SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_004041151.1 NCBI__GCF_000337315.1:WP_004041151.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

7uoiA Crystallographic structure of dape from enterococcus faecium (see paper)
27% identity, 94% coverage: 3:362/385 of query aligns to 8:364/383 of 7uoiA

query
sites
7uoiA
E
 
E
E
 
E
L
 
K
R
 
I
S
 
A
L
 
I
L
 
L
T
 
Q
S
 
E
L
 
I
V
 
I
E
 
R
I
 
I
E
 
K
T
 
S
E
 
V
N
 
N
P
 
-
P
 
-
G
 
G
D
 
N
E
 
E
A
 
G
A
 
E
A
 
V
A
 
A
Q
 
A
F
 
Y
V
 
L
S
 
N
D
 
K
W
 
L
L
 
L
D
 
A
S
 
R
R
 
H
G
 
D
V
 
I
S
 
T
A
 
G
T
 
E
L
 
I
V
 
V
E
 
S
E
 
-
P
 
-
F
 
Y
P
 
R
D
 
D
-
 
G
R
 
R
P
 
D
Q
 
N
V
 
L
A
 
I
A
 
A
R
 
R
V
 
Y
G
 
Q
D
 
K
G
 
G
E
 
Q
P
 
S
S
 
G
V
 
K
V
 
V
L
 
L
-
 
G
-
 
L
N
 
S
G
 
G
H
|
H
L
 
M
D
 
D
V
 
V
V
 
V
P
 
A
A
 
A
G
 
G
D
 
D
R
 
E
D
 
S
Q
 
S
W
 
W
T
 
T
H
 
Y
P
 
A
P
 
P
Y
 
F
D
 
A
P
 
A
T
 
E
V
 
I
R
 
H
D
 
G
G
 
N
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
G
 
G
S
 
A
A
 
T
D
|
D
M
 
M
K
 
K
C
 
S
G
 
G
V
 
L
A
 
A
L
 
A
A
 
M
M
 
V
L
 
I
A
 
A
T
 
M
V
 
I
E
 
E
F
 
L
A
 
K
D
 
-
A
 
-
F
 
-
E
 
E
S
 
S
G
 
G
A
 
K
-
 
P
L
 
F
D
 
N
G
 
G
S
 
T
L
 
V
V
 
K
F
 
L
H
 
L
A
 
A
A
 
T
V
 
V
G
 
G
E
 
E
E
 
E
T
 
V
A
 
G
E
 
E
P
 
L
G
 
G
T
 
G
K
 
E
T
 
Q
L
 
L
L
 
T
E
 
K
R
 
A
G
 
G
Y
 
Y
-
 
V
-
 
D
D
 
D
G
 
L
T
 
D
Y
 
A
G
 
L
V
 
I
V
 
I
L
 
G
E
|
E
P
 
P
T
 
T
A
 
N
L
 
Y
R
 
S
T
 
L
A
 
M
T
 
Y
S
 
T
A
 
H
K
 
M
G
 
G
L
 
S
G
 
I
W
 
N
Y
 
Y
E
 
T
I
 
V
S
 
T
V
 
S
G
 
H
G
 
G
D
 
K
P
 
E
S
 
A
H
 
H
A
 
S
S
 
S
R
 
M
P
 
P
D
 
D
E
 
Q
G
 
G
D
 
Y
N
 
N
A
 
A
I
 
I
G
 
N
N
 
H
A
 
L
R
 
N
P
 
E
V
 
F
L
 
I
D
 
T
A
 
K
L
 
A
E
 
N
A
 
A
Y
 
E
D
 
M
E
 
N
E
 
H
I
 
L
-
 
A
R
 
E
A
 
T
R
 
I
S
 
E
D
 
N
S
 
P
L
 
V
V
 
L
G
 
G
R
 
K
P
 
T
T
 
I
A
 
H
T
 
N
V
 
V
T
 
T
R
 
L
F
 
I
E
 
S
A
 
G
G
 
G
T
 
N
K
 
Q
E
 
V
N
 
N
V
 
S
V
 
I
P
 
P
E
 
S
S
 
H
A
 
A
T
 
Q
I
 
L
T
 
Q
V
 
G
D
 
N
R
 
I
R
 
R
F
 
S
V
 
I
P
 
P
A
 
E
E
 
Y
T
 
P
V
 
N
E
 
D
E
 
K
V
 
I
D
 
I
A
 
A
E
 
L
I
 
L
D
 
Q
A
 
S
L
 
I
L
 
V
S
 
N
D
 
E
V
 
L
T
 
N
A
 
Q
E
 
E
H
 
T
D
 
D
L
 
Y
N
 
H
V
 
L
E
 
E
W
 
L
T
 
-
R
 
-
T
 
-
R
 
-
V
 
M
Y
 
I
E
 
D
S
 
Y
A
 
N
A
 
K
V
 
I
P
 
P
T
 
V
D
 
K
S
 
A
D
 
D
I
 
P
A
 
D
A
 
S
R
 
P
F
 
L
R
 
I
D
 
H
A
 
S
A
 
I
A
 
Q
E
 
Q
R
 
Q
A
 
F
D
 
S
I
 
-
D
 
Q
P
 
P
E
 
L
P
 
P
W
 
L
-
 
V
G
 
G
I
 
A
R
 
A
A
 
A
A
 
T
T
 
T
D
 
D
V
 
A
R
 
A
N
 
E
L
 
F
V
 
T
N
 
K
-
 
A
D
 
N
A
 
H
G
 
S
M
 
F
D
 
D
A
 
F
I
 
V
T
 
V
W
 
F
G
 
G
P
 
P
G
 
G
S
 
V
M
 
V
A
 
T
Q
 
L
A
 
P
H
 
H
A
 
Q
Y
 
V
D
 
D
E
 
E
Y
 
Y
I
 
V
E
 
E
L
 
I

3pfoA Crystal structure of a putative acetylornithine deacetylase (rpa2325) from rhodopseudomonas palustris cga009 at 1.90 a resolution
30% identity, 78% coverage: 65:365/385 of query aligns to 98:406/426 of 3pfoA

query
sites
3pfoA
S
 
S
V
 
L
V
 
I
L
 
L
N
 
Q
G
 
G
H
|
H
L
 
I
D
 
D
V
 
V
V
 
V
P
 
P
A
 
E
G
 
G
D
 
P
R
 
V
D
 
D
Q
 
L
W
 
W
T
 
S
H
 
D
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
D
 
E
P
 
A
T
 
K
V
 
V
R
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
W
L
 
M
Y
 
I
G
 
G
R
 
R
G
 
G
S
 
A
A
 
Q
D
|
D
M
 
M
K
 
K
C
 
G
G
 
G
V
 
V
A
 
S
L
 
A
A
 
M
M
 
I
L
 
F
A
 
A
T
 
L
V
 
-
E
 
-
F
 
-
A
 
-
D
 
D
A
 
A
F
 
I
E
 
R
S
 
T
G
 
A
-
 
G
-
 
Y
A
 
A
L
 
P
D
 
D
G
 
A
S
 
R
L
 
V
V
 
H
F
 
V
H
 
Q
A
 
T
A
 
V
V
 
T
G
 
E
E
 
E
E
|
E
T
 
S
A
 
T
E
 
G
P
 
N
G
 
G
T
 
A
K
 
L
T
 
S
L
 
T
L
 
L
E
 
M
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
D
 
R
G
 
A
T
 
D
Y
 
A
G
 
C
V
 
L
V
 
I
L
 
P
E
|
E
P
 
P
T
 
T
A
 
G
L
 
H
R
 
T
T
 
L
A
 
T
T
 
R
S
 
A
A
 
Q
K
 
V
G
 
G
L
 
A
G
 
V
W
 
W
Y
 
F
E
 
R
I
 
L
S
 
R
V
 
V
G
 
R
G
 
G
D
 
T
P
 
P
S
 
V
H
 
H
A
 
V
S
 
A
R
 
Y
P
 
S
D
 
E
E
 
T
G
 
G
D
 
T
N
 
S
A
 
A
I
 
I
G
 
L
N
 
S
A
 
A
R
 
M
P
 
H
V
 
L
L
 
I
D
 
R
A
 
A
L
 
F
E
 
E
A
 
E
Y
 
Y
D
 
T
E
 
K
E
 
E
I
 
L
R
 
N
A
 
A
R
 
Q
S
 
A
-
 
V
-
 
R
D
 
D
S
 
P
L
 
W
V
 
F
G
 
G
R
 
Q
P
 
V
T
 
K
A
 
N
T
 
P
V
 
I
T
 
-
R
 
K
F
 
F
E
 
N
A
 
V
G
 
G
T
 
I
K
 
I
E
 
K
N
 
G
-
 
G
-
 
D
-
 
W
V
 
A
V
 
S
P
 
S
E
 
T
S
 
A
A
 
A
T
 
W
I
 
C
T
 
E
V
 
L
D
 
D
R
 
C
R
 
R
-
 
L
-
 
G
F
 
L
V
 
L
P
 
T
A
 
G
E
 
D
T
 
T
V
 
P
E
 
Q
E
 
E
V
 
A
D
 
M
A
 
R
E
 
G
I
 
I
D
 
E
A
 
K
L
 
C
L
 
L
S
 
A
D
 
D
V
 
A
T
 
Q
A
 
A
-
 
T
-
 
D
-
 
S
-
 
F
-
 
L
-
 
S
E
 
E
H
 
N
D
 
P
L
 
A
N
 
E
V
 
L
E
 
V
W
 
W
T
 
S
R
 
G
T
 
F
R
 
Q
-
 
A
-
 
D
-
 
P
-
 
A
V
 
V
Y
 
C
E
 
E
S
 
P
A
 
G
A
 
G
V
 
V
P
 
A
T
 
E
D
 
D
S
 
V
D
 
L
I
 
T
A
 
A
A
 
A
R
 
H
F
 
-
R
 
-
D
 
-
A
 
K
A
 
A
A
 
A
E
 
F
R
 
N
A
 
A
D
 
P
I
 
L
D
 
D
P
 
A
E
 
R
P
 
L
W
 
-
G
 
-
I
 
S
R
 
T
A
 
A
A
 
V
T
 
N
D
 
D
V
 
T
R
 
R
N
 
Y
L
 
Y
V
 
S
N
 
V
D
 
D
A
 
Y
G
 
G
M
 
I
D
 
P
A
 
A
I
 
L
T
 
C
W
 
Y
G
 
G
P
 
P
G
 
Y
S
 
G
M
 
Q
A
 
G
Q
 
-
A
 
P
H
|
H
A
 
A
Y
 
F
D
 
D
E
 
E
Y
 
R
I
 
I
E
 
D
L
 
L
S
 
E
E
 
S
V
 
L

5vo3A Crystal structure of dape in complex with the products (succinic acid and diaminopimelic acid) (see paper)
28% identity, 75% coverage: 1:288/385 of query aligns to 5:292/380 of 5vo3A

query
sites
5vo3A
M
 
M
D
 
K
E
 
E
E
 
K
L
 
V
R
 
V
S
 
S
L
 
L
L
 
A
T
 
Q
S
 
D
L
 
L
V
 
I
E
 
R
I
 
R
E
 
P
T
 
S
E
 
I
N
 
S
P
 
P
P
 
-
G
 
-
D
 
N
E
 
D
A
 
E
A
 
G
A
 
C
A
 
Q
Q
 
Q
F
 
I
V
 
I
S
 
A
D
 
E
W
 
R
L
 
L
D
 
E
S
 
K
R
 
L
G
 
G
V
 
F
S
 
Q
A
 
I
T
 
E
L
 
W
V
 
M
E
 
-
E
 
-
P
 
P
F
 
F
P
 
N
D
 
D
R
 
T
P
 
L
Q
 
N
V
 
L
A
 
W
A
 
A
R
 
K
V
 
H
G
 
G
D
 
T
G
 
S
E
 
E
P
 
P
S
 
V
V
 
I
V
 
A
L
 
F
N
 
A
G
 
G
H
|
H
L
 
T
D
 
D
V
 
V
V
 
V
P
 
P
A
 
T
G
 
G
D
 
D
R
 
E
D
 
N
Q
 
Q
W
 
W
T
 
S
H
 
S
P
 
P
P
 
P
Y
 
F
D
 
S
P
 
A
T
 
E
V
 
I
R
 
I
D
 
D
G
 
G
R
 
M
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
G
 
G
S
 
A
A
 
A
D
|
D
M
 
M
K
 
K
C
 
G
G
 
S
V
 
L
A
 
A
L
 
A
A
 
M
M
 
I
L
 
V
A
 
A
T
 
A
V
 
E
E
 
E
F
 
Y
A
 
V
D
 
K
A
 
A
F
 
N
E
 
P
S
 
N
G
 
H
A
 
-
L
 
-
D
 
K
G
 
G
S
 
T
L
 
I
V
 
A
F
 
L
H
 
L
A
 
I
A
 
T
V
 
S
G
 
D
E
|
E
E
|
E
-
x
A
T
 
T
A
 
A
E
 
K
P
 
D
G
 
G
T
 
T
-
 
I
-
 
H
-
 
V
-
 
V
K
 
E
T
 
T
L
 
L
L
 
M
E
 
A
R
 
R
G
 
D
Y
 
E
D
 
K
G
 
I
T
 
T
Y
 
Y
G
 
C
V
 
M
V
 
V
L
 
G
E
|
E
P
 
P
T
 
S
A
 
S
L
 
A
R
 
K
T
 
N
-
 
L
-
 
G
-
 
D
-
 
V
-
 
V
A
 
K
T
 
N
S
 
G
A
x
R
K
 
R
G
 
G
L
x
S
G
 
I
W
 
T
Y
 
G
E
 
N
I
 
L
S
 
Y
V
 
I
G
 
Q
G
 
G
D
 
I
P
 
Q
S
 
G
H
 
H
A
 
V
S
 
A
R
 
Y
P
 
P
D
 
H
E
 
L
G
 
A
D
 
E
N
 
N
A
 
P
I
 
I
G
 
H
N
 
K
A
 
A
R
 
A
P
 
L
V
 
F
L
 
L
D
 
Q
A
 
E
L
 
L
E
 
T
A
 
T
Y
 
Y
D
 
Q
E
 
W
E
 
D
I
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
K
S
 
G
D
 
N
S
 
E
L
 
F
V
 
F
G
 
P
R
 
P
P
 
T
T
 
S
A
 
L
T
 
Q
V
 
I
T
 
A
R
 
N
F
 
I
E
 
H
A
 
A
G
 
G
T
 
T
-
 
G
K
 
S
E
 
N
N
 
N
V
 
V
V
 
I
P
 
P
E
 
A
S
 
E
A
 
L
T
 
Y
I
 
I
T
 
Q
V
 
F
D
 
N
R
 
L
R
|
R
F
 
Y
V
 
C
P
 
-
A
 
-
E
 
-
T
 
-
V
 
T
E
 
E
E
 
V
V
 
T
D
 
D
A
 
E
E
 
I
I
 
I
D
 
K
A
 
Q
L
 
K
L
 
V
S
 
A
D
 
E
V
 
M
T
 
L
A
 
E
E
 
K
H
 
H
D
 
N
L
 
L
N
 
K
-
 
Y
-
 
R
V
 
I
E
 
E
W
 
W
T
 
N

Sites not aligning to the query:

P44514 Succinyl-diaminopimelate desuccinylase; SDAP desuccinylase; N-succinyl-LL-2,6-diaminoheptanedioate amidohydrolase; EC 3.5.1.18 from Haemophilus influenzae (strain ATCC 51907 / DSM 11121 / KW20 / Rd) (see 3 papers)
28% identity, 75% coverage: 1:288/385 of query aligns to 1:288/377 of P44514

query
sites
P44514
M
 
M
D
 
K
E
 
E
E
 
K
L
 
V
R
 
V
S
 
S
L
 
L
L
 
A
T
 
Q
S
 
D
L
 
L
V
 
I
E
 
R
I
 
R
E
 
P
T
 
S
E
 
I
N
 
S
P
 
P
P
 
-
G
 
-
D
 
N
E
 
D
A
 
E
A
 
G
A
 
C
A
 
Q
Q
 
Q
F
 
I
V
 
I
S
 
A
D
 
E
W
 
R
L
 
L
D
 
E
S
 
K
R
 
L
G
 
G
V
 
F
S
 
Q
A
 
I
T
 
E
L
 
W
V
 
M
E
 
-
E
 
-
P
 
P
F
 
F
P
 
N
D
 
D
R
 
T
P
 
L
Q
 
N
V
 
L
A
 
W
A
 
A
R
 
K
V
 
H
G
 
G
D
 
T
G
 
S
E
 
E
P
 
P
S
 
V
V
 
I
V
 
A
L
 
F
N
 
A
G
 
G
H
|
H
L
 
T
D
 
D
V
 
V
V
 
V
P
 
P
A
 
T
G
 
G
D
 
D
R
 
E
D
 
N
Q
 
Q
W
 
W
T
 
S
H
 
S
P
 
P
P
 
P
Y
 
F
D
 
S
P
 
A
T
 
E
V
 
I
R
 
I
D
 
D
G
 
G
R
 
M
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
G
 
G
S
 
A
A
 
A
D
|
D
M
 
M
K
 
K
C
 
G
G
 
S
V
 
L
A
 
A
L
 
A
A
 
M
M
 
I
L
 
V
A
 
A
T
 
A
V
 
E
E
 
E
F
 
Y
A
 
V
D
 
K
A
 
A
F
 
N
E
 
P
S
 
N
G
 
H
A
 
-
L
 
-
D
 
K
G
 
G
S
 
T
L
 
I
V
 
A
F
 
L
H
 
L
A
 
I
A
 
T
V
 
S
G
 
D
E
|
E
E
|
E
-
 
A
T
 
T
A
 
A
E
 
K
P
 
D
G
 
G
T
 
T
-
 
I
-
 
H
-
 
V
-
 
V
K
 
E
T
 
T
L
 
L
L
 
M
E
 
A
R
 
R
G
 
D
Y
 
E
D
 
K
G
 
I
T
 
T
Y
 
Y
G
 
C
V
 
M
V
 
V
L
 
G
E
|
E
P
 
P
T
 
S
A
 
S
L
 
A
R
 
K
T
 
N
-
 
L
-
 
G
-
 
D
-
 
V
-
 
V
A
 
K
T
 
N
S
 
G
A
 
R
K
 
R
G
 
G
L
 
S
G
 
I
W
 
T
Y
 
G
E
 
N
I
 
L
S
 
Y
V
 
I
G
 
Q
G
 
G
D
 
I
P
 
Q
S
 
G
H
 
H
A
 
V
S
 
A
R
 
Y
P
 
P
D
 
H
E
 
L
G
 
A
D
 
E
N
 
N
A
 
P
I
 
I
G
 
H
N
 
K
A
 
A
R
 
A
P
 
L
V
 
F
L
 
L
D
 
Q
A
 
E
L
 
L
E
 
T
A
 
T
Y
 
Y
D
 
Q
E
 
W
E
 
D
I
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
K
S
 
G
D
 
N
S
 
E
L
 
F
V
 
F
G
 
P
R
 
P
P
 
T
T
 
S
A
 
L
T
 
Q
V
 
I
T
 
A
R
 
N
F
 
I
E
 
H
A
 
A
G
 
G
T
 
T
-
 
G
K
 
S
E
 
N
N
 
N
V
 
V
V
 
I
P
 
P
E
 
A
S
 
E
A
 
L
T
 
Y
I
 
I
T
 
Q
V
 
F
D
 
N
R
 
L
R
 
R
F
 
Y
V
 
C
P
 
-
A
 
-
E
 
-
T
 
-
V
 
T
E
 
E
E
 
V
V
 
T
D
 
D
A
 
E
E
 
I
I
 
I
D
 
K
A
 
Q
L
 
K
L
 
V
S
 
A
D
 
E
V
 
M
T
 
L
A
 
E
E
 
K
H
 
H
D
 
N
L
 
L
N
 
K
-
 
Y
-
 
R
V
 
I
E
 
E
W
 
W
T
 
N

Sites not aligning to the query:

7lgpB Dape enzyme from shigella flexneri
29% identity, 69% coverage: 23:287/385 of query aligns to 23:288/377 of 7lgpB

query
sites
7lgpB
D
 
D
E
 
D
A
 
A
A
 
G
A
 
C
A
 
Q
Q
 
A
F
 
L
V
 
L
S
 
I
D
 
E
W
 
R
L
 
L
D
 
Q
S
 
A
R
 
I
G
 
G
V
 
F
S
 
T
A
 
V
T
 
E
L
 
R
V
 
M
E
 
D
E
 
-
P
 
-
F
 
F
P
 
A
D
 
D
R
 
T
P
 
Q
Q
 
N
V
 
F
A
 
W
A
 
A
R
 
W
V
 
R
G
 
G
D
 
Q
G
 
G
E
 
E
P
 
-
S
 
T
V
 
L
V
 
A
L
 
F
N
 
A
G
 
G
H
|
H
L
 
T
D
 
D
V
 
V
V
 
V
P
 
P
A
 
P
G
 
G
D
 
D
R
 
A
D
 
D
Q
 
R
W
 
W
T
 
I
H
 
N
P
 
P
P
 
P
Y
 
F
D
 
E
P
 
P
T
 
T
V
 
I
R
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
M
L
 
L
Y
 
F
G
 
G
R
 
R
G
 
G
S
 
A
A
 
A
D
|
D
M
 
M
K
 
K
C
 
G
G
 
S
V
 
L
A
 
A
L
 
A
A
 
M
M
 
V
L
 
V
A
 
A
T
 
A
V
 
E
E
 
R
F
 
F
A
 
V
D
 
A
A
 
Q
F
 
H
E
 
P
S
 
N
G
 
H
A
 
T
L
 
-
D
 
-
G
 
G
S
 
R
L
 
L
V
 
A
F
 
F
H
 
L
A
 
I
A
 
T
V
 
S
G
 
D
E
 
E
E
 
E
-
 
A
T
 
S
A
 
A
E
 
H
P
 
N
G
 
G
T
 
T
-
 
V
-
 
K
-
 
V
-
 
V
K
 
E
T
 
A
L
 
L
L
 
M
E
 
A
R
 
R
G
 
N
Y
 
E
D
 
R
G
 
L
T
 
D
Y
 
Y
G
 
C
V
 
L
V
 
V
L
 
G
E
|
E
P
 
P
T
 
S
A
 
S
L
 
I
R
 
E
T
 
V
A
 
V
-
 
G
-
 
D
-
 
V
-
 
V
-
 
K
T
 
N
S
 
G
A
 
R
K
 
R
G
 
G
L
 
S
G
 
L
W
 
T
Y
 
C
E
 
N
I
 
L
S
 
T
V
 
I
G
 
H
G
 
G
D
 
V
P
 
Q
S
 
G
H
 
H
A
 
V
S
 
A
R
 
Y
P
 
P
D
 
H
E
 
L
G
 
A
D
 
D
N
 
N
A
 
P
I
 
V
G
 
H
N
 
R
A
 
A
R
 
A
P
 
P
V
 
F
L
 
L
D
 
N
A
 
E
L
 
L
E
 
V
A
 
A
Y
 
I
D
 
E
E
 
W
E
 
D
I
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
Q
S
 
G
D
 
N
S
 
E
L
 
F
V
 
F
G
 
P
R
 
A
P
 
T
T
 
S
A
 
M
T
 
Q
V
 
I
T
 
A
R
 
N
F
 
I
E
 
Q
A
 
A
G
 
G
T
 
T
-
 
G
K
 
S
E
 
N
N
 
N
V
 
V
V
 
I
P
 
P
E
 
G
S
 
E
A
 
L
T
 
F
I
 
V
T
 
Q
V
 
F
D
 
N
R
 
F
R
 
R
F
 
F
V
 
S
P
 
T
A
 
E
E
 
L
T
 
T
V
 
D
E
 
E
E
 
M
V
 
I
D
 
K
A
 
A
E
 
Q
I
 
V
D
 
L
A
 
A
L
 
L
L
 
L
S
 
E
D
 
-
V
 
-
T
 
-
A
 
-
E
 
K
H
 
H
D
 
Q
L
 
L
-
 
R
-
 
Y
N
 
T
V
 
V
E
 
D
W
 
W

4pqaA Crystal structure of succinyl-diaminopimelate desuccinylase from neisseria meningitidis mc58 in complex with the inhibitor captopril (see paper)
26% identity, 89% coverage: 23:365/385 of query aligns to 21:360/375 of 4pqaA

query
sites
4pqaA
D
 
D
E
 
D
A
 
R
A
 
D
A
 
C
A
 
Q
Q
 
K
F
 
L
V
 
L
S
 
A
D
 
E
W
 
R
L
 
L
D
 
H
S
 
K
R
 
I
G
 
G
V
 
F
S
 
A
A
 
A
T
 
E
L
 
-
V
 
-
E
 
E
E
 
L
P
 
H
F
 
F
P
 
G
D
 
D
R
 
T
P
 
K
Q
 
N
V
 
I
A
 
W
A
 
L
R
 
R
V
 
R
G
 
G
D
 
T
G
 
K
E
 
A
P
 
P
S
 
V
V
 
V
V
 
C
L
 
F
N
 
A
G
 
G
H
|
H
L
 
T
D
 
D
V
 
V
V
 
V
P
 
P
A
 
T
G
 
G
D
 
P
R
 
V
D
 
E
Q
 
K
W
 
W
T
 
D
H
 
S
P
 
P
P
 
P
Y
 
F
D
 
E
P
 
P
T
 
A
V
 
E
R
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
G
 
G
S
 
A
A
 
A
D
|
D
M
 
M
K
 
K
C
 
T
G
 
S
V
 
I
A
 
A
L
 
C
A
 
F
M
 
V
L
 
T
A
 
A
T
 
C
V
 
E
E
 
R
F
 
F
A
 
V
D
 
A
A
 
K
F
 
H
E
 
P
S
 
N
G
 
H
A
 
-
L
 
-
D
 
Q
G
 
G
S
 
S
L
 
I
V
 
A
F
 
L
H
 
L
A
 
I
A
 
T
V
 
S
G
 
D
E
|
E
E
|
E
T
 
G
-
 
D
A
 
A
E
 
L
P
 
D
G
 
G
T
 
T
K
 
T
T
 
K
L
 
V
L
 
V
E
 
D
-
 
V
-
 
L
-
 
K
-
 
A
R
 
R
G
 
D
Y
 
E
D
 
L
G
 
I
T
 
D
Y
 
Y
G
 
C
V
 
I
V
 
V
L
 
G
E
|
E
P
 
P
T
 
T
A
 
A
L
 
V
-
 
D
-
 
K
-
 
L
-
 
G
-
 
D
R
 
M
T
 
I
A
 
K
T
 
N
S
 
G
A
 
R
K
 
R
G
 
G
L
 
S
G
 
L
W
 
S
Y
 
G
E
 
N
I
 
L
S
 
T
V
 
V
G
 
K
G
 
G
D
 
K
P
 
Q
S
 
G
H
 
H
A
 
I
S
 
A
R
 
Y
P
 
P
D
 
H
E
 
L
G
 
A
D
 
I
N
 
N
A
 
P
I
 
V
G
 
H
N
 
T
A
 
F
R
 
A
P
 
P
V
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
A
L
 
L
E
 
L
A
 
E
Y
 
L
D
 
T
E
 
Q
E
 
E
I
 
V
R
 
W
A
 
D
R
 
E
S
 
G
D
 
N
S
 
E
L
 
Y
V
 
F
G
 
P
R
 
P
P
 
T
T
 
S
A
 
F
T
 
Q
V
 
I
T
 
S
R
 
N
F
 
I
E
 
N
A
 
G
G
 
G
T
 
T
-
 
G
K
 
A
E
 
T
N
 
N
V
 
V
V
 
I
P
 
P
E
 
G
S
 
E
A
 
L
T
 
N
I
 
V
T
 
K
V
 
F
D
 
N
R
 
F
R
 
R
F
 
F
V
 
S
P
 
T
A
 
E
E
 
S
T
 
T
V
 
E
E
 
A
E
 
G
V
 
L
D
 
K
A
 
Q
E
 
R
I
 
V
D
 
H
A
 
A
L
 
I
L
 
L
S
 
D
D
 
K
V
 
H
T
 
G
A
 
V
E
 
Q
H
 
Y
D
 
D
L
 
L
N
 
-
V
 
-
E
 
Q
W
 
W
T
 
S
R
 
C
T
 
S
R
 
G
V
 
Q
Y
 
P
E
 
F
S
 
L
A
 
T
A
 
Q
V
 
A
P
 
G
T
 
K
D
 
L
S
 
T
D
 
D
I
 
V
A
 
A
A
 
-
R
 
-
F
 
-
R
 
R
D
 
A
A
 
A
A
 
I
A
 
A
E
 
E
R
 
T
A
 
C
D
 
G
I
 
I
D
 
E
P
 
A
E
 
E
P
 
L
W
 
S
G
 
T
I
 
T
R
 
G
A
x
G
A
 
T
T
 
S
D
 
D
V
 
G
R
 
R
N
 
-
L
 
F
V
 
I
N
 
K
D
 
A
A
 
I
G
 
A
M
 
Q
D
 
E
A
 
L
I
 
I
T
 
E
W
 
L
G
 
G
P
 
P
G
 
-
S
 
S
M
 
N
A
 
A
Q
 
T
A
x
I
H
|
H
A
 
Q
Y
 
I
D
 
N
E
 
E
Y
 
N
I
 
V
E
 
R
L
 
L
S
 
N
E
 
D
V
 
I

4o23A Crystal structure of mono-zinc form of succinyl diaminopimelate desuccinylase from neisseria meningitidis mc58 (see paper)
27% identity, 89% coverage: 23:365/385 of query aligns to 21:360/376 of 4o23A

query
sites
4o23A
D
 
D
E
 
D
A
 
R
A
 
D
A
 
C
A
 
Q
Q
 
K
F
 
L
V
 
L
S
 
A
D
 
E
W
 
R
L
 
L
D
 
H
S
 
K
R
 
I
G
 
G
V
 
F
S
 
A
A
 
A
T
 
E
L
 
-
V
 
-
E
 
E
E
 
L
P
 
H
F
 
F
P
 
G
D
 
D
R
 
T
P
 
K
Q
 
N
V
 
I
A
 
W
A
 
L
R
 
R
V
 
R
G
 
G
D
 
T
G
 
K
E
 
A
P
 
P
S
 
V
V
 
V
V
 
C
L
 
F
N
 
A
G
 
G
H
|
H
L
 
T
D
 
D
V
 
V
V
 
V
P
 
P
A
 
T
G
 
G
D
 
P
R
 
V
D
 
E
Q
 
K
W
 
W
T
 
D
H
 
S
P
 
P
P
 
P
Y
 
F
D
 
E
P
 
P
T
 
A
V
 
E
R
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
R
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
G
 
G
S
 
A
A
 
A
D
|
D
M
 
M
K
 
K
C
 
T
G
 
S
V
 
I
A
 
A
L
 
C
A
 
F
M
 
V
L
 
T
A
 
A
T
 
C
V
 
E
E
 
R
F
 
F
A
 
V
D
 
A
A
 
K
F
 
H
E
 
P
S
 
N
G
 
H
A
 
-
L
 
-
D
 
Q
G
 
G
S
 
S
L
 
I
V
 
A
F
 
L
H
 
L
A
 
I
A
 
T
V
 
S
G
 
D
E
 
E
E
 
E
T
 
G
-
 
D
A
 
A
E
 
L
P
 
D
G
 
G
T
 
T
K
 
T
T
 
K
L
 
V
L
 
V
E
 
D
-
 
V
-
 
L
-
 
K
-
 
A
R
 
R
G
 
D
Y
 
E
D
 
L
G
 
I
T
 
D
Y
 
Y
G
 
C
V
 
I
V
 
V
L
 
G
E
|
E
P
 
P
T
 
T
A
 
A
L
 
V
-
 
D
-
 
K
-
 
L
-
 
G
-
 
D
R
 
M
T
 
I
A
 
K
T
 
N
S
 
G
A
 
R
K
 
R
G
 
G
L
 
S
G
 
L
W
 
S
Y
 
G
E
 
N
I
 
L
S
 
T
V
 
V
G
 
K
G
 
G
D
 
K
P
 
Q
S
 
G
H
 
H
A
 
I
S
 
A
R
 
Y
P
 
P
D
 
H
E
 
L
G
 
A
D
 
I
N
 
N
A
 
P
I
 
V
G
 
H
N
 
T
A
 
F
R
 
A
P
 
P
V
 
A
L
 
L
D
 
L
A
 
E
L
 
L
-
 
T
-
 
Q
E
 
E
A
 
V
Y
 
W
D
 
D
E
 
E
E
 
-
I
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
-
S
 
G
D
 
N
S
 
E
L
 
Y
V
 
F
G
 
P
R
 
P
P
 
T
T
 
S
A
 
F
T
 
Q
V
 
I
T
 
S
R
 
N
F
 
I
E
 
N
A
 
G
G
 
G
T
 
T
-
 
G
K
 
A
E
 
T
N
 
N
V
 
V
V
 
I
P
 
P
E
 
G
S
 
E
A
 
L
T
 
N
I
 
V
T
 
K
V
 
F
D
 
N
R
 
F
R
 
R
F
 
F
V
 
S
P
 
T
A
 
E
E
 
S
T
 
T
V
 
E
E
 
A
E
 
G
V
 
L
D
 
K
A
 
Q
E
 
R
I
 
V
D
 
H
A
 
A
L
 
I
L
 
L
S
 
D
D
 
K
V
 
H
T
 
G
A
 
V
E
 
Q
H
 
Y
D
 
D
L
 
L
N
 
-
V
 
-
E
 
Q
W
 
W
T
 
S
R
 
C
T
 
S
R
 
G
V
 
Q
Y
 
P
E
 
F
S
 
L
A
 
T
A
 
Q
V
 
A
P
 
G
T
 
K
D
 
L
S
 
T
D
 
D
I
 
V
A
 
A
A
 
-
R
 
-
F
 
-
R
 
R
D
 
A
A
 
A
A
 
I
A
 
A
E
 
E
R
 
T
A
 
C
D
 
G
I
 
I
D
 
E
P
 
A
E
 
E
P
 
L
W
 
S
G
 
T
I
 
T
R
 
G
A
 
G
A
 
T
T
 
S
D
 
D
V
 
G
R
 
R
N
 
-
L
 
F
V
 
I
N
 
K
D
 
A
A
 
I
G
 
A
M
 
Q
D
 
E
A
 
L
I
 
I
T
 
E
W
 
L
G
 
G
P
 
P
G
 
-
S
 
S
M
 
N
A
 
A
Q
 
T
A
 
I
H
 
H
A
 
Q
Y
 
I
D
 
N
E
 
E
Y
 
N
I
 
V
E
 
R
L
 
L
S
 
N
E
 
D
V
 
I

4h2kA Crystal structure of the catalytic domain of succinyl-diaminopimelate desuccinylase from haemophilus influenzae (see paper)
34% identity, 46% coverage: 1:178/385 of query aligns to 3:173/258 of 4h2kA

query
sites
4h2kA
M
 
M
D
 
K
E
 
E
E
 
K
L
 
V
R
 
V
S
 
S
L
 
L
L
 
A
T
 
Q
S
 
D
L
 
L
V
 
I
E
 
R
I
 
R
E
 
P
T
 
S
E
 
I
N
 
S
P
 
P
P
 
-
G
 
-
D
 
N
E
 
D
A
 
E
A
 
G
A
 
C
A
 
Q
Q
 
Q
F
 
I
V
 
I
S
 
A
D
 
E
W
 
R
L
 
L
D
 
E
S
 
K
R
 
L
G
 
G
V
 
F
S
 
Q
A
 
I
T
 
E
L
 
W
V
 
M
E
 
-
E
 
-
P
 
P
F
 
F
P
 
N
D
 
D
R
 
T
P
 
L
Q
 
N
V
 
L
A
 
W
A
 
A
R
 
K
V
 
H
G
 
G
D
 
T
G
 
S
E
 
E
P
 
P
S
 
V
V
 
I
V
 
A
L
 
F
N
 
A
G
 
G
H
|
H
L
 
T
D
 
D
V
 
V
V
 
V
P
 
P
A
 
T
G
 
G
D
 
D
R
 
E
D
 
N
Q
 
Q
W
 
W
T
 
S
H
 
S
P
 
P
P
 
P
Y
 
F
D
 
S
P
 
A
T
 
E
V
 
I
R
 
I
D
 
D
G
 
G
R
 
M
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
G
 
G
S
 
A
A
 
A
D
|
D
M
 
M
K
 
K
C
 
G
G
 
S
V
 
L
A
 
A
L
 
A
A
 
M
M
 
I
L
 
V
A
 
A
T
 
A
V
 
E
E
 
E
F
 
Y
A
 
V
D
 
K
A
 
A
F
 
N
E
 
P
S
 
N
G
 
H
A
 
-
L
 
-
D
 
K
G
 
G
S
 
T
L
 
I
V
 
A
F
 
L
H
 
L
A
 
I
A
 
T
V
 
S
G
 
D
E
 
E
E
|
E
-
 
A
T
 
T
A
 
A
E
 
K
P
 
D
G
 
G
T
 
T
-
 
I
-
 
H
-
 
V
-
 
V
K
 
E
T
 
T
L
 
L
L
 
M
E
 
A
R
 
R
G
 
D
Y
 
E
D
 
K
G
 
I
T
 
T
Y
 
Y
G
 
C
V
 
M
V
 
V
L
 
G
E
|
E
P
 
P
T
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
T
 
-
A
 
-
T
 
S
S
 
S
A
 
A
K
 
K
G
 
N
L
 
L
G
 
G

Sites not aligning to the query:

8uw6B Acetylornithine deacetylase from escherichia coli, di-zinc form. (see paper)
24% identity, 90% coverage: 30:377/385 of query aligns to 36:376/381 of 8uw6B

query
sites
8uw6B
F
 
L
V
 
L
S
 
A
D
 
D
W
 
W
L
 
F
D
 
K
S
 
D
R
 
L
G
 
G
V
 
F
S
 
N
A
 
V
T
 
E
L
 
V
V
 
-
E
 
-
E
 
Q
P
 
P
F
 
V
P
 
P
-
 
G
-
 
T
-
 
R
D
 
N
R
 
K
P
 
F
Q
 
N
V
 
M
A
 
L
A
 
A
R
 
S
V
 
T
G
 
G
D
 
Q
G
 
G
E
 
A
P
 
G
S
 
G
V
 
L
V
 
L
L
 
L
N
 
A
G
 
G
H
|
H
L
 
T
D
 
D
V
 
T
V
 
V
P
 
P
A
 
F
G
 
D
D
 
D
R
 
-
D
 
G
Q
 
R
W
 
W
T
 
T
H
 
R
P
 
D
P
 
P
Y
 
F
D
 
T
P
 
L
T
 
T
V
 
E
R
 
H
D
 
D
G
 
G
R
 
K
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
R
 
L
G
 
G
S
 
T
A
 
A
D
|
D
M
 
M
K
 
K
C
 
G
G
 
F
V
 
F
A
 
A
L
 
F
A
 
I
M
 
L
L
 
D
A
 
A
T
 
L
V
 
R
E
 
D
F
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
-
F
 
V
E
 
D
S
 
V
G
 
T
A
 
K
L
 
L
D
 
K
G
 
K
S
 
P
L
 
L
V
 
Y
F
 
I
H
 
L
A
 
A
A
 
T
V
 
A
G
 
D
E
 
E
E
|
E
T
 
T
A
 
S
E
 
M
P
 
A
G
 
G
T
 
A
K
 
R
T
 
Y
L
 
F
L
 
A
E
 
E
-
 
T
R
 
T
G
 
A
Y
 
L
D
 
R
G
 
P
T
 
D
Y
 
C
G
 
A
V
 
I
V
 
I
L
 
G
E
|
E
P
 
P
T
 
T
A
 
S
L
 
L
R
 
Q
T
 
P
A
 
V
T
 
R
S
 
A
A
 
H
K
 
K
G
 
G
L
 
H
G
 
I
W
 
S
Y
 
N
E
 
A
I
 
I
S
 
R
V
 
I
G
 
Q
G
 
G
D
 
Q
P
 
S
S
 
G
H
 
H
A
 
S
S
 
S
R
 
D
P
 
P
D
 
A
E
 
R
G
 
G
D
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
I
G
 
E
N
 
L
A
 
M
R
 
H
P
 
D
V
 
A
L
 
I
D
 
G
A
 
H
L
 
I
E
 
L
A
 
Q
Y
 
L
D
 
R
E
 
D
E
 
N
I
 
L
R
 
K
A
 
E
R
 
R
S
 
Y
D
 
H
S
 
Y
-
 
E
-
 
A
-
 
F
L
 
T
V
 
V
G
 
P
R
 
Y
P
 
P
T
 
T
A
 
L
T
 
N
V
 
L
T
 
G
R
 
H
F
 
I
E
 
H
A
 
G
G
 
G
T
 
D
K
 
A
E
 
S
N
 
N
V
 
R
V
 
I
P
 
C
E
 
A
S
 
W
A
 
C
T
 
E
I
 
L
T
 
H
V
 
M
D
 
D
R
 
I
R
 
R
F
 
P
V
 
L
P
 
P
A
 
G
E
 
M
T
 
T
V
 
L
E
 
N
E
 
E
V
 
L
D
 
N
A
 
G
E
 
L
I
 
L
D
 
N
A
 
D
L
 
A
L
 
L
S
 
A
D
 
P
V
 
V
T
 
S
A
 
E
E
 
R
H
 
W
D
 
P
-
 
G
-
 
R
L
 
L
N
 
T
V
 
V
E
 
D
W
 
E
T
 
L
R
 
H
T
 
P
R
 
P
V
 
I
-
 
P
-
 
G
Y
 
Y
E
 
E
S
 
C
A
 
P
A
 
P
V
 
N
P
 
H
T
 
Q
D
 
L
S
 
V
D
 
E
I
 
V
A
 
V
A
 
E
R
 
K
F
 
L
R
 
L
D
 
G
A
 
A
A
 
K
A
 
T
E
 
E
R
 
V
A
 
V
D
 
N
I
 
Y
D
 
C
P
 
T
E
 
E
P
 
-
W
 
-
G
 
-
I
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
A
T
 
P
D
 
F
V
 
I
R
 
Q
N
 
T
L
 
L
V
 
C
N
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
-
M
 
-
D
 
P
A
 
T
I
 
L
T
 
V
W
 
L
G
 
G
P
 
P
G
 
G
S
 
S
M
 
I
A
 
N
Q
 
Q
A
 
A
H
|
H
A
 
Q
Y
 
P
D
 
D
E
 
E
Y
 
Y
I
 
L
E
 
E
L
 
T
S
 
R
E
 
F
V
 
I
E
 
K
A
 
P
G
 
T
Y
 
R
D
 
E
I
 
L
L
 
I
R
 
T
T
 
Q
A
 
V
L
 
I
R
x
H

Sites not aligning to the query:

7t1qA Crystal structure of the succinyl-diaminopimelate desuccinylase (dape) from acinetobacter baumannii in complex with succinic acid
30% identity, 59% coverage: 49:274/385 of query aligns to 45:276/377 of 7t1qA

query
sites
7t1qA
F
 
F
P
 
G
D
 
D
R
 
V
P
 
D
Q
 
N
V
 
L
A
 
W
A
 
A
R
 
R
V
 
R
G
 
G
D
 
T
G
 
E
E
 
G
P
 
P
S
 
V
V
 
F
V
 
C
L
 
F
N
 
A
G
 
G
H
|
H
L
 
T
D
 
D
V
 
V
V
 
V
P
 
P
A
 
T
G
 
G
D
 
R
R
 
L
D
 
D
Q
 
A
W
 
W
T
 
N
H
 
S
P
 
D
P
 
P
Y
 
F
D
 
A
P
 
P
T
 
E
V
 
I
R
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
K
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
G
 
G
S
 
S
A
 
A
D
|
D
M
 
M
K
 
K
C
 
T
G
 
A
V
 
L
A
 
A
L
 
A
A
 
M
M
 
V
L
 
V
A
 
A
T
 
S
V
 
E
E
 
R
F
 
F
A
 
V
D
 
A
A
 
K
F
 
H
E
 
P
S
 
N
G
 
H
A
 
-
L
 
-
D
 
K
G
 
G
S
 
S
L
 
I
V
 
A
F
 
F
H
 
L
A
 
I
A
 
T
V
 
S
G
 
D
E
 
E
E
|
E
-
 
G
T
 
P
A
 
A
E
 
V
P
 
N
G
 
G
T
 
T
-
 
V
-
 
K
-
 
V
-
 
I
K
 
E
T
 
T
L
 
L
L
 
E
E
 
K
R
 
R
G
 
N
Y
 
E
D
 
K
G
 
I
T
 
T
Y
 
W
G
 
C
V
 
L
V
 
V
L
 
G
E
|
E
P
 
P
T
 
S
A
 
S
L
 
T
R
 
H
-
 
K
-
 
L
-
 
G
-
 
D
-
 
I
T
 
V
A
 
K
T
 
N
S
 
G
A
 
R
K
 
R
G
 
G
L
 
S
G
 
L
W
 
N
Y
 
A
E
 
V
I
 
L
S
 
K
V
 
V
G
 
Q
G
 
G
D
 
K
P
 
Q
S
 
G
H
 
H
A
 
V
S
 
A
R
 
Y
P
 
P
D
 
H
E
 
L
G
 
A
D
 
R
N
 
N
A
 
P
I
 
I
G
 
H
N
 
E
A
 
A
R
 
S
P
 
P
V
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
A
L
 
L
E
 
A
A
 
E
Y
 
L
D
 
C
E
 
Q
E
 
T
I
 
V
R
 
W
A
 
D
R
 
N
S
 
G
D
 
N
S
 
E
L
 
Y
V
 
F
G
 
P
R
 
A
P
 
T
T
 
S
A
 
F
T
 
Q
V
 
I
T
 
S
R
 
N
F
 
I
E
 
H
A
 
A
G
 
G
T
 
T
-
 
G
K
 
A
E
 
T
N
 
N
V
 
V
V
 
I
P
 
P
E
 
G
S
 
A
A
 
L
T
 
E
I
 
V
T
 
T
V
 
F
D
 
N
R
 
F
R
 
R
F
 
Y
V
 
S
P
 
T
A
 
E
E
 
V
T
 
T
V
 
A
E
 
E
E
 
Q
V
 
L
D
 
K
A
 
Q
E
 
R
I
 
V
D
 
H
A
 
E
L
 
I
L
 
L

Sites not aligning to the query:

P37111 Aminoacylase-1; ACY-1; N-acyl-L-amino-acid amidohydrolase; EC 3.5.1.14 from Sus scrofa (Pig) (see paper)
25% identity, 97% coverage: 7:379/385 of query aligns to 14:397/407 of P37111

query
sites
P37111
S
 
T
L
 
L
L
 
F
T
 
R
S
 
Q
L
 
Y
V
 
L
E
 
R
I
 
I
E
 
R
T
 
T
E
 
V
N
 
Q
P
 
P
P
 
E
G
 
P
D
 
D
E
 
Y
A
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
V
Q
 
A
F
 
F
V
 
L
S
 
E
D
 
E
W
 
R
L
 
A
D
 
R
S
 
Q
R
 
L
G
 
G
V
 
L
S
 
G
A
 
C
T
 
Q
L
 
K
V
 
V
E
 
E
E
 
V
P
 
-
F
 
V
P
 
P
D
 
G
R
 
H
P
 
V
Q
 
V
V
 
T
A
 
V
A
 
L
R
 
T
V
 
W
G
 
P
D
 
G
G
 
T
E
 
N
P
 
P
-
 
T
-
 
L
-
 
S
S
 
S
V
 
I
V
 
L
L
 
L
N
 
N
G
 
S
H
 
H
L
 
T
D
 
D
V
 
V
V
 
V
P
 
P
A
 
V
G
 
F
D
 
-
R
 
K
D
 
E
Q
 
H
W
 
W
T
 
S
H
 
H
P
 
D
P
 
P
Y
 
F
D
 
E
P
 
G
T
 
F
V
 
K
-
 
D
R
 
A
D
 
D
G
 
G
R
 
Y
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
G
 
G
S
 
A
A
 
Q
D
 
D
M
 
M
K
 
K
C
 
C
G
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
M
 
-
L
 
-
A
 
V
T
 
S
V
 
I
E
 
Q
F
 
Y
A
 
L
D
 
E
A
 
A
F
 
V
E
 
R
S
 
R
G
 
L
A
 
K
L
 
V
D
 
E
G
 
G
S
 
H
-
 
H
-
 
F
-
 
P
-
 
R
L
 
T
V
 
I
F
 
H
H
 
M
A
 
T
A
 
F
V
 
V
G
 
P
E
 
D
E
 
E
T
 
E
A
 
V
-
 
G
-
 
G
E
 
H
P
 
Q
G
 
G
T
 
M
K
 
E
T
 
L
L
 
F
L
 
V
E
 
K
R
 
R
-
 
P
-
 
E
-
 
F
-
 
Q
-
 
A
-
 
L
-
 
R
-
 
A
G
 
G
Y
 
F
D
 
A
G
 
L
T
 
D
Y
 
E
G
 
G
V
 
L
V
 
A
L
 
S
E
 
P
P
 
T
T
 
D
A
 
A
L
 
F
R
 
T
T
 
V
A
 
F
T
 
Y
S
 
S
A
 
E
K
 
R
G
 
S
L
 
P
G
 
W
W
 
W
Y
 
L
E
 
R
I
 
V
S
 
T
V
 
S
G
 
T
G
 
G
D
 
K
P
 
P
S
 
G
H
 
H
A
 
G
S
 
S
R
 
R
P
 
F
D
 
I
E
 
E
G
 
-
D
 
D
N
 
T
A
 
A
I
 
A
G
 
E
N
 
K
A
 
L
R
 
H
P
 
K
V
 
V
L
 
I
D
 
N
A
 
S
L
 
I
E
 
L
A
 
A
Y
 
F
D
 
R
E
 
E
E
 
K
I
 
E
R
 
K
A
 
Q
R
 
R
S
 
L
D
 
Q
S
 
S
L
 
N
V
 
Q
G
 
L
R
 
K
P
 
P
T
 
G
A
 
A
-
 
V
-
 
T
-
 
S
-
 
V
T
 
N
V
 
L
T
 
T
R
 
M
F
 
L
E
 
E
A
 
G
G
 
G
T
 
V
K
 
A
E
 
Y
N
 
N
V
 
V
V
 
V
P
 
P
E
 
A
S
 
T
A
 
M
T
 
S
I
 
A
T
 
C
V
 
F
D
 
D
R
 
F
R
 
R
F
 
V
V
 
A
P
 
P
A
 
D
E
 
V
T
 
D
V
 
L
E
 
K
E
 
A
V
 
F
D
 
E
A
 
E
E
 
Q
I
 
L
D
 
Q
A
 
S
L
 
W
L
 
C
S
 
Q
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
E
D
 
G
V
 
V
T
 
T
A
 
F
E
 
E
H
 
-
D
 
-
L
 
F
N
 
V
V
 
Q
E
 
K
W
 
W
T
 
M
R
 
E
T
 
T
R
 
Q
V
 
V
Y
 
T
E
 
S
S
 
T
A
 
-
A
 
-
V
 
-
P
 
-
T
 
D
D
 
D
S
 
S
D
 
D
-
 
P
-
 
W
-
 
W
-
 
A
-
 
A
I
 
F
A
 
S
A
 
G
R
 
V
F
 
F
R
 
K
D
 
D
A
 
M
A
 
K
-
 
L
A
 
A
E
 
L
R
 
E
A
 
L
D
 
E
I
 
I
D
 
C
P
 
P
E
 
-
P
 
-
W
 
-
G
 
-
I
 
-
R
 
-
A
 
A
A
 
S
T
 
T
D
 
D
V
 
A
R
 
R
N
 
-
L
 
Y
V
 
I
N
 
R
D
 
A
A
 
A
G
 
G
M
 
V
D
 
P
A
 
A
I
 
L
T
 
G
W
 
F
G
 
S
P
 
P
G
 
M
S
 
N
M
 
H
A
 
T
Q
 
P
A
 
V
-
 
L
-
 
L
H
 
H
A
 
D
Y
 
H
D
 
D
E
 
E
Y
 
R
I
 
L
E
 
H
L
 
E
S
 
A
E
 
V
V
 
F
E
 
L
A
 
R
G
 
G
Y
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
Y
R
 
T
T
 
Q
A
 
L
L
 
L
R
 
S
G
 
A
L
 
L

Sites not aligning to the query:

4op4B Crystal structure of the catalytic domain of dape protein from v.Cholerea in the zn bound form (see paper)
49% identity, 18% coverage: 49:119/385 of query aligns to 45:115/265 of 4op4B

query
sites
4op4B
F
 
F
P
 
E
D
 
D
R
 
T
P
 
T
Q
 
N
V
 
F
A
 
W
A
 
A
R
 
R
V
 
R
G
 
G
D
 
T
G
 
Q
E
 
S
P
 
P
S
 
L
V
 
F
V
 
V
L
 
F
N
 
A
G
 
G
H
|
H
L
 
T
D
 
D
V
 
V
V
 
V
P
 
P
A
 
A
G
 
G
D
 
P
R
 
L
D
 
S
Q
 
Q
W
 
W
T
 
H
H
 
T
P
 
P
P
 
P
Y
 
F
D
 
E
P
 
P
T
 
T
V
 
V
R
 
I
D
 
D
G
 
G
R
 
F
L
 
L
Y
 
H
G
 
G
R
 
R
G
 
G
S
 
A
A
 
A
D
|
D
M
 
M
K
 
K
C
 
G
G
 
S
V
 
L
A
 
A
L
 
C
A
 
M
M
 
I
L
 
V
A
 
A
T
 
V
V
 
E
E
 
R
F
 
F

Sites not aligning to the query:

Q03154 Aminoacylase-1; ACY-1; N-acyl-L-amino-acid amidohydrolase; EC 3.5.1.14 from Homo sapiens (Human) (see 6 papers)
22% identity, 97% coverage: 7:379/385 of query aligns to 14:398/408 of Q03154

query
sites
Q03154
S
 
T
L
 
L
L
 
F
T
 
R
S
 
Q
L
 
Y
V
 
L
E
 
R
I
 
I
E
 
R
T
 
T
E
 
V
N
 
Q
P
 
P
P
 
K
G
 
P
D
 
D
E
 
Y
A
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
V
Q
 
A
F
 
F
V
 
F
S
 
E
D
 
E
W
 
T
L
 
A
D
 
R
S
 
Q
R
 
L
G
 
G
V
 
L
S
 
G
A
 
C
T
 
Q
L
 
K
V
 
V
E
 
E
E
 
V
P
 
A
F
 
P
P
 
G
D
 
Y
R
 
V
P
 
V
Q
 
T
V
 
V
A
 
L
A
 
T
R
 
W
V
 
P
G
 
G
D
 
T
G
 
N
E
 
P
-
 
T
-
 
L
P
 
S
S
 
S
V
 
I
V
 
L
L
 
L
N
 
N
G
 
S
H
|
H
L
 
T
D
 
D
V
 
V
V
 
V
P
 
P
A
 
V
G
 
F
D
 
-
R
 
K
D
 
E
Q
 
H
W
 
W
T
 
S
H
 
H
P
 
D
P
 
P
Y
 
F
D
 
E
P
 
A
T
 
F
V
 
K
-
 
D
R
 
S
D
 
E
G
 
G
R
 
Y
L
 
I
Y
 
Y
G
 
A
R
 
R
G
 
G
S
 
A
A
 
Q
D
|
D
M
 
M
K
 
K
C
 
C
G
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
M
 
-
L
 
-
A
 
V
T
 
S
V
 
I
E
 
Q
F
 
Y
A
 
L
D
 
E
A
 
A
F
 
V
E
 
R
S
 
R
G
 
L
A
 
K
L
 
V
D
 
E
G
 
G
S
 
H
-
 
R
-
 
F
-
 
P
-
 
R
L
 
T
V
 
I
F
 
H
H
 
M
A
 
T
A
 
F
V
 
V
G
 
P
E
 
D
E
|
E
T
x
E
A
 
V
-
 
G
-
 
G
E
 
H
P
 
Q
G
 
G
T
 
M
K
 
E
T
 
L
L
 
F
L
 
V
E
 
Q
R
 
R
-
 
P
-
 
E
-
 
F
-
 
H
-
 
A
-
 
L
-
 
R
-
 
A
G
 
G
Y
 
F
D
 
A
G
 
L
T
 
D
Y
x
E
G
 
G
V
 
I
V
 
A
L
 
N
E
 
P
P
 
T
T
 
D
A
 
A
L
 
F
R
 
T
T
 
V
A
 
F
T
 
Y
S
 
S
A
 
E
K
 
R
G
 
S
L
 
P
G
 
W
W
 
W
Y
 
V
E
x
R
I
 
V
S
 
T
V
 
S
G
 
T
G
 
G
D
 
R
P
 
P
S
 
G
H
|
H
A
 
A
S
 
S
R
 
R
P
 
F
D
 
M
E
 
E
G
 
-
D
 
D
N
 
T
A
 
A
I
 
A
G
 
E
N
 
K
A
 
L
R
 
H
P
 
K
V
 
V
L
 
V
D
 
N
A
 
S
L
 
I
E
 
L
A
 
A
Y
 
F
D
 
R
E
 
E
E
 
K
-
x
E
-
 
W
I
 
Q
R
 
R
A
 
L
R
 
Q
S
 
S
D
 
N
S
 
P
L
 
H
V
 
L
G
 
K
R
 
E
P
 
G
T
 
S
A
 
V
T
 
T
-
 
S
-
 
V
-
 
N
V
 
L
T
 
T
R
 
K
F
 
L
E
 
E
A
 
G
G
 
G
T
 
V
K
 
A
E
 
Y
N
 
N
V
 
V
V
 
I
P
 
P
E
 
A
S
 
T
A
 
M
T
 
S
I
 
A
T
 
S
V
 
F
D
 
D
R
 
F
R
 
R
F
 
V
V
 
A
P
 
P
A
 
D
E
 
V
T
 
D
V
 
F
E
 
K
E
 
A
V
 
F
D
 
E
A
 
E
E
 
Q
I
 
L
D
 
Q
A
 
S
L
 
W
L
 
C
S
 
Q
D
 
-
V
 
-
T
 
A
A
 
A
E
 
G
H
 
E
D
 
G
L
 
V
N
 
T
V
 
L
E
 
E
W
 
F
T
 
A
R
 
Q
T
 
K
R
 
W
V
 
M
Y
 
H
E
 
P
S
 
Q
A
 
V
A
 
T
V
 
P
P
 
T
T
 
D
D
 
D
S
 
S
D
 
N
I
 
P
A
 
W
A
 
W
R
 
A
F
 
A
R
 
F
D
 
S
A
 
R
A
 
V
A
 
C
E
 
K
R
 
D
A
 
M
D
 
N
I
 
L
D
 
T
P
 
L
E
 
E
P
 
P
W
 
E
G
 
I
I
 
M
R
 
P
A
 
A
A
 
A
T
 
T
D
 
D
V
 
N
R
 
R
N
 
-
L
 
Y
V
 
I
N
x
R
D
 
A
A
 
V
G
 
G
M
 
V
D
 
P
A
 
A
I
 
L
T
 
G
W
 
F
G
 
S
P
 
P
G
 
M
S
 
N
M
 
R
A
 
T
Q
 
P
A
 
V
-
 
L
-
 
L
H
|
H
A
 
D
Y
 
H
D
 
D
E
 
E
Y
x
R
I
 
L
E
 
H
L
x
E
S
 
A
E
 
V
V
 
F
E
 
L
A
x
R
G
 
G
Y
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
Y
R
 
T
T
 
R
A
 
L
L
 
L
R
 
P
G
 
A
L
 
L

5k8oB Mn2+/5nsa-bound 5-nitroanthranilate aminohydrolase (see paper)
24% identity, 77% coverage: 1:298/385 of query aligns to 14:342/425 of 5k8oB

query
sites
5k8oB
M
 
L
D
 
D
E
 
G
E
 
M
L
 
R
R
 
E
S
 
G
L
 
L
L
 
I
T
 
Q
S
 
T
L
 
A
V
 
V
E
 
E
I
 
L
-
 
G
E
 
S
T
 
I
E
 
E
N
 
A
P
 
P
P
 
T
G
 
G
D
 
R
E
 
E
A
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
G
Q
 
D
F
 
Y
V
 
V
S
 
Y
D
 
E
W
 
W
L
 
M
D
 
A
S
 
R
R
 
N
G
 
G
V
 
F
S
 
G
A
 
P
T
 
E
L
 
R
V
 
V
E
 
G
E
 
V
P
 
-
F
 
F
P
 
D
D
 
D
R
 
R
P
 
F
Q
 
N
V
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
R
V
 
L
-
 
R
-
 
G
G
 
T
D
 
G
G
 
G
E
 
G
P
 
A
S
 
S
V
 
L
V
 
S
L
 
F
N
 
N
G
 
S
H
|
H
L
 
L
D
 
D
V
 
T
V
x
I
P
 
M
A
 
A
G
 
R
D
 
E
-
 
D
-
 
T
-
 
A
-
 
R
-
 
F
-
 
A
-
 
D
-
 
A
R
 
N
D
 
D
Q
 
R
W
 
I
T
 
Y
H
 
H
P
 
E
P
 
A
Y
 
W
D
 
H
P
 
-
T
 
-
V
 
-
R
 
E
D
 
E
G
 
G
R
 
R
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
R
 
Y
G
 
S
S
 
V
A
 
V
D
x
N
M
 
C
K
 
K
C
 
G
G
 
P
V
 
M
A
 
A
L
 
C
A
 
W
M
 
L
L
 
I
A
 
A
T
 
A
V
 
K
E
 
A
F
 
L
A
 
K
D
 
E
A
 
A
F
 
-
E
 
-
S
 
G
G
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
K
G
 
G
S
 
D
L
 
V
V
 
V
F
 
L
H
 
T
A
 
A
A
 
V
V
 
C
G
 
G
E
|
E
E
 
I
T
 
D
A
 
C
E
 
E
P
 
P
-
 
V
-
 
D
-
 
E
-
 
F
-
 
Q
-
 
G
-
 
H
-
 
D
-
 
Y
-
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
D
-
 
I
G
 
G
T
 
A
K
 
R
T
 
Y
L
 
A
L
 
I
E
 
S
R
 
H
G
 
G
Y
 
A
D
 
I
G
 
S
T
 
D
Y
 
Y
G
 
A
V
 
L
V
 
V
L
 
A
E
|
E
P
 
A
T
 
T
A
 
N
L
 
F
R
 
K
T
 
P
A
 
A
T
 
W
S
 
V
A
 
E
K
 
A
G
 
G
L
 
K
G
 
V
W
 
F
Y
 
L
E
 
K
I
 
V
S
 
T
V
 
V
G
 
F
G
 
A
D
 
G
P
 
P
S
 
S
-
 
R
-
x
Y
-
 
T
-
 
P
H
 
Y
A
 
V
S
 
P
R
 
R
P
 
P
D
 
V
-
 
A
-
 
A
-
 
L
E
 
D
G
 
S
D
 
P
N
 
N
A
 
A
I
 
I
G
 
V
N
 
R
A
 
M
R
 
A
P
 
K
V
 
L
L
 
V
D
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
E
Y
 
W
D
 
A
E
 
D
E
 
N
I
 
Y
R
 
E
A
 
K
R
 
R
S
 
Y
D
 
T
S
 
R
L
 
E
V
 
Y
G
 
G
-
 
G
-
 
G
-
 
T
-
 
V
R
 
V
P
 
P
T
 
K
A
 
V
T
 
A
V
 
I
T
 
G
R
 
A
F
 
I
E
 
R
A
 
G
G
 
G
T
 
V
K
 
P
E
 
Y
N
 
K
V
 
I
-
x
Y
-
x
R
V
 
F
P
 
P
E
 
E
S
 
L
A
 
C
T
 
S
I
 
I
T
 
Y
V
 
M
D
 
D
R
 
I
R
 
R
F
 
L
V
 
N
P
 
P
A
 
D
E
 
T
T
 
N
V
 
P
E
 
L
E
 
V
V
 
V
D
 
Q
A
 
R
E
 
E
I
 
V
D
 
E
A
 
A
L
 
V
L
 
V
S
 
S
D
 
K
V
 
L
T
 
G
A
 
L
E
 
K
H
 
A
D
 
E
L
 
V
N
 
K
V
 
P
E
 
F
W
 
L
T
 
F
R
 
R
T
 
-
R
 
R
V
 
G
Y
 
Y
E
 
E
S
 
A
A
 
Q
A
 
G
V
 
I

Sites not aligning to the query:

5k8pA Zn2+/tetrahedral intermediate-bound r289a 5-nitroanthranilate aminohydrolase (see paper)
24% identity, 77% coverage: 1:298/385 of query aligns to 10:338/421 of 5k8pA

query
sites
5k8pA
M
 
L
D
 
D
E
 
G
E
 
M
L
 
R
R
 
E
S
 
G
L
 
L
L
 
I
T
 
Q
S
 
T
L
 
A
V
 
V
E
 
E
I
 
L
-
 
G
E
 
S
T
 
I
E
 
E
N
 
A
P
 
P
P
 
T
G
 
G
D
 
R
E
 
E
A
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
G
Q
 
D
F
 
Y
V
 
V
S
 
Y
D
 
E
W
 
W
L
 
M
D
 
A
S
 
R
R
 
N
G
 
G
V
 
F
S
 
G
A
 
P
T
 
E
L
 
R
V
 
V
E
 
G
E
 
V
P
 
-
F
 
F
P
 
D
D
 
D
R
 
R
P
 
F
Q
 
N
V
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
R
V
 
L
-
 
R
-
 
G
G
 
T
D
 
G
G
 
G
E
 
G
P
 
A
S
 
S
V
 
L
V
 
S
L
 
F
N
 
N
G
 
S
H
|
H
L
 
L
D
 
D
V
 
T
V
x
I
P
 
M
A
 
A
G
 
R
D
 
E
-
 
D
-
 
T
-
 
A
-
 
R
-
 
F
-
 
A
-
 
D
-
 
A
R
 
N
D
 
D
Q
 
R
W
 
I
T
 
Y
H
 
H
P
 
E
P
 
A
Y
 
W
D
 
H
P
 
-
T
 
-
V
 
-
R
 
E
D
 
E
G
 
G
R
 
R
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
R
 
Y
G
 
S
S
 
V
A
 
V
D
x
N
M
 
C
K
 
K
C
 
G
G
 
P
V
 
M
A
 
A
L
 
C
A
 
W
M
 
L
L
 
I
A
 
A
T
 
A
V
 
K
E
 
A
F
 
L
A
 
K
D
 
E
A
 
A
F
 
-
E
 
-
S
 
G
G
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
K
G
 
G
S
 
D
L
 
V
V
 
V
F
 
L
H
 
T
A
 
A
A
 
V
V
 
C
G
 
G
E
|
E
E
 
I
T
 
D
A
 
C
E
 
E
P
 
P
-
 
V
-
 
D
-
 
E
-
 
F
-
 
Q
-
 
G
-
 
H
-
 
D
-
 
Y
-
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
D
-
 
I
G
 
G
T
 
A
K
 
R
T
 
Y
L
 
A
L
 
I
E
 
S
R
 
H
G
 
G
Y
 
A
D
 
I
G
 
S
T
 
D
Y
 
Y
G
 
A
V
 
L
V
 
V
L
 
A
E
|
E
P
 
A
T
 
T
A
 
N
L
 
F
R
 
K
T
 
P
A
 
A
T
 
W
S
 
V
A
 
E
K
 
A
G
 
G
L
 
K
G
 
V
W
 
F
Y
 
L
E
 
K
I
 
V
S
 
T
V
 
V
G
 
F
G
 
A
D
 
G
P
 
P
S
 
S
-
 
R
-
 
Y
-
 
T
-
 
P
H
 
Y
A
 
V
S
 
P
R
 
R
P
 
P
D
 
V
-
 
A
-
 
A
-
 
L
E
 
D
G
 
S
D
 
P
N
 
N
A
 
A
I
 
I
G
 
V
N
 
R
A
 
M
R
 
A
P
 
K
V
 
L
L
 
V
D
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
E
Y
 
W
D
 
A
E
 
D
E
 
N
I
 
Y
R
 
E
A
 
K
R
 
R
S
 
Y
D
 
T
S
 
R
L
 
E
V
 
Y
G
 
G
-
 
G
-
 
G
-
 
T
-
 
V
R
 
V
P
 
P
T
 
K
A
 
V
T
 
A
V
 
I
T
 
G
R
 
A
F
 
I
E
 
R
A
 
G
G
 
G
T
 
V
K
 
P
E
 
Y
N
 
K
V
 
I
-
 
Y
-
 
A
V
 
F
P
 
P
E
 
E
S
 
L
A
 
C
T
 
S
I
 
I
T
 
Y
V
 
M
D
 
D
R
 
I
R
 
R
F
 
L
V
 
N
P
 
P
A
 
D
E
 
T
T
 
N
V
 
P
E
 
L
E
 
V
V
 
V
D
 
Q
A
 
R
E
 
E
I
 
V
D
 
E
A
 
A
L
 
V
L
 
V
S
 
S
D
 
K
V
 
L
T
 
G
A
 
L
E
 
K
H
 
A
D
 
E
L
 
V
N
 
K
V
 
P
E
 
F
W
 
L
T
 
F
R
 
R
T
 
-
R
 
R
V
 
G
Y
 
Y
E
 
E
S
 
A
A
 
Q
A
 
G
V
 
I

Sites not aligning to the query:

5k8nA 5naa-bound 5-nitroanthranilate aminohydrolase (see paper)
24% identity, 77% coverage: 1:298/385 of query aligns to 9:337/420 of 5k8nA

query
sites
5k8nA
M
 
L
D
 
D
E
 
G
E
 
M
L
 
R
R
 
E
S
 
G
L
 
L
L
 
I
T
 
Q
S
 
T
L
 
A
V
 
V
E
 
E
I
 
L
-
 
G
E
 
S
T
 
I
E
 
E
N
 
A
P
 
P
P
 
T
G
 
G
D
 
R
E
 
E
A
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
G
Q
 
D
F
 
Y
V
 
V
S
 
Y
D
 
E
W
 
W
L
 
M
D
 
A
S
 
R
R
 
N
G
 
G
V
 
F
S
 
G
A
 
P
T
 
E
L
 
R
V
 
V
E
 
G
E
 
V
P
 
-
F
 
F
P
 
D
D
 
D
R
 
R
P
 
F
Q
 
N
V
 
V
A
 
V
A
 
G
R
 
R
V
 
L
-
 
R
-
 
G
G
 
T
D
 
G
G
 
G
E
 
G
P
 
A
S
 
S
V
 
L
V
 
S
L
 
F
N
 
N
G
 
S
H
 
H
L
 
L
D
 
D
V
 
T
V
x
I
P
 
M
A
 
A
G
 
R
D
 
E
-
 
D
-
 
T
-
 
A
-
 
R
-
 
F
-
 
A
-
 
D
-
 
A
R
 
N
D
 
D
Q
 
R
W
 
I
T
 
Y
H
 
H
P
 
E
P
 
A
Y
 
W
D
 
H
P
 
-
T
 
-
V
 
-
R
 
E
D
 
E
G
 
G
R
 
R
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
R
 
Y
G
 
S
S
 
V
A
 
V
D
 
N
M
 
C
K
 
K
C
 
G
G
 
P
V
 
M
A
 
A
L
 
C
A
 
W
M
 
L
L
 
I
A
 
A
T
 
A
V
 
K
E
 
A
F
 
L
A
 
K
D
 
E
A
 
A
F
 
-
E
 
-
S
 
G
G
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
K
G
 
G
S
 
D
L
 
V
V
 
V
F
 
L
H
 
T
A
 
A
A
 
V
V
 
C
G
 
G
E
 
E
E
 
I
T
 
D
A
 
C
E
 
E
P
 
P
-
 
V
-
 
D
-
 
E
-
 
F
-
 
Q
-
 
G
-
 
H
-
 
D
-
 
Y
-
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
D
-
 
I
G
 
G
T
 
A
K
 
R
T
 
Y
L
 
A
L
 
I
E
 
S
R
 
H
G
 
G
Y
 
A
D
 
I
G
 
S
T
 
D
Y
 
Y
G
 
A
V
 
L
V
 
V
L
 
A
E
 
E
P
 
A
T
 
T
A
 
N
L
 
F
R
 
K
T
 
P
A
 
A
T
 
W
S
 
V
A
 
E
K
 
A
G
 
G
L
 
K
G
 
V
W
 
F
Y
 
L
E
 
K
I
 
V
S
 
T
V
 
V
G
 
F
G
 
A
D
 
G
P
 
P
S
 
S
-
 
R
-
x
Y
-
 
T
-
 
P
H
 
Y
A
 
V
S
 
P
R
 
R
P
 
P
D
 
V
-
 
A
-
 
A
-
 
L
E
 
D
G
 
S
D
 
P
N
 
N
A
 
A
I
 
I
G
 
V
N
 
R
A
 
M
R
 
A
P
 
K
V
 
L
L
 
V
D
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
E
Y
 
W
D
 
A
E
 
D
E
 
N
I
 
Y
R
 
E
A
 
K
R
 
R
S
 
Y
D
 
T
S
 
R
L
 
E
V
 
Y
G
 
G
-
 
G
-
 
G
-
 
T
-
 
V
R
 
V
P
 
P
T
 
K
A
 
V
T
 
A
V
 
I
T
 
G
R
 
A
F
 
I
E
 
R
A
 
G
G
 
G
T
 
V
K
 
P
E
 
Y
N
 
K
V
 
I
-
x
Y
-
 
R
V
 
F
P
 
P
E
 
E
S
 
L
A
 
C
T
 
S
I
 
I
T
 
Y
V
 
M
D
 
D
R
 
I
R
 
R
F
 
L
V
 
N
P
 
P
A
 
D
E
 
T
T
 
N
V
 
P
E
 
L
E
 
V
V
 
V
D
 
Q
A
 
R
E
 
E
I
 
V
D
 
E
A
 
A
L
 
V
L
 
V
S
 
S
D
 
K
V
 
L
T
 
G
A
 
L
E
 
K
H
 
A
D
 
E
L
 
V
N
 
K
V
 
P
E
 
F
W
 
L
T
 
F
R
 
R
T
 
-
R
 
R
V
 
G
Y
 
Y
E
 
E
S
 
A
A
 
Q
A
 
G
V
 
I

Sites not aligning to the query:

Q8P8J5 N-acetyl-L-citrulline deacetylase; ACDase; Acetylcitrulline deacetylase; EC 3.5.1.- from Xanthomonas campestris pv. campestris (strain ATCC 33913 / DSM 3586 / NCPPB 528 / LMG 568 / P 25) (see paper)
27% identity, 93% coverage: 9:366/385 of query aligns to 12:352/366 of Q8P8J5

query
sites
Q8P8J5
L
 
L
T
 
E
S
 
T
L
 
L
V
 
V
E
 
S
I
 
F
E
 
D
T
 
T
E
 
R
N
 
N
P
 
P
P
 
P
G
 
-
D
 
R
E
 
A
A
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
E
Q
 
G
F
 
G
V
 
I
S
 
F
D
 
D
W
 
Y
L
 
L
D
 
R
S
 
A
R
 
Q
-
 
L
-
 
P
G
 
G
V
 
F
S
 
Q
A
 
V
T
 
E
L
 
V
V
 
I
E
 
D
E
 
H
P
 
G
F
 
D
P
 
G
D
 
A
R
 
V
P
 
S
Q
 
L
V
 
Y
A
 
A
A
 
V
R
 
R
V
 
-
G
 
-
D
 
-
G
 
G
E
 
T
P
 
P
S
 
K
V
 
Y
V
 
L
L
 
F
N
 
N
G
 
V
H
|
H
L
 
L
D
 
D
V
 
T
V
 
V
P
 
P
A
 
-
G
 
-
D
 
D
R
 
S
D
 
P
Q
 
H
W
 
W
T
 
S
H
 
A
P
 
D
P
 
P
Y
 
H
D
 
V
P
 
M
T
 
R
V
 
R
R
 
T
D
 
E
G
 
D
R
 
R
L
 
V
Y
 
I
G
 
G
R
 
L
G
 
G
S
 
V
A
 
C
D
|
D
M
 
I
K
 
K
C
 
G
G
 
A
V
 
A
A
 
A
L
 
A
A
 
L
M
 
V
L
 
A
A
 
A
T
 
A
V
 
N
E
 
A
F
 
G
A
 
D
D
 
G
A
 
-
F
 
-
E
 
-
S
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
D
 
-
G
 
-
S
 
D
L
 
A
V
 
A
F
 
F
H
 
L
A
 
F
A
 
S
V
 
S
G
 
D
E
 
E
E
 
E
T
 
A
A
 
N
E
 
D
P
 
P
-
 
R
G
 
C
T
 
I
K
 
A
T
 
A
L
 
F
L
 
L
E
 
A
R
 
R
G
 
G
Y
 
L
D
 
P
G
 
Y
T
 
D
Y
 
A
G
 
V
V
 
L
V
 
V
L
 
A
E
|
E
P
 
P
T
 
T
A
 
M
L
 
S
R
 
E
T
 
A
A
 
V
T
 
L
S
 
A
A
 
H
K
 
R
G
 
G
L
 
I
G
 
S
W
 
S
Y
 
V
E
 
L
I
 
M
S
 
R
V
 
F
G
 
A
G
 
G
D
 
R
P
 
A
S
 
G
H
 
H
A
 
A
S
 
S
-
 
G
R
 
K
P
 
Q
D
 
D
E
 
P
G
 
A
D
 
A
N
 
S
A
 
A
I
 
L
G
 
H
N
 
Q
A
 
A
-
 
M
R
 
R
P
 
W
V
 
G
L
 
G
D
 
K
A
 
A
L
 
L
E
 
D
A
 
H
Y
 
V
D
 
E
E
 
S
E
 
L
I
 
A
R
 
H
A
 
A
R
 
R
S
 
F
D
 
G
S
 
G
L
 
L
V
 
T
G
 
G
R
 
L
P
 
-
T
 
R
A
 
F
T
 
N
V
 
I
T
 
G
R
 
R
F
 
V
E
 
D
A
 
G
G
 
G
T
 
I
K
 
K
E
 
A
N
 
N
V
 
M
V
 
I
P
 
A
E
 
P
S
 
A
A
 
A
T
 
E
I
 
L
T
 
R
V
 
F
D
 
G
R
 
F
R
 
R
F
 
P
V
 
L
P
 
P
A
 
S
E
 
M
T
 
D
V
 
V
E
 
D
E
 
G
V
 
L
D
 
L
A
 
A
E
 
T
I
 
F
D
 
-
A
 
A
L
 
G
L
 
F
S
 
A
D
 
D
V
 
P
T
 
A
A
 
A
E
 
A
H
 
H
D
 
-
L
 
-
N
 
-
V
 
F
E
 
E
W
 
E
T
 
T
R
 
-
T
 
-
R
 
-
V
 
-
Y
 
F
E
 
R
S
 
G
A
 
P
A
 
S
V
 
L
P
 
P
T
 
S
-
 
G
D
 
D
S
 
I
D
 
A
I
 
R
A
 
A
A
 
E
R
 
E
F
 
R
R
 
R
D
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
R
E
 
D
R
 
V
A
 
A
D
 
D
I
 
A
D
 
L
P
 
D
E
 
L
P
 
P
W
 
I
G
 
G
I
 
-
R
 
-
A
 
N
A
 
A
T
 
V
D
 
D
V
 
F
-
 
W
-
 
T
-
 
E
R
 
A
N
 
S
L
 
L
V
 
F
N
 
S
D
 
A
A
 
G
G
 
G
M
 
Y
D
 
T
A
 
A
I
 
L
T
 
V
W
 
Y
G
 
G
P
 
P
G
 
G
S
 
D
M
 
I
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
H
 
H
A
 
T
Y
 
A
D
 
D
E
 
E
Y
 
F
I
 
V
E
 
T
L
 
L
S
 
A
E
 
Q
V
 
L
E
 
Q

2f7vA Structure of acetylcitrulline deacetylase complexed with one co (see paper)
26% identity, 93% coverage: 9:366/385 of query aligns to 13:347/360 of 2f7vA

query
sites
2f7vA
L
 
L
T
 
E
S
 
T
L
 
L
V
 
V
E
 
S
I
 
F
E
 
D
T
 
T
E
 
R
N
 
N
P
 
P
P
 
P
G
 
R
D
 
A
E
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
E
A
 
G
Q
 
G
F
 
-
V
 
I
S
 
F
D
 
D
W
 
Y
L
 
L
D
 
R
S
 
A
R
 
Q
-
 
L
-
 
P
G
 
G
V
 
F
S
 
Q
A
 
V
T
 
E
L
 
V
V
 
I
E
 
D
E
 
H
P
 
G
F
 
D
P
 
G
D
 
A
R
 
V
P
 
S
Q
 
L
V
 
Y
A
 
A
A
 
V
R
 
R
V
 
-
G
 
-
D
 
-
G
 
G
E
 
T
P
 
P
S
 
K
V
 
Y
V
 
L
L
 
F
N
 
N
G
 
V
H
|
H
L
 
L
D
 
D
V
 
T
V
 
V
P
 
P
A
 
-
G
 
-
D
 
D
R
 
S
D
 
P
Q
 
H
W
 
W
T
 
S
H
 
A
P
 
D
P
 
P
Y
 
H
D
 
V
P
 
M
T
 
R
V
 
R
R
 
T
D
 
E
G
 
D
R
 
R
L
 
V
Y
 
I
G
 
G
R
 
L
G
 
G
S
 
V
A
 
C
D
|
D
M
 
I
K
 
K
C
 
G
G
 
A
V
 
A
A
 
A
L
 
A
A
 
L
M
 
V
L
 
A
A
 
A
T
 
A
V
 
N
E
 
A
F
 
G
A
 
D
D
 
G
A
 
-
F
 
-
E
 
-
S
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
D
 
-
G
 
-
S
 
D
L
 
A
V
 
A
F
 
F
H
 
L
A
 
F
A
 
S
V
 
S
G
 
D
E
|
E
E
 
E
T
 
A
A
 
N
E
 
D
P
 
P
-
 
R
G
 
C
T
 
I
K
 
A
T
 
A
L
 
F
L
 
L
E
 
A
R
 
R
G
 
G
Y
 
L
D
 
P
G
 
Y
T
 
D
Y
 
A
G
 
V
V
 
L
V
 
V
L
 
A
E
|
E
P
 
P
T
 
T
A
 
M
L
 
S
R
 
E
T
 
A
A
 
V
T
 
L
S
 
A
A
 
H
K
 
R
G
 
G
L
 
I
G
 
S
W
 
S
Y
 
V
E
 
L
I
 
M
S
 
R
V
 
F
G
 
A
G
 
G
D
 
R
P
 
A
S
 
G
H
 
-
A
 
-
S
 
-
R
 
-
P
 
-
D
 
D
E
 
P
G
 
A
D
 
A
N
 
S
A
 
A
I
 
L
G
 
H
N
 
Q
A
 
A
-
 
M
R
 
R
P
 
W
V
 
G
L
 
G
D
 
K
A
 
A
L
 
L
E
 
D
A
 
H
Y
 
V
D
 
E
E
 
S
E
 
L
I
 
A
R
 
H
A
 
A
R
 
R
S
 
F
D
 
G
S
 
G
L
 
L
V
 
T
G
 
G
R
 
L
P
 
-
T
 
R
A
 
F
T
 
N
V
 
I
T
 
G
R
 
R
F
 
V
E
 
D
A
 
G
G
 
G
T
 
I
K
 
K
E
 
A
N
 
N
V
 
M
V
 
I
P
 
A
E
 
P
S
 
A
A
 
A
T
 
E
I
 
L
T
 
R
V
 
F
D
 
G
R
 
F
R
 
R
F
 
P
V
 
L
P
 
P
A
 
S
E
 
M
T
 
D
V
 
V
E
 
D
E
 
G
V
 
L
D
 
L
A
 
A
E
 
T
I
 
F
D
 
-
A
 
A
L
 
G
L
 
F
S
 
A
D
 
D
V
 
P
T
 
A
A
 
A
E
 
A
H
 
H
D
 
-
L
 
-
N
 
-
V
 
F
E
 
E
W
 
E
T
 
T
R
 
-
T
 
-
R
 
-
V
 
-
Y
 
F
E
 
R
S
 
G
A
 
P
A
 
S
V
 
L
P
 
P
T
 
S
-
 
G
D
 
D
S
 
I
D
 
A
I
 
R
A
 
A
A
 
E
R
 
E
F
 
R
R
 
R
D
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
R
E
 
D
R
 
V
A
 
A
D
 
D
I
 
A
D
 
L
P
 
D
E
 
L
P
 
P
W
 
I
G
 
G
I
 
-
R
 
-
A
 
N
A
 
A
T
 
V
D
 
D
V
 
F
-
 
W
-
 
T
-
 
E
R
 
A
N
 
S
L
 
L
V
 
F
N
 
S
D
 
A
A
 
G
G
 
G
M
 
Y
D
 
T
A
 
A
I
 
L
T
 
V
W
 
Y
G
 
G
P
 
P
G
 
G
S
 
D
M
 
I
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
H
 
H
A
 
T
Y
 
A
D
 
D
E
 
E
Y
 
F
I
 
V
E
 
T
L
 
L
S
 
A
E
 
Q
V
 
L
E
 
Q

Q96KP4 Cytosolic non-specific dipeptidase; CNDP dipeptidase 2; Glutamate carboxypeptidase-like protein 1; Peptidase A; Threonyl dipeptidase; EC 3.4.13.18 from Homo sapiens (Human)
45% identity, 17% coverage: 46:110/385 of query aligns to 74:138/475 of Q96KP4

query
sites
Q96KP4
E
 
E
E
 
I
P
 
P
F
 
L
P
 
P
D
 
-
R
 
-
P
 
P
Q
 
I
V
 
L
A
 
L
A
 
G
R
 
R
V
 
L
G
 
G
D
 
S
-
 
D
-
 
P
G
 
Q
E
 
K
P
 
K
S
 
T
V
 
V
V
 
C
L
 
I
N
 
Y
G
 
G
H
|
H
L
 
L
D
 
D
V
 
V
V
 
Q
P
 
P
A
 
A
G
 
A
D
 
L
R
 
E
D
 
D
Q
 
G
W
 
W
T
 
D
H
 
S
P
 
E
P
 
P
Y
 
F
D
 
T
P
 
L
T
 
V
V
 
E
R
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
K
L
 
L
Y
|
Y
G
 
G
R
 
R
G
 
G
S
 
S
A
 
T
D
|
D
M
 
D
K
 
K
C
 
G
G
 
P
V
 
V
A
 
A

Sites not aligning to the query:

5xoyA Crystal structure of lysk from thermus thermophilus in complex with lysine (see paper)
25% identity, 95% coverage: 15:379/385 of query aligns to 11:337/341 of 5xoyA

query
sites
5xoyA
I
 
L
E
 
E
T
 
I
E
 
P
N
 
S
P
 
P
P
 
S
G
 
G
D
 
K
E
 
E
A
 
R
A
 
L
A
 
V
A
 
A
Q
 
E
F
 
Y
V
 
L
S
 
A
D
 
E
W
 
G
L
 
M
D
 
Q
S
 
K
R
 
L
G
 
G
V
 
L
S
 
K
A
 
G
T
 
-
L
 
F
V
 
V
E
 
D
E
 
E
P
 
A
F
 
D
P
 
N
D
 
A
R
 
R
P
 
G
Q
 
Q
V
 
V
A
 
-
A
 
-
R
 
-
V
 
-
G
 
G
D
 
E
G
 
G
E
 
P
P
 
V
S
 
Q
V
 
V
V
 
V
L
 
L
N
 
L
G
 
G
H
 
H
L
 
I
D
 
D
V
 
T
V
 
V
P
 
P
A
 
G
G
 
Q
D
 
I
R
 
P
D
 
V
Q
 
R
W
 
-
T
 
-
H
 
-
P
 
-
P
 
-
Y
 
-
D
 
-
P
 
-
T
 
-
V
 
L
R
 
E
D
 
G
G
 
G
R
 
R
L
 
L
Y
 
F
G
 
G
R
 
R
G
 
G
S
 
A
A
 
V
D
 
D
M
 
A
K
 
K
C
 
-
G
 
G
V
 
P
A
 
F
L
 
V
A
 
A
M
 
M
L
 
I
A
 
-
T
 
-
V
 
-
E
 
-
F
 
F
A
 
A
D
 
A
A
 
A
F
 
G
E
 
L
S
 
S
G
 
E
A
 
E
L
 
A
D
 
R
G
 
K
S
 
R
L
 
L
V
 
T
F
 
V
H
 
H
A
 
L
A
 
V
V
 
G
G
 
A
E
 
T
E
 
E
T
x
E
A
 
E
E
 
A
P
 
P
G
 
S
T
x
S
K
 
K
-
 
G
-
 
A
T
 
R
L
 
F
L
 
V
E
 
A
R
 
P
G
 
R
Y
 
L
D
 
K
G
 
P
T
 
H
Y
 
Y
G
 
A
V
 
V
V
 
I
L
 
G
E
 
E
P
 
P
T
 
S
A
 
-
L
 
-
R
 
-
T
 
-
A
 
-
T
 
-
S
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
G
W
 
W
Y
 
E
E
 
G
I
 
I
S
 
T
V
 
L
G
 
G
G
 
Y
D
 
K
P
 
G
S
 
R
H
 
L
A
 
L
S
 
V
R
 
K
P
 
A
D
 
R
E
 
R
G
 
E
D
 
K
N
 
D
A
 
H
I
 
E
G
 
P
N
 
N
A
 
A
R
 
-
P
 
-
V
 
-
L
 
A
D
 
E
A
 
E
L
 
L
E
 
I
A
 
S
Y
 
Y
D
 
F
E
 
V
E
 
A
I
 
I
R
 
K
A
 
A
R
 
W
S
 
A
D
 
E
S
 
A
L
 
M
-
 
N
V
 
V
G
 
G
-
 
Q
R
 
R
P
 
P
-
 
F
-
 
D
-
 
Q
-
 
V
T
 
Q
A
 
Y
T
 
T
V
 
L
T
 
R
R
 
D
F
 
F
E
 
R
A
 
V
G
 
H
T
 
P
K
 
R
E
 
-
N
 
-
V
 
-
V
 
-
P
 
-
E
 
Q
S
 
V
A
 
A
T
 
E
I
 
M
T
 
F
V
 
F
D
 
D
R
 
L
R
|
R
F
 
L
V
 
P
P
 
P
A
 
R
E
 
L
T
 
P
V
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
A
D
 
I
A
 
R
E
 
H
I
 
L
D
 
T
A
 
A
L
 
-
L
 
Y
S
 
A
D
 
P
V
 
P
T
 
T
A
 
I
E
 
E
H
 
L
D
 
E
L
 
F
N
 
-
V
 
-
E
 
-
W
 
F
T
 
G
R
 
R
T
 
E
R
 
V
V
 
P
Y
 
Y
E
 
Q
S
 
G
A
 
-
A
 
-
V
 
-
P
 
P
T
 
K
D
 
D
S
 
T
D
 
P
I
 
L
A
 
T
A
 
R
R
 
A
F
 
F
R
 
R
D
 
Q
A
 
-
A
 
A
A
 
I
E
 
R
R
 
K
A
 
A
D
 
G
I
 
G
D
 
R
P
 
P
E
 
V
P
 
F
W
 
K
G
 
L
I
 
K
R
 
T
A
 
G
A
x
T
T
 
S
D
 
D
V
 
M
R
 
N
N
 
V
L
 
L
V
 
A
N
 
P
D
 
H
A
 
W
G
 
P
M
 
V
D
 
P
A
 
M
I
 
V
T
 
A
W
 
Y
G
 
G
P
 
P
G
 
G
S
 
D
M
 
S
A
 
T
Q
 
L
A
 
D
H
 
H
A
 
T
Y
 
P
D
 
Y
E
 
E
Y
 
H
I
 
V
E
 
E
L
 
V
S
 
A
E
 
E
V
 
F
E
 
L
A
 
K
G
 
G
Y
 
I
D
 
E
I
 
V
L
 
L
R
 
R
T
 
G
A
 
A
L
 
L
R
 
E
G
 
A
L
 
L

Query Sequence

>WP_004041151.1 NCBI__GCF_000337315.1:WP_004041151.1
MDEELRSLLTSLVEIETENPPGDEAAAAQFVSDWLDSRGVSATLVEEPFPDRPQVAARVG
DGEPSVVLNGHLDVVPAGDRDQWTHPPYDPTVRDGRLYGRGSADMKCGVALAMLATVEFA
DAFESGALDGSLVFHAAVGEETAEPGTKTLLERGYDGTYGVVLEPTALRTATSAKGLGWY
EISVGGDPSHASRPDEGDNAIGNARPVLDALEAYDEEIRARSDSLVGRPTATVTRFEAGT
KENVVPESATITVDRRFVPAETVEEVDAEIDALLSDVTAEHDLNVEWTRTRVYESAAVPT
DSDIAARFRDAAAERADIDPEPWGIRAATDVRNLVNDAGMDAITWGPGSMAQAHAYDEYI
ELSEVEAGYDILRTALRGLFEAGAD

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory