SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_005346648.1 NCBI__GCF_000173975.1:WP_005346648.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

8g3hA Structure of cobalamin-dependent methionine synthase (meth) in a resting state (see paper)
33% identity, 99% coverage: 10:820/823 of query aligns to 9:832/841 of 8g3hA

query
sites
8g3hA
I
 
L
Q
 
S
Q
 
Q
K
 
R
P
 
V
V
 
L
I
 
V
L
 
F
D
 
D
G
 
G
A
 
A
T
 
M
G
 
G
S
 
T
N
 
E
L
 
L
Q
 
Q
K
 
K
V
 
R
G
 
D
M
 
L
K
 
T
P
 
P
G
 
E
V
 
D
-
 
Y
-
 
G
-
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
Y
-
 
Y
-
 
G
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
 
V
W
 
L
I
 
N
L
 
R
E
 
T
N
 
R
E
 
P
D
 
D
K
 
V
L
 
V
I
 
R
D
 
E
L
 
I
Q
 
H
K
 
L
S
 
S
F
 
Y
V
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
T
 
A
N
 
E
I
 
V
L
 
I
Y
 
E
A
 
T
P
 
N
T
 
S
F
 
F
S
 
G
G
 
A
N
 
L
R
 
R
V
 
H
K
 
V
L
 
L
E
 
A
E
 
E
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
G
D
 
E
R
 
E
A
 
A
E
 
E
E
 
E
I
 
L
N
 
A
K
 
Y
R
 
R
L
 
A
V
 
A
G
 
R
L
 
I
S
 
A
K
 
K
R
 
E
A
 
A
A
 
A
G
 
E
D
 
P
K
 
Y
-
 
G
A
 
A
L
 
F
V
 
V
A
 
A
G
 
G
D
 
A
M
 
L
T
 
G
M
 
-
T
 
P
G
 
G
V
 
T
A
 
K
L
 
L
E
 
V
P
 
S
V
 
L
G
 
G
P
 
Q
M
 
I
K
 
S
L
 
W
E
 
E
A
 
E
L
 
L
I
 
F
N
 
S
I
 
A
Y
 
Y
K
 
K
E
 
E
Q
 
A
A
 
V
K
 
R
Y
 
G
L
 
L
L
 
V
E
 
R
A
 
G
G
 
G
V
 
V
D
 
D
L
 
L
F
 
I
V
 
L
V
 
L
E
 
E
T
 
T
M
 
A
M
 
Q
S
 
D
L
 
I
A
 
L
E
 
Q
T
 
V
R
 
R
A
 
C
A
 
A
V
 
V
I
 
L
A
 
A
I
 
A
K
 
R
E
 
E
V
 
A
-
 
M
-
 
A
-
 
E
-
 
L
-
 
G
C
 
V
N
 
E
L
 
L
P
 
P
V
 
L
I
 
Q
A
 
V
S
 
Q
L
 
V
T
 
T
F
 
F
Q
 
E
E
 
A
D
 
T
G
 
G
R
 
T
T
 
M
L
 
L
Y
 
V
G
 
G
T
 
T
D
 
D
P
 
E
V
 
Q
T
 
A
A
 
A
V
 
L
V
 
A
V
 
A
L
 
L
Q
 
E
S
 
S
I
 
L
G
 
P
A
 
I
D
 
D
I
 
V
I
 
V
G
 
G
V
 
M
N
 
N
C
 
C
S
 
A
T
 
T
G
 
G
P
 
P
G
 
D
E
 
L
M
 
M
I
 
D
P
 
A
V
 
K
I
 
I
K
 
R
K
 
Y
M
 
F
K
 
A
E
 
Q
Y
 
E
A
 
S
E
 
T
V
 
R
P
 
F
I
 
V
L
 
A
A
 
C
K
 
L
P
 
P
N
 
N
A
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
V
 
R
L
 
N
E
 
E
D
 
G
G
 
G
V
 
R
T
 
V
V
 
V
Y
 
Y
P
 
D
M
 
L
T
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
E
F
 
L
A
 
A
S
 
R
W
 
W
G
 
H
P
 
L
A
 
K
F
 
F
I
 
V
-
 
T
E
 
E
A
 
Y
G
 
G
A
 
V
G
 
N
L
 
A
I
 
V
G
 
G
G
 
G
C
 
C
C
 
C
G
 
G
S
 
T
T
 
G
P
 
P
E
 
E
H
 
H
I
 
I
R
 
R
M
 
K
L
 
V
T
 
A
E
 
E
K
 
A
V
 
V
S
 
G
G
 
G
L
 
R
T
 
P
T
 
S
K
 
P
A
 
V
P
 
H
C
 
K
N
 
T
I
 
A
H
 
F
P
 
P
I
 
P
M
 
Q
L
 
V
A
 
A
S
 
S
E
 
L
R
 
Y
K
 
Q
S
 
A
Q
 
V
E
 
P
I
 
L
A
 
R
L
x
Q
D
 
E
G
x
T
K
x
S
F
 
L
L
 
L
V
 
L
I
 
V
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
L
N
 
N
P
 
A
T
 
T
G
 
G
K
 
S
K
 
K
K
 
R
L
 
F
Q
 
R
E
 
E
E
 
L
L
 
L
R
 
F
A
 
A
G
 
G
K
 
D
L
 
L
D
 
E
L
 
G
V
 
I
E
 
L
E
 
A
M
 
L
A
 
A
E
 
Q
Q
 
E
Q
 
Q
E
 
V
E
 
A
M
 
E
G
 
G
A
 
A
H
 
H
I
 
V
L
 
L
D
 
D
I
 
L
N
 
S
M
 
V
G
 
A
T
 
W
N
 
T
G
 
G
I
 
R
D
 
D
E
 
E
K
 
L
E
 
E
M
 
D
M
 
M
L
 
K
K
 
R
A
 
V
I
 
L
S
 
S
K
 
K
V
 
L
T
 
A
M
 
T
V
 
G
S
 
V
S
 
T
L
 
V
P
 
P
L
 
F
C
 
M
I
 
V
D
 
D
T
 
S
S
 
T
Y
 
S
V
 
P
E
 
E
V
 
V
M
 
M
E
 
E
A
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
K
A
 
R
Y
 
L
P
 
P
G
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
I
I
 
L
N
 
N
S
 
S
I
 
A
S
 
N
L
 
L
E
 
E
T
 
D
-
 
G
-
 
L
E
 
E
K
 
K
I
 
F
E
 
D
K
 
R
L
 
V
L
 
A
P
 
S
L
 
L
A
 
A
K
 
K
K
 
A
Y
 
H
G
 
G
A
 
A
M
 
A
F
 
L
I
 
V
L
 
A
L
 
L
P
 
A
L
 
I
S
 
D
D
 
E
E
 
E
G
 
G
L
 
M
P
 
A
K
 
K
S
 
T
L
 
R
A
 
V
E
 
K
K
 
K
K
 
V
E
 
E
I
 
V
I
 
A
N
 
L
T
 
R
I
 
M
L
 
Y
E
 
E
K
 
R
-
 
L
A
 
T
K
 
E
K
 
H
L
 
H
G
 
G
V
 
L
S
 
R
K
 
P
N
 
E
Q
 
D
I
 
L
I
 
L
V
 
F
D
 
D
G
 
L
L
 
L
V
 
T
T
 
F
T
 
P
V
 
I
G
 
T
A
 
Q
-
 
G
-
 
D
-
 
E
-
 
E
N
 
T
K
 
R
N
 
P
A
 
L
A
 
A
L
 
R
E
 
E
T
 
T
L
 
L
E
 
L
T
 
A
I
 
L
R
 
E
Y
 
E
C
 
L
K
 
R
E
 
E
D
 
R
L
 
L
K
 
P
-
 
G
L
 
V
C
 
G
T
 
F
T
 
V
M
 
L
G
 
G
L
 
V
S
 
S
N
 
N
I
 
V
S
 
S
F
 
F
G
 
G
L
 
L
-
 
K
P
 
P
E
 
K
-
 
A
R
 
R
P
 
R
Y
 
V
V
 
L
N
 
N
G
 
S
A
 
V
F
 
F
A
 
L
S
 
D
M
 
E
A
 
A
I
 
R
A
 
K
S
 
K
G
 
G
L
 
L
T
 
T
M
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
V
N
 
D
P
 
A
S
 
G
N
 
K
Q
 
I
L
 
L
L
 
P
M
 
I
-
 
S
-
 
Q
-
 
I
-
 
P
-
 
E
-
 
E
G
 
A
I
 
Y
S
 
A
F
 
L
A
 
A
S
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
I
R
 
Y
N
 
D
-
 
R
K
 
R
E
 
E
G
 
G
S
 
Q
D
 
D
-
 
P
-
 
L
I
 
F
A
 
A
Y
 
F
I
 
I
E
 
R
Q
 
F
I
 
F
Q
 
E
R
 
-
M
 
-
E
 
-
P
 
-
L
 
-
K
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
I
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
-
A
 
-
K
 
-
T
 
-
A
 
-
G
 
-
N
 
-
G
 
-
E
 
-
K
 
-
Q
 
-
P
 
-
N
 
-
E
 
E
K
 
H
N
 
K
A
 
E
A
 
V
V
 
L
G
 
A
E
 
E
A
 
D
D
 
K
G
 
E
N
 
A
I
 
F
K
 
Q
K
 
A
N
 
L
P
 
P
V
 
V
F
 
E
E
 
E
-
 
R
-
 
L
-
 
R
-
 
R
A
 
R
V
 
V
L
 
L
K
 
E
G
 
G
N
 
K
K
 
R
D
 
V
G
 
G
I
 
L
V
 
E
D
 
E
V
 
D
V
 
L
K
 
A
K
 
E
E
 
A
L
 
L
S
 
G
K
 
R
G
 
-
T
 
M
K
 
R
P
 
P
G
 
L
E
 
E
I
 
I
L
 
I
D
 
N
G
 
G
L
 
P
L
 
L
I
 
L
P
 
E
A
 
A
I
 
M
N
 
K
E
 
E
V
 
V
G
 
G
V
 
E
L
 
L
F
|
F
D
 
G
K
 
A
Q
 
G
K
 
K
Y
 
M
F
 
Q
L
 
L
P
 
P
Q
 
F
L
x
V
I
 
L
S
 
Q
S
 
A
A
 
A
N
 
E
T
 
V
M
 
M
E
x
K
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
E
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
P
 
P
L
 
H
L
 
M
K
 
E
E
 
K
G
 
K
G
 
G
I
 
-
Q
 
-
E
 
E
K
 
G
M
 
K
P
 
G
T
 
K
I
 
L
I
 
V
I
 
L
A
 
A
T
 
T
V
 
V
E
 
K
G
|
G
D
 
D
I
x
V
H
|
H
D
|
D
I
|
I
G
|
G
K
 
K
N
 
N
L
 
L
V
|
V
A
 
D
L
 
I
M
 
I
L
 
L
R
 
T
N
 
N
Y
 
N
G
 
G
Y
 
Y
D
 
T
V
 
V
I
 
Y
D
 
N
L
 
L
G
 
G
K
 
I
D
 
K
V
 
V
P
 
P
A
 
I
D
 
E
E
 
E
I
 
M
I
 
L
A
 
K
A
 
A
A
 
V
K
 
D
E
 
E
H
 
V
N
 
K
A
 
P
S
 
H
I
 
A
I
 
L
V
 
G
L
x
M
S
|
S
A
 
G
L
|
L
M
 
L
T
x
V
T
 
K
T
 
S
M
 
T
M
 
Q
R
 
V
M
 
M
K
 
K
D
 
E
T
 
N
I
 
L
A
 
E
L
 
Y
K
 
M
E
 
R
K
 
A
E
 
R
H
 
G
L
 
Y
D
 
T
V
 
L
K
 
P
V
 
V
M
x
I
I
x
L
G
|
G
G
|
G
A
|
A
V
 
A
T
 
L
T
 
T
Q
 
R
S
 
A
F
 
Y
A
 
V
D
 
E
E
 
E
I
 
L
G
 
R
A
 
S
-
 
I
-
 
Y
-
 
P
-
 
E
D
 
V
G
 
Y
Y
|
Y
S
x
A
A
x
E
D
|
D
A
 
A
A
 
F
D
 
E
A
 
G
V
 
L
R
 
A
L
 
L
A
 
M
K
 
E
K
 
E
L
 
L

3bofA Cobalamin-dependent methionine synthase (1-566) from thermotoga maritima complexed with zn2+ and homocysteine (see paper)
37% identity, 67% coverage: 5:553/823 of query aligns to 6:545/560 of 3bofA

query
sites
3bofA
E
 
E
L
 
V
Y
 
S
T
 
K
M
 
L
I
 
L
Q
 
S
Q
 
E
K
 
R
P
 
V
V
 
L
I
 
L
L
 
L
D
 
D
G
 
G
A
 
A
T
 
Y
G
 
G
S
 
T
N
 
E
L
 
F
Q
 
M
K
 
K
V
 
Y
G
 
G
M
 
Y
K
 
D
P
 
D
G
 
-
V
 
-
C
 
L
P
 
P
E
 
E
E
 
E
W
 
L
I
 
N
L
 
I
E
 
K
N
 
A
E
 
P
D
 
D
K
 
V
L
 
V
I
 
L
D
 
K
L
 
V
Q
 
H
K
 
R
S
 
S
F
 
Y
V
 
I
E
 
E
A
 
S
G
 
G
T
 
S
N
 
D
I
 
V
L
 
I
Y
 
L
A
 
T
P
 
N
T
 
T
F
 
F
S
 
G
G
 
A
N
 
T
R
 
R
V
 
M
K
 
K
L
 
L
E
 
R
E
 
K
Y
 
H
G
 
G
L
 
L
A
 
E
D
 
D
R
 
K
A
 
L
E
 
D
E
 
P
I
 
I
N
 
V
K
 
R
R
 
N
L
 
A
V
 
V
G
 
R
L
 
I
S
 
A
K
 
R
R
 
R
A
 
A
A
 
A
G
 
G
D
 
E
K
 
K
A
 
-
L
 
L
V
 
V
A
 
F
G
 
G
D
 
D
M
 
I
T
 
G
M
 
P
T
 
T
G
 
G
V
 
E
A
 
L
L
 
P
E
 
Y
P
 
P
V
 
L
G
 
G
P
 
S
M
 
T
K
 
L
L
 
F
E
 
E
A
 
E
L
 
F
I
 
Y
N
 
E
I
 
N
Y
 
F
K
 
R
E
 
E
Q
 
T
A
 
V
K
 
E
Y
 
I
L
 
M
L
 
V
E
 
E
A
 
E
G
 
G
V
 
V
D
 
D
L
 
G
F
 
I
V
 
I
V
 
F
E
 
E
T
 
T
M
 
F
M
 
S
S
 
D
L
 
I
A
 
L
E
 
E
T
 
L
R
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
L
A
 
A
I
 
A
K
 
R
E
 
E
V
 
V
C
 
S
-
 
R
N
 
D
L
 
V
P
 
F
V
 
L
I
 
I
A
 
A
S
 
H
L
 
M
T
 
T
F
 
F
Q
 
D
E
 
E
D
 
K
G
 
G
R
 
R
T
 
S
L
 
L
Y
 
T
G
 
G
T
 
T
D
 
D
P
 
P
V
 
A
T
 
N
A
 
F
V
 
A
V
 
I
V
 
T
L
 
F
Q
 
D
S
 
E
I
 
L
G
 
D
A
 
I
D
 
D
I
 
A
I
 
L
G
 
G
V
 
I
N
 
N
C
|
C
S
 
S
T
 
L
G
 
G
P
 
P
G
 
E
E
 
E
M
 
I
I
 
L
P
 
P
V
 
I
I
 
F
K
 
Q
K
 
E
M
 
L
K
 
S
E
 
Q
Y
 
Y
A
 
T
E
 
D
V
 
K
P
 
F
I
 
L
L
 
V
A
 
V
K
 
E
P
 
P
N
 
N
A
 
A
G
 
G
L
 
K
P
 
P
V
 
I
L
 
V
E
 
E
D
 
N
G
 
G
V
 
K
T
 
T
V
 
V
Y
 
Y
P
 
P
M
 
L
T
 
K
P
 
P
E
 
H
E
 
D
F
 
F
A
 
A
S
 
V
W
 
H
G
 
I
P
 
D
A
 
S
F
 
Y
I
 
Y
E
 
E
A
 
L
G
 
G
A
 
V
G
 
N
L
 
I
I
 
F
G
 
G
G
 
G
C
|
C
C
 
C
G
 
G
S
 
T
T
 
T
P
 
P
E
 
E
H
 
H
I
 
V
R
 
K
M
 
L
L
 
F
T
 
-
E
 
R
K
 
K
V
 
V
S
 
L
G
 
G
L
 
-
T
 
N
T
 
R
K
 
K
A
 
P
P
 
L
C
 
Q
N
 
R
I
 
K
H
 
K
P
 
K
I
 
R
M
 
I
L
 
F
A
 
A
S
 
V
E
 
S
R
 
S
K
 
P
S
 
S
Q
 
K
E
 
L
I
 
V
A
 
T
L
 
F
D
 
D
G
 
-
K
 
H
F
 
F
L
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
I
N
 
N
P
 
P
T
 
A
G
 
G
K
 
R
K
 
K
K
 
K
L
 
L
Q
 
W
E
 
A
E
 
E
L
 
M
R
 
Q
A
 
K
G
 
G
K
 
N
L
 
E
D
 
E
L
 
I
V
 
V
E
 
I
E
 
K
M
 
E
A
 
A
E
 
K
Q
 
T
Q
 
Q
E
 
V
E
 
E
M
 
K
G
 
G
A
 
A
H
 
E
I
 
V
L
 
L
D
 
D
I
 
V
N
 
N
M
 
F
G
 
G
T
 
I
N
 
E
G
 
S
I
 
Q
D
 
I
E
 
D
K
 
V
E
 
R
M
 
Y
M
 
V
L
 
E
K
 
K
A
 
I
I
 
V
S
 
Q
K
 
T
V
 
L
T
 
P
M
 
Y
V
 
V
S
 
S
S
 
N
L
 
V
P
 
P
L
 
L
C
 
S
I
 
L
D
 
D
T
 
I
S
 
Q
Y
 
N
V
 
V
E
 
D
V
 
L
M
 
T
E
 
E
A
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
R
 
R
A
 
S
L
 
L
I
 
F
N
 
N
S
 
S
I
 
A
S
 
K
L
 
V
E
 
D
T
 
E
E
 
E
K
 
E
I
 
L
E
 
E
K
 
M
L
 
K
L
 
I
P
 
N
L
 
L
A
 
L
K
 
K
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
A
 
G
M
 
T
F
 
L
I
 
I
L
 
V
L
 
L
P
 
-
L
 
L
S
 
M
D
 
G
E
 
K
G
 
D
L
 
V
P
 
P
K
 
K
S
 
S
L
 
F
A
 
E
E
 
E
K
 
R
K
 
K
E
 
E
I
 
Y
I
 
F
N
 
E
T
 
K
I
 
A
L
 
L
E
 
K
K
 
I
A
 
L
K
 
E
K
 
R
L
 
H
G
 
D
V
 
F
S
 
S
K
 
-
N
 
D
Q
 
R
I
 
V
I
 
I
V
 
F
D
 
D
G
 
P
L
 
G
V
 
V
T
 
L
T
 
P
V
 
L
G
 
G
A
 
A
N
 
-
K
 
E
N
 
G
A
 
K
A
 
P
L
 
V
E
 
E
T
 
V
L
 
L
E
 
K
T
 
T
I
 
I
R
 
E
Y
 
F
C
 
I
K
 
S
E
 
S
D
 
K
L
 
-
K
 
G
L
 
F
C
 
N
T
 
T
T
 
T
M
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
S
N
 
N
I
 
L
S
 
S
F
 
F
G
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
D
R
 
R
P
 
S
Y
 
Y
V
 
Y
N
 
N
G
 
T
A
 
A
F
 
F
A
 
L
S
 
V
M
 
L
A
 
G
I
 
I
A
 
S
S
 
K
G
 
G
L
 
L
T
 
S
M
 
S
A
 
A
I
 
I
A
 
M
N
 
N
P
 
P
S
 
L
N
 
D
Q
 
E
L
 
T
L
 
L
M
 
M

1q8jA Cobalamin-dependent methionine synthase (1-566) from thermotoga maritima (cd2+, hcy, methyltetrahydrofolate complex) (see paper)
37% identity, 67% coverage: 5:553/823 of query aligns to 6:545/559 of 1q8jA

query
sites
1q8jA
E
 
E
L
 
V
Y
 
S
T
 
K
M
 
L
I
 
L
Q
 
S
Q
 
E
K
 
R
P
 
V
V
 
L
I
 
L
L
 
L
D
 
D
G
 
G
A
 
A
T
 
Y
G
 
G
S
 
T
N
 
E
L
 
F
Q
 
M
K
 
K
V
 
Y
G
 
G
M
 
Y
K
 
D
P
 
D
G
 
-
V
 
-
C
 
L
P
 
P
E
 
E
E
 
E
W
 
L
I
 
N
L
 
I
E
 
K
N
 
A
E
 
P
D
 
D
K
 
V
L
 
V
I
 
L
D
 
K
L
 
V
Q
 
H
K
 
R
S
 
S
F
 
Y
V
 
I
E
 
E
A
 
S
G
 
G
T
 
S
N
 
D
I
 
V
L
 
I
Y
 
L
A
 
T
P
 
N
T
 
T
F
 
F
S
 
G
G
 
A
N
 
T
R
 
R
V
 
M
K
 
K
L
 
L
E
 
R
E
 
K
Y
 
H
G
 
G
L
 
L
A
 
E
D
 
D
R
 
K
A
 
L
E
 
D
E
 
P
I
 
I
N
 
V
K
 
R
R
 
N
L
 
A
V
 
V
G
 
R
L
 
I
S
 
A
K
 
R
R
 
R
A
 
A
A
 
A
G
 
G
D
 
E
K
 
K
A
 
-
L
 
L
V
 
V
A
 
F
G
 
G
D
 
D
M
 
I
T
 
G
M
 
P
T
 
T
G
 
G
V
 
E
A
 
L
L
 
P
E
 
Y
P
 
P
V
 
L
G
 
G
P
 
S
M
 
T
K
 
L
L
 
F
E
 
E
A
 
E
L
 
F
I
 
Y
N
 
E
I
 
N
Y
 
F
K
 
R
E
 
E
Q
 
T
A
 
V
K
 
E
Y
 
I
L
 
M
L
 
V
E
 
E
A
 
E
G
 
G
V
 
V
D
 
D
L
 
G
F
 
I
V
 
I
V
 
F
E
 
E
T
 
T
M
 
F
M
 
S
S
 
D
L
 
I
A
 
L
E
 
E
T
 
L
R
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
L
A
 
A
I
 
A
K
 
R
E
 
E
V
 
V
C
 
S
-
 
R
N
 
D
L
 
V
P
 
F
V
 
L
I
 
I
A
 
A
S
 
H
L
 
M
T
 
T
F
 
F
Q
 
D
E
 
E
D
 
K
G
 
G
R
 
R
T
 
S
L
 
L
Y
 
T
G
 
G
T
 
T
D
 
D
P
 
P
V
 
A
T
 
N
A
 
F
V
 
A
V
 
I
V
 
T
L
 
F
Q
 
D
S
 
E
I
 
L
G
 
D
A
 
I
D
 
D
I
 
A
I
 
L
G
 
G
V
 
I
N
 
N
C
 
C
S
 
S
T
 
L
G
 
G
P
 
P
G
 
E
E
 
E
M
 
I
I
 
L
P
 
P
V
 
I
I
 
F
K
 
Q
K
 
E
M
 
L
K
 
S
E
 
Q
Y
 
Y
A
 
T
E
 
D
V
 
K
P
 
F
I
 
L
L
 
V
A
 
V
K
 
E
P
 
P
N
 
N
A
 
A
G
 
G
L
 
K
P
 
P
V
 
I
L
 
V
E
 
E
D
 
N
G
 
G
V
 
K
T
 
T
V
 
V
Y
 
Y
P
 
P
M
 
L
T
 
K
P
 
P
E
 
H
E
 
D
F
 
F
A
 
A
S
 
V
W
 
H
G
 
I
P
 
D
A
 
S
F
 
Y
I
 
Y
E
 
E
A
 
L
G
 
G
A
 
V
G
 
N
L
 
I
I
 
F
G
 
G
G
 
G
C
 
C
C
 
C
G
 
G
S
 
T
T
 
T
P
 
P
E
 
E
H
 
H
I
 
V
R
 
K
M
 
L
L
 
F
T
 
-
E
 
R
K
 
K
V
 
V
S
 
L
G
 
G
L
 
-
T
 
N
T
 
R
K
 
K
A
 
P
P
 
L
C
 
Q
N
 
R
I
 
K
H
 
K
P
 
K
I
 
R
M
 
I
L
 
F
A
 
A
S
 
V
E
 
S
R
 
S
K
 
P
S
 
S
Q
 
K
E
 
L
I
 
V
A
 
T
L
 
F
D
 
D
G
 
-
K
 
H
F
 
F
L
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
E
|
E
R
 
R
I
 
I
N
 
N
P
 
P
T
 
A
G
 
G
K
 
R
K
 
K
K
 
K
L
 
L
Q
 
W
E
 
A
E
 
E
L
 
M
R
 
Q
A
 
K
G
 
G
K
 
N
L
 
E
D
 
E
L
 
I
V
 
V
E
 
I
E
 
K
M
 
E
A
 
A
E
 
K
Q
 
T
Q
 
Q
E
 
V
E
 
E
M
 
K
G
 
G
A
 
A
H
 
E
I
 
V
L
 
L
D
 
D
I
 
V
N
 
N
M
 
F
G
 
G
T
 
I
N
 
E
G
 
S
I
 
Q
D
 
I
E
 
D
K
 
V
E
 
R
M
 
Y
M
 
V
L
 
E
K
 
K
A
 
I
I
 
V
S
 
Q
K
 
T
V
 
L
T
 
P
M
 
Y
V
 
V
S
 
S
S
 
N
L
 
V
P
 
P
L
 
L
C
 
S
I
 
L
D
|
D
T
 
I
S
 
Q
Y
 
N
V
 
V
E
 
D
V
 
L
M
 
T
E
 
E
A
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
R
 
R
A
 
S
L
 
L
I
 
F
N
|
N
S
 
S
I
 
A
S
 
K
L
 
V
E
 
D
T
 
E
E
 
E
K
 
E
I
 
L
E
 
E
K
 
M
L
 
K
L
 
I
P
 
N
L
 
L
A
 
L
K
 
K
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
A
 
G
M
 
T
F
 
L
I
 
I
L
 
V
L
 
L
P
 
-
L
 
L
S
 
M
D
 
G
E
 
K
G
 
D
L
 
V
P
 
P
K
 
K
S
 
S
L
 
F
A
 
E
E
 
E
K
 
R
K
 
K
E
 
E
I
 
Y
I
 
F
N
 
E
T
 
K
I
 
A
L
 
L
E
 
K
K
 
I
A
 
L
K
 
E
K
 
R
L
 
H
G
 
D
V
 
F
S
 
S
K
 
-
N
 
D
Q
 
R
I
 
V
I
 
I
V
 
F
D
|
D
G
 
P
L
 
G
V
 
V
T
 
L
T
 
P
V
 
L
G
 
G
A
 
A
N
 
-
K
 
E
N
 
G
A
 
K
A
 
P
L
 
V
E
 
E
T
 
V
L
 
L
E
 
K
T
 
T
I
 
I
R
 
E
Y
 
F
C
 
I
K
 
S
E
 
S
D
 
K
L
 
-
K
 
G
L
 
F
C
 
N
T
 
T
T
 
T
M
 
V
G
|
G
L
 
L
S
 
S
N
|
N
I
 
L
S
 
S
F
|
F
G
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
D
R
|
R
P
 
S
Y
 
Y
V
 
Y
N
 
N
G
 
T
A
 
A
F
 
F
A
 
L
S
 
V
M
 
L
A
 
G
I
 
I
A
 
S
S
 
K
G
 
G
L
 
L
T
 
S
M
 
S
A
 
A
I
|
I
A
 
M
N
 
N
P
 
P
S
 
L
N
 
D
Q
 
E
L
 
T
L
 
L
M
 
M

Q99707 Methionine synthase; MS; 5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase; Cobalamin-dependent methionine synthase; Vitamin-B12 dependent methionine synthase; EC 2.1.1.13 from Homo sapiens (Human) (see 6 papers)
31% identity, 100% coverage: 4:823/823 of query aligns to 20:899/1265 of Q99707

query
sites
Q99707
E
 
D
E
 
E
L
 
I
Y
 
N
T
 
A
M
 
I
I
 
L
Q
 
Q
Q
 
K
K
 
R
P
 
I
V
 
M
I
 
V
L
 
L
D
 
D
G
 
G
A
 
G
T
 
M
G
 
G
S
 
T
N
 
M
L
 
I
Q
 
Q
K
 
R
V
 
E
G
 
K
M
 
L
K
 
N
P
 
-
G
 
-
V
 
-
C
 
-
P
 
-
E
 
E
E
 
E
W
 
H
I
 
F
L
 
R
E
 
G
N
 
Q
E
 
E
-
 
F
-
 
K
-
 
D
-
 
H
-
 
A
-
x
R
-
 
P
-
 
L
-
 
K
-
 
G
-
 
N
-
 
N
-
 
D
-
 
I
-
 
L
-
 
S
-
 
I
-
 
T
-
 
Q
-
 
P
D
 
D
K
 
V
L
 
I
I
 
Y
D
 
Q
L
 
I
Q
 
H
K
 
K
S
 
E
F
 
Y
V
 
L
E
 
L
A
 
A
G
 
G
T
 
A
N
 
D
I
 
I
L
 
I
Y
 
E
A
 
T
P
 
N
T
 
T
F
 
F
S
 
S
G
 
S
N
 
T
R
 
S
V
 
I
K
 
A
L
 
Q
E
 
A
E
 
D
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
E
D
 
H
R
 
L
A
 
A
E
 
Y
E
 
R
I
 
M
N
 
N
K
 
M
R
 
C
L
 
S
V
 
A
G
 
G
L
 
V
S
 
A
K
 
R
R
 
K
A
 
A
A
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
V
-
 
T
-
 
L
-
 
Q
-
 
T
G
 
G
D
 
I
K
 
K
A
 
R
L
 
F
V
 
V
A
 
A
G
 
G
D
 
A
M
 
L
T
 
G
M
 
P
T
 
T
G
 
N
V
 
K
A
 
T
L
 
L
E
 
S
P
 
-
V
 
V
G
 
S
P
 
P
-
 
S
-
 
V
-
 
E
-
 
R
-
 
P
-
 
D
-
 
Y
-
 
R
-
 
N
M
 
I
K
 
T
L
 
F
E
 
D
A
 
E
L
 
L
I
 
V
N
 
E
I
 
A
Y
 
Y
K
 
Q
E
 
E
Q
 
Q
A
 
A
K
 
K
Y
 
G
L
 
L
L
 
L
E
 
D
A
 
G
G
 
G
V
 
V
D
 
D
L
 
I
F
 
L
V
 
L
V
 
I
E
 
E
T
 
T
M
 
I
M
 
F
S
 
D
L
 
T
A
 
A
E
 
N
T
 
A
R
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
L
I
 
F
A
 
A
I
 
L
K
 
Q
E
 
N
V
 
L
C
 
F
N
 
E
-
 
E
-
 
K
-
 
Y
-
 
A
-
 
P
L
 
R
P
 
P
V
 
I
I
 
F
A
 
I
S
 
S
L
 
G
T
 
T
F
 
I
-
 
V
Q
 
D
E
 
K
D
 
S
G
 
G
R
 
R
T
 
T
L
 
L
Y
 
S
G
 
G
T
 
Q
D
 
T
P
 
G
V
 
E
T
 
G
A
 
F
V
 
V
V
 
I
V
 
S
L
 
V
Q
 
S
S
 
H
I
 
G
G
 
E
A
 
P
D
 
L
I
x
C
I
 
I
G
 
G
V
 
L
N
 
N
C
 
C
S
 
A
T
 
L
G
 
G
P
 
A
G
 
A
E
 
E
M
 
M
I
 
R
P
 
P
V
 
F
I
 
I
K
 
E
K
 
I
M
 
I
K
 
G
E
 
K
Y
 
C
A
 
T
E
 
T
V
 
A
P
 
Y
I
 
V
L
 
L
A
 
C
K
 
Y
P
 
P
N
 
N
A
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
V
 
-
L
 
-
E
 
-
D
 
N
G
 
T
V
 
F
T
 
G
V
 
D
Y
 
Y
P
 
D
M
 
E
T
 
T
P
 
P
E
 
S
E
 
M
F
 
M
A
 
A
S
 
K
W
 
H
G
 
L
P
 
K
A
 
D
F
 
F
I
 
A
E
 
M
A
 
D
G
 
G
-
 
L
A
 
V
G
 
N
L
 
I
I
 
V
G
 
G
G
 
G
C
 
C
C
 
C
G
 
G
S
 
S
T
 
T
P
 
P
E
 
D
H
 
H
I
 
I
R
 
R
M
 
E
L
 
I
T
 
A
E
 
E
K
 
A
V
 
V
S
 
K
G
 
N
L
 
C
T
 
K
T
 
P
K
 
R
A
 
V
P
 
P
-
 
P
-
 
A
C
 
T
N
 
A
I
 
F
H
 
E
P
 
G
I
 
H
M
 
M
L
 
L
A
 
L
S
 
S
E
 
G
R
 
L
K
 
E
S
 
P
Q
 
F
E
 
R
I
 
I
A
 
G
L
 
P
D
 
Y
G
 
T
K
 
N
F
 
F
L
 
V
V
 
N
I
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
C
N
 
N
P
 
V
T
 
A
G
|
G
K
x
S
K
x
R
K
 
K
L
 
F
Q
 
A
E
 
K
E
 
L
L
 
I
R
 
M
A
 
A
G
 
G
K
 
N
L
 
Y
D
 
E
L
 
E
V
 
A
E
 
L
E
 
C
M
 
V
A
 
A
E
 
K
Q
 
V
Q
 
Q
E
 
V
E
 
E
M
 
M
G
 
G
A
 
A
H
 
Q
I
 
V
L
 
L
D
 
D
I
 
V
N
 
N
M
 
M
G
 
D
T
 
D
N
 
G
G
 
M
I
 
L
D
 
D
E
 
G
K
 
P
E
 
S
M
 
A
M
 
M
L
 
T
K
 
R
A
 
F
I
 
C
S
 
N
K
 
L
V
 
I
T
 
A
M
 
S
-
 
E
-
 
P
-
 
D
V
 
I
S
 
A
S
 
K
L
 
V
P
 
P
L
 
L
C
 
C
I
 
I
D
|
D
T
 
S
S
 
S
Y
 
N
V
 
F
E
 
A
V
 
V
M
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
G
L
 
L
R
 
K
A
 
C
Y
 
C
P
 
Q
G
 
G
R
 
K
A
 
C
L
 
I
I
 
V
N
|
N
S
 
S
I
 
I
S
 
S
L
 
L
-
 
K
-
 
E
-
 
G
E
 
E
T
 
D
E
 
D
K
 
F
I
 
L
E
 
E
K
 
K
L
 
A
L
 
R
P
 
K
L
 
I
A
 
-
K
 
K
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
M
 
A
F
 
M
I
 
V
L
 
V
L
 
M
P
 
A
L
 
F
S
 
D
D
 
E
E
 
E
G
 
G
L
 
Q
P
 
A
K
 
T
S
 
E
L
 
T
A
 
D
E
 
T
K
 
K
K
 
I
E
 
R
I
 
V
I
 
C
N
 
T
T
 
R
I
 
A
L
 
Y
E
 
H
K
 
L
-
 
L
A
 
V
K
 
K
K
 
K
L
 
L
G
 
G
V
 
F
S
 
N
K
 
P
N
 
N
Q
 
D
I
 
I
I
 
I
V
 
F
D
|
D
G
 
P
L
 
N
V
 
I
T
 
L
T
 
T
V
 
I
G
 
G
A
 
T
-
 
G
-
 
M
-
 
E
-
 
E
N
 
H
K
 
N
N
 
L
A
 
Y
A
 
A
L
 
I
E
 
N
T
 
F
L
 
I
E
 
H
T
 
A
I
 
T
R
 
K
Y
 
V
C
 
I
K
 
K
E
 
E
D
 
T
L
 
L
K
 
P
L
 
G
C
 
A
T
 
R
-
 
I
T
 
S
M
 
G
G
 
G
L
 
L
S
 
S
N
|
N
I
 
L
S
 
S
F
 
F
G
 
S
L
 
F
P
x
R
E
 
G
-
 
M
-
 
E
-
 
A
-
 
I
R
|
R
P
 
E
Y
 
A
V
 
M
N
 
H
G
 
G
A
 
V
F
 
F
A
 
L
S
 
Y
M
 
H
A
 
A
I
 
I
A
 
K
S
 
S
G
 
G
L
 
M
T
 
D
M
 
M
A
 
G
I
 
I
A
 
V
N
 
N
P
 
A
S
 
G
N
 
N
Q
 
L
L
 
P
L
 
V
M
 
Y
G
 
D
-
 
D
-
 
I
-
 
H
-
 
K
-
 
E
-
 
L
I
 
L
S
 
Q
F
 
L
A
 
C
S
 
E
D
 
D
L
 
L
L
 
I
R
 
W
N
 
N
K
 
K
E
 
D
G
 
-
S
 
-
D
 
-
I
 
-
A
 
-
Y
 
-
I
 
-
E
 
-
Q
 
-
I
 
-
Q
 
-
R
 
-
M
 
-
E
 
-
P
 
P
L
 
E
K
 
A
E
 
T
A
 
E
A
 
K
I
 
L
A
 
L
K
 
R
A
 
Y
A
 
A
K
 
Q
T
 
T
A
 
Q
G
 
G
N
 
T
G
 
G
E
 
G
K
 
K
Q
 
K
P
 
-
N
 
-
E
 
-
K
 
-
N
 
-
A
 
-
A
 
-
V
 
V
G
 
I
E
 
Q
A
 
T
D
 
D
G
 
-
N
 
E
I
 
W
K
 
R
K
 
N
N
 
G
P
 
P
V
 
V
F
 
E
E
 
E
-
 
R
-
 
L
-
 
E
-
 
Y
A
 
A
V
 
L
L
 
V
K
 
K
G
 
G
N
 
I
K
 
E
D
 
K
G
 
H
I
 
I
V
 
I
-
 
E
D
 
D
V
 
T
V
 
E
K
 
E
K
 
A
E
 
R
L
 
L
S
 
N
-
 
Q
-
 
K
K
 
K
G
 
Y
T
 
P
K
 
R
P
 
P
G
 
L
E
 
N
I
 
I
L
 
I
D
 
E
G
 
G
L
 
P
L
 
L
I
 
M
P
 
N
A
 
G
I
 
M
N
 
K
E
 
I
V
 
V
G
 
G
V
 
D
L
 
L
F
 
F
D
 
G
K
 
A
Q
 
G
K
 
K
Y
 
M
F
 
F
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
L
 
V
I
 
I
S
 
K
S
 
S
A
 
A
N
 
R
T
 
V
M
 
M
E
 
K
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
E
 
G
Y
 
H
L
 
L
E
 
I
P
 
P
L
 
F
L
 
M
K
 
E
E
 
K
-
 
E
-
 
R
-
 
E
-
 
E
-
 
T
-
 
R
-
 
V
-
 
L
-
 
N
G
 
G
G
 
T
I
 
V
Q
 
E
E
 
E
K
 
E
M
 
D
P
 
P
-
 
Y
-
 
Q
-
 
G
T
 
T
I
 
I
I
 
V
I
 
L
A
 
A
T
 
T
V
 
V
E
 
K
G
 
G
D
 
D
I
 
V
H
 
H
D
 
D
I
 
I
G
 
G
K
 
K
N
 
N
L
 
I
V
 
V
A
 
G
L
 
V
M
 
V
L
 
L
R
 
G
N
 
C
Y
 
N
G
 
N
Y
 
F
D
 
R
V
 
V
I
 
I
D
 
D
L
 
L
G
 
G
K
 
V
D
 
M
V
 
T
P
 
P
A
 
C
D
 
D
E
 
K
I
 
I
I
 
L
A
 
K
A
 
A
A
 
A
K
 
L
E
 
D
H
 
H
N
 
K
A
 
A
S
 
D
I
 
I
I
 
I
V
 
G
L
 
L
S
 
S
A
 
G
L
 
L
M
 
I
T
 
T
T
 
P
T
 
S
M
 
L
M
 
D
R
 
E
M
 
M
K
 
-
D
 
-
T
 
I
I
 
F
A
 
V
L
 
A
K
 
K
E
 
E
K
 
M
E
 
E
H
 
R
L
 
L
D
 
A
V
 
I
K
 
R
V
 
I
-
 
P
-
 
L
M
 
L
I
 
I
G
 
G
G
 
G
A
 
A
V
 
T
T
 
T
T
 
S
Q
 
K
S
 
T
F
 
H
A
 
T
D
 
A
E
 
V
I
 
K
G
 
I
A
 
A
D
 
P
G
 
R
Y
 
Y
S
 
S
A
 
A
-
 
P
-
 
V
-
 
I
-
 
H
-
 
V
-
 
L
D
 
D
A
 
A
A
 
S
D
 
K
A
 
S
V
 
V
R
 
V
L
 
V
A
 
C
K
 
S
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
A
 
D
E
 
E

Sites not aligning to the query:

P13009 Methionine synthase; 5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase; Methionine synthase, vitamin-B12-dependent; MS; EC 2.1.1.13 from Escherichia coli (strain K12) (see 5 papers)
29% identity, 97% coverage: 2:796/823 of query aligns to 4:840/1227 of P13009

query
sites
P13009
K
 
K
T
 
V
E
 
E
E
 
Q
L
 
L
Y
 
R
T
 
A
M
 
Q
I
 
L
Q
 
N
Q
 
E
K
 
R
P
 
I
V
 
L
I
 
V
L
 
L
D
 
D
G
 
G
A
 
G
T
 
M
G
 
G
S
 
T
N
 
M
L
 
I
Q
 
Q
K
 
S
V
 
Y
G
 
R
M
 
L
K
 
N
P
 
E
-
 
A
-
 
D
-
 
F
-
 
R
G
 
G
V
 
E
C
 
R
P
 
F
E
 
A
E
 
D
W
 
W
I
 
P
L
 
C
E
 
D
-
 
L
-
 
K
-
 
G
N
 
N
E
 
N
D
 
D
K
 
L
L
 
L
I
 
V
-
 
L
-
 
S
-
 
K
-
 
P
-
 
E
-
 
V
-
 
I
-
 
A
D
 
A
L
 
I
Q
 
H
K
 
N
S
 
A
F
 
Y
V
 
F
E
 
E
A
 
A
G
 
G
T
 
A
N
 
D
I
 
I
L
 
I
Y
 
E
A
 
T
P
 
N
T
 
T
F
 
F
S
 
N
G
 
S
N
 
T
R
 
T
V
 
I
K
 
A
L
 
M
E
 
A
E
 
D
Y
 
Y
G
 
Q
L
 
M
A
 
E
D
 
S
R
 
L
A
 
S
E
 
A
E
 
E
I
 
I
N
 
N
K
 
F
R
 
A
L
 
A
V
 
A
G
 
K
-
 
L
-
 
A
-
 
R
-
 
A
-
 
C
-
 
A
-
 
D
-
 
E
L
 
W
S
 
T
K
 
A
R
 
R
A
 
T
A
 
P
G
 
E
D
 
K
K
 
P
A
 
R
L
 
Y
V
 
V
A
 
A
G
 
G
D
 
V
M
 
L
-
 
G
-
 
P
T
 
T
M
 
N
T
 
R
G
 
T
V
 
A
A
 
S
L
 
I
E
 
S
P
 
P
-
 
D
-
 
V
-
 
N
-
 
D
-
 
P
-
 
A
V
 
F
G
 
R
P
 
N
M
 
I
K
 
T
L
 
F
E
 
D
A
 
G
L
 
L
I
 
V
N
 
A
I
 
A
Y
 
Y
K
 
R
E
 
E
Q
 
S
A
 
T
K
 
K
Y
 
A
L
 
L
L
 
V
E
 
E
A
 
G
G
 
G
V
 
A
D
 
D
L
 
L
F
 
I
V
 
L
V
 
I
E
 
E
T
 
T
M
 
V
M
 
F
S
 
D
L
 
T
A
 
L
E
 
N
T
 
A
R
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
F
A
 
A
I
 
V
K
 
K
E
 
T
V
 
E
-
 
F
-
 
E
-
 
A
-
 
L
-
 
G
C
 
V
N
 
E
L
 
L
P
 
P
V
 
I
I
 
M
A
 
I
S
 
S
L
 
G
T
 
T
F
 
I
Q
 
T
E
 
D
-
 
A
D
 
S
G
 
G
R
 
R
T
 
T
L
 
L
Y
 
S
G
 
G
T
 
Q
D
 
T
P
 
T
V
 
E
T
 
A
A
 
F
V
 
Y
V
 
N
V
 
S
L
 
L
Q
 
R
S
 
H
I
 
A
G
 
E
A
 
A
D
 
L
I
 
T
I
 
F
G
 
G
V
 
L
N
 
N
C
|
C
S
 
A
T
 
L
G
 
G
P
 
P
G
 
D
E
 
E
M
 
L
I
 
R
P
 
Q
V
 
Y
I
 
V
K
 
Q
K
 
E
M
 
L
K
 
S
E
 
R
Y
 
I
A
 
A
E
 
E
V
 
C
P
 
Y
I
 
V
L
 
T
A
 
A
K
 
H
P
 
P
N
 
N
A
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
V
 
-
L
 
-
E
 
-
D
 
N
G
 
A
V
 
F
T
 
G
V
 
E
Y
 
Y
P
 
D
M
 
L
T
 
D
P
 
A
E
 
D
E
 
T
F
 
M
A
 
A
S
 
K
W
 
Q
G
 
I
P
 
R
A
 
E
F
 
W
I
 
A
E
 
Q
A
 
A
G
 
G
A
 
F
-
 
L
G
 
N
L
 
I
I
 
V
G
 
G
G
 
G
C
|
C
C
|
C
G
 
G
S
 
T
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
H
 
H
I
 
I
R
 
A
M
 
A
L
 
M
T
 
S
E
 
R
K
 
A
V
 
V
S
 
E
G
 
G
L
 
L
T
 
-
T
 
-
K
 
-
A
 
A
P
 
P
C
 
R
N
 
K
I
 
L
H
 
P
P
 
E
I
 
I
M
 
P
L
 
V
A
 
A
S
 
C
E
 
R
R
 
L
K
 
S
S
 
G
Q
 
L
E
 
E
-
 
P
-
 
L
-
 
N
I
 
I
A
 
G
L
 
E
D
 
D
G
 
S
K
 
L
F
 
F
L
 
V
V
 
N
I
 
V
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
T
N
 
N
P
 
V
T
 
T
G
 
G
K
 
S
K
 
A
K
 
K
L
 
F
Q
 
K
E
 
R
E
 
L
L
 
I
R
 
K
A
 
E
G
 
E
K
 
K
L
 
Y
D
 
S
L
 
E
V
 
A
E
 
L
E
 
D
M
 
V
A
 
A
E
 
R
Q
 
Q
Q
 
Q
E
 
V
E
 
E
M
 
N
G
 
G
A
 
A
H
 
Q
I
 
I
L
 
I
D
 
D
I
 
I
N
 
N
M
 
M
G
 
D
T
 
E
N
 
G
G
 
M
I
 
L
D
 
D
E
 
A
K
 
E
E
 
A
M
 
A
M
 
M
L
 
V
K
 
R
A
 
F
I
 
L
S
 
N
K
 
L
V
 
I
T
 
A
M
 
G
-
 
E
-
 
P
-
 
D
V
 
I
S
 
A
S
 
R
L
 
V
P
 
P
L
 
I
C
 
M
I
 
I
D
 
D
T
 
S
S
 
S
Y
 
K
V
 
W
E
 
D
V
 
V
M
 
I
E
 
E
A
 
K
A
 
G
L
 
L
R
 
K
A
 
C
Y
 
I
P
 
Q
G
 
G
R
 
K
A
 
G
L
 
I
I
 
V
N
 
N
S
 
S
I
 
I
S
 
S
L
 
M
E
 
K
T
 
-
E
 
E
K
 
G
I
 
V
E
 
D
K
 
A
L
 
F
L
 
I
P
 
H
L
 
H
A
 
A
K
 
K
-
 
L
-
 
L
-
 
R
K
 
R
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
M
 
A
F
 
V
I
 
V
L
 
V
L
 
M
P
 
A
L
 
F
S
 
D
D
 
E
E
 
Q
G
 
G
L
 
Q
P
 
A
K
 
D
S
 
T
L
 
R
A
 
A
E
 
R
K
 
K
K
 
I
E
 
E
I
 
I
I
 
C
N
 
R
T
 
R
I
 
A
L
 
Y
E
 
K
-
 
I
K
 
L
A
 
T
K
 
E
K
 
E
L
 
V
G
 
G
V
 
F
S
 
P
K
 
P
N
 
E
Q
 
D
I
 
I
I
 
I
V
 
F
D
 
D
-
 
P
-
 
N
-
 
I
-
 
F
G
 
A
L
 
V
V
 
A
T
 
T
T
 
G
V
 
I
G
 
E
A
 
E
N
 
H
K
 
N
N
 
N
A
 
Y
A
 
A
L
 
Q
E
 
D
T
 
F
L
 
I
E
 
G
T
 
A
I
 
C
R
 
E
Y
 
D
C
 
I
K
 
K
E
 
R
D
 
E
L
 
L
-
 
P
K
 
H
L
 
A
C
 
L
T
 
I
T
 
S
M
 
G
G
 
G
L
 
V
S
 
S
N
 
N
I
 
V
S
 
S
F
 
F
G
 
S
L
 
F
-
 
R
-
 
G
-
 
N
-
 
D
P
 
P
E
 
V
R
 
R
P
 
E
Y
 
A
V
 
I
N
 
H
G
 
A
A
 
V
F
 
F
A
 
L
S
 
Y
M
 
Y
A
 
A
I
 
I
A
 
R
S
 
N
G
 
G
L
 
M
T
 
D
M
 
M
A
 
G
I
 
I
A
 
V
N
 
N
P
 
-
S
 
A
N
 
G
Q
 
Q
L
 
L
L
 
A
M
 
I
G
 
Y
I
 
D
S
 
D
F
 
L
A
 
P
S
 
A
D
 
E
L
 
L
L
 
R
R
 
D
N
 
A
K
 
V
E
 
E
G
 
-
S
 
-
D
 
D
I
 
V
A
 
I
Y
 
-
I
 
-
E
 
-
Q
 
-
I
 
L
Q
 
N
R
 
R
M
 
R
E
 
D
P
 
D
L
 
G
K
 
T
E
 
E
A
 
R
A
 
L
I
 
L
A
 
E
K
 
L
A
 
A
A
 
E
K
 
K
T
 
Y
A
 
R
G
 
G
N
 
S
G
 
-
E
 
-
K
 
K
Q
 
T
P
 
D
N
 
D
E
 
T
K
 
A
N
 
N
A
 
A
A
 
Q
V
 
Q
G
 
A
E
 
E
A
 
W
D
 
R
G
 
S
N
 
W
I
 
E
K
 
V
K
 
N
N
 
K
P
 
R
V
 
L
F
 
E
E
 
Y
A
 
S
V
 
L
L
 
V
K
 
K
G
 
G
N
 
I
K
 
T
D
 
E
G
 
F
I
 
I
V
 
E
D
 
Q
V
 
D
V
 
T
K
 
E
K
 
E
E
 
A
L
 
R
S
 
Q
K
 
Q
G
 
A
T
 
T
K
 
R
P
 
P
G
 
I
E
 
E
I
 
V
L
 
I
D
x
E
G
 
G
L
 
P
L
 
L
I
 
M
P
 
D
A
 
G
I
 
M
N
 
N
E
 
V
V
 
V
G
 
G
V
 
D
L
 
L
F
 
F
D
 
G
K
 
E
Q
 
G
K
 
K
Y
 
M
F
 
F
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
L
 
V
I
 
V
S
 
K
S
 
S
A
 
A
N
 
R
T
 
V
M
 
M
E
 
K
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
E
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
P
 
P
L
 
F
L
 
I
K
 
E
E
 
A
G
 
S
G
 
K
I
 
E
Q
 
Q
E
 
G
K
 
K
M
 
T
P
 
N
-
 
G
T
 
K
I
 
M
I
 
V
I
 
I
A
 
A
T
 
T
V
 
V
E
 
K
G
|
G
D
|
D
I
x
V
H
|
H
D
|
D
I
 
I
G
 
G
K
 
K
N
 
N
L
 
I
V
 
V
A
 
G
L
 
V
M
 
V
L
 
L
R
 
Q
N
 
C
Y
 
N
G
 
N
Y
 
Y
D
 
E
V
 
I
I
 
V
D
 
D
L
 
L
G
 
G
K
 
V
D
 
M
V
 
V
P
 
P
A
 
A
D
 
E
E
 
K
I
 
I
I
 
L
A
 
R
A
 
T
A
 
A
K
 
K
E
 
E
H
 
V
N
 
N
A
 
A
S
 
D
I
 
L
I
 
I
V
 
G
L
 
L
S
|
S
A
 
G
L
 
L
M
 
I
T
|
T
T
 
P
T
x
S
M
 
L
M
 
D
R
 
E
M
 
M
K
 
V
D
 
N
T
 
V
I
 
A
A
 
K
L
 
E
K
 
M
E
 
E
K
 
R
E
 
Q
H
 
G
L
 
F
D
 
T
V
 
I
K
 
P
V
 
L
M
 
L
I
 
I
G
 
G
G
 
G
A
 
A
V
 
T
T
 
T
T
 
S
Q
 
K
S
 
A

Sites not aligning to the query:

4cczA Crystal structure of human 5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, the homocysteine and folate binding domains
28% identity, 68% coverage: 4:566/823 of query aligns to 4:599/611 of 4cczA

query
sites
4cczA
E
 
D
E
 
E
L
 
I
Y
 
N
T
 
A
M
 
I
I
 
L
Q
 
Q
Q
 
K
K
 
R
P
 
I
V
 
M
I
 
V
L
 
L
D
 
D
G
 
G
A
 
G
T
 
M
G
 
G
S
 
T
N
 
M
L
 
I
Q
 
Q
K
 
R
V
 
E
G
 
K
M
 
L
K
 
E
P
 
E
G
 
H
V
 
F
C
 
R
P
 
G
E
 
Q
E
 
E
W
 
F
-
 
K
-
 
D
-
 
H
-
 
A
-
 
R
-
 
P
-
 
L
-
 
K
-
 
G
-
 
N
-
 
N
-
 
D
-
 
I
-
 
L
I
 
S
L
 
I
E
 
T
N
 
Q
E
 
P
D
 
D
K
 
V
L
 
I
I
 
Y
D
 
Q
L
 
I
Q
 
H
K
 
K
S
 
E
F
 
Y
V
 
L
E
 
L
A
 
A
G
 
-
T
 
-
N
 
D
I
 
I
L
 
I
Y
 
E
A
 
T
P
 
N
T
 
T
F
 
F
S
 
S
G
 
S
N
 
T
R
 
S
V
 
I
K
 
A
L
 
Q
E
 
A
E
 
D
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
E
D
 
H
R
 
L
A
 
A
E
 
Y
E
 
R
I
 
M
N
 
N
K
 
M
R
 
C
L
 
S
V
 
A
G
 
G
L
 
V
S
 
A
K
 
R
R
 
K
A
 
A
A
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
V
-
 
T
-
 
L
-
 
Q
-
 
T
G
 
G
D
 
I
K
 
K
A
 
R
L
 
F
V
 
V
A
 
A
G
 
G
D
 
A
M
 
L
T
 
G
M
 
P
T
 
T
G
 
N
V
 
K
A
 
T
L
 
L
E
 
S
P
 
-
V
 
V
G
 
S
P
 
P
-
 
S
-
 
V
-
 
E
-
 
R
-
 
P
-
 
D
-
 
Y
-
 
R
-
 
N
M
 
I
K
 
T
L
 
F
E
 
D
A
 
E
L
 
L
I
 
V
N
 
E
I
 
A
Y
 
Y
K
 
Q
E
 
E
Q
 
Q
A
 
A
K
 
K
Y
 
G
L
 
L
L
 
L
E
 
D
A
 
G
G
 
G
V
 
V
D
 
D
L
 
I
F
 
L
V
 
L
V
 
I
E
 
E
T
 
T
M
 
I
M
 
F
S
 
D
L
 
T
A
 
A
E
 
N
T
 
A
R
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
L
I
 
F
A
 
A
I
 
L
K
 
Q
E
 
N
V
 
L
C
 
F
N
 
E
-
 
E
-
 
K
-
 
Y
-
 
A
-
 
P
L
 
R
P
 
P
V
 
I
I
 
F
A
 
I
S
 
S
L
 
G
T
 
T
F
 
I
-
 
V
Q
 
D
E
 
K
D
 
S
G
 
G
R
 
R
T
 
T
L
 
L
Y
 
S
G
 
G
T
 
Q
D
 
T
P
 
G
V
 
E
T
 
G
A
 
F
V
 
V
V
 
I
V
 
S
L
 
V
Q
 
S
S
 
H
I
 
G
G
 
E
A
 
P
D
 
L
I
 
C
I
 
I
G
 
G
V
 
L
N
 
N
C
 
C
S
 
A
T
 
L
G
 
G
P
 
A
G
 
A
E
 
E
M
 
M
I
 
R
P
 
P
V
 
F
I
 
I
K
 
E
K
 
I
M
 
I
K
 
G
E
 
K
Y
 
C
A
 
T
E
 
T
V
 
A
P
 
Y
I
 
V
L
 
L
A
 
C
K
 
Y
P
 
P
N
 
N
A
 
A
G
 
G
L
 
F
P
 
A
V
 
M
L
 
-
E
 
-
D
 
D
G
 
G
V
 
L
T
 
V
V
 
-
Y
 
-
P
 
-
M
 
-
T
 
-
P
 
-
E
 
-
E
 
-
F
 
-
A
 
-
S
 
-
W
 
-
G
 
-
P
 
-
A
 
-
F
 
-
I
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
N
L
 
I
I
 
V
G
 
G
G
 
G
C
 
C
C
 
C
G
 
G
S
 
S
T
 
T
P
 
P
E
 
D
H
 
H
I
 
I
R
 
R
M
 
E
L
 
I
T
 
A
E
 
E
K
 
A
V
 
V
S
 
K
G
 
N
L
 
C
T
 
K
T
 
P
K
 
R
A
 
V
P
 
P
-
 
P
-
 
A
C
 
T
N
 
A
I
 
F
H
 
E
P
 
G
I
 
H
M
 
M
L
 
L
A
 
L
S
 
S
E
 
G
R
 
L
K
 
E
S
 
P
Q
 
F
E
 
R
I
 
I
A
 
G
L
 
P
D
 
Y
G
 
T
K
 
N
F
 
F
L
 
V
V
 
N
I
 
I
G
 
G
E
|
E
R
 
R
I
 
C
N
 
N
P
 
V
T
 
A
G
|
G
K
 
S
K
x
R
K
 
K
L
 
F
Q
 
A
E
 
K
E
 
L
L
 
I
R
 
M
A
 
A
G
 
G
K
 
N
L
 
Y
D
 
E
L
 
E
V
 
A
E
 
L
E
 
C
M
 
V
A
 
A
E
 
K
Q
 
V
Q
 
Q
E
 
V
E
 
E
M
 
M
G
 
G
A
 
A
H
 
Q
I
 
V
L
 
L
D
 
D
I
 
V
N
 
N
M
 
M
G
 
D
T
 
D
N
 
G
G
 
M
I
 
L
D
 
D
E
 
G
K
 
P
E
 
S
M
 
A
M
 
M
L
 
T
K
 
R
A
 
F
I
 
C
S
 
N
K
 
L
V
 
I
T
 
A
M
 
S
-
 
E
-
 
P
-
 
D
V
 
I
S
 
A
S
 
K
L
 
V
P
 
P
L
 
L
C
 
C
I
 
I
D
 
D
T
 
S
S
 
S
Y
 
N
V
 
F
E
 
A
V
 
V
M
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
G
L
 
L
R
 
K
A
 
C
Y
 
C
P
 
Q
G
 
G
R
 
K
A
 
C
L
 
I
I
 
V
N
|
N
S
 
S
I
 
I
S
 
S
L
 
L
-
 
K
-
 
E
-
 
G
E
 
E
T
 
D
E
 
D
K
 
F
I
 
L
E
 
E
K
 
K
L
 
A
L
 
R
P
 
K
L
 
I
A
 
-
K
 
K
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
M
 
A
F
 
M
I
 
V
L
 
V
L
x
M
P
 
A
L
 
F
S
 
D
D
 
E
E
 
E
G
 
G
L
 
Q
P
 
A
K
 
T
S
 
E
L
 
T
A
 
D
E
 
T
K
 
K
K
 
I
E
 
R
I
 
V
I
 
C
N
 
T
T
 
R
I
 
A
L
 
Y
E
 
H
-
 
L
K
 
L
A
 
V
K
 
K
K
 
K
L
 
L
G
 
G
V
 
F
S
 
N
K
 
P
N
 
N
Q
 
D
I
 
I
I
 
I
V
 
F
D
|
D
G
 
P
L
 
N
V
 
I
T
 
L
T
 
T
V
 
I
G
 
G
A
 
T
-
 
G
-
 
M
-
 
E
-
 
E
N
 
H
K
 
N
N
 
L
A
 
Y
A
 
A
L
 
I
E
 
N
T
 
F
L
 
I
E
 
H
T
 
A
I
 
T
R
 
K
Y
 
V
C
 
I
K
 
K
E
 
E
D
 
T
L
 
L
K
 
P
L
 
G
C
 
A
T
 
R
-
 
I
T
 
S
M
 
G
G
|
G
L
 
L
S
|
S
N
|
N
I
 
L
S
 
S
F
|
F
G
 
S
L
 
F
P
x
R
E
 
G
-
 
M
-
 
E
-
 
A
-
 
I
R
|
R
P
 
E
Y
 
A
V
 
M
N
 
H
G
 
G
A
 
V
F
 
F
A
 
L
S
 
Y
M
 
H
A
 
A
I
 
I
A
 
K
S
 
S
G
 
G
L
 
M
T
 
D
M
 
M
A
 
G
I
 
I
A
 
V
N
 
N
P
 
A
S
 
G
N
 
N
Q
 
L
L
 
P
L
 
V
M
 
Y
G
 
D
-
 
D
-
 
I
-
 
H
-
 
K
-
 
E
-
 
L
I
 
L
S
 
Q
F
 
L
A
 
C
S
 
E
D
 
D
L
 
L
L
 
I
R
 
W
N
 
N
K
 
K
E
 
D

2yckX Methyltransferase bound with tetrahydrofolate (see paper)
32% identity, 32% coverage: 319:578/823 of query aligns to 11:271/272 of 2yckX

query
sites
2yckX
F
 
F
L
 
I
V
 
M
I
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
I
N
 
N
P
 
G
T
x
M
G
x
F
K
 
K
K
 
D
K
 
-
L
 
I
Q
 
R
E
 
E
E
 
A
L
 
I
R
 
L
A
 
N
G
 
K
K
 
D
L
 
P
D
 
R
L
 
P
V
 
I
E
 
Q
E
 
E
M
 
W
A
 
A
E
 
R
Q
 
R
Q
 
Q
E
 
A
E
 
E
M
 
K
G
 
G
A
 
A
H
 
H
I
 
Y
L
 
L
D
 
D
I
 
V
N
 
N
M
 
T
G
 
G
T
 
P
N
 
T
G
 
A
I
 
D
D
 
D
E
 
P
K
 
V
E
 
R
M
 
V
M
 
M
L
 
E
K
 
W
A
 
L
I
 
V
S
 
K
K
 
T
V
 
I
T
 
Q
M
 
E
V
 
V
S
 
V
S
 
D
L
 
L
P
 
P
L
 
C
C
 
C
I
 
L
D
|
D
T
 
S
S
 
T
Y
 
N
V
 
P
E
 
D
V
 
A
M
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
G
L
 
L
R
 
K
A
 
V
Y
 
H
P
 
R
G
 
G
R
 
H
A
 
A
L
 
M
I
 
I
N
|
N
S
 
S
I
 
T
S
 
S
L
 
A
E
 
D
T
 
Q
E
 
W
K
 
K
I
 
M
E
 
D
K
 
I
L
 
F
L
 
F
P
 
P
L
 
M
A
 
A
K
 
K
K
 
K
Y
 
Y
G
 
E
A
 
A
M
 
A
F
 
I
I
 
I
L
 
G
L
 
L
P
 
T
L
 
M
S
 
N
D
 
E
E
 
K
G
 
G
L
 
V
P
 
P
K
 
K
S
 
D
L
 
A
A
 
N
E
 
D
K
 
R
K
 
S
E
 
Q
I
 
L
I
 
A
N
 
M
T
 
E
I
 
L
L
 
V
E
 
A
K
 
N
A
 
A
K
 
D
K
 
A
L
 
H
G
 
G
V
 
I
S
 
P
K
 
M
N
 
T
Q
 
E
I
 
L
I
 
Y
V
 
I
D
|
D
G
 
P
L
 
L
V
 
I
T
 
L
T
 
P
V
 
V
G
 
N
A
 
V
N
 
A
K
 
Q
N
 
E
A
 
H
A
 
A
L
 
V
E
 
E
T
 
V
L
 
L
E
 
E
T
 
T
I
 
I
R
 
R
Y
 
Q
C
 
I
K
 
K
-
 
L
-
 
M
E
 
A
D
 
N
L
 
P
K
 
A
L
 
P
C
 
R
T
 
T
T
 
V
M
 
L
G
|
G
L
 
L
S
 
S
N
|
N
I
 
V
S
 
S
F
x
Q
G
x
K
L
 
C
P
 
P
E
 
D
R
|
R
P
 
P
Y
 
L
V
 
I
N
 
N
G
 
R
A
 
T
F
 
Y
A
 
L
S
 
V
M
 
M
A
 
A
I
 
M
A
 
T
S
 
A
G
 
G
L
 
L
T
 
D
M
 
A
A
 
A
I
|
I
A
 
M
N
 
D
P
 
V
S
 
D
N
 
D
Q
 
D
L
 
A
L
 
L
M
 
V
G
 
D
I
 
A
S
 
A
F
 
A
A
 
T
S
 
A
D
 
H
L
 
I
L
 
L
R
 
L
N
 
N
K
 
K
E
 
E
G
 
I
S
 
Y
D
 
C
I
 
D
A
 
S
Y
 
Y
I
 
L
E
 
K
Q
 
T
I
 
F
Q
 
R
R
 
Q

2ycjA Methyltransferase bound with methyltetrahydrofolate (see paper)
32% identity, 32% coverage: 319:578/823 of query aligns to 10:270/271 of 2ycjA

query
sites
2ycjA
F
 
F
L
 
I
V
 
M
I
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
I
N
 
N
P
 
G
T
x
M
G
x
F
K
 
K
K
 
D
K
 
-
L
 
I
Q
 
R
E
 
E
E
 
A
L
 
I
R
 
L
A
 
N
G
 
K
K
 
D
L
 
P
D
 
R
L
 
P
V
 
I
E
 
Q
E
 
E
M
 
W
A
 
A
E
 
R
Q
 
R
Q
 
Q
E
 
A
E
 
E
M
 
K
G
 
G
A
 
A
H
 
H
I
 
Y
L
 
L
D
 
D
I
 
V
N
 
N
M
 
T
G
 
G
T
 
P
N
 
T
G
 
A
I
 
D
D
 
D
E
 
P
K
 
V
E
 
R
M
 
V
M
 
M
L
 
E
K
 
W
A
 
L
I
 
V
S
 
K
K
 
T
V
 
I
T
 
Q
M
 
E
V
 
V
S
 
V
S
 
D
L
 
L
P
 
P
L
 
C
C
 
C
I
 
L
D
|
D
T
 
S
S
 
T
Y
 
N
V
 
P
E
 
D
V
 
A
M
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
G
L
 
L
R
 
K
A
 
V
Y
 
H
P
 
R
G
 
G
R
 
H
A
 
A
L
 
M
I
 
I
N
|
N
S
 
S
I
 
T
S
 
S
L
 
A
E
 
D
T
 
Q
E
 
W
K
 
K
I
 
M
E
 
D
K
 
I
L
 
F
L
 
F
P
 
P
L
 
M
A
 
A
K
 
K
K
 
K
Y
 
Y
G
 
E
A
 
A
M
 
A
F
 
I
I
 
I
L
 
G
L
 
L
P
 
T
L
 
M
S
 
N
D
 
E
E
 
K
G
 
G
L
 
V
P
 
P
K
 
K
S
 
D
L
 
A
A
 
N
E
 
D
K
 
R
K
 
S
E
 
Q
I
 
L
I
 
A
N
 
M
T
 
E
I
 
L
L
 
V
E
 
A
K
 
N
A
 
A
K
 
D
K
 
A
L
 
H
G
 
G
V
 
I
S
 
P
K
 
M
N
 
T
Q
 
E
I
 
L
I
 
Y
V
 
I
D
|
D
G
 
P
L
 
L
V
 
I
T
 
L
T
 
P
V
 
V
G
 
N
A
 
V
N
 
A
K
 
Q
N
 
E
A
 
H
A
 
A
L
 
V
E
 
E
T
 
V
L
 
L
E
 
E
T
 
T
I
 
I
R
 
R
Y
 
Q
C
 
I
K
 
K
-
 
L
-
 
M
E
 
A
D
 
N
L
 
P
K
 
A
L
 
P
C
 
R
T
 
T
T
 
V
M
 
L
G
|
G
L
 
L
S
 
S
N
|
N
I
 
V
S
 
S
F
x
Q
G
 
K
L
 
C
P
 
P
E
 
D
R
|
R
P
 
P
Y
 
L
V
 
I
N
 
N
G
 
R
A
 
T
F
 
Y
A
 
L
S
 
V
M
 
M
A
 
A
I
 
M
A
 
T
S
 
A
G
 
G
L
 
L
T
 
D
M
 
A
A
 
A
I
|
I
A
 
M
N
 
D
P
 
V
S
 
D
N
 
D
Q
 
D
L
 
A
L
 
L
M
 
V
G
 
D
I
 
A
S
 
A
F
 
A
A
 
T
S
 
A
D
 
H
L
 
I
L
 
L
R
 
L
N
 
N
K
 
K
E
 
E
G
 
I
S
 
Y
D
 
C
I
 
D
A
 
S
Y
 
Y
I
 
L
E
 
K
Q
 
T
I
 
F
Q
 
R
R
 
Q

2yciX Methyltransferase native (see paper)
32% identity, 32% coverage: 319:578/823 of query aligns to 10:270/271 of 2yciX

query
sites
2yciX
F
 
F
L
 
I
V
 
M
I
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
I
N
 
N
P
 
G
T
 
M
G
 
F
K
 
K
K
 
D
K
 
-
L
 
I
Q
 
R
E
 
E
E
 
A
L
 
I
R
 
L
A
 
N
G
 
K
K
 
D
L
 
P
D
 
R
L
 
P
V
 
I
E
 
Q
E
 
E
M
 
W
A
 
A
E
 
R
Q
 
R
Q
 
Q
E
 
A
E
 
E
M
 
K
G
 
G
A
 
A
H
 
H
I
 
Y
L
 
L
D
 
D
I
 
V
N
 
N
M
 
T
G
 
G
T
 
P
N
 
T
G
 
A
I
 
D
D
 
D
E
 
P
K
 
V
E
 
R
M
 
V
M
 
M
L
 
E
K
 
W
A
 
L
I
 
V
S
 
K
K
 
T
V
 
I
T
 
Q
M
 
E
V
 
V
S
 
V
S
 
D
L
 
L
P
 
P
L
 
C
C
 
C
I
 
L
D
 
D
T
 
S
S
 
T
Y
 
N
V
 
P
E
 
D
V
 
A
M
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
G
L
 
L
R
 
K
A
 
V
Y
 
H
P
 
R
G
 
G
R
 
H
A
 
A
L
 
M
I
 
I
N
 
N
S
 
S
I
 
T
S
 
S
L
 
A
E
 
D
T
 
Q
E
 
W
K
 
K
I
 
M
E
 
D
K
 
I
L
 
F
L
 
F
P
 
P
L
 
M
A
 
A
K
 
K
K
 
K
Y
 
Y
G
 
E
A
 
A
M
 
A
F
 
I
I
 
I
L
 
G
L
 
L
P
 
T
L
 
M
S
 
N
D
 
E
E
 
K
G
 
G
L
 
V
P
 
P
K
 
K
S
 
D
L
 
A
A
 
N
E
 
D
K
 
R
K
 
S
E
 
Q
I
 
L
I
 
A
N
 
M
T
 
E
I
 
L
L
 
V
E
 
A
K
 
N
A
 
A
K
 
D
K
 
A
L
 
H
G
 
G
V
 
I
S
 
P
K
 
M
N
 
T
Q
 
E
I
 
L
I
 
Y
V
 
I
D
 
D
G
 
P
L
 
L
V
 
I
T
 
L
T
 
P
V
 
V
G
 
N
A
 
V
N
 
A
K
 
Q
N
 
E
A
 
H
A
 
A
L
 
V
E
 
E
T
 
V
L
 
L
E
 
E
T
 
T
I
 
I
R
 
R
Y
 
Q
C
 
I
K
 
K
-
 
L
-
 
M
E
 
A
D
 
N
L
 
P
K
 
A
L
 
P
C
 
R
T
 
T
T
 
V
M
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
S
N
 
N
I
 
V
S
 
S
F
 
Q
G
x
K
L
 
C
P
 
P
E
 
D
R
|
R
P
 
P
Y
 
L
V
 
I
N
 
N
G
 
R
A
 
T
F
 
Y
A
 
L
S
 
V
M
 
M
A
 
A
I
 
M
A
 
T
S
 
A
G
 
G
L
 
L
T
 
D
M
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
M
N
 
D
P
 
V
S
 
D
N
 
D
Q
 
D
L
 
A
L
 
L
M
 
V
G
 
D
I
 
A
S
 
A
F
 
A
A
 
T
S
 
A
D
 
H
L
 
I
L
 
L
R
 
L
N
 
N
K
 
K
E
 
E
G
 
I
S
 
Y
D
 
C
I
 
D
A
 
S
Y
 
Y
I
 
L
E
 
K
Q
 
T
I
 
F
Q
 
R
R
 
Q

4djfA Crystal structure of folate-bound corrinoid iron-sulfur protein (cfesp) in complex with its methyltransferase (metr), co-crystallized with folate and ti(iii) citrate reductant (see paper)
34% identity, 30% coverage: 319:565/823 of query aligns to 1:248/262 of 4djfA

query
sites
4djfA
F
 
M
L
 
L
V
 
I
I
 
I
G
 
G
E
|
E
R
 
R
I
 
I
N
 
N
P
 
G
T
x
M
G
x
F
-
 
G
-
 
D
-
 
I
K
 
K
K
 
R
K
 
A
L
 
I
Q
 
Q
E
 
E
E
 
R
L
 
D
R
 
P
A
 
A
G
 
P
K
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
-
V
 
V
E
 
Q
E
 
E
M
 
W
A
 
A
E
 
R
Q
 
R
Q
 
Q
E
 
E
E
 
E
M
 
G
G
 
G
A
 
A
H
 
R
I
 
A
L
 
L
D
 
D
I
 
L
N
 
N
M
 
V
G
 
G
T
 
P
N
 
A
G
 
V
I
 
Q
D
 
D
E
 
K
K
 
V
E
 
S
M
 
A
M
 
M
L
 
E
K
 
W
A
 
L
I
 
V
S
 
E
K
 
V
V
 
T
T
 
Q
M
 
E
V
 
V
S
 
S
S
 
N
L
 
L
P
 
T
L
 
L
C
 
C
I
 
L
D
|
D
T
 
S
S
 
T
Y
 
N
V
 
I
E
 
K
V
 
A
M
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
G
L
 
L
R
 
K
A
 
K
Y
 
C
P
 
K
G
 
N
R
 
R
A
 
A
L
 
M
I
 
I
N
|
N
S
 
S
I
 
T
S
 
N
L
 
A
E
 
E
T
 
R
E
 
E
K
 
K
I
 
V
E
 
E
K
 
K
L
 
L
L
 
F
P
 
P
L
 
L
A
 
A
K
 
V
K
 
E
Y
 
H
G
 
G
A
 
A
M
 
A
F
 
L
I
 
I
L
 
G
L
 
L
P
 
T
L
 
M
S
 
N
D
 
K
E
 
T
G
 
G
L
 
I
P
 
P
K
 
K
S
 
D
L
 
S
A
 
D
E
 
T
K
 
R
K
 
L
E
 
A
I
 
F
I
 
A
N
 
M
T
 
E
I
 
L
L
 
V
E
 
A
K
 
A
A
 
A
K
 
D
K
 
E
L
 
F
G
 
G
V
 
L
S
 
P
K
 
M
N
 
E
Q
 
D
I
 
L
I
 
Y
V
 
I
D
|
D
G
 
P
L
 
L
V
 
I
T
 
L
T
 
P
V
 
A
G
 
N
A
x
V
N
 
A
K
 
Q
N
 
D
A
 
H
A
 
A
L
 
P
E
 
E
T
 
V
L
 
L
E
 
K
T
 
T
I
 
L
R
 
Q
Y
 
Q
C
 
I
K
 
K
-
 
M
-
 
L
E
 
A
D
 
D
L
 
P
K
 
A
L
 
P
C
 
K
T
 
T
T
 
V
M
 
L
G
 
G
L
 
L
S
|
S
N
|
N
I
 
V
S
 
S
F
x
Q
G
x
N
L
 
C
P
 
Q
E
 
N
R
|
R
P
 
P
Y
 
L
V
 
I
N
 
N
G
 
R
A
 
T
F
 
F
A
 
L
S
 
A
M
 
M
A
 
A
I
 
M
A
 
A
S
 
C
G
|
G
L
 
L
T
x
D
M
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
A
N
 
D
P
 
A
S
 
C
N
 
D
Q
 
E
L
 
A
L
 
L
M
 
I
G
 
E
I
 
T
S
 
A
F
 
A
A
 
T
S
 
A
D
 
E
L
 
I
L
 
L
R
 
L
N
 
N
K
 
Q

4djeA Crystal structure of folate-bound corrinoid iron-sulfur protein (cfesp) in complex with its methyltransferase (metr), co-crystallized with folate (see paper)
34% identity, 30% coverage: 319:565/823 of query aligns to 1:248/262 of 4djeA

query
sites
4djeA
F
 
M
L
 
L
V
 
I
I
 
I
G
 
G
E
|
E
R
 
R
I
 
I
N
 
N
P
 
G
T
x
M
G
x
F
-
 
G
-
 
D
-
 
I
K
 
K
K
 
R
K
 
A
L
 
I
Q
 
Q
E
 
E
E
 
R
L
 
D
R
 
P
A
 
A
G
 
P
K
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
-
V
 
V
E
 
Q
E
 
E
M
 
W
A
 
A
E
 
R
Q
 
R
Q
 
Q
E
 
E
E
 
E
M
 
G
G
 
G
A
 
A
H
 
R
I
 
A
L
 
L
D
 
D
I
 
L
N
 
N
M
 
V
G
 
G
T
 
P
N
 
A
G
 
V
I
 
Q
D
 
D
E
 
K
K
 
V
E
 
S
M
 
A
M
 
M
L
 
E
K
 
W
A
 
L
I
 
V
S
 
E
K
 
V
V
 
T
T
 
Q
M
 
E
V
 
V
S
 
S
S
 
N
L
 
L
P
 
T
L
 
L
C
 
C
I
 
L
D
|
D
T
 
S
S
 
T
Y
 
N
V
 
I
E
 
K
V
 
A
M
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
G
L
 
L
R
 
K
A
 
K
Y
 
C
P
 
K
G
 
N
R
 
R
A
 
A
L
 
M
I
 
I
N
|
N
S
 
S
I
 
T
S
 
N
L
 
A
E
 
E
T
 
R
E
 
E
K
 
K
I
 
V
E
 
E
K
 
K
L
 
L
L
 
F
P
 
P
L
 
L
A
 
A
K
 
V
K
 
E
Y
 
H
G
 
G
A
 
A
M
 
A
F
 
L
I
 
I
L
 
G
L
 
L
P
 
T
L
 
M
S
 
N
D
 
K
E
 
T
G
 
G
L
 
I
P
 
P
K
 
K
S
 
D
L
 
S
A
 
D
E
 
T
K
 
R
K
 
L
E
 
A
I
 
F
I
 
A
N
 
M
T
 
E
I
 
L
L
 
V
E
 
A
K
 
A
A
 
A
K
 
D
K
 
E
L
 
F
G
 
G
V
 
L
S
 
P
K
 
M
N
 
E
Q
 
D
I
 
L
I
 
Y
V
 
I
D
|
D
G
 
P
L
 
L
V
 
I
T
 
L
T
 
P
V
 
A
G
 
N
A
x
V
N
 
A
K
 
Q
N
 
D
A
 
H
A
 
A
L
 
P
E
 
E
T
 
V
L
 
L
E
 
K
T
 
T
I
 
L
R
 
Q
Y
 
Q
C
 
I
K
 
K
-
 
M
-
 
L
E
 
A
D
 
D
L
 
P
K
 
A
L
 
P
C
 
K
T
 
T
T
 
V
M
 
L
G
|
G
L
 
L
S
|
S
N
|
N
I
 
V
S
 
S
F
 
Q
G
x
N
L
 
C
P
 
Q
E
 
N
R
|
R
P
 
P
Y
 
L
V
 
I
N
 
N
G
 
R
A
 
T
F
 
F
A
 
L
S
 
A
M
 
M
A
 
A
I
 
M
A
 
A
S
 
C
G
|
G
L
 
L
T
x
D
M
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
A
N
 
D
P
 
A
S
 
C
N
 
D
Q
 
E
L
 
A
L
 
L
M
 
I
G
 
E
I
 
T
S
 
A
F
 
A
A
 
T
S
 
A
D
 
E
L
 
I
L
 
L
R
 
L
N
 
N
K
 
Q

4djdA Crystal structure of folate-free corrinoid iron-sulfur protein (cfesp) in complex with its methyltransferase (metr) (see paper)
34% identity, 30% coverage: 319:565/823 of query aligns to 1:248/262 of 4djdA

query
sites
4djdA
F
 
M
L
 
L
V
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
I
N
 
N
P
 
G
T
 
M
G
 
F
-
 
G
-
 
D
-
 
I
K
 
K
K
 
R
K
 
A
L
 
I
Q
 
Q
E
 
E
E
 
R
L
 
D
R
 
P
A
 
A
G
 
P
K
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
-
V
 
V
E
 
Q
E
 
E
M
 
W
A
 
A
E
 
R
Q
 
R
Q
 
Q
E
 
E
E
 
E
M
 
G
G
 
G
A
 
A
H
 
R
I
 
A
L
 
L
D
 
D
I
 
L
N
 
N
M
 
V
G
 
G
T
 
P
N
 
A
G
 
V
I
 
Q
D
 
D
E
 
K
K
 
V
E
 
S
M
 
A
M
 
M
L
 
E
K
 
W
A
 
L
I
 
V
S
 
E
K
 
V
V
 
T
T
 
Q
M
 
E
V
 
V
S
 
S
S
 
N
L
 
L
P
 
T
L
 
L
C
 
C
I
 
L
D
 
D
T
 
S
S
 
T
Y
 
N
V
 
I
E
 
K
V
 
A
M
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
G
L
 
L
R
 
K
A
 
K
Y
 
C
P
 
K
G
 
N
R
 
R
A
 
A
L
 
M
I
 
I
N
 
N
S
 
S
I
 
T
S
 
N
L
 
A
E
 
E
T
 
R
E
 
E
K
 
K
I
 
V
E
 
E
K
 
K
L
 
L
L
 
F
P
 
P
L
 
L
A
 
A
K
 
V
K
 
E
Y
 
H
G
 
G
A
 
A
M
 
A
F
 
L
I
 
I
L
 
G
L
 
L
P
 
T
L
 
M
S
 
N
D
 
K
E
 
T
G
 
G
L
 
I
P
 
P
K
 
K
S
 
D
L
 
S
A
 
D
E
 
T
K
 
R
K
 
L
E
 
A
I
 
F
I
 
A
N
 
M
T
 
E
I
 
L
L
 
V
E
 
A
K
 
A
A
 
A
K
 
D
K
 
E
L
 
F
G
 
G
V
 
L
S
 
P
K
 
M
N
 
E
Q
 
D
I
 
L
I
 
Y
V
 
I
D
 
D
G
 
P
L
 
L
V
 
I
T
 
L
T
 
P
V
 
A
G
 
N
A
 
V
N
 
A
K
 
Q
N
 
D
A
 
H
A
 
A
L
 
P
E
 
E
T
 
V
L
 
L
E
 
K
T
 
T
I
 
L
R
 
Q
Y
 
Q
C
 
I
K
 
K
-
 
M
-
 
L
E
 
A
D
 
D
L
 
P
K
 
A
L
 
P
C
 
K
T
 
T
T
 
V
M
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
S
N
 
N
I
 
V
S
 
S
F
 
Q
G
 
N
L
 
C
P
 
Q
E
 
N
R
 
R
P
 
P
Y
 
L
V
 
I
N
 
N
G
 
R
A
 
T
F
 
F
A
 
L
S
 
A
M
 
M
A
 
A
I
 
M
A
 
A
S
 
C
G
|
G
L
 
L
T
x
D
M
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
A
N
 
D
P
 
A
S
 
C
N
 
D
Q
 
E
L
 
A
L
 
L
M
 
I
G
 
E
I
 
T
S
 
A
F
 
A
A
 
T
S
 
A
D
 
E
L
 
I
L
 
L
R
 
L
N
 
N
K
 
Q

2e7fA 5-methyltetrahydrofolate corrinoid/iron sulfur protein methyltransferase complexed with methyltetrahydrofolate to 2.2 angsrom resolution (see paper)
34% identity, 30% coverage: 319:565/823 of query aligns to 1:248/262 of 2e7fA

query
sites
2e7fA
F
 
M
L
 
L
V
 
I
I
 
I
G
 
G
E
|
E
R
 
R
I
 
I
N
 
N
P
 
G
T
x
M
G
x
F
-
 
G
-
 
D
-
 
I
K
 
K
K
 
R
K
 
A
L
 
I
Q
 
Q
E
 
E
E
 
R
L
 
D
R
 
P
A
 
A
G
 
P
K
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
-
V
 
V
E
 
Q
E
 
E
M
 
W
A
 
A
E
 
R
Q
 
R
Q
 
Q
E
 
E
E
 
E
M
 
G
G
 
G
A
 
A
H
 
R
I
 
A
L
 
L
D
 
D
I
 
L
N
 
N
M
 
V
G
 
G
T
 
P
N
 
A
G
 
V
I
 
Q
D
 
D
E
 
K
K
 
V
E
 
S
M
 
A
M
 
M
L
 
E
K
 
W
A
 
L
I
 
V
S
 
E
K
 
V
V
 
T
T
 
Q
M
 
E
V
 
V
S
 
S
S
 
N
L
 
L
P
 
T
L
 
L
C
 
C
I
 
L
D
|
D
T
 
S
S
 
T
Y
 
N
V
 
I
E
 
K
V
 
A
M
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
G
L
 
L
R
 
K
A
 
K
Y
 
C
P
 
K
G
 
N
R
 
R
A
 
A
L
 
M
I
 
I
N
|
N
S
 
S
I
 
T
S
 
N
L
 
A
E
 
E
T
 
R
E
 
E
K
 
K
I
 
V
E
 
E
K
 
K
L
 
L
L
 
F
P
 
P
L
 
L
A
 
A
K
 
V
K
 
E
Y
 
H
G
 
G
A
 
A
M
 
A
F
 
L
I
 
I
L
 
G
L
 
L
P
 
T
L
 
M
S
 
N
D
 
K
E
 
T
G
 
G
L
 
I
P
 
P
K
 
K
S
 
D
L
 
S
A
 
D
E
 
T
K
 
R
K
 
L
E
 
A
I
 
F
I
 
A
N
 
M
T
 
E
I
 
L
L
 
V
E
 
A
K
 
A
A
 
A
K
 
D
K
 
E
L
 
F
G
 
G
V
 
L
S
 
P
K
 
M
N
 
E
Q
 
D
I
 
L
I
 
Y
V
 
I
D
|
D
G
 
P
L
 
L
V
 
I
T
 
L
T
 
P
V
 
A
G
 
N
A
 
V
N
 
A
K
 
Q
N
 
D
A
 
H
A
 
A
L
 
P
E
 
E
T
 
V
L
 
L
E
 
K
T
 
T
I
 
L
R
 
Q
Y
 
Q
C
 
I
K
 
K
-
 
M
-
 
L
E
 
A
D
 
D
L
 
P
K
 
A
L
 
P
C
 
K
T
 
T
T
 
V
M
 
L
G
|
G
L
 
L
S
|
S
N
|
N
I
 
V
S
 
S
F
x
Q
G
 
N
L
 
C
P
 
Q
E
 
N
R
|
R
P
 
P
Y
 
L
V
 
I
N
 
N
G
 
R
A
 
T
F
 
F
A
 
L
S
 
A
M
 
M
A
 
A
I
 
M
A
 
A
S
 
C
G
|
G
L
 
L
T
x
D
M
 
A
A
 
A
I
|
I
A
 
A
N
 
D
P
 
A
S
 
C
N
 
D
Q
 
E
L
 
A
L
 
L
M
 
I
G
 
E
I
 
T
S
 
A
F
 
A
A
 
T
S
 
A
D
 
E
L
 
I
L
 
L
R
 
L
N
 
N
K
 
Q

Q46389 5-methyltetrahydrofolate:corrinoid/iron-sulfur protein co-methyltransferase; 5-methyltetrahydrofolate corrinoid/iron sulfur protein methyltransferase; MeTr; EC 2.1.1.258 from Moorella thermoacetica (Clostridium thermoaceticum) (see 2 papers)
34% identity, 30% coverage: 319:565/823 of query aligns to 1:248/262 of Q46389

query
sites
Q46389
F
 
M
L
 
L
V
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
I
N
 
N
P
 
G
T
 
M
G
 
F
-
 
G
-
 
D
-
 
I
K
 
K
K
 
R
K
 
A
L
 
I
Q
 
Q
E
 
E
E
 
R
L
 
D
R
 
P
A
 
A
G
 
P
K
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
-
V
 
V
E
 
Q
E
 
E
M
 
W
A
 
A
E
 
R
Q
 
R
Q
 
Q
E
 
E
E
 
E
M
 
G
G
 
G
A
 
A
H
 
R
I
 
A
L
 
L
D
 
D
I
 
L
N
 
N
M
 
V
G
 
G
T
 
P
N
 
A
G
 
V
I
 
Q
D
 
D
E
 
K
K
 
V
E
 
S
M
 
A
M
 
M
L
 
E
K
 
W
A
 
L
I
 
V
S
 
E
K
 
V
V
 
T
T
 
Q
M
 
E
V
 
V
S
 
S
S
 
N
L
 
L
P
 
T
L
 
L
C
 
C
I
 
L
D
 
D
T
 
S
S
 
T
Y
 
N
V
 
I
E
 
K
V
 
A
M
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
G
L
 
L
R
 
K
A
 
K
Y
 
C
P
 
K
G
 
N
R
 
R
A
 
A
L
 
M
I
 
I
N
|
N
S
 
S
I
 
T
S
 
N
L
 
A
E
 
E
T
 
R
E
 
E
K
 
K
I
 
V
E
 
E
K
 
K
L
 
L
L
 
F
P
 
P
L
 
L
A
 
A
K
 
V
K
 
E
Y
 
H
G
 
G
A
 
A
M
 
A
F
 
L
I
 
I
L
 
G
L
 
L
P
 
T
L
 
M
S
 
N
D
 
K
E
 
T
G
 
G
L
 
I
P
 
P
K
 
K
S
 
D
L
 
S
A
 
D
E
 
T
K
 
R
K
 
L
E
 
A
I
 
F
I
 
A
N
 
M
T
 
E
I
 
L
L
 
V
E
 
A
K
 
A
A
 
A
K
 
D
K
 
E
L
 
F
G
 
G
V
 
L
S
 
P
K
 
M
N
 
E
Q
 
D
I
 
L
I
 
Y
V
 
I
D
|
D
G
 
P
L
 
L
V
 
I
T
 
L
T
 
P
V
 
A
G
 
N
A
 
V
N
 
A
K
 
Q
N
 
D
A
 
H
A
 
A
L
 
P
E
 
E
T
 
V
L
 
L
E
 
K
T
 
T
I
 
L
R
 
Q
Y
 
Q
C
 
I
K
|
K
-
 
M
-
 
L
E
 
A
D
 
D
L
 
P
K
 
A
L
 
P
C
 
K
T
 
T
T
 
V
M
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
S
N
|
N
I
 
V
S
 
S
F
x
Q
G
 
N
L
 
C
P
 
Q
E
 
N
R
|
R
P
 
P
Y
 
L
V
 
I
N
 
N
G
 
R
A
 
T
F
 
F
A
 
L
S
 
A
M
 
M
A
 
A
I
 
M
A
 
A
S
 
C
G
|
G
L
 
L
T
x
D
M
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
A
N
 
D
P
 
A
S
 
C
N
 
D
Q
 
E
L
 
A
L
 
L
M
 
I
G
 
E
I
 
T
S
 
A
F
 
A
A
 
T
S
 
A
D
 
E
L
 
I
L
 
L
R
 
L
N
 
N
K
 
Q

3ivaA Structure of the b12-dependent methionine synthase (meth) c-teminal half with adohcy bound (see paper)
39% identity, 21% coverage: 623:796/823 of query aligns to 16:190/576 of 3ivaA

query
sites
3ivaA
A
 
S
V
 
L
L
 
V
K
 
K
G
 
G
N
 
I
K
 
T
D
 
E
G
 
F
I
 
I
V
 
E
D
 
Q
V
 
D
V
 
T
K
 
E
K
 
E
E
 
A
L
 
R
S
 
Q
K
 
Q
G
 
A
T
 
T
K
 
R
P
 
P
G
 
C
E
 
E
I
 
V
L
 
I
D
 
E
G
 
G
L
 
P
L
 
L
I
 
M
P
 
D
A
 
G
I
 
M
N
 
N
E
 
V
V
 
V
G
 
G
V
 
D
L
 
L
F
 
F
D
 
G
K
 
E
Q
 
G
K
 
K
Y
 
M
F
 
F
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
L
 
V
I
 
V
S
 
K
S
 
S
A
 
A
N
 
R
T
 
V
M
 
M
E
 
K
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
E
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
P
 
P
L
 
F
L
 
I
K
 
E
E
 
A
G
 
S
G
 
K
I
 
E
Q
 
Q
E
 
C
K
 
K
M
 
T
P
 
N
-
 
G
T
 
K
I
 
M
I
 
V
I
 
I
A
 
A
T
 
T
V
 
V
E
 
K
G
 
G
D
|
D
I
 
V
H
|
H
D
 
D
I
 
I
G
|
G
K
 
K
N
 
N
L
 
I
V
|
V
A
 
G
L
 
V
M
 
V
L
 
L
R
 
Q
N
 
C
Y
 
N
G
 
N
Y
 
Y
D
 
E
V
 
I
I
 
V
D
 
D
L
 
L
G
 
G
K
 
V
D
 
M
V
 
V
P
 
P
A
 
A
D
 
E
E
 
K
I
 
I
I
 
L
A
 
R
A
 
T
A
 
A
K
 
K
E
 
E
H
 
V
N
 
N
A
 
A
S
 
D
I
 
L
I
 
I
V
x
G
L
|
L
S
|
S
A
 
G
L
|
L
M
x
I
T
|
T
T
 
P
T
x
S
M
 
L
M
 
D
R
 
E
M
 
M
K
 
V
D
 
N
T
 
V
I
 
A
A
 
K
L
 
E
K
 
M
E
 
E
K
 
R
E
 
Q
H
 
G
L
 
F
D
 
T
V
 
I
K
 
P
V
 
L
M
 
L
I
 
I
G
|
G
G
|
G
A
 
A
V
 
T
T
 
T
T
 
S
Q
 
K
S
 
A

Sites not aligning to the query:

3bulA E. Coli i690c/g743c meth c-terminal fragment (649-1227) (see paper)
39% identity, 21% coverage: 623:796/823 of query aligns to 16:190/577 of 3bulA

query
sites
3bulA
A
 
S
V
 
L
L
 
V
K
 
K
G
 
G
N
 
I
K
 
T
D
 
E
G
 
F
I
 
I
V
 
E
D
 
Q
V
 
D
V
 
T
K
 
E
K
 
E
E
 
A
L
 
R
S
 
Q
K
 
Q
G
 
A
T
 
T
K
 
R
P
 
P
G
 
C
E
 
E
I
 
V
L
 
I
D
 
E
G
 
G
L
 
P
L
 
L
I
 
M
P
 
D
A
 
G
I
 
M
N
 
N
E
 
V
V
 
V
G
 
G
V
 
D
L
 
L
F
 
F
D
 
G
K
 
E
Q
 
G
K
 
K
Y
 
M
F
 
F
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
L
 
V
I
 
V
S
 
K
S
 
S
A
 
A
N
 
R
T
 
V
M
 
M
E
 
K
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
E
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
P
 
P
L
 
F
L
 
I
K
 
E
E
 
A
G
 
S
G
 
K
I
 
E
Q
 
Q
E
 
C
K
 
K
M
 
T
P
 
N
-
 
G
T
 
K
I
 
M
I
 
V
I
 
I
A
 
A
T
 
T
V
 
V
E
 
K
G
 
G
D
|
D
I
 
V
H
|
H
D
 
D
I
 
I
G
 
G
K
 
K
N
 
N
L
 
I
V
|
V
A
 
G
L
 
V
M
 
V
L
 
L
R
 
Q
N
 
C
Y
 
N
G
 
N
Y
 
Y
D
 
E
V
 
I
I
 
V
D
 
D
L
 
L
G
 
G
K
 
V
D
 
M
V
 
V
P
 
P
A
 
A
D
 
E
E
 
K
I
 
I
I
 
L
A
 
R
A
 
T
A
 
A
K
 
K
E
 
E
H
 
V
N
 
N
A
 
A
S
 
D
I
 
L
I
 
I
V
x
G
L
|
L
S
|
S
A
 
G
L
|
L
M
x
I
T
|
T
T
 
P
T
x
S
M
 
L
M
 
D
R
 
E
M
 
M
K
 
V
D
 
N
T
 
V
I
 
A
A
 
K
L
 
E
K
 
M
E
 
E
K
 
R
E
 
Q
H
 
G
L
 
F
D
 
T
V
 
I
K
 
P
V
 
L
M
 
L
I
 
I
G
|
G
G
|
G
A
 
A
V
 
T
T
 
T
T
 
S
Q
 
K
S
 
A

Sites not aligning to the query:

8sseA Methionine synthase, c-terminal fragment, cobalamin and reactivation domains from thermus thermophilus hb8 (see paper)
36% identity, 24% coverage: 624:820/823 of query aligns to 10:206/507 of 8sseA

query
sites
8sseA
V
 
V
L
 
V
K
 
E
G
 
G
N
 
R
K
 
K
D
 
Q
G
 
G
I
 
L
V
 
E
D
 
A
V
 
D
V
 
L
K
 
E
K
 
E
E
 
A
L
 
L
S
 
K
K
 
A
G
 
G
T
 
H
K
 
K
P
 
P
G
 
L
E
 
D
I
 
L
L
 
I
D
 
N
G
 
G
L
 
P
L
 
L
I
 
L
P
 
A
A
 
G
I
 
M
N
 
K
E
 
E
V
 
V
G
 
G
V
 
D
L
 
L
F
 
F
D
 
G
K
 
A
Q
 
G
K
 
K
Y
 
M
F
 
Q
L
 
L
P
 
P
Q
 
F
L
 
V
I
 
L
S
 
Q
S
 
A
A
 
A
N
 
E
T
 
V
M
 
M
E
 
K
Q
 
R
A
 
A
V
 
V
E
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
P
 
P
L
 
H
L
 
M
K
 
E
E
 
-
G
 
-
G
 
-
I
 
-
Q
 
K
E
 
E
K
 
G
M
 
K
P
 
G
T
 
T
I
 
L
I
 
V
I
 
L
A
 
A
T
 
T
V
 
V
E
 
K
G
 
G
D
 
D
I
 
V
H
|
H
D
 
D
I
 
I
G
|
G
K
 
K
N
 
N
L
 
L
V
|
V
A
 
D
L
 
I
M
 
I
L
 
L
R
 
S
N
 
N
Y
 
N
G
 
G
Y
 
Y
D
 
R
V
 
V
I
 
V
D
 
N
L
 
L
G
 
G
K
 
I
D
 
K
V
 
V
P
 
P
A
 
I
D
 
E
E
 
E
I
 
I
I
 
L
A
 
K
A
 
A
A
 
V
K
 
E
E
 
A
H
 
H
N
 
K
A
 
P
S
 
H
I
 
A
I
 
V
V
 
G
L
 
M
S
|
S
A
 
G
L
 
L
M
x
L
T
x
V
T
 
K
T
 
S
M
 
T
M
 
L
R
 
V
M
 
M
K
 
K
D
 
E
T
 
N
I
 
L
A
 
E
L
 
Y
K
 
M
E
 
R
K
 
D
E
 
R
H
 
G
L
 
Y
D
 
T
V
 
L
K
 
P
V
 
V
M
x
I
I
 
L
G
|
G
G
|
G
A
|
A
V
 
A
T
 
L
T
 
T
Q
 
R
S
 
S
F
 
Y
A
 
V
D
 
E
E
 
E
I
 
L
G
 
R
A
 
A
-
 
I
-
 
Y
-
 
P
-
 
N
D
 
V
G
 
Y
Y
 
Y
S
 
A
A
 
E
D
 
D
A
 
A
A
 
F
D
 
E
A
 
G
V
 
L
R
 
R
L
 
L
A
 
M
K
 
E
K
 
E
L
 
L

Sites not aligning to the query:

1bmtA How a protein binds b12: a 3.O angstrom x-ray structure of the b12- binding domains of methionine synthase (see paper)
36% identity, 24% coverage: 623:823/823 of query aligns to 16:223/246 of 1bmtA

query
sites
1bmtA
A
 
S
V
 
L
L
 
V
K
 
K
G
 
G
N
 
I
K
 
T
D
 
E
G
 
F
I
 
I
V
 
E
D
 
Q
V
 
D
V
 
T
K
 
E
K
 
E
E
 
A
L
 
R
S
 
Q
K
 
Q
G
 
A
T
 
T
K
 
R
P
 
P
G
 
I
E
 
E
I
 
V
L
 
I
D
x
E
G
 
G
L
 
P
L
 
L
I
x
M
P
 
D
A
 
G
I
x
M
N
 
N
E
 
V
V
 
V
G
|
G
V
 
D
L
 
L
F
 
F
D
 
G
K
 
E
Q
 
G
K
 
K
Y
 
M
F
 
F
L
|
L
P
 
P
Q
 
Q
L
x
V
I
 
V
S
 
K
S
 
S
A
 
A
N
 
R
T
 
V
M
 
M
E
 
K
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
E
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
P
 
P
L
 
F
L
 
I
K
 
E
E
 
A
G
 
S
G
 
K
I
 
E
Q
 
Q
E
 
G
K
 
K
M
 
T
P
 
N
-
 
G
T
 
K
I
 
M
I
 
V
I
 
I
A
 
A
T
 
T
V
 
V
E
 
K
G
 
G
D
|
D
I
x
V
H
|
H
D
|
D
I
|
I
G
 
G
K
 
K
N
 
N
L
x
I
V
 
V
A
 
G
L
 
V
M
 
V
L
 
L
R
 
Q
N
 
C
Y
 
N
G
 
N
Y
 
Y
D
 
E
V
 
I
I
 
V
D
 
D
L
 
L
G
 
G
K
 
V
D
 
M
V
 
V
P
 
P
A
 
A
D
 
E
E
 
K
I
 
I
I
 
L
A
 
R
A
 
T
A
 
A
K
 
K
E
 
E
H
 
V
N
 
N
A
 
A
S
 
D
I
 
L
I
 
I
V
x
G
L
|
L
S
|
S
A
 
G
L
|
L
M
x
I
T
|
T
T
 
P
T
x
S
M
 
L
M
 
D
R
 
E
M
 
M
K
 
V
D
 
N
T
 
V
I
 
A
A
 
K
L
 
E
K
 
M
E
 
E
K
 
R
E
 
Q
H
 
G
L
 
F
D
 
T
V
 
I
K
 
P
V
 
L
M
 
L
I
 
I
G
|
G
G
|
G
A
|
A
V
 
T
T
 
T
T
 
S
Q
 
K
S
 
A
F
 
H
A
 
T
-
 
A
-
 
V
-
 
K
-
 
I
-
 
E
-
 
Q
D
 
N
E
 
Y
I
 
S
G
 
G
A
 
P
D
 
T
G
 
V
Y
 
Y
S
x
V
A
 
Q
D
x
N
A
|
A
A
 
S
D
 
R
A
 
T
V
 
V
R
 
G
L
 
V
A
 
V
K
 
A
K
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
S
E
 
D

2i2xB Crystal structure of methanol:cobalamin methyltransferase complex mtabc from methanosarcina barkeri (see paper)
32% identity, 25% coverage: 619:822/823 of query aligns to 42:243/258 of 2i2xB

query
sites
2i2xB
P
 
P
V
 
I
F
 
A
E
 
K
A
 
A
V
 
I
L
 
F
K
 
E
G
 
G
N
 
E
K
 
E
D
 
D
G
 
D
I
 
V
V
 
V
D
 
E
V
 
G
V
 
L
K
 
Q
K
 
A
E
 
A
L
 
I
S
 
E
K
 
A
G
 
G
T
 
K
K
 
D
P
 
P
G
 
I
E
 
D
I
 
L
L
 
I
D
 
D
G
 
D
L
 
A
L
 
L
I
 
M
P
 
V
A
 
G
I
 
M
N
 
G
E
 
V
V
 
V
G
 
I
V
 
R
L
 
L
F
 
Y
D
 
D
K
 
E
Q
 
G
K
 
V
Y
 
I
F
 
F
L
 
L
P
 
P
Q
 
N
L
 
V
I
 
M
S
 
M
S
 
S
A
 
A
N
 
D
T
 
A
M
 
M
E
 
L
Q
 
E
A
 
G
V
 
I
E
 
E
Y
 
Y
L
 
C
E
 
K
P
 
E
L
 
-
L
 
-
K
 
N
E
 
S
G
 
G
G
 
A
I
 
T
Q
 
P
E
 
K
K
 
T
M
 
K
P
 
G
T
 
T
I
 
V
I
 
V
I
 
C
A
 
H
T
 
V
V
 
A
E
 
E
G
|
G
D
|
D
I
x
V
H
|
H
D
|
D
I
|
I
G
|
G
K
 
K
N
 
N
L
 
I
V
|
V
A
 
T
L
 
A
M
 
L
L
 
L
R
 
R
N
 
A
Y
 
N
G
 
G
Y
 
Y
D
 
N
V
 
V
I
 
V
D
 
D
L
 
L
G
 
G
K
 
R
D
 
D
V
 
V
P
 
P
A
 
A
D
 
E
E
 
E
I
 
V
I
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
V
K
 
Q
E
 
K
H
 
E
N
 
K
A
 
P
S
 
I
I
 
M
I
 
L
V
x
T
L
 
G
S
x
T
A
 
A
L
|
L
M
|
M
T
|
T
T
 
T
T
|
T
M
 
M
M
 
Y
R
 
A
M
 
F
K
 
K
D
 
E
T
 
V
I
 
N
A
 
D
L
 
M
K
 
L
E
 
L
K
 
E
E
 
N
H
 
G
L
 
I
D
 
K
V
 
I
K
 
P
V
 
F
M
x
A
I
 
C
G
|
G
G
|
G
A
x
G
V
 
A
T
 
V
T
 
N
Q
 
Q
S
 
D
F
 
F
A
 
V
D
 
S
E
 
Q
I
 
F
G
 
A
A
 
L
D
 
G
G
 
V
Y
 
Y
S
x
G
A
x
E
D
x
E
A
|
A
A
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
P
R
 
K
L
 
I
A
 
A
K
 
D
K
 
A
L
 
I
L
 
I
A
 
A

Q46EH4 Methanol--corrinoid protein; Methanol:corrinoid methyltransferase 1 subunit of 27 kDa; MT1 subunit 27 kDa from Methanosarcina barkeri (strain Fusaro / DSM 804) (see paper)
32% identity, 25% coverage: 619:822/823 of query aligns to 42:243/258 of Q46EH4

query
sites
Q46EH4
P
 
P
V
 
I
F
 
A
E
 
K
A
 
A
V
 
I
L
 
F
K
 
E
G
 
G
N
 
E
K
 
E
D
 
D
G
 
D
I
 
V
V
 
V
D
 
E
V
 
G
V
 
L
K
 
Q
K
 
A
E
 
A
L
 
I
S
 
E
K
 
A
G
 
G
T
 
K
K
 
D
P
 
P
G
 
I
E
 
D
I
 
L
L
 
I
D
 
D
G
 
D
L
 
A
L
 
L
I
 
M
P
 
V
A
 
G
I
 
M
N
 
G
E
 
V
V
 
V
G
 
I
V
 
R
L
 
L
F
 
Y
D
 
D
K
 
E
Q
 
G
K
 
V
Y
 
I
F
 
F
L
 
L
P
 
P
Q
 
N
L
 
V
I
 
M
S
 
M
S
 
S
A
 
A
N
 
D
T
 
A
M
 
M
E
 
L
Q
 
E
A
 
G
V
 
I
E
 
E
Y
 
Y
L
 
C
E
 
K
P
 
E
L
 
-
L
 
-
K
 
N
E
 
S
G
 
G
G
 
A
I
 
T
Q
 
P
E
 
K
K
 
T
M
 
K
P
 
G
T
 
T
I
 
V
I
 
V
I
 
C
A
x
H
T
 
V
V
 
A
E
 
E
G
 
G
D
 
D
I
 
V
H
|
H
D
 
D
I
 
I
G
 
G
K
 
K
N
 
N
L
 
I
V
 
V
A
 
T
L
 
A
M
 
L
L
 
L
R
 
R
N
 
A
Y
 
N
G
 
G
Y
 
Y
D
 
N
V
 
V
I
 
V
D
 
D
L
 
L
G
 
G
K
 
R
D
 
D
V
 
V
P
 
P
A
 
A
D
 
E
E
 
E
I
 
V
I
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
V
K
 
Q
E
 
K
H
 
E
N
 
K
A
 
P
S
 
I
I
 
M
I
 
L
V
 
T
L
 
G
S
 
T
A
 
A
L
 
L
M
 
M
T
 
T
T
 
T
T
 
T
M
 
M
M
 
Y
R
 
A
M
 
F
K
 
K
D
 
E
T
 
V
I
 
N
A
 
D
L
 
M
K
 
L
E
 
L
K
 
E
E
 
N
H
 
G
L
 
I
D
 
K
V
 
I
K
 
P
V
 
F
M
 
A
I
 
C
G
 
G
G
 
G
A
 
G
V
 
A
T
 
V
T
 
N
Q
 
Q
S
 
D
F
 
F
A
 
V
D
 
S
E
 
Q
I
 
F
G
 
A
A
 
L
D
 
G
G
 
V
Y
 
Y
S
 
G
A
 
E
D
 
E
A
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
P
R
 
K
L
 
I
A
 
A
K
 
D
K
 
A
L
 
I
L
 
I
A
 
A

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_005346648.1 NCBI__GCF_000173975.1:WP_005346648.1
MKTEELYTMIQQKPVILDGATGSNLQKVGMKPGVCPEEWILENEDKLIDLQKSFVEAGTN
ILYAPTFSGNRVKLEEYGLADRAEEINKRLVGLSKRAAGDKALVAGDMTMTGVALEPVGP
MKLEALINIYKEQAKYLLEAGVDLFVVETMMSLAETRAAVIAIKEVCNLPVIASLTFQED
GRTLYGTDPVTAVVVLQSIGADIIGVNCSTGPGEMIPVIKKMKEYAEVPILAKPNAGLPV
LEDGVTVYPMTPEEFASWGPAFIEAGAGLIGGCCGSTPEHIRMLTEKVSGLTTKAPCNIH
PIMLASERKSQEIALDGKFLVIGERINPTGKKKLQEELRAGKLDLVEEMAEQQEEMGAHI
LDINMGTNGIDEKEMMLKAISKVTMVSSLPLCIDTSYVEVMEAALRAYPGRALINSISLE
TEKIEKLLPLAKKYGAMFILLPLSDEGLPKSLAEKKEIINTILEKAKKLGVSKNQIIVDG
LVTTVGANKNAALETLETIRYCKEDLKLCTTMGLSNISFGLPERPYVNGAFASMAIASGL
TMAIANPSNQLLMGISFASDLLRNKEGSDIAYIEQIQRMEPLKEAAIAKAAKTAGNGEKQ
PNEKNAAVGEADGNIKKNPVFEAVLKGNKDGIVDVVKKELSKGTKPGEILDGLLIPAINE
VGVLFDKQKYFLPQLISSANTMEQAVEYLEPLLKEGGIQEKMPTIIIATVEGDIHDIGKN
LVALMLRNYGYDVIDLGKDVPADEIIAAAKEHNASIIVLSALMTTTMMRMKDTIALKEKE
HLDVKVMIGGAVTTQSFADEIGADGYSADAADAVRLAKKLLAE

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory