SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Synpcc7942_0031 Synpcc7942_0031 aminotransferase to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4cxqA Mycobaterium tuberculosis transaminase bioa complexed with substrate kapa (see paper)
41% identity, 98% coverage: 6:420/424 of query aligns to 13:421/427 of 4cxqA

query
sites
4cxqA
H
 
H
L
 
L
W
 
W
F
 
H
P
 
P
F
x
Y
T
 
S
S
 
S
V
 
I
K
 
G
D
 
R
A
 
E
P
 
V
D
 
S
P
 
P
L
 
V
K
 
V
V
 
A
V
 
V
S
 
A
G
 
A
K
 
H
G
 
G
A
 
A
R
 
W
L
 
L
T
 
T
L
 
L
A
 
I
-
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
Q
-
 
P
-
 
I
E
 
E
L
 
V
I
 
L
D
 
D
C
 
A
I
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
 
W
V
 
T
N
 
A
L
 
I
H
 
H
G
 
G
H
 
H
A
 
G
H
 
H
L
 
P
R
 
A
I
 
L
V
 
D
E
 
Q
A
 
A
I
 
L
A
 
T
Q
 
T
Q
 
Q
A
 
L
A
 
R
T
 
V
L
 
M
E
 
N
H
 
H
V
 
V
I
 
M
F
 
F
A
 
G
G
 
G
F
 
L
S
 
T
H
 
H
E
 
E
P
 
P
A
 
A
E
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A
M
 
K
E
 
L
L
 
L
C
 
V
K
 
D
I
 
I
L
 
T
P
 
P
E
 
A
K
 
G
L
 
L
T
 
D
R
 
T
V
 
V
F
 
F
F
 
F
S
 
S
D
 
D
N
 
S
G
|
G
S
|
S
T
 
V
A
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
L
 
A
K
 
K
M
 
M
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
W
 
W
H
 
R
N
 
G
L
 
R
D
 
G
Q
 
L
P
 
P
-
 
G
R
 
K
S
 
R
R
 
R
I
 
L
L
 
M
A
 
T
F
 
W
D
 
R
G
 
G
A
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
D
 
D
T
 
T
F
 
F
G
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
I
G
 
C
E
 
D
-
 
P
R
 
H
S
 
G
L
 
G
F
 
M
N
 
H
A
 
S
P
 
L
F
 
W
E
 
T
K
 
D
L
 
V
L
 
L
F
 
A
S
 
A
V
 
Q
E
 
V
F
 
F
L
 
A
P
 
P
Y
 
-
P
 
-
E
 
-
T
 
-
W
 
-
W
 
-
G
 
-
D
 
-
E
 
Q
T
 
V
V
 
P
E
 
R
A
 
D
K
 
Y
E
 
D
A
 
P
A
 
A
A
 
Y
I
 
S
A
 
A
A
 
A
V
 
F
E
 
E
Q
 
A
A
 
Q
L
 
L
A
 
A
-
 
Q
-
 
H
A
 
A
G
 
G
D
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
V
I
 
V
E
|
E
P
 
P
L
 
V
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
R
M
 
F
A
 
H
R
 
D
P
 
P
Q
 
R
F
 
Y
L
 
L
Q
 
H
Q
 
D
L
 
L
A
 
R
A
 
D
R
 
I
V
 
C
Q
 
R
A
 
R
A
 
Y
G
 
E
S
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
A
 
F
D
|
D
E
 
E
V
x
I
M
x
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
A
 
A
W
 
L
F
 
F
A
 
A
C
 
A
Q
 
D
R
 
H
A
 
A
G
 
G
I
 
V
Q
 
S
P
 
P
D
 
D
L
 
I
I
 
M
C
 
C
L
 
V
S
 
G
K
|
K
G
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
P
 
S
L
 
L
S
 
A
I
 
A
T
 
T
V
 
L
A
 
C
T
 
T
E
 
A
V
 
D
I
 
V
Y
 
A
D
 
H
T
 
T
F
 
I
C
 
S
S
 
A
G
 
G
N
 
A
P
 
A
D
 
G
H
 
-
T
 
A
F
 
L
Y
 
M
H
 
H
G
|
G
H
x
P
S
x
T
Y
 
F
T
 
M
A
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
G
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
V
A
 
S
I
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
V
E
 
E
L
 
L
L
 
L
L
 
L
-
 
G
-
 
Q
D
 
D
S
 
W
E
 
R
A
 
T
I
 
R
V
 
I
Q
 
T
G
 
E
L
 
L
E
 
A
D
 
A
A
 
G
H
 
L
L
 
T
P
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
D
L
 
T
L
 
A
A
 
R
Q
 
A
H
 
L
P
 
P
K
 
A
V
 
V
T
 
T
R
 
D
P
 
V
R
 
R
L
 
V
T
 
C
G
 
G
-
 
A
-
 
I
G
 
G
I
 
V
A
 
I
A
 
E
C
 
C
D
 
D
L
 
-
V
 
-
S
 
-
D
 
-
R
 
-
G
 
-
G
 
-
Y
 
-
L
 
-
D
 
R
P
 
P
I
 
V
G
 
D
L
 
L
R
 
A
V
 
V
R
 
A
Q
 
T
-
 
P
A
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
D
R
 
R
G
 
G
L
 
V
L
 
W
L
 
L
R
|
R
P
 
P
L
 
F
G
 
R
N
 
N
V
 
L
L
 
V
Y
|
Y
L
 
A
L
 
M
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
C
 
I
L
 
C
T
 
T
P
 
P
T
 
A
E
 
E
L
 
I
Q
 
T
D
 
Q
I
 
I
Y
 
T
A
 
S
A
 
A
I
 
M
A
 
V
D
 
E
L
 
V

3du4A Crystal structure of 7-keto-8-aminopelargonic acid bound 7,8- diaminopelargonic acid synthase in bacillus subtilis (see paper)
39% identity, 100% coverage: 3:424/424 of query aligns to 9:443/448 of 3du4A

query
sites
3du4A
S
 
S
H
 
K
P
 
K
H
 
H
L
 
L
W
 
W
F
 
L
P
 
P
F
|
F
T
 
T
S
 
Q
V
 
M
K
 
K
D
 
D
A
 
Y
-
 
D
P
 
E
D
 
N
P
 
P
L
 
L
K
 
I
V
 
I
V
 
E
S
 
S
G
 
G
K
 
T
G
 
G
A
 
I
R
 
K
L
 
V
T
 
K
L
 
D
A
 
I
D
 
N
G
 
G
R
 
K
E
 
E
L
 
Y
I
 
Y
D
 
D
C
 
G
I
 
F
S
 
S
S
 
S
W
 
V
W
 
W
V
 
L
N
 
N
L
 
V
H
 
H
G
 
G
H
 
H
A
 
R
H
 
K
L
 
K
R
 
E
I
 
L
V
 
D
E
 
D
A
 
A
I
 
I
A
 
K
Q
 
K
Q
 
Q
A
 
L
A
 
G
T
 
K
L
 
I
E
 
A
H
 
H
V
 
S
I
 
T
F
 
L
A
x
L
G
 
G
F
 
M
S
 
T
H
 
N
E
 
V
P
 
P
A
 
A
E
 
T
R
 
Q
L
 
L
A
 
A
M
 
E
E
 
T
L
 
L
C
 
I
K
 
D
I
 
I
L
 
S
P
 
P
E
 
K
K
 
K
L
 
L
T
 
T
R
 
R
V
 
V
F
 
F
F
 
Y
S
 
S
D
 
D
N
x
S
G
|
G
S
x
A
T
 
E
A
 
A
V
 
M
E
 
E
V
 
I
A
 
A
L
 
L
K
 
K
M
 
M
A
 
A
L
 
F
Q
 
Q
Y
 
Y
W
 
W
H
 
K
N
 
N
L
 
I
D
 
G
Q
 
K
P
 
P
-
 
E
R
 
K
S
 
Q
R
 
K
I
 
F
L
 
I
A
 
A
F
 
M
D
 
K
G
 
N
A
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
D
 
D
T
 
T
F
 
I
G
 
G
A
 
A
M
 
V
S
 
S
V
 
V
G
 
G
E
 
S
R
 
I
S
 
E
L
 
L
F
 
F
N
 
H
A
 
H
P
 
V
F
 
Y
E
 
G
K
 
P
L
 
L
L
 
M
F
 
F
S
 
E
V
 
S
E
 
Y
F
 
K
L
 
A
P
 
P
Y
 
I
P
 
P
E
 
Y
T
 
V
W
 
Y
W
 
R
G
 
S
D
 
-
E
 
E
T
 
S
V
 
G
E
 
D
A
 
P
K
 
D
E
 
E
A
 
C
-
 
R
-
 
D
A
 
Q
A
 
C
I
 
L
A
 
R
A
 
E
V
 
L
E
 
A
Q
 
Q
A
 
L
L
 
L
A
 
E
A
 
E
-
 
H
-
 
H
G
 
E
D
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
L
I
 
S
I
 
I
E
|
E
P
 
S
L
 
M
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
 
S
G
 
G
M
 
M
R
 
I
M
 
V
A
 
M
R
 
P
P
 
E
Q
 
G
F
 
Y
L
 
L
Q
 
A
Q
 
G
L
 
V
A
 
R
A
 
E
R
 
L
V
 
C
Q
 
T
A
 
T
A
 
Y
G
 
D
S
 
V
L
 
L
L
 
M
I
 
I
A
 
V
D
|
D
E
 
E
V
|
V
M
x
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
A
 
K
W
 
M
F
 
F
A
 
A
C
 
C
Q
 
E
R
 
H
A
 
E
G
 
N
I
 
V
Q
 
Q
P
 
P
D
 
D
L
 
L
I
 
M
C
 
A
L
 
A
S
 
G
K
|
K
G
 
G
L
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
P
 
P
L
 
I
S
 
A
I
 
V
T
 
T
V
 
F
A
 
A
T
 
T
E
 
E
V
 
D
I
 
I
Y
 
Y
D
 
K
T
 
A
F
 
F
C
 
Y
S
 
D
G
 
D
N
 
Y
P
 
E
D
 
N
-
 
L
H
 
K
T
 
T
F
 
F
Y
 
F
H
 
H
G
|
G
H
|
H
S
|
S
Y
 
Y
T
 
T
A
 
G
N
 
N
P
 
Q
L
 
L
G
 
G
C
 
C
A
 
A
A
 
V
A
 
A
I
 
L
A
 
E
S
 
N
L
 
L
E
 
-
L
 
A
L
 
L
L
 
F
D
 
E
S
 
S
E
 
E
A
 
N
I
 
I
V
 
V
Q
 
E
G
 
Q
L
 
V
E
 
A
D
 
E
A
 
K
H
 
S
L
 
-
P
 
K
G
 
K
L
 
L
E
 
H
L
 
F
L
 
L
A
 
L
Q
 
Q
H
 
D
-
 
L
-
 
H
-
 
A
-
 
L
P
 
P
K
 
H
V
 
V
T
 
G
R
 
D
P
 
I
R
 
R
L
 
Q
T
 
L
G
 
G
G
 
F
I
 
M
A
 
C
A
 
G
C
 
A
D
 
E
L
 
L
V
 
V
S
 
R
D
 
S
R
 
K
G
 
E
G
 
T
Y
 
K
L
 
-
D
 
E
P
 
P
-
 
Y
-
 
P
-
 
A
-
 
D
-
 
R
-
 
R
I
 
I
G
 
G
L
 
Y
R
 
K
V
 
V
R
 
S
Q
 
L
A
 
K
A
 
M
I
 
R
A
 
E
R
 
L
G
 
G
L
 
M
L
 
L
L
 
T
R
|
R
P
 
P
L
 
L
G
 
G
N
 
D
V
 
V
L
 
I
Y
x
A
L
 
F
L
 
L
P
 
P
P
 
P
Y
 
L
C
 
A
L
 
S
T
 
T
P
 
A
T
 
E
E
 
E
L
 
L
Q
 
S
D
 
E
I
 
M
Y
 
V
A
 
A
A
 
I
I
 
M
A
 
K
D
 
Q
L
 
A
L
 
I
D
 
H
E
 
E
I
 
V

P53555 L-Lysine--8-amino-7-oxononanoate transaminase; 7,8-diamino-pelargonic acid aminotransferase; DAPA AT; DAPA aminotransferase; 7,8-diaminononanoate synthase; DANS; Diaminopelargonic acid synthase; L-Lysine--8-amino-7-oxononanoate aminotransferase; EC 2.6.1.105 from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
39% identity, 100% coverage: 3:424/424 of query aligns to 9:443/448 of P53555

query
sites
P53555
S
 
S
H
 
K
P
 
K
H
 
H
L
 
L
W
 
W
F
 
L
P
 
P
F
 
F
T
 
T
S
 
Q
V
 
M
K
 
K
D
 
D
A
 
Y
-
 
D
P
 
E
D
 
N
P
 
P
L
 
L
K
 
I
V
 
I
V
 
E
S
 
S
G
 
G
K
 
T
G
 
G
A
 
I
R
 
K
L
 
V
T
 
K
L
 
D
A
 
I
D
 
N
G
 
G
R
 
K
E
 
E
L
 
Y
I
 
Y
D
 
D
C
 
G
I
 
F
S
 
S
S
 
S
W
 
V
W
 
W
V
 
L
N
 
N
L
 
V
H
 
H
G
 
G
H
 
H
A
 
R
H
 
K
L
 
K
R
 
E
I
 
L
V
 
D
E
 
D
A
 
A
I
 
I
A
 
K
Q
 
K
Q
 
Q
A
 
L
A
 
G
T
 
K
L
 
I
E
 
A
H
 
H
V
 
S
I
 
T
F
 
L
A
 
L
G
 
G
F
 
M
S
 
T
H
 
N
E
 
V
P
 
P
A
 
A
E
 
T
R
 
Q
L
 
L
A
 
A
M
 
E
E
 
T
L
 
L
C
 
I
K
 
D
I
 
I
L
 
S
P
 
P
E
 
K
K
 
K
L
 
L
T
 
T
R
 
R
V
 
V
F
 
F
F
 
Y
S
 
S
D
 
D
N
 
S
G
|
G
S
x
A
T
 
E
A
 
A
V
 
M
E
 
E
V
 
I
A
 
A
L
 
L
K
 
K
M
 
M
A
 
A
L
 
F
Q
 
Q
Y
 
Y
W
 
W
H
 
K
N
 
N
L
 
I
D
 
G
Q
 
K
P
 
P
-
 
E
R
 
K
S
 
Q
R
 
K
I
 
F
L
 
I
A
 
A
F
 
M
D
 
K
G
 
N
A
 
G
Y
|
Y
H
 
H
G
 
G
D
 
D
T
 
T
F
 
I
G
 
G
A
 
A
M
 
V
S
 
S
V
 
V
G
 
G
E
 
S
R
 
I
S
 
E
L
 
L
F
 
F
N
 
H
A
 
H
P
 
V
F
 
Y
E
 
G
K
 
P
L
 
L
L
 
M
F
 
F
S
 
E
V
 
S
E
 
Y
F
 
K
L
 
A
P
 
P
Y
 
I
P
 
P
E
 
Y
T
 
V
W
 
Y
W
 
R
G
 
S
D
 
-
E
 
E
T
 
S
V
 
G
E
 
D
A
 
P
K
 
D
E
 
E
A
 
C
-
 
R
-
 
D
A
 
Q
A
 
C
I
 
L
A
 
R
A
 
E
V
 
L
E
 
A
Q
 
Q
A
 
L
L
 
L
A
 
E
A
 
E
-
 
H
-
 
H
G
 
E
D
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
L
I
 
S
I
 
I
E
 
E
P
 
S
L
 
M
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
 
S
G
 
G
M
 
M
R
 
I
M
 
V
A
 
M
R
 
P
P
 
E
Q
 
G
F
 
Y
L
 
L
Q
 
A
Q
 
G
L
 
V
A
 
R
A
 
E
R
 
L
V
 
C
Q
 
T
A
 
T
A
 
Y
G
 
D
S
 
V
L
 
L
L
 
M
I
 
I
A
 
V
D
 
D
E
 
E
V
 
V
M
 
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
A
 
K
W
 
M
F
 
F
A
 
A
C
 
C
Q
 
E
R
 
H
A
 
E
G
 
N
I
 
V
Q
 
Q
P
 
P
D
 
D
L
 
L
I
 
M
C
 
A
L
 
A
S
 
G
K
|
K
G
 
G
L
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
P
 
P
L
 
I
S
 
A
I
 
V
T
 
T
V
 
F
A
 
A
T
 
T
E
 
E
V
 
D
I
 
I
Y
 
Y
D
 
K
T
 
A
F
 
F
C
 
Y
S
 
D
G
 
D
N
 
Y
P
 
E
D
 
N
-
 
L
H
 
K
T
 
T
F
 
F
Y
 
F
H
 
H
G
|
G
H
|
H
S
|
S
Y
 
Y
T
 
T
A
 
G
N
 
N
P
 
Q
L
 
L
G
 
G
C
 
C
A
 
A
A
 
V
A
 
A
I
 
L
A
 
E
S
 
N
L
 
L
E
 
-
L
 
A
L
 
L
L
 
F
D
 
E
S
 
S
E
 
E
A
 
N
I
 
I
V
 
V
Q
 
E
G
 
Q
L
 
V
E
 
A
D
 
E
A
 
K
H
 
S
L
 
-
P
 
K
G
 
K
L
 
L
E
 
H
L
 
F
L
 
L
A
 
L
Q
 
Q
H
 
D
-
 
L
-
 
H
-
 
A
-
 
L
P
 
P
K
 
H
V
 
V
T
 
G
R
 
D
P
 
I
R
 
R
L
 
Q
T
 
L
G
 
G
G
 
F
I
 
M
A
 
C
A
 
G
C
 
A
D
 
E
L
 
L
V
 
V
S
 
R
D
 
S
R
 
K
G
 
E
G
 
T
Y
 
K
L
 
-
D
 
E
P
 
P
-
 
Y
-
 
P
-
 
A
-
 
D
-
 
R
-
 
R
I
 
I
G
 
G
L
 
Y
R
 
K
V
 
V
R
 
S
Q
 
L
A
 
K
A
 
M
I
 
R
A
 
E
R
 
L
G
 
G
L
 
M
L
 
L
L
 
T
R
|
R
P
 
P
L
 
L
G
 
G
N
 
D
V
 
V
L
 
I
Y
 
A
L
 
F
L
 
L
P
 
P
P
 
P
Y
 
L
C
 
A
L
 
S
T
 
T
P
 
A
T
 
E
E
 
E
L
 
L
Q
 
S
D
 
E
I
 
M
Y
 
V
A
 
A
A
 
I
I
 
M
A
 
K
D
 
Q
L
 
A
L
 
I
D
 
H
E
 
E
I
 
V

4w1vA Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase (bioa) from mycobacterium tuberculosis, complexed with a thiazole inhibitor (see paper)
41% identity, 98% coverage: 6:420/424 of query aligns to 13:419/425 of 4w1vA

query
sites
4w1vA
H
 
H
L
 
L
W
 
W
F
 
H
P
|
P
F
x
Y
T
 
S
S
 
S
V
 
I
K
 
G
D
 
R
A
 
S
P
 
P
D
 
-
P
 
-
L
 
V
K
 
V
V
 
A
V
 
V
S
 
A
G
 
A
K
 
H
G
 
G
A
 
A
R
 
W
L
 
L
T
 
T
L
 
L
A
 
I
-
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
Q
-
 
P
-
 
I
E
 
E
L
 
V
I
 
L
D
 
D
C
 
A
I
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
 
W
V
 
T
N
 
A
L
 
I
H
 
H
G
 
G
H
 
H
A
 
G
H
 
H
L
 
P
R
 
A
I
 
L
V
 
D
E
 
Q
A
 
A
I
 
L
A
 
T
Q
 
T
Q
 
Q
A
 
L
A
 
R
T
 
V
L
 
M
E
 
N
H
 
H
V
 
V
I
x
M
F
 
F
A
x
G
G
 
G
F
 
L
S
 
T
H
 
H
E
 
E
P
 
P
A
 
A
E
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A
M
 
K
E
 
L
L
 
L
C
 
V
K
 
D
I
 
I
L
 
T
P
 
P
E
 
A
K
 
G
L
 
L
T
 
D
R
 
T
V
 
V
F
 
F
F
 
F
S
 
S
D
 
D
N
 
S
G
|
G
S
|
S
T
 
V
A
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
L
 
A
K
 
K
M
 
M
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
W
 
W
H
 
R
N
 
G
L
 
R
D
 
G
Q
 
L
P
 
P
-
 
G
R
 
K
S
 
R
R
 
R
I
 
L
L
 
M
A
 
T
F
 
W
D
 
R
G
 
G
A
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
D
 
D
T
 
T
F
 
F
G
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
I
G
 
C
E
 
D
-
 
P
R
 
H
S
 
G
L
 
G
F
 
M
N
 
H
A
 
S
P
 
L
F
 
W
E
 
T
K
 
D
L
 
V
L
 
L
F
 
A
S
 
A
V
 
Q
E
 
V
F
 
F
L
 
A
P
 
P
Y
 
-
P
 
-
E
 
-
T
 
-
W
 
-
W
 
-
G
 
-
D
 
-
E
 
Q
T
 
V
V
 
P
E
 
R
A
 
D
K
 
Y
E
 
D
A
 
P
A
 
A
A
 
Y
I
 
S
A
 
A
A
 
A
V
 
F
E
 
E
Q
 
A
A
 
Q
L
 
L
A
 
A
-
 
Q
-
 
H
A
 
A
G
 
G
D
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
V
I
 
V
E
|
E
P
 
P
L
 
V
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
R
M
 
F
A
 
H
R
 
D
P
 
P
Q
 
R
F
 
Y
L
 
L
Q
 
H
Q
 
D
L
 
L
A
 
R
A
 
D
R
 
I
V
 
C
Q
 
R
A
 
R
A
 
Y
G
 
E
S
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
A
 
F
D
|
D
E
 
E
V
x
I
M
x
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
A
 
A
W
 
L
F
 
F
A
 
A
C
 
A
Q
 
D
R
 
H
A
 
A
G
 
G
I
 
V
Q
 
S
P
 
P
D
 
D
L
 
I
I
 
M
C
 
C
L
 
V
S
 
G
K
|
K
G
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
P
 
S
L
 
L
S
 
A
I
 
A
T
 
T
V
 
L
A
 
C
T
 
T
E
 
A
V
 
D
I
 
V
Y
 
A
D
 
H
T
 
T
F
 
I
C
 
S
S
 
A
G
 
G
N
 
A
P
 
A
D
 
G
H
 
-
T
 
A
F
 
L
Y
 
M
H
 
H
G
|
G
H
x
P
S
x
T
Y
 
F
T
 
M
A
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
G
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
V
A
 
S
I
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
V
E
 
E
L
 
L
L
 
L
L
 
L
-
 
G
-
 
Q
D
 
D
S
 
W
E
 
R
A
 
T
I
 
R
V
 
I
Q
 
T
G
 
E
L
 
L
E
 
A
D
 
A
A
 
G
H
 
L
L
 
T
P
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
D
L
 
T
L
 
A
A
 
R
Q
 
A
H
 
L
P
 
P
K
 
A
V
 
V
T
 
T
R
 
D
P
 
V
R
 
R
L
 
V
T
 
C
G
 
G
-
 
A
-
 
I
G
 
G
I
 
V
A
 
I
A
 
E
C
 
C
D
 
D
L
 
-
V
 
-
S
 
-
D
 
-
R
 
-
G
 
-
G
 
-
Y
 
-
L
 
-
D
 
R
P
 
P
I
 
V
G
 
D
L
 
L
R
 
A
V
 
V
R
 
A
Q
 
T
-
 
P
A
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
D
R
 
R
G
 
G
L
 
V
L
 
W
L
 
L
R
 
R
P
 
P
L
x
F
G
 
R
N
 
N
V
 
L
L
 
V
Y
|
Y
L
 
A
L
 
M
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
C
 
I
L
 
C
T
 
T
P
 
P
T
 
A
E
 
E
L
 
I
Q
 
T
D
 
Q
I
 
I
Y
 
T
A
 
S
A
 
A
I
 
M
A
 
V
D
 
E
L
 
V

4cxrA Mycobaterium tuberculosis transaminase bioa complexed with 1-(1,3- benzothiazol-2-yl)methanamine (see paper)
41% identity, 98% coverage: 6:420/424 of query aligns to 13:419/425 of 4cxrA

query
sites
4cxrA
H
 
H
L
 
L
W
 
W
F
 
H
P
 
P
F
x
Y
T
 
S
S
 
S
V
 
I
K
 
G
D
 
R
A
 
S
P
 
P
D
 
-
P
 
-
L
 
V
K
 
V
V
 
A
V
 
V
S
 
A
G
 
A
K
 
H
G
 
G
A
 
A
R
 
W
L
 
L
T
 
T
L
 
L
A
 
I
-
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
Q
-
 
P
-
 
I
E
 
E
L
 
V
I
 
L
D
 
D
C
 
A
I
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
|
W
V
 
T
N
 
A
L
 
I
H
 
H
G
 
G
H
 
H
A
 
G
H
 
H
L
 
P
R
 
A
I
 
L
V
 
D
E
 
Q
A
 
A
I
 
L
A
 
T
Q
 
T
Q
 
Q
A
 
L
A
 
R
T
 
V
L
 
M
E
 
N
H
 
H
V
 
V
I
 
M
F
 
F
A
 
G
G
 
G
F
 
L
S
 
T
H
 
H
E
 
E
P
 
P
A
 
A
E
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A
M
 
K
E
 
L
L
 
L
C
 
V
K
 
D
I
 
I
L
 
T
P
 
P
E
 
A
K
 
G
L
 
L
T
 
D
R
 
T
V
 
V
F
 
F
F
 
F
S
 
S
D
 
D
N
 
S
G
|
G
S
|
S
T
 
V
A
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
L
 
A
K
 
K
M
 
M
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
W
 
W
H
 
R
N
 
G
L
 
R
D
 
G
Q
 
L
P
 
P
-
 
G
R
 
K
S
 
R
R
 
R
I
 
L
L
 
M
A
 
T
F
 
W
D
 
R
G
 
G
A
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
D
 
D
T
 
T
F
 
F
G
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
I
G
 
C
E
 
D
-
 
P
R
 
H
S
 
G
L
 
G
F
 
M
N
 
H
A
 
S
P
 
L
F
 
W
E
 
T
K
 
D
L
 
V
L
 
L
F
 
A
S
 
A
V
 
Q
E
 
V
F
 
F
L
 
A
P
 
P
Y
 
-
P
 
-
E
 
-
T
 
-
W
 
-
W
 
-
G
 
-
D
 
-
E
 
Q
T
 
V
V
 
P
E
 
R
A
 
D
K
 
Y
E
 
D
A
 
P
A
 
A
A
 
Y
I
 
S
A
 
A
A
 
A
V
 
F
E
 
E
Q
 
A
A
 
Q
L
 
L
A
 
A
-
 
Q
-
 
H
A
 
A
G
 
G
D
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
V
I
 
V
E
|
E
P
 
P
L
 
V
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
|
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
R
M
 
F
A
 
H
R
 
D
P
 
P
Q
 
R
F
 
Y
L
 
L
Q
 
H
Q
 
D
L
 
L
A
 
R
A
 
D
R
 
I
V
 
C
Q
 
R
A
 
R
A
 
Y
G
 
E
S
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
A
 
F
D
|
D
E
 
E
V
x
I
M
x
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
A
 
A
W
 
L
F
 
F
A
 
A
C
 
A
Q
 
D
R
 
H
A
 
A
G
 
G
I
 
V
Q
 
S
P
 
P
D
 
D
L
 
I
I
 
M
C
 
C
L
 
V
S
 
G
K
|
K
G
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
P
 
S
L
 
L
S
 
A
I
 
A
T
 
T
V
 
L
A
 
C
T
 
T
E
 
A
V
 
D
I
 
V
Y
 
A
D
 
H
T
 
T
F
 
I
C
 
S
S
 
A
G
 
G
N
 
A
P
 
A
D
 
G
H
 
-
T
 
A
F
 
L
Y
 
M
H
 
H
G
 
G
H
x
P
S
x
T
Y
 
F
T
 
M
A
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
G
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
V
A
 
S
I
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
V
E
 
E
L
 
L
L
 
L
L
 
L
-
 
G
-
 
Q
D
 
D
S
 
W
E
 
R
A
 
T
I
 
R
V
 
I
Q
 
T
G
 
E
L
 
L
E
 
A
D
 
A
A
 
G
H
 
L
L
 
T
P
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
D
L
 
T
L
 
A
A
 
R
Q
 
A
H
 
L
P
 
P
K
 
A
V
 
V
T
 
T
R
 
D
P
 
V
R
 
R
L
 
V
T
 
C
G
 
G
-
 
A
-
 
I
G
 
G
I
 
V
A
 
I
A
 
E
C
 
C
D
 
D
L
 
-
V
 
-
S
 
-
D
 
-
R
 
-
G
 
-
G
 
-
Y
 
-
L
 
-
D
 
R
P
 
P
I
 
V
G
 
D
L
 
L
R
 
A
V
 
V
R
 
A
Q
 
T
-
 
P
A
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
D
R
 
R
G
 
G
L
 
V
L
 
W
L
 
L
R
 
R
P
 
P
L
 
F
G
 
R
N
 
N
V
 
L
L
 
V
Y
|
Y
L
 
A
L
 
M
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
C
 
I
L
 
C
T
 
T
P
 
P
T
 
A
E
 
E
L
 
I
Q
 
T
D
 
Q
I
 
I
Y
 
T
A
 
S
A
 
A
I
 
M
A
 
V
D
 
E
L
 
V

P9WQ81 Adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase; 7,8-diamino-pelargonic acid aminotransferase; DAPA AT; DAPA aminotransferase; 7,8-diaminononanoate synthase; DANS; 7,8-diaminopelargonic acid synthase; DAPAS; Diaminopelargonic acid synthase; EC 2.6.1.62 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
41% identity, 98% coverage: 6:420/424 of query aligns to 20:429/437 of P9WQ81

query
sites
P9WQ81
H
 
H
L
 
L
W
 
W
F
 
H
P
 
P
F
x
Y
T
 
S
S
 
S
V
 
I
-
 
G
K
 
R
D
 
E
A
 
A
P
 
V
D
 
S
P
 
P
L
 
V
K
 
V
V
 
A
V
 
V
S
 
A
G
 
A
K
 
H
G
 
G
A
 
A
R
 
W
L
 
L
T
 
T
L
 
L
A
 
I
-
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
Q
-
 
P
-
 
I
E
 
E
L
 
V
I
 
L
D
 
D
C
 
A
I
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
 
W
V
 
T
N
 
A
L
 
I
H
 
H
G
 
G
H
 
H
A
 
G
H
 
H
L
 
P
R
 
A
I
 
L
V
 
D
E
 
Q
A
 
A
I
 
L
A
 
T
Q
 
T
Q
 
Q
A
 
L
A
 
R
T
 
V
L
 
M
E
 
N
H
 
H
V
 
V
I
 
M
F
 
F
A
 
G
G
 
G
F
 
L
S
 
T
H
 
H
E
 
E
P
 
P
A
 
A
E
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A
M
 
K
E
 
L
L
 
L
C
 
V
K
 
D
I
 
I
L
 
T
P
 
P
E
 
A
K
 
G
L
 
L
T
 
D
R
 
T
V
 
V
F
 
F
F
 
F
S
 
S
D
 
D
N
 
S
G
 
G
S
 
S
T
 
V
A
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
L
 
A
K
 
K
M
 
M
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
W
 
W
H
 
R
N
 
G
L
 
R
D
 
G
Q
 
L
P
 
P
-
 
G
R
 
K
S
 
R
R
 
R
I
 
L
L
 
M
A
 
T
F
 
W
D
 
R
G
 
G
A
 
G
Y
|
Y
H
 
H
G
 
G
D
 
D
T
 
T
F
 
F
G
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
I
G
 
C
E
 
D
-
 
P
R
 
H
S
 
G
L
 
G
F
 
M
N
 
H
A
 
S
P
 
L
F
 
W
E
 
T
K
 
D
L
 
V
L
 
L
F
 
A
S
 
A
V
 
Q
E
 
V
F
 
F
L
 
A
P
 
P
Y
 
-
P
 
-
E
 
-
T
 
-
W
 
-
W
 
-
G
 
-
D
 
-
E
 
Q
T
 
V
V
 
P
E
 
R
A
 
D
K
 
Y
E
 
D
A
 
P
A
 
A
A
 
Y
I
 
S
A
 
A
A
 
A
V
 
F
E
 
E
Q
 
A
A
 
Q
L
 
L
A
 
A
-
 
Q
-
 
H
A
 
A
G
 
G
D
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
V
I
 
V
E
 
E
P
 
P
L
 
V
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
R
M
 
F
A
 
H
R
 
D
P
 
P
Q
 
R
F
 
Y
L
 
L
Q
 
H
Q
 
D
L
 
L
A
 
R
A
 
D
R
 
I
V
 
C
Q
 
R
A
 
R
A
 
Y
G
 
E
S
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
A
 
F
D
 
D
E
 
E
V
 
I
M
 
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
A
 
A
W
 
L
F
 
F
A
 
A
C
 
A
Q
 
D
R
 
H
A
 
A
G
 
G
I
 
V
Q
 
S
P
 
P
D
 
D
L
 
I
I
 
M
C
 
C
L
 
V
S
 
G
K
|
K
G
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
P
 
S
L
 
L
S
 
A
I
 
A
T
 
T
V
 
L
A
 
C
T
 
T
E
 
A
V
 
D
I
 
V
Y
 
A
D
 
H
T
 
T
F
 
I
C
 
S
S
 
A
G
 
G
N
 
A
P
 
A
D
 
G
H
 
-
T
 
A
F
 
L
Y
 
M
H
 
H
G
|
G
H
 
P
S
 
T
Y
 
F
T
 
M
A
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
G
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
V
A
 
S
I
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
V
E
 
E
L
 
L
L
 
L
L
 
L
-
 
G
-
 
Q
D
 
D
S
 
W
E
 
R
A
 
T
I
 
R
V
 
I
Q
 
T
G
 
E
L
 
L
E
 
A
D
 
A
A
 
G
H
 
L
L
 
T
P
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
D
L
 
T
L
 
A
A
 
R
Q
 
A
H
 
L
P
 
P
K
 
A
V
 
V
T
 
T
R
 
D
P
 
V
R
 
R
L
 
V
T
 
C
G
 
G
-
 
A
-
 
I
G
 
G
I
 
V
A
 
I
A
 
E
C
 
C
D
 
D
L
 
-
V
 
-
S
 
-
D
 
-
R
 
-
G
 
-
G
 
-
Y
 
-
L
 
-
D
 
R
P
 
P
I
 
V
G
 
D
L
 
L
R
 
A
V
 
V
R
 
A
Q
 
T
-
 
P
A
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
D
R
 
R
G
 
G
L
 
V
L
 
W
L
 
L
R
 
R
P
 
P
L
 
F
G
 
R
N
 
N
V
 
L
L
 
V
Y
 
Y
L
 
A
L
 
M
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
C
 
I
L
 
C
T
 
T
P
 
P
T
 
A
E
 
E
L
 
I
Q
 
T
D
 
Q
I
 
I
Y
 
T
A
 
S
A
 
A
I
 
M
A
 
V
D
 
E
L
 
V

4wydA Adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase from mycobacterium tuberculosis complexed with a fragment from dsf screening (see paper)
41% identity, 98% coverage: 6:420/424 of query aligns to 13:422/430 of 4wydA

query
sites
4wydA
H
 
H
L
 
L
W
 
W
F
 
H
P
 
P
F
x
Y
T
 
S
S
 
S
V
 
I
-
 
G
K
 
R
D
 
E
A
 
A
P
 
V
D
 
S
P
 
P
L
 
V
K
 
V
V
 
A
V
 
V
S
 
A
G
 
A
K
 
H
G
 
G
A
 
A
R
 
W
L
 
L
T
 
T
L
 
L
A
 
I
-
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
Q
-
 
P
-
 
I
E
 
E
L
 
V
I
 
L
D
 
D
C
 
A
I
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
|
W
V
 
T
N
 
A
L
 
I
H
 
H
G
 
G
H
 
H
A
 
G
H
 
H
L
 
P
R
 
A
I
 
L
V
 
D
E
 
Q
A
 
A
I
 
L
A
 
T
Q
 
T
Q
 
Q
A
 
L
A
 
R
T
 
V
L
 
M
E
 
N
H
 
H
V
 
V
I
 
M
F
 
F
A
 
G
G
 
G
F
 
L
S
 
T
H
 
H
E
 
E
P
 
P
A
 
A
E
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A
M
 
K
E
 
L
L
 
L
C
 
V
K
 
D
I
 
I
L
 
T
P
 
P
E
 
A
K
 
G
L
 
L
T
 
D
R
 
T
V
 
V
F
 
F
F
 
F
S
 
S
D
 
D
N
 
S
G
|
G
S
|
S
T
 
V
A
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
L
 
A
K
 
K
M
 
M
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
W
 
W
H
 
R
N
 
G
L
 
R
D
 
G
Q
 
L
P
 
P
-
 
G
R
 
K
S
 
R
R
 
R
I
 
L
L
 
M
A
 
T
F
 
W
D
 
R
G
 
G
A
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
D
 
D
T
 
T
F
 
F
G
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
I
G
 
C
E
 
D
-
 
P
R
 
H
S
 
G
L
 
G
F
 
M
N
 
H
A
 
S
P
 
L
F
 
W
E
 
T
K
 
D
L
 
V
L
 
L
F
 
A
S
 
A
V
 
Q
E
 
V
F
 
F
L
 
A
P
 
P
Y
 
-
P
 
-
E
 
-
T
 
-
W
 
-
W
 
-
G
 
-
D
 
-
E
 
Q
T
 
V
V
 
P
E
 
R
A
 
D
K
 
Y
E
 
D
A
 
P
A
 
A
A
 
Y
I
 
S
A
 
A
A
 
A
V
 
F
E
 
E
Q
 
A
A
 
Q
L
 
L
A
 
A
-
 
Q
-
 
H
A
 
A
G
 
G
D
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
V
I
 
V
E
|
E
P
 
P
L
 
V
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
|
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
R
M
 
F
A
 
H
R
 
D
P
 
P
Q
 
R
F
 
Y
L
 
L
Q
 
H
Q
 
D
L
 
L
A
 
R
A
 
D
R
 
I
V
 
C
Q
 
R
A
 
R
A
 
Y
G
 
E
S
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
A
 
F
D
|
D
E
 
E
V
x
I
M
x
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
A
 
A
W
 
L
F
 
F
A
 
A
C
 
A
Q
 
D
R
 
H
A
 
A
G
 
G
I
 
V
Q
 
S
P
 
P
D
 
D
L
 
I
I
 
M
C
 
C
L
 
V
S
 
G
K
|
K
G
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
P
 
S
L
 
L
S
 
A
I
 
A
T
 
T
V
 
L
A
 
C
T
 
T
E
 
A
V
 
D
I
 
V
Y
 
A
D
 
H
T
 
T
F
 
I
C
 
S
S
 
A
G
 
G
N
 
A
P
 
A
D
 
G
H
 
-
T
 
A
F
 
L
Y
 
M
H
 
H
G
|
G
H
x
P
S
x
T
Y
 
F
T
 
M
A
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
G
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
V
A
 
S
I
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
V
E
 
E
L
 
L
L
 
L
L
 
L
-
 
G
-
 
Q
D
 
D
S
 
W
E
 
R
A
 
T
I
 
R
V
 
I
Q
 
T
G
 
E
L
 
L
E
 
A
D
 
A
A
 
G
H
 
L
L
 
T
P
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
D
L
 
T
L
 
A
A
 
R
Q
 
A
H
 
L
P
 
P
K
 
A
V
 
V
T
 
T
R
 
D
P
 
V
R
 
R
L
 
V
T
 
C
G
 
G
-
 
A
-
 
I
G
 
G
I
 
V
A
 
I
A
 
E
C
 
C
D
 
D
L
 
-
V
 
-
S
 
-
D
 
-
R
 
-
G
 
-
G
 
-
Y
 
-
L
 
-
D
 
R
P
 
P
I
 
V
G
 
D
L
 
L
R
 
A
V
 
V
R
 
A
Q
 
T
-
 
P
A
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
D
R
 
R
G
 
G
L
 
V
L
 
W
L
 
L
R
 
R
P
 
P
L
x
F
G
 
R
N
 
N
V
 
L
L
 
V
Y
|
Y
L
 
A
L
 
M
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
C
 
I
L
 
C
T
 
T
P
 
P
T
 
A
E
 
E
L
 
I
Q
 
T
D
 
Q
I
 
I
Y
 
T
A
 
S
A
 
A
I
 
M
A
 
V
D
 
E
L
 
V

5kgtA Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase (bioa) from mycobacterium tuberculosis, complexed with an inhibitor optimized from hts lead: 1-[4-[4-(3-chlorophenyl)carbonylpiperidin-1- yl]phenyl]ethanone (see paper)
41% identity, 98% coverage: 6:420/424 of query aligns to 13:422/429 of 5kgtA

query
sites
5kgtA
H
 
H
L
 
L
W
 
W
F
 
H
P
 
P
F
x
Y
T
 
S
S
 
S
V
 
I
-
 
G
K
 
R
D
 
E
A
 
A
P
 
V
D
 
S
P
 
P
L
 
V
K
 
V
V
 
A
V
 
V
S
 
A
G
 
A
K
 
H
G
 
G
A
 
A
R
 
W
L
 
L
T
 
T
L
 
L
A
 
I
-
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
Q
-
 
P
-
 
I
E
 
E
L
 
V
I
 
L
D
 
D
C
 
A
I
 
M
S
 
S
S
 
S
W
 
W
W
 
W
V
 
T
N
 
A
L
 
I
H
 
H
G
 
G
H
 
H
A
 
G
H
 
H
L
 
P
R
 
A
I
 
L
V
 
D
E
 
Q
A
 
A
I
 
L
A
 
T
Q
 
T
Q
 
Q
A
 
L
A
 
R
T
 
V
L
 
M
E
 
N
H
 
H
V
 
V
I
x
M
F
 
F
A
x
G
G
 
G
F
 
L
S
 
T
H
 
H
E
 
E
P
 
P
A
 
A
E
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A
M
 
K
E
 
L
L
 
L
C
 
V
K
 
D
I
 
I
L
 
T
P
 
P
E
 
A
K
 
G
L
 
L
T
 
D
R
 
T
V
 
V
F
 
F
F
 
F
S
 
S
D
 
D
N
x
S
G
|
G
S
|
S
T
 
V
A
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
L
 
A
K
 
K
M
 
M
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
W
 
W
H
 
R
N
 
G
L
 
R
D
 
G
Q
 
L
P
 
P
-
 
G
R
 
K
S
 
R
R
 
R
I
 
L
L
 
M
A
 
T
F
 
W
D
 
R
G
 
G
A
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
D
 
D
T
 
T
F
 
F
G
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
I
G
 
C
E
 
D
-
 
P
R
 
H
S
 
G
L
 
G
F
 
M
N
 
H
A
 
S
P
 
L
F
 
W
E
 
T
K
 
D
L
 
V
L
 
L
F
 
A
S
 
A
V
 
Q
E
 
V
F
 
F
L
 
A
P
 
P
Y
 
-
P
 
-
E
 
-
T
 
-
W
 
-
W
 
-
G
 
-
D
 
-
E
 
Q
T
 
V
V
 
P
E
 
R
A
 
D
K
 
Y
E
 
D
A
 
P
A
 
A
A
 
Y
I
 
S
A
 
A
A
 
A
V
 
F
E
 
E
Q
 
A
A
 
Q
L
 
L
A
 
A
-
 
Q
-
 
H
A
 
A
G
 
G
D
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
V
I
 
V
E
|
E
P
 
P
L
 
V
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
R
M
 
F
A
 
H
R
 
D
P
 
P
Q
 
R
F
 
Y
L
 
L
Q
 
H
Q
 
D
L
 
L
A
 
R
A
 
D
R
 
I
V
 
C
Q
 
R
A
 
R
A
 
Y
G
 
E
S
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
A
 
F
D
|
D
E
 
E
V
x
I
M
x
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
A
 
A
W
 
L
F
 
F
A
 
A
C
 
A
Q
 
D
R
 
H
A
 
A
G
 
G
I
 
V
Q
 
S
P
 
P
D
 
D
L
 
I
I
 
M
C
 
C
L
 
V
S
 
G
K
|
K
G
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
P
 
S
L
 
L
S
 
A
I
 
A
T
 
T
V
 
L
A
 
C
T
 
T
E
 
A
V
 
D
I
 
V
Y
 
A
D
 
H
T
 
T
F
 
I
C
 
S
S
 
A
G
 
G
N
 
A
P
 
A
D
 
G
H
 
-
T
 
A
F
 
L
Y
 
M
H
 
H
G
|
G
H
 
P
S
x
T
Y
 
F
T
 
M
A
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
G
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
V
A
 
S
I
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
V
E
 
E
L
 
L
L
 
L
L
 
L
-
 
G
-
 
Q
D
 
D
S
 
W
E
 
R
A
 
T
I
 
R
V
 
I
Q
 
T
G
 
E
L
 
L
E
 
A
D
 
A
A
 
G
H
 
L
L
 
T
P
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
D
L
 
T
L
 
A
A
 
R
Q
 
A
H
 
L
P
 
P
K
 
A
V
 
V
T
 
T
R
 
D
P
 
V
R
 
R
L
 
V
T
 
C
G
 
G
-
 
A
-
 
I
G
 
G
I
 
V
A
 
I
A
 
E
C
 
C
D
 
D
L
 
-
V
 
-
S
 
-
D
 
-
R
 
-
G
 
-
G
 
-
Y
 
-
L
 
-
D
 
R
P
 
P
I
 
V
G
 
D
L
 
L
R
 
A
V
 
V
R
 
A
Q
 
T
-
 
P
A
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
D
R
 
R
G
 
G
L
 
V
L
 
W
L
 
L
R
 
R
P
 
P
L
 
F
G
 
R
N
 
N
V
 
L
L
 
V
Y
|
Y
L
 
A
L
 
M
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
C
 
I
L
 
C
T
 
T
P
 
P
T
 
A
E
 
E
L
 
I
Q
 
T
D
 
Q
I
 
I
Y
 
T
A
 
S
A
 
A
I
 
M
A
 
V
D
 
E
L
 
V

5kgsA Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase (bioa) from mycobacterium tuberculosis, complexed with an inhibitor optimized from hts lead: 5-[4-(1,3-benzodioxol-5-ylcarbonyl)piperazin-1-yl]-2, 3-dihydroinden-1-one (see paper)
41% identity, 98% coverage: 6:420/424 of query aligns to 13:422/429 of 5kgsA

query
sites
5kgsA
H
 
H
L
 
L
W
 
W
F
 
H
P
|
P
F
x
Y
T
 
S
S
 
S
V
 
I
-
 
G
K
 
R
D
 
E
A
 
A
P
 
V
D
 
S
P
 
P
L
 
V
K
 
V
V
 
A
V
 
V
S
 
A
G
 
A
K
 
H
G
 
G
A
 
A
R
 
W
L
 
L
T
 
T
L
 
L
A
 
I
-
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
Q
-
 
P
-
 
I
E
 
E
L
 
V
I
 
L
D
 
D
C
 
A
I
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
 
W
V
 
T
N
 
A
L
 
I
H
 
H
G
 
G
H
 
H
A
 
G
H
 
H
L
 
P
R
 
A
I
 
L
V
 
D
E
 
Q
A
 
A
I
 
L
A
 
T
Q
 
T
Q
 
Q
A
 
L
A
 
R
T
 
V
L
 
M
E
 
N
H
 
H
V
 
V
I
x
M
F
 
F
A
x
G
G
 
G
F
 
L
S
 
T
H
 
H
E
 
E
P
 
P
A
 
A
E
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A
M
 
K
E
 
L
L
 
L
C
 
V
K
 
D
I
 
I
L
 
T
P
 
P
E
 
A
K
 
G
L
 
L
T
 
D
R
 
T
V
 
V
F
 
F
F
 
F
S
 
S
D
 
D
N
 
S
G
|
G
S
|
S
T
 
V
A
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
L
 
A
K
 
K
M
 
M
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
W
 
W
H
 
R
N
 
G
L
 
R
D
 
G
Q
 
L
P
 
P
-
 
G
R
 
K
S
 
R
R
 
R
I
 
L
L
 
M
A
 
T
F
 
W
D
 
R
G
 
G
A
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
D
 
D
T
 
T
F
 
F
G
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
I
G
 
C
E
x
D
-
 
P
R
 
H
S
x
G
L
x
G
F
 
M
N
 
H
A
 
S
P
 
L
F
 
W
E
 
T
K
 
D
L
 
V
L
 
L
F
 
A
S
 
A
V
 
Q
E
 
V
F
 
F
L
 
A
P
 
P
Y
 
-
P
 
-
E
 
-
T
 
-
W
 
-
W
 
-
G
 
-
D
 
-
E
 
Q
T
 
V
V
 
P
E
 
R
A
 
D
K
 
Y
E
 
D
A
 
P
A
 
A
A
 
Y
I
 
S
A
 
A
A
 
A
V
 
F
E
 
E
Q
 
A
A
 
Q
L
 
L
A
 
A
-
 
Q
-
 
H
A
 
A
G
 
G
D
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
V
I
 
V
E
|
E
P
 
P
L
 
V
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
R
M
 
F
A
 
H
R
 
D
P
 
P
Q
 
R
F
 
Y
L
 
L
Q
 
H
Q
 
D
L
 
L
A
 
R
A
 
D
R
 
I
V
 
C
Q
 
R
A
 
R
A
 
Y
G
 
E
S
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
A
 
F
D
|
D
E
 
E
V
x
I
M
x
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
A
 
A
W
 
L
F
 
F
A
 
A
C
 
A
Q
 
D
R
 
H
A
 
A
G
 
G
I
 
V
Q
 
S
P
 
P
D
 
D
L
 
I
I
 
M
C
 
C
L
 
V
S
 
G
K
|
K
G
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
P
 
S
L
 
L
S
 
A
I
 
A
T
 
T
V
 
L
A
 
C
T
 
T
E
 
A
V
 
D
I
 
V
Y
 
A
D
 
H
T
 
T
F
 
I
C
 
S
S
 
A
G
 
G
N
 
A
P
 
A
D
 
G
H
 
-
T
 
A
F
 
L
Y
 
M
H
 
H
G
 
G
H
x
P
S
x
T
Y
 
F
T
 
M
A
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
G
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
V
A
 
S
I
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
V
E
 
E
L
 
L
L
 
L
L
 
L
-
 
G
-
 
Q
D
 
D
S
 
W
E
 
R
A
 
T
I
 
R
V
 
I
Q
 
T
G
 
E
L
 
L
E
 
A
D
 
A
A
 
G
H
 
L
L
 
T
P
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
D
L
 
T
L
 
A
A
 
R
Q
 
A
H
 
L
P
 
P
K
 
A
V
 
V
T
 
T
R
 
D
P
 
V
R
 
R
L
 
V
T
 
C
G
 
G
-
 
A
-
 
I
G
 
G
I
 
V
A
 
I
A
 
E
C
 
C
D
 
D
L
 
-
V
 
-
S
 
-
D
 
-
R
 
-
G
 
-
G
 
-
Y
 
-
L
 
-
D
 
R
P
 
P
I
 
V
G
 
D
L
 
L
R
 
A
V
 
V
R
 
A
Q
 
T
-
 
P
A
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
D
R
 
R
G
 
G
L
 
V
L
 
W
L
 
L
R
 
R
P
 
P
L
x
F
G
 
R
N
 
N
V
 
L
L
 
V
Y
|
Y
L
 
A
L
 
M
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
C
 
I
L
 
C
T
 
T
P
 
P
T
 
A
E
 
E
L
 
I
Q
 
T
D
 
Q
I
 
I
Y
 
T
A
 
S
A
 
A
I
 
M
A
 
V
D
 
E
L
 
V

4xjpA Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase (bioa) from mycobacterium tuberculosis, complexed with an inhibitor optimized from hts lead (see paper)
41% identity, 98% coverage: 6:420/424 of query aligns to 13:422/429 of 4xjpA

query
sites
4xjpA
H
 
H
L
 
L
W
 
W
F
 
H
P
|
P
F
x
Y
T
 
S
S
 
S
V
 
I
-
 
G
K
 
R
D
 
E
A
 
A
P
 
V
D
 
S
P
 
P
L
 
V
K
 
V
V
 
A
V
 
V
S
 
A
G
 
A
K
 
H
G
 
G
A
 
A
R
 
W
L
 
L
T
 
T
L
 
L
A
 
I
-
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
Q
-
 
P
-
 
I
E
 
E
L
 
V
I
 
L
D
 
D
C
 
A
I
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
 
W
V
 
T
N
 
A
L
 
I
H
 
H
G
 
G
H
 
H
A
 
G
H
 
H
L
 
P
R
 
A
I
 
L
V
 
D
E
 
Q
A
 
A
I
 
L
A
 
T
Q
 
T
Q
 
Q
A
 
L
A
 
R
T
 
V
L
 
M
E
 
N
H
 
H
V
 
V
I
x
M
F
 
F
A
x
G
G
 
G
F
 
L
S
 
T
H
 
H
E
 
E
P
 
P
A
 
A
E
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A
M
 
K
E
 
L
L
 
L
C
 
V
K
 
D
I
 
I
L
 
T
P
 
P
E
 
A
K
 
G
L
 
L
T
 
D
R
 
T
V
 
V
F
 
F
F
 
F
S
 
S
D
 
D
N
 
S
G
|
G
S
|
S
T
 
V
A
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
L
 
A
K
 
K
M
 
M
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
W
 
W
H
 
R
N
 
G
L
 
R
D
 
G
Q
 
L
P
 
P
-
 
G
R
 
K
S
 
R
R
 
R
I
 
L
L
 
M
A
 
T
F
 
W
D
 
R
G
 
G
A
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
D
 
D
T
 
T
F
 
F
G
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
I
G
 
C
E
 
D
-
 
P
R
 
H
S
x
G
L
x
G
F
 
M
N
 
H
A
 
S
P
 
L
F
 
W
E
 
T
K
 
D
L
 
V
L
 
L
F
 
A
S
 
A
V
 
Q
E
 
V
F
 
F
L
 
A
P
 
P
Y
 
-
P
 
-
E
 
-
T
 
-
W
 
-
W
 
-
G
 
-
D
 
-
E
 
Q
T
 
V
V
 
P
E
 
R
A
 
D
K
 
Y
E
 
D
A
 
P
A
 
A
A
 
Y
I
 
S
A
 
A
A
 
A
V
 
F
E
 
E
Q
 
A
A
 
Q
L
 
L
A
 
A
-
 
Q
-
 
H
A
 
A
G
 
G
D
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
V
I
 
V
E
|
E
P
 
P
L
 
V
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
|
A
G
|
G
G
 
G
M
 
M
R
 
R
M
 
F
A
 
H
R
 
D
P
 
P
Q
 
R
F
 
Y
L
 
L
Q
 
H
Q
 
D
L
 
L
A
 
R
A
 
D
R
 
I
V
 
C
Q
 
R
A
 
R
A
 
Y
G
 
E
S
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
A
 
F
D
|
D
E
 
E
V
x
I
M
x
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
A
 
A
W
 
L
F
 
F
A
 
A
C
 
A
Q
 
D
R
 
H
A
 
A
G
 
G
I
 
V
Q
 
S
P
 
P
D
 
D
L
 
I
I
 
M
C
 
C
L
 
V
S
 
G
K
|
K
G
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
P
 
S
L
 
L
S
 
A
I
 
A
T
 
T
V
 
L
A
 
C
T
 
T
E
 
A
V
 
D
I
 
V
Y
 
A
D
 
H
T
 
T
F
 
I
C
 
S
S
 
A
G
 
G
N
 
A
P
 
A
D
 
G
H
 
-
T
 
A
F
 
L
Y
 
M
H
 
H
G
|
G
H
x
P
S
x
T
Y
 
F
T
 
M
A
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
G
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
V
A
 
S
I
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
V
E
 
E
L
 
L
L
 
L
L
 
L
-
 
G
-
 
Q
D
 
D
S
 
W
E
 
R
A
 
T
I
 
R
V
 
I
Q
 
T
G
 
E
L
 
L
E
 
A
D
 
A
A
 
G
H
 
L
L
 
T
P
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
D
L
 
T
L
 
A
A
 
R
Q
 
A
H
 
L
P
 
P
K
 
A
V
 
V
T
 
T
R
 
D
P
 
V
R
 
R
L
 
V
T
 
C
G
 
G
-
 
A
-
 
I
G
 
G
I
 
V
A
 
I
A
 
E
C
 
C
D
 
D
L
 
-
V
 
-
S
 
-
D
 
-
R
 
-
G
 
-
G
 
-
Y
 
-
L
 
-
D
 
R
P
 
P
I
 
V
G
 
D
L
 
L
R
 
A
V
 
V
R
 
A
Q
 
T
-
 
P
A
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
D
R
 
R
G
 
G
L
 
V
L
 
W
L
 
L
R
 
R
P
 
P
L
x
F
G
 
R
N
 
N
V
 
L
L
 
V
Y
|
Y
L
 
A
L
 
M
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
C
 
I
L
 
C
T
 
T
P
 
P
T
 
A
E
 
E
L
 
I
Q
 
T
D
 
Q
I
 
I
Y
 
T
A
 
S
A
 
A
I
 
M
A
 
V
D
 
E
L
 
V

4xjmA Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase (bioa) from mycobacterium tuberculosis, complexed with a hts lead compound
41% identity, 98% coverage: 6:420/424 of query aligns to 13:422/429 of 4xjmA

query
sites
4xjmA
H
 
H
L
 
L
W
 
W
F
 
H
P
|
P
F
x
Y
T
 
S
S
 
S
V
 
I
-
 
G
K
 
R
D
 
E
A
 
A
P
 
V
D
 
S
P
 
P
L
 
V
K
 
V
V
 
A
V
 
V
S
 
A
G
 
A
K
 
H
G
 
G
A
 
A
R
 
W
L
 
L
T
 
T
L
 
L
A
 
I
-
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
Q
-
 
P
-
 
I
E
 
E
L
 
V
I
 
L
D
 
D
C
 
A
I
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
 
W
V
 
T
N
 
A
L
 
I
H
 
H
G
 
G
H
 
H
A
 
G
H
 
H
L
 
P
R
 
A
I
 
L
V
 
D
E
 
Q
A
 
A
I
 
L
A
 
T
Q
 
T
Q
 
Q
A
 
L
A
 
R
T
 
V
L
 
M
E
 
N
H
 
H
V
 
V
I
x
M
F
 
F
A
x
G
G
 
G
F
 
L
S
 
T
H
 
H
E
 
E
P
 
P
A
 
A
E
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A
M
 
K
E
 
L
L
 
L
C
 
V
K
 
D
I
 
I
L
 
T
P
 
P
E
 
A
K
 
G
L
 
L
T
 
D
R
 
T
V
 
V
F
 
F
F
 
F
S
 
S
D
 
D
N
 
S
G
|
G
S
|
S
T
 
V
A
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
L
 
A
K
 
K
M
 
M
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
W
 
W
H
 
R
N
 
G
L
 
R
D
 
G
Q
 
L
P
 
P
-
 
G
R
 
K
S
 
R
R
 
R
I
 
L
L
 
M
A
 
T
F
 
W
D
 
R
G
 
G
A
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
D
 
D
T
 
T
F
 
F
G
 
L
A
 
A
M
|
M
S
 
S
V
 
I
G
 
C
E
 
D
-
 
P
R
 
H
S
x
G
L
x
G
F
x
M
N
 
H
A
 
S
P
 
L
F
x
W
E
 
T
K
 
D
L
 
V
L
 
L
F
 
A
S
 
A
V
 
Q
E
 
V
F
 
F
L
 
A
P
 
P
Y
 
-
P
 
-
E
 
-
T
 
-
W
 
-
W
 
-
G
 
-
D
 
-
E
 
Q
T
 
V
V
 
P
E
 
R
A
 
D
K
 
Y
E
 
D
A
 
P
A
 
A
A
 
Y
I
 
S
A
 
A
A
 
A
V
 
F
E
 
E
Q
 
A
A
 
Q
L
 
L
A
 
A
-
 
Q
-
 
H
A
 
A
G
 
G
D
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
V
I
 
V
E
|
E
P
 
P
L
 
V
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
R
M
 
F
A
 
H
R
 
D
P
 
P
Q
 
R
F
 
Y
L
 
L
Q
 
H
Q
 
D
L
 
L
A
 
R
A
 
D
R
 
I
V
 
C
Q
 
R
A
 
R
A
 
Y
G
 
E
S
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
A
 
F
D
|
D
E
 
E
V
x
I
M
x
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
A
 
A
W
 
L
F
 
F
A
 
A
C
 
A
Q
 
D
R
 
H
A
 
A
G
 
G
I
 
V
Q
 
S
P
 
P
D
 
D
L
 
I
I
 
M
C
 
C
L
 
V
S
 
G
K
|
K
G
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
P
 
S
L
 
L
S
 
A
I
 
A
T
 
T
V
 
L
A
 
C
T
 
T
E
 
A
V
 
D
I
 
V
Y
 
A
D
 
H
T
 
T
F
 
I
C
 
S
S
 
A
G
 
G
N
 
A
P
 
A
D
 
G
H
 
-
T
 
A
F
 
L
Y
x
M
H
 
H
G
|
G
H
x
P
S
x
T
Y
 
F
T
 
M
A
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
G
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
V
A
 
S
I
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
V
E
 
E
L
 
L
L
 
L
L
 
L
-
 
G
-
 
Q
D
 
D
S
 
W
E
 
R
A
 
T
I
 
R
V
 
I
Q
 
T
G
 
E
L
 
L
E
 
A
D
 
A
A
 
G
H
 
L
L
 
T
P
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
D
L
 
T
L
 
A
A
 
R
Q
 
A
H
 
L
P
 
P
K
 
A
V
 
V
T
 
T
R
 
D
P
 
V
R
 
R
L
 
V
T
 
C
G
 
G
-
 
A
-
 
I
G
 
G
I
 
V
A
 
I
A
 
E
C
 
C
D
 
D
L
 
-
V
 
-
S
 
-
D
 
-
R
 
-
G
 
-
G
 
-
Y
 
-
L
 
-
D
 
R
P
 
P
I
 
V
G
 
D
L
 
L
R
 
A
V
 
V
R
 
A
Q
 
T
-
 
P
A
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
D
R
 
R
G
 
G
L
 
V
L
 
W
L
 
L
R
 
R
P
 
P
L
 
F
G
 
R
N
 
N
V
 
L
L
 
V
Y
|
Y
L
 
A
L
 
M
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
C
 
I
L
 
C
T
 
T
P
 
P
T
 
A
E
 
E
L
 
I
Q
 
T
D
 
Q
I
 
I
Y
 
T
A
 
S
A
 
A
I
 
M
A
 
V
D
 
E
L
 
V

4xjlA Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase (bioa) from mycobacterium tuberculosis, complexed with a hts lead compound
41% identity, 98% coverage: 6:420/424 of query aligns to 13:422/429 of 4xjlA

query
sites
4xjlA
H
 
H
L
 
L
W
 
W
F
 
H
P
|
P
F
x
Y
T
 
S
S
 
S
V
 
I
-
 
G
K
 
R
D
 
E
A
 
A
P
 
V
D
 
S
P
 
P
L
 
V
K
 
V
V
 
A
V
 
V
S
 
A
G
 
A
K
 
H
G
 
G
A
 
A
R
 
W
L
 
L
T
 
T
L
 
L
A
 
I
-
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
Q
-
 
P
-
 
I
E
 
E
L
 
V
I
 
L
D
 
D
C
 
A
I
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
 
W
V
 
T
N
 
A
L
 
I
H
 
H
G
 
G
H
 
H
A
 
G
H
 
H
L
 
P
R
 
A
I
 
L
V
 
D
E
 
Q
A
 
A
I
 
L
A
 
T
Q
 
T
Q
 
Q
A
 
L
A
 
R
T
 
V
L
 
M
E
 
N
H
 
H
V
 
V
I
x
M
F
 
F
A
x
G
G
 
G
F
 
L
S
 
T
H
 
H
E
 
E
P
 
P
A
 
A
E
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A
M
 
K
E
 
L
L
 
L
C
 
V
K
 
D
I
 
I
L
 
T
P
 
P
E
 
A
K
 
G
L
 
L
T
 
D
R
 
T
V
 
V
F
 
F
F
 
F
S
 
S
D
 
D
N
 
S
G
|
G
S
|
S
T
 
V
A
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
L
 
A
K
 
K
M
 
M
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
W
 
W
H
 
R
N
 
G
L
 
R
D
 
G
Q
 
L
P
 
P
-
 
G
R
 
K
S
 
R
R
 
R
I
 
L
L
 
M
A
 
T
F
 
W
D
 
R
G
 
G
A
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
D
 
D
T
 
T
F
 
F
G
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
I
G
x
C
E
 
D
-
 
P
R
 
H
S
x
G
L
x
G
F
 
M
N
 
H
A
 
S
P
 
L
F
 
W
E
 
T
K
 
D
L
 
V
L
 
L
F
 
A
S
 
A
V
 
Q
E
 
V
F
 
F
L
 
A
P
 
P
Y
 
-
P
 
-
E
 
-
T
 
-
W
 
-
W
 
-
G
 
-
D
 
-
E
 
Q
T
 
V
V
 
P
E
 
R
A
 
D
K
 
Y
E
 
D
A
 
P
A
 
A
A
 
Y
I
 
S
A
 
A
A
 
A
V
 
F
E
 
E
Q
 
A
A
 
Q
L
 
L
A
 
A
-
 
Q
-
 
H
A
 
A
G
 
G
D
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
V
I
 
V
E
|
E
P
 
P
L
 
V
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
|
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
R
M
 
F
A
 
H
R
 
D
P
 
P
Q
 
R
F
 
Y
L
 
L
Q
 
H
Q
 
D
L
 
L
A
 
R
A
 
D
R
 
I
V
 
C
Q
 
R
A
 
R
A
 
Y
G
 
E
S
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
A
 
F
D
|
D
E
 
E
V
x
I
M
x
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
A
 
A
W
 
L
F
 
F
A
 
A
C
 
A
Q
 
D
R
 
H
A
 
A
G
 
G
I
 
V
Q
 
S
P
 
P
D
 
D
L
 
I
I
 
M
C
 
C
L
 
V
S
 
G
K
|
K
G
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
P
 
S
L
 
L
S
 
A
I
 
A
T
 
T
V
 
L
A
 
C
T
 
T
E
 
A
V
 
D
I
 
V
Y
 
A
D
 
H
T
 
T
F
 
I
C
 
S
S
 
A
G
 
G
N
 
A
P
 
A
D
 
G
H
 
-
T
 
A
F
 
L
Y
 
M
H
 
H
G
 
G
H
x
P
S
x
T
Y
 
F
T
 
M
A
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
G
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
V
A
 
S
I
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
V
E
 
E
L
 
L
L
 
L
L
 
L
-
 
G
-
 
Q
D
 
D
S
 
W
E
 
R
A
 
T
I
 
R
V
 
I
Q
 
T
G
 
E
L
 
L
E
 
A
D
 
A
A
 
G
H
 
L
L
 
T
P
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
D
L
 
T
L
 
A
A
 
R
Q
 
A
H
 
L
P
 
P
K
 
A
V
 
V
T
 
T
R
 
D
P
 
V
R
 
R
L
 
V
T
 
C
G
 
G
-
 
A
-
 
I
G
 
G
I
 
V
A
 
I
A
 
E
C
 
C
D
 
D
L
 
-
V
 
-
S
 
-
D
 
-
R
 
-
G
 
-
G
 
-
Y
 
-
L
 
-
D
 
R
P
 
P
I
 
V
G
 
D
L
 
L
R
 
A
V
 
V
R
 
A
Q
 
T
-
 
P
A
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
D
R
 
R
G
 
G
L
 
V
L
 
W
L
 
L
R
 
R
P
 
P
L
 
F
G
 
R
N
 
N
V
 
L
L
 
V
Y
|
Y
L
 
A
L
 
M
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
C
 
I
L
 
C
T
 
T
P
 
P
T
 
A
E
 
E
L
 
I
Q
 
T
D
 
Q
I
 
I
Y
 
T
A
 
S
A
 
A
I
 
M
A
 
V
D
 
E
L
 
V

4wygA Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase (bioa) from mycobacterium tuberculosis complexed with a fragment hit (see paper)
41% identity, 98% coverage: 6:420/424 of query aligns to 13:422/429 of 4wygA

query
sites
4wygA
H
 
H
L
 
L
W
 
W
F
 
H
P
 
P
F
x
Y
T
 
S
S
 
S
V
 
I
-
 
G
K
 
R
D
 
E
A
 
A
P
 
V
D
 
S
P
 
P
L
 
V
K
 
V
V
 
A
V
 
V
S
 
A
G
 
A
K
 
H
G
 
G
A
 
A
R
 
W
L
 
L
T
 
T
L
 
L
A
 
I
-
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
Q
-
 
P
-
 
I
E
 
E
L
 
V
I
 
L
D
 
D
C
 
A
I
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
|
W
V
 
T
N
 
A
L
 
I
H
 
H
G
 
G
H
 
H
A
 
G
H
 
H
L
 
P
R
 
A
I
 
L
V
 
D
E
 
Q
A
 
A
I
 
L
A
 
T
Q
 
T
Q
 
Q
A
 
L
A
 
R
T
 
V
L
 
M
E
 
N
H
 
H
V
 
V
I
 
M
F
 
F
A
 
G
G
 
G
F
 
L
S
 
T
H
 
H
E
 
E
P
 
P
A
 
A
E
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A
M
 
K
E
 
L
L
 
L
C
 
V
K
 
D
I
 
I
L
 
T
P
 
P
E
 
A
K
 
G
L
 
L
T
 
D
R
 
T
V
 
V
F
 
F
F
 
F
S
 
S
D
 
D
N
 
S
G
|
G
S
|
S
T
 
V
A
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
L
 
A
K
 
K
M
 
M
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
W
 
W
H
 
R
N
 
G
L
 
R
D
 
G
Q
 
L
P
 
P
-
 
G
R
 
K
S
 
R
R
 
R
I
 
L
L
 
M
A
 
T
F
 
W
D
 
R
G
 
G
A
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
D
 
D
T
 
T
F
 
F
G
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
I
G
 
C
E
 
D
-
 
P
R
 
H
S
 
G
L
 
G
F
 
M
N
 
H
A
 
S
P
 
L
F
 
W
E
 
T
K
 
D
L
 
V
L
 
L
F
 
A
S
 
A
V
 
Q
E
 
V
F
 
F
L
 
A
P
 
P
Y
 
-
P
 
-
E
 
-
T
 
-
W
 
-
W
 
-
G
 
-
D
 
-
E
 
Q
T
 
V
V
 
P
E
 
R
A
 
D
K
 
Y
E
 
D
A
 
P
A
 
A
A
 
Y
I
 
S
A
 
A
A
 
A
V
 
F
E
 
E
Q
 
A
A
 
Q
L
 
L
A
 
A
-
 
Q
-
 
H
A
 
A
G
 
G
D
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
V
I
 
V
E
|
E
P
 
P
L
 
V
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
|
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
R
M
 
F
A
 
H
R
 
D
P
 
P
Q
 
R
F
 
Y
L
 
L
Q
 
H
Q
 
D
L
 
L
A
 
R
A
 
D
R
 
I
V
 
C
Q
 
R
A
 
R
A
 
Y
G
 
E
S
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
A
 
F
D
|
D
E
 
E
V
x
I
M
x
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
A
 
A
W
 
L
F
 
F
A
 
A
C
 
A
Q
 
D
R
 
H
A
 
A
G
 
G
I
 
V
Q
 
S
P
 
P
D
 
D
L
 
I
I
 
M
C
 
C
L
 
V
S
 
G
K
|
K
G
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
P
 
S
L
 
L
S
 
A
I
 
A
T
 
T
V
 
L
A
 
C
T
 
T
E
 
A
V
 
D
I
 
V
Y
 
A
D
 
H
T
 
T
F
 
I
C
 
S
S
 
A
G
 
G
N
 
A
P
 
A
D
 
G
H
 
-
T
 
A
F
 
L
Y
 
M
H
 
H
G
 
G
H
x
P
S
x
T
Y
 
F
T
 
M
A
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
G
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
V
A
 
S
I
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
V
E
 
E
L
 
L
L
 
L
L
 
L
-
 
G
-
 
Q
D
 
D
S
 
W
E
 
R
A
 
T
I
 
R
V
 
I
Q
 
T
G
 
E
L
 
L
E
 
A
D
 
A
A
 
G
H
 
L
L
 
T
P
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
D
L
 
T
L
 
A
A
 
R
Q
 
A
H
 
L
P
 
P
K
 
A
V
 
V
T
 
T
R
 
D
P
 
V
R
 
R
L
 
V
T
 
C
G
 
G
-
 
A
-
 
I
G
 
G
I
 
V
A
 
I
A
 
E
C
 
C
D
 
D
L
 
-
V
 
-
S
 
-
D
 
-
R
 
-
G
 
-
G
 
-
Y
 
-
L
 
-
D
 
R
P
 
P
I
 
V
G
 
D
L
 
L
R
 
A
V
 
V
R
 
A
Q
 
T
-
 
P
A
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
D
R
 
R
G
 
G
L
 
V
L
 
W
L
 
L
R
 
R
P
 
P
L
x
F
G
 
R
N
 
N
V
 
L
L
 
V
Y
|
Y
L
 
A
L
 
M
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
C
 
I
L
 
C
T
 
T
P
 
P
T
 
A
E
 
E
L
 
I
Q
 
T
D
 
Q
I
 
I
Y
 
T
A
 
S
A
 
A
I
 
M
A
 
V
D
 
E
L
 
V

4wyeA Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase (bioa) from mycobacterium tuberculosis complexed with a dsf fragment hit (see paper)
41% identity, 98% coverage: 6:420/424 of query aligns to 13:422/429 of 4wyeA

query
sites
4wyeA
H
 
H
L
 
L
W
 
W
F
 
H
P
 
P
F
x
Y
T
 
S
S
 
S
V
 
I
-
 
G
K
 
R
D
 
E
A
 
A
P
 
V
D
 
S
P
 
P
L
 
V
K
 
V
V
 
A
V
 
V
S
 
A
G
 
A
K
 
H
G
 
G
A
 
A
R
 
W
L
 
L
T
 
T
L
 
L
A
 
I
-
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
Q
-
 
P
-
 
I
E
 
E
L
 
V
I
 
L
D
 
D
C
 
A
I
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
|
W
V
 
T
N
 
A
L
 
I
H
 
H
G
 
G
H
 
H
A
 
G
H
 
H
L
 
P
R
 
A
I
 
L
V
 
D
E
 
Q
A
 
A
I
 
L
A
 
T
Q
 
T
Q
 
Q
A
 
L
A
 
R
T
 
V
L
 
M
E
 
N
H
 
H
V
 
V
I
 
M
F
 
F
A
 
G
G
 
G
F
 
L
S
 
T
H
 
H
E
 
E
P
 
P
A
 
A
E
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A
M
 
K
E
 
L
L
 
L
C
 
V
K
 
D
I
 
I
L
 
T
P
 
P
E
 
A
K
 
G
L
 
L
T
 
D
R
 
T
V
 
V
F
 
F
F
 
F
S
 
S
D
 
D
N
 
S
G
|
G
S
|
S
T
 
V
A
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
L
 
A
K
 
K
M
 
M
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
W
 
W
H
 
R
N
 
G
L
 
R
D
 
G
Q
 
L
P
 
P
-
 
G
R
 
K
S
 
R
R
 
R
I
 
L
L
 
M
A
 
T
F
 
W
D
 
R
G
 
G
A
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
D
 
D
T
 
T
F
 
F
G
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
I
G
 
C
E
 
D
-
 
P
R
 
H
S
 
G
L
 
G
F
 
M
N
 
H
A
 
S
P
 
L
F
 
W
E
 
T
K
 
D
L
 
V
L
 
L
F
 
A
S
 
A
V
 
Q
E
 
V
F
 
F
L
 
A
P
 
P
Y
 
-
P
 
-
E
 
-
T
 
-
W
 
-
W
 
-
G
 
-
D
 
-
E
 
Q
T
 
V
V
 
P
E
 
R
A
 
D
K
 
Y
E
 
D
A
 
P
A
 
A
A
 
Y
I
 
S
A
 
A
A
 
A
V
 
F
E
 
E
Q
 
A
A
 
Q
L
 
L
A
 
A
-
 
Q
-
 
H
A
 
A
G
 
G
D
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
V
I
 
V
E
|
E
P
 
P
L
 
V
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
|
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
R
M
 
F
A
 
H
R
 
D
P
 
P
Q
 
R
F
 
Y
L
 
L
Q
 
H
Q
 
D
L
 
L
A
 
R
A
 
D
R
 
I
V
 
C
Q
 
R
A
 
R
A
 
Y
G
 
E
S
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
A
 
F
D
|
D
E
 
E
V
x
I
M
x
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
A
 
A
W
 
L
F
 
F
A
 
A
C
 
A
Q
 
D
R
 
H
A
 
A
G
 
G
I
 
V
Q
 
S
P
 
P
D
 
D
L
 
I
I
 
M
C
 
C
L
 
V
S
 
G
K
|
K
G
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
P
 
S
L
 
L
S
 
A
I
 
A
T
 
T
V
 
L
A
 
C
T
 
T
E
 
A
V
 
D
I
 
V
Y
 
A
D
 
H
T
 
T
F
 
I
C
 
S
S
 
A
G
 
G
N
 
A
P
 
A
D
 
G
H
 
-
T
 
A
F
 
L
Y
 
M
H
 
H
G
 
G
H
x
P
S
x
T
Y
 
F
T
 
M
A
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
G
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
V
A
 
S
I
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
V
E
 
E
L
 
L
L
 
L
L
 
L
-
 
G
-
 
Q
D
 
D
S
 
W
E
 
R
A
 
T
I
 
R
V
 
I
Q
 
T
G
 
E
L
 
L
E
 
A
D
 
A
A
 
G
H
 
L
L
 
T
P
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
D
L
 
T
L
 
A
A
 
R
Q
 
A
H
 
L
P
 
P
K
 
A
V
 
V
T
 
T
R
 
D
P
 
V
R
 
R
L
 
V
T
 
C
G
 
G
-
 
A
-
 
I
G
 
G
I
 
V
A
 
I
A
 
E
C
 
C
D
 
D
L
 
-
V
 
-
S
 
-
D
 
-
R
 
-
G
 
-
G
 
-
Y
 
-
L
 
-
D
 
R
P
 
P
I
 
V
G
 
D
L
 
L
R
 
A
V
 
V
R
 
A
Q
 
T
-
 
P
A
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
D
R
 
R
G
 
G
L
 
V
L
 
W
L
 
L
R
 
R
P
 
P
L
x
F
G
 
R
N
 
N
V
 
L
L
 
V
Y
|
Y
L
 
A
L
 
M
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
C
 
I
L
 
C
T
 
T
P
 
P
T
 
A
E
 
E
L
 
I
Q
 
T
D
 
Q
I
 
I
Y
 
T
A
 
S
A
 
A
I
 
M
A
 
V
D
 
E
L
 
V

4w1xA Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase (bioa) from mycobacterium tuberculosis, complexed with 1-(4-(4-(3-chlorobenzoyl) piperazin-1-yl)phenyl)ethanone (see paper)
41% identity, 98% coverage: 6:420/424 of query aligns to 13:422/429 of 4w1xA

query
sites
4w1xA
H
 
H
L
 
L
W
 
W
F
 
H
P
|
P
F
x
Y
T
 
S
S
 
S
V
 
I
-
 
G
K
 
R
D
 
E
A
 
A
P
 
V
D
 
S
P
 
P
L
 
V
K
 
V
V
 
A
V
 
V
S
 
A
G
 
A
K
 
H
G
 
G
A
 
A
R
 
W
L
 
L
T
 
T
L
 
L
A
 
I
-
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
Q
-
 
P
-
 
I
E
 
E
L
 
V
I
 
L
D
 
D
C
 
A
I
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
 
W
V
 
T
N
 
A
L
 
I
H
 
H
G
 
G
H
 
H
A
 
G
H
 
H
L
 
P
R
 
A
I
 
L
V
 
D
E
 
Q
A
 
A
I
 
L
A
 
T
Q
 
T
Q
 
Q
A
 
L
A
 
R
T
 
V
L
 
M
E
 
N
H
 
H
V
 
V
I
x
M
F
 
F
A
x
G
G
 
G
F
 
L
S
 
T
H
 
H
E
 
E
P
 
P
A
 
A
E
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A
M
 
K
E
 
L
L
 
L
C
 
V
K
 
D
I
 
I
L
 
T
P
 
P
E
 
A
K
 
G
L
 
L
T
 
D
R
 
T
V
 
V
F
 
F
F
 
F
S
 
S
D
 
D
N
 
S
G
|
G
S
|
S
T
 
V
A
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
L
 
A
K
 
K
M
 
M
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
W
 
W
H
 
R
N
 
G
L
 
R
D
 
G
Q
 
L
P
 
P
-
 
G
R
 
K
S
 
R
R
 
R
I
 
L
L
 
M
A
 
T
F
 
W
D
 
R
G
 
G
A
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
D
 
D
T
 
T
F
 
F
G
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
I
G
 
C
E
 
D
-
 
P
R
 
H
S
x
G
L
x
G
F
 
M
N
 
H
A
 
S
P
 
L
F
 
W
E
 
T
K
 
D
L
 
V
L
 
L
F
 
A
S
 
A
V
 
Q
E
 
V
F
 
F
L
 
A
P
 
P
Y
 
-
P
 
-
E
 
-
T
 
-
W
 
-
W
 
-
G
 
-
D
 
-
E
 
Q
T
 
V
V
 
P
E
 
R
A
 
D
K
 
Y
E
 
D
A
 
P
A
 
A
A
 
Y
I
 
S
A
 
A
A
 
A
V
 
F
E
 
E
Q
 
A
A
 
Q
L
 
L
A
 
A
-
 
Q
-
 
H
A
 
A
G
 
G
D
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
V
I
 
V
E
|
E
P
 
P
L
 
V
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
|
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
R
M
 
F
A
 
H
R
 
D
P
 
P
Q
 
R
F
 
Y
L
 
L
Q
 
H
Q
 
D
L
 
L
A
 
R
A
 
D
R
 
I
V
 
C
Q
 
R
A
 
R
A
 
Y
G
 
E
S
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
A
 
F
D
|
D
E
 
E
V
x
I
M
x
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
A
 
A
W
 
L
F
 
F
A
 
A
C
 
A
Q
 
D
R
 
H
A
 
A
G
 
G
I
 
V
Q
 
S
P
 
P
D
 
D
L
 
I
I
 
M
C
 
C
L
 
V
S
 
G
K
|
K
G
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
P
 
S
L
 
L
S
 
A
I
 
A
T
 
T
V
 
L
A
 
C
T
 
T
E
 
A
V
 
D
I
 
V
Y
 
A
D
 
H
T
 
T
F
 
I
C
 
S
S
 
A
G
 
G
N
 
A
P
 
A
D
 
G
H
 
-
T
 
A
F
 
L
Y
 
M
H
 
H
G
|
G
H
x
P
S
x
T
Y
 
F
T
 
M
A
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
G
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
V
A
 
S
I
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
V
E
 
E
L
 
L
L
 
L
L
 
L
-
 
G
-
 
Q
D
 
D
S
 
W
E
 
R
A
 
T
I
 
R
V
 
I
Q
 
T
G
 
E
L
 
L
E
 
A
D
 
A
A
 
G
H
 
L
L
 
T
P
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
D
L
 
T
L
 
A
A
 
R
Q
 
A
H
 
L
P
 
P
K
 
A
V
 
V
T
 
T
R
 
D
P
 
V
R
 
R
L
 
V
T
 
C
G
 
G
-
 
A
-
 
I
G
 
G
I
 
V
A
 
I
A
 
E
C
 
C
D
 
D
L
 
-
V
 
-
S
 
-
D
 
-
R
 
-
G
 
-
G
 
-
Y
 
-
L
 
-
D
 
R
P
 
P
I
 
V
G
 
D
L
 
L
R
 
A
V
 
V
R
 
A
Q
 
T
-
 
P
A
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
D
R
 
R
G
 
G
L
 
V
L
 
W
L
 
L
R
 
R
P
 
P
L
 
F
G
 
R
N
 
N
V
 
L
L
 
V
Y
|
Y
L
 
A
L
 
M
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
C
 
I
L
 
C
T
 
T
P
 
P
T
 
A
E
 
E
L
 
I
Q
 
T
D
 
Q
I
 
I
Y
 
T
A
 
S
A
 
A
I
 
M
A
 
V
D
 
E
L
 
V

4w1wA Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase (bioa) from mycobacterium tuberculosis, complexed with 7-(diethylamino)-3- (thiophene-2-carbonyl)-2h-chromen-2-one (see paper)
41% identity, 98% coverage: 6:420/424 of query aligns to 13:422/429 of 4w1wA

query
sites
4w1wA
H
 
H
L
 
L
W
 
W
F
 
H
P
|
P
F
x
Y
T
 
S
S
 
S
V
 
I
-
 
G
K
 
R
D
 
E
A
 
A
P
 
V
D
 
S
P
 
P
L
 
V
K
 
V
V
 
A
V
 
V
S
 
A
G
 
A
K
 
H
G
 
G
A
 
A
R
 
W
L
 
L
T
 
T
L
 
L
A
 
I
-
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
Q
-
 
P
-
 
I
E
 
E
L
 
V
I
 
L
D
 
D
C
 
A
I
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
 
W
V
 
T
N
 
A
L
 
I
H
 
H
G
 
G
H
 
H
A
 
G
H
 
H
L
 
P
R
 
A
I
 
L
V
 
D
E
 
Q
A
 
A
I
 
L
A
 
T
Q
 
T
Q
 
Q
A
 
L
A
 
R
T
 
V
L
 
M
E
 
N
H
 
H
V
 
V
I
x
M
F
 
F
A
x
G
G
 
G
F
 
L
S
 
T
H
 
H
E
 
E
P
 
P
A
 
A
E
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A
M
 
K
E
 
L
L
 
L
C
 
V
K
 
D
I
 
I
L
 
T
P
 
P
E
 
A
K
 
G
L
 
L
T
 
D
R
 
T
V
 
V
F
 
F
F
 
F
S
 
S
D
 
D
N
 
S
G
|
G
S
|
S
T
 
V
A
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
L
 
A
K
 
K
M
 
M
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
W
 
W
H
 
R
N
 
G
L
 
R
D
 
G
Q
 
L
P
 
P
-
 
G
R
 
K
S
 
R
R
 
R
I
 
L
L
 
M
A
 
T
F
 
W
D
 
R
G
 
G
A
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
D
 
D
T
 
T
F
 
F
G
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
I
G
 
C
E
 
D
-
 
P
R
 
H
S
x
G
L
 
G
F
 
M
N
 
H
A
 
S
P
 
L
F
 
W
E
 
T
K
 
D
L
 
V
L
 
L
F
 
A
S
 
A
V
 
Q
E
 
V
F
 
F
L
 
A
P
 
P
Y
 
-
P
 
-
E
 
-
T
 
-
W
 
-
W
 
-
G
 
-
D
 
-
E
 
Q
T
 
V
V
 
P
E
 
R
A
 
D
K
 
Y
E
 
D
A
 
P
A
 
A
A
 
Y
I
 
S
A
 
A
A
 
A
V
 
F
E
 
E
Q
 
A
A
 
Q
L
 
L
A
 
A
-
 
Q
-
 
H
A
 
A
G
 
G
D
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
V
I
 
V
E
|
E
P
 
P
L
 
V
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
R
M
 
F
A
 
H
R
 
D
P
 
P
Q
 
R
F
 
Y
L
 
L
Q
 
H
Q
 
D
L
 
L
A
 
R
A
 
D
R
 
I
V
 
C
Q
 
R
A
 
R
A
 
Y
G
 
E
S
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
A
 
F
D
|
D
E
 
E
V
x
I
M
x
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
A
 
A
W
 
L
F
 
F
A
 
A
C
 
A
Q
 
D
R
 
H
A
 
A
G
 
G
I
 
V
Q
 
S
P
 
P
D
 
D
L
 
I
I
 
M
C
 
C
L
 
V
S
 
G
K
|
K
G
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
P
 
S
L
 
L
S
 
A
I
 
A
T
 
T
V
 
L
A
 
C
T
 
T
E
 
A
V
 
D
I
 
V
Y
 
A
D
 
H
T
 
T
F
 
I
C
 
S
S
 
A
G
 
G
N
 
A
P
 
A
D
 
G
H
 
-
T
 
A
F
 
L
Y
 
M
H
 
H
G
|
G
H
x
P
S
x
T
Y
 
F
T
 
M
A
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
G
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
V
A
 
S
I
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
V
E
 
E
L
 
L
L
 
L
L
 
L
-
 
G
-
 
Q
D
 
D
S
 
W
E
 
R
A
 
T
I
 
R
V
 
I
Q
 
T
G
 
E
L
 
L
E
 
A
D
 
A
A
 
G
H
 
L
L
 
T
P
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
D
L
 
T
L
 
A
A
 
R
Q
 
A
H
 
L
P
 
P
K
 
A
V
 
V
T
 
T
R
 
D
P
 
V
R
 
R
L
 
V
T
 
C
G
 
G
-
 
A
-
 
I
G
 
G
I
 
V
A
 
I
A
 
E
C
 
C
D
 
D
L
 
-
V
 
-
S
 
-
D
 
-
R
 
-
G
 
-
G
 
-
Y
 
-
L
 
-
D
 
R
P
 
P
I
 
V
G
 
D
L
 
L
R
 
A
V
 
V
R
 
A
Q
 
T
-
 
P
A
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
D
R
 
R
G
 
G
L
 
V
L
 
W
L
 
L
R
|
R
P
 
P
L
 
F
G
 
R
N
 
N
V
 
L
L
 
V
Y
|
Y
L
 
A
L
 
M
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
C
 
I
L
 
C
T
 
T
P
 
P
T
 
A
E
 
E
L
 
I
Q
 
T
D
 
Q
I
 
I
Y
 
T
A
 
S
A
 
A
I
 
M
A
 
V
D
 
E
L
 
V

5te2A Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase (bioa) from mycobacterium tuberculosis, complexed with a mechanism-based inhibitor (see paper)
41% identity, 98% coverage: 6:420/424 of query aligns to 13:422/428 of 5te2A

query
sites
5te2A
H
 
H
L
 
L
W
 
W
F
 
H
P
 
P
F
x
Y
T
 
S
S
 
S
V
 
I
-
 
G
K
 
R
D
 
E
A
 
A
P
 
V
D
 
S
P
 
P
L
 
V
K
 
V
V
 
A
V
 
V
S
 
A
G
 
A
K
 
H
G
 
G
A
 
A
R
 
W
L
 
L
T
 
T
L
 
L
A
 
I
-
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
Q
-
 
P
-
 
I
E
 
E
L
 
V
I
 
L
D
 
D
C
 
A
I
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
 
W
V
 
T
N
 
A
L
 
I
H
 
H
G
 
G
H
 
H
A
 
G
H
 
H
L
 
P
R
 
A
I
 
L
V
 
D
E
 
Q
A
 
A
I
 
L
A
 
T
Q
 
T
Q
 
Q
A
 
L
A
 
R
T
 
V
L
 
M
E
 
N
H
 
H
V
 
V
I
 
M
F
 
F
A
 
G
G
 
G
F
 
L
S
 
T
H
 
H
E
 
E
P
 
P
A
 
A
E
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A
M
 
K
E
 
L
L
 
L
C
 
V
K
 
D
I
 
I
L
 
T
P
 
P
E
 
A
K
 
G
L
 
L
T
 
D
R
 
T
V
 
V
F
 
F
F
 
F
S
 
S
D
 
D
N
 
S
G
|
G
S
|
S
T
 
V
A
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
L
 
A
K
 
K
M
 
M
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
W
 
W
H
 
R
N
 
G
L
 
R
D
 
G
Q
 
L
P
 
P
-
 
G
R
 
K
S
 
R
R
 
R
I
 
L
L
 
M
A
 
T
F
 
W
D
 
R
G
 
G
A
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
D
 
D
T
 
T
F
 
F
G
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
I
G
 
C
E
 
D
-
 
P
R
 
H
S
 
G
L
 
G
F
 
M
N
 
H
A
 
S
P
 
L
F
 
W
E
 
T
K
 
D
L
 
V
L
 
L
F
 
A
S
 
A
V
 
Q
E
 
V
F
 
F
L
 
A
P
 
P
Y
 
-
P
 
-
E
 
-
T
 
-
W
 
-
W
 
-
G
 
-
D
 
-
E
 
Q
T
 
V
V
 
P
E
 
R
A
 
D
K
 
Y
E
 
D
A
 
P
A
 
A
A
 
Y
I
 
S
A
 
A
A
 
A
V
 
F
E
 
E
Q
 
A
A
 
Q
L
 
L
A
 
A
-
 
Q
-
 
H
A
 
A
G
 
G
D
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
V
I
 
V
E
|
E
P
 
P
L
 
V
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
R
M
 
F
A
 
H
R
 
D
P
 
P
Q
 
R
F
 
Y
L
 
L
Q
 
H
Q
 
D
L
 
L
A
 
R
A
 
D
R
 
I
V
 
C
Q
 
R
A
 
R
A
 
Y
G
 
E
S
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
A
 
F
D
|
D
E
 
E
V
x
I
M
x
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
A
 
A
W
 
L
F
 
F
A
 
A
C
 
A
Q
 
D
R
 
H
A
 
A
G
 
G
I
 
V
Q
 
S
P
 
P
D
 
D
L
 
I
I
 
M
C
 
C
L
 
V
S
 
G
K
|
K
G
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
P
 
S
L
 
L
S
 
A
I
 
A
T
 
T
V
 
L
A
 
C
T
 
T
E
 
A
V
 
D
I
 
V
Y
 
A
D
 
H
T
 
T
F
 
I
C
 
S
S
 
A
G
 
G
N
 
A
P
 
A
D
 
G
H
 
-
T
 
A
F
 
L
Y
 
M
H
 
H
G
|
G
H
x
P
S
x
T
Y
 
F
T
 
M
A
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
G
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
V
A
 
S
I
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
V
E
 
E
L
 
L
L
 
L
L
 
L
-
 
G
-
 
Q
D
 
D
S
 
W
E
 
R
A
 
T
I
 
R
V
 
I
Q
 
T
G
 
E
L
 
L
E
 
A
D
 
A
A
 
G
H
 
L
L
 
T
P
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
D
L
 
T
L
 
A
A
 
R
Q
 
A
H
 
L
P
 
P
K
 
A
V
 
V
T
 
T
R
 
D
P
 
V
R
 
R
L
 
V
T
 
C
G
 
G
-
 
A
-
 
I
G
 
G
I
 
V
A
 
I
A
 
E
C
 
C
D
 
D
L
 
-
V
 
-
S
 
-
D
 
-
R
 
-
G
 
-
G
 
-
Y
 
-
L
 
-
D
 
R
P
 
P
I
 
V
G
 
D
L
 
L
R
 
A
V
 
V
R
 
A
Q
 
T
-
 
P
A
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
D
R
 
R
G
 
G
L
 
V
L
 
W
L
 
L
R
 
R
P
 
P
L
 
F
G
 
R
N
 
N
V
 
L
L
 
V
Y
|
Y
L
 
A
L
 
M
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
C
 
I
L
 
C
T
 
T
P
 
P
T
 
A
E
 
E
L
 
I
Q
 
T
D
 
Q
I
 
I
Y
 
T
A
 
S
A
 
A
I
 
M
A
 
V
D
 
E
L
 
V

4xjoA Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase (bioa) from mycobacterium tuberculosis, complexed with an inhibitor optimized from hts lead (see paper)
41% identity, 98% coverage: 6:420/424 of query aligns to 13:422/428 of 4xjoA

query
sites
4xjoA
H
 
H
L
 
L
W
 
W
F
 
H
P
|
P
F
x
Y
T
 
S
S
 
S
V
 
I
-
 
G
K
 
R
D
 
E
A
 
A
P
 
V
D
 
S
P
 
P
L
 
V
K
 
V
V
 
A
V
 
V
S
 
A
G
 
A
K
 
H
G
 
G
A
 
A
R
 
W
L
 
L
T
 
T
L
 
L
A
 
I
-
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
Q
-
 
P
-
 
I
E
 
E
L
 
V
I
 
L
D
 
D
C
 
A
I
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
 
W
V
 
T
N
 
A
L
 
I
H
 
H
G
 
G
H
 
H
A
 
G
H
 
H
L
 
P
R
 
A
I
 
L
V
 
D
E
 
Q
A
 
A
I
 
L
A
 
T
Q
 
T
Q
 
Q
A
 
L
A
 
R
T
 
V
L
 
M
E
 
N
H
 
H
V
 
V
I
x
M
F
 
F
A
x
G
G
 
G
F
 
L
S
 
T
H
 
H
E
 
E
P
 
P
A
 
A
E
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A
M
 
K
E
 
L
L
 
L
C
 
V
K
 
D
I
 
I
L
 
T
P
 
P
E
 
A
K
 
G
L
 
L
T
 
D
R
 
T
V
 
V
F
 
F
F
 
F
S
 
S
D
 
D
N
 
S
G
|
G
S
|
S
T
 
V
A
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
L
 
A
K
 
K
M
 
M
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
W
 
W
H
 
R
N
 
G
L
 
R
D
 
G
Q
 
L
P
 
P
-
 
G
R
 
K
S
 
R
R
 
R
I
 
L
L
 
M
A
 
T
F
 
W
D
 
R
G
 
G
A
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
D
 
D
T
 
T
F
 
F
G
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
I
G
 
C
E
 
D
-
 
P
R
 
H
S
x
G
L
x
G
F
 
M
N
 
H
A
 
S
P
 
L
F
 
W
E
 
T
K
 
D
L
 
V
L
 
L
F
 
A
S
 
A
V
 
Q
E
 
V
F
 
F
L
 
A
P
 
P
Y
 
-
P
 
-
E
 
-
T
 
-
W
 
-
W
 
-
G
 
-
D
 
-
E
 
Q
T
 
V
V
 
P
E
 
R
A
 
D
K
 
Y
E
 
D
A
 
P
A
 
A
A
 
Y
I
 
S
A
 
A
A
 
A
V
 
F
E
 
E
Q
 
A
A
 
Q
L
 
L
A
 
A
-
 
Q
-
 
H
A
 
A
G
 
G
D
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
V
I
 
V
E
|
E
P
 
P
L
 
V
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
|
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
R
M
 
F
A
 
H
R
 
D
P
 
P
Q
 
R
F
 
Y
L
 
L
Q
 
H
Q
 
D
L
 
L
A
 
R
A
 
D
R
 
I
V
 
C
Q
 
R
A
 
R
A
 
Y
G
 
E
S
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
A
 
F
D
|
D
E
 
E
V
x
I
M
x
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
A
 
A
W
 
L
F
 
F
A
 
A
C
 
A
Q
 
D
R
 
H
A
 
A
G
 
G
I
 
V
Q
 
S
P
 
P
D
 
D
L
 
I
I
 
M
C
 
C
L
 
V
S
 
G
K
|
K
G
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
P
 
S
L
 
L
S
 
A
I
 
A
T
 
T
V
 
L
A
 
C
T
 
T
E
 
A
V
 
D
I
 
V
Y
 
A
D
 
H
T
 
T
F
 
I
C
 
S
S
 
A
G
 
G
N
 
A
P
 
A
D
 
G
H
 
-
T
 
A
F
 
L
Y
 
M
H
 
H
G
 
G
H
x
P
S
x
T
Y
 
F
T
 
M
A
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
G
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
V
A
 
S
I
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
V
E
 
E
L
 
L
L
 
L
L
 
L
-
 
G
-
 
Q
D
 
D
S
 
W
E
 
R
A
 
T
I
 
R
V
 
I
Q
 
T
G
 
E
L
 
L
E
 
A
D
 
A
A
 
G
H
 
L
L
 
T
P
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
D
L
 
T
L
 
A
A
 
R
Q
 
A
H
 
L
P
 
P
K
 
A
V
 
V
T
 
T
R
 
D
P
 
V
R
 
R
L
 
V
T
 
C
G
 
G
-
 
A
-
 
I
G
 
G
I
 
V
A
 
I
A
 
E
C
 
C
D
 
D
L
 
-
V
 
-
S
 
-
D
 
-
R
 
-
G
 
-
G
 
-
Y
 
-
L
 
-
D
 
R
P
 
P
I
 
V
G
 
D
L
 
L
R
 
A
V
 
V
R
 
A
Q
 
T
-
 
P
A
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
D
R
 
R
G
 
G
L
 
V
L
 
W
L
 
L
R
 
R
P
 
P
L
 
F
G
 
R
N
 
N
V
 
L
L
 
V
Y
|
Y
L
 
A
L
 
M
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
C
 
I
L
 
C
T
 
T
P
 
P
T
 
A
E
 
E
L
 
I
Q
 
T
D
 
Q
I
 
I
Y
 
T
A
 
S
A
 
A
I
 
M
A
 
V
D
 
E
L
 
V

4xewA Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase (bioa) from mycobacterium tuberculosis, complexed with a hts lead compound (see paper)
41% identity, 98% coverage: 6:420/424 of query aligns to 13:422/428 of 4xewA

query
sites
4xewA
H
 
H
L
 
L
W
 
W
F
 
H
P
|
P
F
x
Y
T
 
S
S
 
S
V
 
I
-
 
G
K
 
R
D
 
E
A
 
A
P
 
V
D
 
S
P
 
P
L
 
V
K
 
V
V
 
A
V
 
V
S
 
A
G
 
A
K
 
H
G
 
G
A
 
A
R
 
W
L
 
L
T
 
T
L
 
L
A
 
I
-
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
Q
-
 
P
-
 
I
E
 
E
L
 
V
I
 
L
D
 
D
C
 
A
I
 
M
S
 
S
S
 
S
W
|
W
W
 
W
V
 
T
N
 
A
L
 
I
H
 
H
G
 
G
H
 
H
A
 
G
H
 
H
L
 
P
R
 
A
I
 
L
V
 
D
E
 
Q
A
 
A
I
 
L
A
 
T
Q
 
T
Q
 
Q
A
 
L
A
 
R
T
 
V
L
 
M
E
 
N
H
 
H
V
 
V
I
 
M
F
 
F
A
 
G
G
 
G
F
 
L
S
 
T
H
 
H
E
 
E
P
 
P
A
 
A
E
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A
M
 
K
E
 
L
L
 
L
C
 
V
K
 
D
I
 
I
L
 
T
P
 
P
E
 
A
K
 
G
L
 
L
T
 
D
R
 
T
V
 
V
F
 
F
F
 
F
S
 
S
D
 
D
N
 
S
G
|
G
S
|
S
T
 
V
A
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
L
 
A
K
 
K
M
 
M
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
W
 
W
H
 
R
N
 
G
L
 
R
D
 
G
Q
 
L
P
 
P
-
 
G
R
 
K
S
 
R
R
 
R
I
 
L
L
 
M
A
 
T
F
 
W
D
 
R
G
 
G
A
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
D
 
D
T
 
T
F
 
F
G
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
I
G
 
C
E
 
D
-
 
P
R
 
H
S
 
G
L
 
G
F
 
M
N
 
H
A
 
S
P
 
L
F
 
W
E
 
T
K
 
D
L
 
V
L
 
L
F
 
A
S
 
A
V
 
Q
E
 
V
F
 
F
L
 
A
P
 
P
Y
 
-
P
 
-
E
 
-
T
 
-
W
 
-
W
 
-
G
 
-
D
 
-
E
 
Q
T
 
V
V
 
P
E
 
R
A
 
D
K
 
Y
E
 
D
A
 
P
A
 
A
A
 
Y
I
 
S
A
 
A
A
 
A
V
 
F
E
 
E
Q
 
A
A
 
Q
L
 
L
A
 
A
-
 
Q
-
 
H
A
 
A
G
 
G
D
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
V
I
 
V
E
|
E
P
 
P
L
 
V
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
R
M
 
F
A
 
H
R
 
D
P
 
P
Q
 
R
F
 
Y
L
 
L
Q
 
H
Q
 
D
L
 
L
A
 
R
A
 
D
R
 
I
V
 
C
Q
 
R
A
 
R
A
 
Y
G
 
E
S
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
A
 
F
D
|
D
E
 
E
V
x
I
M
x
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
A
 
A
W
 
L
F
 
F
A
 
A
C
 
A
Q
 
D
R
 
H
A
 
A
G
 
G
I
 
V
Q
 
S
P
 
P
D
 
D
L
 
I
I
 
M
C
 
C
L
 
V
S
 
G
K
|
K
G
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
P
 
S
L
 
L
S
 
A
I
 
A
T
 
T
V
 
L
A
 
C
T
 
T
E
 
A
V
 
D
I
 
V
Y
 
A
D
 
H
T
 
T
F
 
I
C
 
S
S
 
A
G
 
G
N
 
A
P
 
A
D
 
G
H
 
-
T
 
A
F
 
L
Y
 
M
H
 
H
G
 
G
H
x
P
S
x
T
Y
 
F
T
 
M
A
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
G
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
V
A
 
S
I
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
V
E
 
E
L
 
L
L
 
L
L
 
L
-
 
G
-
 
Q
D
 
D
S
 
W
E
 
R
A
 
T
I
 
R
V
 
I
Q
 
T
G
 
E
L
 
L
E
 
A
D
 
A
A
 
G
H
 
L
L
 
T
P
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
D
L
 
T
L
 
A
A
 
R
Q
 
A
H
 
L
P
 
P
K
 
A
V
 
V
T
 
T
R
 
D
P
 
V
R
 
R
L
 
V
T
 
C
G
 
G
-
 
A
-
 
I
G
 
G
I
 
V
A
 
I
A
 
E
C
 
C
D
 
D
L
 
-
V
 
-
S
 
-
D
 
-
R
 
-
G
 
-
G
 
-
Y
 
-
L
 
-
D
 
R
P
 
P
I
 
V
G
 
D
L
 
L
R
 
A
V
 
V
R
 
A
Q
 
T
-
 
P
A
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
D
R
 
R
G
 
G
L
 
V
L
 
W
L
 
L
R
|
R
P
 
P
L
x
F
G
 
R
N
 
N
V
 
L
L
 
V
Y
|
Y
L
 
A
L
 
M
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
C
 
I
L
 
C
T
 
T
P
 
P
T
 
A
E
 
E
L
 
I
Q
 
T
D
 
Q
I
 
I
Y
 
T
A
 
S
A
 
A
I
 
M
A
 
V
D
 
E
L
 
V

4wyfA Crystal structure of 7,8-diaminopelargonic acid synthase (bioa) from mycobacterium tuberculosis, complexed with a dsf fragment hit (see paper)
41% identity, 98% coverage: 6:420/424 of query aligns to 13:422/428 of 4wyfA

query
sites
4wyfA
H
 
H
L
 
L
W
 
W
F
 
H
P
 
P
F
x
Y
T
 
S
S
 
S
V
 
I
-
 
G
K
 
R
D
 
E
A
 
A
P
 
V
D
 
S
P
 
P
L
 
V
K
 
V
V
 
A
V
 
V
S
 
A
G
 
A
K
 
H
G
 
G
A
 
A
R
 
W
L
 
L
T
 
T
L
 
L
A
 
I
-
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
Q
-
 
P
-
 
I
E
 
E
L
 
V
I
 
L
D
 
D
C
 
A
I
 
M
S
 
S
S
 
S
W
 
W
W
 
W
V
 
T
N
 
A
L
 
I
H
 
H
G
 
G
H
 
H
A
 
G
H
 
H
L
 
P
R
 
A
I
 
L
V
 
D
E
 
Q
A
 
A
I
 
L
A
 
T
Q
 
T
Q
 
Q
A
 
L
A
 
R
T
 
V
L
 
M
E
 
N
H
 
H
V
 
V
I
x
M
F
 
F
A
x
G
G
 
G
F
 
L
S
 
T
H
 
H
E
 
E
P
 
P
A
 
A
E
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A
M
 
K
E
 
L
L
 
L
C
 
V
K
 
D
I
 
I
L
 
T
P
 
P
E
 
A
K
 
G
L
 
L
T
 
D
R
 
T
V
 
V
F
 
F
F
 
F
S
 
S
D
 
D
N
 
S
G
|
G
S
|
S
T
 
V
A
 
S
V
 
V
E
 
E
V
 
V
A
 
A
L
 
A
K
 
K
M
 
M
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
W
 
W
H
 
R
N
 
G
L
 
R
D
 
G
Q
 
L
P
 
P
-
 
G
R
 
K
S
 
R
R
 
R
I
 
L
L
 
M
A
 
T
F
 
W
D
 
R
G
 
G
A
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
D
 
D
T
 
T
F
 
F
G
 
L
A
 
A
M
 
M
S
 
S
V
 
I
G
 
C
E
 
D
-
 
P
R
 
H
S
 
G
L
 
G
F
 
M
N
 
H
A
 
S
P
 
L
F
 
W
E
 
T
K
 
D
L
 
V
L
 
L
F
 
A
S
 
A
V
 
Q
E
 
V
F
 
F
L
 
A
P
 
P
Y
 
-
P
 
-
E
 
-
T
 
-
W
 
-
W
 
-
G
 
-
D
 
-
E
 
Q
T
 
V
V
 
P
E
 
R
A
 
D
K
 
Y
E
 
D
A
 
P
A
 
A
A
 
Y
I
 
S
A
 
A
A
 
A
V
 
F
E
 
E
Q
 
A
A
 
Q
L
 
L
A
 
A
-
 
Q
-
 
H
A
 
A
G
 
G
D
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
V
I
 
V
E
|
E
P
 
P
L
 
V
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
M
R
 
R
M
 
F
A
 
H
R
 
D
P
 
P
Q
 
R
F
 
Y
L
 
L
Q
 
H
Q
 
D
L
 
L
A
 
R
A
 
D
R
 
I
V
 
C
Q
 
R
A
 
R
A
 
Y
G
 
E
S
 
V
L
 
L
L
 
L
I
 
I
A
 
F
D
|
D
E
 
E
V
x
I
M
x
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
A
 
A
W
 
L
F
 
F
A
 
A
C
 
A
Q
 
D
R
 
H
A
 
A
G
 
G
I
 
V
Q
 
S
P
 
P
D
 
D
L
 
I
I
 
M
C
 
C
L
 
V
S
 
G
K
|
K
G
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
P
 
S
L
 
L
S
 
A
I
 
A
T
 
T
V
 
L
A
 
C
T
 
T
E
 
A
V
 
D
I
 
V
Y
 
A
D
 
H
T
 
T
F
 
I
C
 
S
S
 
A
G
 
G
N
 
A
P
 
A
D
 
G
H
 
-
T
 
A
F
 
L
Y
 
M
H
 
H
G
|
G
H
x
P
S
x
T
Y
 
F
T
 
M
A
 
A
N
 
N
P
 
P
L
 
L
G
 
A
C
 
C
A
 
A
A
 
V
A
 
S
I
 
V
A
 
A
S
 
S
L
 
V
E
 
E
L
 
L
L
 
L
L
 
L
-
 
G
-
 
Q
D
 
D
S
 
W
E
 
R
A
 
T
I
 
R
V
 
I
Q
 
T
G
 
E
L
 
L
E
 
A
D
 
A
A
 
G
H
 
L
L
 
T
P
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
D
L
 
T
L
 
A
A
 
R
Q
 
A
H
 
L
P
 
P
K
 
A
V
 
V
T
 
T
R
 
D
P
 
V
R
 
R
L
 
V
T
 
C
G
 
G
-
 
A
-
 
I
G
 
G
I
 
V
A
 
I
A
 
E
C
 
C
D
 
D
L
 
-
V
 
-
S
 
-
D
 
-
R
 
-
G
 
-
G
 
-
Y
 
-
L
 
-
D
 
R
P
 
P
I
 
V
G
 
D
L
 
L
R
 
A
V
 
V
R
 
A
Q
 
T
-
 
P
A
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
D
R
 
R
G
 
G
L
 
V
L
 
W
L
 
L
R
 
R
P
 
P
L
 
F
G
 
R
N
 
N
V
 
L
L
 
V
Y
|
Y
L
 
A
L
 
M
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
C
 
I
L
 
C
T
 
T
P
 
P
T
 
A
E
 
E
L
 
I
Q
 
T
D
 
Q
I
 
I
Y
 
T
A
 
S
A
 
A
I
 
M
A
 
V
D
 
E
L
 
V

Query Sequence

>Synpcc7942_0031 Synpcc7942_0031 aminotransferase
MPSHPHLWFPFTSVKDAPDPLKVVSGKGARLTLADGRELIDCISSWWVNLHGHAHLRIVE
AIAQQAATLEHVIFAGFSHEPAERLAMELCKILPEKLTRVFFSDNGSTAVEVALKMALQY
WHNLDQPRSRILAFDGAYHGDTFGAMSVGERSLFNAPFEKLLFSVEFLPYPETWWGDETV
EAKEAAAIAAVEQALAAGDVAAVIIEPLVQGAGGMRMARPQFLQQLAARVQAAGSLLIAD
EVMTGFGRTGAWFACQRAGIQPDLICLSKGLTGGFLPLSITVATEVIYDTFCSGNPDHTF
YHGHSYTANPLGCAAAIASLELLLDSEAIVQGLEDAHLPGLELLAQHPKVTRPRLTGGIA
ACDLVSDRGGYLDPIGLRVRQAAIARGLLLRPLGNVLYLLPPYCLTPTELQDIYAAIADL
LDEI

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory