SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_003279875.1 NCBI__GCF_000013785.1:WP_003279875.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 12 hits to proteins with known functional sites (download)

2pc6A Crystal structure of putative acetolactate synthase- small subunit from nitrosomonas europaea (see paper)
67% identity, 100% coverage: 1:163/163 of query aligns to 2:164/164 of 2pc6A

query
sites
2pc6A
M
 
M
R
 
R
H
 
H
I
 
I
I
 
I
S
 
S
L
 
L
L
 
L
M
 
M
E
 
E
N
 
N
E
 
E
P
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
L
S
 
S
R
 
R
V
 
V
V
 
A
G
 
G
L
 
L
F
 
F
S
 
S
Q
 
A
R
 
R
N
 
G
Y
 
Y
N
 
N
I
 
I
E
 
E
S
 
S
L
 
L
T
 
S
V
 
V
A
 
A
P
 
P
T
 
T
E
 
E
D
 
D
P
 
P
T
 
T
L
 
L
S
 
S
R
 
R
L
 
M
T
 
T
L
 
L
T
 
V
T
 
T
V
 
N
G
 
G
H
 
P
E
 
D
E
 
E
V
 
I
I
 
V
E
 
E
Q
 
Q
I
 
I
T
 
T
K
 
K
N
 
Q
L
 
L
N
|
N
K
 
K
L
|
L
V
 
I
E
 
E
V
|
V
V
 
V
K
 
K
L
 
L
V
 
I
D
 
D
L
 
L
S
 
S
E
 
S
S
 
E
A
 
G
H
 
Y
I
 
V
E
 
E
R
 
R
E
 
E
L
 
L
M
 
M
L
 
L
I
 
V
K
 
K
V
 
V
K
 
R
A
 
A
T
 
V
G
 
G
A
 
K
Q
 
D
R
 
R
A
 
E
E
 
E
V
 
M
K
 
K
R
 
R
T
 
L
T
 
A
D
 
D
I
 
I
F
 
F
R
 
R
G
 
G
Q
 
N
I
 
I
V
 
I
D
 
D
V
 
V
T
 
T
T
 
N
S
 
E
V
 
L
Y
 
Y
T
 
T
I
 
I
Q
 
E
L
 
L
A
 
T
G
 
G
T
 
T
S
 
R
D
 
S
K
 
K
L
 
L
D
 
D
S
 
G
F
 
F
I
 
L
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
G
 
D
T
 
C
A
 
N
S
 
L
I
 
I
L
 
L
E
 
E
V
 
I
V
 
A
R
 
R
S
 
T
G
 
G
V
 
V
T
 
S
G
 
G
I
 
L
S
 
S
R
 
R
G
 
G
D
 
E
K
 
R
V
 
V
L
 
L
S
 
K
I
 
L

A0QUX7 Acetolactate synthase small subunit; Acetohydroxy-acid synthase small subunit; AHAS; ALS; EC 2.2.1.6 from Mycolicibacterium smegmatis (strain ATCC 700084 / mc(2)155) (Mycobacterium smegmatis) (see paper)
41% identity, 96% coverage: 3:159/163 of query aligns to 8:164/170 of A0QUX7

query
sites
A0QUX7
H
 
H
I
 
T
I
 
L
S
 
S
L
 
V
L
 
L
M
 
V
E
 
E
N
 
D
E
 
K
P
 
P
G
 
G
A
 
V
L
 
L
S
 
A
R
 
R
V
 
V
V
 
S
G
 
S
L
 
L
F
 
F
S
 
S
Q
 
R
R
 
R
N
 
G
Y
 
F
N
 
N
I
 
I
E
 
Q
S
 
S
L
 
L
T
 
A
V
 
V
A
 
G
P
 
A
T
 
T
E
 
E
D
 
Q
P
x
K
T
 
D
L
 
M
S
 
S
R
 
R
L
 
M
T
 
T
L
 
I
T
 
V
T
 
V
V
 
S
G
 
V
H
 
E
E
 
D
E
 
S
V
 
P
I
 
L
E
 
E
Q
 
Q
I
 
I
T
 
T
K
 
K
N
 
Q
L
 
L
N
 
N
K
 
K
L
 
L
V
 
I
E
 
N
V
 
V
V
 
I
K
 
K
L
 
I
V
 
V
D
 
E
L
 
Q
S
 
E
E
 
E
S
 
D
A
 
N
H
 
S
I
 
V
E
 
S
R
 
R
E
 
E
L
 
L
M
 
A
L
 
L
I
 
I
K
 
K
V
 
V
K
 
R
A
 
A
T
 
D
G
 
A
A
 
T
Q
 
T
R
 
R
A
 
G
E
 
Q
V
 
I
K
 
I
R
 
E
T
 
A
T
 
V
D
 
N
I
 
L
F
 
F
R
 
R
G
 
A
Q
 
K
I
 
V
V
 
V
D
 
D
V
 
V
T
 
S
T
 
T
S
 
E
V
 
S
Y
 
L
T
 
T
I
 
I
Q
 
E
L
 
A
A
 
T
G
 
G
T
 
T
S
 
P
D
 
E
K
 
K
L
 
L
D
 
E
S
 
A
F
 
L
I
 
L
Q
 
R
A
 
V
V
 
L
G
 
E
T
 
P
A
 
Y
S
 
G
I
 
I
L
 
R
E
 
E
V
 
I
V
 
A
R
 
Q
S
 
S
G
 
G
V
 
V
T
 
V
G
 
S
I
 
V
S
 
S
R
 
R
G
 
G
D
 
P
K
 
R

P9WKJ3 Putative acetolactate synthase small subunit; Acetohydroxy-acid synthase small subunit; AHAS; ALS; EC 2.2.1.6 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
39% identity, 96% coverage: 3:159/163 of query aligns to 6:162/168 of P9WKJ3

query
sites
P9WKJ3
H
 
H
I
 
T
I
 
L
S
 
S
L
 
V
L
 
L
M
 
V
E
 
E
N
 
D
E
 
K
P
 
P
G
 
G
A
 
V
L
 
L
S
 
A
R
 
R
V
 
V
V
 
A
G
 
A
L
 
L
F
 
F
S
 
S
Q
 
R
R
 
R
N
 
G
Y
 
F
N
 
N
I
 
I
E
 
E
S
 
S
L
 
L
T
 
A
V
 
V
A
 
G
P
 
A
T
 
T
E
 
E
D
 
C
P
x
K
T
 
D
L
 
R
S
 
S
R
 
R
L
 
M
T
 
T
L
 
I
T
 
V
T
 
V
V
 
S
G
 
A
H
 
E
E
 
D
E
 
T
V
 
P
I
 
L
E
 
E
Q
 
Q
I
 
I
T
 
T
K
 
K
N
 
Q
L
 
L
N
 
N
K
 
K
L
 
L
V
 
I
E
 
N
V
 
V
V
 
I
K
 
K
L
 
I
V
 
V
D
 
E
L
 
Q
S
 
D
E
 
D
S
 
E
A
 
H
H
 
S
I
 
V
E
 
S
R
 
R
E
 
E
L
 
L
M
 
A
L
 
L
I
 
I
K
 
K
V
 
V
K
 
Q
A
 
A
T
 
D
G
 
A
A
 
G
Q
 
S
R
 
R
A
 
S
E
 
Q
V
 
V
K
 
I
R
 
E
T
 
A
T
 
V
D
 
N
I
 
L
F
 
F
R
 
R
G
 
A
Q
 
N
I
 
V
V
 
I
D
 
D
V
 
V
T
 
S
T
 
P
S
 
E
V
 
S
Y
 
L
T
 
T
I
 
V
Q
 
E
L
 
A
A
 
T
G
 
G
T
 
N
S
 
R
D
 
G
K
 
K
L
 
L
D
 
E
S
 
A
F
 
L
I
 
L
Q
 
R
A
 
V
V
 
L
G
 
E
T
 
P
A
 
F
S
 
G
I
 
I
L
 
R
E
 
E
V
 
I
V
 
A
R
 
Q
S
 
S
G
 
G
V
 
M
T
 
V
G
 
S
I
 
L
S
 
S
R
 
R
G
 
G
D
 
P
K
 
R

Q9FFF4 Acetolactate synthase small subunit 2, chloroplastic; ALS-interacting protein 3; Acetohydroxy-acid synthase small subunit 2; Protein valine-tolerant 1 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
40% identity, 95% coverage: 2:156/163 of query aligns to 76:228/477 of Q9FFF4

query
sites
Q9FFF4
R
 
R
H
 
H
I
 
T
I
 
I
S
 
S
L
 
V
L
 
F
M
 
V
E
 
G
N
 
D
E
 
E
P
 
S
G
|
G
A
 
I
L
 
I
S
 
N
R
 
R
V
 
I
V
 
A
G
 
G
L
 
V
F
 
F
S
 
A
Q
 
R
R
 
R
N
 
G
Y
 
Y
N
 
N
I
 
I
E
 
E
S
 
S
L
 
L
T
 
A
V
 
V
A
 
G
P
 
L
T
 
N
E
 
E
D
 
D
P
 
K
T
 
A
L
 
L
S
 
-
R
 
-
L
 
F
T
|
T
L
 
I
T
 
V
T
 
V
V
 
L
G
 
G
H
 
T
E
 
D
E
 
K
V
 
V
I
 
L
E
 
Q
Q
 
Q
I
 
V
T
 
V
K
 
E
N
 
Q
L
 
L
N
 
N
K
 
K
L
 
L
V
 
V
E
 
N
V
 
V
V
 
I
K
 
K
L
 
V
V
 
E
D
 
D
L
 
L
S
 
S
E
 
K
S
 
E
A
 
P
H
 
H
I
 
V
E
 
E
R
 
R
E
 
E
L
 
L
M
 
M
L
 
L
I
 
I
K
 
K
V
 
L
K
 
N
A
 
A
T
 
D
G
 
P
A
 
S
Q
 
T
R
 
R
A
 
S
E
 
E
V
 
I
K
 
M
R
 
W
T
 
L
T
 
V
D
 
D
I
 
I
F
 
F
R
 
R
G
 
A
Q
 
K
I
 
I
V
 
V
D
 
D
V
 
T
T
 
S
T
 
E
S
 
Q
V
 
S
Y
 
L
T
 
T
I
 
I
Q
 
E
L
 
V
A
 
T
G
 
G
T
 
D
S
 
P
D
 
G
K
 
K
L
 
M
D
 
V
S
 
A
F
 
L
I
 
T
Q
 
T
A
 
N
V
 
L
G
 
E
T
 
K
A
 
F
S
 
G
I
 
I
L
 
K
E
 
E
V
 
I
V
 
A
R
 
R
S
 
T
G
 
G
V
 
K
T
 
I
G
 
A
I
 
L
S
 
R
R
 
R

Sites not aligning to the query:

6vz8F Arabidopsis thaliana acetohydroxyacid synthase complex with valine bound (see paper)
37% identity, 95% coverage: 2:156/163 of query aligns to 4:156/159 of 6vz8F

query
sites
6vz8F
R
 
K
H
 
H
I
 
T
I
 
I
S
 
S
L
 
V
L
 
F
M
 
V
E
 
G
N
x
D
E
|
E
P
 
S
G
|
G
A
x
M
L
x
I
S
 
N
R
 
R
V
 
I
V
 
A
G
 
G
L
 
V
F
 
F
S
 
A
Q
 
R
R
 
R
N
 
G
Y
 
Y
N
|
N
I
|
I
E
 
E
S
 
S
L
 
L
T
 
A
V
 
V
A
 
G
P
 
L
T
 
N
E
 
R
D
 
D
P
 
K
T
 
A
L
 
L
S
 
-
R
 
-
L
 
F
T
 
T
L
 
I
T
 
V
T
 
V
V
 
C
G
 
G
H
 
T
E
 
E
E
 
R
V
 
V
I
 
L
E
 
Q
Q
 
Q
I
 
V
T
 
I
K
 
E
N
 
Q
L
 
L
N
 
Q
K
 
K
L
 
L
V
 
V
E
 
N
V
 
V
V
 
L
K
 
K
L
 
V
V
 
E
D
 
D
L
 
I
S
 
S
E
 
S
S
 
E
A
 
P
H
 
Q
I
 
V
E
 
E
R
 
R
E
 
E
L
 
L
M
 
M
L
 
L
I
 
V
K
 
K
V
 
V
K
 
N
A
 
A
T
 
H
G
 
P
A
 
E
Q
 
S
R
 
R
A
 
A
E
 
E
V
 
I
K
 
M
R
 
W
T
 
L
T
 
V
D
 
D
I
 
T
F
 
F
R
 
R
G
 
A
Q
 
R
I
 
V
V
 
V
D
 
D
V
 
I
T
 
A
T
 
E
S
 
H
V
 
A
Y
 
L
T
 
T
I
 
I
Q
 
E
L
 
V
A
 
T
G
 
G
T
 
D
S
 
P
D
 
G
K
 
K
L
 
M
D
 
I
S
 
A
F
 
V
I
 
E
Q
 
R
A
 
N
V
 
L
G
 
K
T
 
K
A
 
F
S
 
Q
I
 
I
L
 
R
E
 
E
V
 
I
V
 
V
R
 
R
S
 
T
G
 
G
V
 
K
T
 
I
G
 
A
I
 
L
S
 
R
R
 
R

Q93YZ7 Acetolactate synthase small subunit 1, chloroplastic; ALS-interacting protein 1; Acetohydroxyacid synthase small subunit 1 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see 2 papers)
37% identity, 95% coverage: 2:156/163 of query aligns to 86:238/491 of Q93YZ7

query
sites
Q93YZ7
R
 
K
H
 
H
I
 
T
I
 
I
S
 
S
L
 
V
L
 
F
M
 
V
E
 
G
N
x
D
E
 
E
P
 
S
G
|
G
A
x
M
L
x
I
S
 
N
R
 
R
V
 
I
V
 
A
G
 
G
L
 
V
F
|
F
S
 
A
Q
 
R
R
 
R
N
 
G
Y
|
Y
N
|
N
I
|
I
E
 
E
S
 
S
L
 
L
T
 
A
V
 
V
A
 
G
P
 
L
T
 
N
E
 
R
D
 
D
P
 
K
T
 
A
L
 
L
S
 
-
R
 
-
L
 
F
T
 
T
L
 
I
T
 
V
T
 
V
V
 
C
G
 
G
H
 
T
E
 
E
E
 
R
V
 
V
I
 
L
E
 
Q
Q
 
Q
I
 
V
T
 
I
K
 
E
N
 
Q
L
 
L
N
 
Q
K
 
K
L
 
L
V
 
V
E
 
N
V
 
V
V
 
L
K
 
K
L
 
V
V
 
E
D
 
D
L
 
I
S
 
S
E
 
S
S
 
E
A
 
P
H
 
Q
I
 
V
E
 
E
R
 
R
E
 
E
L
 
L
M
 
M
L
 
L
I
 
V
K
 
K
V
 
V
K
 
N
A
 
A
T
 
H
G
 
P
A
 
E
Q
 
S
R
 
R
A
 
A
E
 
E
V
 
I
K
 
M
R
 
W
T
 
L
T
 
V
D
 
D
I
 
T
F
 
F
R
 
R
G
 
A
Q
 
R
I
 
V
V
 
V
D
 
D
V
 
I
T
 
A
T
 
E
S
 
H
V
 
A
Y
 
L
T
 
T
I
 
I
Q
 
E
L
 
V
A
 
T
G
 
G
T
 
D
S
 
P
D
 
G
K
 
K
L
 
M
D
 
I
S
 
A
F
 
V
I
 
E
Q
 
R
A
 
N
V
 
L
G
 
K
T
 
K
A
 
F
S
 
Q
I
 
I
L
 
R
E
 
E
V
 
I
V
 
V
R
 
R
S
 
T
G
 
G
V
 
K
T
 
I
G
 
A
I
 
L
S
 
R
R
 
R

Sites not aligning to the query:

O60086 Probable acetolactate synthase small subunit; Acetohydroxy-acid synthase small subunit; AHAS; ALS from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
29% identity, 96% coverage: 2:157/163 of query aligns to 70:265/289 of O60086

query
sites
O60086
R
 
R
H
 
H
I
 
V
I
 
F
S
 
N
L
 
C
L
 
L
M
 
V
E
 
Q
N
 
N
E
 
E
P
 
P
G
 
G
A
 
V
L
 
L
S
 
S
R
 
R
V
 
L
V
 
S
G
 
G
L
 
I
F
 
L
S
 
A
Q
 
A
R
 
R
N
 
G
Y
 
F
N
 
N
I
 
I
E
 
D
S
 
S
L
 
L
T
 
V
V
 
V
A
 
C
P
 
A
T
 
T
E
 
E
D
 
V
P
 
E
T
 
N
L
 
L
S
 
S
R
 
R
L
 
M
T
 
T
L
 
I
T
 
V
T
 
L
V
 
R
G
 
G
H
 
A
E
 
D
E
 
E
V
 
V
I
 
V
E
 
E
Q
 
Q
I
 
A
T
 
K
K
 
R
N
 
Q
L
 
I
N
 
E
K
 
D
L
 
I
V
 
V
E
 
S
V
 
V
V
 
W
K
 
A
L
 
V
V
 
L
D
 
D
L
 
Y
S
 
T
E
 
G
S
 
T
A
 
S
H
 
M
I
 
V
E
 
E
R
 
R
E
 
E
L
 
L
M
 
L
L
 
L
I
 
A
K
 
K
V
 
V
K
 
S
A
 
L
T
 
L
G
 
G
-
 
P
-
 
D
-
 
H
-
 
F
-
 
Q
-
 
E
-
 
H
-
 
F
-
 
E
-
 
R
-
 
S
-
 
E
-
 
K
-
 
V
-
 
A
-
 
E
-
 
S
-
 
T
-
 
N
-
 
A
-
 
K
-
 
A
-
 
K
-
 
S
-
 
D
-
 
G
-
 
E
-
 
G
-
 
V
-
 
M
-
 
N
-
 
A
-
 
N
-
 
A
-
 
A
-
 
L
-
 
Q
-
 
L
-
 
R
-
 
A
A
 
S
Q
 
Q
R
 
L
A
 
A
E
 
A
V
 
I
K
 
N
R
 
Q
T
 
L
T
 
T
D
 
T
I
 
L
F
 
F
R
 
H
G
 
G
Q
 
R
I
 
V
V
 
A
D
 
D
V
 
I
T
 
S
T
 
T
S
 
E
V
 
T
Y
 
I
T
 
I
I
 
L
Q
 
E
L
 
L
A
 
T
G
 
A
T
 
T
S
 
P
D
 
D
K
 
R
L
 
V
D
 
D
S
 
N
F
 
F
I
 
L
Q
 
S
A
 
L
V
 
L
G
 
R
T
 
P
A
 
Y
S
 
G
I
 
V
L
 
L
E
 
E
V
 
A
V
 
C
R
 
R
S
 
T
G
 
G
V
 
T
T
 
S
G
 
A
I
 
M
S
 
T
R
 
R
G
 
A

Sites not aligning to the query:

6vz8G Arabidopsis thaliana acetohydroxyacid synthase complex with valine bound (see paper)
38% identity, 94% coverage: 3:156/163 of query aligns to 4:157/159 of 6vz8G

query
sites
6vz8G
H
 
H
I
 
T
I
 
L
S
 
S
L
 
L
L
 
L
M
 
V
E
 
N
N
x
D
E
 
I
P
 
P
G
|
G
A
x
V
L
|
L
S
 
N
R
 
I
V
 
V
V
 
T
G
 
G
L
 
V
F
 
F
S
 
A
Q
 
R
R
 
R
N
 
G
Y
 
Y
N
|
N
I
|
I
E
 
Q
S
 
S
L
 
L
T
 
A
V
|
V
A
 
G
P
 
H
T
 
A
E
 
E
D
 
T
P
 
K
T
 
G
L
 
I
S
 
S
R
 
R
L
 
I
T
 
T
L
 
T
T
 
V
T
 
I
V
 
P
G
 
A
H
 
T
E
 
D
E
 
E
V
 
S
I
 
V
E
 
S
Q
 
K
I
 
L
T
 
V
K
 
Q
N
 
Q
L
 
L
N
 
Y
K
 
K
L
 
L
V
 
V
E
 
D
V
 
V
V
 
H
K
 
E
L
 
V
V
 
H
D
 
D
L
 
L
S
 
T
E
 
H
S
 
L
A
 
P
H
 
F
I
 
S
E
 
E
R
 
R
E
 
E
L
 
L
M
 
M
L
 
L
I
 
I
K
 
K
V
 
I
K
 
A
A
 
V
T
 
N
G
 
A
A
 
A
Q
 
A
R
 
R
A
 
R
E
 
D
V
 
V
K
 
L
R
 
D
T
 
I
T
 
A
D
 
S
I
 
I
F
 
F
R
 
R
G
 
A
Q
 
K
I
 
A
V
 
V
D
 
D
V
 
V
T
 
S
T
 
D
S
 
H
V
 
T
Y
 
I
T
 
T
I
 
L
Q
 
Q
L
 
L
A
 
T
G
 
G
T
 
D
S
 
L
D
 
D
K
 
K
L
 
M
D
 
V
S
 
A
F
 
L
I
 
Q
Q
 
R
A
 
L
V
 
L
G
 
E
T
 
P
A
 
Y
S
 
G
I
 
I
L
 
C
E
 
E
V
 
V
V
 
A
R
 
R
S
 
T
G
 
G
V
 
R
T
 
V
G
 
A
I
 
L
S
 
A
R
 
R

6wo1B Hybrid acetohydroxyacid synthase complex structure with cryptococcus neoformans ahas catalytic subunit and saccharomyces cerevisiae ahas regulatory subunit (see paper)
28% identity, 95% coverage: 2:156/163 of query aligns to 4:195/197 of 6wo1B

query
sites
6wo1B
R
 
Q
H
 
H
I
 
V
I
 
L
S
 
N
L
 
C
L
 
L
M
 
V
E
 
Q
N
 
N
E
|
E
P
 
P
G
|
G
A
 
V
L
|
L
S
 
S
R
 
R
V
 
V
V
 
S
G
 
G
L
 
T
F
 
L
S
 
A
Q
 
A
R
 
R
N
 
G
Y
 
F
N
 
N
I
 
I
E
 
D
S
 
S
L
 
L
T
 
V
V
 
V
A
 
C
P
 
N
T
 
T
E
 
E
D
 
V
P
 
K
T
 
D
L
 
L
S
 
S
R
 
R
L
 
M
T
 
T
L
 
I
T
 
V
T
 
L
V
 
Q
G
 
G
H
 
Q
E
 
D
E
 
G
V
 
V
I
 
I
E
 
E
Q
 
Q
I
 
A
T
 
R
K
 
R
N
 
Q
L
 
I
N
 
E
K
 
D
L
 
L
V
 
V
E
 
P
V
 
V
V
 
Y
K
 
A
L
 
V
V
 
L
D
 
D
L
 
Y
S
 
T
E
 
N
S
 
S
A
 
E
H
 
I
I
 
I
E
 
K
R
 
R
E
 
E
L
 
L
M
 
V
L
 
M
I
 
A
K
 
R
V
 
I
K
 
S
A
 
L
T
 
L
G
 
G
A
 
T
Q
 
E
R
 
Y
A
 
F
E
 
E
-
 
D
-
 
L
-
 
L
-
 
L
-
 
H
-
 
H
-
 
H
-
 
T
-
 
V
-
 
A
-
 
E
-
 
I
-
 
R
-
 
E
-
 
K
-
 
Q
-
 
F
-
 
H
-
 
P
-
 
A
-
 
N
-
 
L
-
 
P
-
 
A
-
 
S
-
 
E
-
 
V
-
 
L
-
 
R
-
 
L
-
 
K
-
 
H
-
 
E
-
 
H
-
 
L
-
 
N
-
 
D
V
 
I
K
 
T
R
 
N
T
 
L
T
 
T
D
 
N
I
 
N
F
 
F
R
 
G
G
 
G
Q
 
R
I
 
V
V
 
V
D
 
D
V
 
I
T
 
S
T
 
E
S
 
T
V
 
S
Y
 
C
T
 
I
I
 
V
Q
 
E
L
 
L
A
 
S
G
 
A
T
 
K
S
 
P
D
 
T
K
 
R
L
 
I
D
 
S
S
 
A
F
 
F
I
 
L
Q
 
K
A
 
L
V
 
V
G
 
E
T
 
P
A
 
F
S
 
G
I
 
V
L
 
L
E
 
E
V
 
C
V
 
A
R
 
R
S
 
S
G
 
G
V
 
M
T
 
M
G
 
A
I
 
L
S
 
P
R
 
R

6u9dL Saccharomyces cerevisiae acetohydroxyacid synthase (see paper)
26% identity, 95% coverage: 2:156/163 of query aligns to 37:240/255 of 6u9dL

query
sites
6u9dL
R
 
Q
H
 
H
I
 
V
I
 
L
S
 
N
L
 
C
L
 
L
M
 
V
E
 
Q
N
 
N
E
 
E
P
 
P
G
 
G
A
 
V
L
 
L
S
 
S
R
 
R
V
 
V
V
 
S
G
 
G
L
 
T
F
 
L
S
 
A
Q
 
A
R
 
R
N
 
G
Y
 
F
N
 
N
I
 
I
E
 
D
S
 
S
L
 
L
T
 
V
V
 
V
A
 
C
P
 
N
T
 
T
E
 
E
D
 
V
P
 
K
T
 
D
L
 
L
S
 
S
R
 
R
L
 
M
T
 
T
L
 
I
T
 
V
T
 
L
V
 
Q
G
 
G
H
 
Q
E
 
D
E
 
G
V
 
V
I
 
I
E
 
E
Q
 
Q
I
 
A
T
 
R
K
 
R
N
 
Q
L
 
I
N
 
E
K
 
D
L
 
L
V
 
V
E
 
P
V
 
V
V
 
Y
K
 
A
L
 
V
V
 
L
D
 
D
L
 
Y
S
 
T
E
 
N
S
 
S
A
 
E
H
 
I
I
 
I
E
 
K
R
 
R
E
 
E
L
 
L
M
 
V
L
 
M
I
 
A
K
 
R
V
 
I
K
 
S
A
 
L
T
 
L
G
 
G
A
 
T
Q
 
E
R
 
Y
-
 
F
-
 
E
-
 
D
-
 
L
-
 
L
-
 
L
-
 
H
-
 
H
-
 
H
-
 
T
-
 
S
-
 
T
-
 
N
-
 
A
-
 
G
-
 
A
-
 
A
-
 
D
-
 
S
-
 
Q
-
 
E
-
 
L
-
 
V
A
 
A
E
 
E
V
 
I
K
 
R
R
 
E
T
 
K
-
 
Q
-
 
F
-
 
H
-
 
P
-
 
A
-
 
N
-
 
L
-
 
P
-
 
A
-
 
S
-
 
E
-
 
V
-
 
L
-
 
R
-
 
L
-
 
K
-
 
H
-
 
E
-
 
H
-
 
L
-
 
N
-
 
D
-
 
I
-
 
T
-
 
N
-
 
L
T
 
T
D
 
N
I
x
N
F
|
F
R
 
G
G
 
G
Q
 
R
I
 
V
V
|
V
D
|
D
V
x
I
T
 
S
T
 
E
S
 
T
V
 
S
Y
 
C
T
 
I
I
 
V
Q
 
E
L
 
L
A
 
S
G
 
A
T
x
K
S
 
P
D
 
T
K
x
R
L
 
I
D
 
S
S
 
A
F
 
F
I
 
L
Q
 
K
A
 
L
V
 
V
G
 
E
T
 
P
A
 
F
S
 
G
I
 
V
L
 
L
E
 
E
V
 
C
V
 
A
R
 
R
S
 
S
G
 
G
V
 
M
T
 
M
G
 
A
I
 
L
S
 
P
R
|
R

5yumA Crystallographic structures of ilvn.Val/ile complexes:conformational selectivity for feedback inhibition of ahass (see paper)
34% identity, 43% coverage: 4:73/163 of query aligns to 5:73/91 of 5yumA

query
sites
5yumA
I
 
I
I
 
L
S
 
E
L
 
L
L
 
T
M
 
V
E
 
R
N
|
N
E
x
H
P
 
P
G
 
G
A
x
V
L
x
M
S
 
T
R
 
H
V
 
V
V
 
C
G
 
G
L
 
L
F
 
F
S
 
A
Q
 
R
R
 
R
N
 
A
Y
 
F
N
 
N
I
 
V
E
 
E
S
 
G
L
 
I
T
 
L
V
x
C
A
 
L
P
 
P
T
 
I
E
 
Q
D
 
D
P
 
S
T
 
D
L
 
K
S
 
S
R
 
H
L
 
I
T
 
W
L
 
L
T
 
-
T
 
L
V
 
V
G
 
N
H
 
D
E
 
D
E
 
Q
V
 
R
I
 
L
E
 
E
Q
 
Q
I
 
M
T
 
I
K
 
S
N
 
Q
L
 
I
N
 
D
K
 
K
L
 
L
V
 
E
E
x
D
V
 
V
V
 
V
K
 
K
L
 
V

5yppE Crystal structure of ilvn.Val-1a (see paper)
34% identity, 43% coverage: 4:73/163 of query aligns to 5:73/91 of 5yppE

query
sites
5yppE
I
 
I
I
 
L
S
 
E
L
 
L
L
 
T
M
 
V
E
 
R
N
 
N
E
x
H
P
 
P
G
 
G
A
 
V
L
x
M
S
 
T
R
 
H
V
 
V
V
 
C
G
 
G
L
 
L
F
 
F
S
 
A
Q
 
R
R
 
R
N
 
A
Y
 
F
N
|
N
I
x
V
E
 
E
S
 
G
L
 
I
T
 
L
V
x
C
A
 
L
P
 
P
T
 
I
E
 
Q
D
 
D
P
 
S
T
 
D
L
 
K
S
 
S
R
 
H
L
 
I
T
 
W
L
 
L
T
 
-
T
 
L
V
 
V
G
 
N
H
 
D
E
 
D
E
 
Q
V
 
R
I
 
L
E
 
E
Q
 
Q
I
 
M
T
 
I
K
 
S
N
 
Q
L
 
I
N
 
D
K
 
K
L
 
L
V
 
E
E
 
D
V
 
V
V
 
V
K
 
K
L
 
V

Query Sequence

>WP_003279875.1 NCBI__GCF_000013785.1:WP_003279875.1
MRHIISLLMENEPGALSRVVGLFSQRNYNIESLTVAPTEDPTLSRLTLTTVGHEEVIEQI
TKNLNKLVEVVKLVDLSESAHIERELMLIKVKATGAQRAEVKRTTDIFRGQIVDVTTSVY
TIQLAGTSDKLDSFIQAVGTASILEVVRSGVTGISRGDKVLSI

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory