SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_004512800.1 NCBI__GCF_000012925.1:WP_004512800.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4dxvA Crystal structure of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii complexed with mg and cl ions at 1.80 a resolution
51% identity, 100% coverage: 2:290/290 of query aligns to 2:291/291 of 4dxvA

query
sites
4dxvA
F
 
I
K
 
Q
G
 
G
S
 
S
I
 
I
V
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
V
T
 
T
P
 
P
-
 
M
F
 
L
N
 
K
N
 
D
G
 
G
Q
 
G
V
 
V
D
 
D
F
 
W
E
 
K
K
 
S
L
 
L
R
 
E
E
 
K
L
 
L
V
 
V
E
 
E
F
 
W
Q
 
H
I
 
I
S
 
E
N
 
Q
G
 
G
T
 
T
D
 
N
A
 
S
I
 
I
V
 
V
P
 
A
C
 
V
G
 
G
T
|
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
A
 
A
S
 
S
T
 
T
L
 
L
D
 
S
Y
 
M
D
 
E
E
 
E
H
 
H
M
 
T
D
 
Q
V
 
V
V
 
I
K
 
K
T
 
E
V
 
I
I
 
I
E
 
R
Q
 
V
V
 
A
N
 
N
K
 
K
R
 
R
V
 
I
P
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
G
S
 
A
N
 
N
S
 
S
T
 
T
A
 
R
E
 
E
A
 
A
I
 
I
E
 
E
L
 
L
S
 
T
Q
 
K
K
 
A
A
 
A
K
 
K
E
 
D
V
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
A
V
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
V
T
|
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
N
 
N
K
 
K
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
Y
R
 
Q
H
 
H
Y
 
Y
T
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
E
I
 
L
P
 
P
Q
 
L
I
 
I
L
 
L
Y
|
Y
N
|
N
V
|
V
P
|
P
G
 
G
R
|
R
T
|
T
G
 
G
V
 
V
N
 
D
M
 
L
L
 
S
P
 
N
E
 
D
T
 
T
V
 
A
A
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
P
 
E
H
 
I
K
 
P
N
 
N
I
 
I
V
 
V
A
 
G
I
 
I
K
|
K
E
 
D
A
 
A
T
 
T
G
 
G
S
 
D
L
 
V
Q
 
P
Q
 
R
A
 
G
S
 
K
E
 
A
I
 
L
L
 
I
A
 
D
L
 
A
C
 
L
G
 
N
D
 
G
K
 
K
I
 
M
D
 
A
V
 
V
L
 
Y
C
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
F
 
E
I
 
T
T
 
A
F
 
W
P
 
E
M
 
L
M
 
M
A
 
L
C
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
D
G
 
G
V
 
N
I
|
I
S
 
S
V
 
V
L
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
I
M
 
A
P
 
P
K
 
K
T
 
A
V
 
M
A
 
S
E
 
E
L
 
V
T
 
C
D
 
A
A
 
V
F
 
A
Y
 
I
A
 
A
G
 
K
D
 
D
M
 
E
E
 
Q
K
 
Q
A
 
A
R
 
K
Q
 
T
L
 
L
H
 
N
L
 
N
Q
 
K
T
 
I
L
 
A
K
 
N
I
 
L
G
 
H
N
 
N
A
 
I
M
 
L
F
 
F
I
 
C
E
 
E
S
 
S
N
 
N
P
 
P
I
 
I
P
 
P
V
 
V
K
 
K
T
 
W
A
 
A
L
 
L
G
 
H
L
 
E
M
 
M
G
 
G
K
 
L
C
 
I
S
 
D
D
 
T
E
 
G
V
 
I
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
C
 
T
P
 
P
M
 
L
G
 
A
A
 
E
A
 
Q
N
 
Y
K
 
R
E
 
E
K
 
P
L
 
L
A
 
R
A
 
N
I
 
A
M
 
L
K
 
K
E
 
D
Y
 
A
E
 
G
L
 
I
I
 
I

3u8gA Crystal structure of the complex of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with oxalic acid at 1.80 a resolution
51% identity, 100% coverage: 2:290/290 of query aligns to 2:291/291 of 3u8gA

query
sites
3u8gA
F
 
I
K
 
Q
G
 
G
S
 
S
I
 
I
V
 
V
A
|
A
I
 
I
V
 
V
T
 
T
P
 
P
-
 
M
F
 
L
N
 
K
N
 
D
G
 
G
Q
 
G
V
 
V
D
 
D
F
 
W
E
 
K
K
 
S
L
 
L
R
 
E
E
 
K
L
 
L
V
 
V
E
 
E
F
 
W
Q
 
H
I
 
I
S
 
E
N
 
Q
G
 
G
T
 
T
D
 
N
A
 
S
I
 
I
V
 
V
P
 
A
C
 
V
G
|
G
T
|
T
T
|
T
G
 
G
E
 
E
A
 
A
S
 
S
T
 
T
L
 
L
D
 
S
Y
 
M
D
 
E
E
 
E
H
 
H
M
 
T
D
 
Q
V
 
V
V
 
I
K
 
K
T
 
E
V
 
I
I
 
I
E
 
R
Q
 
V
V
 
A
N
 
N
K
 
K
R
 
R
V
 
I
P
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
G
S
 
A
N
 
N
S
 
S
T
 
T
A
 
R
E
 
E
A
 
A
I
 
I
E
 
E
L
 
L
S
 
T
Q
 
K
K
 
A
A
 
A
K
 
K
E
 
D
V
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
A
V
 
A
L
|
L
L
 
L
V
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
N
 
N
K
 
K
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
Y
R
 
Q
H
 
H
Y
 
Y
T
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
E
I
 
L
P
 
P
Q
 
L
I
 
I
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
V
 
V
P
 
P
G
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
G
V
 
V
N
 
D
M
 
L
L
 
S
P
 
N
E
 
D
T
 
T
V
 
A
A
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
P
 
E
H
 
I
K
 
P
N
 
N
I
 
I
V
 
V
A
 
G
I
 
I
K
|
K
E
 
D
A
 
A
T
 
T
G
 
G
S
 
D
L
 
V
Q
 
P
Q
 
R
A
 
G
S
 
K
E
 
A
I
 
L
L
 
I
A
 
D
L
 
A
C
 
L
G
 
N
D
 
G
K
 
K
I
 
M
D
 
A
V
 
V
L
 
Y
C
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
F
 
E
I
 
T
T
 
A
F
 
W
P
 
E
M
 
L
M
 
M
A
 
L
C
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
D
G
 
G
V
 
N
I
|
I
S
 
S
V
 
V
L
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
I
M
 
A
P
 
P
K
 
K
T
 
A
V
 
M
A
 
S
E
 
E
L
 
V
T
 
C
D
 
A
A
 
V
F
 
A
Y
 
I
A
 
A
G
 
K
D
 
D
M
 
E
E
 
Q
K
 
Q
A
 
A
R
 
K
Q
 
T
L
 
L
H
 
N
L
 
N
Q
 
K
T
 
I
L
 
A
K
 
N
I
 
L
G
 
H
N
 
N
A
 
I
M
 
L
F
 
F
I
 
C
E
 
E
S
 
S
N
 
N
P
 
P
I
 
I
P
 
P
V
 
V
K
 
K
T
 
W
A
 
A
L
 
L
G
 
H
L
 
E
M
 
M
G
 
G
K
 
L
C
 
I
S
 
D
D
 
T
E
 
G
V
 
I
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
C
 
T
P
 
P
M
 
L
G
 
A
A
 
E
A
 
Q
N
 
Y
K
 
R
E
 
E
K
 
P
L
 
L
A
 
R
A
 
N
I
 
A
M
 
L
K
 
K
E
 
D
Y
 
A
E
 
G
L
 
I
I
 
I

3tdfA Crystal structure of the complex of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with 2-ketobutanoic acid at 1.99 a resolution
51% identity, 100% coverage: 2:290/290 of query aligns to 2:291/291 of 3tdfA

query
sites
3tdfA
F
 
I
K
 
Q
G
 
G
S
 
S
I
 
I
V
 
V
A
|
A
I
 
I
V
 
V
T
 
T
P
 
P
-
 
M
F
 
L
N
 
K
N
 
D
G
 
G
Q
 
G
V
 
V
D
 
D
F
 
W
E
 
K
K
 
S
L
 
L
R
 
E
E
 
K
L
 
L
V
 
V
E
 
E
F
 
W
Q
 
H
I
 
I
S
 
E
N
 
Q
G
 
G
T
 
T
D
 
N
A
 
S
I
 
I
V
 
V
P
 
A
C
 
V
G
 
G
T
|
T
T
|
T
G
 
G
E
 
E
A
 
A
S
 
S
T
 
T
L
 
L
D
 
S
Y
 
M
D
 
E
E
 
E
H
 
H
M
 
T
D
 
Q
V
 
V
V
 
I
K
 
K
T
 
E
V
 
I
I
 
I
E
 
R
Q
 
V
V
 
A
N
 
N
K
 
K
R
 
R
V
 
I
P
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
G
S
 
A
N
 
N
S
 
S
T
 
T
A
 
R
E
 
E
A
 
A
I
 
I
E
 
E
L
 
L
S
 
T
Q
 
K
K
 
A
A
 
A
K
 
K
E
 
D
V
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
A
V
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
N
 
N
K
 
K
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
Y
R
 
Q
H
 
H
Y
 
Y
T
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
E
I
 
L
P
 
P
Q
 
L
I
 
I
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
V
 
V
P
 
P
G
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
G
V
 
V
N
 
D
M
 
L
L
 
S
P
 
N
E
 
D
T
 
T
V
 
A
A
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
P
 
E
H
 
I
K
 
P
N
 
N
I
 
I
V
 
V
A
 
G
I
 
I
K
|
K
E
 
D
A
 
A
T
 
T
G
 
G
S
 
D
L
 
V
Q
 
P
Q
 
R
A
 
G
S
 
K
E
 
A
I
 
L
L
 
I
A
 
D
L
 
A
C
 
L
G
 
N
D
 
G
K
 
K
I
 
M
D
 
A
V
 
V
L
 
Y
C
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
F
 
E
I
 
T
T
 
A
F
 
W
P
 
E
M
 
L
M
 
M
A
 
L
C
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
D
G
 
G
V
 
N
I
|
I
S
 
S
V
 
V
L
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
I
M
 
A
P
 
P
K
 
K
T
 
A
V
 
M
A
 
S
E
 
E
L
 
V
T
 
C
D
 
A
A
 
V
F
 
A
Y
 
I
A
 
A
G
 
K
D
 
D
M
 
E
E
 
Q
K
 
Q
A
 
A
R
 
K
Q
 
T
L
 
L
H
 
N
L
 
N
Q
 
K
T
 
I
L
 
A
K
 
N
I
 
L
G
 
H
N
 
N
A
 
I
M
 
L
F
 
F
I
 
C
E
 
E
S
 
S
N
 
N
P
 
P
I
 
I
P
 
P
V
 
V
K
 
K
T
 
W
A
 
A
L
 
L
G
 
H
L
 
E
M
 
M
G
 
G
K
 
L
C
 
I
S
 
D
D
 
T
E
 
G
V
 
I
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
C
 
T
P
 
P
M
 
L
G
 
A
A
 
E
A
 
Q
N
 
Y
K
 
R
E
 
E
K
 
P
L
 
L
A
 
R
A
 
N
I
 
A
M
 
L
K
 
K
E
 
D
Y
 
A
E
 
G
L
 
I
I
 
I

3tceA Crystal structure of the complex of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with 5-hydroxylysine at 2.6 a resolution
51% identity, 100% coverage: 2:290/290 of query aligns to 2:291/291 of 3tceA

query
sites
3tceA
F
 
I
K
 
Q
G
 
G
S
 
S
I
 
I
V
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
V
T
 
T
P
 
P
-
 
M
F
 
L
N
 
K
N
 
D
G
 
G
Q
 
G
V
 
V
D
 
D
F
 
W
E
 
K
K
 
S
L
 
L
R
 
E
E
 
K
L
 
L
V
 
V
E
 
E
F
 
W
Q
 
H
I
 
I
S
 
E
N
 
Q
G
 
G
T
 
T
D
 
N
A
 
S
I
 
I
V
 
V
P
 
A
C
 
V
G
 
G
T
|
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
A
 
A
S
|
S
T
 
T
L
|
L
D
 
S
Y
 
M
D
 
E
E
 
E
H
|
H
M
 
T
D
 
Q
V
 
V
V
 
I
K
 
K
T
 
E
V
 
I
I
 
I
E
 
R
Q
 
V
V
 
A
N
 
N
K
 
K
R
 
R
V
 
I
P
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
G
S
 
A
N
 
N
S
 
S
T
 
T
A
 
R
E
 
E
A
 
A
I
 
I
E
 
E
L
 
L
S
 
T
Q
 
K
K
 
A
A
 
A
K
 
K
E
 
D
V
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
A
V
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
|
Y
Y
|
Y
N
 
N
K
 
K
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
Y
R
 
Q
H
 
H
Y
 
Y
T
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
E
I
 
L
P
 
P
Q
 
L
I
 
I
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
V
 
V
P
 
P
G
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
G
V
 
V
N
 
D
M
 
L
L
 
S
P
 
N
E
 
D
T
 
T
V
 
A
A
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
P
 
E
H
 
I
K
 
P
N
 
N
I
 
I
V
 
V
A
 
G
I
 
I
K
|
K
E
 
D
A
 
A
T
 
T
G
 
G
S
 
D
L
 
V
Q
 
P
Q
 
R
A
 
G
S
 
K
E
 
A
I
 
L
L
 
I
A
 
D
L
 
A
C
 
L
G
 
N
D
 
G
K
 
K
I
 
M
D
 
A
V
 
V
L
 
Y
C
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
F
 
E
I
 
T
T
 
A
F
 
W
P
 
E
M
 
L
M
 
M
A
 
L
C
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
D
G
 
G
V
 
N
I
|
I
S
 
S
V
 
V
L
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
I
M
 
A
P
 
P
K
 
K
T
 
A
V
 
M
A
 
S
E
 
E
L
 
V
T
 
C
D
 
A
A
 
V
F
 
A
Y
 
I
A
 
A
G
 
K
D
 
D
M
 
E
E
 
Q
K
 
Q
A
 
A
R
 
K
Q
 
T
L
 
L
H
 
N
L
 
N
Q
 
K
T
 
I
L
 
A
K
 
N
I
 
L
G
 
H
N
 
N
A
 
I
M
 
L
F
 
F
I
 
C
E
 
E
S
 
S
N
 
N
P
 
P
I
 
I
P
 
P
V
 
V
K
 
K
T
 
W
A
 
A
L
 
L
G
 
H
L
 
E
M
 
M
G
 
G
K
 
L
C
 
I
S
 
D
D
 
T
E
 
G
V
 
I
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
C
 
T
P
 
P
M
 
L
G
 
A
A
 
E
A
 
Q
N
 
Y
K
 
R
E
 
E
K
 
P
L
 
L
A
 
R
A
 
N
I
 
A
M
 
L
K
 
K
E
 
D
Y
 
A
E
 
G
L
 
I
I
 
I

3rk8A Crystal structure of the chloride inhibited dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii complexed with pyruvate at 1.8 a resolution
51% identity, 100% coverage: 2:290/290 of query aligns to 2:291/291 of 3rk8A

query
sites
3rk8A
F
 
I
K
 
Q
G
 
G
S
 
S
I
 
I
V
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
V
T
 
T
P
 
P
-
 
M
F
 
L
N
 
K
N
 
D
G
 
G
Q
 
G
V
 
V
D
 
D
F
 
W
E
 
K
K
 
S
L
 
L
R
 
E
E
 
K
L
 
L
V
 
V
E
 
E
F
 
W
Q
 
H
I
 
I
S
 
E
N
 
Q
G
 
G
T
 
T
D
 
N
A
 
S
I
 
I
V
 
V
P
 
A
C
 
V
G
 
G
T
|
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
A
 
A
S
 
S
T
 
T
L
 
L
D
 
S
Y
 
M
D
 
E
E
 
E
H
 
H
M
 
T
D
 
Q
V
 
V
V
 
I
K
 
K
T
 
E
V
 
I
I
 
I
E
 
R
Q
 
V
V
 
A
N
 
N
K
 
K
R
 
R
V
 
I
P
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
G
S
 
A
N
 
N
S
 
S
T
 
T
A
 
R
E
 
E
A
 
A
I
 
I
E
 
E
L
 
L
S
 
T
Q
 
K
K
 
A
A
 
A
K
 
K
E
 
D
V
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
A
V
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
N
 
N
K
 
K
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
Y
R
 
Q
H
 
H
Y
 
Y
T
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
E
I
 
L
P
 
P
Q
 
L
I
 
I
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
V
 
V
P
 
P
G
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
G
V
 
V
N
 
D
M
 
L
L
 
S
P
 
N
E
 
D
T
 
T
V
 
A
A
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
P
 
E
H
 
I
K
 
P
N
 
N
I
 
I
V
 
V
A
 
G
I
 
I
K
|
K
E
 
D
A
 
A
T
 
T
G
 
G
S
 
D
L
 
V
Q
 
P
Q
 
R
A
 
G
S
 
K
E
 
A
I
 
L
L
 
I
A
 
D
L
 
A
C
 
L
G
 
N
D
 
G
K
 
K
I
 
M
D
 
A
V
 
V
L
 
Y
C
 
S
G
|
G
D
 
D
D
 
D
F
 
E
I
 
T
T
 
A
F
 
W
P
 
E
M
 
L
M
 
M
A
 
L
C
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
D
G
 
G
V
 
N
I
|
I
S
 
S
V
 
V
L
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
I
M
 
A
P
 
P
K
 
K
T
 
A
V
 
M
A
 
S
E
 
E
L
 
V
T
 
C
D
 
A
A
 
V
F
 
A
Y
 
I
A
 
A
G
 
K
D
 
D
M
 
E
E
 
Q
K
 
Q
A
 
A
R
 
K
Q
 
T
L
 
L
H
 
N
L
 
N
Q
 
K
T
 
I
L
 
A
K
 
N
I
 
L
G
 
H
N
 
N
A
 
I
M
 
L
F
|
F
I
 
C
E
 
E
S
 
S
N
 
N
P
 
P
I
 
I
P
 
P
V
 
V
K
 
K
T
 
W
A
 
A
L
 
L
G
 
H
L
 
E
M
 
M
G
 
G
K
 
L
C
 
I
S
 
D
D
 
T
E
 
G
V
 
I
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
C
 
T
P
 
P
M
 
L
G
 
A
A
 
E
A
 
Q
N
 
Y
K
 
R
E
 
E
K
 
P
L
 
L
A
 
R
A
 
N
I
 
A
M
 
L
K
 
K
E
 
D
Y
 
A
E
 
G
L
 
I
I
 
I

3pueB Crystal structure of the complex of dhydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with lysine at 2.6a resolution
51% identity, 100% coverage: 2:290/290 of query aligns to 2:291/291 of 3pueB

query
sites
3pueB
F
 
I
K
 
Q
G
 
G
S
 
S
I
 
I
V
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
V
T
 
T
P
 
P
-
 
M
F
 
L
N
 
K
N
 
D
G
 
G
Q
 
G
V
 
V
D
 
D
F
 
W
E
 
K
K
 
S
L
 
L
R
 
E
E
 
K
L
 
L
V
 
V
E
 
E
F
 
W
Q
 
H
I
 
I
S
 
E
N
 
Q
G
 
G
T
 
T
D
 
N
A
 
S
I
 
I
V
 
V
P
 
A
C
 
V
G
 
G
T
|
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
A
 
A
S
 
S
T
 
T
L
 
L
D
 
S
Y
 
M
D
 
E
E
 
E
H
 
H
M
 
T
D
 
Q
V
 
V
V
 
I
K
 
K
T
 
E
V
 
I
I
 
I
E
 
R
Q
 
V
V
 
A
N
 
N
K
 
K
R
 
R
V
 
I
P
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
G
S
 
A
N
 
N
S
 
S
T
 
T
A
 
R
E
 
E
A
 
A
I
 
I
E
 
E
L
 
L
S
 
T
Q
 
K
K
 
A
A
 
A
K
 
K
E
 
D
V
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
A
V
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
N
 
N
K
 
K
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
Y
R
 
Q
H
 
H
Y
 
Y
T
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
E
I
 
L
P
 
P
Q
 
L
I
 
I
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
V
 
V
P
 
P
G
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
G
V
 
V
N
 
D
M
 
L
L
 
S
P
 
N
E
 
D
T
 
T
V
 
A
A
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
P
 
E
H
 
I
K
 
P
N
 
N
I
 
I
V
 
V
A
 
G
I
 
I
K
|
K
E
 
D
A
 
A
T
 
T
G
 
G
S
 
D
L
 
V
Q
 
P
Q
 
R
A
 
G
S
 
K
E
 
A
I
 
L
L
 
I
A
 
D
L
 
A
C
 
L
G
 
N
D
 
G
K
 
K
I
 
M
D
 
A
V
 
V
L
 
Y
C
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
F
 
E
I
 
T
T
 
A
F
 
W
P
 
E
M
 
L
M
 
M
A
 
L
C
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
D
G
 
G
V
 
N
I
|
I
S
 
S
V
 
V
L
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
I
M
 
A
P
 
P
K
 
K
T
 
A
V
 
M
A
 
S
E
 
E
L
 
V
T
 
C
D
 
A
A
 
V
F
 
A
Y
 
I
A
 
A
G
 
K
D
 
D
M
 
E
E
 
Q
K
 
Q
A
 
A
R
 
K
Q
 
T
L
 
L
H
 
N
L
 
N
Q
 
K
T
 
I
L
 
A
K
 
N
I
 
L
G
 
H
N
 
N
A
 
I
M
 
L
F
|
F
I
 
C
E
 
E
S
 
S
N
|
N
P
 
P
I
 
I
P
 
P
V
 
V
K
 
K
T
 
W
A
 
A
L
 
L
G
 
H
L
 
E
M
 
M
G
 
G
K
 
L
C
 
I
S
 
D
D
 
T
E
 
G
V
 
I
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
C
 
T
P
 
P
M
 
L
G
 
A
A
 
E
A
 
Q
N
 
Y
K
 
R
E
 
E
K
 
P
L
 
L
A
 
R
A
 
N
I
 
A
M
 
L
K
 
K
E
 
D
Y
 
A
E
 
G
L
 
I
I
 
I

Q9X1K9 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase; HTPA synthase; EC 4.3.3.7 from Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / DSM 3109 / JCM 10099 / NBRC 100826 / MSB8) (see paper)
45% identity, 100% coverage: 1:290/290 of query aligns to 1:294/294 of Q9X1K9

query
sites
Q9X1K9
M
 
M
F
 
F
K
 
R
G
 
G
S
 
V
I
 
G
V
 
T
A
 
A
I
 
I
V
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
F
N
 
K
N
 
N
G
 
G
Q
 
E
V
 
L
D
 
D
F
 
L
E
 
E
K
 
S
L
 
Y
R
 
E
E
 
R
L
 
L
V
 
V
E
 
R
F
 
Y
Q
 
Q
I
 
L
S
 
E
N
 
N
G
 
G
T
 
V
D
 
N
A
 
A
I
 
L
V
 
I
P
 
V
C
 
L
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
A
 
S
S
 
P
T
 
T
L
 
V
D
 
N
Y
 
E
D
 
D
E
 
E
H
 
R
M
 
E
D
 
K
V
 
L
V
 
V
K
 
S
T
 
R
V
 
T
I
 
L
E
 
E
Q
 
I
V
 
V
N
 
D
K
 
G
R
 
K
V
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
V
G
 
G
T
 
A
G
 
G
S
 
T
N
 
N
S
 
S
T
 
T
A
 
E
E
 
K
A
 
T
I
 
L
E
 
K
L
 
L
S
 
V
Q
 
K
K
 
Q
A
 
A
K
 
E
E
 
K
V
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
N
G
 
G
V
 
V
L
 
L
L
 
V
V
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
Y
N
 
N
K
 
K
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
Y
R
 
Q
H
 
H
Y
 
Y
T
 
K
A
 
Y
I
 
I
A
 
S
D
 
E
A
 
R
V
 
T
A
 
D
I
 
L
P
 
G
Q
 
I
I
 
V
L
 
V
Y
 
Y
N
 
N
V
 
V
P
 
P
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
V
 
V
N
 
N
M
 
V
L
 
L
P
 
P
E
 
E
T
 
T
V
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
I
A
 
A
P
 
A
H
 
D
-
 
L
K
 
K
N
 
N
I
 
V
V
 
V
A
 
G
I
 
I
K
 
K
E
 
E
A
 
A
T
 
N
G
 
P
S
x
D
L
x
I
Q
x
D
Q
 
Q
A
 
I
S
 
D
E
 
R
I
 
T
L
 
V
A
 
S
L
 
L
-
 
T
-
 
K
-
 
Q
C
 
A
G
 
R
D
 
S
K
 
D
I
 
F
D
 
M
V
 
V
L
 
W
C
 
S
G
 
G
D
 
N
D
 
D
F
 
D
I
 
R
T
 
T
F
 
F
P
 
Y
M
 
L
M
 
L
A
 
C
C
 
A
G
 
G
A
 
G
K
 
D
G
 
G
V
 
V
I
 
I
S
 
S
V
 
V
L
 
V
A
 
S
N
 
N
I
 
V
M
 
A
P
 
P
K
 
K
T
 
Q
V
 
M
A
 
V
E
 
E
L
 
L
T
 
C
D
 
A
A
 
E
F
 
Y
Y
 
F
A
 
S
G
 
G
D
 
N
M
 
L
E
 
E
K
 
K
A
 
S
R
 
R
Q
 
E
L
 
V
H
 
H
L
 
R
Q
 
K
T
 
L
L
 
R
K
 
P
I
 
L
G
 
M
N
 
K
A
 
A
M
 
L
F
 
F
I
 
V
E
 
E
S
 
T
N
 
N
P
 
P
I
 
I
P
 
P
V
 
V
K
 
K
T
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
N
L
 
L
M
 
M
G
 
G
K
 
F
C
 
I
S
 
E
D
 
N
E
 
E
V
 
L
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
C
 
V
P
 
P
M
 
A
G
 
S
A
 
E
A
 
K
N
 
T
K
 
V
E
 
E
K
 
L
L
 
L
A
 
R
A
 
N
I
 
V
M
 
L
K
 
K
E
 
E
Y
 
S
E
 
G
L
 
L
I
 
L

1o5kA Crystal structure of dihydrodipicolinate synthase (tm1521) from thermotoga maritima at 1.80 a resolution
45% identity, 100% coverage: 1:290/290 of query aligns to 2:295/295 of 1o5kA

query
sites
1o5kA
M
 
M
F
 
F
K
 
R
G
 
G
S
 
V
I
 
G
V
 
T
A
 
A
I
 
I
V
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
F
N
 
K
N
 
N
G
 
G
Q
 
E
V
 
L
D
 
D
F
 
L
E
 
E
K
 
S
L
 
Y
R
 
E
E
 
R
L
 
L
V
 
V
E
 
R
F
 
Y
Q
 
Q
I
 
L
S
 
E
N
 
N
G
 
G
T
 
V
D
 
N
A
 
A
I
 
L
V
 
I
P
 
V
C
 
L
G
 
G
T
|
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
A
 
S
S
 
P
T
 
T
L
 
V
D
 
N
Y
 
E
D
 
D
E
 
E
H
 
R
M
 
E
D
 
K
V
 
L
V
 
V
K
 
S
T
 
R
V
 
T
I
 
L
E
|
E
Q
 
I
V
 
V
N
x
D
K
 
G
R
 
K
V
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
V
G
 
G
T
 
A
G
 
G
S
 
T
N
 
N
S
 
S
T
 
T
A
 
E
E
 
K
A
 
T
I
 
L
E
 
K
L
 
L
S
 
V
Q
 
K
K
 
Q
A
 
A
K
 
E
E
 
K
V
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
N
G
 
G
V
 
V
L
 
L
L
 
V
V
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
N
 
N
K
 
K
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
Y
R
 
Q
H
 
H
Y
 
Y
T
 
K
A
 
Y
I
 
I
A
 
S
D
 
E
A
 
R
V
 
T
A
 
D
I
 
L
P
 
G
Q
 
I
I
 
V
L
 
V
Y
|
Y
N
 
N
V
 
V
P
 
P
G
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
G
V
 
V
N
 
N
M
 
V
L
 
L
P
 
P
E
 
E
T
 
T
V
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
I
A
 
A
P
 
A
H
 
D
-
 
L
K
 
K
N
 
N
I
 
V
V
 
V
A
 
G
I
 
I
K
|
K
E
 
E
A
 
A
T
 
N
G
 
P
S
 
D
L
 
I
Q
 
D
Q
 
Q
A
 
I
S
 
D
E
 
R
I
 
T
L
 
V
A
 
S
L
 
L
C
 
T
G
 
K
-
 
Q
-
 
A
-
 
R
D
 
S
K
 
D
I
 
F
D
 
M
V
 
V
L
 
W
C
 
S
G
 
G
D
 
N
D
 
D
F
 
D
I
 
R
T
 
T
F
 
F
P
 
Y
M
 
L
M
 
L
A
 
C
C
 
A
G
 
G
A
 
G
K
 
D
G
 
G
V
 
V
I
|
I
S
 
S
V
 
V
L
 
V
A
 
S
N
 
N
I
 
V
M
 
A
P
 
P
K
 
K
T
 
Q
V
 
M
A
 
V
E
 
E
L
 
L
T
 
C
D
 
A
A
 
E
F
 
Y
Y
 
F
A
 
S
G
 
G
D
 
N
M
 
L
E
 
E
K
 
K
A
 
S
R
 
R
Q
 
E
L
 
V
H
 
H
L
 
R
Q
 
K
T
 
L
L
 
R
K
 
P
I
 
L
G
 
M
N
 
K
A
 
A
M
 
L
F
 
F
I
 
V
E
 
E
S
 
T
N
 
N
P
 
P
I
 
I
P
 
P
V
 
V
K
 
K
T
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
N
L
 
L
M
 
M
G
 
G
K
 
F
C
 
I
S
 
E
D
 
N
E
 
E
V
 
L
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
C
 
V
P
 
P
M
 
A
G
 
S
A
 
E
A
 
K
N
 
T
K
 
V
E
 
E
K
 
L
L
 
L
A
 
R
A
 
N
I
 
V
M
 
L
K
 
K
E
 
E
Y
 
S
E
 
G
L
 
L
I
 
L

3s8hA Structure of dihydrodipicolinate synthase complexed with 3- hydroxypropanoic acid(hpa)at 2.70 a resolution
52% identity, 99% coverage: 1:286/290 of query aligns to 1:287/292 of 3s8hA

query
sites
3s8hA
M
 
M
F
 
I
K
 
A
G
 
G
S
 
S
I
 
M
V
 
V
A
|
A
I
x
L
V
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
F
N
 
D
-
 
A
N
 
Q
G
 
G
Q
 
R
V
 
L
D
 
D
F
 
W
E
 
D
K
 
S
L
 
L
R
 
A
E
 
K
L
 
L
V
 
V
E
 
D
F
 
F
Q
 
H
I
 
L
S
 
Q
N
 
D
G
 
G
T
 
T
D
 
N
A
 
A
I
 
I
V
|
V
P
 
A
C
 
V
G
|
G
T
|
T
T
|
T
G
|
G
E
 
E
A
 
S
S
 
A
T
 
T
L
 
L
D
 
D
Y
 
V
D
 
E
E
 
E
H
 
H
M
 
I
D
 
Q
V
 
V
V
 
V
K
 
R
T
 
R
V
 
V
I
 
V
E
 
D
Q
 
Q
V
 
V
N
 
K
K
 
G
R
 
R
V
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
G
S
 
A
N
 
N
S
 
S
T
 
T
A
 
R
E
 
E
A
 
A
I
 
V
E
 
A
L
 
L
S
 
T
Q
 
E
K
 
A
A
 
A
K
 
K
E
 
S
V
 
G
G
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
A
V
 
C
L
 
L
L
 
L
V
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
N
 
N
K
 
K
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
L
 
M
V
 
Y
R
 
Q
H
 
H
Y
 
F
T
 
R
A
 
H
I
 
I
A
 
A
D
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
A
I
 
I
P
 
P
Q
 
Q
I
 
I
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
V
 
V
P
 
P
G
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
S
V
 
C
N
 
D
M
 
M
L
 
L
P
 
P
E
 
E
T
 
T
V
 
V
A
 
E
R
 
R
L
 
L
A
 
S
P
 
K
H
 
V
K
 
P
N
 
N
I
 
I
V
 
I
A
 
G
I
 
I
K
|
K
E
 
E
A
 
A
T
 
T
G
 
G
S
 
D
L
 
L
Q
 
Q
Q
 
R
A
 
A
S
 
K
E
 
E
I
 
V
L
 
I
A
 
E
L
 
R
C
 
V
G
 
G
D
 
K
K
 
D
I
 
F
D
 
L
V
 
V
L
 
Y
C
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
F
 
A
I
 
T
T
 
A
F
 
V
P
 
E
M
 
L
M
 
M
A
 
L
C
 
L
G
 
G
A
 
G
K
 
K
G
 
G
V
 
N
I
|
I
S
 
S
V
 
V
L
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
V
M
 
A
P
 
P
K
 
R
T
 
A
V
 
M
A
 
S
E
 
D
L
 
L
T
 
C
D
 
A
A
 
A
F
 
A
Y
 
M
A
 
R
G
 
G
D
 
D
M
 
A
E
 
A
K
 
A
A
 
A
R
 
R
Q
 
A
L
 
I
H
 
N
L
 
D
Q
 
R
T
 
L
L
 
M
K
 
P
I
 
L
G
 
H
N
 
K
A
 
A
M
 
L
F
 
F
I
 
I
E
 
E
S
 
S
N
 
N
P
 
P
I
 
I
P
 
P
V
 
V
K
 
K
T
 
W
A
 
A
L
 
L
G
 
H
L
 
E
M
 
M
G
 
G
K
 
L
C
 
I
S
 
P
D
 
E
E
 
G
V
 
I
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
C
 
T
P
 
W
M
 
L
G
 
S
A
 
P
A
 
H
N
 
C
K
 
H
E
 
D
K
 
P
L
 
L
A
 
R
A
 
Q
I
 
A
M
 
M
K
 
R
E
 
Q

3puoA Crystal structure of dihydrodipicolinate synthase from pseudomonas aeruginosa(psdhdps)complexed with l-lysine at 2.65a resolution (see paper)
52% identity, 99% coverage: 1:286/290 of query aligns to 1:287/292 of 3puoA

query
sites
3puoA
M
 
M
F
 
I
K
 
A
G
 
G
S
 
S
I
 
M
V
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
F
N
 
D
-
 
A
N
 
Q
G
 
G
Q
 
R
V
 
L
D
 
D
F
 
W
E
 
D
K
 
S
L
 
L
R
 
A
E
 
K
L
 
L
V
 
V
E
 
D
F
 
F
Q
 
H
I
 
L
S
 
Q
N
 
D
G
 
G
T
 
T
D
 
N
A
 
A
I
 
I
V
 
V
P
 
A
C
 
V
G
 
G
T
|
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
A
x
S
S
x
A
T
 
T
L
|
L
D
|
D
Y
x
V
D
 
E
E
 
E
H
 
H
M
 
I
D
 
Q
V
 
V
V
 
V
K
 
R
T
 
R
V
 
V
I
 
V
E
 
D
Q
 
Q
V
 
V
N
 
K
K
 
G
R
 
R
V
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
G
S
 
A
N
 
N
S
 
S
T
 
T
A
 
R
E
 
E
A
 
A
I
 
V
E
 
A
L
 
L
S
 
T
Q
 
E
K
 
A
A
 
A
K
 
K
E
 
S
V
 
G
G
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
A
V
 
C
L
 
L
L
 
L
V
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
N
 
N
K
 
K
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
L
 
M
V
 
Y
R
 
Q
H
 
H
Y
 
F
T
 
R
A
 
H
I
 
I
A
 
A
D
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
A
I
 
I
P
 
P
Q
 
Q
I
 
I
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
V
 
V
P
 
P
G
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
S
V
 
C
N
 
D
M
 
M
L
 
L
P
 
P
E
 
E
T
 
T
V
 
V
A
 
E
R
 
R
L
 
L
A
 
S
P
 
K
H
 
V
K
 
P
N
 
N
I
 
I
V
 
I
A
 
G
I
 
I
K
|
K
E
 
E
A
 
A
T
 
T
G
 
G
S
 
D
L
 
L
Q
 
Q
Q
 
R
A
 
A
S
 
K
E
 
E
I
 
V
L
 
I
A
 
E
L
 
R
C
 
V
G
 
G
D
 
K
K
 
D
I
 
F
D
 
L
V
 
V
L
 
Y
C
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
F
 
A
I
 
T
T
 
A
F
 
V
P
 
E
M
 
L
M
 
M
A
 
L
C
 
L
G
 
G
A
 
G
K
 
K
G
 
G
V
 
N
I
|
I
S
 
S
V
 
V
L
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
V
M
 
A
P
 
P
K
 
R
T
 
A
V
 
M
A
 
S
E
 
D
L
 
L
T
 
C
D
 
A
A
 
A
F
 
A
Y
 
M
A
 
R
G
 
G
D
 
D
M
 
A
E
 
A
K
 
A
A
 
A
R
 
R
Q
 
A
L
 
I
H
 
N
L
 
D
Q
 
R
T
 
L
L
 
M
K
 
P
I
 
L
G
 
H
N
 
K
A
 
A
M
 
L
F
 
F
I
 
I
E
 
E
S
 
S
N
 
N
P
 
P
I
 
I
P
 
P
V
 
V
K
 
K
T
 
W
A
 
A
L
 
L
G
 
H
L
 
E
M
 
M
G
 
G
K
 
L
C
 
I
S
 
P
D
 
E
E
 
G
V
x
I
R
 
R
L
|
L
P
 
P
L
|
L
C
x
T
P
 
W
M
 
L
G
 
S
A
 
P
A
 
H
N
 
C
K
 
H
E
 
D
K
 
P
L
 
L
A
 
R
A
 
Q
I
 
A
M
 
M
K
 
R
E
 
Q

5t25A Kinetic, spectral and structural characterization of the slow binding inhibitor acetopyruvate with dihydrodipicolinate synthase from escherichia coli.
47% identity, 100% coverage: 1:290/290 of query aligns to 2:293/293 of 5t25A

query
sites
5t25A
M
 
M
F
 
F
K
 
T
G
 
G
S
 
S
I
 
I
V
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
N
 
D
-
 
E
N
 
K
G
 
G
Q
 
N
V
 
V
D
 
C
F
 
R
E
 
A
K
 
S
L
 
L
R
 
K
E
 
K
L
 
L
V
 
I
E
 
D
F
 
Y
Q
 
H
I
 
V
S
 
A
N
 
S
G
 
G
T
 
T
D
 
S
A
 
A
I
 
I
V
 
V
P
 
S
C
 
V
G
 
G
T
|
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
A
 
S
S
x
A
T
 
T
L
|
L
D
 
N
Y
x
H
D
 
D
E
 
E
H
 
H
M
 
A
D
 
D
V
 
V
V
 
V
K
 
M
T
 
M
V
 
T
I
 
L
E
 
D
Q
 
L
V
 
A
N
 
D
K
 
G
R
 
R
V
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
G
S
 
A
N
|
N
S
 
A
T
 
T
A
 
A
E
|
E
A
 
A
I
 
I
E
 
S
L
 
L
S
 
T
Q
 
Q
K
 
R
A
 
F
K
 
N
E
 
D
V
 
S
G
 
G
A
 
I
D
 
V
G
 
G
V
 
C
L
 
L
L
 
T
V
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
|
Y
Y
|
Y
N
 
N
K
 
R
P
 
P
T
 
S
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
Y
R
 
Q
H
 
H
Y
 
F
T
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
E
A
 
H
V
 
T
A
 
D
I
 
L
P
 
P
Q
 
Q
I
 
I
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
V
 
V
P
 
P
G
 
S
R
|
R
T
 
T
G
 
G
V
 
C
N
 
D
M
 
L
L
 
L
P
 
P
E
 
E
T
 
T
V
 
V
A
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
A
P
 
K
H
 
V
K
 
K
N
 
N
I
 
I
V
 
I
A
 
G
I
 
I
K
|
K
E
 
E
A
 
A
T
 
T
G
 
G
S
 
N
L
 
L
Q
 
T
Q
 
R
A
 
V
S
 
N
E
 
Q
I
 
I
L
 
K
A
 
E
L
 
L
C
 
V
G
 
S
D
 
D
K
 
D
I
 
F
D
 
V
V
 
L
L
 
L
C
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
F
 
A
I
 
S
T
 
A
F
 
L
P
 
D
M
 
F
M
 
M
A
 
Q
C
 
L
G
 
G
A
 
G
K
 
H
G
 
G
V
 
V
I
|
I
S
 
S
V
 
V
L
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
V
M
 
A
P
 
A
K
 
R
T
 
D
V
 
M
A
 
A
E
 
Q
L
 
M
T
 
C
D
 
K
A
 
L
F
 
A
Y
 
A
A
 
E
G
 
G
D
 
H
M
 
F
E
 
A
K
 
E
A
 
A
R
 
R
Q
 
V
L
 
I
H
 
N
L
 
Q
Q
 
R
T
 
L
L
 
M
K
 
P
I
 
L
G
 
H
N
 
N
A
 
K
M
 
L
F
 
F
I
 
V
E
 
E
S
 
P
N
 
N
P
 
P
I
 
I
P
 
P
V
 
V
K
 
K
T
 
W
A
 
A
-
 
C
-
 
K
-
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
L
M
 
V
G
 
A
K
 
-
C
 
-
S
 
T
D
 
D
E
 
T
V
 
L
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
M
C
 
T
P
 
P
M
 
I
G
 
T
A
 
D
A
 
S
N
 
G
K
 
R
E
 
E
K
 
T
L
 
V
A
 
R
A
 
A
I
 
A
M
 
L
K
 
K
E
 
H
Y
 
A
E
 
G
L
 
L
I
 
L

2atsA Dihydrodipicolinate synthase co-crystallised with (s)-lysine
47% identity, 100% coverage: 1:290/290 of query aligns to 1:292/292 of 2atsA

query
sites
2atsA
M
 
M
F
 
F
K
 
T
G
 
G
S
 
S
I
 
I
V
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
N
 
D
-
 
E
N
 
K
G
 
G
Q
 
N
V
 
V
D
 
C
F
 
R
E
 
A
K
 
S
L
 
L
R
 
K
E
 
K
L
 
L
V
 
I
E
 
D
F
 
Y
Q
 
H
I
 
V
S
 
A
N
 
S
G
 
G
T
 
T
D
 
S
A
 
A
I
 
I
V
 
V
P
 
S
C
 
V
G
 
G
T
|
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
A
 
S
S
x
A
T
 
T
L
|
L
D
 
N
Y
x
H
D
 
D
E
 
E
H
|
H
M
 
A
D
 
D
V
 
V
V
 
V
K
 
M
T
 
M
V
 
T
I
 
L
E
 
D
Q
 
L
V
 
A
N
 
D
K
 
G
R
 
R
V
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
G
S
 
A
N
|
N
S
 
A
T
 
T
A
 
A
E
|
E
A
 
A
I
 
I
E
 
S
L
 
L
S
 
T
Q
 
Q
K
 
R
A
 
F
K
 
N
E
 
D
V
 
S
G
 
G
A
 
I
D
 
V
G
 
G
V
 
C
L
 
L
L
 
T
V
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
|
Y
Y
|
Y
N
 
N
K
 
R
P
 
P
T
 
S
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
Y
R
 
Q
H
 
H
Y
 
F
T
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
E
A
 
H
V
 
T
A
 
D
I
 
L
P
 
P
Q
 
Q
I
 
I
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
V
 
V
P
 
P
G
 
S
R
|
R
T
 
T
G
 
G
V
 
C
N
 
D
M
 
L
L
 
L
P
 
P
E
 
E
T
 
T
V
 
V
A
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
A
P
 
K
H
 
V
K
 
K
N
 
N
I
 
I
V
 
I
A
 
G
I
 
I
K
|
K
E
 
E
A
 
A
T
 
T
G
 
G
S
 
N
L
 
L
Q
 
T
Q
 
R
A
 
V
S
 
N
E
 
Q
I
 
I
L
 
K
A
 
E
L
 
L
C
 
V
G
 
S
D
 
D
K
 
D
I
 
F
D
 
V
V
 
L
L
 
L
C
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
F
 
A
I
 
S
T
 
A
F
 
L
P
 
D
M
 
F
M
 
M
A
 
Q
C
 
L
G
 
G
A
 
G
K
 
H
G
 
G
V
 
V
I
|
I
S
 
S
V
 
V
L
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
V
M
 
A
P
 
A
K
 
R
T
 
D
V
 
M
A
 
A
E
 
Q
L
 
M
T
 
C
D
 
K
A
 
L
F
 
A
Y
 
A
A
 
E
G
 
G
D
 
H
M
 
F
E
 
A
K
 
E
A
 
A
R
 
R
Q
 
V
L
 
I
H
 
N
L
 
Q
Q
 
R
T
 
L
L
 
M
K
 
P
I
 
L
G
 
H
N
 
N
A
 
K
M
 
L
F
 
F
I
 
V
E
 
E
S
 
P
N
 
N
P
 
P
I
 
I
P
 
P
V
 
V
K
 
K
T
 
W
A
 
A
-
 
C
-
 
K
-
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
L
M
 
V
G
 
A
K
 
-
C
 
-
S
 
T
D
 
D
E
 
T
V
 
L
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
M
C
 
T
P
 
P
M
 
I
G
 
T
A
 
D
A
 
S
N
 
G
K
 
R
E
 
E
K
 
T
L
 
V
A
 
R
A
 
A
I
 
A
M
 
L
K
 
K
E
 
H
Y
 
A
E
 
G
L
 
L
I
 
L

P0A6L2 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase; HTPA synthase; EC 4.3.3.7 from Escherichia coli (strain K12) (see 7 papers)
47% identity, 100% coverage: 1:290/290 of query aligns to 1:292/292 of P0A6L2

query
sites
P0A6L2
M
 
M
F
 
F
K
 
T
G
 
G
S
 
S
I
 
I
V
 
V
A
 
A
I
 
I
V
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
N
 
D
-
 
E
N
 
K
G
 
G
Q
 
N
V
 
V
D
 
C
F
 
R
E
 
A
K
 
S
L
 
L
R
 
K
E
 
K
L
 
L
V
 
I
E
 
D
F
 
Y
Q
 
H
I
 
V
S
 
A
N
 
S
G
 
G
T
 
T
D
 
S
A
 
A
I
 
I
V
 
V
P
 
S
C
 
V
G
 
G
T
|
T
T
|
T
G
 
G
E
 
E
A
 
S
S
 
A
T
 
T
L
 
L
D
 
N
Y
 
H
D
 
D
E
 
E
H
 
H
M
 
A
D
 
D
V
 
V
V
 
V
K
 
M
T
 
M
V
 
T
I
 
L
E
 
D
Q
 
L
V
 
A
N
 
D
K
 
G
R
 
R
V
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
G
S
 
A
N
 
N
S
 
A
T
 
T
A
 
A
E
 
E
A
 
A
I
 
I
E
 
S
L
 
L
S
 
T
Q
 
Q
K
 
R
A
 
F
K
 
N
E
 
D
V
 
S
G
 
G
A
 
I
D
 
V
G
 
G
V
 
C
L
 
L
L
 
T
V
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
N
 
N
K
 
R
P
 
P
T
 
S
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
Y
R
 
Q
H
 
H
Y
 
F
T
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
E
A
 
H
V
 
T
A
 
D
I
 
L
P
 
P
Q
 
Q
I
 
I
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
V
 
V
P
 
P
G
 
S
R
|
R
T
 
T
G
 
G
V
 
C
N
 
D
M
 
L
L
 
L
P
 
P
E
 
E
T
 
T
V
 
V
A
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
A
P
 
K
H
 
V
K
 
K
N
 
N
I
 
I
V
 
I
A
 
G
I
 
I
K
|
K
E
 
E
A
 
A
T
 
T
G
 
G
S
 
N
L
 
L
Q
 
T
Q
 
R
A
 
V
S
 
N
E
 
Q
I
 
I
L
 
K
A
 
E
L
 
L
C
 
V
G
 
S
D
 
D
K
 
D
I
 
F
D
 
V
V
 
L
L
 
L
C
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
F
 
A
I
 
S
T
 
A
F
 
L
P
 
D
M
 
F
M
 
M
A
 
Q
C
x
L
G
 
G
A
 
G
K
 
H
G
 
G
V
 
V
I
|
I
S
 
S
V
 
V
L
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
V
M
 
A
P
 
A
K
 
R
T
 
D
V
 
M
A
 
A
E
 
Q
L
 
M
T
 
C
D
 
K
A
 
L
F
 
A
Y
 
A
A
 
E
G
 
G
D
 
H
M
 
F
E
 
A
K
 
E
A
 
A
R
 
R
Q
 
V
L
 
I
H
 
N
L
 
Q
Q
 
R
T
 
L
L
 
M
K
 
P
I
 
L
G
 
H
N
 
N
A
 
K
M
 
L
F
 
F
I
 
V
E
 
E
S
 
P
N
 
N
P
 
P
I
 
I
P
 
P
V
 
V
K
 
K
T
 
W
A
 
A
-
 
C
-
 
K
-
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
L
M
 
V
G
 
A
K
 
-
C
 
-
S
 
T
D
 
D
E
 
T
V
 
L
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
M
C
 
T
P
 
P
M
 
I
G
 
T
A
 
D
A
 
S
N
 
G
K
 
R
E
 
E
K
 
T
L
 
V
A
 
R
A
 
A
I
 
A
M
 
L
K
 
K
E
 
H
Y
 
A
E
 
G
L
 
L
I
 
L

3i7sA Dihydrodipicolinate synthase mutant - k161a - with the substrate pyruvate bound in the active site. (see paper)
47% identity, 100% coverage: 1:290/290 of query aligns to 1:292/292 of 3i7sA

query
sites
3i7sA
M
 
M
F
 
F
K
 
T
G
 
G
S
 
S
I
 
I
V
 
V
A
|
A
I
 
I
V
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
N
 
D
-
 
E
N
 
K
G
 
G
Q
 
N
V
 
V
D
 
C
F
 
R
E
 
A
K
 
S
L
 
L
R
 
K
E
 
K
L
 
L
V
 
I
E
 
D
F
 
Y
Q
 
H
I
 
V
S
 
A
N
 
S
G
 
G
T
 
T
D
 
S
A
 
A
I
 
I
V
 
V
P
 
S
C
 
V
G
 
G
T
|
T
T
|
T
G
 
G
E
 
E
A
 
S
S
 
A
T
 
T
L
 
L
D
 
N
Y
 
H
D
 
D
E
 
E
H
 
H
M
 
A
D
 
D
V
 
V
V
 
V
K
 
M
T
 
M
V
 
T
I
 
L
E
 
D
Q
 
L
V
 
A
N
 
D
K
 
G
R
 
R
V
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
G
 
G
T
 
T
G
 
G
S
 
A
N
 
N
S
 
A
T
 
T
A
 
A
E
 
E
A
 
A
I
 
I
E
 
S
L
 
L
S
 
T
Q
 
Q
K
 
R
A
 
F
K
 
N
E
 
D
V
 
S
G
 
G
A
 
I
D
 
V
G
 
G
V
 
C
L
 
L
L
 
T
V
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
N
 
N
K
 
R
P
 
P
T
 
S
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
L
 
L
V
 
Y
R
 
Q
H
 
H
Y
 
F
T
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
E
A
 
H
V
 
T
A
 
D
I
 
L
P
 
P
Q
 
Q
I
 
I
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
V
 
V
P
 
P
G
 
S
R
|
R
T
 
T
G
 
G
V
 
C
N
 
D
M
 
L
L
 
L
P
 
P
E
 
E
T
 
T
V
 
V
A
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
A
P
 
K
H
 
V
K
 
K
N
 
N
I
 
I
V
 
I
A
 
G
I
 
I
K
x
R
E
 
E
A
 
A
T
 
T
G
 
G
S
 
N
L
 
L
Q
 
T
Q
 
R
A
 
V
S
 
N
E
 
Q
I
 
I
L
 
K
A
 
E
L
 
L
C
 
V
G
 
S
D
 
D
K
 
D
I
 
F
D
 
V
V
 
L
L
 
L
C
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
F
 
A
I
 
S
T
 
A
F
 
L
P
 
D
M
 
F
M
 
M
A
 
Q
C
 
L
G
 
G
A
 
G
K
 
H
G
 
G
V
 
V
I
|
I
S
 
S
V
 
V
L
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
V
M
 
A
P
 
A
K
 
R
T
 
D
V
 
M
A
 
A
E
 
Q
L
 
M
T
 
C
D
 
K
A
 
L
F
 
A
Y
 
A
A
 
E
G
 
G
D
 
H
M
 
F
E
 
A
K
 
E
A
 
A
R
 
R
Q
 
V
L
 
I
H
 
N
L
 
Q
Q
 
R
T
 
L
L
 
M
K
 
P
I
 
L
G
 
H
N
 
N
A
 
K
M
 
L
F
 
F
I
 
V
E
 
E
S
 
P
N
 
N
P
 
P
I
 
I
P
 
P
V
 
V
K
 
K
T
 
W
A
 
A
-
 
C
-
 
K
-
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
L
M
 
V
G
 
A
K
 
-
C
 
-
S
 
T
D
 
D
E
 
T
V
 
L
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
M
C
 
T
P
 
P
M
 
I
G
 
T
A
 
D
A
 
S
N
 
G
K
 
R
E
 
E
K
 
T
L
 
V
A
 
R
A
 
A
I
 
A
M
 
L
K
 
K
E
 
H
Y
 
A
E
 
G
L
 
L
I
 
L

4pfmA Shewanella benthica dhdps with lysine and pyruvate
48% identity, 94% coverage: 1:272/290 of query aligns to 2:275/295 of 4pfmA

query
sites
4pfmA
M
 
M
F
 
I
K
 
N
G
 
G
S
 
S
I
 
I
V
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
I
T
 
T
P
 
P
F
 
L
N
 
N
-
 
S
N
 
D
G
 
G
Q
 
T
V
 
V
D
 
D
F
 
Y
E
 
T
K
 
S
L
 
L
R
 
E
E
 
K
L
 
L
V
 
V
E
 
E
F
 
Y
Q
 
H
I
 
I
S
 
T
N
 
E
G
 
G
T
 
T
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
V
P
 
A
C
 
V
G
 
G
T
|
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
A
x
S
S
x
A
T
 
T
L
|
L
D
 
P
Y
 
I
D
 
S
E
 
E
H
|
H
M
 
I
D
 
A
V
 
V
V
 
V
K
 
G
T
 
Q
V
 
T
I
 
V
E
 
K
Q
 
F
V
 
A
N
 
S
K
 
G
R
 
R
V
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
G
G
 
G
T
 
N
G
 
G
S
 
A
N
|
N
S
 
A
T
 
T
A
 
A
E
|
E
A
 
A
I
 
I
E
 
E
L
 
L
S
 
T
Q
 
K
K
 
A
A
 
Q
K
 
N
E
 
K
V
 
L
G
 
G
A
 
V
D
 
A
G
 
A
V
 
M
L
 
L
L
 
G
V
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
|
Y
Y
|
Y
N
 
N
K
 
K
P
 
P
T
 
S
Q
 
P
E
 
K
G
 
G
L
 
L
V
 
I
R
 
A
H
 
H
Y
 
Y
T
 
T
A
 
A
I
 
V
A
 
A
D
 
A
A
 
S
V
 
T
A
 
D
I
 
I
P
 
P
Q
 
Q
I
 
I
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
V
 
V
P
 
P
G
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
A
V
 
V
N
 
D
M
 
M
L
 
L
P
 
P
E
 
E
T
 
T
V
 
I
A
 
A
R
 
Q
L
 
L
A
 
V
P
 
E
H
 
V
K
 
P
N
 
N
I
 
I
V
 
I
A
 
G
I
 
V
K
|
K
E
 
D
A
 
A
T
 
T
G
 
G
S
 
D
L
 
V
Q
 
A
Q
 
R
A
 
V
S
 
K
E
 
Q
I
 
L
L
 
R
A
 
D
L
 
L
C
 
C
G
 
G
D
 
N
K
 
D
I
 
F
D
 
L
V
 
L
L
 
Y
C
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
F
 
A
I
 
T
T
 
A
F
 
R
P
 
E
M
 
F
M
 
L
A
 
T
C
 
L
G
 
G
A
 
G
K
 
D
G
 
G
V
 
V
I
|
I
S
 
S
V
 
V
L
 
A
A
 
N
N
 
N
I
 
I
M
 
V
P
 
P
K
 
K
T
 
L
V
 
F
A
 
K
E
 
L
L
 
M
T
 
C
D
 
D
A
 
A
F
 
A
Y
 
L
A
 
A
G
 
G
D
 
D
M
 
T
E
 
Q
K
 
A
A
 
A
R
 
M
Q
 
A
L
 
A
H
 
E
L
 
D
Q
 
Q
T
 
I
L
 
K
K
 
G
I
 
L
G
 
F
N
 
S
A
 
A
M
 
L
F
 
F
I
 
C
E
 
E
S
 
A
N
 
N
P
 
P
I
 
I
P
 
P
V
 
V
K
 
K
T
 
W
A
 
A
L
 
A
G
 
H
L
 
K
M
 
M
G
 
G
K
 
L
C
 
I
S
 
S
D
 
Q
-
 
G
E
 
D
V
 
I
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
C
 
T
P
 
E
M
 
L

5ktlA Dihydrodipicolinate synthase from the industrial and evolutionarily important cyanobacteria anabaena variabilis. (see paper)
45% identity, 100% coverage: 2:290/290 of query aligns to 5:295/295 of 5ktlA

query
sites
5ktlA
F
 
F
K
 
G
G
 
T
S
 
V
I
 
L
V
 
T
A
 
A
I
 
M
V
 
I
T
 
T
P
 
P
F
 
F
N
 
K
-
 
A
N
 
D
G
 
G
Q
 
S
V
 
V
D
 
N
F
 
Y
E
 
A
K
 
V
L
 
A
R
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
A
E
 
A
F
 
H
Q
 
L
I
 
V
S
 
D
N
 
N
G
 
G
T
 
T
D
 
D
A
 
T
I
 
L
V
 
V
P
 
V
C
 
C
G
 
G
T
|
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
A
x
S
S
 
P
T
 
T
L
|
L
D
 
S
Y
 
W
D
 
D
E
 
E
H
x
E
M
 
Y
D
 
N
V
 
L
V
 
F
K
 
V
T
x
E
V
 
V
I
 
L
E
x
Q
Q
 
T
V
 
V
N
 
A
K
 
G
R
 
K
V
 
A
P
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
A
G
 
G
T
 
C
G
 
G
S
 
S
N
 
N
S
 
S
T
 
T
A
 
K
E
 
E
A
 
A
I
 
I
E
 
A
L
 
A
S
 
T
Q
 
Q
K
 
K
A
 
A
K
 
A
E
 
K
V
 
I
G
 
G
A
 
V
D
 
H
G
 
G
V
 
T
L
 
L
L
 
Q
V
 
V
T
 
V
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
N
 
N
K
 
K
P
 
P
T
 
P
Q
 
Q
E
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
Y
R
 
Q
H
 
H
Y
 
F
T
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
Q
A
 
A
V
 
C
A
 
P
-
 
D
I
 
L
P
 
P
Q
 
L
I
 
L
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
V
 
V
P
 
P
G
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
G
V
 
Q
N
 
N
M
 
L
L
 
S
P
 
P
E
 
E
T
 
T
V
 
V
A
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
P
 
E
H
 
I
K
 
D
N
 
N
I
 
I
V
 
I
A
 
G
I
 
V
K
|
K
E
 
E
A
 
A
T
 
S
G
 
G
S
 
N
L
 
L
Q
 
D
Q
 
Q
A
 
A
S
 
G
E
 
E
I
 
I
L
 
R
A
 
R
L
 
S
C
 
T
G
 
P
D
 
K
K
 
E
I
 
F
D
 
Q
V
 
I
L
 
Y
C
 
A
G
 
G
D
 
D
D
 
D
F
 
S
I
 
L
T
 
T
F
 
L
P
 
P
M
 
L
M
 
L
A
 
A
C
 
I
G
 
G
A
 
A
K
 
K
G
 
G
V
 
V
I
x
V
S
 
S
V
 
V
L
 
A
A
 
S
N
 
H
I
 
L
M
 
V
P
 
G
K
 
N
T
 
Q
V
 
L
A
 
Q
E
 
Q
L
 
M
T
 
I
D
 
Q
A
 
A
F
 
F
Y
 
N
A
 
S
G
 
G
D
 
Q
M
 
V
E
 
T
K
 
V
A
 
A
R
 
S
Q
 
D
L
 
I
H
 
H
L
 
L
Q
 
R
T
 
L
L
 
L
K
 
P
I
 
L
G
 
F
N
 
K
A
 
A
M
 
L
F
 
F
I
 
I
E
 
T
S
 
T
N
 
N
P
 
P
I
 
I
P
 
P
V
 
I
K
 
K
T
 
Q
A
 
A
L
 
L
G
 
K
L
 
L
M
 
Q
G
 
G
K
 
W
C
 
E
S
 
V
D
 
G
E
 
S
V
 
T
R
 
R
L
 
P
P
 
P
L
 
L
C
 
S
P
 
D
M
 
A
G
 
D
A
 
A
A
 
E
N
 
V
K
 
S
E
 
Q
K
 
K
L
 
L
A
 
E
A
 
A
I
 
V
M
 
M
K
 
K
E
 
H
Y
 
L
E
 
N
L
 
L
I
 
I

Q07607 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase; HTPA synthase; Protein MosA; EC 4.3.3.7 from Rhizobium meliloti (Ensifer meliloti) (Sinorhizobium meliloti) (see paper)
44% identity, 99% coverage: 1:286/290 of query aligns to 1:287/292 of Q07607

query
sites
Q07607
M
 
M
F
 
F
K
 
E
G
 
G
S
 
S
I
 
I
V
 
T
A
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
F
N
 
A
N
 
D
G
 
D
Q
 
R
V
 
I
D
 
D
F
 
E
E
 
V
K
 
A
L
 
L
R
 
H
E
 
D
L
 
L
V
 
V
E
 
E
F
 
W
Q
 
Q
I
 
I
S
 
E
N
 
E
G
 
G
T
 
S
D
 
F
A
 
G
I
 
L
V
 
V
P
 
P
C
 
C
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
A
 
S
S
 
P
T
 
T
L
 
L
D
 
S
Y
 
K
D
 
S
E
 
E
H
 
H
M
 
E
D
 
Q
V
 
V
V
 
V
K
 
E
T
 
I
V
 
T
I
 
I
E
 
K
Q
 
T
V
 
A
N
 
N
K
 
G
R
 
R
V
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
G
 
G
T
 
A
G
 
G
S
 
S
N
 
N
S
 
S
T
 
T
A
 
A
E
 
E
A
 
A
I
 
I
E
 
A
L
 
F
S
 
V
Q
 
R
K
 
H
A
 
A
K
 
Q
E
 
N
V
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
G
V
 
V
L
 
L
L
 
I
V
 
V
T
 
S
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
Y
N
 
N
K
 
K
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
L
 
I
V
 
Y
R
 
Q
H
 
H
Y
 
F
T
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
D
D
 
A
A
 
A
V
 
S
A
 
T
I
 
I
P
 
P
Q
 
I
I
 
I
L
 
V
Y
 
Y
N
 
N
V
 
I
P
 
P
G
 
G
R
 
R
T
 
S
G
 
A
V
 
I
N
 
E
M
 
I
L
 
H
P
 
V
E
 
E
T
 
T
V
 
L
A
 
A
R
 
R
L
 
I
A
 
F
P
 
E
H
 
D
-
 
C
K
 
P
N
 
N
I
 
V
V
 
K
A
 
G
I
 
V
K
|
K
E
 
D
A
 
A
T
 
T
G
 
G
S
 
N
L
 
L
Q
 
L
Q
 
R
A
 
P
S
 
S
E
 
L
I
 
E
L
 
R
A
 
M
L
 
A
C
 
C
G
 
G
D
 
E
K
 
D
I
 
F
D
 
N
V
 
L
L
 
L
C
 
T
G
 
G
D
 
E
D
 
D
F
 
G
I
 
T
T
 
A
F
 
L
P
 
G
M
 
Y
M
 
M
A
 
A
C
 
H
G
 
G
A
 
G
K
 
H
G
 
G
V
 
C
I
 
I
S
 
S
V
 
V
L
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
V
M
 
A
P
 
P
K
 
A
T
 
L
V
 
C
A
 
A
E
 
D
L
 
F
T
 
Q
D
 
Q
A
 
A
F
 
C
Y
 
L
A
 
N
G
 
G
D
 
D
M
 
F
E
 
A
K
 
A
A
 
A
R
 
L
Q
 
K
L
 
L
H
 
Q
L
 
D
Q
 
R
T
 
L
L
 
M
K
 
P
I
 
L
G
 
H
N
 
R
A
 
A
M
 
L
F
 
F
I
 
L
E
 
E
S
 
T
N
 
N
P
 
P
I
 
A
P
 
G
V
 
A
K
 
K
T
 
Y
A
 
A
L
 
L
G
 
Q
L
 
R
M
 
L
G
 
G
K
 
R
C
 
M
S
 
R
D
 
G
E
 
D
V
 
L
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
C
 
V
P
 
T
M
 
I
G
 
S
A
 
P
A
 
S
N
 
F
K
 
Q
E
 
E
K
 
E
L
 
I
A
 
D
A
 
D
I
 
A
M
 
M
K
 
R
E
 
H

4m19A Dihydrodipicolinate synthase from c. Jejuni with pyruvate bound to the active site and lysine bound to allosteric site (see paper)
44% identity, 99% coverage: 4:289/290 of query aligns to 6:293/296 of 4m19A

query
sites
4m19A
G
 
G
S
 
A
I
 
M
V
 
T
A
 
A
I
 
L
V
 
I
T
 
T
P
 
P
F
 
F
N
 
K
N
 
N
G
 
G
Q
 
K
V
 
V
D
 
D
F
 
E
E
 
Q
K
 
S
L
 
Y
R
 
A
E
 
R
L
 
L
V
 
I
E
 
K
F
 
R
Q
 
Q
I
 
I
S
 
E
N
 
N
G
 
G
T
 
I
D
 
D
A
 
A
I
 
V
V
 
V
P
 
P
C
 
V
G
 
G
T
|
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
A
x
S
S
x
A
T
 
T
L
|
L
D
 
T
Y
x
H
D
 
E
E
 
E
H
|
H
M
 
R
D
 
T
V
 
C
V
 
I
K
 
E
T
 
I
V
 
A
I
 
V
E
 
E
Q
 
T
V
 
C
N
 
K
-
 
G
K
 
T
R
 
K
V
 
V
P
 
K
V
 
V
I
 
L
A
 
A
G
 
G
T
 
A
G
 
G
S
 
S
N
|
N
S
 
A
T
 
T
A
 
H
E
|
E
A
 
A
I
 
V
E
 
G
L
 
L
S
 
A
Q
 
K
K
 
F
A
 
A
K
 
K
E
 
E
V
 
H
G
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
G
V
 
I
L
 
L
L
 
S
V
 
V
T
 
A
P
 
P
Y
|
Y
Y
|
Y
N
 
N
K
 
K
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
E
 
Q
G
 
G
L
 
L
V
 
Y
R
 
E
H
 
H
Y
 
Y
T
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
Q
A
 
S
V
 
V
A
 
D
I
 
I
P
 
P
Q
 
V
I
 
L
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
V
 
V
P
 
P
G
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
G
V
 
C
N
 
E
M
 
I
L
 
S
P
 
T
E
 
D
T
 
T
V
 
I
A
 
I
R
 
K
L
 
L
A
 
F
P
 
R
H
 
D
-
 
C
K
 
E
N
 
N
I
 
I
V
 
Y
A
 
G
I
 
V
K
|
K
E
 
E
A
 
A
T
 
S
G
 
G
S
 
N
L
 
I
Q
 
D
Q
 
K
A
 
C
S
 
V
E
 
D
I
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
H
C
 
-
G
 
E
D
 
P
K
 
R
I
 
M
D
 
M
V
 
L
L
 
I
C
 
S
G
 
G
D
 
E
D
 
D
F
 
A
I
 
I
T
 
N
F
 
Y
P
 
P
M
 
I
M
 
L
A
 
S
C
 
N
G
 
G
A
 
G
K
 
K
G
 
G
V
 
V
I
|
I
S
 
S
V
 
V
L
 
T
A
 
S
N
 
N
I
 
L
M
 
L
P
 
P
K
 
D
T
 
M
V
 
I
A
 
S
E
 
A
L
 
L
T
 
T
D
 
H
A
 
F
F
 
A
Y
 
L
A
 
D
G
 
E
D
 
N
M
 
Y
E
 
K
K
 
E
A
 
A
R
 
K
Q
 
K
L
 
I
H
 
N
L
 
D
Q
 
E
T
 
L
L
 
Y
K
 
N
I
 
I
G
 
N
N
 
K
A
 
I
M
 
L
F
 
F
I
 
C
E
 
E
S
 
S
N
 
N
P
 
P
I
 
I
P
 
P
V
 
I
K
 
K
T
 
T
A
 
A
L
 
M
G
 
Y
L
 
L
M
 
A
G
 
G
K
 
L
C
 
I
-
 
E
S
 
S
D
 
L
E
 
E
V
 
F
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
C
 
C
P
 
S
M
 
P
G
 
S
A
 
K
A
 
E
N
 
N
K
 
F
E
 
A
K
 
K
L
 
I
A
 
E
A
 
E
I
 
V
M
 
M
K
 
K
E
 
K
Y
 
Y
E
 
K
L
 
I

6u01B Dihydrodipicolinate synthase (dhdps) from c.Jejuni, n84d mutant with pyruvate bound in the active site (see paper)
43% identity, 99% coverage: 4:289/290 of query aligns to 6:293/296 of 6u01B

query
sites
6u01B
G
 
G
S
 
A
I
 
M
V
 
T
A
 
A
I
 
L
V
 
I
T
 
T
P
 
P
F
 
F
N
 
K
N
 
N
G
 
G
Q
 
K
V
 
V
D
 
D
F
 
E
E
 
Q
K
 
S
L
 
Y
R
 
A
E
 
R
L
 
L
V
 
I
E
 
K
F
 
R
Q
 
Q
I
 
I
S
 
E
N
 
N
G
 
G
T
 
I
D
 
D
A
 
A
I
 
V
V
 
V
P
 
P
C
 
V
G
 
G
T
|
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
A
 
S
S
 
A
T
 
T
L
 
L
D
 
T
Y
 
H
D
 
E
E
 
E
H
 
H
M
 
R
D
 
T
V
 
C
V
 
I
K
 
E
T
 
I
V
 
A
I
 
V
E
 
E
Q
 
T
V
 
C
N
 
K
-
 
G
K
 
T
R
 
K
V
 
V
P
 
K
V
 
V
I
 
L
A
 
A
G
 
G
T
 
A
G
 
G
S
 
S
N
 
D
S
 
A
T
 
T
A
 
H
E
 
E
A
 
A
I
 
V
E
 
G
L
 
L
S
 
A
Q
 
K
K
 
F
A
 
A
K
 
K
E
 
E
V
 
H
G
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
G
V
 
I
L
 
L
L
 
S
V
 
V
T
 
A
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
N
 
N
K
 
K
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
E
 
Q
G
 
G
L
 
L
V
 
Y
R
 
E
H
 
H
Y
 
Y
T
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
Q
A
 
S
V
 
V
A
 
D
I
 
I
P
 
P
Q
 
V
I
 
L
L
 
L
Y
|
Y
N
 
N
V
 
V
P
 
P
G
 
G
R
|
R
T
 
T
G
 
G
V
 
C
N
 
E
M
 
I
L
 
S
P
 
T
E
 
D
T
 
T
V
 
I
A
 
I
R
 
K
L
 
L
A
 
F
P
 
R
H
 
D
-
 
C
K
 
E
N
 
N
I
 
I
V
 
Y
A
 
G
I
 
V
K
|
K
E
 
E
A
 
A
T
 
S
G
 
G
S
 
N
L
 
I
Q
 
D
Q
 
K
A
 
C
S
 
V
E
 
D
I
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
H
C
 
-
G
 
E
D
 
P
K
 
R
I
 
M
D
 
M
V
 
L
L
 
I
C
x
S
G
 
G
D
x
E
D
|
D
F
 
A
I
 
I
T
x
N
F
 
Y
P
 
P
M
 
I
M
 
L
A
 
S
C
 
N
G
 
G
A
 
G
K
 
K
G
 
G
V
 
V
I
|
I
S
 
S
V
 
V
L
 
T
A
 
S
N
 
N
I
 
L
M
 
L
P
 
P
K
 
D
T
 
M
V
 
I
A
 
S
E
 
A
L
 
L
T
 
T
D
 
H
A
 
F
F
 
A
Y
 
L
A
 
D
G
 
E
D
 
N
M
 
Y
E
 
K
K
 
E
A
 
A
R
 
K
Q
 
K
L
 
I
H
 
N
L
 
D
Q
 
E
T
 
L
L
 
Y
K
 
N
I
 
I
G
 
N
N
 
K
A
 
I
M
 
L
F
 
F
I
 
C
E
 
E
S
 
S
N
 
N
P
 
P
I
 
I
P
 
P
V
 
I
K
 
K
T
 
T
A
 
A
L
 
M
G
 
Y
L
 
L
M
 
A
G
 
G
K
 
L
C
 
I
-
 
E
S
 
S
D
 
L
E
 
E
V
 
F
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
C
 
C
P
 
S
M
 
P
G
 
S
A
 
K
A
 
E
N
 
N
K
 
F
E
 
A
K
 
K
L
 
I
A
 
E
A
 
E
I
 
V
M
 
M
K
 
K
E
 
K
Y
 
Y
E
 
K
L
 
I

4i7wA Agrobacterium tumefaciens dhdps with lysine and pyruvate
48% identity, 93% coverage: 1:269/290 of query aligns to 1:271/294 of 4i7wA

query
sites
4i7wA
M
 
M
F
 
F
K
 
K
G
 
G
S
 
S
I
 
I
V
 
P
A
 
A
I
 
L
V
 
I
T
 
T
P
 
P
F
 
F
-
 
T
N
 
D
N
 
N
G
 
G
Q
 
A
V
 
V
D
 
D
F
 
E
E
 
Q
K
 
A
L
 
F
R
 
A
E
 
A
L
 
H
V
 
V
E
 
E
F
 
W
Q
 
Q
I
 
I
S
 
A
N
 
E
G
 
G
T
 
S
D
 
N
A
 
G
I
 
L
V
 
V
P
 
P
C
 
V
G
 
G
T
|
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
A
x
S
S
x
P
T
 
T
L
|
L
D
 
S
Y
 
H
D
 
D
E
 
E
H
|
H
M
 
K
D
 
R
V
 
V
V
 
V
K
 
E
T
 
L
V
 
C
I
 
I
E
 
E
Q
 
V
V
 
A
N
 
A
K
 
K
R
 
R
V
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
G
 
G
T
 
A
G
 
G
S
 
S
N
|
N
S
 
N
T
 
T
A
 
D
E
|
E
A
 
A
I
 
I
E
 
E
L
 
L
S
 
A
Q
 
L
K
 
H
A
 
A
K
 
Q
E
 
D
V
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
A
V
 
L
L
 
L
L
 
V
V
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
|
Y
Y
|
Y
N
 
N
K
 
K
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
E
 
K
G
 
G
L
 
L
V
 
F
R
 
A
H
 
H
Y
 
F
T
 
S
A
 
A
I
 
V
A
 
A
D
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
K
I
 
L
P
 
P
Q
 
I
I
 
V
L
 
I
Y
|
Y
N
 
N
V
 
I
P
 
P
G
 
P
R
|
R
T
 
S
G
 
V
V
 
V
N
 
D
M
 
M
L
 
S
P
 
P
E
 
E
T
 
T
V
 
M
A
 
G
R
 
A
L
 
L
A
 
V
-
 
K
P
 
A
H
 
H
K
 
K
N
 
N
I
 
I
V
 
V
A
 
G
I
 
V
K
|
K
E
 
D
A
 
A
T
 
T
G
 
G
S
 
K
L
 
L
Q
 
D
Q
 
R
A
 
V
S
 
S
E
 
E
I
 
Q
L
 
R
A
 
I
L
 
S
C
 
C
G
 
G
D
 
K
K
 
D
I
 
F
D
 
I
V
 
Q
L
 
L
C
 
S
G
 
G
D
 
E
D
 
D
F
 
S
I
 
T
T
 
A
F
 
L
P
 
G
M
 
F
M
 
N
A
 
A
C
 
H
G
 
G
A
 
G
K
 
V
G
 
G
V
 
C
I
|
I
S
 
S
V
 
V
L
 
S
A
 
A
N
 
N
I
 
V
M
 
A
P
 
P
K
 
R
T
 
L
V
 
C
A
 
S
E
 
E
L
 
F
T
 
Q
D
 
A
A
 
A
F
 
M
Y
 
L
A
 
A
G
 
G
D
 
D
M
 
Y
E
 
A
K
 
K
A
 
A
R
 
L
Q
 
E
L
 
Y
H
 
Q
L
 
D
Q
 
R
T
 
L
L
 
M
K
 
P
I
 
L
G
 
H
N
 
R
A
 
A
M
 
I
F
 
F
I
 
M
E
 
E
S
 
P
N
 
G
P
 
V
I
 
C
P
 
G
V
 
T
K
 
K
T
 
Y
A
 
A
L
 
L
G
 
S
L
 
K
M
 
T
G
 
R
K
 
G
C
 
C
S
 
N
D
 
R
E
 
K
V
 
V
R
 
R
L
 
S
P
 
P
L
 
L

Query Sequence

>WP_004512800.1 NCBI__GCF_000012925.1:WP_004512800.1
MFKGSIVAIVTPFNNGQVDFEKLRELVEFQISNGTDAIVPCGTTGEASTLDYDEHMDVVK
TVIEQVNKRVPVIAGTGSNSTAEAIELSQKAKEVGADGVLLVTPYYNKPTQEGLVRHYTA
IADAVAIPQILYNVPGRTGVNMLPETVARLAPHKNIVAIKEATGSLQQASEILALCGDKI
DVLCGDDFITFPMMACGAKGVISVLANIMPKTVAELTDAFYAGDMEKARQLHLQTLKIGN
AMFIESNPIPVKTALGLMGKCSDEVRLPLCPMGAANKEKLAAIMKEYELI

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory