SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Synpcc7942_B2663 FitnessBrowser__SynE:Synpcc7942_B2663 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 16 hits to proteins with known functional sites (download)

3p47A Crystal structure of entamoeba histolytica serine acetyltransferase 1 in complex with l-cysteine (see paper)
42% identity, 77% coverage: 55:300/319 of query aligns to 40:265/270 of 3p47A

query
sites
3p47A
L
 
L
H
 
Q
G
 
K
L
 
L
R
 
R
S
 
K
V
 
I
L
 
F
F
 
F
P
 
P
R
 
D
H
 
F
F
 
F
G
 
M
D
 
K
P
 
H
E
 
Q
L
 
K
S
 
I
V
 
T
E
 
E
T
 
S
T
 
-
H
 
-
Y
 
-
F
 
H
I
 
I
G
 
A
N
 
S
T
 
E
L
 
L
D
 
T
K
 
K
T
 
L
L
 
V
N
 
D
L
 
Y
L
 
I
N
 
K
E
 
D
Q
 
S
I
 
-
R
 
-
R
 
-
E
 
-
L
 
-
W
 
-
L
 
-
Q
 
-
H
 
-
V
 
V
T
 
T
Q
 
A
G
 
Y
T
 
N
P
 
D
E
 
E
A
 
L
T
 
F
P
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
-
S
 
-
Q
 
-
H
 
-
A
 
A
S
 
H
E
 
Q
L
 
C
T
 
V
Q
 
M
A
 
A
F
 
I
A
 
L
Q
 
E
A
 
K
L
 
L
P
 
P
E
 
S
I
 
I
K
 
K
R
 
R
L
 
T
L
 
L
D
 
K
S
 
T
D
 
D
V
 
L
N
 
I
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
L
 
A
G
 
G
D
 
D
P
 
P
A
 
A
A
 
A
Q
 
P
S
 
G
I
 
L
S
 
S
E
 
L
I
 
I
L
 
I
F
 
R
C
 
C
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
I
 
F
T
 
Q
A
 
A
I
 
V
T
 
I
F
 
V
H
 
Y
R
 
R
L
 
I
A
 
A
H
 
H
R
 
V
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
E
L
 
C
G
 
G
L
 
E
P
 
R
L
 
Y
L
 
Y
A
 
C
R
 
R
I
 
E
T
 
M
A
 
M
E
 
E
V
 
S
S
 
V
H
 
H
S
 
S
E
 
Y
T
 
T
G
 
S
I
 
I
D
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
G
A
 
A
A
 
S
I
 
I
G
 
K
G
 
G
S
 
H
F
 
F
F
 
F
I
 
I
D
 
D
H
 
H
G
 
G
T
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
C
 
A
V
 
I
I
 
I
G
 
G
D
 
E
R
 
W
V
 
C
R
 
R
I
 
I
Y
 
Y
Q
 
Q
A
 
S
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
A
|
A
K
 
M
S
x
H
F
 
F
P
 
-
R
 
Q
D
 
E
E
 
E
T
 
G
G
 
G
A
 
V
L
 
I
I
 
K
K
 
R
G
 
G
Q
 
T
A
 
K
R
|
R
H
|
H
P
 
P
V
 
T
I
 
V
E
 
G
D
 
D
D
 
Y
V
 
V
V
 
T
I
 
I
Y
 
G
A
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
K
L
 
V
L
 
L
G
 
G
R
 
N
I
 
I
T
 
I
V
 
V
G
 
G
R
 
S
G
 
H
S
 
V
T
 
R
I
 
I
G
 
G
G
 
A
N
 
N
V
 
C
W
 
W
L
 
I
T
 
D
R
 
R
S
 
D
V
 
V
P
 
D
A
 
S
G
 
N

3q1xA Crystal structure of entamoeba histolytica serine acetyltransferase 1 in complex with l-serine (see paper)
42% identity, 77% coverage: 55:300/319 of query aligns to 38:263/267 of 3q1xA

query
sites
3q1xA
L
 
L
H
 
Q
G
 
K
L
 
L
R
 
R
S
 
K
V
 
I
L
 
F
F
 
F
P
 
P
R
 
D
H
 
F
F
 
F
G
 
M
D
 
K
P
 
H
E
 
Q
L
 
K
S
 
I
V
 
T
E
 
E
T
 
S
T
 
-
H
 
-
Y
 
-
F
 
H
I
 
I
G
 
A
N
 
S
T
 
E
L
 
L
D
 
T
K
 
K
T
 
L
L
 
V
N
 
D
L
 
Y
L
 
I
N
 
K
E
 
D
Q
 
S
I
 
-
R
 
-
R
 
-
E
 
-
L
 
-
W
 
-
L
 
-
Q
 
-
H
 
-
V
 
V
T
 
T
Q
 
A
G
 
Y
T
 
N
P
 
D
E
 
E
A
 
L
T
 
F
P
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
-
S
 
-
Q
 
-
H
 
-
A
 
A
S
 
H
E
 
Q
L
 
C
T
 
V
Q
 
M
A
 
A
F
 
I
A
 
L
Q
 
E
A
 
K
L
 
L
P
 
P
E
 
S
I
 
I
K
 
K
R
 
R
L
 
T
L
 
L
D
 
K
S
 
T
D
 
D
V
 
L
N
 
I
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
L
 
A
G
 
G
D
 
D
P
 
P
A
 
A
A
 
A
Q
 
P
S
 
G
I
 
L
S
 
S
E
 
L
I
 
I
L
 
I
F
 
R
C
 
C
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
I
 
F
T
 
Q
A
 
A
I
 
V
T
 
I
F
 
V
H
 
Y
R
 
R
L
 
I
A
 
A
H
 
H
R
 
V
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
E
L
 
C
G
 
G
L
 
E
P
 
R
L
 
Y
L
 
Y
A
 
C
R
 
R
I
 
E
T
 
M
A
 
M
E
 
E
V
 
S
S
 
V
H
 
H
S
 
S
E
 
Y
T
 
T
G
 
S
I
 
I
D
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
G
A
 
A
A
 
S
I
 
I
G
 
K
G
 
G
S
 
H
F
 
F
F
 
F
I
 
I
D
 
D
H
 
H
G
 
G
T
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
C
 
A
V
 
I
I
 
I
G
 
G
D
 
E
R
 
W
V
 
C
R
 
R
I
 
I
Y
 
Y
Q
 
Q
A
 
S
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
M
S
x
H
F
 
F
P
 
-
R
 
Q
D
 
E
E
 
E
T
 
G
G
 
G
A
 
V
L
 
I
I
 
K
K
 
R
G
 
G
Q
 
T
A
 
K
R
|
R
H
|
H
P
 
P
V
 
T
I
 
V
E
 
G
D
 
D
D
 
Y
V
 
V
V
 
T
I
 
I
Y
 
G
A
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
K
L
 
V
L
 
L
G
 
G
R
 
N
I
 
I
T
 
I
V
 
V
G
 
G
R
 
S
G
 
H
S
 
V
T
 
R
I
 
I
G
 
G
G
 
A
N
 
N
V
 
C
W
 
W
L
 
I
T
 
D
R
 
R
S
 
D
V
 
V
P
 
D
A
 
S
G
 
N

7bw9A Crystal structure of serine acetyltransferase isoform 3 in complex with cysteine from entamoeba histolytica
39% identity, 92% coverage: 22:313/319 of query aligns to 1:272/280 of 7bw9A

query
sites
7bw9A
V
 
M
S
 
S
A
 
S
L
 
L
S
 
L
Q
 
Q
A
 
Q
S
 
T
T
 
S
D
 
Q
P
 
L
L
 
L
P
 
V
H
 
Q
H
 
S
L
 
Y
L
 
Q
S
 
S
D
 
D
Q
 
N
F
 
I
-
 
A
-
 
F
-
 
K
-
 
S
-
 
T
Y
 
K
P
 
Q
L
 
F
P
 
P
S
 
E
R
 
K
E
 
K
S
 
S
L
 
F
G
 
-
L
 
L
I
 
E
L
 
L
H
 
E
G
 
L
L
 
I
R
 
Q
S
 
K
V
 
I
L
 
L
F
 
F
P
 
P
R
 
D
H
 
F
F
 
F
G
 
T
D
 
R
P
 
R
E
 
D
L
 
K
S
 
R
V
 
T
E
 
-
T
 
-
T
 
-
H
 
-
Y
 
-
F
 
-
I
 
F
G
 
N
N
 
N
T
 
V
L
 
L
D
 
E
K
 
R
T
 
-
L
 
L
N
 
S
L
 
L
L
 
L
N
 
V
E
 
Y
Q
 
H
I
 
I
R
 
Q
R
 
N
E
 
S
L
 
I
W
 
E
L
 
A
Q
 
Y
H
 
Y
V
 
N
T
 
Q
Q
 
Q
G
 
L
T
 
A
P
 
E
E
 
K
A
 
C
T
 
I
P
 
T
A
 
A
V
 
L
L
 
L
S
 
S
Q
 
Q
H
 
F
A
 
V
S
 
T
E
 
-
L
 
-
T
 
-
Q
 
-
A
 
-
F
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
-
L
 
-
P
 
-
E
 
-
I
 
I
K
 
R
R
 
E
L
 
L
L
 
V
D
 
K
S
 
Q
D
 
D
V
 
I
N
 
I
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
L
 
T
G
 
G
D
|
D
P
|
P
A
 
A
A
 
A
Q
 
S
S
 
S
I
 
L
S
 
A
E
 
M
I
 
I
L
 
I
F
 
R
C
 
S
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
I
 
I
T
 
H
A
 
V
I
 
M
T
 
M
F
 
I
H
 
Q
R
 
R
L
 
V
A
 
A
H
 
H
R
 
I
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
M
L
 
N
G
 
G
L
 
D
P
 
I
L
 
E
L
 
Y
A
 
S
R
 
R
I
 
E
T
 
L
A
 
M
E
 
E
V
 
N
S
 
I
H
 
H
S
 
S
E
 
V
T
 
T
G
 
G
I
 
I
D
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
G
A
 
T
A
 
S
I
 
I
G
 
G
G
 
N
S
 
H
F
 
F
F
 
F
I
 
I
D
|
D
H
|
H
G
 
G
T
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
C
 
A
V
 
V
I
 
I
G
 
G
D
 
N
R
 
W
V
 
C
R
 
R
I
 
V
Y
 
Y
Q
 
Q
A
 
S
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
A
|
A
K
 
M
S
 
S
F
 
F
P
 
-
R
 
-
D
 
-
E
 
-
T
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
I
 
-
K
 
K
G
 
G
Q
 
N
A
 
K
R
|
R
H
|
H
P
 
P
V
 
T
I
 
I
E
 
G
D
 
D
D
 
F
V
 
V
V
 
V
I
 
I
Y
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
K
L
 
V
L
 
L
G
 
G
R
 
N
I
 
I
T
 
T
V
 
I
G
 
G
R
 
S
G
 
N
S
 
V
T
 
K
I
 
I
G
 
G
G
 
A
N
 
N
V
 
C
W
 
W
L
 
I
T
 
T
R
 
Q
S
 
N
V
 
I
P
 
D
A
 
Q
G
 
D
S
 
Q
-
 
I
-
 
V
F
 
F
I
 
I
S
 
S
Q
 
E
-
 
H
-
 
P
A
 
S
Q
 
Q
I
 
I
R
 
T
S
 
K
D
 
E
N
 
N
F
 
L

6wyeA Crystal structure of neisseria gonorrhoeae serine acetyltransferase (cyse) (see paper)
37% identity, 55% coverage: 124:298/319 of query aligns to 64:232/261 of 6wyeA

query
sites
6wyeA
L
 
L
T
 
F
Q
 
E
A
 
I
F
 
Y
A
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
-
 
G
-
 
S
-
 
D
P
 
T
E
 
Q
I
 
I
K
 
S
R
 
K
L
 
C
L
 
V
D
 
E
S
 
A
D
 
D
V
 
L
N
 
K
A
 
A
A
 
I
Y
 
Y
L
 
E
G
 
R
D
|
D
P
|
P
A
 
A
A
 
C
Q
 
D
S
 
E
I
 
Y
S
 
S
E
 
L
I
 
P
L
 
L
F
 
L
C
 
Y
Y
 
F
P
 
K
G
 
G
I
 
F
T
 
H
A
 
A
I
 
I
T
 
Q
F
 
A
H
 
H
R
 
R
L
 
I
A
 
N
H
 
H
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
L
L
 
D
G
 
G
L
 
R
P
 
K
L
 
T
L
 
L
A
 
A
R
 
Y
I
 
F
T
 
L
A
 
Q
E
 
N
V
 
R
S
 
M
H
 
S
S
 
E
E
 
V
T
 
F
G
 
G
I
 
V
D
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
A
A
 
A
A
 
R
I
 
L
G
 
G
G
 
Y
S
 
G
F
 
L
F
 
M
I
 
L
D
|
D
H
|
H
G
 
A
T
 
T
G
 
G
V
 
F
V
 
V
I
 
A
G
 
G
E
 
E
T
 
T
C
 
A
V
 
V
I
 
L
G
 
G
D
 
N
R
 
N
V
 
I
R
 
S
I
 
I
Y
 
L
Q
 
H
A
 
G
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
-
K
 
-
S
 
-
F
 
-
P
 
-
R
 
-
D
 
-
E
 
-
T
 
-
G
|
G
A
 
S
L
 
G
I
 
K
K
 
E
G
 
G
Q
 
G
A
 
D
R
|
R
H
|
H
P
 
P
V
 
K
I
 
I
E
 
G
D
 
D
D
 
G
V
 
V
V
 
M
I
 
I
Y
 
G
A
 
A
G
 
N
A
 
A
T
 
S
L
 
I
L
 
L
G
 
G
R
 
N
I
 
I
T
 
R
V
 
I
G
 
G
R
 
S
G
 
N
S
 
A
T
 
K
I
 
I
G
 
G
G
 
A
N
 
G
V
 
S
W
 
V
L
 
V
T
 
V
R
 
S
S
 
D
V
 
V
P
 
P

4hzdA Crystal structure of serine acetyltransferase in complex with coenzyme a from brucella abortus strain s19 (see paper)
35% identity, 65% coverage: 91:298/319 of query aligns to 35:231/250 of 4hzdA

query
sites
4hzdA
L
 
I
L
 
L
N
 
N
E
 
Q
Q
 
P
I
 
S
R
 
L
R
 
E
E
 
E
L
 
A
W
 
V
L
 
M
Q
 
H
H
 
R
V
 
I
T
 
A
Q
 
E
-
 
R
-
 
L
G
 
G
T
 
H
P
 
P
E
 
D
A
 
V
T
 
S
P
 
A
A
 
D
V
 
I
L
 
L
S
 
R
Q
 
Q
H
 
T
A
 
F
S
 
D
E
 
T
L
 
M
T
 
L
Q
 
E
A
 
A
F
 
N
A
 
-
Q
 
-
A
 
-
L
 
-
P
 
P
E
 
E
I
 
W
K
 
S
R
 
H
L
 
V
L
 
L
D
 
R
S
 
V
D
 
D
V
 
I
N
 
Q
A
 
A
A
 
V
Y
 
Y
L
 
D
G
 
R
D
 
D
P
 
P
A
 
A
A
 
Y
Q
 
S
S
 
R
I
 
F
S
 
M
E
 
D
I
 
P
L
 
V
F
 
L
C
 
Y
Y
 
L
P
 
K
G
 
G
I
 
F
T
 
H
A
 
A
I
 
I
T
 
Q
F
 
T
H
 
H
R
 
R
L
 
L
A
 
A
H
 
H
R
 
W
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
K
L
 
Q
G
 
G
L
 
R
P
 
K
L
 
D
L
 
F
A
 
A
R
 
Y
I
 
Y
T
 
L
A
 
Q
E
 
S
V
 
R
S
 
S
H
 
S
S
 
S
E
 
I
T
 
F
G
 
Q
I
 
T
D
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
A
A
 
A
A
 
R
I
 
L
G
 
G
G
 
S
S
 
G
F
 
L
F
 
F
I
 
L
D
 
D
H
|
H
G
 
A
T
 
T
G
 
G
V
 
L
V
 
V
I
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
C
 
A
V
 
V
I
 
V
G
 
E
D
 
D
R
 
N
V
 
V
R
 
S
I
 
I
Y
 
L
Q
 
H
A
 
G
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
G
K
 
T
S
 
G
F
 
K
P
 
S
R
 
S
D
 
G
E
 
D
T
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
I
 
-
K
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
-
R
 
R
H
 
H
P
 
P
V
 
K
I
 
I
E
 
R
D
 
Q
D
 
G
V
 
V
V
 
L
I
 
I
Y
x
G
A
|
A
G
 
G
A
 
A
T
 
K
L
 
I
L
 
L
G
 
G
R
 
N
I
 
I
T
 
Q
V
 
V
G
 
G
R
 
Q
G
 
C
S
 
S
T
 
K
I
 
I
G
x
A
G
x
A
N
 
G
V
x
S
W
 
V
L
 
V
T
 
L
R
 
K
S
 
S
V
 
V
P
 
P

Sites not aligning to the query:

7ra4A Crystal structure of neisseria gonorrhoeae serine acetyltransferase (cyse) in complex with serine (see paper)
37% identity, 55% coverage: 124:298/319 of query aligns to 62:230/243 of 7ra4A

query
sites
7ra4A
L
 
L
T
 
F
Q
 
E
A
 
I
F
 
Y
A
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
-
 
G
-
 
S
-
 
D
P
 
T
E
 
Q
I
 
I
K
 
S
R
 
K
L
 
C
L
 
V
D
 
E
S
 
A
D
 
D
V
 
L
N
 
K
A
 
A
A
 
I
Y
 
Y
L
 
E
G
 
R
D
|
D
P
|
P
A
 
A
A
 
C
Q
 
D
S
 
E
I
 
Y
S
 
S
E
 
L
I
 
P
L
 
L
F
 
L
C
 
Y
Y
 
F
P
 
K
G
 
G
I
 
F
T
 
H
A
 
A
I
 
I
T
 
Q
F
 
A
H
 
H
R
 
R
L
 
I
A
 
N
H
 
H
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
L
L
 
D
G
 
G
L
 
R
P
 
K
L
 
T
L
 
L
A
 
A
R
 
Y
I
 
F
T
 
L
A
 
Q
E
 
N
V
 
R
S
 
M
H
 
S
S
 
E
E
 
V
T
 
F
G
 
G
I
 
V
D
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
A
A
 
A
A
 
R
I
 
L
G
 
G
G
 
Y
S
 
G
F
 
L
F
 
M
I
 
L
D
|
D
H
|
H
G
 
A
T
 
T
G
 
G
V
 
F
V
 
V
I
 
A
G
 
G
E
 
E
T
 
T
C
 
A
V
 
V
I
 
L
G
 
G
D
 
N
R
 
N
V
 
I
R
 
S
I
 
I
Y
 
L
Q
 
H
A
 
G
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
-
K
 
-
S
 
-
F
 
-
P
 
-
R
 
-
D
 
-
E
 
-
T
 
-
G
 
G
A
 
S
L
 
G
I
 
K
K
 
E
G
 
G
Q
 
G
A
 
D
R
|
R
H
|
H
P
 
P
V
 
K
I
 
I
E
 
G
D
 
D
D
 
G
V
 
V
V
 
M
I
 
I
Y
 
G
A
 
A
G
 
N
A
 
A
T
 
S
L
 
I
L
 
L
G
 
G
R
 
N
I
 
I
T
 
R
V
 
I
G
 
G
R
 
S
G
 
N
S
 
A
T
 
K
I
 
I
G
 
G
G
 
A
N
 
G
V
 
S
W
 
V
L
 
V
T
 
V
R
 
S
S
 
D
V
 
V
P
 
P

4n69A Soybean serine acetyltransferase complexed with serine (see paper)
41% identity, 52% coverage: 133:298/319 of query aligns to 74:230/243 of 4n69A

query
sites
4n69A
P
 
P
E
 
S
I
 
L
K
 
R
R
 
S
L
 
A
L
 
A
D
 
V
S
 
A
D
 
D
V
 
L
N
 
R
A
 
A
A
 
A
Y
 
R
L
 
E
G
 
R
D
 
D
P
 
P
A
 
A
A
 
C
Q
 
V
S
 
S
I
 
Y
S
 
S
E
 
H
I
 
C
L
 
L
F
 
L
C
 
N
Y
 
Y
P
 
K
G
 
G
I
 
F
T
 
L
A
 
A
I
 
C
T
 
Q
F
 
A
H
 
H
R
 
R
L
 
V
A
 
A
H
 
H
R
 
L
L
 
L
Y
 
W
Q
 
R
-
 
Q
-
 
S
-
 
R
-
 
R
-
 
P
L
 
L
G
 
A
L
 
L
P
 
A
L
 
L
L
 
H
A
 
S
R
 
R
I
 
I
T
 
A
A
 
-
E
 
-
V
 
-
S
 
-
H
 
-
S
 
N
E
 
V
T
 
F
G
 
A
I
 
V
D
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
A
A
 
A
A
 
R
I
 
I
G
 
G
G
 
K
S
 
G
F
 
I
F
 
L
I
 
F
D
 
D
H
 
H
G
 
A
T
 
T
G
 
G
V
 
V
V
 
V
I
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
C
 
A
V
 
V
I
 
I
G
 
G
D
 
N
R
 
N
V
 
V
R
 
S
I
 
I
Y
 
L
Q
 
H
A
 
H
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
A
x
G
K
 
-
S
 
-
F
 
-
P
 
-
R
 
-
D
 
-
E
 
-
T
 
T
G
 
G
A
 
K
L
 
V
I
 
-
K
 
-
G
 
G
Q
 
G
A
 
D
R
|
R
H
|
H
P
 
P
V
 
K
I
 
I
E
 
G
D
 
D
D
 
G
V
 
V
V
 
L
I
 
I
Y
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
T
L
 
I
L
 
L
G
 
G
R
 
N
I
 
I
T
 
K
V
 
I
G
 
G
R
 
E
G
 
G
S
 
A
T
 
K
I
 
V
G
 
G
G
 
A
N
 
G
V
 
S
W
 
V
L
 
V
T
 
L
R
 
I
S
 
D
V
 
V
P
 
P

8i04A Crystal structure of serine acetyltransferase from salmonella typhimurium complexed with serine (see paper)
35% identity, 59% coverage: 112:298/319 of query aligns to 50:227/258 of 8i04A

query
sites
8i04A
A
 
A
T
 
S
P
 
P
A
 
I
V
 
M
L
 
P
S
 
A
Q
 
I
H
 
A
A
 
I
S
 
R
E
 
E
L
 
V
T
 
V
Q
 
E
A
 
E
F
 
A
A
 
Y
Q
 
A
A
 
A
L
 
D
P
 
P
E
 
E
I
 
M
K
 
I
R
 
A
L
 
S
L
 
A
D
 
A
S
 
C
D
 
D
V
 
I
N
 
Q
A
 
A
A
 
V
Y
 
R
L
 
T
G
 
R
D
|
D
P
|
P
A
 
A
A
 
V
Q
 
D
S
 
K
I
 
Y
S
 
S
E
 
T
I
 
P
L
 
L
F
 
L
C
 
Y
Y
 
L
P
 
K
G
 
G
I
 
F
T
 
H
A
 
A
I
 
L
T
 
Q
F
 
A
H
 
Y
R
 
R
L
 
I
A
 
G
H
 
H
R
 
W
L
 
L
Y
 
W
Q
 
N
L
 
K
G
 
G
L
 
R
P
 
R
L
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
I
I
 
F
T
 
L
A
 
Q
E
 
N
V
 
Q
S
 
V
H
 
S
S
 
V
E
 
S
T
 
F
G
 
Q
I
 
V
D
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
A
A
 
A
A
 
K
I
 
I
G
 
G
G
 
R
S
 
G
F
 
I
F
 
M
I
 
L
D
|
D
H
|
H
G
 
A
T
 
T
G
 
G
V
 
I
V
 
V
I
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
C
 
A
V
 
V
I
 
I
G
 
E
D
 
D
R
 
D
V
 
V
R
 
S
I
 
I
Y
 
L
Q
 
Q
A
 
S
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
A
x
G
K
 
T
S
 
G
F
 
K
P
 
T
R
 
S
D
 
G
E
 
D
T
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
I
 
-
K
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
-
R
|
R
H
|
H
P
 
P
V
 
K
I
 
I
E
 
R
D
 
E
D
 
G
V
 
V
V
 
M
I
 
I
Y
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
K
L
 
I
L
 
L
G
 
G
R
 
N
I
 
I
T
 
E
V
 
V
G
 
G
R
 
R
G
 
G
S
 
A
T
 
K
I
 
I
G
 
G
G
 
A
N
 
G
V
 
S
W
 
V
L
 
V
T
 
L
R
 
Q
S
 
P
V
 
V
P
 
P

8i06A Crystal structure of serine acetyltransferase from salmonella typhimurium complexed with coa (see paper)
35% identity, 59% coverage: 112:298/319 of query aligns to 54:231/244 of 8i06A

query
sites
8i06A
A
 
A
T
 
S
P
 
P
A
 
I
V
 
M
L
 
P
S
 
A
Q
 
I
H
 
A
A
 
I
S
 
R
E
 
E
L
 
V
T
 
V
Q
 
E
A
 
E
F
 
A
A
 
Y
Q
 
A
A
 
A
L
 
D
P
 
P
E
 
E
I
 
M
K
 
I
R
 
A
L
 
S
L
 
A
D
 
A
S
 
C
D
 
D
V
 
I
N
 
Q
A
 
A
A
 
V
Y
 
R
L
 
T
G
 
R
D
 
D
P
|
P
A
 
A
A
 
V
Q
 
D
S
 
K
I
 
Y
S
 
S
E
 
T
I
 
P
L
 
L
F
 
L
C
 
Y
Y
 
L
P
 
K
G
 
G
I
 
F
T
 
H
A
 
A
I
 
L
T
 
Q
F
 
A
H
 
Y
R
 
R
L
 
I
A
 
G
H
 
H
R
 
W
L
 
L
Y
 
W
Q
 
N
L
 
K
G
 
G
L
 
R
P
 
R
L
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
I
I
 
F
T
 
L
A
 
Q
E
 
N
V
 
Q
S
 
V
H
 
S
S
 
V
E
 
S
T
 
F
G
 
Q
I
 
V
D
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
A
A
 
A
A
 
K
I
 
I
G
 
G
G
 
R
S
 
G
F
 
I
F
 
M
I
 
L
D
 
D
H
|
H
G
 
A
T
 
T
G
 
G
V
 
I
V
 
V
I
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
C
 
A
V
 
V
I
 
I
G
 
E
D
 
D
R
 
D
V
 
V
R
 
S
I
 
I
Y
x
L
Q
|
Q
A
 
S
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
G
K
 
T
S
 
G
F
 
K
P
 
T
R
 
S
D
 
G
E
 
D
T
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
I
 
-
K
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
-
R
 
R
H
 
H
P
 
P
V
 
K
I
 
I
E
 
R
D
 
E
D
 
G
V
 
V
V
 
M
I
 
I
Y
x
G
A
|
A
G
 
G
A
 
A
T
 
K
L
 
I
L
 
L
G
 
G
R
 
N
I
 
I
T
 
E
V
 
V
G
 
G
R
 
R
G
 
G
S
 
A
T
 
K
I
 
I
G
|
G
G
x
A
N
 
G
V
 
S
W
 
V
L
 
V
T
 
L
R
 
Q
S
 
P
V
 
V
P
 
P

Sites not aligning to the query:

3gvdI Crystal structure of serine acetyltransferase cyse from yersinia pestis
39% identity, 50% coverage: 142:299/319 of query aligns to 87:235/272 of 3gvdI

query
sites
3gvdI
D
 
D
V
 
I
N
 
L
A
 
A
A
 
V
Y
 
R
L
 
L
G
 
R
D
|
D
P
|
P
A
 
A
A
 
V
Q
 
D
S
 
K
I
 
Y
S
 
S
E
 
T
I
 
P
L
 
L
F
 
L
C
 
Y
Y
 
L
P
 
K
G
 
G
I
 
F
T
 
H
A
 
A
I
 
L
T
 
Q
F
 
A
H
 
Y
R
 
R
L
 
I
A
 
G
H
 
H
R
 
W
L
 
L
Y
 
W
Q
 
A
L
 
Q
G
 
D
L
 
R
P
 
K
L
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
I
I
 
Y
T
 
L
A
 
Q
E
 
N
V
 
Q
S
 
V
H
 
S
S
 
V
E
 
A
T
 
F
G
 
G
I
 
V
D
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
A
A
 
A
A
 
T
I
 
I
G
 
G
G
 
C
S
 
G
F
 
I
F
 
M
I
 
L
D
|
D
H
 
H
G
 
A
T
 
T
G
 
G
V
 
I
V
 
V
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
C
 
A
V
 
V
I
 
V
G
 
E
D
 
N
R
 
D
V
 
V
R
 
S
I
 
I
Y
 
L
Q
 
Q
A
 
S
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
|
G
A
x
G
K
 
T
S
 
G
F
 
K
P
 
T
R
 
S
D
 
G
E
 
D
T
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
I
 
-
K
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
-
R
|
R
H
 
H
P
 
P
V
 
K
I
 
I
E
 
R
D
 
E
D
 
G
V
 
V
V
 
M
I
 
I
Y
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
K
L
 
I
L
 
L
G
 
G
R
 
N
I
 
I
T
 
E
V
 
V
G
 
G
R
 
R
G
 
G
S
 
A
T
 
K
I
 
I
G
 
G
G
 
A
N
 
G
V
 
S
W
 
V
L
 
V
T
 
L
R
 
Q
S
 
S
V
 
V
P
 
P
A
 
A

1t3dA Crystal structure of serine acetyltransferase from e.Coli at 2.2a (see paper)
37% identity, 55% coverage: 123:298/319 of query aligns to 65:231/262 of 1t3dA

query
sites
1t3dA
E
 
E
L
 
V
T
 
V
Q
 
E
A
 
E
F
 
A
A
 
Y
Q
 
A
A
 
A
L
 
D
P
 
P
E
 
E
I
 
M
K
 
I
R
 
A
L
 
S
L
 
A
D
 
A
S
 
C
D
 
D
V
 
I
N
 
Q
A
 
A
A
 
V
Y
 
R
L
 
T
G
 
R
D
|
D
P
|
P
A
 
A
A
 
V
Q
 
D
S
 
K
I
 
Y
S
 
S
E
 
T
I
 
P
L
 
L
F
 
L
C
 
Y
Y
 
L
P
 
K
G
 
G
I
 
F
T
 
H
A
 
A
I
 
L
T
 
Q
F
 
A
H
 
Y
R
 
R
L
 
I
A
 
G
H
 
H
R
 
W
L
 
L
Y
 
W
Q
 
N
L
 
Q
G
 
G
L
 
R
P
 
R
L
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
I
I
 
F
T
 
L
A
 
Q
E
 
N
V
 
Q
S
 
V
H
 
S
S
 
V
E
 
T
T
 
F
G
 
Q
I
 
V
D
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
A
A
 
A
A
 
K
I
 
I
G
 
G
G
 
R
S
 
G
F
 
I
F
 
M
I
 
L
D
|
D
H
 
H
G
 
A
T
 
T
G
 
G
V
 
I
V
 
V
I
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
C
 
A
V
 
V
I
 
I
G
 
E
D
 
N
R
 
D
V
 
V
R
 
S
I
 
I
Y
 
L
Q
 
Q
A
 
S
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
-
K
 
-
S
 
-
F
 
-
P
 
-
R
 
-
D
 
-
E
 
-
T
 
-
G
|
G
A
 
T
L
 
G
I
 
K
K
 
S
G
 
G
Q
 
G
A
 
D
R
|
R
H
|
H
P
 
P
V
 
K
I
 
I
E
 
R
D
 
E
D
 
G
V
 
V
V
 
M
I
 
I
Y
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
K
L
 
I
L
 
L
G
 
G
R
 
N
I
 
I
T
 
E
V
 
V
G
 
G
R
 
R
G
 
G
S
 
A
T
 
K
I
 
I
G
 
G
G
 
A
N
 
G
V
 
S
W
 
V
L
 
V
T
 
L
R
 
Q
S
 
P
V
 
V
P
 
P

8i09A Crystal structure of serine acetyltransferase from salmonella typhimurium complexed with butyl gallate (see paper)
35% identity, 59% coverage: 112:298/319 of query aligns to 53:230/246 of 8i09A

query
sites
8i09A
A
 
A
T
 
S
P
 
P
A
 
I
V
 
M
L
 
P
S
 
A
Q
 
I
H
 
A
A
 
I
S
 
R
E
 
E
L
 
V
T
 
V
Q
 
E
A
 
E
F
 
A
A
 
Y
Q
 
A
A
 
A
L
 
D
P
 
P
E
 
E
I
 
M
K
 
I
R
 
A
L
 
S
L
 
A
D
 
A
S
 
C
D
 
D
V
 
I
N
 
Q
A
 
A
A
 
V
Y
 
R
L
 
T
G
 
R
D
|
D
P
 
P
A
 
A
A
 
V
Q
 
D
S
 
K
I
 
Y
S
 
S
E
 
T
I
 
P
L
 
L
F
 
L
C
 
Y
Y
 
L
P
 
K
G
 
G
I
 
F
T
 
H
A
 
A
I
 
L
T
 
Q
F
 
A
H
 
Y
R
 
R
L
 
I
A
 
G
H
 
H
R
 
W
L
 
L
Y
 
W
Q
 
N
L
 
K
G
 
G
L
 
R
P
 
R
L
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
I
I
 
F
T
 
L
A
 
Q
E
 
N
V
 
Q
S
 
V
H
 
S
S
 
V
E
 
S
T
 
F
G
 
Q
I
 
V
D
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
A
A
 
A
A
 
K
I
 
I
G
 
G
G
 
R
S
 
G
F
 
I
F
 
M
I
 
L
D
|
D
H
|
H
G
 
A
T
 
T
G
 
G
V
 
I
V
 
V
I
 
V
G
|
G
E
 
E
T
 
T
C
 
A
V
 
V
I
 
I
G
 
E
D
 
D
R
 
D
V
 
V
R
 
S
I
 
I
Y
 
L
Q
 
Q
A
 
S
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
A
x
G
K
x
T
S
 
G
F
 
K
P
 
T
R
 
S
D
 
G
E
 
D
T
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
I
 
-
K
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
-
R
|
R
H
|
H
P
 
P
V
 
K
I
 
I
E
 
R
D
 
E
D
 
G
V
 
V
V
 
M
I
 
I
Y
x
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
K
L
 
I
L
 
L
G
 
G
R
 
N
I
 
I
T
 
E
V
 
V
G
 
G
R
 
R
G
 
G
S
 
A
T
x
K
I
|
I
G
|
G
G
 
A
N
 
G
V
 
S
W
 
V
L
 
V
T
x
L
R
 
Q
S
 
P
V
 
V
P
 
P

Sites not aligning to the query:

4h7oA Crystal structure of serine acetyltransferase from vibrio cholerae o1 biovar el tor n16961
38% identity, 55% coverage: 124:298/319 of query aligns to 63:227/258 of 4h7oA

query
sites
4h7oA
L
 
I
T
 
E
Q
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
A
Q
 
-
A
 
A
L
 
D
P
 
P
E
 
S
I
 
I
K
 
S
R
 
E
L
 
A
L
 
A
D
 
A
S
 
C
D
 
D
V
 
I
N
 
C
A
 
A
A
 
T
Y
 
V
L
 
N
G
 
R
D
|
D
P
|
P
A
 
A
A
 
V
Q
 
S
S
 
M
I
 
Y
S
 
S
E
 
M
I
 
P
L
 
L
F
 
L
C
 
Y
Y
 
L
P
 
K
G
 
G
I
 
Y
T
 
H
A
 
A
I
 
L
T
 
Q
F
 
G
H
 
Y
R
 
R
L
 
V
A
 
A
H
 
N
R
 
W
L
 
L
Y
 
W
Q
 
R
L
 
Q
G
 
G
L
 
R
P
 
K
L
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
T
I
x
Y
T
 
F
A
 
Q
E
 
N
V
x
Q
S
 
I
H
 
S
S
 
V
E
 
A
T
 
C
G
 
Q
I
 
V
D
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
A
A
 
A
A
 
R
I
 
I
G
 
G
G
 
R
S
 
G
F
 
I
F
 
M
I
 
L
D
|
D
H
|
H
G
 
A
T
 
T
G
 
G
V
 
I
V
 
V
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
C
 
A
V
 
V
I
 
V
G
 
E
D
 
D
R
 
D
V
 
V
R
 
S
I
 
I
Y
 
L
Q
 
Q
A
 
D
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
A
x
G
K
 
T
S
 
G
F
 
-
P
 
-
R
 
-
D
 
K
E
 
E
T
 
C
G
 
G
A
 
-
L
 
-
I
 
-
K
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
D
R
|
R
H
|
H
P
 
P
V
 
K
I
 
I
E
 
R
D
 
E
D
 
G
V
 
V
V
 
M
I
 
I
Y
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
K
L
 
I
L
 
L
G
 
G
R
 
N
I
 
I
T
 
E
V
 
V
G
 
G
R
 
E
G
 
G
S
 
A
T
 
K
I
 
I
G
 
G
G
 
S
N
 
G
V
 
S
W
 
V
L
 
V
T
 
L
R
 
Q
S
 
A
V
 
V
P
 
P

Sites not aligning to the query:

1ssqD Serine acetyltransferase- complex with cysteine (see paper)
35% identity, 59% coverage: 112:298/319 of query aligns to 50:227/257 of 1ssqD

query
sites
1ssqD
A
 
A
T
 
N
P
 
P
A
 
I
V
 
M
L
 
P
S
 
A
Q
 
I
H
 
S
A
 
L
S
 
R
E
 
E
L
 
I
T
 
I
Q
 
E
A
 
E
F
 
A
A
 
Y
Q
 
Q
A
 
S
L
 
N
P
 
P
E
 
S
I
 
I
K
 
I
R
 
D
L
 
C
L
 
A
D
 
A
S
 
C
D
 
D
V
 
I
N
 
Q
A
 
A
A
 
V
Y
 
R
L
 
H
G
 
R
D
|
D
P
 
P
A
 
A
A
 
V
Q
 
E
S
 
L
I
 
W
S
 
S
E
 
T
I
 
P
L
 
L
F
 
L
C
 
Y
Y
 
L
P
 
K
G
 
G
I
 
F
T
 
H
A
 
A
I
 
I
T
 
Q
F
 
S
H
 
Y
R
 
R
L
 
I
A
 
T
H
 
H
R
 
Y
L
 
L
Y
 
W
Q
 
N
L
 
Q
G
 
N
L
 
R
P
 
K
L
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
L
I
 
Y
T
 
L
A
 
Q
E
 
N
V
 
Q
S
 
I
H
 
S
S
 
V
E
 
A
T
 
F
G
 
D
I
 
V
D
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
A
A
 
A
A
 
K
I
 
I
G
 
G
G
 
H
S
 
G
F
 
I
F
 
M
I
 
F
D
|
D
H
|
H
G
 
A
T
 
T
G
 
G
V
 
I
V
 
V
I
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
C
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
E
D
 
N
R
 
D
V
 
V
R
 
S
I
 
I
Y
 
L
Q
 
Q
A
 
G
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
G
K
 
T
S
 
G
F
 
-
P
 
-
R
 
-
D
 
K
E
 
E
T
 
S
G
 
G
A
 
-
L
 
-
I
 
-
K
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
D
R
 
R
H
 
H
P
 
P
V
 
K
I
 
V
E
 
R
D
 
E
D
 
G
V
 
V
V
 
M
I
 
I
Y
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
K
L
 
I
L
 
L
G
 
G
R
 
N
I
 
I
T
 
E
V
 
V
G
 
G
R
 
K
G
 
Y
S
 
A
T
 
K
I
 
I
G
 
G
G
 
A
N
 
N
V
 
S
W
 
V
L
 
V
T
 
L
R
 
N
S
 
P
V
 
V
P
 
P

4n6bA Soybean serine acetyltransferase complexed with coa (see paper)
39% identity, 52% coverage: 133:298/319 of query aligns to 70:220/233 of 4n6bA

query
sites
4n6bA
P
 
P
E
 
S
I
 
L
K
 
R
R
 
S
L
 
A
L
 
A
D
 
V
S
 
A
D
 
D
V
 
L
N
 
R
A
 
A
A
 
A
Y
 
R
L
 
E
G
 
R
D
 
D
P
 
-
A
 
-
A
 
-
Q
 
V
S
 
S
I
 
Y
S
 
S
E
 
H
I
 
C
L
 
L
F
 
L
C
 
N
Y
 
Y
P
 
K
G
 
G
I
 
F
T
 
L
A
 
A
I
 
C
T
 
Q
F
 
A
H
 
H
R
 
R
L
 
V
A
 
A
H
 
H
R
 
L
L
 
L
Y
 
W
Q
 
R
-
 
Q
-
 
S
-
 
R
-
 
R
-
 
P
L
 
L
G
 
A
L
 
L
P
 
A
L
 
L
L
 
H
A
 
S
R
 
R
I
 
I
T
 
A
A
 
-
E
 
-
V
 
-
S
 
-
H
 
-
S
 
N
E
 
V
T
 
F
G
 
A
I
 
V
D
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
A
A
 
A
A
 
R
I
 
I
G
 
G
G
 
K
S
 
G
F
 
I
F
 
L
I
 
F
D
 
D
H
|
H
G
 
A
T
 
T
G
 
G
V
 
V
V
 
V
I
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
C
 
A
V
 
V
I
 
I
G
 
G
D
 
N
R
 
N
V
 
V
R
 
S
I
 
I
Y
x
L
Q
 
H
A
 
H
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
A
x
G
K
 
-
S
 
-
F
 
-
P
 
-
R
 
-
D
 
-
E
 
-
T
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
I
 
-
K
 
T
G
 
G
Q
 
G
A
 
D
R
 
R
H
 
H
P
 
P
V
 
K
I
 
I
E
 
G
D
 
D
D
 
G
V
 
V
V
 
L
I
 
I
Y
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
T
L
 
I
L
 
L
G
 
G
R
 
N
I
 
I
T
 
K
V
 
I
G
 
G
R
 
E
G
 
G
S
 
A
T
x
K
I
 
V
G
|
G
G
x
A
N
 
G
V
 
S
W
 
V
L
 
V
T
x
L
R
 
I
S
 
D
V
 
V
P
 
P

Sites not aligning to the query:

1sstA Serine acetyltransferase- complex with coa (see paper)
33% identity, 59% coverage: 112:298/319 of query aligns to 50:220/233 of 1sstA

query
sites
1sstA
A
 
A
T
 
N
P
 
P
A
 
I
V
 
M
L
 
P
S
 
A
Q
 
I
H
 
S
A
 
L
S
 
R
E
 
E
L
 
I
T
 
I
Q
 
E
A
 
E
F
 
A
A
 
Y
Q
 
Q
A
 
S
L
 
N
P
 
P
E
 
S
I
 
I
K
 
I
R
 
D
L
 
C
L
 
A
D
 
A
S
 
C
D
 
D
V
 
I
N
 
Q
A
 
A
A
 
V
Y
 
R
L
 
H
G
 
R
D
 
D
P
 
P
A
 
A
A
 
V
Q
 
E
S
 
L
I
 
W
S
 
S
E
 
T
I
 
P
L
 
L
F
 
L
C
 
Y
Y
 
L
P
 
K
G
 
G
I
 
F
T
 
H
A
 
A
I
 
I
T
 
Q
F
 
S
H
 
Y
R
 
R
L
 
I
A
 
T
H
 
H
R
 
Y
L
 
L
Y
 
W
Q
 
N
L
 
Q
G
 
N
L
 
R
P
 
K
L
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
L
I
 
Y
T
 
L
A
 
Q
E
 
N
V
 
Q
S
 
I
H
 
S
S
 
V
E
 
A
T
 
F
G
 
D
I
 
V
D
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
A
A
 
A
A
 
K
I
 
I
G
 
G
G
 
H
S
 
G
F
 
I
F
 
M
I
 
F
D
 
D
H
|
H
G
 
A
T
 
T
G
 
G
V
 
I
V
 
V
I
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
C
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
E
D
 
N
R
 
D
V
 
V
R
 
S
I
 
I
Y
x
L
Q
 
Q
A
 
G
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
A
x
G
K
x
T
S
 
-
F
 
-
P
 
-
R
 
-
D
 
-
E
 
-
T
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
I
 
-
K
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
-
R
 
-
H
 
H
P
 
P
V
 
K
I
 
V
E
 
R
D
 
E
D
 
G
V
 
V
V
 
M
I
 
I
Y
 
G
A
|
A
G
 
G
A
 
A
T
 
K
L
 
I
L
|
L
G
 
G
R
 
N
I
 
I
T
 
E
V
 
V
G
 
G
R
 
K
G
 
Y
S
 
A
T
x
K
I
 
I
G
|
G
G
x
A
N
 
N
V
 
S
W
x
V
L
 
V
T
x
L
R
 
N
S
 
P
V
 
V
P
 
P

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>Synpcc7942_B2663 FitnessBrowser__SynE:Synpcc7942_B2663
MSLSPRSDRTEIRRSWGLDSIVSALSQASTDPLPHHLLSDQFYPLPSRESLGLILHGLRS
VLFPRHFGDPELSVETTHYFIGNTLDKTLNLLNEQIRRELWLQHVTQGTPEATPAVLSQH
ASELTQAFAQALPEIKRLLDSDVNAAYLGDPAAQSISEILFCYPGITAITFHRLAHRLYQ
LGLPLLARITAEVSHSETGIDIHPGAAIGGSFFIDHGTGVVIGETCVIGDRVRIYQAVTL
GAKSFPRDETGALIKGQARHPVIEDDVVIYAGATLLGRITVGRGSTIGGNVWLTRSVPAG
SFISQAQIRSDNFESGGGI

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory