SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing SMc03103 SMc03103 carbon monoxide dehydrogenase medium subunit transmembrane protein to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 13 hits to proteins with known functional sites (download)

4zohB Crystal structure of glyceraldehyde oxidoreductase (see paper)
35% identity, 96% coverage: 11:265/265 of query aligns to 13:272/274 of 4zohB

query
sites
4zohB
S
 
N
V
 
L
E
 
N
E
 
E
A
 
A
A
 
L
N
 
E
L
 
F
M
 
L
G
 
E
T
 
E
A
 
H
A
 
Q
E
 
D
G
 
A
K
x
R
Y
x
P
L
 
L
S
x
A
G
|
G
G
|
G
M
x
H
T
x
S
L
|
L
I
 
I
P
 
P
T
 
M
M
 
L
K
 
K
Q
 
L
R
 
R
L
 
L
A
 
I
A
 
R
P
 
P
S
 
S
D
 
Y
L
 
I
V
 
V
D
 
E
L
 
I
R
 
R
H
 
R
I
 
F
A
 
S
E
 
N
M
 
L
K
 
S
G
 
Y
I
 
I
T
 
T
V
 
K
D
 
D
G
 
G
R
 
N
S
 
L
V
 
Y
R
 
K
I
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
L
T
 
T
T
 
T
H
|
H
E
 
Y
E
 
N
V
 
I
A
 
S
T
 
K
S
 
S
A
 
S
A
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
C
 
I
P
 
P
A
 
L
I
 
L
C
 
S
G
 
E
L
 
T
A
 
A
S
 
S
H
 
N
I
|
I
G
|
G
D
 
D
P
 
P
H
 
Q
V
|
V
R
 
R
H
 
N
M
 
M
G
 
G
T
|
T
I
 
I
G
 
G
G
|
G
S
|
S
I
 
I
A
x
S
N
 
H
N
 
L
D
 
D
P
 
P
A
 
S
A
|
A
D
|
D
Y
 
Y
P
 
P
A
 
A
A
 
A
M
 
L
L
 
I
A
 
A
L
 
M
D
 
D
A
 
A
-
 
K
V
 
V
I
 
K
V
 
I
T
 
T
D
 
S
R
 
R
-
 
K
-
 
G
-
 
D
R
 
R
E
 
V
V
 
V
K
 
N
A
 
F
E
 
K
D
 
S
F
 
F
F
 
A
T
 
K
G
 
D
L
 
M
F
 
F
E
 
T
T
 
P
A
 
D
L
 
L
E
 
N
D
 
P
G
 
G
E
 
E
I
x
L
V
|
V
T
 
T
A
 
E
V
 
I
R
 
Q
-
 
V
-
 
P
-
 
T
F
 
F
E
 
E
A
 
G
P
 
-
A
 
Y
K
 
K
A
 
F
A
 
S
Y
 
Y
Q
 
Q
K
 
K
F
 
L
P
 
E
N
 
R
P
 
R
A
 
A
S
 
G
R
x
D
Y
x
F
A
 
A
M
 
I
T
 
V
G
 
G
V
 
V
F
 
A
V
 
L
V
 
L
R
 
L
R
 
K
D
 
L
D
 
S
G
 
G
-
 
D
-
 
V
-
 
I
-
 
E
G
 
D
V
 
V
R
 
R
V
 
I
A
 
G
V
 
L
T
 
T
G
 
A
A
 
V
G
 
N
S
 
N
D
 
V
G
 
A
V
 
V
F
 
R
R
 
A
H
 
K
R
 
G
D
 
A
L
 
E
E
 
E
A
 
E
A
 
L
L
 
L
A
 
G
A
 
K
N
 
R
W
 
L
S
 
N
P
 
D
G
 
E
A
 
I
V
 
I
A
 
E
N
 
K
V
 
A
Q
 
A
V
 
T
D
 
R
D
 
A
S
 
M
D
 
E
L
 
S
L
 
A
S
 
N
D
 
P
I
 
T
H
 
S
A
 
G
S
 
S
A
 
A
A
 
E
Y
|
Y
R
 
K
A
 
K
N
 
K
L
 
M
V
 
V
K
 
K
V
 
V
M
 
L
T
 
T
K
 
K
R
 
R
A
 
A
V
 
I
A
 
I
A
 
T
A
 
A

1ffuC Carbon monoxide dehydrogenase from hydrogenophaga pseudoflava which lacks the mo-pyranopterin moiety of the molybdenum cofactor (see paper)
39% identity, 75% coverage: 5:203/265 of query aligns to 7:217/287 of 1ffuC

query
sites
1ffuC
N
 
E
Y
 
Y
H
 
H
R
 
A
A
 
P
S
 
K
S
 
S
V
 
V
E
 
G
E
 
E
A
 
A
A
 
V
N
 
A
L
 
L
M
 
L
G
 
G
T
 
Q
-
 
L
A
 
G
A
 
S
E
 
D
G
 
A
K
|
K
Y
x
L
L
 
L
S
x
A
G
|
G
G
|
G
M
x
H
T
x
S
L
|
L
I
 
L
P
 
P
T
 
M
M
 
M
K
 
K
Q
 
L
R
 
R
L
 
F
A
 
A
A
 
Q
P
 
P
S
 
E
D
 
H
L
 
L
V
 
I
D
 
D
L
x
I
R
 
N
H
 
R
I
 
I
A
 
P
E
 
E
M
 
L
K
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
R
V
 
E
D
 
E
G
 
G
R
 
S
S
 
T
V
 
V
R
 
V
I
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
M
T
 
T
T
 
V
H
 
E
E
 
N
E
 
D
V
 
L
A
 
I
T
 
S
S
 
S
A
 
P
A
 
I
L
 
V
A
 
Q
A
 
A
A
 
R
C
 
L
P
 
P
A
 
L
I
 
L
C
 
A
G
 
E
L
 
A
A
 
A
S
 
K
H
 
L
I
|
I
G
x
A
D
 
D
P
 
P
H
 
Q
V
 
V
R
 
R
H
 
N
M
 
R
G
|
G
T
|
T
I
 
I
G
 
G
G
|
G
S
x
D
I
 
I
A
|
A
N
 
H
N
 
G
D
 
D
P
 
P
A
 
G
A
x
N
D
|
D
Y
 
H
P
 
P
A
 
A
A
 
L
M
 
S
L
 
I
A
 
A
L
 
V
D
 
E
A
 
A
V
 
H
I
 
F
V
 
V
T
 
L
D
 
E
-
 
G
-
 
P
-
 
N
-
 
G
R
 
R
R
 
R
E
 
T
V
 
V
K
 
P
A
 
A
E
 
D
D
 
G
F
 
F
F
 
F
T
 
L
G
 
G
L
 
T
F
 
Y
E
 
M
T
 
T
A
 
L
L
|
L
E
 
E
D
 
E
G
 
N
E
 
E
I
x
V
V
x
M
T
 
V
A
 
E
V
 
I
R
 
R
-
 
V
-
 
P
-
 
A
F
 
F
E
 
A
A
 
A
P
 
G
A
 
T
K
 
G
A
 
W
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
E
K
 
K
F
 
L
P
 
K
N
 
R
P
 
K
A
 
T
S
 
G
R
 
D
Y
x
W
A
 
A
M
 
T
T
 
A
G
 
G
V
 
C
F
 
A
V
 
V
V
 
V
R
 
M
R
 
R
D
 
K
D
 
S
G
 
G
G
 
G
-
 
T
-
 
V
-
 
S
-
 
H
V
 
I
R
 
R
V
 
I
A
 
A
V
 
L
T
 
T

1n5wC Crystal structure of the cu,mo-co dehydrogenase (codh); oxidized form (see paper)
41% identity, 73% coverage: 5:197/265 of query aligns to 7:207/287 of 1n5wC

query
sites
1n5wC
N
 
D
Y
 
Y
H
 
H
R
 
R
A
 
P
S
 
K
S
 
S
V
 
I
E
 
A
E
 
D
A
 
A
A
 
V
N
 
A
L
 
L
M
 
L
G
 
T
T
 
K
A
 
L
A
 
G
E
 
E
-
 
D
G
 
A
K
 
R
Y
 
P
L
 
L
S
 
A
G
 
G
G
 
G
M
x
H
T
 
S
L
 
L
I
 
I
P
 
P
T
 
I
M
 
M
K
 
K
Q
 
T
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
T
P
 
P
S
 
E
D
 
H
L
 
L
V
 
V
D
 
D
L
 
L
R
 
R
H
 
D
I
 
I
A
 
G
E
 
D
M
 
L
K
 
V
G
 
G
I
 
I
T
 
R
V
 
E
D
 
E
G
 
G
R
 
T
S
 
D
V
 
V
R
 
V
I
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
M
T
 
T
T
 
T
H
 
Q
E
 
H
E
 
A
V
 
L
A
 
I
T
 
G
S
 
S
A
 
D
A
 
F
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
K
C
 
L
P
 
P
A
 
I
I
 
I
C
 
R
G
 
E
L
 
T
A
 
S
S
 
L
H
 
L
I
|
I
G
x
A
D
 
D
P
 
P
H
 
Q
V
 
I
R
 
R
H
 
Y
M
 
M
G
 
G
T
 
T
I
 
I
G
 
G
G
 
G
S
x
N
I
 
A
A
 
A
N
 
N
N
 
G
D
 
D
P
 
P
A
 
G
A
x
N
D
|
D
Y
 
M
P
 
P
A
 
A
A
 
L
M
 
M
L
 
Q
A
 
C
L
 
L
D
 
G
A
 
A
V
 
A
I
 
Y
V
 
E
T
 
L
D
 
T
R
 
G
R
 
P
E
 
E
-
 
G
-
 
A
-
 
R
-
 
I
V
 
V
K
 
A
A
 
A
E
 
R
D
 
D
F
 
Y
F
 
Y
T
 
Q
G
 
G
L
 
A
F
 
Y
E
 
F
T
 
T
A
 
A
L
 
I
E
 
E
D
 
P
G
 
G
E
 
E
I
 
L
V
 
L
T
 
T
A
 
A
V
 
I
R
 
R
F
 
I
E
 
P
A
 
V
P
 
P
A
 
P
K
 
T
A
 
G
-
 
H
-
 
G
-
 
Y
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
E
K
 
K
F
 
L
P
 
K
N
 
R
P
 
K
A
 
I
S
 
G
R
 
D
Y
|
Y
A
 
A
M
 
T
T
 
A
G
 
A
V
 
A
F
 
A
V
 
V
V
 
V
R
 
L
R
 
T
D
 
M
D
 
S
G
 
G
G
 
G

P19920 Carbon monoxide dehydrogenase medium chain; CO dehydrogenase subunit M; CO-DH M; EC 1.2.5.3 from Afipia carboxidovorans (strain ATCC 49405 / DSM 1227 / KCTC 32145 / OM5) (Oligotropha carboxidovorans) (see 2 papers)
41% identity, 73% coverage: 5:197/265 of query aligns to 7:207/288 of P19920

query
sites
P19920
N
 
D
Y
 
Y
H
 
H
R
 
R
A
 
P
S
 
K
S
 
S
V
 
I
E
 
A
E
 
D
A
 
A
A
 
V
N
 
A
L
 
L
M
 
L
G
 
T
T
 
K
A
 
L
A
 
G
E
 
E
-
 
D
G
 
A
K
 
R
Y
 
P
L
 
L
S
x
A
G
|
G
G
|
G
M
x
H
T
x
S
L
 
L
I
 
I
P
 
P
T
 
I
M
 
M
K
 
K
Q
 
T
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
T
P
 
P
S
 
E
D
 
H
L
 
L
V
 
V
D
 
D
L
 
L
R
 
R
H
 
D
I
 
I
A
 
G
E
 
D
M
 
L
K
 
V
G
 
G
I
 
I
T
 
R
V
 
E
D
 
E
G
 
G
R
 
T
S
 
D
V
 
V
R
 
V
I
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
M
T
 
T
T
 
T
H
 
Q
E
 
H
E
 
A
V
 
L
A
 
I
T
 
G
S
 
S
A
 
D
A
 
F
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
K
C
 
L
P
 
P
A
 
I
I
 
I
C
 
R
G
 
E
L
 
T
A
 
S
S
 
L
H
 
L
I
 
I
G
 
A
D
 
D
P
 
P
H
 
Q
V
 
I
R
 
R
H
 
Y
M
 
M
G
 
G
T
|
T
I
|
I
G
|
G
G
|
G
S
x
N
I
 
A
A
 
A
N
 
N
N
 
G
D
 
D
P
 
P
A
 
G
A
 
N
D
 
D
Y
 
M
P
 
P
A
 
A
A
 
L
M
 
M
L
 
Q
A
 
C
L
 
L
D
 
G
A
 
A
V
 
A
I
 
Y
V
 
E
T
 
L
D
 
T
R
 
G
R
 
P
E
 
E
-
 
G
-
 
A
-
 
R
-
 
I
V
 
V
K
 
A
A
 
A
E
 
R
D
 
D
F
 
Y
F
 
Y
T
 
Q
G
 
G
L
 
A
F
 
Y
E
 
F
T
 
T
A
 
A
L
 
I
E
 
E
D
 
P
G
 
G
E
 
E
I
 
L
V
 
L
T
 
T
A
 
A
V
 
I
R
 
R
F
 
I
E
 
P
A
 
V
P
 
P
A
 
P
K
 
T
A
 
G
-
 
H
-
 
G
-
 
Y
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
E
K
 
K
F
 
L
P
 
K
N
 
R
P
 
K
A
 
I
S
 
G
R
 
D
Y
 
Y
A
 
A
M
 
T
T
 
A
G
 
A
V
 
A
F
 
A
V
 
V
V
 
V
R
 
L
R
 
T
D
 
M
D
 
S
G
 
G
G
 
G

7dqxE Crystal structure of xanthine dehydrogenase family protein
30% identity, 98% coverage: 5:265/265 of query aligns to 7:283/293 of 7dqxE

query
sites
7dqxE
N
 
D
Y
 
Y
H
 
V
R
 
V
A
 
A
S
 
D
S
 
S
V
 
V
E
 
E
E
 
H
A
 
A
A
 
L
N
 
R
L
 
L
M
 
L
G
 
A
T
 
D
A
 
G
A
 
G
E
 
D
-
 
D
G
 
A
K
|
K
Y
x
I
L
x
I
S
 
A
G
|
G
G
|
G
M
x
Q
T
x
S
L
|
L
I
 
V
P
 
P
T
 
L
M
 
L
K
 
N
Q
 
F
R
 
R
L
 
M
A
 
S
A
 
R
P
 
P
S
 
S
D
 
L
L
 
L
V
 
V
D
 
D
L
 
I
R
 
N
H
 
R
I
 
V
A
 
P
E
 
G
M
 
L
K
 
A
G
 
N
I
 
I
T
 
R
V
 
K
D
 
S
G
 
D
R
 
Q
S
 
T
V
 
I
R
 
A
I
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
L
T
 
T
T
 
R
H
|
H
E
 
A
E
 
K
V
 
L
A
 
T
T
 
T
S
 
S
A
 
K
A
 
T
L
 
I
A
 
S
A
 
Q
A
 
N
C
 
L
P
 
P
A
 
I
I
 
L
C
 
S
G
 
E
L
 
A
A
 
A
S
 
A
H
 
W
I
|
I
G
x
A
D
 
H
P
 
P
H
 
Q
V
x
I
R
 
R
H
 
N
M
 
R
G
|
G
T
|
T
I
 
I
G
|
G
G
|
G
S
|
S
I
 
L
A
|
A
N
 
H
N
 
A
D
 
D
P
 
A
A
 
A
A
|
A
D
x
E
Y
 
L
P
 
P
A
 
V
A
 
V
M
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
A
V
 
Y
I
 
V
-
 
T
-
 
A
-
 
Q
-
 
S
V
 
L
T
 
Q
D
 
G
R
 
E
R
 
R
E
 
K
V
 
I
K
 
P
A
 
L
E
 
K
D
 
E
F
 
L
F
 
L
T
 
V
G
 
S
L
 
H
F
 
F
E
 
V
T
 
S
A
 
S
L
 
I
E
 
L
D
 
P
G
 
G
E
 
E
I
 
L
V
x
I
T
 
V
A
 
E
V
 
V
R
 
N
F
 
V
-
 
P
E
 
Q
A
 
L
P
 
P
-
 
H
-
 
G
A
 
S
K
 
G
A
 
A
A
 
A
Y
 
F
Q
 
D
K
 
E
F
 
F
P
 
S
N
 
R
P
 
R
A
 
H
S
 
G
R
 
D
Y
|
Y
A
 
A
M
 
I
T
 
G
G
 
G
-
 
A
V
 
A
F
 
S
V
 
L
V
 
V
R
 
T
R
 
L
D
 
D
D
 
E
G
 
Q
G
 
G
-
 
K
-
 
C
-
 
S
-
 
R
V
 
A
R
 
R
V
 
I
A
 
T
V
 
V
T
 
L
G
 
G
A
 
G
G
 
G
S
 
S
D
 
T
G
 
A
V
 
I
F
 
-
R
 
R
H
 
C
R
 
Q
D
 
E
L
 
A
E
 
E
A
 
N
A
 
I
L
 
L
A
 
I
-
 
D
-
 
S
-
 
T
-
 
L
A
 
S
N
 
S
W
 
H
S
 
D
P
 
I
G
 
A
A
 
A
V
 
A
A
 
A
N
 
H
V
 
A
Q
 
A
V
 
V
D
 
Q
D
 
G
S
 
L
D
 
D
L
 
P
L
 
V
S
 
P
D
 
T
I
 
V
H
 
H
A
 
G
S
 
S
A
 
A
A
 
Q
Y
 
Y
R
 
R
A
 
A
N
 
Q
L
 
V
V
 
I
K
 
R
V
 
T
M
 
M
T
 
V
K
 
E
R
 
R
A
 
T
V
 
L
A
 
A
A
 
K
A
 
A

1t3qC Crystal structure of quinoline 2-oxidoreductase from pseudomonas putida 86 (see paper)
30% identity, 98% coverage: 5:265/265 of query aligns to 7:279/285 of 1t3qC

query
sites
1t3qC
N
 
S
Y
 
Y
H
 
R
R
 
A
A
 
P
S
 
A
S
 
S
V
 
L
E
 
Q
E
 
E
A
 
V
A
 
I
N
 
Q
L
 
V
M
 
L
G
 
A
T
 
D
A
 
D
A
 
P
E
 
D
G
 
A
K
 
R
Y
x
I
L
 
I
S
x
A
G
|
G
G
|
G
M
x
Q
T
x
S
L
|
L
I
 
L
P
 
P
T
 
L
M
 
L
K
 
A
Q
 
F
R
 
R
L
 
L
A
 
V
A
 
Y
P
 
P
S
 
S
D
 
C
L
 
L
V
 
V
D
 
D
L
 
L
R
 
R
H
 
N
I
 
V
A
 
S
E
 
E
M
 
L
K
 
F
G
 
E
I
 
I
T
 
S
V
 
Q
D
 
S
G
 
A
R
 
G
S
 
I
V
 
L
R
 
S
I
 
V
G
 
G
A
 
A
A
 
M
T
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
F
E
 
R
V
 
N
A
 
K
T
 
T
S
 
D
A
 
P
A
 
T
L
 
V
A
 
A
A
 
K
A
 
C
C
 
V
P
 
P
A
 
I
I
 
L
C
 
P
G
 
K
L
 
V
A
 
L
S
 
A
H
 
H
I
x
V
G
x
A
D
 
H
P
 
Q
H
 
A
V
|
V
R
 
R
H
 
N
M
 
R
G
 
G
T
|
T
I
 
L
G
 
G
G
|
G
S
|
S
I
 
L
A
|
A
N
 
H
N
 
A
D
 
D
P
 
A
A
 
G
A
|
A
D
x
E
Y
 
M
P
 
P
A
 
F
A
 
L
M
 
M
L
 
A
A
 
T
L
 
L
D
 
G
A
 
A
V
 
T
I
 
M
V
 
Y
T
 
I
D
 
A
R
 
S
-
 
S
-
 
A
-
 
G
-
 
V
R
 
R
E
 
S
V
 
V
K
 
S
A
 
A
E
 
T
D
 
D
F
 
F
F
 
M
T
 
K
G
 
G
L
 
H
F
 
Y
E
 
F
T
 
T
A
 
D
L
 
L
E
 
E
D
 
A
G
 
G
E
 
E
I
 
V
V
x
L
T
 
-
A
 
-
V
 
V
R
 
R
F
 
V
E
 
E
A
 
I
P
 
P
A
 
I
K
 
P
A
 
A
A
 
L
Y
 
H
Q
 
W
K
 
E
F
 
F
P
 
D
N
 
E
P
 
Y
A
 
A
S
 
R
R
 
R
-
 
K
-
 
G
-
 
D
Y
|
Y
A
 
A
M
 
L
T
 
V
G
 
M
V
 
A
F
 
A
V
 
A
V
 
G
R
 
L
R
 
S
D
 
M
D
 
Q
G
 
G
G
 
G
V
 
R
R
 
C
V
 
V
A
 
A
V
 
A
T
 
R
G
 
I
A
 
A
G
 
-
S
 
-
D
 
L
G
 
G
V
 
A
F
 
V
R
 
E
H
 
E
R
 
R
D
 
A
L
 
H
E
 
Q
A
 
A
A
 
I
L
 
R
A
 
A
A
 
N
N
 
D
W
 
F
S
 
L
P
 
V
G
 
G
A
 
K
V
 
V
A
 
-
N
 
-
V
 
-
Q
 
-
V
 
I
D
 
D
D
 
E
S
 
S
D
 
T
L
 
A
L
 
A
-
 
T
-
 
A
-
 
A
-
 
E
-
 
L
-
 
A
-
 
T
-
 
E
-
 
G
-
 
L
-
 
E
-
 
P
-
 
R
S
 
S
D
 
D
I
 
I
H
 
H
A
 
G
S
 
S
A
 
R
A
 
D
Y
 
L
R
 
R
A
 
L
N
 
S
L
 
L
V
 
A
K
 
K
V
 
A
M
 
I
T
 
T
K
 
Q
R
 
R
A
 
V
V
 
I
A
 
L
A
 
K
A
 
A

3hrdG Crystal structure of nicotinate dehydrogenase (see paper)
29% identity, 75% coverage: 1:198/265 of query aligns to 1:212/292 of 3hrdG

query
sites
3hrdG
M
 
M
Y
 
K
E
 
D
T
 
F
N
 
E
Y
 
F
H
 
F
R
 
A
A
 
P
S
 
K
S
 
T
V
 
L
E
 
E
E
 
E
A
 
A
A
 
K
N
 
G
L
 
L
M
 
L
G
 
H
T
 
Q
A
 
Y
A
 
K
E
 
D
-
 
V
-
 
P
G
 
P
K
 
A
Y
x
I
L
 
I
S
x
A
G
|
G
G
|
G
M
x
T
T
x
D
L
 
L
I
 
V
P
 
I
T
 
E
M
 
I
K
 
N
Q
 
D
R
 
R
L
 
W
A
 
E
A
 
K
P
 
P
S
 
D
D
 
V
L
 
V
V
 
I
D
 
D
L
 
I
R
 
K
H
 
K
I
 
L
A
 
K
E
 
E
M
 
L
K
 
E
G
 
Y
I
 
I
T
 
R
V
 
V
D
 
E
G
 
E
R
 
N
S
 
T
V
 
I
R
 
H
I
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
L
T
 
S
T
 
T
H
x
F
E
 
T
E
 
Q
V
 
I
A
 
E
T
 
N
S
 
H
A
 
P
A
 
F
L
 
I
A
 
R
A
 
S
A
 
H
C
 
V
P
 
R
A
 
A
I
 
L
C
 
Y
G
 
K
L
 
A
A
 
A
S
 
S
H
 
Q
I
x
V
G
|
G
D
 
S
P
 
P
H
 
Q
V
x
I
R
 
R
H
 
N
M
 
L
G
 
G
T
|
T
I
 
I
G
 
G
G
|
G
S
x
N
I
 
L
A
x
S
N
x
T
N
 
S
D
 
S
P
 
V
A
 
A
A
x
G
D
|
D
Y
 
G
P
 
V
A
 
S
A
 
A
M
 
M
L
 
T
A
 
T
L
 
L
D
 
D
A
 
A
V
 
T
I
 
V
V
 
V
T
 
L
D
 
E
R
 
S
-
 
V
-
 
R
-
 
G
-
 
T
R
 
R
E
 
Q
V
 
M
K
 
K
A
 
L
E
 
T
D
 
D
F
 
F
F
 
F
T
 
D
G
 
G
L
 
E
-
 
G
F
 
F
E
 
K
-
 
R
-
 
R
T
 
N
A
 
A
L
 
L
E
 
E
D
 
A
G
 
D
E
 
E
I
|
I
V
x
M
T
 
T
A
 
E
V
 
V
R
 
I
F
 
I
E
 
D
A
 
R
P
 
P
A
 
D
K
 
A
A
 
H
A
 
S
Y
 
A
Q
 
S
K
 
A
F
 
F
P
 
Y
N
 
K
P
 
L
A
 
A
S
 
K
R
 
R
Y
 
K
A
 
S
M
 
L
T
 
A
-
 
I
-
 
S
-
 
V
-
 
I
-
 
G
G
 
G
V
 
G
F
 
M
V
 
A
V
 
V
R
 
K
R
 
V
D
 
D
D
 
D
G
 
A
G
 
G
V
 
V

Q0QLF4 Nicotinate dehydrogenase FAD-subunit; NDH; Nicotinic acid hydroxylase FAD-subunit; NAH; EC 1.17.1.5 from Eubacterium barkeri (Clostridium barkeri) (see paper)
29% identity, 75% coverage: 1:198/265 of query aligns to 1:212/296 of Q0QLF4

query
sites
Q0QLF4
M
 
M
Y
 
K
E
 
D
T
 
F
N
 
E
Y
 
F
H
 
F
R
 
A
A
 
P
S
 
K
S
 
T
V
 
L
E
 
E
E
 
E
A
 
A
A
 
K
N
 
G
L
 
L
M
 
L
G
 
H
T
 
Q
A
 
Y
A
 
K
E
 
D
-
 
V
-
 
P
G
 
P
K
 
A
Y
x
I
L
x
I
S
x
A
G
|
G
G
|
G
M
x
T
T
x
D
L
|
L
I
 
V
P
 
I
T
 
E
M
 
I
K
 
N
Q
 
D
R
 
R
L
 
W
A
 
E
A
 
K
P
 
P
S
 
D
D
 
V
L
 
V
V
 
I
D
 
D
L
 
I
R
 
K
H
 
K
I
 
L
A
 
K
E
 
E
M
 
L
K
 
E
G
 
Y
I
 
I
T
 
R
V
 
V
D
 
E
G
 
E
R
 
N
S
 
T
V
 
I
R
 
H
I
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
L
T
 
S
T
 
T
H
 
F
E
 
T
E
 
Q
V
 
I
A
 
E
T
 
N
S
 
H
A
 
P
A
 
F
L
 
I
A
 
R
A
 
S
A
 
H
C
 
V
P
 
R
A
 
A
I
 
L
C
 
Y
G
 
K
L
 
A
A
 
A
S
 
S
H
 
Q
I
 
V
G
|
G
D
 
S
P
 
P
H
 
Q
V
 
I
R
 
R
H
 
N
M
 
L
G
 
G
T
|
T
I
|
I
G
|
G
G
|
G
S
x
N
I
 
L
A
 
S
N
 
T
N
 
S
D
 
S
P
 
V
A
 
A
A
 
G
D
|
D
Y
 
G
P
 
V
A
 
S
A
 
A
M
 
M
L
 
T
A
 
T
L
 
L
D
 
D
A
 
A
V
 
T
I
 
V
V
 
V
T
 
L
D
 
E
R
 
S
-
 
V
-
 
R
-
 
G
-
 
T
R
 
R
E
 
Q
V
 
M
K
 
K
A
 
L
E
 
T
D
 
D
F
 
F
F
 
F
T
 
D
G
 
G
L
 
E
-
 
G
F
 
F
E
 
K
-
 
R
-
x
R
T
 
N
A
 
A
L
 
L
E
 
E
D
 
A
G
 
D
E
 
E
I
 
I
V
x
M
T
 
T
A
 
E
V
 
V
R
 
I
F
 
I
E
 
D
A
 
R
P
 
P
A
 
D
K
 
A
A
 
H
A
 
S
Y
 
A
Q
 
S
K
 
A
F
 
F
P
 
Y
N
x
K
P
 
L
A
 
A
S
 
K
R
 
R
Y
 
K
A
 
S
M
 
L
T
 
A
-
 
I
-
 
S
-
 
V
-
 
I
-
 
G
G
 
G
V
 
G
F
 
M
V
 
A
V
 
V
R
 
K
R
 
V
D
 
D
D
 
D
G
 
A
G
 
G
V
 
V

1jroA Crystal structure of xanthine dehydrogenase from rhodobacter capsulatus (see paper)
32% identity, 66% coverage: 89:262/265 of query aligns to 249:435/450 of 1jroA

query
sites
1jroA
P
 
P
A
 
A
I
 
L
C
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
L
S
 
R
H
 
R
I
x
F
G
x
A
D
 
S
P
 
E
H
 
Q
V
 
V
R
 
R
H
 
Q
M
 
V
G
 
A
T
|
T
I
 
I
G
 
G
G
|
G
S
x
N
I
 
I
A
|
A
N
 
N
N
 
G
D
 
S
P
 
P
A
 
I
A
x
G
D
|
D
Y
 
G
P
 
P
A
 
P
A
 
A
M
 
L
L
 
I
A
 
A
L
 
M
D
 
G
A
 
A
V
 
S
I
 
L
V
 
T
-
 
L
-
 
R
-
 
R
-
 
G
T
 
Q
D
 
E
R
 
R
R
 
R
E
 
R
V
 
M
K
 
P
A
 
L
E
 
E
D
 
D
F
 
F
F
 
F
T
 
L
G
 
E
L
 
Y
F
 
R
E
 
K
T
 
Q
A
 
D
L
x
R
E
 
R
D
 
P
G
 
G
E
 
E
I
 
F
V
|
V
T
 
E
A
 
S
V
 
V
R
 
T
F
 
L
-
 
P
-
 
K
E
 
S
A
 
A
P
 
P
A
 
G
K
 
L
A
 
R
A
 
C
Y
 
Y
-
 
K
-
 
L
-
 
S
Q
 
K
K
 
R
F
 
F
P
 
D
N
 
Q
P
 
D
A
 
I
S
 
S
R
 
-
Y
 
-
A
 
A
M
 
V
T
 
C
G
 
G
V
 
C
F
 
L
V
 
N
V
 
L
R
 
T
R
 
L
D
 
K
D
 
G
G
 
S
G
 
K
V
 
I
R
 
E
V
 
T
A
 
A
-
 
R
V
 
I
T
 
A
G
 
F
A
 
G
G
 
G
S
 
M
D
 
A
G
 
G
V
 
V
-
 
P
F
 
K
R
 
R
H
 
A
R
 
A
D
 
A
L
 
F
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
-
 
I
A
 
G
A
 
Q
N
 
D
W
 
F
S
 
R
P
 
E
G
 
D
A
 
T
V
 
I
A
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
L
N
 
P
V
 
L
Q
 
L
V
 
A
D
 
Q
D
 
D
S
 
F
D
 
T
L
 
P
L
 
L
S
 
S
D
 
D
I
 
M
H
 
R
A
 
A
S
 
S
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
R
 
R
A
 
M
N
 
N
L
 
A
V
 
A
K
 
Q
V
 
A
M
 
M
T
 
A
K
 
L
R
 
R
A
 
Y
V
 
V

Sites not aligning to the query:

2w54A Crystal structure of xanthine dehydrogenase from rhodobacter capsulatus in complex with bound inhibitor pterin-6-aldehyde (see paper)
32% identity, 66% coverage: 89:262/265 of query aligns to 249:435/450 of 2w54A

query
sites
2w54A
P
 
P
A
 
A
I
 
L
C
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
L
S
 
R
H
 
R
I
x
F
G
x
A
D
 
S
P
 
E
H
 
Q
V
 
V
R
 
R
H
 
Q
M
 
V
G
x
A
T
|
T
I
 
I
G
 
G
G
|
G
S
x
N
I
 
I
A
|
A
N
|
N
N
 
G
D
 
S
P
 
P
A
 
I
A
x
G
D
|
D
Y
 
G
P
 
P
A
 
P
A
 
A
M
 
L
L
 
I
A
 
A
L
 
M
D
 
G
A
 
A
V
 
S
I
 
L
V
 
T
-
 
L
-
 
R
-
 
R
-
 
G
T
 
Q
D
 
E
R
 
R
R
 
R
E
 
R
V
 
M
K
 
P
A
 
L
E
 
E
D
 
D
F
 
F
F
 
F
T
 
L
G
 
E
L
 
Y
F
 
R
E
 
K
T
 
Q
A
 
D
L
x
R
E
 
R
D
 
P
G
 
G
E
 
E
I
 
F
V
|
V
T
 
E
A
 
S
V
 
V
R
 
T
F
 
L
-
 
P
-
 
K
E
 
S
A
 
A
P
 
P
A
 
G
K
 
L
A
 
R
A
 
C
Y
 
Y
-
 
K
-
 
L
-
 
S
Q
 
K
K
 
R
F
 
F
P
 
D
N
x
Q
P
 
D
A
 
I
S
 
S
R
 
-
Y
 
-
A
 
A
M
 
V
T
 
C
G
 
G
V
 
C
F
 
L
V
 
N
V
 
L
R
 
T
R
 
L
D
 
K
D
 
G
G
 
S
G
 
K
V
 
I
R
 
E
V
 
T
A
 
A
-
 
R
V
 
I
T
 
A
G
 
F
A
 
G
G
 
G
S
 
M
D
 
A
G
 
G
V
 
V
-
 
P
F
 
K
R
 
R
H
 
A
R
 
A
D
 
A
L
 
F
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
-
 
I
A
 
G
A
 
Q
N
 
D
W
 
F
S
 
R
P
 
E
G
 
D
A
 
T
V
 
I
A
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
L
N
 
P
V
 
L
Q
 
L
V
 
A
D
 
Q
D
 
D
S
 
F
D
 
T
L
 
P
L
 
L
S
 
S
D
 
D
I
 
M
H
 
R
A
 
A
S
 
S
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
R
 
R
A
 
M
N
 
N
L
 
A
V
 
A
K
 
Q
V
 
A
M
 
M
T
 
A
K
 
L
R
 
R
A
 
Y
V
 
V

Sites not aligning to the query:

O33820 4-hydroxybenzoyl-CoA reductase subunit beta; 4-HBCR subunit beta; EC 1.1.7.1 from Thauera aromatica (see paper)
26% identity, 97% coverage: 7:262/265 of query aligns to 10:317/324 of O33820

query
sites
O33820
H
 
H
R
 
R
A
 
P
S
 
A
S
 
T
V
 
L
E
 
A
E
 
D
A
 
A
A
 
V
N
 
N
L
 
A
M
 
L
G
 
-
T
 
-
A
 
A
A
 
A
E
 
E
G
 
A
K
 
T
Y
 
L
-
x
P
L
|
L
S
x
G
G
x
A
G
|
G
M
x
T
T
x
D
L
|
L
I
 
L
P
 
P
T
 
N
M
 
L
K
 
R
Q
 
R
R
 
G
L
 
L
A
 
G
A
 
H
P
 
P
S
 
A
D
 
A
L
 
L
V
 
V
D
 
D
L
 
L
R
 
T
H
 
G
I
 
I
A
 
D
E
 
G
M
 
L
K
 
A
G
 
T
I
 
I
T
 
S
V
 
T
-
 
L
-
 
A
D
 
D
G
 
G
R
 
-
S
 
S
V
 
L
R
 
R
I
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
G
T
 
A
T
 
T
H
 
L
E
 
E
E
 
A
V
 
I
A
 
A
T
 
E
S
 
H
A
 
D
A
 
A
L
 
I
A
 
R
A
 
T
A
 
T
C
 
W
P
 
P
A
 
A
I
 
L
C
 
A
G
 
Q
L
 
A
A
 
A
S
 
E
H
 
S
I
 
V
G
 
A
D
 
G
P
 
P
H
 
T
V
 
H
R
 
R
H
 
A
M
 
A
G
 
A
T
|
T
I
 
L
G
 
G
G
 
G
S
x
N
I
 
L
A
 
C
N
x
Q
N
 
D
D
 
T
P
 
R
A
 
C
-
 
T
-
 
F
-
 
Y
-
 
N
-
 
Q
-
 
S
-
 
E
-
 
W
-
 
W
-
 
R
-
 
S
-
 
G
-
 
N
-
 
G
-
 
Y
-
 
C
-
 
L
-
 
K
-
 
Y
-
 
K
-
 
G
-
 
D
-
 
K
-
 
C
-
 
H
-
 
V
-
 
I
-
 
V
-
 
K
-
 
S
-
 
D
-
 
R
-
 
C
-
 
Y
-
 
A
-
 
T
-
 
Y
-
 
H
A
 
G
D
|
D
Y
 
V
P
 
A
A
 
P
A
 
A
M
 
L
L
 
M
A
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
A
-
 
R
-
 
A
-
 
E
-
 
I
V
 
V
I
 
G
V
 
P
T
 
A
D
 
G
R
 
K
R
 
R
E
 
T
V
 
V
K
 
P
A
 
V
E
 
A
D
 
Q
F
 
L
F
 
F
-
 
R
-
 
E
T
 
S
G
 
G
L
 
A
F
 
E
E
 
H
T
 
L
A
 
T
L
 
L
E
 
E
D
 
K
G
 
G
E
 
E
I
 
L
V
 
L
T
 
A
A
 
A
V
 
I
R
 
-
F
 
-
E
 
E
A
 
V
P
 
P
A
 
P
-
 
T
-
 
G
-
 
A
-
 
W
K
 
S
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
S
K
|
K
F
 
V
P
 
R
-
 
I
N
 
R
P
 
D
A
 
A
S
 
V
R
 
D
Y
 
F
A
 
P
M
 
L
T
 
A
G
 
G
V
 
V
F
 
A
V
 
A
V
 
A
R
 
L
R
 
Q
D
 
R
D
 
D
G
 
G
-
 
D
-
 
R
-
 
I
-
 
A
G
 
G
V
 
L
R
 
R
V
 
V
A
 
A
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
S
G
 
N
S
 
S
D
 
A
G
 
P
V
 
L
F
 
M
R
 
V
H
 
P
R
 
V
D
 
D
L
 
-
E
 
-
A
 
A
A
 
L
L
 
L
A
 
G
A
 
G
N
 
N
W
 
W
S
 
D
P
 
D
G
 
A
A
 
A
-
 
A
-
 
E
-
 
T
V
 
L
A
 
A
N
 
Q
V
 
L
Q
 
V
V
 
R
D
 
K
D
 
T
S
 
S
D
 
N
L
 
V
L
 
L
S
 
R
D
 
T
I
 
T
H
 
I
A
 
T
S
 
G
A
 
V
A
 
K
Y
 
Y
R
 
R
A
 
R
N
 
R
L
 
V
V
 
L
K
 
L
V
 
A
M
 
I
T
 
S
K
 
R
R
 
K
A
 
V
V
 
V

1rm6B Structure of 4-hydroxybenzoyl-coa reductase from thauera aromatica (see paper)
26% identity, 97% coverage: 7:262/265 of query aligns to 10:317/323 of 1rm6B

query
sites
1rm6B
H
 
H
R
 
R
A
 
P
S
 
A
S
 
T
V
 
L
E
 
A
E
 
D
A
 
A
A
 
V
N
 
N
L
 
A
M
 
L
G
 
-
T
 
-
A
 
A
A
 
A
E
 
E
G
 
A
K
 
T
Y
 
L
-
x
P
L
 
L
S
x
G
G
x
A
G
|
G
M
x
T
T
x
D
L
|
L
I
 
L
P
 
P
T
 
N
M
 
L
K
 
R
Q
 
R
R
 
G
L
 
L
A
 
G
A
 
H
P
 
P
S
 
A
D
 
A
L
 
L
V
 
V
D
 
D
L
|
L
R
 
T
H
 
G
I
 
I
A
 
D
E
 
G
M
 
L
K
 
A
G
 
T
I
 
I
T
 
S
V
 
T
-
 
L
-
 
A
D
 
D
G
 
G
R
 
-
S
 
S
V
 
L
R
 
R
I
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
G
T
 
A
T
 
T
H
 
L
E
 
E
E
 
A
V
 
I
A
 
A
T
 
E
S
 
H
A
 
D
A
 
A
L
 
I
A
 
R
A
 
T
A
 
T
C
 
W
P
 
P
A
 
A
I
 
L
C
 
A
G
 
Q
L
 
A
A
 
A
S
 
E
H
 
S
I
x
V
G
x
A
D
 
G
P
 
P
H
 
T
V
 
H
R
 
R
H
 
A
M
 
A
G
x
A
T
|
T
I
 
L
G
 
G
G
|
G
S
x
N
I
 
L
A
x
C
N
x
Q
N
 
D
D
 
T
P
 
R
A
x
C
-
 
T
-
x
F
-
 
Y
-
 
N
-
 
Q
-
 
S
-
 
E
-
 
W
-
 
W
-
 
R
-
 
S
-
 
G
-
 
N
-
 
G
-
 
Y
-
x
C
-
 
L
-
 
K
-
 
Y
-
 
K
-
 
G
-
 
D
-
 
K
-
x
C
-
x
H
-
x
V
-
 
I
-
 
V
-
 
K
-
 
S
-
 
D
-
 
R
-
x
C
-
x
Y
-
x
A
-
 
T
-
 
Y
-
 
H
A
 
G
D
|
D
Y
 
V
P
 
A
A
 
P
A
 
A
M
 
L
L
 
M
A
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
A
-
 
R
-
 
A
-
 
E
-
 
I
V
 
V
I
 
G
V
 
P
T
 
A
D
 
G
R
 
K
R
 
R
E
 
T
V
 
V
K
 
P
A
 
V
E
 
A
D
 
Q
F
 
L
F
 
F
-
 
R
-
 
E
T
 
S
G
 
G
L
 
A
F
 
E
E
 
H
T
 
L
A
 
T
L
 
L
E
 
E
D
 
K
G
 
G
E
 
E
I
 
L
V
x
L
T
 
A
A
 
A
V
 
I
R
 
-
F
 
-
E
 
E
A
 
V
P
 
P
A
 
P
-
 
T
-
 
G
-
 
A
-
 
W
K
 
S
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
S
K
 
K
F
 
V
P
 
R
-
 
I
N
 
R
P
 
D
A
 
A
S
x
V
R
x
D
Y
x
F
A
 
P
M
 
L
T
 
A
G
 
G
V
 
V
F
 
A
V
 
A
V
 
A
R
 
L
R
 
Q
D
 
R
D
 
D
G
 
G
-
 
D
-
 
R
-
 
I
-
 
A
G
 
G
V
 
L
R
 
R
V
 
V
A
 
A
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
S
G
 
N
S
 
S
D
 
A
G
 
P
V
 
L
F
 
M
R
 
V
H
 
P
R
 
V
D
 
D
L
 
-
E
 
-
A
 
A
A
 
L
L
 
L
A
 
G
A
 
G
N
 
N
W
 
W
S
 
D
P
 
D
G
 
A
A
 
A
-
 
A
-
 
E
-
 
T
V
 
L
A
 
A
N
 
Q
V
 
L
Q
 
V
V
 
R
D
 
K
D
 
T
S
 
S
D
 
N
L
 
V
L
 
L
S
 
R
D
 
T
I
 
T
H
 
I
A
 
T
S
 
G
A
 
V
A
 
K
Y
 
Y
R
 
R
A
 
R
N
 
R
L
 
V
V
 
L
K
 
L
V
 
A
M
 
I
T
 
S
K
 
R
R
 
K
A
 
V
V
 
V

5y6qB Crystal structure of an aldehyde oxidase from methylobacillus sp. Ky4400 (see paper)
25% identity, 66% coverage: 1:175/265 of query aligns to 1:227/330 of 5y6qB

query
sites
5y6qB
M
 
M
Y
 
N
E
 
P
T
 
F
N
 
H
Y
 
W
H
 
K
R
 
V
A
 
A
S
 
Q
S
 
S
V
 
A
E
 
S
E
 
E
A
 
A
A
 
A
N
 
A
L
 
L
M
 
K
G
 
Q
T
 
Q
A
 
S
A
 
G
E
 
-
G
 
S
K
 
Q
Y
x
I
L
 
L
S
x
A
G
|
G
G
|
G
M
x
T
T
|
T
L
x
Q
I
 
L
P
 
D
T
 
L
M
 
M
K
 
K
Q
 
C
R
 
G
L
 
V
A
 
F
A
 
N
P
 
P
S
 
P
D
 
Q
L
 
L
V
 
I
D
 
G
L
 
I
R
 
N
H
 
G
I
 
L
A
 
S
E
 
E
M
 
L
K
 
R
G
 
S
I
 
L
T
 
S
V
 
F
D
 
D
G
 
N
R
 
D
S
 
K
V
 
I
R
 
S
I
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
L
T
 
I
T
 
T
H
 
M
E
 
S
E
 
Q
V
 
L
A
 
A
T
 
D
S
 
H
A
 
P
A
 
D
L
 
C
A
 
Q
A
 
Q
A
 
H
C
 
A
P
 
P
A
 
A
I
 
I
C
 
Y
G
 
G
L
 
S
A
 
L
S
 
W
H
 
Q
I
x
A
G
x
A
D
 
S
P
 
P
H
 
Q
V
x
I
R
 
R
H
 
N
M
 
M
G
x
A
T
|
T
I
 
L
G
 
G
G
|
G
S
x
N
I
 
L
A
x
R
N
x
Q
-
 
R
-
 
T
-
 
R
-
x
C
-
 
A
-
 
Y
-
x
Y
N
 
R
D
 
D
P
 
P
A
 
A
-
 
T
-
 
F
-
 
S
-
 
A
-
x
C
-
x
N
-
 
K
-
 
R
-
 
N
-
 
P
-
 
G
-
 
S
-
 
G
-
x
C
-
 
A
-
x
A
-
 
R
-
 
Q
-
 
G
-
 
V
-
 
N
-
 
S
-
 
N
-
 
H
-
 
A
-
 
I
-
 
L
-
 
G
-
 
A
-
 
S
-
 
D
-
 
S
-
x
C
-
x
I
A
|
A
D
 
V
Y
 
Y
P
 
P
A
x
G
-
x
D
-
 
L
-
 
A
-
 
V
A
 
A
M
 
L
L
 
V
A
 
A
L
 
F
D
 
D
A
 
A
V
 
V
I
 
V
V
 
I
T
 
V
-
 
Q
-
 
N
-
 
P
-
 
Q
-
 
G
D
 
E
R
 
T
R
 
R
E
 
R
V
 
I
K
 
A
A
 
I
E
 
D
D
 
D
F
 
F
F
 
F
T
 
L
G
 
L
L
 
P
F
 
G
E
 
E
T
 
T
A
 
P
-
 
D
-
 
Q
-
 
E
-
 
H
-
 
D
L
 
L
E
 
R
D
 
D
G
 
D
E
 
E
I
|
I
V
x
I
T
 
V
A
 
A
V
 
I
R
 
-
F
 
-
E
 
E
A
 
V
P
 
P
A
 
Q
K
 
T
A
 
A
A
 
S
Y
 
L
Q
 
Q
K
 
R

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>SMc03103 SMc03103 carbon monoxide dehydrogenase medium subunit transmembrane protein
MYETNYHRASSVEEAANLMGTAAEGKYLSGGMTLIPTMKQRLAAPSDLVDLRHIAEMKGI
TVDGRSVRIGAATTHEEVATSAALAAACPAICGLASHIGDPHVRHMGTIGGSIANNDPAA
DYPAAMLALDAVIVTDRREVKAEDFFTGLFETALEDGEIVTAVRFEAPAKAAYQKFPNPA
SRYAMTGVFVVRRDDGGVRVAVTGAGSDGVFRHRDLEAALAANWSPGAVANVQVDDSDLL
SDIHASAAYRANLVKVMTKRAVAAA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory