SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_004045322.1 NCBI__GCF_000337315.1:WP_004045322.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 13 hits to proteins with known functional sites (download)

1gpmA Escherichia coli gmp synthetase complexed with amp and pyrophosphate (see paper)
31% identity, 81% coverage: 3:193/237 of query aligns to 5:198/501 of 1gpmA

query
sites
1gpmA
R
 
K
P
 
H
R
 
R
L
 
I
A
 
L
F
 
I
L
 
L
D
 
D
A
 
F
S
 
G
H
 
S
G
 
Q
D
 
Y
S
 
T
S
 
Q
T
 
L
S
 
V
R
 
A
N
 
R
F
 
R
R
 
V
R
 
R
E
 
E
L
 
L
D
 
G
-
 
V
-
 
Y
A
 
C
D
 
E
L
 
L
V
 
W
E
 
A
F
 
W
D
 
D
V
 
V
T
 
T
D
 
E
G
 
A
R
 
Q
L
 
I
P
 
R
D
 
D
H
 
-
F
 
F
D
 
N
Y
 
P
D
 
S
G
 
G
V
 
I
V
 
I
I
 
L
S
 
S
G
 
G
S
x
G
-
 
P
S
 
E
S
 
S
S
 
T
V
 
T
Y
 
E
W
 
E
D
 
N
E
 
S
P
 
P
W
 
R
I
 
A
R
 
P
N
 
Q
L
 
Y
V
 
V
S
 
F
W
 
-
V
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
-
D
 
-
E
 
E
R
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
L
 
V
L
 
F
G
 
G
V
 
V
C
|
C
F
x
Y
G
 
G
H
 
M
Q
 
Q
V
 
T
V
 
M
A
 
A
A
 
M
A
 
Q
L
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
H
V
 
V
E
 
E
D
 
A
M
 
S
G
 
N
A
 
E
F
 
R
E
 
E
L
 
F
G
 
G
Y
 
Y
N
 
A
E
 
Q
I
 
V
E
 
E
R
 
V
T
 
V
R
 
-
P
 
-
D
 
-
D
 
N
G
 
D
N
 
S
D
 
A
I
 
L
L
 
V
A
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
E
E
 
D
R
 
A
F
 
L
T
 
T
-
 
A
-
 
D
-
 
G
-
 
K
-
 
P
-
 
L
-
 
L
-
 
D
V
 
V
F
 
W
T
 
M
S
 
S
H
 
H
G
 
G
D
 
D
R
 
K
V
 
V
T
 
T
E
 
A
L
 
I
P
 
P
S
 
S
G
 
D
A
 
F
D
 
I
L
 
T
L
 
V
A
 
A
E
 
S
N
 
T
E
 
E
-
 
S
-
 
C
-
 
P
F
 
F
G
 
A
V
 
I
H
 
M
A
 
A
F
 
N
R
 
E
R
 
E
N
 
K
H
 
R
A
 
F
F
 
Y
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
F
 
F
H
|
H
P
 
P
E
|
E
Y
 
V
D
 
-
T
 
T
D
 
H
T
 
T
A
 
R
E
 
Q
A
 
G
I
 
M
A
 
R
R
 
M
Q
 
L
K
 
E
D
 
R
F
 
F
L
 
V
P
 
R
D
 
D

Sites not aligning to the query:

5tw7F Crystal structure of a gmp synthase (glutamine-hydrolyzing) from neisseria gonorrhoeae
29% identity, 91% coverage: 1:215/237 of query aligns to 1:210/490 of 5tw7F

query
sites
5tw7F
M
 
M
T
 
T
R
 
Q
P
 
D
R
 
K
L
 
I
A
 
L
F
 
I
L
 
L
D
 
D
A
 
-
S
 
-
H
 
F
G
 
G
D
 
S
S
 
Q
S
 
V
T
 
T
S
 
R
R
 
L
N
 
I
F
 
A
R
 
R
R
 
R
E
 
V
L
 
R
D
 
E
A
 
A
-
 
H
-
 
V
-
 
Y
-
 
C
D
 
E
L
 
L
V
 
H
E
 
S
F
 
F
D
 
D
V
 
M
T
 
P
D
 
L
G
 
D
R
 
E
L
 
I
P
 
-
D
 
K
H
 
A
F
 
F
D
 
N
Y
 
P
D
 
K
G
 
G
V
 
I
V
 
I
I
 
L
S
 
S
G
 
G
S
x
G
S
 
P
S
 
N
S
 
S
V
 
V
Y
 
Y
W
 
E
D
 
S
E
 
D
P
 
-
W
 
-
I
 
-
R
 
-
N
 
-
L
 
-
V
 
-
S
 
-
W
 
Y
V
 
Q
A
 
A
D
 
D
A
 
T
D
 
G
-
 
I
-
 
F
E
 
D
R
 
L
G
 
G
V
 
I
P
 
P
L
 
V
L
 
L
G
 
G
V
 
I
C
|
C
F
x
Y
G
 
G
H
 
M
Q
 
Q
V
 
F
V
 
M
A
 
A
A
 
H
A
 
H
L
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
E
V
 
V
E
 
Q
D
 
P
M
 
G
G
 
N
A
 
Q
F
 
R
E
 
E
L
 
F
G
 
G
Y
 
Y
N
 
A
E
 
Q
I
 
V
E
 
K
R
 
T
T
 
I
R
 
D
P
 
S
D
 
G
D
 
L
G
 
T
N
 
R
D
 
G
I
 
I
L
 
Q
A
 
D
G
 
D
I
 
A
G
 
P
E
 
N
R
 
T
F
 
L
T
 
D
V
 
V
F
 
W
T
 
M
S
 
S
H
 
H
G
 
G
D
 
D
R
 
K
V
 
V
T
 
S
E
 
K
L
 
L
P
 
P
S
 
D
G
 
G
A
 
F
D
 
A
L
 
V
L
 
I
A
 
G
E
 
D
N
 
T
E
 
P
F
 
S
G
 
C
V
 
P
H
 
I
A
 
A
F
 
M
R
 
M
R
 
E
N
 
N
-
 
T
-
 
E
-
 
K
H
 
Q
A
 
F
F
 
Y
G
 
G
V
 
I
Q
 
Q
F
 
F
H
|
H
P
 
P
E
|
E
Y
 
V
D
 
-
T
 
T
D
 
H
T
 
T
A
 
K
E
 
Q
A
 
G
I
 
R
A
 
A
R
 
L
Q
 
L
K
 
N
D
 
R
F
 
F
L
 
V
P
 
L
D
 
D
E
 
-
R
 
-
I
 
I
R
 
C
S
 
G
V
 
A
V
 
Q
D
 
P
G
 
G
I
 
W
T
 
T
P
 
M
E
 
P
N
 
N
Y
 
Y
A
 
I
A
 
E
A
 
E
C
 
A
E
 
V
A
 
A
K
 
K

Sites not aligning to the query:

7d54A Crstal structure msgatase with gln (see paper)
31% identity, 76% coverage: 4:182/237 of query aligns to 5:188/242 of 7d54A

query
sites
7d54A
P
 
P
R
 
K
L
 
V
A
 
L
F
 
F
L
 
I
D
 
H
A
 
N
S
 
E
H
 
H
-
 
M
-
 
C
-
 
T
-
 
E
-
 
A
-
 
M
-
 
L
G
 
G
D
 
D
S
 
A
S
 
F
T
 
S
S
 
E
R
 
C
N
 
G
F
 
F
R
 
D
R
 
I
E
 
E
-
 
T
-
 
F
-
 
E
-
 
V
L
 
V
D
 
P
A
 
P
D
 
E
L
 
R
V
 
V
E
 
E
F
 
T
D
 
P
V
 
A
T
 
G
D
 
D
G
 
V
R
 
A
L
 
F
P
 
P
D
 
D
H
 
P
F
 
T
D
 
A
Y
 
Y
D
 
D
G
 
V
V
 
I
V
 
V
I
 
P
S
 
L
G
 
G
S
x
A
S
 
R
S
 
W
S
 
P
V
 
V
Y
 
Y
W
 
E
D
 
Q
E
 
S
-
 
L
-
 
V
-
 
G
P
 
T
W
 
W
I
 
V
R
 
T
N
 
A
L
 
E
V
 
M
S
 
D
W
 
M
V
 
M
A
 
R
D
 
K
A
 
A
D
 
A
E
 
D
R
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
G
L
 
I
L
 
L
G
 
G
V
 
V
C
|
C
F
 
F
G
 
G
H
 
G
Q
 
Q
V
 
L
V
 
L
A
 
A
A
 
Q
A
 
T
L
 
F
G
 
G
G
 
G
T
 
S
V
 
V
E
 
A
D
 
R
M
 
A
G
 
E
A
 
T
F
 
A
E
 
E
L
 
V
G
 
G
Y
 
W
N
 
F
E
 
E
I
 
L
E
 
D
R
 
T
T
 
-
R
 
-
P
 
-
D
 
D
D
 
D
G
 
A
N
 
G
D
 
L
I
 
I
L
 
A
A
 
P
G
 
G
I
 
-
G
 
-
E
 
-
R
 
-
F
 
-
T
 
P
V
 
W
F
 
F
T
 
Q
S
x
W
H
 
H
G
 
F
D
 
D
R
 
R
V
 
W
T
 
T
E
 
-
L
 
V
P
 
P
S
 
P
G
 
G
A
 
A
D
 
T
L
 
E
L
 
I
A
 
A
E
 
R
N
 
T
E
 
S
F
 
R
G
 
S
V
 
S
H
 
Q
A
 
A
F
 
F
R
 
V
R
 
L
N
 
G
H
 
R
A
 
A
F
 
L
G
 
A
V
 
L
Q
 
Q
F
 
F
H
 
H
P
 
P
E
 
E
Y
 
V
D
 
D
T
 
V
D
 
D
T
 
L
A
 
L
E
 
E

Sites not aligning to the query:

7yc6A Crystal structure of d110p mutant of gatase subunit of methanocaldococcus jannaschii gmp synthetase
29% identity, 55% coverage: 45:175/237 of query aligns to 43:160/183 of 7yc6A

query
sites
7yc6A
D
 
E
Y
 
V
D
 
K
G
 
G
V
 
I
V
 
I
I
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
G
S
 
-
S
 
-
S
 
-
V
 
-
Y
 
-
W
 
-
D
 
-
E
 
-
P
 
P
W
 
D
I
 
I
R
 
E
N
 
K
L
 
A
V
 
K
S
 
N
W
 
C
V
 
I
A
 
D
D
 
I
A
 
A
D
 
L
E
 
N
R
 
A
G
 
K
V
 
L
P
 
P
L
 
I
L
 
L
G
 
G
V
 
I
C
|
C
F
 
L
G
 
G
H
 
H
Q
 
Q
V
 
L
V
 
I
A
 
A
A
 
L
A
 
A
L
 
Y
G
 
G
G
 
G
T
 
-
V
 
-
E
 
-
D
 
-
M
 
-
G
 
-
A
 
-
F
 
-
E
 
E
L
 
V
G
 
G
Y
 
R
N
 
A
E
 
A
I
 
L
E
 
T
R
 
K
T
 
V
R
 
Y
P
 
V
D
|
D
D
 
K
G
 
E
N
 
N
D
 
P
I
 
L
L
 
F
A
 
K
G
 
N
I
 
V
G
 
P
E
 
R
R
 
E
F
 
F
T
 
N
V
 
A
F
 
W
T
 
A
S
 
S
H
 
H
G
 
K
D
 
D
R
x
E
V
 
V
T
 
K
E
 
K
L
 
V
P
 
P
S
 
E
G
 
G
A
 
F
D
 
E
L
 
I
L
 
L
A
 
A
E
x
H
N
 
S
E
 
D
F
 
I
G
x
C
-
 
Q
V
 
V
H
 
E
A
 
A
F
 
M
R
 
K
R
 
H
N
 
K
H
 
T
A
 
K
-
 
P
-
 
I
F
 
Y
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
F
 
F
H
|
H
P
 
P
E
 
E

2ywcA Crystal structure of gmp synthetase from thermus thermophilus in complex with xmp
36% identity, 48% coverage: 79:191/237 of query aligns to 71:181/475 of 2ywcA

query
sites
2ywcA
G
 
G
V
 
L
P
 
P
L
 
L
L
 
L
G
 
G
V
 
I
C
|
C
F
x
Y
G
 
G
H
 
M
Q
 
Q
V
 
L
V
 
L
A
 
A
A
 
Q
A
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
R
V
 
V
E
 
E
D
 
R
M
 
A
G
 
G
A
 
R
F
 
A
E
 
E
L
 
Y
G
 
G
Y
 
K
N
 
A
E
 
L
I
 
L
E
 
T
R
 
R
T
 
H
R
 
E
P
 
-
D
 
-
D
 
-
G
 
-
N
 
G
D
 
P
I
 
L
L
 
F
A
 
R
G
 
G
I
 
L
G
 
E
E
 
G
R
 
E
F
 
V
T
 
Q
V
 
V
F
 
W
T
 
M
S
 
S
H
 
H
G
 
Q
D
 
D
R
 
A
V
 
V
T
 
T
E
 
A
L
 
P
P
 
P
S
 
P
G
 
G
A
 
W
D
 
R
L
 
V
L
 
V
A
 
A
-
 
E
-
 
T
-
 
E
E
 
E
N
 
N
E
 
P
F
 
V
G
 
A
V
 
A
H
 
I
A
 
A
F
 
S
R
 
P
R
 
D
N
 
G
H
 
R
A
 
A
F
 
Y
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
F
 
F
H
|
H
P
 
P
E
|
E
Y
 
V
D
 
-
T
 
A
D
 
H
T
 
T
A
 
P
E
 
K
A
 
G
I
 
M
A
 
Q
R
 
I
Q
 
L
K
 
E
D
 
N
F
 
F
L
 
L

Sites not aligning to the query:

P49915 GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]; GMP synthetase; Glutamine amidotransferase; EC 6.3.5.2 from Homo sapiens (Human) (see paper)
30% identity, 62% coverage: 46:193/237 of query aligns to 69:209/693 of P49915

query
sites
P49915
Y
 
F
D
 
R
G
 
A
V
 
I
V
 
I
I
 
I
S
 
S
G
 
G
S
 
G
S
 
P
S
 
N
S
 
S
V
 
V
Y
 
Y
W
 
A
-
 
E
D
 
D
E
 
A
P
 
P
W
 
W
I
 
F
R
 
D
N
 
P
L
 
A
V
 
I
S
 
F
W
 
T
V
 
I
A
 
-
D
 
-
A
 
-
D
 
-
E
 
-
R
 
-
G
 
G
V
 
K
P
 
P
L
 
V
L
 
L
G
 
G
V
 
I
C
|
C
F
 
Y
G
 
G
H
 
M
Q
 
Q
V
 
M
V
 
M
A
 
N
A
 
K
A
 
V
L
 
F
G
 
G
G
 
G
T
 
T
V
 
V
E
 
H
D
 
K
M
 
K
G
 
S
A
 
V
F
 
R
E
 
E
L
 
D
G
 
G
Y
 
V
N
 
F
E
 
N
I
 
I
E
 
S
R
 
V
T
 
-
R
 
-
P
 
-
D
 
D
D
 
N
G
 
T
N
 
C
D
 
S
I
 
L
L
 
F
A
 
R
G
 
G
I
 
L
G
 
Q
E
 
K
R
 
E
F
 
E
T
 
V
V
 
V
F
 
L
T
 
L
S
 
T
H
 
H
G
 
G
D
 
D
R
 
S
V
 
V
T
 
D
E
 
K
L
 
V
P
 
A
S
 
D
G
 
G
A
 
F
D
 
K
L
 
V
L
 
V
A
 
A
E
 
R
-
 
S
-
 
G
N
 
N
E
 
I
F
 
V
G
 
A
V
 
G
H
 
I
A
 
A
F
 
N
R
 
E
R
 
S
N
 
K
H
 
K
A
 
L
F
 
Y
G
 
G
V
 
A
Q
 
Q
F
 
F
H
|
H
P
 
P
E
|
E
Y
 
V
D
 
G
-
 
L
T
 
T
D
 
E
T
 
N
A
 
G
E
 
K
A
 
V
I
 
I
A
 
L
R
 
-
Q
 
-
K
 
K
D
 
N
F
 
F
L
 
L
P
 
Y
D
 
D

Sites not aligning to the query:

2vxoB Human gmp synthetase in complex with xmp (see paper)
29% identity, 62% coverage: 46:193/237 of query aligns to 47:184/658 of 2vxoB

query
sites
2vxoB
Y
 
F
D
 
R
G
 
A
V
 
I
V
 
I
I
 
I
S
 
S
G
 
G
S
x
G
S
 
P
S
 
N
S
 
S
V
 
V
Y
 
Y
W
 
A
-
 
E
D
 
D
E
 
A
P
 
P
W
 
W
I
 
F
R
 
D
N
 
P
L
 
A
V
 
I
S
 
F
W
 
T
V
 
I
A
 
-
D
 
-
A
 
-
D
 
-
E
 
-
R
 
-
G
 
G
V
 
K
P
 
P
L
 
V
L
 
L
G
 
G
V
 
I
C
|
C
F
x
Y
G
 
G
H
 
M
Q
 
Q
V
 
M
V
 
M
A
 
N
A
 
K
A
 
V
L
 
F
G
 
G
G
 
G
T
 
T
V
 
V
E
 
H
D
 
K
M
 
K
-
 
S
-
 
D
G
 
G
A
 
V
F
 
F
E
 
N
L
 
I
G
 
S
Y
 
V
N
 
-
E
 
-
I
 
-
E
 
-
R
 
-
T
 
-
R
 
-
P
 
-
D
 
D
D
 
N
G
 
T
N
 
C
D
 
S
I
 
L
L
 
F
A
 
R
G
 
G
I
 
L
G
 
Q
E
 
K
R
 
E
F
 
E
T
 
V
V
 
V
F
 
L
T
 
L
S
 
T
H
 
H
G
 
G
D
 
D
R
 
S
V
 
V
T
 
D
E
 
K
L
 
V
P
 
A
S
 
D
G
 
G
A
 
F
D
 
K
L
 
V
L
 
V
A
 
A
E
 
R
-
 
S
-
 
G
N
 
N
E
 
I
F
 
V
G
 
A
V
 
G
H
 
I
A
 
A
F
 
N
R
 
E
R
 
S
N
 
K
H
 
K
A
 
L
F
 
Y
G
 
G
V
 
A
Q
 
Q
F
 
F
H
|
H
P
 
P
E
|
E
Y
 
V
D
 
G
-
 
L
T
 
T
D
 
E
T
 
N
A
 
G
E
 
K
A
 
V
I
 
I
A
 
L
R
 
-
Q
 
-
K
 
K
D
 
N
F
 
F
L
 
L
P
 
Y
D
 
D

Sites not aligning to the query:

8hx8A Crystal structure of 4-amino-4-deoxychorismate synthase from streptomyces venezuelae co-crystallized with chorismate (see paper)
35% identity, 58% coverage: 39:175/237 of query aligns to 42:173/673 of 8hx8A

query
sites
8hx8A
R
 
R
L
 
L
P
 
P
D
 
V
H
 
E
F
 
-
D
 
D
Y
 
F
D
 
D
G
 
A
V
 
I
V
 
V
I
 
V
S
 
S
G
 
P
S
 
G
S
 
P
S
 
G
S
 
S
V
 
P
Y
 
D
W
 
R
D
 
E
E
 
R
P
 
D
W
 
F
I
 
G
R
 
-
N
 
-
L
 
-
V
 
I
S
 
S
W
 
R
V
 
R
A
 
A
D
 
I
A
 
T
D
 
D
E
 
S
R
 
-
G
 
G
V
 
L
P
 
P
L
 
V
L
 
L
G
 
G
V
 
V
C
 
C
F
 
L
G
 
G
H
 
H
Q
 
Q
V
 
G
V
 
I
A
 
A
A
 
Q
A
 
L
L
 
F
G
 
G
G
 
G
T
 
T
V
 
V
E
 
G
D
 
L
M
 
-
G
 
-
A
 
A
F
 
P
E
 
E
L
 
P
G
 
M
Y
 
H
N
 
G
E
 
R
I
 
V
E
 
S
R
 
E
T
 
V
R
 
R
P
 
-
D
 
H
D
 
T
G
 
G
N
 
E
D
 
D
I
 
V
L
 
F
A
 
R
G
 
G
I
 
L
G
 
P
E
 
S
R
 
P
F
 
F
T
 
T
V
 
A
F
 
V
T
 
R
S
 
Y
H
 
H
G
 
S
D
 
L
R
 
A
V
 
A
T
 
T
E
 
D
L
 
L
P
 
P
S
 
D
G
 
E
A
 
L
D
 
E
L
 
P
L
 
L
A
 
A
E
 
W
N
 
S
E
 
D
F
 
D
G
 
G
V
 
V
H
 
V
A
 
M
-
 
G
-
 
L
-
 
R
F
 
H
R
 
R
R
 
E
N
 
K
H
 
P
A
 
L
F
 
W
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
F
 
F
H
 
H
P
 
P
E
 
E

Sites not aligning to the query:

1i7qB Anthranilate synthase from s. Marcescens (see paper)
33% identity, 43% coverage: 80:180/237 of query aligns to 77:176/192 of 1i7qB

query
sites
1i7qB
V
 
L
P
 
P
L
 
I
L
 
I
G
 
G
V
 
I
C
|
C
F
x
L
G
 
G
H
 
H
Q
|
Q
V
 
A
V
 
I
A
 
V
A
 
E
A
 
A
L
 
Y
G
 
G
G
 
G
T
 
Q
V
 
V
E
 
G
D
 
Q
M
 
A
G
 
G
A
 
E
F
 
I
E
 
L
L
 
H
G
 
G
Y
 
K
N
 
A
E
 
S
I
 
-
E
 
-
R
 
-
T
 
A
R
 
I
P
 
A
D
 
H
D
 
D
G
 
G
N
 
E
D
 
G
I
 
M
L
 
F
A
 
A
G
 
G
I
 
M
G
 
A
E
 
N
R
 
P
F
 
L
T
 
P
V
 
V
F
 
A
T
 
R
S
 
Y
H
|
H
G
x
S
D
x
L
R
 
V
V
 
G
T
 
S
E
 
N
L
 
I
P
 
P
S
 
-
G
 
-
A
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
T
A
 
V
E
 
N
N
 
A
E
 
R
F
 
F
G
 
G
-
 
E
-
 
M
V
 
V
H
 
M
A
 
A
F
 
V
R
 
R
-
 
D
-
 
D
R
 
R
N
 
R
H
 
R
A
 
V
F
 
C
G
 
G
V
 
F
Q
 
Q
F
 
F
H
|
H
P
 
P
E
|
E
Y
 
S
D
 
I
T
 
L
D
 
T
T
 
T

Sites not aligning to the query:

P00903 Aminodeoxychorismate synthase component 2; ADC synthase; ADCS; 4-amino-4-deoxychorismate synthase component 2; Aminodeoxychorismate synthase, glutamine amidotransferase component; EC 2.6.1.85 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
35% identity, 41% coverage: 80:175/237 of query aligns to 73:170/187 of P00903

query
sites
P00903
V
 
L
P
 
P
L
 
I
L
 
L
G
 
G
V
 
V
C
|
C
F
 
L
G
 
G
H
 
H
Q
 
Q
V
 
A
V
 
M
A
 
A
A
 
Q
A
 
A
L
 
F
G
 
G
G
 
G
T
 
K
V
 
V
E
 
V
D
 
R
M
 
A
G
 
A
A
 
K
F
 
V
E
 
M
L
 
H
G
 
G
Y
 
-
N
 
-
E
 
-
I
 
-
E
 
-
R
 
K
T
 
T
R
 
S
P
 
P
-
 
I
-
 
T
D
 
H
D
 
N
G
 
G
N
 
E
D
 
G
I
 
V
L
 
F
A
 
R
G
 
G
I
 
L
G
 
A
E
 
N
R
 
P
F
 
L
T
 
T
V
 
V
F
 
T
T
 
R
S
 
Y
H
 
H
G
 
S
D
 
L
R
 
V
V
 
V
T
 
E
-
 
P
-
 
D
E
 
S
L
 
L
P
 
P
S
 
A
G
 
C
A
 
F
D
 
D
L
 
V
L
 
T
A
 
A
E
 
W
N
 
S
E
 
E
-
 
T
-
 
R
-
 
E
-
 
I
F
 
M
G
 
G
V
 
I
H
 
R
A
 
-
F
 
H
R
 
R
R
 
Q
N
 
W
H
 
D
A
 
L
F
 
E
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
F
 
F
H
|
H
P
 
P
E
|
E

P00900 Anthranilate synthase component 2; AS; ASII; Anthranilate synthase, GATase component; Anthranilate synthase, glutamine amidotransferase component; EC 4.1.3.27 from Serratia marcescens (see 3 papers)
30% identity, 43% coverage: 80:180/237 of query aligns to 78:177/193 of P00900

query
sites
P00900
V
 
L
P
 
P
L
 
I
L
 
I
G
 
G
V
 
I
C
|
C
F
 
L
G
 
G
H
 
H
Q
 
Q
V
 
A
V
 
I
A
 
V
A
 
E
A
 
A
L
 
Y
G
 
G
G
 
G
T
 
Q
V
 
V
E
 
G
D
 
Q
M
 
A
G
 
G
A
 
E
F
 
I
E
 
L
L
 
H
G
 
G
Y
 
K
N
 
A
E
 
S
I
 
-
E
 
-
R
 
-
T
 
A
R
 
I
P
 
A
D
 
H
D
 
D
G
 
G
N
 
E
D
 
G
I
 
M
L
 
F
A
 
A
G
 
G
I
 
M
G
 
A
E
 
N
R
 
P
F
 
L
T
 
P
V
 
V
F
 
A
T
 
R
S
 
Y
H
 
H
G
 
S
D
 
L
R
 
V
V
 
G
T
 
S
E
 
N
L
 
I
P
 
P
S
 
A
G
 
D
A
 
L
D
 
T
L
 
V
L
 
N
A
 
A
E
 
R
N
 
S
E
 
G
F
 
E
G
 
M
V
 
V
H
 
M
A
 
A
F
 
V
R
 
R
-
 
D
-
 
D
R
 
R
N
 
R
H
 
R
A
 
V
F
 
C
G
 
G
V
 
F
Q
 
Q
F
 
F
H
 
H
P
 
P
E
 
E
Y
 
S
D
 
I
T
 
L
D
 
T
T
 
T

Sites not aligning to the query:

Q18990 Multifunctional protein pyr-1; EC 6.3.5.5; EC 3.5.1.2; EC 6.3.4.16; EC 2.1.3.2; EC 3.5.2.3 from Caenorhabditis elegans (see 3 papers)
27% identity, 56% coverage: 45:176/237 of query aligns to 217:342/2198 of Q18990

query
sites
Q18990
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
G
 
G
V
 
L
V
 
F
I
 
L
S
 
S
G
 
N
S
 
G
S
 
P
S
 
G
S
 
D
V
 
P
Y
 
E
W
 
I
D
 
C
E
 
A
P
 
P
W
 
L
I
 
V
R
 
D
N
 
R
L
 
L
V
 
A
S
 
K
W
 
V
V
 
I
A
 
A
D
 
R
A
 
G
D
 
D
E
 
K
R
 
-
G
 
-
V
 
-
P
 
P
L
 
I
L
 
F
G
 
G
V
 
I
C
 
C
F
 
L
G
 
G
H
 
H
Q
 
Q
V
 
I
V
 
L
A
 
S
A
 
R
A
 
A
L
 
I
G
 
G
G
 
A
T
 
K
V
 
-
E
 
-
D
 
-
M
 
-
G
 
-
A
 
T
F
 
Y
E
 
K
L
 
L
G
 
K
Y
 
Y
N
 
G
E
 
N
I
 
R
E
 
G
R
 
H
T
 
N
R
 
Q
P
 
P
D
 
C
D
 
T
G
 
H
N
 
-
D
 
-
I
 
-
L
 
-
A
 
Y
G
 
A
I
 
T
G
 
G
E
 
R
R
 
C
F
 
Y
T
 
I
V
 
T
F
 
S
T
 
Q
S
 
N
H
 
H
G
 
G
D
 
Y
R
 
A
V
 
V
-
 
D
-
 
P
T
 
D
E
 
S
L
 
L
P
 
P
S
 
A
G
 
D
A
 
W
D
 
K
L
 
A
L
 
L
-
 
F
-
 
T
-
 
N
-
 
E
-
 
N
-
 
D
A
 
K
E
 
T
N
 
N
E
 
E
F
 
G
G
 
I
V
 
V
H
 
H
A
 
S
F
 
S
R
 
K
R
 
P
N
 
-
H
 
-
A
 
F
F
 
F
G
 
S
V
 
V
Q
 
Q
F
 
F
H
 
H
P
 
P
E
 
E
Y
 
H

Sites not aligning to the query:

P08955 Multifunctional protein CAD; Carbamoyl phosphate synthetase 2-aspartate transcarbamylase-dihydroorotase; EC 6.3.5.5; EC 3.5.1.2; EC 6.3.4.16; EC 2.1.3.2; EC 3.5.2.3 from Mesocricetus auratus (Golden hamster) (see paper)
29% identity, 57% coverage: 42:176/237 of query aligns to 210:339/2225 of P08955

query
sites
P08955
D
 
D
H
 
S
F
 
Q
D
 
K
Y
 
Y
D
 
D
G
 
G
V
 
L
V
 
F
I
 
L
S
 
S
G
 
N
S
 
G
S
 
P
S
 
G
S
 
D
V
 
P
Y
 
A
W
 
S
D
 
Y
E
 
P
P
 
G
W
 
V
I
 
V
R
 
A
N
 
T
L
 
L
V
 
N
S
 
R
W
 
V
V
 
L
A
 
S
D
 
E
A
 
P
D
 
N
E
 
P
R
 
R
G
 
-
V
 
-
P
 
P
L
 
V
L
 
F
G
 
G
V
 
I
C
 
C
F
 
L
G
 
G
H
 
H
Q
 
Q
V
 
L
V
 
L
A
 
A
A
 
L
A
 
A
L
 
I
G
 
G
G
 
A
T
 
K
V
 
T
E
 
Y
D
 
K
M
 
M
G
 
R
A
 
Y
F
 
G
E
 
N
L
 
R
G
 
G
Y
 
H
N
 
N
E
 
Q
I
 
-
E
 
-
R
 
-
T
 
-
R
 
-
P
 
-
D
 
-
D
 
-
G
 
-
N
 
P
D
 
C
I
 
L
L
 
L
A
 
V
G
 
G
I
 
T
G
 
G
E
 
R
R
 
C
F
 
F
T
 
L
V
 
T
F
 
S
T
 
Q
S
 
N
H
 
H
G
 
G
D
 
F
R
 
A
V
 
V
-
 
D
-
 
A
T
 
D
E
 
S
L
 
L
P
 
P
S
 
A
G
 
G
A
 
W
D
 
T
L
 
P
L
 
L
-
 
F
-
 
T
-
 
N
-
 
A
-
 
N
-
 
D
A
 
C
E
 
S
N
 
N
E
 
E
F
 
G
G
 
I
V
 
V
H
 
H
A
 
-
F
 
-
R
 
D
R
 
S
N
 
L
H
 
P
A
 
F
F
 
F
G
 
S
V
 
V
Q
 
Q
F
 
F
H
 
H
P
 
P
E
 
E
Y
 
H

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_004045322.1 NCBI__GCF_000337315.1:WP_004045322.1
MTRPRLAFLDASHGDSSTSRNFRRELDADLVEFDVTDGRLPDHFDYDGVVISGSSSSVYW
DEPWIRNLVSWVADADERGVPLLGVCFGHQVVAAALGGTVEDMGAFELGYNEIERTRPDD
GNDILAGIGERFTVFTSHGDRVTELPSGADLLAENEFGVHAFRRNHAFGVQFHPEYDTDT
AEAIARQKDFLPDERIRSVVDGITPENYAAACEAKRLFDNFVTYVNRTNAGSVESAA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory