SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_003554655.1 NCBI__GCF_000023185.1:WP_003554655.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P07003 Pyruvate dehydrogenase [ubiquinone]; Pyruvate oxidase; POX; Pyruvate:ubiquinone-8 oxidoreductase; EC 1.2.5.1 from Escherichia coli (strain K12) (see 4 papers)
33% identity, 92% coverage: 5:554/600 of query aligns to 6:546/572 of P07003

query
sites
P07003
A
|
A
D
x
A
I
x
Y
L
x
I
I
x
A
D
x
K
T
|
T
L
|
L
I
x
E
E
x
S
W
x
A
D
x
G
V
|
V
K
|
K
V
x
R
I
|
I
F
x
W
G
|
G
L
x
V
P
x
T
G
|
G
D
|
D
G
x
S
I
x
L
N
|
N
G
|
G
V
x
L
M
x
S
E
x
D
A
x
S
L
|
L
R
 
-
K
x
N
R
|
R
Q
x
M
D
x
G
Q
x
T
I
|
I
R
x
E
F
x
W
I
x
M
Q
x
S
V
x
T
R
|
R
H
|
H
E
|
E
E
|
E
S
x
V
A
|
A
A
|
A
F
|
F
M
x
A
A
|
A
S
x
G
A
|
A
Y
x
E
A
|
A
K
x
Q
F
x
L
T
x
S
G
|
G
N
x
E
L
|
L
G
x
A
V
|
V
C
|
C
L
x
A
A
x
G
T
x
S
S
x
C
G
|
G
P
|
P
G
|
G
G
x
N
T
x
L
N
x
H
L
|
L
L
x
I
T
x
N
G
|
G
L
|
L
Y
x
F
D
|
D
A
x
C
K
x
H
L
x
R
D
x
N
Q
x
H
M
x
V
P
|
P
V
|
V
L
|
L
A
|
A
I
|
I
T
x
A
G
x
A
T
x
H
Q
x
I
Y
x
P
H
x
S
D
x
S
L
x
E
I
|
I
E
x
G
T
x
S
F
x
G
T
x
Y
Q
x
F
Q
|
Q
D
x
E
V
x
T
D
x
H
L
x
P
T
x
Q
R
x
E
V
x
L
F
|
F
D
x
R
N
x
E
V
x
C
A
x
S
L
x
H
Y
|
Y
N
x
C
A
x
E
H
x
L
V
|
V
S
|
S
D
x
S
A
x
P
S
x
E
H
x
Q
M
x
I
E
x
P
N
x
Q
V
|
V
A
x
L
S
x
A
L
x
I
A
|
A
C
x
M
R
|
R
S
x
K
A
|
A
L
x
V
S
x
L
R
x
N
R
|
R
G
|
G
V
|
V
A
x
S
H
x
V
L
x
V
S
x
V
I
x
L
A
x
P
N
x
G
D
|
D
V
|
V
Q
 
-
E
 
-
M
 
-
D
 
-
G
 
-
K
 
-
S
 
-
R
 
-
S
x
A
K
x
L
R
x
K
N
x
P
R
x
A
P
|
P
K
x
E
H
x
G
V
x
A
P
x
T
N
x
M
R
x
H
Y
x
W
F
x
Y
H
|
H
G
x
A
R
x
P
Q
|
Q
-
x
P
-
x
V
-
x
V
V
x
T
P
|
P
E
|
E
E
|
E
I
x
E
E
|
E
L
|
L
D
x
R
R
x
K
A
x
L
A
|
A
R
x
Q
I
x
L
L
|
L
N
x
R
D
x
Y
A
x
S
R
x
S
K
x
N
V
x
I
A
|
A
I
x
L
L
x
M
A
x
C
G
|
G
R
x
S
G
|
G
V
x
C
V
x
A
G
|
G
A
|
A
A
x
H
E
x
K
E
|
E
L
|
L
R
x
V
E
|
E
I
x
F
A
|
A
D
x
G
L
x
K
L
x
I
A
x
K
A
|
A
P
|
P
V
x
I
A
x
V
K
x
H
A
|
A
L
|
L
L
x
R
G
|
G
K
|
K
T
x
E
A
x
H
L
x
V
A
x
E
D
x
Y
D
|
D
D
x
N
P
|
P
L
x
Y
T
x
D
T
x
V
G
|
G
G
x
M
I
x
T
G
|
G
I
x
L
L
x
I
G
|
G
T
x
F
A
x
S
P
x
S
S
x
G
Q
x
F
E
x
H
I
x
T
M
|
M
E
x
M
Q
x
N
C
x
A
D
|
D
A
x
T
V
x
L
L
x
V
I
x
L
V
x
L
G
|
G
S
x
T
S
x
Q
F
|
F
P
|
P
Y
|
Y
I
x
R
E
x
A
Y
x
F
Y
|
Y
P
|
P
R
x
T
P
x
D
E
 
-
A
 
-
A
|
A
R
x
K
G
x
I
V
x
I
Q
|
Q
I
|
I
D
|
D
S
x
I
D
x
N
P
|
P
Q
x
A
R
x
S
I
|
I
G
|
G
L
x
A
R
x
H
F
x
S
P
x
K
V
|
V
D
|
D
A
x
M
G
x
A
L
|
L
V
|
V
G
|
G
D
|
D
A
x
I
R
x
K
E
x
S
T
|
T
L
|
L
R
|
R
L
x
A
L
|
L
R
x
L
P
|
P
R
x
L
L
x
V
T
x
E
R
x
E
K
|
K
T
x
A
D
|
D
R
|
R
S
x
K
F
|
F
L
|
L
E
x
D
K
|
K
A
|
A
Q
x
L
T
x
E
A
x
D
M
x
Y
S
x
R
E
x
D
W
x
A
R
|
R
R
x
K
K
x
G
M
x
L
E
x
D
T
x
D
M
x
L
E
x
A
T
x
K
E
x
P
R
x
S
S
x
E
A
x
K
P
x
A
L
x
I
K
x
H
P
|
P
Q
|
Q
A
x
Y
V
x
L
V
x
A
R
x
Q
A
x
Q
F
x
I
G
x
S
R
x
H
R
x
F
I
x
A
A
|
A
A
x
D
D
|
D
G
x
A
V
x
I
L
x
F
V
x
T
A
x
C
D
|
D
S
x
V
G
|
G
Q
x
T
N
x
P
T
|
T
E
x
V
L
x
W
A
|
A
A
|
A
R
|
R
H
x
Y
I
x
L
D
x
K
L
x
M
R
x
N
T
x
G
T
x
K
N
x
R
Q
x
R
F
x
L
A
x
L
V
x
G
S
|
S
G
x
F
A
x
N
L
x
H
A
x
G
S
|
S
M
|
M
A
|
A
S
x
N
G
x
A
L
x
M
P
|
P
Y
x
Q
A
|
A
I
x
L
A
x
G
A
|
A
G
x
Q
A
|
A
A
x
T
D
x
E
P
|
P
K
x
E
R
|
R
P
x
Q
I
x
V
Y
x
V
A
|
A
V
x
M
I
x
C
G
|
G
D
|
D
G
|
G
G
|
G
F
|
F
G
x
S
M
|
M
Q
x
L
L
x
M
G
|
G
E
x
D
F
|
F
S
x
L
T
x
S
A
x
V
V
|
V
R
x
Q
M
|
M
A
x
K
L
|
L
P
|
P
L
x
V
K
|
K
L
x
I
L
x
V
V
|
V
I
x
F
C
x
N
N
|
N
G
x
S
M
x
V
L
|
L
N
x
G
Q
x
F
I
x
V
A
|
A
W
x
M
E
|
E
Q
 
-
M
|
M
M
x
K
F
x
A
L
x
G
G
|
G
N
x
Y
P
x
L
Q
x
T
F
x
D
A
x
G
C
x
T
E
|
E
L
|
L
A
x
H
P
x
D
I
x
T
D
x
N
F
|
F
A
|
A
K
x
R
A
x
I
A
|
A
E
|
E
A
|
A
M
x
C
G
|
G
G
x
I
R
x
T
G
|
G
F
x
I
T
x
R
I
x
V
R
x
E
R
x
K
F
x
A
D
x
S
Q
x
E
I
x
V
E
x
D
P
x
E
T
x
A
L
|
L
T
x
Q
E
x
R
A
|
A
F
|
F
S
|
S
V
x
I
A
x
D
G
|
G
P
|
P
V
|
V
V
x
L
I
x
V
Q
x
D
A
x
V
M
x
V
V
|
V
D
x
A
Q
x
K
Y
x
E
E
|
E
P
x
L
M
x
A
M
x
I
P
|
P
P
|
P
K
x
Q
M
x
I
P
x
K
K
x
L
D
x
E
Y
x
Q
A
|
A
K
|
K
S
x
G
F
|
F

Sites not aligning to the query:

3ey9A Structural basis for membrane binding and catalytic activation of the peripheral membrane enzyme pyruvate oxidase from escherichia coli (see paper)
33% identity, 92% coverage: 5:554/600 of query aligns to 5:545/571 of 3ey9A

query
sites
3ey9A
A
 
A
D
 
A
I
 
Y
L
 
I
I
 
A
D
 
K
T
 
T
L
 
L
I
 
E
E
 
S
W
 
A
D
 
G
V
 
V
K
 
K
V
 
R
I
 
I
F
 
W
G
 
G
L
x
V
P
x
T
G
|
G
D
|
D
G
x
S
I
x
L
N
 
N
G
 
G
V
 
L
M
 
S
E
 
D
A
 
S
L
 
L
R
 
-
K
 
N
R
 
R
Q
 
M
D
 
G
Q
 
T
I
 
I
R
 
E
F
 
W
I
 
M
Q
 
S
V
 
T
R
 
R
H
 
H
E
|
E
E
 
E
S
 
V
A
 
A
A
 
A
F
 
F
M
 
A
A
 
A
S
 
G
A
 
A
Y
 
E
A
 
A
K
 
Q
F
 
L
T
 
S
G
 
G
N
 
E
L
 
L
G
 
A
V
 
V
C
 
C
L
 
A
A
 
G
T
x
S
S
 
C
G
 
G
P
 
P
G
|
G
G
 
N
T
 
L
N
x
H
L
 
L
L
 
I
T
 
N
G
 
G
L
 
L
Y
 
F
D
 
D
A
 
C
K
 
H
L
 
R
D
 
N
Q
 
H
M
 
V
P
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
A
I
 
I
T
 
A
G
 
A
T
 
H
Q
 
I
Y
 
P
H
 
S
D
 
S
L
 
E
I
 
I
E
 
G
T
 
S
F
 
G
T
 
Y
Q
x
F
Q
|
Q
D
 
E
V
 
T
D
 
H
L
 
P
T
 
Q
R
 
E
V
 
L
F
 
F
D
 
R
N
 
E
V
 
C
A
 
S
L
 
H
Y
 
Y
N
 
C
A
 
E
H
 
L
V
 
V
S
 
S
D
 
S
A
 
P
S
 
E
H
 
Q
M
 
I
E
 
P
N
 
Q
V
 
V
A
 
L
S
 
A
L
 
I
A
 
A
C
 
M
R
 
R
S
 
K
A
 
A
L
 
V
S
 
L
R
 
N
R
 
R
G
 
G
V
 
V
A
 
S
H
 
V
L
 
V
S
 
V
I
 
L
A
 
P
N
x
G
D
 
D
V
 
V
Q
 
-
E
 
-
M
 
-
D
 
-
G
 
-
K
 
-
S
 
-
R
 
-
S
 
A
K
 
L
R
 
K
N
 
P
R
 
A
P
 
P
K
 
E
H
 
G
V
 
A
P
 
T
N
 
M
R
 
H
Y
 
W
F
 
Y
H
 
H
G
 
A
R
 
P
Q
 
Q
-
 
P
-
 
V
-
 
V
V
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
E
E
 
E
L
 
L
D
 
R
R
 
K
A
 
L
A
 
A
R
 
Q
I
 
L
L
 
L
N
 
R
D
 
Y
A
 
S
R
 
S
K
 
N
V
 
I
A
 
A
I
 
L
L
 
M
A
 
C
G
|
G
R
x
S
G
|
G
V
 
C
V
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
H
E
 
K
E
 
E
L
 
L
R
 
V
E
 
E
I
 
F
A
 
A
D
 
G
L
 
K
L
 
I
A
 
K
A
 
A
P
 
P
V
 
I
A
 
V
K
 
H
A
|
A
L
|
L
L
x
R
G
 
G
K
 
K
T
 
E
A
 
H
L
 
V
A
 
E
D
 
Y
D
 
D
D
 
N
P
 
P
L
 
Y
T
 
D
T
 
V
G
 
G
G
 
M
I
x
T
G
|
G
I
x
L
L
x
I
G
 
G
T
 
F
A
 
S
P
 
S
S
 
G
Q
 
F
E
 
H
I
 
T
M
 
M
E
 
M
Q
 
N
C
 
A
D
 
D
A
 
T
V
 
L
L
 
V
I
 
L
V
 
L
G
|
G
S
x
T
S
x
Q
F
|
F
P
 
P
Y
|
Y
I
 
R
E
x
A
Y
 
F
Y
 
Y
P
 
P
R
 
T
P
 
D
E
 
-
A
 
-
A
 
A
R
 
K
G
 
I
V
 
I
Q
 
Q
I
 
I
D
|
D
S
x
I
D
 
N
P
 
P
Q
 
A
R
x
S
I
 
I
G
 
G
L
 
A
R
 
H
F
 
S
P
 
K
V
 
V
D
 
D
A
 
M
G
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
D
|
D
A
x
I
R
 
K
E
 
S
T
 
T
L
 
L
R
 
R
L
 
A
L
 
L
R
 
L
P
 
P
R
 
L
L
 
V
T
 
E
R
 
E
K
 
K
T
 
A
D
 
D
R
 
R
S
 
K
F
 
F
L
 
L
E
 
D
K
 
K
A
 
A
Q
 
L
T
 
E
A
 
D
M
 
Y
S
 
R
E
 
D
W
 
A
R
 
R
R
 
K
K
 
G
M
 
L
E
 
D
T
 
D
M
 
L
E
 
A
T
 
K
E
 
P
R
 
S
S
 
E
A
 
K
P
 
A
L
 
I
K
 
H
P
 
P
Q
 
Q
A
 
Y
V
 
L
V
 
A
R
 
Q
A
 
Q
F
 
I
G
 
S
R
 
H
R
 
F
I
 
A
A
 
A
A
 
D
D
 
D
G
 
A
V
 
I
L
 
F
V
 
T
A
 
C
D
 
D
S
x
V
G
|
G
Q
x
T
N
x
P
T
|
T
E
 
V
L
 
W
A
 
A
A
 
A
R
 
R
H
 
Y
I
 
L
D
 
K
L
 
M
R
 
N
T
 
G
T
 
K
N
 
R
Q
 
R
F
 
L
A
 
L
V
 
G
S
 
S
G
x
F
A
x
N
L
 
H
A
x
G
S
 
S
M
|
M
A
 
A
S
 
N
G
 
A
L
 
M
P
 
P
Y
 
Q
A
 
A
I
 
L
A
 
G
A
 
A
G
 
Q
A
 
A
A
 
T
D
 
E
P
 
P
K
 
E
R
 
R
P
 
Q
I
 
V
Y
 
V
A
 
A
V
 
M
I
 
C
G
|
G
D
|
D
G
|
G
G
|
G
F
 
F
G
 
S
M
 
M
Q
 
L
L
 
M
G
 
G
E
 
D
F
 
F
S
 
L
T
 
S
A
 
V
V
 
V
R
 
Q
M
 
M
A
 
K
L
 
L
P
 
P
L
 
V
K
 
K
L
 
I
L
 
V
V
 
V
I
 
F
C
 
N
N
|
N
G
 
S
M
x
V
L
|
L
N
x
G
Q
x
F
I
x
V
A
 
A
W
 
M
E
|
E
Q
 
-
M
 
M
M
 
K
F
 
A
L
 
G
G
 
G
N
 
Y
P
 
L
Q
 
T
F
 
D
A
 
G
C
 
T
E
 
E
L
 
L
A
 
H
P
 
D
I
 
T
D
 
N
F
 
F
A
 
A
K
 
R
A
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
A
M
 
C
G
 
G
G
 
I
R
 
T
G
 
G
F
 
I
T
 
R
I
 
V
R
 
E
R
 
K
F
 
A
D
 
S
Q
 
E
I
 
V
E
 
D
P
 
E
T
 
A
L
 
L
T
 
Q
E
 
R
A
 
A
F
 
F
S
 
S
V
 
I
A
 
D
G
 
G
P
 
P
V
 
V
V
 
L
I
 
V
Q
 
D
A
 
V
M
 
V
V
 
V
D
 
A
Q
x
K
Y
 
E
E
 
E
P
 
L
M
 
A
M
 
I
P
 
P
P
 
P
K
 
Q
M
 
I
P
 
K
K
 
L
D
 
E
Y
 
Q
A
 
A
K
 
K
S
 
G
F
 
F

Sites not aligning to the query:

2ezuA Pyruvate oxidase variant f479w in complex with reaction intermediate 2-acetyl-thiamin diphosphate (see paper)
30% identity, 91% coverage: 8:553/600 of query aligns to 9:554/585 of 2ezuA

query
sites
2ezuA
L
 
V
I
 
I
D
 
K
T
 
V
L
 
L
I
 
E
E
 
A
W
 
W
D
 
G
V
 
V
K
 
D
V
 
H
I
 
L
F
 
Y
G
 
G
L
x
I
P
 
P
G
|
G
D
x
G
G
x
S
I
|
I
N
 
N
G
 
S
V
 
I
M
 
M
E
 
D
A
 
A
L
 
L
R
 
S
K
 
A
R
 
E
Q
 
R
D
 
D
Q
 
R
I
 
I
R
 
H
F
 
Y
I
 
I
Q
 
Q
V
 
V
R
 
R
H
 
H
E
|
E
E
 
E
S
 
V
A
 
G
A
 
A
F
 
M
M
 
A
A
 
A
S
 
A
A
 
A
Y
 
D
A
 
A
K
 
K
F
 
L
T
 
T
G
 
G
N
 
K
L
 
I
G
 
G
V
 
V
C
 
C
L
 
F
A
 
G
T
x
S
S
 
A
G
 
G
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
T
N
 
H
L
 
L
L
 
M
T
 
N
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
K
 
R
L
 
E
D
 
D
Q
x
H
M
 
V
P
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
A
I
 
L
T
 
I
G
 
G
T
 
Q
Q
 
F
Y
 
G
H
 
T
D
 
T
L
 
G
I
 
M
E
 
N
T
 
M
F
 
D
T
 
T
Q
x
F
Q
|
Q
D
x
E
V
 
M
D
 
N
L
 
E
T
 
N
R
 
P
V
 
I
F
 
Y
D
 
A
N
 
D
V
 
V
A
 
A
L
 
D
Y
 
Y
N
 
N
A
 
V
H
 
T
V
 
A
S
 
V
D
 
N
A
 
A
S
 
A
H
 
T
M
 
L
E
 
P
N
 
H
V
 
V
A
 
I
S
 
D
L
 
E
A
 
A
C
 
I
R
 
R
S
 
R
A
 
A
L
 
Y
S
 
A
R
 
H
R
 
Q
G
 
G
V
 
V
A
 
A
H
 
V
L
 
V
S
 
Q
I
 
I
A
 
P
N
x
V
D
 
D
V
 
L
-
 
P
-
 
W
Q
 
Q
E
 
Q
M
 
I
-
 
P
-
 
A
-
 
E
D
 
D
G
 
W
K
 
Y
S
 
A
R
 
S
S
 
A
K
 
N
R
 
S
N
 
Y
R
 
Q
P
 
T
K
 
P
H
 
L
V
 
L
P
 
P
N
 
E
R
 
-
Y
 
-
F
 
-
H
 
-
G
 
-
R
 
-
Q
 
-
V
 
-
P
 
P
E
 
D
E
 
V
I
 
Q
E
 
A
L
 
V
D
 
T
R
 
R
A
 
L
A
 
T
R
 
Q
I
 
T
L
 
L
N
 
L
D
 
A
A
 
A
R
 
E
K
 
R
V
 
P
A
 
L
I
 
I
L
 
Y
A
 
Y
G
|
G
R
x
I
G
|
G
V
 
A
V
 
R
G
 
K
A
 
A
A
 
G
E
 
K
E
 
E
L
 
L
R
 
E
E
 
Q
I
 
L
A
 
S
D
 
K
L
 
T
L
 
L
A
 
K
A
 
I
P
 
P
V
 
L
A
 
M
K
 
S
A
x
T
L
x
Y
L
x
P
G
 
A
K
 
K
T
 
G
A
 
I
L
 
V
A
 
A
D
 
D
D
 
R
D
 
Y
P
 
P
L
 
A
T
 
Y
T
 
L
G
 
G
G
 
S
I
x
A
G
x
N
I
x
R
L
x
V
G
 
A
T
 
Q
A
 
K
P
 
P
S
 
A
Q
 
N
E
 
E
I
 
A
M
 
L
E
 
A
Q
 
Q
C
 
A
D
 
D
A
 
V
V
 
V
L
 
L
I
 
F
V
 
V
G
|
G
S
x
N
S
x
N
F
 
Y
P
|
P
Y
x
F
I
 
A
E
|
E
Y
 
V
Y
 
S
P
 
K
R
 
A
P
 
F
E
 
K
A
 
N
A
 
T
R
 
R
G
 
Y
-
 
F
V
 
L
Q
 
Q
I
 
I
D
|
D
S
x
I
D
 
D
P
 
P
Q
 
A
R
x
K
I
 
L
G
 
G
L
 
K
R
 
R
F
 
H
P
 
K
V
 
T
D
 
D
A
 
I
G
 
A
L
 
V
V
 
L
G
 
A
D
|
D
A
|
A
R
 
Q
E
 
K
T
 
T
L
 
L
R
 
A
L
 
A
L
 
I
R
 
L
P
 
A
R
 
Q
L
 
V
T
 
S
R
 
E
K
 
R
T
 
E
D
 
S
R
 
T
S
 
P
F
 
W
L
 
W
E
 
Q
K
 
A
A
 
N
Q
 
L
T
 
A
A
 
N
M
 
V
S
 
K
E
 
N
W
 
W
R
 
R
R
 
A
K
 
Y
M
 
L
E
 
A
T
 
S
M
 
L
E
 
E
T
 
D
E
 
K
R
 
Q
S
 
E
A
 
G
P
 
P
L
 
L
K
 
Q
P
 
A
Q
 
Y
A
 
Q
V
 
V
V
 
L
R
 
R
A
 
A
F
 
V
G
 
N
R
 
K
R
 
I
I
 
A
A
 
E
A
 
P
D
 
D
G
 
A
V
 
I
L
 
Y
V
 
S
A
 
I
D
 
D
S
x
V
G
 
G
Q
x
D
N
 
I
T
 
N
E
 
L
L
 
N
A
 
A
A
 
N
R
 
R
H
 
H
I
 
L
D
 
K
L
 
L
R
 
T
T
 
P
T
 
S
N
 
N
Q
 
R
F
 
H
A
 
I
V
 
T
S
 
S
G
x
N
A
 
L
L
 
F
A
|
A
S
 
T
M
|
M
A
 
G
S
 
V
G
 
G
L
 
I
P
 
P
Y
 
G
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
G
 
K
A
 
L
A
 
N
D
 
Y
P
 
P
K
 
E
R
 
R
P
 
Q
I
 
V
Y
 
F
A
 
N
V
 
L
I
 
A
G
|
G
D
|
D
G
|
G
G
 
G
F
 
A
G
 
S
M
 
M
Q
 
T
L
 
M
G
 
Q
E
 
D
F
 
L
S
 
A
T
 
T
A
 
Q
V
 
V
R
 
Q
M
 
Y
A
 
H
L
 
L
P
 
P
L
 
V
K
 
I
L
 
N
L
 
V
V
 
V
I
 
F
C
 
T
N
|
N
G
 
C
M
x
Q
L
x
Y
N
x
G
Q
x
W
I
|
I
A
 
K
W
 
D
E
|
E
Q
 
Q
M
 
E
M
 
D
F
 
T
L
 
N
G
 
Q
N
 
N
P
 
D
Q
 
F
F
 
I
A
 
G
C
 
V
E
 
E
L
 
F
A
 
N
P
 
D
I
 
I
D
 
D
F
 
F
A
 
S
K
 
K
A
 
I
A
 
A
E
 
D
A
 
G
M
 
V
G
 
H
G
 
M
R
 
Q
G
 
A
F
 
F
T
 
R
I
 
V
R
 
N
R
 
K
F
 
I
D
 
E
Q
 
Q
I
 
L
E
 
P
P
 
D
T
 
V
L
 
F
T
 
E
E
 
Q
A
 
A
F
 
K
S
 
A
V
 
I
A
 
A
G
 
Q
-
 
H
-
 
E
P
 
P
V
 
V
V
 
L
I
 
I
Q
 
D
A
 
A
M
 
V
V
 
I
D
 
T
Q
x
G
Y
 
D
E
 
R
P
 
P
M
 
L
M
 
P
P
 
A
P
 
E
K
 
K
M
x
L
P
 
R
K
x
L
D
|
D
Y
 
S
A
 
A
K
 
M
S
|
S

2ez9A Pyruvate oxidase variant f479w in complex with reaction intermediate analogue 2-phosphonolactyl-thiamin diphosphate (see paper)
30% identity, 91% coverage: 8:553/600 of query aligns to 9:554/585 of 2ez9A

query
sites
2ez9A
L
 
V
I
 
I
D
 
K
T
 
V
L
 
L
I
 
E
E
 
A
W
 
W
D
 
G
V
 
V
K
 
D
V
 
H
I
 
L
F
 
Y
G
 
G
L
x
I
P
 
P
G
|
G
D
x
G
G
x
S
I
|
I
N
 
N
G
 
S
V
 
I
M
 
M
E
 
D
A
 
A
L
 
L
R
 
S
K
 
A
R
 
E
Q
 
R
D
 
D
Q
 
R
I
 
I
R
 
H
F
 
Y
I
 
I
Q
 
Q
V
 
V
R
 
R
H
 
H
E
|
E
E
 
E
S
 
V
A
 
G
A
 
A
F
 
M
M
 
A
A
 
A
S
 
A
A
 
A
Y
 
D
A
 
A
K
 
K
F
 
L
T
 
T
G
 
G
N
 
K
L
 
I
G
 
G
V
 
V
C
 
C
L
 
F
A
 
G
T
x
S
S
 
A
G
 
G
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
T
N
 
H
L
 
L
L
 
M
T
 
N
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
K
 
R
L
 
E
D
 
D
Q
x
H
M
 
V
P
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
A
I
 
L
T
 
I
G
 
G
T
 
Q
Q
 
F
Y
 
G
H
 
T
D
 
T
L
 
G
I
 
M
E
 
N
T
 
M
F
 
D
T
 
T
Q
x
F
Q
|
Q
D
x
E
V
 
M
D
 
N
L
 
E
T
 
N
R
 
P
V
 
I
F
 
Y
D
 
A
N
 
D
V
 
V
A
 
A
L
 
D
Y
 
Y
N
 
N
A
 
V
H
 
T
V
 
A
S
 
V
D
 
N
A
 
A
S
 
A
H
 
T
M
 
L
E
 
P
N
 
H
V
 
V
A
 
I
S
 
D
L
 
E
A
 
A
C
 
I
R
 
R
S
 
R
A
 
A
L
 
Y
S
 
A
R
 
H
R
 
Q
G
 
G
V
 
V
A
 
A
H
 
V
L
 
V
S
 
Q
I
 
I
A
 
P
N
x
V
D
 
D
V
 
L
-
 
P
-
 
W
Q
 
Q
E
 
Q
M
 
I
-
 
P
-
 
A
-
 
E
D
 
D
G
 
W
K
 
Y
S
 
A
R
 
S
S
 
A
K
 
N
R
 
S
N
 
Y
R
 
Q
P
 
T
K
 
P
H
 
L
V
 
L
P
 
P
N
 
E
R
 
-
Y
 
-
F
 
-
H
 
-
G
 
-
R
 
-
Q
 
-
V
 
-
P
 
P
E
 
D
E
 
V
I
 
Q
E
 
A
L
 
V
D
 
T
R
 
R
A
 
L
A
 
T
R
 
Q
I
 
T
L
 
L
N
 
L
D
 
A
A
 
A
R
 
E
K
 
R
V
 
P
A
 
L
I
 
I
L
 
Y
A
 
Y
G
|
G
R
x
I
G
|
G
V
 
A
V
 
R
G
 
K
A
 
A
A
 
G
E
 
K
E
 
E
L
 
L
R
 
E
E
 
Q
I
 
L
A
 
S
D
 
K
L
 
T
L
 
L
A
 
K
A
 
I
P
 
P
V
 
L
A
 
M
K
 
S
A
x
T
L
x
Y
L
x
P
G
 
A
K
 
K
T
 
G
A
 
I
L
 
V
A
 
A
D
 
D
D
 
R
D
 
Y
P
 
P
L
 
A
T
 
Y
T
 
L
G
 
G
G
 
S
I
x
A
G
x
N
I
x
R
L
x
V
G
 
A
T
 
Q
A
 
K
P
 
P
S
 
A
Q
 
N
E
 
E
I
 
A
M
 
L
E
 
A
Q
 
Q
C
 
A
D
 
D
A
 
V
V
 
V
L
 
L
I
 
F
V
 
V
G
|
G
S
x
N
S
x
N
F
 
Y
P
|
P
Y
x
F
I
 
A
E
|
E
Y
 
V
Y
 
S
P
 
K
R
 
A
P
 
F
E
 
K
A
 
N
A
 
T
R
 
R
G
 
Y
-
 
F
V
 
L
Q
 
Q
I
 
I
D
|
D
S
x
I
D
 
D
P
 
P
Q
 
A
R
x
K
I
 
L
G
 
G
L
 
K
R
 
R
F
 
H
P
 
K
V
 
T
D
 
D
A
 
I
G
 
A
L
 
V
V
 
L
G
 
A
D
|
D
A
|
A
R
 
Q
E
 
K
T
 
T
L
 
L
R
 
A
L
 
A
L
 
I
R
 
L
P
 
A
R
 
Q
L
 
V
T
 
S
R
 
E
K
 
R
T
 
E
D
 
S
R
 
T
S
 
P
F
 
W
L
 
W
E
 
Q
K
 
A
A
 
N
Q
 
L
T
 
A
A
 
N
M
 
V
S
 
K
E
 
N
W
 
W
R
 
R
R
 
A
K
 
Y
M
 
L
E
 
A
T
 
S
M
 
L
E
 
E
T
 
D
E
 
K
R
 
Q
S
 
E
A
 
G
P
 
P
L
 
L
K
 
Q
P
 
A
Q
 
Y
A
 
Q
V
 
V
V
 
L
R
 
R
A
 
A
F
 
V
G
 
N
R
 
K
R
 
I
I
 
A
A
 
E
A
 
P
D
 
D
G
 
A
V
 
I
L
 
Y
V
 
S
A
 
I
D
 
D
S
x
V
G
 
G
Q
x
D
N
 
I
T
 
N
E
 
L
L
 
N
A
 
A
A
 
N
R
 
R
H
 
H
I
 
L
D
 
K
L
 
L
R
 
T
T
 
P
T
 
S
N
 
N
Q
 
R
F
 
H
A
 
I
V
 
T
S
 
S
G
x
N
A
 
L
L
 
F
A
|
A
S
 
T
M
|
M
A
 
G
S
 
V
G
 
G
L
 
I
P
 
P
Y
 
G
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
G
 
K
A
 
L
A
 
N
D
 
Y
P
 
P
K
 
E
R
 
R
P
 
Q
I
 
V
Y
 
F
A
 
N
V
 
L
I
 
A
G
|
G
D
|
D
G
|
G
G
 
G
F
 
A
G
 
S
M
 
M
Q
 
T
L
 
M
G
 
Q
E
 
D
F
 
L
S
 
A
T
 
T
A
 
Q
V
 
V
R
 
Q
M
 
Y
A
 
H
L
 
L
P
 
P
L
 
V
K
 
I
L
 
N
L
 
V
V
 
V
I
 
F
C
 
T
N
|
N
G
 
C
M
x
Q
L
x
Y
N
x
G
Q
x
W
I
|
I
A
 
K
W
 
D
E
|
E
Q
 
Q
M
 
E
M
 
D
F
 
T
L
 
N
G
 
Q
N
 
N
P
 
D
Q
 
F
F
 
I
A
 
G
C
 
V
E
 
E
L
 
F
A
 
N
P
 
D
I
 
I
D
 
D
F
 
F
A
 
S
K
 
K
A
 
I
A
 
A
E
 
D
A
 
G
M
 
V
G
 
H
G
 
M
R
 
Q
G
 
A
F
 
F
T
 
R
I
 
V
R
 
N
R
 
K
F
 
I
D
 
E
Q
 
Q
I
 
L
E
 
P
P
 
D
T
 
V
L
 
F
T
 
E
E
 
Q
A
 
A
F
 
K
S
 
A
V
 
I
A
 
A
G
 
Q
-
 
H
-
 
E
P
 
P
V
 
V
V
 
L
I
 
I
Q
 
D
A
 
A
M
 
V
V
 
I
D
 
T
Q
x
G
Y
 
D
E
 
R
P
 
P
M
 
L
M
 
P
P
 
A
P
 
E
K
 
K
M
 
L
P
 
R
K
 
L
D
 
D
Y
 
S
A
 
A
K
 
M
S
 
S

2ez8A Pyruvate oxidase variant f479w in complex with reaction intermediate 2-lactyl-thiamin diphosphate (see paper)
30% identity, 91% coverage: 8:553/600 of query aligns to 9:554/585 of 2ez8A

query
sites
2ez8A
L
 
V
I
 
I
D
 
K
T
 
V
L
 
L
I
 
E
E
 
A
W
 
W
D
 
G
V
 
V
K
 
D
V
 
H
I
 
L
F
 
Y
G
 
G
L
x
I
P
 
P
G
|
G
D
x
G
G
x
S
I
|
I
N
 
N
G
 
S
V
 
I
M
 
M
E
 
D
A
 
A
L
 
L
R
 
S
K
 
A
R
 
E
Q
 
R
D
 
D
Q
 
R
I
 
I
R
 
H
F
 
Y
I
 
I
Q
 
Q
V
 
V
R
 
R
H
 
H
E
|
E
E
 
E
S
 
V
A
 
G
A
 
A
F
 
M
M
 
A
A
 
A
S
 
A
A
 
A
Y
 
D
A
 
A
K
 
K
F
 
L
T
 
T
G
 
G
N
 
K
L
 
I
G
 
G
V
 
V
C
 
C
L
 
F
A
 
G
T
x
S
S
 
A
G
 
G
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
T
N
 
H
L
 
L
L
 
M
T
 
N
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
K
 
R
L
 
E
D
 
D
Q
x
H
M
 
V
P
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
A
I
 
L
T
 
I
G
 
G
T
 
Q
Q
 
F
Y
 
G
H
 
T
D
 
T
L
 
G
I
 
M
E
 
N
T
 
M
F
 
D
T
 
T
Q
x
F
Q
|
Q
D
x
E
V
 
M
D
 
N
L
 
E
T
 
N
R
 
P
V
 
I
F
 
Y
D
 
A
N
 
D
V
 
V
A
 
A
L
 
D
Y
 
Y
N
 
N
A
 
V
H
 
T
V
 
A
S
 
V
D
 
N
A
 
A
S
 
A
H
 
T
M
 
L
E
 
P
N
 
H
V
 
V
A
 
I
S
 
D
L
 
E
A
 
A
C
 
I
R
 
R
S
 
R
A
 
A
L
 
Y
S
 
A
R
 
H
R
 
Q
G
 
G
V
 
V
A
 
A
H
 
V
L
 
V
S
 
Q
I
 
I
A
 
P
N
x
V
D
 
D
V
 
L
-
 
P
-
 
W
Q
 
Q
E
 
Q
M
 
I
-
 
P
-
 
A
-
 
E
D
 
D
G
 
W
K
 
Y
S
 
A
R
 
S
S
 
A
K
 
N
R
 
S
N
 
Y
R
 
Q
P
 
T
K
 
P
H
 
L
V
 
L
P
 
P
N
 
E
R
 
-
Y
 
-
F
 
-
H
 
-
G
 
-
R
 
-
Q
 
-
V
 
-
P
 
P
E
 
D
E
 
V
I
 
Q
E
 
A
L
 
V
D
 
T
R
 
R
A
 
L
A
 
T
R
 
Q
I
 
T
L
 
L
N
 
L
D
 
A
A
 
A
R
 
E
K
 
R
V
 
P
A
 
L
I
 
I
L
 
Y
A
 
Y
G
|
G
R
x
I
G
|
G
V
 
A
V
 
R
G
 
K
A
 
A
A
 
G
E
 
K
E
 
E
L
 
L
R
 
E
E
 
Q
I
 
L
A
 
S
D
 
K
L
 
T
L
 
L
A
 
K
A
 
I
P
 
P
V
 
L
A
 
M
K
 
S
A
x
T
L
x
Y
L
x
P
G
 
A
K
 
K
T
 
G
A
 
I
L
 
V
A
 
A
D
 
D
D
 
R
D
 
Y
P
 
P
L
 
A
T
 
Y
T
 
L
G
 
G
G
 
S
I
x
A
G
x
N
I
x
R
L
x
V
G
 
A
T
 
Q
A
 
K
P
 
P
S
 
A
Q
 
N
E
 
E
I
 
A
M
 
L
E
 
A
Q
 
Q
C
 
A
D
 
D
A
 
V
V
 
V
L
 
L
I
 
F
V
 
V
G
|
G
S
x
N
S
x
N
F
 
Y
P
|
P
Y
x
F
I
 
A
E
|
E
Y
 
V
Y
 
S
P
 
K
R
 
A
P
 
F
E
 
K
A
 
N
A
 
T
R
 
R
G
 
Y
-
 
F
V
 
L
Q
 
Q
I
 
I
D
|
D
S
x
I
D
 
D
P
 
P
Q
 
A
R
x
K
I
 
L
G
 
G
L
 
K
R
 
R
F
 
H
P
 
K
V
 
T
D
 
D
A
 
I
G
 
A
L
 
V
V
 
L
G
 
A
D
|
D
A
|
A
R
 
Q
E
 
K
T
 
T
L
 
L
R
 
A
L
 
A
L
 
I
R
 
L
P
 
A
R
 
Q
L
 
V
T
 
S
R
 
E
K
 
R
T
 
E
D
 
S
R
 
T
S
 
P
F
 
W
L
 
W
E
 
Q
K
 
A
A
 
N
Q
 
L
T
 
A
A
 
N
M
 
V
S
 
K
E
 
N
W
 
W
R
 
R
R
 
A
K
 
Y
M
 
L
E
 
A
T
 
S
M
 
L
E
 
E
T
 
D
E
 
K
R
 
Q
S
 
E
A
 
G
P
 
P
L
 
L
K
 
Q
P
 
A
Q
 
Y
A
 
Q
V
 
V
V
 
L
R
 
R
A
 
A
F
 
V
G
 
N
R
 
K
R
 
I
I
 
A
A
 
E
A
 
P
D
 
D
G
 
A
V
 
I
L
 
Y
V
 
S
A
 
I
D
 
D
S
x
V
G
 
G
Q
x
D
N
 
I
T
x
N
E
 
L
L
 
N
A
 
A
A
 
N
R
 
R
H
 
H
I
 
L
D
 
K
L
 
L
R
 
T
T
 
P
T
 
S
N
 
N
Q
 
R
F
 
H
A
 
I
V
 
T
S
 
S
G
x
N
A
 
L
L
 
F
A
|
A
S
 
T
M
|
M
A
 
G
S
 
V
G
 
G
L
 
I
P
 
P
Y
 
G
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
G
 
K
A
 
L
A
 
N
D
 
Y
P
 
P
K
 
E
R
 
R
P
 
Q
I
 
V
Y
 
F
A
 
N
V
 
L
I
 
A
G
|
G
D
|
D
G
|
G
G
 
G
F
 
A
G
 
S
M
 
M
Q
 
T
L
 
M
G
 
Q
E
 
D
F
 
L
S
 
A
T
 
T
A
 
Q
V
 
V
R
 
Q
M
 
Y
A
 
H
L
 
L
P
 
P
L
 
V
K
 
I
L
 
N
L
 
V
V
 
V
I
 
F
C
 
T
N
|
N
G
 
C
M
x
Q
L
x
Y
N
x
G
Q
x
W
I
|
I
A
 
K
W
 
D
E
|
E
Q
 
Q
M
 
E
M
 
D
F
 
T
L
 
N
G
 
Q
N
 
N
P
 
D
Q
 
F
F
 
I
A
 
G
C
 
V
E
 
E
L
 
F
A
 
N
P
 
D
I
 
I
D
 
D
F
 
F
A
 
S
K
 
K
A
 
I
A
 
A
E
 
D
A
 
G
M
 
V
G
 
H
G
 
M
R
 
Q
G
 
A
F
 
F
T
 
R
I
 
V
R
 
N
R
 
K
F
 
I
D
 
E
Q
 
Q
I
 
L
E
 
P
P
 
D
T
 
V
L
 
F
T
 
E
E
 
Q
A
 
A
F
 
K
S
 
A
V
 
I
A
 
A
G
 
Q
-
 
H
-
 
E
P
 
P
V
 
V
V
 
L
I
 
I
Q
 
D
A
 
A
M
 
V
V
 
I
D
 
T
Q
x
G
Y
 
D
E
 
R
P
 
P
M
 
L
M
 
P
P
 
A
P
 
E
K
 
K
M
x
L
P
 
R
K
x
L
D
|
D
Y
 
S
A
 
A
K
x
M
S
|
S

2ez4B Pyruvate oxidase variant f479w (see paper)
30% identity, 91% coverage: 8:553/600 of query aligns to 9:554/585 of 2ez4B

query
sites
2ez4B
L
 
V
I
 
I
D
 
K
T
 
V
L
 
L
I
 
E
E
 
A
W
 
W
D
 
G
V
 
V
K
 
D
V
 
H
I
 
L
F
 
Y
G
 
G
L
x
I
P
 
P
G
|
G
D
x
G
G
x
S
I
|
I
N
 
N
G
 
S
V
 
I
M
 
M
E
 
D
A
 
A
L
 
L
R
 
S
K
 
A
R
 
E
Q
 
R
D
 
D
Q
 
R
I
 
I
R
 
H
F
 
Y
I
 
I
Q
 
Q
V
 
V
R
 
R
H
 
H
E
|
E
E
 
E
S
 
V
A
 
G
A
 
A
F
 
M
M
 
A
A
 
A
S
 
A
A
 
A
Y
 
D
A
 
A
K
 
K
F
 
L
T
 
T
G
 
G
N
 
K
L
 
I
G
 
G
V
 
V
C
 
C
L
 
F
A
 
G
T
x
S
S
 
A
G
 
G
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
T
N
 
H
L
 
L
L
 
M
T
 
N
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
K
 
R
L
 
E
D
 
D
Q
x
H
M
 
V
P
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
A
I
 
L
T
 
I
G
 
G
T
 
Q
Q
 
F
Y
 
G
H
 
T
D
 
T
L
 
G
I
 
M
E
 
N
T
 
M
F
 
D
T
 
T
Q
x
F
Q
|
Q
D
x
E
V
 
M
D
 
N
L
 
E
T
 
N
R
 
P
V
 
I
F
 
Y
D
 
A
N
 
D
V
 
V
A
 
A
L
 
D
Y
 
Y
N
 
N
A
 
V
H
 
T
V
 
A
S
 
V
D
 
N
A
 
A
S
 
A
H
 
T
M
 
L
E
 
P
N
 
H
V
 
V
A
 
I
S
 
D
L
 
E
A
 
A
C
 
I
R
 
R
S
 
R
A
 
A
L
 
Y
S
 
A
R
 
H
R
 
Q
G
 
G
V
 
V
A
 
A
H
 
V
L
 
V
S
 
Q
I
 
I
A
 
P
N
x
V
D
 
D
V
 
L
-
 
P
-
 
W
Q
 
Q
E
 
Q
M
 
I
-
 
P
-
 
A
-
 
E
D
 
D
G
 
W
K
 
Y
S
 
A
R
 
S
S
 
A
K
 
N
R
 
S
N
 
Y
R
 
Q
P
 
T
K
 
P
H
 
L
V
 
L
P
 
P
N
 
E
R
 
-
Y
 
-
F
 
-
H
 
-
G
 
-
R
 
-
Q
 
-
V
 
-
P
 
P
E
 
D
E
 
V
I
 
Q
E
 
A
L
 
V
D
 
T
R
 
R
A
 
L
A
 
T
R
 
Q
I
 
T
L
 
L
N
 
L
D
 
A
A
 
A
R
 
E
K
 
R
V
 
P
A
 
L
I
 
I
L
 
Y
A
 
Y
G
|
G
R
x
I
G
|
G
V
 
A
V
 
R
G
 
K
A
 
A
A
 
G
E
 
K
E
 
E
L
 
L
R
 
E
E
 
Q
I
 
L
A
 
S
D
 
K
L
 
T
L
 
L
A
 
K
A
 
I
P
 
P
V
 
L
A
 
M
K
 
S
A
x
T
L
x
Y
L
x
P
G
 
A
K
 
K
T
 
G
A
 
I
L
 
V
A
 
A
D
 
D
D
 
R
D
 
Y
P
 
P
L
 
A
T
 
Y
T
 
L
G
 
G
G
 
S
I
x
A
G
x
N
I
x
R
L
x
V
G
 
A
T
 
Q
A
 
K
P
 
P
S
 
A
Q
 
N
E
 
E
I
 
A
M
 
L
E
 
A
Q
 
Q
C
 
A
D
 
D
A
 
V
V
 
V
L
 
L
I
 
F
V
 
V
G
|
G
S
x
N
S
x
N
F
 
Y
P
|
P
Y
x
F
I
 
A
E
|
E
Y
 
V
Y
 
S
P
 
K
R
 
A
P
 
F
E
 
K
A
 
N
A
 
T
R
 
R
G
 
Y
-
 
F
V
 
L
Q
 
Q
I
 
I
D
|
D
S
x
I
D
 
D
P
 
P
Q
 
A
R
x
K
I
 
L
G
 
G
L
 
K
R
 
R
F
 
H
P
 
K
V
 
T
D
 
D
A
 
I
G
 
A
L
 
V
V
 
L
G
 
A
D
|
D
A
|
A
R
 
Q
E
 
K
T
 
T
L
 
L
R
 
A
L
 
A
L
 
I
R
 
L
P
 
A
R
 
Q
L
 
V
T
 
S
R
 
E
K
 
R
T
 
E
D
 
S
R
 
T
S
 
P
F
 
W
L
 
W
E
 
Q
K
 
A
A
 
N
Q
 
L
T
 
A
A
 
N
M
 
V
S
 
K
E
 
N
W
 
W
R
 
R
R
 
A
K
 
Y
M
 
L
E
 
A
T
 
S
M
 
L
E
 
E
T
 
D
E
 
K
R
 
Q
S
 
E
A
 
G
P
 
P
L
 
L
K
 
Q
P
 
A
Q
 
Y
A
 
Q
V
 
V
V
 
L
R
 
R
A
 
A
F
 
V
G
 
N
R
 
K
R
 
I
I
 
A
A
 
E
A
 
P
D
 
D
G
 
A
V
 
I
L
 
Y
V
 
S
A
 
I
D
 
D
S
x
V
G
 
G
Q
x
D
N
 
I
T
 
N
E
 
L
L
 
N
A
 
A
A
 
N
R
 
R
H
 
H
I
 
L
D
 
K
L
 
L
R
 
T
T
 
P
T
 
S
N
 
N
Q
 
R
F
 
H
A
 
I
V
 
T
S
 
S
G
x
N
A
 
L
L
 
F
A
|
A
S
 
T
M
|
M
A
 
G
S
 
V
G
 
G
L
 
I
P
 
P
Y
 
G
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
G
 
K
A
 
L
A
 
N
D
 
Y
P
 
P
K
 
E
R
 
R
P
 
Q
I
 
V
Y
 
F
A
 
N
V
 
L
I
 
A
G
|
G
D
|
D
G
|
G
G
|
G
F
 
A
G
 
S
M
 
M
Q
 
T
L
 
M
G
 
Q
E
 
D
F
 
L
S
 
A
T
 
T
A
 
Q
V
 
V
R
 
Q
M
 
Y
A
 
H
L
 
L
P
 
P
L
 
V
K
 
I
L
 
N
L
 
V
V
 
V
I
 
F
C
 
T
N
|
N
G
 
C
M
x
Q
L
x
Y
N
x
G
Q
x
W
I
|
I
A
 
K
W
 
D
E
|
E
Q
 
Q
M
 
E
M
 
D
F
 
T
L
 
N
G
 
Q
N
 
N
P
 
D
Q
 
F
F
 
I
A
 
G
C
 
V
E
 
E
L
 
F
A
 
N
P
 
D
I
 
I
D
 
D
F
 
F
A
 
S
K
 
K
A
 
I
A
 
A
E
 
D
A
 
G
M
 
V
G
 
H
G
 
M
R
 
Q
G
 
A
F
 
F
T
 
R
I
 
V
R
 
N
R
 
K
F
 
I
D
 
E
Q
 
Q
I
 
L
E
 
P
P
 
D
T
 
V
L
 
F
T
 
E
E
 
Q
A
 
A
F
 
K
S
 
A
V
 
I
A
 
A
G
 
Q
-
 
H
-
 
E
P
 
P
V
 
V
V
 
L
I
 
I
Q
 
D
A
 
A
M
 
V
V
 
I
D
 
T
Q
x
G
Y
 
D
E
 
R
P
 
P
M
 
L
M
 
P
P
 
A
P
 
E
K
 
K
M
 
L
P
 
R
K
 
L
D
 
D
Y
 
S
A
 
A
K
 
M
S
 
S

4feeA High-resolution structure of pyruvate oxidase in complex with reaction intermediate 2-hydroxyethyl-thiamin diphosphate carbanion-enamine, crystal b (see paper)
30% identity, 91% coverage: 8:553/600 of query aligns to 9:554/586 of 4feeA

query
sites
4feeA
L
 
V
I
 
I
D
 
K
T
 
V
L
 
L
I
 
E
E
 
A
W
 
W
D
 
G
V
 
V
K
 
D
V
 
H
I
 
L
F
 
Y
G
 
G
L
 
I
P
 
P
G
 
G
D
 
G
G
 
S
I
 
I
N
 
N
G
 
S
V
 
I
M
 
M
E
 
D
A
 
A
L
 
L
R
 
S
K
 
A
R
 
E
Q
 
R
D
 
D
Q
 
R
I
 
I
R
 
H
F
 
Y
I
 
I
Q
 
Q
V
 
V
R
 
R
H
 
H
E
 
E
E
 
E
S
 
V
A
 
G
A
 
A
F
 
M
M
 
A
A
 
A
S
 
A
A
 
A
Y
 
D
A
 
A
K
 
K
F
 
L
T
 
T
G
 
G
N
 
K
L
 
I
G
 
G
V
 
V
C
 
C
L
 
F
A
 
G
T
 
S
S
 
A
G
 
G
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
T
N
 
H
L
 
L
L
 
M
T
 
N
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
K
 
R
L
 
E
D
 
D
Q
x
H
M
 
V
P
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
A
I
 
L
T
 
I
G
 
G
T
 
Q
Q
 
F
Y
 
G
H
 
T
D
 
T
L
 
G
I
 
M
E
 
N
T
 
M
F
 
D
T
 
T
Q
 
F
Q
 
Q
D
 
E
V
 
M
D
 
N
L
 
E
T
 
N
R
 
P
V
 
I
F
 
Y
D
 
A
N
 
D
V
 
V
A
 
A
L
 
D
Y
 
Y
N
 
N
A
 
V
H
 
T
V
 
A
S
 
V
D
 
N
A
 
A
S
 
A
H
 
T
M
 
L
E
 
P
N
 
H
V
 
V
A
 
I
S
 
D
L
 
E
A
 
A
C
 
I
R
 
R
S
 
R
A
 
A
L
 
Y
S
 
A
R
 
H
R
 
Q
G
 
G
V
 
V
A
 
A
H
 
V
L
 
V
S
 
Q
I
 
I
A
 
P
N
 
V
D
 
D
V
 
L
-
 
P
-
 
W
Q
 
Q
E
 
Q
M
 
I
-
 
P
-
 
A
-
 
E
D
 
D
G
 
W
K
 
Y
S
 
A
R
 
S
S
 
A
K
 
N
R
 
S
N
 
Y
R
 
Q
P
 
T
K
 
P
H
 
L
V
 
L
P
 
P
N
 
E
R
 
-
Y
 
-
F
 
-
H
 
-
G
 
-
R
 
-
Q
 
-
V
 
-
P
 
P
E
 
D
E
 
V
I
 
Q
E
 
A
L
 
V
D
 
T
R
 
R
A
 
L
A
 
T
R
 
Q
I
 
T
L
 
L
N
 
L
D
 
A
A
 
A
R
 
E
K
 
R
V
 
P
A
 
L
I
 
I
L
 
Y
A
 
Y
G
|
G
R
x
I
G
|
G
V
 
A
V
 
R
G
 
K
A
 
A
A
 
G
E
 
K
E
 
E
L
 
L
R
 
E
E
 
Q
I
 
L
A
 
S
D
 
K
L
 
T
L
 
L
A
 
K
A
 
I
P
 
P
V
 
L
A
 
M
K
 
S
A
x
T
L
x
Y
L
x
P
G
 
A
K
 
K
T
 
G
A
 
I
L
 
V
A
 
A
D
 
D
D
 
R
D
 
Y
P
 
P
L
 
A
T
 
Y
T
 
L
G
 
G
G
 
S
I
x
A
G
x
N
I
x
R
L
x
V
G
 
A
T
 
Q
A
 
K
P
 
P
S
 
A
Q
 
N
E
 
E
I
 
A
M
 
L
E
 
A
Q
 
Q
C
 
A
D
 
D
A
 
V
V
 
V
L
 
L
I
 
F
V
 
V
G
|
G
S
x
N
S
x
N
F
 
Y
P
|
P
Y
x
F
I
 
A
E
 
E
Y
 
V
Y
 
S
P
 
K
R
 
A
P
 
F
E
 
K
A
 
N
A
 
T
R
 
R
G
 
Y
-
 
F
V
 
L
Q
 
Q
I
 
I
D
|
D
S
x
I
D
 
D
P
 
P
Q
 
A
R
x
K
I
 
L
G
 
G
L
 
K
R
 
R
F
 
H
P
 
K
V
 
T
D
 
D
A
 
I
G
 
A
L
 
V
V
 
L
G
 
A
D
|
D
A
|
A
R
 
Q
E
 
K
T
 
T
L
 
L
R
 
A
L
 
A
L
 
I
R
 
L
P
 
A
R
 
Q
L
 
V
T
 
S
R
 
E
K
 
R
T
 
E
D
 
S
R
 
T
S
 
P
F
 
W
L
 
W
E
 
Q
K
 
A
A
 
N
Q
 
L
T
 
A
A
 
N
M
 
V
S
 
K
E
 
N
W
 
W
R
 
R
R
 
A
K
 
Y
M
 
L
E
 
A
T
 
S
M
 
L
E
 
E
T
 
D
E
 
K
R
 
Q
S
 
E
A
 
G
P
 
P
L
 
L
K
 
Q
P
 
A
Q
 
Y
A
 
Q
V
 
V
V
 
L
R
 
R
A
 
A
F
 
V
G
 
N
R
 
K
R
 
I
I
 
A
A
 
E
A
 
P
D
 
D
G
 
A
V
 
I
L
 
Y
V
 
S
A
 
I
D
 
D
S
x
V
G
 
G
Q
x
D
N
 
I
T
x
N
E
 
L
L
 
N
A
 
A
A
 
N
R
 
R
H
 
H
I
 
L
D
 
K
L
 
L
R
 
T
T
 
P
T
 
S
N
 
N
Q
 
R
F
 
H
A
 
I
V
 
T
S
 
S
G
x
N
A
 
L
L
 
F
A
|
A
S
 
T
M
|
M
A
 
G
S
 
V
G
 
G
L
 
I
P
 
P
Y
 
G
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
G
 
K
A
 
L
A
 
N
D
 
Y
P
 
P
K
 
E
R
 
R
P
 
Q
I
 
V
Y
 
F
A
 
N
V
 
L
I
 
A
G
|
G
D
|
D
G
|
G
G
 
G
F
 
A
G
 
S
M
 
M
Q
 
T
L
 
M
G
 
Q
E
 
D
F
 
L
S
 
A
T
 
T
A
 
Q
V
 
V
R
 
Q
M
 
Y
A
 
H
L
 
L
P
 
P
L
 
V
K
 
I
L
 
N
L
 
V
V
 
V
I
 
F
C
 
T
N
|
N
G
 
C
M
x
Q
L
x
Y
N
x
G
Q
x
F
I
|
I
A
 
K
W
 
D
E
 
E
Q
 
Q
M
 
E
M
 
D
F
 
T
L
 
N
G
 
Q
N
 
N
P
 
D
Q
 
F
F
 
I
A
 
G
C
 
V
E
 
E
L
 
F
A
 
N
P
 
D
I
 
I
D
 
D
F
 
F
A
 
S
K
 
K
A
 
I
A
 
A
E
 
D
A
 
G
M
 
V
G
 
H
G
 
M
R
 
Q
G
 
A
F
 
F
T
 
R
I
 
V
R
 
N
R
 
K
F
 
I
D
 
E
Q
 
Q
I
 
L
E
 
P
P
 
D
T
 
V
L
 
F
T
 
E
E
 
Q
A
 
A
F
 
K
S
 
A
V
 
I
A
 
A
G
 
Q
-
 
H
-
 
E
P
 
P
V
 
V
V
 
L
I
 
I
Q
 
D
A
 
A
M
 
V
V
 
I
D
 
T
Q
 
G
Y
 
D
E
 
R
P
 
P
M
 
L
M
 
P
P
 
A
P
 
E
K
 
K
M
x
L
P
 
R
K
x
L
D
|
D
Y
 
S
A
 
A
K
x
M
S
|
S

1powA The refined structures of a stabilized mutant and of wild-type pyruvate oxidase from lactobacillus plantarum (see paper)
30% identity, 91% coverage: 8:553/600 of query aligns to 9:554/585 of 1powA

query
sites
1powA
L
 
V
I
 
I
D
 
K
T
 
V
L
 
L
I
 
E
E
 
A
W
 
W
D
 
G
V
 
V
K
 
D
V
 
H
I
 
L
F
 
Y
G
 
G
L
x
I
P
 
P
G
|
G
D
x
G
G
x
S
I
|
I
N
 
N
G
 
S
V
 
I
M
 
M
E
 
D
A
 
A
L
 
L
R
 
S
K
 
A
R
 
E
Q
 
R
D
 
D
Q
 
R
I
 
I
R
 
H
F
 
Y
I
 
I
Q
 
Q
V
 
V
R
 
R
H
 
H
E
|
E
E
 
E
S
 
V
A
 
G
A
 
A
F
 
M
M
 
A
A
 
A
S
 
A
A
 
A
Y
 
D
A
 
A
K
 
K
F
 
L
T
 
T
G
 
G
N
 
K
L
 
I
G
 
G
V
 
V
C
 
C
L
 
F
A
 
G
T
x
S
S
 
A
G
 
G
P
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
T
N
 
H
L
 
L
L
 
M
T
 
N
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
K
 
R
L
 
E
D
 
D
Q
x
H
M
 
V
P
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
A
I
 
L
T
 
I
G
 
G
T
 
Q
Q
 
F
Y
 
G
H
 
T
D
 
T
L
 
G
I
 
M
E
 
N
T
 
M
F
 
D
T
 
T
Q
x
F
Q
|
Q
D
x
E
V
 
M
D
 
N
L
 
E
T
 
N
R
 
P
V
 
I
F
 
Y
D
 
A
N
 
D
V
 
V
A
 
A
L
 
D
Y
 
Y
N
 
N
A
 
V
H
 
T
V
 
A
S
 
V
D
 
N
A
 
A
S
 
A
H
 
T
M
 
L
E
 
P
N
 
H
V
 
V
A
 
I
S
 
D
L
 
E
A
 
A
C
 
I
R
 
R
S
 
R
A
 
A
L
 
Y
S
 
A
R
 
H
R
 
Q
G
 
G
V
 
V
A
 
A
H
 
V
L
 
V
S
 
Q
I
 
I
A
 
P
N
x
V
D
 
D
V
 
L
-
 
P
-
 
W
Q
 
Q
E
 
Q
M
 
I
-
 
P
-
 
A
-
 
E
D
 
D
G
 
W
K
 
Y
S
 
A
R
 
S
S
 
A
K
 
N
R
 
S
N
 
Y
R
 
Q
P
 
T
K
 
P
H
 
L
V
 
L
P
 
P
N
 
E
R
 
-
Y
 
-
F
 
-
H
 
-
G
 
-
R
 
-
Q
 
-
V
 
-
P
 
P
E
 
D
E
 
V
I
 
Q
E
 
A
L
 
V
D
 
T
R
 
R
A
 
L
A
 
T
R
 
Q
I
 
T
L
 
L
N
 
L
D
 
A
A
 
A
R
 
E
K
 
R
V
 
P
A
 
L
I
 
I
L
 
Y
A
 
Y
G
|
G
R
x
I
G
|
G
V
 
A
V
 
R
G
 
K
A
 
A
A
 
G
E
 
K
E
 
E
L
 
L
R
 
E
E
 
Q
I
 
L
A
 
S
D
 
K
L
 
T
L
 
L
A
 
K
A
 
I
P
 
P
V
 
L
A
 
M
K
 
S
A
x
T
L
x
Y
L
 
P
G
 
A
K
 
K
T
 
G
A
 
I
L
 
V
A
 
A
D
 
D
D
 
R
D
 
Y
P
 
P
L
 
A
T
 
Y
T
 
L
G
 
G
G
 
S
I
x
A
G
 
N
I
x
R
L
x
V
G
 
A
T
 
Q
A
 
K
P
 
P
S
 
A
Q
 
N
E
 
E
I
 
A
M
 
L
E
 
A
Q
 
Q
C
 
A
D
 
D
A
 
V
V
 
V
L
 
L
I
 
F
V
 
V
G
|
G
S
x
N
S
x
N
F
x
Y
P
|
P
Y
x
F
I
 
A
E
|
E
Y
 
V
Y
 
S
P
 
K
R
 
A
P
 
F
E
 
K
A
 
N
A
 
T
R
 
R
G
 
Y
-
 
F
V
 
L
Q
 
Q
I
 
I
D
|
D
S
x
I
D
 
D
P
 
P
Q
 
A
R
x
K
I
 
L
G
 
G
L
 
K
R
 
R
F
 
H
P
 
K
V
 
T
D
 
D
A
 
I
G
 
A
L
 
V
V
 
L
G
 
A
D
|
D
A
|
A
R
 
Q
E
 
K
T
 
T
L
 
L
R
 
A
L
 
A
L
 
I
R
 
L
P
 
A
R
 
Q
L
 
V
T
 
S
R
 
E
K
 
R
T
 
E
D
 
S
R
 
T
S
 
P
F
 
W
L
 
W
E
 
Q
K
 
A
A
 
N
Q
 
L
T
 
A
A
 
N
M
 
V
S
 
K
E
 
N
W
 
W
R
 
R
R
 
A
K
 
Y
M
 
L
E
 
A
T
 
S
M
 
L
E
 
E
T
 
D
E
 
K
R
 
Q
S
 
E
A
 
G
P
 
P
L
 
L
K
 
Q
P
 
A
Q
 
Y
A
 
Q
V
 
V
V
 
L
R
 
R
A
 
A
F
 
V
G
 
N
R
 
K
R
 
I
I
 
A
A
 
E
A
 
P
D
 
D
G
 
A
V
 
I
L
 
Y
V
 
S
A
 
I
D
 
D
S
x
V
G
 
G
Q
x
D
N
 
I
T
 
N
E
 
L
L
 
N
A
 
A
A
 
N
R
 
R
H
 
H
I
 
L
D
 
K
L
 
L
R
 
T
T
 
P
T
 
S
N
 
N
Q
 
R
F
 
H
A
 
I
V
 
T
S
 
S
G
x
N
A
 
L
L
 
F
A
|
A
S
 
T
M
|
M
A
 
G
S
 
V
G
 
G
L
 
I
P
 
P
Y
 
G
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
G
 
K
A
 
L
A
 
N
D
 
Y
P
 
P
K
 
E
R
 
R
P
 
Q
I
 
V
Y
 
F
A
 
N
V
 
L
I
 
A
G
 
G
D
|
D
G
|
G
G
 
G
F
 
A
G
 
S
M
 
M
Q
 
T
L
 
M
G
 
Q
E
 
D
F
 
L
S
 
A
T
 
T
A
 
Q
V
 
V
R
 
Q
M
 
Y
A
 
H
L
 
L
P
 
P
L
 
V
K
 
I
L
 
N
L
 
V
V
 
V
I
 
F
C
 
T
N
|
N
G
 
C
M
x
Q
L
x
Y
N
x
G
Q
x
F
I
|
I
A
 
K
W
 
D
E
|
E
Q
 
Q
M
 
E
M
 
D
F
 
T
L
 
N
G
 
Q
N
 
N
P
 
D
Q
 
F
F
 
I
A
 
G
C
 
V
E
 
E
L
 
F
A
 
N
P
 
D
I
 
I
D
 
D
F
 
F
A
 
S
K
 
K
A
 
I
A
 
A
E
 
D
A
 
G
M
 
V
G
 
H
G
 
M
R
 
Q
G
 
A
F
 
F
T
 
R
I
 
V
R
 
N
R
 
K
F
 
I
D
 
E
Q
 
Q
I
 
L
E
 
P
P
 
D
T
 
V
L
 
F
T
 
E
E
 
Q
A
 
A
F
 
K
S
 
A
V
 
I
A
 
A
G
 
Q
-
 
H
-
 
E
P
 
P
V
 
V
V
 
L
I
 
I
Q
 
D
A
 
A
M
 
V
V
 
I
D
 
T
Q
x
G
Y
 
D
E
 
R
P
 
P
M
 
L
M
 
P
P
 
A
P
 
E
K
 
K
M
 
L
P
 
R
K
 
L
D
 
D
Y
 
S
A
 
A
K
 
M
S
 
S

2djiA Crystal structure of pyruvate oxidase from aerococcus viridans containing fad (see paper)
28% identity, 96% coverage: 8:582/600 of query aligns to 10:581/590 of 2djiA

query
sites
2djiA
L
 
V
I
 
M
D
 
K
T
 
I
L
 
L
I
 
E
E
 
S
W
 
W
D
 
G
V
 
A
K
 
D
V
 
T
I
 
I
F
 
Y
G
 
G
L
x
I
P
 
P
G
x
S
D
x
G
G
x
T
I
x
L
N
 
S
G
 
S
V
 
L
M
 
M
E
 
D
A
 
A
L
 
M
R
 
G
K
 
E
R
 
E
Q
 
E
D
 
N
Q
 
N
I
 
V
R
 
K
F
 
F
I
 
L
Q
 
Q
V
 
V
R
 
K
H
 
H
E
|
E
E
 
E
S
 
V
A
 
G
A
 
A
F
 
M
M
 
A
A
 
A
S
 
V
A
 
M
Y
 
Q
A
 
S
K
 
K
F
 
F
T
 
G
G
 
G
N
 
N
L
 
L
G
 
G
V
 
V
C
 
T
L
 
V
A
 
G
T
x
S
S
 
G
G
 
G
P
 
P
G
 
G
G
 
A
T
 
S
N
 
H
L
 
L
L
 
I
T
 
N
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
K
 
A
L
 
M
D
 
D
Q
 
N
M
 
I
P
 
P
V
 
V
L
 
V
A
 
A
I
 
I
T
 
L
G
 
G
T
 
S
Q
 
R
Y
 
P
H
 
Q
D
 
R
L
 
E
I
 
L
E
 
N
T
 
M
F
 
D
T
 
A
Q
x
F
Q
|
Q
D
 
E
V
 
L
D
 
N
L
 
Q
T
 
N
R
 
P
V
 
M
F
 
Y
D
 
D
N
 
H
V
 
I
A
 
A
L
 
V
Y
 
Y
N
 
N
A
 
R
H
 
R
V
 
V
S
 
A
D
 
Y
A
 
A
S
 
E
H
 
Q
M
 
L
E
 
P
N
 
K
V
 
L
A
 
V
S
 
D
L
 
E
A
 
A
C
 
A
R
 
R
S
 
M
A
 
A
L
 
I
S
 
A
R
 
K
R
 
R
G
 
G
V
 
V
A
 
A
H
 
V
L
 
L
S
 
E
I
 
V
A
 
P
N
x
G
D
 
D
V
 
F
Q
 
A
E
 
K
M
 
V
-
 
E
-
 
I
-
 
D
-
 
N
D
 
D
G
 
Q
K
 
W
S
 
Y
R
 
S
S
 
S
K
 
A
R
 
N
N
 
S
R
 
L
P
 
R
K
 
K
H
 
Y
V
 
A
P
 
P
N
 
-
R
 
-
Y
 
-
F
 
-
H
 
-
G
 
-
R
 
-
Q
 
I
V
 
A
P
 
P
E
 
A
E
 
A
I
 
Q
E
 
D
L
 
I
D
 
D
R
 
A
A
 
A
A
 
V
R
 
E
I
 
L
L
 
L
N
 
N
D
 
N
A
 
S
R
 
K
K
 
R
V
 
P
A
 
V
I
 
I
L
 
Y
A
 
A
G
|
G
R
x
I
G
|
G
V
 
T
V
 
M
G
 
G
A
 
H
A
 
G
E
 
P
E
 
A
L
 
V
R
 
Q
E
 
E
I
 
L
A
 
A
D
 
R
L
 
K
L
 
I
A
 
K
A
 
A
P
 
P
V
 
V
A
 
I
K
 
T
A
x
T
L
x
G
L
x
K
G
 
N
K
 
F
T
 
E
A
 
T
L
 
F
A
 
E
D
 
W
D
 
D
D
 
F
P
 
E
L
 
A
T
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
S
I
x
T
G
x
Y
I
x
R
L
x
V
G
 
G
T
 
W
A
 
K
P
 
P
S
 
A
Q
 
N
E
 
E
I
 
T
M
 
I
E
 
L
Q
 
E
C
 
A
D
 
D
A
 
T
V
 
V
L
 
L
I
 
F
V
 
A
G
|
G
S
|
S
S
x
N
F
|
F
P
|
P
Y
x
F
I
 
S
E
|
E
Y
 
V
Y
 
E
P
 
G
R
 
T
P
 
F
E
 
R
A
 
N
A
 
V
R
 
D
G
 
N
-
 
F
V
 
I
Q
 
Q
I
 
I
D
|
D
S
x
I
D
 
D
P
 
P
Q
 
A
R
x
M
I
 
L
G
 
G
L
 
K
R
 
R
F
 
H
P
 
H
V
 
A
D
 
D
A
 
V
G
 
A
L
 
I
V
 
L
G
 
G
D
|
D
A
|
A
R
 
A
E
 
L
T
 
A
L
 
I
R
 
D
L
 
E
L
 
I
R
 
L
P
 
N
R
 
K
L
 
V
T
 
D
R
 
A
K
 
V
T
 
E
D
 
E
R
 
S
S
 
A
F
 
W
L
 
W
E
 
T
K
 
A
A
 
N
Q
 
L
T
 
K
A
 
N
M
 
I
S
 
A
E
 
N
W
 
W
R
 
R
R
 
E
K
 
Y
M
 
I
E
 
N
T
 
M
M
 
L
E
 
E
T
 
T
E
 
K
R
 
E
S
 
E
A
 
G
P
 
D
L
 
L
K
 
Q
P
 
F
Q
 
Y
A
 
Q
V
 
V
V
 
Y
R
 
N
A
 
A
F
 
I
G
 
N
R
 
N
R
 
H
I
 
A
A
 
D
A
 
E
D
 
D
G
 
A
V
 
I
L
 
Y
V
 
S
A
 
I
D
 
D
S
x
V
G
 
G
Q
 
N
N
 
S
T
 
T
E
 
Q
L
 
T
A
 
S
A
 
I
R
 
R
H
 
H
I
 
L
D
 
H
L
 
M
R
 
T
T
 
P
T
 
K
N
 
N
Q
 
M
F
 
W
A
 
R
V
 
T
S
 
S
G
x
P
A
 
L
L
 
F
A
|
A
S
 
T
M
|
M
A
 
G
S
 
I
G
 
A
L
 
I
P
 
P
Y
 
G
A
 
G
I
 
L
A
 
G
A
 
A
G
 
K
A
 
N
A
 
T
D
 
Y
P
 
P
K
 
D
R
 
R
P
 
Q
I
 
V
Y
 
W
A
 
N
V
 
I
I
 
I
G
 
G
D
|
D
G
 
G
G
 
A
F
 
F
G
 
S
M
 
M
Q
 
T
L
 
Y
G
 
P
E
 
D
F
 
V
S
 
V
T
 
T
A
 
N
V
 
V
R
 
R
M
 
Y
A
 
N
L
 
M
P
 
P
L
 
V
K
 
I
L
 
N
L
 
V
V
 
V
I
 
F
C
 
S
N
|
N
G
 
-
M
 
-
L
 
-
N
 
-
Q
 
-
I
 
-
A
 
-
W
 
-
E
 
T
Q
x
E
M
x
Y
M
 
A
F
|
F
L
x
I
G
 
K
N
 
N
P
x
K
Q
 
Y
-
 
E
-
 
D
-
 
T
-
 
N
-
 
K
-
 
N
-
 
L
F
 
F
A
 
G
C
 
V
E
 
D
L
 
F
A
 
T
P
 
D
I
 
V
D
 
D
F
 
Y
A
 
A
K
 
K
A
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
A
M
 
Q
G
 
G
G
 
A
R
 
K
G
 
G
F
 
F
T
 
T
I
 
V
R
 
S
R
 
R
F
 
I
D
 
E
Q
 
D
I
 
M
E
 
D
P
 
R
T
 
V
L
 
M
T
 
A
E
 
E
A
 
A
F
 
V
S
 
A
V
 
A
-
 
N
-
 
K
A
 
A
G
 
G
-
 
H
P
 
T
V
 
V
V
 
V
I
 
I
Q
 
D
A
 
C
M
 
K
V
 
I
D
 
T
Q
|
Q
Y
 
D
E
 
R
P
 
P
M
 
-
M
 
I
P
 
P
P
 
V
K
 
E
M
 
T
P
 
L
K
 
K
D
 
L
Y
 
D
A
 
S
K
 
K
S
 
L
F
 
Y
R
 
S
Q
 
E
A
 
D
L
 
E
P
 
I
E
 
K
T
 
A
P
 
Y
G
 
K
H
 
E
R
 
R
A
 
Y
I
 
E
E
 
A
A
 
A
N
 
N
V
 
L
S
 
-
R
 
-
S
 
V
P
 
P
L
 
F
R
 
R
E
 
E
M
 
Y
M
 
L
D
 
E
A
 
A

1v5gA Crystal structure of the reaction intermediate between pyruvate oxidase containing fad and tpp, and substrate pyruvate (see paper)
28% identity, 96% coverage: 8:582/600 of query aligns to 9:580/589 of 1v5gA

query
sites
1v5gA
L
 
V
I
 
M
D
 
K
T
 
I
L
 
L
I
 
E
E
 
S
W
 
W
D
 
G
V
 
A
K
 
D
V
 
T
I
 
I
F
 
Y
G
 
G
L
 
I
P
 
P
G
 
S
D
 
G
G
 
T
I
 
L
N
 
S
G
 
S
V
 
L
M
 
M
E
 
D
A
 
A
L
 
M
R
 
G
K
 
E
R
 
E
Q
 
E
D
 
N
Q
 
N
I
 
V
R
 
K
F
 
F
I
 
L
Q
 
Q
V
 
V
R
 
K
H
 
H
E
 
E
E
 
E
S
 
V
A
 
G
A
 
A
F
 
M
M
 
A
A
 
A
S
 
V
A
 
M
Y
 
Q
A
 
S
K
 
K
F
 
F
T
 
G
G
 
G
N
 
N
L
 
L
G
 
G
V
 
V
C
 
T
L
 
V
A
 
G
T
 
S
S
 
G
G
 
G
P
 
P
G
 
G
G
 
A
T
 
S
N
 
H
L
 
L
L
 
I
T
 
N
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
K
 
A
L
 
M
D
 
D
Q
 
N
M
 
I
P
 
P
V
 
V
L
 
V
A
 
A
I
 
I
T
 
L
G
 
G
T
 
S
Q
 
R
Y
 
P
H
 
Q
D
 
R
L
 
E
I
 
L
E
 
N
T
 
M
F
 
D
T
 
A
Q
 
F
Q
 
Q
D
 
E
V
 
L
D
 
N
L
 
Q
T
 
N
R
 
P
V
 
M
F
 
Y
D
 
D
N
 
H
V
 
I
A
 
A
L
 
V
Y
 
Y
N
 
N
A
 
R
H
 
R
V
 
V
S
 
A
D
 
Y
A
 
A
S
 
E
H
 
Q
M
 
L
E
 
P
N
 
K
V
 
L
A
 
V
S
 
D
L
 
E
A
 
A
C
 
A
R
 
R
S
 
M
A
 
A
L
 
I
S
 
A
R
 
K
R
 
R
G
 
G
V
 
V
A
 
A
H
 
V
L
 
L
S
 
E
I
 
V
A
 
P
N
 
G
D
 
D
V
 
F
Q
 
A
E
 
K
M
 
V
-
 
E
-
 
I
-
 
D
-
 
N
D
 
D
G
 
Q
K
 
W
S
 
Y
R
 
S
S
 
S
K
 
A
R
 
N
N
 
S
R
 
L
P
 
R
K
 
K
H
 
Y
V
 
A
P
 
P
N
 
-
R
 
-
Y
 
-
F
 
-
H
 
-
G
 
-
R
 
-
Q
 
I
V
 
A
P
 
P
E
 
A
E
 
A
I
 
Q
E
 
D
L
 
I
D
 
D
R
 
A
A
 
A
A
 
V
R
 
E
I
 
L
L
 
L
N
 
N
D
 
N
A
 
S
R
 
K
K
 
R
V
 
P
A
 
V
I
 
I
L
 
Y
A
 
A
G
|
G
R
x
I
G
|
G
V
 
T
V
 
M
G
 
G
A
 
H
A
 
G
E
 
P
E
 
A
L
 
V
R
 
Q
E
 
E
I
 
L
A
 
A
D
 
R
L
 
K
L
 
I
A
 
K
A
 
A
P
 
P
V
 
V
A
 
I
K
 
T
A
x
T
L
x
G
L
x
K
G
 
N
K
 
F
T
 
E
A
 
T
L
 
F
A
 
E
D
 
W
D
 
D
D
 
F
P
 
E
L
 
A
T
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
S
I
x
T
G
x
Y
I
x
R
L
x
V
G
 
G
T
 
W
A
 
K
P
 
P
S
 
A
Q
 
N
E
 
E
I
 
T
M
 
I
E
 
L
Q
 
E
C
 
A
D
 
D
A
 
T
V
 
V
L
 
L
I
 
F
V
 
A
G
|
G
S
|
S
S
x
N
F
|
F
P
 
P
Y
x
F
I
 
S
E
 
E
Y
 
V
Y
 
E
P
 
G
R
 
T
P
 
F
E
 
R
A
 
N
A
 
V
R
 
D
G
 
N
-
 
F
V
 
I
Q
 
Q
I
 
I
D
|
D
S
x
I
D
 
D
P
 
P
Q
 
A
R
x
M
I
 
L
G
 
G
L
 
K
R
 
R
F
 
H
P
 
H
V
 
A
D
 
D
A
 
V
G
 
A
L
 
I
V
 
L
G
 
G
D
|
D
A
|
A
R
 
A
E
 
L
T
 
A
L
 
I
R
 
D
L
 
E
L
 
I
R
 
L
P
 
N
R
 
K
L
 
V
T
 
D
R
 
A
K
 
V
T
 
E
D
 
E
R
 
S
S
 
A
F
 
W
L
 
W
E
 
T
K
 
A
A
 
N
Q
 
L
T
 
K
A
 
N
M
 
I
S
 
A
E
 
N
W
 
W
R
 
R
R
 
E
K
 
Y
M
 
I
E
 
N
T
 
M
M
 
L
E
 
E
T
 
T
E
 
K
R
 
E
S
 
E
A
 
G
P
 
D
L
 
L
K
 
Q
P
 
F
Q
 
Y
A
 
Q
V
 
V
V
 
Y
R
 
N
A
 
A
F
 
I
G
 
N
R
 
N
R
 
H
I
 
A
A
 
D
A
 
E
D
 
D
G
 
A
V
 
I
L
 
Y
V
 
S
A
 
I
D
 
D
S
x
V
G
 
G
Q
x
N
N
 
S
T
 
T
E
 
Q
L
 
T
A
 
S
A
 
I
R
 
R
H
 
H
I
 
L
D
 
H
L
 
M
R
 
T
T
 
P
T
 
K
N
 
N
Q
 
M
F
 
W
A
 
R
V
 
T
S
 
S
G
x
P
A
 
L
L
 
F
A
 
A
S
 
T
M
|
M
A
 
G
S
 
I
G
 
A
L
 
I
P
 
P
Y
 
G
A
 
G
I
 
L
A
 
G
A
 
A
G
 
K
A
 
N
A
 
T
D
 
Y
P
 
P
K
 
D
R
 
R
P
 
Q
I
 
V
Y
 
W
A
 
N
V
 
I
I
 
I
G
|
G
D
|
D
G
|
G
G
x
A
F
 
F
G
 
S
M
 
M
Q
 
T
L
 
Y
G
 
P
E
 
D
F
 
V
S
 
V
T
 
T
A
 
N
V
 
V
R
 
R
M
 
Y
A
 
N
L
 
M
P
 
P
L
 
V
K
 
I
L
 
N
L
 
V
V
 
V
I
 
F
C
 
S
N
|
N
G
 
-
M
 
-
L
 
-
N
 
-
Q
 
-
I
 
-
A
 
-
W
 
-
E
 
T
Q
x
E
M
x
Y
M
x
A
F
|
F
L
x
I
G
 
K
N
 
N
P
 
K
Q
 
Y
-
 
E
-
 
D
-
 
T
-
 
N
-
 
K
-
 
N
-
 
L
F
 
F
A
 
G
C
 
V
E
 
D
L
 
F
A
 
T
P
 
D
I
 
V
D
 
D
F
 
Y
A
 
A
K
 
K
A
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
A
M
 
Q
G
 
G
G
 
A
R
 
K
G
 
G
F
 
F
T
 
T
I
 
V
R
 
S
R
 
R
F
 
I
D
 
E
Q
 
D
I
 
M
E
 
D
P
 
R
T
 
V
L
 
M
T
 
A
E
 
E
A
 
A
F
 
V
S
 
A
V
 
A
-
 
N
-
 
K
A
 
A
G
 
G
-
 
H
P
 
T
V
 
V
V
 
V
I
 
I
Q
 
D
A
 
C
M
 
K
V
 
I
D
 
T
Q
 
Q
Y
 
D
E
 
R
P
 
P
M
 
-
M
 
I
P
 
P
P
 
V
K
 
E
M
 
T
P
 
L
K
 
K
D
 
L
Y
 
D
A
 
S
K
 
K
S
 
L
F
 
Y
R
 
S
Q
 
E
A
 
D
L
 
E
P
 
I
E
 
K
T
 
A
P
 
Y
G
 
K
H
 
E
R
 
R
A
 
Y
I
 
E
E
 
A
A
 
A
N
 
N
V
 
L
S
 
-
R
 
-
S
 
V
P
 
P
L
 
F
R
 
R
E
 
E
M
 
Y
M
 
L
D
 
E
A
 
A

1v5fA Crystal structure of pyruvate oxidase complexed with fad and tpp, from aerococcus viridans (see paper)
28% identity, 96% coverage: 8:582/600 of query aligns to 9:580/589 of 1v5fA

query
sites
1v5fA
L
 
V
I
 
M
D
 
K
T
 
I
L
 
L
I
 
E
E
 
S
W
 
W
D
 
G
V
 
A
K
 
D
V
 
T
I
 
I
F
 
Y
G
 
G
L
 
I
P
 
P
G
 
S
D
 
G
G
 
T
I
 
L
N
 
S
G
 
S
V
 
L
M
 
M
E
 
D
A
 
A
L
 
M
R
 
G
K
 
E
R
 
E
Q
 
E
D
 
N
Q
 
N
I
 
V
R
 
K
F
 
F
I
 
L
Q
 
Q
V
 
V
R
 
K
H
 
H
E
 
E
E
 
E
S
 
V
A
 
G
A
 
A
F
 
M
M
 
A
A
 
A
S
 
V
A
 
M
Y
 
Q
A
 
S
K
 
K
F
 
F
T
 
G
G
 
G
N
 
N
L
 
L
G
 
G
V
 
V
C
 
T
L
 
V
A
 
G
T
 
S
S
 
G
G
 
G
P
 
P
G
 
G
G
 
A
T
 
S
N
 
H
L
 
L
L
 
I
T
 
N
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
K
 
A
L
 
M
D
 
D
Q
 
N
M
 
I
P
 
P
V
 
V
L
 
V
A
 
A
I
 
I
T
 
L
G
 
G
T
 
S
Q
 
R
Y
 
P
H
 
Q
D
 
R
L
 
E
I
 
L
E
 
N
T
 
M
F
 
D
T
 
A
Q
 
F
Q
 
Q
D
 
E
V
 
L
D
 
N
L
 
Q
T
 
N
R
 
P
V
 
M
F
 
Y
D
 
D
N
 
H
V
 
I
A
 
A
L
 
V
Y
 
Y
N
 
N
A
 
R
H
 
R
V
 
V
S
 
A
D
 
Y
A
 
A
S
 
E
H
 
Q
M
 
L
E
 
P
N
 
K
V
 
L
A
 
V
S
 
D
L
 
E
A
 
A
C
 
A
R
 
R
S
 
M
A
 
A
L
 
I
S
 
A
R
 
K
R
 
R
G
 
G
V
 
V
A
 
A
H
 
V
L
 
L
S
 
E
I
 
V
A
 
P
N
 
G
D
 
D
V
 
F
Q
 
A
E
 
K
M
 
V
-
 
E
-
 
I
-
 
D
-
 
N
D
 
D
G
 
Q
K
 
W
S
 
Y
R
 
S
S
 
S
K
 
A
R
 
N
N
 
S
R
 
L
P
 
R
K
 
K
H
 
Y
V
 
A
P
 
P
N
 
-
R
 
-
Y
 
-
F
 
-
H
 
-
G
 
-
R
 
-
Q
 
I
V
 
A
P
 
P
E
 
A
E
 
A
I
 
Q
E
 
D
L
 
I
D
 
D
R
 
A
A
 
A
A
 
V
R
 
E
I
 
L
L
 
L
N
 
N
D
 
N
A
 
S
R
 
K
K
 
R
V
 
P
A
 
V
I
 
I
L
 
Y
A
 
A
G
|
G
R
x
I
G
|
G
V
 
T
V
 
M
G
 
G
A
 
H
A
 
G
E
 
P
E
 
A
L
 
V
R
 
Q
E
 
E
I
 
L
A
 
A
D
 
R
L
 
K
L
 
I
A
 
K
A
 
A
P
 
P
V
 
V
A
 
I
K
 
T
A
x
T
L
x
G
L
x
K
G
 
N
K
 
F
T
 
E
A
 
T
L
 
F
A
 
E
D
 
W
D
 
D
D
 
F
P
 
E
L
 
A
T
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
S
I
x
T
G
x
Y
I
x
R
L
x
V
G
 
G
T
 
W
A
 
K
P
 
P
S
 
A
Q
 
N
E
 
E
I
 
T
M
 
I
E
 
L
Q
 
E
C
 
A
D
 
D
A
 
T
V
 
V
L
 
L
I
 
F
V
 
A
G
|
G
S
|
S
S
x
N
F
|
F
P
|
P
Y
x
F
I
 
S
E
 
E
Y
 
V
Y
 
E
P
 
G
R
 
T
P
 
F
E
 
R
A
 
N
A
 
V
R
 
D
G
 
N
-
 
F
V
 
I
Q
 
Q
I
 
I
D
|
D
S
x
I
D
 
D
P
 
P
Q
 
A
R
x
M
I
 
L
G
 
G
L
 
K
R
 
R
F
 
H
P
 
H
V
 
A
D
 
D
A
 
V
G
 
A
L
 
I
V
 
L
G
 
G
D
|
D
A
|
A
R
 
A
E
 
L
T
 
A
L
 
I
R
 
D
L
 
E
L
 
I
R
 
L
P
 
N
R
 
K
L
 
V
T
 
D
R
 
A
K
 
V
T
 
E
D
 
E
R
 
S
S
 
A
F
 
W
L
 
W
E
 
T
K
 
A
A
 
N
Q
 
L
T
 
K
A
 
N
M
 
I
S
 
A
E
 
N
W
 
W
R
 
R
R
 
E
K
 
Y
M
 
I
E
 
N
T
 
M
M
 
L
E
 
E
T
 
T
E
 
K
R
 
E
S
 
E
A
 
G
P
 
D
L
 
L
K
 
Q
P
 
F
Q
 
Y
A
 
Q
V
 
V
V
 
Y
R
 
N
A
 
A
F
 
I
G
 
N
R
 
N
R
 
H
I
 
A
A
 
D
A
 
E
D
 
D
G
 
A
V
 
I
L
 
Y
V
 
S
A
 
I
D
 
D
S
 
V
G
 
G
Q
x
N
N
x
S
T
 
T
E
 
Q
L
 
T
A
 
S
A
 
I
R
 
R
H
 
H
I
 
L
D
 
H
L
 
M
R
 
T
T
 
P
T
 
K
N
 
N
Q
 
M
F
 
W
A
 
R
V
 
T
S
 
S
G
x
P
A
 
L
L
 
F
A
 
A
S
 
T
M
|
M
A
 
G
S
 
I
G
 
A
L
 
I
P
 
P
Y
 
G
A
 
G
I
 
L
A
 
G
A
 
A
G
 
K
A
 
N
A
 
T
D
 
Y
P
 
P
K
 
D
R
 
R
P
 
Q
I
 
V
Y
 
W
A
 
N
V
 
I
I
 
I
G
|
G
D
|
D
G
|
G
G
 
A
F
 
F
G
 
S
M
 
M
Q
 
T
L
 
Y
G
 
P
E
 
D
F
 
V
S
 
V
T
 
T
A
 
N
V
 
V
R
 
R
M
 
Y
A
 
N
L
 
M
P
 
P
L
 
V
K
 
I
L
 
N
L
 
V
V
 
V
I
 
F
C
 
S
N
|
N
G
 
-
M
 
-
L
 
-
N
 
-
Q
 
-
I
 
-
A
 
-
W
 
-
E
 
T
Q
 
E
M
x
Y
M
x
A
F
|
F
L
x
I
G
 
K
N
 
N
P
 
K
Q
 
Y
-
 
E
-
 
D
-
 
T
-
 
N
-
 
K
-
 
N
-
 
L
F
 
F
A
 
G
C
 
V
E
 
D
L
 
F
A
 
T
P
 
D
I
 
V
D
 
D
F
 
Y
A
 
A
K
 
K
A
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
A
M
 
Q
G
 
G
G
 
A
R
 
K
G
 
G
F
 
F
T
 
T
I
 
V
R
 
S
R
 
R
F
 
I
D
 
E
Q
 
D
I
 
M
E
 
D
P
 
R
T
 
V
L
 
M
T
 
A
E
 
E
A
 
A
F
 
V
S
 
A
V
 
A
-
 
N
-
 
K
A
 
A
G
 
G
-
 
H
P
 
T
V
 
V
V
 
V
I
 
I
Q
 
D
A
 
C
M
 
K
V
 
I
D
 
T
Q
 
Q
Y
 
D
E
 
R
P
 
P
M
 
-
M
 
I
P
 
P
P
 
V
K
 
E
M
 
T
P
 
L
K
 
K
D
 
L
Y
 
D
A
 
S
K
 
K
S
 
L
F
 
Y
R
 
S
Q
 
E
A
 
D
L
 
E
P
 
I
E
 
K
T
 
A
P
 
Y
G
 
K
H
 
E
R
 
R
A
 
Y
I
 
E
E
 
A
A
 
A
N
 
N
V
 
L
S
 
-
R
 
-
S
 
V
P
 
P
L
 
F
R
 
R
E
 
E
M
 
Y
M
 
L
D
 
E
A
 
A

1y9dD Pyruvate oxidase variant v265a from lactobacillus plantarum (see paper)
30% identity, 91% coverage: 8:553/600 of query aligns to 9:529/560 of 1y9dD

query
sites
1y9dD
L
 
V
I
 
I
D
 
K
T
 
V
L
 
L
I
 
E
E
 
A
W
 
W
D
 
G
V
 
V
K
 
D
V
 
H
I
 
L
F
 
Y
G
 
G
L
x
I
P
 
P
G
|
G
D
x
G
G
x
S
I
|
I
N
 
N
G
 
S
V
 
I
M
 
M
E
 
D
A
 
A
L
 
L
R
 
S
K
 
A
R
 
E
Q
 
R
D
 
D
Q
 
R
I
 
I
R
 
H
F
 
Y
I
 
I
Q
 
Q
V
 
V
R
 
R
H
 
H
E
|
E
E
 
E
S
 
V
A
 
G
A
 
A
F
 
M
M
 
A
A
 
A
S
 
A
A
 
A
Y
 
D
A
 
A
K
 
K
F
 
L
T
 
T
G
 
G
N
 
K
L
 
I
G
 
G
V
 
V
C
 
C
L
 
F
A
 
G
T
x
S
S
 
A
G
 
G
P
|
P
G
 
G
G
 
G
T
 
T
N
x
H
L
 
L
L
 
M
T
 
N
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
A
 
A
K
 
R
L
 
E
D
 
D
Q
 
H
M
 
V
P
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
A
I
 
L
T
 
I
G
 
G
T
 
-
Q
 
-
Y
 
-
H
 
-
D
 
-
L
 
-
I
 
-
E
 
Q
T
 
F
F
 
G
T
 
T
Q
 
T
Q
 
G
D
x
E
V
 
M
D
 
N
L
 
E
T
 
N
R
 
P
V
 
I
F
 
Y
D
 
A
N
 
D
V
 
V
A
 
A
L
 
D
Y
 
Y
N
 
N
A
 
V
H
 
T
V
 
A
S
 
V
D
 
N
A
 
A
S
 
A
H
 
T
M
 
L
E
 
P
N
 
H
V
 
V
A
 
I
S
 
D
L
 
E
A
 
A
C
 
I
R
 
R
S
 
R
A
 
A
L
 
Y
S
 
A
R
 
H
R
 
Q
G
 
G
V
 
V
A
 
A
H
 
V
L
 
V
S
 
Q
I
 
I
A
 
P
N
x
V
D
 
D
V
 
L
Q
 
P
E
 
W
M
 
-
D
 
-
G
 
-
K
 
-
S
 
-
R
 
-
S
 
-
K
 
-
R
 
-
N
 
-
R
 
-
P
 
-
K
 
Q
H
 
Q
V
 
I
P
 
P
-
 
A
N
 
E
R
 
D
Y
 
W
F
 
Y
H
 
A
G
 
S
R
 
A
Q
 
P
V
 
E
P
 
P
E
 
D
E
 
V
I
 
Q
E
 
A
L
 
V
D
 
T
R
 
R
A
 
L
A
 
T
R
 
Q
I
 
T
L
 
L
N
 
L
D
 
A
A
 
A
R
 
E
K
 
R
V
 
P
A
 
L
I
 
I
L
 
Y
A
 
Y
G
 
G
R
x
I
G
|
G
V
 
A
V
 
R
G
 
K
A
 
A
A
 
G
E
 
K
E
 
E
L
 
L
R
 
E
E
 
Q
I
 
L
A
 
S
D
 
K
L
 
T
L
 
L
A
 
K
A
 
I
P
 
P
V
 
L
A
 
M
K
 
S
A
x
T
L
 
Y
L
x
P
G
 
A
K
 
K
T
 
G
A
 
I
L
 
V
A
 
A
D
 
D
D
 
R
D
 
Y
P
 
P
L
 
A
T
 
Y
T
 
L
G
 
G
G
 
S
I
 
A
G
 
N
I
x
R
L
 
A
G
 
A
T
 
Q
A
 
K
P
 
P
S
 
A
Q
 
N
E
 
E
I
 
A
M
 
L
E
 
A
Q
 
Q
C
 
A
D
 
D
A
 
V
V
 
V
L
 
L
I
 
F
V
 
V
G
|
G
S
x
N
S
x
N
F
 
Y
P
 
N
Y
 
-
I
 
T
E
 
R
Y
 
Y
Y
 
F
P
 
-
R
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
-
G
 
-
V
 
L
Q
 
Q
I
 
I
D
|
D
S
x
I
D
 
D
P
 
P
Q
 
A
R
x
K
I
 
L
G
 
G
L
 
K
R
 
R
F
 
H
P
 
K
V
 
T
D
 
D
A
 
I
G
 
A
L
 
V
V
 
L
G
 
A
D
|
D
A
|
A
R
 
Q
E
 
K
T
 
T
L
 
L
R
 
A
L
 
A
L
 
I
R
 
L
P
 
A
R
 
Q
L
 
V
T
 
S
R
 
E
K
 
R
T
 
E
D
 
S
R
 
T
S
 
P
F
 
W
L
 
W
E
 
Q
K
 
A
A
 
N
Q
 
L
T
 
A
A
 
N
M
 
V
S
 
K
E
 
N
W
 
W
R
 
R
R
 
A
K
 
Y
M
 
L
E
 
A
T
 
S
M
 
L
E
 
E
T
 
D
E
 
K
R
 
Q
S
 
E
A
 
G
P
 
P
L
 
L
K
 
Q
P
 
A
Q
 
Y
A
 
Q
V
 
V
V
 
L
R
 
R
A
 
A
F
 
V
G
 
N
R
 
K
R
 
I
I
 
A
A
 
E
A
 
P
D
 
D
G
 
A
V
 
I
L
 
Y
V
 
S
A
 
I
D
 
D
S
x
V
G
 
G
Q
x
D
N
 
I
T
 
N
E
 
L
L
 
N
A
 
A
A
 
N
R
 
R
H
 
H
I
 
L
D
 
K
L
 
L
R
 
T
T
 
P
T
 
S
N
 
N
Q
 
R
F
 
H
A
 
I
V
 
T
S
 
S
G
 
N
A
 
L
L
 
F
A
|
A
S
 
T
M
|
M
A
 
G
S
 
V
G
 
G
L
 
I
P
 
P
Y
 
G
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
G
 
K
A
 
L
A
 
N
D
 
Y
P
 
P
K
 
E
R
 
R
P
 
Q
I
 
V
Y
 
F
A
 
N
V
 
L
I
 
A
G
|
G
D
|
D
G
|
G
G
 
G
F
 
A
G
 
S
M
 
M
Q
 
T
L
 
M
G
 
Q
E
 
D
F
 
L
S
 
A
T
 
T
A
 
Q
V
 
V
R
 
Q
M
 
Y
A
 
H
L
 
L
P
 
P
L
 
V
K
 
I
L
 
N
L
 
V
V
 
V
I
 
F
C
 
T
N
|
N
G
 
C
M
x
Q
L
x
Y
N
x
G
Q
x
F
I
|
I
A
 
K
W
 
D
E
|
E
Q
 
Q
M
 
E
M
 
D
F
 
T
L
 
N
G
 
Q
N
 
N
P
 
D
Q
 
F
F
 
I
A
 
G
C
 
V
E
 
E
L
 
F
A
 
N
P
 
D
I
 
I
D
 
D
F
 
F
A
 
S
K
 
K
A
 
I
A
 
A
E
 
D
A
 
G
M
 
V
G
 
H
G
 
M
R
 
Q
G
 
A
F
 
F
T
 
R
I
 
V
R
 
N
R
 
K
F
 
I
D
 
E
Q
 
Q
I
 
L
E
 
P
P
 
D
T
 
V
L
 
F
T
 
E
E
 
Q
A
 
A
F
 
K
S
 
A
V
 
I
A
 
A
G
 
Q
-
 
H
-
 
E
P
 
P
V
 
V
V
 
L
I
 
I
Q
 
D
A
 
A
M
 
V
V
 
I
D
 
T
Q
x
G
Y
 
D
E
 
R
P
 
P
M
 
L
M
 
P
P
 
A
P
 
E
K
 
K
M
 
L
P
 
R
K
 
L
D
 
D
Y
 
S
A
 
A
K
 
M
S
 
S

9ev3A Corynebacterium glutamicum pyruvate:quinone oxidoreductase (pqo) purified from bacteria grown in acetate minimal medium (see paper)
31% identity, 96% coverage: 5:579/600 of query aligns to 5:575/577 of 9ev3A

query
sites
9ev3A
A
 
A
D
 
E
I
 
Q
L
 
L
I
 
I
D
 
D
T
 
T
L
 
L
I
 
E
E
 
A
W
 
Q
D
 
G
V
 
V
K
 
K
V
 
R
I
 
I
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
P
 
V
G
 
G
D
 
D
G
 
S
I
 
L
N
 
N
G
 
P
V
 
I
M
 
V
E
 
D
A
 
A
L
 
V
R
 
R
K
 
-
R
 
-
Q
 
Q
D
 
S
Q
 
D
I
 
I
R
 
E
F
 
W
I
 
V
Q
 
H
V
 
V
R
 
R
H
 
N
E
 
E
E
 
E
S
 
A
A
 
A
A
 
A
F
 
F
M
 
A
A
 
A
S
 
G
A
 
A
Y
 
E
A
 
S
K
 
L
F
 
I
T
 
T
G
 
G
N
 
E
L
 
L
G
 
A
V
 
V
C
 
C
L
 
A
A
 
A
T
 
S
S
 
C
G
 
G
P
 
P
G
 
G
G
 
N
T
 
T
N
 
H
L
 
L
L
 
I
T
 
Q
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
A
 
S
K
 
H
L
 
R
D
 
N
Q
 
G
M
 
A
P
 
K
V
 
V
L
 
L
A
 
A
I
 
I
T
 
A
G
 
S
T
 
H
Q
 
I
Y
 
P
H
 
S
D
 
A
L
 
Q
I
 
I
E
 
G
T
 
S
F
 
T
T
 
F
Q
 
F
Q
 
Q
D
 
E
V
 
T
D
 
H
L
 
P
T
 
E
R
 
I
V
 
L
F
 
F
D
 
K
N
 
E
V
 
C
A
 
S
L
 
G
Y
 
Y
N
 
C
A
 
E
H
 
M
V
 
V
S
 
N
D
 
G
A
 
G
S
 
E
H
 
Q
M
 
G
E
 
E
N
 
R
V
 
I
A
 
L
S
 
H
L
 
H
A
 
A
C
 
I
R
 
Q
S
 
S
A
 
T
L
 
M
S
 
A
R
 
G
R
 
K
G
 
G
V
 
V
A
 
S
H
 
V
L
 
V
S
 
V
I
 
I
A
 
P
N
 
G
D
 
D
V
 
I
Q
 
A
E
 
K
M
 
E
D
 
D
G
 
A
K
 
G
S
 
D
R
 
G
S
 
T
K
 
Y
R
 
S
N
 
N
R
 
-
P
 
-
K
 
-
H
 
-
V
 
-
P
 
-
N
 
S
R
 
T
Y
 
I
F
 
S
H
 
S
G
 
G
R
 
T
Q
 
P
V
 
V
-
 
V
-
 
F
P
 
P
E
 
D
E
 
P
I
 
T
E
 
E
L
 
A
D
 
A
R
 
A
A
 
L
A
 
V
R
 
E
I
 
A
L
 
I
N
 
N
D
 
N
A
 
A
R
 
K
K
 
S
V
 
V
A
 
T
I
 
L
L
 
F
A
 
C
G
|
G
R
 
A
G
|
G
V
 
V
V
 
K
G
 
N
A
 
A
A
 
R
E
 
A
E
 
Q
L
 
V
R
 
L
E
 
E
I
 
L
A
 
A
D
 
E
L
 
K
L
 
I
A
 
K
A
 
S
P
 
P
V
 
I
A
 
G
K
 
H
A
|
A
L
|
L
L
x
G
G
 
G
K
 
K
T
 
Q
A
 
Y
L
 
I
A
 
Q
D
 
H
D
 
E
D
 
N
P
 
P
L
 
F
T
 
E
T
 
V
G
 
G
G
 
M
I
 
S
G
|
G
I
 
L
L
|
L
G
 
G
T
 
Y
A
 
G
P
 
A
S
 
C
Q
 
V
E
 
D
I
 
A
M
 
S
E
 
N
Q
 
E
C
 
A
D
 
D
A
 
L
V
 
L
L
 
I
I
 
L
V
 
L
G
|
G
S
x
T
S
x
D
F
|
F
P
|
P
Y
|
Y
I
 
S
E
 
D
Y
 
F
Y
 
L
P
 
P
R
 
K
P
 
D
E
 
N
A
 
V
A
 
A
R
 
-
G
 
-
V
 
-
Q
 
Q
I
 
V
D
|
D
S
x
I
D
 
N
P
 
G
Q
 
A
R
x
H
I
 
I
G
 
G
L
 
R
R
 
R
F
 
T
P
 
T
V
 
V
D
 
K
A
 
Y
G
 
P
L
 
V
V
 
T
G
 
G
D
|
D
A
x
V
R
 
A
E
 
A
T
 
T
L
 
I
R
 
E
L
 
N
L
 
I
R
 
L
P
 
P
R
 
H
L
 
V
T
 
K
R
 
E
K
 
K
T
 
T
D
 
D
R
 
R
S
 
S
F
 
F
L
 
L
E
 
D
K
 
R
A
 
M
Q
 
L
T
 
K
A
 
A
M
 
H
S
 
-
E
 
-
W
 
-
R
 
E
R
 
R
K
 
K
M
 
L
E
 
S
-
 
S
-
 
V
-
 
V
-
 
E
-
 
T
-
 
Y
T
 
T
M
 
H
E
 
N
T
 
V
E
 
E
R
 
K
S
 
H
A
 
V
P
 
P
L
 
I
K
 
H
P
 
P
Q
 
E
A
 
Y
V
 
V
V
 
A
R
 
S
A
 
I
F
 
L
G
 
N
R
 
E
R
 
L
I
 
A
A
 
D
A
 
K
D
 
D
G
 
A
V
 
V
L
 
F
V
 
T
A
 
V
D
 
D
S
 
T
G
|
G
Q
x
M
N
 
C
T
x
N
E
 
V
L
 
W
A
 
H
A
 
A
R
 
R
H
 
Y
I
 
I
D
 
E
L
 
N
-
 
P
R
 
E
T
 
G
T
 
T
N
 
R
Q
 
D
F
 
F
A
 
V
V
 
G
S
 
S
G
x
F
A
x
R
L
 
H
A
 
G
S
 
T
M
|
M
A
 
A
S
 
N
G
 
A
L
 
L
P
 
P
Y
 
H
A
 
A
I
 
I
A
 
G
A
 
A
G
 
Q
A
 
S
A
 
V
D
 
D
P
 
R
K
 
N
R
 
R
P
 
Q
I
 
V
Y
 
I
A
 
A
V
 
M
I
 
C
G
|
G
D
|
D
G
|
G
G
|
G
F
 
L
G
 
G
M
|
M
Q
 
L
L
 
L
G
 
G
E
 
E
F
 
L
S
 
L
T
 
T
A
 
V
V
 
K
R
 
L
M
 
H
A
 
Q
L
 
L
P
 
P
L
 
L
K
 
K
L
 
A
L
 
V
V
 
V
I
 
F
C
 
N
N
|
N
G
 
S
M
x
S
L
|
L
N
x
G
Q
x
M
I
x
V
A
 
K
W
 
L
E
 
E
Q
 
-
M
 
M
M
 
L
F
 
V
L
 
E
G
 
G
N
 
Q
P
 
P
Q
 
E
F
 
F
A
 
G
C
 
T
E
 
D
L
 
H
A
 
E
P
 
E
I
 
V
D
 
N
F
 
F
A
 
A
K
 
E
A
 
I
A
 
A
E
 
A
A
 
A
M
 
A
G
 
G
G
 
I
R
 
K
G
 
S
F
 
V
T
 
R
I
 
I
R
 
T
R
 
D
F
 
P
D
 
K
Q
 
K
I
 
V
E
 
R
P
 
E
T
 
Q
L
 
L
T
 
A
E
 
E
A
 
A
F
 
L
S
 
A
V
 
Y
A
 
P
G
 
G
P
 
P
V
 
V
V
 
L
I
 
I
Q
 
D
A
 
I
M
 
V
V
 
T
D
 
D
Q
 
P
Y
 
N
E
 
A
P
 
L
M
 
S
M
 
I
P
 
P
P
 
P
K
 
T
M
 
I
P
 
T
K
 
W
D
 
E
Y
 
Q
A
 
V
K
 
M
S
 
G
F
 
F
R
 
S
Q
 
K
A
 
A
L
 
A
P
 
T
E
 
R
T
 
T
P
 
V
G
 
F
H
 
G
R
 
G
A
 
G
I
 
V
E
 
G
A
 
A
-
 
M
-
 
I
N
 
D
V
 
L
S
 
A
R
 
R
S
 
S
P
 
N
L
 
I
R
 
R
E
 
N
M
 
I

P09114 Acetolactate synthase 2, chloroplastic; ALS II; Acetohydroxy-acid synthase II; Acetolactate synthase II; EC 2.2.1.6 from Nicotiana tabacum (Common tobacco) (see paper)
28% identity, 90% coverage: 3:543/600 of query aligns to 92:643/664 of P09114

query
sites
P09114
N
 
K
A
 
G
A
 
S
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
V
D
 
E
T
 
A
L
 
L
I
 
E
E
 
R
W
 
E
D
 
G
V
 
V
K
 
T
V
 
D
I
 
V
F
 
F
G
 
A
L
 
Y
P
 
P
G
 
G
D
 
G
G
 
A
I
 
S
N
 
M
G
 
E
V
 
I
M
 
H
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
-
K
 
T
R
 
R
Q
 
S
D
 
S
Q
 
I
I
 
I
R
 
R
F
 
N
I
 
V
Q
 
L
V
 
P
R
 
R
H
 
H
E
 
E
E
 
Q
S
 
G
A
 
G
A
 
V
F
 
F
M
 
A
A
 
A
S
 
E
A
 
G
Y
 
Y
A
 
A
K
 
R
F
 
A
T
 
T
G
 
G
N
 
F
L
 
P
G
 
G
V
 
V
C
 
C
L
 
I
A
 
A
T
 
T
S
 
S
G
 
G
P
 
P
G
 
G
G
 
A
T
 
T
N
 
N
L
 
L
L
 
V
T
 
S
G
 
G
L
 
L
Y
 
A
D
 
D
A
 
A
K
 
L
L
 
L
D
 
D
Q
 
S
M
 
V
P
 
P
V
 
I
L
 
V
A
 
A
I
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
Q
 
V
Y
x
P
H
 
R
D
 
R
L
 
M
I
 
I
E
 
G
T
 
T
F
 
D
T
 
A
Q
 
F
Q
 
Q
D
 
E
V
 
T
D
 
P
L
 
I
T
 
V
R
 
E
V
 
V
F
 
T
D
 
R
N
 
S
V
 
I
A
 
T
L
 
K
Y
 
H
N
 
N
A
 
Y
H
 
L
V
 
V
S
 
M
D
 
D
A
 
V
S
 
E
H
 
D
M
 
I
E
 
P
N
 
R
V
 
V
A
 
V
S
 
R
L
 
E
A
 
A
C
 
F
R
 
F
S
 
L
A
 
A
L
 
R
S
 
S
-
 
G
R
 
R
R
 
P
G
 
G
V
 
P
A
 
V
H
 
L
L
 
I
S
 
D
I
 
V
A
 
P
N
 
K
D
 
D
V
 
I
Q
 
Q
E
 
Q
M
 
Q
D
 
-
G
 
-
K
 
L
S
 
V
R
 
I
S
 
P
K
 
D
R
 
W
N
 
D
R
 
Q
P
 
P
K
 
M
H
 
R
V
 
L
P
 
P
N
 
G
R
 
Y
Y
 
M
F
 
S
H
 
R
G
 
L
R
 
P
Q
 
K
V
 
L
P
 
P
E
 
N
E
 
E
I
 
M
E
 
L
L
 
L
D
 
E
R
 
Q
A
 
I
A
 
V
R
 
R
I
 
L
L
 
I
N
 
S
D
 
E
A
 
S
R
 
K
K
 
K
V
 
P
A
 
V
I
 
L
L
 
Y
A
 
V
G
 
G
R
 
G
G
 
G
V
 
C
V
 
S
G
 
Q
A
 
S
A
 
S
E
 
E
E
 
E
L
 
L
R
 
R
E
 
R
I
 
F
A
 
V
D
 
E
L
 
L
L
 
T
A
 
G
A
 
I
P
 
P
V
 
V
A
 
A
K
 
S
A
 
T
L
 
L
L
 
M
G
 
G
K
 
L
T
 
G
A
 
A
L
 
F
A
 
P
D
 
T
D
 
G
D
 
D
P
 
E
L
 
L
T
 
S
T
 
L
G
 
S
G
 
M
I
 
L
G
 
G
I
 
M
L
 
H
G
 
G
T
 
T
A
 
V
P
 
Y
S
 
A
Q
 
N
E
 
Y
I
 
A
M
 
V
E
 
D
Q
 
S
C
 
S
D
 
D
A
 
L
V
 
L
L
 
L
I
 
A
V
 
F
G
 
G
S
 
V
S
 
R
F
 
F
P
 
D
-
 
D
-
 
R
-
 
V
-
 
T
-
 
G
Y
 
K
I
 
L
E
 
E
Y
 
A
Y
 
F
P
 
-
R
 
-
P
 
A
E
 
S
A
 
R
A
 
A
R
 
K
G
 
I
V
 
V
Q
 
H
I
 
I
D
 
D
S
 
I
D
 
D
P
 
S
Q
 
A
R
 
E
I
 
I
G
 
G
L
 
K
R
 
N
F
 
K
P
 
Q
V
 
P
D
 
H
A
 
V
G
 
S
L
 
I
V
 
C
G
 
A
D
 
D
A
 
I
R
 
K
E
 
L
T
 
A
L
 
L
R
 
Q
L
 
G
L
 
L
R
 
N
P
 
S
R
 
I
L
 
L
T
 
E
R
 
S
K
 
K
T
 
E
D
 
G
R
 
K
S
 
L
F
 
K
L
 
L
E
 
D
K
 
-
A
 
-
Q
 
-
T
 
-
A
 
-
M
 
F
S
 
S
E
 
A
W
 
W
R
 
R
R
 
Q
K
 
E
M
 
L
E
 
T
T
 
V
M
 
Q
E
 
K
T
 
V
E
 
K
R
 
Y
S
 
P
A
 
L
P
 
N
L
 
F
K
 
K
-
 
T
-
 
F
-
 
G
-
 
D
-
 
A
-
 
I
-
 
P
P
 
P
Q
 
Q
A
 
Y
V
 
A
V
 
I
R
 
Q
A
 
V
F
 
L
G
 
D
R
 
E
R
 
L
I
 
T
A
 
N
A
 
G
D
 
S
G
 
A
V
 
I
L
 
I
V
 
S
A
 
T
D
 
G
S
 
V
G
 
G
Q
 
Q
N
 
H
T
 
Q
E
 
M
L
 
W
A
 
A
A
 
A
R
 
Q
H
 
Y
I
 
Y
D
 
K
L
 
Y
R
 
R
T
 
K
T
 
P
N
 
R
Q
 
Q
F
 
W
A
 
L
V
 
T
S
 
S
G
 
G
A
 
G
L
 
L
A
 
G
S
 
A
M
 
M
A
 
G
S
 
F
G
 
G
L
 
L
P
 
P
Y
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
G
A
 
A
G
 
A
A
 
V
A
 
G
D
 
R
P
 
P
K
 
D
R
 
E
P
 
V
I
 
V
Y
 
V
A
 
D
V
 
I
I
 
D
G
 
G
D
 
D
G
 
G
G
 
S
F
 
F
G
 
I
M
 
M
Q
 
N
L
 
V
G
 
Q
E
 
E
F
 
L
S
 
A
T
 
T
A
 
I
V
 
K
R
 
V
M
 
E
A
 
N
L
 
L
P
 
P
L
 
V
K
 
K
L
 
I
L
 
M
V
 
L
I
 
L
C
 
N
N
 
N
G
 
Q
M
 
H
L
 
L
N
 
G
Q
 
M
I
 
V
A
 
V
-
 
Q
W
|
W
E
 
E
Q
 
D
M
 
R
M
 
F
-
 
Y
-
 
K
-
 
A
-
 
N
-
 
R
-
 
A
-
 
H
-
 
T
F
 
Y
L
 
L
G
 
G
N
 
N
P
 
P
Q
 
S
F
 
N
A
 
E
C
 
A
E
 
E
L
 
I
A
 
F
P
 
P
I
 
-
D
 
N
F
 
M
A
 
L
K
 
K
A
 
F
A
 
A
E
 
E
A
 
A
M
 
C
G
 
G
G
 
V
R
 
P
G
 
A
F
 
A
T
 
R
I
 
V
R
 
T
R
 
H
F
 
R
D
 
D
Q
 
D
I
 
L
E
 
R
P
 
A
T
 
A
L
 
I
T
 
Q
E
 
K
A
 
M
F
 
L
S
 
D
V
 
T
A
 
P
G
 
G
P
 
P
V
 
Y
V
 
L
I
 
L
Q
 
D
A
 
V
M
 
I
V
 
V
D
 
P
Q
 
H
Y
 
Q
E
 
E
P
 
H
M
 
V
M
 
L
P
 
P

P09342 Acetolactate synthase 1, chloroplastic; ALS I; Acetohydroxy-acid synthase I; Acetolactate synthase I; EC 2.2.1.6 from Nicotiana tabacum (Common tobacco) (see 2 papers)
28% identity, 90% coverage: 3:543/600 of query aligns to 95:646/667 of P09342

query
sites
P09342
N
 
K
A
 
G
A
 
S
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
V
D
 
E
T
 
A
L
 
L
I
 
E
E
 
R
W
 
E
D
 
G
V
 
V
K
 
T
V
 
D
I
 
V
F
 
F
G
 
A
L
 
Y
P
 
P
G
 
G
D
 
G
G
 
A
I
 
S
N
 
M
G
 
E
V
 
I
M
 
H
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
-
K
 
T
R
 
R
Q
 
S
D
 
S
Q
 
I
I
 
I
R
 
R
F
 
N
I
 
V
Q
 
L
V
 
P
R
 
R
H
 
H
E
 
E
E
 
Q
S
 
G
A
 
G
A
 
V
F
 
F
M
 
A
A
 
A
S
 
E
A
 
G
Y
 
Y
A
 
A
K
 
R
F
 
A
T
 
T
G
 
G
N
 
F
L
 
P
G
 
G
V
 
V
C
|
C
L
 
I
A
 
A
T
 
T
S
 
S
G
 
G
P
 
P
G
 
G
G
 
A
T
 
T
N
 
N
L
 
L
L
 
V
T
 
S
G
 
G
L
 
L
Y
 
A
D
 
D
A
 
A
K
 
L
L
 
L
D
 
D
Q
 
S
M
 
V
P
 
P
V
 
I
L
 
V
A
 
A
I
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
Q
 
V
Y
x
P
H
 
R
D
 
R
L
 
M
I
 
I
E
 
G
T
 
T
F
 
D
T
 
A
Q
 
F
Q
 
Q
D
 
E
V
 
T
D
 
P
L
 
I
T
 
V
R
 
E
V
 
V
F
 
T
D
 
R
N
 
S
V
 
I
A
 
T
L
 
K
Y
 
H
N
 
N
A
 
Y
H
 
L
V
 
V
S
 
M
D
 
D
A
 
V
S
 
E
H
 
D
M
 
I
E
 
P
N
 
R
V
 
V
A
 
V
S
 
R
L
 
E
A
 
A
C
 
F
R
 
F
S
 
L
A
 
A
L
 
R
S
 
S
-
 
G
R
 
R
R
 
P
G
 
G
V
 
P
A
 
I
H
 
L
L
 
I
S
 
D
I
 
V
A
 
P
N
 
K
D
 
D
V
 
I
Q
 
Q
E
 
Q
M
 
Q
D
 
-
G
 
-
K
 
L
S
 
V
R
 
I
S
 
P
K
 
D
R
 
W
N
 
D
R
 
Q
P
 
P
K
 
M
H
 
R
V
 
L
P
 
P
N
 
G
R
 
Y
Y
 
M
F
 
S
H
 
R
G
 
L
R
 
P
Q
 
K
V
 
L
P
 
P
E
 
N
E
 
E
I
 
M
E
 
L
L
 
L
D
 
E
R
 
Q
A
 
I
A
 
V
R
 
R
I
 
L
L
 
I
N
 
S
D
 
E
A
 
S
R
 
K
K
 
K
V
 
P
A
 
V
I
 
L
L
 
Y
A
 
V
G
 
G
R
 
G
G
 
G
V
x
C
V
 
S
G
 
Q
A
 
S
A
 
S
E
 
E
E
 
D
L
 
L
R
 
R
E
 
R
I
 
F
A
 
V
D
 
E
L
 
L
L
 
T
A
 
G
A
 
I
P
 
P
V
 
V
A
 
A
K
 
S
A
 
T
L
 
L
L
 
M
G
 
G
K
 
L
T
 
G
A
 
A
L
 
F
A
 
P
D
 
T
D
 
G
D
 
D
P
 
E
L
 
L
T
 
S
T
 
L
G
 
S
G
 
M
I
 
L
G
 
G
I
 
M
L
 
H
G
 
G
T
 
T
A
 
V
P
 
Y
S
 
A
Q
 
N
E
 
Y
I
 
A
M
 
V
E
 
D
Q
 
S
C
 
S
D
 
D
A
 
L
V
 
L
L
 
L
I
 
A
V
 
F
G
 
G
S
 
V
S
 
R
F
 
F
P
 
D
-
 
D
-
 
R
-
 
V
-
 
T
-
 
G
Y
 
K
I
 
L
E
 
E
Y
 
A
Y
 
F
P
 
-
R
 
-
P
 
A
E
 
S
A
 
R
A
 
A
R
 
K
G
 
I
V
 
V
Q
 
H
I
 
I
D
 
D
S
 
I
D
 
D
P
 
S
Q
 
A
R
 
E
I
 
I
G
 
G
L
 
K
R
 
N
F
 
K
P
 
Q
V
 
P
D
 
H
A
 
V
G
 
S
L
 
I
V
 
C
G
 
A
D
 
D
A
 
I
R
 
K
E
 
L
T
 
A
L
 
L
R
 
Q
L
 
G
L
 
L
R
 
N
P
 
S
R
 
I
L
 
L
T
 
E
R
 
S
K
 
K
T
 
E
D
 
G
R
 
K
S
 
L
F
 
K
L
 
L
E
 
D
K
 
-
A
 
-
Q
 
-
T
 
-
A
 
-
M
 
F
S
 
S
E
 
A
W
 
W
R
 
R
R
 
Q
K
 
E
M
 
L
E
 
T
T
 
E
M
 
Q
E
 
K
T
 
V
E
 
K
R
 
H
S
 
P
A
 
L
P
 
N
L
 
F
K
 
K
-
 
T
-
 
F
-
 
G
-
 
D
-
 
A
-
 
I
-
 
P
P
 
P
Q
 
Q
A
 
Y
V
 
A
V
 
I
R
 
Q
A
 
V
F
 
L
G
 
D
R
 
E
R
 
L
I
 
T
A
 
N
A
 
G
D
 
N
G
 
A
V
 
I
L
 
I
V
 
S
A
 
T
D
 
G
S
 
V
G
 
G
Q
 
Q
N
 
H
T
 
Q
E
 
M
L
 
W
A
 
A
A
 
A
R
 
Q
H
 
Y
I
 
Y
D
 
K
L
 
Y
R
 
R
T
 
K
T
 
P
N
 
R
Q
 
Q
F
 
W
A
 
L
V
 
T
S
 
S
G
 
G
A
 
G
L
 
L
A
 
G
S
 
A
M
 
M
A
 
G
S
 
F
G
 
G
L
 
L
P
 
P
Y
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
G
A
 
A
G
 
A
A
 
V
A
 
G
D
 
R
P
 
P
K
 
D
R
 
E
P
 
V
I
 
V
Y
 
V
A
 
D
V
 
I
I
 
D
G
 
G
D
 
D
G
 
G
G
 
S
F
 
F
G
 
I
M
 
M
Q
 
N
L
 
V
G
 
Q
E
 
E
F
 
L
S
 
A
T
 
T
A
 
I
V
 
K
R
 
V
M
 
E
A
 
N
L
 
L
P
 
P
L
 
V
K
 
K
L
 
I
L
 
M
V
 
L
I
 
L
C
 
N
N
 
N
G
 
Q
M
 
H
L
 
L
N
 
G
Q
 
M
I
 
V
A
 
V
-
 
Q
W
 
W
E
 
E
Q
 
D
M
 
R
M
 
F
-
 
Y
-
 
K
-
 
A
-
 
N
-
 
R
-
 
A
-
 
H
-
 
T
F
 
Y
L
 
L
G
 
G
N
 
N
P
 
P
Q
 
S
F
 
N
A
 
E
C
 
A
E
 
E
L
 
I
A
 
F
P
 
P
I
 
-
D
 
N
F
 
M
A
 
L
K
 
K
A
 
F
A
 
A
E
 
E
A
 
A
M
 
C
G
 
G
G
 
V
R
 
P
G
 
A
F
 
A
T
 
R
I
 
V
R
 
T
R
 
H
F
 
R
D
 
D
Q
 
D
I
 
L
E
 
R
P
 
A
T
 
A
L
 
I
T
 
Q
E
 
K
A
 
M
F
 
L
S
 
D
V
 
T
A
 
P
G
 
G
P
 
P
V
 
Y
V
 
L
I
 
L
Q
 
D
A
 
V
M
 
I
V
 
V
D
 
P
Q
 
H
Y
 
Q
E
 
E
P
 
H
M
 
V
M
 
L
P
 
P

P07342 Acetolactate synthase catalytic subunit, mitochondrial; Acetohydroxy-acid synthase catalytic subunit; AHAS; ALS; EC 2.2.1.6 from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) (see paper)
28% identity, 88% coverage: 16:543/600 of query aligns to 106:653/687 of P07342

query
sites
P07342
D
 
N
V
 
V
K
 
D
V
 
T
I
 
V
F
 
F
G
 
G
L
 
Y
P
 
P
G
 
G
D
 
G
G
 
A
I
 
I
N
 
L
G
 
P
V
 
V
M
 
Y
E
 
D
A
 
A
L
 
I
R
 
H
K
 
-
R
 
N
Q
 
S
D
 
D
Q
 
K
I
 
F
R
 
N
F
 
F
I
 
V
Q
 
L
V
 
P
R
 
K
H
 
H
E
 
E
E
 
Q
S
 
G
A
 
A
A
 
G
F
 
H
M
 
M
A
 
A
S
 
E
A
 
G
Y
 
Y
A
 
A
K
 
R
F
 
A
T
 
S
G
 
G
N
 
K
L
 
P
G
 
G
V
 
V
C
 
V
L
 
L
A
 
V
T
 
T
S
 
S
G
 
G
P
 
P
G
 
G
G
 
A
T
 
T
N
 
N
L
 
V
L
 
V
T
 
T
G
 
P
L
 
M
Y
 
A
D
 
D
A
 
A
K
 
F
L
 
A
D
 
D
Q
 
G
M
 
I
P
 
P
V
 
M
L
 
V
A
 
V
I
 
F
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
Q
 
V
Y
 
P
H
 
T
D
 
S
L
 
A
I
 
I
E
 
G
T
 
T
F
 
D
T
 
A
Q
 
F
Q
 
Q
D
 
E
V
 
A
D
 
D
L
 
V
T
 
V
R
 
G
V
 
I
F
 
S
D
 
R
N
 
S
V
 
C
A
 
T
L
 
K
Y
 
W
N
 
N
A
 
V
H
 
M
V
 
V
S
 
K
D
 
S
A
 
V
S
 
E
H
 
E
M
 
L
E
 
P
N
 
L
V
 
R
A
 
I
S
 
N
L
 
E
A
 
A
C
 
F
R
 
E
S
 
I
A
 
A
L
 
T
S
 
S
R
 
G
R
|
R
-
 
P
G
 
G
V
 
P
A
 
V
H
 
L
L
 
V
S
 
D
I
 
L
A
 
P
N
 
K
D
 
D
V
 
V
Q
 
T
E
 
A
-
 
A
-
 
I
M
 
L
D
 
R
G
 
N
K
 
P
S
 
I
R
 
P
S
 
T
K
 
K
R
 
T
N
 
T
R
 
L
P
 
P
K
 
S
H
 
N
V
 
A
P
 
L
N
 
N
R
 
Q
Y
 
-
F
 
L
H
 
T
G
 
S
R
 
R
Q
 
A
V
 
Q
P
 
D
E
 
E
E
 
F
I
 
V
-
 
M
-
 
Q
E
 
S
L
 
I
D
 
N
R
 
K
A
 
A
A
 
A
R
 
D
I
 
L
L
 
I
N
 
N
D
 
L
A
 
A
R
 
K
K
 
K
V
 
P
A
 
V
I
 
L
L
 
Y
A
 
V
G
 
G
R
 
A
G
 
G
V
 
I
V
 
L
G
 
N
A
 
H
A
 
A
E
 
D
E
 
G
-
 
P
-
 
R
-
 
L
L
 
L
R
 
K
E
 
E
I
 
L
A
 
S
D
 
D
L
 
R
L
 
A
A
 
Q
A
 
I
P
 
P
V
 
V
A
 
T
K
 
T
A
 
T
L
 
L
L
 
Q
G
 
G
K
 
L
T
 
G
A
 
S
L
 
F
A
 
D
D
 
Q
D
 
E
D
 
D
P
 
P
L
 
K
T
 
S
T
 
L
G
 
D
G
 
M
I
 
L
G
 
G
I
 
M
L
x
H
G
|
G
T
x
C
A
|
A
P
x
T
S
x
A
Q
x
N
E
x
L
I
x
A
M
x
V
E
x
Q
Q
x
N
C
x
A
D
|
D
A
x
L
V
x
I
L
x
I
I
x
A
V
|
V
G
|
G
S
x
A
S
x
R
F
 
F
P
 
D
-
 
D
-
 
R
-
 
V
-
 
T
-
 
G
-
 
N
-
 
I
-
 
S
-
 
K
-
 
F
Y
 
A
I
 
P
E
 
E
Y
 
A
Y
 
R
P
 
R
R
 
A
P
 
A
E
 
A
A
 
E
A
 
G
R
 
R
G
 
G
-
 
G
-
 
I
V
 
I
Q
 
H
I
 
F
D
x
E
S
x
V
D
x
S
P
|
P
Q
x
K
R
x
N
I
|
I
G
x
N
L
x
K
R
x
V
F
x
V
P
x
Q
V
x
T
D
x
Q
A
x
I
G
x
A
L
x
V
V
x
E
G
|
G
D
|
D
A
 
A
R
 
T
E
 
T
T
 
N
L
 
L
R
 
G
L
 
K
L
 
M
R
 
M
P
 
S
R
 
K
L
 
I
T
 
F
R
 
P
K
 
V
T
 
K
D
 
E
R
 
R
S
 
S
F
 
-
L
 
-
E
 
-
K
 
E
A
 
W
Q
 
F
T
 
A
A
 
Q
M
 
I
S
 
N
E
 
K
W
 
W
R
 
K
R
 
K
K
 
E
-
 
Y
-
 
P
M
 
Y
E
 
A
T
 
Y
M
 
M
E
 
E
T
 
E
E
 
T
R
 
P
S
 
G
A
 
S
P
 
K
L
 
I
K
 
K
P
 
P
Q
 
Q
A
 
T
V
 
V
V
 
I
R
 
K
A
 
K
F
 
L
G
 
S
R
 
K
R
 
V
I
 
A
A
 
N
A
 
D
D
 
T
G
 
G
-
 
R
-
 
H
-
 
V
V
 
I
L
 
V
V
 
T
A
 
T
D
 
G
S
 
V
G
 
G
Q
 
Q
N
 
H
T
 
Q
E
 
M
L
 
W
A
 
A
A
 
A
R
 
Q
H
 
H
I
 
W
D
 
T
L
 
W
R
 
R
T
 
N
T
 
P
N
 
H
Q
 
T
F
 
F
A
 
I
V
 
T
S
 
S
G
 
G
A
 
G
L
 
L
A
 
G
S
 
T
M
 
M
A
 
G
S
 
Y
G
 
G
L
 
L
P
 
P
Y
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
G
A
 
A
G
 
Q
A
 
V
A
 
A
D
 
K
P
 
P
K
 
E
R
 
S
P
 
L
I
 
V
Y
 
I
A
 
D
V
 
I
I
 
D
G
 
G
D
 
D
G
 
A
G
 
S
F
 
F
G
 
N
M
 
M
Q
 
T
L
 
L
G
 
T
E
 
E
F
 
L
S
 
S
T
 
S
A
 
A
V
 
V
R
 
Q
M
 
A
A
 
G
L
 
T
P
 
P
L
 
V
K
 
K
L
 
I
L
 
L
V
 
I
I
 
L
C
 
N
N
 
N
-
 
E
-
 
E
-
 
Q
G
 
G
M
 
M
L
 
V
N
 
T
Q
 
Q
I
 
-
A
 
-
W
 
W
E
 
Q
Q
 
S
M
 
L
M
 
F
F
 
Y
L
 
E
G
 
H
N
 
R
P
 
Y
Q
 
S
F
 
H
A
 
T
C
 
H
E
 
Q
L
 
L
A
 
N
P
 
P
I
 
-
D
 
D
F
 
F
A
 
I
K
 
K
A
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
M
 
M
G
 
G
G
 
L
R
 
K
G
 
G
F
 
L
T
 
R
I
 
V
R
 
K
R
 
K
F
 
Q
D
 
E
Q
 
E
I
 
L
E
 
D
P
 
A
T
 
K
L
 
L
T
 
K
E
 
E
A
 
F
F
 
V
S
 
S
V
 
T
A
 
K
G
 
G
P
 
P
V
 
V
V
 
L
I
 
L
Q
 
E
A
 
V
M
 
E
V
 
V
D
 
D
Q
 
K
Y
 
K
E
 
V
P
 
P
M
 
V
M
 
L
P
 
P

6u9dB Saccharomyces cerevisiae acetohydroxyacid synthase (see paper)
28% identity, 88% coverage: 16:543/600 of query aligns to 26:573/607 of 6u9dB

query
sites
6u9dB
D
 
N
V
 
V
K
 
D
V
 
T
I
 
V
F
 
F
G
 
G
L
x
Y
P
 
P
G
|
G
D
x
G
G
x
A
I
|
I
N
 
L
G
 
P
V
 
V
M
 
Y
E
 
D
A
 
A
L
 
I
R
 
H
K
 
-
R
 
N
Q
 
S
D
 
D
Q
 
K
I
 
F
R
 
N
F
 
F
I
 
V
Q
 
L
V
 
P
R
 
K
H
 
H
E
|
E
E
 
Q
S
 
G
A
 
A
A
 
G
F
 
H
M
 
M
A
 
A
S
 
E
A
 
G
Y
 
Y
A
 
A
K
 
R
F
 
A
T
 
S
G
 
G
N
 
K
L
 
P
G
 
G
V
 
V
C
 
V
L
 
L
A
 
V
T
|
T
S
 
S
G
 
G
P
|
P
G
 
G
G
 
A
T
 
T
N
 
N
L
 
V
L
 
V
T
 
T
G
 
P
L
 
M
Y
 
A
D
 
D
A
 
A
K
 
F
L
 
A
D
 
D
Q
 
G
M
 
I
P
 
P
V
 
M
L
 
V
A
 
V
I
 
F
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
Q
x
V
Y
x
P
H
 
T
D
 
S
L
 
A
I
 
I
E
 
G
T
 
T
F
 
D
T
 
A
Q
x
F
Q
|
Q
D
x
E
V
 
A
D
 
D
L
 
V
T
 
V
R
 
G
V
 
I
F
 
S
D
 
R
N
 
S
V
 
C
A
 
T
L
 
K
Y
 
W
N
 
N
A
 
V
H
 
M
V
 
V
S
 
K
D
 
S
A
 
V
S
 
E
H
 
E
M
 
L
E
 
P
N
 
L
V
 
R
A
 
I
S
 
N
L
 
E
A
 
A
C
 
F
R
 
E
S
 
I
A
 
A
L
 
T
S
 
S
R
 
G
R
|
R
-
 
P
G
 
G
V
 
P
A
 
V
H
 
L
L
 
V
S
 
D
I
 
L
A
 
P
N
x
K
D
 
D
V
 
V
Q
 
T
E
 
A
-
 
A
-
 
I
M
 
L
D
 
R
G
 
N
K
 
P
S
 
I
R
 
P
S
 
T
K
 
K
R
 
T
N
 
T
R
 
L
P
 
P
K
 
S
H
 
N
V
 
A
P
 
L
N
 
N
R
 
Q
Y
 
-
F
 
L
H
 
T
G
 
S
R
 
R
Q
 
A
V
 
Q
P
 
D
E
 
E
E
 
F
I
 
V
-
 
M
-
 
Q
E
 
S
L
 
I
D
 
N
R
 
K
A
 
A
A
 
A
R
 
D
I
 
L
L
 
I
N
 
N
D
 
L
A
 
A
R
 
K
K
 
K
V
 
P
A
 
V
I
 
L
L
 
Y
A
 
V
G
 
G
R
x
A
G
|
G
V
 
I
V
 
L
G
x
N
A
 
H
A
 
A
E
 
D
E
 
G
-
 
P
-
 
R
-
 
L
L
 
L
R
 
K
E
 
E
I
 
L
A
 
S
D
 
D
L
 
R
L
 
A
A
 
Q
A
 
I
P
 
P
V
 
V
A
 
T
K
 
T
A
x
T
L
|
L
L
x
Q
G
 
G
K
 
L
T
 
G
A
 
S
L
 
F
A
 
D
D
 
Q
D
 
E
D
 
D
P
 
P
L
 
K
T
 
S
T
 
L
G
 
D
G
 
M
I
x
L
G
 
G
I
x
M
L
 
H
G
 
G
T
 
C
A
 
A
P
 
T
S
 
A
Q
 
N
E
 
L
I
 
A
M
 
V
E
 
Q
Q
 
N
C
 
A
D
 
D
A
 
L
V
 
I
L
 
I
I
 
A
V
 
V
G
|
G
S
 
A
S
x
R
F
 
F
P
x
D
-
x
D
-
x
R
-
x
V
-
 
T
-
 
G
-
 
N
-
 
I
-
 
S
-
 
K
-
 
F
Y
 
A
I
 
P
E
 
E
Y
 
A
Y
 
R
P
 
R
R
 
A
P
 
A
E
 
A
A
 
E
A
 
G
R
 
R
G
 
G
-
 
G
-
 
I
V
 
I
Q
 
H
I
 
F
D
x
E
S
x
V
D
 
S
P
 
P
Q
 
K
R
x
N
I
 
I
G
 
N
L
 
K
R
 
V
F
 
V
P
 
Q
V
 
T
D
 
Q
A
 
I
G
 
A
L
 
V
V
 
E
G
 
G
D
|
D
A
|
A
R
 
T
E
 
T
T
 
N
L
 
L
R
 
G
L
 
K
L
 
M
R
 
M
P
 
S
R
 
K
L
 
I
T
 
F
R
 
P
K
 
V
T
 
K
D
 
E
R
 
R
S
 
S
F
 
-
L
 
-
E
 
-
K
 
E
A
 
W
Q
 
F
T
 
A
A
 
Q
M
 
I
S
 
N
E
 
K
W
 
W
R
 
K
R
 
K
K
 
E
-
 
Y
-
 
P
M
 
Y
E
 
A
T
 
Y
M
 
M
E
 
E
T
 
E
E
 
T
R
 
P
S
 
G
A
 
S
P
 
K
L
 
I
K
 
K
P
 
P
Q
 
Q
A
 
T
V
 
V
V
 
I
R
 
K
A
 
K
F
 
L
G
 
S
R
 
K
R
 
V
I
 
A
A
 
N
A
 
D
D
 
T
G
 
G
-
 
R
-
 
H
-
 
V
V
 
I
L
 
V
V
 
T
A
 
T
D
 
G
S
x
V
G
|
G
Q
|
Q
N
x
H
T
 
Q
E
x
M
L
 
W
A
 
A
A
 
A
R
 
Q
H
 
H
I
 
W
D
 
T
L
 
W
R
 
R
T
 
N
T
 
P
N
 
H
Q
 
T
F
 
F
A
 
I
V
 
T
S
 
S
G
|
G
A
x
G
L
 
L
A
x
G
S
 
T
M
|
M
A
 
G
S
 
Y
G
 
G
L
 
L
P
 
P
Y
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
G
A
 
A
G
 
Q
A
 
V
A
 
A
D
 
K
P
 
P
K
 
E
R
 
S
P
 
L
I
 
V
Y
 
I
A
 
D
V
 
I
I
 
D
G
 
G
D
|
D
G
x
A
G
x
S
F
 
F
G
 
N
M
 
M
Q
 
T
L
 
L
G
 
T
E
 
E
F
 
L
S
 
S
T
 
S
A
 
A
V
 
V
R
 
Q
M
 
A
A
 
G
L
 
T
P
 
P
L
 
V
K
 
K
L
 
I
L
 
L
V
 
I
I
 
L
C
 
N
N
|
N
-
 
E
-
x
E
-
x
Q
G
|
G
M
|
M
L
x
V
N
 
T
Q
 
Q
I
 
-
A
 
-
W
|
W
E
 
Q
Q
 
S
M
 
L
M
 
F
F
 
Y
L
 
E
G
 
H
N
 
R
P
 
Y
Q
 
S
F
 
H
A
 
T
C
 
H
E
 
Q
L
 
L
A
 
N
P
 
P
I
 
-
D
 
D
F
 
F
A
 
I
K
 
K
A
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
M
 
M
G
 
G
G
 
L
R
 
K
G
 
G
F
 
L
T
 
R
I
 
V
R
 
K
R
 
K
F
 
Q
D
 
E
Q
 
E
I
 
L
E
 
D
P
 
A
T
 
K
L
 
L
T
 
K
E
 
E
A
 
F
F
 
V
S
 
S
V
 
T
A
 
K
G
 
G
P
 
P
V
 
V
V
 
L
I
 
L
Q
 
E
A
 
V
M
 
E
V
 
V
D
 
D
Q
 
K
Y
 
K
E
 
V
P
 
P
M
 
V
M
 
L
P
 
P

1t9bB Crystal structure of yeast acetohydroxyacid synthase in complex with a sulfonylurea herbicide, chlorsulfuron (see paper)
27% identity, 88% coverage: 16:543/600 of query aligns to 22:561/595 of 1t9bB

query
sites
1t9bB
D
 
N
V
 
V
K
 
D
V
 
T
I
 
V
F
 
F
G
 
G
L
x
Y
P
 
P
G
|
G
D
x
G
G
x
A
I
|
I
N
 
L
G
 
P
V
 
V
M
 
Y
E
 
D
A
 
A
L
 
I
R
 
H
K
 
-
R
 
N
Q
 
S
D
 
D
Q
 
K
I
 
F
R
 
N
F
 
F
I
 
V
Q
 
L
V
 
P
R
 
K
H
 
H
E
|
E
E
 
Q
S
 
G
A
 
A
A
 
G
F
 
H
M
 
M
A
 
A
S
 
E
A
 
G
Y
 
Y
A
 
A
K
 
R
F
 
A
T
 
S
G
 
G
N
 
K
L
 
P
G
 
G
V
 
V
C
 
V
L
 
L
A
 
V
T
|
T
S
 
S
G
 
G
P
 
P
G
 
G
G
 
A
T
 
T
N
 
N
L
 
V
L
 
V
T
 
T
G
 
P
L
 
M
Y
 
A
D
 
D
A
 
A
K
 
F
L
 
A
D
 
D
Q
 
G
M
 
I
P
 
P
V
 
M
L
 
V
A
 
V
I
 
F
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
Q
x
V
Y
x
P
H
 
T
D
 
S
L
 
A
I
 
I
E
 
G
T
 
T
F
 
D
T
 
A
Q
x
F
Q
|
Q
D
x
E
V
 
A
D
 
D
L
 
V
T
 
V
R
 
G
V
 
I
F
 
S
D
 
R
N
 
S
V
 
C
A
 
T
L
 
K
Y
 
W
N
 
N
A
 
V
H
 
M
V
 
V
S
 
K
D
 
S
A
 
V
S
 
E
H
 
E
M
 
L
E
 
P
N
 
L
V
 
R
A
 
I
S
 
N
L
 
E
A
 
A
C
 
F
R
 
E
S
 
I
A
 
A
L
 
T
S
 
S
R
 
G
R
|
R
-
 
P
G
 
G
V
 
P
A
 
V
H
 
L
L
 
V
S
 
D
I
 
L
A
 
P
N
x
K
D
 
D
V
 
V
Q
 
T
E
 
A
-
 
A
-
 
I
M
 
L
D
 
R
G
 
N
K
 
P
S
 
I
R
 
P
S
 
T
K
 
K
R
 
T
N
 
T
R
 
L
P
 
P
K
 
S
H
 
R
V
 
A
P
 
Q
N
 
D
R
 
E
Y
 
F
F
 
V
H
 
M
G
 
Q
R
 
-
Q
 
-
V
 
-
P
 
-
E
 
-
E
 
-
I
 
-
E
 
S
L
 
I
D
 
N
R
 
K
A
 
A
A
 
A
R
 
D
I
 
L
L
 
I
N
 
N
D
 
L
A
 
A
R
 
K
K
 
K
V
 
P
A
 
V
I
 
L
L
 
Y
A
 
V
G
|
G
R
x
A
G
|
G
V
 
I
V
 
L
G
x
N
A
 
H
A
 
A
E
 
D
E
 
G
-
 
P
-
x
R
-
 
L
L
 
L
R
 
K
E
 
E
I
 
L
A
 
S
D
 
D
L
 
R
L
 
A
A
 
Q
A
 
I
P
 
P
V
 
V
A
 
T
K
 
T
A
x
T
L
|
L
L
x
Q
G
 
G
K
 
L
T
 
G
A
 
S
L
 
F
A
 
D
D
 
Q
D
 
E
D
 
D
P
 
P
L
 
K
T
 
S
T
 
L
G
 
D
G
x
M
I
x
L
G
 
G
I
x
M
L
x
H
G
 
G
T
 
C
A
 
A
P
 
T
S
 
A
Q
 
N
E
 
L
I
 
A
M
 
V
E
 
Q
Q
 
N
C
 
A
D
 
D
A
 
L
V
 
I
L
 
I
I
 
A
V
 
V
G
|
G
S
x
A
S
x
R
F
 
F
P
x
D
-
x
D
-
x
R
-
x
V
-
 
T
-
 
G
-
 
N
-
 
I
-
 
S
-
 
K
-
 
F
Y
 
A
I
 
P
E
 
E
Y
 
A
Y
 
R
P
 
R
R
 
A
P
 
A
E
 
A
A
 
E
A
 
G
R
 
R
G
 
G
-
 
G
-
 
I
V
 
I
Q
 
H
I
 
F
D
x
E
S
x
V
D
 
S
P
 
P
Q
 
K
R
x
N
I
 
I
G
 
N
L
 
K
R
 
V
F
 
V
P
 
Q
V
 
T
D
 
Q
A
 
I
G
 
A
L
 
V
V
 
E
G
|
G
D
|
D
A
|
A
R
 
T
E
 
T
T
 
N
L
 
L
R
 
G
L
 
K
L
 
M
R
 
M
P
 
S
R
 
K
L
 
I
T
 
F
R
 
P
K
 
V
T
 
K
D
 
E
R
 
R
S
 
S
F
 
-
L
 
-
E
 
-
K
 
E
A
 
W
Q
 
F
T
 
A
A
 
Q
M
 
I
S
 
N
E
 
K
W
 
W
R
 
K
R
 
K
K
 
E
-
 
Y
-
 
P
M
 
Y
E
 
A
T
 
Y
M
 
M
E
 
E
T
 
E
E
 
T
R
 
P
S
 
G
A
 
S
P
 
K
L
 
I
K
 
K
P
 
P
Q
 
Q
A
 
T
V
 
V
V
 
I
R
 
K
A
 
K
F
 
L
G
 
S
R
 
K
R
 
V
I
 
A
A
 
N
A
 
D
D
 
T
G
 
G
-
 
R
-
 
H
-
 
V
V
 
I
L
 
V
V
 
T
A
 
T
D
 
G
S
x
V
G
 
G
Q
 
Q
N
 
H
T
x
Q
E
x
M
L
 
W
A
 
A
A
 
A
R
 
Q
H
 
H
I
 
W
D
 
T
L
 
W
R
 
R
T
 
N
T
 
P
N
 
H
Q
 
T
F
 
F
A
 
I
V
 
T
S
 
S
G
|
G
A
x
G
L
|
L
A
x
G
S
 
T
M
|
M
A
 
G
S
 
Y
G
 
G
L
 
L
P
 
P
Y
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
G
A
 
A
G
 
Q
A
 
V
A
 
A
D
 
K
P
 
P
K
 
E
R
 
S
P
 
L
I
 
V
Y
 
I
A
 
D
V
 
I
I
 
D
G
 
G
D
|
D
G
 
A
G
 
S
F
 
F
G
 
N
M
 
M
Q
 
T
L
 
L
G
 
T
E
 
E
F
 
L
S
 
S
T
 
S
A
 
A
V
 
V
R
 
Q
M
 
A
A
 
G
L
 
T
P
 
P
L
 
V
K
 
K
L
 
I
L
 
L
V
 
I
I
 
L
C
 
N
N
|
N
-
 
E
-
x
E
-
x
Q
G
 
G
M
|
M
L
x
V
N
 
T
Q
 
Q
I
 
-
A
 
-
W
|
W
E
 
Q
Q
 
S
M
 
L
M
 
F
F
 
Y
L
 
E
G
 
H
N
 
R
P
 
Y
Q
 
S
F
 
H
A
 
T
C
 
H
E
 
Q
L
 
L
A
 
N
P
 
P
I
 
-
D
 
D
F
 
F
A
 
I
K
 
K
A
x
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
M
 
M
G
|
G
G
x
L
R
 
K
G
 
G
F
 
L
T
 
R
I
 
V
R
 
K
R
 
K
F
 
Q
D
 
E
Q
 
E
I
 
L
E
 
D
P
 
A
T
 
K
L
 
L
T
 
K
E
 
E
A
 
F
F
 
V
S
 
S
V
 
T
A
 
K
G
 
G
P
 
P
V
 
V
V
 
L
I
 
L
Q
 
E
A
 
V
M
 
E
V
 
V
D
 
D
Q
x
K
Y
 
K
E
 
V
P
 
P
M
 
V
M
 
L
P
 
P

1t9cA Crystal structure of yeast acetohydroxyacid synthase in complex with a sulfonylurea herbicide, sulfometuron methyl (see paper)
28% identity, 88% coverage: 16:543/600 of query aligns to 22:562/596 of 1t9cA

query
sites
1t9cA
D
 
N
V
 
V
K
 
D
V
 
T
I
 
V
F
 
F
G
 
G
L
x
Y
P
 
P
G
|
G
D
x
G
G
x
A
I
|
I
N
 
L
G
 
P
V
 
V
M
 
Y
E
 
D
A
 
A
L
 
I
R
 
H
K
 
-
R
 
N
Q
 
S
D
 
D
Q
 
K
I
 
F
R
 
N
F
 
F
I
 
V
Q
 
L
V
 
P
R
 
K
H
 
H
E
|
E
E
 
Q
S
 
G
A
 
A
A
 
G
F
 
H
M
 
M
A
 
A
S
 
E
A
 
G
Y
 
Y
A
 
A
K
 
R
F
 
A
T
 
S
G
 
G
N
 
K
L
 
P
G
 
G
V
 
V
C
 
V
L
 
L
A
 
V
T
|
T
S
 
S
G
 
G
P
 
P
G
 
G
G
 
A
T
 
T
N
 
N
L
 
V
L
 
V
T
 
T
G
 
P
L
 
M
Y
 
A
D
 
D
A
 
A
K
 
F
L
 
A
D
 
D
Q
 
G
M
 
I
P
 
P
V
 
M
L
 
V
A
 
V
I
 
F
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
Q
x
V
Y
x
P
H
 
T
D
 
S
L
 
A
I
 
I
E
 
G
T
 
T
F
 
D
T
 
A
Q
x
F
Q
|
Q
D
x
E
V
 
A
D
 
D
L
 
V
T
 
V
R
 
G
V
 
I
F
 
S
D
 
R
N
 
S
V
 
C
A
 
T
L
 
K
Y
 
W
N
 
N
A
 
V
H
 
M
V
 
V
S
 
K
D
 
S
A
 
V
S
 
E
H
 
E
M
 
L
E
 
P
N
 
L
V
 
R
A
 
I
S
 
N
L
 
E
A
 
A
C
 
F
R
 
E
S
 
I
A
 
A
L
 
T
S
 
S
R
 
G
R
|
R
-
 
P
G
 
G
V
 
P
A
 
V
H
 
L
L
 
V
S
 
D
I
 
L
A
 
P
N
x
K
D
 
D
V
 
V
Q
 
T
E
 
A
M
 
-
D
 
-
G
 
A
K
 
I
S
 
L
R
 
R
S
 
N
K
 
P
R
 
I
N
 
P
R
 
T
P
 
K
K
 
T
H
 
T
V
 
L
P
 
P
N
 
S
R
 
S
Y
 
R
F
 
A
H
 
Q
G
 
D
R
 
E
Q
 
F
V
 
V
P
 
M
E
 
Q
E
 
S
I
 
I
E
 
-
L
 
-
D
 
N
R
 
K
A
 
A
A
 
A
R
 
D
I
 
L
L
 
I
N
 
N
D
 
L
A
 
A
R
 
K
K
 
K
V
 
P
A
 
V
I
 
L
L
 
Y
A
 
V
G
|
G
R
x
A
G
|
G
V
 
I
V
 
L
G
x
N
A
 
H
A
 
A
E
 
D
E
 
G
-
 
P
-
x
R
-
 
L
L
 
L
R
 
K
E
 
E
I
 
L
A
 
S
D
 
D
L
 
R
L
 
A
A
 
Q
A
 
I
P
 
P
V
 
V
A
 
T
K
 
T
A
x
T
L
|
L
L
x
Q
G
 
G
K
 
L
T
 
G
A
 
S
L
 
F
A
 
D
D
 
Q
D
 
E
D
 
D
P
 
P
L
 
K
T
 
S
T
 
L
G
 
D
G
 
M
I
x
L
G
 
G
I
x
M
L
x
H
G
 
G
T
 
C
A
 
A
P
 
T
S
 
A
Q
 
N
E
 
L
I
 
A
M
 
V
E
 
Q
Q
 
N
C
 
A
D
 
D
A
 
L
V
 
I
L
 
I
I
 
A
V
 
V
G
|
G
S
x
A
S
x
R
F
 
F
P
x
D
-
x
D
-
x
R
-
x
V
-
 
T
-
 
G
-
 
N
-
 
I
-
 
S
-
 
K
-
 
F
Y
 
A
I
 
P
E
 
E
Y
 
A
Y
 
R
P
 
R
R
 
A
P
 
A
E
 
A
A
 
E
A
 
G
R
 
R
G
 
G
-
 
G
-
 
I
V
 
I
Q
 
H
I
 
F
D
x
E
S
x
V
D
 
S
P
 
P
Q
 
K
R
x
N
I
 
I
G
 
N
L
 
K
R
 
V
F
 
V
P
 
Q
V
 
T
D
 
Q
A
 
I
G
 
A
L
 
V
V
 
E
G
|
G
D
|
D
A
|
A
R
 
T
E
 
T
T
 
N
L
 
L
R
 
G
L
 
K
L
 
M
R
 
M
P
 
S
R
 
K
L
 
I
T
 
F
R
 
P
K
 
V
T
 
K
D
 
E
R
 
R
S
 
S
F
 
-
L
 
-
E
 
-
K
 
E
A
 
W
Q
 
F
T
 
A
A
 
Q
M
 
I
S
 
N
E
 
K
W
 
W
R
 
K
R
 
K
K
 
E
-
 
Y
-
 
P
M
 
Y
E
 
A
T
 
Y
M
 
M
E
 
E
T
 
E
E
 
T
R
 
P
S
 
G
A
 
S
P
 
K
L
 
I
K
 
K
P
 
P
Q
 
Q
A
 
T
V
 
V
V
 
I
R
 
K
A
 
K
F
 
L
G
 
S
R
 
K
R
 
V
I
 
A
A
 
N
A
 
D
D
 
T
G
 
G
-
 
R
-
 
H
-
 
V
V
 
I
L
 
V
V
 
T
A
 
T
D
 
G
S
x
V
G
 
G
Q
 
Q
N
 
H
T
 
Q
E
x
M
L
 
W
A
 
A
A
 
A
R
 
Q
H
 
H
I
 
W
D
 
T
L
 
W
R
 
R
T
 
N
T
 
P
N
 
H
Q
 
T
F
 
F
A
 
I
V
 
T
S
 
S
G
|
G
A
x
G
L
|
L
A
x
G
S
 
T
M
|
M
A
 
G
S
 
Y
G
 
G
L
 
L
P
 
P
Y
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
G
A
 
A
G
 
Q
A
 
V
A
 
A
D
 
K
P
 
P
K
 
E
R
 
S
P
 
L
I
 
V
Y
 
I
A
 
D
V
 
I
I
 
D
G
 
G
D
|
D
G
 
A
G
 
S
F
 
F
G
 
N
M
 
M
Q
 
T
L
 
L
G
 
T
E
 
E
F
 
L
S
 
S
T
 
S
A
 
A
V
 
V
R
 
Q
M
 
A
A
 
G
L
 
T
P
 
P
L
 
V
K
 
K
L
 
I
L
 
L
V
 
I
I
 
L
C
 
N
N
|
N
-
 
E
-
x
E
-
x
Q
G
 
G
M
|
M
L
x
V
N
 
T
Q
 
Q
I
 
-
A
 
-
W
|
W
E
 
Q
Q
 
S
M
 
L
M
 
F
F
 
Y
L
 
E
G
 
H
N
 
R
P
 
Y
Q
 
S
F
 
H
A
 
T
C
 
H
E
 
Q
L
 
L
A
 
N
P
 
P
I
 
-
D
 
D
F
 
F
A
 
I
K
 
K
A
x
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
M
 
M
G
|
G
G
x
L
R
 
K
G
 
G
F
 
L
T
 
R
I
 
V
R
 
K
R
 
K
F
 
Q
D
 
E
Q
 
E
I
 
L
E
 
D
P
 
A
T
 
K
L
 
L
T
 
K
E
 
E
A
 
F
F
 
V
S
 
S
V
 
T
A
 
K
G
 
G
P
 
P
V
 
V
V
 
L
I
 
L
Q
 
E
A
 
V
M
 
E
V
 
V
D
 
D
Q
x
K
Y
 
K
E
 
V
P
 
P
M
 
V
M
 
L
P
 
P

1t9dA Crystal structure of yeast acetohydroxyacid synthase in complex with a sulfonylurea herbicide, metsulfuron methyl (see paper)
28% identity, 88% coverage: 16:543/600 of query aligns to 22:562/596 of 1t9dA

query
sites
1t9dA
D
 
N
V
 
V
K
 
D
V
 
T
I
 
V
F
 
F
G
 
G
L
x
Y
P
 
P
G
|
G
D
x
G
G
x
A
I
|
I
N
 
L
G
 
P
V
 
V
M
 
Y
E
 
D
A
 
A
L
 
I
R
 
H
K
 
-
R
 
N
Q
 
S
D
 
D
Q
 
K
I
 
F
R
 
N
F
 
F
I
 
V
Q
 
L
V
 
P
R
 
K
H
 
H
E
|
E
E
 
Q
S
 
G
A
 
A
A
 
G
F
 
H
M
 
M
A
 
A
S
 
E
A
 
G
Y
 
Y
A
 
A
K
 
R
F
 
A
T
 
S
G
 
G
N
 
K
L
 
P
G
 
G
V
 
V
C
 
V
L
 
L
A
 
V
T
|
T
S
 
S
G
 
G
P
|
P
G
 
G
G
 
A
T
 
T
N
 
N
L
 
V
L
 
V
T
 
T
G
 
P
L
 
M
Y
 
A
D
 
D
A
 
A
K
 
F
L
 
A
D
 
D
Q
 
G
M
 
I
P
 
P
V
 
M
L
 
V
A
 
V
I
 
F
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
Q
x
V
Y
x
P
H
 
T
D
 
S
L
 
A
I
 
I
E
 
G
T
 
T
F
 
D
T
 
A
Q
x
F
Q
|
Q
D
x
E
V
 
A
D
 
D
L
 
V
T
 
V
R
 
G
V
 
I
F
 
S
D
 
R
N
 
S
V
 
C
A
 
T
L
 
K
Y
 
W
N
 
N
A
 
V
H
 
M
V
 
V
S
 
K
D
 
S
A
 
V
S
 
E
H
 
E
M
 
L
E
 
P
N
 
L
V
 
R
A
 
I
S
 
N
L
 
E
A
 
A
C
 
F
R
 
E
S
 
I
A
 
A
L
 
T
S
 
S
R
 
G
R
|
R
-
 
P
G
 
G
V
 
P
A
 
V
H
 
L
L
 
V
S
 
D
I
 
L
A
 
P
N
x
K
D
 
D
V
 
V
Q
 
T
E
 
A
M
 
-
D
 
-
G
 
A
K
 
I
S
 
L
R
 
R
S
 
N
K
 
P
R
 
I
N
 
P
R
 
T
P
 
K
K
 
T
H
 
T
V
 
L
P
 
P
N
 
T
R
 
S
Y
 
R
F
 
A
H
 
Q
G
 
D
R
 
E
Q
 
F
V
 
V
P
 
M
E
 
Q
E
 
S
I
 
I
E
 
-
L
 
-
D
 
N
R
 
K
A
 
A
A
 
A
R
 
D
I
 
L
L
 
I
N
 
N
D
 
L
A
 
A
R
 
K
K
 
K
V
 
P
A
 
V
I
 
L
L
 
Y
A
 
V
G
|
G
R
x
A
G
|
G
V
 
I
V
 
L
G
x
N
A
 
H
A
 
A
E
 
D
E
 
G
-
 
P
-
x
R
-
 
L
L
 
L
R
 
K
E
 
E
I
 
L
A
 
S
D
 
D
L
 
R
L
 
A
A
 
Q
A
 
I
P
 
P
V
 
V
A
 
T
K
 
T
A
x
T
L
|
L
L
x
Q
G
 
G
K
 
L
T
 
G
A
 
S
L
 
F
A
 
D
D
 
Q
D
 
E
D
 
D
P
 
P
L
 
K
T
 
S
T
 
L
G
 
D
G
x
M
I
x
L
G
 
G
I
x
M
L
x
H
G
 
G
T
 
C
A
 
A
P
 
T
S
 
A
Q
 
N
E
 
L
I
 
A
M
 
V
E
 
Q
Q
 
N
C
 
A
D
 
D
A
 
L
V
 
I
L
 
I
I
 
A
V
 
V
G
|
G
S
x
A
S
x
R
F
 
F
P
x
D
-
x
D
-
x
R
-
x
V
-
 
T
-
 
G
-
 
N
-
 
I
-
 
S
-
 
K
-
 
F
Y
 
A
I
 
P
E
 
E
Y
 
A
Y
 
R
P
 
R
R
 
A
P
 
A
E
 
A
A
 
E
A
 
G
R
 
R
G
 
G
-
 
G
-
 
I
V
 
I
Q
 
H
I
 
F
D
x
E
S
x
V
D
 
S
P
 
P
Q
 
K
R
x
N
I
 
I
G
 
N
L
 
K
R
 
V
F
 
V
P
 
Q
V
 
T
D
 
Q
A
 
I
G
 
A
L
 
V
V
 
E
G
|
G
D
|
D
A
|
A
R
 
T
E
 
T
T
 
N
L
 
L
R
 
G
L
 
K
L
 
M
R
 
M
P
 
S
R
 
K
L
 
I
T
 
F
R
 
P
K
 
V
T
 
K
D
 
E
R
 
R
S
 
S
F
 
-
L
 
-
E
 
-
K
 
E
A
 
W
Q
 
F
T
 
A
A
 
Q
M
 
I
S
 
N
E
 
K
W
 
W
R
 
K
R
 
K
K
 
E
-
 
Y
-
 
P
M
 
Y
E
 
A
T
 
Y
M
 
M
E
 
E
T
 
E
E
 
T
R
 
P
S
 
G
A
 
S
P
 
K
L
 
I
K
 
K
P
 
P
Q
 
Q
A
 
T
V
 
V
V
 
I
R
 
K
A
 
K
F
 
L
G
 
S
R
 
K
R
 
V
I
 
A
A
 
N
A
 
D
D
 
T
G
 
G
-
 
R
-
 
H
-
 
V
V
 
I
L
 
V
V
 
T
A
 
T
D
 
G
S
x
V
G
 
G
Q
 
Q
N
 
H
T
x
Q
E
x
M
L
 
W
A
 
A
A
 
A
R
 
Q
H
 
H
I
 
W
D
 
T
L
 
W
R
 
R
T
 
N
T
 
P
N
 
H
Q
 
T
F
 
F
A
 
I
V
 
T
S
 
S
G
|
G
A
x
G
L
|
L
A
x
G
S
 
T
M
|
M
A
 
G
S
 
Y
G
 
G
L
 
L
P
 
P
Y
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
G
A
 
A
G
 
Q
A
 
V
A
 
A
D
 
K
P
 
P
K
 
E
R
 
S
P
 
L
I
 
V
Y
 
I
A
 
D
V
 
I
I
 
D
G
 
G
D
|
D
G
 
A
G
 
S
F
 
F
G
 
N
M
|
M
Q
 
T
L
 
L
G
 
T
E
 
E
F
 
L
S
 
S
T
 
S
A
 
A
V
 
V
R
 
Q
M
 
A
A
 
G
L
 
T
P
 
P
L
 
V
K
 
K
L
 
I
L
 
L
V
 
I
I
 
L
C
 
N
N
|
N
-
 
E
-
x
E
-
x
Q
G
 
G
M
|
M
L
x
V
N
 
T
Q
 
Q
I
 
-
A
 
-
W
|
W
E
 
Q
Q
 
S
M
 
L
M
 
F
F
 
Y
L
 
E
G
 
H
N
 
R
P
 
Y
Q
 
S
F
 
H
A
 
T
C
 
H
E
 
Q
L
 
L
A
 
N
P
 
P
I
 
-
D
 
D
F
 
F
A
 
I
K
 
K
A
x
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
M
 
M
G
|
G
G
x
L
R
 
K
G
 
G
F
 
L
T
 
R
I
 
V
R
 
K
R
 
K
F
 
Q
D
 
E
Q
 
E
I
 
L
E
 
D
P
 
A
T
 
K
L
 
L
T
 
K
E
 
E
A
 
F
F
 
V
S
 
S
V
 
T
A
 
K
G
 
G
P
 
P
V
 
V
V
 
L
I
 
L
Q
 
E
A
 
V
M
 
E
V
 
V
D
 
D
Q
x
K
Y
 
K
E
 
V
P
 
P
M
 
V
M
 
L
P
 
P

Query Sequence

>WP_003554655.1 NCBI__GCF_000023185.1:WP_003554655.1
MPNAADILIDTLIEWDVKVIFGLPGDGINGVMEALRKRQDQIRFIQVRHEESAAFMASAY
AKFTGNLGVCLATSGPGGTNLLTGLYDAKLDQMPVLAITGTQYHDLIETFTQQDVDLTRV
FDNVALYNAHVSDASHMENVASLACRSALSRRGVAHLSIANDVQEMDGKSRSKRNRPKHV
PNRYFHGRQVPEEIELDRAARILNDARKVAILAGRGVVGAAEELREIADLLAAPVAKALL
GKTALADDDPLTTGGIGILGTAPSQEIMEQCDAVLIVGSSFPYIEYYPRPEAARGVQIDS
DPQRIGLRFPVDAGLVGDARETLRLLRPRLTRKTDRSFLEKAQTAMSEWRRKMETMETER
SAPLKPQAVVRAFGRRIAADGVLVADSGQNTELAARHIDLRTTNQFAVSGALASMASGLP
YAIAAGAADPKRPIYAVIGDGGFGMQLGEFSTAVRMALPLKLLVICNGMLNQIAWEQMMF
LGNPQFACELAPIDFAKAAEAMGGRGFTIRRFDQIEPTLTEAFSVAGPVVIQAMVDQYEP
MMPPKMPKDYAKSFRQALPETPGHRAIEANVSRSPLREMMDAGEQEKELSENTTDLPGIP

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory