SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_005346465.1 NCBI__GCF_000173975.1:WP_005346465.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 14 hits to proteins with known functional sites (download)

7wxiA Gpr domain of drosophila p5cs filament with glutamate and atpgammas (see paper)
33% identity, 97% coverage: 9:414/418 of query aligns to 8:407/430 of 7wxiA

query
sites
7wxiA
Q
 
N
A
 
A
V
 
R
T
 
T
A
 
G
K
 
S
N
 
R
A
 
Q
I
 
M
N
 
Q
S
 
A
A
 
L
D
 
T
T
 
P
E
 
A
T
 
Q
K
 
R
N
 
A
K
 
S
A
 
A
L
 
V
A
 
N
N
 
T
M
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
L
L
 
L
L
 
V
A
 
S
H
 
R
T
 
E
D
 
K
A
 
F
I
 
I
L
 
L
E
 
D
A
 
A
N
 
N
K
 
A
Q
 
K
D
 
D
V
 
L
-
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
Q
R
 
K
G
 
S
K
 
G
I
 
L
S
 
A
D
 
K
V
 
P
M
 
L
I
 
L
D
 
S
R
 
R
L
 
L
M
 
S
L
 
L
D
 
N
A
 
P
G
 
A
R
 
K
I
 
L
E
 
K
G
 
N
M
 
L
A
 
S
K
 
V
G
 
G
I
 
L
R
 
K
E
 
Q
L
 
I
I
 
A
-
 
E
D
 
D
L
 
S
D
 
H
D
 
K
P
 
N
A
 
V
G
 
G
K
 
R
V
 
V
L
 
L
R
 
R
T
 
R
V
 
T
E
 
R
R
 
L
P
 
A
N
 
D
G
 
Q
I
 
L
V
 
E
I
 
L
E
 
K
K
 
Q
T
 
V
A
 
T
V
 
V
P
 
P
M
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
L
A
 
L
I
 
V
I
 
I
Y
 
F
E
 
E
S
 
S
R
 
R
P
 
P
N
 
D
V
 
S
T
 
L
S
 
P
D
 
Q
A
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
L
C
 
A
I
 
M
K
 
A
S
 
S
G
 
A
N
 
N
V
 
G
C
 
L
V
 
L
L
 
L
R
 
K
S
 
G
G
 
G
K
 
K
E
 
E
A
 
A
W
 
A
K
 
H
S
 
S
A
 
N
N
 
K
A
 
A
V
 
L
V
 
M
T
 
E
A
 
L
L
 
V
K
 
K
E
 
E
G
 
A
M
 
L
V
 
A
K
 
T
S
 
V
N
 
G
L
 
A
P
 
E
G
 
-
E
 
H
G
 
A
I
 
V
Q
 
S
L
 
L
I
 
V
E
 
-
D
 
-
T
 
S
S
 
T
R
 
R
E
 
E
S
 
E
S
 
I
V
 
S
E
 
D
L
 
L
M
 
L
K
 
S
A
 
M
V
 
E
G
 
N
Y
 
H
V
 
I
D
 
D
L
 
L
L
 
I
I
 
I
P
 
P
R
 
R
G
 
G
G
 
S
P
 
S
G
 
D
L
 
L
I
 
V
R
 
R
S
 
S
C
 
I
V
 
Q
E
 
Q
N
 
Q
A
 
S
-
 
L
K
 
H
V
 
I
P
 
P
C
 
V
I
 
L
Q
 
G
T
 
H
G
 
A
T
 
E
G
 
G
I
 
V
C
 
C
H
 
H
V
 
V
Y
 
Y
V
 
I
D
 
D
E
 
R
S
 
D
A
 
A
S
 
D
F
 
L
E
 
E
K
 
K
A
 
A
L
 
L
Q
 
R
I
 
I
I
 
A
E
 
R
N
 
D
A
 
A
K
 
K
T
 
C
S
 
D
R
 
Y
P
 
P
S
 
A
V
 
A
C
 
C
N
 
N
A
 
A
E
 
M
E
 
E
V
 
T
L
 
L
L
 
L
V
 
I
H
 
H
S
 
E
A
 
D
V
 
L
A
 
M
E
 
S
K
 
G
F
 
-
L
 
-
P
 
-
L
 
A
L
 
I
Q
 
F
K
 
G
K
 
D
L
 
V
V
 
C
E
 
N
E
 
M
R
 
L
K
 
K
E
 
R
K
 
E
G
 
G
E
 
-
I
 
-
P
 
-
V
 
V
E
 
K
L
 
I
R
 
Y
L
 
A
C
 
G
D
 
P
R
 
R
A
 
L
A
 
N
K
 
Q
I
 
Q
I
 
L
S
 
T
G
 
F
T
 
G
P
 
P
A
 
P
G
 
A
A
 
A
D
 
K
D
 
S
F
 
L
D
 
K
T
 
H
E
 
E
F
 
Y
L
 
G
D
 
A
Y
 
L
I
 
E
L
 
C
A
 
C
V
 
I
K
 
E
I
 
V
V
 
V
D
 
P
S
 
S
V
 
L
E
 
D
E
 
E
A
 
A
V
 
I
E
 
N
H
 
H
I
 
I
S
 
H
K
 
T
H
 
Y
S
 
G
T
 
S
G
 
S
H
 
H
S
 
T
E
 
D
A
 
V
I
 
I
I
 
V
T
 
T
E
 
E
S
 
N
K
 
D
E
 
A
A
 
A
A
 
A
D
 
R
Y
 
Q
F
 
F
T
 
L
M
 
G
R
 
S
V
 
V
D
 
D
S
 
S
A
 
A
A
 
C
V
 
V
Y
 
F
V
 
H
N
 
N
V
 
A
S
 
S
T
 
S
R
|
R
F
 
F
T
 
A
D
|
D
G
 
G
G
 
F
E
 
R
F
 
F
G
 
G
L
 
L
G
 
G
C
 
A
E
 
E
M
 
V
G
 
G
I
 
I
S
 
S
T
 
T
Q
 
A
K
 
R
L
 
I
H
 
H
A
 
A
R
 
R
G
 
G
P
 
P
M
 
V
G
 
G
L
 
V
E
 
E
E
 
G
L
 
L
C
 
L
T
 
T
Y
 
T
K
 
K
Y
 
W
I
 
I
I
 
L
R
 
E
G
 
G
E
 
Q

7wxgA Gpr domain closed form of drosophila p5cs filament with glutamate, atp, and NADPH (see paper)
33% identity, 97% coverage: 9:414/418 of query aligns to 8:407/430 of 7wxgA

query
sites
7wxgA
Q
 
N
A
 
A
V
 
R
T
 
T
A
 
G
K
 
S
N
 
R
A
 
Q
I
 
M
N
 
Q
S
 
A
A
 
L
D
 
T
T
 
P
E
 
A
T
 
Q
K
 
R
N
 
A
K
 
S
A
 
A
L
 
V
A
 
N
N
 
T
M
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
L
L
 
L
L
 
V
A
 
S
H
 
R
T
 
E
D
 
K
A
 
F
I
 
I
L
 
L
E
 
D
A
 
A
N
 
N
K
 
A
Q
 
K
D
 
D
V
 
L
-
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
Q
R
 
K
G
 
S
K
 
G
I
 
L
S
 
A
D
 
K
V
 
P
M
 
L
I
 
L
D
 
S
R
 
R
L
 
L
M
 
S
L
 
L
D
 
N
A
 
P
G
 
A
R
 
K
I
 
L
E
 
K
G
 
N
M
 
L
A
 
S
K
 
V
G
 
G
I
 
L
R
 
K
E
 
Q
L
 
I
I
 
A
-
 
E
D
 
D
L
 
S
D
 
H
D
 
K
P
 
N
A
 
V
G
 
G
K
 
R
V
 
V
L
 
L
R
 
R
T
 
R
V
 
T
E
 
R
R
 
L
P
 
A
N
 
D
G
 
Q
I
 
L
V
 
E
I
 
L
E
 
K
K
 
Q
T
 
V
A
 
T
V
 
V
P
 
P
M
 
I
G
 
G
V
 
V
I
 
L
A
 
L
I
 
V
I
 
I
Y
 
F
E
|
E
S
 
S
R
 
R
P
 
P
N
 
D
V
 
S
T
 
L
S
 
P
D
 
Q
A
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
L
C
 
A
I
 
M
K
 
A
S
 
S
G
 
A
N
 
N
V
 
G
C
 
L
V
 
L
L
 
L
R
 
K
S
 
G
G
 
G
K
 
K
E
 
E
A
 
A
W
 
A
K
 
H
S
 
S
A
 
N
N
 
K
A
 
A
V
 
L
V
 
M
T
 
E
A
 
L
L
 
V
K
 
K
E
 
E
G
 
A
M
 
L
V
 
A
K
 
T
S
 
V
N
 
G
L
 
A
P
 
E
G
 
-
E
 
H
G
 
A
I
 
V
Q
 
S
L
 
L
I
 
V
E
 
-
D
 
-
T
 
S
S
 
T
R
|
R
E
 
E
S
 
E
S
 
I
V
 
S
E
 
D
L
 
L
M
 
L
K
 
S
A
 
M
V
 
E
G
 
N
Y
 
H
V
 
I
D
 
D
L
 
L
L
 
I
I
 
I
P
 
P
R
 
R
G
|
G
G
x
S
P
x
S
G
 
D
L
|
L
I
 
V
R
 
R
S
 
S
C
 
I
V
 
Q
E
 
Q
N
 
Q
A
 
S
-
 
L
K
 
H
V
 
I
P
 
P
C
 
V
I
 
L
Q
 
G
T
 
H
G
 
A
T
 
E
G
|
G
I
 
V
C
 
C
H
 
H
V
 
V
Y
 
Y
V
 
I
D
 
D
E
 
R
S
 
D
A
 
A
S
 
D
F
 
L
E
 
E
K
 
K
A
 
A
L
 
L
Q
 
R
I
 
I
I
 
A
E
 
R
N
 
D
A
 
A
K
 
K
T
 
C
S
 
D
R
 
Y
P
 
P
S
 
A
V
 
A
C
 
C
N
 
N
A
 
A
E
 
M
E
 
E
V
 
T
L
 
L
L
 
L
V
 
I
H
 
H
S
 
E
A
 
D
V
 
L
A
 
M
E
 
S
K
 
G
F
 
-
L
 
-
P
 
-
L
 
A
L
 
I
Q
 
F
K
 
G
K
 
D
L
 
V
V
 
C
E
 
N
E
 
M
R
 
L
K
 
K
E
 
R
K
 
E
G
 
G
E
 
-
I
 
-
P
 
-
V
 
V
E
 
K
L
 
I
R
 
Y
L
 
A
C
 
G
D
 
P
R
 
R
A
 
L
A
 
N
K
 
Q
I
 
Q
I
 
L
S
 
T
G
 
F
T
 
G
P
 
P
A
 
P
G
 
A
A
 
A
D
 
K
D
 
S
F
 
L
D
 
K
T
 
H
E
|
E
F
 
Y
L
 
G
D
 
A
Y
 
L
I
 
E
L
 
C
A
 
C
V
 
I
K
 
E
I
 
V
V
 
V
D
 
P
S
 
S
V
 
L
E
 
D
E
 
E
A
 
A
V
 
I
E
 
N
H
 
H
I
 
I
S
 
H
K
 
T
H
 
Y
S
 
G
T
 
S
G
 
S
H
 
H
S
 
T
E
 
D
A
 
V
I
 
I
I
 
V
T
 
T
E
 
E
S
 
N
K
 
D
E
 
A
A
 
A
A
 
A
D
 
R
Y
 
Q
F
 
F
T
 
L
M
 
G
R
 
S
V
 
V
D
 
D
S
 
S
A
 
A
A
 
C
V
 
V
Y
 
F
V
 
H
N
 
N
V
 
A
S
 
S
T
 
S
R
 
R
F
 
F
T
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
F
E
 
R
F
 
F
G
 
G
L
 
L
G
 
G
C
 
A
E
 
E
M
 
V
G
 
G
I
 
I
S
 
S
T
 
T
Q
 
A
K
 
R
L
 
I
H
 
H
A
 
A
R
 
R
G
 
G
P
 
P
M
 
V
G
 
G
L
 
V
E
 
E
E
 
G
L
 
L
C
 
L
T
 
T
Y
 
T
K
 
K
Y
 
W
I
 
I
I
 
L
R
 
E
G
 
G
E
 
Q

4jbeB 1.95 angstrom crystal structure of gamma-glutamyl phosphate reductase from saccharomonospora viridis.
31% identity, 96% coverage: 10:411/418 of query aligns to 15:407/412 of 4jbeB

query
sites
4jbeB
A
 
A
V
 
K
T
 
S
A
 
A
K
 
A
N
 
P
A
 
S
I
 
L
N
 
S
S
 
G
A
 
A
D
 
P
T
 
D
E
 
T
T
 
A
K
 
I
N
 
D
K
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
E
N
 
S
M
 
M
A
 
A
D
 
D
A
 
R
L
 
L
L
 
L
A
 
A
H
 
H
T
 
R
D
 
D
A
 
A
I
 
V
L
 
L
E
 
A
A
 
A
N
 
N
K
 
A
Q
 
E
D
 
D
V
 
I
-
 
A
E
 
K
A
 
A
A
 
E
R
 
A
G
 
G
K
 
G
I
 
M
S
 
S
D
 
A
V
 
G
M
 
L
I
 
L
D
 
D
R
 
R
L
 
L
M
 
T
L
 
I
D
 
T
A
 
E
G
 
S
R
 
R
I
 
L
E
 
T
G
 
D
M
 
M
A
 
A
K
 
D
G
 
Q
I
 
L
R
 
R
E
 
L
L
 
L
I
 
A
D
 
G
L
 
A
D
 
P
D
 
H
P
 
P
A
 
Q
G
 
R
K
 
T
V
 
V
-
 
E
L
 
L
R
 
S
T
 
T
V
 
L
E
 
D
R
 
-
P
 
-
N
 
G
G
 
G
I
 
L
V
 
R
I
 
L
E
 
V
K
 
E
T
 
R
A
 
R
V
 
R
P
 
P
M
 
V
G
 
G
V
 
V
I
 
I
A
 
G
I
 
A
I
 
N
Y
 
Y
E
 
E
S
 
A
R
 
R
P
 
P
N
 
N
V
 
V
T
 
T
S
 
V
D
 
D
A
 
V
A
 
A
A
 
S
L
 
Q
C
 
L
I
 
V
K
 
K
S
 
S
G
 
R
N
 
N
V
 
A
C
 
G
V
 
V
L
 
L
R
 
R
S
 
T
G
 
G
K
 
S
E
 
A
A
 
A
W
 
L
K
 
K
S
 
S
A
 
A
N
 
Q
A
 
R
V
 
L
V
 
L
-
 
E
T
 
V
A
 
V
L
 
I
K
 
R
E
 
P
G
 
A
M
 
L
V
 
T
K
 
D
S
 
S
N
 
G
L
 
I
P
 
D
G
 
A
E
 
N
G
 
V
I
 
V
Q
 
Q
L
 
L
I
 
V
E
 
P
D
 
R
T
 
P
S
 
E
R
 
R
E
 
E
S
 
A
S
 
A
V
 
G
E
 
A
L
 
L
M
 
V
K
 
R
A
 
L
V
 
P
G
 
D
Y
 
L
V
 
V
D
 
P
L
 
L
L
 
V
I
 
I
P
 
L
R
 
R
G
 
G
G
 
S
P
 
G
G
 
E
L
 
S
I
 
T
R
 
R
S
 
A
C
 
L
V
 
A
E
 
L
N
 
E
A
 
A
K
 
A
V
 
Q
P
 
H
C
 
G
I
 
V
Q
 
R
T
 
T
-
 
L
-
 
A
-
 
H
-
 
A
-
 
D
G
 
G
T
 
G
G
 
G
I
 
V
C
 
-
H
 
-
V
 
L
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
E
 
E
S
 
K
A
 
A
S
x
D
F
 
R
E
x
D
K
 
T
A
 
V
L
 
R
Q
 
S
I
 
L
I
 
V
E
 
V
N
 
N
A
 
S
K
 
-
T
 
L
S
 
D
R
 
R
P
 
L
S
 
G
V
 
V
C
 
C
N
 
N
A
 
R
E
 
L
E
 
N
V
 
L
L
 
L
L
 
L
V
 
I
H
 
H
S
 
D
A
|
A
V
 
V
A
 
Y
E
 
E
K
x
E
F
 
F
L
 
W
P
 
P
L
 
V
L
 
V
Q
 
S
K
x
E
K
 
A
L
 
L
V
 
A
E
|
E
E
 
R
R
 
G
K
 
V
E
 
S
K
 
P
G
 
S
E
 
L
I
 
P
P
 
P
V
 
Y
E
 
D
L
 
-
R
 
-
L
 
-
C
 
-
D
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
-
K
 
-
I
 
-
I
 
-
S
 
-
G
 
-
T
 
H
P
 
P
A
 
I
G
 
G
A
 
Y
D
 
E
-
 
W
D
 
A
F
 
L
D
 
D
T
 
S
E
 
E
F
 
R
L
 
-
D
 
E
Y
 
A
I
 
T
L
 
V
A
 
T
V
 
V
K
 
A
I
 
R
V
 
V
D
 
D
S
 
G
V
 
V
E
 
A
E
 
E
A
 
A
V
 
V
E
 
R
H
 
I
I
 
A
S
 
N
K
 
E
H
 
E
S
 
T
T
 
S
G
 
G
H
 
L
S
 
A
E
 
A
A
 
G
I
 
I
I
 
A
T
 
T
E
 
E
S
 
D
K
 
A
E
 
R
A
 
A
A
 
A
D
 
E
Y
 
E
F
 
F
T
 
F
M
 
D
R
 
G
V
 
Y
D
 
Q
S
 
G
A
 
T
A
 
G
V
 
V
Y
 
F
V
 
W
N
 
N
V
 
A
S
 
P
T
 
T
R
 
R
F
 
L
T
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
F
E
 
K
F
 
L
G
 
L
L
 
G
G
 
V
C
 
P
E
 
E
M
 
T
G
 
G
I
 
I
S
 
N
T
 
L
Q
 
D
K
 
K
L
 
V
H
 
P
A
 
G
-
 
P
R
 
R
G
 
G
P
 
P
M
 
V
G
 
T
L
 
Y
E
 
P
E
 
D
L
 
L
C
 
Y
T
 
V
Y
 
R
K
 
Q
Y
 
Y
I
 
A
I
 
V

5j7iB Crystal structure of a geobacillus thermoglucosidasius acetylating aldehyde dehydrogenase in complex with adp (see paper)
26% identity, 78% coverage: 57:384/418 of query aligns to 39:422/456 of 5j7iB

query
sites
5j7iB
K
 
K
I
 
I
S
 
V
D
 
E
V
 
S
M
 
M
I
 
A
D
 
N
R
 
A
L
 
A
M
 
R
L
 
E
D
 
E
A
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
L
E
 
A
G
 
A
M
 
M
A
 
A
-
 
V
-
 
E
-
 
E
-
 
T
-
 
G
-
 
F
-
 
G
-
 
N
-
 
V
-
 
E
-
 
D
K
 
K
G
 
T
I
 
L
R
 
K
E
 
N
L
 
L
I
 
F
D
 
A
L
 
A
D
 
N
D
 
D
P
 
V
A
 
Y
G
 
N
-
 
S
-
 
I
-
 
K
-
 
D
-
 
V
K
 
K
V
 
T
L
 
V
R
 
G
T
 
I
V
 
I
E
 
R
R
 
R
P
 
D
N
 
E
G
 
E
I
 
N
V
 
R
I
 
V
E
 
W
K
 
E
T
 
I
A
 
A
V
 
Q
P
 
P
M
 
V
G
 
G
V
 
I
I
 
V
A
 
A
-
 
G
I
 
I
I
 
I
Y
 
P
E
 
S
S
 
T
R
 
N
P
 
P
N
 
T
V
 
S
T
 
T
S
 
V
D
 
I
A
 
F
A
 
K
A
 
A
L
 
L
-
 
I
C
 
A
I
 
V
K
 
K
S
 
A
G
 
R
N
 
N
V
 
A
C
 
I
V
 
V
L
 
F
R
 
S
S
 
P
G
 
H
K
 
P
E
 
S
A
 
A
W
 
A
K
 
K
S
 
C
A
 
T
N
 
A
A
 
E
V
 
A
V
 
A
T
 
R
A
 
I
L
 
M
K
 
Q
E
 
E
G
 
A
M
 
A
V
 
E
K
 
R
S
 
A
N
 
G
L
 
A
P
 
P
G
 
K
E
 
G
G
 
L
I
 
I
Q
 
S
L
 
C
I
 
I
E
 
T
D
 
Q
T
 
P
S
 
T
R
 
M
E
 
A
S
 
A
S
 
T
V
 
N
E
 
E
L
 
L
M
 
M
K
 
K
A
 
H
V
 
-
G
 
K
Y
 
L
V
 
T
D
 
D
L
 
V
L
 
I
I
 
L
P
 
A
R
 
T
G
 
G
G
 
G
P
 
P
G
 
G
L
|
L
I
 
V
R
 
K
S
 
A
C
 
A
V
 
Y
E
 
S
N
 
S
A
 
G
K
 
K
V
 
-
P
 
P
C
 
A
I
 
Y
Q
 
G
T
 
V
G
 
G
T
 
P
G
 
G
I
 
N
C
 
V
H
 
P
V
 
V
Y
 
Y
V
 
I
D
 
H
E
 
E
S
 
S
A
 
A
S
 
N
F
 
I
E
 
A
K
 
K
A
 
A
L
 
V
Q
 
Q
I
 
L
I
 
I
E
 
I
N
 
Q
A
 
S
K
 
K
T
 
T
-
 
F
S
 
D
R
 
Y
P
 
G
S
 
T
V
 
I
C
 
C
N
 
A
A
 
S
E
 
E
E
 
Q
V
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
V
H
 
D
S
 
E
A
 
S
V
 
I
A
 
K
E
 
E
K
 
K
F
 
V
L
 
V
P
 
A
L
 
E
L
 
L
Q
 
K
K
 
Q
K
 
Q
-
 
G
-
 
A
-
 
Y
-
 
F
L
 
L
V
 
N
E
 
E
E
 
E
R
 
E
K
 
K
E
 
Q
K
 
K
G
 
V
-
 
A
-
 
S
-
 
I
-
 
I
-
 
M
-
 
V
-
 
N
-
 
G
-
 
S
-
 
L
-
 
N
-
x
A
-
 
K
-
 
I
-
 
V
-
 
G
-
 
K
-
 
A
-
 
P
-
 
Q
-
 
V
-
 
I
-
 
A
-
 
E
-
 
M
-
 
A
-
 
G
-
 
I
E
 
E
I
 
I
P
 
P
V
 
S
E
 
D
L
 
V
R
 
K
L
 
L
C
 
L
D
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
-
K
 
-
I
 
V
I
 
A
S
 
E
G
 
E
T
 
T
P
 
E
A
 
V
G
 
G
A
 
K
D
 
E
-
 
Y
D
 
P
F
 
F
D
 
S
T
 
I
E
 
E
F
 
K
L
 
L
D
 
S
Y
 
P
I
 
I
L
 
L
A
 
A
V
 
F
K
 
Y
I
 
I
V
 
V
D
 
K
S
 
G
V
 
M
E
 
E
E
 
E
A
 
A
V
 
S
E
 
E
H
 
L
I
 
A
S
 
Q
K
 
K
-
 
L
-
 
L
-
 
E
-
 
V
H
 
G
S
 
G
T
 
L
G
 
G
H
 
H
S
 
T
E
 
V
A
 
G
I
 
I
I
 
H
T
 
A
E
 
E
S
 
D
K
 
E
E
 
K
A
 
V
A
 
I
D
 
E
Y
 
A
F
 
Y
T
 
T
M
 
I
R
 
D
V
 
K
D
 
P
S
 
A
A
 
G
A
 
R
V
 
I
Y
 
V
V
 
V
N
 
N
V
 
A
S
 
G
T
 
T
R
 
T
F
 
F
T
 
G
D
 
G
G
 
I
G
 
G
-
 
A
-
 
T
-
 
V
-
 
N
-
 
V
-
 
K
-
 
P
E
 
S
F
 
L
G
 
T
L
 
L
G
 
G
C
 
C

5j7iC Crystal structure of a geobacillus thermoglucosidasius acetylating aldehyde dehydrogenase in complex with adp (see paper)
26% identity, 78% coverage: 57:384/418 of query aligns to 38:421/455 of 5j7iC

query
sites
5j7iC
K
 
K
I
 
I
S
 
V
D
 
E
V
 
S
M
 
M
I
 
A
D
 
N
R
 
A
L
 
A
M
 
R
L
 
E
D
 
E
A
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
L
E
 
A
G
 
A
M
 
M
A
 
A
-
 
V
-
 
E
-
 
E
-
 
T
-
 
G
-
 
F
-
 
G
-
 
N
-
 
V
-
 
E
-
 
D
K
 
K
G
 
T
I
 
L
R
 
K
E
 
N
L
 
L
I
 
F
D
 
A
L
 
A
D
 
N
D
 
D
P
 
V
A
 
Y
G
 
N
-
 
S
-
 
I
-
 
K
-
 
D
-
 
V
K
 
K
V
 
T
L
 
V
R
 
G
T
 
I
V
 
I
E
 
R
R
 
R
P
 
D
N
 
E
G
 
E
I
 
N
V
 
R
I
 
V
E
 
W
K
 
E
T
 
I
A
 
A
V
 
Q
P
 
P
M
 
V
G
 
G
V
 
I
I
 
V
A
 
A
-
 
G
I
 
I
I
 
I
Y
 
P
E
 
S
S
 
T
R
 
N
P
 
P
N
 
T
V
 
S
T
 
T
S
 
V
D
 
I
A
 
F
A
 
K
A
 
A
L
 
L
-
 
I
C
 
A
I
 
V
K
 
K
S
 
A
G
 
R
N
 
N
V
 
A
C
 
I
V
 
V
L
 
F
R
 
S
S
 
P
G
x
H
K
x
P
E
 
S
A
 
A
W
 
A
K
 
K
S
 
C
A
 
T
N
 
A
A
 
E
V
 
A
V
 
A
T
 
R
A
 
I
L
 
M
K
 
Q
E
 
E
G
 
A
M
 
A
V
 
E
K
 
R
S
 
A
N
 
G
L
 
A
P
 
P
G
 
K
E
 
G
G
 
L
I
 
I
Q
 
S
L
 
C
I
 
I
E
 
T
D
 
Q
T
 
P
S
 
T
R
 
M
E
 
A
S
 
A
S
 
T
V
 
N
E
 
E
L
 
L
M
 
M
K
 
K
A
 
H
V
 
-
G
 
K
Y
 
L
V
 
T
D
 
D
L
 
V
L
 
I
I
 
L
P
 
A
R
 
T
G
 
G
G
 
G
P
 
P
G
 
G
L
|
L
I
 
V
R
 
K
S
 
A
C
 
A
V
 
Y
E
 
S
N
 
S
A
 
G
K
 
K
V
 
-
P
 
P
C
 
A
I
 
Y
Q
 
G
T
 
V
G
 
G
T
 
P
G
 
G
I
 
N
C
 
V
H
 
P
V
 
V
Y
 
Y
V
 
I
D
 
H
E
 
E
S
 
S
A
 
A
S
 
N
F
 
I
E
 
A
K
 
K
A
 
A
L
 
V
Q
 
Q
I
 
L
I
 
I
E
 
I
N
 
Q
A
 
S
K
 
K
T
 
T
-
 
F
S
 
D
R
 
Y
P
 
G
S
 
T
V
 
I
C
 
C
N
 
A
A
 
S
E
 
E
E
 
Q
V
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
V
H
 
D
S
 
E
A
 
S
V
 
I
A
 
K
E
 
E
K
 
K
F
 
V
L
 
V
P
 
A
L
 
E
L
 
L
Q
 
K
K
 
Q
K
 
Q
-
 
G
-
 
A
-
 
Y
-
 
F
L
 
L
V
 
N
E
 
E
E
 
E
R
 
E
K
 
K
E
 
Q
K
 
K
G
 
V
-
 
A
-
 
S
-
 
I
-
 
I
-
 
M
-
 
V
-
 
N
-
 
G
-
 
S
-
 
L
-
 
N
-
 
A
-
 
K
-
 
I
-
 
V
-
 
G
-
 
K
-
 
A
-
 
P
-
 
Q
-
 
V
-
 
I
-
 
A
-
 
E
-
 
M
-
 
A
-
 
G
-
 
I
E
 
E
I
 
I
P
 
P
V
 
S
E
 
D
L
 
V
R
 
K
L
 
L
C
 
L
D
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
-
K
 
-
I
 
V
I
 
A
S
 
E
G
 
E
T
 
T
P
 
E
A
 
V
G
 
G
A
 
K
D
 
E
-
 
Y
D
 
P
F
 
F
D
 
S
T
 
I
E
 
E
F
 
K
L
 
L
D
 
S
Y
 
P
I
 
I
L
 
L
A
 
A
V
 
F
K
 
Y
I
 
I
V
 
V
D
 
K
S
 
G
V
 
M
E
 
E
E
 
E
A
 
A
V
 
S
E
 
E
H
 
L
I
 
A
S
 
Q
K
 
K
-
 
L
-
 
L
-
 
E
-
 
V
H
 
G
S
 
G
T
 
L
G
 
G
H
 
H
S
 
T
E
 
V
A
 
G
I
 
I
I
 
H
T
 
A
E
 
E
S
 
D
K
 
E
E
 
K
A
 
V
A
 
I
D
 
E
Y
 
A
F
 
Y
T
 
T
M
 
I
R
 
D
V
 
K
D
 
P
S
 
A
A
 
G
A
 
R
V
 
I
Y
 
V
V
 
V
N
 
N
V
 
A
S
 
G
T
 
T
R
 
T
F
 
F
T
 
G
D
 
G
G
 
I
G
 
G
-
 
A
-
 
T
-
 
V
-
 
N
-
 
V
-
 
K
-
 
P
E
 
S
F
 
L
G
 
T
L
 
L
G
 
G
C
 
C

8cekA Succinyl-coa reductase from clostridium kluyveri (sucd) with NADPH (see paper)
25% identity, 51% coverage: 48:260/418 of query aligns to 45:245/449 of 8cekA

query
sites
8cekA
K
 
K
Q
 
E
D
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
E
A
 
T
R
 
E
G
 
M
K
 
G
I
 
V
S
 
Y
D
 
E
V
 
D
M
 
K
I
 
V
D
 
A
R
 
K
L
 
C
M
 
H
L
 
L
D
 
K
A
 
S
G
 
G
R
 
A
I
 
I
E
 
W
G
 
N
M
 
H
A
 
I
K
 
K
G
 
D
I
 
K
R
 
K
E
 
T
L
 
V
I
 
G
D
 
I
L
 
I
D
 
K
D
 
E
P
 
E
A
 
P
G
 
E
K
 
R
V
 
A
L
 
L
R
 
V
T
 
Y
V
 
V
E
 
A
R
 
K
P
 
P
N
 
K
G
 
G
I
 
V
V
 
V
I
 
A
E
 
A
K
 
T
T
 
T
A
x
P
V
x
I
P
 
-
M
 
-
G
 
-
V
 
-
I
 
-
A
 
-
I
 
-
I
 
-
Y
 
-
E
 
-
S
 
T
R
 
N
P
 
P
N
 
V
V
 
V
T
 
T
S
 
P
D
 
M
A
 
C
A
 
N
A
 
A
L
 
M
C
 
A
-
 
A
I
 
I
K
 
K
S
 
G
G
 
R
N
 
N
V
 
T
C
 
I
V
 
I
L
 
V
R
 
A
S
 
P
G
x
H
K
x
P
E
 
K
A
 
A
W
 
K
K
 
K
S
 
V
A
 
S
N
 
A
A
 
H
V
 
T
V
 
V
T
 
E
A
 
L
L
 
M
K
 
N
E
 
A
G
 
E
M
 
L
V
 
K
K
 
K
S
 
L
N
 
G
L
 
A
P
 
P
G
 
E
E
 
N
G
 
I
I
 
I
Q
 
Q
L
 
I
I
 
V
E
 
E
D
 
A
T
 
P
S
 
S
R
 
R
E
 
E
S
 
A
S
 
A
V
 
K
E
 
E
L
 
L
M
 
M
K
 
E
A
 
S
V
 
-
G
 
-
Y
 
-
V
 
A
D
 
D
L
 
V
L
 
V
I
 
I
P
 
A
R
x
T
G
|
G
G
|
G
P
 
A
G
 
G
L
x
R
I
 
V
R
 
K
S
 
A
C
 
A
V
 
Y
E
 
S
N
 
S
A
 
G
K
 
R
V
 
-
P
 
P
C
 
A
I
 
Y
Q
 
G
T
x
V
G
 
G
T
 
P
G
 
G
I
 
N
C
 
S
H
 
Q
V
 
V
Y
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
K
S
 
G
A
 
Y
S
 
D
F
 
Y
E
 
N
K
 
K
A
 
A
L
 
A
Q
 
Q
-
 
D
I
 
I
I
 
I
E
 
T
N
 
G
A
 
R
K
 
K
T
 
Y
S
 
D
R
 
N
P
 
G
S
 
I
V
 
I
C
|
C
N
 
S
A
 
S
E
 
E
E
 
Q
V
 
S
L
 
V
L
 
I

Sites not aligning to the query:

8cejC Succinyl-coa reductase from clostridium kluyveri (sucd) with mesaconyl-c1-coa (see paper)
25% identity, 51% coverage: 48:260/418 of query aligns to 45:245/449 of 8cejC

query
sites
8cejC
K
 
K
Q
 
E
D
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
E
A
 
T
R
 
E
G
 
M
K
 
G
I
 
V
S
 
Y
D
 
E
V
 
D
M
 
K
I
 
V
D
 
A
R
 
K
L
 
C
M
 
H
L
 
L
D
x
K
A
 
S
G
 
G
R
 
A
I
 
I
E
 
W
G
 
N
M
 
H
A
 
I
K
 
K
G
 
D
I
 
K
R
 
K
E
 
T
L
 
V
I
 
G
D
 
I
L
 
I
D
 
K
D
 
E
P
 
E
A
 
P
G
 
E
K
 
R
V
 
A
L
 
L
R
 
V
T
 
Y
V
 
V
E
 
A
R
 
K
P
 
P
N
 
K
G
 
G
I
 
V
V
 
V
I
 
A
E
 
A
K
 
T
T
 
T
A
x
P
V
 
I
P
 
-
M
 
-
G
 
-
V
 
-
I
 
-
A
 
-
I
 
-
I
 
-
Y
 
-
E
 
-
S
x
T
R
x
N
P
 
P
N
 
V
V
 
V
T
 
T
S
 
P
D
 
M
A
 
C
A
 
N
A
 
A
L
 
M
C
 
A
-
 
A
I
 
I
K
 
K
S
 
G
G
 
R
N
 
N
V
 
T
C
 
I
V
 
I
L
 
V
R
x
A
S
x
P
G
x
H
K
x
P
E
 
K
A
 
A
W
 
K
K
 
K
S
 
V
A
 
S
N
 
A
A
 
H
V
 
T
V
 
V
T
 
E
A
 
L
L
 
M
K
 
N
E
 
A
G
 
E
M
 
L
V
 
K
K
 
K
S
 
L
N
 
G
L
 
A
P
 
P
G
 
E
E
 
N
G
 
I
I
 
I
Q
 
Q
L
 
I
I
 
V
E
 
E
D
 
A
T
 
P
S
 
S
R
|
R
E
 
E
S
 
A
S
 
A
V
 
K
E
 
E
L
 
L
M
 
M
K
 
E
A
 
S
V
 
-
G
 
-
Y
 
-
V
 
A
D
 
D
L
 
V
L
 
V
I
 
I
P
 
A
R
 
T
G
 
G
G
 
G
P
 
A
G
|
G
L
x
R
I
 
V
R
 
K
S
 
A
C
 
A
V
 
Y
E
 
S
N
 
S
A
 
G
K
 
R
V
 
-
P
 
P
C
 
A
I
 
Y
Q
 
G
T
 
V
G
 
G
T
 
P
G
 
G
I
 
N
C
 
S
H
 
Q
V
 
V
Y
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
K
S
 
G
A
 
Y
S
 
D
F
 
Y
E
 
N
K
 
K
A
 
A
L
 
A
Q
 
Q
-
 
D
I
 
I
I
 
I
E
 
T
N
 
G
A
 
R
K
 
K
T
 
Y
S
 
D
R
 
N
P
 
G
S
 
I
V
x
I
C
|
C
N
x
S
A
 
S
E
 
E
E
 
Q
V
 
S
L
 
V
L
 
I

Sites not aligning to the query:

8cejA Succinyl-coa reductase from clostridium kluyveri (sucd) with mesaconyl-c1-coa (see paper)
25% identity, 51% coverage: 48:260/418 of query aligns to 45:245/449 of 8cejA

query
sites
8cejA
K
 
K
Q
 
E
D
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
E
A
 
T
R
 
E
G
 
M
K
 
G
I
 
V
S
 
Y
D
 
E
V
 
D
M
 
K
I
 
V
D
 
A
R
 
K
L
 
C
M
 
H
L
 
L
D
x
K
A
 
S
G
 
G
R
 
A
I
 
I
E
 
W
G
 
N
M
 
H
A
 
I
K
 
K
G
 
D
I
 
K
R
 
K
E
 
T
L
 
V
I
 
G
D
 
I
L
 
I
D
 
K
D
 
E
P
 
E
A
 
P
G
 
E
K
 
R
V
 
A
L
 
L
R
 
V
T
 
Y
V
 
V
E
 
A
R
 
K
P
 
P
N
 
K
G
 
G
I
 
V
V
 
V
I
 
A
E
 
A
K
 
T
T
 
T
A
 
P
V
 
I
P
 
-
M
 
-
G
 
-
V
 
-
I
 
-
A
 
-
I
 
-
I
 
-
Y
 
-
E
 
-
S
 
T
R
 
N
P
 
P
N
 
V
V
 
V
T
 
T
S
 
P
D
 
M
A
 
C
A
 
N
A
 
A
L
 
M
C
 
A
-
 
A
I
 
I
K
 
K
S
 
G
G
 
R
N
 
N
V
 
T
C
 
I
V
 
I
L
 
V
R
 
A
S
 
P
G
 
H
K
 
P
E
 
K
A
 
A
W
 
K
K
 
K
S
 
V
A
 
S
N
 
A
A
 
H
V
 
T
V
 
V
T
 
E
A
 
L
L
 
M
K
 
N
E
 
A
G
 
E
M
 
L
V
 
K
K
 
K
S
 
L
N
 
G
L
 
A
P
 
P
G
 
E
E
 
N
G
 
I
I
 
I
Q
 
Q
L
 
I
I
 
V
E
 
E
D
 
A
T
 
P
S
 
S
R
 
R
E
 
E
S
 
A
S
 
A
V
 
K
E
 
E
L
 
L
M
 
M
K
 
E
A
 
S
V
 
-
G
 
-
Y
 
-
V
 
A
D
 
D
L
 
V
L
 
V
I
 
I
P
 
A
R
 
T
G
 
G
G
 
G
P
 
A
G
 
G
L
 
R
I
 
V
R
 
K
S
 
A
C
 
A
V
 
Y
E
 
S
N
 
S
A
 
G
K
 
R
V
 
-
P
 
P
C
 
A
I
 
Y
Q
 
G
T
 
V
G
 
G
T
 
P
G
 
G
I
 
N
C
 
S
H
 
Q
V
 
V
Y
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
K
S
 
G
A
 
Y
S
 
D
F
 
Y
E
 
N
K
 
K
A
 
A
L
 
A
Q
 
Q
-
 
D
I
 
I
I
 
I
E
 
T
N
 
G
A
 
R
K
 
K
T
 
Y
S
 
D
R
 
N
P
 
G
S
 
I
V
 
I
C
|
C
N
x
S
A
 
S
E
 
E
E
 
Q
V
 
S
L
 
V
L
 
I

Sites not aligning to the query:

7bvpA Adhe spirosome in extended conformation (see paper)
26% identity, 36% coverage: 109:257/418 of query aligns to 101:249/869 of 7bvpA

query
sites
7bvpA
A
 
A
V
 
E
P
 
P
M
 
I
G
 
G
V
 
I
I
 
I
-
 
C
A
 
G
I
 
I
I
 
V
Y
x
P
E
x
T
S
 
T
R
 
N
P
 
P
N
 
T
V
 
S
T
 
T
S
 
A
D
 
I
A
 
F
A
 
K
A
 
S
L
 
L
-
 
I
C
 
S
I
 
L
K
 
K
S
 
T
G
 
R
N
 
N
V
 
A
C
 
I
V
 
I
L
 
F
R
 
S
S
 
P
G
x
H
K
 
P
E
 
R
A
 
A
W
 
K
K
 
D
S
 
A
A
 
T
N
 
N
A
 
K
V
 
A
V
 
A
T
 
D
A
 
I
L
 
V
K
 
L
E
 
Q
G
 
A
M
 
A
V
 
I
K
 
A
S
 
A
N
 
G
L
 
A
P
 
P
G
 
K
E
 
D
G
 
L
I
 
I
Q
 
G
L
 
W
I
 
I
E
 
D
D
 
Q
T
 
P
S
 
S
R
 
V
E
 
E
S
 
L
S
 
S
V
 
N
E
 
A
L
 
L
M
 
M
K
 
H
A
 
H
V
 
P
G
 
D
Y
 
-
V
 
I
D
 
N
L
 
L
L
 
I
I
 
L
P
 
A
R
 
T
G
|
G
G
|
G
P
 
P
G
 
G
L
x
M
I
 
V
R
 
K
S
 
A
C
 
A
V
 
Y
E
 
S
N
 
S
A
 
G
K
 
K
V
 
-
P
 
P
C
 
A
I
 
I
Q
 
G
T
x
V
G
|
G
T
x
A
G
 
G
I
 
N
C
 
T
H
 
P
V
 
V
Y
 
V
V
 
I
D
 
D
E
 
E
S
 
T
A
 
A
S
 
D
F
 
I
E
 
K
K
 
R
A
 
A
L
 
V
Q
 
A
I
 
S
I
 
V
E
 
L
N
 
M
A
 
S
K
 
K
T
 
T
S
 
F
R
 
D
P
 
N
S
 
G
V
 
V
C
 
I
N
x
C
A
 
A
E
 
S
E
 
E

Sites not aligning to the query:

6tqmA Escherichia coli adhe structure in its compact conformation (see paper)
26% identity, 36% coverage: 109:257/418 of query aligns to 101:249/869 of 6tqmA

query
sites
6tqmA
A
 
A
V
 
E
P
 
P
M
 
I
G
 
G
V
 
I
I
 
I
-
 
C
A
 
G
I
 
I
I
 
V
Y
 
P
E
 
T
S
 
T
R
 
N
P
 
P
N
 
T
V
 
S
T
 
T
S
 
A
D
 
I
A
 
F
A
 
K
A
 
S
L
 
L
-
 
I
C
 
S
I
 
L
K
 
K
S
 
T
G
 
R
N
 
N
V
 
A
C
 
I
V
 
I
L
 
F
R
 
S
S
 
P
G
 
H
K
 
P
E
 
R
A
 
A
W
 
K
K
 
D
S
 
A
A
 
T
N
 
N
A
 
K
V
 
A
V
 
A
T
 
D
A
 
I
L
 
V
K
 
L
E
 
Q
G
 
A
M
 
A
V
 
I
K
 
A
S
 
A
N
 
G
L
 
A
P
 
P
G
 
K
E
 
D
G
 
L
I
 
I
Q
 
G
L
 
W
I
 
I
E
 
D
D
 
Q
T
 
P
S
 
S
R
 
V
E
 
E
S
 
L
S
 
S
V
 
N
E
 
A
L
 
L
M
 
M
K
 
H
A
 
H
V
 
P
G
 
D
Y
 
-
V
 
I
D
 
N
L
 
L
L
 
I
I
 
L
P
 
A
R
 
T
G
 
G
G
 
G
P
 
P
G
 
G
L
 
M
I
 
V
R
 
K
S
 
A
C
 
A
V
 
Y
E
 
S
N
 
S
A
 
G
K
 
K
V
 
-
P
 
P
C
 
A
I
 
I
Q
 
G
T
 
V
G
 
G
T
 
A
G
 
G
I
 
N
C
 
T
H
 
P
V
 
V
Y
 
V
V
 
I
D
 
D
E
 
E
S
 
T
A
 
A
S
 
D
F
 
I
E
 
K
K
 
R
A
 
A
L
 
V
Q
 
A
I
 
S
I
 
V
E
 
L
N
 
M
A
 
S
K
 
K
T
 
T
S
 
F
R
 
D
P
 
N
S
 
G
V
 
V
C
 
I
N
 
C
A
 
A
E
 
S
E
 
E

Sites not aligning to the query:

P0A9Q7 Bifunctional aldehyde-alcohol dehydrogenase AdhE; Alcohol dehydrogenase E; EC 1.2.1.10; EC 1.1.1.1 from Escherichia coli (strain K12) (see 8 papers)
26% identity, 36% coverage: 109:257/418 of query aligns to 101:249/891 of P0A9Q7

query
sites
P0A9Q7
A
 
A
V
 
E
P
 
P
M
 
I
G
 
G
V
 
I
I
 
I
-
 
C
A
 
G
I
|
I
I
x
V
Y
x
P
E
x
T
S
x
T
R
x
N
P
 
P
N
 
T
V
 
S
T
 
T
S
 
A
D
 
I
A
 
F
A
 
K
A
 
S
L
 
L
-
 
I
C
 
S
I
 
L
K
 
K
S
 
T
G
 
R
N
 
N
V
 
A
C
 
I
V
 
I
L
 
F
R
 
S
S
 
P
G
 
H
K
 
P
E
 
R
A
 
A
W
 
K
K
 
D
S
 
A
A
 
T
N
 
N
A
 
K
V
 
A
V
 
A
T
 
D
A
 
I
L
 
V
K
 
L
E
 
Q
G
 
A
M
 
A
V
 
I
K
 
A
S
 
A
N
 
G
L
 
A
P
 
P
G
 
K
E
 
D
G
 
L
I
 
I
Q
 
G
L
 
W
I
 
I
E
 
D
D
 
Q
T
 
P
S
 
S
R
 
V
E
 
E
S
 
L
S
 
S
V
 
N
E
 
A
L
 
L
M
 
M
K
 
H
A
 
H
V
 
P
G
 
D
Y
 
-
V
 
I
D
 
N
L
 
L
L
 
I
I
 
L
P
 
A
R
 
T
G
 
G
G
|
G
P
 
P
G
 
G
L
 
M
I
 
V
R
 
K
S
 
A
C
 
A
V
 
Y
E
 
S
N
 
S
A
 
G
K
 
K
V
 
-
P
 
P
C
 
A
I
 
I
Q
 
G
T
 
V
G
|
G
T
 
A
G
 
G
I
 
N
C
 
T
H
 
P
V
 
V
Y
 
V
V
 
I
D
 
D
E
 
E
S
 
T
A
 
A
S
 
D
F
 
I
E
 
K
K
 
R
A
 
A
L
 
V
Q
 
A
I
 
S
I
 
V
E
 
L
N
 
M
A
 
S
K
 
K
T
 
T
S
 
F
R
 
D
P
 
N
S
 
G
V
 
V
C
 
I
N
 
C
A
 
A
E
 
S
E
 
E

Sites not aligning to the query:

P0A9Q8 Bifunctional aldehyde-alcohol dehydrogenase AdhE; Alcohol dehydrogenase E; EC 1.2.1.10; EC 1.1.1.1 from Escherichia coli O157:H7 (see paper)
26% identity, 36% coverage: 109:257/418 of query aligns to 101:249/891 of P0A9Q8

query
sites
P0A9Q8
A
 
A
V
 
E
P
 
P
M
 
I
G
 
G
V
 
I
I
 
I
-
 
C
A
 
G
I
 
I
I
 
V
Y
 
P
E
 
T
S
 
T
R
 
N
P
 
P
N
 
T
V
 
S
T
 
T
S
 
A
D
 
I
A
 
F
A
 
K
A
 
S
L
 
L
-
 
I
C
 
S
I
 
L
K
 
K
S
 
T
G
 
R
N
 
N
V
 
A
C
 
I
V
 
I
L
 
F
R
 
S
S
 
P
G
 
H
K
 
P
E
 
R
A
 
A
W
 
K
K
 
D
S
 
A
A
 
T
N
 
N
A
 
K
V
 
A
V
 
A
T
 
D
A
 
I
L
 
V
K
 
L
E
 
Q
G
 
A
M
 
A
V
 
I
K
 
A
S
 
A
N
 
G
L
 
A
P
 
P
G
 
K
E
 
D
G
 
L
I
 
I
Q
 
G
L
 
W
I
 
I
E
 
D
D
 
Q
T
 
P
S
 
S
R
 
V
E
 
E
S
 
L
S
 
S
V
 
N
E
 
A
L
 
L
M
 
M
K
 
H
A
 
H
V
 
P
G
 
D
Y
 
-
V
 
I
D
 
N
L
 
L
L
 
I
I
 
L
P
 
A
R
 
T
G
 
G
G
 
G
P
 
P
G
 
G
L
 
M
I
 
V
R
 
K
S
 
A
C
 
A
V
 
Y
E
 
S
N
 
S
A
 
G
K
 
K
V
 
-
P
 
P
C
 
A
I
 
I
Q
 
G
T
 
V
G
 
G
T
 
A
G
 
G
I
 
N
C
 
T
H
 
P
V
 
V
Y
 
V
V
 
I
D
 
D
E
 
E
S
 
T
A
 
A
S
 
D
F
 
I
E
 
K
K
 
R
A
 
A
L
 
V
Q
 
A
I
 
S
I
 
V
E
 
L
N
 
M
A
 
S
K
 
K
T
 
T
S
 
F
R
 
D
P
 
N
S
 
G
V
 
V
C
 
I
N
 
C
A
 
A
E
 
S
E
 
E

Sites not aligning to the query:

6gvsA Engineered glycolyl-coa reductase comprising 8 mutations with bound NADP+ (see paper)
25% identity, 44% coverage: 101:283/418 of query aligns to 95:277/441 of 6gvsA

query
sites
6gvsA
N
 
N
G
 
G
I
 
L
V
 
T
I
 
L
E
 
V
K
 
E
T
 
Y
A
 
S
V
 
-
P
 
P
M
 
F
G
 
G
V
 
V
I
 
I
A
 
G
I
 
A
I
 
I
Y
 
-
E
 
-
S
 
-
R
 
T
P
|
P
N
x
T
V
 
T
T
 
N
S
 
P
D
 
T
A
 
E
A
 
T
A
 
I
L
 
V
C
 
C
-
 
N
-
 
S
-
 
I
-
 
G
-
 
M
I
 
L
K
 
A
S
 
A
G
 
G
N
 
N
V
 
S
C
 
V
V
 
V
L
 
F
R
 
S
S
 
P
G
x
H
K
 
G
E
 
R
A
 
A
W
 
R
K
 
Q
S
 
V
A
 
S
N
 
L
A
 
L
V
 
L
V
 
V
T
 
R
A
 
L
L
 
I
K
 
N
E
 
Q
G
 
K
M
 
L
V
 
A
K
 
A
S
 
L
N
 
G
L
 
A
P
 
P
G
 
E
E
 
N
G
 
L
I
 
V
Q
 
V
L
 
T
I
 
V
E
 
E
D
 
K
T
 
P
S
 
S
R
|
R
E
 
E
S
 
N
S
 
T
V
 
L
E
 
A
L
 
M
M
 
M
K
 
-
A
 
A
V
 
H
G
 
P
Y
 
K
V
 
V
D
 
R
L
 
M
L
 
L
I
 
V
P
 
A
R
x
T
G
|
G
G
|
G
P
 
P
G
 
A
L
|
L
I
 
V
R
 
K
S
 
A
C
 
V
V
 
L
E
 
S
N
 
T
A
 
G
K
 
K
V
 
-
P
 
K
C
 
A
I
 
I
Q
 
G
T
x
A
G
|
G
T
x
A
G
 
G
I
 
N
C
 
P
H
 
P
V
 
V
Y
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
E
S
 
T
A
 
A
S
 
N
F
 
I
E
 
E
K
 
K
-
 
A
A
 
A
L
 
C
Q
 
D
I
 
I
I
 
V
E
 
N
N
 
G
A
 
C
K
 
S
T
 
F
S
 
D
R
 
N
P
 
N
S
 
I
V
 
T
C
|
C
N
 
T
A
 
A
E
 
E
E
 
K
V
 
E
L
 
I
L
 
I
V
 
A
H
 
V
S
 
A
A
 
Q
V
 
I
A
 
A
E
 
D
K
 
Y
F
 
L
L
 
I
P
 
F
L
 
N
L
 
L
Q
 
K
K
 
K
K
 
N
L
 
G
V
 
A
E
 
Y
E
 
E
R
 
I
K
 
K
E
 
D

Sites not aligning to the query:

4c3sA Structure of a propionaldehyde dehydrogenase from the clostridium phytofermentans fucose utilisation bacterial microcompartment (see paper)
25% identity, 42% coverage: 108:284/418 of query aligns to 93:278/435 of 4c3sA

query
sites
4c3sA
T
 
T
A
 
L
V
 
V
P
 
E
M
 
M
G
 
G
V
 
P
I
 
F
A
 
G
I
 
V
I
 
I
Y
 
G
E
 
A
S
x
I
R
x
T
P
|
P
N
x
C
V
x
T
T
 
N
S
 
P
D
 
S
A
 
E
A
 
T
A
 
I
L
 
I
C
 
C
-
 
N
-
 
T
-
 
I
-
 
G
-
 
M
I
 
L
K
 
A
S
 
G
G
 
G
N
 
N
V
 
T
C
 
V
V
 
V
L
 
F
R
 
N
S
 
P
G
x
H
K
 
P
E
 
A
A
 
A
W
 
I
K
 
K
S
 
T
A
 
S
N
 
N
A
 
F
V
 
A
V
 
V
T
 
Q
A
 
L
L
 
I
K
 
N
E
 
E
G
 
A
M
 
S
V
 
L
K
 
S
S
 
A
N
 
G
L
 
G
P
 
P
G
 
V
E
 
N
G
 
I
I
 
A
Q
 
C
L
 
S
I
 
V
E
 
R
D
 
K
T
 
P
S
 
T
R
x
L
E
 
D
S
 
S
S
 
S
V
 
-
E
 
K
L
 
I
M
 
M
K
 
M
A
 
S
V
 
H
G
 
Q
Y
 
D
V
 
I
D
 
P
L
 
L
L
 
I
I
 
A
P
 
A
R
x
T
G
|
G
G
|
G
P
 
P
G
 
G
L
x
V
I
 
V
R
 
T
S
 
A
C
 
V
V
 
L
E
 
Q
N
 
S
A
 
G
K
 
K
V
 
R
P
 
G
C
 
-
I
 
I
Q
 
G
T
x
A
G
|
G
T
 
A
G
 
G
I
 
N
C
 
P
H
 
P
V
 
V
Y
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
E
S
 
T
A
 
A
S
 
D
F
 
I
E
 
R
K
 
K
A
 
A
L
 
A
Q
 
E
I
 
D
I
 
I
E
 
I
N
 
N
A
 
G
K
 
C
T
 
T
S
 
F
R
 
D
P
 
N
S
 
N
V
 
L
-
 
P
C
|
C
N
 
I
A
 
A
E
 
E
E
 
K
V
 
E
L
 
V
L
 
V
V
 
A
H
 
I
S
 
D
A
 
A
V
 
I
A
 
A
E
 
N
K
 
E
F
 
L
L
 
M
P
 
N
L
 
Y
L
 
M
Q
 
V
K
 
K
K
 
E
-
 
Q
-
 
G
-
 
C
-
 
Y
-
 
A
L
 
I
V
 
T
E
 
K
E
 
E
R
 
Q
K
 
Q
E
 
E
K
 
K

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_005346465.1 NCBI__GCF_000173975.1:WP_005346465.1
MTTKEILTQAVTAKNAINSADTETKNKALANMADALLAHTDAILEANKQDVEAARGKISD
VMIDRLMLDAGRIEGMAKGIRELIDLDDPAGKVLRTVERPNGIVIEKTAVPMGVIAIIYE
SRPNVTSDAAALCIKSGNVCVLRSGKEAWKSANAVVTALKEGMVKSNLPGEGIQLIEDTS
RESSVELMKAVGYVDLLIPRGGPGLIRSCVENAKVPCIQTGTGICHVYVDESASFEKALQ
IIENAKTSRPSVCNAEEVLLVHSAVAEKFLPLLQKKLVEERKEKGEIPVELRLCDRAAKI
ISGTPAGADDFDTEFLDYILAVKIVDSVEEAVEHISKHSTGHSEAIITESKEAADYFTMR
VDSAAVYVNVSTRFTDGGEFGLGCEMGISTQKLHARGPMGLEELCTYKYIIRGEGQIR

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory