SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing SMc03111 FitnessBrowser__Smeli:SMc03111 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 6 hits to proteins with known functional sites (download)

3wkiA Crystal structure of cellobiose 2-epimerase in complex with cellobiitol (see paper)
27% identity, 63% coverage: 16:260/387 of query aligns to 21:275/407 of 3wkiA

query
sites
3wkiA
L
 
L
N
 
T
D
 
E
A
 
N
A
 
I
L
 
L
P
 
K
L
 
F
W
 
W
R
 
A
Q
 
T
K
 
R
G
 
T
F
 
H
D
 
D
G
 
P
E
 
V
G
 
H
G
 
G
G
 
G
F
 
F
V
 
V
E
 
G
T
 
R
I
 
V
D
 
G
M
 
P
K
 
D
G
 
G
E
 
R
P
 
P
T
 
H
R
 
P
D
 
E
D
 
A
R
 
P
R
 
R
S
 
G
R
 
A
V
 
I
-
 
L
Q
 
N
P
 
A
R
|
R
Q
 
I
V
 
L
Y
 
W
C
 
T
F
 
F
A
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
Y
R
 
R
R
 
Q
G
 
L
W
 
G
D
 
T
G
 
P
D
 
L
W
 
Y
R
 
R
T
 
E
A
 
M
A
 
A
E
 
E
G
 
R
G
 
A
L
 
Y
L
 
R
Y
 
Y
F
 
F
D
 
V
R
 
R
-
 
H
-
 
F
V
 
V
Y
 
D
G
 
A
Q
 
E
P
 
H
G
 
G
G
 
G
F
 
V
Y
 
Y
G
 
W
A
 
M
L
 
V
A
 
A
N
 
-
A
 
A
D
 
D
G
 
G
K
 
R
L
 
P
I
 
L
D
 
D
A
 
T
S
 
R
F
 
K
D
 
H
L
 
V
Y
|
Y
N
 
A
Q
 
Q
A
 
S
F
 
F
A
 
A
L
 
I
L
 
Y
A
 
A
F
 
L
A
 
S
H
 
E
L
 
W
A
 
H
E
 
R
V
 
A
L
 
T
P
 
G
E
 
G
R
 
E
G
 
A
A
 
A
E
 
L
M
 
A
V
 
L
G
 
A
R
 
R
S
 
S
D
 
-
K
 
-
L
 
I
R
 
Y
R
 
D
Q
 
L
L
 
I
E
 
E
A
 
T
R
 
H
C
 
C
K
 
A
H
 
D
P
 
R
L
 
V
A
 
H
G
 
G
-
 
G
-
 
Y
-
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
C
-
 
D
-
 
R
-
 
A
-
 
W
-
 
R
-
 
P
-
 
L
-
 
E
-
 
D
-
 
A
-
 
R
F
 
L
E
x
S
E
 
A
D
 
K
D
|
D
P
 
A
P
 
P
R
 
E
L
 
-
P
 
P
L
 
R
G
 
S
S
 
M
N
|
N
P
 
T
H
 
H
M
 
L
H
|
H
L
 
V
F
 
L
E
 
E
A
 
A
C
 
Y
L
 
A
A
 
N
S
 
L
E
 
Y
E
 
R
V
 
V
E
 
-
G
 
-
F
 
W
D
 
P
R
 
E
V
 
T
A
 
E
W
 
L
A
 
A
N
 
A
L
 
R
A
 
L
D
 
Q
E
 
A
I
 
L
A
 
I
H
 
E
L
 
L
A
 
F
M
 
L
D
 
R
R
 
A
F
 
I
I
 
Y
D
 
H
A
 
P
E
 
A
S
 
T
G
 
G
A
 
H
L
 
L
R
 
I
E
 
L
F
 
F
F
 
F
D
 
D
H
 
E
D
 
R
W
 
W
A
 
R
P
 
P
F
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
K
 
R
G
 
S
R
 
R
I
 
A
V
 
V
E
 
S
P
 
F
G
 
G
H
|
H
L
 
D
F
 
I
E
|
E
W
 
A
A
 
S
W
 
W
L
 
L
L
 
L
L
 
L
R
 
E
W
 
A
A
 
V
E
 
D
R
 
V
R
 
L
G
 
G
N
 
Q
A
 
A

Sites not aligning to the query:

3wkhA Crystal structure of cellobiose 2-epimerase in complex with epilactose (see paper)
27% identity, 63% coverage: 16:260/387 of query aligns to 21:275/410 of 3wkhA

query
sites
3wkhA
L
 
L
N
 
T
D
 
E
A
 
N
A
 
I
L
 
L
P
 
K
L
 
F
W
 
W
R
 
A
Q
 
T
K
 
R
G
 
T
F
 
H
D
 
D
G
 
P
E
 
V
G
 
H
G
 
G
G
 
G
F
 
F
V
 
V
E
 
G
T
 
R
I
 
V
D
 
G
M
 
P
K
 
D
G
 
G
E
 
R
P
 
P
T
 
H
R
 
P
D
 
E
D
 
A
R
 
P
R
 
R
S
 
G
R
 
A
V
 
I
-
 
L
Q
 
N
P
 
A
R
|
R
Q
 
I
V
 
L
Y
 
W
C
 
T
F
 
F
A
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
Y
R
 
R
R
 
Q
G
 
L
W
 
G
D
 
T
G
 
P
D
 
L
W
 
Y
R
 
R
T
 
E
A
 
M
A
 
A
E
 
E
G
 
R
G
 
A
L
 
Y
L
 
R
Y
 
Y
F
 
F
D
 
V
R
 
R
-
 
H
-
 
F
V
 
V
Y
 
D
G
 
A
Q
 
E
P
 
H
G
 
G
G
 
G
F
 
V
Y
 
Y
G
 
W
A
 
M
L
 
V
A
 
A
N
 
-
A
 
A
D
 
D
G
 
G
K
 
R
L
 
P
I
 
L
D
 
D
A
 
T
S
 
R
F
 
K
D
 
H
L
 
V
Y
|
Y
N
 
A
Q
 
Q
A
 
S
F
 
F
A
 
A
L
 
I
L
 
Y
A
 
A
F
 
L
A
 
S
H
 
E
L
 
W
A
 
H
E
 
R
V
 
A
L
 
T
P
 
G
E
 
G
R
 
E
G
 
A
A
 
A
E
 
L
M
 
A
V
 
L
G
 
A
R
 
R
S
 
S
D
 
-
K
 
-
L
 
I
R
 
Y
R
 
D
Q
 
L
L
 
I
E
 
E
A
 
T
R
 
H
C
 
C
K
 
A
H
 
D
P
 
R
L
 
V
A
 
H
G
 
G
-
 
G
-
 
Y
-
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
C
-
 
D
-
 
R
-
 
A
-
 
W
-
 
R
-
 
P
-
 
L
-
 
E
-
 
D
-
 
A
-
 
R
F
 
L
E
x
S
E
 
A
D
 
K
D
|
D
P
 
A
P
 
P
R
 
E
L
 
-
P
 
P
L
 
R
G
 
S
S
 
M
N
|
N
P
 
T
H
 
H
M
 
L
H
|
H
L
 
V
F
 
L
E
 
E
A
 
A
C
 
Y
L
 
A
A
 
N
S
 
L
E
 
Y
E
 
R
V
 
V
E
 
-
G
 
-
F
 
W
D
 
P
R
 
E
V
 
T
A
 
E
W
 
L
A
 
A
N
 
A
L
 
R
A
 
L
D
 
Q
E
 
A
I
 
L
A
 
I
H
 
E
L
 
L
A
 
F
M
 
L
D
 
R
R
 
A
F
 
I
I
 
Y
D
 
H
A
 
P
E
 
A
S
 
T
G
 
G
A
 
H
L
 
L
R
 
I
E
 
L
F
 
F
F
 
F
D
 
D
H
 
E
D
 
R
W
 
W
A
 
R
P
 
P
F
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
K
 
R
G
 
S
R
 
R
I
 
A
V
 
V
E
 
S
P
 
F
G
 
G
H
|
H
L
 
D
F
 
I
E
 
E
W
 
A
A
 
S
W
 
W
L
 
L
L
 
L
L
 
L
R
 
E
W
 
A
A
 
V
E
 
D
R
 
V
R
 
L
G
 
G
N
 
Q
A
 
A

Sites not aligning to the query:

3wkgA Crystal structure of cellobiose 2-epimerase in complex with glucosylmannose (see paper)
27% identity, 63% coverage: 16:260/387 of query aligns to 21:275/410 of 3wkgA

query
sites
3wkgA
L
 
L
N
 
T
D
 
E
A
 
N
A
 
I
L
 
L
P
 
K
L
 
F
W
 
W
R
 
A
Q
 
T
K
 
R
G
 
T
F
 
H
D
 
D
G
 
P
E
 
V
G
 
H
G
 
G
G
 
G
F
 
F
V
 
V
E
 
G
T
 
R
I
 
V
D
 
G
M
 
P
K
 
D
G
 
G
E
 
R
P
 
P
T
 
H
R
 
P
D
 
E
D
 
A
R
 
P
R
 
R
S
 
G
R
 
A
V
 
I
-
 
L
Q
 
N
P
 
A
R
|
R
Q
 
I
V
 
L
Y
 
W
C
 
T
F
 
F
A
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
Y
R
 
R
R
 
Q
G
 
L
W
 
G
D
 
T
G
 
P
D
 
L
W
 
Y
R
 
R
T
 
E
A
 
M
A
 
A
E
 
E
G
 
R
G
 
A
L
 
Y
L
 
R
Y
 
Y
F
 
F
D
 
V
R
 
R
-
 
H
-
 
F
V
 
V
Y
 
D
G
 
A
Q
 
E
P
 
H
G
 
G
G
 
G
F
 
V
Y
 
Y
G
 
W
A
 
M
L
 
V
A
 
A
N
 
-
A
 
A
D
 
D
G
 
G
K
 
R
L
 
P
I
 
L
D
 
D
A
 
T
S
 
R
F
 
K
D
 
H
L
 
V
Y
|
Y
N
 
A
Q
 
Q
A
 
S
F
 
F
A
 
A
L
 
I
L
 
Y
A
 
A
F
 
L
A
 
S
H
 
E
L
 
W
A
 
H
E
 
R
V
 
A
L
 
T
P
 
G
E
 
G
R
 
E
G
 
A
A
 
A
E
 
L
M
 
A
V
 
L
G
 
A
R
 
R
S
 
S
D
 
-
K
 
-
L
 
I
R
 
Y
R
 
D
Q
 
L
L
 
I
E
 
E
A
 
T
R
 
H
C
 
C
K
 
A
H
 
D
P
 
R
L
 
V
A
 
H
G
 
G
-
 
G
-
 
Y
-
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
C
-
 
D
-
 
R
-
 
A
-
 
W
-
 
R
-
 
P
-
 
L
-
 
E
-
 
D
-
 
A
-
 
R
F
 
L
E
x
S
E
 
A
D
 
K
D
|
D
P
 
A
P
 
P
R
 
E
L
 
-
P
 
P
L
 
R
G
 
S
S
 
M
N
|
N
P
 
T
H
 
H
M
 
L
H
|
H
L
 
V
F
 
L
E
 
E
A
 
A
C
 
Y
L
 
A
A
 
N
S
 
L
E
 
Y
E
 
R
V
 
V
E
 
-
G
 
-
F
 
W
D
 
P
R
 
E
V
 
T
A
 
E
W
 
L
A
 
A
N
 
A
L
 
R
A
 
L
D
 
Q
E
 
A
I
 
L
A
 
I
H
 
E
L
 
L
A
 
F
M
 
L
D
 
R
R
 
A
F
 
I
I
 
Y
D
 
H
A
 
P
E
 
A
S
 
T
G
 
G
A
 
H
L
 
L
R
 
I
E
 
L
F
 
F
F
 
F
D
 
D
H
 
E
D
 
R
W
 
W
A
 
R
P
 
P
F
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
K
 
R
G
 
S
R
 
R
I
 
A
V
 
V
E
 
S
P
 
F
G
 
G
H
|
H
L
 
D
F
 
I
E
 
E
W
 
A
A
 
S
W
 
W
L
 
L
L
 
L
L
 
L
R
 
E
W
 
A
A
 
V
E
 
D
R
 
V
R
 
L
G
 
G
N
 
Q
A
 
A

Sites not aligning to the query:

8h1lB Crystal structure of glucose-2-epimerase in complex with d-glucitol from runella slithyformis runsl_4512 (see paper)
24% identity, 63% coverage: 11:252/387 of query aligns to 12:283/423 of 8h1lB

query
sites
8h1lB
E
 
E
L
 
I
A
 
E
G
 
T
W
 
Y
L
 
L
N
 
N
D
 
T
A
 
G
A
 
L
L
 
L
P
 
P
L
 
F
W
 
W
R
 
I
Q
 
T
K
 
R
G
 
T
F
 
V
D
 
D
G
 
K
E
 
E
G
 
N
G
 
G
G
 
G
F
 
F
V
 
L
E
 
T
T
 
H
I
 
F
D
 
D
M
 
Q
K
 
F
G
 
G
E
 
N
P
 
D
T
 
S
R
 
G
D
 
E
D
 
D
R
 
E
R
 
K
S
 
S
R
 
L
V
 
I
-
 
A
Q
 
Q
P
 
S
R
|
R
Q
 
S
V
 
V
Y
 
F
C
 
T
F
 
Y
A
 
S
A
 
S
A
 
A
G
 
H
R
 
R
R
 
A
G
 
G
W
 
Y
D
 
G
G
 
G
D
 
G
W
 
V
-
 
L
-
 
A
R
 
E
T
 
M
A
 
A
A
 
R
E
 
H
G
 
G
G
 
V
L
 
D
L
 
Y
Y
 
L
F
 
I
D
 
N
R
 
N
V
 
M
Y
 
W
-
 
D
G
 
N
Q
 
E
P
 
H
G
 
G
G
 
G
F
 
F
Y
 
Y
G
 
-
A
 
W
L
 
M
A
 
T
N
 
N
A
 
R
D
 
K
G
 
G
K
 
E
L
 
V
I
 
T
D
 
I
A
 
D
S
 
Q
F
 
K
D
 
I
L
 
V
Y
|
Y
N
 
G
Q
 
L
A
 
S
F
 
F
A
 
C
L
 
I
L
 
Y
A
 
S
F
 
L
A
 
S
H
 
E
L
 
Y
A
 
T
E
 
L
V
 
A
L
 
T
P
 
G
E
 
D
-
 
P
R
 
R
G
 
G
A
 
R
E
 
E
M
 
Y
V
 
A
G
 
E
R
 
K
S
 
T
D
 
F
K
 
D
L
 
L
R
 
L
R
 
Q
Q
 
K
L
 
Y
E
 
A
A
 
V
R
 
D
C
 
T
K
 
H
H
 
Y
P
 
G
-
 
G
-
 
Y
L
 
F
A
 
E
G
 
M
F
 
F
E
 
N
E
 
R
D
 
D
D
 
W
P
 
T
P
 
L
R
 
K
L
 
G
P
 
P
L
 
G
G
 
A
S
 
A
-
 
G
-
 
G
-
 
D
-
 
R
-
 
K
-
 
T
-
 
L
N
x
D
P
 
V
H
 
H
M
 
M
H
|
H
L
 
L
F
 
M
E
 
E
A
 
A
C
 
Y
L
 
T
A
 
T
S
 
L
E
 
Y
E
 
E
V
 
C
E
 
T
G
 
G
F
 
-
D
 
Q
R
 
E
V
 
I
A
 
H
W
 
R
A
 
R
N
 
K
L
 
L
A
 
L
D
 
E
E
 
T
I
 
I
A
 
E
H
 
-
L
 
L
A
 
L
M
 
V
D
 
N
R
 
K
F
 
V
I
 
M
D
 
H
A
 
P
E
 
E
S
 
Y
G
 
G
A
 
T
L
 
G
R
 
I
E
 
P
F
 
Q
F
 
F
D
 
W
H
 
A
D
 
D
W
 
W
A
 
S
P
 
V
F
 
A
P
 
P
G
 
Q
E
 
I
K
 
K
G
 
F
R
 
D
I
 
I
V
 
V
-
 
W
-
 
G
-
 
W
-
 
D
-
 
R
-
 
F
-
 
N
-
 
P
-
 
D
-
 
G
-
 
L
-
 
K
-
 
S
-
 
A
-
 
A
-
 
E
-
 
D
-
 
N
-
 
T
E
 
S
P
 
Y
G
 
G
H
|
H
L
 
N
F
 
S
E
|
E
W
 
F
A
 
A
W
 
W
L
 
L
L
 
L
L
 
M
R
 
H

Sites not aligning to the query:

P51606 N-acylglucosamine 2-epimerase; AGE; GlcNAc 2-epimerase; N-acetyl-D-glucosamine 2-epimerase; Renin-binding protein; RnBP; EC 5.1.3.8 from Homo sapiens (Human) (see paper)
25% identity, 63% coverage: 18:261/387 of query aligns to 30:277/427 of P51606

query
sites
P51606
D
 
D
A
 
R
A
 
V
L
 
V
P
 
A
L
 
F
W
 
W
R
 
M
Q
 
E
K
 
H
G
 
S
F
 
H
D
 
D
G
 
Q
E
 
E
G
 
H
G
 
G
G
 
G
F
 
F
V
 
F
E
 
T
T
x
C
I
 
L
D
 
G
M
 
R
K
 
E
G
 
G
E
 
R
P
 
V
T
 
Y
R
 
D
D
 
D
D
 
L
R
 
K
R
 
Y
S
 
V
R
 
W
V
 
L
Q
 
Q
P
 
G
R
 
R
Q
 
Q
V
 
V
Y
 
W
C
 
M
F
 
Y
A
x
C
A
 
R
A
 
L
G
 
Y
R
 
R
-
 
T
-
 
F
-
 
E
R
 
R
G
 
F
W
 
R
D
 
H
G
 
A
D
 
Q
W
 
L
R
 
L
T
 
D
A
 
A
A
 
A
E
 
K
G
 
A
G
 
G
-
 
G
-
 
E
-
 
F
L
 
L
L
 
L
Y
 
R
F
 
Y
D
 
A
R
 
R
V
 
V
Y
 
-
G
 
A
Q
 
P
P
 
P
G
 
G
G
 
K
F
 
K
Y
x
C
G
 
A
A
 
F
L
 
V
A
 
L
N
 
T
A
 
R
D
 
D
G
 
G
K
 
R
L
 
P
I
 
V
D
 
K
A
 
V
S
 
Q
F
 
R
D
 
T
L
 
I
Y
 
F
N
 
S
Q
 
E
A
x
C
F
 
F
A
 
Y
L
 
T
L
 
M
A
 
A
F
 
M
A
 
N
H
 
E
L
 
L
A
 
W
E
 
R
V
 
A
L
 
T
P
 
G
E
 
E
-
 
V
-
 
R
R
 
Y
G
 
Q
A
 
T
E
 
E
M
 
A
V
 
V
G
 
E
R
 
M
S
 
M
D
 
D
K
 
Q
L
 
I
R
 
V
R
 
H
Q
 
W
L
 
V
E
 
Q
A
 
E
R
 
D
C
 
A
-
 
S
-
 
G
-
 
L
-
 
G
K
 
R
H
 
P
P
 
Q
L
 
L
A
 
Q
G
 
G
F
 
A
E
 
P
E
 
A
D
 
A
D
 
E
P
 
P
P
 
M
R
 
A
L
 
V
P
 
P
L
 
M
G
 
M
S
 
L
N
 
-
P
 
-
H
 
-
M
 
L
H
 
N
L
 
L
F
 
V
E
 
E
A
 
Q
C
 
L
-
 
G
L
 
E
A
 
A
S
 
D
E
 
E
E
 
E
V
 
L
E
 
A
G
 
G
F
 
-
D
 
-
R
 
-
V
 
-
A
 
K
W
 
Y
A
 
A
N
 
E
L
 
L
A
 
G
D
 
D
E
 
W
I
x
C
A
 
A
H
 
R
L
 
R
A
 
I
M
 
L
D
 
Q
R
 
H
F
 
-
I
 
V
D
 
Q
A
 
R
E
 
D
S
 
G
G
 
Q
A
 
A
L
 
V
R
 
L
E
 
E
F
 
N
F
 
V
D
 
S
H
 
E
D
 
G
W
 
G
A
 
K
P
 
E
F
 
L
P
 
P
G
 
G
E
x
C
K
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
Q
V
 
Q
E
 
N
P
 
P
G
 
G
H
 
H
L
 
T
F
 
L
E
 
E
W
 
A
A
 
G
W
 
W
L
 
F
L
 
L
L
 
L
R
 
R
W
 
H
A
 
C
E
 
I
R
 
R
R
 
K
G
 
G
N
 
D
A
 
P
Q
 
E

Sites not aligning to the query:

P17560 N-acylglucosamine 2-epimerase; AGE; GlcNAc 2-epimerase; N-acetyl-D-glucosamine 2-epimerase; Renin-binding protein; RnBP; EC 5.1.3.8 from Sus scrofa (Pig) (see paper)
22% identity, 76% coverage: 18:313/387 of query aligns to 20:324/402 of P17560

query
sites
P17560
D
 
D
A
 
R
A
 
V
L
 
M
P
 
A
L
 
F
W
 
W
R
 
L
Q
 
E
K
 
H
G
 
S
F
 
H
D
 
D
G
 
R
E
 
E
G
 
H
G
 
G
G
 
G
F
 
F
V
 
F
E
 
T
T
 
C
I
 
L
D
 
G
M
 
R
K
 
D
G
 
G
E
 
R
P
 
V
T
 
Y
R
 
D
D
 
D
D
 
L
R
 
K
R
 
Y
S
 
V
R
 
W
V
 
L
Q
 
Q
P
 
G
R
 
R
Q
 
Q
V
 
V
Y
 
W
C
 
M
F
 
Y
A
 
C
A
 
R
A
 
L
G
 
Y
R
 
R
-
 
K
-
 
L
-
 
E
R
 
R
G
 
F
W
 
H
D
 
R
G
 
P
D
 
E
W
 
L
R
 
L
T
 
D
A
 
A
A
 
A
E
 
K
G
 
A
G
 
G
-
 
G
-
 
E
-
 
F
L
 
L
L
 
L
Y
 
R
F
 
H
D
 
A
R
 
R
V
 
V
Y
 
-
G
 
A
Q
 
P
P
 
P
G
 
E
G
 
K
F
 
K
Y
 
C
G
 
A
A
 
F
L
 
V
A
 
L
N
 
T
A
 
R
D
 
D
G
 
G
K
 
R
L
 
P
I
 
V
D
 
K
A
 
V
S
 
Q
F
 
R
D
 
S
L
 
I
Y
 
F
N
 
S
Q
 
E
A
 
C
F
 
F
A
 
Y
L
 
T
L
 
M
A
 
A
F
 
M
A
 
N
H
 
E
L
 
L
A
 
W
E
 
R
V
 
V
L
 
T
P
 
A
E
 
E
R
 
-
G
 
-
A
 
A
E
 
R
M
 
Y
V
 
Q
G
 
S
R
 
E
S
 
A
D
 
V
K
 
D
L
 
M
R
 
M
R
 
D
Q
 
Q
L
 
I
E
 
V
A
 
H
R
 
W
C
 
V
K
 
R
H
 
E
P
 
D
L
 
P
A
 
S
G
 
G
F
 
L
E
 
G
E
 
R
D
 
P
D
 
Q
P
 
L
P
 
P
R
 
G
L
 
A
P
 
V
L
 
A
G
 
S
S
 
E
N
 
S
P
 
M
H
 
A
M
 
V
H
 
P
L
 
M
F
 
M
E
x
L
A
 
L
C
 
C
L
 
L
A
 
V
S
 
E
E
 
Q
E
x
L
V
 
G
E
 
E
G
 
E
F
 
D
D
 
E
R
 
E
V
 
L
A
 
A
-
 
G
-
 
R
W
 
Y
A
 
A
N
 
Q
L
 
L
A
 
G
D
 
H
E
 
W
I
 
C
A
 
A
H
 
R
L
 
R
A
 
I
M
 
L
D
 
Q
R
 
H
F
 
-
I
 
V
D
 
Q
A
 
R
E
 
D
S
 
G
G
 
Q
A
 
A
L
 
V
R
 
L
E
 
E
F
 
N
F
 
V
D
 
S
H
 
E
D
 
D
W
 
G
A
 
E
P
 
E
F
 
L
P
 
S
G
 
G
E
 
C
K
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
H
V
 
Q
E
 
N
P
 
P
G
 
G
H
 
H
L
 
A
F
 
L
E
 
E
W
 
A
A
 
G
W
 
W
L
 
F
L
 
L
L
 
L
R
 
R
W
 
H
A
 
S
E
 
S
R
 
R
R
 
S
G
 
G
N
 
D
A
 
A
Q
 
K
-
 
L
-
 
R
-
 
A
-
 
H
-
 
V
-
 
I
-
 
D
-
 
T
-
 
F
A
 
L
I
 
L
V
 
L
K
 
P
A
 
F
R
 
R
R
 
S
-
 
G
-
 
W
-
 
D
-
 
A
-
 
D
-
 
H
-
 
G
-
 
G
L
 
L
F
 
F
E
 
Y
I
 
F
G
 
Q
E
 
D
K
 
A
D
 
D
G
 
G
T
 
L
C
 
C
P
 
P
D
 
T
R
 
Q
D
 
L
V
 
E
V
 
W
V
 
A
M
 
M
T
 
K
L
 
L
F
 
W
D
 
-
D
 
-
F
 
-
S
 
-
V
 
-
A
 
-
D
 
-
P
 
-
T
 
-
A
 
-
R
 
-
L
 
-
W
 
W
P
 
P
Q
 
H
T
 
S
E
 
E
W
 
A
L
 
M
K
 
I
A
 
A
A
 
F
I
 
L

Query Sequence

>SMc03111 FitnessBrowser__Smeli:SMc03111
MGMDIHLQAGELAGWLNDAALPLWRQKGFDGEGGGFVETIDMKGEPTRDDRRSRVQPRQV
YCFAAAGRRGWDGDWRTAAEGGLLYFDRVYGQPGGFYGALANADGKLIDASFDLYNQAFA
LLAFAHLAEVLPERGAEMVGRSDKLRRQLEARCKHPLAGFEEDDPPRLPLGSNPHMHLFE
ACLASEEVEGFDRVAWANLADEIAHLAMDRFIDAESGALREFFDHDWAPFPGEKGRIVEP
GHLFEWAWLLLRWAERRGNAQAIVKARRLFEIGEKDGTCPDRDVVVMTLFDDFSVADPTA
RLWPQTEWLKAAIRFAALTEGAERERYLASAGRAAAALQRFLNVPVRGLWRDKQKADGSF
VEEPAPASTFYHILCAIYELEDCLKRM

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory