SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_003560902.1 NCBI__GCF_000023185.1:WP_003560902.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 10 hits to proteins with known functional sites (download)

2pc6A Crystal structure of putative acetolactate synthase- small subunit from nitrosomonas europaea (see paper)
42% identity, 86% coverage: 24:186/190 of query aligns to 4:158/164 of 2pc6A

query
sites
2pc6A
H
 
H
T
 
I
L
 
I
S
 
S
V
 
L
L
 
L
V
 
M
D
 
E
N
 
N
E
 
E
P
 
A
G
 
G
V
 
A
L
 
L
A
 
S
R
 
R
V
 
V
I
 
A
G
 
G
L
 
L
F
 
F
S
 
S
G
 
A
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
N
 
N
I
 
I
E
 
E
S
 
S
L
 
L
T
 
S
V
 
V
S
 
A
E
 
P
T
 
T
E
 
E
H
 
D
Q
 
P
A
 
T
H
 
-
L
 
L
S
 
S
R
 
R
I
 
M
T
 
T
V
 
L
V
 
V
T
 
T
R
 
N
G
 
G
T
 
P
P
 
D
Q
 
E
V
 
I
L
 
V
E
 
E
Q
 
Q
I
 
I
K
 
T
A
 
K
Q
 
Q
L
 
L
E
x
N
R
 
K
I
x
L
V
 
I
P
 
E
V
|
V
H
 
V
R
 
K
V
 
L
V
 
I
D
 
D
L
 
L
T
 
S
V
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
-
E
 
-
L
 
-
G
 
-
Q
 
S
D
 
E
R
 
G
P
 
Y
I
 
V
E
 
E
R
 
R
E
 
E
V
 
L
A
 
M
L
 
L
V
 
V
K
 
K
V
 
V
I
 
R
G
 
A
E
 
V
G
 
G
E
 
K
M
 
D
R
 
R
A
 
E
E
 
E
T
 
M
L
 
K
R
 
R
L
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
I
F
 
F
H
 
R
A
 
G
K
 
N
V
 
I
V
 
I
D
 
D
A
 
V
T
 
T
V
 
N
G
 
E
H
 
L
F
 
Y
I
 
T
L
 
I
E
 
E
I
 
L
T
 
T
G
 
G
K
 
T
S
 
R
S
 
S
K
 
K
I
 
L
D
 
D
Q
 
G
F
 
F
V
 
L
A
 
Q
I
 
A
M
 
V
K
 
D
P
 
C
L
 
N
G
 
L
L
 
I
I
 
L
E
 
E
V
 
I
C
 
A
R
 
R
T
 
T
G
 
G
I
 
V
A
 
S
A
 
G
M
 
L
N
 
S
R
 
R
G
 
G

A0QUX7 Acetolactate synthase small subunit; Acetohydroxy-acid synthase small subunit; AHAS; ALS; EC 2.2.1.6 from Mycolicibacterium smegmatis (strain ATCC 700084 / mc(2)155) (Mycobacterium smegmatis) (see paper)
39% identity, 88% coverage: 23:190/190 of query aligns to 7:166/170 of A0QUX7

query
sites
A0QUX7
S
 
T
H
 
H
T
 
T
L
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
L
V
 
V
D
 
E
N
 
D
E
 
K
P
 
P
G
 
G
V
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
R
V
 
V
I
 
S
G
 
S
L
 
L
F
 
F
S
 
S
G
 
R
R
 
R
G
 
G
Y
 
F
N
 
N
I
 
I
E
 
Q
S
 
S
L
 
L
T
 
A
V
 
V
S
 
G
E
 
A
T
 
T
E
 
E
H
 
-
Q
 
Q
A
x
K
H
 
D
L
 
M
S
 
S
R
 
R
I
 
M
T
 
T
V
 
I
V
 
V
T
 
V
R
 
S
G
 
V
T
 
E
P
 
D
Q
 
S
V
 
P
L
 
L
E
 
E
Q
 
Q
I
 
I
K
 
T
A
 
K
Q
 
Q
L
 
L
E
 
N
R
 
K
I
 
L
V
 
I
P
 
N
V
 
V
H
 
I
R
 
K
V
 
I
V
 
V
D
 
-
L
 
-
T
 
-
V
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
-
E
 
E
L
 
Q
G
 
E
Q
 
E
D
 
D
R
 
N
P
 
S
I
 
V
E
 
S
R
 
R
E
 
E
V
 
L
A
 
A
L
 
L
V
 
I
K
 
K
V
 
V
I
 
R
G
 
A
E
 
D
G
 
A
E
 
T
M
 
T
R
 
R
A
 
G
E
 
Q
T
 
I
L
 
I
R
 
E
L
 
A
A
 
V
D
 
N
A
 
L
F
 
F
H
 
R
A
 
A
K
 
K
V
 
V
V
 
V
D
 
D
A
 
V
T
 
S
V
 
T
G
 
E
H
 
S
F
 
L
I
 
T
L
 
I
E
 
E
I
 
A
T
 
T
G
 
G
K
 
T
S
 
P
S
 
E
K
 
K
I
 
L
D
 
E
Q
 
A
F
 
L
V
 
L
A
 
R
I
 
V
M
 
L
K
 
E
P
 
P
L
 
Y
G
 
G
L
 
I
I
 
R
E
 
E
V
 
I
C
 
A
R
 
Q
T
 
S
G
 
G
I
 
V
A
 
V
A
 
S
M
 
V
N
 
S
R
 
R
G
 
G
V
 
P
Q
 
R
G
 
G
M
 
I

P9WKJ3 Putative acetolactate synthase small subunit; Acetohydroxy-acid synthase small subunit; AHAS; ALS; EC 2.2.1.6 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
37% identity, 93% coverage: 14:190/190 of query aligns to 1:164/168 of P9WKJ3

query
sites
P9WKJ3
I
 
M
S
 
S
P
 
P
E
 
K
T
 
T
A
 
-
A
 
-
V
 
-
E
 
-
S
 
-
H
 
H
T
 
T
L
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
L
V
 
V
D
 
E
N
 
D
E
 
K
P
 
P
G
 
G
V
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
R
V
 
V
I
 
A
G
 
A
L
 
L
F
 
F
S
 
S
G
 
R
R
 
R
G
 
G
Y
 
F
N
 
N
I
 
I
E
 
E
S
 
S
L
 
L
T
 
A
V
 
V
S
 
G
E
 
A
T
 
T
E
 
E
H
 
C
Q
x
K
A
 
D
H
 
R
L
 
-
S
 
S
R
 
R
I
 
M
T
 
T
V
 
I
V
 
V
T
 
V
R
 
S
G
 
A
T
 
E
P
 
D
Q
 
T
V
 
P
L
 
L
E
 
E
Q
 
Q
I
 
I
K
 
T
A
 
K
Q
 
Q
L
 
L
E
 
N
R
 
K
I
 
L
V
 
I
P
 
N
V
 
V
H
 
I
R
 
K
V
 
I
V
 
V
D
 
-
L
 
-
T
 
-
V
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
-
E
 
E
L
 
Q
G
 
D
Q
 
D
D
 
E
R
 
H
P
 
S
I
 
V
E
 
S
R
 
R
E
 
E
V
 
L
A
 
A
L
 
L
V
 
I
K
 
K
V
 
V
I
 
Q
G
 
A
E
 
D
G
 
A
E
 
G
M
 
S
R
 
R
A
 
S
E
 
Q
T
 
V
L
 
I
R
 
E
L
 
A
A
 
V
D
 
N
A
 
L
F
 
F
H
 
R
A
 
A
K
 
N
V
 
V
V
 
I
D
 
D
A
 
V
T
 
S
V
 
P
G
 
E
H
 
S
F
 
L
I
 
T
L
 
V
E
 
E
I
 
A
T
 
T
G
 
G
K
 
N
S
 
R
S
 
G
K
 
K
I
 
L
D
 
E
Q
 
A
F
 
L
V
 
L
A
 
R
I
 
V
M
 
L
K
 
E
P
 
P
L
 
F
G
 
G
L
 
I
I
 
R
E
 
E
V
 
I
C
 
A
R
 
Q
T
 
S
G
 
G
I
 
M
A
 
V
A
 
S
M
 
L
N
 
S
R
 
R
G
 
G
V
 
P
Q
 
R
G
 
G
M
 
I

O60086 Probable acetolactate synthase small subunit; Acetohydroxy-acid synthase small subunit; AHAS; ALS from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
37% identity, 86% coverage: 24:186/190 of query aligns to 71:265/289 of O60086

query
sites
O60086
H
 
H
T
 
V
L
 
F
S
 
N
V
 
C
L
 
L
V
 
V
D
 
Q
N
 
N
E
 
E
P
 
P
G
 
G
V
 
V
L
 
L
A
 
S
R
 
R
V
 
L
I
 
S
G
 
G
L
 
I
F
 
L
S
 
A
G
 
A
R
 
R
G
 
G
Y
 
F
N
 
N
I
 
I
E
 
D
S
 
S
L
 
L
T
 
V
V
 
V
S
 
C
E
 
A
T
 
T
E
 
E
H
 
V
Q
 
E
A
 
-
H
 
N
L
 
L
S
 
S
R
 
R
I
 
M
T
 
T
V
 
I
V
 
V
T
 
L
R
 
R
G
 
G
T
 
A
P
 
D
Q
 
E
V
 
V
L
 
V
E
 
E
Q
 
Q
I
 
A
K
 
K
A
 
R
Q
 
Q
L
 
I
E
 
E
R
 
D
I
 
I
V
 
V
P
 
S
V
 
V
H
 
W
R
 
A
V
 
V
V
 
L
D
 
D
L
 
Y
T
 
T
-
 
G
-
 
T
-
 
S
-
 
M
-
 
V
-
 
E
-
 
R
-
 
E
-
 
L
-
 
L
-
 
L
V
 
A
R
 
K
A
 
V
R
 
S
E
 
L
L
 
L
G
 
G
Q
 
P
D
 
D
-
 
H
-
 
F
-
 
Q
-
 
E
-
 
H
-
 
F
-
 
E
-
 
R
-
 
S
-
 
E
R
 
K
P
 
V
I
 
A
E
 
E
R
 
S
E
 
T
V
 
N
A
 
A
L
 
K
V
 
A
K
 
K
V
 
S
I
 
D
G
 
G
E
 
E
G
 
G
-
 
V
-
 
M
-
 
N
-
 
A
-
 
N
-
 
A
-
 
A
-
 
L
E
 
Q
M
 
L
R
 
R
A
 
A
E
 
S
T
 
Q
L
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
I
-
 
N
R
 
Q
L
 
L
A
 
T
D
 
T
A
 
L
F
 
F
H
 
H
A
 
G
K
 
R
V
 
V
V
 
A
D
 
D
A
 
I
T
 
S
V
 
T
G
 
E
H
 
T
F
 
I
I
 
I
L
 
L
E
 
E
I
 
L
T
 
T
G
 
A
K
 
T
S
 
P
S
 
D
K
 
R
I
 
V
D
 
D
Q
 
N
F
 
F
V
 
L
A
 
S
I
 
L
M
 
L
K
 
R
P
 
P
L
 
Y
G
 
G
L
 
V
I
 
L
E
 
E
V
 
A
C
 
C
R
 
R
T
 
T
G
 
G
I
 
T
A
 
S
A
 
A
M
 
M
N
 
T
R
 
R
G
 
A

Sites not aligning to the query:

Q9FFF4 Acetolactate synthase small subunit 2, chloroplastic; ALS-interacting protein 3; Acetohydroxy-acid synthase small subunit 2; Protein valine-tolerant 1 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
37% identity, 89% coverage: 21:189/190 of query aligns to 74:232/477 of Q9FFF4

query
sites
Q9FFF4
V
 
V
E
 
R
S
 
R
H
 
H
T
 
T
L
 
I
S
 
S
V
 
V
L
 
F
V
 
V
D
 
G
N
 
D
E
 
E
P
 
S
G
|
G
V
 
I
L
 
I
A
 
N
R
 
R
V
 
I
I
 
A
G
 
G
L
 
V
F
 
F
S
 
A
G
 
R
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
N
 
N
I
 
I
E
 
E
S
 
S
L
 
L
T
 
A
V
 
V
S
 
G
E
 
L
T
 
N
E
 
E
H
 
D
Q
 
K
A
 
A
H
 
L
L
 
F
S
 
-
R
 
-
I
 
-
T
|
T
V
 
I
V
 
V
T
 
V
R
 
L
G
 
G
T
 
T
P
 
D
Q
 
K
V
 
V
L
 
L
E
 
Q
Q
 
Q
I
 
V
K
 
V
A
 
E
Q
 
Q
L
 
L
E
 
N
R
 
K
I
 
L
V
 
V
P
 
N
V
 
V
H
 
I
R
 
K
V
 
V
V
 
E
D
 
D
L
 
L
T
 
S
V
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
-
E
 
-
L
 
-
G
 
-
Q
 
K
D
 
E
R
 
P
P
 
H
I
 
V
E
 
E
R
 
R
E
 
E
V
 
L
A
 
M
L
 
L
V
 
I
K
 
K
V
 
L
I
 
N
G
 
A
E
 
D
G
 
P
E
 
S
M
 
T
R
 
R
A
 
S
E
 
E
T
 
I
L
 
M
R
 
W
L
 
L
A
 
V
D
 
D
A
 
I
F
 
F
H
 
R
A
 
A
K
 
K
V
 
I
V
 
V
D
 
D
A
 
T
T
 
S
V
 
E
G
 
Q
H
 
S
F
 
L
I
 
T
L
 
I
E
 
E
I
 
V
T
 
T
G
 
G
K
 
D
S
 
P
S
 
G
K
 
K
I
 
M
D
 
V
Q
 
A
F
 
L
V
 
T
A
 
T
I
 
N
M
 
L
K
 
E
P
 
K
L
 
F
G
 
G
L
 
I
I
 
K
E
 
E
V
 
I
C
 
A
R
 
R
T
 
T
G
 
G
I
 
K
A
 
I
A
 
A
M
 
L
N
 
R
R
 
R
G
 
E
V
 
K
Q
 
M
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Q93YZ7 Acetolactate synthase small subunit 1, chloroplastic; ALS-interacting protein 1; Acetohydroxyacid synthase small subunit 1 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see 2 papers)
39% identity, 89% coverage: 17:185/190 of query aligns to 313:473/491 of Q93YZ7

query
sites
Q93YZ7
E
 
D
T
 
T
A
 
S
A
 
G
V
 
L
E
 
R
S
 
S
H
 
H
T
 
T
L
 
L
S
 
S
V
 
L
L
 
L
V
 
V
D
 
N
N
x
D
E
 
I
P
 
P
G
|
G
V
|
V
L
|
L
A
 
N
R
 
I
V
 
V
I
 
T
G
 
G
L
 
V
F
|
F
S
 
A
G
 
R
R
 
R
G
 
G
Y
|
Y
N
|
N
I
|
I
E
 
Q
S
 
S
L
 
L
T
 
A
V
 
V
S
 
G
E
 
H
T
 
A
E
 
E
H
 
T
Q
 
K
A
 
G
H
 
-
L
 
I
S
 
S
R
 
R
I
 
I
T
 
T
V
 
T
V
 
V
T
 
I
R
 
P
G
 
A
T
 
T
P
 
D
Q
 
E
V
 
S
L
 
V
E
 
S
Q
 
K
I
 
L
K
 
V
A
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
E
 
Y
R
 
K
I
 
L
V
 
V
P
 
D
V
 
V
H
 
H
R
 
E
V
 
V
V
 
H
D
 
D
L
 
L
T
 
T
V
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
-
E
 
-
L
 
-
G
 
-
Q
 
-
D
 
H
R
 
L
P
 
P
I
 
F
-
 
S
E
 
E
R
 
R
E
 
E
V
 
L
A
 
M
L
 
L
V
 
I
K
 
K
V
 
I
I
 
A
G
 
V
E
 
N
G
 
A
E
 
A
M
 
A
R
 
R
A
 
R
E
 
D
T
 
V
L
 
L
R
 
D
L
 
I
A
 
A
D
 
S
A
 
I
F
 
F
H
 
R
A
 
A
K
 
K
V
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
V
T
 
S
V
 
D
G
 
H
H
 
T
F
 
I
I
 
T
L
 
L
E
 
Q
I
 
L
T
 
T
G
 
G
K
 
D
S
 
L
S
 
D
K
 
K
I
 
M
D
 
V
Q
 
A
F
 
L
V
 
Q
A
 
R
I
 
L
M
 
L
K
 
E
P
 
P
L
 
Y
G
 
G
L
 
I
I
 
C
E
 
E
V
 
V
C
 
A
R
 
R
T
 
T
G
 
G
I
 
R
A
 
V
A
 
A
M
 
L
N
 
A
R
 
R

Sites not aligning to the query:

6vz8G Arabidopsis thaliana acetohydroxyacid synthase complex with valine bound (see paper)
39% identity, 87% coverage: 21:185/190 of query aligns to 1:157/159 of 6vz8G

query
sites
6vz8G
V
 
L
E
 
R
S
 
S
H
 
H
T
 
T
L
 
L
S
 
S
V
 
L
L
 
L
V
 
V
D
 
N
N
x
D
E
 
I
P
 
P
G
|
G
V
|
V
L
|
L
A
 
N
R
 
I
V
 
V
I
 
T
G
 
G
L
 
V
F
 
F
S
 
A
G
 
R
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
N
|
N
I
|
I
E
 
Q
S
 
S
L
 
L
T
 
A
V
|
V
S
 
G
E
 
H
T
 
A
E
 
E
H
 
T
Q
 
K
A
 
G
H
 
-
L
 
I
S
 
S
R
 
R
I
 
I
T
 
T
V
 
T
V
 
V
T
 
I
R
 
P
G
 
A
T
 
T
P
 
D
Q
 
E
V
 
S
L
 
V
E
 
S
Q
 
K
I
 
L
K
 
V
A
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
E
 
Y
R
 
K
I
 
L
V
 
V
P
 
D
V
 
V
H
 
H
R
 
E
V
 
V
V
 
H
D
 
D
L
 
L
T
 
T
V
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
-
E
 
-
L
 
-
G
 
-
Q
 
-
D
 
H
R
 
L
P
 
P
I
 
F
-
 
S
E
 
E
R
 
R
E
 
E
V
 
L
A
 
M
L
 
L
V
 
I
K
 
K
V
 
I
I
 
A
G
 
V
E
 
N
G
 
A
E
 
A
M
 
A
R
 
R
A
 
R
E
 
D
T
 
V
L
 
L
R
 
D
L
 
I
A
 
A
D
 
S
A
 
I
F
 
F
H
 
R
A
 
A
K
 
K
V
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
V
T
 
S
V
 
D
G
 
H
H
 
T
F
 
I
I
 
T
L
 
L
E
 
Q
I
 
L
T
 
T
G
 
G
K
 
D
S
 
L
S
 
D
K
 
K
I
 
M
D
 
V
Q
 
A
F
 
L
V
 
Q
A
 
R
I
 
L
M
 
L
K
 
E
P
 
P
L
 
Y
G
 
G
L
 
I
I
 
C
E
 
E
V
 
V
C
 
A
R
 
R
T
 
T
G
 
G
I
 
R
A
 
V
A
 
A
M
 
L
N
 
A
R
 
R

6vz8F Arabidopsis thaliana acetohydroxyacid synthase complex with valine bound (see paper)
38% identity, 87% coverage: 21:185/190 of query aligns to 2:156/159 of 6vz8F

query
sites
6vz8F
V
 
V
E
 
R
S
 
K
H
 
H
T
 
T
L
 
I
S
 
S
V
 
V
L
 
F
V
 
V
D
 
G
N
x
D
E
|
E
P
 
S
G
|
G
V
x
M
L
x
I
A
 
N
R
 
R
V
 
I
I
 
A
G
 
G
L
 
V
F
 
F
S
 
A
G
 
R
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
N
|
N
I
|
I
E
 
E
S
 
S
L
 
L
T
 
A
V
 
V
S
 
G
E
 
L
T
 
N
E
 
R
H
 
D
Q
 
K
A
 
A
H
 
L
L
 
F
S
 
-
R
 
-
I
 
-
T
 
T
V
 
I
V
 
V
T
 
V
R
 
C
G
 
G
T
 
T
P
 
E
Q
 
R
V
 
V
L
 
L
E
 
Q
Q
 
Q
I
 
V
K
 
I
A
 
E
Q
 
Q
L
 
L
E
 
Q
R
 
K
I
 
L
V
 
V
P
 
N
V
 
V
H
 
L
R
 
K
V
 
V
V
 
E
D
 
D
L
 
I
T
 
S
V
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
-
E
 
-
L
 
-
G
 
-
Q
 
S
D
 
E
R
 
P
P
 
Q
I
 
V
E
 
E
R
 
R
E
 
E
V
 
L
A
 
M
L
 
L
V
 
V
K
 
K
V
 
V
I
 
N
G
 
A
E
 
H
G
 
P
E
 
E
M
 
S
R
 
R
A
 
A
E
 
E
T
 
I
L
 
M
R
 
W
L
 
L
A
 
V
D
 
D
A
 
T
F
 
F
H
 
R
A
 
A
K
 
R
V
 
V
V
 
V
D
 
D
A
 
I
T
 
A
V
 
E
G
 
H
H
 
A
F
 
L
I
 
T
L
 
I
E
 
E
I
 
V
T
 
T
G
 
G
K
 
D
S
 
P
S
 
G
K
 
K
I
 
M
D
 
I
Q
 
A
F
 
V
V
 
E
A
 
R
I
 
N
M
 
L
K
 
K
P
 
K
L
 
F
G
 
Q
L
 
I
I
 
R
E
 
E
V
 
I
C
 
V
R
 
R
T
 
T
G
 
G
I
 
K
A
 
I
A
 
A
M
 
L
N
 
R
R
 
R

6wo1B Hybrid acetohydroxyacid synthase complex structure with cryptococcus neoformans ahas catalytic subunit and saccharomyces cerevisiae ahas regulatory subunit (see paper)
32% identity, 86% coverage: 22:185/190 of query aligns to 3:195/197 of 6wo1B

query
sites
6wo1B
E
 
K
S
 
Q
H
 
H
T
 
V
L
 
L
S
 
N
V
 
C
L
 
L
V
 
V
D
 
Q
N
 
N
E
|
E
P
 
P
G
|
G
V
 
V
L
|
L
A
 
S
R
 
R
V
 
V
I
 
S
G
 
G
L
 
T
F
 
L
S
 
A
G
 
A
R
 
R
G
 
G
Y
 
F
N
 
N
I
 
I
E
 
D
S
 
S
L
 
L
T
 
V
V
 
V
S
 
C
E
 
N
T
 
T
E
 
E
H
 
V
Q
 
K
A
 
-
H
 
D
L
 
L
S
 
S
R
 
R
I
 
M
T
 
T
V
 
I
V
 
V
T
 
L
R
 
Q
G
 
G
T
 
Q
P
 
D
Q
 
G
V
 
V
L
 
I
E
 
E
Q
 
Q
I
 
A
K
 
R
A
 
R
Q
 
Q
L
 
I
E
 
E
R
 
D
I
 
L
V
 
V
P
 
P
V
 
V
H
 
Y
R
 
A
V
 
V
V
 
L
D
 
D
L
 
Y
T
 
T
V
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
-
E
 
-
L
 
-
G
 
-
Q
 
N
D
 
S
R
 
E
P
 
I
I
 
I
E
 
K
R
 
R
E
 
E
V
 
L
A
 
V
L
 
M
V
 
A
K
 
R
V
 
I
I
 
S
G
 
L
E
 
L
G
 
G
-
 
T
-
 
E
-
 
Y
-
 
F
-
 
E
-
 
D
-
 
L
-
 
L
-
 
L
-
 
H
-
 
H
-
 
H
-
 
T
-
 
V
-
 
A
E
 
E
M
 
I
R
 
R
-
 
E
-
 
K
-
 
Q
-
 
F
-
 
H
-
 
P
-
 
A
-
 
N
-
 
L
-
 
P
-
 
A
A
 
S
E
 
E
T
 
V
L
 
L
R
 
R
-
 
L
-
 
K
-
 
H
-
 
E
-
 
H
-
 
L
-
 
N
-
 
D
-
 
I
-
 
T
-
 
N
L
 
L
A
 
T
D
 
N
A
 
N
F
 
F
H
 
G
A
 
G
K
 
R
V
 
V
V
 
V
D
 
D
A
 
I
T
 
S
V
 
E
G
 
T
H
 
S
F
 
C
I
 
I
L
 
V
E
 
E
I
 
L
T
 
S
G
 
A
K
 
K
S
 
P
S
 
T
K
 
R
I
 
I
D
 
S
Q
 
A
F
 
F
V
 
L
A
 
K
I
 
L
M
 
V
K
 
E
P
 
P
L
 
F
G
 
G
L
 
V
I
 
L
E
 
E
V
 
C
C
 
A
R
 
R
T
 
S
G
 
G
I
 
M
A
 
M
A
 
A
M
 
L
N
 
P
R
 
R

6u9dL Saccharomyces cerevisiae acetohydroxyacid synthase (see paper)
32% identity, 90% coverage: 15:185/190 of query aligns to 29:240/255 of 6u9dL

query
sites
6u9dL
S
 
A
P
 
P
E
 
S
T
 
R
A
 
Q
A
 
P
V
 
R
E
 
K
S
 
Q
H
 
H
T
 
V
L
 
L
S
 
N
V
 
C
L
 
L
V
 
V
D
 
Q
N
 
N
E
 
E
P
 
P
G
 
G
V
 
V
L
 
L
A
 
S
R
 
R
V
 
V
I
 
S
G
 
G
L
 
T
F
 
L
S
 
A
G
 
A
R
 
R
G
 
G
Y
 
F
N
 
N
I
 
I
E
 
D
S
 
S
L
 
L
T
 
V
V
 
V
S
 
C
E
 
N
T
 
T
E
 
E
H
 
V
Q
 
K
A
 
-
H
 
D
L
 
L
S
 
S
R
 
R
I
 
M
T
 
T
V
 
I
V
 
V
T
 
L
R
 
Q
G
 
G
T
 
Q
P
 
D
Q
 
G
V
 
V
L
 
I
E
 
E
Q
 
Q
I
 
A
K
 
R
A
 
R
Q
 
Q
L
 
I
E
 
E
R
 
D
I
 
L
V
 
V
P
 
P
V
 
V
H
 
Y
R
 
A
V
 
V
V
 
L
D
 
D
L
 
Y
T
 
T
-
 
N
-
 
S
-
 
E
-
 
I
-
 
I
-
 
K
-
 
R
-
 
E
-
 
L
V
 
V
R
 
M
A
 
A
R
 
R
-
 
I
-
 
S
-
 
L
-
 
L
-
 
G
-
 
T
E
 
E
L
 
Y
G
 
F
Q
 
E
D
 
D
R
 
L
P
 
L
I
 
L
E
 
H
R
 
H
E
 
H
V
 
T
A
 
S
-
 
T
-
 
N
-
 
A
-
 
G
-
 
A
-
 
A
-
 
D
-
 
S
-
 
Q
-
 
E
L
 
L
V
 
V
K
 
A
V
 
E
I
 
I
G
 
R
E
 
E
G
 
K
E
 
Q
M
 
F
R
 
H
-
 
P
-
 
A
-
 
N
-
 
L
-
 
P
-
 
A
A
 
S
E
 
E
T
 
V
L
 
L
R
 
R
-
 
L
-
 
K
-
 
H
-
 
E
-
 
H
-
 
L
-
 
N
-
 
D
-
 
I
-
 
T
-
 
N
L
 
L
A
 
T
D
 
N
A
x
N
F
|
F
H
 
G
A
 
G
K
 
R
V
 
V
V
|
V
D
|
D
A
x
I
T
 
S
V
 
E
G
 
T
H
 
S
F
 
C
I
 
I
L
 
V
E
 
E
I
 
L
T
 
S
G
 
A
K
|
K
S
 
P
S
 
T
K
x
R
I
 
I
D
 
S
Q
 
A
F
 
F
V
 
L
A
 
K
I
 
L
M
 
V
K
 
E
P
 
P
L
 
F
G
 
G
L
 
V
I
 
L
E
 
E
V
 
C
C
 
A
R
 
R
T
 
S
G
 
G
I
 
M
A
 
M
A
 
A
M
 
L
N
 
P
R
|
R

Query Sequence

>WP_003560902.1 NCBI__GCF_000023185.1:WP_003560902.1
MNAHLQPTGSAYFISPETAAVESHTLSVLVDNEPGVLARVIGLFSGRGYNIESLTVSETE
HQAHLSRITVVTRGTPQVLEQIKAQLERIVPVHRVVDLTVRARELGQDRPIEREVALVKV
IGEGEMRAETLRLADAFHAKVVDATVGHFILEITGKSSKIDQFVAIMKPLGLIEVCRTGI
AAMNRGVQGM

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory