SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Synpcc7942_1490 FitnessBrowser__SynE:Synpcc7942_1490 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2i4bA Crystal structure of bicarbonate transport protein cmpa from synechocystis sp. Pcc 6803 in complex with bicarbonate and calcium (see paper)
30% identity, 56% coverage: 277:645/663 of query aligns to 6:400/401 of 2i4bA

query
sites
2i4bA
E
 
E
K
 
T
V
 
A
N
 
N
L
 
I
E
 
K
I
 
L
G
 
G
Y
 
Y
V
 
I
P
 
P
L
x
I
M
 
V
A
x
E
C
 
A
A
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
I
V
 
I
A
 
A
Q
 
Q
E
 
E
K
 
K
A
 
G
F
 
F
F
 
F
A
 
A
K
 
K
H
 
Y
G
 
G
L
 
M
D
 
T
E
 
G
V
 
V
S
 
E
L
 
V
V
 
S
R
 
K
E
 
Q
T
 
A
S
 
N
W
|
W
R
 
A
G
 
S
I
 
A
V
 
R
D
 
D
G
 
N
L
 
V
T
 
T
E
 
I
N
 
G
Y
 
S
L
 
Q
D
 
G
A
 
G
A
 
G
-
 
I
-
 
D
-
 
G
-
 
G
-
 
Q
-
 
W
Q
|
Q
M
 
M
P
 
P
A
 
-
G
 
-
M
 
M
P
 
P
V
 
H
W
 
L
M
 
I
S
 
T
V
 
E
G
 
G
G
 
I
-
 
I
Q
 
T
G
 
N
G
 
G
S
 
N
P
 
K
L
 
V
P
 
P
I
 
M
V
 
Y
S
 
V
S
 
L
L
 
A
T
 
Q
M
 
L
S
 
I
R
 
T
N
 
Q
G
 
G
N
|
N
G
 
G
I
 
I
T
 
A
L
 
V
S
 
A
K
 
P
A
 
M
L
 
H
Y
 
E
D
 
G
E
 
K
G
 
G
-
 
V
-
 
N
-
 
L
-
 
D
I
 
I
Q
 
T
T
 
K
V
 
A
D
 
A
D
 
D
F
 
Y
R
 
I
N
 
K
L
 
G
L
 
F
R
 
N
S
 
K
T
 
T
A
 
N
D
 
G
K
 
R
Q
 
K
H
 
F
I
 
K
M
 
A
G
 
A
I
 
H
V
x
T
H
 
F
P
 
P
A
 
N
S
 
V
M
 
N
H
x
Q
N
 
D
L
 
F
L
 
W
L
 
I
R
 
R
Y
 
Y
W
 
W
L
 
F
A
 
A
A
 
A
N
 
G
Q
 
G
I
 
V
D
 
D
P
 
P
D
 
D
R
 
T
D
 
D
V
 
I
Q
 
D
L
 
L
R
 
L
T
 
A
I
 
V
P
 
P
P
 
P
A
 
A
Q
 
E
M
 
T
V
 
V
A
 
Q
D
 
G
L
 
M
K
 
R
D
 
N
G
 
G
T
 
T
I
 
M
D
 
D
G
 
A
Y
 
F
C
 
S
I
 
T
G
 
G
E
 
D
P
 
P
W
 
W
N
 
P
A
 
Y
W
 
R
A
 
I
A
 
V
Q
 
T
K
 
E
E
 
N
I
 
I
G
 
G
F
 
Y
T
 
M
I
 
A
A
 
G
S
 
L
D
 
T
L
 
A
E
 
Q
I
 
I
W
 
W
N
 
P
G
 
Y
H
 
H
P
 
P
G
x
E
K
x
E
V
 
Y
L
 
L
G
 
A
V
 
I
R
 
R
E
 
A
D
 
D
W
 
W
A
 
V
N
 
D
R
 
K
Y
 
N
P
 
P
N
 
K
S
 
A
H
 
T
V
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
L
K
 
K
A
 
G
L
 
I
L
 
M
E
 
E
A
 
A
C
 
Q
Q
 
Q
Y
 
W
C
 
I
E
 
D
D
 
D
P
 
P
A
 
K
N
 
N
W
 
R
D
 
P
E
 
E
L
 
V
R
 
V
E
 
Q
L
 
I
L
 
V
S
 
S
D
 
G
R
 
R
R
 
N
Y
 
Y
L
 
F
S
 
N
C
 
V
P
 
P
K
 
T
E
 
T
Y
 
I
I
 
L
-
 
E
-
 
S
-
 
P
-
 
F
-
 
K
-
 
G
Q
 
Q
F
 
Y
S
 
T
-
 
M
-
 
G
-
 
D
-
 
G
Q
 
Q
S
 
P
T
 
A
A
 
I
D
 
D
D
 
D
L
 
F
A
 
Q
V
 
K
-
 
G
P
 
P
H
 
L
H
 
Y
R
 
W
F
 
K
A
 
D
G
 
G
A
 
I
G
 
G
-
 
N
V
 
V
N
 
S
R
 
Y
P
 
P
S
 
Y
R
 
K
T
 
S
E
 
H
H
 
D
L
 
L
W
 
W
M
 
F
M
 
L
T
 
T
Q
 
E
L
 
S
A
 
I
R
 
R
W
 
W
G
 
G
D
 
-
V
 
-
P
 
-
F
 
F
P
 
H
R
 
K
N
 
N
W
 
A
V
 
I
-
 
P
-
 
D
-
 
L
-
 
D
-
 
T
-
 
A
-
 
Q
E
 
K
I
 
I
L
 
I
E
 
D
R
 
K
V
 
V
C
 
N
R
 
R
V
 
E
G
 
D
V
 
L
F
 
W
S
 
R
T
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
T
E
 
E
L
 
A
G
 
G
L
 
F
S
 
T
E
 
A
V
 
D
V
 
I
N
 
P
Y
 
S
Q
 
S
R
 
T
S
 
S
T
 
R
P
 
G
V
 
V
E
 
E
-
 
T
L
 
F
F
 
F
D
 
D
G
 
G
V
 
I
P
 
T
F
 
F
N
 
D
A
 
P
E
 
A
D
 
N
P
 
P
I
 
S
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
N
 
Q
S
 
S
L
 
L
P
 
A
I
 
I
H
 
K
R
 
K

P73452 Nitrate/nitrite binding protein NrtA from Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa) (see paper)
29% identity, 55% coverage: 277:643/663 of query aligns to 60:441/446 of P73452

query
sites
P73452
E
 
E
K
 
V
V
 
T
N
 
T
L
 
A
E
 
K
I
 
L
G
 
G
Y
 
F
V
 
I
P
 
A
L
 
L
M
 
T
A
 
D
C
 
A
A
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
I
V
 
I
A
 
A
Q
 
K
E
 
E
K
 
K
A
 
G
F
 
F
F
 
Y
A
 
A
K
 
K
H
 
Y
G
 
G
L
 
M
D
 
P
E
 
D
V
 
V
S
 
E
L
 
V
V
 
L
R
 
K
E
 
Q
T
 
A
S
 
S
W
|
W
-
 
G
-
 
T
-
 
T
-
 
R
R
 
D
G
 
N
I
 
L
V
 
V
D
 
L
G
 
G
L
 
S
T
 
A
E
 
S
N
 
G
Y
 
G
L
 
I
D
 
D
A
 
G
A
 
A
Q
 
H
M
 
I
P
 
L
A
 
T
G
 
P
M
 
M
P
 
P
V
 
Y
W
 
L
M
 
I
S
 
T
V
 
M
G
 
G
G
 
T
-
 
V
Q
 
T
G
 
D
G
 
G
S
 
K
P
 
P
L
 
T
P
 
P
I
 
M
V
 
Y
S
 
I
S
 
L
L
 
A
T
 
R
M
 
L
S
 
N
R
 
V
N
 
N
G
 
G
N
x
Q
G
 
G
I
 
I
T
 
Q
L
 
L
S
 
G
K
 
N
A
 
N
L
 
Y
Y
 
K
D
 
D
E
 
L
G
 
K
I
 
V
Q
 
G
T
 
T
-
 
D
V
 
A
D
 
A
D
 
P
F
 
L
R
 
K
N
 
E
L
 
A
L
 
F
R
 
A
S
 
K
T
 
V
A
 
T
D
 
D
K
 
P
Q
 
K
H
 
-
I
 
-
M
 
V
G
 
A
I
 
M
V
 
T
H
 
F
P
 
P
A
 
G
S
 
G
M
 
T
H
|
H
N
 
D
L
 
M
L
 
W
L
 
I
R
 
R
Y
 
Y
W
 
W
L
 
L
A
 
A
A
 
A
N
 
G
Q
 
G
I
 
M
D
 
E
P
 
P
D
 
G
R
 
K
D
 
D
V
 
F
Q
 
S
L
 
T
R
 
I
T
 
V
I
 
V
P
 
P
P
 
P
A
 
A
Q
 
Q
M
 
M
V
 
V
A
 
A
D
 
N
L
 
V
K
 
K
D
 
V
G
 
N
T
 
A
I
 
M
D
 
E
G
 
S
Y
 
F
C
 
C
I
 
V
G
|
G
E
 
E
P
 
P
W
 
W
N
 
P
A
 
L
W
 
Q
A
 
T
A
 
V
Q
 
N
K
 
Q
E
 
G
I
 
V
G
 
G
F
 
Y
T
 
Q
I
 
A
A
 
L
S
 
T
D
 
T
L
 
G
E
 
Q
I
 
L
W
 
W
N
 
K
G
 
D
H
 
H
P
 
P
G
 
E
K
|
K
V
 
A
L
 
F
G
 
G
V
 
M
R
 
R
E
 
A
D
 
D
W
 
W
A
 
V
N
 
D
R
 
Q
Y
 
N
P
 
P
N
 
K
S
 
A
H
 
A
V
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
L
K
 
M
A
 
A
L
 
V
L
 
M
E
 
E
A
 
A
C
 
Q
Q
 
Q
Y
 
W
C
 
C
E
 
D
D
 
Q
P
 
A
A
 
E
N
 
N
W
 
K
D
 
E
E
 
E
L
 
M
R
 
C
E
 
Q
L
 
I
L
 
L
S
 
S
D
 
K
R
 
R
R
 
E
Y
 
W
L
 
F
S
 
K
C
 
V
P
 
P
K
 
F
E
 
E
Y
 
D
I
 
I
-
 
I
-
 
D
-
 
R
-
 
S
-
 
K
-
 
G
-
 
I
-
 
Y
Q
 
N
F
 
F
-
 
G
-
 
N
S
 
G
Q
 
Q
S
 
E
T
 
T
A
 
F
D
 
E
D
 
D
L
 
Q
A
 
E
V
 
I
P
 
-
H
 
M
H
 
Q
R
 
K
F
 
Y
A
 
W
G
 
V
A
 
D
G
 
N
V
 
A
N
 
S
R
 
Y
P
 
P
S
 
Y
R
 
K
T
 
S
E
 
H
H
 
D
L
 
Q
W
 
W
M
 
F
M
 
L
T
 
T
Q
 
E
L
 
N
A
 
I
R
 
R
W
 
W
G
 
G
D
 
Y
V
 
L
P
 
P
F
 
A
P
 
S
R
 
T
N
 
D
W
 
T
V
 
K
E
 
A
I
 
I
L
 
V
E
 
D
R
 
K
V
 
V
C
 
N
R
 
R
V
 
E
G
 
D
V
 
L
F
 
W
S
 
R
T
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
Q
E
 
A
L
 
L
G
 
E
L
 
V
-
 
P
S
 
A
E
 
D
V
 
Q
V
 
I
N
 
P
Y
 
S
Q
 
S
R
 
P
S
 
S
T
 
R
P
 
G
V
 
I
E
 
E
-
 
T
L
 
F
F
 
F
D
 
D
G
 
G
V
 
I
P
 
T
F
 
F
N
 
D
A
 
P
E
 
E
D
 
N
P
 
P
I
 
Q
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
N
 
D
S
 
S
L
 
L
P
 
K
I
 
I

2g29A Crystal structure of the periplasmic nitrate-binding protein nrta from synechocystis pcc 6803 (see paper)
29% identity, 55% coverage: 277:643/663 of query aligns to 4:385/385 of 2g29A

query
sites
2g29A
E
 
E
K
 
V
V
 
T
N
 
T
L
 
A
E
 
K
I
 
L
G
 
G
Y
 
F
V
 
I
P
 
A
L
|
L
M
 
T
A
 
D
C
 
A
A
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
I
V
 
I
A
 
A
Q
 
K
E
 
E
K
 
K
A
 
G
F
 
F
F
 
Y
A
 
A
K
 
K
H
 
Y
G
 
G
L
 
M
D
 
P
E
 
D
V
 
V
S
 
E
L
 
V
V
 
L
R
 
K
E
 
Q
T
 
A
S
 
S
W
|
W
-
 
G
-
 
T
-
 
T
-
 
R
R
 
D
G
 
N
I
 
L
V
 
V
D
 
L
G
 
G
L
 
S
T
 
A
E
 
S
N
 
G
Y
 
G
L
 
I
D
 
D
A
 
G
A
 
A
Q
 
H
M
 
I
P
 
L
A
 
T
G
 
P
M
 
M
P
 
P
V
 
Y
W
 
L
M
 
I
S
 
T
V
 
M
G
 
G
G
 
T
-
 
V
Q
 
T
G
 
D
G
 
G
S
 
K
P
 
P
L
 
T
P
 
P
I
 
M
V
 
Y
S
 
I
S
 
L
L
 
A
T
 
R
M
 
L
S
 
N
R
 
V
N
 
N
G
 
G
N
 
Q
G
 
G
I
 
I
T
 
Q
L
 
L
S
 
G
K
 
N
A
 
N
L
 
Y
Y
 
K
D
 
D
E
 
L
G
 
K
I
 
V
Q
 
G
T
 
T
-
 
D
V
 
A
D
 
A
D
 
P
F
 
L
R
 
K
N
 
E
L
 
A
L
 
F
R
 
A
S
 
K
T
 
V
A
 
T
D
 
D
K
 
P
Q
 
K
H
 
-
I
 
-
M
 
V
G
 
A
I
 
M
V
 
T
H
 
F
P
 
P
A
 
G
S
 
G
M
 
T
H
|
H
N
 
D
L
 
M
L
 
W
L
 
I
R
 
R
Y
 
Y
W
 
W
L
 
L
A
 
A
A
 
A
N
 
G
Q
 
G
I
 
M
D
 
E
P
 
P
D
 
G
R
 
K
D
 
D
V
 
F
Q
 
S
L
 
T
R
 
I
T
 
V
I
 
V
P
 
P
P
|
P
A
 
A
Q
 
Q
M
 
M
V
 
V
A
 
A
D
 
N
L
 
V
K
 
K
D
 
V
G
 
N
T
 
A
I
 
M
D
 
E
G
 
S
Y
 
F
C
 
C
I
x
V
G
|
G
E
 
E
P
 
P
W
 
W
N
 
P
A
 
L
W
 
Q
A
 
T
A
 
V
Q
 
N
K
 
Q
E
 
G
I
 
V
G
 
G
F
 
Y
T
 
Q
I
 
A
A
 
L
S
 
T
D
 
T
L
 
G
E
 
Q
I
 
L
W
 
W
N
 
K
G
 
D
H
 
H
P
 
P
G
 
E
K
|
K
V
 
A
L
 
F
G
 
G
V
 
M
R
 
R
E
 
A
D
 
D
W
 
W
A
 
V
N
 
D
R
 
Q
Y
 
N
P
 
P
N
 
K
S
 
A
H
 
A
V
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
L
K
 
M
A
 
A
L
 
V
L
 
M
E
 
E
A
 
A
C
 
Q
Q
 
Q
Y
 
W
C
 
C
E
 
D
D
 
Q
P
 
A
A
 
E
N
 
N
W
 
K
D
 
E
E
 
E
L
 
M
R
 
C
E
 
Q
L
 
I
L
 
L
S
 
S
D
 
K
R
 
R
R
 
E
Y
 
W
L
 
F
S
 
K
C
 
V
P
 
P
K
 
F
E
 
E
Y
 
D
I
 
I
-
 
I
-
 
D
-
 
R
-
 
S
-
 
K
-
 
G
-
 
I
-
 
Y
Q
 
N
F
 
F
-
 
G
-
 
N
S
 
G
Q
 
Q
S
 
E
T
 
T
A
 
F
D
 
E
D
 
D
L
 
Q
A
 
E
V
 
I
P
 
-
H
 
M
H
 
Q
R
 
K
F
 
Y
A
 
W
G
 
V
A
 
D
G
 
N
V
 
A
N
 
S
R
 
Y
P
 
P
S
 
Y
R
 
K
T
 
S
E
 
H
H
 
D
L
 
Q
W
 
W
M
 
F
M
 
L
T
 
T
Q
 
E
L
 
N
A
 
I
R
 
R
W
 
W
G
 
G
D
 
Y
V
 
L
P
 
P
F
 
A
P
 
S
R
 
T
N
 
D
W
 
T
V
 
K
E
 
A
I
 
I
L
 
V
E
 
D
R
 
K
V
 
V
C
 
N
R
 
R
V
 
E
G
 
D
V
 
L
F
 
W
S
 
R
T
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
Q
E
 
A
L
 
L
G
 
E
L
 
V
-
 
P
S
 
A
E
 
D
V
 
Q
V
 
I
N
 
P
Y
 
S
Q
 
S
R
 
P
S
 
S
T
 
R
P
 
G
V
 
I
E
 
E
-
 
T
L
 
F
F
 
F
D
 
D
G
 
G
V
 
I
P
 
T
F
 
F
N
 
D
A
 
P
E
 
E
D
 
N
P
 
P
I
 
Q
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
N
 
D
S
 
S
L
 
L
P
 
K
I
 
I

8hprD Lpqy-sugabc in state 4 (see paper)
40% identity, 33% coverage: 5:221/663 of query aligns to 3:216/362 of 8hprD

query
sites
8hprD
V
 
I
A
 
V
V
 
L
E
 
D
N
 
R
I
 
V
E
 
T
K
 
K
S
 
S
F
x
Y
P
 
P
L
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
-
N
 
D
E
 
V
Y
 
R
L
 
A
A
 
A
L
 
V
K
 
K
G
 
E
I
 
F
D
 
S
L
 
M
E
 
T
I
 
I
K
 
A
Q
 
D
G
 
G
E
 
E
F
 
F
I
 
I
S
 
I
L
 
L
I
 
V
G
 
G
H
 
P
S
|
S
G
 
G
C
|
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
T
L
 
L
N
 
N
L
 
M
I
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
E
L
 
E
P
 
I
T
 
T
D
 
S
G
 
G
A
 
E
V
 
L
S
 
R
L
 
I
E
 
G
G
 
G
Q
 
E
Q
 
R
I
 
V
T
 
N
A
 
E
P
 
K
G
 
A
P
 
P
-
 
K
-
 
D
-
 
R
D
 
D
R
 
I
M
 
A
V
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
|
Q
N
 
S
Y
 
Y
S
 
A
L
 
L
F
 
Y
P
 
P
W
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
R
 
R
E
 
Q
N
 
N
I
 
I
A
 
A
L
 
F
A
 
P
V
 
L
D
 
-
E
 
-
V
 
T
L
 
L
R
 
A
D
 
K
L
 
V
P
 
P
K
 
K
E
 
A
E
 
E
R
 
I
Q
 
A
A
 
A
I
 
K
V
 
V
E
 
E
E
 
E
H
 
T
I
 
A
Q
 
K
L
 
I
V
 
L
G
 
D
L
 
L
G
 
S
H
 
E
A
 
L
A
 
L
D
 
D
K
x
R
P
 
K
P
 
P
A
 
G
Q
|
Q
L
 
L
S
|
S
G
|
G
G
|
G
M
 
Q
K
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
M
A
 
G
R
 
R
G
 
A
L
 
I
A
 
V
T
 
R
R
 
S
P
 
P
K
 
K
L
 
A
L
 
F
L
 
L
L
 
M
D
 
D
E
x
Q
P
 
P
F
 
L
G
 
S
A
 
N
L
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
K
T
 
L
R
 
R
G
 
V
N
 
Q
L
 
M
Q
 
R
E
 
A
K
 
E
L
 
I
M
 
S
Q
 
R
I
 
L
C
 
Q
E
 
D
E
 
R
N
 
L
H
 
G
V
 
T
T
 
T
A
 
T
V
 
V
M
 
Y
V
 
V
T
 
T
H
|
H
D
 
D
V
 
Q
D
 
T
E
 
E
A
 
A
V
 
M
L
 
T
L
 
L
S
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
V
V
 
V
M
 
V
L
 
M
T
 
L
N
 
A
G
 
G
P
 
E
G
 
V
S
 
Q
K
 
Q
I
 
I
G
 
G

8hprC Lpqy-sugabc in state 4 (see paper)
40% identity, 33% coverage: 5:221/663 of query aligns to 3:216/363 of 8hprC

query
sites
8hprC
V
 
I
A
 
V
V
 
L
E
 
D
N
 
R
I
 
V
E
 
T
K
 
K
S
 
S
F
x
Y
P
 
P
L
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
-
N
 
D
E
 
V
Y
 
R
L
 
A
A
 
A
L
 
V
K
 
K
G
 
E
I
 
F
D
 
S
L
 
M
E
 
T
I
 
I
K
 
A
Q
 
D
G
 
G
E
 
E
F
 
F
I
 
I
S
 
I
L
 
L
I
 
V
G
 
G
H
 
P
S
|
S
G
|
G
C
 
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
 
T
L
 
T
L
 
L
N
 
N
L
 
M
I
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
E
L
 
E
P
 
I
T
 
T
D
 
S
G
 
G
A
 
E
V
 
L
S
 
R
L
 
I
E
 
G
G
 
G
Q
 
E
Q
 
R
I
 
V
T
 
N
A
 
E
P
 
K
G
 
A
P
 
P
-
 
K
-
 
D
-
 
R
D
 
D
R
 
I
M
 
A
V
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
|
Q
N
 
S
Y
 
Y
S
 
A
L
 
L
F
 
Y
P
 
P
W
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
R
 
R
E
 
Q
N
 
N
I
 
I
A
 
A
L
 
F
A
 
P
V
 
L
D
 
-
E
 
-
V
 
T
L
 
L
R
 
A
D
 
K
L
 
V
P
 
P
K
 
K
E
 
A
E
 
E
R
 
I
Q
 
A
A
 
A
I
 
K
V
 
V
E
 
E
E
 
E
H
 
T
I
 
A
Q
 
K
L
 
I
V
 
L
G
 
D
L
 
L
G
 
S
H
 
E
A
 
L
A
 
L
D
 
D
K
 
R
P
 
K
P
 
P
A
 
G
Q
|
Q
L
 
L
S
 
S
G
|
G
G
|
G
M
x
Q
K
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
M
A
 
G
R
 
R
G
 
A
L
 
I
A
 
V
T
 
R
R
 
S
P
 
P
K
 
K
L
 
A
L
 
F
L
 
L
L
 
M
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
F
 
L
G
 
S
A
 
N
L
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
K
T
 
L
R
 
R
G
 
V
N
 
Q
L
 
M
Q
 
R
E
 
A
K
 
E
L
 
I
M
 
S
Q
 
R
I
 
L
C
 
Q
E
 
D
E
 
R
N
 
L
H
 
G
V
 
T
T
 
T
A
 
T
V
 
V
M
 
Y
V
 
V
T
 
T
H
|
H
D
 
D
V
 
Q
D
 
T
E
 
E
A
 
A
V
 
M
L
 
T
L
 
L
S
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
V
V
 
V
M
 
V
L
 
M
T
 
L
N
 
A
G
 
G
P
 
E
G
 
V
S
 
Q
K
 
Q
I
 
I
G
 
G

8hplC Lpqy-sugabc in state 1 (see paper)
40% identity, 33% coverage: 5:221/663 of query aligns to 3:214/384 of 8hplC

query
sites
8hplC
V
 
I
A
 
V
V
 
L
E
 
D
N
 
R
I
 
V
E
 
T
K
 
K
S
 
S
F
x
Y
P
 
P
L
 
R
S
 
A
G
 
-
G
 
-
N
 
-
E
 
-
Y
 
-
L
 
-
A
 
A
L
 
V
K
 
K
G
 
E
I
 
F
D
 
S
L
 
M
E
 
T
I
 
I
K
 
A
Q
 
D
G
 
G
E
 
E
F
 
F
I
 
I
S
 
I
L
 
L
I
 
V
G
 
G
H
 
P
S
 
S
G
|
G
C
|
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
T
L
 
L
N
 
N
L
 
M
I
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
E
L
 
E
P
 
I
T
 
T
D
 
S
G
 
G
A
 
E
V
 
L
S
 
R
L
 
I
E
 
G
G
 
G
Q
 
E
Q
 
R
I
 
V
T
 
N
A
 
E
P
 
K
G
 
A
P
 
P
-
 
K
-
 
D
-
 
R
D
 
D
R
 
I
M
 
A
V
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
S
Y
 
Y
S
 
A
L
 
L
F
 
Y
P
 
P
W
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
R
 
R
E
 
Q
N
 
N
I
 
I
A
 
A
L
 
F
A
 
P
V
 
L
D
 
-
E
 
-
V
 
T
L
 
L
R
 
A
D
 
K
L
 
V
P
 
P
K
 
K
E
 
A
E
 
E
R
 
I
Q
 
A
A
 
A
I
 
K
V
 
V
E
 
E
E
 
E
H
 
T
I
 
A
Q
 
K
L
 
I
V
 
L
G
 
D
L
 
L
G
 
S
H
 
E
A
 
L
A
 
L
D
 
D
K
 
R
P
 
K
P
 
P
A
 
G
Q
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
Q
K
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
M
A
 
G
R
 
R
G
 
A
L
 
I
A
 
V
T
 
R
R
 
S
P
 
P
K
 
K
L
 
A
L
 
F
L
 
L
L
 
M
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
F
 
L
G
 
S
A
 
N
L
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
K
T
 
L
R
 
R
G
 
V
N
 
Q
L
 
M
Q
 
R
E
 
A
K
 
E
L
 
I
M
 
S
Q
 
R
I
 
L
C
 
Q
E
 
D
E
 
R
N
 
L
H
 
G
V
 
T
T
 
T
A
 
T
V
 
V
M
 
Y
V
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
D
V
 
Q
D
 
T
E
 
E
A
 
A
V
 
M
L
 
T
L
 
L
S
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
V
V
 
V
M
 
V
L
 
M
T
 
L
N
 
A
G
 
G
P
 
E
G
 
V
S
 
Q
K
 
Q
I
 
I
G
 
G

2d62A Crystal structure of multiple sugar binding transport atp- binding protein
41% identity, 30% coverage: 24:221/663 of query aligns to 21:225/375 of 2d62A

query
sites
2d62A
A
 
A
L
 
V
K
 
K
G
 
D
I
 
L
D
 
S
L
 
L
E
 
E
I
 
I
K
 
K
Q
 
D
G
 
G
E
 
E
F
 
F
I
 
L
S
 
V
L
 
L
I
 
L
G
 
G
H
 
P
S
 
S
G
|
G
C
|
C
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
T
L
 
L
N
 
R
L
 
M
I
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
E
L
 
E
P
 
P
T
 
T
D
 
R
G
 
G
A
 
Q
V
 
I
S
 
Y
L
 
I
E
 
E
G
 
D
Q
 
N
Q
 
L
I
 
V
T
 
A
A
 
D
P
 
P
G
 
E
P
 
K
-
 
G
-
 
V
-
 
F
-
 
V
-
 
P
-
 
P
-
 
K
-
 
E
-
 
R
D
 
D
R
 
V
M
 
A
V
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
S
Y
 
Y
S
 
A
L
 
L
F
 
Y
P
 
P
W
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
R
 
Y
E
 
D
N
 
N
I
 
I
A
 
A
L
 
F
A
 
P
V
 
L
D
 
K
E
 
-
V
 
-
L
 
L
R
 
R
D
 
K
L
 
V
P
 
P
K
 
K
E
 
Q
E
 
E
R
 
I
Q
 
D
A
 
K
I
 
R
V
 
V
E
 
R
E
 
E
H
 
V
I
 
A
Q
 
E
L
 
M
V
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
T
H
 
E
A
 
L
A
 
L
D
 
N
K
 
R
P
 
K
P
 
P
A
 
R
Q
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
Q
K
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
L
A
 
G
R
 
R
G
 
A
L
 
I
A
 
I
T
 
R
R
 
R
P
 
P
K
 
K
L
 
V
L
 
F
L
 
L
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
F
 
L
G
 
S
A
 
N
L
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
K
T
 
L
R
 
R
G
 
V
N
 
K
L
 
M
Q
 
R
E
 
A
K
 
E
L
 
L
M
 
K
Q
 
K
I
 
L
C
 
Q
E
 
R
E
 
Q
N
 
L
H
 
G
V
 
V
T
 
T
A
 
T
V
 
I
M
 
Y
V
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
D
V
 
Q
D
 
V
E
 
E
A
 
A
V
 
M
L
 
T
L
 
M
S
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
I
V
 
A
M
 
V
L
 
M
T
 
N
N
 
K
G
 
G
P
 
E
G
 
L
S
 
Q
K
 
Q
I
 
V
G
 
G

P69874 Spermidine/putrescine import ATP-binding protein PotA; EC 7.6.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
43% identity, 32% coverage: 1:215/663 of query aligns to 14:224/378 of P69874

query
sites
P69874
M
 
L
S
 
S
L
 
P
F
 
L
V
 
V
A
 
Q
V
 
L
E
 
A
N
 
G
I
 
I
E
 
R
K
 
K
S
x
C
F
|
F
P
 
-
L
 
-
S
 
-
G
 
D
G
 
G
N
 
K
E
 
E
Y
 
-
L
 
-
A
 
V
L
 
I
K
 
P
G
 
Q
I
 
L
D
 
D
L
 
L
E
 
T
I
 
I
K
 
N
Q
 
N
G
 
G
E
 
E
F
|
F
I
 
L
S
 
T
L
 
L
I
 
L
G
 
G
H
 
P
S
 
S
G
 
G
C
|
C
G
 
G
K
 
K
S
 
T
T
 
T
L
 
V
L
|
L
N
 
R
L
 
L
I
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
E
L
 
T
P
 
V
T
 
D
D
 
S
G
 
G
A
 
R
V
 
I
S
 
M
L
|
L
E
 
D
G
 
N
Q
 
E
Q
 
D
I
 
I
T
 
T
-
 
H
A
 
V
P
 
P
G
 
A
P
 
E
D
 
N
R
 
R
M
 
Y
V
 
V
-
 
N
-
 
T
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
S
Y
 
Y
S
 
A
L
 
L
F
 
F
P
 
P
W
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
R
 
F
E
 
E
N
 
N
I
 
V
A
 
A
L
 
F
A
 
G
V
 
L
D
 
R
E
 
-
V
 
-
L
 
M
R
 
Q
D
 
K
L
 
T
P
 
P
K
 
A
E
 
A
E
 
E
R
 
I
Q
 
T
A
 
P
I
 
R
V
 
V
E
 
M
E
 
E
H
 
A
I
 
L
Q
 
R
L
 
M
V
|
V
G
 
Q
L
 
L
G
 
E
H
 
T
A
 
F
A
 
A
D
 
Q
K
 
R
P
 
K
P
 
P
A
 
H
Q
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
Q
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
G
 
A
L
 
V
A
 
V
T
 
N
R
 
K
P
 
P
K
 
R
L
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
|
D
E
 
E
P
 
S
F
 
L
G
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
Y
L
 
K
T
 
L
R
 
R
G
 
K
N
 
Q
L
 
M
Q
 
Q
E
 
N
K
 
E
L
 
L
M
 
K
Q
 
A
I
 
L
C
 
Q
E
 
R
E
 
K
N
 
L
H
 
G
V
 
I
T
 
T
A
 
F
V
 
V
M
 
F
V
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
D
V
 
Q
D
 
E
E
 
E
A
 
A
V
 
L
L
 
T
L
 
M
S
 
S
D
 
D
R
 
R
I
 
I
V
 
V
M
 
V
L
 
M
T
 
R
N
 
D
G
 
G

Sites not aligning to the query:

P9WQI3 Trehalose import ATP-binding protein SugC; MtbSugC; Nucleotide-binding domain of SugABC transporter; NBD of SugABC transporter; SugABC transporter ATPase SugC; EC 7.5.2.- from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
38% identity, 33% coverage: 5:221/663 of query aligns to 4:217/393 of P9WQI3

query
sites
P9WQI3
V
 
I
A
 
V
V
 
L
E
 
D
N
 
H
I
 
V
E
 
N
K
 
K
S
 
S
F
 
Y
P
 
P
L
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
-
N
 
D
E
 
G
Y
 
H
L
 
T
A
 
A
L
 
V
K
 
R
G
 
D
I
 
L
D
 
N
L
 
L
E
 
T
I
 
I
K
 
A
Q
 
D
G
 
G
E
 
E
F
 
F
I
 
L
S
 
I
L
 
L
I
 
V
G
 
G
H
 
P
S
 
S
G
 
G
C
 
C
G
 
G
K
 
K
S
 
T
T
 
T
L
 
T
L
 
L
N
 
N
L
 
M
I
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
E
L
 
D
P
 
I
T
 
S
D
 
S
G
 
G
A
 
E
V
 
L
S
 
R
L
 
I
E
 
A
G
 
G
Q
 
E
Q
 
R
I
 
V
T
 
N
A
 
E
P
 
K
G
 
A
P
 
P
-
 
K
-
 
D
-
 
R
D
 
D
R
 
I
M
 
A
V
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
S
Y
 
Y
S
 
A
L
 
L
F
 
Y
P
 
P
W
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
R
 
R
E
 
Q
N
 
N
I
 
I
A
 
A
L
 
F
A
 
P
V
 
L
D
 
-
E
 
-
V
 
T
L
 
L
R
 
A
D
 
K
L
 
M
P
 
R
K
 
K
E
 
A
E
 
D
R
 
I
Q
 
A
A
 
Q
I
 
K
V
 
V
E
 
S
E
 
E
H
 
T
I
 
A
Q
 
K
L
 
I
V
 
L
G
 
D
L
 
L
G
 
T
H
 
N
A
 
L
A
 
L
D
 
D
K
 
R
P
 
K
P
 
P
A
 
S
Q
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
Q
K
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
M
A
 
G
R
 
R
G
 
A
L
 
I
A
 
V
T
 
R
R
 
H
P
 
P
K
 
K
L
 
A
L
 
F
L
 
L
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
F
 
L
G
 
S
A
 
N
L
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
K
T
 
L
R
 
R
G
 
V
N
 
Q
L
 
M
Q
 
R
E
 
G
K
 
E
L
 
I
M
 
A
Q
 
Q
I
 
L
C
 
Q
E
 
R
E
 
R
N
 
L
H
 
G
V
 
T
T
 
T
A
 
T
V
 
V
M
 
Y
V
 
V
T
 
T
H
|
H
D
 
D
V
 
Q
D
 
T
E
 
E
A
 
A
V
 
M
L
 
T
L
 
L
S
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
V
V
 
V
M
 
V
L
 
M
T
 
Y
N
 
G
G
 
G
P
 
I
G
 
A
S
 
Q
K
 
Q
I
 
I
G
 
G

1g291 Malk (see paper)
39% identity, 31% coverage: 20:226/663 of query aligns to 14:227/372 of 1g291

query
sites
1g291
N
 
G
E
 
E
Y
 
V
L
 
T
A
 
A
L
 
V
K
 
R
G
 
E
I
 
M
D
 
S
L
 
L
E
 
E
I
 
V
K
 
K
Q
 
D
G
 
G
E
 
E
F
 
F
I
 
M
S
 
I
L
 
L
I
 
L
G
 
G
H
 
P
S
|
S
G
|
G
C
|
C
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
T
L
 
L
N
 
R
L
 
M
I
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
E
L
 
E
P
 
P
T
 
S
D
 
R
G
 
G
A
 
Q
V
 
I
S
 
Y
L
 
I
E
 
-
G
 
G
Q
 
D
Q
 
K
I
 
L
T
 
V
A
 
A
-
x
D
-
 
P
-
x
E
-
x
K
-
 
G
-
 
I
-
 
F
-
 
V
P
 
P
G
 
P
P
x
K
D
|
D
R
 
R
-
 
D
-
 
I
M
 
A
V
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
S
Y
 
Y
S
 
A
L
 
L
F
 
Y
P
 
P
W
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
R
 
Y
E
 
D
N
 
N
I
 
I
A
 
A
L
 
F
A
 
P
V
 
L
D
 
K
E
 
-
V
 
-
L
 
L
R
 
R
D
 
K
L
 
V
P
 
P
K
 
R
E
 
Q
E
 
E
R
 
I
Q
 
D
A
 
Q
I
 
R
V
 
V
E
 
R
E
 
E
H
 
V
I
 
A
Q
 
E
L
 
L
V
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
T
H
 
E
A
 
L
A
 
L
D
 
N
K
 
R
P
 
K
P
 
P
A
 
R
Q
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
Q
K
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
L
A
 
G
R
 
R
G
 
A
L
 
I
A
 
V
T
 
R
R
 
K
P
 
P
K
 
Q
L
 
V
L
 
F
L
 
L
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
F
 
L
G
 
S
A
 
N
L
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
K
T
 
L
R
 
R
G
 
V
N
 
R
L
 
M
Q
 
R
E
 
A
K
 
E
L
 
L
M
 
K
Q
 
K
I
 
L
C
 
Q
E
 
R
E
 
Q
N
 
L
H
 
G
V
 
V
T
 
T
A
 
T
V
 
I
M
 
Y
V
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
D
V
 
Q
D
 
V
E
 
E
A
 
A
V
 
M
L
 
T
L
 
M
S
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
I
V
 
A
M
 
V
L
 
M
T
 
N
N
 
R
G
 
G
P
 
V
G
 
L
S
 
Q
K
 
Q
I
 
V
G
 
G
G
 
S
I
 
P
L
 
D
E
 
E
V
 
V

Sites not aligning to the query:

7ahhC Opua inhibited inward-facing, sbd docked (see paper)
38% identity, 29% coverage: 29:221/663 of query aligns to 46:245/382 of 7ahhC

query
sites
7ahhC
D
 
N
L
 
F
E
 
E
I
 
I
K
 
N
Q
 
E
G
 
G
E
 
E
F
 
I
I
 
F
S
 
V
L
 
I
I
 
M
G
 
G
H
 
L
S
 
S
G
|
G
C
 
S
G
|
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
L
 
L
N
 
R
L
 
L
I
 
L
A
 
N
G
 
R
L
 
L
E
 
I
L
 
E
P
 
P
T
 
T
D
 
S
G
 
G
A
 
K
V
 
I
S
 
F
L
 
I
E
 
D
G
 
N
Q
 
Q
Q
 
D
I
 
V
T
 
A
A
 
T
P
 
L
G
 
N
P
 
K
D
 
E
R
 
D
M
 
L
V
 
L
-
 
Q
-
 
V
-
 
R
-
 
R
-
 
K
-
 
T
-
 
M
-
 
S
-
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
N
Y
 
F
S
 
G
L
 
L
F
 
F
P
 
P
W
 
H
L
 
R
T
 
T
V
 
I
R
 
L
E
 
E
N
 
N
I
 
T
A
 
E
L
 
Y
A
 
G
V
 
L
D
 
E
E
 
-
V
 
-
L
 
V
R
 
Q
D
 
N
L
 
V
P
 
P
K
 
K
E
 
E
E
 
E
R
 
R
Q
 
R
A
 
K
I
 
R
V
 
A
E
 
E
E
 
K
H
 
A
I
 
L
Q
 
D
L
 
N
V
 
A
G
 
N
L
 
L
G
 
L
H
 
D
A
 
F
A
 
K
D
 
D
K
 
Q
P
 
Y
P
 
P
A
 
K
Q
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
M
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
G
I
 
L
A
 
A
R
 
R
G
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
N
R
 
D
P
 
P
K
 
E
L
 
I
L
 
L
L
 
L
L
 
M
D
|
D
E
|
E
P
 
A
F
 
F
G
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
P
L
 
L
T
 
I
R
 
R
G
 
R
N
 
E
L
 
M
Q
 
Q
E
 
D
K
 
E
L
 
L
M
 
L
Q
 
E
I
 
L
C
 
Q
E
 
A
E
 
K
N
 
F
H
 
Q
V
 
K
T
 
T
A
 
I
V
 
I
M
 
F
V
 
V
T
 
S
H
 
H
D
 
D
V
 
L
D
 
N
E
 
E
A
 
A
V
 
L
L
 
R
L
 
I
S
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
I
V
 
A
M
 
I
L
 
M
T
 
K
N
 
D
G
 
G
P
 
K
G
 
I
S
 
M
K
 
Q
I
 
I
G
 
G

Sites not aligning to the query:

7aheC Opua inhibited inward facing (see paper)
38% identity, 29% coverage: 29:221/663 of query aligns to 46:245/382 of 7aheC

query
sites
7aheC
D
 
N
L
 
F
E
 
E
I
 
I
K
 
N
Q
 
E
G
 
G
E
 
E
F
 
I
I
 
F
S
 
V
L
 
I
I
 
M
G
 
G
H
 
L
S
 
S
G
 
G
C
 
S
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
L
 
L
N
 
R
L
 
L
I
 
L
A
 
N
G
 
R
L
 
L
E
 
I
L
 
E
P
 
P
T
 
T
D
 
S
G
 
G
A
 
K
V
 
I
S
 
F
L
 
I
E
 
D
G
 
N
Q
 
Q
Q
 
D
I
 
V
T
 
A
A
 
T
P
 
L
G
 
N
P
 
K
D
 
E
R
 
D
M
 
L
V
 
L
-
 
Q
-
 
V
-
 
R
-
 
R
-
 
K
-
 
T
-
 
M
-
 
S
-
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
N
Y
 
F
S
 
G
L
 
L
F
 
F
P
 
P
W
 
H
L
 
R
T
 
T
V
 
I
R
 
L
E
 
E
N
 
N
I
 
T
A
 
E
L
 
Y
A
 
G
V
 
L
D
 
E
E
 
-
V
 
-
L
 
V
R
 
Q
D
 
N
L
 
V
P
 
P
K
 
K
E
 
E
E
 
E
R
 
R
Q
 
R
A
 
K
I
 
R
V
 
A
E
 
E
E
 
K
H
 
A
I
 
L
Q
 
D
L
 
N
V
 
A
G
 
N
L
 
L
G
 
L
H
 
D
A
 
F
A
 
K
D
 
D
K
 
Q
P
 
Y
P
 
P
A
 
K
Q
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
M
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
G
I
 
L
A
 
A
R
 
R
G
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
N
R
 
D
P
 
P
K
 
E
L
 
I
L
 
L
L
 
L
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
A
F
 
F
G
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
P
L
 
L
T
 
I
R
 
R
G
 
R
N
 
E
L
 
M
Q
 
Q
E
 
D
K
 
E
L
 
L
M
 
L
Q
 
E
I
 
L
C
 
Q
E
 
A
E
 
K
N
 
F
H
 
Q
V
 
K
T
 
T
A
 
I
V
 
I
M
 
F
V
 
V
T
 
S
H
 
H
D
 
D
V
 
L
D
 
N
E
 
E
A
 
A
V
 
L
L
 
R
L
 
I
S
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
I
V
 
A
M
 
I
L
 
M
T
 
K
N
 
D
G
 
G
P
 
K
G
 
I
S
 
M
K
 
Q
I
 
I
G
 
G

Sites not aligning to the query:

1vciA Crystal structure of the atp-binding cassette of multisugar transporter from pyrococcus horikoshii ot3 complexed with atp (see paper)
40% identity, 33% coverage: 5:226/663 of query aligns to 7:216/353 of 1vciA

query
sites
1vciA
V
 
V
A
 
K
V
 
L
E
 
E
N
 
N
I
 
L
E
 
T
K
 
K
S
 
R
F
|
F
P
 
-
L
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
G
N
 
N
E
 
-
Y
x
F
L
 
T
A
 
A
L
 
V
K
 
N
G
 
K
I
 
L
D
 
N
L
 
L
E
 
T
I
 
I
K
 
K
Q
 
D
G
 
G
E
 
E
F
 
F
I
 
L
S
 
V
L
 
L
I
 
L
G
 
G
H
 
P
S
|
S
G
|
G
C
 
C
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
T
L
 
L
N
 
R
L
 
M
I
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
E
L
 
E
P
 
P
T
 
T
D
 
E
G
 
G
A
 
R
V
 
I
S
 
Y
L
 
F
E
 
G
G
 
D
Q
 
R
Q
 
D
I
 
V
T
 
T
-
 
Y
A
 
L
P
 
P
G
 
P
P
 
K
D
 
D
R
 
R
M
 
-
V
 
-
V
 
-
F
 
-
Q
 
-
N
 
N
Y
 
I
S
 
S
L
 
M
-
 
V
F
 
F
P
 
Q
W
 
H
L
 
M
T
 
T
V
 
V
R
 
Y
E
 
E
N
 
N
I
 
I
A
 
A
L
 
F
A
 
P
V
 
-
D
 
-
E
 
-
V
 
-
L
 
L
R
 
K
D
 
K
L
 
F
P
 
P
K
 
K
E
 
D
E
 
E
R
 
I
Q
 
D
A
 
K
I
 
R
V
 
V
E
 
R
E
 
W
H
 
A
I
 
A
Q
 
E
L
 
L
V
 
L
G
 
Q
L
 
I
G
 
E
H
 
E
A
 
L
A
 
L
D
 
N
K
 
R
P
 
Y
P
 
P
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
Q
K
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
V
A
 
A
R
 
R
G
 
A
L
 
I
A
 
V
T
 
V
R
 
E
P
 
P
K
 
D
L
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
F
 
L
G
 
S
A
 
N
L
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
K
T
 
L
R
 
R
G
 
V
N
 
A
L
 
M
Q
 
R
E
 
A
K
 
E
L
 
I
M
 
K
Q
 
K
I
 
L
C
 
Q
E
 
Q
E
 
K
N
 
L
H
 
K
V
 
V
T
 
T
A
 
T
V
 
I
M
 
Y
V
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
D
V
 
Q
D
 
V
E
 
E
A
 
A
V
 
M
L
 
T
L
 
M
S
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
I
V
 
A
M
 
V
L
 
M
T
 
N
N
 
R
G
 
G
P
 
Q
G
 
L
S
 
L
K
 
Q
I
 
I
G
 
G
G
 
S
I
 
P
L
 
T
E
 
E
V
 
V

7ahdC Opua (e190q) occluded (see paper)
37% identity, 29% coverage: 29:221/663 of query aligns to 46:245/260 of 7ahdC

query
sites
7ahdC
D
 
N
L
 
F
E
 
E
I
 
I
K
 
N
Q
 
E
G
 
G
E
 
E
F
 
I
I
 
F
S
 
V
L
 
I
I
 
M
G
 
G
H
 
L
S
|
S
G
|
G
C
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
N
 
R
L
 
L
I
 
L
A
 
N
G
 
R
L
 
L
E
 
I
L
 
E
P
 
P
T
 
T
D
 
S
G
 
G
A
 
K
V
 
I
S
 
F
L
 
I
E
 
D
G
 
N
Q
 
Q
Q
 
D
I
 
V
T
 
A
A
 
T
P
 
L
G
 
N
P
 
K
D
 
E
R
 
D
M
 
L
V
 
L
-
 
Q
-
 
V
-
 
R
-
 
R
-
 
K
-
 
T
-
 
M
-
 
S
-
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
|
Q
N
 
N
Y
 
F
S
 
G
L
 
L
F
 
F
P
 
P
W
 
H
L
 
R
T
 
T
V
 
I
R
 
L
E
 
E
N
 
N
I
 
T
A
 
E
L
 
Y
A
 
G
V
 
L
D
 
E
E
 
-
V
 
-
L
 
V
R
 
Q
D
 
N
L
 
V
P
 
P
K
 
K
E
 
E
E
 
E
R
 
R
Q
 
R
A
 
K
I
 
R
V
 
A
E
 
E
E
 
K
H
 
A
I
 
L
Q
 
D
L
 
N
V
 
A
G
 
N
L
 
L
G
 
L
H
 
D
A
 
F
A
 
K
D
 
D
K
 
Q
P
 
Y
P
 
P
A
x
K
Q
|
Q
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
M
|
M
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
G
I
 
L
A
 
A
R
 
R
G
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
N
R
 
D
P
 
P
K
 
E
L
 
I
L
 
L
L
 
L
L
 
M
D
 
D
E
x
Q
P
 
A
F
 
F
G
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
P
L
 
L
T
 
I
R
 
R
G
 
R
N
 
E
L
 
M
Q
 
Q
E
 
D
K
 
E
L
 
L
M
 
L
Q
 
E
I
 
L
C
 
Q
E
 
A
E
 
K
N
 
F
H
 
Q
V
 
K
T
 
T
A
 
I
V
 
I
M
 
F
V
 
V
T
 
S
H
|
H
D
 
D
V
 
L
D
 
N
E
 
E
A
 
A
V
 
L
L
 
R
L
 
I
S
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
I
V
 
A
M
 
I
L
 
M
T
 
K
N
 
D
G
 
G
P
 
K
G
 
I
S
 
M
K
 
Q
I
 
I
G
 
G

Sites not aligning to the query:

2awnB Crystal structure of the adp-mg-bound e. Coli malk (crystallized with atp-mg) (see paper)
39% identity, 33% coverage: 5:226/663 of query aligns to 3:220/374 of 2awnB

query
sites
2awnB
V
 
V
A
 
Q
V
 
L
E
 
Q
N
 
N
I
 
V
E
 
T
K
 
K
S
 
A
F
x
W
P
 
-
L
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
-
N
 
G
E
 
E
Y
 
V
L
 
V
A
x
V
L
 
S
K
 
K
G
 
D
I
 
I
D
 
N
L
 
L
E
 
D
I
 
I
K
 
H
Q
 
E
G
 
G
E
 
E
F
 
F
I
 
V
S
 
V
L
 
F
I
 
V
G
 
G
H
 
P
S
|
S
G
|
G
C
 
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
N
 
R
L
 
M
I
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
E
L
 
T
P
 
I
T
 
T
D
 
S
G
 
G
A
 
D
V
 
L
S
 
F
L
 
I
-
 
G
E
 
E
G
 
K
Q
 
R
Q
 
M
I
 
N
T
 
D
A
 
T
P
 
P
G
 
P
P
 
A
D
 
E
R
 
R
M
 
G
V
 
V
-
 
G
-
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
S
Y
 
Y
S
 
A
L
 
L
F
 
Y
P
 
P
W
 
H
L
 
L
T
 
S
V
 
V
R
 
A
E
 
E
N
 
N
I
 
M
A
 
S
L
 
F
A
 
G
V
 
L
D
 
K
E
 
-
V
 
-
L
 
L
R
 
A
D
 
G
L
 
A
P
 
K
K
 
K
E
 
E
E
 
V
R
 
I
Q
 
N
A
 
Q
I
 
R
V
 
V
E
 
N
E
 
Q
H
 
V
I
 
A
Q
 
E
L
 
V
V
 
L
G
 
Q
L
 
L
G
 
A
H
 
H
A
 
L
A
 
L
D
 
D
K
 
R
P
 
K
P
 
P
A
 
K
Q
 
A
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
M
 
Q
K
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
G
R
 
R
G
 
T
L
 
L
A
 
V
T
 
A
R
 
E
P
 
P
K
 
S
L
 
V
L
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
F
 
L
G
 
S
A
 
N
L
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
A
T
 
L
R
 
R
G
 
V
N
 
Q
L
 
M
Q
 
R
E
 
I
K
 
E
L
 
I
M
 
S
Q
 
R
I
 
L
C
 
H
E
 
K
E
 
R
N
 
L
H
 
G
V
 
R
T
 
T
A
 
M
V
 
I
M
 
Y
V
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
D
V
 
Q
D
 
V
E
 
E
A
 
A
V
 
M
L
 
T
L
 
L
S
 
A
D
 
D
R
 
K
I
 
I
V
 
V
M
 
V
L
 
L
T
 
D
N
 
A
G
 
G
P
 
R
G
 
V
S
 
A
K
 
Q
I
 
V
G
 
G
G
 
K
I
 
P
L
 
L
E
 
E
V
 
L

P68187 Maltose/maltodextrin import ATP-binding protein MalK; EC 7.5.2.1 from Escherichia coli (strain K12) (see 5 papers)
39% identity, 33% coverage: 5:226/663 of query aligns to 4:221/371 of P68187

query
sites
P68187
V
 
V
A
 
Q
V
 
L
E
 
Q
N
 
N
I
 
V
E
 
T
K
 
K
S
 
A
F
 
W
P
 
-
L
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
-
N
 
G
E
 
E
Y
 
V
L
 
V
A
 
V
L
 
S
K
 
K
G
 
D
I
 
I
D
 
N
L
 
L
E
 
D
I
 
I
K
 
H
Q
 
E
G
 
G
E
 
E
F
 
F
I
 
V
S
 
V
L
 
F
I
 
V
G
 
G
H
 
P
S
 
S
G
 
G
C
 
C
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
L
 
L
N
 
R
L
 
M
I
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
E
L
 
T
P
 
I
T
 
T
D
 
S
G
 
G
A
 
D
V
 
L
S
 
F
L
 
I
-
 
G
E
 
E
G
 
K
Q
 
R
Q
 
M
I
 
N
T
 
D
A
 
T
P
 
P
G
 
P
P
 
A
D
 
E
R
 
R
M
 
G
V
 
V
-
 
G
-
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
S
Y
 
Y
S
x
A
L
 
L
F
 
Y
P
 
P
W
 
H
L
 
L
T
 
S
V
 
V
R
 
A
E
 
E
N
 
N
I
 
M
A
 
S
L
 
F
A
 
G
V
 
L
D
 
K
E
 
-
V
 
-
L
 
L
R
 
A
D
 
G
L
 
A
P
x
K
K
 
K
E
 
E
E
 
V
R
 
I
Q
 
N
A
 
Q
I
 
R
V
|
V
E
 
N
E
 
Q
H
x
V
I
 
A
Q
x
E
L
 
V
V
 
L
G
 
Q
L
 
L
G
x
A
H
 
H
A
 
L
A
 
L
D
 
D
K
 
R
P
 
K
P
 
P
A
 
K
Q
 
A
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
|
G
M
 
Q
K
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
G
R
 
R
G
 
T
L
 
L
A
 
V
T
 
A
R
 
E
P
 
P
K
 
S
L
 
V
L
 
F
L
 
L
L
 
L
D
|
D
E
 
E
P
 
P
F
 
L
G
 
S
A
 
N
L
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
A
T
 
L
R
 
R
G
 
V
N
 
Q
L
 
M
Q
 
R
E
 
I
K
 
E
L
 
I
M
 
S
Q
 
R
I
 
L
C
 
H
E
 
K
E
 
R
N
 
L
H
 
G
V
 
R
T
 
T
A
 
M
V
 
I
M
 
Y
V
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
D
V
 
Q
D
 
V
E
 
E
A
 
A
V
 
M
L
 
T
L
 
L
S
 
A
D
 
D
R
 
K
I
 
I
V
 
V
M
 
V
L
 
L
T
 
D
N
 
A
G
 
G
P
 
R
G
 
V
S
 
A
K
 
Q
I
 
V
G
 
G
G
 
K
I
 
P
L
 
L
E
 
E
V
 
L

Sites not aligning to the query:

3puyA Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to amp-pnp after crystal soaking of the pretranslocation state (see paper)
39% identity, 33% coverage: 5:226/663 of query aligns to 3:220/371 of 3puyA

query
sites
3puyA
V
 
V
A
 
Q
V
 
L
E
 
Q
N
 
N
I
 
V
E
 
T
K
 
K
S
 
A
F
x
W
P
 
-
L
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
-
N
 
G
E
 
E
Y
 
V
L
 
V
A
 
V
L
 
S
K
 
K
G
 
D
I
 
I
D
 
N
L
 
L
E
 
D
I
 
I
K
 
H
Q
 
E
G
 
G
E
 
E
F
 
F
I
 
V
S
 
V
L
 
F
I
 
V
G
 
G
H
 
P
S
|
S
G
|
G
C
|
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
N
 
R
L
 
M
I
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
E
L
 
T
P
 
I
T
 
T
D
 
S
G
 
G
A
 
D
V
 
L
S
 
F
L
 
I
-
 
G
E
 
E
G
 
K
Q
 
R
Q
 
M
I
 
N
T
 
D
A
 
T
P
 
P
G
 
P
P
 
A
D
 
E
R
 
R
M
 
G
V
 
V
-
 
G
-
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
|
Q
N
 
S
Y
 
Y
S
 
A
L
 
L
F
 
Y
P
 
P
W
 
H
L
 
L
T
 
S
V
 
V
R
 
A
E
 
E
N
 
N
I
 
M
A
 
S
L
 
F
A
 
G
V
 
L
D
 
K
E
 
-
V
 
-
L
 
L
R
 
A
D
 
G
L
 
A
P
 
K
K
 
K
E
 
E
E
 
V
R
 
I
Q
 
N
A
 
Q
I
 
R
V
 
V
E
 
N
E
 
Q
H
 
V
I
 
A
Q
 
E
L
 
V
V
 
L
G
 
Q
L
 
L
G
 
A
H
 
H
A
 
L
A
 
L
D
 
D
K
x
R
P
 
K
P
 
P
A
 
K
Q
x
A
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
M
x
Q
K
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
G
R
 
R
G
 
T
L
 
L
A
 
V
T
 
A
R
 
E
P
 
P
K
 
S
L
 
V
L
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
F
 
L
G
 
S
A
 
N
L
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
A
T
 
L
R
 
R
G
 
V
N
 
Q
L
 
M
Q
 
R
E
 
I
K
 
E
L
 
I
M
 
S
Q
 
R
I
 
L
C
 
H
E
 
K
E
 
R
N
 
L
H
 
G
V
 
R
T
 
T
A
 
M
V
 
I
M
 
Y
V
 
V
T
 
T
H
|
H
D
 
D
V
 
Q
D
 
V
E
 
E
A
 
A
V
 
M
L
 
T
L
 
L
S
 
A
D
 
D
R
 
K
I
 
I
V
 
V
M
 
V
L
 
L
T
 
D
N
 
A
G
 
G
P
 
R
G
 
V
S
 
A
K
 
Q
I
 
V
G
 
G
G
 
K
I
 
P
L
 
L
E
 
E
V
 
L

3puxA Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to adp-bef3 (see paper)
39% identity, 33% coverage: 5:226/663 of query aligns to 3:220/371 of 3puxA

query
sites
3puxA
V
 
V
A
 
Q
V
 
L
E
 
Q
N
 
N
I
 
V
E
 
T
K
 
K
S
 
A
F
x
W
P
 
-
L
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
-
N
 
G
E
 
E
Y
 
V
L
 
V
A
 
V
L
 
S
K
 
K
G
 
D
I
 
I
D
 
N
L
 
L
E
 
D
I
 
I
K
 
H
Q
 
E
G
 
G
E
 
E
F
 
F
I
 
V
S
 
V
L
 
F
I
 
V
G
 
G
H
 
P
S
|
S
G
|
G
C
|
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
N
 
R
L
 
M
I
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
E
L
 
T
P
 
I
T
 
T
D
 
S
G
 
G
A
 
D
V
 
L
S
 
F
L
 
I
-
 
G
E
 
E
G
 
K
Q
 
R
Q
 
M
I
 
N
T
 
D
A
 
T
P
 
P
G
 
P
P
 
A
D
 
E
R
 
R
M
 
G
V
 
V
-
 
G
-
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
|
Q
N
 
S
Y
 
Y
S
 
A
L
 
L
F
 
Y
P
 
P
W
 
H
L
 
L
T
 
S
V
 
V
R
 
A
E
 
E
N
 
N
I
 
M
A
 
S
L
 
F
A
 
G
V
 
L
D
 
K
E
 
-
V
 
-
L
 
L
R
 
A
D
 
G
L
 
A
P
 
K
K
 
K
E
 
E
E
 
V
R
 
I
Q
 
N
A
 
Q
I
 
R
V
 
V
E
 
N
E
 
Q
H
 
V
I
 
A
Q
 
E
L
 
V
V
 
L
G
 
Q
L
 
L
G
 
A
H
 
H
A
 
L
A
 
L
D
 
D
K
x
R
P
 
K
P
 
P
A
 
K
Q
 
A
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
M
x
Q
K
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
G
R
 
R
G
 
T
L
 
L
A
 
V
T
 
A
R
 
E
P
 
P
K
 
S
L
 
V
L
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
F
 
L
G
 
S
A
 
N
L
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
A
T
 
L
R
 
R
G
 
V
N
 
Q
L
 
M
Q
 
R
E
 
I
K
 
E
L
 
I
M
 
S
Q
 
R
I
 
L
C
 
H
E
 
K
E
 
R
N
 
L
H
 
G
V
 
R
T
 
T
A
 
M
V
 
I
M
 
Y
V
 
V
T
 
T
H
|
H
D
 
D
V
 
Q
D
 
V
E
 
E
A
 
A
V
 
M
L
 
T
L
 
L
S
 
A
D
 
D
R
 
K
I
 
I
V
 
V
M
 
V
L
 
L
T
 
D
N
 
A
G
 
G
P
 
R
G
 
V
S
 
A
K
 
Q
I
 
V
G
 
G
G
 
K
I
 
P
L
 
L
E
 
E
V
 
L

3puwA Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to adp-alf4 (see paper)
39% identity, 33% coverage: 5:226/663 of query aligns to 3:220/371 of 3puwA

query
sites
3puwA
V
 
V
A
 
Q
V
 
L
E
 
Q
N
 
N
I
 
V
E
 
T
K
 
K
S
 
A
F
x
W
P
 
-
L
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
-
N
 
G
E
 
E
Y
 
V
L
 
V
A
x
V
L
 
S
K
 
K
G
 
D
I
 
I
D
 
N
L
 
L
E
 
D
I
 
I
K
 
H
Q
 
E
G
 
G
E
 
E
F
 
F
I
 
V
S
 
V
L
 
F
I
 
V
G
 
G
H
 
P
S
|
S
G
|
G
C
|
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
N
 
R
L
 
M
I
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
E
L
 
T
P
 
I
T
 
T
D
 
S
G
 
G
A
 
D
V
 
L
S
 
F
L
 
I
-
 
G
E
 
E
G
 
K
Q
 
R
Q
 
M
I
 
N
T
 
D
A
 
T
P
 
P
G
 
P
P
 
A
D
 
E
R
 
R
M
 
G
V
 
V
-
 
G
-
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
|
Q
N
 
S
Y
 
Y
S
 
A
L
 
L
F
 
Y
P
 
P
W
 
H
L
 
L
T
 
S
V
 
V
R
 
A
E
 
E
N
 
N
I
 
M
A
 
S
L
 
F
A
 
G
V
 
L
D
 
K
E
 
-
V
 
-
L
 
L
R
 
A
D
 
G
L
 
A
P
 
K
K
 
K
E
 
E
E
 
V
R
 
I
Q
 
N
A
 
Q
I
 
R
V
 
V
E
 
N
E
 
Q
H
 
V
I
 
A
Q
 
E
L
 
V
V
 
L
G
 
Q
L
 
L
G
 
A
H
 
H
A
 
L
A
 
L
D
 
D
K
x
R
P
 
K
P
 
P
A
 
K
Q
x
A
L
 
L
S
|
S
G
|
G
G
|
G
M
x
Q
K
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
G
R
 
R
G
 
T
L
 
L
A
 
V
T
 
A
R
 
E
P
 
P
K
 
S
L
 
V
L
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
F
 
L
G
 
S
A
 
N
L
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
A
T
 
L
R
 
R
G
 
V
N
 
Q
L
 
M
Q
 
R
E
 
I
K
 
E
L
 
I
M
 
S
Q
 
R
I
 
L
C
 
H
E
 
K
E
 
R
N
 
L
H
 
G
V
 
R
T
 
T
A
 
M
V
 
I
M
 
Y
V
 
V
T
 
T
H
|
H
D
 
D
V
 
Q
D
 
V
E
 
E
A
 
A
V
 
M
L
 
T
L
 
L
S
 
A
D
 
D
R
 
K
I
 
I
V
 
V
M
 
V
L
 
L
T
 
D
N
 
A
G
 
G
P
 
R
G
 
V
S
 
A
K
 
Q
I
 
V
G
 
G
G
 
K
I
 
P
L
 
L
E
 
E
V
 
L

3puvA Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to adp-vo4 (see paper)
39% identity, 33% coverage: 5:226/663 of query aligns to 3:220/371 of 3puvA

query
sites
3puvA
V
 
V
A
 
Q
V
 
L
E
 
Q
N
 
N
I
 
V
E
 
T
K
 
K
S
 
A
F
x
W
P
 
-
L
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
-
N
 
G
E
 
E
Y
 
V
L
 
V
A
x
V
L
 
S
K
 
K
G
 
D
I
 
I
D
 
N
L
 
L
E
 
D
I
 
I
K
 
H
Q
 
E
G
 
G
E
 
E
F
 
F
I
 
V
S
 
V
L
 
F
I
 
V
G
 
G
H
 
P
S
 
S
G
|
G
C
|
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
N
 
R
L
 
M
I
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
E
L
 
T
P
 
I
T
 
T
D
 
S
G
 
G
A
 
D
V
 
L
S
 
F
L
 
I
-
 
G
E
 
E
G
 
K
Q
 
R
Q
 
M
I
 
N
T
 
D
A
 
T
P
 
P
G
 
P
P
 
A
D
 
E
R
 
R
M
 
G
V
 
V
-
 
G
-
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
|
Q
N
 
S
Y
 
Y
S
 
A
L
 
L
F
 
Y
P
 
P
W
 
H
L
 
L
T
 
S
V
 
V
R
 
A
E
 
E
N
 
N
I
 
M
A
 
S
L
 
F
A
 
G
V
 
L
D
 
K
E
 
-
V
 
-
L
 
L
R
 
A
D
 
G
L
 
A
P
 
K
K
 
K
E
 
E
E
 
V
R
 
I
Q
 
N
A
 
Q
I
 
R
V
 
V
E
 
N
E
 
Q
H
 
V
I
 
A
Q
 
E
L
 
V
V
 
L
G
 
Q
L
 
L
G
 
A
H
 
H
A
 
L
A
 
L
D
 
D
K
x
R
P
 
K
P
 
P
A
 
K
Q
x
A
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
M
x
Q
K
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
G
R
 
R
G
 
T
L
 
L
A
 
V
T
 
A
R
 
E
P
 
P
K
 
S
L
 
V
L
 
F
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
F
 
L
G
 
S
A
 
N
L
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
A
T
 
L
R
 
R
G
 
V
N
 
Q
L
 
M
Q
 
R
E
 
I
K
 
E
L
 
I
M
 
S
Q
 
R
I
 
L
C
 
H
E
 
K
E
 
R
N
 
L
H
 
G
V
 
R
T
 
T
A
 
M
V
 
I
M
 
Y
V
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
D
V
 
Q
D
 
V
E
 
E
A
 
A
V
 
M
L
 
T
L
 
L
S
 
A
D
 
D
R
 
K
I
 
I
V
 
V
M
 
V
L
 
L
T
 
D
N
 
A
G
 
G
P
 
R
G
 
V
S
 
A
K
 
Q
I
 
V
G
 
G
G
 
K
I
 
P
L
 
L
E
 
E
V
 
L

Query Sequence

>Synpcc7942_1490 FitnessBrowser__SynE:Synpcc7942_1490
MSLFVAVENIEKSFPLSGGNEYLALKGIDLEIKQGEFISLIGHSGCGKSTLLNLIAGLEL
PTDGAVSLEGQQITAPGPDRMVVFQNYSLFPWLTVRENIALAVDEVLRDLPKEERQAIVE
EHIQLVGLGHAADKPPAQLSGGMKQRVAIARGLATRPKLLLLDEPFGALDALTRGNLQEK
LMQICEENHVTAVMVTHDVDEAVLLSDRIVMLTNGPGSKIGGILEVDIPRPRKRMDVVHH
PSYYSLRSEIIYFLNQQKRVKKLNARKVTTVARHGLEKVNLEIGYVPLMACAPLVVAQEK
AFFAKHGLDEVSLVRETSWRGIVDGLTENYLDAAQMPAGMPVWMSVGGQGGSPLPIVSSL
TMSRNGNGITLSKALYDEGIQTVDDFRNLLRSTADKQHIMGIVHPASMHNLLLRYWLAAN
QIDPDRDVQLRTIPPAQMVADLKDGTIDGYCIGEPWNAWAAQKEIGFTIASDLEIWNGHP
GKVLGVREDWANRYPNSHVALVKALLEACQYCEDPANWDELRELLSDRRYLSCPKEYIQF
SQSTADDLAVPHHRFAGAGVNRPSRTEHLWMMTQLARWGDVPFPRNWVEILERVCRVGVF
STAARELGLSEVVNYQRSTPVELFDGVPFNAEDPIAYLNSLPIHRDFSVAEIALDQPRPI
AAA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory