SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing SMc04397 FitnessBrowser__Smeli:SMc04397 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

7w5nA The crystal structure of the reduced form of gluconobacter oxydans wsh-004 sndh (see paper)
49% identity, 96% coverage: 18:500/504 of query aligns to 9:490/492 of 7w5nA

query
sites
7w5nA
R
 
R
E
 
E
F
 
F
R
 
G
M
 
F
L
 
F
I
 
I
D
 
D
G
 
G
Q
 
E
W
 
W
V
 
R
D
 
A
G
 
G
A
 
K
E
 
D
G
 
-
R
 
-
T
 
F
I
 
F
E
 
D
R
 
R
V
 
S
A
 
S
P
 
P
G
 
A
H
 
H
G
 
D
V
 
V
V
 
P
V
 
V
S
 
T
R
 
R
Y
 
I
Q
 
P
A
 
R
A
 
C
A
 
T
K
 
R
A
 
E
D
 
D
A
 
L
E
 
D
R
 
E
A
 
A
I
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
R
A
 
A
F
 
F
D
 
E
E
 
N
G
 
G
P
 
S
W
 
W
P
 
A
R
 
G
M
 
L
T
 
A
A
 
A
S
 
A
E
 
D
R
 
R
S
 
A
L
 
A
I
 
V
L
 
L
L
 
L
R
 
K
A
 
A
A
 
A
D
 
G
M
 
L
I
 
L
A
 
R
A
 
E
R
 
R
A
 
R
D
 
D
E
 
D
L
 
I
A
 
A
F
 
Y
L
 
W
D
 
E
A
 
V
V
 
L
E
 
E
S
 
N
G
 
G
K
 
K
P
 
P
I
 
I
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
K
 
K
G
 
G
E
 
E
L
 
I
A
 
D
G
 
H
A
 
C
A
 
I
D
 
A
I
 
C
W
 
F
R
 
E
Y
 
M
A
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
M
L
 
L
S
 
H
G
 
G
E
 
D
S
 
T
Y
 
F
N
 
N
T
 
N
L
 
L
G
 
G
E
 
E
G
 
G
T
 
L
L
 
F
G
 
G
V
 
M
V
 
V
L
 
L
R
 
R
E
 
E
P
 
P
I
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
V
S
 
G
I
 
L
I
 
I
T
 
T
P
 
P
W
|
W
N
 
N
F
 
F
P
 
P
F
 
F
L
 
M
I
 
I
V
 
L
S
 
C
Q
 
E
K
 
R
L
 
A
P
 
P
F
 
F
A
 
I
L
 
L
A
 
A
A
 
S
G
 
G
C
 
C
T
 
T
T
 
L
V
 
V
V
 
V
K
|
K
P
 
P
S
x
A
E
 
E
L
 
V
T
 
T
S
 
S
A
 
A
S
 
T
T
 
T
L
 
L
V
 
L
L
 
L
G
 
A
E
 
E
I
 
I
L
 
L
E
 
A
A
 
D
A
 
A
G
 
G
V
 
L
P
 
P
Q
 
K
G
 
G
V
 
V
V
 
F
N
 
N
I
 
V
I
 
V
V
 
T
G
 
G
T
|
T
G
|
G
P
 
R
E
 
T
A
 
V
G
|
G
A
 
Q
P
 
A
L
 
M
T
 
T
T
 
E
H
 
H
P
 
Q
H
 
D
V
 
I
D
 
D
M
 
M
V
 
L
S
 
S
F
|
F
T
 
T
G
|
G
S
|
S
T
 
T
G
 
G
I
x
V
G
 
G
Q
 
K
L
 
S
T
 
C
M
 
I
A
 
H
N
 
A
A
 
A
A
 
A
Q
 
D
T
 
S
-
 
N
L
 
L
K
 
K
K
 
K
V
 
L
S
 
G
L
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
N
 
N
P
 
P
Q
 
I
I
 
V
V
 
V
F
 
F
P
 
A
D
 
D
A
 
S
N
 
N
L
 
L
D
 
E
E
 
D
F
 
A
I
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
V
V
 
A
F
 
F
G
 
G
A
 
I
Y
 
S
F
 
F
N
 
N
A
 
T
G
 
G
E
 
Q
C
 
C
C
 
C
N
 
V
A
 
S
G
 
S
S
 
S
R
 
R
L
 
L
I
 
I
L
 
V
H
 
E
R
 
R
D
 
S
I
 
V
A
 
A
E
 
E
E
 
K
V
 
F
T
 
E
A
 
R
R
 
L
I
 
V
A
 
V
S
 
A
L
 
K
S
 
M
A
 
E
K
 
K
V
 
I
K
 
R
V
 
V
G
 
G
D
 
D
P
 
P
L
 
F
D
 
D
P
 
P
E
 
E
T
 
T
Q
 
Q
V
 
I
G
 
G
A
 
A
I
 
I
I
 
T
T
 
T
P
 
E
Q
 
A
H
x
Q
L
 
N
Q
 
K
K
 
T
I
 
I
A
 
L
G
 
D
Y
 
Y
V
 
I
S
 
A
S
 
K
A
 
G
S
 
K
N
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
I
 
L
A
 
L
H
 
C
G
 
G
G
 
G
T
 
G
T
 
I
L
 
V
D
 
D
L
 
F
G
 
G
M
 
K
G
 
G
Q
 
Q
F
 
Y
M
 
I
A
 
Q
P
 
P
T
 
T
I
 
L
L
 
F
S
 
T
A
 
D
V
 
V
R
 
K
P
 
P
E
 
S
M
 
M
A
 
G
V
 
I
A
 
A
R
 
R
E
 
D
E
|
E
V
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
L
S
 
A
V
 
S
L
 
F
T
 
H
F
 
F
E
 
D
K
 
T
T
 
V
E
 
D
E
 
E
A
 
A
I
 
I
R
 
A
I
 
I
A
 
A
N
 
N
S
 
D
I
 
T
D
 
V
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
S
 
A
A
 
A
G
 
S
V
 
V
W
 
W
S
 
S
R
 
K
D
 
D
F
 
I
D
 
D
T
 
K
C
 
A
L
 
L
T
 
A
I
 
V
G
 
T
R
 
R
R
 
R
V
 
V
R
 
R
A
 
A
G
 
G
T
 
R
V
 
F
W
 
W
M
 
V
N
 
N
T
 
T
F
 
I
M
 
M
D
 
S
G
 
G
A
 
G
S
 
P
E
 
E
L
 
T
P
 
P
F
 
L
G
 
G
G
 
G
Y
 
F
R
 
K
Q
 
Q
S
 
S
G
 
G
L
 
W
G
 
G
R
 
R
E
 
E
L
 
A
G
 
G
R
 
L
H
 
Y
A
 
G
V
 
V
E
 
E
D
 
E
Y
 
Y
T
 
T
E
 
Q
T
 
I
K
 
K
T
 
S
L
 
V
N
 
H
M
 
I
H
 
E
I
 
T
G
 
G
R
 
K
R
 
R
S
 
S
N
 
H
W
 
W

7w5kA The c296a mutant of l-sorbosone dehydrogenase (sndh) from gluconobacter oxydans wsh-004 (see paper)
49% identity, 96% coverage: 18:500/504 of query aligns to 8:489/491 of 7w5kA

query
sites
7w5kA
R
 
R
E
 
E
F
 
F
R
 
G
M
 
F
L
 
F
I
 
I
D
 
D
G
 
G
Q
 
E
W
 
W
V
 
R
D
 
A
G
 
G
A
 
K
E
 
D
G
 
-
R
 
-
T
 
F
I
 
F
E
 
D
R
 
R
V
 
S
A
 
S
P
 
P
G
 
A
H
 
H
G
 
D
V
 
V
V
 
P
V
 
V
S
 
T
R
 
R
Y
 
I
Q
 
P
A
 
R
A
 
C
A
 
T
K
 
R
A
 
E
D
 
D
A
 
L
E
 
D
R
 
E
A
 
A
I
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
R
A
 
A
F
 
F
D
 
E
E
 
N
G
 
G
P
 
S
W
 
W
P
 
A
R
 
G
M
 
L
T
 
A
A
 
A
S
 
A
E
 
D
R
 
R
S
 
A
L
 
A
I
 
V
L
 
L
L
 
L
R
 
K
A
 
A
A
 
A
D
 
G
M
 
L
I
 
L
A
 
R
A
 
E
R
 
R
A
 
R
D
 
D
E
 
D
L
 
I
A
 
A
F
 
Y
L
 
W
D
 
E
A
 
V
V
 
L
E
 
E
S
 
N
G
 
G
K
 
K
P
 
P
I
 
I
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
K
 
K
G
 
G
E
 
E
L
 
I
A
 
D
G
 
H
A
 
C
A
 
I
D
 
A
I
 
C
W
 
F
R
 
E
Y
 
M
A
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
M
L
 
L
S
 
H
G
 
G
E
 
D
S
 
T
Y
 
F
N
 
N
T
 
N
L
 
L
G
 
G
E
 
E
G
 
G
T
 
L
L
 
F
G
 
G
V
 
M
V
 
V
L
 
L
R
 
R
E
 
E
P
 
P
I
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
V
S
 
G
I
 
L
I
|
I
T
|
T
P
|
P
W
|
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
F
 
F
L
 
M
I
|
I
V
 
L
S
 
C
Q
 
E
K
 
R
L
 
A
P
 
P
F
 
F
A
 
I
L
 
L
A
 
A
A
 
S
G
 
G
C
 
C
T
 
T
T
 
L
V
 
V
V
 
V
K
|
K
P
 
P
S
x
A
E
|
E
L
 
V
T
 
T
S
 
S
A
 
A
S
 
T
T
 
T
L
 
L
V
 
L
L
 
L
G
 
A
E
 
E
I
 
I
L
 
L
E
 
A
A
 
D
A
 
A
G
 
G
V
 
L
P
 
P
Q
 
K
G
 
G
V
 
V
V
 
F
N
 
N
I
 
V
I
 
V
V
 
T
G
 
G
T
|
T
G
|
G
P
 
R
E
 
T
A
 
V
G
|
G
A
x
Q
P
 
A
L
 
M
T
 
T
T
 
E
H
 
H
P
 
Q
H
 
D
V
 
I
D
 
D
M
 
M
V
 
L
S
 
S
F
|
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
T
 
T
G
 
G
I
x
V
G
 
G
Q
 
K
L
 
S
T
 
C
M
 
I
A
 
H
N
 
A
A
 
A
A
 
A
Q
 
D
T
 
S
-
 
N
L
 
L
K
 
K
K
 
K
V
 
L
S
 
G
L
 
L
E
|
E
L
|
L
G
|
G
G
 
G
K
 
K
N
 
N
P
 
P
Q
 
I
I
 
V
V
 
V
F
 
F
P
 
A
D
 
D
A
 
S
N
 
N
L
 
L
D
 
E
E
 
D
F
 
A
I
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
V
V
 
A
F
 
F
G
 
G
A
 
I
Y
 
S
F
 
F
N
 
N
A
 
T
G
 
G
E
 
Q
C
 
C
C
x
A
N
 
V
A
 
S
G
 
S
S
 
S
R
 
R
L
 
L
I
 
I
L
 
V
H
 
E
R
 
R
D
 
S
I
 
V
A
 
A
E
 
E
E
 
K
V
 
F
T
 
E
A
 
R
R
 
L
I
 
V
A
 
V
S
 
A
L
 
K
S
 
M
A
 
E
K
 
K
V
 
I
K
 
R
V
 
V
G
 
G
D
 
D
P
 
P
L
 
F
D
 
D
P
 
P
E
 
E
T
 
T
Q
 
Q
V
 
I
G
 
G
A
 
A
I
 
I
I
 
T
T
 
T
P
 
E
Q
 
A
H
 
Q
L
 
N
Q
 
K
K
 
T
I
 
I
A
 
L
G
 
D
Y
 
Y
V
 
I
S
 
A
S
 
K
A
 
G
S
 
K
N
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
I
 
L
A
 
L
H
 
C
G
 
G
G
 
G
T
 
G
T
 
I
L
 
V
D
 
D
L
 
F
G
 
G
M
 
K
G
 
G
Q
 
Q
F
 
Y
M
 
I
A
 
Q
P
 
P
T
 
T
I
 
L
L
 
F
S
 
T
A
 
D
V
 
V
R
 
K
P
 
P
E
 
S
M
 
M
A
 
G
V
 
I
A
 
A
R
 
R
E
 
D
E
|
E
V
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
L
S
 
A
V
 
S
L
 
F
T
 
H
F
 
F
E
 
D
K
 
T
T
 
V
E
 
D
E
 
E
A
 
A
I
 
I
R
 
A
I
 
I
A
 
A
N
 
N
S
 
D
I
 
T
D
 
V
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
S
 
A
A
 
A
G
 
S
V
 
V
W
 
W
S
 
S
R
 
K
D
 
D
F
 
I
D
 
D
T
 
K
C
 
A
L
 
L
T
 
A
I
 
V
G
 
T
R
 
R
R
 
R
V
 
V
R
 
R
A
 
A
G
 
G
T
 
R
V
 
F
W
 
W
M
 
V
N
 
N
T
 
T
F
 
I
M
 
M
D
 
S
G
 
G
A
 
G
S
 
P
E
 
E
L
 
T
P
 
P
F
 
L
G
 
G
G
 
G
Y
 
F
R
 
K
Q
 
Q
S
 
S
G
 
G
L
 
W
G
 
G
R
 
R
E
 
E
L
 
A
G
 
G
R
 
L
H
 
Y
A
 
G
V
 
V
E
 
E
D
 
E
Y
 
Y
T
 
T
E
 
Q
T
 
I
K
 
K
T
 
S
L
 
V
N
 
H
M
 
I
H
 
E
I
 
T
G
 
G
R
 
K
R
 
R
S
 
S
N
 
H
W
 
W

3u4jA Crystal structure of NAD-dependent aldehyde dehydrogenase from sinorhizobium meliloti
49% identity, 96% coverage: 20:501/504 of query aligns to 22:504/505 of 3u4jA

query
sites
3u4jA
F
 
Y
R
 
Q
M
 
M
L
 
L
I
 
V
D
 
D
G
 
G
Q
 
K
W
 
S
V
 
V
D
 
D
G
 
A
A
 
A
E
 
S
G
 
G
R
 
S
T
 
T
I
 
I
E
 
D
R
 
R
V
 
V
A
 
S
P
 
P
G
 
G
H
 
H
-
 
A
G
 
G
V
x
E
V
 
V
V
 
V
S
 
G
R
 
T
Y
 
W
Q
 
P
A
 
E
A
 
A
A
 
S
K
 
A
A
 
D
D
 
D
A
 
V
E
 
R
R
 
K
A
 
A
I
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
K
A
 
A
F
 
F
D
 
D
E
 
A
G
 
G
P
 
P
W
 
W
P
 
P
R
 
R
M
 
M
T
 
S
A
 
G
S
 
A
E
 
E
R
 
R
S
 
S
L
 
R
I
 
L
L
 
M
L
 
F
R
 
K
A
 
V
A
 
A
D
 
D
M
 
L
I
 
I
A
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
Q
D
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
A
F
 
L
L
 
I
D
 
E
A
 
S
V
 
L
E
 
E
S
 
V
G
 
G
K
 
K
P
 
P
I
 
I
S
 
A
Q
 
Q
A
 
A
K
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
I
A
 
G
G
 
F
A
 
C
A
 
A
D
 
D
I
 
L
W
 
W
R
 
S
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
Q
A
 
A
R
 
R
E
 
A
L
 
L
S
 
E
G
 
G
E
 
Q
S
 
T
Y
 
H
N
 
N
T
 
N
L
 
I
G
 
G
E
 
D
G
 
D
T
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
L
V
 
V
L
 
L
R
 
R
E
 
E
P
 
P
I
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
V
S
 
G
I
 
I
I
 
I
T
 
T
P
 
P
W
 
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
F
 
F
L
 
I
I
 
I
V
 
A
S
 
S
Q
 
E
K
 
R
L
 
V
P
 
P
F
 
W
A
 
A
L
 
I
A
 
G
A
 
S
G
 
G
C
 
C
T
 
T
T
 
V
V
 
V
V
 
L
K
|
K
P
 
P
S
 
S
E
 
E
L
 
F
T
 
T
S
 
S
A
 
G
S
 
T
T
 
S
L
 
I
V
 
R
L
 
L
G
 
A
E
 
E
I
 
L
L
 
A
E
 
R
A
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
I
P
 
P
Q
 
D
G
 
G
V
 
V
V
 
F
N
 
N
I
 
V
I
 
V
V
 
T
G
 
G
T
 
Y
G
 
G
P
 
D
E
 
P
A
 
A
G
 
G
A
 
Q
P
 
V
L
 
L
T
 
A
T
 
E
H
 
D
P
 
P
H
 
N
V
 
V
D
 
D
M
 
M
V
 
V
S
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
S
T
 
V
G
 
R
I
 
V
G
 
G
Q
 
T
L
 
K
T
 
L
M
 
G
A
 
E
N
 
I
A
 
A
A
 
A
Q
 
R
T
 
T
L
 
V
K
 
K
K
 
R
V
 
V
S
 
G
L
 
L
E
|
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
N
 
G
P
 
P
Q
 
Q
I
 
I
V
 
V
F
 
F
P
 
A
D
 
D
A
 
A
N
 
D
L
 
L
D
 
D
E
 
A
F
 
A
I
 
A
D
 
D
A
 
G
A
 
I
V
 
A
F
 
Y
G
 
G
A
 
V
Y
 
Y
F
 
H
N
 
N
A
 
A
G
 
G
E
 
Q
C
 
C
C
|
C
N
 
I
A
 
S
G
 
G
S
 
S
R
 
R
L
 
L
I
 
L
L
 
V
H
 
Q
R
 
E
D
 
G
I
 
I
A
 
R
E
 
D
E
 
A
V
 
L
T
 
M
A
 
E
R
 
R
I
 
L
A
 
L
S
 
D
L
 
I
S
 
S
A
 
R
K
 
K
V
 
V
K
 
A
V
 
F
G
 
G
D
 
D
P
 
P
L
 
L
D
 
N
P
 
E
E
 
R
T
 
T
Q
 
K
V
 
I
G
 
G
A
 
A
I
 
M
I
 
I
T
 
S
P
 
E
Q
 
A
H
 
H
L
 
A
Q
 
E
K
 
K
I
 
V
A
 
H
G
 
S
Y
 
Y
V
 
V
S
 
T
S
 
A
A
 
G
S
 
I
N
 
T
E
 
S
G
 
G
A
 
A
R
 
E
I
 
L
A
 
L
H
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
E
T
 
R
L
 
I
D
 
G
L
 
R
G
 
E
M
 
A
G
 
G
Q
 
L
F
 
Y
M
 
Y
A
 
A
P
 
P
T
 
T
I
 
V
L
 
F
S
 
A
A
 
G
V
 
V
R
 
T
P
 
P
E
 
D
M
 
M
A
 
S
V
 
I
A
 
A
R
 
R
E
 
E
E
|
E
V
 
I
F
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
L
S
 
S
V
 
T
L
 
L
T
 
T
F
 
F
E
 
K
K
 
T
T
 
A
E
 
D
E
 
E
A
 
A
I
 
V
R
 
A
I
 
L
A
 
A
N
 
N
S
 
A
I
 
T
D
 
E
Y
 
F
G
 
G
L
 
L
S
 
S
A
 
A
G
 
S
V
 
V
W
 
W
S
 
S
R
 
T
D
 
N
F
 
L
D
 
E
T
 
T
C
 
A
L
 
L
T
 
Q
I
 
T
G
 
I
R
 
R
R
 
R
V
 
I
R
 
R
A
 
A
G
 
G
T
 
R
V
 
C
W
 
W
M
 
I
N
 
N
T
 
S
F
 
V
M
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
T
S
 
P
E
 
E
L
 
L
P
 
P
F
 
I
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
R
 
K
Q
 
K
S
 
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
R
E
|
E
L
 
L
G
 
G
R
 
R
H
 
Y
A
 
G
V
 
F
E
 
D
D
 
E
Y
 
Y
T
 
S
E
 
Q
T
 
F
K
 
K
T
 
G
L
 
V
N
 
H
M
 
V
H
 
T
I
 
L
G
 
G
R
 
R
R
 
P
S
 
A
N
 
P
W
 
W
W
 
F

Sites not aligning to the query:

Q56YU0 Aldehyde dehydrogenase family 2 member C4; ALDH1a; Protein REDUCED EPIDERMAL FLUORESCENCE 1; EC 1.2.1.3 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
41% identity, 96% coverage: 21:502/504 of query aligns to 21:501/501 of Q56YU0

query
sites
Q56YU0
R
 
K
M
 
L
L
 
F
I
 
I
D
 
N
G
 
G
Q
 
Q
W
 
F
V
 
I
D
 
D
G
 
A
A
 
A
E
 
S
G
 
G
R
 
K
T
 
T
I
 
F
E
 
E
R
 
T
V
 
I
A
 
D
P
 
P
G
 
R
H
 
N
G
 
G
V
 
E
V
 
V
V
 
I
S
 
A
R
 
T
Y
 
I
Q
 
A
A
 
E
A
 
G
A
 
D
K
 
K
A
 
E
D
 
D
A
 
V
E
 
D
R
 
L
A
 
A
I
 
V
A
 
N
A
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
Y
A
 
A
F
 
F
D
 
D
E
 
H
G
 
G
P
 
P
W
 
W
P
 
P
R
 
R
M
 
M
T
 
T
A
 
G
S
 
F
E
 
E
R
 
R
S
 
A
L
 
K
I
 
L
L
 
I
L
 
N
R
 
K
A
 
F
A
 
A
D
 
D
M
 
L
I
 
I
A
 
E
A
 
E
R
 
N
A
 
I
D
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
A
F
 
K
L
 
L
D
 
D
A
 
A
V
 
V
E
 
D
S
 
G
G
 
G
K
 
K
P
 
L
I
 
F
S
 
Q
Q
 
L
A
 
G
K
 
K
-
 
Y
G
 
A
E
 
D
L
 
I
A
 
P
G
 
A
A
 
T
A
 
A
D
 
G
I
 
H
W
 
F
R
 
R
Y
 
Y
A
 
N
A
 
A
A
 
G
L
 
A
A
 
A
R
 
D
E
 
K
L
 
I
S
 
H
G
 
G
E
 
E
S
 
T
Y
 
L
N
 
K
T
 
M
L
 
T
G
 
R
E
 
Q
G
 
S
T
 
L
L
 
F
G
|
G
V
 
Y
V
 
T
L
 
L
R
 
K
E
 
E
P
 
P
I
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
V
S
 
G
I
 
N
I
 
I
T
 
I
P
 
P
W
 
W
N
 
N
F
 
F
P
 
P
F
 
S
L
 
I
I
 
M
V
 
F
S
 
A
Q
 
T
K
 
K
L
 
V
P
 
A
F
 
P
A
 
A
L
 
M
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
C
T
 
T
T
 
M
V
 
V
V
 
V
K
 
K
P
 
P
S
 
A
E
 
E
L
 
Q
T
 
T
S
 
S
A
 
L
S
 
S
T
 
A
L
 
L
V
 
F
L
 
Y
G
 
A
E
 
H
I
 
L
L
 
S
E
 
K
A
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
I
P
 
P
Q
 
D
G
 
G
V
 
V
V
 
L
N
 
N
I
 
I
I
 
V
V
 
T
G
 
G
T
 
F
G
 
G
P
 
S
E
 
T
A
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
A
L
 
I
T
 
A
T
 
S
H
 
H
P
 
M
H
 
D
V
 
V
D
 
D
M
 
K
V
 
V
S
 
S
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
S
T
 
T
G
 
D
I
 
V
G
 
G
Q
 
R
L
 
K
T
 
I
M
 
M
-
 
Q
A
 
A
N
 
A
A
 
A
A
 
A
Q
 
S
T
 
N
L
 
L
K
 
K
K
 
K
V
 
V
S
 
S
L
 
L
E
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
N
 
S
P
 
P
Q
 
L
I
 
L
V
 
I
F
 
F
P
 
N
D
 
D
A
 
A
N
 
D
L
 
I
D
 
D
E
 
K
F
 
A
I
 
A
D
 
D
A
 
L
A
 
A
V
 
L
F
 
L
G
 
G
A
 
C
Y
 
F
F
 
Y
N
 
N
A
 
K
G
 
G
E
 
E
C
 
I
C
 
C
N
 
V
A
 
A
G
 
S
S
 
S
R
 
R
L
 
V
I
 
F
L
 
V
H
 
Q
R
 
E
D
 
G
I
 
I
A
 
Y
E
 
D
E
 
K
V
 
V
T
 
V
A
 
E
R
 
K
I
 
L
A
 
V
S
 
E
L
 
K
S
 
A
A
 
K
K
 
D
V
 
W
K
 
T
V
 
V
G
 
G
D
 
D
P
 
P
L
 
F
D
 
D
P
 
S
E
 
T
T
 
A
Q
 
R
V
 
Q
G
 
G
A
 
P
I
 
Q
I
 
V
T
 
D
P
 
K
Q
 
R
H
 
Q
L
 
F
Q
 
E
K
 
K
I
 
I
A
 
L
G
 
S
Y
 
Y
V
 
I
S
 
E
S
 
H
A
 
G
S
 
K
N
 
N
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
T
I
 
L
A
 
L
H
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
K
T
 
A
L
 
I
D
 
G
L
 
-
G
 
D
M
 
K
G
 
G
Q
 
Y
F
 
F
M
 
I
A
 
Q
P
 
P
T
 
T
I
 
I
L
 
F
S
 
A
A
 
D
V
 
V
R
 
T
P
 
E
E
 
D
M
 
M
A
 
K
V
 
I
A
 
Y
R
 
Q
E
 
D
E
 
E
V
 
I
F
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
M
S
 
S
V
 
L
L
 
M
T
 
K
F
 
F
E
 
K
K
 
T
T
 
V
E
 
E
E
 
E
A
x
G
I
 
I
R
 
K
I
 
C
A
 
A
N
 
N
S
 
N
I
 
T
D
 
K
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
S
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
I
W
 
L
S
 
S
R
 
Q
D
 
D
F
 
I
D
 
D
T
 
L
C
 
I
L
 
N
T
 
T
I
 
V
G
 
S
R
 
R
R
 
S
V
 
I
R
 
K
A
 
A
G
 
G
T
 
I
V
 
I
W
 
W
M
 
V
N
 
N
T
 
C
F
 
Y
M
 
F
D
 
G
G
 
F
A
 
D
S
 
L
E
 
D
L
 
C
P
 
P
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
R
 
K
Q
 
M
S
 
S
G
 
G
L
 
N
G
 
C
R
 
R
E
 
E
L
 
S
G
 
G
R
 
M
H
 
D
A
 
A
V
 
L
E
 
D
D
 
N
Y
 
Y
T
 
L
E
 
Q
T
 
T
K
 
K
T
 
S
L
 
V
N
 
V
M
 
M
H
 
P
I
 
L
G
 
-
R
 
-
R
 
H
S
 
N
N
 
S
W
 
P
W
 
W
M
 
M

4pxlA Structure of zm aldh2-3 (rf2c) in complex with NAD (see paper)
42% identity, 94% coverage: 16:490/504 of query aligns to 2:476/486 of 4pxlA

query
sites
4pxlA
D
 
E
T
 
V
R
 
R
E
 
F
F
 
T
R
 
K
M
 
L
L
 
F
I
 
I
D
 
D
G
 
G
Q
 
K
W
 
F
V
 
V
D
 
D
G
 
A
A
 
V
E
 
S
G
 
G
R
 
K
T
 
T
I
 
F
E
 
E
R
 
T
V
 
R
A
 
D
P
 
P
G
 
R
H
 
T
G
 
G
V
 
E
V
 
V
V
 
I
S
 
A
R
 
S
Y
 
I
Q
 
A
A
 
E
A
 
G
A
 
D
K
 
K
A
 
A
D
 
D
A
 
V
E
 
D
R
 
L
A
 
A
I
 
V
A
 
K
A
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
E
A
 
A
F
 
F
D
 
D
E
 
N
G
 
G
P
 
P
W
 
W
P
 
P
R
 
R
M
 
M
T
 
T
A
 
G
S
 
Y
E
 
E
R
 
R
S
 
G
L
 
R
I
 
I
L
 
L
L
 
H
R
 
R
A
 
F
A
 
A
D
 
D
M
 
L
I
 
I
A
 
D
A
 
E
R
 
H
A
 
V
D
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
A
F
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
T
V
 
V
E
 
D
S
 
A
G
 
G
K
 
K
P
 
L
I
 
F
S
 
A
Q
 
V
A
 
G
K
 
K
G
 
A
-
 
R
E
 
D
L
 
I
A
 
P
G
 
G
A
 
A
A
 
A
D
 
H
I
 
L
W
 
L
R
 
R
Y
 
Y
A
 
Y
A
 
A
A
 
G
L
 
A
A
 
A
R
 
D
E
 
K
L
 
V
S
 
H
G
 
G
E
 
A
S
 
T
Y
 
L
N
 
K
T
 
-
L
 
M
G
 
A
E
 
Q
G
 
R
T
 
M
L
 
H
G
 
G
V
 
Y
V
 
T
L
 
L
R
 
K
E
 
E
P
 
P
I
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
V
S
 
G
I
 
H
I
|
I
T
x
V
P
|
P
W
|
W
N
|
N
F
 
Y
P
 
P
F
 
T
L
 
T
I
 
M
V
 
F
S
 
F
Q
 
F
K
 
K
L
 
V
P
 
G
F
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
C
T
 
A
T
 
V
V
 
V
V
 
V
K
|
K
P
 
P
S
 
A
E
|
E
L
 
Q
T
 
T
S
 
P
A
 
L
S
 
S
T
 
A
L
 
L
V
 
F
L
 
Y
G
 
A
E
 
H
I
 
L
L
 
A
E
 
R
A
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
Q
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
L
N
 
N
I
 
V
I
 
V
V
 
P
G
 
G
T
 
F
G
|
G
P
 
P
E
 
T
A
 
A
G
|
G
A
|
A
P
 
A
L
 
V
T
 
A
T
 
A
H
 
H
P
 
M
H
 
D
V
 
V
D
 
D
M
 
K
V
 
V
S
 
S
F
|
F
T
 
T
G
|
G
S
|
S
T
 
T
G
 
E
I
x
V
G
 
G
Q
 
R
L
 
L
T
 
V
M
 
M
A
 
R
N
 
A
A
 
A
A
 
A
Q
 
E
T
 
S
-
 
N
L
 
L
K
 
K
K
 
P
V
 
V
S
 
S
L
 
L
E
|
E
L
 
L
G
|
G
G
 
G
K
 
K
N
 
S
P
 
P
Q
 
V
I
 
I
V
 
V
F
 
F
P
 
D
D
 
D
A
 
A
N
 
D
L
 
L
D
 
D
E
 
M
F
 
A
I
 
V
D
 
N
A
 
L
A
 
V
V
 
N
F
 
F
G
 
A
A
 
T
Y
 
Y
F
 
T
N
 
N
A
 
K
G
 
G
E
 
E
C
 
I
C
|
C
N
 
V
A
 
A
G
 
G
S
 
T
R
 
R
L
 
I
I
 
Y
L
 
V
H
 
Q
R
 
E
D
 
G
I
 
I
A
 
Y
E
 
D
E
 
E
V
 
F
T
 
V
A
 
K
R
 
K
I
 
A
A
 
A
S
 
E
L
 
L
S
 
A
A
 
S
K
 
K
V
 
S
K
 
V
V
 
V
G
 
G
D
 
D
P
 
P
L
 
F
D
 
N
P
 
P
E
 
S
T
 
V
Q
 
S
V
 
Q
G
 
G
A
 
P
I
 
Q
I
 
V
T
 
D
P
 
K
Q
 
D
H
x
Q
L
 
Y
Q
 
E
K
|
K
I
 
V
A
 
L
G
 
R
Y
 
Y
V
 
I
S
 
D
S
 
I
A
 
G
S
 
K
N
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
T
I
 
L
A
 
V
H
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
K
T
 
P
L
 
C
D
 
G
L
 
-
G
 
D
M
 
K
G
 
G
Q
 
Y
F
 
Y
M
 
I
A
 
E
P
 
P
T
 
T
I
 
I
L
 
F
S
 
T
A
 
D
V
 
V
R
 
K
P
 
D
E
 
D
M
 
M
A
 
T
V
 
I
A
 
A
R
 
Q
E
 
D
E
|
E
V
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
M
S
 
A
V
 
L
L
 
M
T
 
K
F
 
F
E
 
K
K
 
T
T
 
V
E
 
E
E
 
E
A
 
V
I
 
I
R
 
Q
I
 
K
A
 
A
N
 
N
S
 
N
I
 
T
D
 
R
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
S
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
I
W
 
V
S
 
T
R
 
K
D
 
N
F
 
I
D
 
D
T
 
V
C
 
A
L
 
N
T
 
T
I
 
V
G
 
S
R
 
R
R
 
S
V
 
I
R
 
R
A
 
A
G
 
G
T
 
A
V
 
I
W
 
W
M
 
I
N
 
N
T
 
C
F
 
Y
M
 
F
D
 
A
G
 
F
A
 
D
S
 
P
E
 
D
L
 
A
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
R
 
K
Q
 
M
S
 
S
G
 
G
L
 
F
G
 
G
R
 
K
E
x
D
L
 
M
G
 
G
R
 
M
H
 
D
A
 
A
V
 
L
E
 
D
D
 
K
Y
 
Y
T
 
L
E
 
Q
T
 
T
K
 
K
T
 
T
L
 
V

5gtlA NADPH complex structure of aldehyde dehydrogenase from bacillus cereus
39% identity, 97% coverage: 4:494/504 of query aligns to 2:490/491 of 5gtlA

query
sites
5gtlA
T
 
N
V
 
I
V
 
E
V
 
L
R
 
K
P
 
P
K
 
K
A
 
V
L
 
E
G
 
A
D
 
-
Y
 
F
D
 
L
T
 
N
R
 
E
E
 
E
F
 
I
R
 
K
M
 
M
L
 
F
I
 
I
D
 
N
G
 
G
Q
 
E
W
 
F
V
 
V
D
 
S
G
 
A
A
 
I
E
 
G
G
 
G
R
 
K
T
 
T
I
 
F
E
 
E
R
 
T
V
 
Y
A
 
N
P
 
P
G
 
A
H
 
T
G
 
E
V
 
D
V
 
V
V
 
L
S
 
A
R
 
V
Y
 
V
Q
 
C
A
 
E
A
 
A
A
 
Q
K
 
E
A
 
E
D
 
D
A
 
I
E
 
D
R
 
A
A
 
A
I
 
V
A
 
K
A
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
S
A
 
A
F
 
F
D
 
E
E
 
S
G
 
G
P
 
P
W
 
W
P
 
A
R
 
E
M
 
M
T
 
T
A
 
T
S
 
A
E
 
E
R
 
R
S
 
A
L
 
H
I
 
L
L
 
I
L
 
Y
R
 
K
A
 
L
A
 
A
D
 
D
M
 
L
I
 
I
A
 
E
A
 
E
R
 
H
A
 
R
D
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
A
F
 
Q
L
 
L
D
 
E
A
 
A
V
 
L
E
 
D
S
 
N
G
 
G
K
 
K
P
 
P
I
 
Y
S
 
Q
Q
 
V
A
 
A
-
 
L
K
 
D
G
 
D
E
 
D
L
 
I
A
 
S
G
 
A
A
 
T
A
 
V
D
 
E
I
 
N
W
 
Y
R
 
R
Y
 
Y
A
 
Y
A
 
A
A
 
G
L
 
W
A
 
T
R
 
T
E
 
K
L
 
I
S
 
I
G
 
G
E
 
Q
S
 
T
Y
 
I
N
 
-
T
 
P
L
 
I
G
 
S
E
 
K
G
 
D
T
 
Y
L
 
L
G
 
N
V
 
Y
V
 
T
L
 
R
R
 
H
E
 
E
P
 
P
I
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
V
S
 
G
I
 
Q
I
|
I
T
 
I
P
|
P
W
 
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
F
 
L
L
 
V
I
 
M
V
 
S
S
 
S
Q
 
W
K
 
K
L
 
M
P
 
G
F
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
T
G
 
G
C
 
C
T
 
T
T
 
I
V
 
V
V
 
L
K
|
K
P
 
P
S
x
A
E
|
E
L
x
Q
T
 
T
S
 
P
A
 
L
S
 
S
T
 
L
L
 
L
V
 
Y
L
 
A
G
 
A
E
 
K
I
 
L
L
 
F
E
 
K
A
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
F
P
 
P
Q
 
N
G
 
G
V
 
V
V
 
V
N
 
N
I
 
F
I
 
V
V
 
P
G
 
G
T
 
F
G
|
G
P
 
P
E
 
E
A
 
A
G
|
G
A
 
A
P
 
A
L
 
I
T
 
V
T
 
N
H
 
H
P
 
H
H
 
D
V
 
I
D
 
D
M
 
K
V
 
V
S
 
A
F
 
F
T
 
T
G
|
G
S
|
S
T
 
T
G
 
V
I
x
T
G
 
G
Q
 
K
L
 
Y
T
 
I
M
 
M
A
 
R
N
 
Q
A
 
S
A
 
A
Q
 
E
T
 
M
L
 
I
K
 
K
K
 
H
V
 
V
S
 
T
L
 
L
E
|
E
L
|
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
N
 
S
P
 
P
Q
 
N
I
 
I
V
 
I
F
 
L
P
 
E
D
 
D
A
 
A
N
 
D
L
 
L
D
 
E
E
 
E
F
 
A
I
 
I
D
 
N
A
 
G
A
 
A
V
 
F
F
 
Q
G
 
G
A
 
I
Y
 
M
F
 
Y
N
 
N
A
 
H
G
 
G
E
 
Q
C
 
N
C
|
C
N
 
S
A
 
A
G
 
G
S
 
S
R
 
R
L
 
V
I
 
F
L
 
V
H
 
H
R
 
R
D
 
K
I
 
H
A
 
Y
E
 
E
E
 
T
V
 
V
T
 
V
A
 
D
R
 
A
I
 
L
A
 
V
S
 
K
L
 
M
S
 
A
A
 
N
K
 
N
V
 
V
K
 
K
V
 
L
G
 
G
D
 
A
P
 
G
L
 
M
D
 
E
P
 
K
E
 
E
T
 
T
Q
 
E
V
 
M
G
 
G
A
 
P
I
 
L
I
 
V
T
 
S
P
 
K
Q
 
K
H
 
Q
L
 
Q
Q
 
E
K
 
R
I
 
V
A
 
L
G
 
N
Y
 
Y
V
 
I
S
 
E
S
 
Q
A
 
G
S
 
K
N
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
T
I
 
V
A
 
A
H
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
E
T
 
R
L
 
A
D
 
-
L
 
L
G
 
E
M
 
K
G
 
G
Q
 
Y
F
 
F
M
 
V
A
 
K
P
 
P
T
 
T
I
 
V
L
 
F
S
 
T
A
 
D
V
 
V
R
 
T
P
 
D
E
 
D
M
 
M
A
 
T
V
 
I
A
 
V
R
 
K
E
 
E
E
|
E
V
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
V
S
 
V
V
 
V
L
 
L
T
 
P
F
 
F
E
 
D
K
 
S
T
 
T
E
 
E
E
 
E
A
 
V
I
 
I
R
 
E
I
 
R
A
 
A
N
 
N
S
 
N
I
 
S
D
 
S
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
S
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
W
 
W
S
 
T
R
 
Q
D
 
N
F
 
I
D
 
K
T
 
T
C
 
G
L
 
H
T
 
Q
I
 
V
G
 
A
R
 
N
R
 
K
V
 
L
R
 
K
A
 
A
G
 
G
T
 
T
V
 
V
W
 
W
M
 
I
N
 
N
T
 
D
F
 
Y
M
 
N
D
 
L
G
 
E
A
 
N
S
 
A
E
 
A
L
 
A
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
R
 
K
Q
 
Q
S
 
S
G
 
G
L
 
I
G
 
G
R
 
R
E
|
E
L
 
L
G
 
G
R
 
S
H
 
Y
A
 
A
V
 
L
E
 
D
D
 
N
Y
 
Y
T
 
T
E
 
E
T
 
V
K
 
K
T
 
S
L
 
V
N
 
W
M
 
V
H
 
N
I
 
I

5gtkA NAD+ complex structure of aldehyde dehydrogenase from bacillus cereus
39% identity, 97% coverage: 4:494/504 of query aligns to 2:490/491 of 5gtkA

query
sites
5gtkA
T
 
N
V
 
I
V
 
E
V
 
L
R
 
K
P
 
P
K
 
K
A
 
V
L
 
E
G
 
A
D
 
-
Y
 
F
D
 
L
T
 
N
R
 
E
E
 
E
F
 
I
R
 
K
M
 
M
L
 
F
I
 
I
D
 
N
G
 
G
Q
 
E
W
 
F
V
 
V
D
 
S
G
 
A
A
 
I
E
 
G
G
 
G
R
 
K
T
 
T
I
 
F
E
 
E
R
 
T
V
 
Y
A
 
N
P
 
P
G
 
A
H
 
T
G
 
E
V
 
D
V
 
V
V
 
L
S
 
A
R
 
V
Y
 
V
Q
 
C
A
 
E
A
 
A
A
 
Q
K
 
E
A
 
E
D
 
D
A
 
I
E
 
D
R
 
A
A
 
A
I
 
V
A
 
K
A
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
S
A
 
A
F
 
F
D
 
E
E
 
S
G
 
G
P
 
P
W
 
W
P
 
A
R
 
E
M
 
M
T
 
T
A
 
T
S
 
A
E
 
E
R
 
R
S
 
A
L
 
H
I
 
L
L
 
I
L
 
Y
R
 
K
A
 
L
A
 
A
D
 
D
M
 
L
I
 
I
A
 
E
A
 
E
R
 
H
A
 
R
D
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
A
F
 
Q
L
 
L
D
 
E
A
 
A
V
 
L
E
 
D
S
 
N
G
 
G
K
 
K
P
 
P
I
 
Y
S
 
Q
Q
 
V
A
 
A
-
 
L
K
 
D
G
 
D
E
 
D
L
 
I
A
 
S
G
 
A
A
 
T
A
 
V
D
 
E
I
 
N
W
 
Y
R
 
R
Y
 
Y
A
 
Y
A
 
A
A
 
G
L
 
W
A
 
T
R
 
T
E
 
K
L
 
I
S
 
I
G
 
G
E
 
Q
S
 
T
Y
 
I
N
 
-
T
 
P
L
 
I
G
 
S
E
 
K
G
 
D
T
 
Y
L
 
L
G
 
N
V
 
Y
V
 
T
L
 
R
R
 
H
E
 
E
P
 
P
I
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
V
S
 
G
I
 
Q
I
|
I
T
x
I
P
|
P
W
|
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
F
 
L
L
 
V
I
 
M
V
 
S
S
 
S
Q
 
W
K
 
K
L
 
M
P
 
G
F
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
T
G
 
G
C
 
C
T
 
T
T
 
I
V
 
V
V
 
L
K
|
K
P
 
P
S
 
A
E
|
E
L
 
Q
T
 
T
S
 
P
A
 
L
S
 
S
T
 
L
L
 
L
V
 
Y
L
 
A
G
 
A
E
 
K
I
 
L
L
 
F
E
 
K
A
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
F
P
 
P
Q
 
N
G
 
G
V
 
V
V
 
V
N
 
N
I
 
F
I
 
V
V
 
P
G
 
G
T
 
F
G
|
G
P
 
P
E
 
E
A
 
A
G
|
G
A
|
A
P
 
A
L
 
I
T
 
V
T
 
N
H
 
H
P
 
H
H
 
D
V
 
I
D
 
D
M
 
K
V
 
V
S
 
A
F
|
F
T
 
T
G
|
G
S
|
S
T
 
T
G
 
V
I
x
T
G
 
G
Q
 
K
L
x
Y
T
 
I
M
 
M
A
 
R
N
 
Q
A
 
S
A
 
A
Q
 
E
T
 
M
L
 
I
K
 
K
K
 
H
V
 
V
S
 
T
L
 
L
E
|
E
L
|
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
N
 
S
P
 
P
Q
 
N
I
 
I
V
 
I
F
 
L
P
 
E
D
 
D
A
 
A
N
 
D
L
 
L
D
 
E
E
 
E
F
 
A
I
 
I
D
 
N
A
 
G
A
 
A
V
 
F
F
 
Q
G
 
G
A
 
I
Y
 
M
F
 
Y
N
 
N
A
 
H
G
 
G
E
 
Q
C
 
N
C
|
C
N
 
S
A
 
A
G
 
G
S
 
S
R
 
R
L
 
V
I
 
F
L
 
V
H
 
H
R
 
R
D
 
K
I
 
H
A
 
Y
E
 
E
E
 
T
V
 
V
T
 
V
A
 
D
R
 
A
I
 
L
A
 
V
S
 
K
L
 
M
S
 
A
A
 
N
K
 
N
V
 
V
K
 
K
V
 
L
G
 
G
D
 
A
P
 
G
L
 
M
D
 
E
P
 
K
E
 
E
T
 
T
Q
 
E
V
 
M
G
 
G
A
 
P
I
 
L
I
 
V
T
 
S
P
 
K
Q
 
K
H
x
Q
L
 
Q
Q
 
E
K
x
R
I
 
V
A
 
L
G
 
N
Y
 
Y
V
 
I
S
 
E
S
 
Q
A
 
G
S
 
K
N
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
T
I
 
V
A
 
A
H
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
E
T
 
R
L
 
A
D
 
-
L
 
L
G
 
E
M
 
K
G
 
G
Q
 
Y
F
 
F
M
 
V
A
 
K
P
 
P
T
 
T
I
 
V
L
 
F
S
 
T
A
 
D
V
 
V
R
 
T
P
 
D
E
 
D
M
 
M
A
 
T
V
 
I
A
 
V
R
 
K
E
 
E
E
|
E
V
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
V
S
 
V
V
 
V
L
 
L
T
 
P
F
 
F
E
 
D
K
 
S
T
 
T
E
 
E
E
 
E
A
 
V
I
 
I
R
 
E
I
 
R
A
 
A
N
 
N
S
 
N
I
 
S
D
 
S
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
S
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
W
 
W
S
 
T
R
 
Q
D
 
N
F
 
I
D
 
K
T
 
T
C
 
G
L
 
H
T
 
Q
I
 
V
G
 
A
R
 
N
R
 
K
V
 
L
R
 
K
A
 
A
G
 
G
T
 
T
V
 
V
W
 
W
M
 
I
N
 
N
T
 
D
F
 
Y
M
 
N
D
 
L
G
 
E
A
 
N
S
 
A
E
 
A
L
 
A
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
R
 
K
Q
 
Q
S
 
S
G
 
G
L
 
I
G
 
G
R
 
R
E
|
E
L
 
L
G
 
G
R
 
S
H
 
Y
A
 
A
V
 
L
E
 
D
D
 
N
Y
 
Y
T
 
T
E
 
E
T
 
V
K
 
K
T
 
S
L
 
V
N
 
W
M
 
V
H
 
N
I
 
I

4neaA 1.90 angstrom resolution crystal structure of betaine aldehyde dehydrogenase (betb) from staphylococcus aureus in complex with NAD+ and bme-free cys289 (see paper)
39% identity, 95% coverage: 21:499/504 of query aligns to 19:496/505 of 4neaA

query
sites
4neaA
R
 
R
M
 
Q
L
 
Y
I
 
I
D
 
D
G
 
G
Q
 
E
W
 
W
V
 
V
D
 
E
G
 
S
A
 
A
E
 
N
G
 
K
R
 
N
T
 
T
I
 
R
E
 
D
R
 
I
V
 
I
A
 
N
P
 
P
G
 
Y
H
 
N
G
 
Q
V
 
E
V
 
V
V
 
I
S
 
F
R
 
T
Y
 
V
Q
 
S
A
 
E
A
 
G
A
 
T
K
 
K
A
 
E
D
 
D
A
 
A
E
 
E
R
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
L
A
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
R
A
 
A
F
 
F
D
 
E
E
 
S
G
 
G
P
 
E
W
 
W
P
 
S
R
 
Q
M
 
E
T
 
T
A
 
A
S
 
E
E
 
T
R
 
R
S
 
G
L
 
K
I
 
K
L
 
V
L
 
R
R
 
A
A
 
I
A
 
A
D
 
D
M
 
K
I
 
I
A
 
K
A
 
E
R
 
H
A
 
R
D
 
E
E
 
A
L
 
L
A
 
A
F
 
R
L
 
L
D
 
E
A
 
T
V
 
L
E
 
D
S
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
T
I
 
L
S
 
E
Q
 
E
A
 
S
K
 
Y
G
 
A
E
 
D
L
 
M
A
 
D
G
 
D
A
 
I
A
 
H
D
 
N
I
 
V
W
 
F
R
 
M
Y
 
Y
A
 
F
A
 
A
A
 
G
L
 
L
A
 
A
R
 
D
E
 
K
L
 
D
S
 
G
G
 
G
E
 
E
S
 
M
Y
 
I
N
 
D
T
 
S
L
 
P
G
 
I
E
 
P
G
 
D
T
 
T
L
 
E
G
 
S
V
 
K
V
 
I
L
 
V
R
 
K
E
 
E
P
 
P
I
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
V
S
 
T
I
 
Q
I
 
I
T
 
T
P
|
P
W
 
W
N
|
N
F
 
Y
P
 
P
F
 
L
L
 
L
I
 
Q
V
 
A
S
 
S
Q
 
W
K
 
K
L
 
I
P
 
A
F
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
T
G
 
G
C
 
C
T
 
S
T
 
L
V
 
V
V
 
M
K
|
K
P
 
P
S
 
S
E
|
E
L
 
I
T
 
T
S
 
P
A
 
L
S
 
T
T
 
T
L
 
I
V
 
R
L
 
V
G
 
F
E
 
E
I
 
L
L
 
M
E
 
E
A
 
E
A
 
V
G
 
G
V
 
F
P
 
P
Q
 
K
G
 
G
V
 
T
V
 
I
N
 
N
I
 
L
I
 
I
V
 
L
G
 
G
T
 
A
G
|
G
P
 
S
E
 
E
A
 
V
G
|
G
A
 
D
P
 
V
L
 
M
T
 
S
T
 
G
H
 
H
P
 
K
H
 
E
V
 
V
D
 
D
M
 
L
V
 
V
S
 
S
F
 
F
T
 
T
G
|
G
S
x
G
T
 
I
G
 
E
I
x
T
G
 
G
Q
 
K
L
x
H
T
x
I
M
 
M
A
 
K
N
 
N
A
 
A
A
 
A
Q
 
N
T
 
N
L
 
V
K
 
T
K
 
N
V
 
I
S
 
A
L
 
L
E
|
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
N
 
N
P
 
P
Q
 
N
I
 
I
V
 
I
F
 
F
P
 
D
D
 
D
A
 
A
N
 
D
L
 
F
D
 
E
E
 
L
F
 
A
I
 
V
D
 
D
A
 
Q
A
 
A
V
 
L
F
 
N
G
 
G
A
 
G
Y
 
Y
F
 
F
N
 
H
A
 
A
G
 
G
E
 
Q
C
 
V
C
|
C
N
 
S
A
 
A
G
 
G
S
 
S
R
 
R
L
 
I
I
 
L
L
 
V
H
 
Q
R
 
N
D
 
S
I
 
I
A
 
K
E
 
D
E
 
K
V
 
F
T
 
E
A
 
Q
R
 
A
I
 
L
A
 
I
S
 
D
L
 
R
S
 
V
A
 
K
K
 
K
V
 
I
K
 
K
V
 
L
G
 
G
D
 
N
P
 
G
L
 
F
D
 
D
P
 
A
E
 
D
T
 
T
Q
 
E
V
 
M
G
 
G
A
 
P
I
 
V
I
 
I
T
 
S
P
 
T
Q
 
E
H
 
H
L
 
R
Q
 
N
K
 
K
I
 
I
A
 
E
G
 
S
Y
 
Y
V
 
M
S
 
D
S
 
V
A
 
A
S
 
K
N
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
T
I
 
I
A
 
A
H
 
V
G
 
G
G
 
G
T
 
K
-
 
R
-
 
P
-
 
D
T
 
R
L
 
D
D
 
D
L
 
L
G
 
K
M
 
D
G
 
G
Q
 
L
F
 
F
M
 
F
A
 
E
P
 
P
T
 
T
I
 
V
L
 
I
S
 
T
A
 
N
V
 
C
R
 
D
P
 
T
E
 
S
M
 
M
A
 
R
V
 
I
A
 
V
R
 
Q
E
 
E
E
|
E
V
 
V
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
V
S
 
T
V
 
V
L
 
E
T
 
G
F
 
F
E
 
E
K
 
T
T
 
E
E
 
Q
E
 
E
A
 
A
I
 
I
R
 
Q
I
 
L
A
 
A
N
 
N
S
 
D
I
 
S
D
 
I
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
S
 
A
A
 
G
G
 
A
V
 
V
W
 
F
S
 
S
R
 
K
D
 
D
F
 
I
D
 
G
T
 
K
C
 
A
L
 
Q
T
 
R
I
 
V
G
 
A
R
 
N
R
 
K
V
 
L
R
 
K
A
 
L
G
 
G
T
 
T
V
 
V
W
 
W
M
 
I
N
 
N
T
 
D
F
 
F
M
 
H
D
 
P
G
 
Y
A
 
F
S
 
A
E
 
Q
L
 
A
P
 
P
F
 
W
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
R
 
K
Q
 
Q
S
 
S
G
 
G
L
 
I
G
 
G
R
 
R
E
|
E
L
 
L
G
 
G
R
 
K
H
 
E
A
 
G
V
 
L
E
 
E
D
 
E
Y
 
Y
T
 
L
E
 
V
T
 
S
K
 
K
T
 
-
L
 
-
N
 
-
M
 
-
H
 
H
I
 
I
G
 
L
R
 
T
R
 
N
S
 
T
N
 
N

4pz2B Structure of zm aldh2-6 (rf2f) in complex with NAD (see paper)
42% identity, 96% coverage: 15:500/504 of query aligns to 3:493/494 of 4pz2B

query
sites
4pz2B
Y
 
F
D
 
D
T
 
V
R
 
P
E
 
E
F
 
I
R
 
R
-
 
F
-
 
T
-
 
K
M
 
L
L
 
F
I
 
I
D
 
N
G
 
G
Q
 
S
W
 
F
V
 
V
D
 
D
G
 
A
A
 
V
E
 
S
G
 
G
R
 
R
T
 
T
I
 
F
E
 
D
R
 
T
V
 
R
A
 
D
P
 
P
G
 
R
H
 
T
G
 
G
V
 
G
V
 
V
V
 
I
S
 
A
R
 
S
Y
 
V
Q
 
A
A
 
E
A
 
A
A
 
D
K
 
K
A
 
E
D
 
D
A
 
V
E
 
D
R
 
L
A
 
A
I
 
V
A
 
R
A
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
A
A
 
A
F
 
F
D
 
D
E
 
H
G
 
G
P
 
E
W
 
W
P
 
P
R
 
R
M
 
M
T
 
S
A
 
G
S
 
S
E
 
E
R
 
R
S
 
G
L
 
R
I
 
I
L
 
M
L
 
A
R
 
R
A
 
L
A
 
A
D
 
D
M
 
L
I
 
V
A
 
E
A
 
E
R
 
H
A
 
A
D
 
G
E
 
E
L
 
L
A
 
A
F
 
A
L
 
L
D
 
E
A
 
S
V
 
L
E
 
D
S
 
A
G
 
G
K
 
K
-
 
H
P
 
P
I
 
A
S
 
V
Q
 
T
A
 
R
K
 
A
G
 
V
E
 
D
L
 
V
A
 
G
G
 
N
A
 
A
A
 
A
D
 
G
I
 
S
W
 
L
R
 
R
Y
 
Y
A
 
F
A
 
A
A
 
G
L
 
A
A
 
A
R
 
D
E
 
K
L
 
I
S
 
H
G
 
G
E
 
E
S
 
T
Y
 
L
N
 
K
T
 
M
L
 
P
G
 
G
E
 
Q
G
 
F
T
 
Q
L
 
-
G
 
G
V
 
H
V
 
T
L
 
L
R
 
R
E
 
E
P
 
P
I
 
L
G
 
G
V
 
V
V
 
A
S
 
G
I
 
V
I
|
I
T
x
I
P
|
P
W
|
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
F
 
S
L
 
T
I
x
M
V
 
F
S
 
A
Q
 
V
K
 
K
L
 
V
P
 
A
F
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
C
T
 
A
T
 
L
V
 
V
V
 
V
K
|
K
P
 
P
S
x
A
E
|
E
L
 
Q
T
 
T
S
 
P
A
 
L
S
 
S
T
 
A
L
 
L
V
 
Y
L
 
L
G
 
A
E
 
Q
I
 
L
L
 
A
E
 
K
A
 
Q
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
Q
 
D
G
 
G
V
 
V
V
 
I
N
 
N
I
 
V
I
 
V
V
 
P
G
 
G
T
 
F
G
|
G
P
 
P
E
 
T
A
 
A
G
|
G
A
 
A
P
 
A
L
 
L
T
 
A
T
 
S
H
 
H
P
 
M
H
 
D
V
 
V
D
 
D
M
 
M
V
 
V
S
 
S
F
|
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
T
 
T
G
 
E
I
x
V
G
 
G
Q
 
R
L
 
L
T
 
I
M
 
M
-
 
K
A
 
A
N
 
S
A
 
A
A
 
E
Q
 
S
T
 
N
L
 
L
K
 
K
K
 
P
V
 
V
S
 
Y
L
 
L
E
|
E
L
|
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
N
 
S
P
 
P
Q
 
L
I
 
I
V
 
V
F
 
F
P
 
D
D
 
D
A
 
A
N
 
D
L
 
L
D
 
D
E
 
M
F
 
A
I
 
V
D
 
E
A
 
L
A
 
A
V
 
V
F
 
G
G
 
A
A
 
S
Y
 
F
F
 
F
N
 
N
A
 
K
G
 
G
E
 
E
C
 
A
C
|
C
N
 
V
A
 
A
G
 
A
S
 
S
R
 
R
L
 
V
I
 
Y
L
 
V
H
 
Q
R
 
E
D
 
R
I
 
V
A
 
Y
E
 
D
E
 
R
V
 
F
T
 
E
A
 
E
R
 
R
I
 
L
A
 
A
S
 
E
L
 
R
S
 
M
A
 
R
K
 
S
V
 
W
K
 
V
V
 
V
G
 
G
D
 
D
P
 
P
L
 
F
-
 
S
D
 
D
P
 
P
E
 
R
T
 
A
Q
 
D
V
 
Q
G
 
G
A
 
P
I
 
Q
I
 
V
T
 
D
P
 
K
Q
 
A
H
 
Q
L
 
Y
Q
 
E
K
 
R
I
 
V
A
 
L
G
 
S
Y
 
Y
V
 
I
S
 
D
S
 
H
A
 
G
S
 
K
N
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
T
I
 
L
A
 
L
H
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
R
T
 
P
L
 
C
-
 
A
D
 
P
L
 
E
G
 
G
M
 
K
G
 
G
Q
 
Y
F
 
Y
M
 
I
A
 
E
P
 
P
T
 
T
I
 
V
L
 
F
S
 
T
A
 
N
V
 
V
R
 
K
P
 
E
E
 
D
M
 
M
A
 
I
V
 
I
A
 
A
R
 
K
E
 
E
E
|
E
V
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
L
 
M
S
 
C
V
 
L
L
 
M
T
 
K
F
 
F
E
 
K
K
 
T
T
 
V
E
 
E
E
 
E
A
 
A
I
 
I
R
 
A
I
 
R
A
 
A
N
 
N
S
 
D
I
 
T
D
 
R
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
S
 
G
A
 
A
G
 
G
V
 
V
W
 
V
S
 
T
R
 
R
D
 
D
F
 
L
D
 
D
T
 
V
C
 
A
L
 
N
T
 
R
I
 
V
G
 
V
R
 
R
R
 
S
V
 
V
R
 
R
A
 
A
G
 
G
T
 
V
V
 
V
W
 
W
M
 
V
N
 
N
T
 
C
F
 
Y
M
 
F
D
 
A
G
 
M
A
 
G
S
 
S
E
 
D
L
 
C
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
Y
 
R
R
 
K
Q
 
M
S
 
S
G
 
G
L
 
F
G
 
G
R
 
K
E
x
D
L
 
E
G
 
G
R
 
M
H
 
H
A
 
A
V
 
L
E
 
D
D
 
K
Y
 
Y
T
 
L
E
 
A
T
 
V
K
 
K
T
 
S
L
 
V
N
 
V
M
 
T
H
 
P
I
 
L
G
 
-
R
 
R
R
 
A
S
 
S
N
 
P
W
 
W

O24174 Betaine aldehyde dehydrogenase 1; OsBADH1; EC 1.2.1.8 from Oryza sativa subsp. japonica (Rice) (see paper)
41% identity, 96% coverage: 22:503/504 of query aligns to 12:501/505 of O24174

query
sites
O24174
M
 
L
L
 
F
I
 
I
D
 
G
G
 
G
Q
 
G
W
 
W
V
 
R
D
 
E
G
 
P
A
 
S
E
 
L
G
 
G
R
 
R
T
 
R
I
 
L
E
 
P
R
 
V
V
 
V
A
 
N
P
 
P
G
 
A
H
 
T
G
 
E
V
 
A
V
 
T
V
 
I
S
 
G
R
 
D
Y
 
I
Q
 
P
A
 
A
A
 
A
A
 
T
K
 
A
A
 
E
D
 
D
A
 
V
E
 
E
R
 
L
A
 
A
I
 
V
A
 
S
A
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
D
A
 
A
F
 
F
-
 
G
-
 
R
D
 
D
E
 
G
G
 
G
-
 
R
P
 
H
W
 
W
P
 
S
R
 
R
M
 
A
T
 
P
A
 
G
S
 
A
E
 
V
R
 
R
S
 
A
L
 
K
I
 
Y
L
 
L
L
 
K
R
 
A
A
 
I
A
 
A
D
 
A
M
 
K
I