SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing SMc04129 FitnessBrowser__Smeli:SMc04129 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3q2kC Crystal structure of the wlba dehydrogenase from bordetella pertussis in complex with nadh and udp-glcnaca (see paper)
33% identity, 48% coverage: 1:209/433 of query aligns to 3:206/347 of 3q2kC

query
sites
3q2kC
M
 
I
M
 
T
D
 
D
N
 
R
K
 
K
R
 
I
R
 
R
F
 
F
A
 
G
L
 
L
V
 
V
G
 
G
T
 
C
G
|
G
N
x
R
R
x
I
G
 
S
T
 
K
T
 
N
M
 
H
W
 
I
G
 
G
R
 
A
D
 
I
L
 
A
L
 
Q
A
 
H
G
 
G
W
 
D
R
 
R
G
 
A
L
 
-
V
 
-
D
 
E
L
 
L
V
 
V
A
 
E
I
 
I
A
 
C
D
|
D
T
|
T
N
 
N
-
 
P
-
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
A
 
A
E
 
A
R
 
E
A
 
A
R
 
-
T
 
-
M
 
-
I
 
-
A
 
A
T
 
T
N
 
G
A
 
A
P
 
R
V
 
P
Y
 
F
G
 
S
N
 
S
V
 
L
D
 
S
A
 
D
M
 
M
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
T
 
G
R
 
N
P
 
A
D
 
D
L
 
A
V
 
L
I
 
V
V
 
L
C
x
A
T
|
T
P
 
P
D
x
S
D
 
G
T
 
L
H
|
H
D
 
P
D
 
W
I
x
Q
V
 
A
V
 
I
R
 
E
A
 
V
L
 
A
E
 
Q
S
 
A
G
 
G
A
 
R
D
 
H
V
 
V
I
 
V
T
 
S
E
|
E
K
|
K
P
 
P
M
 
M
S
 
A
T
 
T
T
 
R
V
 
W
E
 
E
K
 
D
I
 
G
R
 
K
R
 
R
I
 
M
L
 
V
D
 
K
A
 
A
E
 
C
K
 
D
R
 
E
T
 
A
G
 
G
R
 
V
R
 
R
V
 
L
D
 
F
V
 
V
S
 
V
F
 
K
N
x
Q
Y
 
N
R
 
R
F
 
R
A
 
N
P
 
A
T
 
T
A
 
L
A
 
Q
R
 
L
I
 
V
K
 
K
E
 
K
L
 
A
L
 
I
N
 
E
A
 
Q
G
 
G
E
 
R
I
 
F
G
 
G
R
 
R
V
 
I
-
 
Y
-
 
M
T
 
V
S
 
T
V
 
V
D
 
N
F
 
V
H
 
F
W
|
W
Y
 
-
L
 
-
D
 
-
T
|
T
R
|
R
H
 
P
G
 
Q
A
 
E
D
x
Y
Y
 
Y
-
 
D
F
 
A
R
 
A
R
 
R
W
|
W
H
x
R
A
 
G
Y
 
K
A
 
W
E
 
E
H
 
W
S
 
D
G
 
G
S
 
G
L
 
A
F
 
F
V
 
M
H
x
N
K
x
Q
A
 
A
T
 
S
H
|
H
H
 
Y
F
 
V
D
 
D
L
 
L
L
 
L
N
 
D
W
 
W
Y
 
-
L
 
L
D
 
V
S
 
G
D
 
P
P
 
V
E
 
E
A
 
S
V
 
V
S
 
Y
A
 
A
F
 
Y

Sites not aligning to the query:

3q2kK Crystal structure of the wlba dehydrogenase from bordetella pertussis in complex with nadh and udp-glcnaca (see paper)
33% identity, 47% coverage: 5:209/433 of query aligns to 2:201/322 of 3q2kK

query
sites
3q2kK
K
 
K
R
 
I
R
 
R
F
 
F
A
 
G
L
 
L
V
 
V
G
|
G
T
 
C
G
|
G
N
x
R
R
x
I
G
 
S
T
 
K
T
 
N
M
 
H
W
 
I
G
 
G
R
 
A
D
 
I
L
 
A
L
 
Q
A
 
H
G
 
G
W
 
D
R
 
R
G
 
-
L
 
-
V
 
A
D
 
E
L
 
L
V
 
V
A
 
E
I
 
I
A
 
C
D
|
D
T
|
T
N
 
N
-
 
P
-
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
A
 
A
E
 
A
R
 
E
A
 
A
R
 
-
T
 
-
M
 
-
I
 
-
A
 
A
T
 
T
N
 
G
A
 
A
P
 
R
V
 
P
Y
 
F
G
 
S
N
 
S
V
 
L
D
 
S
A
 
D
M
 
M
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
T
 
G
R
 
N
P
 
A
D
 
D
L
 
A
V
 
L
I
 
V
V
 
L
C
 
A
T
|
T
P
|
P
D
x
S
D
 
G
T
x
L
H
|
H
D
 
P
D
 
W
I
 
Q
V
 
A
V
 
I
R
 
E
A
 
V
L
 
A
E
 
Q
S
 
A
G
 
G
A
 
R
D
 
H
V
 
V
I
 
V
T
 
S
E
|
E
K
|
K
P
 
P
M
 
M
S
 
A
T
 
T
T
 
R
V
 
W
E
 
E
K
 
D
I
 
G
R
 
K
R
 
R
I
 
M
L
 
V
D
 
K
A
 
A
E
 
C
K
 
D
R
 
E
T
 
A
G
 
G
R
 
V
R
 
R
V
 
L
D
 
F
V
 
V
S
 
V
F
 
K
N
x
Q
Y
 
N
R
 
R
F
 
R
A
 
N
P
 
A
T
 
T
A
 
L
A
 
Q
R
 
L
I
 
V
K
 
K
E
 
K
L
 
A
L
 
I
N
 
E
A
 
Q
G
 
G
E
 
R
I
 
F
G
 
G
R
 
R
V
 
I
-
 
Y
-
 
M
T
 
V
S
 
T
V
 
V
D
 
N
F
 
V
H
 
F
W
 
W
Y
 
-
L
 
-
D
 
-
T
|
T
R
|
R
H
 
P
G
 
Q
A
 
E
D
x
Y
Y
 
Y
-
 
D
F
 
A
R
 
A
R
 
R
W
|
W
H
x
R
A
 
G
Y
 
K
A
 
W
E
 
E
H
 
W
S
 
D
G
 
G
S
 
G
L
 
A
F
 
F
V
 
M
H
x
N
K
x
Q
A
 
A
T
 
S
H
|
H
H
 
Y
F
 
V
D
 
D
L
 
L
L
 
L
N
 
D
W
 
W
Y
 
-
L
 
L
D
 
V
S
 
G
D
 
P
P
 
V
E
 
E
A
 
S
V
 
V
S
 
Y
A
 
A
F
 
Y

Sites not aligning to the query:

3e18A Crystal structure of NAD-binding protein from listeria innocua
31% identity, 38% coverage: 44:208/433 of query aligns to 36:196/348 of 3e18A

query
sites
3e18A
L
x
I
R
 
L
A
 
A
E
 
E
R
x
K
A
 
R
R
 
E
T
 
A
M
 
A
I
 
A
A
 
Q
T
 
K
N
 
G
A
 
L
P
 
K
V
 
I
Y
 
Y
G
 
E
N
 
S
V
 
Y
D
 
E
A
 
A
M
 
V
L
 
L
A
 
A
E
 
D
T
 
E
R
 
K
P
 
V
D
 
D
L
 
A
V
 
V
I
 
L
V
 
I
C
x
A
T
|
T
P
|
P
D
x
N
D
 
D
T
 
S
H
|
H
D
 
K
D
 
E
I
 
L
V
 
A
V
 
I
R
 
S
A
 
A
L
 
L
E
 
E
S
 
A
G
 
G
A
 
K
D
 
H
V
 
V
I
 
V
T
 
C
E
|
E
K
|
K
P
 
P
M
 
V
S
 
T
T
 
M
T
 
T
V
 
S
E
 
E
K
 
D
I
 
L
R
 
L
R
 
A
I
 
I
L
 
M
D
 
D
A
 
V
E
 
A
K
 
K
R
 
R
T
 
V
G
 
N
R
 
K
R
 
H
V
 
F
D
 
M
V
 
V
S
 
H
F
 
Q
N
|
N
Y
 
R
R
 
R
F
 
W
A
 
D
P
 
E
T
 
D
A
 
F
A
 
L
R
 
I
I
 
I
K
 
K
E
 
E
L
 
M
L
 
F
N
 
E
A
 
Q
G
 
K
E
 
T
I
 
I
G
 
G
R
 
E
V
 
M
T
 
-
S
 
-
V
 
-
D
 
-
F
 
F
H
 
H
W
 
-
Y
 
-
L
 
L
D
 
E
T
 
S
R
 
R
-
 
V
H
 
H
G
 
G
A
 
A
D
 
N
Y
 
G
F
 
I
-
 
P
R
 
G
R
 
D
W
|
W
H
x
R
A
 
H
Y
 
L
A
 
K
E
 
A
H
 
H
S
 
G
G
 
G
S
 
G
L
 
M
F
 
V
V
 
L
H
 
D
K
 
W
A
 
G
T
 
V
H
|
H
H
 
L
F
 
L
D
 
D
L
 
Q
L
 
L
N
 
L
W
 
F
Y
 
L
L
 
V
D
 
D
S
 
S
D
 
N
P
 
V
E
 
K
A
 
S
V
 
V
S
 
S
A
 
A

Sites not aligning to the query:

7xr9A Crystal structure of dgpa with glucose (see paper)
28% identity, 43% coverage: 39:224/433 of query aligns to 28:216/344 of 7xr9A

query
sites
7xr9A
A
 
A
D
 
D
T
 
L
N
 
N
A
 
E
L
 
I
R
 
V
A
 
A
E
 
E
R
 
K
A
 
A
R
 
A
T
 
A
M
 
E
I
 
F
A
 
G
T
 
E
N
 
G
A
 
A
P
 
Q
V
 
V
Y
 
T
G
 
A
N
x
D
V
x
Y
D
 
K
A
 
E
M
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
N
T
 
P
R
 
E
P
 
V
D
 
E
L
 
V
V
 
V
I
 
H
V
 
V
C
|
C
T
|
T
P
|
P
D
 
N
D
 
V
T
 
S
H
|
H
D
 
S
D
 
E
I
 
I
V
 
T
V
 
I
R
 
A
A
 
A
L
 
F
E
 
E
S
 
A
G
 
G
A
 
K
D
 
H
V
 
V
I
 
Y
T
 
C
E
|
E
K
|
K
P
|
P
M
 
M
S
 
S
T
 
H
T
 
S
V
 
T
E
 
E
K
 
E
I
 
A
R
 
E
R
 
K
I
 
M
L
 
V
D
 
E
A
 
A
E
 
W
K
 
K
R
 
K
T
 
S
G
 
G
R
 
K
R
 
Q
V
 
F
D
 
T
V
 
I
S
 
G
F
 
Y
N
x
Q
Y
 
N
R
 
R
F
 
F
A
 
R
P
 
E
T
 
E
A
 
V
A
 
M
R
 
N
I
 
L
K
 
K
E
 
K
L
 
S
L
 
C
N
 
D
A
 
K
G
 
G
E
 
E
I
 
L
G
 
G
R
 
E
V
 
I
T
 
-
S
 
-
V
 
-
D
 
-
F
 
-
H
 
-
W
 
-
Y
 
Y
L
 
Y
D
 
G
T
 
K
R
 
A
H
 
H
G
 
A
A
 
-
D
 
-
Y
 
-
F
 
V
R
|
R
R
 
R
-
 
R
-
 
A
-
 
V
-
 
P
-
 
T
W
|
W
H
 
G
A
x
V
Y
x
F
A
 
M
E
 
D
-
 
K
-
 
E
-
 
A
H
x
Q
S
 
G
G
 
G
S
 
G
L
 
P
F
 
L
V
 
I
H
x
D
K
 
I
A
 
G
T
 
T
H
|
H
H
 
A
F
 
L
D
 
D
L
 
I
L
 
T
N
 
L
W
 
W
Y
 
C
L
 
M
-
 
N
-
 
N
-
 
Y
D
 
D
S
 
V
D
 
D
P
 
S
E
 
V
A
 
T
V
 
G
S
 
S
A
 
V
F
 
F
A
 
Y
D
 
K
L
 
L
-
 
G
-
 
Q
Q
 
K
M
 
E
Y
 
N
G
 
G
R
 
P
R
 
E
G
 
G
P
 
N
F
 
L
R
 
F
G
 
G
P
 
P

Sites not aligning to the query:

3ec7A Crystal structure of putative dehydrogenase from salmonella typhimurium lt2
26% identity, 47% coverage: 7:209/433 of query aligns to 4:195/336 of 3ec7A

query
sites
3ec7A
R
 
K
F
 
A
A
 
G
L
 
I
V
 
V
G
 
G
T
 
I
G
|
G
N
x
M
R
x
I
G
 
G
T
 
S
T
 
D
M
 
H
W
 
L
G
 
R
R
 
R
D
 
-
L
 
-
L
 
L
A
 
A
G
 
N
W
 
T
R
 
V
G
 
S
L
 
G
V
 
V
D
 
E
L
 
V
V
 
V
A
 
A
I
 
V
A
 
C
D
|
D
T
x
I
N
 
V
A
 
A
L
 
G
R
|
R
A
 
A
E
 
Q
R
 
A
A
 
A
R
 
L
T
 
D
M
 
K
I
 
Y
A
 
A
T
 
I
N
 
E
A
 
A
P
 
K
V
 
D
Y
 
Y
G
 
N
N
 
D
V
 
Y
D
 
H
A
 
D
M
 
L
L
 
I
A
 
N
E
 
D
T
 
K
R
 
D
P
 
V
D
 
E
L
 
V
V
 
V
I
 
I
V
 
I
C
x
T
T
x
A
P
x
S
D
x
N
D
 
E
T
 
A
H
|
H
D
 
A
D
 
D
I
 
V
V
 
A
V
 
V
R
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
N
S
 
A
G
 
N
A
 
K
D
 
Y
V
 
V
I
 
F
T
 
C
E
|
E
K
|
K
P
 
P
M
 
L
S
 
A
T
 
V
T
 
T
V
 
A
E
 
A
K
 
D
I
 
C
R
 
Q
R
 
R
I
 
V
L
 
I
D
 
E
A
 
A
E
 
E
K
 
Q
R
 
K
T
 
N
G
 
G
R
 
K
R
 
R
-
 
M
V
 
V
D
 
Q
V
 
I
S
 
G
F
 
F
N
x
M
Y
 
R
R
 
R
F
 
Y
A
 
D
P
 
K
T
 
G
A
 
Y
A
 
V
R
 
Q
I
 
L
K
 
K
E
 
N
L
 
I
L
 
I
N
 
D
A
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
I
G
 
G
R
 
Q
V
 
P
T
 
L
S
 
M
V
 
V
D
 
-
F
 
-
H
 
-
W
 
-
Y
 
-
L
 
-
D
 
-
T
 
-
R
 
-
H
 
H
G
 
G
A
 
R
D
 
H
Y
 
Y
F
 
-
R
 
-
R
 
N
W
 
A
H
 
S
A
 
T
Y
 
V
A
 
P
E
 
E
H
 
Y
S
 
K
G
 
T
S
 
P
L
 
Q
F
 
A
V
 
I
H
 
Y
K
 
E
A
 
T
-
 
L
T
 
I
H
|
H
H
 
E
F
 
I
D
 
D
L
 
V
L
 
M
N
 
H
W
 
W
Y
 
L
L
 
L
D
 
N
S
 
E
D
 
D
P
 
Y
E
 
K
A
 
T
V
 
V
S
 
K
A
 
V
F
 
Y

Sites not aligning to the query:

3nt5A Crystal structure of myo-inositol dehydrogenase from bacillus subtilis with bound cofactor and product inosose (see paper)
28% identity, 47% coverage: 7:209/433 of query aligns to 4:195/337 of 3nt5A

query
sites
3nt5A
R
 
R
F
 
I
A
 
G
L
 
V
V
 
I
G
|
G
T
 
T
G
|
G
N
x
A
R
x
I
G
 
G
T
 
K
T
 
E
M
 
H
W
 
I
G
 
N
R
 
R
-
 
I
-
 
T
D
 
N
L
 
K
L
 
L
A
 
S
G
 
G
W
 
-
R
 
-
G
 
-
L
 
-
V
 
A
D
 
E
L
 
I
V
 
V
A
 
A
I
 
V
A
 
T
D
|
D
T
x
V
N
 
N
A
 
Q
L
 
E
R
 
A
A
 
A
E
 
Q
R
 
K
A
 
V
R
 
V
T
 
E
M
 
Q
I
 
Y
A
 
Q
T
 
L
N
 
N
A
 
A
P
 
T
V
 
V
Y
 
Y
G
 
P
N
 
N
V
 
D
D
 
D
A
 
S
M
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
D
T
 
E
R
 
N
P
 
V
D
 
D
L
 
A
V
 
V
I
 
L
V
 
V
C
 
T
T
x
S
P
x
W
D
x
G
D
 
P
T
 
A
H
 
H
D
 
E
D
 
S
I
 
S
V
 
V
V
 
L
R
 
K
A
 
A
L
 
I
E
 
K
S
 
A
G
 
Q
A
 
K
D
 
Y
V
 
V
I
 
F
T
 
C
E
|
E
K
|
K
P
 
P
M
 
L
S
 
A
T
 
T
T
 
T
V
 
A
E
 
E
K
 
G
I
 
C
R
 
M
R
 
R
I
 
I
L
 
V
D
 
E
A
 
E
E
 
E
K
 
I
R
 
K
T
 
V
G
 
G
R
 
K
R
 
R
-
 
L
V
 
V
D
 
Q
V
 
V
S
 
G
F
 
F
N
 
M
Y
 
R
R
 
R
F
 
Y
A
 
D
P
 
S
T
 
G
A
 
Y
A
 
V
R
 
Q
I
 
L
K
 
K
E
 
E
L
 
A
L
 
L
N
 
D
A
 
N
G
 
H
E
 
V
I
 
I
G
 
G
R
 
E
V
 
P
T
 
L
S
 
M
V
 
I
D
 
H
F
 
C
H
 
A
W
 
-
Y
x
H
L
 
R
D
 
N
T
 
P
R
 
T
H
 
V
G
 
G
A
 
D
D
 
N
Y
 
Y
F
 
T
R
 
-
R
 
-
W
 
-
H
 
-
A
 
-
Y
 
-
A
 
-
E
 
-
H
 
-
S
 
T
G
 
D
S
 
M
L
 
A
F
 
V
V
 
V
H
 
D
K
 
T
A
 
L
T
 
V
H
|
H
H
 
E
F
 
I
D
 
D
L
 
V
L
 
L
N
 
H
W
 
W
Y
 
L
L
 
V
D
 
N
S
 
D
D
 
D
P
 
Y
E
 
E
A
 
S
V
 
V
S
 
Q
A
 
V
F
 
I

Sites not aligning to the query:

3nt4A Crystal structure of myo-inositol dehydrogenase from bacillus subtilis with bound cofactor nadh and inositol (see paper)
28% identity, 47% coverage: 7:209/433 of query aligns to 4:195/337 of 3nt4A

query
sites
3nt4A
R
 
R
F
 
I
A
 
G
L
 
V
V
 
I
G
 
G
T
 
T
G
|
G
N
x
A
R
x
I
G
 
G
T
 
K
T
 
E
M
 
H
W
 
I
G
 
N
R
 
R
-
 
I
-
 
T
D
 
N
L
 
K
L
 
L
A
 
S
G
 
G
W
 
-
R
 
-
G
 
-
L
 
-
V
 
A
D
 
E
L
 
I
V
 
V
A
 
A
I
 
V
A
 
T
D
|
D
T
x
V
N
 
N
A
 
Q
L
 
E
R
 
A
A
 
A
E
 
Q
R
 
K
A
 
V
R
 
V
T
 
E
M
 
Q
I
 
Y
A
 
Q
T
 
L
N
 
N
A
 
A
P
 
T
V
 
V
Y
 
Y
G
 
P
N
 
N
V
 
D
D
 
D
A
 
S
M
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
D
T
 
E
R
 
N
P
 
V
D
 
D
L
 
A
V
 
V
I
 
L
V
 
V
C
 
T
T
x
S
P
x
W
D
x
G
D
 
P
T
 
A
H
 
H
D
 
E
D
 
S
I
 
S
V
 
V
V
 
L
R
 
K
A
 
A
L
 
I
E
 
K
S
 
A
G
 
Q
A
 
K
D
 
Y
V
 
V
I
 
F
T
 
C
E
|
E
K
|
K
P
 
P
M
 
L
S
 
A
T
 
T
T
 
T
V
 
A
E
 
E
K
 
G
I
 
C
R
 
M
R
 
R
I
 
I
L
 
V
D
 
E
A
 
E
E
 
E
K
 
I
R
 
K
T
 
V
G
 
G
R
 
K
R
 
R
-
 
L
V
 
V
D
 
Q
V
 
V
S
 
G
F
 
F
N
 
M
Y
 
R
R
 
R
F
 
Y
A
 
D
P
 
S
T
 
G
A
 
Y
A
 
V
R
 
Q
I
 
L
K
 
K
E
 
E
L
 
A
L
 
L
N
 
D
A
 
N
G
 
H
E
 
V
I
 
I
G
 
G
R
 
E
V
 
P
T
 
L
S
 
M
V
 
I
D
 
H
F
 
C
H
 
A
W
 
-
Y
x
H
L
 
R
D
 
N
T
 
P
R
 
T
H
 
V
G
 
G
A
 
D
D
 
N
Y
 
Y
F
 
T
R
 
-
R
 
-
W
 
-
H
 
-
A
 
-
Y
 
-
A
 
-
E
 
-
H
 
-
S
 
T
G
 
D
S
 
M
L
 
A
F
 
V
V
 
V
H
 
D
K
 
T
A
 
L
T
 
V
H
|
H
H
 
E
F
 
I
D
 
D
L
 
V
L
 
L
N
 
H
W
 
W
Y
 
L
L
 
V
D
 
N
S
 
D
D
 
D
P
 
Y
E
 
E
A
 
S
V
 
V
S
 
Q
A
 
V
F
 
I

Sites not aligning to the query:

3nt2B Crystal structure of myo-inositol dehydrogenase from bacillus subtilis with bound cofactor (see paper)
28% identity, 47% coverage: 7:209/433 of query aligns to 4:195/337 of 3nt2B

query
sites
3nt2B
R
 
R
F
 
I
A
 
G
L
 
V
V
 
I
G
|
G
T
 
T
G
|
G
N
x
A
R
 
I
G
 
G
T
 
K
T
 
E
M
 
H
W
 
I
G
 
N
R
 
R
-
 
I
-
 
T
D
 
N
L
 
K
L
 
L
A
 
S
G
 
G
W
 
-
R
 
-
G
 
-
L
 
-
V
 
A
D
 
E
L
 
I
V
 
V
A
 
A
I
 
V
A
 
T
D
|
D
T
x
V
N
 
N
A
 
Q
L
 
E
R
 
A
A
 
A
E
 
Q
R
 
K
A
 
V
R
 
V
T
 
E
M
 
Q
I
 
Y
A
 
Q
T
 
L
N
 
N
A
 
A
P
 
T
V
 
V
Y
 
Y
G
 
P
N
 
N
V
 
D
D
 
D
A
 
S
M
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
D
T
 
E
R
 
N
P
 
V
D
 
D
L
 
A
V
 
V
I
 
L
V
 
V
C
 
T
T
x
S
P
x
W
D
 
G
D
 
P
T
x
A
H
 
H
D
 
E
D
 
S
I
 
S
V
 
V
V
 
L
R
 
K
A
 
A
L
 
I
E
 
K
S
 
A
G
 
Q
A
 
K
D
 
Y
V
 
V
I
 
F
T
 
C
E
 
E
K
|
K
P
 
P
M
 
L
S
 
A
T
 
T
T
 
T
V
 
A
E
 
E
K
 
G
I
 
C
R
 
M
R
 
R
I
 
I
L
 
V
D
 
E
A
 
E
E
 
E
K
 
I
R
 
K
T
 
V
G
 
G
R
 
K
R
 
R
-
 
L
V
 
V
D
 
Q
V
 
V
S
 
G
F
 
F
N
 
M
Y
 
R
R
 
R
F
 
Y
A
 
D
P
 
S
T
 
G
A
 
Y
A
 
V
R
 
Q
I
 
L
K
 
K
E
 
E
L
 
A
L
 
L
N
 
D
A
 
N
G
 
H
E
 
V
I
 
I
G
 
G
R
 
E
V
 
P
T
 
L
S
 
M
V
 
I
D
 
H
F
 
C
H
 
A
W
 
-
Y
 
H
L
 
R
D
 
N
T
 
P
R
 
T
H
 
V
G
 
G
A
 
D
D
 
N
Y
 
Y
F
 
T
R
 
-
R
 
-
W
 
-
H
 
-
A
 
-
Y
 
-
A
 
-
E
 
-
H
 
-
S
 
T
G
 
D
S
 
M
L
 
A
F
 
V
V
 
V
H
 
D
K
 
T
A
 
L
T
 
V
H
|
H
H
 
E
F
 
I
D
 
D
L
 
V
L
 
L
N
 
H
W
 
W
Y
 
L
L
 
V
D
 
N
S
 
D
D
 
D
P
 
Y
E
 
E
A
 
S
V
 
V
S
 
Q
A
 
V
F
 
I

Sites not aligning to the query:

3nt2A Crystal structure of myo-inositol dehydrogenase from bacillus subtilis with bound cofactor (see paper)
28% identity, 47% coverage: 7:209/433 of query aligns to 4:195/337 of 3nt2A

query
sites
3nt2A
R
 
R
F
 
I
A
 
G
L
 
V
V
 
I
G
|
G
T
 
T
G
|
G
N
x
A
R
x
I
G
 
G
T
 
K
T
 
E
M
 
H
W
 
I
G
 
N
R
 
R
-
 
I
-
 
T
D
 
N
L
 
K
L
 
L
A
 
S
G
 
G
W
 
-
R
 
-
G
 
-
L
 
-
V
 
A
D
 
E
L
 
I
V
 
V
A
 
A
I
 
V
A
 
T
D
|
D
T
x
V
N
 
N
A
 
Q
L
 
E
R
 
A
A
 
A
E
 
Q
R
 
K
A
 
V
R
 
V
T
 
E
M
 
Q
I
 
Y
A
 
Q
T
 
L
N
 
N
A
 
A
P
 
T
V
 
V
Y
 
Y
G
 
P
N
 
N
V
 
D
D
 
D
A
 
S
M
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
D
T
 
E
R
 
N
P
 
V
D
 
D
L
 
A
V
 
V
I
 
L
V
 
V
C
 
T
T
x
S
P
x
W
D
x
G
D
 
P
T
x
A
H
|
H
D
 
E
D
 
S
I
 
S
V
 
V
V
 
L
R
 
K
A
 
A
L
 
I
E
 
K
S
 
A
G
 
Q
A
 
K
D
 
Y
V
 
V
I
 
F
T
 
C
E
|
E
K
|
K
P
 
P
M
 
L
S
 
A
T
 
T
T
 
T
V
 
A
E
 
E
K
 
G
I
 
C
R
 
M
R
 
R
I
 
I
L
 
V
D
 
E
A
 
E
E
 
E
K
 
I
R
 
K
T
 
V
G
 
G
R
 
K
R
 
R
-
 
L
V
 
V
D
 
Q
V
 
V
S
 
G
F
 
F
N
 
M
Y
 
R
R
 
R
F
 
Y
A
 
D
P
 
S
T
 
G
A
 
Y
A
 
V
R
 
Q
I
 
L
K
 
K
E
 
E
L
 
A
L
 
L
N
 
D
A
 
N
G
 
H
E
 
V
I
 
I
G
 
G
R
 
E
V
 
P
T
 
L
S
 
M
V
 
I
D
 
H
F
 
C
H
 
A
W
 
-
Y
 
H
L
 
R
D
 
N
T
 
P
R
 
T
H
 
V
G
 
G
A
 
D
D
 
N
Y
 
Y
F
 
T
R
 
-
R
 
-
W
 
-
H
 
-
A
 
-
Y
 
-
A
 
-
E
 
-
H
 
-
S
 
T
G
 
D
S
 
M
L
 
A
F
 
V
V
 
V
H
 
D
K
 
T
A
 
L
T
 
V
H
|
H
H
 
E
F
 
I
D
 
D
L
 
V
L
 
L
N
 
H
W
 
W
Y
 
L
L
 
V
D
 
N
S
 
D
D
 
D
P
 
Y
E
 
E
A
 
S
V
 
V
S
 
Q
A
 
V
F
 
I

Sites not aligning to the query:

4l8vA Crystal structure of a12k/d35s mutant myo-inositol dehydrogenase from bacillus subtilis with bound cofactor NADP (see paper)
28% identity, 47% coverage: 7:209/433 of query aligns to 4:195/337 of 4l8vA

query
sites
4l8vA
R
 
R
F
 
I
A
 
G
L
 
V
V
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
N
x
K
R
x
I
G
 
G
T
 
K
T
 
E
M
 
H
W
 
I
G
 
N
R
 
R
-
 
I
-
 
T
D
 
N
L
 
K
L
 
L
A
 
S
G
 
G
W
 
-
R
 
-
G
 
-
L
 
-
V
 
A
D
 
E
L
 
I
V
 
V
A
 
A
I
 
V
A
 
T
D
 
S
T
 
V
N
 
N
A
 
Q
L
 
E
R
 
A
A
 
A
E
 
Q
R
 
K
A
 
V
R
 
V
T
 
E
M
 
Q
I
 
Y
A
 
Q
T
 
L
N
 
N
A
 
A
P
 
T
V
 
V
Y
 
Y
G
 
P
N
 
N
V
 
D
D
 
D
A
 
S
M
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
D
T
 
E
R
 
N
P
 
V
D
 
D
L
 
A
V
 
V
I
 
L
V
 
V
C
 
T
T
x
S
P
x
W
D
 
G
D
 
P
T
 
A
H
|
H
D
 
E
D
 
S
I
 
S
V
 
V
V
 
L
R
 
K
A
 
A
L
 
I
E
 
K
S
 
A
G
 
Q
A
 
K
D
 
Y
V
 
V
I
 
F
T
 
C
E
|
E
K
|
K
P
 
P
M
 
L
S
 
A
T
 
T
T
 
T
V
 
A
E
 
E
K
 
G
I
 
C
R
 
M
R
 
R
I
 
I
L
 
V
D
 
E
A
 
E
E
 
E
K
 
I
R
 
K
T
 
V
G
 
G
R
 
K
R
 
R
-
 
L
V
 
V
D
 
Q
V
 
V
S
 
G
F
 
F
N
x
M
Y
 
R
R
 
R
F
 
Y
A
 
D
P
 
S
T
 
G
A
 
Y
A
 
V
R
 
Q
I
 
L
K
 
K
E
 
E
L
 
A
L
 
L
N
 
D
A
 
N
G
 
H
E
 
V
I
 
I
G
 
G
R
 
E
V
 
P
T
 
L
S
 
M
V
 
I
D
 
H
F
 
C
H
 
A
W
 
-
Y
 
H
L
 
R
D
 
N
T
 
P
R
 
T
H
 
V
G
 
G
A
 
D
D
 
N
Y
 
Y
F
 
T
R
 
-
R
 
-
W
 
-
H
 
-
A
 
-
Y
 
-
A
 
-
E
 
-
H
 
-
S
 
T
G
 
D
S
 
M
L
 
A
F
 
V
V
 
V
H
 
D
K
 
T
A
 
L
T
 
V
H
|
H
H
 
E
F
 
I
D
 
D
L
 
V
L
 
L
N
 
H
W
 
W
Y
 
L
L
 
V
D
 
N
S
 
D
D
 
D
P
 
Y
E
 
E
A
 
S
V
 
V
S
 
Q
A
 
V
F
 
I

Sites not aligning to the query:

3q2iA Crystal structure of the wlba dehydrognase from chromobactrium violaceum in complex with nadh and udp-glcnaca at 1.50 a resolution (see paper)
31% identity, 48% coverage: 1:209/433 of query aligns to 7:210/345 of 3q2iA

query
sites
3q2iA
M
 
I
M
 
T
D
 
D
N
 
R
K
 
K
R
 
I
R
 
R
F
 
F
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
 
G
T
x
C
G
|
G
N
x
R
R
x
I
G
 
A
T
 
N
T
 
N
M
 
H
W
 
F
G
 
G
R
 
A
-
 
L
D
 
E
L
 
K
L
 
H
A
 
A
G
 
D
W
 
R
R
 
A
G
 
E
L
 
L
V
 
I
D
 
D
L
 
V
V
 
C
A
x
D
I
|
I
A
 
-
D
 
D
T
 
P
N
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
K
A
 
A
E
 
A
R
 
V
A
 
E
R
 
R
T
 
T
M
 
-
I
 
-
A
 
-
T
 
-
N
 
G
A
 
A
P
 
R
V
 
G
Y
 
H
G
 
A
N
 
S
V
 
L
D
 
T
A
 
D
M
 
M
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
T
 
T
R
 
D
P
 
A
D
 
D
L
 
I
V
 
V
I
 
I
V
 
L
C
 
T
T
|
T
P
|
P
D
x
S
D
 
G
T
 
L
H
|
H
D
 
P
D
 
T
I
 
Q
V
 
S
V
 
I
R
 
E
A
 
C
L
 
S
E
 
E
S
 
A
G
 
G
A
 
F
D
 
H
V
 
V
I
 
M
T
 
T
E
|
E
K
|
K
P
 
P
M
 
M
S
 
A
T
 
T
T
 
R
V
 
W
E
 
E
K
 
D
I
 
G
R
 
L
R
 
E
I
 
M
L
 
V
D
 
K
A
 
A
E
 
A
K
 
D
R
 
K
T
 
A
G
 
K
R
 
K
R
 
H
V
 
L
D
 
F
V
 
V
S
 
V
F
 
K
N
x
Q
Y
x
N
R
 
R
F
 
R
A
 
N
P
 
A
T
 
T
A
 
L
A
 
Q
R
 
L
I
 
L
K
 
K
E
 
R
L
 
A
L
 
M
N
 
Q
A
 
E
G
 
K
E
 
R
I
 
F
G
 
G
R
 
R
V
 
I
T
 
Y
S
 
M
V
 
V
D
 
N
F
 
V
H
 
N
W
 
V
Y
 
F
L
 
W
D
 
-
T
|
T
R
|
R
H
 
P
G
 
Q
A
 
E
D
x
Y
Y
 
Y
-
 
D
F
 
A
R
 
A
R
 
G
W
|
W
H
x
R
A
 
G
Y
 
T
A
 
W
E
 
E
H
 
F
S
 
D
G
 
G
S
 
G
L
 
A
F
 
F
V
 
M
H
x
N
K
x
Q
A
 
A
T
 
S
H
|
H
H
 
Y
F
 
V
D
 
D
L
 
L
L
 
L
N
 
D
W
 
W
Y
 
-
L
 
L
D
 
I
S
 
G
D
 
P
P
 
V
E
 
E
A
 
S
V
 
V
S
 
Q
A
 
A
F
 
Y

Sites not aligning to the query:

7xreC Crystal structure of dgpa
27% identity, 45% coverage: 32:224/433 of query aligns to 30:226/363 of 7xreC

query
sites
7xreC
L
 
L
V
 
N
D
 
E
L
 
I
V
 
V
A
 
A
I
 
F
A
 
C
D
|
D
T
x
I
N
 
Q
A
 
I
L
 
D
R
 
R
A
 
A
E
 
E
R
 
K
A
 
A
R
 
A
T
 
A
M
 
E
I
 
F
A
 
G
T
 
A
N
 
E
A
 
G
-
 
A
P
 
Q
V
 
V
Y
 
T
G
 
A
N
 
D
V
 
Y
D
 
K
A
 
E
M
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
N
T
 
P
R
 
E
P
 
V
D
 
E
L
 
V
V
 
V
I
 
H
V
 
V
C
 
C
T
|
T
P
|
P
D
x
N
D
 
V
T
 
S
H
|
H
D
 
S
D
 
E
I
 
I
V
 
T
V
 
I
R
 
A
A
 
A
L
 
F
E
 
E
S
 
A
G
 
G
A
 
K
D
 
H
V
 
V
I
 
Y
T
 
C
E
|
E
K
|
K
P
|
P
M
 
M
S
 
S
T
 
H
T
 
S
V
 
T
E
 
E
K
 
E
I
 
A
R
 
E
R
 
K
I
 
M
L
 
V
D
 
E
A
 
A
E
 
W
K
 
K
R
 
K
T
 
S
G
 
G
R
 
K
R
 
Q
V
 
F
D
 
T
V
 
I
S
 
G
F
 
Y
N
 
Q
Y
 
N
R
 
R
F
 
F
A
 
R
P
 
E
T
 
E
A
 
V
A
 
M
R
 
N
I
 
L
K
 
K
E
 
K
L
 
S
L
 
C
N
 
D
A
 
K
G
 
G
E
 
E
I
 
L
G
 
G
R
 
E
V
 
I
T
 
-
S
 
-
V
 
-
D
 
-
F
 
-
H
 
-
W
 
-
Y
 
Y
L
 
Y
D
 
G
T
 
K
R
 
A
H
 
H
G
 
A
A
 
V
D
 
-
Y
 
-
F
 
-
R
 
R
R
 
R
-
 
R
-
 
A
-
 
V
-
 
P
-
 
T
W
 
W
H
 
G
A
 
V
Y
x
F
A
 
M
E
 
D
-
 
K
-
 
E
-
 
A
H
x
Q
S
 
G
G
 
G
S
 
G
L
 
P
F
 
L
V
 
I
H
 
D
K
 
I
A
 
G
T
 
T
H
|
H
H
 
A
F
 
L
D
 
D
L
 
I
L
 
T
N
 
L
W
 
W
Y
 
C
L
 
M
-
 
N
-
 
N
-
 
Y
D
 
D
S
 
V
D
 
D
P
 
S
E
 
V
A
 
T
V
 
G
S
 
S
A
 
V
F
 
F
A
 
Y
D
 
K
L
 
L
-
 
G
-
 
Q
Q
 
K
M
 
E
Y
 
N
G
 
G
R
 
P
R
 
E
G
 
G
P
 
N
F
 
L
R
 
F
G
 
G
P
 
P

Sites not aligning to the query:

3m2tA The crystal structure of dehydrogenase from chromobacterium violaceum
28% identity, 36% coverage: 7:160/433 of query aligns to 5:155/342 of 3m2tA

query
sites
3m2tA
R
 
K
F
 
V
A
 
G
L
 
L
V
 
V
G
|
G
T
 
I
G
|
G
N
x
A
R
x
Q
G
 
-
T
 
-
T
 
-
M
 
-
W
 
M
G
 
Q
R
 
E
D
 
N
L
 
L
L
 
L
A
 
P
G
 
S
W
 
L
R
 
L
G
 
Q
L
 
M
V
 
Q
D
 
D
L
 
I
-
 
R
-
 
I
V
 
V
A
 
A
I
 
A
A
 
C
D
|
D
T
x
S
N
 
D
A
 
L
L
 
E
R
|
R
A
 
A
E
 
R
R
 
R
A
 
V
R
 
H
T
 
R
M
 
F
I
 
I
A
 
-
T
 
S
N
 
D
A
 
I
P
 
P
V
 
V
Y
 
L
G
 
D
N
 
N
V
 
V
D
 
P
A
 
A
M
 
M
L
 
L
A
 
N
E
 
Q
T
 
V
R
 
P
P
 
L
D
 
D
L
 
A
V
 
V
I
 
V
V
 
M
C
x
A
T
x
G
P
 
P
D
 
P
D
 
Q
T
x
L
H
 
H
D
 
F
D
 
E
I
 
M
V
 
G
V
 
L
R
 
L
A
 
A
L
 
M
E
 
S
S
 
K
G
 
G
A
 
V
D
 
N
V
 
V
I
 
F
T
 
V
E
|
E
K
|
K
P
 
P
M
 
P
S
 
C
T
 
A
T
 
T
V
 
L
E
 
E
K
 
E
I
 
L
R
 
E
R
 
T
I
 
L
L
 
I
D
 
D
A
 
A
E
 
A
K
 
R
R
 
R
T
 
S
G
 
D
R
 
V
R
 
V
V
 
S
D
 
G
V
 
V
S
 
G
F
 
M
N
|
N
Y
 
F
R
 
K
F
 
F
A
 
A
P
 
R
T
 
P
A
 
V
A
 
R
R
 
Q
I
 
L
K
 
R
E
 
E
L
 
M
L
 
T
N
 
Q
A
 
V
G
 
D
E
 
E
I
 
F
G
 
G
R
 
E
V
 
T
T
 
L
S
 
H
V
 
I
D
 
Q
F
 
L
H
 
N
W
 
H
Y
 
Y

Sites not aligning to the query:

8qc8D Crystal structure of NAD-dependent glycoside hydrolase from flavobacterium sp. (Strain k172) in complex with co-factor NAD+ (see paper)
25% identity, 47% coverage: 7:208/433 of query aligns to 3:201/339 of 8qc8D

query
sites
8qc8D
R
 
R
F
 
Y
A
 
G
L
 
L
V
 
I
G
 
G
T
 
A
G
|
G
N
x
H
R
x
M
G
 
A
T
 
R
T
 
E
M
 
H
W
 
V
G
 
-
R
 
R
D
 
N
L
 
L
L
 
A
A
 
L
G
 
I
W
 
P
R
 
G
G
 
S
L
 
L
V
 
I
D
 
-
L
 
-
V
 
T
A
 
A
I
 
V
A
 
A
D
|
D
T
x
P
N
x
T
A
 
P
L
 
S
R
x
S
A
 
L
E
 
E
R
 
E
A
 
T
R
 
A
T
 
R
M
 
E
I
 
I
A
 
G
T
 
Y
N
 
D
A
 
V
P
 
Q
V
 
T
Y
 
F
G
 
S
N
 
A
V
 
H
D
 
K
A
 
D
M
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
S
T
 
G
R
 
L
P
 
V
D
 
D
L
 
A
V
 
L
I
 
V
V
 
I
C
x
A
T
x
S
P
|
P
D
x
N
D
 
D
T
 
T
H
|
H
D
 
L
D
 
E
I
 
I
V
 
L
V
 
K
R
 
D
A
 
I
L
 
F
E
 
A
S
 
S
G
 
G
A
 
T
D
 
N
-
 
L
-
 
P
V
 
V
I
 
L
T
 
V
E
|
E
K
|
K
P
 
P
M
 
V
S
 
C
T
 
T
T
 
S
V
 
A
E
 
E
K
 
Q
I
 
A
R
 
D
R
 
E
I
 
L
L
 
E
D
 
E
A
 
L
E
 
A
K
 
A
R
 
T
T
 
Y
G
 
T
R
 
A
R
 
P
V
 
V
D
 
W
V
 
V
S
 
A
F
 
M
N
x
E
Y
 
Y
R
 
R
F
 
Y
A
 
M
P
 
P
T
 
P
A
 
V
A
 
Q
R
 
E
I
 
I
K
 
I
E
 
Q
L
 
A
L
 
A
N
 
H
A
 
S
G
 
G
E
 
K
I
 
L
G
 
G
R
 
N
V
 
I
T
 
-
S
 
-
V
 
-
D
 
-
F
 
-
H
 
H
W
 
M
Y
 
L
L
 
S
D
 
I
T
 
V
R
 
E
H
 
H
G
 
R
A
 
F
D
 
P
Y
 
F
F
 
L
R
 
H
R
x
K
-
x
V
-
 
D
-
 
A
W
|
W
H
 
N
A
 
R
Y
 
F
A
 
A
E
 
E
H
 
R
S
 
T
G
 
G
S
 
G
L
 
T
F
 
L
V
 
V
H
 
E
K
 
K
A
 
C
T
 
C
H
 
H
H
 
F
F
 
F
D
 
D
L
 
L
L
 
M
N
 
R
W
 
L
Y
 
I
L
 
L
D
 
Q
S
 
D
D
 
E
P
 
P
E
 
T
A
 
R
V
 
I
S
 
Y
A
 
A

8qc2A Crystal structure of NAD-dependent glycoside hydrolase from flavobacterium sp. (Strain k172) in complex with co-factor NAD+ and sulfoquinovose (sq) (see paper)
25% identity, 47% coverage: 7:208/433 of query aligns to 5:203/363 of 8qc2A

query
sites
8qc2A
R
 
R
F
 
Y
A
 
G
L
 
L
V
 
I
G
 
G
T
 
A
G
|
G
N
x
H
R
x
M
G
 
A
T
 
R
T
 
E
M
 
H
W
 
V
G
 
-
R
 
R
D
 
N
L
 
L
L
 
A
A
 
L
G
 
I
W
 
P
R
 
G
G
 
S
L
 
L
V
 
I
D
 
-
L
 
-
V
 
T
A
 
A
I
 
V
A
 
A
D
|
D
T
x
P
N
x
T
A
 
P
L
 
S
R
x
S
A
 
L
E
 
E
R
 
E
A
 
T
R
 
A
T
 
R
M
 
E
I
 
I
A
 
G
T
 
Y
N
 
D
A
 
V
P
 
Q
V
 
T
Y
 
F
G
 
S
N
 
A
V
 
H
D
 
K
A
 
D
M
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
S
T
 
G
R
 
L
P
 
V
D
 
D
L
 
A
V
 
L
I
 
V
V
 
I
C
x
A
T
x
S
P
|
P
D
x
N
D
 
D
T
 
T
H
|
H
D
 
L
D
 
E
I
 
I
V
 
L
V
 
K
R
 
D
A
 
I
L
 
F
E
 
A
S
 
S
G
 
G
A
 
T
D
 
N
-
 
L
-
 
P
V
 
V
I
 
L
T
 
V
E
|
E
K
|
K
P
 
P
M
 
V
S
 
C
T
 
T
T
 
S
V
 
A
E
 
E
K
 
Q
I
 
A
R
 
D
R
 
E
I
 
L
L
 
E
D
 
E
A
 
L
E
 
A
K
 
A
R
 
T
T
 
Y
G
 
T
R
 
A
R
 
P
V
 
V
D
 
W
V
 
V
S
 
A
F
 
M
N
x
E
Y
|
Y
R
 
R
F
 
Y
A
 
M
P
 
P
T
 
P
A
 
V
A
 
Q
R
 
E
I
 
I
K
 
I
E
 
Q
L
 
A
L
 
A
N
 
H
A
 
S
G
 
G
E
 
K
I
 
L
G
 
G
R
 
N
V
 
I
T
 
-
S
 
-
V
 
-
D
 
-
F
 
-
H
 
H
W
 
M
Y
 
L
L
 
S
D
 
I
T
 
V
R
 
E
H
 
H
G
x
R
A
 
F
D
 
P
Y
x
F
F
x
L
R
 
H
R
x
K
-
x
V
-
 
D
-
 
A
W
|
W
H
 
N
A
 
R
Y
 
F
A
 
A
E
 
E
H
 
R
S
 
T
G
 
G
S
 
G
L
 
T
F
 
L
V
 
V
H
x
E
K
 
K
A
 
C
T
 
C
H
|
H
H
 
F
F
 
F
D
 
D
L
 
L
L
 
M
N
 
R
W
 
L
Y
 
I
L
 
L
D
 
Q
S
 
D
D
 
E
P
 
P
E
 
T
A
 
R
V
 
I
S
 
Y
A
 
A

Sites not aligning to the query:

8qc8B Crystal structure of NAD-dependent glycoside hydrolase from flavobacterium sp. (Strain k172) in complex with co-factor NAD+ (see paper)
25% identity, 47% coverage: 7:208/433 of query aligns to 7:205/367 of 8qc8B

query
sites
8qc8B
R
 
R
F
 
Y
A
 
G
L
 
L
V
 
I
G
 
G
T
 
A
G
 
G
N
x
H
R
x
M
G
 
A
T
 
R
T
 
E
M
 
H
W
 
V
G
 
-
R
 
R
D
 
N
L
 
L
L
 
A
A
 
L
G
 
I
W
 
P
R
 
G
G
 
S
L
 
L
V
 
I
D
 
-
L
 
-
V
 
T
A
 
A
I
 
V
A
 
A
D
|
D
T
x
P
N
x
T
A
 
P
L
 
S
R
x
S
A
 
L
E
 
E
R
 
E
A
 
T
R
 
A
T
 
R
M
 
E
I
 
I
A
 
G
T
 
Y
N
 
D
A
 
V
P
 
Q
V
 
T
Y
 
F
G
 
S
N
 
A
V
 
H
D
 
K
A
 
D
M
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
S
T
 
G
R
 
L
P
 
V
D
 
D
L
 
A
V
 
L
I
 
V
V
 
I
C
x
A
T
x
S
P
|
P
D
x
N
D
 
D
T
 
T
H
|
H
D
 
L
D
 
E
I
 
I
V
 
L
V
 
K
R
 
D
A
 
I
L
 
F
E
 
A
S
 
S
G
 
G
A
 
T
D
 
N
-
 
L
-
 
P
V
 
V
I
 
L
T
 
V
E
|
E
K
|
K
P
 
P
M
 
V
S
 
C
T
 
T
T
 
S
V
 
A
E
 
E
K
 
Q
I
 
A
R
 
D
R
 
E
I
 
L
L
 
E
D
 
E
A
 
L
E
 
A
K
 
A
R
 
T
T
 
Y
G
 
T
R
 
A
R
 
P
V
 
V
D
 
W
V
 
V
S
 
A
F
 
M
N
x
E
Y
 
Y
R
 
R
F
 
Y
A
 
M
P
 
P
T
 
P
A
 
V
A
 
Q
R
 
E
I
 
I
K
 
I
E
 
Q
L
 
A
L
 
A
N
 
H
A
 
S
G
 
G
E
 
K
I
 
L
G
 
G
R
 
N
V
 
I
T
 
-
S
 
-
V
 
-
D
 
-
F
 
-
H
 
H
W
 
M
Y
 
L
L
 
S
D
 
I
T
 
V
R
 
E
H
 
H
G
 
R
A
 
F
D
 
P
Y
 
F
F
 
L
R
 
H
R
x
K
-
x
V
-
 
D
-
 
A
W
|
W
H
 
N
A
 
R
Y
 
F
A
 
A
E
 
E
H
 
R
S
 
T
G
 
G
S
 
G
L
 
T
F
 
L
V
 
V
H
 
E
K
 
K
A
 
C
T
 
C
H
 
H
H
 
F
F
 
F
D
 
D
L
 
L
L
 
M
N
 
R
W
 
L
Y
 
I
L
 
L
D
 
Q
S
 
D
D
 
E
P
 
P
E
 
T
A
 
R
V
 
I
S
 
Y
A
 
A

Sites not aligning to the query:

1zh8A Crystal structure of oxidoreductase (tm0312) from thermotoga maritima at 2.50 a resolution
25% identity, 48% coverage: 5:210/433 of query aligns to 3:206/325 of 1zh8A

query
sites
1zh8A
K
 
K
R
 
I
R
 
R
F
 
L
A
 
G
L
 
I
V
 
V
G
|
G
T
x
C
G
|
G
N
 
-
R
 
-
G
 
-
T
 
-
T
 
-
M
x
I
W
x
A
G
 
A
R
 
R
D
 
E
L
 
L
-
 
H
-
 
L
-
 
P
-
 
A
L
 
L
A
 
K
G
 
N
W
 
L
R
 
S
G
 
H
L
 
L
V
 
F
D
 
E
L
 
I
V
 
T
A
 
A
I
 
V
A
 
T
D
x
S
T
x
R
N
x
T
A
 
R
L
 
S
R
x
H
A
 
A
E
 
E
R
 
E
A
 
F
R
 
A
T
 
K
M
 
M
I
 
V
A
 
G
T
 
-
N
 
N
A
 
P
P
 
A
V
 
V
Y
 
F
G
 
D
N
 
S
V
 
Y
D
 
E
A
 
E
M
 
L
L
 
L
A
 
E
E
 
S
T
 
G
R
 
L
P
 
V
D
 
D
L
 
A
V
 
V
I
 
D
V
 
L
C
x
T
T
x
L
P
|
P
D
 
V
D
 
E
T
x
L
H
 
N
D
 
L
D
 
P
I
 
F
V
 
I
V
 
E
R
 
K
A
 
A
L
 
L
E
 
R
S
 
K
G
 
G
A
 
V
D
 
H
V
 
V
I
 
I
T
 
C
E
|
E
K
|
K
P
 
P
M
 
I
S
 
S
T
 
T
T
 
D
V
 
V
E
 
E
K
 
T
I
 
G
R
 
K
R
 
K
I
 
V
L
 
V
D
 
E
A
 
L
E
 
S
K
 
E
R
 
K
T
 
S
G
 
E
R
 
K
R
 
T
V
 
V
D
 
Y
V
 
I
S
 
A
F
 
E
N
|
N
Y
 
F
R
 
R
F
 
H
A
 
V
P
 
P
T
 
A
A
 
F
A
 
W
R
 
K
I
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
L
L
 
V
N
 
E
A
 
S
G
 
G
E
 
A
I
 
I
G
 
G
R
 
D
V
 
P
T
 
V
S
 
F
V
 
M
D
 
N
F
 
W
H
 
Q
W
 
I
Y
 
W
L
 
V
D
 
G
T
 
M
R
 
D
H
 
E
G
 
N
A
 
N
D
 
K
Y
|
Y
F
 
V
R
 
H
R
 
T
-
 
D
W
|
W
H
x
R
A
 
K
Y
 
K
A
 
P
E
 
K
H
 
H
S
 
V
G
 
G
S
 
G
L
 
F
F
 
L
V
 
S
H
 
D
K
 
G
A
 
G
T
 
V
H
|
H
H
 
H
F
 
A
D
 
A
L
 
A
L
 
M
N
 
R
W
 
L
Y
 
I
L
 
L
D
 
-
S
 
G
D
 
E
P
 
I
E
 
E
A
 
W
V
 
I
S
 
S
A
 
A
F
 
V
A
 
A

Sites not aligning to the query:

4mjlD Crystal structure of myo-inositol dehydrogenase from lactobacillus casei in complex with NAD and d-chiro-inositol
31% identity, 33% coverage: 7:150/433 of query aligns to 4:146/339 of 4mjlD

query
sites
4mjlD
R
 
K
F
 
V
A
 
G
L
 
V
V
 
I
G
 
G
T
 
T
G
|
G
N
x
A
R
x
M
G
 
G
T
 
R
T
 
A
M
 
H
W
 
I
G
 
D
R
 
R
-
 
L
-
 
T
D
 
N
L
 
V
L
 
L
A
 
T
G
 
G
W
 
-
R
 
-
G
 
-
L
 
-
V
 
A
D
 
E
L
 
V
V
 
V
A
 
A
I
 
V
A
 
T
D
|
D
T
x
I
N
 
D
A
 
H
L
 
E
R
 
A
A
 
A
E
 
E
R
 
A
A
 
A
R
 
V
T
 
R
M
 
D
I
 
F
A
 
H
T
 
L
N
 
N
A
 
A
P
 
K
V
 
V
Y
 
Y
G
 
P
N
 
D
V
 
D
D
 
T
A
 
S
M
 
L
L
 
L
A
 
Q
E
 
D
T
 
P
R
 
D
P
 
I
D
 
D
L
 
A
V
 
V
I
 
F
V
 
V
C
x
V
T
x
S
P
 
F
D
 
G
D
 
G
T
 
A
H
|
H
D
 
E
D
 
A
I
 
T
V
 
V
V
 
L
R
 
K
A
 
A
L
 
L
E
 
D
S
 
T
G
 
D
A
 
K
D
 
F
V
 
I
I
 
F
T
 
T
E
|
E
K
|
K
P
 
P
M
 
L
S
 
A
T
 
T
T
 
T
V
 
L
E
 
E
K
 
G
I
 
A
R
 
K
R
 
R
I
 
I
L
 
V
D
 
D
A
 
K
E
 
E
-
 
L
K
 
T
R
 
K
T
 
S
G
 
K
R
 
K
R
 
V
V
 
I
D
 
Q
V
 
V
S
 
G
F
 
F
N
x
M
Y
 
R
R
 
R
F
 
Y
A
 
D
P
 
Q
T
 
G
A
 
I
A
 
R
R
 
A
I
 
L
K
 
K
E
 
E
L
 
K
L
 
L
N
 
D
A
 
T
G
 
G
E
 
I
I
 
I
G
 
G

Sites not aligning to the query:

4mioD Crystal structure of myo-inositol dehydrogenase from lactobacillus casei in complex with NAD(h) and myo-inositol
31% identity, 33% coverage: 7:150/433 of query aligns to 4:146/339 of 4mioD

query
sites
4mioD
R
 
K
F
 
V
A
 
G
L
 
V
V
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
N
x
A
R
x
M
G
 
G
T
 
R
T
 
A
M
 
H
W
 
I
G
 
D
R
 
R
-
 
L
-
 
T
D
 
N
L
 
V
L
 
L
A
 
T
G
 
G
W
 
-
R
 
-
G
 
-
L
 
-
V
 
A
D
 
E
L
 
V
V
 
V
A
 
A
I
 
V
A
 
T
D
|
D
T
x
I
N
 
D
A
 
H
L
 
E
R
 
A
A
 
A
E
 
E
R
 
A
A
 
A
R
 
V
T
 
R
M
 
D
I
 
F
A
 
H
T
 
L
N
 
N
A
 
A
P
 
K
V
 
V
Y
 
Y
G
 
P
N
 
D
V
 
D
D
 
T
A
 
S
M
 
L
L
 
L
A
 
Q
E
 
D
T
 
P
R
 
D
P
 
I
D
 
D
L
 
A
V
 
V
I
 
F
V
 
V
C
 
V
T
x
S
P
 
F
D
 
G
D
 
G
T
x
A
H
|
H
D
 
E
D
 
A
I
 
T
V
 
V
V
 
L
R
 
K
A
 
A
L
 
L
E
 
D
S
 
T
G
 
D
A
 
K
D
 
F
V
 
I
I
 
F
T
 
T
E
|
E
K
|
K
P
 
P
M
 
L
S
 
A
T
 
T
T
 
T
V
 
L
E
 
E
K
 
G
I
 
A
R
 
K
R
 
R
I
 
I
L
 
V
D
 
D
A
 
K
E
 
E
-
 
L
K
 
T
R
 
K
T
 
S
G
 
K
R
 
K
R
 
V
V
 
I
D
 
Q
V
 
V
S
 
G
F
 
F
N
x
M
Y
 
R
R
 
R
F
 
Y
A
 
D
P
 
Q
T
 
G
A
 
I
A
 
R
R
 
A
I
 
L
K
 
K
E
 
E
L
 
K
L
 
L
N
 
D
A
 
T
G
 
G
E
 
I
I
 
I
G
 
G

Sites not aligning to the query:

4mioA Crystal structure of myo-inositol dehydrogenase from lactobacillus casei in complex with NAD(h) and myo-inositol
31% identity, 33% coverage: 7:150/433 of query aligns to 4:146/339 of 4mioA

query
sites
4mioA
R
 
K
F
 
V
A
 
G
L
 
V
V
 
I
G
 
G
T
 
T
G
|
G
N
x
A
R
x
M
G
 
G
T
 
R
T
 
A
M
 
H
W
 
I
G
 
D
R
 
R
-
 
L
-
 
T
D
 
N
L
 
V
L
 
L
A
 
T
G
 
G
W
 
-
R
 
-
G
 
-
L
 
-
V
 
A
D
 
E
L
 
V
V
 
V
A
 
A
I
 
V
A
 
T
D
|
D
T
x
I
N
 
D
A
 
H
L
 
E
R
 
A
A
 
A
E
 
E
R
 
A
A
 
A
R
 
V
T
 
R
M
 
D
I
 
F
A
 
H
T
 
L
N
 
N
A
 
A
P
 
K
V
 
V
Y
 
Y
G
 
P
N
 
D
V
 
D
D
 
T
A
 
S
M
 
L
L
 
L
A
 
Q
E
 
D
T
 
P
R
 
D
P
 
I
D
 
D
L
 
A
V
 
V
I
 
F
V
 
V
C
 
V
T
x
S
P
x
F
D
 
G
D
 
G
T
 
A
H
|
H
D
 
E
D
 
A
I
 
T
V
 
V
V
 
L
R
 
K
A
 
A
L
 
L
E
 
D
S
 
T
G
 
D
A
 
K
D
 
F
V
 
I
I
 
F
T
 
T
E
|
E
K
|
K
P
 
P
M
 
L
S
 
A
T
 
T
T
 
T
V
 
L
E
 
E
K
 
G
I
 
A
R
 
K
R
 
R
I
 
I
L
 
V
D
 
D
A
 
K
E
 
E
-
 
L
K
 
T
R
 
K
T
 
S
G
 
K
R
 
K
R
 
V
V
 
I
D
 
Q
V
 
V
S
 
G
F
 
F
N
 
M
Y
 
R
R
 
R
F
 
Y
A
 
D
P
 
Q
T
 
G
A
 
I
A
 
R
R
 
A
I
 
L
K
 
K
E
 
E
L
 
K
L
 
L
N
 
D
A
 
T
G
 
G
E
 
I
I
 
I
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>SMc04129 FitnessBrowser__Smeli:SMc04129
MMDNKRRFALVGTGNRGTTMWGRDLLAGWRGLVDLVAIADTNALRAERARTMIATNAPVY
GNVDAMLAETRPDLVIVCTPDDTHDDIVVRALESGADVITEKPMSTTVEKIRRILDAEKR
TGRRVDVSFNYRFAPTAARIKELLNAGEIGRVTSVDFHWYLDTRHGADYFRRWHAYAEHS
GSLFVHKATHHFDLLNWYLDSDPEAVSAFADLQMYGRRGPFRGPRCKLCPHKSECDFYLD
LEADPFLDSLYEEPSEIDSYFRDGCVFREDIDIPDTMVANIRYRNDVHVSYSLNTFQPIE
GHHIAFNGTKGRIELRQYEDQPWETPPEDEILLVRNFPKGKPAMERITVPHFPGGHYGGD
DRLRNTLFEPDAKDPLGQRAGARAGAMSVLCGIAALQSSRTGKIVRLADLMPELFTDGAQ
PMRERLKETCSRR

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory