SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_004308709.1 NCBI__GCF_000310185.1:WP_004308709.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3qhxA Crystal structure of cystathionine gamma-synthase metb (cgs) from mycobacterium ulcerans agy99 bound to hepes (see paper)
45% identity, 91% coverage: 30:376/382 of query aligns to 24:376/377 of 3qhxA

query
sites
3qhxA
P
 
P
I
 
I
H
 
Y
L
 
A
A
 
S
T
 
S
T
 
T
F
 
F
E
 
A
R
 
Q
A
 
D
E
 
G
D
 
V
G
 
G
S
 
G
L
 
L
P
 
R
G
 
G
G
 
G
R
 
Y
I
 
E
Y
 
Y
A
 
A
R
|
R
D
 
T
A
 
G
S
 
N
P
 
P
A
 
T
Y
 
R
D
 
T
P
 
A
A
 
L
E
 
E
A
 
A
L
 
A
L
 
L
C
 
A
E
 
A
L
 
V
E
 
E
G
 
D
G
 
A
A
 
A
R
 
F
A
 
G
A
 
R
L
 
A
F
 
F
A
 
S
S
 
S
G
 
G
M
 
M
A
 
A
A
 
A
A
 
A
S
 
D
A
 
C
V
 
A
L
 
L
L
 
R
A
 
A
-
 
M
L
 
L
K
 
R
P
 
P
G
 
G
A
 
D
R
 
H
I
 
V
V
 
V
A
 
I
P
 
P
H
 
D
D
 
D
M
 
A
Y
|
Y
W
 
G
S
 
G
L
 
T
R
 
F
N
 
R
W
 
L
M
 
I
I
 
D
G
 
K
F
 
V
A
 
F
A
 
T
N
 
G
W
 
W
Q
 
N
I
 
V
A
 
E
L
 
Y
D
 
T
-
 
P
-
 
V
F
 
A
Y
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
L
A
 
D
E
 
A
L
 
V
A
 
R
A
 
A
L
 
A
L
 
I
Q
 
R
R
 
P
P
 
T
A
 
T
D
 
R
L
 
L
V
 
I
W
 
W
V
 
V
E
 
E
T
 
T
P
 
P
A
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
L
W
 
L
E
 
S
I
 
I
L
 
A
D
 
D
I
 
I
A
 
A
R
 
G
A
 
I
A
 
A
E
 
Q
L
 
L
A
 
G
H
 
A
A
 
D
A
 
S
G
 
S
A
 
A
R
 
K
L
 
V
V
 
L
V
 
V
D
|
D
S
 
N
T
 
T
V
 
F
P
 
A
T
 
S
P
 
P
V
 
A
F
 
L
T
 
Q
R
 
Q
P
 
P
L
 
L
A
 
S
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
V
 
V
V
 
V
M
 
L
H
 
H
S
 
S
A
 
T
T
 
T
K
|
K
Y
 
Y
L
 
I
N
 
G
G
 
G
H
 
H
S
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
V
A
 
G
G
 
G
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
R
 
N
A
 
D
E
 
E
-
 
E
-
 
L
D
 
D
D
 
Q
F
 
S
W
 
F
A
 
A
R
 
F
I
 
L
K
 
Q
T
 
N
A
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
G
G
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
P
G
 
G
P
 
P
F
 
F
E
 
D
A
 
A
W
 
Y
L
 
L
L
 
T
N
 
M
R
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
K
T
 
T
L
 
L
F
 
V
P
 
L
R
 
R
V
 
M
R
 
Q
T
 
R
A
 
H
A
 
S
A
 
E
S
 
N
A
 
A
L
 
A
R
 
A
I
 
V
A
 
A
Q
 
E
H
 
F
F
 
L
E
 
A
H
 
E
H
 
H
P
 
P
A
 
A
L
 
I
L
 
S
A
 
T
V
 
V
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
L
 
L
P
 
P
S
 
S
H
 
H
R
 
P
G
 
G
H
 
H
D
 
A
I
 
V
A
 
A
C
 
A
R
 
R
Q
 
Q
M
 
M
E
 
R
G
 
-
G
 
G
F
 
F
G
 
G
A
 
G
M
 
M
L
 
V
S
 
S
L
 
V
R
 
R
V
 
M
R
 
R
G
 
A
G
 
G
E
 
R
D
 
T
A
 
A
A
 
A
R
 
E
R
 
Q
V
 
L
A
 
C
G
 
A
A
 
K
V
 
T
K
 
N
I
 
I
F
 
F
R
 
I
R
 
L
A
 
A
T
x
E
S
|
S
L
 
L
G
 
G
S
 
S
V
 
V
E
 
E
S
 
S
L
 
L
I
 
I
E
 
E
H
 
H
-
 
P
-
 
S
-
 
A
-
x
M
-
 
T
R
 
H
G
 
A
P
 
S
I
 
T
E
 
A
G
 
G
P
 
S
G
 
Q
T
 
L
R
 
E
C
 
V
P
 
P
L
 
D
D
 
D
L
 
L
L
 
V
R
|
R
L
 
L
S
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
I
E
 
E
D
 
D
S
 
V
D
 
A
D
 
D
L
 
L
I
 
L
A
 
D
D
 
D
L
 
L
E
 
K
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L

1n8pA Crystal structure of cystathionine gamma-lyase from yeast (see paper)
40% identity, 93% coverage: 24:379/382 of query aligns to 22:391/393 of 1n8pA

query
sites
1n8pA
H
 
H
R
 
G
D
 
S
I
 
V
V
 
I
P
 
E
P
 
P
I
 
I
H
 
S
L
 
L
A
 
S
T
 
T
T
 
T
F
 
F
E
 
K
R
 
Q
A
 
S
E
 
S
D
 
P
G
 
A
S
 
N
L
 
P
P
 
I
G
 
G
G
 
T
R
 
Y
I
 
E
Y
 
Y
A
 
S
R
|
R
D
 
S
A
 
Q
S
 
N
P
 
P
A
 
N
Y
 
R
D
 
E
P
 
N
A
 
L
E
 
E
A
 
R
L
 
A
L
 
V
C
 
A
E
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
N
G
 
A
A
 
Q
R
 
Y
A
 
G
A
 
L
L
 
A
F
 
F
A
 
S
S
|
S
G
|
G
M
x
S
A
 
A
A
 
T
A
 
T
S
 
A
A
 
T
V
 
I
L
 
L
L
 
Q
A
 
S
L
 
L
K
 
P
P
 
Q
G
 
G
A
 
S
R
 
H
I
 
A
V
 
V
A
 
S
P
 
I
H
 
G
D
 
D
M
 
V
Y
|
Y
W
 
G
S
 
G
L
 
T
R
 
H
N
 
R
W
 
Y
M
 
F
I
 
T
G
 
K
F
 
V
A
 
A
A
 
N
N
 
A
W
 
H
Q
 
G
I
 
V
A
 
E
L
 
T
D
 
S
F
 
F
Y
 
T
A
 
N
D
 
D
A
 
L
-
 
L
A
 
N
E
 
D
L
 
L
A
 
P
A
 
Q
L
 
L
L
 
I
Q
 
K
R
 
E
P
 
N
A
 
T
D
 
K
L
 
L
V
 
V
W
 
W
V
 
I
E
 
E
T
 
T
P
 
P
A
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
T
W
 
L
E
 
K
I
 
V
L
 
T
D
 
D
I
 
I
A
 
Q
R
 
K
A
 
V
A
 
A
E
 
D
L
 
L
-
 
I
-
 
K
A
 
K
H
 
H
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
Q
R
 
D
-
 
V
-
 
I
L
 
L
V
 
V
V
 
V
D
|
D
S
 
N
T
 
T
V
x
F
P
 
L
T
 
S
P
 
P
V
 
Y
F
 
I
T
 
S
R
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
N
L
 
F
G
 
G
A
 
A
D
 
D
V
 
I
V
 
V
M
 
V
H
 
H
S
|
S
A
 
A
T
 
T
K
|
K
Y
 
Y
L
 
I
N
 
N
G
 
G
H
 
H
S
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
V
A
 
L
G
 
G
V
 
V
L
 
L
V
 
A
T
 
T
R
 
N
A
 
N
E
 
K
D
 
-
D
 
P
F
 
L
W
 
Y
A
 
E
R
 
R
I
 
L
K
 
Q
T
 
F
A
 
L
R
 
Q
A
 
N
A
 
A
G
 
I
G
 
G
A
 
A
V
 
I
L
 
P
G
 
S
P
 
P
F
 
F
E
 
D
A
 
A
W
 
W
L
 
L
L
 
T
N
 
H
R
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
K
T
 
T
L
 
L
F
 
H
P
 
L
R
 
R
V
 
V
R
 
R
T
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
N
R
 
K
I
 
I
A
 
A
Q
 
E
H
 
F
F
 
L
-
 
A
E
 
A
H
 
D
H
 
K
P
 
E
A
 
N
L
 
V
L
 
V
A
 
A
V
 
V
L
 
N
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
L
 
L
P
 
K
S
 
T
H
 
H
R
 
P
G
 
N
H
 
Y
D
 
D
I
 
V
A
 
V
C
 
L
R
 
K
Q
 
Q
M
 
H
E
 
R
G
 
D
G
 
A
F
 
L
-
 
G
G
 
G
A
 
G
M
 
M
L
 
I
S
 
S
L
 
F
R
 
R
V
 
I
R
 
K
G
 
G
G
 
G
E
 
A
D
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
S
R
 
K
V
 
F
A
 
A
G
 
S
A
 
S
V
 
T
K
 
R
I
 
L
F
 
F
R
 
T
R
 
L
A
 
A
T
 
E
S
 
S
L
 
L
G
 
G
S
 
G
V
 
I
E
 
E
S
 
S
L
 
L
I
 
L
E
 
E
-
 
V
-
 
P
-
 
A
-
 
V
-
 
M
-
 
T
H
 
H
R
 
G
G
 
G
-
 
I
P
 
P
I
 
K
E
 
E
G
 
A
-
 
R
P
 
E
G
 
A
T
 
S
R
 
G
C
 
V
P
 
F
L
 
D
D
 
D
L
 
L
L
 
V
R
 
R
L
 
I
S
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
I
E
 
E
D
 
D
S
 
T
D
 
D
D
 
D
L
 
L
I
 
L
A
 
E
D
 
D
L
 
I
E
 
K
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
Q
 
Q
A
 
A

4iyoD Crystal structure of cystathionine gamma lyase from xanthomonas oryzae pv. Oryzae (xometc) in complex with e-site serine, a-site serine, a- site external aldimine structure with aminoacrylate and a-site iminopropionate intermediates (see paper)
41% identity, 98% coverage: 7:380/382 of query aligns to 2:384/384 of 4iyoD

query
sites
4iyoD
L
 
L
S
 
S
P
 
L
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
I
Q
 
H
G
 
G
T
 
-
G
 
G
A
 
Q
T
 
S
P
 
P
M
 
D
P
 
P
H
 
S
R
 
T
D
 
G
-
 
A
I
 
V
V
 
M
P
 
P
P
 
P
I
 
I
H
 
Y
L
 
A
A
 
T
T
 
S
T
 
T
F
 
Y
E
 
A
R
 
Q
A
 
S
E
 
S
D
 
P
G
 
G
S
 
E
L
 
H
P
 
Q
G
 
G
G
 
F
R
 
E
I
 
-
Y
|
Y
A
 
S
R
|
R
D
x
T
A
 
H
S
 
N
P
 
P
A
 
T
Y
 
R
D
 
F
P
 
A
A
 
Y
E
 
E
A
 
R
L
 
C
L
 
V
C
 
A
E
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
G
A
 
T
R
 
R
A
 
A
A
 
F
L
 
A
F
 
F
A
 
A
S
 
S
G
 
G
M
 
M
A
 
A
A
 
A
A
 
T
S
 
S
A
 
T
V
 
V
L
 
M
L
 
E
A
 
L
L
 
L
K
 
D
P
 
A
G
 
G
A
 
S
R
 
H
I
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
M
H
 
D
D
 
D
M
 
L
Y
|
Y
-
 
G
-
 
G
-
 
T
W
 
F
S
x
R
L
 
L
R
 
F
N
 
E
W
 
R
M
 
V
I
 
R
G
 
R
F
 
R
A
 
T
A
 
A
N
 
G
W
 
L
Q
 
D
I
 
F
A
 
S
L
 
F
D
 
V
F
 
D
Y
 
L
A
 
T
D
 
D
A
 
P
A
 
A
E
 
A
L
 
F
A
 
K
A
 
A
L
 
A
L
 
I
Q
 
R
R
 
A
P
 
D
A
 
T
D
 
K
L
 
M
V
 
V
W
 
W
V
 
I
E
 
E
T
 
T
P
 
P
A
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
M
W
 
L
E
 
K
I
 
L
L
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
A
R
 
A
A
 
I
A
 
A
E
 
V
L
 
I
A
 
A
H
 
R
A
 
K
A
 
H
G
 
G
A
 
L
R
 
L
L
 
T
V
 
V
V
 
V
D
|
D
S
 
N
T
 
T
V
 
F
P
 
A
T
 
S
P
 
P
V
 
M
F
 
L
T
 
Q
R
 
R
P
 
P
L
 
L
A
 
S
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
V
 
L
V
 
V
M
 
V
H
 
H
S
 
S
A
 
A
T
 
T
K
|
K
Y
 
Y
L
 
L
N
 
N
G
 
G
H
 
H
S
 
S
D
 
D
V
 
M
V
 
V
A
 
G
G
 
G
V
 
I
L
 
A
V
 
V
T
 
V
R
 
G
A
 
D
E
 
N
D
 
A
D
 
E
F
 
L
W
 
A
A
 
E
R
 
Q
I
 
M
K
 
A
T
 
F
A
 
L
R
 
Q
A
x
N
A
 
S
G
 
I
G
 
G
A
 
G
V
 
V
L
 
Q
G
 
G
P
 
P
F
 
F
E
 
D
A
 
S
W
 
F
L
 
L
L
 
A
N
 
L
R
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
K
T
 
T
L
 
L
F
 
P
P
 
L
R
 
R
V
 
M
R
 
R
T
 
A
A
 
H
A
 
C
A
 
E
S
 
N
A
 
A
L
 
L
R
 
A
I
 
L
A
 
A
Q
 
Q
H
 
W
F
 
L
E
 
E
H
 
T
H
 
H
P
 
P
A
 
A
L
 
I
L
 
E
A
 
K
V
 
V
L
 
I
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
L
 
L
P
 
A
S
 
S
H
 
H
R
 
P
G
 
Q
H
 
H
D
 
V
I
 
L
A
 
A
C
 
K
R
 
R
Q
 
Q
M
 
M
E
 
S
G
 
-
G
 
G
F
 
F
G
 
G
A
 
G
M
 
I
L
 
V
S
 
S
L
 
I
R
 
V
V
 
L
R
 
K
G
 
G
G
 
G
E
 
F
D
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
K
R
 
R
V
 
F
A
 
C
G
 
E
A
 
K
V
 
T
K
 
E
I
 
L
F
 
F
R
 
T
R
 
L
A
 
A
T
x
E
S
|
S
L
 
L
G
 
G
S
 
G
V
 
V
E
 
E
S
 
S
L
 
L
I
 
V
E
 
N
H
 
H
R
 
-
G
 
-
P
 
P
I
 
A
E
 
V
G
 
M
P
x
T
G
 
H
T
 
A
R
 
S
C
 
I
P
 
P
L
 
V
-
 
A
-
 
R
-
 
R
-
 
E
-
 
Q
-
 
L
-
 
G
-
 
I
-
 
S
-
 
D
D
 
A
L
 
L
L
 
V
R
|
R
L
 
L
S
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
I
E
 
E
D
 
D
S
 
L
D
 
G
D
 
D
L
 
L
I
 
R
A
 
G
D
 
D
L
 
L
E
 
E
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
V
Q
 
N
A
 
Q
N
 
N

1cs1D Cystathionine gamma-synthase (cgs) from escherichia coli (see paper)
42% identity, 93% coverage: 27:381/382 of query aligns to 21:383/384 of 1cs1D

query
sites
1cs1D
I
 
V
V
 
V
P
 
P
P
 
P
I
 
I
H
 
H
L
 
L
A
 
S
T
 
S
T
 
T
F
 
Y
E
 
N
R
 
F
A
 
T
E
 
G
D
 
F
G
 
N
S
 
E
L
 
-
P
 
P
G
 
R
G
 
A
R
 
H
I
 
D
Y
 
Y
A
 
S
R
|
R
D
 
R
A
 
G
S
 
N
P
 
P
A
 
T
Y
 
R
D
 
D
P
 
V
A
 
V
E
 
Q
A
 
R
L
 
A
L
 
L
C
 
A
E
 
E
L
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
G
A
 
A
R
 
G
A
 
A
A
 
V
L
 
L
F
 
T
A
 
N
S
 
T
G
 
G
M
 
M
A
 
S
A
 
A
A
 
I
S
 
H
A
 
L
V
 
V
L
 
T
-
 
T
L
 
V
A
 
F
L
 
L
K
 
K
P
 
P
G
 
G
A
 
D
R
 
L
I
 
L
V
 
V
A
 
A
P
 
P
H
 
H
D
 
D
M
 
C
Y
|
Y
-
 
G
-
 
G
-
 
S
W
 
Y
S
 
R
L
 
L
R
 
F
N
 
D
W
 
S
M
 
L
I
 
A
G
 
K
F
 
R
A
 
G
A
 
C
N
 
Y
W
 
R
Q
 
V
I
 
L
A
 
F
L
 
V
D
 
D
F
 
Q
Y
 
G
A
 
D
D
 
E
A
 
Q
A
 
A
E
 
L
L
 
R
A
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
A
Q
 
E
R
 
K
P
 
P
A
 
-
D
 
K
L
 
L
V
 
V
W
 
L
V
 
V
E
 
E
T
 
S
P
 
P
A
 
S
N
 
N
P
 
P
T
 
L
W
 
L
E
 
R
I
 
V
L
 
V
D
 
D
I
 
I
A
|
A
R
x
K
A
 
I
A
 
C
E
 
H
L
 
L
A
 
A
H
 
R
A
 
E
A
 
V
G
 
G
A
 
A
R
 
V
L
 
S
V
 
V
V
 
V
D
|
D
S
 
N
T
 
T
V
 
F
P
 
L
T
 
S
P
 
P
V
 
A
F
 
L
T
 
Q
R
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
V
 
L
V
 
V
M
 
L
H
 
H
S
 
S
A
 
C
T
 
T
K
|
K
Y
 
Y
L
 
L
N
 
N
G
 
G
H
 
H
S
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
V
A
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
V
V
 
I
T
 
A
R
 
K
A
 
D
E
 
P
D
 
D
-
 
V
-
 
V
-
 
T
-
 
E
-
 
L
D
 
A
F
 
W
W
 
W
A
 
A
R
 
N
I
 
N
K
 
I
T
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
G
 
G
A
 
V
V
 
T
L
 
G
G
 
G
P
 
A
F
 
F
E
 
D
A
 
S
W
 
Y
L
 
L
L
 
L
N
 
L
R
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
R
T
 
T
L
 
L
F
 
V
P
 
P
R
 
R
V
 
M
R
 
E
T
 
L
A
 
A
A
 
Q
A
 
R
S
 
N
A
 
A
L
 
Q
R
 
A
I
 
I
A
 
V
Q
 
K
H
 
Y
F
 
L
E
 
Q
H
 
T
H
 
Q
P
 
P
A
 
L
L
 
V
L
 
K
A
 
K
V
 
L
L
 
Y
Y
 
H
P
 
P
G
 
S
L
 
L
P
 
P
S
 
E
H
 
N
R
 
Q
G
 
G
H
 
H
D
 
E
I
 
I
A
 
A
C
 
A
R
 
R
Q
 
Q
M
 
Q
E
 
K
G
 
-
G
 
G
F
 
F
G
 
G
A
 
A
M
 
M
L
 
L
S
 
S
L
 
F
R
 
E
V
 
L
R
 
D
G
 
G
G
 
D
E
 
E
D
 
Q
A
 
T
A
 
L
R
 
R
R
 
R
V
 
F
A
 
L
G
 
G
A
 
G
V
 
L
K
 
S
I
 
L
F
 
F
R
 
T
R
 
L
A
 
A
T
 
E
S
 
S
L
 
L
G
 
G
S
 
G
V
 
V
E
 
E
S
 
S
L
 
L
I
 
I
E
 
S
H
 
H
R
 
A
G
 
A
P
 
T
I
 
M
E
 
T
G
 
H
P
 
A
G
 
G
T
 
M
R
 
A
-
 
P
-
 
E
-
 
A
-
 
R
-
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
G
C
 
I
P
 
S
L
 
E
D
 
T
L
 
L
L
 
L
R
 
R
L
 
I
S
 
S
V
 
T
G
 
G
I
 
I
E
 
E
D
 
D
S
 
G
D
 
E
D
 
D
L
 
L
I
 
I
A
 
A
D
 
D
L
 
L
E
 
E
Q
 
N
A
 
G
L
 
F
Q
 
R
Q
 
A
A
 
A
N
 
N
E
 
K

P00935 Cystathionine gamma-synthase; CGS; O-succinylhomoserine (thiol)-lyase; EC 2.5.1.48 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
42% identity, 93% coverage: 27:381/382 of query aligns to 23:385/386 of P00935

query
sites
P00935
I
 
V
V
 
V
P
 
P
P
 
P
I
 
I
H
 
H
L
 
L
A
 
S
T
 
S
T
 
T
F
 
Y
E
 
N
R
 
F
A
 
T
E
 
G
D
 
F
G
 
N
S
 
E
L
 
-
P
 
P
G
 
R
G
 
A
R
 
H
I
 
D
Y
 
Y
A
 
S
R
 
R
D
 
R
A
 
G
S
 
N
P
 
P
A
 
T
Y
 
R
D
 
D
P
 
V
A
 
V
E
 
Q
A
 
R
L
 
A
L
 
L
C
 
A
E
 
E
L
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
G
A
 
A
R
 
G
A
 
A
A
 
V
L
 
L
F
 
T
A
 
N
S
 
T
G
 
G
M
 
M
A
 
S
A
 
A
A
 
I
S
 
H
A
 
L
V
 
V
L
 
T
-
 
T
L
 
V
A
 
F
L
 
L
K
 
K
P
 
P
G
 
G
A
 
D
R
 
L
I
 
L
V
 
V
A
 
A
P
 
P
H
 
H
D
 
D
M
 
C
Y
 
Y
-
 
G
-
 
G
-
 
S
W
 
Y
S
 
R
L
 
L
R
 
F
N
 
D
W
 
S
M
 
L
I
 
A
G
 
K
F
 
R
A
 
G
A
 
C
N
 
Y
W
 
R
Q
 
V
I
 
L
A
 
F
L
 
V
D
 
D
F
 
Q
Y
 
G
A
 
D
D
 
E
A
 
Q
A
 
A
E
 
L
L
 
R
A
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
A
Q
 
E
R
 
K
P
 
P
A
 
-
D
 
K
L
 
L
V
 
V
W
 
L
V
 
V
E
 
E
T
 
S
P
 
P
A
 
S
N
 
N
P
 
P
T
 
L
W
 
L
E
 
R
I
 
V
L
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
A
R
 
K
A
 
I
A
 
C
E
 
H
L
 
L
A
 
A
H
 
R
A
 
E
A
 
V
G
 
G
A
 
A
R
 
V
L
 
S
V
 
V
V
 
V
D
 
D
S
 
N
T
 
T
V
 
F
P
 
L
T
 
S
P
 
P
V
 
A
F
 
L
T
 
Q
R
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
V
 
L
V
 
V
M
 
L
H
 
H
S
 
S
A
 
C
T
 
T
K
|
K
Y
 
Y
L
 
L
N
 
N
G
 
G
H
 
H
S
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
V
A
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
V
V
 
I
T
 
A
R
 
K
A
 
D
E
 
P
D
 
D
-
 
V
-
 
V
-
 
T
-
 
E
-
 
L
D
 
A
F
 
W
W
 
W
A
 
A
R
 
N
I
 
N
K
 
I
T
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
G
 
G
A
 
V
V
 
T
L
 
G
G
 
G
P
 
A
F
 
F
E
 
D
A
 
S
W
 
Y
L
 
L
L
 
L
N
 
L
R
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
R
T
 
T
L
 
L
F
 
V
P
 
P
R
 
R
V
 
M
R
 
E
T
 
L
A
 
A
A
 
Q
A
 
R
S
 
N
A
 
A
L
 
Q
R
 
A
I
 
I
A
 
V
Q
 
K
H
 
Y
F
 
L
E
 
Q
H
 
T
H
 
Q
P
 
P
A
 
L
L
 
V
L
 
K
A
 
K
V
 
L
L
 
Y
Y
 
H
P
 
P
G
 
S
L
 
L
P
 
P
S
 
E
H
 
N
R
 
Q
G
 
G
H
 
H
D
 
E
I
 
I
A
 
A
C
 
A
R
 
R
Q
 
Q
M
 
Q
E
 
K
G
 
-
G
 
G
F
 
F
G
 
G
A
 
A
M
 
M
L
 
L
S
 
S
L
 
F
R
 
E
V
 
L
R
 
D
G
 
G
G
 
D
E
 
E
D
 
Q
A
 
T
A
 
L
R
 
R
R
 
R
V
 
F
A
 
L
G
 
G
A
 
G
V
 
L
K
 
S
I
 
L
F
 
F
R
 
T
R
 
L
A
 
A
T
 
E
S
 
S
L
 
L
G
 
G
S
 
G
V
 
V
E
 
E
S
 
S
L
 
L
I
 
I
E
 
S
H
 
H
R
 
A
G
 
A
P
 
T
I
 
M
E
 
T
G
 
H
P
 
A
G
 
G
T
 
M
R
 
A
-
 
P
-
 
E
-
 
A
-
 
R
-
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
G
C
 
I
P
 
S
L
 
E
D
 
T
L
 
L
L
 
L
R
 
R
L
 
I
S
 
S
V
 
T
G
 
G
I
 
I
E
 
E
D
 
D
S
 
G
D
 
E
D
 
D
L
 
L
I
 
I
A
 
A
D
 
D
L
 
L
E
 
E
Q
 
N
A
 
G
L
 
F
Q
 
R
Q
 
A
A
 
A
N
 
N
E
 
K

4iyoB Crystal structure of cystathionine gamma lyase from xanthomonas oryzae pv. Oryzae (xometc) in complex with e-site serine, a-site serine, a- site external aldimine structure with aminoacrylate and a-site iminopropionate intermediates (see paper)
41% identity, 97% coverage: 7:376/382 of query aligns to 2:380/381 of 4iyoB

query
sites
4iyoB
L
 
L
S
 
S
P
 
L
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
I
Q
 
H
G
 
G
T
 
-
G
 
G
A
 
Q
T
 
S
P
 
P
M
 
D
P
 
P
H
 
S
R
 
T
D
 
G
-
 
A
I
 
V
V
 
M
P
 
P
P
 
P
I
 
I
H
 
Y
L
 
A
A
 
T
T
 
S
T
 
T
F
 
Y
E
 
A
R
 
Q
A
 
S
E
 
S
D
 
P
G
 
G
S
 
E
L
 
H
P
 
Q
G
 
G
G
 
F
R
 
E
I
 
-
Y
|
Y
A
 
S
R
|
R
D
x
T
A
 
H
S
 
N
P
 
P
A
 
T
Y
 
R
D
 
F
P
 
A
A
 
Y
E
 
E
A
 
R
L
 
C
L
 
V
C
 
A
E
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
G
A
 
T
R
 
R
A
 
A
A
 
F
L
 
A
F
 
F
A
 
A
S
 
S
G
 
G
M
 
M
A
 
A
A
 
A
A
 
T
S
 
S
A
 
T
V
 
V
L
 
M
L
 
E
A
 
L
L
 
L
K
 
D
P
 
A
G
 
G
A
 
S
R
 
H
I
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
M
H
 
D
D
 
D
M
 
L
Y
|
Y
-
 
G
-
 
G
-
 
T
W
 
F
S
x
R
L
 
L
R
 
F
N
 
E
W
 
R
M
 
V
I
 
R
G
 
R
F
 
R
A
 
T
A
 
A
N
 
G
W
 
L
Q
 
D
I
 
F
A
 
S
L
 
F
D
 
V
F
 
D
Y
 
L
A
 
T
D
 
D
A
 
P
A
 
A
E
 
A
L
 
F
A
 
K
A
 
A
L
 
A
L
 
I
Q
 
R
R
 
A
P
 
D
A
 
T
D
 
K
L
 
M
V
 
V
W
 
W
V
 
I
E
 
E
T
 
T
P
 
P
A
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
M
W
 
L
E
 
K
I
 
L
L
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
A
R
 
A
A
 
I
A
 
A
E
 
V
L
 
I
A
 
A
H
 
R
A
 
K
A
 
H
G
 
G
A
 
L
R
 
L
L
 
T
V
 
V
V
 
V
D
|
D
S
 
N
T
 
T
V
 
F
P
 
A
T
 
S
P
 
P
V
 
M
F
 
L
T
 
Q
R
 
R
P
 
P
L
 
L
A
 
S
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
V
 
L
V
 
V
M
 
V
H
 
H
S
 
S
A
 
A
T
 
T
K
|
K
Y
 
Y
L
 
L
N
 
N
G
 
G
H
 
H
S
 
S
D
 
D
V
 
M
V
 
V
A
 
G
G
 
G
V
 
I
L
 
A
V
 
V
T
 
V
R
 
G
A
 
D
E
 
N
D
 
A
D
 
E
F
 
L
W
 
A
A
 
E
R
x
Q
I
 
M
K
 
A
T
x
F
A
 
L
R
 
Q
A
x
N
A
 
S
G
 
I
G
 
G
A
 
G
V
 
V
L
 
Q
G
 
G
P
 
P
F
 
F
E
 
D
A
 
S
W
 
F
L
 
L
L
 
A
N
 
L
R
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
K
T
 
T
L
 
L
F
 
P
P
 
L
R
 
R
V
 
M
R
 
R
T
 
A
A
 
H
A
 
C
A
 
E
S
 
N
A
 
A
L
 
L
R
 
A
I
 
L
A
 
A
Q
 
Q
H
 
W
F
 
L
E
 
E
H
 
T
H
 
H
P
 
P
A
 
A
L
 
I
L
 
E
A
 
K
V
 
V
L
 
I
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
L
 
L
P
 
A
S
 
S
H
 
H
R
 
P
G
 
Q
H
 
H
D
 
V
I
 
L
A
 
A
C
 
K
R
 
R
Q
 
Q
M
 
M
E
 
S
G
 
-
G
 
G
F
 
F
G
 
G
A
 
G
M
 
I
L
 
V
S
 
S
L
 
I
R
 
V
V
 
L
R
 
K
G
 
G
G
 
G
E
 
F
D
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
K
R
 
R
V
 
F
A
 
C
G
 
E
A
 
K
V
 
T
K
 
E
I
 
L
F
 
F
R
 
T
R
 
L
A
 
A
T
x
E
S
|
S
L
 
L
G
 
G
S
 
G
V
 
V
E
 
E
S
 
S
L
 
L
I
 
V
E
 
N
H
 
H
R
 
-
G
 
-
P
 
P
I
 
A
E
 
V
G
 
M
P
x
T
G
 
H
T
 
A
R
 
S
C
 
I
P
 
P
L
 
V
-
 
A
-
 
R
-
 
R
-
 
E
-
 
Q
-
 
L
-
 
G
-
 
I
-
 
S
-
 
D
D
 
A
L
 
L
L
 
V
R
|
R
L
 
L
S
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
I
E
 
E
D
 
D
S
 
L
D
 
G
D
 
D
L
 
L
I
 
R
A
 
G
D
 
D
L
 
L
E
 
E
Q
 
R
A
 
A
L
 
L

4iy7B Crystal structure of cystathionine gamma lyase (xometc) from xanthomonas oryzae pv. Oryzae in complex with e-site serine, a-site external aldimine structure with serine and a-site external aldimine structure with aminoacrylate intermediates (see paper)
41% identity, 97% coverage: 7:376/382 of query aligns to 2:380/381 of 4iy7B

query
sites
4iy7B
L
 
L
S
 
S
P
 
L
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
I
Q
 
H
G
 
G
T
 
-
G
 
G
A
 
Q
T
 
S
P
 
P
M
 
D
P
 
P
H
 
S
R
 
T
D
 
G
-
 
A
I
 
V
V
 
M
P
 
P
P
 
P
I
 
I
H
 
Y
L
 
A
A
 
T
T
 
S
T
 
T
F
 
Y
E
 
A
R
 
Q
A
 
S
E
 
S
D
 
P
G
 
G
S
 
E
L
 
H
P
 
Q
G
 
G
G
 
F
R
 
E
I
 
-
Y
|
Y
A
 
S
R
|
R
D
x
T
A
 
H
S
 
N
P
 
P
A
 
T
Y
 
R
D
 
F
P
 
A
A
 
Y
E
 
E
A
 
R
L
 
C
L
 
V
C
 
A
E
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
G
A
 
T
R
 
R
A
 
A
A
 
F
L
 
A
F
 
F
A
 
A
S
 
S
G
|
G
M
|
M
A
 
A
A
 
A
A
 
T
S
 
S
A
 
T
V
 
V
L
 
M
L
 
E
A
 
L
L
 
L
K
 
D
P
 
A
G
 
G
A
 
S
R
 
H
I
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
M
H
 
D
D
 
D
M
 
L
Y
|
Y
-
 
G
-
 
G
-
 
T
W
 
F
S
x
R
L
 
L
R
 
F
N
 
E
W
 
R
M
 
V
I
 
R
G
 
R
F
 
R
A
 
T
A
 
A
N
 
G
W
 
L
Q
 
D
I
 
F
A
 
S
L
 
F
D
 
V
F
 
D
Y
 
L
A
 
T
D
 
D
A
 
P
A
 
A
E
 
A
L
 
F
A
 
K
A
 
A
L
 
A
L
 
I
Q
 
R
R
 
A
P
 
D
A
 
T
D
 
K
L
 
M
V
 
V
W
 
W
V
 
I
E
|
E
T
 
T
P
 
P
A
 
T
N
|
N
P
 
P
T
 
M
W
 
L
E
 
K
I
 
L
L
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
A
R
 
A
A
 
I
A
 
A
E
 
V
L
 
I
A
 
A
H
 
R
A
 
K
A
 
H
G
 
G
A
 
L
R
 
L
L
 
T
V
 
V
V
 
V
D
|
D
S
 
N
T
 
T
V
 
F
P
 
A
T
 
S
P
 
P
V
 
M
F
 
L
T
 
Q
R
 
R
P
 
P
L
 
L
A
 
S
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
V
 
L
V
 
V
M
 
V
H
 
H
S
|
S
A
 
A
T
 
T
K
|
K
Y
 
Y
L
 
L
N
 
N
G
 
G
H
 
H
S
 
S
D
 
D
V
 
M
V
 
V
A
 
G
G
 
G
V
 
I
L
 
A
V
 
V
T
 
V
R
 
G
A
 
D
E
 
N
D
 
A
D
 
E
F
 
L
W
 
A
A
 
E
R
x
Q
I
 
M
K
 
A
T
x
F
A
 
L
R
 
Q
A
x
N
A
 
S
G
 
I
G
 
G
A
 
G
V
 
V
L
 
Q
G
 
G
P
 
P
F
 
F
E
 
D
A
 
S
W
 
F
L
 
L
L
 
A
N
 
L
R
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
K
T
 
T
L
 
L
F
 
P
P
 
L
R
 
R
V
 
M
R
 
R
T
 
A
A
 
H
A
 
C
A
 
E
S
 
N
A
 
A
L
 
L
R
 
A
I
 
L
A
 
A
Q
 
Q
H
 
W
F
 
L
E
 
E
H
 
T
H
 
H
P
 
P
A
 
A
L
 
I
L
 
E
A
 
K
V
 
V
L
 
I
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
L
 
L
P
 
A
S
 
S
H
 
H
R
 
P
G
 
Q
H
 
H
D
 
V
I
 
L
A
 
A
C
 
K
R
 
R
Q
 
Q
M
 
M
E
 
S
G
 
-
G
 
G
F
 
F
G
 
G
A
 
G
M
 
I
L
 
V
S
 
S
L
 
I
R
 
V
V
 
L
R
 
K
G
 
G
G
 
G
E
 
F
D
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
K
R
 
R
V
 
F
A
 
C
G
 
E
A
 
K
V
 
T
K
 
E
I
 
L
F
 
F
R
 
T
R
 
L
A
 
A
T
x
E
S
|
S
L
|
L
G
 
G
S
 
G
V
 
V
E
 
E
S
 
S
L
 
L
I
 
V
E
 
N
H
 
H
R
 
-
G
 
-
P
 
P
I
 
A
E
 
V
G
 
M
P
x
T
G
 
H
T
 
A
R
 
S
C
 
I
P
 
P
L
 
V
-
 
A
-
 
R
-
 
R
-
 
E
-
 
Q
-
 
L
-
 
G
-
 
I
-
 
S
-
 
D
D
 
A
L
 
L
L
 
V
R
|
R
L
 
L
S
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
I
E
 
E
D
 
D
S
 
L
D
 
G
D
 
D
L
 
L
I
 
R
A
 
G
D
 
D
L
 
L
E
 
E
Q
 
R
A
 
A
L
 
L

4iy7A Crystal structure of cystathionine gamma lyase (xometc) from xanthomonas oryzae pv. Oryzae in complex with e-site serine, a-site external aldimine structure with serine and a-site external aldimine structure with aminoacrylate intermediates (see paper)
41% identity, 97% coverage: 7:376/382 of query aligns to 2:380/381 of 4iy7A

query
sites
4iy7A
L
 
L
S
 
S
P
 
L
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
I
Q
 
H
G
 
G
T
 
-
G
 
G
A
 
Q
T
 
S
P
 
P
M
 
D
P
 
P
H
 
S
R
 
T
D
 
G
-
 
A
I
 
V
V
 
M
P
 
P
P
 
P
I
 
I
H
 
Y
L
 
A
A
 
T
T
 
S
T
 
T
F
 
Y
E
 
A
R
 
Q
A
 
S
E
 
S
D
 
P
G
 
G
S
 
E
L
 
H
P
 
Q
G
 
G
G
 
F
R
 
E
I
 
-
Y
|
Y
A
 
S
R
|
R
D
x
T
A
 
H
S
 
N
P
 
P
A
 
T
Y
 
R
D
 
F
P
 
A
A
 
Y
E
 
E
A
 
R
L
 
C
L
 
V
C
 
A
E
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
G
A
 
T
R
 
R
A
 
A
A
 
F
L
 
A
F
 
F
A
 
A
S
 
S
G
|
G
M
|
M
A
 
A
A
 
A
A
 
T
S
 
S
A
 
T
V
 
V
L
 
M
L
 
E
A
 
L
L
 
L
K
 
D
P
 
A
G
 
G
A
 
S
R
 
H
I
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
M
H
 
D
D
 
D
M
 
L
Y
|
Y
-
 
G
-
 
G
-
 
T
W
 
F
S
x
R
L
 
L
R
 
F
N
 
E
W
 
R
M
 
V
I
 
R
G
 
R
F
 
R
A
 
T
A
 
A
N
 
G
W
 
L
Q
 
D
I
 
F
A
 
S
L
 
F
D
 
V
F
 
D
Y
 
L
A
 
T
D
 
D
A
 
P
A
 
A
E
 
A
L
 
F
A
 
K
A
 
A
L
 
A
L
 
I
Q
 
R
R
 
A
P
 
D
A
 
T
D
 
K
L
 
M
V
 
V
W
 
W
V
 
I
E
|
E
T
 
T
P
 
P
A
 
T
N
|
N
P
 
P
T
 
M
W
 
L
E
 
K
I
 
L
L
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
A
R
 
A
A
 
I
A
 
A
E
 
V
L
 
I
A
 
A
H
 
R
A
 
K
A
 
H
G
 
G
A
 
L
R
 
L
L
 
T
V
 
V
V
 
V
D
|
D
S
 
N
T
 
T
V
 
F
P
 
A
T
 
S
P
 
P
V
 
M
F
 
L
T
 
Q
R
 
R
P
 
P
L
 
L
A
 
S
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
V
 
L
V
 
V
M
 
V
H
 
H
S
|
S
A
 
A
T
 
T
K
|
K
Y
 
Y
L
 
L
N
 
N
G
 
G
H
 
H
S
 
S
D
 
D
V
 
M
V
 
V
A
 
G
G
 
G
V
 
I
L
 
A
V
 
V
T
 
V
R
 
G
A
 
D
E
 
N
D
 
A
D
 
E
F
 
L
W
 
A
A
 
E
R
 
Q
I
 
M
K
 
A
T
 
F
A
 
L
R
 
Q
A
x
N
A
 
S
G
 
I
G
 
G
A
 
G
V
 
V
L
 
Q
G
 
G
P
 
P
F
 
F
E
 
D
A
 
S
W
 
F
L
 
L
L
 
A
N
 
L
R
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
K
T
 
T
L
 
L
F
 
P
P
 
L
R
 
R
V
 
M
R
 
R
T
 
A
A
 
H
A
 
C
A
 
E
S
 
N
A
 
A
L
 
L
R
 
A
I
 
L
A
 
A
Q
 
Q
H
 
W
F
 
L
E
 
E
H
 
T
H
 
H
P
 
P
A
 
A
L
 
I
L
 
E
A
 
K
V
 
V
L
 
I
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
L
 
L
P
 
A
S
 
S
H
 
H
R
 
P
G
 
Q
H
 
H
D
 
V
I
 
L
A
 
A
C
 
K
R
 
R
Q
 
Q
M
 
M
E
 
S
G
 
-
G
 
G
F
 
F
G
 
G
A
 
G
M
 
I
L
 
V
S
 
S
L
 
I
R
 
V
V
 
L
R
 
K
G
 
G
G
 
G
E
 
F
D
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
K
R
 
R
V
 
F
A
 
C
G
 
E
A
 
K
V
 
T
K
 
E
I
 
L
F
 
F
R
 
T
R
 
L
A
 
A
T
x
E
S
|
S
L
|
L
G
 
G
S
 
G
V
 
V
E
 
E
S
 
S
L
 
L
I
 
V
E
 
N
H
 
H
R
 
-
G
 
-
P
 
P
I
 
A
E
 
V
G
 
M
P
x
T
G
 
H
T
 
A
R
 
S
C
 
I
P
 
P
L
 
V
-
 
A
-
 
R
-
 
R
-
 
E
-
 
Q
-
 
L
-
 
G
-
 
I
-
 
S
-
 
D
D
 
A
L
 
L
L
 
V
R
|
R
L
 
L
S
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
I
E
 
E
D
 
D
S
 
L
D
 
G
D
 
D
L
 
L
I
 
R
A
 
G
D
 
D
L
 
L
E
 
E
Q
 
R
A
 
A
L
 
L

4ixzA Native structure of cystathionine gamma lyase (xometc) from xanthomonas oryzae pv. Oryzae at ph 9.0 (see paper)
41% identity, 97% coverage: 7:376/382 of query aligns to 2:380/381 of 4ixzA

query
sites
4ixzA
L
 
L
S
 
S
P
 
L
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
I
Q
 
H
G
 
G
T
 
-
G
 
G
A
 
Q
T
 
S
P
 
P
M
 
D
P
 
P
H
 
S
R
 
T
D
 
G
-
 
A
I
 
V
V
 
M
P
 
P
P
 
P
I
 
I
H
 
Y
L
 
A
A
 
T
T
 
S
T
 
T
F
 
Y
E
 
A
R
 
Q
A
 
S
E
 
S
D
 
P
G
 
G
S
 
E
L
 
H
P
 
Q
G
 
G
G
 
F
R
 
E
I
 
-
Y
 
Y
A
 
S
R
|
R
D
 
T
A
 
H
S
 
N
P
 
P
A
 
T
Y
 
R
D
 
F
P
 
A
A
 
Y
E
 
E
A
 
R
L
 
C
L
 
V
C
 
A
E
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
G
A
 
T
R
 
R
A
 
A
A
 
F
L
 
A
F
 
F
A
 
A
S
 
S
G
 
G
M
 
M
A
 
A
A
 
A
A
 
T
S
 
S
A
 
T
V
 
V
L
 
M
L
 
E
A
 
L
L
 
L
K
 
D
P
 
A
G
 
G
A
 
S
R
 
H
I
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
M
H
 
D
D
 
D
M
 
L
Y
|
Y
-
 
G
-
 
G
-
 
T
W
 
F
S
 
R
L
 
L
R
 
F
N
 
E
W
 
R
M
 
V
I
 
R
G
 
R
F
 
R
A
 
T
A
 
A
N
 
G
W
 
L
Q
 
D
I
 
F
A
 
S
L
 
F
D
 
V
F
 
D
Y
 
L
A
 
T
D
 
D
A
 
P
A
 
A
E
 
A
L
 
F
A
 
K
A
 
A
L
 
A
L
 
I
Q
 
R
R
 
A
P
 
D
A
 
T
D
 
K
L
 
M
V
 
V
W
 
W
V
 
I
E
 
E
T
 
T
P
 
P
A
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
M
W
 
L
E
 
K
I
 
L
L
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
A
R
 
A
A
 
I
A
 
A
E
 
V
L
 
I
A
 
A
H
 
R
A
 
K
A
 
H
G
 
G
A
 
L
R
 
L
L
 
T
V
 
V
V
 
V
D
|
D
S
 
N
T
 
T
V
 
F
P
 
A
T
 
S
P
 
P
V
 
M
F
 
L
T
 
Q
R
 
R
P
 
P
L
 
L
A
 
S
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
V
 
L
V
 
V
M
 
V
H
 
H
S
 
S
A
 
A
T
 
T
K
|
K
Y
 
Y
L
 
L
N
 
N
G
 
G
H
 
H
S
 
S
D
 
D
V
 
M
V
 
V
A
 
G
G
 
G
V
 
I
L
 
A
V
 
V
T
 
V
R
 
G
A
 
D
E
 
N
D
 
A
D
 
E
F
 
L
W
 
A
A
 
E
R
 
Q
I
 
M
K
 
A
T
 
F
A
 
L
R
 
Q
A
 
N
A
 
S
G
 
I
G
 
G
A
 
G
V
 
V
L
 
Q
G
 
G
P
 
P
F
 
F
E
 
D
A
 
S
W
 
F
L
 
L
L
 
A
N
 
L
R
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
K
T
 
T
L
 
L
F
 
P
P
 
L
R
 
R
V
 
M
R
 
R
T
 
A
A
 
H
A
 
C
A
 
E
S
 
N
A
 
A
L
 
L
R
 
A
I
 
L
A
 
A
Q
 
Q
H
 
W
F
 
L
E
 
E
H
 
T
H
 
H
P
 
P
A
 
A
L
 
I
L
 
E
A
 
K
V
 
V
L
 
I
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
L
 
L
P
 
A
S
 
S
H
 
H
R
 
P
G
 
Q
H
 
H
D
 
V
I
 
L
A
 
A
C
 
K
R
 
R
Q
 
Q
M
 
M
E
 
S
G
 
-
G
 
G
F
 
F
G
 
G
A
 
G
M
 
I
L
 
V
S
 
S
L
 
I
R
 
V
V
 
L
R
 
K
G
 
G
G
 
G
E
 
F
D
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
K
R
 
R
V
 
F
A
 
C
G
 
E
A
 
K
V
 
T
K
 
E
I
 
L
F
 
F
R
 
T
R
 
L
A
 
A
T
 
E
S
|
S
L
|
L
G
 
G
S
 
G
V
 
V
E
 
E
S
 
S
L
 
L
I
 
V
E
 
N
H
 
H
R
 
-
G
 
-
P
 
P
I
 
A
E
 
V
G
 
M
P
x
T
G
 
H
T
 
A
R
 
S
C
 
I
P
 
P
L
 
V
-
 
A
-
 
R
-
 
R
-
 
E
-
 
Q
-
 
L
-
 
G
-
 
I
-
 
S
-
 
D
D
 
A
L
 
L
L
 
V
R
|
R
L
 
L
S
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
I
E
 
E
D
 
D
S
 
L
D
 
G
D
 
D
L
 
L
I
 
R
A
 
G
D
 
D
L
 
L
E
 
E
Q
 
R
A
 
A
L
 
L

4ixsB Native structure of xometc at ph 5.2 (see paper)
40% identity, 97% coverage: 7:376/382 of query aligns to 1:371/372 of 4ixsB

query
sites
4ixsB
L
 
L
S
 
S
P
 
L
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
I
Q
 
H
G
 
G
T
 
-
G
 
G
A
 
Q
T
 
S
P
 
P
M
 
D
P
 
P
H
 
S
R
 
T
D
 
G
-
 
A
I
 
V
V
 
M
P
 
P
P
 
P
I
 
I
H
 
Y
L
 
A
A
 
T
T
 
S
T
 
T
F
 
Y
E
 
A
R
 
Q
A
 
S
E
 
S
D
 
P
G
 
-
S
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
I
 
-
Y
 
-
A
 
S
R
|
R
D
 
T
A
 
H
S
 
N
P
 
P
A
 
T
Y
 
R
D
 
F
P
 
A
A
 
Y
E
 
E
A
 
R
L
 
C
L
 
V
C
 
A
E
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
G
A
 
T
R
 
R
A
 
A
A
 
F
L
 
A
F
 
F
A
 
A
S
 
S
G
 
G
M
 
M
A
 
A
A
 
A
A
 
T
S
 
S
A
 
T
V
 
V
L
 
M
L
 
E
A
 
L
L
 
L
K
 
D
P
 
A
G
 
G
A
 
S
R
 
H
I
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
M
H
 
D
D
 
D
M
 
L
Y
|
Y
-
 
G
-
 
G
-
 
T
W
 
F
S
 
R
L
 
L
R
 
F
N
 
E
W
 
R
M
 
V
I
 
R
G
 
R
F
 
R
A
 
T
A
 
A
N
 
G
W
 
L
Q
 
D
I
 
F
A
 
S
L
 
F
D
 
V
F
 
D
Y
 
L
A
 
T
D
 
D
A
 
P
A
 
A
E
 
A
L
 
F
A
 
K
A
 
A
L
 
A
L
 
I
Q
 
R
R
 
A
P
 
D
A
 
T
D
 
K
L
 
M
V
 
V
W
 
W
V
 
I
E
 
E
T
 
T
P
 
P
A
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
M
W
 
L
E
 
K
I
 
L
L
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
A
R
 
A
A
 
I
A
 
A
E
 
V
L
 
I
A
 
A
H
 
R
A
 
K
A
 
H
G
 
G
A
 
L
R
 
L
L
 
T
V
 
V
V
 
V
D
|
D
S
 
N
T
 
T
V
 
F
P
 
A
T
 
S
P
 
P
V
 
M
F
 
L
T
 
Q
R
 
R
P
 
P
L
 
L
A
 
S
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
V
 
L
V
 
V
M
 
V
H
 
H
S
 
S
A
 
A
T
 
T
K
|
K
Y
 
Y
L
 
L
N
 
N
G
 
G
H
 
H
S
 
S
D
 
D
V
 
M
V
 
V
A
 
G
G
 
G
V
 
I
L
 
A
V
 
V
T
 
V
R
 
G
A
 
D
E
 
N
D
 
A
D
 
E
F
 
L
W
 
A
A
 
E
R
 
Q
I
 
M
K
 
A
T
 
F
A
 
L
R
 
Q
A
 
N
A
 
S
G
 
I
G
 
G
A
 
G
V
 
V
L
 
Q
G
 
G
P
 
P
F
 
F
E
 
D
A
 
S
W
 
F
L
 
L
L
 
A
N
 
L
R
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
K
T
 
T
L
 
L
F
 
P
P
 
L
R
 
R
V
 
M
R
 
R
T
 
A
A
 
H
A
 
C
A
 
E
S
 
N
A
 
A
L
 
L
R
 
A
I
 
L
A
 
A
Q
 
Q
H
 
W
F
 
L
E
 
E
H
 
T
H
 
H
P
 
P
A
 
A
L
 
I
L
 
E
A
 
K
V
 
V
L
 
I
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
L
 
L
P
 
A
S
 
S
H
 
H
R
 
P
G
 
Q
H
 
H
D
 
V
I
 
L
A
 
A
C
 
K
R
 
R
Q
 
Q
M
 
M
E
 
S
G
 
-
G
 
G
F
 
F
G
 
G
A
 
G
M
 
I
L
 
V
S
 
S
L
 
I
R
 
V
V
 
L
R
 
K
G
 
G
G
 
G
E
 
F
D
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
K
R
 
R
V
 
F
A
 
C
G
 
E
A
 
K
V
 
T
K
 
E
I
 
L
F
 
F
R
 
T
R
 
L
A
 
A
T
x
E
S
|
S
L
 
L
G
 
G
S
 
G
V
 
V
E
 
E
S
 
S
L
 
L
I
 
V
E
 
N
H
 
H
R
 
-
G
 
-
P
 
P
I
 
A
E
 
V
G
 
M
P
x
T
G
 
H
T
 
A
R
 
S
C
 
I
P
 
P
L
 
V
-
 
A
-
 
R
-
 
R
-
 
E
-
 
Q
-
 
L
-
 
G
-
 
I
-
 
S
-
 
D
D
 
A
L
 
L
L
 
V
R
|
R
L
 
L
S
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
I
E
 
E
D
 
D
S
 
L
D
 
G
D
 
D
L
 
L
I
 
R
A
 
G
D
 
D
L
 
L
E
 
E
Q
 
R
A
 
A
L
 
L

5x5hA Crystal structure of metb from corynebacterium glutamicum (see paper)
38% identity, 92% coverage: 27:378/382 of query aligns to 26:383/385 of 5x5hA

query
sites
5x5hA
I
 
I
V
 
N
P
 
T
P
 
P
I
 
I
H
 
Y
L
 
A
A
 
S
T
 
T
T
 
T
F
|
F
E
 
A
R
x
Q
A
 
N
E
 
A
D
 
P
G
 
N
S
 
E
L
 
L
P
 
R
G
 
K
G
 
G
R
 
Y
I
x
E
Y
 
Y
A
 
T
R
|
R
D
 
V
A
 
G
S
 
N
P
 
P
A
 
T
Y
 
I
D
 
V
P
 
A
A
 
L
E
 
E
A
 
Q
L
 
T
L
 
V
C
 
A
E
 
A
L
 
L
E
|
E
G
 
G
G
 
A
A
 
K
R
 
Y
A
 
G
A
 
R
L
 
A
F
 
F
A
 
S
S
 
S
G
|
G
M
|
M
A
 
A
A
 
A
A
 
T
S
 
D
A
 
I
V
 
L
L
 
F
-
 
R
L
 
I
A
 
I
L
 
L
K
 
K
P
 
P
G
 
G
A
 
D
R
 
H
I
 
I
V
 
V
A
 
L
P
 
G
H
 
N
D
 
D
M
 
A
Y
|
Y
W
 
G
S
 
G
L
 
T
R
 
Y
N
 
R
W
 
L
M
 
I
I
 
D
G
 
T
F
 
V
A
 
F
A
 
T
N
 
A
W
 
W
Q
 
G
I
 
V
A
 
E
L
 
Y
D
 
T
F
 
V
Y
 
V
A
 
D
D
 
T
A
 
S
A
 
V
-
 
V
-
 
E
E
 
E
L
 
V
A
 
K
A
 
A
L
 
A
L
 
I
Q
 
K
R
 
D
P
 
N
A
 
T
D
 
K
L
 
L
V
 
I
W
 
W
V
 
V
E
 
E
T
 
T
P
 
P
A
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
A
W
 
L
E
 
G
I
 
I
L
 
T
D
 
D
I
 
I
A
 
E
R
 
A
A
 
V
A
 
A
E
 
K
L
 
L
A
 
T
H
 
E
A
 
G
A
 
T
G
 
N
A
 
A
R
 
K
L
 
L
V
 
V
V
 
V
D
|
D
S
 
N
T
 
T
V
 
F
P
 
A
T
 
S
P
 
P
V
 
Y
F
 
L
T
 
Q
R
x
Q
P
|
P
L
|
L
A
 
K
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
H
V
 
A
V
 
V
M
 
L
H
 
H
S
|
S
A
 
T
T
|
T
K
|
K
Y
 
Y
L
 
I
N
 
G
G
 
G
H
 
H
S
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
V
A
 
G
G
 
G
V
 
L
L
 
V
V
 
V
T
 
T
R
 
N
A
 
-
E
 
D
D
 
Q
D
 
E
F
 
M
W
 
D
A
 
E
R
 
E
I
 
L
K
 
L
T
 
F
A
 
M
R
 
Q
A
 
G
A
 
G
G
 
I
G
 
G
A
 
P
V
 
I
L
 
P
G
 
S
P
 
V
F
 
F
E
 
D
A
 
A
W
 
Y
L
 
L
L
 
T
N
 
A
R
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
K
T
 
T
L
 
L
F
 
A
P
 
V
R
 
R
V
 
M
R
 
D
T
 
R
A
 
H
A
 
C
A
 
D
S
 
N
A
 
A
L
 
E
R
 
K
I
 
I
A
 
A
Q
 
E
H
 
F
F
 
L
E
 
D
H
 
S
H
 
R
P
 
P
A
 
E
L
 
V
L
 
S
A
 
T
V
 
V
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
L
 
L
P
 
K
S
 
N
H
 
H
R
 
P
G
 
G
H
 
H
D
 
E
I
 
V
A
 
A
C
 
A
R
 
K
Q
 
Q
M
 
M
E
 
K
G
 
-
G
 
R
F
 
F
G
 
G
A
 
G
M
 
M
L
 
I
S
 
S
L
 
V
R
 
R
V
 
F
R
 
A
G
 
G
G
 
G
E
 
E
D
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
K
R
 
K
V
 
F
A
 
C
G
 
T
A
 
S
V
 
T
K
 
K
I
 
L
F
 
I
R
 
C
R
 
L
A
 
A
T
 
E
S
 
S
L
 
L
G
 
G
S
 
G
V
 
V
E
 
E
S
 
S
L
 
L
I
 
L
E
 
E
H
 
H
R
 
P
G
 
A
P
 
T
I
 
M
E
 
T
-
 
H
-
 
Q
-
 
S
-
 
A
-
 
A
G
 
G
P
 
S
G
 
Q
T
 
L
R
 
E
C
 
V
P
 
P
L
 
R
D
 
D
L
 
L
L
 
V
R
 
R
L
 
I
S
 
S
V
 
I
G
 
G
I
 
I
E
 
E
D
 
D
S
 
I
D
 
E
D
 
D
L
 
L
I
 
L
A
 
A
D
 
D
L
 
V
E
 
E
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
Q
 
N
Q
 
N

6k1lB E53a mutant of a putative cystathionine gamma-lyase (see paper)
41% identity, 97% coverage: 7:377/382 of query aligns to 3:382/382 of 6k1lB

query
sites
6k1lB
L
 
L
S
 
A
P
 
L
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
I
Q
 
H
G
 
G
T
 
-
G
 
G
A
 
Q
T
 
S
P
 
P
M
 
D
P
 
P
H
 
S
R
 
T
D
 
G
-
 
A
I
 
V
V
 
M
P
 
P
P
 
P
I
 
I
H
 
Y
L
 
A
A
 
T
T
 
S
T
 
T
F
 
Y
E
 
A
R
 
Q
A
 
S
E
 
S
D
 
P
G
 
G
S
 
E
L
 
H
P
 
Q
G
 
G
G
 
-
R
 
F
I
 
A
Y
|
Y
A
 
S
R
|
R
D
 
T
A
 
H
S
 
N
P
 
P
A
 
T
Y
 
R
D
 
F
P
 
A
A
 
Y
E
 
E
A
 
R
L
 
C
L
 
V
C
 
A
E
 
S
L
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
G
A
 
T
R
 
R
A
 
G
A
 
F
L
 
A
F
 
F
A
 
A
S
|
S
G
|
G
M
|
M
A
 
A
A
 
A
A
 
S
S
 
S
A
 
T
V
 
V
L
 
I
L
 
E
A
 
L
L
 
L
K
 
D
P
 
A
G
 
G
A
 
S
R
 
H
I
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
M
H
 
D
D
 
D
M
 
I
Y
|
Y
W
 
G
-
 
G
S
 
S
L
 
F
R
 
R
N
 
-
W
 
-
M
 
L
I
 
F
G
 
E
F
 
R
A
 
V
A
 
R
N
 
R
W
 
R
Q
 
T
I
 
A
A
 
G
L
 
L
D
 
D
F
 
F
-
 
S
Y
 
F
A
 
V
D
 
D
A
 
L
A
 
T
E
 
D
L
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
F
-
 
E
-
 
A
-
 
S
L
 
I
Q
 
T
R
 
P
P
 
K
A
 
T
D
 
K
L
 
M
V
 
V
W
 
W
V
 
I
E
 
E
T
 
T
P
 
P
A
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
M
W
 
L
E
 
K
I
 
I
L
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
A
R
 
A
A
 
V
A
 
A
E
 
A
L
 
I
A
 
A
H
 
K
A
 
R
A
 
H
G
 
G
A
 
L
R
 
I
L
 
V
V
 
V
V
 
V
D
|
D
S
 
N
T
 
T
V
 
F
P
 
A
T
 
S
P
 
P
V
 
M
F
 
L
T
 
Q
R
 
R
P
 
P
L
 
L
A
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
V
 
L
V
 
V
M
 
L
H
 
H
S
|
S
A
 
A
T
 
T
K
|
K
Y
 
Y
L
 
L
N
 
N
G
 
G
H
 
H
S
 
S
D
 
D
V
 
M
V
 
V
A
 
G
G
 
G
V
 
M
L
 
V
V
 
V
T
 
V
R
 
G
A
 
D
E
 
N
D
 
A
D
 
E
F
 
L
W
 
A
A
 
E
R
 
Q
I
 
M
K
 
A
T
 
F
A
 
L
R
 
Q
A
 
N
A
 
S
G
 
V
G
 
G
A
 
G
V
 
V
L
 
Q
G
 
G
P
 
P
F
 
F
E
 
D
A
 
S
W
 
F
L
 
L
L
 
A
N
 
L
R
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
K
T
 
T
L
 
L
F
 
P
P
 
L
R
 
R
V
 
M
R
 
K
T
 
A
A
 
H
A
 
C
A
 
A
S
 
N
A
 
A
L
 
L
R
 
A
I
 
L
A
 
A
Q
 
Q
H
 
W
F
 
L
E
 
E
H
 
K
H
 
H
P
 
P
A
 
A
L
 
V
L
 
E
A
 
K
V
 
V
L
 
I
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
L
 
L
P
 
A
S
 
S
H
 
H
R
 
P
G
 
Q
H
 
H
D
 
E
I
 
L
A
 
A
C
 
G
R
 
K
Q
 
Q
M
 
M
E
 
-
G
 
A
G
 
G
F
 
Y
G
 
G
A
 
G
M
 
I
L
 
V
S
 
S
L
 
I
R
 
V
V
 
L
R
 
K
G
 
G
G
 
G
E
 
F
D
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
K
R
 
R
V
 
F
A
 
C
G
 
E
A
 
K
V
 
T
K
 
E
I
 
L
F
 
F
R
 
T
R
 
L
A
 
A
T
x
E
S
 
S
L
 
L
G
 
G
S
 
G
V
 
V
E
 
E
S
 
S
L
 
L
I
 
V
E
 
N
H
 
H
R
 
-
G
 
-
P
 
P
I
 
A
E
 
V
G
 
M
P
x
T
G
 
H
T
 
A
R
 
S
C
 
I
P
 
P
L
 
V
-
 
A
-
 
R
-
 
R
-
 
E
-
 
Q
-
 
L
-
 
G
-
 
I
-
 
S
-
 
D
D
 
A
L
 
L
L
 
V
R
|
R
L
 
L
S
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
V
E
 
E
D
 
D
S
 
L
D
 
G
D
 
D
L
 
L
I
 
Q
A
 
V
D
 
D
L
 
L
E
 
G
Q
 
E
A
 
A
L
 
L
Q
 
K

6k1lA E53a mutant of a putative cystathionine gamma-lyase (see paper)
41% identity, 97% coverage: 7:377/382 of query aligns to 3:382/382 of 6k1lA

query
sites
6k1lA
L
 
L
S
 
A
P
 
L
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
I
Q
 
H
G
 
G
T
 
-
G
 
G
A
 
Q
T
 
S
P
 
P
M
 
D
P
 
P
H
 
S
R
 
T
D
 
G
-
 
A
I
 
V
V
 
M
P
 
P
P
 
P
I
 
I
H
 
Y
L
 
A
A
 
T
T
 
S
T
 
T
F
 
Y
E
 
A
R
 
Q
A
 
S
E
 
S
D
 
P
G
 
G
S
 
E
L
 
H
P
 
Q
G
 
G
G
 
-
R
 
F
I
 
A
Y
|
Y
A
 
S
R
|
R
D
 
T
A
 
H
S
 
N
P
 
P
A
 
T
Y
 
R
D
 
F
P
 
A
A
 
Y
E
 
E
A
 
R
L
 
C
L
 
V
C
 
A
E
 
S
L
 
L
E
 
E
G
 
G
G
 
G
A
 
T
R
 
R
A
 
G
A
 
F
L
 
A
F
 
F
A
 
A
S
 
S
G
|
G
M
|
M
A
 
A
A
 
A
A
 
S
S
 
S
A
 
T
V
 
V
L
 
I
L
 
E
A
 
L
L
 
L
K
 
D
P
 
A
G
 
G
A
 
S
R
 
H
I
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
M
H
 
D
D
 
D
M
 
I
Y
|
Y
W
 
G
-
 
G
S
 
S
L
 
F
R
 
R
N
 
-
W
 
-
M
 
L
I
 
F
G
 
E
F
 
R
A
 
V
A
 
R
N
 
R
W
 
R
Q
 
T
I
 
A
A
 
G
L
 
L
D
 
D
F
 
F
-
 
S
Y
 
F
A
 
V
D
 
D
A
 
L
A
 
T
E
 
D
L
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
F
-
 
E
-
 
A
-
 
S
L
 
I
Q
 
T
R
 
P
P
 
K
A
 
T
D
 
K
L
 
M
V
 
V
W
 
W
V
 
I
E
 
E
T
 
T
P
 
P
A
 
T
N
 
N
P
 
P
T
 
M
W
 
L
E
 
K
I
 
I
L
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
A
R
 
A
A
 
V
A
 
A
E
 
A
L
 
I
A
 
A
H
 
K
A
 
R
A
 
H
G
 
G
A
 
L
R
 
I
L
 
V
V
 
V
V
 
V
D
|
D
S
 
N
T
 
T
V
 
F
P
 
A
T
 
S
P
 
P
V
 
M
F
 
L
T
 
Q
R
 
R
P
 
P
L
 
L
A
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
V
 
L
V
 
V
M
 
L
H
 
H
S
|
S
A
 
A
T
|
T
K
|
K
Y
 
Y
L
 
L
N
 
N
G
 
G
H
 
H
S
 
S
D
 
D
V
 
M
V
 
V
A
 
G
G
 
G
V
 
M
L
 
V
V
 
V
T
 
V
R
 
G
A
 
D
E
 
N
D
 
A
D
 
E
F
 
L
W
 
A
A
 
E
R
 
Q
I
 
M
K
 
A
T
 
F
A
 
L
R
 
Q
A
 
N
A
 
S
G
 
V
G
 
G
A
 
G
V
 
V
L
 
Q
G
 
G
P
 
P
F
 
F
E
 
D
A
 
S
W
 
F
L
 
L
L
 
A
N
 
L
R
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
K
T
 
T
L
 
L
F
 
P
P
 
L
R
 
R
V
 
M
R
 
K
T
 
A
A
 
H
A
 
C
A
 
A
S
 
N
A
 
A
L
 
L
R
 
A
I
 
L
A
 
A
Q
 
Q
H
 
W
F
 
L
E
 
E
H
 
K
H
 
H
P
 
P
A
 
A
L
 
V
L
 
E
A
 
K
V
 
V
L
 
I
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
L
 
L
P
 
A
S
 
S
H
 
H
R
 
P
G
 
Q
H
 
H
D
 
E
I
 
L
A
 
A
C
 
G
R
 
K
Q
 
Q
M
 
M
E
 
-
G
 
A
G
 
G
F
 
Y
G
 
G
A
 
G
M
 
I
L
 
V
S
 
S
L
 
I
R
 
V
V
 
L
R
 
K
G
 
G
G
 
G
E
 
F
D
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
K
R
 
R
V
 
F
A
 
C
G
 
E
A
 
K
V
 
T
K
 
E
I
 
L
F
 
F
R
 
T
R
 
L
A
 
A
T
 
E
S
 
S
L
 
L
G
 
G
S
 
G
V
 
V
E
 
E
S
 
S
L
 
L
I
 
V
E
 
N
H
 
H
R
 
-
G
 
-
P
 
P
I
 
A
E
 
V
G
 
M
P
 
T
G
 
H
T
 
A
R
 
S
C
 
I
P
 
P
L
 
V
-
 
A
-
 
R
-
 
R
-
 
E
-
 
Q
-
 
L
-
 
G
-
 
I
-
 
S
-
 
D
D
 
A
L
 
L
L
 
V
R
 
R
L
 
L
S
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
V
E
 
E
D
 
D
S
 
L
D
 
G
D
 
D
L
 
L
I
 
Q
A
 
V
D
 
D
L
 
L
E
 
G
Q
 
E
A
 
A
L
 
L
Q
 
K

1e5fA Methionine gamma-lyase (mgl) from trichomonas vaginalis
34% identity, 97% coverage: 6:376/382 of query aligns to 2:389/393 of 1e5fA

query
sites
1e5fA
K
 
R
L
 
M
S
 
T
P
 
P
A
 
A
T
 
T
L
 
A
A
 
C
A
 
I
Q
 
H
G
 
A
T
 
N
G
 
-
A
 
-
T
 
-
P
 
-
M
 
-
P
 
P
H
 
Q
R
 
K
D
 
D
-
 
Q
-
 
F
-
 
G
-
 
A
I
 
A
V
 
I
P
 
P
P
 
P
I
 
I
H
 
Y
L
 
Q
A
 
T
T
 
S
T
 
T
F
 
F
-
 
V
-
 
F
E
 
D
R
 
N
A
 
C
E
 
Q
D
 
Q
G
 
G
S
 
G
-
 
N
-
 
R
-
 
F
-
 
A
-
 
G
L
 
Q
P
 
E
G
 
S
G
 
G
R
 
Y
I
 
I
Y
|
Y
A
 
T
R
|
R
D
 
L
A
 
G
S
 
N
P
 
P
A
 
T
Y
 
V
D
 
S
P
 
N
A
 
L
E
 
E
A
 
G
L
 
K
L
 
I
C
 
A
E
 
F
L
 
L
E
 
E
G
 
K
G
 
T
A
 
E
R
 
A
A
 
C
A
 
V
L
 
A
F
 
T
A
 
S
S
 
S
G
|
G
M
|
M
A
 
G
A
 
A
-
 
I
A
 
A
S
 
A
A
 
T
V
 
V
L
 
L
L
 
T
A
 
I
L
 
L
K
 
K
P
 
A
G
 
G
A
 
D
R
 
H
I
 
L
V
 
I
A
 
S
P
 
D
H
 
E
D
 
C
M
 
L
Y
|
Y
W
 
G
S
 
C
L
 
T
R
 
H
N
 
A
W
 
L
M
 
F
I
 
E
G
 
H
F
 
A
A
 
L
A
 
T
N
 
K
W
 
F
Q
 
G
I
 
I
A
 
Q
L
 
V
D
 
D
F
 
F
Y
 
I
A
 
N
D
 
T
A
 
A
-
 
I
-
 
P
A
 
G
E
 
E
L
 
V
A
 
K
A
 
K
L
 
H
L
 
M
Q
 
K
R
 
P
P
 
N
A
 
T
D
 
K
L
 
I
V
 
V
W
 
Y
V
 
F
E
 
E
T
 
T
P
 
P
A
 
A
N
 
N
P
 
P
T
 
T
W
 
L
E
 
K
I
 
I
L
 
I
D
 
D
I
 
M
A
 
E
R
 
R
A
 
V
A
 
C
E
 
K
L
 
D
A
 
A
H
 
H
A
 
S
A
 
Q
G
 
E
A
 
G
R
 
V
L
 
L
V
 
V
V
 
I
-
 
A
D
|
D
S
 
N
T
 
T
V
 
F
P
 
C
T
 
S
P
 
P
V
 
M
F
 
I
T
 
T
R
 
N
P
 
P
L
 
V
A
 
D
L
 
F
G
 
G
A
 
V
D
 
D
V
 
V
V
 
V
M
 
V
H
 
H
S
|
S
A
 
A
T
 
T
K
|
K
Y
 
Y
L
 
I
N
 
N
G
 
G
H
 
H
S
 
T
D
 
D
V
 
V
V
 
V
A
 
A
G
 
G
V
 
L
L
 
I
V
 
C
T
 
G
R
 
K
A
 
A
E
 
D
D
 
L
D
 
L
F
 
Q
W
 
Q
A
 
I
R
 
R
I
 
M
K
 
V
T
 
G
A
 
I
R
 
K
A
 
D
A
 
I
G
 
T
G
 
G
A
 
S
V
 
V
L
 
I
G
 
S
P
 
P
F
 
H
E
 
D
A
 
A
W
 
W
L
 
L
L
 
I
N
 
T
R
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
S
T
 
T
L
 
L
F
 
N
P
 
I
R
 
R
V
 
M
R
 
K
T
 
A
A
 
E
A
 
S
A
 
E
S
 
N
A
 
A
L
 
M
R
 
K
I
 
V
A
 
A
Q
 
E
H
 
Y
F
 
L
E
 
K
H
 
S
H
 
H
P
 
P
A
 
A
L
 
V
L
 
E
A
 
K
V
 
V
L
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
L
 
F
P
 
E
S
 
D
H
 
H
R
 
E
G
 
G
H
 
H
D
 
D
I
 
I
A
 
A
C
 
K
R
 
K
Q
 
Q
M
 
M
E
 
R
G
 
-
G
 
M
F
 
Y
G
 
G
A
 
S
M
 
M
L
 
I
S
 
T
L
 
F
R
 
I
V
 
L
R
 
K
G
 
S
G
 
G
E
 
F
D
 
E
A
 
G
A
 
A
R
 
K
R
 
K
V
 
L
A
 
L
G
 
D
A
 
N
V
 
L
K
 
K
I
 
L
F
 
I
R
 
T
R
 
L
A
 
A
T
 
V
S
 
S
L
 
L
G
 
G
S
 
G
V
 
C
E
 
E
S
 
S
L
 
L
I
 
I
E
 
Q
H
 
H
R
 
P
G
 
A
P
 
S
I
 
M
-
 
T
-
 
H
-
 
A
-
 
V
-
 
V
-
 
P
-
 
K
-
 
E
E
 
E
G
 
R
P
 
E
G
 
A
T
 
A
R
 
G
C
 
I
P
 
T
L
 
D
D
 
G
L
 
M
L
 
I
R
 
R
L
 
L
S
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
I
E
 
E
D
 
D
S
 
A
D
 
D
D
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
D
 
D
L
 
F
E
 
K
Q
 
Q
A
 
G
L
 
L

1e5eA Methionine gamma-lyase (mgl) from trichomonas vaginalis in complex with propargylglycine
34% identity, 97% coverage: 6:376/382 of query aligns to 2:389/394 of 1e5eA

query
sites
1e5eA
K
 
R
L
 
M
S
 
T
P
 
P
A
 
A
T
 
T
L
 
A
A
 
C
A
 
I
Q
 
H
G
 
A
T
 
N
G
 
-
A
 
-
T
 
-
P
 
-
M
 
-
P
 
P
H
 
Q
R
 
K
D
 
D
-
 
Q
-
 
F
-
 
G
-
 
A
I
 
A
V
 
I
P
 
P
P
 
P
I
 
I
H
 
Y
L
 
Q
A
 
T
T
 
S
T
 
T
F
 
F
-
 
V
-
 
F
E
 
D
R
 
N
A
 
C
E
 
Q
D
 
Q
G
 
G
S
 
G
-
 
N
-
 
R
-
 
F
-
 
A
-
 
G
L
 
Q
P
 
E
G
 
S
G
 
G
R
 
Y
I
 
I
Y
|
Y
A
 
T
R
|
R
D
 
L
A
 
G
S
 
N
P
 
P
A
 
T
Y
 
V
D
 
S
P
 
N
A
 
L
E
 
E
A
 
G
L
 
K
L
 
I
C
 
A
E
 
F
L
 
L
E
 
E
G
 
K
G
 
T
A
 
E
R
 
A
A
 
C
A
 
V
L
 
A
F
 
T
A
 
S
S
 
S
G
|
G
M
|
M
A
 
G
A
 
A
-
 
I
A
 
A
S
 
A
A
 
T
V
 
V
L
 
L
L
 
T
A
 
I
L
 
L
K
 
K
P
 
A
G
 
G
A
 
D
R
 
H
I
 
L
V
 
I
A
 
S
P
 
D
H
 
E
D
 
C
M
 
L
Y
|
Y
W
 
G
S
 
C
L
 
T
R
 
H
N
 
A
W
 
L
M
 
F
I
 
E
G
 
H
F
 
A
A
 
L
A
 
T
N
 
K
W
 
F
Q
 
G
I
 
I
A
 
Q
L
 
V
D
 
D
F
 
F
Y
 
I
A
 
N
D
 
T
A
 
A
-
 
I
-
 
P
A
 
G
E
 
E
L
 
V
A
 
K
A
 
K
L
 
H
L
 
M
Q
 
K
R
 
P
P
 
N
A
 
T
D
 
K
L
 
I
V
 
V
W
 
Y
V
 
F
E
 
E
T
 
T
P
 
P
A
 
A
N
|
N
P
 
P
T
 
T
W
 
L
E
 
K
I
 
I
L
 
I
D
 
D
I
 
M
A
 
E
R
 
R
A
 
V
A
 
C
E
 
K
L
 
D
A
 
A
H
 
H
A
 
S
A
 
Q
G
 
E
A
 
G
R
 
V
L
 
L
V
 
V
V
 
I
-
 
A
D
|
D
S
 
N
T
 
T
V
 
F
P
 
C
T
 
S
P
 
P
V
 
M
F
 
I
T
 
T
R
 
N
P
 
P
L
 
V
A
 
D
L
 
F
G
 
G
A
 
V
D
 
D
V
 
V
V
 
V
M
 
V
H
 
H
S
|
S
A
 
A
T
|
T
K
|
K
Y
 
Y
L
 
I
N
 
N
G
 
G
H
 
H
S
 
T
D
 
D
V
 
V
V
 
V
A
 
A
G
 
G
V
 
L
L
 
I
V
 
C
T
 
G
R
 
K
A
 
A
E
 
D
D
 
L
D
 
L
F
 
Q
W
 
Q
A
 
I
R
 
R
I
 
M
K
 
V
T
 
G
A
 
I
R
 
K
A
 
D
A
 
I
G
 
T
G
 
G
A
 
S
V
 
V
L
 
I
G
 
S
P
 
P
F
 
H
E
 
D
A
 
A
W
 
W
L
 
L
L
 
I
N
 
T
R
 
R
G
 
G
L
 
L
R
 
S
T
 
T
L
 
L
F
 
N
P
 
I
R
 
R
V
 
M
R
 
K
T
 
A
A
 
E
A
 
S
A
 
E
S
 
N
A
 
A
L
 
M
R
 
K
I
 
V
A
 
A
Q
 
E
H
 
Y
F
 
L
E
 
K
H
 
S
H
 
H
P
 
P
A
 
A
L
 
V
L
 
E
A
 
K
V
 
V
L
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
L
 
F
P
 
E
S
 
D
H
 
H
R
 
E
G
 
G
H
 
H
D
 
D
I
 
I
A
 
A
C
 
K
R
 
K
Q
 
Q
M
 
M
E
 
R
G
 
-
G
 
M
F
 
Y
G
 
G
A
 
S
M
 
M
L
 
I
S
 
T
L
 
F
R
 
I
V
 
L
R
 
K
G
 
S
G
 
G
E
 
F
D
 
E
A
 
G
A
 
A
R
 
K
R
 
K
V
 
L
A
 
L
G
 
D
A
 
N
V
 
L
K
 
K
I
 
L
F
 
I
R
 
T
R
 
L
A
 
A
T
 
V
S
|
S
L
 
L
G
 
G
S
 
G
V
 
C
E
 
E
S
 
S
L
 
L
I
 
I
E
 
Q
H
 
H
R
 
P
G
 
A
P
 
S
I
 
M
-
x
T
-
 
H
-
 
A
-
 
V
-
 
V
-
 
P
-
 
K
-
 
E
E
 
E
G
 
R
P
 
E
G
 
A
T
 
A
R
 
G
C
 
I
P
 
T
L
 
D
D
 
G
L
 
M
L
 
I
R
|
R
L
 
L
S
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
I
E
 
E
D
 
D
S
 
A
D
 
D
D
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
D
 
D
L
 
F
E
 
K
Q
 
Q
A
 
G
L
 
L

7mcyH Crystal structure of staphylococcus aureus cystathionine gamma lyase, holoenzyme with bound nl3 (see paper)
36% identity, 92% coverage: 27:376/382 of query aligns to 21:377/380 of 7mcyH

query
sites
7mcyH
I
 
V
V
 
T
P
 
T
P
 
P
I
 
I
H
 
Y
L
 
Q
A
 
T
T
 
S
T
 
T
F
 
Y
E
 
L
R
 
Q
A
 
D
E
 
D
D
 
I
G
 
G
S
 
D
L
 
L
P
 
R
G
 
Q
G
 
G
R
 
Y
I
 
E
Y
 
Y
A
 
S
R
 
R
D
 
T
A
 
A
S
 
N
P
 
P
A
 
T
Y
 
R
D
 
S
P
 
S
A
 
V
E
 
E
A
 
S
L
 
V
L
 
I
C
 
A
E
 
T
L
 
L
E
 
E
G
 
N
G
 
G
A
 
K
R
 
H
A
 
G
A
 
F
L
 
A
F
 
F
A
 
S
S
 
S
G
 
G
M
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
I
S
 
S
A
 
A
V
 
V
L
 
V
L
 
M
A
 
L
L
 
L
K
 
D
P
 
K
G
 
G
A
 
D
R
 
H
I
 
I
V
 
I
A
 
L
P
 
N
H
 
S
D
|
D
M
x
V
Y
|
Y
W
x
G
S
 
G
L
 
T
R
x
Y
N
 
R
W
 
A
M
 
L
I
 
T
G
 
K
F
 
V
A
 
F
A
 
T
N
 
R
W
 
F
Q
 
G
I
 
I
A
 
E
L
 
V
D
 
D
F
 
F
Y
 
-
A
 
V
D
 
D
A
 
T
A
 
T
E
 
H
L
 
T
A
 
D
A
 
S
L
 
I
L
 
V
Q
 
Q
-
 
A
-
 
I
R
 
R
P
 
P
A
 
T
-
 
T
D
 
K
L
 
M
V
 
L
W
 
F
V
 
I
E
 
E
T
 
T
P
 
P
A
 
S
N
|
N
P
|
P
T
 
L
W
 
L
E
 
R
I
 
V
L
 
T
D
 
D
I
 
I
A
 
K
R
 
K
A
 
S
A
 
A
E
 
E
L
 
I
A
 
A
H
 
K
A
 
E
A
 
H
G
 
G
A
 
L
R
 
I
L
 
S
V
 
V
V
 
V
D
 
D
S
 
N
T
 
T
V
 
F
P
 
M
T
 
T
P
 
P
V
 
Y
F
 
Y
T
 
Q
R
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
D
L
 
L
G
 
G
A
 
I
D
 
D
V
 
I
V
 
V
M
 
L
H
 
H
S
 
S
A
 
A
T
 
T
K
 
K
Y
 
Y
L
 
L
N
 
G
G
 
G
H
 
H
S
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
V
A
 
A
G
 
G
V
 
-
L
 
L
V
 
V
T
 
A
R
 
T
A
 
S
E
 
D
D
 
D
D
 
K
F
 
L
W
 
A
A
 
E
R
 
R
I
 
L
K
 
A
T
 
F
A
 
I
R
 
S
A
 
N
A
 
S
G
 
T
G
 
G
A
 
G
V
 
I
L
 
L
G
 
G
P
 
P
F
 
Q
E
 
D
A
 
S
W
 
Y
L
 
L
L
 
L
N
 
V
R
 
R
G
 
G
L
 
I
R
 
K
T
 
T
L
 
L
F
 
G
P
 
L
R
 
R
V
 
M
R
 
E
T
 
Q
A
 
I
A
 
N
A
 
R
S
 
S
A
 
V
L
 
I
R
 
E
I
 
I
A
 
I
Q
 
K
H
 
M
F
 
L
E
 
Q
H
 
A
H
 
H
P
 
P
A
 
A
L
 
V
L
 
Q
A
 
Q
V
 
V
L
 
F
Y
 
H
P
 
P
G
 
S
L
 
I
P
 
E
S
 
S
H
 
H
R
 
L
G
 
N
H
 
H
D
 
D
I
 
V
A
 
H
C
 
M
R
 
A
Q
 
Q
M
 
A
E
 
D
G
 
G
G
 
H
F
 
T
G
 
G
A
 
-
M
 
V
L
 
I
S
 
A
L
 
F
R
 
E
V
 
V
R
 
K
G
 
N
G
 
T
E
 
E
D
 
-
A
 
S
A
 
A
R
 
K
R
 
Q
V
 
L
A
 
I
G
 
K
A
 
A
V
 
T
K
 
S
I
 
Y
F
 
Y
R
 
T
R
 
L
A
 
A
T
 
E
S
 
S
L
 
L
G
 
G
S
 
A
V
 
V
E
 
E
S
 
S
L
 
L
I
 
I
E
 
S
H
 
-
R
 
-
G
 
V
P
 
P
I
 
A
E
 
L
G
 
M
P
x
T
G
x
H
T
 
A
R
 
S
C
x
I
P
 
P
L
 
A
D
 
D
-
 
I
-
 
R
-
 
A
-
 
K
-
 
E
-
 
G
-
 
I
-
 
T
-
 
D
-
 
G
L
 
L
L
 
V
R
 
R
L
 
I
S
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
I
E
 
E
D
 
D
S
 
T
D
 
E
D
 
D
L
 
L
I
 
V
A
 
D
D
 
D
L
 
L
E
 
K
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L

Sites not aligning to the query:

7mcuH Crystal structure of staphylococcus aureus cystathionine gamma lyase, holoenzyme with bound nl2 (see paper)
36% identity, 92% coverage: 27:376/382 of query aligns to 21:377/380 of 7mcuH

query
sites
7mcuH
I
 
V
V
 
T
P
 
T
P
 
P
I
 
I
H
 
Y
L
 
Q
A
 
T
T
 
S
T
 
T
F
 
Y
E
 
L
R
 
Q
A
 
D
E
 
D
D
 
I
G
 
G
S
 
D
L
 
L
P
 
R
G
 
Q
G
 
G
R
 
Y
I
 
E
Y
 
Y
A
 
S
R
 
R
D
 
T
A
 
A
S
 
N
P
 
P
A
 
T
Y
 
R
D
 
S
P
 
S
A
 
V
E
 
E
A
 
S
L
 
V
L
 
I
C
 
A
E
 
T
L
 
L
E
 
E
G
 
N
G
 
G
A
 
K
R
 
H
A
 
G
A
 
F
L
 
A
F
 
F
A
 
S
S
 
S
G
 
G
M
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
I
S
 
S
A
 
A
V
 
V
L
 
V
L
 
M
A
 
L
L
 
L
K
 
D
P
 
K
G
 
G
A
 
D
R
 
H
I
 
I
V
 
I
A
 
L
P
 
N
H
 
S
D
 
D
M
 
V
Y
 
Y
W
x
G
S
 
G
L
 
T
R
x
Y
N
 
R
W
 
A
M
 
L
I
 
T
G
 
K
F
 
V
A
 
F
A
 
T
N
 
R
W
 
F
Q
 
G
I
 
I
A
 
E
L
 
V
D
 
D
F
 
F
Y
 
-
A
 
V
D
 
D
A
 
T
A
 
T
E
 
H
L
 
T
A
 
D
A
 
S
L
 
I
L
 
V
Q
 
Q
-
 
A
-
 
I
R
 
R
P
 
P
A
 
T
-
 
T
D
 
K
L
 
M
V
 
L
W
 
F
V
 
I
E
 
E
T
 
T
P
 
P
A
 
S
N
 
N
P
 
P
T
 
L
W
 
L
E
 
R
I
 
V
L
 
T
D
 
D
I
 
I
A
 
K
R
 
K
A
 
S
A
 
A
E
 
E
L
 
I
A
 
A
H
 
K
A
 
E
A
 
H
G
 
G
A
 
L
R
 
I
L
 
S
V
 
V
V
 
V
D
 
D
S
 
N
T
 
T
V
 
F
P
 
M
T
 
T
P
 
P
V
 
Y
F
 
Y
T
 
Q
R
 
N
P
 
P
L
 
L
A
 
D
L
 
L
G
 
G
A
 
I
D
 
D
V
 
I
V
 
V
M
 
L
H
 
H
S
 
S
A
 
A
T
 
T
K
 
K
Y
 
Y
L
 
L
N
 
G
G
 
G
H
 
H
S
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
V
A
 
A
G
 
G
V
 
-
L
 
L
V
 
V
T
 
A
R
 
T
A
 
S
E
 
D
D
 
D
D
 
K
F
 
L
W
 
A
A
 
E
R
 
R
I
 
L
K
 
A
T
 
F
A
 
I
R
 
S
A
 
N
A
 
S
G
 
T
G
 
G
A
 
G
V
 
I
L
 
L
G
 
G
P
 
P
F
 
Q
E
 
D
A
 
S
W
 
Y
L
 
L
L
 
L
N
 
V
R
 
R
G
 
G
L
 
I
R
 
K
T
 
T
L
 
L
F
 
G
P
 
L
R
 
R
V
 
M
R
 
E
T
 
Q
A
 
I
A
 
N
A
 
R
S
 
S
A
 
V
L
 
I
R
 
E
I
 
I
A
 
I
Q
 
K
H
 
M
F
 
L
E
 
Q
H
 
A
H
 
H
P
 
P
A
 
A
L
 
V
L
 
Q
A
 
Q
V
 
V
L
 
F
Y
 
H
P
 
P
G
 
S
L
 
I
P
 
E
S
 
S
H
 
H
R
 
L
G
 
N
H
 
H
D
 
D
I
 
V
A
 
H
C
 
M
R
 
A
Q
 
Q
M
 
A
E
 
D
G
 
G
G
 
H
F
 
T
G
 
G
A
 
-
M
 
V
L
 
I
S
 
A
L
 
F
R
 
E
V
 
V
R
 
K
G
 
N
G
 
T
E
 
E
D
 
-
A
 
S
A
 
A
R
 
K
R
 
Q
V
 
L
A
 
I
G
 
K
A
 
A
V
 
T
K
 
S
I
 
Y
F
 
Y
R
 
T
R
 
L
A
 
A
T
 
E
S
 
S
L
 
L
G
 
G
S
 
A
V
 
V
E
 
E
S
 
S
L
 
L
I
 
I
E
 
S
H
 
-
R
 
-
G
 
V
P
 
P
I
 
A
E
 
L
G
 
M
P
x
T
G
x
H
T
 
A
R
 
S
C
x
I
P
 
P
L
 
A
D
 
D
-
 
I
-
 
R
-
 
A
-
 
K
-
x
E
-
 
G
-
 
I
-
 
T
-
 
D
-
 
G
L
 
L
L
 
V
R
 
R
L
 
I
S
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
I
E
 
E
D
 
D
S
 
T
D
 
E
D
 
D
L
 
L
I
 
V
A
 
D
D
 
D
L
 
L
E
 
K
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L

Sites not aligning to the query:

3aeoA Reaction intermediate structure of entamoeba histolytica methionine gamma-lyase 1 containing methionine alpha, beta-enamine-pyridoxamine- 5'-phosphate
37% identity, 86% coverage: 48:377/382 of query aligns to 48:385/387 of 3aeoA

query
sites
3aeoA
G
 
G
R
 
H
I
 
I
Y
|
Y
A
 
S
R
|
R
D
 
L
A
 
G
S
 
N
P
 
P
A
 
T
Y
 
V
D
 
E
P
 
Q
A
 
F
E
 
E
A
 
E
L
 
M
L
 
V
C
 
C
E
 
S
L
 
I
E
 
E
G
 
G
G
 
A
A
 
A
R
 
G
A
 
S
A
 
A
L
 
A
F
 
F
A
 
G
S
 
S
G
|
G
M
|
M
A
 
G
A
 
A
A
 
I
S
 
S
A
 
S
V
 
S
L
 
T
L
 
L
A
 
A
-
 
F
L
 
L
K
 
Q
P
 
K
G
 
G
A
 
D
R
 
H
I
 
L
V
 
I
A
 
A
P
 
G
H
 
D
D
 
T
M
 
L
Y
|
Y
W
 
G
S
 
C
L
 
T
R
 
V
N
 
S
W
 
L
M
 
F
I
 
T
G
 
H
F
 
W
A
 
L
A
 
P
N
 
R
W
 
F
Q
 
G
I
 
I
A
 
E
L
 
V
D
 
D
F
 
L
Y
 
I
-
 
D
-
 
T
A
 
S
D
 
D
A
 
V
A
 
E
E
 
K
L
 
V
A
 
K
A
 
A
L
 
A
L
 
W
Q
 
K
R
 
P
P
 
N
A
 
T
D
 
K
L
 
M
V
 
V
W
 
Y
V
 
L
E
|
E
T
 
S
P
 
P
A
 
A
N
|
N
P
 
P
T
 
T
W
 
C
E
 
K
I
 
V
L
 
S
D
 
D
I
 
I
A
 
K
R
 
G
A
 
I
A
 
A
E
 
V
L
 
V
A
 
C
H
 
H
A
 
E
A
 
R
G
 
G
A
 
A
R
 
R
L
 
L
V
 
V
V
 
V
D
|
D
S
 
A
T
 
T
V
 
F
P
 
T
T
 
S
P
 
P
V
 
C
F
 
F
T
 
L
R
 
K
P
 
P
L
 
L
A
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
V
 
I
V
 
A
M
 
L
H
 
H
S
|
S
A
 
V
T
x
S
K
|
K
Y
 
Y
L
 
I
N
 
N
G
 
G
H
 
H
S
 
G
D
 
D
V
 
V
V
 
I
A
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
S
V
 
S
T
 
A
R
 
K
A
 
T
E
 
A
D
 
E
D
 
D
F
 
I
W
 
-
A
 
A
R
 
T
I
 
I
K
 
K
T
 
F
A
 
Y
R
 
R
A
 
K
A
 
D
G
 
A
G
 
G
A
 
S
V
 
L
L
 
M
G
 
A
P
 
P
F
 
M
E
 
D
A
 
A
W
 
F
L
 
L
L
 
C
N
 
A
R
 
R
G
 
G
L
 
M
R
 
K
T
 
T
L
 
L
F
 
P
P
 
I
R
 
R
V
 
M
R
 
Q
T
 
I
A
 
H
A
 
M
A
 
E
S
 
N
A
 
G
L
 
L
R
 
K
I
 
V
A
 
A
Q
 
K
H
 
F
F
 
L
E
 
E
H
 
Q
H
 
H
P
 
E
A
 
K
L
 
I
L
 
V
A
 
K
V
 
V
L
 
N
Y
 
H
P
 
P
G
 
G
L
 
L
P
 
E
S
 
S
H
 
F
R
 
P
G
 
G
H
 
H
D
 
D
I
 
I
A
 
A
C
 
K
R
 
K
Q
 
Q
M
 
M
E
 
T
G
 
-
G
 
G
F
 
Y
G
 
G
A
 
S
M
 
T
L
 
F
S
 
L
L
 
F
R
 
E
V
 
M
R
 
K
G
 
S
G
 
F
E
 
E
D
 
-
A
 
A
A
 
A
R
 
K
R
 
K
V
 
L
A
 
M
G
 
E
A
 
H
V
 
L
K
 
K
I
 
V
F
 
C
R
 
T
R
 
L
A
 
A
T
x
V
S
|
S
L
 
L
G
 
G
S
 
C
V
 
V
E
 
D
S
 
T
L
 
L
I
 
I
E
 
E
H
 
H
R
 
P
G
 
A
P
 
S
I
 
M
E
x
T
G
 
H
P
 
A
G
 
A
T
 
V
R
 
P
C
 
E
P
 
N
L
 
I
-
 
M
-
 
R
-
 
K
-
 
Q
-
 
G
-
 
I
-
 
T
-
 
P
D
 
E
L
 
L
L
 
V
R
|
R
L
 
I
S
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
I
E
 
E
D
 
N
S
 
V
D
 
D
D
 
D
L
 
I
I
 
I
A
 
A
D
 
D
L
 
L
E
 
K
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
Q
 
E

3aelA Reaction intermediate structure of entamoeba histolytica methionine gamma-lyase 1 containing methionine imine-pyridoxamine-5'-phosphate and alpha-amino-alpha, beta-butenoic acid-pyridoxal-5'-phosphate
37% identity, 86% coverage: 48:377/382 of query aligns to 48:385/387 of 3aelA

query
sites
3aelA
G
 
G
R
 
H
I
 
I
Y
|
Y
A
 
S
R
|
R
D
 
L
A
 
G
S
 
N
P
 
P
A
 
T
Y
 
V
D
 
E
P
 
Q
A
 
F
E
 
E
A
 
E
L
 
M
L
 
V
C
 
C
E
 
S
L
 
I
E
 
E
G
 
G
G
 
A
A
 
A
R
 
G
A
 
S
A
 
A
L
 
A
F
 
F
A
 
G
S
 
S
G
|
G
M
|
M
A
 
G
A
 
A
A
 
I
S
 
S
A
 
S
V
 
S
L
 
T
L
 
L
A
 
A
-
 
F
L
 
L
K
 
Q
P
 
K
G
 
G
A
 
D
R
 
H
I
 
L
V
 
I
A
 
A
P
 
G
H
 
D
D
 
T
M
 
L
Y
|
Y
W
 
G
S
 
C
L
 
T
R
 
V
N
 
S
W
 
L
M
 
F
I
 
T
G
 
H
F
 
W
A
 
L
A
 
P
N
 
R
W
 
F
Q
 
G
I
 
I
A
 
E
L
 
V
D
 
D
F
 
L
Y
 
I
-
 
D
-
 
T
A
 
S
D
 
D
A
 
V
A
 
E
E
 
K
L
 
V
A
 
K
A
 
A
L
 
A
L
 
W
Q
 
K
R
 
P
P
 
N
A
 
T
D
 
K
L
 
M
V
 
V
W
 
Y
V
 
L
E
|
E
T
 
S
P
 
P
A
 
A
N
|
N
P
 
P
T
 
T
W
 
C
E
 
K
I
 
V
L
 
S
D
 
D
I
 
I
A
 
K
R
 
G
A
 
I
A
 
A
E
 
V
L
 
V
A
 
C
H
 
H
A
 
E
A
 
R
G
 
G
A
 
A
R
 
R
L
 
L
V
 
V
V
 
V
D
|
D
S
 
A
T
|
T
V
 
F
P
 
T
T
 
S
P
 
P
V
 
C
F
 
F
T
 
L
R
 
K
P
 
P
L
 
L
A
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
V
 
I
V
 
A
M
 
L
H
 
H
S
|
S
A
 
V
T
x
S
K
|
K
Y
 
Y
L
 
I
N
 
N
G
 
G
H
 
H
S
 
G
D
 
D
V
 
V
V
 
I
A
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
S
V
 
S
T
 
A
R
 
K
A
 
T
E
 
A
D
 
E
D
 
D
F
 
I
W
 
-
A
 
A
R
 
T
I
 
I
K
 
K
T
 
F
A
 
Y
R
 
R
A
 
K
A
 
D
G
 
A
G
 
G
A
 
S
V
 
L
L
 
M
G
 
A
P
 
P
F
 
M
E
 
D
A
 
A
W
 
F
L
 
L
L
 
C
N
 
A
R
 
R
G
 
G
L
 
M
R
 
K
T
 
T
L
 
L
F
 
P
P
 
I
R
 
R
V
 
M
R
 
Q
T
 
I
A
 
H
A
 
M
A
 
E
S
 
N
A
 
G
L
 
L
R
 
K
I
 
V
A
 
A
Q
 
K
H
 
F
F
 
L
E
 
E
H
 
Q
H
 
H
P
 
E
A
 
K
L
 
I
L
 
V
A
 
K
V
 
V
L
 
N
Y
 
H
P
 
P
G
 
G
L
 
L
P
 
E
S
 
S
H
 
F
R
 
P
G
 
G
H
 
H
D
 
D
I
 
I
A
 
A
C
 
K
R
 
K
Q
 
Q
M
 
M
E
 
T
G
 
-
G
 
G
F
 
Y
G
 
G
A
 
S
M
 
T
L
 
F
S
 
L
L
 
F
R
 
E
V
 
M
R
 
K
G
 
S
G
 
F
E
 
E
D
 
-
A
 
A
A
 
A
R
 
K
R
 
K
V
 
L
A
 
M
G
 
E
A
 
H
V
 
L
K
 
K
I
 
V
F
 
C
R
 
T
R
 
L
A
 
A
T
 
V
S
|
S
L
 
L
G
 
G
S
 
C
V
 
V
E
 
D
S
 
T
L
 
L
I
 
I
E
 
E
H
 
H
R
 
P
G
 
A
P
 
S
I
 
M
E
x
T
G
 
H
P
 
A
G
 
A
T
 
V
R
 
P
C
 
E
P
 
N
L
 
I
-
 
M
-
 
R
-
 
K
-
 
Q
-
 
G
-
 
I
-
 
T
-
 
P
D
 
E
L
 
L
L
 
V
R
|
R
L
 
I
S
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
I
E
 
E
D
 
N
S
 
V
D
 
D
D
 
D
L
 
I
I
 
I
A
 
A
D
 
D
L
 
L
E
 
K
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
Q
 
E

3aejC Reaction intermediate structure of entamoeba histolytica methionine gamma-lyase 1 tetramer containing michaelis complex and methionine- pyridoxal-5'-phosphate
37% identity, 86% coverage: 48:377/382 of query aligns to 48:385/387 of 3aejC

query
sites
3aejC
G
 
G
R
 
H
I
 
I
Y
|
Y
A
 
S
R
|
R
D
 
L
A
 
G
S
 
N
P
 
P
A
 
T
Y
 
V
D
 
E
P
 
Q
A
 
F
E
 
E
A
 
E
L
 
M
L
 
V
C
 
C
E
 
S
L
 
I
E
 
E
G
 
G
G
 
A
A
 
A
R
 
G
A
 
S
A
 
A
L
 
A
F
 
F
A
 
G
S
 
S
G
 
G
M
 
M
A
 
G
A
 
A
A
 
I
S
 
S
A
 
S
V
 
S
L
 
T
L
 
L
A
 
A
-
 
F
L
 
L
K
 
Q
P
 
K
G
 
G
A
 
D
R
 
H
I
 
L
V
 
I
A
 
A
P
 
G
H
 
D
D
 
T
M
 
L
Y
|
Y
W
 
G
S
 
C
L
 
T
R
 
V
N
 
S
W
 
L
M
 
F
I
 
T
G
 
H
F
 
W
A
 
L
A
 
P
N
 
R
W
 
F
Q
 
G
I
 
I
A
 
E
L
 
V
D
 
D
F
 
L
Y
 
I
-
 
D
-
 
T
A
 
S
D
 
D
A
 
V
A
 
E
E
 
K
L
 
V
A
 
K
A
 
A
L
 
A
L
 
W
Q
 
K
R
 
P
P
 
N
A
 
T
D
 
K
L
 
M
V
 
V
W
 
Y
V
 
L
E
 
E
T
 
S
P
 
P
A
 
A
N
 
N
P
 
P
T
 
T
W
 
C
E
 
K
I
 
V
L
 
S
D
 
D
I
 
I
A
 
K
R
 
G
A
 
I
A
 
A
E
 
V
L
 
V
A
 
C
H
 
H
A
 
E
A
 
R
G
 
G
A
 
A
R
 
R
L
 
L
V
 
V
V
 
V
D
|
D
S
 
A
T
 
T
V
 
F
P
 
T
T
 
S
P
 
P
V
 
C
F
 
F
T
 
L
R
 
K
P
 
P
L
 
L
A
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
V
 
I
V
 
A
M
 
L
H
 
H
S
 
S
A
 
V
T
 
S
K
|
K
Y
 
Y
L
 
I
N
 
N
G
 
G
H
 
H
S
 
G
D
 
D
V
 
V
V
 
I
A
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
S
V
 
S
T
 
A
R
 
K
A
 
T
E
 
A
D
 
E
D
 
D
F
 
I
W
 
-
A
 
A
R
 
T
I
 
I
K
 
K
T
 
F
A
 
Y
R
 
R
A
 
K
A
 
D
G
 
A
G
 
G
A
 
S
V
 
L
L
 
M
G
 
A
P
 
P
F
 
M
E
 
D
A
 
A
W
 
F
L
 
L
L
 
C
N
 
A
R
 
R
G
 
G
L
 
M
R
 
K
T
 
T
L
 
L
F
 
P
P
 
I
R
 
R
V
 
M
R
 
Q
T
 
I
A
 
H
A
 
M
A
 
E
S
 
N
A
 
G
L
 
L
R
 
K
I
 
V
A
 
A
Q
 
K
H
 
F
F
 
L
E
 
E
H
 
Q
H
 
H
P
 
E
A
 
K
L
 
I
L
 
V
A
 
K
V
 
V
L
 
N
Y
 
H
P
 
P
G
 
G
L
 
L
P
 
E
S
 
S
H
 
F
R
 
P
G
 
G
H
 
H
D
 
D
I
 
I
A
 
A
C
 
K
R
 
K
Q
 
Q
M
 
M
E
 
T
G
 
-
G
 
G
F
 
Y
G
 
G
A
 
S
M
 
T
L
 
F
S
 
L
L
 
F
R
 
E
V
 
M
R
 
K
G
 
S
G
 
F
E
 
E
D
 
-
A
 
A
A
 
A
R
 
K
R
 
K
V
 
L
A
 
M
G
 
E
A
 
H
V
 
L
K
 
K
I
 
V
F
 
C
R
 
T
R
 
L
A
 
A
T
 
V
S
|
S
L
|
L
G
 
G
S
 
C
V
 
V
E
 
D
S
 
T
L
 
L
I
 
I
E
 
E
H
 
H
R
 
P
G
 
A
P
 
S
I
 
M
E
x
T
G
 
H
P
 
A
G
 
A
T
 
V
R
 
P
C
 
E
P
 
N
L
 
I
-
 
M
-
 
R
-
 
K
-
 
Q
-
 
G
-
 
I
-
 
T
-
 
P
D
 
E
L
 
L
L
 
V
R
|
R
L
 
I
S
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
I
E
 
E
D
 
N
S
 
V
D
 
D
D
 
D
L
 
I
I
 
I
A
 
A
D
 
D
L
 
L
E
 
K
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
Q
 
E

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_004308709.1 NCBI__GCF_000310185.1:WP_004308709.1
MQHDAKLSPATLAAQGTGATPMPHRDIVPPIHLATTFERAEDGSLPGGRIYARDASPAYD
PAEALLCELEGGARAALFASGMAAASAVLLALKPGARIVAPHDMYWSLRNWMIGFAANWQ
IALDFYADAAELAALLQRPADLVWVETPANPTWEILDIARAAELAHAAGARLVVDSTVPT
PVFTRPLALGADVVMHSATKYLNGHSDVVAGVLVTRAEDDFWARIKTARAAGGAVLGPFE
AWLLNRGLRTLFPRVRTAAASALRIAQHFEHHPALLAVLYPGLPSHRGHDIACRQMEGGF
GAMLSLRVRGGEDAARRVAGAVKIFRRATSLGSVESLIEHRGPIEGPGTRCPLDLLRLSV
GIEDSDDLIADLEQALQQANEP

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory