SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Synpcc7942_1848 FitnessBrowser__SynE:Synpcc7942_1848 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

Q04797 Aspartate-semialdehyde dehydrogenase; ASA dehydrogenase; ASADH; Aspartate-beta-semialdehyde dehydrogenase; EC 1.2.1.11 from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
47% identity, 94% coverage: 10:343/354 of query aligns to 1:342/346 of Q04797

query
sites
Q04797
L
 
M
S
 
G
Q
 
R
G
 
G
Y
 
L
R
 
H
V
 
V
A
 
A
I
 
V
L
 
V
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
A
V
 
V
G
 
G
T
 
Q
E
 
Q
L
 
M
L
 
L
Q
 
K
I
 
T
L
 
L
E
 
E
E
 
D
R
 
R
Q
 
N
F
 
F
P
 
E
I
 
M
A
 
D
E
 
T
L
 
L
R
 
T
L
 
L
L
 
L
A
 
S
S
 
S
P
 
K
R
 
R
S
 
S
A
 
A
G
 
G
Q
 
T
T
 
K
L
 
V
T
 
T
F
 
F
A
 
K
G
 
G
E
 
Q
T
 
E
L
 
L
T
 
T
I
 
V
Q
 
Q
E
 
E
A
 
A
T
 
S
P
 
P
S
 
E
A
 
S
F
 
F
Q
 
E
G
 
G
L
 
V
D
 
N
I
 
I
V
 
A
L
 
L
A
 
F
S
 
S
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
T
 
V
S
 
S
K
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
P
A
 
E
I
 
A
V
 
V
A
 
K
A
 
R
G
 
G
A
 
A
V
 
I
M
 
V
I
 
I
D
 
D
N
 
N
S
 
T
S
|
S
A
 
A
F
 
F
R
 
R
M
 
M
D
 
D
P
 
E
T
 
N
V
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
V
N
 
N
P
 
E
E
 
A
A
 
D
A
 
L
A
 
H
Q
 
E
H
 
H
Q
 
N
G
 
G
I
 
I
I
 
I
A
 
A
N
 
N
P
 
P
N
 
N
C
 
C
T
 
S
T
 
T
I
 
I
L
 
Q
M
 
M
A
 
V
I
 
A
A
 
A
L
 
L
W
 
E
P
 
P
L
 
I
Q
 
R
Q
 
K
R
 
A
H
x
Y
P
 
G
I
 
L
R
 
N
R
 
K
I
 
V
V
 
I
V
 
V
S
 
S
T
 
T
Y
 
Y
Q
 
Q
S
 
A
A
 
V
S
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
N
R
 
E
A
 
A
M
 
V
A
 
K
E
 
E
V
 
L
Q
 
Y
E
 
S
Q
 
Q
S
 
T
R
 
Q
A
 
A
I
 
I
L
 
L
A
 
N
G
 
K
Q
 
E
P
 
E
A
 
I
I
 
E
A
 
P
E
 
E
I
 
I
L
 
M
P
 
P
-
 
V
-
 
K
-
 
G
-
 
D
-
 
K
-
 
K
-
 
H
Y
 
Y
P
 
Q
L
 
I
A
 
A
F
 
F
N
 
N
L
 
A
F
 
I
P
 
P
H
 
Q
N
 
I
S
 
D
P
 
K
L
 
F
T
 
Q
E
 
D
S
 
N
G
 
G
Y
 
Y
C
 
T
E
 
F
E
 
E
E
 
E
L
 
M
K
 
K
M
 
M
L
 
I
N
 
N
E
 
E
S
 
T
R
 
K
K
 
K
I
 
I
F
 
M
G
 
H
L
 
M
P
 
P
D
 
D
L
 
L
K
 
Q
L
 
V
T
 
A
A
 
A
T
 
T
C
 
C
V
 
V
R
 
R
V
 
L
P
 
P
V
 
I
L
 
Q
R
 
T
A
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
A
 
S
I
 
V
N
 
Y
V
 
I
E
 
E
F
 
I
T
 
D
-
 
R
E
 
D
P
 
D
F
 
A
S
 
T
V
 
V
A
 
E
E
 
D
A
 
I
R
 
K
E
 
N
A
 
L
I
 
L
A
 
K
A
 
E
A
 
A
P
 
P
G
 
G
A
 
V
R
 
T
L
 
L
L
 
Q
E
 
D
D
 
D
W
 
P
D
 
S
R
 
Q
N
 
Q
Y
 
L
F
 
Y
P
 
P
M
 
M
P
 
P
I
 
A
E
 
D
A
 
A
S
 
V
G
 
G
E
 
K
D
 
N
D
 
D
V
 
V
L
 
F
V
 
V
G
 
G
R
 
R
I
 
I
R
 
R
Q
 
K
D
 
D
L
 
L
S
 
D
E
 
R
P
 
A
N
 
N
A
 
G
L
 
F
E
 
H
L
 
L
W
 
W
I
 
V
C
 
V
G
 
S
D
 
D
Q
 
N
I
 
L
R
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
W
N
 
N
A
 
S
V
 
V
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
E
 
E
L
 
S
L
 
L
V
 
K
K
 
K

4r54A Complex crystal structure of sp-aspartate-semialdehyde-dehydrogenase with 3-carboxy-ethyl-phthalic acid (see paper)
48% identity, 96% coverage: 13:351/354 of query aligns to 1:350/357 of 4r54A

query
sites
4r54A
G
 
G
Y
 
Y
R
 
T
V
 
V
A
 
A
I
 
V
L
 
V
G
|
G
A
 
A
T
|
T
G
|
G
A
|
A
V
|
V
G
 
G
T
 
A
E
 
Q
L
 
M
L
 
I
Q
 
K
I
 
M
L
 
L
E
 
E
E
 
E
R
 
S
Q
 
T
F
 
L
P
 
P
I
 
I
A
 
D
E
 
K
L
 
I
R
 
R
L
 
Y
L
 
L
A
|
A
S
|
S
P
 
A
R
|
R
S
|
S
A
 
A
G
 
G
Q
 
K
T
 
S
L
 
L
T
 
K
F
 
F
A
 
K
G
 
D
E
 
Q
T
 
D
L
 
I
T
 
T
I
 
I
Q
 
E
E
 
E
A
x
T
T
 
T
P
 
E
S
 
T
A
 
A
F
 
F
Q
 
E
G
 
G
L
 
V
D
 
D
I
 
I
V
 
A
L
 
L
A
 
F
S
|
S
A
|
A
G
|
G
G
x
S
S
 
S
T
|
T
S
 
S
K
 
A
A
 
K
L
 
Y
A
 
A
E
 
P
A
 
Y
I
 
A
V
 
V
A
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
V
V
 
V
M
 
V
I
 
V
D
 
D
N
|
N
S
x
T
S
|
S
A
 
Y
F
 
F
R
|
R
M
 
Q
D
 
N
P
 
P
T
 
D
V
 
V
P
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
V
N
 
N
P
 
A
E
 
H
A
 
A
A
 
L
A
 
D
Q
 
A
H
 
H
Q
 
N
G
 
G
I
 
I
I
 
I
A
 
A
N
 
C
P
 
P
N
|
N
C
|
C
T
 
S
T
 
T
I
 
I
L
 
Q
M
 
M
A
 
M
I
 
V
A
 
A
L
 
L
W
 
E
P
 
P
L
 
V
Q
 
R
Q
 
Q
R
 
K
H
 
W
P
 
G
I
 
L
R
 
D
R
 
R
I
 
I
V
 
I
V
 
V
S
 
S
T
 
T
Y
 
Y
Q
 
Q
S
 
A
A
 
V
S
 
S
G
 
G
A
 
A
G
|
G
A
 
M
R
 
G
A
 
A
M
 
I
A
 
L
E
 
E
V
 
T
Q
 
Q
E
 
R
Q
 
E
S
 
L
R
 
R
A
 
E
I
 
V
L
 
L
A
 
N
G
 
D
-
 
G
-
 
V
Q
 
K
P
 
P
A
 
C
I
 
D
-
 
L
-
 
H
A
 
A
E
 
E
I
 
I
L
 
L
P
 
P
-
 
S
-
 
G
-
 
G
-
 
D
-
 
K
-
 
K
-
 
H
Y
 
Y
P
 
P
L
 
I
A
 
A
F
 
F
N
 
N
L
 
A
F
 
L
P
 
P
H
 
Q
N
 
I
S
 
D
P
 
V
L
 
F
T
 
T
E
 
D
S
 
N
G
 
D
Y
 
Y
C
 
T
E
 
Y
E
 
E
E
 
E
L
 
M
K
|
K
M
 
M
L
 
T
N
 
K
E
 
E
S
 
T
R
 
K
K
 
K
I
 
I
F
 
M
G
 
E
L
 
D
P
 
D
D
 
S
L
 
I
K
 
A
L
 
V
T
 
S
A
 
A
T
 
T
C
 
C
V
 
V
R
 
R
V
 
I
P
 
P
V
 
V
L
 
L
R
 
S
A
 
A
H
 
H
S
 
S
E
 
E
A
 
S
I
 
V
N
 
Y
V
 
I
E
 
E
F
 
T
T
 
K
E
 
E
P
 
V
F
 
A
S
 
P
V
 
I
A
 
E
E
 
E
A
 
V
R
 
K
E
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
F
P
 
P
G
 
G
A
 
A
R
 
V
L
 
L
L
 
E
E
 
D
D
 
D
W
 
V
D
 
A
R
 
H
N
 
Q
Y
 
I
F
 
Y
P
 
P
M
 
Q
P
 
A
I
 
I
E
 
N
A
 
A
S
 
V
G
 
G
E
 
S
D
 
R
D
 
D
V
 
T
L
 
F
V
 
V
G
 
G
R
 
R
I
 
I
R
 
R
Q
 
K
D
 
D
L
 
L
S
 
D
E
 
A
P
 
E
N
 
K
A
 
G
L
 
I
E
 
H
L
 
M
W
 
W
I
 
V
C
 
V
G
 
S
D
 
D
Q
 
N
I
 
L
R
 
L
K
 
K
G
|
G
A
 
A
A
 
A
L
 
W
N
 
N
A
 
S
V
 
V
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
E
 
E
L
 
T
L
 
L
V
 
H
K
 
E
R
 
R
Q
 
G
W
 
L
L
 
V
R
 
R
S
 
P
P
 
T
A
 
A

4r41A Complex crystal structure of 4-nitro-2-phosphono-benzoic acid with sp- aspartate-semialdehyde dehydrogenase and nicotinamide-dinucleotide (see paper)
48% identity, 96% coverage: 13:351/354 of query aligns to 1:350/357 of 4r41A

query
sites
4r41A
G
 
G
Y
 
Y
R
 
T
V
 
V
A
 
A
I
 
V
L
 
V
G
|
G
A
 
A
T
|
T
G
|
G
A
|
A
V
 
V
G
 
G
T
 
A
E
 
Q
L
 
M
L
 
I
Q
 
K
I
 
M
L
 
L
E
 
E
E
 
E
R
 
S
Q
 
T
F
 
L
P
 
P
I
 
I
A
 
D
E
 
K
L
 
I
R
 
R
L
 
Y
L
 
L
A
|
A
S
|
S
P
 
A
R
|
R
S
|
S
A
 
A
G
 
G
Q
 
K
T
 
S
L
 
L
T
 
K
F
 
F
A
 
K
G
 
D
E
 
Q
T
 
D
L
 
I
T
 
T
I
 
I
Q
 
E
E
 
E
A
x
T
T
 
T
P
 
E
S
 
T
A
 
A
F
 
F
Q
 
E
G
 
G
L
 
V
D
 
D
I
 
I
V
 
A
L
 
L
A
 
F
S
|
S
A
|
A
G
|
G
G
x
S
S
 
S
T
 
T
S
 
S
K
 
A
A
 
K
L
 
Y
A
 
A
E
 
P
A
 
Y
I
 
A
V
 
V
A
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
V
V
 
V
M
 
V
I
 
V
D
 
D
N
|
N
S
x
T
S
|
S
A
 
Y
F
 
F
R
|
R
M
 
Q
D
 
N
P
 
P
T
 
D
V
 
V
P
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
V
N
 
N
P
 
A
E
 
H
A
 
A
A
 
L
A
 
D
Q
 
A
H
 
H
Q
 
N
G
 
G
I
 
I
I
 
I
A
 
A
N
 
C
P
 
P
N
 
N
C
 
C
T
 
S
T
 
T
I
 
I
L
 
Q
M
 
M
A
 
M
I
 
V
A
 
A
L
 
L
W
 
E
P
 
P
L
 
V
Q
 
R
Q
 
Q
R
 
K
H
 
W
P
 
G
I
 
L
R
 
D
R
 
R
I
 
I
V
 
I
V
 
V
S
 
S
T
 
T
Y
 
Y
Q
 
Q
S
 
A
A
 
V
S
 
S
G
 
G
A
 
A
G
|
G
A
x
M
R
x
G
A
 
A
M
 
I
A
 
L
E
 
E
V
 
T
Q
 
Q
E
 
R
Q
 
E
S
 
L
R
 
R
A
 
E
I
 
V
L
 
L
A
 
N
G
 
D
-
 
G
-
 
V
Q
 
K
P
 
P
A
 
C
I
 
D
-
 
L
-
 
H
A
 
A
E
 
E
I
 
I
L
 
L
P
 
P
-
 
S
-
 
G
-
 
G
-
 
D
-
 
K
-
 
K
-
 
H
Y
 
Y
P
 
P
L
 
I
A
 
A
F
 
F
N
 
N
L
 
A
F
 
L
P
 
P
H
 
Q
N
 
I
S
 
D
P
 
V
L
 
F
T
 
T
E
 
D
S
 
N
G
 
D
Y
 
Y
C
 
T
E
 
Y
E
 
E
E
 
E
L
 
M
K
|
K
M
 
M
L
 
T
N
 
K
E
 
E
S
 
T
R
 
K
K
 
K
I
 
I
F
 
M
G
 
E
L
 
D
P
 
D
D
 
S
L
 
I
K
 
A
L
 
V
T
 
S
A
 
A
T
 
T
C
 
C
V
 
V
R
 
R
V
 
I
P
 
P
V
 
V
L
 
L
R
 
S
A
 
A
H
 
H
S
 
S
E
 
E
A
 
S
I
 
V
N
 
Y
V
 
I
E
 
E
F
 
T
T
 
K
E
 
E
P
 
V
F
 
A
S
 
P
V
 
I
A
 
E
E
 
E
A
 
V
R
 
K
E
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
F
P
 
P
G
 
G
A
 
A
R
 
V
L
 
L
L
 
E
E
 
D
D
 
D
W
 
V
D
 
A
R
 
H
N
 
Q
Y
 
I
F
 
Y
P
 
P
M
 
Q
P
 
A
I
 
I
E
 
N
A
 
A
S
 
V
G
 
G
E
 
S
D
 
R
D
 
D
V
 
T
L
 
F
V
 
V
G
 
G
R
 
R
I
 
I
R
 
R
Q
 
K
D
 
D
L
 
L
S
 
D
E
 
A
P
 
E
N
 
K
A
 
G
L
 
I
E
 
H
L
 
M
W
 
W
I
 
V
C
 
V
G
 
S
D
 
D
Q
 
N
I
 
L
R
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
W
N
 
N
A
 
S
V
 
V
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
E
 
E
L
 
T
L
 
L
V
 
H
K
 
E
R
 
R
Q
 
G
W
 
L
L
 
V
R
 
R
S
 
P
P
 
T
A
 
A

4r3nA Crystal structure of the ternary complex of sp-asadh with NADP and 1, 2,3-benzenetricarboxylic acid (see paper)
48% identity, 96% coverage: 13:351/354 of query aligns to 1:350/357 of 4r3nA

query
sites
4r3nA
G
 
G
Y
 
Y
R
 
T
V
 
V
A
 
A
I
 
V
L
 
V
G
|
G
A
 
A
T
|
T
G
|
G
A
|
A
V
|
V
G
 
G
T
 
A
E
 
Q
L
 
M
L
 
I
Q
 
K
I
 
M
L
 
L
E
 
E
E
 
E
R
 
S
Q
 
T
F
 
L
P
 
P
I
 
I
A
 
D
E
 
K
L
 
I
R
 
R
L
 
Y
L
 
L
A
|
A
S
|
S
P
 
A
R
 
R
S
|
S
A
 
A
G
 
G
Q
 
K
T
 
S
L
 
L
T
 
K
F
 
F
A
 
K
G
 
D
E
 
Q
T
 
D
L
 
I
T
 
T
I
 
I
Q
 
E
E
 
E
A
x
T
T
 
T
P
 
E
S
 
T
A
 
A
F
 
F
Q
 
E
G
 
G
L
 
V
D
 
D
I
 
I
V
 
A
L
 
L
A
 
F
S
|
S
A
|
A
G
|
G
G
x
S
S
 
S
T
 
T
S
 
S
K
 
A
A
 
K
L
 
Y
A
 
A
E
 
P
A
 
Y
I
 
A
V
 
V
A
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
V
V
 
V
M
 
V
I
 
V
D
 
D
N
|
N
S
x
T
S
|
S
A
 
Y
F
 
F
R
|
R
M
 
Q
D
 
N
P
 
P
T
 
D
V
 
V
P
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
V
N
 
N
P
 
A
E
 
H
A
 
A
A
 
L
A
 
D
Q
 
A
H
 
H
Q
 
N
G
 
G
I
 
I
I
 
I
A
 
A
N
 
C
P
 
P
N
|
N
C
|
C
T
 
S
T
 
T
I
 
I
L
 
Q
M
 
M
A
 
M
I
 
V
A
 
A
L
 
L
W
 
E
P
 
P
L
 
V
Q
 
R
Q
 
Q
R
 
K
H
 
W
P
 
G
I
 
L
R
 
D
R
 
R
I
 
I
V
 
I
V
 
V
S
 
S
T
 
T
Y
 
Y
Q
|
Q
S
 
A
A
 
V
S
 
S
G
 
G
A
 
A
G
|
G
A
x
M
R
 
G
A
 
A
M
 
I
A
 
L
E
 
E
V
 
T
Q
 
Q
E
 
R
Q
 
E
S
 
L
R
 
R
A
 
E
I
 
V
L
 
L
A
 
N
G
 
D
-
 
G
-
 
V
Q
 
K
P
 
P
A
 
C
I
 
D
-
 
L
-
 
H
A
 
A
E
 
E
I
 
I
L
 
L
P
 
P
-
 
S
-
 
G
-
 
G
-
 
D
-
 
K
-
 
K
-
 
H
Y
 
Y
P
 
P
L
 
I
A
 
A
F
 
F
N
 
N
L
 
A
F
 
L
P
 
P
H
 
Q
N
 
I
S
 
D
P
 
V
L
 
F
T
 
T
E
 
D
S
 
N
G
 
D
Y
 
Y
C
 
T
E
 
Y
E
 
E
E
 
E
L
 
M
K
|
K
M
 
M
L
 
T
N
 
K
E
 
E
S
 
T
R
 
K
K
 
K
I
 
I
F
 
M
G
 
E
L
 
D
P
 
D
D
 
S
L
 
I
K
 
A
L
 
V
T
 
S
A
 
A
T
 
T
C
 
C
V
 
V
R
|
R
V
 
I
P
 
P
V
 
V
L
 
L
R
 
S
A
 
A
H
|
H
S
 
S
E
 
E
A
 
S
I
 
V
N
 
Y
V
 
I
E
 
E
F
 
T
T
 
K
E
 
E
P
 
V
F
 
A
S
 
P
V
 
I
A
 
E
E
 
E
A
 
V
R
 
K
E
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
F
P
 
P
G
 
G
A
 
A
R
 
V
L
 
L
L
 
E
E
 
D
D
 
D
W
 
V
D
 
A
R
 
H
N
 
Q
Y
 
I
F
 
Y
P
 
P
M
 
Q
P
 
A
I
 
I
E
 
N
A
 
A
S
 
V
G
 
G
E
 
S
D
 
R
D
 
D
V
 
T
L
 
F
V
 
V
G
 
G
R
 
R
I
 
I
R
 
R
Q
 
K
D
 
D
L
 
L
S
 
D
E
 
A
P
 
E
N
 
K
A
 
G
L
 
I
E
 
H
L
 
M
W
 
W
I
 
V
C
 
V
G
 
S
D
 
D
Q
 
N
I
 
L
R
 
L
K
 
K
G
|
G
A
 
A
A
 
A
L
 
W
N
 
N
A
 
S
V
 
V
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
E
 
E
L
 
T
L
 
L
V
 
H
K
 
E
R
 
R
Q
 
G
W
 
L
L
 
V
R
 
R
S
 
P
P
 
T
A
 
A

3q1lA Crystals structure of aspartate beta-semialdehyde dehydrogenase from streptococcus pneumoniae with cysteamine bound covalently to cys 128 (see paper)
48% identity, 96% coverage: 13:351/354 of query aligns to 1:350/357 of 3q1lA

query
sites
3q1lA
G
 
G
Y
 
Y
R
 
T
V
 
V
A
 
A
I
 
V
L
 
V
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
A
V
 
V
G
 
G
T
 
A
E
 
Q
L
 
M
L
 
I
Q
 
K
I
 
M
L
 
L
E
 
E
E
 
E
R
 
S
Q
 
T
F
 
L
P
 
P
I
 
I
A
 
D
E
 
K
L
 
I
R
 
R
L
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
A
R
 
R
S
 
S
A
 
A
G
 
G
Q
 
K
T
 
S
L
 
L
T
 
K
F
 
F
A
 
K
G
 
D
E
 
Q
T
 
D
L
 
I
T
 
T
I
 
I
Q
 
E
E
 
E
A
 
T
T
 
T
P
 
E
S
 
T
A
 
A
F
 
F
Q
 
E
G
 
G
L
 
V
D
 
D
I
 
I
V
 
A
L
 
L
A
 
F
S
 
S
A
 
A
G
 
G
G
 
S
S
 
S
T
 
T
S
 
S
K
 
A
A
 
K
L
 
Y
A
 
A
E
 
P
A
 
Y
I
 
A
V
 
V
A
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
V
V
 
V
M
 
V
I
 
V
D
 
D
N
 
N
S
 
T
S
 
S
A
 
Y
F
 
F
R
 
R
M
 
Q
D
 
N
P
 
P
T
 
D
V
 
V
P
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
V
N
 
N
P
 
A
E
 
H
A
 
A
A
 
L
A
 
D
Q
 
A
H
 
H
Q
 
N
G
 
G
I
 
I
I
 
I
A
 
A
N
 
C
P
 
P
N
|
N
C
|
C
T
 
S
T
 
T
I
 
I
L
 
Q
M
 
M
A
 
M
I
 
V
A
 
A
L
 
L
W
 
E
P
 
P
L
 
V
Q
 
R
Q
 
Q
R
 
K
H
 
W
P
 
G
I
 
L
R
 
D
R
 
R
I
 
I
V
 
I
V
 
V
S
 
S
T
 
T
Y
 
Y
Q
|
Q
S
 
A
A
 
V
S
 
S
G
|
G
A
 
A
G
 
G
A
 
M
R
 
G
A
 
A
M
 
I
A
 
L
E
 
E
V
 
T
Q
 
Q
E
 
R
Q
 
E
S
 
L
R
 
R
A
 
E
I
 
V
L
 
L
A
 
N
G
 
D
-
 
G
-
 
V
Q
 
K
P
 
P
A
 
C
I
 
D
-
 
L
-
 
H
A
 
A
E
 
E
I
 
I
L
 
L
P
 
P
-
 
S
-
 
G
-
 
G
-
 
D
-
 
K
-
 
K
-
 
H
Y
 
Y
P
 
P
L
 
I
A
 
A
F
 
F
N
 
N
L
 
A
F
 
L
P
 
P
H
 
Q
N
 
I
S
 
D
P
 
V
L
 
F
T
 
T
E
 
D
S
 
N
G
 
D
Y
 
Y
C
 
T
E
 
Y
E
|
E
E
 
E
L
 
M
K
 
K
M
 
M
L
 
T
N
 
K
E
 
E
S
 
T
R
 
K
K
 
K
I
 
I
F
 
M
G
 
E
L
 
D
P
 
D
D
 
S
L
 
I
K
 
A
L
 
V
T
 
S
A
 
A
T
 
T
C
 
C
V
 
V
R
|
R
V
 
I
P
 
P
V
 
V
L
 
L
R
 
S
A
 
A
H
|
H
S
 
S
E
 
E
A
 
S
I
 
V
N
 
Y
V
 
I
E
 
E
F
 
T
T
 
K
E
 
E
P
 
V
F
 
A
S
 
P
V
 
I
A
 
E
E
 
E
A
 
V
R
 
K
E
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
F
P
 
P
G
 
G
A
 
A
R
 
V
L
 
L
L
 
E
E
 
D
D
 
D
W
 
V
D
 
A
R
 
H
N
 
Q
Y
 
I
F
 
Y
P
 
P
M
 
Q
P
 
A
I
 
I
E
 
N
A
 
A
S
 
V
G
 
G
E
 
S
D
 
R
D
 
D
V
 
T
L
 
F
V
 
V
G
 
G
R
 
R
I
 
I
R
 
R
Q
 
K
D
 
D
L
 
L
S
 
D
E
 
A
P
 
E
N
 
K
A
 
G
L
 
I
E
 
H
L
 
M
W
 
W
I
 
V
C
 
V
G
 
S
D
 
D
Q
 
N
I
 
L
R
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
W
N
 
N
A
 
S
V
 
V
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
E
 
E
L
 
T
L
 
L
V
 
H
K
 
E
R
 
R
Q
 
G
W
 
L
L
 
V
R
 
R
S
 
P
P
 
T
A
 
A

3pwsA Crystal structure of aspartate beta-semialdehide dehydrogenase from streptococcus pneumoniae with 2',5'-adenosine diphosphate and d-2- aminoadipate (see paper)
48% identity, 96% coverage: 13:351/354 of query aligns to 1:350/357 of 3pwsA

query
sites
3pwsA
G
 
G
Y
 
Y
R
 
T
V
 
V
A
 
A
I
 
V
L
 
V
G
|
G
A
 
A
T
|
T
G
|
G
A
|
A
V
 
V
G
 
G
T
 
A
E
 
Q
L
 
M
L
 
I
Q
 
K
I
 
M
L
 
L
E
 
E
E
 
E
R
 
S
Q
 
T
F
 
L
P
 
P
I
 
I
A
 
D
E
 
K
L
 
I
R
 
R
L
 
Y
L
 
L
A
|
A
S
|
S
P
 
A
R
|
R
S
|
S
A
 
A
G
 
G
Q
 
K
T
 
S
L
 
L
T
 
K
F
 
F
A
 
K
G
 
D
E
 
Q
T
 
D
L
 
I
T
 
T
I
 
I
Q
 
E
E
 
E
A
x
T
T
 
T
P
 
E
S
 
T
A
 
A
F
 
F
Q
 
E
G
 
G
L
 
V
D
 
D
I
 
I
V
 
A
L
 
L
A
 
F
S
 
S
A
|
A
G
 
G
G
 
S
S
 
S
T
|
T
S
 
S
K
 
A
A
 
K
L
 
Y
A
 
A
E
 
P
A
 
Y
I
 
A
V
 
V
A
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
V
V
 
V
M
 
V
I
 
V
D
 
D
N
 
N
S
 
T
S
 
S
A
 
Y
F
 
F
R
|
R
M
 
Q
D
 
N
P
 
P
T
 
D
V
 
V
P
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
V
N
 
N
P
 
A
E
 
H
A
 
A
A
 
L
A
 
D
Q
 
A
H
 
H
Q
 
N
G
 
G
I
 
I
I
 
I
A
 
A
N
 
C
P
 
P
N
|
N
C
 
C
T
 
S
T
 
T
I
 
I
L
 
Q
M
 
M
A
 
M
I
 
V
A
 
A
L
 
L
W
 
E
P
 
P
L
 
V
Q
 
R
Q
 
Q
R
 
K
H
 
W
P
 
G
I
 
L
R
 
D
R
 
R
I
 
I
V
 
I
V
 
V
S
 
S
T
 
T
Y
 
Y
Q
 
Q
S
 
A
A
 
V
S
 
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
A
x
M
R
 
G
A
 
A
M
 
I
A
 
L
E
 
E
V
 
T
Q
 
Q
E
 
R
Q
 
E
S
 
L
R
 
R
A
 
E
I
 
V
L
 
L
A
 
N
G
 
D
-
 
G
-
 
V
Q
 
K
P
 
P
A
 
C
I
 
D
-
 
L
-
 
H
A
 
A
E
 
E
I
 
I
L
 
L
P
 
P
-
 
S
-
 
G
-
 
G
-
 
D
-
 
K
-
 
K
-
 
H
Y
 
Y
P
 
P
L
 
I
A
 
A
F
 
F
N
 
N
L
 
A
F
 
L
P
 
P
H
 
Q
N
x
I
S
 
D
P
 
V
L
 
F
T
 
T
E
 
D
S
 
N
G
 
D
Y
 
Y
C
 
T
E
 
Y
E
|
E
E
 
E
L
 
M
K
|
K
M
 
M
L
 
T
N
 
K
E
 
E
S
 
T
R
 
K
K
 
K
I
 
I
F
 
M
G
 
E
L
 
D
P
 
D
D
 
S
L
 
I
K
 
A
L
 
V
T
 
S
A
 
A
T
 
T
C
 
C
V
 
V
R
|
R
V
 
I
P
 
P
V
 
V
L
 
L
R
 
S
A
 
A
H
 
H
S
 
S
E
 
E
A
 
S
I
 
V
N
 
Y
V
 
I
E
 
E
F
 
T
T
 
K
E
 
E
P
 
V
F
 
A
S
 
P
V
 
I
A
 
E
E
 
E
A
 
V
R
 
K
E
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
F
P
 
P
G
 
G
A
 
A
R
 
V
L
 
L
L
 
E
E
 
D
D
 
D
W
 
V
D
 
A
R
 
H
N
 
Q
Y
 
I
F
 
Y
P
 
P
M
 
Q
P
 
A
I
 
I
E
 
N
A
 
A
S
 
V
G
 
G
E
 
S
D
 
R
D
 
D
V
 
T
L
 
F
V
 
V
G
 
G
R
 
R
I
 
I
R
 
R
Q
 
K
D
 
D
L
 
L
S
 
D
E
 
A
P
 
E
N
 
K
A
 
G
L
 
I
E
 
H
L
 
M
W
 
W
I
 
V
C
 
V
G
 
S
D
 
D
Q
 
N
I
 
L
R
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
W
N
 
N
A
 
S
V
 
V
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
E
 
E
L
 
T
L
 
L
V
 
H
K
 
E
R
 
R
Q
 
G
W
 
L
L
 
V
R
 
R
S
 
P
P
 
T
A
 
A

3pwkA Crystal structure of aspartate beta-semialdehide dehydrogenase from streptococcus pneumoniae with 2',5'-adenosine diphosphate and d-2- aminoadipate (see paper)
48% identity, 96% coverage: 13:351/354 of query aligns to 1:350/357 of 3pwkA

query
sites
3pwkA
G
 
G
Y
 
Y
R
 
T
V
 
V
A
 
A
I
 
V
L
 
V
G
|
G
A
 
A
T
|
T
G
|
G
A
|
A
V
 
V
G
 
G
T
 
A
E
 
Q
L
 
M
L
 
I
Q
 
K
I
 
M
L
 
L
E
 
E
E
 
E
R
 
S
Q
 
T
F
 
L
P
 
P
I
 
I
A
 
D
E
 
K
L
 
I
R
 
R
L
 
Y
L
 
L
A
|
A
S
|
S
P
 
A
R
|
R
S
|
S
A
 
A
G
 
G
Q
 
K
T
 
S
L
 
L
T
 
K
F
 
F
A
 
K
G
 
D
E
 
Q
T
 
D
L
 
I
T
 
T
I
 
I
Q
 
E
E
 
E
A
x
T
T
 
T
P
 
E
S
 
T
A
 
A
F
 
F
Q
 
E
G
 
G
L
 
V
D
 
D
I
 
I
V
 
A
L
 
L
A
 
F
S
 
S
A
|
A
G
 
G
G
 
S
S
 
S
T
|
T
S
 
S
K
 
A
A
 
K
L
 
Y
A
 
A
E
 
P
A
 
Y
I
 
A
V
 
V
A
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
V
V
 
V
M
 
V
I
 
V
D
 
D
N
 
N
S
 
T
S
 
S
A
 
Y
F
 
F
R
|
R
M
 
Q
D
 
N
P
 
P
T
 
D
V
 
V
P
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
V
N
 
N
P
 
A
E
 
H
A
 
A
A
 
L
A
 
D
Q
 
A
H
 
H
Q
 
N
G
 
G
I
 
I
I
 
I
A
 
A
N
 
C
P
 
P
N
|
N
C
 
C
T
 
S
T
 
T
I
 
I
L
 
Q
M
 
M
A
 
M
I
 
V
A
 
A
L
 
L
W
 
E
P
 
P
L
 
V
Q
 
R
Q
 
Q
R
 
K
H
 
W
P
 
G
I
 
L
R
 
D
R
 
R
I
 
I
V
 
I
V
 
V
S
 
S
T
 
T
Y
 
Y
Q
 
Q
S
 
A
A
 
V
S
 
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
A
 
M
R
 
G
A
 
A
M
 
I
A
 
L
E
 
E
V
 
T
Q
 
Q
E
 
R
Q
 
E
S
 
L
R
 
R
A
 
E
I
 
V
L
 
L
A
 
N
G
 
D
-
 
G
-
 
V
Q
 
K
P
 
P
A
 
C
I
 
D
-
 
L
-
 
H
A
 
A
E
 
E
I
 
I
L
 
L
P
 
P
-
 
S
-
 
G
-
 
G
-
 
D
-
 
K
-
 
K
-
 
H
Y
 
Y
P
 
P
L
 
I
A
 
A
F
 
F
N
 
N
L
 
A
F
 
L
P
 
P
H
 
Q
N
 
I
S
 
D
P
 
V
L
 
F
T
 
T
E
 
D
S
 
N
G
 
D
Y
 
Y
C
 
T
E
 
Y
E
|
E
E
 
E
L
 
M
K
|
K
M
 
M
L
 
T
N
 
K
E
 
E
S
 
T
R
 
K
K
 
K
I
 
I
F
 
M
G
 
E
L
 
D
P
 
D
D
 
S
L
 
I
K
 
A
L
 
V
T
 
S
A
 
A
T
 
T
C
 
C
V
 
V
R
|
R
V
 
I
P
 
P
V
 
V
L
 
L
R
 
S
A
 
A
H
 
H
S
 
S
E
 
E
A
 
S
I
 
V
N
 
Y
V
 
I
E
 
E
F
 
T
T
 
K
E
 
E
P
 
V
F
 
A
S
 
P
V
 
I
A
 
E
E
 
E
A
 
V
R
 
K
E
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
F
P
 
P
G
 
G
A
 
A
R
 
V
L
 
L
L
 
E
E
 
D
D
 
D
W
 
V
D
 
A
R
 
H
N
 
Q
Y
 
I
F
 
Y
P
 
P
M
 
Q
P
 
A
I
 
I
E
 
N
A
 
A
S
 
V
G
 
G
E
 
S
D
 
R
D
 
D
V
 
T
L
 
F
V
 
V
G
 
G
R
 
R
I
 
I
R
 
R
Q
 
K
D
 
D
L
 
L
S
 
D
E
 
A
P
 
E
N
 
K
A
 
G
L
 
I
E
 
H
L
 
M
W
 
W
I
 
V
C
 
V
G
 
S
D
 
D
Q
 
N
I
 
L
R
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
W
N
 
N
A
 
S
V
 
V
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
E
 
E
L
 
T
L
 
L
V
 
H
K
 
E
R
 
R
Q
 
G
W
 
L
L
 
V
R
 
R
S
 
P
P
 
T
A
 
A

2gz3A Structure of aspartate semialdehyde dehydrogenase (asadh) from streptococcus pneumoniae complexed with NADP and aspartate- semialdehyde (see paper)
48% identity, 96% coverage: 13:351/354 of query aligns to 1:350/357 of 2gz3A

query
sites
2gz3A
G
 
G
Y
 
Y
R
 
T
V
 
V
A
 
A
I
 
V
L
 
V
G
|
G
A
 
A
T
|
T
G
|
G
A
|
A
V
|
V
G
 
G
T
 
A
E
 
Q
L
 
M
L
 
I
Q
 
K
I
 
M
L
 
L
E
 
E
E
 
E
R
 
S
Q
 
T
F
 
L
P
 
P
I
 
I
A
 
D
E
 
K
L
 
I
R
 
R
L
 
Y
L
 
L
A
|
A
S
|
S
P
 
A
R
|
R
S
|
S
A
 
A
G
 
G
Q
 
K
T
 
S
L
 
L
T
 
K
F
 
F
A
 
K
G
 
D
E
 
Q
T
 
D
L
 
I
T
 
T
I
 
I
Q
 
E
E
 
E
A
x
T
T
 
T
P
 
E
S
 
T
A
 
A
F
 
F
Q
 
E
G
 
G
L
 
V
D
 
D
I
 
I
V
 
A
L
 
L
A
 
F
S
|
S
A
|
A
G
|
G
G
 
S
S
 
S
T
|
T
S
 
S
K
 
A
A
 
K
L
 
Y
A
 
A
E
 
P
A
 
Y
I
 
A
V
 
V
A
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
V
V
 
V
M
 
V
I
 
V
D
 
D
N
|
N
S
 
T
S
 
S
A
 
Y
F
 
F
R
 
R
M
 
Q
D
 
N
P
 
P
T
 
D
V
 
V
P
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
V
N
 
N
P
 
A
E
 
H
A
 
A
A
 
L
A
 
D
Q
 
A
H
 
H
Q
 
N
G
 
G
I
 
I
I
 
I
A
 
A
N
 
C
P
 
P
N
 
N
C
|
C
T
 
S
T
 
T
I
 
I
L
 
Q
M
 
M
A
 
M
I
 
V
A
 
A
L
 
L
W
 
E
P
 
P
L
 
V
Q
 
R
Q
 
Q
R
 
K
H
 
W
P
 
G
I
 
L
R
 
D
R
 
R
I
 
I
V
 
I
V
 
V
S
 
S
T
 
T
Y
 
Y
Q
|
Q
S
 
A
A
 
V
S
 
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
A
x
M
R
 
G
A
 
A
M
 
I
A
 
L
E
 
E
V
 
T
Q
 
Q
E
 
R
Q
 
E
S
 
L
R
 
R
A
 
E
I
 
V
L
 
L
A
 
N
G
 
D
-
 
G
-
 
V
Q
 
K
P
 
P
A
 
C
I
 
D
-
 
L
-
 
H
A
 
A
E
 
E
I
 
I
L
 
L
P
 
P
-
 
S
-
 
G
-
 
G
-
 
D
-
 
K
-
 
K
-
 
H
Y
 
Y
P
 
P
L
 
I
A
 
A
F
 
F
N
 
N
L
 
A
F
 
L
P
 
P
H
 
Q
N
 
I
S
 
D
P
 
V
L
 
F
T
 
T
E
 
D
S
 
N
G
 
D
Y
 
Y
C
 
T
E
 
Y
E
|
E
E
 
E
L
 
M
K
 
K
M
 
M
L
 
T
N
 
K
E
 
E
S
 
T
R
 
K
K
 
K
I
 
I
F
 
M
G
 
E
L
 
D
P
 
D
D
 
S
L
 
I
K
 
A
L
 
V
T
 
S
A
 
A
T
 
T
C
 
C
V
 
V
R
|
R
V
 
I
P
 
P
V
 
V
L
 
L
R
 
S
A
 
A
H
|
H
S
 
S
E
 
E
A
 
S
I
 
V
N
 
Y
V
 
I
E
 
E
F
 
T
T
 
K
E
 
E
P
 
V
F
 
A
S
 
P
V
 
I
A
 
E
E
 
E
A
 
V
R
 
K
E
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
F
P
 
P
G
 
G
A
 
A
R
 
V
L
 
L
L
 
E
E
 
D
D
 
D
W
 
V
D
 
A
R
 
H
N
 
Q
Y
 
I
F
 
Y
P
 
P
M
 
Q
P
 
A
I
 
I
E
 
N
A
 
A
S
 
V
G
 
G
E
 
S
D
 
R
D
 
D
V
 
T
L
 
F
V
 
V
G
 
G
R
 
R
I
 
I
R
 
R
Q
 
K
D
 
D
L
 
L
S
 
D
E
 
A
P
 
E
N
 
K
A
 
G
L
 
I
E
 
H
L
 
M
W
 
W
I
 
V
C
 
V
G
 
S
D
 
D
Q
x
N
I
 
L
R
 
L
K
 
K
G
 
G
A
|
A
A
 
A
L
 
W
N
 
N
A
 
S
V
 
V
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
E
 
E
L
 
T
L
 
L
V
 
H
K
 
E
R
 
R
Q
 
G
W
 
L
L
 
V
R
 
R
S
 
P
P
 
T
A
 
A

2gz2A Structure of aspartate semialdehyde dehydrogenase (asadh) from streptococcus pneumoniae complexed with 2',5'-adp (see paper)
48% identity, 96% coverage: 13:351/354 of query aligns to 1:350/357 of 2gz2A

query
sites
2gz2A
G
 
G
Y
 
Y
R
 
T
V
 
V
A
 
A
I
 
V
L
 
V
G
|
G
A
 
A
T
|
T
G
|
G
A
 
A
V
 
V
G
 
G
T
 
A
E
 
Q
L
 
M
L
 
I
Q
 
K
I
 
M
L
 
L
E
 
E
E
 
E
R
 
S
Q
 
T
F
 
L
P
 
P
I
 
I
A
 
D
E
 
K
L
 
I
R
 
R
L
 
Y
L
 
L
A
|
A
S
|
S
P
 
A
R
|
R
S
|
S
A
 
A
G
 
G
Q
 
K
T
 
S
L
 
L
T
 
K
F
 
F
A
 
K
G
 
D
E
 
Q
T
 
D
L
 
I
T
 
T
I
 
I
Q
 
E
E
 
E
A
x
T
T
 
T
P
 
E
S
 
T
A
 
A
F
 
F
Q
 
E
G
 
G
L
 
V
D
 
D
I
 
I
V
 
A
L
 
L
A
 
F
S
 
S
A
|
A
G
 
G
G
 
S
S
 
S
T
|
T
S
 
S
K
 
A
A
 
K
L
 
Y
A
 
A
E
 
P
A
 
Y
I
 
A
V
 
V
A
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
V
V
 
V
M
 
V
I
 
V
D
 
D
N
 
N
S
 
T
S
 
S
A
 
Y
F
 
F
R
 
R
M
 
Q
D
 
N
P
 
P
T
 
D
V
 
V
P
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
V
N
 
N
P
 
A
E
 
H
A
 
A
A
 
L
A
 
D
Q
 
A
H
 
H
Q
 
N
G
 
G
I
 
I
I
 
I
A
 
A
N
 
C
P
 
P
N
 
N
C
|
C
T
 
S
T
 
T
I
 
I
L
 
Q
M
 
M
A
 
M
I
 
V
A
 
A
L
 
L
W
 
E
P
 
P
L
 
V
Q
 
R
Q
 
Q
R
 
K
H
 
W
P
 
G
I
 
L
R
 
D
R
 
R
I
 
I
V
 
I
V
 
V
S
 
S
T
 
T
Y
 
Y
Q
|
Q
S
 
A
A
 
V
S
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
M
R
 
G
A
 
A
M
 
I
A
 
L
E
 
E
V
 
T
Q
 
Q
E
 
R
Q
 
E
S
 
L
R
 
R
A
 
E
I
 
V
L
 
L
A
 
N
G
 
D
-
 
G
-
 
V
Q
 
K
P
 
P
A
 
C
I
 
D
-
 
L
-
 
H
A
 
A
E
 
E
I
 
I
L
 
L
P
 
P
-
 
S
-
 
G
-
 
G
-
 
D
-
 
K
-
 
K
-
 
H
Y
 
Y
P
 
P
L
 
I
A
 
A
F
 
F
N
 
N
L
 
A
F
 
L
P
 
P
H
 
Q
N
 
I
S
 
D
P
 
V
L
 
F
T
 
T
E
 
D
S
 
N
G
 
D
Y
 
Y
C
 
T
E
 
Y
E
 
E
E
 
E
L
 
M
K
 
K
M
 
M
L
 
T
N
 
K
E
 
E
S
 
T
R
 
K
K
 
K
I
 
I
F
 
M
G
 
E
L
 
D
P
 
D
D
 
S
L
 
I
K
 
A
L
 
V
T
 
S
A
 
A
T
 
T
C
 
C
V
 
V
R
|
R
V
 
I
P
 
P
V
 
V
L
 
L
R
 
S
A
 
A
H
|
H
S
 
S
E
 
E
A
 
S
I
 
V
N
 
Y
V
 
I
E
 
E
F
 
T
T
 
K
E
 
E
P
 
V
F
 
A
S
 
P
V
 
I
A
 
E
E
 
E
A
 
V
R
 
K
E
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
F
P
 
P
G
 
G
A
 
A
R
 
V
L
 
L
L
 
E
E
 
D
D
 
D
W
 
V
D
 
A
R
 
H
N
 
Q
Y
 
I
F
 
Y
P
 
P
M
 
Q
P
 
A
I
 
I
E
 
N
A
 
A
S
 
V
G
 
G
E
 
S
D
 
R
D
 
D
V
 
T
L
 
F
V
 
V
G
 
G
R
 
R
I
 
I
R
 
R
Q
 
K
D
 
D
L
 
L
S
 
D
E
 
A
P
 
E
N
 
K
A
 
G
L
 
I
E
 
H
L
 
M
W
 
W
I
 
V
C
 
V
G
 
S
D
 
D
Q
 
N
I
 
L
R
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
W
N
 
N
A
 
S
V
 
V
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
E
 
E
L
 
T
L
 
L
V
 
H
K
 
E
R
 
R
Q
 
G
W
 
L
L
 
V
R
 
R
S
 
P
P
 
T
A
 
A

2gz1A Structure of aspartate semialdehyde dehydrogenase (asadh) from streptococcus pneumoniae complexed with NADP (see paper)
48% identity, 96% coverage: 13:351/354 of query aligns to 1:350/357 of 2gz1A

query
sites
2gz1A
G
 
G
Y
 
Y
R
 
T
V
 
V
A
 
A
I
 
V
L
 
V
G
|
G
A
 
A
T
|
T
G
|
G
A
|
A
V
|
V
G
 
G
T
 
A
E
 
Q
L
 
M
L
 
I
Q
 
K
I
 
M
L
 
L
E
 
E
E
 
E
R
 
S
Q
 
T
F
 
L
P
 
P
I
 
I
A
 
D
E
 
K
L
 
I
R
 
R
L
 
Y
L
 
L
A
|
A
S
|
S
P
 
A
R
|
R
S
|
S
A
 
A
G
 
G
Q
 
K
T
 
S
L
 
L
T
 
K
F
 
F
A
 
K
G
 
D
E
 
Q
T
 
D
L
 
I
T
 
T
I
 
I
Q
 
E
E
 
E
A
x
T
T
 
T
P
 
E
S
 
T
A
 
A
F
 
F
Q
 
E
G
 
G
L
 
V
D
 
D
I
 
I
V
 
A
L
 
L
A
 
F
S
|
S
A
|
A
G
|
G
G
 
S
S
 
S
T
|
T
S
 
S
K
 
A
A
 
K
L
 
Y
A
 
A
E
 
P
A
 
Y
I
 
A
V
 
V
A
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
V
V
 
V
M
 
V
I
 
V
D
 
D
N
|
N
S
 
T
S
 
S
A
 
Y
F
 
F
R
 
R
M
 
Q
D
 
N
P
 
P
T
 
D
V
 
V
P
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
V
N
 
N
P
 
A
E
 
H
A
 
A
A
 
L
A
 
D
Q
 
A
H
 
H
Q
 
N
G
 
G
I
 
I
I
 
I
A
 
A
N
 
C
P
 
P
N
 
N
C
|
C
T
 
S
T
 
T
I
 
I
L
 
Q
M
 
M
A
 
M
I
 
V
A
 
A
L
 
L
W
 
E
P
 
P
L
 
V
Q
 
R
Q
 
Q
R
 
K
H
 
W
P
 
G
I
 
L
R
 
D
R
 
R
I
 
I
V
 
I
V
 
V
S
 
S
T
 
T
Y
 
Y
Q
|
Q
S
 
A
A
 
V
S
|
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
A
x
M
R
 
G
A
 
A
M
 
I
A
 
L
E
 
E
V
 
T
Q
 
Q
E
 
R
Q
 
E
S
 
L
R
 
R
A
 
E
I
 
V
L
 
L
A
 
N
G
 
D
-
 
G
-
 
V
Q
 
K
P
 
P
A
 
C
I
 
D
-
 
L
-
 
H
A
 
A
E
 
E
I
 
I
L
 
L
P
 
P
-
 
S
-
 
G
-
 
G
-
 
D
-
 
K
-
 
K
-
 
H
Y
 
Y
P
 
P
L
 
I
A
 
A
F
 
F
N
 
N
L
 
A
F
 
L
P
 
P
H
 
Q
N
 
I
S
 
D
P
 
V
L
 
F
T
 
T
E
 
D
S
 
N
G
 
D
Y
 
Y
C
 
T
E
 
Y
E
 
E
E
 
E
L
 
M
K
 
K
M
 
M
L
 
T
N
 
K
E
 
E
S
 
T
R
 
K
K
 
K
I
 
I
F
 
M
G
 
E
L
 
D
P
 
D
D
 
S
L
 
I
K
 
A
L
 
V
T
 
S
A
 
A
T
 
T
C
 
C
V
 
V
R
|
R
V
 
I
P
 
P
V
 
V
L
 
L
R
 
S
A
 
A
H
|
H
S
 
S
E
 
E
A
 
S
I
 
V
N
 
Y
V
 
I
E
 
E
F
 
T
T
 
K
E
 
E
P
 
V
F
 
A
S
 
P
V
 
I
A
 
E
E
 
E
A
 
V
R
 
K
E
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
F
P
 
P
G
 
G
A
 
A
R
 
V
L
 
L
L
 
E
E
 
D
D
 
D
W
 
V
D
 
A
R
 
H
N
 
Q
Y
 
I
F
 
Y
P
 
P
M
 
Q
P
 
A
I
 
I
E
 
N
A
 
A
S
 
V
G
 
G
E
 
S
D
 
R
D
 
D
V
 
T
L
 
F
V
 
V
G
 
G
R
 
R
I
 
I
R
 
R
Q
 
K
D
 
D
L
 
L
S
 
D
E
 
A
P
 
E
N
 
K
A
 
G
L
 
I
E
 
H
L
 
M
W
 
W
I
 
V
C
 
V
G
 
S
D
 
D
Q
x
N
I
x
L
R
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
W
N
 
N
A
 
S
V
 
V
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
E
 
E
L
 
T
L
 
L
V
 
H
K
 
E
R
 
R
Q
 
G
W
 
L
L
 
V
R
 
R
S
 
P
P
 
T
A
 
A

3pylC Crystal structure of aspartate beta-semialdehide dehydrogenase from streptococcus pneumoniae with d-2,3-diaminopropionate (see paper)
48% identity, 96% coverage: 13:351/354 of query aligns to 1:350/361 of 3pylC

query
sites
3pylC
G
 
G
Y
 
Y
R
 
T
V
 
V
A
 
A
I
 
V
L
 
V
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
A
V
 
V
G
 
G
T
 
A
E
 
Q
L
 
M
L
 
I
Q
 
K
I
 
M
L
 
L
E
 
E
E
 
E
R
 
S
Q
 
T
F
 
L
P
 
P
I
 
I
A
 
D
E
 
K
L
 
I
R
 
R
L
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
A
R
 
R
S
 
S
A
 
A
G
 
G
Q
 
K
T
 
S
L
 
L
T
 
K
F
 
F
A
 
K
G
 
D
E
 
Q
T
 
D
L
 
I
T
 
T
I
 
I
Q
 
E
E
 
E
A
 
T
T
 
T
P
 
E
S
 
T
A
 
A
F
 
F
Q
 
E
G
 
G
L
 
V
D
 
D
I
 
I
V
 
A
L
 
L
A
 
F
S
 
S
A
 
A
G
 
G
G
 
S
S
 
S
T
 
T
S
 
S
K
 
A
A
 
K
L
 
Y
A
 
A
E
 
P
A
 
Y
I
 
A
V
 
V
A
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
V
V
 
V
M
 
V
I
 
V
D
 
D
N
 
N
S
 
T
S
 
S
A
 
Y
F
 
F
R
 
R
M
 
Q
D
 
N
P
 
P
T
 
D
V
 
V
P
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
V
N
 
N
P
 
A
E
 
H
A
 
A
A
 
L
A
 
D
Q
 
A
H
 
H
Q
 
N
G
 
G
I
 
I
I
 
I
A
 
A
N
 
C
P
 
P
N
|
N
C
|
C
T
 
S
T
 
T
I
 
I
L
 
Q
M
 
M
A
 
M
I
 
V
A
 
A
L
 
L
W
 
E
P
 
P
L
 
V
Q
 
R
Q
 
Q
R
 
K
H
 
W
P
 
G
I
 
L
R
 
D
R
 
R
I
 
I
V
 
I
V
 
V
S
 
S
T
 
T
Y
 
Y
Q
 
Q
S
 
A
A
 
V
S
 
S
G
|
G
A
 
A
G
 
G
A
 
M
R
 
G
A
 
A
M
 
I
A
 
L
E
 
E
V
 
T
Q
 
Q
E
 
R
Q
 
E
S
 
L
R
 
R
A
 
E
I
 
V
L
 
L
A
 
N
G
 
D
-
 
G
-
 
V
Q
 
K
P
 
P
A
 
C
I
 
D
-
 
L
-
 
H
A
 
A
E
 
E
I
 
I
L
 
L
P
 
P
-
 
S
-
 
G
-
 
G
-
 
D
-
 
K
-
 
K
-
 
H
Y
 
Y
P
 
P
L
 
I
A
 
A
F
 
F
N
 
N
L
 
A
F
 
L
P
 
P
H
 
Q
N
 
I
S
 
D
P
 
V
L
 
F
T
 
T
E
 
D
S
 
N
G
 
D
Y
 
Y
C
 
T
E
 
Y
E
|
E
E
 
E
L
 
M
K
 
K
M
 
M
L
 
T
N
 
K
E
 
E
S
 
T
R
 
K
K
 
K
I
 
I
F
 
M
G
 
E
L
 
D
P
 
D
D
 
S
L
 
I
K
 
A
L
 
V
T
 
S
A
 
A
T
 
T
C
 
C
V
 
V
R
|
R
V
 
I
P
 
P
V
 
V
L
 
L
R
 
S
A
 
A
H
 
H
S
 
S
E
 
E
A
 
S
I
 
V
N
 
Y
V
 
I
E
 
E
F
 
T
T
 
K
E
 
E
P
 
V
F
 
A
S
 
P
V
 
I
A
 
E
E
 
E
A
 
V
R
 
K
E
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
F
P
 
P
G
 
G
A
 
A
R
 
V
L
 
L
L
 
E
E
 
D
D
 
D
W
 
V
D
 
A
R
 
H
N
 
Q
Y
 
I
F
 
Y
P
 
P
M
 
Q
P
 
A
I
 
I
E
 
N
A
 
A
S
 
V
G
 
G
E
 
S
D
 
R
D
 
D
V
 
T
L
 
F
V
 
V
G
 
G
R
 
R
I
 
I
R
 
R
Q
 
K
D
 
D
L
 
L
S
 
D
E
 
A
P
 
E
N
 
K
A
 
G
L
 
I
E
 
H
L
 
M
W
 
W
I
 
V
C
 
V
G
 
S
D
 
D
Q
 
N
I
 
L
R
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
W
N
 
N
A
 
S
V
 
V
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
E
 
E
L
 
T
L
 
L
V
 
H
K
 
E
R
 
R
Q
 
G
W
 
L
L
 
V
R
 
R
S
 
P
P
 
T
A
 
A

3q11A Crystals structure of aspartate beta-semialdehyde dehydrogenase from streptococcus pneumoniae with NADP and aspartyl beta- difluorophosphonate (see paper)
48% identity, 96% coverage: 13:351/354 of query aligns to 1:350/358 of 3q11A

query
sites
3q11A
G
 
G
Y
 
Y
R
 
T
V
 
V
A
 
A
I
 
V
L
 
V
G
|
G
A
 
A
T
|
T
G
|
G
A
 
A
V
 
V
G
 
G
T
 
A
E
 
Q
L
 
M
L
 
I
Q
 
K
I
 
M
L
 
L
E
 
E
E
 
E
R
 
S
Q
 
T
F
 
L
P
 
P
I
 
I
A
 
D
E
 
K
L
 
I
R
 
R
L
 
Y
L
 
L
A
|
A
S
|
S
P
 
A
R
|
R
S
|
S
A
 
A
G
 
G
Q
 
K
T
 
S
L
 
L
T
 
K
F
 
F
A
 
K
G
 
D
E
 
Q
T
 
D
L
 
I
T
 
T
I
 
I
Q
 
E
E
 
E
A
x
T
T
 
T
P
 
E
S
 
T
A
 
A
F
 
F
Q
 
E
G
 
G
L
 
V
D
 
D
I
 
I
V
 
A
L
 
L
A
 
F
S
 
S
A
|
A
G
 
G
G
 
S
S
 
S
T
|
T
S
 
S
K
 
A
A
 
K
L
 
Y
A
 
A
E
 
P
A
 
Y
I
 
A
V
 
V
A
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
V
V
 
V
M
 
V
I
 
V
D
 
D
N
 
N
S
 
T
S
 
S
A
 
Y
F
 
F
R
|
R
M
 
Q
D
 
N
P
 
P
T
 
D
V
 
V
P
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
V
N
 
N
P
 
A
E
 
H
A
 
A
A
 
L
A
 
D
Q
 
A
H
 
H
Q
 
N
G
 
G
I
 
I
I
 
I
A
 
A
N
 
C
P
 
P
N
|
N
C
|
C
T
 
S
T
 
T
I
 
I
L
 
Q
M
 
M
A
 
M
I
 
V
A
 
A
L
 
L
W
 
E
P
 
P
L
 
V
Q
 
R
Q
 
Q
R
 
K
H
 
W
P
 
G
I
 
L
R
 
D
R
 
R
I
 
I
V
 
I
V
 
V
S
 
S
T
 
T
Y
 
Y
Q
|
Q
S
 
A
A
 
V
S
 
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
A
x
M
R
x
G
A
 
A
M
 
I
A
 
L
E
 
E
V
 
T
Q
 
Q
E
 
R
Q
 
E
S
 
L
R
 
R
A
 
E
I
 
V
L
 
L
A
 
N
G
 
D
-
 
G
-
 
V
Q
 
K
P
 
P
A
 
C
I
 
D
-
 
L
-
 
H
A
 
A
E
 
E
I
 
I
L
 
L
P
 
P
-
 
S
-
 
G
-
 
G
-
 
D
-
 
K
-
 
K
-
 
H
Y
 
Y
P
 
P
L
 
I
A
 
A
F
 
F
N
 
N
L
 
A
F
 
L
P
 
P
H
 
Q
N
 
I
S
 
D
P
 
V
L
 
F
T
 
T
E
 
D
S
 
N
G
 
D
Y
 
Y
C
 
T
E
 
Y
E
|
E
E
 
E
L
 
M
K
|
K
M
 
M
L
 
T
N
 
K
E
 
E
S
 
T
R
 
K
K
 
K
I
 
I
F
 
M
G
 
E
L
 
D
P
 
D
D
 
S
L
 
I
K
 
A
L
 
V
T
 
S
A
 
A
T
 
T
C
 
C
V
 
V
R
|
R
V
 
I
P
 
P
V
 
V
L
 
L
R
 
S
A
 
A
H
 
H
S
 
S
E
 
E
A
 
S
I
 
V
N
 
Y
V
 
I
E
 
E
F
 
T
T
 
K
E
 
E
P
 
V
F
 
A
S
 
P
V
 
I
A
 
E
E
 
E
A
 
V
R
 
K
E
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
F
P
 
P
G
 
G
A
 
A
R
 
V
L
 
L
L
 
E
E
 
D
D
 
D
W
 
V
D
 
A
R
 
H
N
 
Q
Y
 
I
F
 
Y
P
 
P
M
 
Q
P
 
A
I
 
I
E
 
N
A
 
A
S
 
V
G
 
G
E
 
S
D
 
R
D
 
D
V
 
T
L
 
F
V
 
V
G
 
G
R
 
R
I
 
I
R
 
R
Q
 
K
D
 
D
L
 
L
S
 
D
E
 
A
P
 
E
N
 
K
A
 
G
L
 
I
E
 
H
L
 
M
W
 
W
I
 
V
C
 
V
G
 
S
D
 
D
Q
 
N
I
 
L
R
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
W
N
 
N
A
 
S
V
 
V
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
E
 
E
L
 
T
L
 
L
V
 
H
K
 
E
R
 
R
Q
 
G
W
 
L
L
 
V
R
 
R
S
 
P
P
 
T
A
 
A

4r51A Crystal complex structure of sp-aspartate-semialdehyde-dehydrogenase with nicotinamide adenine dinucleotide phosphate and phthalic acid (see paper)
48% identity, 96% coverage: 13:351/354 of query aligns to 1:350/360 of 4r51A

query
sites
4r51A
G
 
G
Y
 
Y
R
 
T
V
 
V
A
 
A
I
 
V
L
 
V
G
|
G
A
 
A
T
|
T
G
|
G
A
|
A
V
|
V
G
 
G
T
 
A
E
 
Q
L
 
M
L
 
I
Q
 
K
I
 
M
L
 
L
E
 
E
E
 
E
R
 
S
Q
 
T
F
 
L
P
 
P
I
 
I
A
 
D
E
 
K
L
 
I
R
 
R
L
 
Y
L
 
L
A
|
A
S
|
S
P
 
A
R
 
R
S
|
S
A
 
A
G
 
G
Q
 
K
T
 
S
L
 
L
T
 
K
F
 
F
A
 
K
G
 
D
E
 
Q
T
 
D
L
 
I
T
 
T
I
 
I
Q
 
E
E
 
E
A
x
T
T
 
T
P
 
E
S
 
T
A
 
A
F
 
F
Q
 
E
G
 
G
L
 
V
D
 
D
I
 
I
V
 
A
L
 
L
A
 
F
S
|
S
A
|
A
G
|
G
G
x
S
S
 
S
T
 
T
S
 
S
K
 
A
A
 
K
L
 
Y
A
 
A
E
 
P
A
 
Y
I
 
A
V
 
V
A
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
V
V
 
V
M
 
V
I
 
V
D
 
D
N
|
N
S
x
T
S
|
S
A
 
Y
F
 
F
R
|
R
M
 
Q
D
 
N
P
 
P
T
 
D
V
 
V
P
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
V
N
 
N