354 of query aligns to 57:191/363 of 7xreC

query
sites
7xreC
E
 
Q
I
 
V
L
 
T
P
 
A
S
 
D
F
 
Y
P
 
K
E
 
E
A
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
N
L
 
P
E
 
E
P
 
V
E
 
E
L
 
V
C
 
V
S
 
H
I
 
V
N
 
C
T
|
T
Y
x
P
S
x
N
D
 
V
T
 
S
H
|
H
A
 
S
D
 
E
Y
 
I
A
 
T
V
 
I
M
 
A
A
 
A
M
 
F
E
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
K
H
 
H
V
 
V
F
 
Y
V
 
C
E
|
E
K
|
K
P
|
P
L
 
M
A
 
S
T
 
H
T
 
S
V
 
T
A
 
E
D
 
E
A
 
A
E
 
E
R
 
K
V
 
M
V
 
V
A
 
E
C
 
A
A
 
W
R
 
K
A
 
K
N
 
S
G
 
G
R
 
K
K
 
Q
L
 
F
V
 
T
V
 
I
G
 
G
Y
 
Y
I
 
Q
L
 
N
R
 
R
H
 
F
H
 
R
P
 
E
S
 
E
W
 
V
M
 
M
R
 
N
L
 
L
I
 
K
A
 
K
E
 
S
A
 
C
R
 
D
K
 
K
-
 
G
-
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
E
P
 
I
Y
 
Y
V
 
Y
F
 
G
R
 
K
M
 
A
N
 
H
L
 
A
N
 
V
Q
 
R
Q
 
R
S
 
R
S
 
A
G
 
V
P
 
P
T
 
T
W
 
W
A
 
G
T
 
V
H
x
F
-
 
M
K
 
D
S
 
K
L
 
E
M
 
A
Q
|
Q
T
 
G
T
 
G
P
 
G
P
 
P
I
 
L
V
 
I
D
 
D
C
 
I
G
 
G
V
 
T
H
|
H
Y
 
A
V
 
L
D
 
D
V
 
I

Sites not aligning to the query:

1evjA Crystal structure of glucose-fructose oxidoreductase (gfor) delta1-22 s64d (see paper)
31% identity, 34% coverage: 79:197/354 of query aligns to 82:205/340 of 1evjA

query
sites
1evjA
H
|
H
A
 
A
D
 
E
Y
 
F
A
 
A
V
 
I
M
 
R
A
 
A
M
 
F
E
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
K
H
 
H
V
 
V
F
 
M
V
 
C
E
|
E
K
|
K
P
 
P
L
 
M
A
 
A
T
 
T
T
 
S
V
 
V
A
 
A
D
 
D
A
 
C
E
 
Q
R
 
R
V
 
M
V
 
I
A
 
D
C
 
A
A
 
A
R
 
K
A
 
A
N
 
A
G
 
N
R
 
K
K
 
K
L
 
L
V
 
M
V
 
I
G
 
G
Y
 
Y
I
x
R
L
 
C
R
 
H
H
 
Y
H
 
D
P
 
P
-
 
M
-
 
N
-
 
R
S
 
A
W
 
A
M
 
V
R
 
K
L
 
L
I
 
I
A
 
R
E
 
E
A
 
N
R
 
Q
-
 
L
-
 
G
K
 
K
L
 
L
G
 
G
G
 
M
P
 
V
Y
 
T
V
 
T
F
 
D
R
 
N
M
 
S
N
 
D
-
 
V
L
 
M
N
 
D
Q
 
Q
Q
 
N
S
 
D
S
 
P
G
 
A
P
 
Q
T
 
Q
W
|
W
A
x
R
T
 
L
H
 
R
K
 
R
S
 
E
L
 
L
M
 
A
Q
 
G
T
 
G
T
 
G
P
 
-
P
 
S
I
 
L
V
 
M
D
 
D
C
 
I
G
 
G
V
 
I
H
x
Y
Y
 
G
V
 
L
D
 
N
V
 
G
M
 
T
C
 
R
Q
 
Y
I
 
L
T
 
L
D
 
G
A
 
E
N
 
E
P
 
P
V
 
I
E
 
E
V
 
V
R
 
R

Sites not aligning to the query:

1h6dA Oxidized precursor form of glucose-fructose oxidoreductase from zymomonas mobilis complexed with glycerol (see paper)
31% identity, 34% coverage: 79:197/354 of query aligns to 113:236/383 of 1h6dA

query
sites
1h6dA
H
|
H
A
 
A
D
 
E
Y
 
F
A
 
A
V
 
I
M
 
R
A
 
A
M
 
F
E
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
K
H
 
H
V
 
V
F
 
M
V
 
C
E
|
E
K
|
K
P
 
P
L
 
M
A
 
A
T
 
T
T
 
S
V
 
V
A
 
A
D
 
D
A
 
C
E
 
Q
R
 
R
V
 
M
V
 
I
A
 
D
C
 
A
A
 
A
R
 
K
A
 
A
N
 
A
G
 
N
R
 
K
K
 
K
L
 
L
V
 
M
V
 
I
G
 
G
Y
 
Y
I
x
R
L
 
C
R
 
H
H
 
Y
H
 
D
P
 
P
-
 
M
-
 
N
-
 
R
S
 
A
W
 
A
M
 
V
R
 
K
L
 
L
I
 
I
A
 
R
E
 
E
A
 
N
R
 
Q
-
 
L
-
 
G
K
 
K
L
 
L
G
 
G
G
 
M
P
 
V
Y
 
T
V
 
T
F
 
D
R
 
N
M
 
S
N
 
D
-
 
V
L
 
M
N
 
D
Q
 
Q
Q
 
N
S
 
D
S
 
P
G
x
A
P
 
Q
T
 
Q
W
|
W
A
x
R
T
 
L
H
 
R
K
 
R
S
 
E
L
 
L
M
 
A
Q
 
G
T
 
G
T
 
G
P
 
-
P
 
S
I
 
L
V
 
M
D
|
D
C
 
I
G
 
G
V
 
I
H
x
Y
Y
 
G
V
 
L
D
 
N
V
 
G
M
 
T
C
 
R
Q
 
Y
I
 
L
T
 
L
D
 
G
A
 
E
N
 
E
P
 
P
V
 
I
E
 
E
V
 
V
R
 
R

Sites not aligning to the query:

1rydA Crystal structure of glucose-fructose oxidoreductase from zymomonas mobilis
31% identity, 34% coverage: 79:197/354 of query aligns to 111:234/381 of 1rydA

query
sites
1rydA
H
|
H
A
 
A
D
 
E
Y
 
F
A
 
A
V
 
I
M
 
R
A
 
A
M
 
F
E
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
K
H
 
H
V
 
V
F
 
M
V
 
C
E
|
E
K
|
K
P
 
P
L
 
M
A
 
A
T
 
T
T
 
S
V
 
V
A
 
A
D
 
D
A
 
C
E
 
Q
R
 
R
V
 
M
V
 
I
A
 
D
C
 
A
A
 
A
R
 
K
A
 
A
N
 
A
G
 
N
R
 
K
K
 
K
L
 
L
V
 
M
V
 
I
G
 
G
Y
 
Y
I
x
R
L
 
C
R
 
H
H
 
Y
H
 
D
P
 
P
-
 
M
-
 
N
-
 
R
S
 
A
W
 
A
M
 
V
R
 
K
L
 
L
I
 
I
A
 
R
E
 
E
A
 
N
R
 
Q
-
 
L
-
 
G
K
 
K
L
 
L
G
 
G
G
 
M
P
 
V
Y
 
T
V
 
T
F
 
D
R
 
N
M
 
S
N
 
D
-
 
V
L
 
M
N
 
D
Q
 
Q
Q
 
N
S
 
D
S
 
P
G
x
A
P
 
Q
T
 
Q
W
|
W
A
x
R
T
 
L
H
 
R
K
 
R
S
 
E
L
 
L
M
 
A
Q
 
G
T
 
G
T
 
G
P
 
-
P
 
S
I
 
L
V
 
M
D
 
D
C
 
I
G
 
G
V
 
I
H
x
Y
Y
 
G
V
 
L
D
 
N
V
 
G
M
 
T
C
 
R
Q
 
Y
I
 
L
T
 
L
D
 
G
A
 
E
N
 
E
P
 
P
V
 
I
E
 
E
V
 
V
R
 
R

Sites not aligning to the query:

3e18A Crystal structure of NAD-binding protein from listeria innocua
23% identity, 67% coverage: 9:245/354 of query aligns to 5:240/348 of 3e18A

query
sites
3e18A
R
 
Q
V
 
L
L
 
V
S
 
I
A
 
V
G
 
G
L
 
Y
G
|
G
N
x
G
M
|
M
G
 
G
R
 
S
S
 
Y
H
 
H
A
 
V
L
 
T
A
 
L
Y
 
A
H
 
S
Q
 
A
N
 
A
P
 
D
G
 
N
F
 
L
E
 
E
I
 
V
A
 
H
G
 
G
-
 
V
-
x
F
-
x
D
-
x
I
L
 
L
V
 
A
N
 
E
R
x
K
S
 
R
K
 
E
V
 
A
A
 
A
L
 
A
P
 
Q
E
 
K
A
 
G
L
 
L
A
 
K
G
 
I
Y
 
Y
E
 
E
I
 
-
L
 
-
P
 
-
S
 
S
F
 
Y
P
 
E
E
 
A
A
 
V
L
 
L
A
 
A
E
 
D
L
 
E
E
 
K
P
 
V
E
 
D
L
 
A
C
 
V
S
 
L
I
 
I
N
x
A
T
|
T
Y
x
P
S
x
N
D
 
D
T
 
S
H
|
H
A
 
K
D
 
E
Y
 
L
A
 
A
V
 
I
M
 
S
A
 
A
M
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
K
H
 
H
V
 
V
F
 
V
V
 
C
E
|
E
K
|
K
P
 
P
L
 
V
A
 
T
T
 
M
T
 
T
V
 
S
A
 
E
D
 
D
A
 
L
E
 
L
R
 
A
V
 
I
V
 
M
A
 
D
C
 
V
A
 
A
R
 
K
A
 
R
N
 
V
G
 
N
R
 
K
K
 
H
L
 
F
V
 
M
V
 
V
G
 
H
Y
 
Q
I
x
N
L
 
R
R
 
R
H
 
W
H
 
D
P
 
E
S
 
D
W
 
F
M
 
L
-
 
I
-
 
I
R
 
K
L
 
E
I
 
M
A
 
F
E
 
E
A
 
Q
R
 
K
K
 
T
L
 
I
G
 
G
G
 
E
P
 
M
Y
 
F
V
 
H
F
 
L
R
 
E
M
 
S
N
 
R
L
 
V
N
 
H
Q
 
G
Q
 
A
S
 
N
S
 
G
G
 
I
P
 
P
-
 
G
T
 
D
W
|
W
A
x
R
T
 
H
H
 
L
K
 
K
S
 
A
L
 
-
M
 
-
Q
 
H
T
 
G
T
 
G
P
 
G
P
 
M
I
 
V
V
 
L
D
 
D
C
 
W
G
 
G
V
 
V
H
|
H
Y
 
L
V
 
L
D
 
D
V
 
Q
M
 
L
C
 
L
Q
 
F
I
 
L
T
 
V
D
 
D
A
 
S
N
 
N
P
 
V
V
 
K
E
 
S
V
 
V
R
 
S
G
 
A
-
 
N
M
 
L
G
 
S
L
 
F
R
 
A
L
 
L
S
 
G
N
 
D
E
 
E
I
 
V
A
 
D
A
 
D
D
 
G
M
 
F
Y
 
V
N
 
T
Y
 
F
G
 
-
H
 
-
L
 
-
Q
 
-
V
 
I
I
 
T
F
 
F
E
 
E
D
 
N
G
 
G
S
 
I
V
 
T
G
 
A
W
 
Q
Y
 
I
E
 
E
A
 
V
G
 
G
W
 
T
G
 
T
P
 
N
M
 
F
I
 
I
S
 
K
E
 
L
T
 
P
A
 
R
F
 
W
F
 
Y
V
 
V
K
 
K

6norA Crystal structure of gend2 from gentamicin a biosynthesis in complex with NAD (see paper)
23% identity, 94% coverage: 22:354/354 of query aligns to 27:347/349 of 6norA

query
sites
6norA
H
 
H
A
 
A
L
 
E
A
 
V
Y
 
L
H
 
T
Q
 
A
N
 
D
P
 
P
G
 
R
F
 
V
E
 
D
I
 
L
A
 
R
G
 
W
L
 
V
V
 
V
N
x
D
R
|
R
-
 
D
S
 
E
K
 
R
V
 
V
A
 
G
L
 
T
P
 
D
E
 
L
A
 
A
L
 
T
A
 
R
-
 
F
G
 
G
Y
 
A
E
 
R
I
 
V
L
 
T
P
 
T
S
 
T
F
 
L
P
 
D
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
D
L
 
D
E
 
T
P
 
V
E
 
R
L
 
F
C
 
V
S
 
V
I
 
V
N
x
A
T
|
T
Y
x
P
S
 
A
D
 
A
T
 
T
H
|
H
A
 
E
D
 
P
Y
 
I
A
 
A
V
 
A
M
 
Q
A
 
V
M
 
I
E
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
R
H
 
N
V
 
V
F
 
L
V
 
V
E
|
E
K
|
K
P
 
P
L
 
L
A
 
V
T
 
L
T
 
S
V
 
T
A
 
G
D
 
H
A
 
A
E
 
R
R
 
Q
V
 
L
V
 
A
A
 
A
C
 
A
A
 
A
R
 
H
A
 
E
N
 
R
G
 
G
R
 
V
K
 
V
L
 
L
V
 
A
V
 
H
G
 
G
Y
 
G
I
x
N
L
 
F
R
 
V
H
 
Y
H
 
A
P
 
P
S
 
K
W
 
F
M
 
V
R
 
R
-
 
A
-
 
H
-
 
E
L
 
L
I
 
A
A
 
A
E
 
D
A
 
R
R
 
E
K
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
T
P
 
V
Y
 
H
V
 
S
F
 
V
R
 
R
M
 
V
N
 
A
L
 
F
N
 
R
Q
 
T
Q
 
S
S
 
G
S
 
P
G
 
D
P
x
T
T
 
D
W
|
W
A
 
F
T
 
R
H
 
S
K
 
K
S
 
A
L
 
-
M
 
T
Q
 
A
T
 
G
T
 
G
P
 
G
P
 
A
I
 
L
V
 
T
D
 
D
C
 
L
G
 
G
V
 
W
H
 
H
Y
 
A
V
 
V
D
 
E
V
 
-
M
 
L
C
 
C
Q
 
R
I
 
W
T
 
M
D
 
L
A
 
G
N
 
K
P
 
P
V
 
A
E
 
I
V
 
R
R
 
A
G
 
V
M
 
T
G
 
A
L
 
C
R
 
T
L
 
R
S
 
Q
N
 
L
E
 
S
I
 
A
A
 
A
A
 
G
D
 
D
M
 
V
Y
 
E
N
 
D
Y
 
Q
G
 
G
H
 
V
L
 
V
Q
 
L
V
 
I
I
 
E
F
 
F
E
 
A
D
 
D
G
 
G
S
 
A
V
 
I
G
 
G
W
 
Q
Y
 
C
E
 
D
A
 
V
G
 
S
W
 
W
G
 
A
P
 
C
M
 
P
I
 
G
S
 
G
E
 
E
T
 
Q
A
 
-
F
 
-
F
 
L
V
 
T
K
 
V
D
 
E
V
 
V
M
 
I
S
 
G
P
 
T
N
 
E
G
 
G
S
 
L
V
 
V
S
 
T
I
 
A
V
 
D
M
 
L
D
 
W
Q
 
Q
N
 
G
A
 
M
K
 
G
S
 
-
D
 
-
D
 
-
I
 
V
D
 
E
V
 
A
H
 
Y
T
 
T
K
 
N
T
 
T
S
 
K
V
 
F
I
 
-
R
 
-
V
 
-
H
 
-
S
 
G
A
 
A
A
 
V
T
 
W
G
 
E
P
 
P
D
 
N
G
 
Q
R
 
G
F
 
W
L
 
L
K
 
R
S
 
P
D
 
E
E
 
W
D
 
E
L
 
W
V
 
I
M
 
R
E
 
N
G
 
S
E
 
G
P
x
Y
G
 
V
H
 
H
Q
 
Q
E
 
-
L
 
-
C
 
-
D
 
D
R
 
R
E
 
Q
Q
 
-
A
 
-
F
 
-
V
 
V
L
 
V
K
 
D
A
 
A
I
 
V
R
 
L
E
 
D
D
 
G
I
 
R
D
 
P
L
 
M
G
 
T
R
 
H
H
 
T
M
 
P
D
 
D
D
 
D
A
 
A
V
 
V
Q
 
A
S
 
V
L
 
V
K
 
E
I
 
T
C
 
L
L
 
E
A
 
A
A
 
A
D
 
Y
D
 
R
S
 
S
V
 
A
R
 
A
T
 
D
G
 
G
K
 
R
P
 
K
V
 
V
K
 
E
L
 
M

Sites not aligning to the query:

5yaqB Crystal structure of scyllo-inositol dehydrogenase with l-glucose dehydrogenase activity complexed with scyllo-inosose (see paper)
32% identity, 38% coverage: 14:149/354 of query aligns to 8:154/366 of 5yaqB

query
sites
5yaqB
G
|
G
L
x
T
G
|
G
N
x
F
M
|
M
G
 
G
R
 
K
S
 
C
H
 
H
A
 
A
L
 
M
A
 
A
Y
 
W
H
 
-
Q
 
R
N
 
N
P
 
V
G
 
A
F
 
T
E
 
A
I
 
F
A
 
G
G
 
G
L
 
L
V
 
P
N
 
P
R
 
R
S
 
L
K
 
E
V
 
V
-
 
L
-
 
A
-
x
D
-
x
M
-
 
P
-
 
A
-
 
D
-
 
K
-
 
A
-
 
H
A
 
S
L
 
L
P
 
A
E
 
S
A
 
S
L
 
F
A
 
G
G
 
F
Y
 
A
E
 
R
I
 
G
L
 
T
P
 
A
S
 
D
F
 
W
P
 
R
E
 
E
A
 
A
L
 
V
A
 
S
E
 
D
L
 
P
E
 
A
P
 
V
E
 
D
L
 
V
C
 
V
S
 
S
I
 
I
N
x
T
T
|
T
Y
 
P
S
x
N
D
 
G
T
 
L
H
|
H
A
 
R
D
 
E
Y
 
M
A
 
A
V
 
E
M
 
A
A
 
A
M
 
L
E
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
K
H
 
H
V
 
V
F
 
W
V
 
L
E
|
E
K
|
K
P
 
P
L
 
M
A
 
A
T
 
L
T
 
S
V
 
V
A
 
E
D
 
D
A
 
A
E
 
Q
R
 
A
V
 
M
V
 
E
A
 
A
C
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
A
N
 
S
G
 
D
R
 
R
K
 
R
L
 
T
V
 
I
V
 
I
G
 
G
Y
 
Y
I
x
N
L
x
Y
R
 
T
H
 
R
H
 
S
P
 
P
S
 
A
W
 
F
-
 
R
-
 
A
-
 
A
M
 
V
R
 
D
L
 
L
I
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
G
R
 
-
K
 
A
L
 
I
G
 
G
G
 
R
P
 
P
Y
 
I
V
 
H
F
 
F
R
 
R

Sites not aligning to the query:

5ya8A Crystal structure of scyllo-inositol dehydrogenase with l-glucose dehydrogenase activity complexed with myo-inositol (see paper)
32% identity, 38% coverage: 14:149/354 of query aligns to 8:154/366 of 5ya8A

query
sites
5ya8A
G
 
G
L
x
T
G
|
G
N
x
F
M
|
M
G
 
G
R
 
K
S
 
C
H
 
H
A
 
A
L
 
M
A
 
A
Y
 
W
H
 
-
Q
 
R
N
 
N
P
 
V
G
 
A
F
 
T
E
 
A
I
 
F
A
 
G
G
 
G
L
 
L
V
 
P
N
 
P
R
 
R
S
 
L
K
 
E
V
 
V
-
 
L
-
 
A
-
x
D
-
x
M
-
 
P
-
 
A
-
 
D
-
 
K
-
 
A
-
 
H
A
 
S
L
 
L
P
 
A
E
 
S
A
 
S
L
 
F
A
 
G
G
 
F
Y
 
A
E
 
R
I
 
G
L
 
T
P
 
A
S
 
D
F
 
W
P
 
R
E
 
E
A
 
A
L
 
V
A
 
S
E
 
D
L
 
P
E
 
A
P
 
V
E
 
D
L
 
V
C
 
V
S
 
S
I
 
I
N
x
T
T
|
T
Y
x
P
S
x
N
D
 
G
T
 
L
H
|
H
A
 
R
D
 
E
Y
 
M
A
 
A
V
 
E
M
 
A
A
 
A
M
 
L
E
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
K
H
 
H
V
 
V
F
 
W
V
 
L
E
|
E
K
|
K
P
 
P
L
 
M
A
 
A
T
 
L
T
 
S
V
 
V
A
 
E
D
 
D
A
 
A
E
 
Q
R
 
A
V
 
M
V
 
E
A
 
A
C
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
A
N
 
S
G
 
D
R
 
R
K
 
R
L
 
T
V
 
I
V
 
I
G
 
G
Y
 
Y
I
x
N
L
x
Y
R
 
T
H
 
R
H
 
S
P
 
P
S
 
A
W
 
F
-
 
R
-
 
A
-
 
A
M
 
V
R
 
D
L
 
L
I
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
G
R
 
-
K
 
A
L
 
I
G
 
G
G
 
R
P
 
P
Y
 
I
V
 
H
F
 
F
R
 
R

Sites not aligning to the query:

6ktkC Crystal structure of scyllo-inositol dehydrogenase r178a mutant, complexed with nadh and l-glucono-1,5-lactone, from paracoccus laeviglucosivorans (see paper)
32% identity, 38% coverage: 14:149/354 of query aligns to 9:155/368 of 6ktkC

query
sites
6ktkC
G
 
G
L
x
T
G
|
G
N
x
F
M
|
M
G
 
G
R
 
K
S
 
C
H
 
H
A
 
A
L
 
M
A
 
A
Y
 
W
H
 
-
Q
 
R
N
 
N
P
 
V
G
 
A
F
 
T
E
 
A
I
 
F
A
 
G
G
 
G
L
 
L
V
 
P
N
 
P
R
 
R
S
 
L
K
 
E
V
 
V
-
 
L
-
 
A
-
x
D
-
x
M
-
 
P
-
 
A
-
 
D
-
 
K
-
 
A
-
 
H
A
 
S
L
 
L
P
 
A
E
 
S
A
 
S
L
 
F
A
 
G
G
 
F
Y
 
A
E
 
R
I
 
G
L
 
T
P
 
A
S
 
D
F
 
W
P
 
R
E
 
E
A
 
A
L
 
V
A
 
S
E
 
D
L
 
P
E
 
A
P
 
V
E
 
D
L
 
V
C
 
V
S
 
S
I
 
I
N
x
T
T
|
T
Y
 
P
S
x
N
D
 
G
T
 
L
H
|
H
A
 
R
D
 
E
Y
 
M
A
 
A
V
 
E
M
 
A
A
 
A
M
 
L
E
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
K
H
 
H
V
 
V
F
 
W
V
 
L
E
|
E
K
|
K
P
 
P
L
 
M
A
 
A
T
 
L
T
 
S
V
 
V
A
 
E
D
 
D
A
 
A
E
 
Q
R
 
A
V
 
M
V
 
E
A
 
A
C
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
A
N
 
S
G
 
D
R
 
R
K
 
R
L
 
T
V
 
I
V
 
I
G
 
G
Y
 
Y
I
x
N
L
x
Y
R
 
T
H
 
R
H
 
S
P
 
P
S
 
A
W
 
F
-
 
R
-
 
A
-
 
A
M
 
V
R
 
D
L
 
L
I
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
G
R
 
-
K
 
A
L
 
I
G
 
G
G
 
R
P
 
P
Y
 
I
V
 
H
F
 
F
R
 
R

Sites not aligning to the query:

7bvjA Udp-n-acetylglucosamine 3-dehydrogenase gnna from acidithiobacillus ferrooxidans (p21) (see paper)
28% identity, 53% coverage: 14:201/354 of query aligns to 10:185/313 of 7bvjA

query
sites
7bvjA
G
 
G
L
 
V
G
|
G
N
x
H
M
x
L
G
 
G
R
 
R
S
 
F
H
 
H
A
 
A
L
 
Q
A
 
K
Y
 
Y
H
 
A
Q
 
A
N
 
I
P
 
S
G
 
-
F
 
-
E
 
Q
I
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
V
V
x
F
N
x
D
R
x
E
S
 
N
K
 
A
V
 
E
A
x
R
L
 
A
P
 
A
E
 
E
A
 
V
L
 
A
A
 
A
G
 
E
Y
 
L
E
 
R
I
 
C
-
 
R
-
 
A
L
 
F
P
 
P
S
 
S
F
 
V
P
 
D
E
 
A
A
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
E
L
 
V
E
 
D
P
 
A
E
 
-
L
 
-
C
 
V
S
 
S
I
 
I
N
 
V
T
|
T
Y
x
P
S
 
T
D
 
S
T
 
T
H
 
H
A
 
F
D
 
A
Y
 
V
A
 
A
V
 
E
M
 
V
A
 
A
M
 
M
E
 
Q
A
 
A
G
 
G
A
 
V
H
 
H
V
 
C
F
 
L
V
 
I
E
 
E
K
 
K
P
 
P
L
 
F
A
 
T
T
 
L
T
 
D
V
 
T
A
 
E
D
 
E
A
 
A
E
 
D
R
 
A
V
 
L
V
 
I
A
 
G
C
 
M
A
 
A
R
 
Q
A
 
E
N
 
R
G
 
H
R
 
L
K
 
V
L
 
L
V
 
A
V
 
I
G
 
G
Y
 
H
I
 
I
L
 
K
R
 
R
H
 
V
H
 
H
P
 
P
S
 
A
W
 
I
M
 
Q
R
 
Y
L
 
L
I
 
-
A
 
-
E
 
R
A
 
Q
R
 
A
K
 
G
L
 
F
G
 
G
G
 
A
P
 
P
Y
 
-
V
 
-
F
 
-
R
 
-
M
 
-
N
 
-
L
 
-
N
 
-
Q
 
R
Q
 
Y
S
 
L
S
 
E
G
 
A
P
 
E
T
 
R
W
 
L
A
 
A
T
 
P
H
 
F
K
 
K
S
 
P
L
 
R
M
 
S
Q
 
L
T
 
D
T
 
I
P
 
D
P
 
V
I
 
I
V
 
M
D
 
D
C
 
L
G
 
M
V
 
I
H
 
H
Y
 
D
V
 
L
D
 
D
V
 
L
M
 
T
C
 
L
Q
 
L
I
 
L
T
 
T
D
 
G
A
 
A
N
 
E
P
 
P
V
 
V
E
 
D
V
 
V
R
 
R
G
 
A
M
 
V
G
 
G
L
 
V

Sites not aligning to the query:

B3TMR8 dTDP-3,4-didehydro-2,6-dideoxy-alpha-D-glucose 3-reductase; 3-ketoreductase; NADPH-dependent C3-ketoreductase; EC 1.1.1.384 from Actinomadura kijaniata (see paper)
30% identity, 36% coverage: 3:131/354 of query aligns to 5:136/332 of B3TMR8

query
sites
B3TMR8
S
 
A
S
 
N
A
 
A
P
 
N
P
 
P
I
 
I
R
 
R
V
 
V
L
 
G
S
 
V
A
 
I
G
 
G
L
x
C
G
x
A
N
x
D
M
x
I
G
x
A
R
x
W
S
x
R
H
 
R
A
 
A
L
 
L
-
 
P
A
 
A
Y
 
L
H
 
E
Q
 
A
N
 
E
P
 
P
G
 
L
F
 
T
E
 
E
I
 
V
A
 
T
G
 
A
L
 
I
V
 
A
N
x
S
R
|
R
S
 
R
-
 
W
-
 
D
-
 
R
K
 
A
V
 
K
A
 
R
L
 
F
P
 
T
E
 
E
A
 
R
L
 
F
A
 
G
G
 
G
Y
 
-
E
 
E
I
 
P
L
 
V
P
 
E
S
 
G
F
x
Y
P
 
P
E
 
A
A
 
L
L
 
L
A
 
E
E
 
R
L
 
D
E
 
D
P
 
V
E
 
D
L
 
A
C
 
V
S
 
Y
I
 
V
N
 
P
T
x
L
Y
 
P
S
 
A
D
 
V
T
 
L
H
|
H
A
 
A
D
 
E
Y
 
W
A
 
I
V
 
D
M
 
R
A
 
A
M
 
L
E
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
K
H
 
H
V
 
V
F
 
L
V
 
A
E
 
E
K
|
K
P
 
P
L
 
L
A
 
T
T
 
T
T
 
D
V
 
R
A
 
P
D
 
Q
A
 
A
E
 
E
R
 
R
V
 
L
V
 
F
A
 
A
C
 
V
A
 
A
R
 
R
A
 
E
N
 
R
G
 
G
R
 
L
K
 
L
L
 
L
V
 
M
V
 
E
G
 
N
Y
 
F
I
 
M
L
 
F
R
 
L
H
 
H
H
 
H
P
 
P
S
 
Q

Sites not aligning to the query:

4l8vA Crystal structure of a12k/d35s mutant myo-inositol dehydrogenase from bacillus subtilis with bound cofactor NADP (see paper)
24% identity, 50% coverage: 8:185/354 of query aligns to 3:181/337 of 4l8vA

query
sites
4l8vA
I
 
L
R
 
R
V
 
I
L
 
G
S
 
V
A
 
I
G
 
G
L
 
T
G
 
G
N
x
K
M
x
I
G
 
G
R
 
K
S
 
E
H
 
H
A
 
I
-
 
N
L
 
R
A
 
I
Y
 
T
H
 
N
Q
 
K
N
 
L
P
 
S
G
 
G
F
 
A
E
 
E
I
 
I
A
 
V
G
 
A
L
 
V
V
 
T
N
 
S
R
 
V
S
 
N
K
 
Q
V
 
E
A
 
A
L
 
A
P
 
Q
E
 
K
A
 
V
L
 
V
A
 
E
G
 
Q
Y
 
Y
E
 
Q
-
 
L
-
 
N
-
 
A
-
 
T
I
 
V
L
 
Y
P
 
P
S
 
N
F
 
D
P
 
D
E
 
S
A
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
D
L
 
E
E
 
N
P
 
V
E
 
D
L
 
A
C
 
V
S
 
L
I
 
V
N
 
T
T
x
S
Y
x
W
S
 
G
D
 
P
T
 
A
H
|
H
A
 
E
D
 
S
Y
 
S
A
 
V
V
 
L
M
 
K
A
 
A
M
 
I
E
 
K
A
 
A
G
 
Q
A
 
K
H
 
Y
V
 
V
F
 
F
V
 
C
E
|
E
K
|
K
P
 
P
L
 
L
A
 
A
T
 
T
T
 
T
V
 
A
A
 
E
D
 
G
A
 
C
E
 
M
R
 
R
V
 
I
V
 
V
A
 
E
C
 
E
A
 
E
R
 
I
A
 
K
N
 
V
G
 
G
R
 
K
K
 
R
L
 
L
V
 
V
-
 
Q
V
 
V
G
 
G
Y
 
F
I
x
M
L
 
R
R
 
R
H
 
Y
H
 
D
P
 
S
S
 
G
W
 
Y
M
 
V
R
 
Q
L
 
L
-
 
K
-
 
E
I
 
A
A
 
L
E
 
D
A
 
N
R
 
H
K
 
V
L
 
I
G
 
G
G
 
E
P
 
P
Y
 
L
V
 
M
F
 
I
R
 
H
M
 
C
N
 
A
L
 
H
N
 
R
Q
 
N
Q
 
P
S
 
T
S
 
V
G
 
G
P
 
D
T
 
N
W
 
Y
A
 
T
T
 
T
H
 
D
K
 
M
S
 
A
L
 
-
M
 
-
Q
 
-
T
 
-
T
 
-
P
 
-
P
 
-
I
 
V
V
 
V
D
 
D
C
 
T
G
 
L
V
 
V
H
|
H
Y
 
E
V
 
I
D
 
D
V
 
V
M
 
L

Sites not aligning to the query:

3rc1A Crystal structure of kijd10, a 3-ketoreductase from actinomadura kijaniata incomplex with NADP and tdp-benzene (see paper)
30% identity, 35% coverage: 7:131/354 of query aligns to 2:129/325 of 3rc1A

query
sites
3rc1A
P
 
P
I
 
I
R
 
R
V
 
V
L
 
G
S
 
V
A
 
I
G
 
G
L
x
C
G
x
A
N
x
D
M
x
I
G
 
A
R
 
W
S
x
R
H
x
R
A
 
A
L
 
L
-
 
P
A
 
A
Y
 
L
H
 
E
Q
 
A
N
 
E
P
 
P
G
 
L
F
 
T
E
 
E
I
 
V
A
 
T
G
 
A
L
 
I
V
 
A
N
x
S
R
|
R
S
 
R
-
 
W
-
 
D
-
 
R
K
 
A
V
 
K
A
 
R
L
 
F
P
 
T
E
 
E
A
 
R
L
 
F
A
 
G
G
 
G
Y
 
-
E
 
E
I
 
P
L
 
V
P
 
E
S
 
G
F
x
Y
P
 
P
E
 
A
A
 
L
L
 
L
A
 
E
E
 
R
L
 
D
E
 
D
P
 
V
E
 
D
L
 
A
C
 
V
S
 
Y
I
 
V
N
x
P
T
x
L
Y
x
P
S
 
A
D
 
V
T
 
L
H
|
H
A
 
A
D
 
E
Y
 
W
A
 
I
V
 
D
M
 
R
A
 
A
M
 
L
E
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
K
H
 
H
V
 
V
F
 
L
V
 
A
E
|
E
K
|
K
P
 
P
L
 
L
A
 
T
T
 
T
T
 
D
V
 
R
A
 
P
D
 
Q
A
 
A
E
 
E
R
 
R
V
 
L
V
 
F
A
 
A
C
 
V
A
 
A
R
 
R
A
 
E
N
 
R
G
 
G
R
 
L
K
 
L
L
 
L
V
 
M
V
 
E
G
 
N
Y
 
F
I
 
M
L
 
F
R
 
L
H
 
H
H
 
H
P
 
P
S
 
Q

Sites not aligning to the query:

3nt5A Crystal structure of myo-inositol dehydrogenase from bacillus subtilis with bound cofactor and product inosose (see paper)
24% identity, 50% coverage: 8:185/354 of query aligns to 3:181/337 of 3nt5A

query
sites
3nt5A
I
 
L
R
 
R
V
 
I
L
 
G
S
 
V
A
 
I
G
|
G
L
 
T
G
|
G
N
x
A
M
x
I
G
 
G
R
 
K
S
 
E
H
 
H
A
 
I
-
 
N
L
 
R
A
 
I
Y
 
T
H
 
N
Q
 
K
N
 
L
P
 
S
G
 
G
F
 
A
E
 
E
I
 
I
A
 
V
G
 
A
L
 
V
V
 
T
N
x
D
R
x
V
S
 
N
K
 
Q
V
 
E
A
 
A
L
 
A
P
 
Q
E
 
K
A
 
V
L
 
V
A
 
E
G
 
Q
Y
 
Y
E
 
Q
-
 
L
-
 
N
-
 
A
-
 
T
I
 
V
L
 
Y
P
 
P
S
 
N
F
 
D
P
 
D
E
 
S
A
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
D
L
 
E
E
 
N
P
 
V
E
 
D
L
 
A
C
 
V
S
 
L
I
 
V
N
 
T
T
x
S
Y
x
W
S
x
G
D
 
P
T
 
A
H
 
H
A
 
E
D
 
S
Y
 
S
A
 
V
V
 
L
M
 
K
A
 
A
M
 
I
E
 
K
A
 
A
G
 
Q
A
 
K
H
 
Y
V
 
V
F
 
F
V
 
C
E
|
E
K
|
K
P
 
P
L
 
L
A
 
A
T
 
T
T
 
T
V
 
A
A
 
E
D
 
G
A
 
C
E
 
M
R
 
R
V
 
I
V
 
V
A
 
E
C
 
E
A
 
E
R
 
I
A
 
K
N
 
V
G
 
G
R
 
K
K
 
R
L
 
L
V
 
V
-
 
Q
V
 
V
G
 
G
Y
 
F
I
 
M
L
 
R
R
 
R
H
 
Y
H
 
D
P
 
S
S
 
G
W
 
Y
M
 
V
R
 
Q
L
 
L
-
 
K
-
 
E
I
 
A
A
 
L
E
 
D
A
 
N
R
 
H
K
 
V
L
 
I
G
 
G
G
 
E
P
 
P
Y
 
L
V
 
M
F
 
I
R
 
H
M
 
C
N
 
A
L
x
H
N
 
R
Q
 
N
Q
 
P
S
 
T
S
 
V
G
 
G
P
 
D
T
 
N
W
 
Y
A
 
T
T
 
T
H
 
D
K
 
M
S
 
A
L
 
-
M
 
-
Q
 
-
T
 
-
T
 
-
P
 
-
P
 
-
I
 
V
V
 
V
D
 
D
C
 
T
G
 
L
V
 
V
H
|
H
Y
 
E
V
 
I
D
 
D
V
 
V
M
 
L

Sites not aligning to the query:

3nt4A Crystal structure of myo-inositol dehydrogenase from bacillus subtilis with bound cofactor nadh and inositol (see paper)
24% identity, 50% coverage: 8:185/354 of query aligns to 3:181/337 of 3nt4A

query
sites
3nt4A
I
 
L
R
 
R
V
 
I
L
 
G
S
 
V
A
 
I
G
 
G
L
 
T
G
|
G
N
x
A
M
x
I
G
 
G
R
 
K
S
 
E
H
 
H
A
 
I
-
 
N
L
 
R
A
 
I
Y
 
T
H
 
N
Q
 
K
N
 
L
P
 
S
G
 
G
F
 
A
E
 
E
I
 
I
A
 
V
G
 
A
L
 
V
V
 
T
N
x
D
R
x
V
S
 
N
K
 
Q
V
 
E
A
 
A
L
 
A
P
 
Q
E
 
K
A
 
V
L
 
V
A
 
E
G
 
Q
Y
 
Y
E
 
Q
-
 
L
-
 
N
-
 
A
-
 
T
I
 
V
L
 
Y
P
 
P
S
 
N
F
 
D
P
 
D
E
 
S
A
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
D
L
 
E
E
 
N
P
 
V
E
 
D
L
 
A
C
 
V
S
 
L
I
 
V
N
 
T
T
x
S
Y
x
W
S
x
G
D
 
P
T
 
A
H
 
H
A
 
E
D
 
S
Y
 
S
A
 
V
V
 
L
M
 
K
A
 
A
M
 
I
E
 
K
A
 
A
G
 
Q
A
 
K
H
 
Y
V
 
V
F
 
F
V
 
C
E
|
E
K
|
K
P
 
P
L
 
L
A
 
A
T
 
T
T
 
T
V
 
A
A
 
E
D
 
G
A
 
C
E
 
M
R
 
R
V
 
I
V
 
V
A
 
E
C
 
E
A
 
E
R
 
I
A
 
K
N
 
V
G
 
G
R
 
K
K
 
R
L
 
L
V
 
V
-
 
Q
V
 
V
G
 
G
Y
 
F
I
 
M
L
 
R
R
 
R
H
 
Y
H
 
D
P
 
S
S
 
G
W
 
Y
M
 
V
R
 
Q
L
 
L
-
 
K
-
 
E
I
 
A
A
 
L
E
 
D
A
 
N
R
 
H
K
 
V
L
 
I
G
 
G
G
 
E
P
 
P
Y
 
L
V
 
M
F
 
I
R
 
H
M
 
C
N
 
A
L
x
H
N
 
R
Q
 
N
Q
 
P
S
 
T
S
 
V
G
 
G
P
 
D
T
 
N
W
 
Y
A
 
T
T
 
T
H
 
D
K
 
M
S
 
A
L
 
-
M
 
-
Q
 
-
T
 
-
T
 
-
P
 
-
P
 
-
I
 
V
V
 
V
D
 
D
C
 
T
G
 
L
V
 
V
H
|
H
Y
 
E
V
 
I
D
 
D
V
 
V
M
 
L

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>SMc02870 FitnessBrowser__Smeli:SMc02870
MNSSAPPIRVLSAGLGNMGRSHALAYHQNPGFEIAGLVNRSKVALPEALAGYEILPSFPE
ALAELEPELCSINTYSDTHADYAVMAMEAGAHVFVEKPLATTVADAERVVACARANGRKL
VVGYILRHHPSWMRLIAEARKLGGPYVFRMNLNQQSSGPTWATHKSLMQTTPPIVDCGVH
YVDVMCQITDANPVEVRGMGLRLSNEIAADMYNYGHLQVIFEDGSVGWYEAGWGPMISET
AFFVKDVMSPNGSVSIVMDQNAKSDDIDVHTKTSVIRVHSAATGPDGRFLKSDEDLVMEG
EPGHQELCDREQAFVLKAIREDIDLGRHMDDAVQSLKICLAADDSVRTGKPVKL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory