SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Synpcc7942_0061 FitnessBrowser__SynE:Synpcc7942_0061 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1rkxC Crystal structure at 1.8 angstrom of cdp-d-glucose 4,6-dehydratase from yersinia pseudotuberculosis (see paper)
43% identity, 99% coverage: 1:366/368 of query aligns to 1:347/351 of 1rkxC

query
sites
1rkxC
M
 
I
N
 
N
S
 
N
S
 
S
F
 
F
W
 
W
R
 
Q
D
 
G
R
 
K
Q
 
R
V
 
V
L
 
F
I
 
V
T
 
T
G
|
G
H
 
H
T
|
T
G
|
G
F
|
F
K
|
K
G
 
G
S
 
G
W
 
W
L
 
L
T
 
S
L
 
L
W
 
W
L
 
L
L
 
Q
M
 
T
Q
 
M
G
 
G
A
 
A
D
 
T
V
 
V
W
 
K
G
 
G
Y
 
Y
A
x
S
L
|
L
P
 
T
P
 
A
E
 
P
S
 
T
E
 
V
R
 
P
S
 
S
L
 
L
F
 
F
T
 
E
A
 
T
L
 
A
D
 
R
L
 
V
A
 
A
N
 
D
Q
 
G
R
 
M
Q
 
Q
A
 
S
G
 
-
W
 
-
G
 
-
Y
 
-
F
 
-
Q
 
-
Y
 
-
R
 
E
L
 
I
G
 
G
E
x
D
M
x
I
N
 
R
D
 
D
A
 
Q
E
 
N
A
 
K
L
 
L
R
 
L
Q
 
E
W
 
S
V
 
I
E
 
R
Q
 
E
A
 
F
Q
 
Q
P
 
P
E
 
E
V
 
I
V
 
V
F
 
F
H
 
H
L
x
M
A
|
A
A
|
A
Q
 
Q
P
|
P
L
 
L
V
 
V
R
 
R
R
 
L
S
 
S
Y
 
Y
A
 
S
D
 
E
P
 
P
L
 
V
G
 
E
T
 
T
W
 
Y
Q
 
S
T
|
T
N
 
N
V
 
V
L
 
M
G
 
G
S
 
T
L
 
V
Q
 
Y
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
L
 
I
K
 
R
S
 
H
L
 
V
Q
 
G
H
 
G
P
 
V
C
 
K
A
 
A
M
 
V
V
 
V
M
 
N
V
x
I
T
|
T
T
x
S
D
|
D
K
|
K
V
 
C
Y
 
Y
E
 
D
N
 
N
R
 
K
E
 
E
W
 
W
V
 
I
Y
 
W
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
E
 
E
T
 
N
D
 
E
C
 
A
L
 
M
G
 
G
G
 
G
H
 
Y
D
 
D
P
 
P
Y
|
Y
S
 
S
A
 
N
S
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
C
M
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
V
V
 
T
A
 
S
S
 
S
W
 
Y
R
 
R
S
 
N
S
 
S
F
 
F
C
 
F
G
 
N
D
 
P
A
 
A
A
 
N
H
 
Y
Q
 
G
T
 
Q
P
 
H
Y
 
G
L
 
T
A
 
A
I
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
V
R
 
R
A
|
A
G
 
G
N
 
N
V
|
V
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
D
 
D
W
 
W
A
 
A
V
 
L
D
 
D
R
 
R
I
 
I
V
 
V
P
 
P
D
 
D
A
 
I
V
 
L
R
 
R
S
 
A
L
 
F
S
 
E
A
 
Q
G
 
S
A
 
Q
A
 
P
I
 
V
A
 
I
V
 
I
R
 
R
N
 
N
S
 
P
H
 
H
S
 
A
T
 
I
R
 
R
P
 
P
W
 
W
Q
 
Q
H
 
H
V
 
V
L
 
L
E
 
E
P
 
P
L
 
L
G
 
S
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
R
 
K
L
 
L
L
 
-
E
 
-
H
 
Y
Q
 
T
Q
 
D
S
 
G
A
 
A
E
 
E
K
 
-
T
 
-
V
 
-
N
 
-
P
 
-
F
 
Y
A
 
A
R
 
E
A
 
G
F
 
W
N
 
N
F
 
F
G
 
G
P
 
P
A
 
N
I
 
D
E
 
A
S
 
D
N
 
A
R
 
T
S
 
P
V
 
V
K
 
K
E
 
N
L
 
I
I
 
V
T
 
E
T
 
Q
V
 
M
L
 
V
Q
 
K
H
 
Y
W
 
W
P
 
G
G
 
-
Q
 
-
W
 
-
V
 
-
D
 
E
Q
 
G
S
 
A
D
 
S
P
 
W
T
 
Q
A
 
L
P
 
P
H
 
H
E
 
E
A
 
A
G
 
H
L
 
Y
L
 
L
H
 
K
L
 
L
V
 
D
S
 
C
D
 
S
Q
 
K
A
 
A
R
 
K
Q
 
M
L
 
Q
L
 
L
G
 
G
W
 
W
Q
 
H
P
 
P
R
 
R
W
 
W
D
 
N
F
 
L
E
 
N
T
 
T
T
 
T
V
 
L
S
 
E
R
 
Y
T
 
I
I
 
V
H
 
G
W
 
W
Y
 
H
R
 
K
P
 
N
V
 
-
M
 
W
M
 
L
T
 
S
G
 
G
G
 
T
S
 
D
A
 
M
L
 
H
E
 
E
A
 
Y
C
 
S
L
 
I
E
 
T
D
 
E
L
 
I
A
 
N
T
 
N
Y
 
Y

1wvgA Structure of cdp-d-glucose 4,6-dehydratase from salmonella typhi (see paper)
44% identity, 94% coverage: 1:346/368 of query aligns to 2:330/352 of 1wvgA

query
sites
1wvgA
M
 
I
N
 
D
S
 
K
S
 
N
F
 
F
W
 
W
R
 
Q
D
 
G
R
 
K
Q
 
R
V
 
V
L
 
F
I
 
V
T
 
T
G
|
G
H
 
H
T
|
T
G
|
G
F
|
F
K
|
K
G
 
G
S
 
S
W
 
W
L
 
L
T
 
S
L
 
L
W
 
W
L
 
L
L
 
T
M
 
E
Q
 
M
G
 
G
A
 
A
D
 
I
V
 
V
W
 
K
G
 
G
Y
 
Y
A
|
A
L
|
L
P
 
D
P
 
A
E
 
P
S
 
T
E
 
V
R
 
P
S
 
S
L
 
L
F
 
F
T
 
E
A
 
I
L
 
V
D
 
R
L
 
L
A
 
N
N
 
D
Q
 
L
R
 
M
Q
 
E
A
 
S
G
 
-
W
 
-
G
 
-
Y
 
-
F
 
-
Q
 
-
Y
 
-
R
 
H
L
 
I
G
 
G
E
x
D
M
x
I
N
 
R
D
 
D
A
 
F
E
 
E
A
 
K
L
 
L
R
 
R
Q
 
S
W
 
S
V
 
I
E
 
A
Q
 
E
A
 
F
Q
 
K
P
 
P
E
 
E
V
 
I
V
 
V
F
 
F
H
 
H
L
x
M
A
|
A
A
|
A
Q
 
Q
P
|
P
L
 
L
V
 
V
R
 
R
R
 
L
S
 
S
Y
 
Y
A
 
E
D
 
Q
P
 
P
L
 
I
G
 
K
T
 
T
W
 
Y
Q
 
S
T
 
T
N
 
N
V
 
V
L
 
M
G
 
G
S
 
T
L
 
V
Q
 
H
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
T
L
 
V
K
 
K
S
 
Q
L
 
V
Q
 
G
H
 
N
P
 
I
C
 
K
A
 
A
M
 
V
V
 
V
M
 
N
V
x
I
T
 
T
T
 
S
D
 
D
K
|
K
V
 
C
Y
 
Y
E
 
D
N
 
N
R
 
R
E
 
E
W
 
W
V
 
V
Y
 
W
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
E
 
E
T
 
N
D
 
E
C
 
P
L
 
M
G
 
G
G
 
G
H
 
Y
D
 
D
P
 
P
Y
|
Y
S
 
S
A
 
N
S
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
C
M
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
V
V
 
A
A
 
S
S
 
A
W
 
F
R
 
R
S
 
N
S
 
S
F
 
F
C
 
F
G
 
N
D
 
P
A
 
A
A
 
N
H
 
Y
Q
 
E
T
 
Q
P
 
H
Y
 
G
L
 
V
A
 
G
I
 
L
A
 
A
T
 
S
A
 
V
R
 
R
A
 
A
G
 
G
N
|
N
V
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
D
 
D
W
 
W
A
 
A
V
 
K
D
|
D
R
|
R
I
x
L
V
 
I
P
 
P
D
|
D
A
 
I
V
 
L
R
 
R
S
 
S
L
 
F
S
 
E
A
 
N
G
 
N
A
 
Q
A
 
Q
I
 
V
A
x
I
V
 
I
R
|
R
N
|
N
S
 
P
H
 
Y
S
|
S
T
 
I
R
|
R
P
 
P
W
 
W
Q
 
Q
H
 
H
V
 
V
L
 
L
E
 
E
P
 
P
L
 
L
G
 
S
G
 
G
Y
 
Y
L
 
I
L
 
V
L
 
V
A
 
A
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
L
 
-
E
 
-
H
 
Y
Q
 
T
Q
 
E
S
 
G
A
 
A
E
 
K
K
 
-
T
 
-
V
 
-
N
 
-
P
 
-
F
 
F
A
 
S
R
 
E
A
 
G
F
 
W
N
 
N
F
 
F
G
 
G
P
 
P
A
 
R
I
 
D
E
 
E
S
 
D
N
 
A
R
 
K
S
 
T
V
 
V
K
 
E
E
 
F
L
 
I
I
 
V
T
 
D
T
 
K
V
 
M
L
 
V
Q
 
T
H
 
L
W
 
W
P
 
G
G
 
D
Q
 
-
W
 
-
V
 
-
D
 
D
Q
 
A
S
 
S
D
 
W
P
 
L
T
 
L
A
 
D
P
 
P
H
 
H
E
|
E
A
 
A
G
 
H
L
 
Y
L
 
L
H
 
K
L
 
L
V
 
D
S
 
C
D
 
S
Q
 
K
A
 
A
R
 
N
Q
 
M
L
 
Q
L
 
L
G
 
G
W
 
W
Q
 
H
P
 
P
R
 
R
W
 
W
D
 
G
F
 
L
E
 
T
T
 
E
T
 
T
V
 
L
S
 
S
R
 
R
T
 
I
I
 
V
H
 
K
W
 
W
Y
 
H
R
 
K

7us5A X-ray crystal structure of gdp-d-glycero-d-manno-heptose 4,6- dehydratase from campylobacter jejuni (see paper)
25% identity, 87% coverage: 9:329/368 of query aligns to 5:317/346 of 7us5A

query
sites
7us5A
R
 
K
Q
 
T
V
 
A
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
H
 
F
T
|
T
G
|
G
F
x
Q
K
x
V
G
 
G
S
 
S
W
 
Q
L
 
M
T
 
A
L
 
D
W
 
F
L
 
L
L
 
L
M
 
E
Q
 
N
-
 
T
G
 
D
A
 
Y
D
 
D
V
 
V
W
 
I
G
 
G
Y
 
M
A
 
M
L
x
R
P
 
W
P
 
Q
E
|
E
S
 
P
E
 
M
R
 
D
S
 
N
L
 
I
F
 
Y
T
 
H
A
 
L
L
 
S
D
 
D
L
 
R
A
 
I
N
 
N
Q
 
K
R
 
K
Q
 
D
A
 
R
G
 
I
W
 
S
G
 
I
Y
 
F
F
 
Y
Q
 
-
Y
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
A
E
x
D
M
x
L
N
 
N
D
 
D
A
 
Y
E
 
S
A
 
S
L
 
L
R
 
Q
Q
 
K
W
 
L
V
 
F
E
 
E
Q
 
S
A
 
Q
Q
 
R
P
 
P
E
 
D
V
 
V
V
 
I
F
 
F
H
 
H
L
|
L
A
|
A
A
|
A
Q
 
Q
P
x
S
L
 
Y
V
x
P
R
 
K
R
 
T
S
 
S
Y
 
F
A
 
D
D
 
I
P
 
P
L
 
I
G
 
E
T
 
T
W
 
L
Q
 
Q
T
|
T
N
 
N
V
 
I
L
 
I
G
 
G
S
 
T
L
 
A
Q
 
N
L
 
I
L
 
L
E
 
E
A
 
N
L
 
I
K
 
R
S
 
I
L
 
L
Q
 
K
-
 
A
-
 
K
-
 
E
-
 
G
H
 
Y
P
 
D
C
 
P
A
 
V
M
 
V
V
 
H
M
 
I
V
x
C
T
 
S
T
 
S
D
 
S
K
x
E
V
 
V
Y
 
Y
E
 
G
N
 
K
R
 
A
E
 
K
W
 
V
V
 
G
Y
 
V
G
 
K
Y
 
L
R
 
N
E
 
E
T
 
E
D
 
T
C
 
A
L
 
F
G
 
H
G
 
G
H
 
A
D
 
S
P
 
P
Y
|
Y
S
 
S
A
 
I
S
 
S
K
|
K
A
 
I
A
 
G
M
 
T
E
 
D
L
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
-
S
 
-
W
 
Y
R
 
L
S
 
G
S
 
K
F
 
F
C
 
Y
G
 
G
D
 
E
A
 
A
A
 
Y
H
 
N
Q
 
I
T
 
R
P
 
T
Y
 
F
L
 
V
A
 
T
I
 
R
A
 
M
T
 
G
A
 
T
R
x
H
A
 
S
G
 
G
N
 
P
V
 
-
I
 
-
G
 
R
G
x
R
G
 
S
D
 
D
W
x
V
A
x
F
V
x
F
D
 
E
R
 
S
I
 
T
V
 
V
P
 
A
D
 
K
A
 
Q
V
 
I
R
 
A
S
 
L
L
 
I
S
 
E
A
 
A
G
 
G
-
 
Y
-
 
Q
-
 
E
A
 
P
A
 
V
I
 
I
A
 
K
V
 
V
R
x
G
N
|
N
S
 
L
H
 
S
S
|
S
T
 
V
R
|
R
P
 
T
W
 
F
Q
 
Q
H
 
D
V
 
C
L
 
R
E
 
D
P
 
A
L
 
I
G
 
R
G
 
A
Y
 
Y
L
 
Y
L
 
L
L
 
L
A
 
S
Q
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
L
E
 
E
H
 
-
Q
 
-
Q
 
-
S
 
-
A
 
S
E
 
E
K
 
K
T
 
G
V
 
N
N
 
I
P
 
P
F
 
C
A
 
G
R
 
E
A
 
A
F
 
F
N
 
N
F
 
I
G
 
-
P
 
-
A
 
A
I
 
G
E
 
E
S
 
E
N
 
A
R
 
F
S
 
K
V
x
L
K
 
P
E
 
E
L
 
V
I
 
I
T
 
D
T
 
I
V
 
L
L
 
L
Q
 
N
H
 
F
W
 
S
P
 
D
-
 
M
-
 
G
-
 
R
G
 
G
Q
 
I
W
 
E
V
 
V
D
 
R
Q
 
Q
-
 
V
S
 
E
D
 
D
P
x
R
T
 
M
A
x
R
P
 
P
H
 
I
E
x
D
A
 
A
G
 
D
L
 
Y
L
 
Q
H
 
M
L
 
F
V
 
D
S
 
N
D
 
S
Q
 
K
A
 
I
R
 
K
Q
 
S
L
 
F
L
 
I
G
 
D
W
 
W
Q
 
K

P27830 dTDP-glucose 4,6-dehydratase 2; EC 4.2.1.46 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
25% identity, 92% coverage: 9:345/368 of query aligns to 2:331/355 of P27830

query
sites
P27830
R
 
R
Q
 
K
V
 
I
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
H
 
G
T
 
A
G
 
G
F
|
F
K
x
I
G
 
G
S
 
S
W
 
A
L
 
L
T
 
V
L
 
R
W
 
Y
L
 
I
L
 
I
M
 
N
Q
 
E
G
 
T
A
 
S
D
 
D
V
 
A
-
 
V
-
 
V
-
 
V
-
 
V
-
x
D
-
x
K
W
x
L
G
x
T
Y
 
Y
A
 
A
-
 
G
-
 
N
-
 
L
-
 
M
-
 
S
L
 
L
P
 
A
P
 
P
-
 
V
-
 
A
E
 
Q
S
 
S
E
 
E
R
 
R
S
 
F
L
 
A
F
 
F
T
 
E
A
 
K
L
 
V
D
|
D
L
x
I
A
 
C
N
 
D
Q
 
R
R
 
-
Q
 
-
A
 
-
G
 
-
W
 
-
G
 
-
Y
 
-
F
 
-
Q
 
-
Y
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
-
E
 
-
M
 
-
N
 
-
D
 
-
A
 
A
E
 
E
A
 
L
L
 
A
R
 
R
Q
 
V
W
 
F
V
 
T
E
 
E
Q
 
H
A
 
-
Q
 
Q
P
 
P
E
 
D
V
 
C
V
 
V
F
 
M
H
 
H
L
 
L
A
 
A
A
 
A
Q
 
E
P
 
S
L
 
H
V
 
V
R
 
D
R
 
R
S
 
S
Y
 
I
A
 
D
D
 
G
P
 
P
L
 
A
G
 
A
T
 
F
W
 
I
Q
 
E
T
|
T
N
 
N
V
 
I
L
 
V
G
 
G
S
 
T
L
 
Y
Q
 
T
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
L
 
A
K
 
R
S
 
A
L
 
Y
-
 
W
-
 
N
-
 
A
-
 
L
-
 
T
-
 
E
-
 
D
-
 
K
Q
 
K
H
 
S
P
 
A
C
 
F
A
 
R
M
 
F
V
 
H
M
 
H
V
 
I
T
 
S
T
 
T
D
|
D
K
x
E
V
 
V
Y
 
Y
E
 
G
N
 
D
R
 
L
E
 
H
W
 
S
V
 
T
Y
 
D
G
 
D
-
 
F
Y
 
F
R
 
T
E
 
E
T
 
T
D
 
T
C
 
P
L
 
Y
G
 
A
G
 
P
H
 
S
D
 
S
P
 
P
Y
|
Y
S
|
S
A
|
A
S
|
S
K
|
K
A
 
A
A
 
S
M
 
S
E
 
D
L
 
H
A
 
L
V
 
V
A
 
R
S
 
A
W
 
W
R
 
L
S
 
R
S
 
T
F
 
Y
C
 
G
G
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
H
 
-
Q
 
-
T
 
-
P
 
-
Y
 
-
L
 
L
A
 
P
I
 
T
A
 
L
T
 
I
A
 
T
R
 
N
A
 
C
G
 
S
N
 
N
V
x
N
I
 
Y
G
 
G
G
 
P
G
 
Y
D
 
H
W
 
F
A
 
P
V
 
-
D
 
E
R
 
K
I
 
L
V
 
I
P
 
P
D
 
L
A
 
M
V
 
I
R
 
L
S
 
N
L
 
A
S
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
K
A
 
S
I
 
L
A
 
P
V
 
V
R
 
Y
-
 
G
N
 
N
S
 
G
H
 
Q
S
 
Q
T
 
I
R
 
R
P
 
D
W
 
W
Q
 
L
H
 
Y
V
 
V
L
 
E
E
 
D
P
 
H
L
 
A
G
 
R
G
 
A
Y
 
L
L
 
Y
L
 
C
L
 
V
A
 
A
Q
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
-
E
 
-
H
 
-
Q
 
-
Q
 
-
S
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
-
T
 
T
V
 
T
N
 
G
P
 
K
F
 
V
A
 
G
R
 
E
A
 
T
F
 
Y
N
 
N
F
 
I
G
 
G
P
 
G
A
 
H
I
 
N
E
 
E
-
 
R
S
 
K
N
 
N
R
 
L
S
 
D
V
 
V
K
 
V
E
 
E
L
 
T
I
 
I
T
 
C
T
 
E
V
 
L
L
 
L
Q
 
E
H
 
E
W
 
L
P
 
A
G
 
-
Q
 
-
W
 
-
V
 
-
D
 
-
Q
 
-
S
 
-
D
 
-
P
 
P
T
 
N
A
 
K
P
 
P
H
 
H
E
 
G
A
 
V
G
 
A
-
 
H
-
 
Y
-
 
R
-
 
D
L
 
L
L
 
I
H
 
T
L
 
F
V
 
V
S
 
A
D
 
D
Q
 
R
-
 
P
-
 
G
-
 
H
-
 
D
-
 
L
-
 
R
-
 
Y
-
 
A
-
 
I
-
 
D
-
 
A
-
 
S
-
 
K
-
 
I
A
 
A
R
 
R
Q
 
E
L
 
-
L
 
L
G
 
G
W
 
W
Q
 
L
P
 
P
R
 
Q
W
 
E
D
 
T
F
 
F
E
 
E
T
 
S
T
 
G
V
 
M
S
 
R
R
 
K
T
 
T
I
 
V
H
 
Q
W
 
W
Y
 
Y

6bwlA X-ray structure of pal from bacillus thuringiensis (see paper)
25% identity, 92% coverage: 10:348/368 of query aligns to 2:312/313 of 6bwlA

query
sites
6bwlA
Q
 
K
V
 
I
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
H
 
G
T
 
A
G
|
G
F
|
F
K
x
I
G
 
G
S
 
R
W
 
W
L
 
V
T
 
V
L
 
K
W
 
R
L
 
L
L
 
L
M
 
Q
Q
 
D
G
 
K
A
 
H
D
 
E
V
 
V
W
 
W
G
 
-
Y
 
-
A
 
-
L
 
-
P
 
-
P
 
-
E
 
-
S
 
-
E
 
-
R
 
-
S
 
-
L
 
-
F
 
-
T
 
-
A
 
I
L
 
L
D
|
D
-
x
N
L
|
L
A
 
A
N
|
N
Q
x
S
R
 
T
Q
 
T
A
 
A
G
 
N
W
 
I
G
 
T
Y
 
E
F
 
F
Q
 
A
Y
 
H
R
 
D
L
 
L
-
 
N
-
 
L
-
 
K
-
 
Q
-
 
C
-
 
I
-
 
Q
G
 
G
E
x
D
M
x
I
N
 
K
D
 
D
A
 
K
E
 
K
A
 
L
L
 
V
R
 
A
Q
 
Q
W
 
L
V
 
F
E
 
E
Q
 
N
A
 
N
Q
 
S
P
 
F
E
 
D
V
 
L
V
 
C
F
 
Y
H
 
H
L
|
L
A
|
A
A
|
A
Q
 
S
P
x
I
L
 
N
V
 
V
R
 
Q
R
 
D
S
 
S
Y
 
I
A
 
D
D
 
D
P
 
A
L
 
R
G
 
A
T
 
T
W
 
F
Q
 
E
T
 
N
N
 
D
V
 
T
L
 
I
G
 
G
S
 
T
L
 
F
Q
 
N
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
-
L
 
-
K
 
Q
S
 
C
L
 
L
Q
 
N
H
 
Y
P
 
D
C
 
V
A
 
K
M
 
M
V
 
V
M
 
F
V
x
M
T
 
S
T
|
T
D
x
C
K
x
M
V
 
V
Y
 
Y
E
 
D
N
 
K
R
 
A
E
 
T
W
 
N
V
 
I
Y
 
Q
G
 
G
Y
 
I
R
 
S
E
 
E
T
 
L
D
 
D
C
 
P
L
 
I
G
 
K
G
 
P
H
 
A
D
 
S
P
 
P
Y
|
Y
S
 
A
A
 
G
S
 
S
K
|
K
A
 
I
A
 
A
M
 
A
E
 
E
L
 
N
A
 
M
V
 
V
A
 
L
S
 
S
W
 
Y
R
 
Y
S
 
Y
S
 
-
F
 
-
C
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
A
H
 
Y
Q
 
K
T
 
L
P
 
P
Y
 
V
L
 
V
A
 
V
I
 
I
A
 
-
T
 
-
A
 
-
R
 
R
A
 
P
G
 
F
N
|
N
V
x
T
I
 
Y
G
 
G
-
 
P
-
 
F
-
 
Q
-
 
K
-
 
T
G
 
G
G
 
G
D
 
E
W
 
G
A
x
G
V
|
V
D
 
-
R
 
-
I
 
-
V
 
-
P
 
-
D
 
-
A
 
-
V
 
-
R
 
-
S
 
-
L
 
-
S
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
F
V
 
I
R
 
N
N
 
N
S
 
K
H
 
L
S
 
D
T
 
N
R
 
V
P
 
P
W
 
L
Q
x
N
H
 
-
V
 
-
L
 
-
E
 
-
P
 
-
L
x
I
G
x
Y
G
 
G
Y
 
D
L
 
G
L
 
K
L
x
Q
A
 
T
Q
x
R
R
 
D
L
 
L
L
 
L
E
 
Y
H
 
V
Q
 
E
Q
 
D
S
 
C
A
 
A
E
 
D
K
 
F
T
 
V
V
 
V
N
 
A
P
 
A
F
 
G
A
 
Y
R
 
S
A
 
A
F
 
K
N
 
A
F
 
N
G
 
G
P
 
H
A
 
I
I
 
I
E
 
N
S
 
A
N
 
G
R
 
T
S
 
G
V
 
Q
K
 
D
E
 
I
L
 
S
I
|
I
T
 
N
T
 
K
V
 
L
L
 
A
Q
 
E
H
 
L
W
 
I
P
 
S
G
 
G
Q
 
N
W
 
K
V
 
V
D
 
S
Q
 
I
S
 
Q
D
 
H
P
 
V
T
 
T
A
 
H
P
 
I
H
 
H
-
 
P
-
 
Q
-
 
S
E
|
E
A
 
I
G
 
Q
L
 
K
L
 
L
H
 
L
L
 
C
V
 
N
S
 
Y
D
 
E
Q
 
K
A
 
A
R
 
K
Q
 
T
L
 
I
L
 
L
G
 
N
W
 
W
Q
 
E
P
 
P
R
 
K
W
 
V
D
 
S
F
 
L
E
 
E
T
 
D
T
 
G
V
 
V
S
 
I
R
 
K
T
 
T
I
 
E
H
 
E
W
 
W
Y
 
I
R
 
K
P
 
S
V
 
L

2hunA Crystal structure of hypothetical protein ph0414 from pyrococcus horikoshii ot3
24% identity, 91% coverage: 10:345/368 of query aligns to 3:306/329 of 2hunA

query
sites
2hunA
Q
 
K
V
 
L
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
H
 
G
T
 
M
G
|
G
F
|
F
K
x
I
G
 
G
S
 
S
W
 
N
L
 
F
T
 
I
L
 
R
W
 
Y
L
 
I
L
 
L
M
 
E
Q
 
K
-
 
H
-
 
P
-
 
D
-
 
W
-
 
E
-
 
V
-
 
I
G
 
N
A
 
I
D
|
D
V
x
K
W
 
L
G
 
G
Y
 
Y
A
 
G
L
x
S
P
 
N
P
 
P
E
 
A
S
 
N
E
 
L
R
 
K
S
 
-
L
 
-
F
 
-
T
 
-
A
 
-
L
 
-
D
 
D
L
 
L
A
 
E
N
 
D
Q
 
D
R
 
P
Q
 
R
A
 
-
G
 
-
W
 
-
G
 
-
Y
 
-
F
 
Y
Q
 
T
Y
 
F
R
 
V
L
 
K
G
 
G
E
x
D
M
x
V
N
 
A
D
 
D
A
 
Y
E
 
E
A
 
L
L
 
V
R
 
K
Q
 
E
W
 
L
V
 
V
E
 
R
Q
 
K
A
 
V
Q
 
-
P
 
-
E
 
D
V
 
G
V
 
V
F
 
V
H
 
H
L
|
L
A
|
A
A
|
A
Q
 
E
P
 
S
L
 
H
V
 
V
R
 
D
R
 
R
S
 
S
Y
 
I
A
 
S
D
 
S
P
 
P
L
 
E
G
 
I
T
 
F
W
 
L
Q
 
H
T
x
S
N
 
N
V
 
V
L
 
I
G
 
G
S
 
T
L
 
Y
Q
 
T
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
S
L
 
I
K
 
R
S
 
R
L
 
E
Q
 
N
H
 
P
P
 
E
C
 
V
A
 
R
M
 
F
V
 
V
M
 
H
V
 
V
T
 
S
T
|
T
D
|
D
K
x
E
V
 
V
Y
 
Y
E
 
G
N
 
D
R
 
-
E
 
-
W
 
I
V
 
L
Y
 
K
G
 
G
-
 
S
Y
 
F
R
 
T
E
 
E
T
 
N
D
 
D
C
 
R
L
 
L
G
 
M
G
 
P
H
 
S
D
 
S
P
 
P
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
S
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
A
M
 
S
E
 
D
L
 
M
A
 
L
V
 
V
A
 
L
S
 
G
W
 
W
R
 
T
S
 
R
S
 
T
F
 
Y
C
 
N
G
 
L
D
 
N
A
 
A
A
 
-
H
 
-
Q
 
-
T
 
-
P
 
-
Y
 
-
L
 
-
A
 
-
I
 
-
A
 
S
T
 
I
A
 
T
R
 
R
A
x
C
G
x
T
N
|
N
V
x
N
I
 
Y
G
 
G
G
 
P
G
 
Y
D
 
Q
W
 
F
A
 
P
V
 
-
D
 
E
R
 
K
I
 
L
V
 
I
P
 
P
D
 
K
A
 
T
V
 
I
R
 
I
S
 
R
L
 
A
S
 
S
A
 
L
G
 
G
A
 
L
A
 
K
I
 
I
A
 
P
V
 
I
R
 
Y
N
 
G
S
 
-
H
 
-
S
 
T
T
 
V
R
 
R
P
 
D
W
 
W
Q
 
L
H
 
Y
V
 
V
L
 
E
E
 
D
P
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
Y
 
H
L
 
V
L
 
R
L
 
A
A
 
I
Q
 
E
R
 
L
L
 
V
L
 
L
E
 
L
H
 
K
Q
 
G
Q
 
E
S
 
S
A
 
R
E
 
E
K
 
-
T
 
-
V
 
-
N
 
-
P
 
-
F
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
I
F
 
Y
N
 
N
F
 
I
G
 
S
P
 
A
A
 
G
I
 
E
E
 
E
-
 
K
S
 
T
N
 
N
R
 
L
S
 
E
V
 
V
K
 
V
E
 
K
L
 
I
I
 
I
T
 
L
T
 
R
V
 
L
L
 
M
Q
 
G
H
 
K
W
 
-
P
 
-
G
 
G
Q
 
E
W
 
E
V
 
L
D
 
I
Q
 
E
S
 
L
D
 
V
P
 
E
T
 
D
A
 
R
P
 
P
H
 
G
E
 
H
A
 
D
G
 
L
L
 
R
L
 
Y
H
 
S
L
 
L
V
 
D
S
 
S
D
 
W
Q
 
K
A
 
I
R
 
T
Q
 
R
L
 
D
L
 
L
G
 
K
W
 
W
Q
 
R
P
 
P
R
 
K
W
 
Y
D
 
T
F
 
F
E
 
D
T
 
E
T
 
G
V
 
I
S
 
K
R
 
K
T
 
T
I
 
I
H
 
D
W
 
W
Y
 
Y

1orrA Crystal structure of cdp-tyvelose 2-epimerase complexed with NAD and cdp (see paper)
29% identity, 44% coverage: 10:171/368 of query aligns to 2:172/338 of 1orrA

query
sites
1orrA
Q
 
K
V
 
L
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
H
 
G
T
 
C
G
|
G
F
|
F
K
x
L
G
 
G
S
 
S
W
 
N
L
 
L
T
 
A
L
 
S
W
 
F
L
 
A
L
 
L
M
 
S
Q
 
Q
G
 
G
A
 
I
D
 
D
V
 
L
W
 
-
G
 
-
Y
 
I
A
 
V
L
 
F
P
x
D
P
x
N
E
 
L
S
|
S
E
x
R
R
 
K
S
 
G
L
 
A
F
 
T
T
 
D
A
 
N
L
 
L
D
 
-
L
 
-
A
 
-
N
 
-
Q
 
H
R
 
W
Q
 
L
A
 
S
G
 
S
W
 
L
G
 
G
Y
 
N
F
 
F
Q
 
E
Y
 
F
R
 
V
L
 
H
G
 
G
E
x
D
M
x
I
N
 
R
D
 
N
A
 
K
E
 
N
A
 
D
L
 
V
R
 
T
Q
 
R
W
 
L
V
 
I
E
 
T
Q
 
K
A
 
Y
Q
 
M
P
 
P
E
 
D
V
 
S
V
 
C
F
 
F
H
 
H
L
|
L
A
 
A
A
 
G
Q
 
Q
P
x
V
L
 
A
V
 
M
R
 
T
R
 
T
S
 
S
Y
 
I
A
 
D
D
 
N
P
 
P
L
 
C
G
 
M
T
 
D
W
 
F
Q
 
E
T
 
I
N
 
N
V
 
V
L
 
G
G
 
G
S
 
T
L
 
L
Q
 
N
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
L
 
V
K
 
R
S
 
Q
L
 
Y
Q
 
N
H
 
S
P
 
N
C
 
C
A
 
N
M
 
I
V
 
I
M
 
Y
V
x
S
T
 
S
T
|
T
D
x
N
K
|
K
V
 
V
Y
 
Y
E
 
G
N
 
D
R
 
L
E
 
E
-
 
Q
W
 
Y
V
 
K
Y
 
Y
-
 
N
-
 
E
-
 
T
-
 
E
-
 
T
-
 
R
-
 
Y
-
 
T
-
 
C
-
 
V
-
 
D
-
 
K
-
 
P
-
 
N
G
 
G
Y
 
Y
R
 
D
E
 
E
T
 
S
D
 
T
C
 
Q
L
 
L
G
 
D
G
 
F
H
 
H
D
 
S
P
 
P
Y
|
Y
S
 
G
A
 
C
S
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
A
M
 
A
E
 
D

Sites not aligning to the query:

P14169 CDP-paratose 2-epimerase; CDP-tyvelose 2-epimerase; EC 5.1.3.10 from Salmonella typhi (see paper)
29% identity, 44% coverage: 10:171/368 of query aligns to 2:172/338 of P14169

query
sites
P14169
Q
 
K
V
 
L
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
H
 
G
T
 
C
G
 
G
F
 
F
K
 
L
G
 
G
S
 
S
W
 
N
L
 
L
T
 
A
L
 
S
W
 
F
L
 
A
L
 
L
M
 
S
Q
 
Q
G
 
G
A
 
I
D
 
D
V
 
L
W
 
-
G
 
-
Y
 
I
A
 
V
L
 
F
P
 
D
P
 
N
E
 
L
S
 
S
E
 
R
R
 
K
S
 
G
L
 
A
F
 
T
T
 
D
A
 
N
L
 
L
D
 
-
L
 
-
A
 
-
N
 
-
Q
 
H
R
 
W
Q
 
L
A
 
S
G
 
S
W
 
L
G
 
G
Y
 
N
F
 
F
Q
 
E
Y
 
F
R
 
V
L
 
H
G
 
G
E
 
D
M
 
I
N
 
R
D
 
N
A
 
K
E
 
N
A
 
D
L
 
V
R
 
T
Q
 
R
W
 
L
V
 
I
E
 
T
Q
 
K
A
 
Y
Q
 
M
P
 
P
E
 
D
V
 
S
V
 
C
F
 
F
H
 
H
L
 
L
A
 
A
A
 
G
Q
 
Q
P
 
V
L
 
A
V
 
M
R
 
T
R
 
T
S
 
S
Y
 
I
A
 
D
D
 
N
P
 
P
L
 
C
G
 
M
T
 
D
W
 
F
Q
 
E
T
 
I
N
 
N
V
 
V
L
 
G
G
 
G
S
 
T
L
 
L
Q
 
N
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
L
 
V
K
 
R
S
 
Q
L
 
Y
Q
 
N
H
 
S
P
 
N
C
 
C
A
 
N
M
 
I
V
 
I
M
 
Y
V
 
S
T
 
S
T
|
T
D
 
N
K
 
K
V
 
V
Y
 
Y
E
 
G
N
 
D
R
 
L
E
 
E
-
 
Q
W
 
Y
V
 
K
Y
 
Y
-
 
N
-
 
E
-
 
T
-
 
E
-
 
T
-
 
R
-
 
Y
-
 
T
-
 
C
-
 
V
-
 
D
-
 
K
-
 
P
-
 
N
G
 
G
Y
 
Y
R
 
D
E
 
E
T
 
S
D
 
T
C
 
Q
L
 
L
G
 
D
G
 
F
H
 
H
D
 
S
P
 
P
Y
 
Y
S
 
G
A
 
C
S
 
S
K
 
K
A
 
G
A
 
A
M
 
A
E
 
D

8du1A Crystal structure of NAD bound dtdp-glucose 4,6-dehydratase from elizabethkingia anophelis
22% identity, 92% coverage: 9:345/368 of query aligns to 4:337/361 of 8du1A

query
sites
8du1A
R
 
K
Q
 
N
V
 
I
L
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
H
 
G
T
 
A
G
|
G
F
|
F
K
x
I
G
 
G
S
 
S
W
 
H
L
 
V
T
 
V
L
 
R
W
 
E
L
 
F
L
 
V
M
 
I
Q
 
K
G
 
N
A
 
P
D
 
E
V
 
I
W
 
T
G
 
I
Y
 
I
A
 
N
L
 
L
P
 
-
P
 
-
E
 
-
S
 
-
E
 
-
R
x
D
S
x
A
L
|
L
F
x
T
T
 
Y
A
 
A
L
x
G
D
 
N
L
 
L
A
 
E
N
 
N
Q
 
L
R
 
K
Q
 
D
-
 
I
A
 
E
G
 
N
W
 
F
G
 
P
Y
 
N
F
 
Y
Q
 
V
Y
 
F
R
 
E
L
 
K
G
 
A
E
x
D
M
x
I
N
 
T
D
 
K
A
 
P
E
 
E
A
 
E
L
 
L
R
 
R
Q
 
K
W
 
V
V
 
F
E
 
E
Q
 
K
A
 
Y
Q
 
N
P
 
P
E
 
D
V
 
A
V
 
V
F
 
V
H
 
H
L
|
L
A
|
A
A
|
A
Q
 
E
P
 
S
L
 
H
V
 
V
R
 
D
R
 
R
S
 
S
Y
 
I
A
 
T
D
 
D
P
 
P
L
 
N
G
 
A
T
 
F
W
 
I
Q
 
N
T
|
T
N
 
N
V
 
V
L
 
I
G
 
G
S
 
T
L
 
A
Q
 
N
L
 
L
L
 
L
E
 
N
A
 
L
L
 
C
K
 
R
S
 
E
L
 
F
-
 
W
-
 
T
-
 
L
-
 
N
-
 
P
-
 
E
-
 
H
-
 
T
-
 
H
-
 
G
-
 
R
-
 
F
-
 
P
Q
 
N
H
 
E
P
 
P
C
 
R
A
 
T
M
 
N
V
 
L
M
 
F
-
 
Y
-
 
H
V
 
V
T
x
S
T
|
T
D
 
D
K
 
E
V
 
V
Y
 
Y
E
 
G
N
 
S
R
 
L
E
 
G
W
 
E
V
 
T
Y
 
G
G
 
F
Y
 
F
R
 
L
E
 
E
T
 
T
D
 
T
C
 
A
L
 
Y
G
 
D
G
 
P
H
 
Q
D
 
S
P
 
P
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
A
A
 
A
M
 
S
E
 
D
L
 
H
A
 
L
V
 
V
A
 
R
S
 
A
W
 
Y
R
 
G
S
 
N
S
 
T
F
 
Y
C
 
G
G
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
H
 
-
Q
 
-
T
 
-
P
 
-
Y
 
-
L
 
M
A
 
P
I
 
F
A
 
I
T
 
V
A
 
S
R
 
N
A
x
C
G
 
S
N
 
N
V
 
N
I
 
Y
G
 
G
G
 
P
G
 
N
D
 
H
W
 
F
A
 
P
V
 
-
D
 
E
R
 
K
I
 
L
V
 
I
P
 
P
D
 
L
A
 
C
V
 
I
R
 
S
S
 
N
L
 
I
S
 
L
A
 
N
G
 
E
A
 
K
A
 
P
I
 
L
A
 
P
V
 
I
R
 
Y
-
 
G
N
 
D
S
 
G
H
 
K
S
 
Y
T
 
T
R
 
R
P
 
D
W
 
W
Q
 
L
H
 
Y
V
 
V
L
 
I
E
 
D
P
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
Y
 
-
L
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
H
Q
 
A
R
 
R
L
 
A
L
 
I
E
 
H
H
 
Q
Q
 
I
Q
 
F
S
 
N
A
 
E
E
 
A
K
 
K
T
 
T
V
 
-
N
 
-
P
 
-
F
 
-
A
 
G
R
 
E
A
 
T
F
 
Y
N
 
N
F
 
I
G
 
G
P
 
G
A
 
F
I
 
N
E
 
E
-
 
W
-
 
Q
S
 
N
N
 
I
R
 
D
S
 
L
V
 
V
K
 
K
E
 
E
L
 
L
I
 
I
T
 
K
T
 
-
V
 
-
L
 
-
Q
 
-
H
 
-
W
 
-
P
 
-
G
 
-
Q
 
Q
W
 
L
V
 
D
D
 
A
Q
 
K
S
 
L
D
 
G
P
 
K
T
 
P
A
 
E
P
 
G
H
 
H
E
 
S
A
 
E
G
 
K
L
 
L
L
 
I
H
 
T
L
 
F
V
 
V
S
 
K
D
 
D
-
 
R
-
 
P
-
 
G
-
 
H
-
 
D
-
 
K
-
 
R
-
 
Y
-
 
A
-
 
I
-
 
D
-
 
A
-
 
T
Q
 
K
A
 
L
R
 
N
Q
 
K
L
 
D
L
 
L
G
 
G
W
 
W
Q
 
K
P
 
P
R
 
S
W
 
V
D
 
T
F
 
F
E
 
E
T
 
E
T
 
G
V
 
L
S
 
A
R
 
K
T
 
T
I
 
I
H
 
D
W
 
W
Y
 
Y

P93031 GDP-mannose 4,6 dehydratase 2; GDP-D-mannose dehydratase 2; GMD 2; EC 4.2.1.47 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see 2 papers)
24% identity, 93% coverage: 2:342/368 of query aligns to 21:348/373 of P93031

query
sites
P93031
N
 
D
S
 
S
S
 
T
F
 
V
W
 
V
R
 
E
D
 
P
R
 
R
Q
 
K
V
 
I
-
 
A
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
H
x
I
T
|
T
G
|
G
F
x
Q
K
x
D
G
 
G
S
 
S
W
 
Y
L
 
L
T
 
T
L
 
E
W
 
F
L
 
L
L
 
L
M
 
G
Q
 
K
G
 
G
A
 
Y
D
 
E
V
 
V
W
 
H
G
 
G
Y
 
L
A
 
I
L
x
R
P
 
R
P
 
S
-
 
S
-
 
N
-
 
F
E
 
N
S
 
T
E
 
Q
R
 
R
S
 
I
L
 
N
F
 
H
T
 
I
A
 
Y
L
 
I
D
 
D
L
 
P
A
 
H
N
 
N
Q
 
V
R
 
N
Q
 
K
A
 
A
G
 
-
W
 
-
G
 
-
Y
 
L
F
 
M
Q
 
K
Y
 
L
R
 
H
L
 
Y
G
 
A
E
x
D
M
x
L
N
 
T
D
 
D
A
 
A
E
 
S
A
 
S
L
 
L
R
 
R
Q
 
R
W
 
W
V
 
I
E
 
D
Q
 
V
A
 
I
Q
 
K
P
|
P
E
 
D
V
 
E
V
 
V
F
 
Y
H
 
N
L
|
L
A
|
A
A
|
A
Q
|
Q
P
x
S
L
 
H
V
 
V
R
 
A
R
 
V
S
 
S
Y
 
F
A
 
E
D
 
I
P
 
P
L
 
D
G
x
Y
T
 
T
W
 
A
Q
 
D
T
 
V
N
 
V
V
 
A
L
 
T
G
 
G
S
 
A
L
 
L
Q
x
R
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
L
 
V
K
 
R
S
 
S
L
 
H
Q
 
T
H
 
I
P
 
D
C
 
S
A
 
G
M
 
-
V
 
-
M
 
-
V
 
-
T
x
R
T
 
T
D
 
V
K
 
K
V
 
Y
Y
 
Y
E
 
Q
-
 
A
N
 
G
R
x
S
E
 
S
W
 
E
V
 
M
Y
 
F
G
 
G
-
 
S
-
 
T
-
 
P
-
 
P
-
 
P
Y
 
Q
R
 
S
E
 
E
T
 
T
D
 
T
C
 
P
L
 
F
G
 
H
G
 
P
H
 
R
D
 
S
P
 
P
Y
 
Y
S
 
A
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
C
A
|
A
M
 
A
E
 
H
L
 
W
A
 
Y
V
 
T
A
 
V
S
 
N
W
 
Y
R
 
R
S
 
E
S
x
A
F
 
Y
C
 
G
G
 
L
D
 
F
A
 
A
A
 
C
H
 
N
Q
x
G
T
 
I
P
 
L
Y
 
F
L
 
N
A
x
H
I
 
E
A
 
S
T
 
P
A
 
R
R
|
R
A
 
G
G
 
E
N
 
N
V
 
F
I
 
-
G
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
-
W
 
-
A
 
-
V
 
V
D
 
T
R
 
R
I
 
K
V
 
I
P
 
T
D
 
R
A
 
A
V
 
L
R
 
G
S
 
R
L
 
I
S
 
K
A
 
V
G
 
G
-
 
L
-
 
Q
A
 
T
A
 
K
I
 
L
A
 
F
V
 
L
R
 
G
N
 
N
S
 
L
H
 
Q
S
 
A
T
 
S
R
 
R
P
 
D
W
 
W
Q
 
G
H
 
F
V
 
A
L
 
-
E
 
-
P
 
-
L
 
-
G
 
G
G
 
D
Y
 
Y
L
 
V
L
 
E
L
 
A
A
 
M
Q
 
W
R
 
L
L
 
M
L
 
L
E
 
Q
H
 
Q
Q
 
E
Q
 
K
S
 
P
A
 
D
E
 
D
K
 
Y
T
 
V
V
 
V
N
 
-
P
 
-
F
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
F
 
-
N
 
-
F
 
-
G
 
-
P
 
-
A
 
A
I
 
T
E
 
E
S
 
E
N
 
G
R
 
H
S
 
T
V
 
V
K
 
E
E
 
E
L
 
F
I
 
L
T
 
D
T
 
V
V
 
S
L
 
F
Q
 
G
H
 
Y
W
 
L
P
 
G
G
 
L
Q
 
N
W
 
W
V
 
K
D
 
D
Q
 
Y
S
 
V
D
 
E
P
 
I
T
 
D
A
 
Q
-
 
R
-
 
Y
-
 
F
-
 
R
P
 
P
H
 
A
E
 
E
A
 
V
G
 
D
L
 
N
L
 
L
H
 
Q
L
 
G
V
 
D
S
 
A
D
 
S
Q
 
K
A
 
A
R
 
K
Q
 
E
L
 
V
L
 
L
G
 
G
W
 
W
Q
 
K
P
 
P
R
 
Q
W
 
V
D
 
G
F
 
F
E
 
E
T
 
K
T
 
L
V
 
V
S
 
K
R
 
M
T
 
M
I
 
V

1bxkB Dtdp-glucose 4,6-dehydratase from e. Coli
25% identity, 92% coverage: 9:345/368 of query aligns to 2:325/344 of 1bxkB

query
sites
1bxkB
R
 
R
Q
 
K
V
 
I
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
H
 
G
T
 
A
G
|
G
F
|
F
K
x
I
G
 
G
S
 
S
W
 
A
L
 
L
T
 
V
L
 
R
W
 
Y
L
 
I
L
 
I
M
 
N
Q
 
E
G
 
T
A
 
S
D
 
D
V
 
A
-
 
V
-
 
V
-
 
V
-
 
V
-
x
D
-
x
K
W
x
L
G
x
T
Y
 
Y
A
|
A
-
x
G
-
 
N
-
 
L
-
 
M
-
 
S
L
 
L
P
 
A
P
 
P
-
 
V
-
 
A
E
 
Q
S
 
S
E
 
E
R
 
R
S
 
F
L
 
A
F
 
F
T
 
E
A
 
K
L
 
V
D
|
D
L
x
I
A
 
C
N
 
D
Q
 
R
R
 
-
Q
 
-
A
 
-
G
 
-
W
 
-
G
 
-
Y
 
-
F
 
-
Q
 
-
Y
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
-
E
 
-
M
 
-
N
 
-
D
 
-
A
 
A
E
 
E
A
 
L
L
 
A
R
 
R
Q
 
V
W
 
F
V
 
T
E
 
E
Q
 
H
A
 
-
Q
 
Q
P
 
P
E
 
D
V
 
C
V
 
V
F
 
M
H
 
H
L
|
L
A
 
A
A
|
A
Q
 
E
P
 
S
L
 
H
V
 
V
R
 
D
R
 
R
S
 
S
Y
 
I
A
 
D
D
 
G
P
 
P
L
 
A
G
 
A
T
 
F
W
 
I
Q
 
E
T
|
T
N
 
N
V
 
I
L
 
V
G
 
G
S
 
T
L
 
Y
Q
 
T
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
L
 
A
K
 
R
S
 
A
L
 
Y
-
 
W
-
 
N
-
 
A
-
 
L
-
 
T
-
 
E
-
 
D
-
 
K
Q
 
K
H
x
S
P
 
A
C
 
F
A
 
R
M
 
F
V
 
H
M
 
H
V
x
I
T
x
S
T
|
T
D
|
D
K
x
E
V
 
V
Y
 
Y
E
 
G
N
 
D
R
 
L
E
 
H
W
 
S
V
 
T
Y
 
D
G
 
D
-
 
F
Y
 
F
R
 
T
E
 
E
T
 
T
D
 
T
C
 
P
L
 
Y
G
 
A
G
 
P
H
 
S
D
x
S
P
 
P
Y
|
Y
S
|
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
A
A
 
S
M
 
S
E
 
D
L
 
H
A
 
L
V
 
V
A
 
R
S
 
A
W
 
W
R
 
L
S
 
R
S
 
T
F
 
Y
C
 
G
G
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
H
 
-
Q
 
-
T
 
-
P
 
-
Y
 
-
L
 
L
A
 
P
I
 
T
A
 
L
T
 
I
A
 
T
R
 
N
A
x
C
G
 
S
N
 
N
V
 
N
I
 
Y
G
 
G
G
 
P
G
 
Y
D
 
H
W
 
F
A
 
P
V
 
-
D
 
E
R
 
K
I
 
L
V
 
I
P
 
P
D
 
L
A
 
M
V
 
I
R
 
L
S
 
N
L
 
A
S
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
K
A
 
S
I
 
L
A
 
P
V
 
V
R
 
Y
-
 
G
N
 
N
S
 
G
H
 
Q
S
 
Q
T
 
I
R
 
R
P
 
D
W
 
W
Q
 
L
H
 
Y
V
 
V
L
 
E
E
 
D
P
 
H
L
 
A
G
 
R
G
 
A
Y
 
L
L
 
Y
L
 
C
L
 
V
A
 
A
Q
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
-
E
 
-
H
 
-
Q
 
-
Q
 
-
S
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
-
T
 
T
V
 
T
N
 
G
P
 
K
F
 
V
A
 
G
R
 
E
A
 
T
F
 
Y
N
 
N
F
 
I
G
 
G
P
 
G
A
 
H
I
 
N
E
 
E
-
 
R
S
 
K
N
 
N
R
 
L
S
 
D
V
 
V
K
 
V
E
 
E
L
 
T
I
 
I
T
 
C
T
 
E
V
 
L
L
 
L
Q
 
E
H
 
E
W
 
L
P
 
A
G
 
-
Q
 
-
W
 
-
V
 
-
D
 
-
Q
 
-
S
 
-
D
 
-
P
 
P
T
 
N
A
 
K
P
 
P
H
 
H
E
 
-
A
 
-
G
 
G
L
 
V
L
 
A
H
 
H
L
 
Y
-
 
R
-
 
D
-
 
L
-
 
I
-
 
T
-
 
F
-
 
V
-
 
A
-
 
L
-
 
R
-
 
Y
-
 
A
-
 
I
-
 
D
V
 
A
S
 
S
D
 
K
Q
 
I
A
 
A
R
 
R
Q
 
E
L
 
-
L
 
L
G
 
G
W
 
C
Q
 
V
P
 
P
R
 
Q
W
 
E
D
 
T
F
 
F
E
 
E
T
 
S
T
 
G
V
 
M
S
 
R
R
 
K
T
 
T
I
 
V
H
 
Q
W
 
W
Y
 
Y

1n7gB Crystal structure of the gdp-mannose 4,6-dehydratase ternary complex with NADPH and gdp-rhamnose. (see paper)
24% identity, 90% coverage: 12:342/368 of query aligns to 5:316/336 of 1n7gB

query
sites
1n7gB
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
H
 
I
T
|
T
G
|
G
F
x
Q
K
x
D
G
 
G
S
 
S
W
 
Y
L
 
L
T
 
T
L
 
E
W
 
F
L
 
L
L
 
L
M
 
G
Q
 
K
G
 
G
A
 
Y
D
 
E
V
 
V
W
 
H
G
 
G
Y
 
L
A
 
I
L
 
-
P
 
-
P
 
-
E
 
-
S
 
-
E
x
R
R
|
R
S
|
S
L
x
S
F
 
N
T
 
F
A
 
N
L
 
T
D
 
Q
L
 
R
A
 
I
N
 
N
Q
 
H
R
 
I
Q
 
Y
A
 
I
G
 
D
W
 
K
G
 
A
Y
 
L
F
 
M
Q
 
K
Y
 
L
R
 
H
L
 
Y
G
 
A
E
x
D
M
x
L
N
 
T
D
 
D
A
 
A
E
 
S
A
 
S
L
 
L
R
 
R
Q
 
R
W
 
W
V
 
I
E
 
D
Q
 
V
A
 
I
Q
 
K
P
 
P
E
 
D
V
 
E
V
 
V
F
 
Y
H
 
N
L
|
L
A
|
A
A
|
A
Q
 
Q
P
x
S
L
x
H
V
 
V
R
 
A
R
 
V
S
 
S
Y
 
F
A
 
E
D
 
I
P
 
P
L
 
D
G
 
Y
T
 
T
W
 
A
Q
 
D
T
x
V
N
 
V
V
 
A
L
 
T
G
 
G
S
 
A
L
 
L
Q
 
R
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
L
 
V
K
 
R
S
 
S
L
 
H
Q
 
T
H
 
I
P
 
D
C
 
S
A
 
G
M
 
-
V
 
-
M
 
-
V
 
-
T
 
R
T
 
T
D
 
V
K
 
K
V
 
Y
Y
 
Y
E
 
Q
-
x
A
N
x
G
R
x
S
E
x
S
W
x
E
V
 
M
Y
 
F
G
 
G
-
 
S
-
 
T
-
 
P
-
 
P
-
 
P
Y
 
Q
R
 
S
E
 
E
T
 
T
D
 
T
C
 
P
L
 
F
G
 
H
G
 
P
H
 
R
D
 
S
P
 
P
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
C
A
 
A
M
 
A
E
 
H
L
 
W
A
 
Y
V
 
T
A
 
V
S
 
N
W
 
Y
R
 
R
S
 
E
S
 
A
F
 
Y
C
 
G
G
 
L
D
 
F
A
 
A
A
 
C
H
 
N
Q
 
G
T
 
I
P
 
L
Y
 
F
L
x
N
A
x
H
I
 
E
A
 
S
T
 
P
A
 
R
R
|
R
A
 
G
G
 
E
N
 
N
V
x
F
I
 
-
G
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
-
W
 
-
A
 
-
V
|
V
D
 
T
R
 
R
I
 
K
V
 
I
P
 
T
D
 
R
A
 
A
V
 
L
R
 
G
S
 
R
L
 
I
S
 
K
A
 
V
G
 
G
-
 
L
-
 
Q
A
 
T
A
 
K
I
 
L
A
 
F
V
 
L
R
x
G
N
|
N
S
 
L
H
 
Q
S
 
A
T
 
S
R
|
R
P
 
D
W
 
W
Q
 
G
H
 
F
V
 
A
L
 
-
E
 
-
P
 
-
L
 
-
G
 
G
G
 
D
Y
 
Y
L
 
V
L
 
E
L
 
A
A
 
M
Q
 
W
R
 
L
L
 
M
L
 
L
E
 
Q
H
 
Q
Q
 
E
Q
 
K
S
 
P
A
 
D
E
 
D
K
 
Y
T
 
V
V
 
V
N
 
-
P
 
-
F
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
F
 
-
N
 
-
F
 
-
G
 
-
P
 
-
A
 
A
I
 
T
E
 
E
S
 
E
N
 
G
R
 
H
S
 
T
V
 
V
K
 
E
E
 
E
L
 
F
I
 
L
T
 
D
T
 
V
V
 
S
L
 
F
Q
 
G
H
 
Y
W
 
L
P
 
G
G
 
L
Q
 
N
W
 
W
V
 
K
D
 
D
Q
 
Y
S
 
V
D
 
E
P
 
I
T
 
D
A
 
Q
-
 
R
-
 
Y
-
 
F
-
x
R
P
 
P
H
 
A
E
|
E
A
 
V
G
 
D
L
 
N
L
 
L
H
 
Q
L
 
G
V
 
D
S
 
A
D
 
S
Q
 
K
A
 
A
R
 
K
Q
 
E
L
 
V
L
 
L
G
 
G
W
 
W
Q
 
K
P
 
P
R
 
Q
W
 
V
D
 
G
F
 
F
E
 
E
T
 
K
T
 
L
V
 
V
S
 
K
R
 
M
T
 
M
I
 
V

1n7hA Crystal structure of gdp-mannose 4,6-dehydratase ternary complex with NADPH and gdp (see paper)
24% identity, 90% coverage: 12:342/368 of query aligns to 5:313/331 of 1n7hA

query
sites
1n7hA
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
H
 
I
T
|
T
G
|
G
F
x
Q
K
x
D
G
 
G
S
 
S
W
 
Y
L
 
L
T
 
T
L
 
E
W
 
F
L
 
L
L
 
L
M
 
G
Q
 
K
G
 
G
A
 
Y
D
 
E
V
 
V
W
 
H
G
 
G
Y
 
L
A
 
-
L
 
-
P
 
-
P
 
-
E
 
-
S
 
-
E
 
-
R
 
-
S
 
-
L
 
I
F
x
R
T
 
R
A
 
S
L
 
S
D
 
N
L
 
F
A
 
N
N
 
T
Q
 
Q
R
 
R
-
 
I
Q
 
N
A
 
H
G
 
I
W
 
Y
G
 
A
Y
 
L
F
 
M
Q
 
K
Y
 
L
R
 
H
L
 
Y
G
 
A
E
x
D
M
x
L
N
 
T
D
 
D
A
 
A
E
 
S
A
 
S
L
 
L
R
 
R
Q
 
R
W
 
W
V
 
I
E
 
D
Q
 
V
A
 
I
Q
 
K
P
 
P
E
 
D
V
 
E
V
 
V
F
 
Y
H
 
N
L
|
L
A
|
A
A
|
A
Q
 
Q
P
x
S
L
 
H
V
 
V
R
 
A
R
 
V
S
 
S
Y
 
F
A
 
E
D
 
I
P
 
P
L
 
D
G
 
Y
T
 
T
W
 
A
Q
 
D
T
 
V
N
 
V
V
 
A
L
 
T
G
 
G
S
 
A
L
 
L
Q
 
R
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
L
 
V
K
 
R
S
 
S
L
 
H
Q
 
T
H
 
I
P
 
D
C
 
S
A
 
G
M
 
-
V
 
-
M
 
-
V
 
-
T
 
R
T
 
T
D
 
V
K
 
K
V
 
Y
Y
 
Y
E
 
Q
-
x
A
N
x
G
R
x
S
E
x
S
W
x
E
V
 
M
Y
 
F
G
 
G
-
 
S
-
 
T
-
 
P
-
 
P
-
 
P
Y
 
Q
R
 
S
E
 
E
T
 
T
D
 
T
C
 
P
L
 
F
G
 
H
G
 
P
H
 
R
D
 
S
P
 
P
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
C
A
 
A
M
 
A
E
 
H
L
 
W
A
 
Y
V
 
T
A
 
V
S
 
N
W
 
Y
R
 
R
S
 
E
S
 
A
F
 
Y
C
 
G
G
 
L
D
 
F
A
 
A
A
 
C
H
 
N
Q
 
G
T
 
I
P
x
L
Y
 
F
L
x
N
A
x
H
I
 
E
A
 
S
T
 
P
A
 
R
R
|
R
A
 
G
G
 
E
N
 
N
V
x
F
I
 
-
G
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
-
W
 
-
A
 
-
V
|
V
D
 
T
R
 
R
I
x
K
V
 
I
P
 
T
D
 
R
A
 
A
V
 
L
R
 
G
S
 
R
L
 
I
S
 
K
A
 
V
G
 
G
-
 
L
-
 
Q
A
 
T
A
 
K
I
 
L
A
 
F
V
x
L
R
x
G
N
|
N
S
 
L
H
 
Q
S
 
A
T
 
S
R
|
R
P
 
D
W
 
W
Q
 
G
H
 
F
V
 
A
L
 
-
E
 
-
P
 
-
L
 
-
G
 
G
G
 
D
Y
 
Y
L
 
V
L
 
E
L
 
A
A
 
M
Q
 
W
R
 
L
L
 
M
L
 
L
E
 
Q
H
 
Q
Q
 
E
Q
 
K
S
 
P
A
 
D
E
 
D
K
 
Y
T
 
V
V
 
V
N
 
-
P
 
-
F
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
F
 
-
N
 
-
F
 
-
G
 
-
P
 
-
A
 
A
I
 
T
E
 
E
S
 
E
N
 
G
R
 
H
S
 
T
V
 
V
K
 
E
E
 
E
L
 
F
I
 
L
T
 
D
T
 
V
V
 
S
L
 
F
Q
 
G
H
 
Y
W
 
L
P
 
G
G
 
L
Q
 
N
W
 
W
V
 
K
D
 
D
Q
 
Y
S
 
V
D
 
E
P
 
I
T
 
D
A
 
Q
-
 
R
-
 
Y
-
 
F
-
x
R
P
 
P
H
 
A
E
|
E
A
 
V
G
 
D
L
 
N
L
 
L
H
 
Q
L
 
G
V
 
D
S
 
A
D
 
S
Q
 
K
A
 
A
R
 
K
Q
 
E
L
 
V
L
 
L
G
 
G
W
 
W
Q
 
K
P
 
P
R
 
Q
W
 
V
D
 
G
F
 
F
E
 
E
T
 
K
T
 
L
V
 
V
S
 
K
R
 
M
T
 
M
I
 
V

Q9LPG6 Trifunctional UDP-glucose 4,6-dehydratase/UDP-4-keto-6-deoxy-D-glucose 3,5-epimerase/UDP-4-keto-L-rhamnose-reductase RHM2; NDP-rhamnose synthase; Protein MUCILAGE-MODIFIED 4; Protein RHAMNOSE BIOSYNTHESIS 2; Rhamnose biosynthetic enzyme 2; AtRHM2; UDP-L-rhamnose synthase MUM4; EC 4.2.1.76; EC 1.1.1.-; EC 5.1.3.- from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see 2 papers)
23% identity, 94% coverage: 1:345/368 of query aligns to 1:321/667 of Q9LPG6

query
sites
Q9LPG6
M
 
M
N
 
D
S
 
D
S
 
T
F
 
T
W
 
Y
R
 
K
D
 
P
R
 
K
Q
 
N
V
 
I
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
H
 
A
T
 
A
G
|
G
F
 
F
K
 
I
G
 
A
S
 
S
W
 
H
L
 
V
T
 
A
L
 
N
W
 
R
L
 
L
L
 
I
M
 
R
Q
 
N
G
 
Y
A
 
P
D
 
D
V
 
Y
W
x
K
G
 
I
Y
 
V
A
 
V
L
 
L
P
 
D
P
 
K
E
 
L
S
 
D
E
 
Y
R
 
C
S
 
S
L
 
D
F
 
L
T
 
K
A
 
N
L
 
L
D
 
D
L
 
P
A
 
S
N
 
F
Q
 
S
R
 
S
Q
 
P
A
 
N
G
 
-
W
 
-
G
 
-
Y
 
-
F
 
F
Q
 
K
Y
 
F
R
 
V
L
 
K
G
 
G
E
 
D
M
 
I
N
 
A
D
 
S
A
 
D
E
 
D
A
 
L
L
 
V
R
 
N
Q
 
Y
W
 
L
V
 
L
E
 
I
Q
 
T
A
 
E
Q
 
N
P
 
I
E
 
D
V
 
T
V
 
I
F
 
M
H
 
H
L
 
F
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
P
 
T
L
 
H
V
 
V
R
x
D
R
 
N
S
 
S
Y
 
F
A
 
G
D
 
N
P
 
S
L
 
F
G
 
E
T
 
F
W
 
T
Q
 
K
T
 
N
N
 
N
V
 
I
L
 
Y
G
 
G
S
 
T
L
 
H
Q
 
V
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
L
 
C
K
 
K
S
 
V
L
 
T
Q
 
G
H
 
Q
P
 
I
C
 
R
A
 
R
M
 
F
V
 
I
M
 
H
V
 
V
T
 
S
T
 
T
D
 
D
K
 
E
V
 
V
Y
 
Y
-
 
G
-
 
E
E
 
T
N
 
D
R
 
E
E
 
D
W
 
A
V
 
A
Y
 
V
G
 
G
Y
 
N
R
 
H
E
 
E
T
 
A
D
 
S
C
 
Q
L
 
L
G
 
L
G
 
P
H
 
T
D
 
N
P
 
P
Y
 
Y
S
 
S
A
 
A
S
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
G
M
 
A
E
 
E
L
 
M
A
 
L
V
 
V
A
 
M
S
 
A
W
 
Y
R
 
G
S
 
R
S
 
S
F
 
Y
C
 
G
G
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
H
 
-
Q
 
-
T
 
-
P
 
-
Y
 
-
L
 
L
A
 
P
I
 
V
A
 
I
T
 
T
A
 
T
R
 
R
A
 
G
G
 
N
N
 
N
V
 
V
I
 
Y
G
|
G
G
 
P
G
 
N
D
 
Q
W
 
F
A
 
P
V
 
-
D
 
E
R
 
K
I
 
M
V
 
I
P
 
P
D
 
K
A
 
F
V
 
I
R
 
L
S
 
L
L
 
A
S
 
M
A
 
S
G
 
G
A
 
K
A
 
P
I
 
L
A
 
P
V
 
I
R
 
H
N
 
G
S
 
D
H
 
G
S
 
S
T
 
N
-
 
V
R
 
R
P
 
S
W
 
Y
Q
 
L
H
 
Y
V
 
C
L
 
E
E
 
D
P
 
V
L
 
A
G
 
E
G
 
A
Y
 
F
-
 
E
L
 
V
L
 
V
L
 
L
A
 
H
Q
 
K
R
 
G
L
 
E
L
 
I
E
 
G
H
 
H
Q
 
V
Q
 
Y
S
 
N
A
 
V
-
 
G
-
 
T
-
 
K
-
 
R
E
 
E
K
 
R
T
 
R
V
 
V
N
 
I
P
 
D
F
 
V
A
 
A
R
 
R
A
 
D
F
 
I
N
 
C
-
 
K
-
 
L
F
 
F
G
 
G
P
 
K
A
 
D
I
 
P
E
 
E
S
 
S
N
 
S
R
 
-
S
 
-
V
 
-
K
 
-
E
 
-
L
 
-
I
 
-
T
 
I
T
 
Q
V
 
F
L
 
V
Q
 
E
H
 
N
W
 
R
P
 
P
G
 
-
Q
 
-
W
 
F
V
 
N
D
 
D
Q
 
Q
S
 
R
D
 
-
P
 
-
T
 
-
A
 
-
P
 
-
H
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
H
 
Y
L
 
F
V
 
L
S
 
D
D
 
D
Q
 
Q
A
 
K
R
 
L
Q
 
K
L
 
K
L
 
L
G
 
G
W
 
W
Q
 
Q
P
 
E
R
 
R
W
 
T
D
 
N
F
 
W
E
 
E
T
 
D
T
 
G
V
 
L
S
 
K
R
 
K
T
 
T
I
 
M
H
 
D
W
 
W
Y
 
Y

Sites not aligning to the query:

Q9SYM5 Trifunctional UDP-glucose 4,6-dehydratase/UDP-4-keto-6-deoxy-D-glucose 3,5-epimerase/UDP-4-keto-L-rhamnose-reductase RHM1; Protein REPRESSOR OF LRX1 1; Rhamnose biosynthetic enzyme 1; AtRHM1; EC 4.2.1.76; EC 1.1.1.-; EC 5.1.3.- from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see 3 papers)
22% identity, 92% coverage: 6:345/368 of query aligns to 4:319/669 of Q9SYM5

query
sites
Q9SYM5
W
 
Y
R
 
T
D
 
P
R
 
K
Q
 
N
V
 
I
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
H
 
A
T
 
A
G
 
G
F
 
F
K
 
I
G
 
A
S
 
S
W
 
H
L
 
V
T
 
A
L
 
N
W
 
R
L
 
L
L
 
I
M
 
R
Q
 
S
G
 
Y
A
 
P
D
 
D
V
 
Y
W
 
K
G
 
I
Y
 
V
A
 
V
L
 
L
P
 
D
P
 
K
E
 
L
S
 
D
E
 
Y
R
 
C
S
 
S
L
 
N
F
 
L
T
 
K
A
 
N
L
 
L
D
 
N
L
 
P
A
 
S
N
 
K
Q
 
H
R
 
S
Q
 
P
A
 
N
G
 
-
W
 
-
G
 
-
Y
 
-
F
 
F
Q
 
K
Y
 
F
R
 
V
L
 
K
G
 
G
E
 
D
M
 
I
N
 
A
D
 
S
A
 
A
E
 
D
A
 
L
L
 
V
R
 
N
Q
 
H
W
 
L
V
 
L
E
 
I
Q
 
T
A
 
E
Q
 
G
P
 
I
E
 
D
V
 
T
V
 
I
F
 
M
H
 
H
L
 
F
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
P
 
T
L
 
H
V
 
V
R
 
D
R
 
N
S
 
S
Y
 
F
A
 
G
D
 
N
P
 
S
L
 
F
G
 
E
T
 
F
W
 
T
Q
 
K
T
 
N
N
 
N
V
 
I
L
 
Y
G
 
G
S
 
T
L
 
H
Q
 
V
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
L
 
C
K
 
K
S
 
V
L
 
T
Q
 
G
H
 
Q
P
 
I
C
 
R
A
 
R
M
 
F
V
 
I
M
 
H
V
 
V
T
 
S
T
 
T
D
 
D
K
 
E
V
 
V
Y
 
Y
-
 
G
-
 
E
E
 
T
N
 
D
R
 
E
E
 
D
W
 
A
V
 
L
Y
 
V
G
 
G
Y
 
N
R
 
H
E
 
E
T
 
A
D
 
S
C
 
Q
L
 
L
G
 
L
G
 
P
H
 
T
D
 
N
P
 
P
Y
 
Y
S
 
S
A
 
A
S
 
T
K
 
K
A
 
A
A
 
G
M
 
A
E
 
E
L
 
M
A
 
L
V
 
V
A
 
M
S
 
A
W
 
Y
R
 
G
S
 
R
S
 
S
F
 
Y
C
 
G
G
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
H
 
-
Q
 
-
T
 
-
P
 
-
Y
 
-
L
 
L
A
 
P
I
 
V
A
 
I
T
 
T
A
 
T
R
 
R
A
 
G
G
 
N
N
 
N
V
 
V
I
 
Y
G
 
G
G
 
P
G
 
N
D
 
Q
W
 
F
A
 
P
V
 
-
D
 
E
R
 
K
I
 
L
V
 
I
P
 
P
D
 
K
A
 
F
V
 
I
R
 
L
S
 
L
L
 
A
S
 
M
A
 
R
G
 
G
A
 
Q
A
 
V
I
 
L
A
 
P
V
 
I
R
 
H
N
 
G
S
 
D
H
 
G
S
 
S
T
 
N
-
 
V
R
 
R
P
 
S
W
 
Y
Q
 
L
H
 
Y
V
 
C
L
 
E
E
 
D
P
 
V
L
 
A
G
 
E
G
 
A
Y
 
F
L
 
E
L
 
V
L
 
V
A
 
L
Q
 
H
R
 
K
-
 
G
-
 
E
-
 
V
-
 
G
-
 
H
L
 
V
L
 
Y
E
 
N
H
 
I
Q
 
G
Q
 
T
S
 
K
A
 
K
E
 
E
K
 
R
T
 
R
V
 
V
N
 
N
P
 
D
F
 
V
A
 
A
R
 
K
A
 
D
-
 
I
-
 
C
-
 
K
-
 
L
F
 
F
N
 
N
F
 
M
G
 
D
P
 
P
A
 
-
I
 
-
E
 
E
S
 
A
N
 
N
R
 
-
S
 
-
V
 
-
K
 
-
E
 
-
L
 
-
I
 
-
T
 
I
T
 
K
V
 
F
L
 
V
Q
 
D
H
 
N
W
x
R
P
 
P
G
 
-
Q
 
-
W
 
F
V
 
N
D
 
D
Q
 
Q
S
 
R
D
 
-
P
 
-
T
 
-
A
 
-
P
 
-
H
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
H
 
Y
L
 
F
V
 
L
S
 
D
D
 
D
Q
 
Q
A
 
K
R
 
L
Q
 
K
L
 
K
L
 
L
G
 
G
W
 
W
Q
 
S
P
 
E
R
 
R
W
 
T
D
 
T
F
 
W
E
 
E
T
 
E
T
 
G
V
 
L
S
 
K
R
 
K
T
 
T
I
 
M
H
 
D
W
 
W
Y
 
Y

2pk3A Crystal structure of a gdp-4-keto-6-deoxy-d-mannose reductase (see paper)
22% identity, 91% coverage: 12:346/368 of query aligns to 4:307/309 of 2pk3A

query
sites
2pk3A
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
H
 
V
T
 
A
G
|
G
F
|
F
K
x
V
G
 
G
S
 
K
W
 
Y
L
 
L
T
 
A
L
 
N
W
 
H
L
 
L
L
 
T
M
 
E
Q
 
Q
G
 
N
A
 
V
D
 
E
V
 
V
W
 
F
G
 
G
Y
 
T
A
 
S
L
x
R
P
 
N
P
 
N
E
 
E
S
 
A
E
 
K
R
 
L
S
 
P
L
 
N
F
 
V
T
 
E
A
 
M
L
 
I
D
 
S
L
 
L
A
 
-
N
 
-
Q
 
-
R
 
-
Q
 
-
A
 
-
G
 
-
W
 
-
G
 
-
Y
 
-
F
 
-
Q
 
-
Y
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
-
E
x
D
M
x
I
N
 
M
D
 
D
A
 
S
E
 
Q
A
 
R
L
 
V
R
 
K
Q
 
K
W
 
V
V
 
I
E
 
S
Q
 
D
A
 
I
Q
 
K
P
 
P
E
 
D
V
 
Y
V
 
I
F
 
F
H
 
H
L
|
L
A
|
A
A
|
A
Q
 
K
P
x
S
L
 
S
V
|
V
R
 
K
R
 
D
S
 
S
Y
 
W
A
 
L
D
 
N
P
 
K
L
 
K
G
 
G
T
 
T
W
 
F
Q
 
S
T
 
T
N
 
N
V
 
V
L
 
F
G
 
G
S
 
T
L
 
L
Q
 
H
L
 
V
L
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
V
K
 
R
S
 
D
L
 
S
Q
 
N
H
 
L
P
 
D
C
 
C
A
 
R
M
 
I
V
 
L
M
 
T
V
x
I
T
 
G
T
x
S
D
x
S
K
x
E
V
 
E
Y
 
Y
-
 
G
-
 
M
-
 
I
-
 
L
-
 
P
E
 
E
N
 
E
R
 
S
E
 
P
W
 
-
V
 
-
Y
 
-
G
 
-
Y
 
V
R
 
S
E
 
E
T
 
E
D
 
N
C
 
Q
L
 
L
G
 
R
G
 
P
H
 
M
D
 
S
P
 
P
Y
|
Y
S
 
G
A
 
V
S
 
S
K
|
K
A
 
A
A
 
S
M
 
V
E
 
G
L
 
M
A
 
L
V
 
A
A
 
R
S
 
Q
W
 
Y
R
 
V
S
 
K
S
 
A
F
 
Y
C
 
G
G
 
M
D
 
D
A
 
I
A
 
I
H
 
H
Q
 
T
T
 
R
P
 
T
Y
x
F
L
x
N
A
x
H
I
 
I
A
 
G
T
 
P
A
 
G
R
 
Q
A
 
S
G
 
L
N
x
G
V
x
F
I
x
V
G
 
-
G
 
T
G
 
Q
D
|
D
W
x
F
A
 
A
V
 
-
D
 
K
R
 
Q
I
 
I
V
 
V
P
 
D
D
 
-
A
 
-
V
 
I
R
 
E
S
 
M
L
 
E
S
 
K
A
 
Q
G
 
E
A
 
P
A
 
I
I
 
I
A
 
K
V
 
V
R
x
G
N
|
N
S
 
L
H
 
E
S
 
A
T
 
V
R
|
R
P
 
D
W
 
F
Q
 
T
H
 
D
V
 
V
L
 
R
E
 
D
P
 
I
L
 
V
G
 
Q
G
 
A
Y
 
Y
L
 
W
L
 
L
L
 
L
A
 
S
Q
 
Q
R
 
-
L
 
-
L
 
-
E
 
-
H
 
-
Q
 
-
Q
 
-
S
 
-
A
 
Y
E
 
G
K
 
K
T
 
T
V
 
G
N
 
D
P
 
V
F
 
Y
A
 
N
R
 
V
A
 
C
F
 
S
N
 
G
F
 
I
G
 
G
P
 
T
A
 
R
I
|
I
E
 
Q
S
 
-
N
 
-
R
 
-
S
 
-
V
 
-
K
 
-
E
 
D
L
 
V
I
 
L
T
 
D
T
 
L
V
 
L
L
 
L
Q
 
A
H
 
M
W
 
A
P
 
N
G
 
V
Q
 
K
W
 
I
V
 
D
D
 
T
Q
 
E
S
 
L
D
 
N
P
 
P
T
 
L
A
x
Q
-
 
L
-
x
R
P
 
P
H
 
S
E
|
E
A
 
V
G
 
P
L
 
T
L
 
L
H
 
I
L
 
G
V
 
S
S
 
N
D
 
K
Q
 
R
A
 
L
R
 
K
Q
 
D
L
 
S
L
 
T
G
 
G
W
 
W
Q
 
K
P
 
P
R
 
R
W
 
I
D
 
P
F
 
L
E
 
E
T
 
K
T
 
S
V
 
L
S
 
F
R
 
E
T
 
I
I
 
L
H
 
Q
W
 
S
Y
 
Y
R
 
R

Q6T1X6 GDP-6-deoxy-D-mannose reductase; EC 1.1.1.281 from Aneurinibacillus thermoaerophilus (see paper)
22% identity, 91% coverage: 12:346/368 of query aligns to 4:307/309 of Q6T1X6

query
sites
Q6T1X6
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
H
 
V
T
 
A
G
 
G
F
 
F
K
 
V
G
 
G
S
 
K
W
 
Y
L
 
L
T
 
A
L
 
N
W
 
H
L
 
L
L
 
T
M
 
E
Q
 
Q
G
 
N
A
 
V
D
 
E
V
 
V
W
 
F
G
 
G
Y
 
T
A
 
S
L
 
R
P
 
N
P
 
N
E
 
E
S
 
A
E
 
K
R
 
L
S
 
P
L
 
N
F
 
V
T
 
E
A
 
M
L
 
I
D
 
S
L
 
L
A
 
-
N
 
-
Q
 
-
R
 
-
Q
 
-
A
 
-
G
 
-
W
 
-
G
 
-
Y
 
-
F
 
-
Q
 
-
Y
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
-
E
 
D
M
 
I
N
 
M
D
 
D
A
 
S
E
 
Q
A
 
R
L
 
V
R
 
K
Q
 
K
W
 
V
V
 
I
E
 
S
Q
 
D
A
 
I
Q
 
K
P
 
P
E
 
D
V
 
Y
V
 
I
F
 
F
H
 
H
L
 
L
A
 
A
A
 
A
Q
 
K
P
 
S
L
 
S
V
 
V
R
 
K
R
 
D
S
 
S
Y
 
W
A
 
L
D
 
N
P
 
K
L
 
K
G
 
G
T
 
T
W
 
F
Q
 
S
T
 
T
N
 
N
V
 
V
L
 
F
G
 
G
S
 
T
L
 
L
Q
 
H
L
 
V
L
 
L
E
 
D
A
 
A
L
 
V
K
 
R
S
 
D
L
 
S
Q
 
N
H
 
L
P
 
D
C
 
C
A
 
R
M
 
I
V
 
L
M
 
T
V
 
I
T
 
G
T
 
S
D
 
S
K
 
E
V
 
E
Y
 
Y
-
 
G
-
 
M
-
 
I
-
 
L
-
 
P
E
 
E
N
 
E
R
 
S
E
 
P
W
 
-
V
 
-
Y
 
-
G
 
-
Y
 
V
R
 
S
E
 
E
T
 
E
D
 
N
C
 
Q
L
 
L
G
 
R
G
 
P
H
 
M
D
 
S
P
 
P
Y
 
Y
S
 
G
A
 
V
S
 
S
K
 
K
A
 
A
A
 
S
M
 
V
E
 
G
L
 
M
A
 
L
V
 
A
A
 
R
S
 
Q
W
 
Y
R
 
V
S
 
K
S
 
A
F
 
Y
C
 
G
G
 
M
D
 
D
A
 
I
A
 
I
H
 
H
Q
 
T
T
 
R
P
 
T
Y
 
F
L
x
N
A
 
H
I
 
I
A
 
G
T
 
P
A
 
G
R
 
Q
A
 
S
G
 
L
N
 
G
V
 
F
I
 
V
G
 
-
G
 
T
G
 
Q
D
|
D
W
 
F
A
 
A
V
 
-
D
 
K
R
 
Q
I
 
I
V
 
V
P
 
D
D
 
-
A
 
-
V
 
I
R
 
E
S
 
M
L
 
E
S
 
K
A
 
Q
G
 
E
A
 
P
A
 
I
I
 
I
A
 
K
V
 
V
R
 
G
N
 
N
S
 
L
H
 
E
S
 
A
T
 
V
R
|
R
P
 
D
W
 
F
Q
 
T
H
 
D
V
 
V
L
 
R
E
 
D
P
 
I
L
 
V
G
 
Q
G
 
A
Y
 
Y
L
 
W
L
 
L
L
 
L
A
 
S
Q
 
Q
R
 
-
L
 
-
L
 
-
E
 
-
H
 
-
Q
 
-
Q
 
-
S
 
-
A
 
Y
E
 
G
K
 
K
T
 
T
V
 
G
N
 
D
P
 
V
F
 
Y
A
 
N
R
 
V
A
 
C
F
 
S
N
 
G
F
 
I
G
 
G
P
 
T
A
 
R
I
 
I
E
 
Q
S
 
-
N
 
-
R
 
-
S
 
-
V
 
-
K
 
-
E
 
D
L
 
V
I
 
L
T
 
D
T
 
L
V
 
L
L
 
L
Q
 
A
H
 
M
W
 
A
P
 
N
G
 
V
Q
 
K
W
 
I
V
 
D
D
 
T
Q
 
E
S
 
L
D
 
N
P
 
P
T
 
L
A
 
Q
-
 
L
-
 
R
P
 
P
H
 
S
E
 
E
A
 
V
G
 
P
L
 
T
L
 
L
H
 
I
L
 
G
V
 
S
S
 
N
D
 
K
Q
 
R
A
 
L
R
 
K
Q
 
D
L
 
S
L
 
T
G
 
G
W
 
W
Q
 
K
P
 
P
R
 
R
W
 
I
D
 
P
F
 
L
E
 
E
T
 
K
T
 
S
V
 
L
S
 
F
R
 
E
T
 
I
I
 
L
H
 
Q
W
 
S
Y
 
Y
R
 
R

Q51366 GDP-mannose 4,6-dehydratase; GDP-D-mannose dehydratase; EC 4.2.1.47 from Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1) (see paper)
25% identity, 91% coverage: 9:343/368 of query aligns to 3:314/323 of Q51366

query
sites
Q51366
R
 
R
Q
 
S
V
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
H
 
I
T
|
T
G
|
G
F
x
Q
K
x
D
G
 
G
S
 
A
W
 
Y
L
 
L
T
 
A
L
 
K
W
 
L
L
 
L
L
 
L
M
 
E
Q
 
K
G
 
G
A
 
Y
D
 
R
V
 
V
W
 
H
G
 
G
Y
 
L
A
 
V
L
 
-
P
 
-
P
 
-
E
 
-
S
 
A
E
 
R
R
|
R
S
 
S
L
 
S
F
 
D
T
 
T
A
 
R
L
 
W
D
 
R
L
 
L
A
 
-
N
 
-
Q
 
-
R
 
R
Q
 
E
A
 
L
G
 
G
W
 
I
-
 
E
G
 
G
Y
 
D
F
 
I
Q
 
Q
Y
 
Y
R
 
E
L
 
D
G
 
G
E
x
D
M
|
M
N
 
A
D
 
D
A
 
A
E
 
C
A
 
S
L
 
V
R
 
Q
Q
 
R
W
 
A
V
 
V
E
 
I
Q
 
K
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
E
 
Q
V
 
E
V
 
V
F
 
Y
H
 
N
L
|
L
A
|
A
A
|
A
Q
|
Q
P
x
S
L
 
F
V
 
V
R
 
G
R
 
A
S
 
S
Y
 
W
A
 
N
D
 
Q
P
 
P
L
 
V
G
 
T
T
 
T
W
 
G
Q
 
V
T
 
V
N
 
D
V
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
V
L
 
T
Q
 
H
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
L
 
I
K
 
R
S
 
Q
L
 
F
Q
 
S
H
 
P
P
 
E
C
 
T
A
 
R
M
 
F
V
 
Y
M
 
Q
V
 
A
T
 
S
T
 
T
D
 
S
K
 
E
V
 
M
Y
 
F
E
 
-
N
 
-
R
 
-
E
 
G
W
 
L
V
 
I
Y
 
Q
G
 
A
Y
 
E
R
 
R
-
 
Q
-
 
D
E
 
E
T
 
N
D
 
T
C
 
P
L
 
F
G
 
Y
G
 
P
H
 
R
D
 
S
P
 
P
Y
 
Y
S
 
G
A
 
V
S
 
A
K
|
K
A
 
L
A
 
Y
M
 
G
E
 
H
L
 
W
A
 
I
V
 
T
A
 
V
S
 
N
W
 
Y
R
 
R
S
 
E
S
 
S
F
 
F
C
 
G
G
 
L
D
 
H
A
 
A
A
 
S
-
 
S
-
 
G
-
 
I
-
 
L
-
 
F
-
 
N
H
|
H
Q
 
E
T
 
S
P
 
P
Y
 
L
L
x
R
A
 
G
I
 
I
A
 
E
T
 
F
A
 
-
R
 
-
A
 
-
G
 
-
N
 
-
V
 
-
I
 
-
G
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
-
W
 
-
A
 
-
V
 
V
D
 
T
R
 
R
I
 
K
V
 
V
P
 
T
D
 
D
A
 
A
V
 
V
R
 
A
S
 
R
L
 
I
S
 
K
A
 
L
G
 
G
A
 
K
A
 
Q
I
 
Q
A
 
E
V
 
L
R
 
R
-
 
L
-
 
G
N
 
N
S
 
V
H
 
D
S
 
A
T
 
K
R
 
R
P
 
D
W
 
W
Q
 
-
H
 
-
V
 
-
L
 
-
E
 
-
P
 
G
L
 
F
G
 
A
G
 
G
Y
 
D
L
 
Y
L
 
V
L
 
E
A
 
A
Q
 
M
R
 
W
L
 
L
L
 
M
E
 
L
H
 
Q
Q
 
Q
Q
 
D
S
 
K
A
 
A
E
 
D
K
 
-
T
 
-
V
 
-
N
 
-
P
 
-
F
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
F
 
-
N
 
D
F
 
Y
G
 
V
P
 
V
A
 
A
I
 
T
E
 
G
S
 
V
N
 
T
R
 
T
S
 
T
V
 
V
K
 
R
E
 
D
L
 
M
I
 
C
T
 
Q
T
 
I
V
 
A
L
 
F
Q
 
E
H
 
H
W
 
V
P
 
G
G
 
L
Q
 
D
W
 
Y
V
 
R
D
 
D
-
 
F
-
 
L
Q
 
K
S
 
I
D
 
D
P
 
P
T
 
A
-
 
F
-
 
F
A
 
R
P
 
P
H
 
A
E
 
E
A
 
V
G
 
D
L
 
V
L
 
L
H
 
L
L
 
G
V
 
N
S
 
P
D
 
A
Q
 
K
A
 
A
R
 
Q
Q
 
R
L
 
V
L
 
L
G
 
G
W
 
W
Q
 
K
P
 
P
R
 
R
W
 
T
D
 
S
F
 
L
E
 
D
T
 
E
T
 
L
V
 
I
S
 
R
R
 
M
T
 
M
I
 
V
H
 
E

1rpnD Crystal structure of gdp-d-mannose 4,6-dehydratase in complexes with gdp and NADPH (see paper)
25% identity, 91% coverage: 9:343/368 of query aligns to 2:313/322 of 1rpnD

query
sites
1rpnD
R
 
R
Q
 
S
V
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
H
 
I
T
|
T
G
|
G
F
x
Q
K
x
D
G
 
G
S
 
A
W
 
Y
L
 
L
T
 
A
L
 
K
W
 
L
L
 
L
L
 
L
M
 
E
Q
 
K
G
 
G
A
 
Y
D
 
R
V
 
V
W
 
H
G
 
G
Y
 
L
A
 
V
L
 
-
P
 
-
P
 
-
E
 
-
S
 
A
E
x
R
R
|
R
S
|
S
L
 
S
F
 
D
T
 
T
A
 
R
L
 
W
D
 
R
L
 
L
A
 
-
N
 
-
Q
 
-
R
 
R
Q
 
E
A
 
L
G
 
G
W
 
I
-
 
E
G
 
G
Y
 
D
F
 
I
Q
 
Q
Y
 
Y
R
 
E
L
 
D
G
 
G
E
x
D
M
|
M
N
 
A
D
 
D
A
 
A
E
 
C
A
 
S
L
 
V
R
 
Q
Q
 
R
W
 
A
V
 
V
E
 
I
Q
 
K
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
E
 
Q
V
 
E
V
 
V
F
 
Y
H
 
N
L
|
L
A
|
A
A
|
A
Q
 
Q
P
x
S
L
x
F
V
 
V
R
 
G
R
 
A
S
 
S
Y
 
W
A
 
N
D
 
Q
P
 
P
L
 
V
G
 
T
T
 
T
W
 
G
Q
 
V
T
 
V
N
 
D
V
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
V
L
 
T
Q
 
H
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
L
 
I
K
 
R
S
 
Q
L
 
F
Q
 
S
H
 
P
P
 
E
C
 
T
A
 
R
M
 
F
V
 
Y
M
 
Q
V
x
A
T
x
S
T
|
T
D
x
S
K
x
E
V
 
M
Y
 
F
E
 
-
N
 
-
R
 
-
E
 
G
W
 
L
V
 
I
Y
 
Q
G
 
A
Y
 
E
R
 
R
-
 
Q
-
 
D
E
 
E
T
 
N
D
 
T
C
 
P
L
 
F
G
 
Y
G
 
P
H
 
R
D
 
S
P
 
P
Y
|
Y
S
 
G
A
 
V
S
 
A
K
|
K
A
 
L
A
 
Y
M
 
G
E
 
H
L
 
W
A
 
I
V
 
T
A
 
V
S
 
N
W
 
Y
R
 
R
S
 
E
S
 
S
F
 
F
C
 
G
G
 
L
D
 
H
A
 
A
A
 
S
-
 
S
-
 
G
-
 
I
-
x
L
-
 
F
-
x
N
H
|
H
Q
 
E
T
 
S
P
 
P
Y
 
L
L
x
R
A
 
G
I
 
I
A
x
E
T
x
F
A
 
-
R
 
-
A
 
-
G
 
-
N
 
-
V
 
-
I
 
-
G
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
-
W
 
-
A
 
-
V
|
V
D
 
T
R
 
R
I
x
K
V
 
V
P
 
T
D
 
D
A
 
A
V
 
V
R
 
A
S
 
R
L
 
I
S
 
K
A
 
L
G
 
G
A
 
K
A
 
Q
I
 
Q
A
 
E
V
 
L
R
 
R
-
x
L
-
x
G
N
|
N
S
 
V
H
 
D
S
x
A
T
 
K
R
|
R
P
 
D
W
 
W
Q
 
-
H
 
-
V
 
-
L
 
-
E
 
-
P
 
G
L
 
F
G
 
A
G
 
G
Y
 
D
L
 
Y
L
 
V
L
 
E
A
 
A
Q
 
M
R
 
W
L
 
L
L
 
M
E
 
L
H
 
Q
Q
 
Q
Q
 
D
S
 
K
A
 
A
E
 
D
K
 
-
T
 
-
V
 
-
N
 
-
P
 
-
F
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
F
 
-
N
 
D
F
 
Y
G
 
V
P
 
V
A
 
A
I
 
T
E
 
G
S
 
V
N
 
T
R
 
T
S
 
T
V
 
V
K
 
R
E
 
D
L
 
M
I
 
C
T
 
Q
T
 
I
V
 
A
L
 
F
Q
 
E
H
 
H
W
 
V
P
 
G
G
 
L
Q
 
D
W
 
Y
V
 
R
D
 
D
-
 
F
-
 
L
Q
 
K
S
 
I
D
 
D
P
 
P
T
 
A
-
x
F
-
 
F
A
x
R
P
 
P
H
 
A
E
|
E
A
 
V
G
 
D
L
 
V
L
 
L
H
 
L
L
 
G
V
 
N
S
 
P
D
 
A
Q
 
K
A
 
A
R
 
Q
Q
 
R
L
 
V
L
 
L
G
 
G
W
 
W
Q
 
K
P
 
P
R
 
R
W
 
T
D
 
S
F
 
L
E
 
D
T
 
E
T
 
L
V
 
I
S
 
R
R
 
M
T
 
M
I
 
V
H
 
E

1kewA The crystal structure of dtdp-d-glucose 4,6-dehydratase (rmlb) from salmonella enterica serovar typhimurium with thymidine diphosphate bound (see paper)
24% identity, 91% coverage: 10:345/368 of query aligns to 2:334/361 of 1kewA

query
sites
1kewA
Q
 
K
V
 
I
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
H
 
G
T
 
A
G
|
G
F
|
F
K
x
I
G
 
G
S
 
S
W
 
A
L
 
V
T
 
V
L
 
R
W
 
H
L
 
I
L
 
I
M
 
K
Q
 
N
G
 
T
A
 
Q
D
 
D
V
 
T
W
 
V
G
 
V
Y
 
N
A
 
I
L
x
D
P
x
K
P
x
L
E
x
T
S
 
Y
E
x
A
R
x
G
S
 
N
L
 
L
F
 
E
T
 
S
A
 
L
L
 
S
D
 
D
L
 
I
A
 
S
N
 
E
Q
 
S
R
 
N
Q
 
R
A
 
-
G
 
-
W
 
-
G
 
-
Y
 
-
F
 
Y
Q
 
N
Y
 
F
R
 
E
L
 
H
G
 
A
E
x
D
M
x
I
N
 
C
D
 
D
A
 
S
E
 
A
A
 
E
L
 
I
R
 
T
Q
 
R
W
 
I
V
 
F
E
 
E
Q
 
Q
A
 
Y
Q
 
Q
P
 
P
E
 
D
V
 
A
V
 
V
F
 
M
H
 
H
L
|
L
A
|
A
A
|
A
Q
 
E
P
x
S
L
 
H
V
 
V
R
 
D
R
 
R
S
 
S
Y
 
I
A
 
T
D
 
G
P
 
P
L
 
A
G
 
A
T
 
F
W
 
I
Q
 
E
T
|
T
N
 
N
V
 
I
L
 
V
G
 
G
S
 
T
L
 
Y
Q
 
A
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
V
L
 
A
K
 
R
S
 
K
L
 
Y
-
 
W
-
 
S
-
 
A
-
 
L
-
 
G
-
 
E
-
 
D
-
 
K
Q
 
K
H
 
N
P
 
N
C
 
F
A
 
R
M
 
F
V
 
H
M
 
H
V
x
I
T
x
S
T
|
T
D
|
D
K
x
E
V
 
V
Y
 
Y
-
 
G
-
 
D
-
 
L
-
 
P
-
 
H
-
 
P
-
 
D
-
 
E
-
 
V
E
 
E
N
 
N
R
 
S
E
 
V
W
 
T
V
x
L
Y
 
P
G
x
L
Y
x
F
R
 
T
E
 
E
T
|
T
D
 
T
C
 
A
L
 
Y
G
 
A
G
 
P
H
 
S
D
 
S
P
 
P
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
A
A
 
S
M
 
S
E
 
D
L
 
H
A
 
L
V
 
V
A
 
R
S
 
A
W
 
W
R
 
R
S
 
R
S
 
T
F
 
Y
-
 
G
-
 
L
-
 
P
-
 
T
-
 
I
-
 
V
-
 
T
-
 
N
C
|
C
G
 
S
D
x
N
A
 
-
A
 
-
H
x
N
Q
 
Y
T
 
G
P
 
P
Y
 
Y
-
 
H
-
 
F
-
 
P
-
 
E
-
x
K
-
x
L
-
 
I
-
 
P
L
 
L
A
 
V
I
 
I
A
 
L
T
 
N
A
 
A
R
 
L
A
 
E
G
 
G
N
 
K
-
 
P
-
 
L
-
x
P
V
 
I
I
x
Y
G
 
G
G
 
K
G
 
G
D
 
D
W
 
Q
A
 
I
V
x
R
D
 
D
-
 
W
R
 
L
I
 
Y
V
 
V
P
 
E
D
 
D
A
 
H
V
 
A
R
 
R
S
 
A
L
 
L
S
 
H
A
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
I
 
M
A
 
V
V
 
V
R
 
T
N
 
E
S
 
G
H
 
K
S
 
A
T
 
G
R
 
E
P
 
T
W
 
Y
Q
 
N
H
 
-
V
 
-
L
 
-
E
 
-
P
 
-
L
 
I
G
 
G
G
 
G
Y
 
-
L
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
-
E
 
-
H
 
H
Q
 
N
Q
 
E
S
 
K
A
 
K
E
x
N
K
 
L
T
 
D
V
 
V
N
 
-
P
 
V
F
 
F
A
 
T
R
 
I
A
 
C
F
 
D
N
 
L
F
 
L
G
 
D
P
 
E
A
 
I
I
 
V
E
 
P
S
 
K
N
 
A
R
 
T
S
 
S
V
 
Y
K
 
R
E
 
E
L
 
Q
I
 
I
T
 
T
T
 
Y
V
 
V
L
 
A
Q
 
D
H
x
R
W
 
-
P
 
P
G
 
G
Q
x
H
W
 
-
V
 
-
D
 
-
Q
 
-
S
 
-
D
 
D
P
 
R
T
 
R
A
 
Y
P
 
A
H
 
I
E
 
D
A
 
A
G
 
G
L
 
K
L
 
I
H
 
-
L
 
-
V
 
-
S
 
-
D
 
-
Q
 
-
A
 
S
R
 
R
Q
 
E
L
 
-
L
 
L
G
 
G
W
 
W
Q
 
K
P
 
P
R
 
L
W
 
E
D
 
T
F
 
F
E
 
E
T
 
S
T
 
G
V
 
I
S
 
R
R
 
K
T
 
T
I
 
V
H
 
E
W
 
W
Y
 
Y

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>Synpcc7942_0061 FitnessBrowser__SynE:Synpcc7942_0061
MNSSFWRDRQVLITGHTGFKGSWLTLWLLMQGADVWGYALPPESERSLFTALDLANQRQA
GWGYFQYRLGEMNDAEALRQWVEQAQPEVVFHLAAQPLVRRSYADPLGTWQTNVLGSLQL
LEALKSLQHPCAMVMVTTDKVYENREWVYGYRETDCLGGHDPYSASKAAMELAVASWRSS
FCGDAAHQTPYLAIATARAGNVIGGGDWAVDRIVPDAVRSLSAGAAIAVRNSHSTRPWQH
VLEPLGGYLLLAQRLLEHQQSAEKTVNPFARAFNFGPAIESNRSVKELITTVLQHWPGQW
VDQSDPTAPHEAGLLHLVSDQARQLLGWQPRWDFETTVSRTIHWYRPVMMTGGSALEACL
EDLATYGQ

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory