SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_000590982.1 NCBI__GCF_000382825.1:WP_000590982.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4ymuJ Crystal structure of an amino acid abc transporter complex with arginines and atps (see paper)
49% identity, 97% coverage: 1:240/247 of query aligns to 1:237/240 of 4ymuJ

query
sites
4ymuJ
M
 
M
I
 
I
K
 
F
I
 
V
S
 
N
N
 
D
L
 
V
S
 
Y
K
 
K
S
 
N
F
|
F
S
 
G
G
 
S
Q
 
L
T
 
E
V
|
V
L
 
L
D
 
K
H
 
G
L
 
V
N
 
T
L
 
L
D
 
K
I
 
V
Q
 
N
K
 
K
G
 
G
E
 
E
V
 
V
V
 
V
A
 
V
L
 
I
I
 
I
G
 
G
S
 
P
S
|
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
F
 
L
L
 
L
R
 
R
S
 
C
L
 
I
N
 
N
Y
 
L
L
 
L
E
 
E
T
 
E
P
 
P
D
 
T
S
 
K
G
 
G
S
 
E
I
 
V
Q
 
F
I
 
I
D
 
D
D
 
G
F
 
V
S
 
K
V
 
I
D
 
N
F
 
N
S
 
G
K
 
K
I
 
V
T
 
N
Q
 
-
E
 
-
E
 
-
I
 
I
L
 
N
A
 
K
L
 
V
R
 
R
R
 
Q
K
 
K
L
 
V
S
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
H
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
F
E
 
P
R
 
H
R
 
L
T
 
T
A
 
A
L
 
I
D
 
E
N
 
N
V
 
I
K
 
T
E
 
L
G
 
A
L
 
P
V
 
V
V
 
K
V
 
V
K
 
K
K
 
K
L
 
M
S
 
N
D
 
K
Q
 
K
E
 
E
A
 
A
T
 
E
K
 
E
I
 
L
A
 
A
K
 
V
E
 
D
E
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
L
D
 
D
R
 
K
E
 
K
N
 
D
H
 
Q
Y
 
Y
P
 
P
R
 
I
H
 
K
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
L
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
K
 
Q
P
 
P
D
 
E
V
 
V
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
L
 
M
V
 
V
G
 
K
E
 
E
V
 
V
E
 
L
K
 
N
S
 
V
I
 
M
A
 
K
D
 
Q
A
 
L
A
 
A
K
 
N
S
 
E
G
 
G
Q
 
M
T
 
T
M
 
M
I
 
V
L
 
V
V
 
V
S
 
T
H
|
H
D
 
E
M
 
M
S
 
G
F
 
F
V
 
A
A
 
R
Q
 
E
V
 
V
A
 
G
D
 
D
K
 
R
I
 
V
L
 
I
F
 
F
L
 
M
D
 
D
K
 
D
G
 
G
K
 
V
I
 
I
I
 
V
E
 
E
S
 
E
G
 
G
T
 
T
P
 
P
D
 
E
E
 
E
I
 
I
I
 
F
H
 
Y
H
 
R
P
 
A
K
 
K
E
 
N
E
 
E
R
 
R
T
 
T
K
 
R
E
 
E
F
 
F
F
 
L
A
 
S

4u00A Crystal structure of ttha1159 in complex with adp (see paper)
47% identity, 97% coverage: 1:239/247 of query aligns to 2:236/241 of 4u00A

query
sites
4u00A
M
 
I
I
 
I
K
 
R
I
 
I
S
 
R
N
 
N
L
 
L
S
 
H
K
 
K
S
 
W
F
|
F
S
 
G
G
 
P
Q
 
L
T
 
H
V
|
V
L
 
L
D
 
K
H
 
G
L
 
I
N
 
H
L
 
L
D
 
E
I
 
V
Q
 
A
K
 
P
G
 
G
E
 
E
V
 
K
V
 
L
A
 
V
L
 
I
I
 
I
G
 
G
S
 
P
S
|
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
F
 
L
L
 
I
R
 
R
S
 
T
L
 
I
N
 
N
Y
 
R
L
 
L
E
 
E
T
 
D
P
 
F
D
 
Q
S
 
E
G
 
G
S
 
E
I
 
V
Q
 
V
I
 
V
D
 
D
D
 
G
F
 
L
S
 
S
V
 
V
D
 
K
F
 
D
S
 
D
K
 
R
I
 
A
T
 
L
Q
 
R
E
 
E
E
 
-
I
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
I
R
 
R
R
 
R
K
 
E
L
 
V
S
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
Q
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
F
E
 
P
R
 
H
R
 
M
T
 
T
A
 
V
L
 
L
D
 
E
N
 
N
V
 
V
K
 
T
E
 
L
G
 
A
L
 
P
V
 
M
V
 
R
V
 
V
K
 
R
K
 
R
L
 
W
S
 
P
D
 
R
Q
 
E
E
 
K
A
 
A
T
 
E
K
 
K
I
 
K
A
 
A
K
 
L
E
 
E
E
 
L
L
 
L
A
 
E
K
 
R
V
 
V
G
 
G
L
 
I
S
 
L
D
 
D
R
 
Q
E
 
A
N
 
R
H
 
K
Y
 
Y
P
 
P
R
 
A
H
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
K
 
E
P
 
P
D
 
K
V
 
I
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
L
 
M
V
 
V
G
 
G
E
 
E
V
 
V
E
 
L
K
 
D
S
 
V
I
 
M
A
 
R
D
 
D
A
 
L
A
 
A
K
 
Q
S
 
G
G
 
G
Q
 
M
T
 
T
M
 
M
I
 
V
L
 
V
V
 
V
S
 
T
H
 
H
D
 
E
M
 
M
S
 
G
F
 
F
V
 
A
A
 
R
Q
 
E
V
 
V
A
 
A
D
 
D
K
 
R
I
 
V
L
 
V
F
 
F
L
 
M
D
 
D
K
 
G
G
 
G
K
 
Q
I
 
I
I
 
V
E
 
E
S
 
E
G
 
G
T
 
R
P
 
P
D
 
E
E
 
E
I
 
I
I
 
F
H
 
T
H
 
R
P
 
P
K
 
K
E
 
E
E
 
E
R
 
R
T
 
T
K
 
R
E
 
S
F
 
F
F
 
L

3c4jA Abc protein artp in complex with atp-gamma-s
48% identity, 97% coverage: 1:240/247 of query aligns to 3:239/242 of 3c4jA

query
sites
3c4jA
M
 
M
I
 
I
K
 
D
I
 
V
S
 
H
N
 
Q
L
 
L
S
 
K
K
 
K
S
 
S
F
|
F
S
 
G
G
 
S
Q
 
L
T
 
E
V
|
V
L
 
L
D
 
K
H
 
G
L
 
I
N
 
N
L
 
V
D
 
H
I
 
I
Q
 
R
K
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
V
V
 
V
A
 
V
L
 
V
I
 
I
G
 
G
S
 
P
S
|
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
F
 
F
L
 
L
R
 
R
S
 
C
L
 
L
N
 
N
Y
 
L
L
 
L
E
 
E
T
 
D
P
 
F
D
 
D
S
 
E
G
 
G
S
 
E
I
 
I
Q
 
I
I
 
I
D
 
D
D
 
G
F
 
I
S
 
N
V
 
L
D
 
-
F
 
-
S
 
-
K
 
K
I
 
A
T
 
K
Q
 
D
E
 
T
E
 
N
I
 
L
L
 
N
A
 
K
L
 
V
R
 
R
R
 
E
K
 
E
L
 
V
S
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
R
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
F
E
 
P
R
 
H
R
 
M
T
 
T
A
 
V
L
 
L
D
 
N
N
 
N
V
 
I
K
 
T
E
 
L
G
 
A
L
 
P
V
 
M
V
 
K
V
 
V
K
 
R
K
 
K
L
 
W
S
 
P
D
 
R
Q
 
E
E
 
K
A
 
A
T
 
E
K
 
A
I
 
K
A
 
A
K
 
M
E
 
E
E
 
L
L
 
L
A
 
D
K
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
K
D
 
D
R
 
K
E
 
A
N
 
H
H
 
A
Y
 
Y
P
 
P
R
 
D
H
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
K
 
E
P
 
P
D
 
K
V
 
I
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
L
 
M
V
 
V
G
 
G
E
 
E
V
 
V
E
 
L
K
 
S
S
 
V
I
 
M
A
 
K
D
 
Q
A
 
L
A
 
A
K
 
N
S
 
E
G
 
G
Q
 
M
T
 
T
M
 
M
I
 
V
L
 
V
V
 
V
S
 
T
H
 
H
D
 
E
M
 
M
S
 
G
F
 
F
V
 
A
A
 
R
Q
 
E
V
 
V
A
 
G
D
 
D
K
 
R
I
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
M
D
 
D
K
 
G
G
 
G
K
 
Y
I
 
I
I
 
I
E
 
E
S
 
E
G
 
G
T
 
K
P
 
P
D
 
E
E
 
D
I
 
L
I
 
F
H
 
D
H
 
R
P
 
P
K
 
Q
E
 
H
E
 
E
R
 
R
T
 
T
K
 
K
E
 
A
F
 
F
F
 
L
A
 
S

3c41J Abc protein artp in complex with amp-pnp/mg2+
48% identity, 97% coverage: 1:240/247 of query aligns to 3:239/242 of 3c41J

query
sites
3c41J
M
 
M
I
 
I
K
 
D
I
 
V
S
 
H
N
 
Q
L
 
L
S
 
K
K
 
K
S
 
S
F
|
F
S
 
G
G
 
S
Q
 
L
T
 
E
V
|
V
L
 
L
D
 
K
H
 
G
L
 
I
N
 
N
L
 
V
D
 
H
I
 
I
Q
 
R
K
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
V
V
 
V
A
 
V
L
 
V
I
 
I
G
 
G
S
 
P
S
|
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
F
 
F
L
 
L
R
 
R
S
 
C
L
 
L
N
 
N
Y
 
L
L
 
L
E
 
E
T
 
D
P
 
F
D
 
D
S
 
E
G
 
G
S
 
E
I
 
I
Q
 
I
I
 
I
D
 
D
D
 
G
F
 
I
S
 
N
V
 
L
D
 
-
F
 
-
S
 
-
K
 
K
I
 
A
T
 
K
Q
 
D
E
 
T
E
 
N
I
 
L
L
 
N
A
 
K
L
 
V
R
 
R
R
 
E
K
 
E
L
 
V
S
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
R
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
F
E
 
P
R
 
H
R
 
M
T
 
T
A
 
V
L
 
L
D
 
N
N
 
N
V
 
I
K
 
T
E
 
L
G
 
A
L
 
P
V
 
M
V
 
K
V
 
V
K
 
R
K
 
K
L
 
W
S
 
P
D
 
R
Q
 
E
E
 
K
A
 
A
T
 
E
K
 
A
I
 
K
A
 
A
K
 
M
E
 
E
E
 
L
L
 
L
A
 
D
K
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
K
D
 
D
R
 
K
E
 
A
N
 
H
H
 
A
Y
 
Y
P
 
P
R
 
D
H
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
K
 
E
P
 
P
D
 
K
V
 
I
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
|
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
L
 
M
V
 
V
G
 
G
E
 
E
V
 
V
E
 
L
K
 
S
S
 
V
I
 
M
A
 
K
D
 
Q
A
 
L
A
 
A
K
 
N
S
 
E
G
 
G
Q
 
M
T
 
T
M
 
M
I
 
V
L
 
V
V
 
V
S
 
T
H
 
H
D
 
E
M
 
M
S
 
G
F
 
F
V
 
A
A
 
R
Q
 
E
V
 
V
A
 
G
D
 
D
K
 
R
I
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
M
D
 
D
K
 
G
G
 
G
K
 
Y
I
 
I
I
 
I
E
 
E
S
 
E
G
 
G
T
 
K
P
 
P
D
 
E
E
 
D
I
 
L
I
 
F
H
 
D
H
 
R
P
 
P
K
 
Q
E
 
H
E
 
E
R
 
R
T
 
T
K
 
K
E
 
A
F
 
F
F
 
L
A
 
S

2olkA Abc protein artp in complex with adp-beta-s
48% identity, 97% coverage: 1:240/247 of query aligns to 3:239/242 of 2olkA

query
sites
2olkA
M
 
M
I
 
I
K
 
D
I
 
V
S
 
H
N
 
Q
L
 
L
S
 
K
K
 
K
S
 
S
F
|
F
S
 
G
G
 
S
Q
 
L
T
 
E
V
|
V
L
 
L
D
 
K
H
 
G
L
 
I
N
 
N
L
 
V
D
 
H
I
 
I
Q
 
R
K
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
V
V
 
V
A
 
V
L
 
V
I
 
I
G
 
G
S
 
P
S
|
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
F
 
F
L
 
L
R
 
R
S
 
C
L
 
L
N
 
N
Y
 
L
L
 
L
E
 
E
T
 
D
P
 
F
D
 
D
S
 
E
G
 
G
S
 
E
I
 
I
Q
 
I
I
 
I
D
 
D
D
 
G
F
 
I
S
 
N
V
 
L
D
 
-
F
 
-
S
 
-
K
 
K
I
 
A
T
 
K
Q
 
D
E
 
T
E
 
N
I
 
L
L
 
N
A
 
K
L
 
V
R
 
R
R
 
E
K
 
E
L
 
V
S
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
R
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
F
E
 
P
R
 
H
R
 
M
T
 
T
A
 
V
L
 
L
D
 
N
N
 
N
V
 
I
K
 
T
E
 
L
G
 
A
L
 
P
V
 
M
V
 
K
V
 
V
K
 
R
K
 
K
L
 
W
S
 
P
D
 
R
Q
 
E
E
 
K
A
 
A
T
 
E
K
 
A
I
 
K
A
 
A
K
 
M
E
 
E
E
 
L
L
 
L
A
 
D
K
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
K
D
 
D
R
 
K
E
 
A
N
 
H
H
 
A
Y
 
Y
P
 
P
R
 
D
H
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
K
 
E
P
 
P
D
 
K
V
 
I
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
L
 
M
V
 
V
G
 
G
E
 
E
V
 
V
E
 
L
K
 
S
S
 
V
I
 
M
A
 
K
D
 
Q
A
 
L
A
 
A
K
 
N
S
 
E
G
 
G
Q
 
M
T
 
T
M
 
M
I
 
V
L
 
V
V
 
V
S
 
T
H
 
H
D
 
E
M
 
M
S
 
G
F
 
F
V
 
A
A
 
R
Q
 
E
V
 
V
A
 
G
D
 
D
K
 
R
I
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
M
D
 
D
K
 
G
G
 
G
K
 
Y
I
 
I
I
 
I
E
 
E
S
 
E
G
 
G
T
 
K
P
 
P
D
 
E
E
 
D
I
 
L
I
 
F
H
 
D
H
 
R
P
 
P
K
 
Q
E
 
H
E
 
E
R
 
R
T
 
T
K
 
K
E
 
A
F
 
F
F
 
L
A
 
S

2oljA Abc protein artp in complex with adp/mg2+
48% identity, 97% coverage: 1:240/247 of query aligns to 3:239/242 of 2oljA

query
sites
2oljA
M
 
M
I
 
I
K
 
D
I
 
V
S
 
H
N
 
Q
L
 
L
S
 
K
K
 
K
S
 
S
F
|
F
S
 
G
G
 
S
Q
 
L
T
 
E
V
|
V
L
 
L
D
 
K
H
 
G
L
 
I
N
 
N
L
 
V
D
 
H
I
 
I
Q
 
R
K
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
V
V
 
V
A
 
V
L
 
V
I
 
I
G
 
G
S
 
P
S
|
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
F
 
F
L
 
L
R
 
R
S
 
C
L
 
L
N
 
N
Y
 
L
L
 
L
E
 
E
T
 
D
P
 
F
D
 
D
S
 
E
G
 
G
S
 
E
I
 
I
Q
 
I
I
 
I
D
 
D
D
 
G
F
 
I
S
 
N
V
 
L
D
 
-
F
 
-
S
 
-
K
 
K
I
 
A
T
 
K
Q
 
D
E
 
T
E
 
N
I
 
L
L
 
N
A
 
K
L
 
V
R
 
R
R
 
E
K
 
E
L
 
V
S
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
R
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
F
E
 
P
R
 
H
R
 
M
T
 
T
A
 
V
L
 
L
D
 
N
N
 
N
V
 
I
K
 
T
E
 
L
G
 
A
L
 
P
V
 
M
V
 
K
V
 
V
K
 
R
K
 
K
L
 
W
S
 
P
D
 
R
Q
 
E
E
 
K
A
 
A
T
 
E
K
 
A
I
 
K
A
 
A
K
 
M
E
 
E
E
 
L
L
 
L
A
 
D
K
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
K
D
 
D
R
 
K
E
 
A
N
 
H
H
 
A
Y
 
Y
P
 
P
R
 
D
H
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
K
 
E
P
 
P
D
 
K
V
 
I
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
L
 
M
V
 
V
G
 
G
E
 
E
V
 
V
E
 
L
K
 
S
S
 
V
I
 
M
A
 
K
D
 
Q
A
 
L
A
 
A
K
 
N
S
 
E
G
 
G
Q
 
M
T
 
T
M
 
M
I
 
V
L
 
V
V
 
V
S
 
T
H
 
H
D
 
E
M
 
M
S
 
G
F
 
F
V
 
A
A
 
R
Q
 
E
V
 
V
A
 
G
D
 
D
K
 
R
I
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
M
D
 
D
K
 
G
G
 
G
K
 
Y
I
 
I
I
 
I
E
 
E
S
 
E
G
 
G
T
 
K
P
 
P
D
 
E
E
 
D
I
 
L
I
 
F
H
 
D
H
 
R
P
 
P
K
 
Q
E
 
H
E
 
E
R
 
R
T
 
T
K
 
K
E
 
A
F
 
F
F
 
L
A
 
S

P02915 Histidine/lysine/arginine/ornithine transport ATP-binding protein HisP; EC 7.4.2.1 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
44% identity, 96% coverage: 2:239/247 of query aligns to 7:253/258 of P02915

query
sites
P02915
I
 
L
K
 
H
I
 
V
S
 
I
N
 
D
L
 
L
S
 
H
K
 
K
S
 
R
F
 
Y
S
 
G
G
 
G
Q
 
H
T
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
K
H
 
G
L
 
V
N
 
S
L
 
L
D
 
Q
I
 
A
Q
 
R
K
 
A
G
 
G
E
 
D
V
 
V
V
 
I
A
 
S
L
 
I
I
 
I
G
 
G
S
 
S
S
|
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
F
 
F
L
 
L
R
 
R
S
 
C
L
 
I
N
 
N
Y
 
F
L
 
L
E
 
E
T
 
K
P
 
P
D
 
S
S
 
E
G
 
G
S
 
A
I
 
I
Q
 
I
I
 
V
D
 
N
D
 
G
F
 
Q
S
 
N
V
 
I
D
 
N
F
 
L
S
 
V
K
 
R
-
 
D
-
 
K
-
 
D
-
 
G
-
 
Q
-
 
L
-
 
K
-
 
V
I
 
A
T
 
D
Q
 
K
E
 
N
E
 
Q
I
 
L
L
 
R
A
 
L
L
 
L
R
 
R
R
 
T
K
 
R
L
 
L
S
 
T
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
H
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
W
E
 
S
R
 
H
R
 
M
T
 
T
A
 
V
L
 
L
D
 
E
N
 
N
V
 
V
K
 
M
E
 
E
G
 
A
L
 
P
V
 
I
V
 
Q
V
 
V
K
 
L
K
 
G
L
 
L
S
 
S
D
 
K
Q
 
H
E
 
D
A
 
A
T
 
R
K
 
E
I
 
R
A
 
A
K
 
L
E
 
K
E
 
Y
L
 
L
A
 
A
K
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
I
S
 
D
D
 
E
R
 
R
-
 
A
E
 
Q
N
 
G
H
 
K
Y
 
Y
P
 
P
R
 
V
H
 
H
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
S
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
K
 
E
P
 
P
D
 
D
V
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
L
 
L
V
 
V
G
 
G
E
 
E
V
 
V
E
 
L
K
 
R
S
 
I
I
 
M
A
 
Q
D
 
Q
A
 
L
A
 
A
K
 
E
S
 
E
G
 
G
Q
 
K
T
 
T
M
 
M
I
 
V
L
 
V
V
 
V
S
 
T
H
 
H
D
 
E
M
 
M
S
 
G
F
 
F
V
 
A
A
 
R
Q
 
H
V
 
V
A
 
S
D
 
S
K
 
H
I
 
V
L
 
I
F
 
F
L
 
L
D
 
H
K
 
Q
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
E
E
 
E
S
 
E
G
 
G
T
 
D
P
 
P
D
 
E
E
 
Q
I
 
V
I
 
F
H
 
G
H
 
N
P
 
P
K
 
Q
E
 
S
E
 
P
R
 
R
T
 
L
K
 
Q
E
 
Q
F
 
F
F
 
L

1b0uA Atp-binding subunit of the histidine permease from salmonella typhimurium (see paper)
44% identity, 96% coverage: 2:239/247 of query aligns to 3:249/258 of 1b0uA

query
sites
1b0uA
I
 
L
K
 
H
I
 
V
S
 
I
N
 
D
L
 
L
S
 
H
K
 
K
S
 
R
F
x
Y
S
 
G
G
 
G
Q
x
H
T
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
K
H
 
G
L
 
V
N
 
S
L
 
L
D
 
Q
I
 
A
Q
 
R
K
 
A
G
 
G
E
 
D
V
 
V
V
 
I
A
 
S
L
 
I
I
 
I
G
 
G
S
 
S
S
|
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
F
 
F
L
 
L
R
 
R
S
 
C
L
 
I
N
 
N
Y
 
F
L
 
L
E
 
E
T
 
K
P
 
P
D
 
S
S
 
E
G
 
G
S
 
A
I
 
I
Q
 
I
I
 
V
D
 
N
D
 
G
F
 
Q
S
 
N
V
 
I
D
 
N
F
 
L
S
 
V
K
 
R
-
 
D
-
 
K
-
 
D
-
 
G
-
 
Q
-
 
L
-
 
K
-
 
V
I
 
A
T
 
D
Q
 
K
E
 
N
E
 
Q
I
 
L
L
 
R
A
 
L
L
 
L
R
 
R
R
 
T
K
 
R
L
 
L
S
 
T
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
H
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
W
E
 
S
R
 
H
R
 
M
T
 
T
A
 
V
L
 
L
D
 
E
N
 
N
V
 
V
K
 
M
E
 
E
G
 
A
L
 
P
V
 
I
V
 
Q
V
 
V
K
 
L
K
 
G
L
 
L
S
 
S
D
 
K
Q
 
H
E
 
D
A
 
A
T
 
R
K
 
E
I
 
R
A
 
A
K
 
L
E
 
K
E
 
Y
L
 
L
A
 
A
K
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
I
S
 
D
D
 
E
R
 
R
-
 
A
E
 
Q
N
 
G
H
 
K
Y
 
Y
P
 
P
R
 
V
H
 
H
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
S
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
K
 
E
P
 
P
D
 
D
V
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
L
 
L
V
 
V
G
 
G
E
 
E
V
 
V
E
 
L
K
 
R
S
 
I
I
 
M
A
 
Q
D
 
Q
A
 
L
A
 
A
K
 
E
S
 
E
G
 
G
Q
 
K
T
 
T
M
 
M
I
 
V
L
 
V
V
 
V
S
 
T
H
 
H
D
 
E
M
 
M
S
 
G
F
 
F
V
 
A
A
 
R
Q
 
H
V
 
V
A
 
S
D
 
S
K
 
H
I
 
V
L
 
I
F
 
F
L
 
L
D
 
H
K
 
Q
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
E
E
 
E
S
 
E
G
 
G
T
 
D
P
 
P
D
 
E
E
 
Q
I
 
V
I
 
F
H
 
G
H
 
N
P
 
P
K
 
Q
E
 
S
E
 
P
R
 
R
T
 
L
K
 
Q
E
 
Q
F
 
F
F
 
L

P30750 Methionine import ATP-binding protein MetN; EC 7.4.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
39% identity, 98% coverage: 1:241/247 of query aligns to 1:243/343 of P30750

query
sites
P30750
M
 
M
I
 
I
K
 
K
I
 
L
S
 
S
N
 
N
L
 
I
S
 
T
K
 
K
S
 
V
F
 
F
S
 
H
G
 
Q
Q
 
G
T
 
T
-
 
R
-
 
T
-
 
I
-
 
Q
V
 
A
L
 
L
D
 
N
H
 
N
L
 
V
N
 
S
L
 
L
D
 
H
I
 
V
Q
 
P
K
 
A
G
 
G
E
 
Q
V
 
I
V
 
Y
A
 
G
L
 
V
I
 
I
G
 
G
S
 
A
S
|
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
F
 
L
L
 
I
R
 
R
S
 
C
L
 
V
N
 
N
Y
 
L
L
 
L
E
 
E
T
 
R
P
 
P
D
 
T
S
 
E
G
 
G
S
 
S
I
 
V
Q
 
L
I
 
V
D
 
D
D
 
-
F
 
-
S
 
G
V
 
Q
D
 
E
F
 
L
S
 
T
K
 
T
I
 
L
T
 
S
Q
 
E
E
 
S
E
 
E
I
 
L
L
 
T
A
 
K
L
 
A
R
 
R
R
 
R
K
 
Q
L
 
I
S
 
G
M
 
M
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
H
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
L
E
 
S
R
 
S
R
 
R
T
 
T
A
 
V
L
 
F
D
 
G
N
 
N
V
 
V
K
 
A
E
 
L
G
 
P
L
 
L
V
 
E
V
 
L
V
 
D
K
 
N
K
 
T
L
 
P
S
 
K
D
 
D
Q
 
-
E
 
E
A
 
V
T
 
K
K
 
R
I
 
R
A
 
V
K
 
T
E
 
E
E
 
L
L
 
L
A
 
S
K
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
G
D
 
D
R
 
K
E
 
H
N
 
D
H
 
S
Y
 
Y
P
 
P
R
 
S
H
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
S
K
 
N
P
 
P
D
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
C
D
 
D
E
|
E
P
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
A
L
 
T
V
 
T
G
 
R
E
 
S
V
 
I
E
 
L
K
 
E
S
 
L
I
 
L
A
 
K
D
 
D
A
 
I
A
 
N
K
 
R
S
 
R
-
 
L
G
 
G
Q
 
L
T
 
T
M
 
I
I
 
L
L
 
L
V
 
I
S
 
T
H
 
H
D
 
E
M
 
M
S
 
D
F
 
V
V
 
V
A
 
K
Q
 
R
V
 
I
A
 
C
D
 
D
K
 
C
I
 
V
L
 
A
F
 
V
L
 
I
D
 
S
K
 
N
G
 
G
K
 
E
I
 
L
I
 
I
E
 
E
S
 
Q
G
 
D
T
 
T
P
 
V
D
 
S
E
 
E
I
 
V
I
 
F
H
 
S
H
 
H
P
 
P
K
 
K
E
 
T
E
 
P
R
 
L
T
 
A
K
 
Q
E
 
K
F
 
F
F
 
I
A
 
Q
S
 
S

Sites not aligning to the query:

6cvlD Crystal structure of the escherichia coli atpgs-bound metni methionine abc transporter in complex with its metq binding protein (see paper)
39% identity, 98% coverage: 1:241/247 of query aligns to 2:244/344 of 6cvlD

query
sites
6cvlD
M
 
M
I
 
I
K
 
K
I
 
L
S
 
S
N
 
N
L
 
I
S
 
T
K
 
K
S
 
V
F
|
F
S
 
H
G
x
Q
Q
 
G
T
 
T
-
 
R
-
 
T
-
x
I
-
 
Q
V
 
A
L
 
L
D
 
N
H
 
N
L
 
V
N
 
S
L
 
L
D
 
H
I
 
V
Q
 
P
K
 
A
G
 
G
E
 
Q
V
 
I
V
 
Y
A
 
G
L
 
V
I
 
I
G
 
G
S
 
A
S
|
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
F
 
L
L
 
I
R
 
R
S
 
C
L
 
V
N
 
N
Y
 
L
L
 
L
E
 
E
T
 
R
P
 
P
D
 
T
S
 
E
G
 
G
S
 
S
I
 
V
Q
 
L
I
 
V
D
 
D
D
 
-
F
 
-
S
 
G
V
 
Q
D
 
E
F
 
L
S
 
T
K
 
T
I
 
L
T
 
S
Q
 
E
E
 
S
E
 
E
I
 
L
L
 
T
A
 
K
L
 
A
R
 
R
R
 
R
K
 
Q
L
 
I
S
 
G
M
 
M
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
H
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
L
E
 
S
R
 
S
R
 
R
T
 
T
A
 
V
L
 
F
D
 
G
N
 
N
V
 
V
K
 
A
E
 
L
G
 
P
L
 
L
V
 
E
V
 
L
V
 
D
K
 
N
K
 
T
L
 
P
S
 
K
D
 
D
Q
 
-
E
 
E
A
 
V
T
 
K
K
 
R
I
 
R
A
 
V
K
 
T
E
 
E
E
 
L
L
 
L
A
 
S
K
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
G
D
 
D
R
 
K
E
 
H
N
 
D
H
 
S
Y
 
Y
P
 
P
R
 
S
H
x
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
Q
|
Q
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
S
K
 
N
P
 
P
D
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
A
L
 
T
V
 
T
G
 
R
E
 
S
V
 
I
E
 
L
K
 
E
S
 
L
I
 
L
A
 
K
D
 
D
A
 
I
A
 
N
K
 
R
S
 
R
-
 
L
G
 
G
Q
 
L
T
 
T
M
 
I
I
 
L
L
 
L
V
 
I
S
 
T
H
|
H
D
 
E
M
 
M
S
 
D
F
 
V
V
 
V
A
 
K
Q
 
R
V
 
I
A
 
C
D
 
D
K
 
C
I
 
V
L
 
A
F
 
V
L
 
I
D
 
S
K
 
N
G
 
G
K
 
E
I
 
L
I
 
I
E
 
E
S
 
Q
G
 
D
T
 
T
P
 
V
D
 
S
E
 
E
I
 
V
I
 
F
H
 
S
H
 
H
P
 
P
K
 
K
E
 
T
E
 
P
R
 
L
T
 
A
K
 
Q
E
 
K
F
 
F
F
 
I
A
 
Q
S
 
S

3tuzC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 semet soak crystal form (see paper)
39% identity, 98% coverage: 1:241/247 of query aligns to 2:244/344 of 3tuzC

query
sites
3tuzC
M
 
M
I
 
I
K
 
K
I
 
L
S
 
S
N
 
N
L
 
I
S
 
T
K
 
K
S
 
V
F
|
F
S
 
H
G
x
Q
Q
 
G
T
 
T
-
 
R
-
 
T
-
 
I
-
 
Q
V
 
A
L
 
L
D
 
N
H
 
N
L
 
V
N
 
S
L
 
L
D
 
H
I
 
V
Q
 
P
K
 
A
G
 
G
E
 
Q
V
 
I
V
 
Y
A
 
G
L
 
V
I
 
I
G
 
G
S
 
A
S
 
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
F
 
L
L
 
I
R
 
R
S
 
C
L
 
V
N
 
N
Y
 
L
L
 
L
E
 
E
T
 
R
P
 
P
D
 
T
S
 
E
G
 
G
S
 
S
I
 
V
Q
 
L
I
 
V
D
 
D
D
 
-
F
 
-
S
 
G
V
 
Q
D
 
E
F
 
L
S
 
T
K
 
T
I
 
L
T
 
S
Q
 
E
E
 
S
E
 
E
I
 
L
L
 
T
A
 
K
L
 
A
R
 
R
R
 
R
K
 
Q
L
 
I
S
 
G
M
 
M
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
H
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
L
E
 
S
R
 
S
R
 
R
T
 
T
A
 
V
L
 
F
D
 
G
N
 
N
V
 
V
K
 
A
E
 
L
G
 
P
L
 
L
V
 
E
V
 
L
V
 
D
K
 
N
K
 
T
L
 
P
S
 
K
D
 
D
Q
 
-
E
 
E
A
 
V
T
 
K
K
 
R
I
 
R
A
 
V
K
 
T
E
 
E
E
 
L
L
 
L
A
 
S
K
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
G
D
 
D
R
 
K
E
 
H
N
 
D
H
 
S
Y
 
Y
P
 
P
R
 
S
H
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
S
K
 
N
P
 
P
D
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
A
L
 
T
V
 
T
G
 
R
E
 
S
V
 
I
E
 
L
K
 
E
S
 
L
I
 
L
A
 
K
D
 
D
A
 
I
A
 
N
K
 
R
S
 
R
-
 
L
G
 
G
Q
 
L
T
 
T
M
 
I
I
 
L
L
 
L
V
 
I
S
 
T
H
 
H
D
 
E
M
 
M
S
 
D
F
 
V
V
 
V
A
 
K
Q
 
R
V
 
I
A
 
C
D
 
D
K
 
C
I
 
V
L
 
A
F
 
V
L
 
I
D
 
S
K
 
N
G
 
G
K
 
E
I
 
L
I
 
I
E
 
E
S
 
Q
G
 
D
T
 
T
P
 
V
D
 
S
E
 
E
I
 
V
I
 
F
H
 
S
H
 
H
P
 
P
K
 
K
E
 
T
E
 
P
R
 
L
T
 
A
K
 
Q
E
 
K
F
 
F
F
 
I
A
 
Q
S
 
S

Sites not aligning to the query:

3tuiC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 native crystal form (see paper)
39% identity, 98% coverage: 1:241/247 of query aligns to 2:244/344 of 3tuiC

query
sites
3tuiC
M
 
M
I
 
I
K
 
K
I
 
L
S
 
S
N
 
N
L
 
I
S
 
T
K
 
K
S
 
V
F
|
F
S
 
H
G
 
Q
Q
 
G
T
 
T
-
 
R
-
 
T
-
 
I
-
 
Q
V
 
A
L
 
L
D
 
N
H
 
N
L
 
V
N
 
S
L
 
L
D
 
H
I
 
V
Q
 
P
K
 
A
G
 
G
E
 
Q
V
 
I
V
 
Y
A
 
G
L
 
V
I
 
I
G
 
G
S
 
A
S
 
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
F
 
L
L
 
I
R
 
R
S
 
C
L
 
V
N
 
N
Y
 
L
L
 
L
E
 
E
T
 
R
P
 
P
D
 
T
S
 
E
G
 
G
S
 
S
I
 
V
Q
 
L
I
 
V
D
 
D
D
 
-
F
 
-
S
 
G
V
 
Q
D
 
E
F
 
L
S
 
T
K
 
T
I
 
L
T
 
S
Q
 
E
E
 
S
E
 
E
I
 
L
L
 
T
A
 
K
L
 
A
R
 
R
R
 
R
K
 
Q
L
 
I
S
 
G
M
 
M
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
H
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
L
E
 
S
R
 
S
R
 
R
T
 
T
A
 
V
L
 
F
D
 
G
N
 
N
V
 
V
K
 
A
E
 
L
G
 
P
L
 
L
V
 
E
V
 
L
V
 
D
K
 
N
K
 
T
L
 
P
S
 
K
D
 
D
Q
 
-
E
 
E
A
 
V
T
 
K
K
 
R
I
 
R
A
 
V
K
 
T
E
 
E
E
 
L
L
 
L
A
 
S
K
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
G
D
 
D
R
 
K
E
 
H
N
 
D
H
 
S
Y
 
Y
P
 
P
R
 
S
H
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
S
K
 
N
P
 
P
D
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
A
L
 
T
V
 
T
G
 
R
E
 
S
V
 
I
E
 
L
K
 
E
S
 
L
I
 
L
A
 
K
D
 
D
A
 
I
A
 
N
K
 
R
S
 
R
-
 
L
G
 
G
Q
 
L
T
 
T
M
 
I
I
 
L
L
 
L
V
 
I
S
 
T
H
 
H
D
 
E
M
 
M
S
 
D
F
 
V
V
 
V
A
 
K
Q
 
R
V
 
I
A
 
C
D
 
D
K
 
C
I
 
V
L
 
A
F
 
V
L
 
I
D
 
S
K
 
N
G
 
G
K
 
E
I
 
L
I
 
I
E
 
E
S
 
Q
G
 
D
T
 
T
P
 
V
D
 
S
E
 
E
I
 
V
I
 
F
H
 
S
H
 
H
P
 
P
K
 
K
E
 
T
E
 
P
R
 
L
T
 
A
K
 
Q
E
 
K
F
 
F
F
 
I
A
 
Q
S
 
S

7ahhC Opua inhibited inward-facing, sbd docked (see paper)
43% identity, 88% coverage: 21:238/247 of query aligns to 46:262/382 of 7ahhC

query
sites
7ahhC
N
 
N
L
 
F
D
 
E
I
 
I
Q
 
N
K
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
I
V
 
F
A
 
V
L
 
I
I
 
M
G
 
G
S
 
L
S
 
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
F
 
L
L
 
L
R
 
R
S
 
L
L
 
L
N
 
N
Y
 
R
L
 
L
E
 
I
T
 
E
P
 
P
D
 
T
S
 
S
G
 
G
S
 
K
I
 
I
Q
 
F
I
 
I
D
 
D
D
 
N
F
 
-
S
 
-
V
 
Q
D
 
D
F
 
V
S
 
A
K
 
T
I
 
L
T
 
N
Q
 
K
E
 
E
E
 
D
I
 
L
L
 
L
A
 
Q
L
 
V
R
 
R
R
 
R
K
 
K
-
 
T
L
 
M
S
 
S
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
N
F
 
F
N
 
G
L
 
L
F
 
F
E
 
P
R
 
H
R
 
R
T
 
T
A
 
I
L
 
L
D
 
E
N
 
N
V
 
T
K
 
E
E
 
Y
G
 
G
L
 
L
V
 
E
V
 
V
V
 
-
K
 
Q
K
 
N
L
 
V
S
 
P
D
 
K
Q
 
E
E
 
E
A
 
R
T
 
R
K
 
K
I
 
R
A
 
A
K
 
E
E
 
K
E
 
A
L
 
L
A
 
D
K
 
N
V
 
A
G
 
N
L
 
L
S
 
L
D
 
D
R
 
F
E
 
K
N
 
D
H
 
Q
Y
 
Y
P
 
P
R
 
K
H
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
G
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
N
K
 
D
P
 
P
D
 
E
V
 
I
L
 
L
L
 
L
L
 
M
D
|
D
E
|
E
P
 
A
T
 
F
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
L
L
 
I
V
 
R
G
 
R
E
 
E
V
 
M
E
 
Q
K
 
D
S
 
E
I
 
L
A
 
L
D
 
E
-
 
L
A
 
Q
A
 
A
K
 
K
S
 
F
G
 
Q
Q
 
K
T
 
T
M
 
I
I
 
I
L
 
F
V
 
V
S
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
L
S
 
N
F
 
E
V
 
A
A
 
L
Q
 
R
V
 
I
A
 
G
D
 
D
K
 
R
I
 
I
L
 
A
F
 
I
L
 
M
D
 
K
K
 
D
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
M
E
 
Q
S
 
I
G
 
G
T
 
T
P
 
G
D
 
E
E
 
E
I
 
I
I
 
L
H
 
T
H
 
N
P
 
P
K
 
A
E
 
N
E
 
D
R
 
Y
T
 
V
K
 
K
E
 
T
F
 
F

Sites not aligning to the query:

7aheC Opua inhibited inward facing (see paper)
43% identity, 88% coverage: 21:238/247 of query aligns to 46:262/382 of 7aheC

query
sites
7aheC
N
 
N
L
 
F
D
 
E
I
 
I
Q
 
N
K
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
I
V
 
F
A
 
V
L
 
I
I
 
M
G
 
G
S
 
L
S
 
S
G
 
G
A
 
S
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
F
 
L
L
 
L
R
 
R
S
 
L
L
 
L
N
 
N
Y
 
R
L
 
L
E
 
I
T
 
E
P
 
P
D
 
T
S
 
S
G
 
G
S
 
K
I
 
I
Q
 
F
I
 
I
D
 
D
D
 
N
F
 
-
S
 
-
V
 
Q
D
 
D
F
 
V
S
 
A
K
 
T
I
 
L
T
 
N
Q
 
K
E
 
E
E
 
D
I
 
L
L
 
L
A
 
Q
L
 
V
R
 
R
R
 
R
K
 
K
-
 
T
L
 
M
S
 
S
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
N
F
 
F
N
 
G
L
 
L
F
 
F
E
 
P
R
 
H
R
 
R
T
 
T
A
 
I
L
 
L
D
 
E
N
 
N
V
 
T
K
 
E
E
 
Y
G
 
G
L
 
L
V
 
E
V
 
V
V
 
-
K
 
Q
K
 
N
L
 
V
S
 
P
D
 
K
Q
 
E
E
 
E
A
 
R
T
 
R
K
 
K
I
 
R
A
 
A
K
 
E
E
 
K
E
 
A
L
 
L
A
 
D
K
 
N
V
 
A
G
 
N
L
 
L
S
 
L
D
 
D
R
 
F
E
 
K
N
 
D
H
 
Q
Y
 
Y
P
 
P
R
 
K
H
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
G
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
N
K
 
D
P
 
P
D
 
E
V
 
I
L
 
L
L
 
L
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
A
T
 
F
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
L
L
 
I
V
 
R
G
 
R
E
 
E
V
 
M
E
 
Q
K
 
D
S
 
E
I
 
L
A
 
L
D
 
E
-
 
L
A
 
Q
A
 
A
K
 
K
S
 
F
G
 
Q
Q
 
K
T
 
T
M
 
I
I
 
I
L
 
F
V
 
V
S
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
L
S
 
N
F
 
E
V
 
A
A
 
L
Q
 
R
V
 
I
A
 
G
D
 
D
K
 
R
I
 
I
L
 
A
F
 
I
L
 
M
D
 
K
K
 
D
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
M
E
 
Q
S
 
I
G
 
G
T
 
T
P
 
G
D
 
E
E
 
E
I
 
I
I
 
L
H
 
T
H
 
N
P
 
P
K
 
A
E
 
N
E
 
D
R
 
Y
T
 
V
K
 
K
E
 
T
F
 
F

Sites not aligning to the query:

7ahdC Opua (e190q) occluded (see paper)
43% identity, 87% coverage: 21:236/247 of query aligns to 46:260/260 of 7ahdC

query
sites
7ahdC
N
 
N
L
 
F
D
 
E
I
 
I
Q
 
N
K
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
I
V
 
F
A
 
V
L
 
I
I
 
M
G
 
G
S
 
L
S
|
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
F
 
L
L
 
L
R
 
R
S
 
L
L
 
L
N
 
N
Y
 
R
L
 
L
E
 
I
T
 
E
P
 
P
D
 
T
S
 
S
G
 
G
S
 
K
I
 
I
Q
 
F
I
 
I
D
 
D
D
 
N
F
 
-
S
 
-
V
 
Q
D
 
D
F
 
V
S
 
A
K
 
T
I
 
L
T
 
N
Q
 
K
E
 
E
E
 
D
I
 
L
L
 
L
A
 
Q
L
 
V
R
 
R
R
 
R
K
 
K
-
 
T
L
 
M
S
 
S
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
|
Q
Q
 
N
F
 
F
N
 
G
L
 
L
F
 
F
E
 
P
R
 
H
R
 
R
T
 
T
A
 
I
L
 
L
D
 
E
N
 
N
V
 
T
K
 
E
E
 
Y
G
 
G
L
 
L
V
 
E
V
 
V
V
 
-
K
 
Q
K
 
N
L
 
V
S
 
P
D
 
K
Q
 
E
E
 
E
A
 
R
T
 
R
K
 
K
I
 
R
A
 
A
K
 
E
E
 
K
E
 
A
L
 
L
A
 
D
K
 
N
V
 
A
G
 
N
L
 
L
S
 
L
D
 
D
R
 
F
E
 
K
N
 
D
H
 
Q
Y
 
Y
P
 
P
R
x
K
H
x
Q
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
Q
x
M
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
G
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
N
K
 
D
P
 
P
D
 
E
V
 
I
L
 
L
L
 
L
L
 
M
D
 
D
E
x
Q
P
 
A
T
 
F
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
L
L
 
I
V
 
R
G
 
R
E
 
E
V
 
M
E
 
Q
K
 
D
S
 
E
I
 
L
A
 
L
D
 
E
-
 
L
A
 
Q
A
 
A
K
 
K
S
 
F
G
 
Q
Q
 
K
T
 
T
M
 
I
I
 
I
L
 
F
V
 
V
S
 
S
H
|
H
D
 
D
M
 
L
S
 
N
F
 
E
V
 
A
A
 
L
Q
 
R
V
 
I
A
 
G
D
 
D
K
 
R
I
 
I
L
 
A
F
 
I
L
 
M
D
 
K
K
 
D
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
M
E
 
Q
S
 
I
G
 
G
T
 
T
P
 
G
D
 
E
E
 
E
I
 
I
I
 
L
H
 
T
H
 
N
P
 
P
K
 
A
E
 
N
E
 
D
R
 
Y
T
 
V
K
 
K

Sites not aligning to the query:

8igqA Cryo-em structure of mycobacterium tuberculosis adp bound ftsex/ripc complex in peptidisc (see paper)
39% identity, 88% coverage: 1:218/247 of query aligns to 2:218/227 of 8igqA

query
sites
8igqA
M
 
M
I
 
I
K
 
T
I
 
L
S
 
D
N
 
H
L
 
V
S
 
T
K
 
K
S
 
Q
F
x
Y
-
 
K
-
 
S
S
 
S
G
 
A
Q
 
R
T
 
P
V
 
A
L
 
L
D
 
D
H
 
D
L
 
I
N
 
N
L
 
V
D
 
K
I
 
I
Q
 
D
K
 
K
G
 
G
E
 
E
V
 
F
V
 
V
A
 
F
L
 
L
I
 
I
G
 
G
S
 
P
S
 
S
G
|
G
A
x
S
G
 
G
K
|
K
S
|
S
T
 
T
F
 
F
L
 
M
R
 
R
S
 
L
L
 
L
N
 
L
Y
 
A
L
 
A
E
 
E
T
 
T
P
 
P
D
 
T
S
 
S
G
 
G
S
 
D
I
 
V
Q
 
R
I
 
V
D
 
S
D
 
K
F
 
F
S
 
H
V
 
V
D
 
N
F
 
-
S
 
-
K
 
K
I
 
L
T
 
R
Q
 
G
E
 
R
E
 
H
I
 
V
L
 
P
A
 
K
L
 
L
R
 
R
R
 
Q
K
 
V
L
 
I
S
 
G
M
 
C
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
D
F
 
F
N
 
R
L
 
L
F
 
L
E
 
Q
R
 
Q
R
 
K
T
 
T
A
 
V
L
 
Y
D
 
D
N
 
N
V
 
V
K
 
A
E
 
F
G
 
A
L
 
L
V
 
E
V
 
V
V
 
I
K
 
G
K
 
K
L
 
R
S
 
T
D
 
D
Q
 
-
E
 
A
A
 
I
T
 
N
K
 
R
I
 
V
A
 
V
K
 
P
E
 
E
E
 
V
L
 
L
A
 
E
K
 
T
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
S
D
 
G
R
 
K
E
 
A
N
 
N
H
 
R
Y
 
L
P
 
P
R
 
D
H
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
F
A
 
V
M
 
N
K
 
R
P
 
P
D
 
L
V
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
G
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
L
 
T
V
 
S
G
 
R
E
 
D
V
 
I
E
 
M
K
 
D
S
 
L
I
 
L
A
 
E
D
 
R
A
 
I
A
 
N
K
 
R
S
 
T
G
 
G
Q
 
T
T
 
T
M
 
V
I
 
L
L
 
M
V
 
A
S
 
T
H
 
H
D
 
D
M
 
H
S
 
H
F
 
I
V
 
V
A
 
D
Q
 
S
V
 
M
A
 
R
D
 
Q
K
 
R
I
 
V
L
 
V
F
 
E
L
 
L
D
 
S
K
 
L
G
 
G
K
 
R
I
 
L
I
 
V

A5U7B7 Cell division ATP-binding protein FtsE from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25177 / H37Ra) (see 2 papers)
38% identity, 89% coverage: 1:219/247 of query aligns to 1:218/229 of A5U7B7

query
sites
A5U7B7
M
 
M
I
 
I
K
 
T
I
 
L
S
 
D
N
 
H
L
 
V
S
 
T
K
 
K
S
 
Q
F
 
Y
-
 
K
-
 
S
S
 
S
G
 
A
Q
 
R
T
 
P
V
 
A
L
 
L
D
 
D
H
 
D
L
 
I
N
 
N
L
 
V
D
 
K
I
 
I
Q
 
D
K
 
K
G
 
G
E
 
E
V
 
F
V
 
V
A
 
F
L
 
L
I
 
I
G
 
G
S
 
P
S
 
S
G
 
G
A
 
S
G
 
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
F
 
F
L
 
M
R
 
R
S
 
L
L
 
L
N
 
L
Y
 
A
L
 
A
E
 
E
T
 
T
P
 
P
D
 
T
S
 
S
G
 
G
S
 
D
I
 
V
Q
 
R
I
 
V
D
 
S
D
 
K
F
 
F
S
 
H
V
 
V
D
 
N
F
 
-
S
 
-
K
 
K
I
 
L
T
 
R
Q
 
G
E
 
R
E
 
H
I
 
V
L
 
P
A
 
K
L
 
L
R
 
R
R
 
Q
K
 
V
L
 
I
S
 
G
M
x
C
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
D
F
 
F
N
 
R
L
 
L
F
 
L
E
 
Q
R
 
Q
R
 
K
T
 
T
A
 
V
L
 
Y
D
 
D
N
 
N
V
 
V
K
 
A
E
 
F
G
 
A
L
 
L
V
 
E
V
 
V
V
 
I
K
 
G
K
 
K
L
 
R
S
 
T
D
 
D
Q
 
-
E
 
A
A
 
I
T
 
N
K
 
R
I
 
V
A
 
V
K
 
P
E
 
E
E
 
V
L
 
L
A
 
E
K
 
T
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
S
D
 
G
R
 
K
E
 
A
N
 
N
H
 
R
Y
 
L
P
 
P
R
 
D
H
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
F
A
 
V
M
 
N
K
 
R
P
 
P
D
 
L
V
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
G
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
L
 
T
V
 
S
G
 
R
E
 
D
V
 
I
E
 
M
K
 
D
S
 
L
I
 
L
A
 
E
D
 
R
A
 
I
A
 
N
K
 
R
S
 
T
G
 
G
Q
 
T
T
 
T
M
 
V
I
 
L
L
 
M
V
 
A
S
 
T
H
 
H
D
 
D
M
 
H
S
 
H
F
 
I
V
 
V
A
 
D
Q
 
S
V
 
M
A
 
R
D
 
Q
K
 
R
I
 
V
L
 
V
F
 
E
L
 
L
D
 
S
K
 
L
G
 
G
K
 
R
I
 
L
I
 
V
E
 
R

8iddA Cryo-em structure of mycobacterium tuberculosis atp bound ftsex/ripc complex in peptidisc (see paper)
39% identity, 88% coverage: 1:218/247 of query aligns to 2:218/225 of 8iddA

query
sites
8iddA
M
 
M
I
 
I
K
 
T
I
 
L
S
 
D
N
 
H
L
 
V
S
 
T
K
 
K
S
 
Q
F
x
Y
-
 
K
-
 
S
S
 
S
G
 
A
Q
 
R
T
 
P
V
 
A
L
 
L
D
 
D
H
 
D
L
 
I
N
 
N
L
 
V
D
 
K
I
 
I
Q
 
D
K
 
K
G
 
G
E
 
E
V
 
F
V
 
V
A
 
F
L
 
L
I
 
I
G
 
G
S
 
P
S
|
S
G
 
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
 
T
F
 
F
L
 
M
R
 
R
S
 
L
L
 
L
N
 
L
Y
 
A
L
 
A
E
 
E
T
 
T
P
 
P
D
 
T
S
 
S
G
 
G
S
 
D
I
 
V
Q
 
R
I
 
V
D
 
S
D
 
K
F
 
F
S
 
H
V
 
V
D
 
N
F
 
-
S
 
-
K
 
K
I
 
L
T
 
R
Q
 
G
E
 
R
E
 
H
I
 
V
L
 
P
A
 
K
L
 
L
R
 
R
R
 
Q
K
 
V
L
 
I
S
 
G
M
 
C
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
D
F
 
F
N
 
R
L
 
L
F
 
L
E
 
Q
R
 
Q
R
 
K
T
 
T
A
 
V
L
 
Y
D
 
D
N
 
N
V
 
V
K
 
A
E
 
F
G
 
A
L
 
L
V
 
E
V
 
V
V
 
I
K
 
G
K
 
K
L
 
R
S
 
T
D
 
D
Q
 
-
E
 
A
A
 
I
T
 
N
K
 
R
I
 
V
A
 
V
K
 
P
E
 
E
E
 
V
L
 
L
A
 
E
K
 
T
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
S
D
 
G
R
 
K
E
 
A
N
 
N
H
 
R
Y
 
L
P
 
P
R
 
D
H
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
F
A
 
V
M
 
N
K
 
R
P
 
P
D
 
L
V
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
G
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
L
 
T
V
 
S
G
 
R
E
 
D
V
 
I
E
 
M
K
 
D
S
 
L
I
 
L
A
 
E
D
 
R
A
 
I
A
 
N
K
 
R
S
 
T
G
 
G
Q
 
T
T
 
T
M
 
V
I
 
L
L
 
M
V
 
A
S
 
T
H
 
H
D
 
D
M
 
H
S
 
H
F
 
I
V
 
V
A
 
D
Q
 
S
V
 
M
A
 
R
D
 
Q
K
 
R
I
 
V
L
 
V
F
 
E
L
 
L
D
 
S
K
 
L
G
 
G
K
 
R
I
 
L
I
 
V

1oxvD Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
39% identity, 93% coverage: 2:230/247 of query aligns to 4:232/353 of 1oxvD

query
sites
1oxvD
I
 
I
K
 
I
I
 
V
S
 
K
N
 
N
L
 
V
S
 
S
K
 
K
S
 
V
F
|
F
S
 
K
-
 
K
G
 
G
Q
 
K
T
 
V
V
 
V
-
 
A
L
 
L
D
 
D
H
 
N
L
 
V
N
 
N
L
 
I
D
 
N
I
 
I
Q
 
E
K
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
R
V
 
F
A
 
G
L
 
I
I
 
L
G
 
G
S
 
P
S
|
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
F
 
F
L
 
M
R
 
R
S
 
I
L
 
I
N
 
A
Y
 
G
L
 
L
E
 
D
T
 
V
P
 
P
D
 
S
S
 
T
G
 
G
S
 
E
I
 
L
Q
 
Y
I
 
F
D
 
D
D
 
D
F
 
R
S
 
L
V
 
V
-
 
A
-
 
S
D
 
N
F
 
G
S
 
K
K
 
L
I
 
I
T
 
V
Q
 
P
E
 
P
E
 
E
I
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
D
R
 
R
K
 
K
L
 
I
S
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
|
Q
Q
 
T
F
 
W
N
 
A
L
 
L
F
 
Y
E
 
P
R
 
N
R
 
L
T
 
T
A
 
A
L
 
F
D
 
E
N
 
N
V
 
I
K
 
A
E
 
F
G
 
P
L
 
L
V
 
T
V
 
N
V
 
M
K
 
K
K
 
-
L
 
M
S
 
S
D
 
K
Q
 
E
E
 
E
A
 
I
T
 
R
K
 
K
I
 
R
A
 
V
K
 
-
E
 
E
E
 
E
L
 
V
A
 
A
K
 
K
V
 
I
-
 
L
G
 
D
L
 
I
S
 
H
D
 
H
R
 
V
E
 
L
N
 
N
H
 
H
Y
 
F
P
 
P
R
 
R
H
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
V
M
 
K
K
 
D
P
 
P
D
 
S
V
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
F
S
 
S
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
A
E
 
R
L
 
M
V
 
R
G
 
D
E
 
S
V
 
A
E
 
R
K
 
A
S
 
L
I
 
V
A
 
K
D
 
E
A
 
V
-
 
Q
A
 
S
K
 
R
S
 
L
G
 
G
Q
 
V
T
 
T
M
 
L
I
 
L
L
 
V
V
 
V
S
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
P
S
 
A
F
 
D
V
 
I
A
 
F
Q
 
A
V
 
I
A
 
A
D
 
D
K
 
R
I
 
V
L
 
G
F
 
V
L
 
L
D
 
V
K
 
K
G
 
G
K
 
K
I
 
L
I
 
V
E
 
Q
S
 
V
G
 
G
T
 
K
P
 
P
D
 
E
E
 
D
I
 
L
I
 
Y
H
 
D
H
 
N
P
 
P

1oxvA Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
39% identity, 93% coverage: 2:230/247 of query aligns to 4:232/353 of 1oxvA

query
sites
1oxvA
I
 
I
K
 
I
I
 
V
S
 
K
N
 
N
L
 
V
S