SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing SMc04142 FitnessBrowser__Smeli:SMc04142 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 13 hits to proteins with known functional sites (download)

Q15493 Regucalcin; RC; Gluconolactonase; GNL; Senescence marker protein 30; SMP-30; EC 3.1.1.17 from Homo sapiens (Human) (see 2 papers)
31% identity, 97% coverage: 5:289/294 of query aligns to 4:297/299 of Q15493

query
sites
Q15493
L
 
I
T
 
K
F
 
I
E
 
E
C
 
C
L
 
V
L
 
L
D
 
P
S
 
E
R
 
N
C
 
C
D
 
R
V
 
C
A
 
G
E
|
E
S
 
S
P
 
P
V
 
V
F
 
W
D
 
E
E
 
E
R
 
V
R
 
S
N
 
N
C
 
S
L
 
L
F
 
L
F
 
F
V
 
V
D
 
D
I
 
I
G
 
P
R
 
A
S
 
K
A
 
K
L
 
V
H
 
C
R
 
R
V
 
W
D
 
D
L
 
S
S
 
F
G
 
T
A
 
K
G
 
Q
H
 
V
V
 
Q
E
 
R
W
 
V
T
 
T
I
 
M
E
 
D
G
 
A
G
 
P
A
 
V
C
 
S
S
 
S
T
 
V
G
 
A
L
 
L
A
 
R
R
 
Q
S
 
S
G
 
G
R
 
G
L
 
Y
V
 
V
L
 
A
A
 
T
Q
 
I
R
 
G
D
 
T
R
 
K
V
 
F
V
 
C
L
 
A
F
 
L
D
 
N
-
 
W
P
 
K
D
 
E
A
 
Q
G
 
S
A
 
A
V
 
V
T
 
V
R
 
-
E
 
-
I
 
L
A
 
A
A
 
T
I
 
V
E
 
D
P
 
N
D
 
D
I
 
K
A
 
K
D
 
N
T
 
N
R
 
R
L
 
F
N
|
N
D
 
D
G
 
G
K
 
K
V
 
V
G
 
D
P
 
P
D
 
A
G
 
G
A
 
R
F
 
Y
W
 
F
V
 
A
G
 
G
T
 
T
M
 
M
H
 
A
D
 
E
V
 
E
P
 
T
D
 
A
-
 
P
-
 
A
-
 
V
-
 
L
R
 
E
R
 
R
P
 
H
V
 
Q
A
 
G
S
 
A
L
 
L
Y
 
Y
R
 
S
V
 
L
S
 
F
P
 
P
E
 
D
G
 
H
A
 
H
V
 
V
E
 
K
R
 
K
K
 
Y
V
 
F
E
 
D
G
 
Q
V
 
V
V
 
D
C
 
I
S
 
S
N
|
N
G
 
G
L
 
L
A
 
D
W
 
W
S
 
S
G
 
L
D
 
D
G
 
H
S
 
K
L
 
I
L
 
F
F
 
Y
H
 
Y
S
 
I
D
 
D
S
 
S
R
 
L
G
 
S
A
 
Y
W
 
S
I
 
V
D
 
D
R
 
A
W
 
F
Q
 
D
F
 
Y
D
 
D
P
 
L
A
 
Q
T
 
T
G
 
G
A
 
Q
L
 
I
S
 
S
G
 
N
R
 
R
R
 
R
R
 
S
L
 
V
A
 
Y
S
 
K
L
 
L
D
 
E
E
 
K
A
 
E
S
 
E
G
 
Q
R
 
I
P
 
P
D
|
D
G
 
G
A
 
M
A
 
C
T
 
I
D
 
D
A
 
A
E
 
E
A
 
G
H
 
K
Y
 
L
W
 
W
S
 
V
A
 
A
G
 
C
V
 
Y
S
 
N
A
 
G
G
 
G
I
 
R
V
 
V
N
 
I
R
 
R
F
 
L
S
 
D
P
 
P
-
 
V
E
 
T
G
 
G
R
 
K
L
 
R
V
 
L
G
 
Q
T
 
T
H
 
V
R
 
K
F
 
L
P
 
P
V
 
V
P
 
D
A
 
K
P
 
T
T
 
T
M
 
S
P
 
C
C
 
C
F
 
F
A
 
G
G
 
G
P
 
K
D
 
N
L
 
Y
K
 
S
T
 
E
L
 
M
L
 
Y
V
 
V
T
 
T
S
 
C
L
 
A
R
 
R
-
 
D
-
 
G
-
 
M
-
 
D
P
 
P
A
 
E
G
 
G
I
 
L
G
 
L
K
 
R
E
 
Q
N
 
P
R
 
E
S
 
A
G
 
G
G
 
G
I
 
I
F
 
F
-
 
K
V
 
I
A
 
T
R
 
G
S
 
L
P
 
G
V
 
V
A
 
K
G
 
G
V
 
I
A
 
A
V
 
P
H
 
Y
R
 
S
F
 
Y

3g4hA Crystal structure of human senescence marker protein-30 (zinc bound) (see paper)
31% identity, 97% coverage: 5:289/294 of query aligns to 2:295/297 of 3g4hA

query
sites
3g4hA
L
 
I
T
 
K
F
 
I
E
 
E
C
 
C
L
 
V
L
 
L
D
 
P
S
 
E
R
 
N
C
 
C
D
 
R
V
 
C
A
 
G
E
|
E
S
 
S
P
 
P
V
 
V
F
 
W
D
 
E
E
 
E
R
 
V
R
 
S
N
 
N
C
 
S
L
 
L
F
 
L
F
 
F
V
 
V
D
 
D
I
 
I
G
 
P
R
 
A
S
 
K
A
 
K
L
 
V
H
 
C
R
 
R
V
 
W
D
 
D
L
 
S
S
 
F
G
 
T
A
 
K
G
 
Q
H
 
V
V
 
Q
E
 
R
W
 
V
T
 
T
I
 
M
E
 
D
G
 
A
G
 
P
A
 
V
C
 
S
S
 
S
T
 
V
G
 
A
L
 
L
A
 
R
R
 
Q
S
 
S
G
 
G
R
 
G
L
 
Y
V
 
V
L
 
A
A
 
T
Q
 
I
R
 
G
D
 
T
R
 
K
V
 
F
V
 
C
L
 
A
F
 
L
D
 
N
-
 
W
P
 
K
D
 
E
A
 
Q
G
 
S
A
 
A
V
 
V
T
 
V
R
 
-
E
 
-
I
 
L
A
 
A
A
 
T
I
 
V
E
 
D
P
 
N
D
 
D
I
 
K
A
 
K
D
 
N
T
 
N
R
 
R
L
 
F
N
 
N
D
 
D
G
 
G
K
 
K
V
 
V
G
 
D
P
 
P
D
 
A
G
 
G
A
 
R
F
 
Y
W
 
F
V
 
A
G
 
G
T
 
T
M
 
M
H
 
A
D
 
E
V
 
E
P
 
T
D
 
A
-
 
P
-
 
A
-
 
V
-
 
L
R
 
E
R
 
R
P
 
H
V
 
Q
A
 
G
S
 
A
L
 
L
Y
 
Y
R
 
S
V
 
L
S
 
F
P
 
P
E
 
D
G
 
H
A
 
H
V
 
V
E
 
K
R
 
K
K
 
Y
V
 
F
E
 
D
G
 
Q
V
 
V
V
 
D
C
 
I
S
 
S
N
|
N
G
 
G
L
 
L
A
 
D
W
 
W
S
 
S
G
 
L
D
 
D
G
 
H
S
 
K
L
 
I
L
 
F
F
 
Y
H
 
Y
S
 
I
D
 
D
S
 
S
R
 
L
G
 
S
A
 
Y
W
 
S
I
 
V
D
 
D
R
 
A
W
 
F
Q
 
D
F
 
Y
D
 
D
P
 
L
A
 
Q
T
 
T
G
 
G
A
 
Q
L
 
I
S
 
S
G
 
N
R
 
R
R
 
R
R
 
S
L
 
V
A
 
Y
S
 
K
L
 
L
D
 
E
E
 
K
A
 
E
S
 
E
G
 
Q
R
 
I
P
 
P
D
|
D
G
 
G
A
 
M
A
 
C
T
 
I
D
 
D
A
 
A
E
 
E
A
 
G
H
 
K
Y
 
L
W
 
W
S
 
V
A
 
A
G
 
C
V
 
Y
S
 
N
A
 
G
G
 
G
I
 
R
V
 
V
N
 
I
R
 
R
F
 
L
S
 
D
P
 
P
-
 
V
E
 
T
G
 
G
R
 
K
L
 
R
V
 
L
G
 
Q
T
 
T
H
 
V
R
 
K
F
 
L
P
 
P
V
 
V
P
 
D
A
 
K
P
 
T
T
 
T
M
 
S
P
 
C
C
 
C
F
 
F
A
 
G
G
 
G
P
 
K
D
 
N
L
 
Y
K
 
S
T
 
E
L
 
M
L
 
Y
V
 
V
T
 
T
S
 
C
L
 
A
R
 
R
-
 
D
-
 
G
-
 
M
-
 
D
P
 
P
A
 
E
G
 
G
I
 
L
G
 
L
K
 
R
E
 
Q
N
 
P
R
 
E
S
 
A
G
 
G
G
 
G
I
 
I
F
 
F
-
 
K
V
 
I
A
 
T
R
 
G
S
 
L
P
 
G
V
 
V
A
 
K
G
 
G
V
 
I
A
 
A
V
 
P
H
 
Y
R
 
S
F
 
Y

4gncA Human smp30/gnl-1,5-ag complex (see paper)
31% identity, 97% coverage: 5:289/294 of query aligns to 3:296/298 of 4gncA

query
sites
4gncA
L
 
I
T
 
K
F
 
I
E
 
E
C
 
C
L
 
V
L
 
L
D
 
P
S
 
E
R
 
N
C
 
C
D
 
R
V
x
C
A
 
G
E
|
E
S
 
S
P
 
P
V
 
V
F
 
W
D
 
E
E
 
E
R
 
V
R
 
S
N
 
N
C
 
S
L
 
L
F
 
L
F
 
F
V
 
V
D
 
D
I
|
I
G
 
P
R
 
A
S
 
K
A
 
K
L
 
V
H
 
C
R
 
R
V
 
W
D
 
D
L
 
S
S
 
F
G
 
T
A
 
K
G
 
Q
H
 
V
V
 
Q
E
 
R
W
 
V
T
 
T
I
 
M
E
 
D
G
 
A
G
 
P
A
 
V
C
 
S
S
 
S
T
 
V
G
 
A
L
 
L
A
 
R
R
 
Q
S
 
S
G
 
G
R
 
G
L
 
Y
V
 
V
L
 
A
A
 
T
Q
 
I
R
 
G
D
 
T
R
 
K
V
 
F
V
 
C
L
 
A
F
 
L
D
 
N
-
 
W
P
 
K
D
 
E
A
 
Q
G
 
S
A
 
A
V
 
V
T
 
V
R
 
-
E
 
-
I
 
L
A
 
A
A
 
T
I
 
V
E
 
D
P
 
N
D
 
D
I
 
K
A
 
K
D
 
N
T
 
N
R
|
R
L
 
F
N
|
N
D
|
D
G
 
G
K
 
K
V
 
V
G
 
D
P
 
P
D
 
A
G
 
G
A
 
R
F
 
Y
W
 
F
V
 
A
G
 
G
T
 
T
M
|
M
H
 
A
D
 
E
V
 
E
P
 
T
D
 
A
-
 
P
-
 
A
-
 
V
-
 
L
R
 
E
R
 
R
P
 
H
V
 
Q
A
 
G
S
 
A
L
 
L
Y
 
Y
R
 
S
V
 
L
S
 
F
P
 
P
E
 
D
G
 
H
A
 
H
V
 
V
E
 
K
R
 
K
K
 
Y
V
 
F
E
 
D
G
 
Q
V
 
V
V
 
D
C
 
I
S
 
S
N
|
N
G
 
G
L
 
L
A
 
D
W
 
W
S
 
S
G
 
L
D
 
D
G
 
H
S
 
K
L
 
I
L
 
F
F
 
Y
H
 
Y
S
 
I
D
 
D
S
 
S
R
 
L
G
 
S
A
 
Y
W
 
S
I
 
V
D
 
D
R
 
A
W
 
F
Q
 
D
F
 
Y
D
 
D
P
 
L
A
 
Q
T
 
T
G
 
G
A
 
Q
L
 
I
S
 
S
G
 
N
R
 
R
R
 
R
R
 
S
L
 
V
A
 
Y
S
 
K
L
 
L
D
 
E
E
 
K
A
 
E
S
 
E
G
 
Q
R
 
I
P
 
P
D
|
D
G
 
G
A
 
M
A
 
C
T
 
I
D
 
D
A
 
A
E
 
E
A
 
G
H
 
K
Y
 
L
W
 
W
S
 
V
A
 
A
G
 
C
V
x
Y
S
 
N
A
 
G
G
 
G
I
 
R
V
 
V
N
 
I
R
 
R
F
 
L
S
 
D
P
 
P
-
 
V
E
 
T
G
 
G
R
 
K
L
 
R
V
 
L
G
 
Q
T
 
T
H
 
V
R
 
K
F
 
L
P
 
P
V
 
V
P
 
D
A
 
K
P
 
T
T
|
T
M
 
S
P
 
C
C
 
C
F
 
F
A
 
G
G
 
G
P
 
K
D
x
N
L
x
Y
K
 
S
T
 
E
L
 
M
L
 
Y
V
 
V
T
 
T
S
 
C
L
 
A
R
 
R
-
 
D
-
 
G
-
 
M
-
 
D
P
 
P
A
 
E
G
 
G
I
 
L
G
 
L
K
 
R
E
 
Q
N
 
P
R
 
E
S
 
A
G
 
G
G
 
G
I
 
I
F
 
F
-
 
K
V
 
I
A
 
T
R
 
G
S
 
L
P
 
G
V
 
V
A
 
K
G
|
G
V
x
I
A
|
A
V
 
P
H
 
Y
R
 
S
F
 
Y

4gnaA Mouse smp30/gnl-xylitol complex (see paper)
30% identity, 97% coverage: 5:289/294 of query aligns to 2:295/297 of 4gnaA

query
sites
4gnaA
L
 
I
T
 
K
F
 
V
E
 
E
C
 
C
L
 
V
L
 
L
D
 
R
S
 
E
R
 
N
C
 
Y
D
 
R
V
 
C
A
 
G
E
|
E
S
 
S
P
 
P
V
 
V
F
 
W
D
 
E
E
 
E
R
 
A
R
 
S
N
 
Q
C
 
S
L
 
L
F
 
L
F
 
F
V
 
V
D
 
D
I
 
I
G
 
P
R
 
S
S
 
K
A
 
I
L
 
I
H
 
C
R
 
R
V
 
W
D
 
D
L
 
T
S
 
V
G
 
S
A
 
N
G
 
Q
H
 
V
V
 
Q
E
 
R
W
 
V
T
 
A
I
 
V
E
 
D
G
 
A
G
 
P
A
 
V
C
 
S
S
 
S
T
 
V
G
 
A
L
 
L
A
 
R
R
 
Q
S
 
L
G
 
G
R
 
G
L
 
Y
V
 
V
L
 
A
A
 
T
Q
 
I
R
 
G
D
 
T
R
 
K
V
 
F
V
 
C
L
 
A
F
 
L
D
 
N
P
 
W
D
 
E
A
 
N
G
 
Q
A
 
S
V
 
V
T
 
F
R
 
V
E
 
-
I
 
L
A
 
A
A
 
M
I
 
V
E
 
D
P
 
E
D
 
D
I
 
K
A
 
K
D
 
N
T
 
N
R
|
R
L
 
F
N
|
N
D
 
D
G
 
G
K
 
K
V
 
V
G
 
D
P
 
P
D
 
A
G
 
G
A
 
R
F
 
Y
W
 
F
V
 
A
G
 
G
T
 
T
M
 
M
H
 
A
D
 
E
V
x
E
P
 
T
D
 
A
-
x
P
-
 
A
-
 
V
-
 
L
R
 
E
R
 
R
P
 
H
V
 
Q
A
 
G
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
R
 
S
V
 
L
S
 
F
P
 
P
E
 
D
G
 
H
A
 
S
V
 
V
E
 
K
R
 
K
K
 
Y
V
 
F
E
 
D
G
 
Q
V
 
V
V
 
D
C
 
I
S
 
S
N
|
N
G
 
G
L
 
L
A
 
D
W
 
W
S
 
S
G
 
L
D
 
D
G
 
H
S
 
K
L
 
I
L
 
F
F
 
Y
H
 
Y
S
 
I
D
 
D
S
 
S
R
 
L
G
 
S
A
 
Y
W
 
T
I
 
V
D
 
D
R
 
A
W
 
F
Q
 
D
F
 
Y
D
 
D
P
 
L
A
 
Q
T
 
T
G
 
G
A
 
Q
L
 
I
S
 
S
G
 
N
R
 
R
R
 
R
R
 
I
L
 
V
A
 
Y
S
 
K
L
 
M
D
 
E
E
 
K
A
 
D
S
 
E
G
 
Q
R
 
I
P
 
P
D
|
D
G
 
G
A
 
M
A
 
C
T
 
I
D
 
D
A
 
A
E
 
E
A
 
G
H
 
K
Y
 
L
W
 
W
S
 
V
A
 
A
G
 
C
V
x
Y
S
 
N
A
 
G
G
 
G
I
 
R
V
 
V
N
 
I
R
 
R
F
 
L
S
 
D
P
 
P
E
 
E
-
 
T
G
 
G
R
 
K
L
 
R
V
 
L
G
 
Q
T
 
T
H
 
V
R
 
K
F
 
L
P
 
P
V
 
V
P
 
D
A
 
K
P
 
T
T
 
T
M
 
S
P
 
C
C
 
C
F
 
F
A
 
G
G
 
G
P
 
K
D
 
D
L
 
Y
K
 
S
T
 
E
L
 
M
L
 
Y
V
 
V
T
 
T
S
 
C
-
 
A
-
 
R
-
 
D
-
 
G
L
 
L
R
 
N
P
 
A
A
 
E
G
 
G
I
 
L
G
 
L
K
 
R
E
 
Q
N
 
P
R
 
D
S
 
A
G
 
G
G
 
N
I
 
I
F
 
F
-
 
K
V
 
I
A
 
T
R
 
G
S
 
L
P
 
G
V
 
V
A
 
K
G
 
G
V
 
I
A
 
A
V
 
P
H
 
Y
R
 
S
F
 
Y

4gn9A Mouse smp30/gnl-glucose complex (see paper)
30% identity, 97% coverage: 5:289/294 of query aligns to 2:295/297 of 4gn9A

query
sites
4gn9A
L
 
I
T
 
K
F
 
V
E
 
E
C
 
C
L
 
V
L
 
L
D
 
R
S
 
E
R
 
N
C
 
Y
D
 
R
V
 
C
A
 
G
E
|
E
S
 
S
P
 
P
V
 
V
F
 
W
D
x
E
E
 
E
R
 
A
R
 
S
N
 
Q
C
 
S
L
 
L
F
 
L
F
 
F
V
 
V
D
 
D
I
 
I
G
 
P
R
 
S
S
 
K
A
 
I
L
 
I
H
 
C
R
|
R
V
 
W
D
 
D
L
 
T
S
 
V
G
 
S
A
 
N
G
 
Q
H
 
V
V
 
Q
E
 
R
W
 
V
T
 
A
I
 
V
E
 
D
G
 
A
G
 
P
A
 
V
C
 
S
S
 
S
T
 
V
G
 
A
L
 
L
A
 
R
R
 
Q
S
 
L
G
|
G
R
x
G
L
x
Y
V
 
V
L
 
A
A
 
T
Q
 
I
R
 
G
D
 
T
R
 
K
V
 
F
V
 
C
L
 
A
F
 
L
D
x
N
P
x
W
D
x
E
A
 
N
G
 
Q
A
 
S
V
 
V
T
 
F
R
 
V
E
 
-
I
 
L
A
 
A
A
 
M
I
x
V
E
x
D
P
x
E
D
|
D
I
 
K
A
 
K
D
 
N
T
 
N
R
|
R
L
 
F
N
|
N
D
 
D
G
 
G
K
 
K
V
 
V
G
 
D
P
 
P
D
 
A
G
 
G
A
 
R
F
 
Y
W
 
F
V
 
A
G
 
G
T
 
T
M
 
M
H
 
A
D
 
E
V
x
E
P
 
T
D
 
A
-
 
P
-
 
A
-
 
V
-
 
L
R
 
E
R
 
R
P
 
H
V
 
Q
A
 
G
S
 
S
L
 
L
Y
|
Y
R
 
S
V
 
L
S
 
F
P
 
P
E
 
D
G
 
H
A
 
S
V
 
V
E
 
K
R
x
K
K
 
Y
V
 
F
E
 
D
G
 
Q
V
 
V
V
 
D
C
x
I
S
 
S
N
|
N
G
 
G
L
 
L
A
 
D
W
 
W
S
 
S
G
 
L
D
 
D
G
 
H
S
 
K
L
 
I
L
 
F
F
 
Y
H
 
Y
S
 
I
D
 
D
S
|
S
R
 
L
G
 
S
A
 
Y
W
 
T
I
 
V
D
 
D
R
 
A
W
 
F
Q
 
D
F
 
Y
D
 
D
P
 
L
A
 
Q
T
 
T
G
 
G
A
 
Q
L
 
I
S
 
S
G
 
N
R
 
R
R
 
R
R
 
I
L
 
V
A
 
Y
S
 
K
L
 
M
D
 
E
E
 
K
A
 
D
S
 
E
G
 
Q
R
x
I
P
 
P
D
|
D
G
 
G
A
 
M
A
 
C
T
 
I
D
 
D
A
 
A
E
 
E
A
 
G
H
 
K
Y
 
L
W
 
W
S
 
V
A
 
A
G
 
C
V
x
Y
S
 
N
A
 
G
G
 
G
I
 
R
V
 
V
N
 
I
R
 
R
F
 
L
S
 
D
P
 
P
E
 
E
-
 
T
G
 
G
R
 
K
L
 
R
V
 
L
G
 
Q
T
 
T
H
 
V
R
 
K
F
 
L
P
 
P
V
 
V
P
 
D
A
 
K
P
 
T
T
 
T
M
 
S
P
 
C
C
 
C
F
 
F
A
 
G
G
 
G
P
 
K
D
 
D
L
 
Y
K
 
S
T
 
E
L
 
M
L
 
Y
V
 
V
T
 
T
S
 
C
-
 
A
-
 
R
-
 
D
-
 
G
L
 
L
R
 
N
P
 
A
A
 
E
G
 
G
I
 
L
G
 
L
K
 
R
E
 
Q
N
 
P
R
 
D
S
 
A
G
 
G
G
 
N
I
 
I
F
 
F
-
 
K
V
 
I
A
 
T
R
 
G
S
 
L
P
 
G
V
 
V
A
 
K
G
 
G
V
 
I
A
 
A
V
 
P
H
 
Y
R
 
S
F
 
Y

4gn8A Mouse smp30/gnl-1,5-ag complex (see paper)
30% identity, 97% coverage: 5:289/294 of query aligns to 2:295/297 of 4gn8A

query
sites
4gn8A
L
 
I
T
 
K
F
 
V
E
 
E
C
 
C
L
 
V
L
 
L
D
 
R
S
 
E
R
 
N
C
 
Y
D
 
R
V
 
C
A
 
G
E
|
E
S
 
S
P
 
P
V
 
V
F
 
W
D
 
E
E
 
E
R
 
A
R
 
S
N
 
Q
C
 
S
L
 
L
F
 
L
F
 
F
V
 
V
D
 
D
I
 
I
G
 
P
R
 
S
S
 
K
A
 
I
L
 
I
H
 
C
R
 
R
V
 
W
D
 
D
L
 
T
S
 
V
G
 
S
A
 
N
G
 
Q
H
 
V
V
 
Q
E
 
R
W
 
V
T
 
A
I
 
V
E
 
D
G
 
A
G
 
P
A
 
V
C
 
S
S
 
S
T
 
V
G
 
A
L
 
L
A
 
R
R
x
Q
S
 
L
G
 
G
R
 
G
L
 
Y
V
 
V
L
 
A
A
 
T
Q
 
I
R
 
G
D
 
T
R
 
K
V
 
F
V
 
C
L
 
A
F
 
L
D
 
N
P
 
W
D
 
E
A
 
N
G
 
Q
A
 
S
V
 
V
T
 
F
R
 
V
E
 
-
I
 
L
A
 
A
A
 
M
I
 
V
E
 
D
P
 
E
D
 
D
I
 
K
A
 
K
D
 
N
T
 
N
R
|
R
L
 
F
N
|
N
D
 
D
G
 
G
K
 
K
V
 
V
G
 
D
P
|
P
D
x
A
G
|
G
A
 
R
F
 
Y
W
 
F
V
 
A
G
 
G
T
 
T
M
 
M
H
 
A
D
 
E
V
x
E
P
 
T
D
 
A
-
x
P
-
 
A
-
 
V
-
 
L
R
 
E
R
 
R
P
 
H
V
 
Q
A
 
G
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
R
 
S
V
 
L
S
 
F
P
 
P
E
 
D
G
 
H
A
 
S
V
 
V
E
 
K
R
 
K
K
 
Y
V
 
F
E
 
D
G
 
Q
V
 
V
V
 
D
C
 
I
S
 
S
N
|
N
G
 
G
L
 
L
A
 
D
W
 
W
S
 
S
G
 
L
D
 
D
G
 
H
S
 
K
L
x
I
L
 
F
F
x
Y
H
 
Y
S
 
I
D
 
D
S
 
S
R
 
L
G
 
S
A
 
Y
W
 
T
I
 
V
D
 
D
R
x
A
W
 
F
Q
 
D
F
 
Y
D
|
D
P
 
L
A
x
Q
T
|
T
G
 
G
A
 
Q
L
 
I
S
 
S
G
 
N
R
 
R
R
|
R
R
 
I
L
x
V
A
 
Y
S
 
K
L
 
M
D
 
E
E
 
K
A
 
D
S
 
E
G
 
Q
R
 
I
P
 
P
D
|
D
G
 
G
A
 
M
A
 
C
T
 
I
D
 
D
A
 
A
E
 
E
A
 
G
H
 
K
Y
 
L
W
 
W
S
 
V
A
 
A
G
 
C
V
x
Y
S
 
N
A
 
G
G
 
G
I
 
R
V
 
V
N
 
I
R
 
R
F
 
L
S
 
D
P
|
P
E
 
E
-
 
T
G
 
G
R
 
K
L
 
R
V
 
L
G
 
Q
T
 
T
H
 
V
R
 
K
F
 
L
P
 
P
V
 
V
P
 
D
A
 
K
P
 
T
T
 
T
M
 
S
P
 
C
C
 
C
F
 
F
A
 
G
G
 
G
P
 
K
D
 
D
L
 
Y
K
 
S
T
 
E
L
 
M
L
 
Y
V
 
V
T
 
T
S
 
C
-
 
A
-
 
R
-
 
D
-
 
G
L
 
L
R
 
N
P
 
A
A
 
E
G
 
G
I
 
L
G
 
L
K
 
R
E
 
Q
N
 
P
R
 
D
S
 
A
G
 
G
G
 
N
I
 
I
F
 
F
-
 
K
V
 
I
A
 
T
R
 
G
S
 
L
P
 
G
V
 
V
A
 
K
G
 
G
V
 
I
A
 
A
V
 
P
H
x
Y
R
x
S
F
 
Y

Sites not aligning to the query:

4gn7A Mouse smp30/gnl (see paper)
30% identity, 97% coverage: 5:289/294 of query aligns to 2:295/297 of 4gn7A

query
sites
4gn7A
L
 
I
T
 
K
F
 
V
E
 
E
C
 
C
L
 
V
L
 
L
D
 
R
S
 
E
R
 
N
C
 
Y
D
 
R
V
 
C
A
 
G
E
|
E
S
 
S
P
 
P
V
 
V
F
 
W
D
 
E
E
 
E
R
 
A
R
 
S
N
 
Q
C
 
S
L
 
L
F
 
L
F
 
F
V
 
V
D
 
D
I
 
I
G
 
P
R
 
S
S
 
K
A
 
I
L
 
I
H
 
C
R
 
R
V
 
W
D
 
D
L
 
T
S
 
V
G
 
S
A
 
N
G
 
Q
H
 
V
V
 
Q
E
 
R
W
 
V
T
 
A
I
 
V
E
 
D
G
 
A
G
 
P
A
 
V
C
 
S
S
 
S
T
 
V
G
 
A
L
 
L
A
 
R
R
 
Q
S
 
L
G
 
G
R
 
G
L
 
Y
V
 
V
L
 
A
A
 
T
Q
 
I
R
 
G
D
 
T
R
 
K
V
 
F
V
 
C
L
 
A
F
 
L
D
 
N
P
 
W
D
 
E
A
 
N
G
 
Q
A
 
S
V
 
V
T
 
F
R
 
V
E
 
-
I
 
L
A
 
A
A
 
M
I
 
V
E
 
D
P
 
E
D
 
D
I
 
K
A
 
K
D
 
N
T
 
N
R
 
R
L
 
F
N
 
N
D
 
D
G
 
G
K
 
K
V
 
V
G
 
D
P
 
P
D
 
A
G
 
G
A
 
R
F
 
Y
W
 
F
V
 
A
G
 
G
T
 
T
M
 
M
H
 
A
D
 
E
V
 
E
P
 
T
D
 
A
-
 
P
-
 
A
-
 
V
-
 
L
R
 
E
R
 
R
P
 
H
V
 
Q
A
 
G
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
R
 
S
V
 
L
S
 
F
P
 
P
E
 
D
G
 
H
A
 
S
V
 
V
E
 
K
R
 
K
K
 
Y
V
 
F
E
 
D
G
 
Q
V
 
V
V
 
D
C
 
I
S
 
S
N
|
N
G
 
G
L
 
L
A
 
D
W
 
W
S
 
S
G
 
L
D
 
D
G
 
H
S
 
K
L
 
I
L
 
F
F
 
Y
H
 
Y
S
 
I
D
 
D
S
 
S
R
 
L
G
 
S
A
 
Y
W
 
T
I
 
V
D
 
D
R
 
A
W
 
F
Q
 
D
F
 
Y
D
 
D
P
 
L
A
 
Q
T
 
T
G
 
G
A
 
Q
L
 
I
S
 
S
G
 
N
R
 
R
R
 
R
R
 
I
L
 
V
A
 
Y
S
 
K
L
 
M
D
 
E
E
 
K
A
 
D
S
 
E
G
 
Q
R
 
I
P
 
P
D
|
D
G
 
G
A
 
M
A
 
C
T
 
I
D
 
D
A
 
A
E
 
E
A
 
G
H
 
K
Y
 
L
W
 
W
S
 
V
A
 
A
G
 
C
V
 
Y
S
 
N
A
 
G
G
 
G
I
 
R
V
 
V
N
 
I
R
 
R
F
 
L
S
 
D
P
 
P
E
 
E
-
 
T
G
 
G
R
 
K
L
 
R
V
 
L
G
 
Q
T
 
T
H
 
V
R
 
K
F
 
L
P
 
P
V
 
V
P
 
D
A
 
K
P
 
T
T
 
T
M
 
S
P
 
C
C
 
C
F
 
F
A
 
G
G
 
G
P
 
K
D
 
D
L
 
Y
K
 
S
T
 
E
L
 
M
L
 
Y
V
 
V
T
 
T
S
 
C
-
 
A
-
 
R
-
 
D
-
 
G
L
 
L
R
 
N
P
 
A
A
 
E
G
 
G
I
 
L
G
 
L
K
 
R
E
 
Q
N
 
P
R
 
D
S
 
A
G
 
G
G
 
N
I
 
I
F
 
F
-
 
K
V
 
I
A
 
T
R
 
G
S
 
L
P
 
G
V
 
V
A
 
K
G
 
G
V
 
I
A
 
A
V
 
P
H
 
Y
R
 
S
F
 
Y

5gx1A Luciferin-regenerating enzyme collected with serial synchrotron rotational crystallography with accumulated dose of 1.1 mgy (1st measurement) (see paper)
30% identity, 84% coverage: 14:259/294 of query aligns to 12:270/307 of 5gx1A

query
sites
5gx1A
R
 
K
C
 
Y
D
 
T
V
 
V
A
 
G
E
|
E
S
 
G
P
 
P
V
 
H
F
 
W
D
 
D
E
 
H
R
 
E
R
 
T
N
 
Q
C
 
T
L
 
L
F
 
Y
F
 
F
V
 
V
D
 
D
I
 
T
G
 
V
R
 
E
S
 
K
A
 
T
L
 
F
H
 
H
R
 
K
V
 
Y
D
 
V
L
 
P
S
 
S
G
 
Q
A
 
K
G
 
K
H
 
Y
V
 
T
E
 
F
W
x
C
T
 
K
I
 
V
E
 
D
G
 
K
-
 
L
G
 
V
A
 
S
C
 
F
S
 
I
T
 
I
G
 
P
L
 
L
A
 
A
R
 
G
S
 
S
-
 
P
G
 
G
R
 
R
L
 
F
V
 
V
L
 
V
A
 
S
Q
 
L
R
 
E
D
 
R
R
 
E
V
 
I
V
 
A
L
 
I
F
x
L
D
 
T
P
x
W
D
 
D
-
 
G
-
 
V
-
 
S
-
 
A
A
 
A
G
 
P
A
 
T
V
 
S
T
 
I
R
 
E
E
 
A
I
 
I
A
 
V
A
 
N
I
 
V
E
 
E
P
 
P
D
 
H
I
 
I
A
 
K
D
 
N
T
 
N
R
 
R
L
 
L
N
 
N
D
 
D
G
 
G
K
 
K
V
 
A
G
 
D
P
 
P
D
 
L
G
 
G
A
 
N
F
 
L
W
 
W
V
 
T
G
 
G
T
 
T
M
 
M
H
 
A
-
 
I
-
 
D
-
 
A
D
 
G
V
 
L
P
 
P
D
 
I
R
 
G
R
 
P
P
 
V
V
 
T
A
 
G
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
R
 
H
V
 
L
S
 
G
P
 
A
E
 
D
G
 
K
A
 
K
V
 
V
E
 
K
R
 
M
K
 
H
V
 
E
E
 
S
G
 
N
V
 
I
V
 
A
C
 
I
S
 
A
N
|
N
G
 
G
L
 
L
A
 
A
W
 
W
S
 
S
G
 
N
D
 
D
G
 
L
S
 
K
L
 
K
L
 
M
F
 
Y
H
 
Y
S
 
I
D
 
D
S
 
S
R
 
G
G
 
K
A
 
R
W
 
R
I
 
V
D
 
D
R
 
E
W
 
Y
Q
 
D
F
 
Y
D
 
D
P
 
A
A
 
S
T
 
T
G
 
L
A
 
S
L
 
I
S
 
S
G
 
N
R
 
Q
R
 
R
R
 
P
L
 
L
A
 
F
S
 
T
L
 
F
D
 
E
-
 
K
-
 
H
E
 
E
A
 
V
S
 
P
G
 
G
R
 
Y
P
 
P
D
|
D
G
 
G
A
 
Q
A
 
T
T
 
I
D
 
D
A
 
E
E
 
E
A
 
G
H
 
N
Y
 
L
W
 
W
S
 
V
A
 
A
G
 
V
V
 
F
S
 
Q
A
 
G
G
 
Q
I
 
R
V
 
I
N
 
I
R
 
K
F
 
I
S
 
S
P
 
T
E
 
Q
G
 
Q
-
 
P
-
 
E
R
 
V
L
 
L
V
 
L
G
 
D
T
 
T
H
 
V
R
 
K
F
 
I
P
 
P
V
 
D
P
 
P
A
 
Q
P
 
V
T
 
T
M
 
S
P
 
V
C
 
A
F
 
F
A
 
G
G
 
G
P
 
P
D
 
N
L
 
L
K
 
D
T
 
E
L
 
L
L
 
Y
V
 
V
T
 
T
S
 
S

5d9bA Luciferin-regenerating enzyme solved by siras using xfel (refined against native data) (see paper)
30% identity, 84% coverage: 14:259/294 of query aligns to 12:270/307 of 5d9bA

query
sites
5d9bA
R
 
K
C
 
Y
D
 
T
V
 
V
A
 
G
E
|
E
S
 
G
P
 
P
V
 
H
F
 
W
D
 
D
E
 
H
R
 
E
R
 
T
N
 
Q
C
 
T
L
 
L
F
 
Y
F
 
F
V
 
V
D
 
D
I
 
T
G
 
V
R
 
E
S
 
K
A
 
T
L
 
F
H
 
H
R
 
K
V
 
Y
D
 
V
L
 
P
S
 
S
G
 
Q
A
 
K
G
 
K
H
 
Y
V
 
T
E
 
F
W
 
C
T
 
K
I
 
V
E
 
D
G
 
K
-
 
L
G
 
V
A
 
S
C
 
F
S
 
I
T
 
I
G
 
P
L
 
L
A
 
A
R
 
G
S
 
S
-
 
P
G
 
G
R
 
R
L
 
F
V
 
V
L
 
V
A
 
S
Q
 
L
R
 
E
D
 
R
R
 
E
V
 
I
V
 
A
L
 
I
F
 
L
D
 
T
P
 
W
D
 
D
-
 
G
-
 
V
-
 
S
-
 
A
A
 
A
G
 
P
A
 
T
V
 
S
T
 
I
R
 
E
E
 
A
I
 
I
A
 
V
A
 
N
I
 
V
E
 
E
P
 
P
D
 
H
I
 
I
A
 
K
D
 
N
T
 
N
R
 
R
L
 
L
N
 
N
D
 
D
G
 
G
K
 
K
V
 
A
G
 
D
P
 
P
D
 
L
G
 
G
A
 
N
F
 
L
W
 
W
V
 
T
G
 
G
T
 
T
M
 
M
H
 
A
-
 
I
-
 
D
-
 
A
D
 
G
V
 
L
P
 
P
D
 
I
R
 
G
R
 
P
P
 
V
V
 
T
A
 
G
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
R
 
H
V
 
L
S
 
G
P
 
A
E
 
D
G
 
K
A
 
K
V
 
V
E
 
K
R
 
M
K
 
H
V
 
E
E
 
S
G
 
N
V
 
I
V
 
A
C
 
I
S
 
A
N
|
N
G
 
G
L
 
L
A
 
A
W
 
W
S
 
S
G
 
N
D
 
D
G
 
L
S
 
K
L
 
K
L
 
M
F
 
Y
H
 
Y
S
 
I
D
 
D
S
 
S
R
 
G
G
 
K
A
 
R
W
 
R
I
 
V
D
 
D
R
 
E
W
 
Y
Q
 
D
F
 
Y
D
 
D
P
 
A
A
 
S
T
 
T
G
 
L
A
 
S
L
 
I
S
 
S
G
 
N
R
 
Q
R
 
R
R
 
P
L
 
L
A
 
F
S
 
T
L
 
F
D
 
E
-
 
K
-
 
H
E
 
E
A
 
V
S
 
P
G
 
G
R
 
Y
P
 
P
D
|
D
G
 
G
A
 
Q
A
 
T
T
 
I
D
 
D
A
 
E
E
 
E
A
 
G
H
 
N
Y
 
L
W
 
W
S
 
V
A
 
A
G
 
V
V
 
F
S
 
Q
A
 
G
G
 
Q
I
 
R
V
 
I
N
 
I
R
 
K
F
 
I
S
 
S
P
 
T
E
 
Q
G
 
Q
-
 
P
-
 
E
R
 
V
L
 
L
V
 
L
G
 
D
T
 
T
H
 
V
R
 
K
F
 
I
P
 
P
V
 
D
P
 
P
A
 
Q
P
 
V
T
 
T
M
 
S
P
 
V
C
 
A
F
 
F
A
 
G
G
 
G
P
 
P
D
 
N
L
 
L
K
 
D
T
 
E
L
 
L
L
 
Y
V
 
V
T
 
T
S
 
S

Q9A9Z1 D-xylonolactone lactonase; Xylono-1,5-lactonase; EC 3.1.1.110 from Caulobacter vibrioides (strain ATCC 19089 / CB15) (Caulobacter crescentus) (see paper)
31% identity, 95% coverage: 9:288/294 of query aligns to 7:285/289 of Q9A9Z1

query
sites
Q9A9Z1
C
 
C
L
 
V
L
 
W
D
 
D
S
 
L
R
 
K
C
 
A
D
 
T
V
 
L
A
 
G
E
|
E
S
 
G
P
 
P
V
 
I
F
 
W
D
 
-
E
 
-
R
 
H
R
 
G
N
 
D
C
 
T
L
 
L
F
 
W
F
 
F
V
 
V
D
 
D
I
 
I
G
 
K
R
 
Q
S
 
R
A
 
K
L
 
I
H
 
H
R
 
-
V
 
-
D
 
N
L
 
Y
S
 
H
G
 
P
A
 
A
G
 
T
H
 
G
V
 
E
E
 
R
W
 
F
T
 
S
I
 
F
E
 
D
G
 
A
G
 
P
A
 
D
C
 
Q
S
 
V
T
 
T
G
 
F
L
 
L
A
 
A
R
 
P
-
 
I
-
 
V
-
 
G
S
 
A
G
 
T
R
 
G
L
 
F
V
 
V
L
 
V
A
 
G
Q
 
L
R
 
K
D
 
T
R
 
G
V
 
I
V
 
H
L
 
R
F
 
F
D
 
H
P
 
P
D
 
A
A
 
T
G
 
G
A
 
F
V
 
-
T
 
-
R
 
S
E
 
L
I
 
L
A
 
L
A
 
E
I
 
V
E
 
E
P
 
D
D
 
A
I
 
A
A
 
L
D
 
N
T
 
N
R
 
R
L
 
P
N
 
N
D
 
D
G
 
A
K
 
T
V
 
V
G
 
D
P
 
A
D
 
Q
G
 
G
A
 
R
F
 
L
W
 
W
V
 
F
G
 
G
T
 
T
M
 
M
H
 
H
D
 
D
V
 
G
P
 
E
D
 
E
R
 
N
R
 
N
P
 
S
V
 
-
A
 
G
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
R
 
R
V
 
M
S
 
D
P
 
L
E
 
T
G
 
G
A
 
-
V
 
V
E
 
A
R
 
R
K
 
M
V
 
D
E
 
R
G
 
D
V
 
I
V
 
C
C
 
I
S
 
T
N
|
N
G
 
G
L
 
P
A
 
C
W
 
V
S
 
S
G
 
P
D
 
D
G
 
G
S
 
K
L
 
T
L
 
F
F
 
Y
H
 
H
S
 
T
D
 
D
S
 
T
R
 
L
G
 
E
A
 
K
W
 
T
I
 
I
D
 
-
R
 
-
W
 
Y
Q
 
A
F
 
F
D
 
D
P
 
L
A
 
A
T
 
E
-
 
D
G
 
G
A
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
N
R
 
K
R
 
R
R
 
V
L
 
F
A
 
V
S
 
Q
L
 
F
D
 
A
E
 
L
A
 
G
S
 
D
G
 
D
-
 
V
R
 
Y
P
 
P
D
|
D
G
 
G
A
 
S
A
 
V
T
 
V
D
 
D
A
 
S
E
 
E
A
 
G
H
 
Y
Y
 
L
W
 
W
S
 
T
A
 
A
G
 
L
V
 
W
S
 
G
A
 
G
G
 
F
I
 
G
V
 
A
N
 
V
R
 
R
F
 
F
S
 
S
P
 
P
E
 
Q
G
 
G
R
 
D
L
 
A
V
 
V
G
 
T
T
 
R
H
 
I
R
 
E
F
 
L
P
 
P
V
 
A
P
 
P
A
 
N
P
 
V
T
 
T
M
 
K
P
 
P
C
 
C
F
 
F
A
 
G
G
 
G
P
 
P
D
 
D
L
 
L
K
 
K
T
 
T
L
 
L
L
 
Y
V
 
F
T
 
T
S
 
T
L
 
A
R
 
R
P
 
-
A
 
K
G
 
G
I
 
L
G
 
S
K
 
D
E
 
E
N
 
T
-
 
L
-
 
A
-
 
Q
-
 
Y
-
 
P
R
 
L
S
 
A
G
 
G
G
 
G
I
 
V
F
 
F
V
 
A
A
 
V
R
 
P
S
 
V
P
 
D
V
 
V
A
 
A
G
 
G
V
 
Q
A
 
P
V
 
Q
H
 
H
R
 
E

7pldA Caulobacter crescentus xylonolactonase with (r)-4-hydroxy-2- pyrrolidone (see paper)
31% identity, 95% coverage: 9:288/294 of query aligns to 5:283/287 of 7pldA

query
sites
7pldA
C
 
C
L
 
V
L
 
W
D
 
D
S
 
L
R
 
K
C
 
A
D
 
T
V
 
L
A
 
G
E
|
E
S
 
G
P
 
P
V
 
I
F
 
W
D
 
-
E
 
-
R
 
H
R
 
G
N
 
D
C
 
T
L
 
L
F
 
W
F
 
F
V
 
V
D
 
D
I
 
I
G
 
K
R
 
Q
S
 
R
A
 
K
L
 
I
H
 
H
R
 
-
V
 
-
D
 
N
L
 
Y
S
 
H
G
 
P
A
 
A
G
 
T
H
 
G
V
 
E
E
 
R
W
 
F
T
 
S
I
 
F
E
 
D
G
 
A
G
 
P
A
 
D
C
 
Q
S
 
V
T
 
T
G
 
F
L
 
L
A
 
A
R
 
P
-
 
I
-
 
V
-
 
G
S
 
A
G
 
T
R
 
G
L
 
F
V
 
V
L
 
V
A
 
G
Q
 
L
R
 
K
D
 
T
R
 
G
V
 
I
V
 
H
L
 
R
F
 
F
D
 
H
P
 
P
D
 
A
A
 
T
G
 
G
A
 
F
V
 
S
T
 
L
R
 
-
E
 
-
I
 
L
A
 
L
A
 
E
I
 
V
E
 
E
P
 
D
D
 
A
I
 
A
A
 
L
D
 
N
T
 
N
R
 
R
L
 
P
N
|
N
D
 
D
G
 
A
K
 
T
V
 
V
G
 
D
P
 
A
D
 
Q
G
 
G
A
 
R
F
 
L
W
 
W
V
 
F
G
 
G
T
 
T
M
 
M
H
 
H
D
 
D
V
 
G
P
x
E
D
 
E
R
 
N
R
 
N
P
 
S
V
 
-
A
 
G
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
R
 
R
V
 
M
S
 
D
P
 
L
E
 
T
G
 
G
A
 
-
V
 
V
E
 
A
R
 
R
K
 
M
V
 
D
E
 
R
G
 
D
V
 
I
V
 
C
C
 
I
S
 
T
N
|
N
G
 
G
L
 
P
A
 
C
W
 
V
S
 
S
G
 
P
D
 
D
G
 
G
S
 
K
L
 
T
L
 
F
F
 
Y
H
 
H
S
 
T
D
 
D
S
x
T
R
x
L
G
 
E
A
 
K
W
 
T
I
 
I
D
 
-
R
 
-
W
 
Y
Q
 
A
F
 
F
D
 
D
P
 
L
A
 
A
T
 
E
-
 
D
G
 
G
A
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
N
R
 
K
R
 
R
R
 
V
L
 
F
A
 
V
S
 
Q
L
 
F
D
 
A
E
 
L
A
 
G
S
 
D
G
 
D
-
 
V
R
 
Y
P
 
P
D
|
D
G
 
G
A
 
S
A
 
V
T
 
V
D
 
D
A
 
S
E
 
E
A
 
G
H
 
Y
Y
 
L
W
 
W
S
 
T
A
 
A
G
 
L
V
x
W
S
 
G
A
 
G
G
 
F
I
 
G
V
 
A
N
 
V
R
 
R
F
 
F
S
 
S
P
 
P
E
 
Q
G
 
G
R
 
D
L
 
A
V
 
V
G
 
T
T
 
R
H
 
I
R
 
E
F
 
L
P
 
P
V
 
A
P
 
P
A
 
N
P
 
V
T
 
T
M
 
K
P
 
P
C
 
C
F
 
F
A
 
G
G
 
G
P
 
P
D
 
D
L
 
L
K
 
K
T
 
T
L
 
L
L
 
Y
V
 
F
T
 
T
S
 
T
L
 
A
R
 
R
P
 
-
A
x
K
G
 
G
I
 
L
G
 
S
K
 
D
E
 
E
N
 
T
-
 
L
-
 
A
-
 
Q
-
 
Y
-
 
P
R
 
L
S
 
A
G
 
G
G
 
G
I
 
V
F
 
F
V
 
A
A
 
V
R
 
P
S
 
V
P
 
D
V
 
V
A
 
A
G
 
G
V
 
Q
A
 
P
V
 
Q
H
 
H
R
 
E

7plbB Caulobacter crescentus xylonolactonase with d-xylose (see paper)
31% identity, 95% coverage: 9:288/294 of query aligns to 7:285/289 of 7plbB

query
sites
7plbB
C
 
C
L
 
V
L
 
W
D
 
D
S
 
L
R
 
K
C
 
A
D
 
T
V
x
L
A
 
G
E
|
E
S
 
G
P
 
P
V
 
I
F
 
W
D
 
-
E
 
-
R
x
H
R
 
G
N
 
D
C
 
T
L
 
L
F
 
W
F
 
F
V
 
V
D
 
D
I
 
I
G
 
K
R
 
Q
S
 
R
A
 
K
L
 
I
H
 
H
R
 
-
V
 
-
D
 
N
L
 
Y
S
 
H
G
 
P
A
 
A
G
 
T
H
 
G
V
 
E
E
 
R
W
 
F
T
 
S
I
 
F
E
 
D
G
 
A
G
 
P
A
 
D
C
 
Q
S
 
V
T
 
T
G
 
F
L
 
L
A
 
A
R
 
P
-
 
I
-
 
V
-
 
G
S
x
A
G
x
T
R
x
G
L
x
F
V
 
V
L
 
V
A
 
G
Q
 
L
R
 
K
D
 
T
R
 
G
V
 
I
V
 
H
L
 
R
F
 
F
D
x
H
P
|
P
D
 
A
A
 
T
G
 
G
A
 
F
V
 
-
T
 
-
R
 
S
E
 
L
I
 
L
A
 
L
A
x
E
I
x
V
E
|
E
P
x
D
D
 
A
I
 
A
A
 
L
D
 
N
T
 
N
R
|
R
L
 
P
N
|
N
D
 
D
G
 
A
K
 
T
V
 
V
G
 
D
P
 
A
D
 
Q
G
 
G
A
x
R
F
 
L
W
 
W
V
 
F
G
 
G
T
 
T
M
|
M
H
 
H
D
 
D
V
 
G
P
x
E
D
 
E
R
 
N
R
 
N
P
 
S
V
 
-
A
 
G
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
R
|
R
V
 
M
S
x
D
P
 
L
E
x
T
G
 
G
A
 
-
V
 
V
E
 
A
R
 
R
K
 
M
V
 
D
E
 
R
G
 
D
V
 
I
V
 
C
C
 
I
S
 
T
N
|
N
G
 
G
L
 
P
A
 
C
W
 
V
S
 
S
G
 
P
D
 
D
G
 
G
S
 
K
L
 
T
L
 
F
F
 
Y
H
 
H
S
 
T
D
 
D
S
 
T
R
 
L
G
 
E
A
 
K
W
 
T
I
 
I
D
 
-
R
 
-
W
 
Y
Q
 
A
F
 
F
D
 
D
P
 
L
A
 
A
T
 
E
-
x
D
G
 
G
A
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
N
R
 
K
R
 
R
R
 
V
L
 
F
A
 
V
S
 
Q
L
 
F
D
 
A
E
 
L
A
 
G
S
 
D
G
 
D
-
 
V
R
 
Y
P
 
P
D
|
D
G
 
G
A
 
S
A
 
V
T
 
V
D
 
D
A
 
S
E
 
E
A
 
G
H
 
Y
Y
 
L
W
 
W
S
 
T
A
 
A
G
 
L
V
x
W
S
 
G
A
 
G
G
 
F
I
 
G
V
 
A
N
 
V
R
 
R
F
 
F
S
 
S
P
 
P
E
 
Q
G
 
G
R
 
D
L
 
A
V
 
V
G
 
T
T
 
R
H
 
I
R
 
E
F
 
L
P
 
P
V
 
A
P
 
P
A
 
N
P
 
V
T
 
T
M
 
K
P
 
P
C
 
C
F
 
F
A
 
G
G
 
G
P
 
P
D
 
D
L
 
L
K
 
K
T
 
T
L
 
L
L
 
Y
V
 
F
T
 
T
S
 
T
L
 
A
R
 
R
P
 
-
A
 
K
G
 
G
I
 
L
G
 
S
K
 
D
E
 
E
N
 
T
-
 
L
-
 
A
-
 
Q
-
 
Y
-
 
P
R
 
L
S
 
A
G
 
G
G
 
G
I
 
V
F
 
F
V
 
A
A
 
V
R
 
P
S
 
V
P
 
D
V
 
V
A
 
A
G
 
G
V
 
Q
A
 
P
V
 
Q
H
 
H
R
 
E

3dr2A Structural and functional analyses of xc5397 from xanthomonas campestris: a gluconolactonase important in glucose secondary metabolic pathways (see paper)
27% identity, 82% coverage: 18:258/294 of query aligns to 44:288/299 of 3dr2A

query
sites
3dr2A
A
 
S
E
|
E
S
 
G
P
 
P
V
 
A
F
 
W
D
 
W
E
 
E
R
 
A
R
 
Q
N
 
R
C
 
T
L
 
L
F
 
V
F
 
W
V
 
S
D
 
D
-
 
L
I
 
V
G
 
G
R
 
R
S
 
R
A
 
V
L
 
L
-
 
G
H
 
W
R
 
R
V
 
E
D
 
D
L
 
-
S
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
G
H
 
T
V
 
V
E
 
D
W
 
V
T
 
L
I
 
L
E
 
D
G
 
A
G
 
T
A
 
A
C
 
F
S
 
T
T
 
N
G
 
G
L
 
N
A
 
A
-
 
V
-
 
D
R
 
A
S
 
Q
G
 
Q
R
 
R
L
 
L
V
 
V
L
 
H
A
 
C
Q
 
E
R
 
H
D
 
G
R
 
R
V
 
R
V
 
A
L
 
I
F
 
T
D
 
R
P
 
S
D
 
D
A
 
A
G
 
D
A
 
G
V
 
Q
T
 
A
R
 
H
E
 
L
I
 
L
A
 
V
A
 
G
I
 
R
E
 
Y
P
 
A
D
 
G
I
 
K
A
 
R
D
 
L
T
 
N
R
 
S
L
 
P
N
|
N
D
 
D
G
 
L
K
 
I
V
 
V
G
 
A
P
 
R
D
 
D
G
 
G
A
 
A
F
 
I
W
 
W
V
 
F
G
 
-
T
 
T
M
 
D
H
 
P
D
 
P
V
 
F
P
 
G
D
 
L
R
 
R
R
 
K
P
 
P
V
 
S
A
 
Q
-
 
G
-
 
C
-
 
P
-
 
A
-
 
D
-
 
P
-
 
E
-
 
L
-
 
A
-
 
H
-
 
H
S
 
S
L
 
V
Y
 
Y
R
 
R
V
 
L
S
 
P
P
 
P
E
 
D
G
 
G
A
 
S
V
 
P
E
 
L
R
 
Q
K
 
R
V
 
M
E
 
A
G
 
D
V
 
L
V
 
D
C
 
H
S
 
P
N
|
N
G
 
G
L
 
L
A
 
A
W
 
F
S
 
S
G
 
P
D
 
D
G
 
E
S
 
Q
L
 
T
L
 
L
F
 
Y
H
 
V
S
 
S
D
 
Q
S
 
T
R
 
P
G
 
E
A
 
G
W
 
S
I
 
V
D
 
E
R
 
I
W
 
T
Q
 
A
F
 
F
D
 
A
P
 
W
A
 
R
T
 
D
G
 
G
A
 
A
L
 
L
S
 
H
G
 
D
R
 
R
R
 
R
R
 
H
L
 
F
A
 
A
S
 
S
L
 
V
D
 
P
E
 
D
A
 
-
S
 
-
G
 
G
R
 
L
P
 
P
D
|
D
G
 
G
A
 
F
A
 
C
T
 
V
D
 
D
A
 
R
E
 
G
A
 
G
H
 
W
Y
 
L
W
 
W
S
 
S
A
 
S
G
 
S
V
 
G
S
 
T
A
 
G
G
 
V
I
 
C
V
 
V
N
 
-
R
 
-
F
 
F
S
 
D
P
 
S
E
 
D
G
 
G
R
 
Q
L
 
L
V
 
L
G
 
G
T
 
-
H
 
-
R
 
H
F
 
I
P
 
P
V
 
T
P
 
P
A
 
G
P
 
T
T
 
A
M
 
S
P
 
N
C
 
C
F
 
T
A
 
F
G
 
D
P
 
Q
D
 
A
L
 
Q
K
 
Q
T
 
R
L
 
L
L
 
F
V
 
I
T
 
T

Query Sequence

>SMc04142 FitnessBrowser__Smeli:SMc04142
MSFDLTFECLLDSRCDVAESPVFDERRNCLFFVDIGRSALHRVDLSGAGHVEWTIEGGAC
STGLARSGRLVLAQRDRVVLFDPDAGAVTREIAAIEPDIADTRLNDGKVGPDGAFWVGTM
HDVPDRRPVASLYRVSPEGAVERKVEGVVCSNGLAWSGDGSLLFHSDSRGAWIDRWQFDP
ATGALSGRRRLASLDEASGRPDGAATDAEAHYWSAGVSAGIVNRFSPEGRLVGTHRFPVP
APTMPCFAGPDLKTLLVTSLRPAGIGKENRSGGIFVARSPVAGVAVHRFDDRWI

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory