SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Synpcc7942_B2619 FitnessBrowser__SynE:Synpcc7942_B2619 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 11 hits to proteins with known functional sites (download)

3lasA Crystal structure of carbonic anhydrase from streptococcus mutans to 1.4 angstrom resolution
43% identity, 95% coverage: 1:182/192 of query aligns to 3:165/166 of 3lasA

query
sites
3lasA
M
 
M
T
 
S
V
 
Y
L
 
F
T
 
D
E
 
N
V
 
F
L
 
I
E
 
K
A
 
A
N
 
N
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
Y
A
 
V
A
 
D
A
 
L
F
 
H
G
 
G
E
 
-
K
 
T
G
 
A
S
 
H
L
 
L
A
 
P
L
 
L
P
 
K
P
 
P
A
 
K
R
 
T
Q
 
R
F
 
V
A
 
A
I
 
I
L
 
V
T
 
T
C
|
C
M
 
M
D
 
D
A
 
S
R
 
R
L
 
L
D
 
H
P
 
V
A
 
A
Q
 
P
Y
 
A
A
 
L
G
 
G
L
 
L
K
 
A
E
 
L
G
 
G
D
 
D
A
 
A
H
 
H
V
 
I
I
 
L
R
 
R
N
 
N
A
 
A
G
 
G
G
 
G
R
 
R
A
 
V
S
 
T
D
 
D
D
 
D
A
 
V
I
 
I
R
 
R
S
 
S
L
 
L
V
 
V
I
 
I
S
 
S
Y
 
E
K
 
Q
L
 
Q
L
 
L
G
 
G
T
 
T
K
 
S
E
 
E
W
 
I
F
 
V
V
 
V
I
 
L
H
 
H
H
|
H
T
 
T
D
 
D
C
|
C
G
 
G
M
 
A
E
 
Q
F
 
T
F
 
F
T
 
T
N
 
N
S
 
A
V
 
E
I
 
F
G
 
-
S
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
N
 
-
S
 
-
L
 
-
E
 
-
T
 
T
A
 
E
V
 
Q
L
 
L
R
 
K
S
 
R
D
 
D
G
 
L
F
 
A
T
 
V
D
 
D
I
 
A
G
 
G
E
 
-
G
 
-
P
 
-
G
 
-
S
 
-
E
 
-
E
 
D
G
 
Q
K
 
D
Y
 
F
I
 
L
H
 
P
W
 
F
L
 
T
T
 
D
I
 
I
E
 
E
N
 
-
Q
 
-
T
 
-
Q
 
E
S
 
S
V
 
V
V
 
R
E
 
E
D
 
D
V
 
I
Q
 
A
R
 
L
I
 
L
R
 
K
R
 
N
H
 
S
P
 
P
L
 
L
V
 
I
P
 
P
S
 
E
N
 
D
I
 
I
P
 
I
I
 
I
Y
 
S
G
 
G
Y
 
A
L
 
I
Y
 
Y
D
 
D
V
 
V
R
 
D
S
 
T
G
 
G
R
 
R
L
 
V
I
 
R
E
 
E
V
 
V

6jqcA The structural basis of the beta-carbonic anhydrase cafc (wild type) of the filamentous fungus aspergillus fumigatus (see paper)
46% identity, 84% coverage: 21:182/192 of query aligns to 20:160/164 of 6jqcA

query
sites
6jqcA
K
 
K
G
 
G
S
 
H
L
 
L
A
 
P
L
 
L
P
 
P
P
 
P
A
 
K
R
 
R
Q
 
K
F
 
L
A
 
A
I
 
V
L
 
V
T
 
T
C
|
C
M
 
M
D
 
D
A
 
A
R
 
R
L
 
I
D
 
D
P
 
V
A
 
F
Q
 
S
Y
 
V
A
 
L
G
 
G
L
 
L
K
 
T
E
 
E
G
 
G
D
 
D
A
 
A
H
 
H
V
 
V
I
 
I
R
 
R
N
 
N
A
 
A
G
 
G
G
 
G
R
 
R
A
 
A
S
 
S
D
 
-
D
 
E
A
 
A
I
 
L
R
 
R
S
 
S
L
 
L
V
 
I
I
 
I
S
 
S
Y
 
Q
K
 
R
L
 
L
L
 
L
G
 
G
T
 
T
K
 
E
E
 
E
W
 
V
F
 
V
V
 
V
I
 
I
H
 
H
H
|
H
T
 
T
D
 
D
C
|
C
G
 
G
M
 
M
E
 
L
F
 
T
F
 
F
T
 
S
N
 
D
S
 
E
V
 
D
I
 
I
G
 
R
S
 
A
L
 
K
L
 
I
A
 
R
N
 
E
S
 
E
L
 
L
E
 
-
T
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
-
R
 
-
S
 
-
D
 
-
G
 
-
F
 
-
T
 
-
D
 
-
I
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
P
 
-
G
 
-
S
 
G
E
 
E
E
 
D
G
 
A
K
 
S
Y
 
D
I
 
I
H
 
K
W
 
F
L
 
L
T
 
P
I
 
F
E
 
R
N
 
D
Q
 
L
T
 
E
Q
 
A
S
 
S
V
 
V
V
 
R
E
 
E
D
 
D
V
 
V
Q
 
R
R
 
F
I
 
L
R
 
R
R
 
G
H
 
S
P
 
R
L
 
L
V
 
V
P
 
Q
S
 
G
N
 
N
I
 
V
P
 
T
I
 
-
Y
 
-
G
 
G
Y
 
Y
L
 
V
Y
 
Y
D
 
E
V
 
V
R
 
E
S
 
R
G
 
G
R
 
R
L
 
L
I
 
V
E
 
R
V
 
L

P9WPJ7 Beta-carbonic anhydrase 1; Beta-CA 1; Carbonate dehydratase 1; mtCA 1; EC 4.2.1.1 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
39% identity, 95% coverage: 1:182/192 of query aligns to 1:161/163 of P9WPJ7

query
sites
P9WPJ7
M
 
M
T
 
T
V
 
V
L
 
T
T
 
D
E
 
D
V
 
Y
L
 
L
E
 
A
A
 
N
N
 
N
Q
 
V
A
 
D
Y
 
Y
A
 
A
A
 
S
A
 
G
F
 
F
G
 
-
E
 
-
K
 
K
G
 
G
S
 
P
L
 
L
A
 
P
L
 
M
P
 
P
P
 
P
A
 
S
R
 
K
Q
 
H
F
 
I
A
 
A
I
 
I
L
 
V
T
 
A
C
|
C
M
 
M
D
|
D
A
 
A
R
 
R
L
 
L
D
 
D
P
 
V
A
 
Y
Q
 
R
Y
 
M
A
 
L
G
 
G
L
 
I
K
 
K
E
 
E
G
 
G
D
 
E
A
 
A
H
 
H
V
 
V
I
 
I
R
 
R
N
 
N
A
 
A
G
 
G
G
 
C
R
 
V
A
 
V
S
 
T
D
 
D
D
 
D
A
 
V
I
 
I
R
 
R
S
 
S
L
 
L
V
 
A
I
 
I
S
 
S
Y
 
Q
K
 
R
L
 
L
L
 
L
G
 
G
T
 
T
K
 
R
E
 
E
W
 
I
F
 
I
V
 
L
I
 
L
H
 
H
H
|
H
T
 
T
D
 
D
C
|
C
G
 
G
M
 
M
E
 
L
F
 
T
F
 
F
T
 
T
N
 
D
S
 
D
V
 
-
I
 
-
G
 
-
S
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
N
 
-
S
 
-
L
 
-
E
 
-
T
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
-
R
 
-
S
 
-
D
 
-
G
 
-
F
 
-
T
 
-
D
 
D
I
 
F
G
 
K
E
 
R
G
 
A
P
 
I
G
 
Q
S
 
D
E
 
E
E
 
T
G
 
G
K
 
I
Y
 
R
I
 
P
H
 
T
W
 
W
L
 
S
-
 
P
-
 
E
T
 
S
I
 
Y
E
 
P
N
 
D
Q
 
A
T
 
V
Q
 
E
S
 
D
V
 
V
V
 
R
E
 
Q
D
 
S
V
 
L
Q
 
R
R
 
R
I
 
I
R
 
E
R
 
V
H
 
N
P
 
P
L
 
F
V
 
V
P
 
T
S
 
K
N
 
H
I
 
T
P
 
S
I
 
L
Y
 
R
G
 
G
Y
 
F
L
 
V
Y
 
F
D
 
D
V
 
V
R
 
A
S
 
T
G
 
G
R
 
K
L
 
L
I
 
N
E
 
E
V
 
V

4yf4A Crystal structure of rv1284 in the presence of polycarpine at mildly acidic ph (see paper)
39% identity, 94% coverage: 2:182/192 of query aligns to 2:161/163 of 4yf4A

query
sites
4yf4A
T
 
T
V
 
V
L
 
T
T
 
D
E
 
D
V
 
Y
L
 
L
E
 
A
A
 
N
N
 
N
Q
 
V
A
 
D
Y
 
Y
A
 
A
A
 
S
A
 
G
F
 
F
G
 
-
E
 
-
K
 
K
G
 
G
S
 
P
L
 
L
A
 
P
L
 
M
P
 
P
P
 
P
A
 
S
R
 
K
Q
 
H
F
 
I
A
 
A
I
 
I
L
 
V
T
 
A
C
 
C
M
 
M
D
 
D
A
 
A
R
 
R
L
 
L
D
 
D
P
 
V
A
 
Y
Q
 
R
Y
 
M
A
 
L
G
 
G
L
 
I
K
 
K
E
 
E
G
 
G
D
 
E
A
 
A
H
 
H
V
 
V
I
 
I
R
 
R
N
 
N
A
 
A
G
 
G
G
 
C
R
 
V
A
 
V
S
 
T
D
 
D
D
 
D
A
 
V
I
 
I
R
 
R
S
 
S
L
 
L
V
 
A
I
 
I
S
 
S
Y
 
Q
K
 
R
L
 
L
L
 
L
G
 
G
T
 
T
K
 
R
E
 
E
W
 
I
F
 
I
V
 
L
I
 
L
H
 
H
H
|
H
T
 
T
D
 
D
C
|
C
G
 
G
M
 
M
E
 
L
F
 
T
F
 
F
T
 
T
N
 
D
S
 
D
V
 
-
I
 
-
G
 
-
S
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
N
 
-
S
 
-
L
 
-
E
 
-
T
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
-
R
 
-
S
 
-
D
 
-
G
 
-
F
 
-
T
 
-
D
 
D
I
 
F
G
 
K
E
 
R
G
 
A
P
 
I
G
 
Q
S
 
D
E
 
E
E
 
T
G
 
G
K
 
I
Y
 
R
I
 
P
H
 
T
W
 
W
L
 
S
-
 
P
-
 
E
T
 
S
I
 
Y
E
 
P
N
 
D
Q
 
A
T
 
V
Q
 
E
S
 
D
V
 
V
V
 
R
E
 
Q
D
 
S
V
 
L
Q
 
R
R
 
R
I
|
I
R
x
E
R
 
V
H
x
N
P
 
P
L
 
F
V
|
V
P
 
T
S
 
K
N
 
H
I
 
T
P
 
S
I
 
L
Y
 
R
G
 
G
Y
 
F
L
 
V
Y
 
F
D
 
D
V
 
V
R
 
A
S
 
T
G
 
G
R
 
K
L
 
L
I
 
N
E
 
E
V
 
V

H1AAP2 Carbonyl sulfide hydrolase; COSase; EC 3.13.1.7 from Thiobacillus thioparus (see paper)
35% identity, 92% coverage: 7:182/192 of query aligns to 9:209/219 of H1AAP2

query
sites
H1AAP2
V
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
N
N
 
N
Q
 
R
A
 
L
Y
 
Y
A
 
A
A
 
G
A
 
G
F
 
Q
-
 
A
-
 
T
-
 
H
-
 
R
-
 
P
G
 
G
E
 
H
K
 
P
G
 
G
S
 
M
L
 
Q
A
 
P
L
 
I
P
 
Q
P
 
P
A
 
S
R
 
R
Q
 
R
F
 
V
A
 
A
I
 
V
L
 
V
T
 
A
C
|
C
M
 
M
D
 
D
A
 
A
R
 
R
L
 
L
D
 
D
P
 
V
A
 
E
Q
 
D
Y
 
L
A
 
L
G
 
G
L
 
L
K
 
Q
E
 
T
G
 
G
D
 
E
A
 
A
H
 
H
V
 
I
I
 
I
R
 
R
N
 
N
A
 
A
G
 
G
G
 
G
R
 
V
A
 
I
S
 
N
D
 
E
D
 
D
A
 
A
I
 
I
R
 
R
S
 
C
L
 
L
V
 
I
I
 
I
S
 
S
Y
 
H
K
 
H
L
 
L
L
 
L
G
 
N
T
 
T
K
 
H
E
 
E
W
 
I
F
 
I
V
 
L
I
 
V
H
 
H
H
|
H
T
 
T
D
 
R
C
|
C
G
 
G
M
 
M
E
 
L
F
 
A
F
 
F
T
 
T
N
 
D
S
 
D
V
 
L
I
 
L
G
 
R
S
 
A
L
 
G
L
 
L
A
 
E
N
 
G
-
 
D
-
 
A
S
 
A
L
 
A
E
 
E
T
 
K
A
 
L
V
 
I
L
 
G
R
 
Q
S
 
A
D
 
T
G
 
G
F
 
R
T
 
A
D
 
F
I
 
V
G
 
S
E
 
A
G
 
G
P
 
K
G
 
A
S
 
S
E
 
A
E
 
S
G
 
P
K
 
A
Y
 
A
I
 
F
H
 
Q
W
 
A
L
 
F
-
 
R
-
 
G
-
 
P
-
 
P
-
 
E
-
 
P
-
 
L
-
 
D
-
 
A
-
 
P
T
 
R
I
 
S
E
 
D
N
 
A
Q
 
S
T
 
T
Q
 
E
S
 
R
V
 
I
V
 
A
E
 
A
D
 
D
V
 
V
Q
 
R
R
 
R
-
 
G
-
 
L
-
 
S
-
 
I
I
 
I
R
 
L
R
 
N
H
 
H
P
 
P
L
 
W
V
 
L
P
 
P
S
 
T
N
 
A
I
 
G
P
 
P
-
 
D
-
 
A
-
 
I
-
 
T
I
 
V
Y
 
R
G
 
G
Y
 
F
L
 
I
Y
 
Y
D
 
D
V
 
V
R
 
D
S
 
T
G
 
G
R
 
R
L
 
L
I
 
E
E
 
E
V
 
V

3vqjA Crystal structutre of thiobacillus thioparus thi115 carbonyl sulfide hydrolase (see paper)
35% identity, 92% coverage: 7:182/192 of query aligns to 5:205/213 of 3vqjA

query
sites
3vqjA
V
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
N
N
 
N
Q
 
R
A
 
L
Y
 
Y
A
 
A
A
 
G
A
 
G
F
 
Q
-
 
A
-
 
T
-
 
H
-
 
R
-
 
P
G
 
G
E
 
H
K
 
P
G
 
G
S
 
M
L
 
Q
A
 
P
L
 
I
P
 
Q
P
 
P
A
 
S
R
 
R
Q
 
R
F
 
V
A
 
A
I
 
V
L
 
V
T
 
A
C
|
C
M
 
M
D
 
D
A
 
A
R
 
R
L
 
L
D
 
D
P
 
V
A
 
E
Q
 
D
Y
 
L
A
 
L
G
 
G
L
 
L
K
 
Q
E
 
T
G
 
G
D
 
E
A
 
A
H
 
H
V
 
I
I
 
I
R
 
R
N
 
N
A
 
A
G
 
G
G
 
G
R
 
V
A
 
I
S
 
N
D
 
E
D
 
D
A
 
A
I
 
I
R
 
R
S
 
C
L
 
L
V
 
I
I
 
I
S
 
S
Y
 
H
K
 
H
L
 
L
L
 
L
G
 
N
T
 
T
K
 
H
E
 
E
W
 
I
F
 
I
V
 
L
I
 
V
H
 
H
H
|
H
T
 
T
D
 
R
C
|
C
G
 
G
M
 
M
E
 
L
F
 
A
F
 
F
T
 
T
N
 
D
S
 
D
V
 
L
I
 
L
G
 
R
S
 
A
L
 
G
L
 
L
A
 
E
N
 
G
-
 
D
-
 
A
S
 
A
L
 
A
E
 
E
T
 
K
A
 
L
V
 
I
L
 
G
R
 
Q
S
 
A
D
 
T
G
 
G
F
 
R
T
 
A
D
 
F
I
 
V
G
 
S
E
 
A
G
 
G
P
 
K
G
 
A
S
 
S
E
 
A
E
 
S
G
 
P
K
 
A
Y
 
A
I
 
F
H
 
Q
W
 
A
L
 
F
-
 
R
-
 
G
-
 
P
-
 
P
-
 
E
-
 
P
-
 
L
-
 
D
-
 
A
-
 
P
T
 
R
I
 
S
E
 
D
N
 
A
Q
 
S
T
 
T
Q
 
E
S
 
R
V
 
I
V
 
A
E
 
A
D
 
D
V
 
V
Q
 
R
R
 
R
-
 
G
-
 
L
-
 
S
-
 
I
I
 
I
R
 
L
R
 
N
H
 
H
P
 
P
L
 
W
V
 
L
P
 
P
S
 
T
N
 
A
I
 
G
P
 
P
-
 
D
-
 
A
-
 
I
-
 
T
I
 
V
Y
 
R
G
 
G
Y
 
F
L
 
I
Y
 
Y
D
 
D
V
 
V
R
 
D
S
 
T
G
 
G
R
 
R
L
 
L
I
 
E
E
 
E
V
 
V

G0WXL9 Carbon disulfide hydrolase; CS(2) hydrolase; Carbon disulfide lyase; EC 3.13.1.5 from Acidianus sp. (strain A1-3) (see paper)
32% identity, 92% coverage: 3:179/192 of query aligns to 1:182/204 of G0WXL9

query
sites
G0WXL9
V
 
M
L
 
V
T
 
S
E
 
E
V
 
Y
L
 
I
E
 
D
A
 
S
N
 
E
Q
 
L
A
 
K
Y
 
R
A
 
L
A
 
E
A
 
D
F
 
Y
G
 
A
E
 
L
K
 
R
G
 
R
S
 
V
L
 
K
A
 
G
L
 
I
P
 
P
P
 
N
A
 
N
R
 
R
Q
 
R
F
 
L
A
 
W
I
 
V
L
 
L
T
 
T
C
|
C
M
 
M
D
 
D
A
 
E
R
 
R
L
 
V
D
 
H
P
 
I
A
 
E
Q
 
Q
Y
 
S
A
 
L
G
 
G
L
 
I
K
 
Q
E
 
P
G
 
D
D
 
D
A
 
A
H
 
H
V
 
I
I
 
Y
R
 
R
N
 
N
A
 
A
G
 
G
G
 
G
R
 
I
A
 
V
S
 
T
D
 
D
D
 
D
A
 
A
I
 
I
R
 
R
S
 
S
L
 
A
V
 
S
I
 
L
S
 
T
Y
 
T
K
 
N
L
x
F
L
x
F
G
 
G
T
 
T
K
 
K
E
 
E
W
 
I
F
 
I
V
 
V
I
 
V
H
 
T
H
|
H
T
 
T
D
 
D
C
|
C
G
 
G
M
 
M
E
 
L
F
 
R
F
|
F
T
 
T
-
 
G
N
 
E
S
 
E
V
 
V
I
 
A
G
 
K
S
 
Y
L
 
F
L
 
I
A
 
S
N
 
K
S
 
G
L
 
I
E
 
K
T
 
P
A
 
T
V
 
E
L
 
V
R
 
Q
S
 
L
D
 
D
G
 
P
F
 
L
T
 
-
D
 
-
I
 
L
G
 
P
E
 
A
G
 
F
P
 
R
G
 
I
S
 
S
E
 
S
E
 
E
G
 
E
K
 
D
Y
 
F
I
 
I
H
 
K
W
 
W
-
 
F
-
 
K
-
 
F
-
 
Y
-
 
E
-
 
D
L
 
L
T
 
G
I
 
V
E
 
K
N
 
S
Q
 
P
T
 
D
Q
 
E
S
 
M
V
 
A
V
 
L
E
 
K
D
 
G
V
 
V
Q
 
E
R
 
I
I
 
L
R
 
R
R
 
N
H
 
H
P
 
P
L
 
L
V
 
I
P
 
P
S
 
K
N
 
D
I
 
V
P
 
R
I
 
I
Y
 
T
G
 
G
Y
 
Y
L
 
V
Y
 
Y
D
 
E
V
 
V
R
 
E
S
 
T
G
 
H
R
 
R
L
 
L

Sites not aligning to the query:

3tenA Holo form of carbon disulfide hydrolase (see paper)
35% identity, 80% coverage: 26:179/192 of query aligns to 22:180/201 of 3tenA

query
sites
3tenA
L
 
I
P
 
P
P
 
N
A
 
N
R
 
R
Q
 
R
F
 
L
A
 
W
I
 
V
L
 
L
T
 
T
C
|
C
M
 
M
D
 
D
A
 
E
R
 
R
L
 
V
D
 
H
P
 
I
A
 
E
Q
 
Q
Y
 
S
A
 
L
G
 
G
L
 
I
K
 
Q
E
 
P
G
 
D
D
 
D
A
 
A
H
 
H
V
 
I
I
 
Y
R
 
R
N
 
N
A
 
A
G
 
G
G
 
G
R
 
I
A
 
V
S
 
T
D
 
D
D
 
D
A
 
A
I
 
I
R
 
R
S
 
S
L
 
A
V
 
S
I
 
L
S
 
T
Y
 
T
K
 
N
L
 
F
L
 
F
G
 
G
T
 
T
K
 
K
E
 
E
W
 
I
F
 
I
V
 
V
I
 
V
H
 
T
H
|
H
T
 
T
D
 
D
C
|
C
G
 
G
M
 
M
E
 
L
F
 
R
F
 
F
T
 
T
-
 
G
N
 
E
S
 
E
V
 
V
I
 
A
G
 
K
S
 
Y
L
 
F
L
 
I
A
 
S
N
 
K
S
 
G
L
 
I
E
 
K
T
 
P
A
 
T
V
 
E
L
 
V
R
 
Q
S
 
L
D
 
D
G
 
P
F
 
L
T
 
-
D
 
-
I
 
L
G
 
P
E
 
A
G
 
F
P
 
R
G
 
I
S
 
S
E
 
S
E
 
E
G
 
E
K
 
D
Y
 
F
I
 
I
H
 
K
W
 
W
-
 
F
-
 
K
-
 
F
-
 
Y
-
 
E
-
 
D
L
 
L
T
 
G
I
 
V
E
 
K
N
 
S
Q
 
P
T
 
D
Q
 
E
S
 
M
V
 
A
V
 
L
E
 
K
D
 
G
V
 
V
Q
 
E
R
 
I
I
 
L
R
 
R
R
 
N
H
 
H
P
 
P
L
 
L
V
 
I
P
 
P
S
 
K
N
 
D
I
 
V
P
 
R
I
 
I
Y
 
T
G
 
G
Y
 
Y
L
 
V
Y
 
Y
D
 
E
V
 
V
R
 
E
S
 
T
G
 
H
R
 
R
L
 
L

1g5cA Crystal structure of the 'cab' type beta class carbonic anhydrase from methanobacterium thermoautotrophicum (see paper)
33% identity, 92% coverage: 3:179/192 of query aligns to 1:162/169 of 1g5cA

query
sites
1g5cA
V
 
I
L
 
I
T
 
K
E
 
D
V
 
I
L
 
L
E
 
R
A
 
E
N
 
N
Q
 
Q
A
 
D
Y
 
F
A
 
R
A
 
-
A
 
-
F
 
F
G
 
R
E
 
D
K
 
L
G
 
S
S
 
D
L
 
L
A
 
K
L
 
H
P
 
S
P
 
P
A
 
-
R
 
-
Q
 
K
F
 
L
A
 
C
I
 
I
L
 
I
T
 
T
C
|
C
M
 
M
D
|
D
A
x
S
R
|
R
L
 
L
-
 
I
D
 
D
P
 
L
A
 
L
Q
 
E
Y
 
R
A
 
A
-
 
L
G
 
G
L
 
I
K
 
G
E
 
R
G
 
G
D
 
D
A
 
A
H
 
K
V
 
V
I
 
I
R
 
K
N
 
N
A
 
A
G
 
G
G
 
N
R
 
I
A
 
V
S
 
D
D
 
D
D
 
G
A
 
V
I
 
I
R
 
R
S
 
S
L
 
A
V
 
A
I
 
V
S
 
A
Y
 
I
K
 
Y
L
 
A
L
 
L
G
 
G
T
 
D
K
 
N
E
 
E
W
 
I
F
 
I
V
 
I
I
 
V
H
 
G
H
|
H
T
 
T
D
|
D
C
|
C
G
 
G
M
 
M
E
 
A
F
 
R
F
 
L
T
 
D
N
 
E
S
 
D
V
 
L
I
 
I
G
 
V
S
 
S
L
 
R
L
 
M
A
 
R
N
 
E
-
 
L
S
 
G
L
 
V
E
 
E
T
 
E
A
 
E
V
 
V
L
 
I
R
 
E
S
 
N
D
 
-
G
 
-
F
 
F
T
 
S
-
 
I
D
 
D
I
 
V
G
 
L
E
 
N
G
 
P
P
 
V
G
 
G
S
 
D
E
 
E
E
 
E
G
 
-
K
 
-
Y
 
-
I
 
-
H
 
-
W
 
-
L
 
-
T
 
-
I
 
-
E
 
-
N
 
-
Q
 
-
T
 
-
Q
 
E
S
 
N
V
 
V
V
 
I
E
 
E
D
 
G
V
 
V
Q
 
K
R
 
R
I
 
L
R
 
K
R
 
S
H
 
S
P
 
P
L
 
L
V
 
I
P
 
P
S
 
E
N
 
S
I
 
I
P
 
G
I
 
V
Y
 
H
G
 
G
Y
 
L
L
 
I
Y
 
I
D
 
D
V
 
I
R
 
N
S
 
T
G
 
G
R
 
R
L
 
L

1g5cF Crystal structure of the 'cab' type beta class carbonic anhydrase from methanobacterium thermoautotrophicum (see paper)
35% identity, 78% coverage: 31:179/192 of query aligns to 11:148/155 of 1g5cF

query
sites
1g5cF
Q
 
K
F
 
L
A
 
C
I
 
I
L
 
I
T
 
T
C
|
C
M
 
M
D
 
D
A
 
S
R
 
R
L
 
L
-
 
I
D
 
D
P
 
L
A
 
L
Q
 
E
Y
 
R
A
 
A
-
 
L
G
 
G
L
 
I
K
 
G
E
 
R
G
 
G
D
 
D
A
 
A
H
x
K
V
 
V
I
 
I
R
 
K
N
 
N
A
 
A
G
 
G
G
 
N
R
 
I
A
 
V
S
 
D
D
 
D
D
 
G
A
 
V
I
 
I
R
 
R
S
 
S
L
 
A
V
 
A
I
 
V
S
 
A
Y
 
I
K
 
Y
L
 
A
L
|
L
G
 
G
T
 
D
K
 
N
E
 
E
W
 
I
F
 
I
V
 
I
I
 
V
H
 
G
H
|
H
T
 
T
D
 
D
C
|
C
G
 
G
M
 
M
E
 
A
F
 
R
F
 
L
T
 
D
N
x
E
S
 
D
V
 
L
I
 
I
G
 
V
S
 
S
L
 
R
L
 
M
A
 
R
N
 
E
-
 
L
S
 
G
L
 
V
E
 
E
T
 
E
A
 
E
V
 
V
L
 
I
R
 
E
S
 
N
D
 
-
G
 
-
F
 
F
T
x
S
-
 
I
D
 
D
I
x
V
G
 
L
E
 
N
G
 
P
P
 
V
G
 
G
S
 
D
E
 
E
E
 
E
G
 
-
K
 
-
Y
 
-
I
 
-
H
 
-
W
 
-
L
 
-
T
 
-
I
 
-
E
 
-
N
 
-
Q
 
-
T
 
-
Q
 
E
S
 
N
V
 
V
V
 
I
E
 
E
D
 
G
V
 
V
Q
 
K
R
 
R
I
 
L
R
 
K
R
 
S
H
 
S
P
 
P
L
 
L
V
 
I
P
 
P
S
 
E
N
 
S
I
 
I
P
 
G
I
 
V
Y
 
H
G
 
G
Y
 
L
L
 
I
Y
 
I
D
 
D
V
 
I
R
 
N
S
 
T
G
 
G
R
 
R
L
 
L

Sites not aligning to the query:

6y04A Crystal structure of beta-carbonic anhydrase isoform i (tvaca1) from the trichomonas vaginalis protozoan. (see paper)
33% identity, 95% coverage: 1:182/192 of query aligns to 1:178/182 of 6y04A

query
sites
6y04A
M
 
M
T
 
S
V
 
Q
L
 
L
T
 
E
E
 
L
V
 
I
L
 
T
E
 
S
A
 
A
N
 
N
Q
 
Q
A
 
A
Y
 
F
A
 
L
A
 
E
A
 
A
F
 
N
G
 
P
E
 
E
K
 
L
G
 
T
S
 
K
L
 
L
A
 
N
L
 
K
P
 
A
P
 
P
A
 
Q
R
 
R
Q
 
H
F
 
I
A
 
A
I
 
I
L
 
V
T
 
T
C
|
C
M
 
M
D
 
D
A
 
T
R
 
R
L
 
L
-
 
V
D
 
N
P
 
F
A
 
A
Q
 
E
Y
 
D
A
 
A
-
 
I
G
 
G
L
 
V
K
 
K
E
 
R
G
 
G
D
 
E
A
 
A
H
 
T
V
 
V
I
 
I
R
 
K
N
 
A
A
 
A
G
 
G
G
 
N
-
 
G
-
 
I
-
 
W
-
 
T
R
 
T
A
 
G
S
 
L
D
 
S
D
 
D
A
 
I
I
 
V
R
 
V
S
 
S
L
 
L
V
 
L
I
 
V
S
 
S
Y
 
I
K
 
Y
L
 
E
L
 
L
G
 
G
T
 
V
K
 
Q
E
 
E
W
 
I
F
 
F
V
 
I
I
 
M
H
 
G
H
|
H
T
 
E
D
 
C
C
|
C
G
 
G
M
 
M
E
 
-
F
 
-
F
 
-
T
 
T
N
 
H
S
 
A
V
 
S
I
 
T
G
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
G
A
 
A
N
 
Q
S
 
M
L
 
L
E
 
K
T
 
S
A
 
G
V
 
I
L
 
K
R
 
P
S
 
E
D
 
D
G
 
-
F
 
-
T
 
-
D
 
-
I
 
-
G
 
I
E
 
E
G
 
K
P
 
F
G
 
K
S
 
S
E
 
D
E
 
L
G
 
S
K
 
K
Y
 
W
I
 
V
H
 
D
W
 
-
L
 
-
T
 
D
I
 
F
E
 
K
N
 
D
Q
 
P
T
 
I
Q
 
D
S
 
N
V
 
I
V
 
K
E
 
N
D
 
S
V
 
V
Q
 
R
R
 
C
I
 
V
R
 
R
R
 
E
H
 
N
P
 
P
L
 
L
V
 
I
P
 
P
S
 
K
N
 
N
I
 
I
P
 
P
I
 
I
Y
 
H
G
 
G
Y
 
L
L
 
L
Y
 
I
D
 
H
V
 
P
R
 
D
S
 
T
G
 
G
R
 
K
L
 
V
I
 
T
E
 
T
V
 
I

Query Sequence

>Synpcc7942_B2619 FitnessBrowser__SynE:Synpcc7942_B2619
MTVLTEVLEANQAYAAAFGEKGSLALPPARQFAILTCMDARLDPAQYAGLKEGDAHVIRN
AGGRASDDAIRSLVISYKLLGTKEWFVIHHTDCGMEFFTNSVIGSLLANSLETAVLRSDG
FTDIGEGPGSEEGKYIHWLTIENQTQSVVEDVQRIRRHPLVPSNIPIYGYLYDVRSGRLI
EVPEATTAGVAR

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory