SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_005456138.1 NCBI__GCF_000244975.1:WP_005456138.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
39% identity, 96% coverage: 6:251/255 of query aligns to 5:241/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
L
 
L
T
 
Q
G
 
D
R
 
K
V
 
V
V
 
A
L
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
A
R
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
A
 
E
T
 
A
A
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
F
A
 
M
G
 
K
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
K
V
 
V
L
 
V
V
 
I
V
 
A
D
|
D
L
x
F
A
 
N
D
 
E
P
 
A
V
 
A
D
 
G
V
 
K
A
 
E
S
 
A
A
 
V
L
 
-
R
 
-
E
 
E
E
 
A
F
 
N
P
 
P
G
 
G
Q
 
V
R
 
V
F
 
F
A
 
I
S
 
-
R
 
-
R
 
R
V
|
V
D
|
D
V
|
V
R
 
S
D
 
D
E
 
R
D
 
E
D
 
S
V
 
V
R
 
H
R
 
R
S
 
L
V
 
V
D
 
E
E
 
N
L
 
V
V
 
A
D
 
E
G
 
R
F
 
F
G
 
G
R
 
K
I
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
T
x
I
A
 
T
S
 
R
R
x
D
S
 
S
G
 
M
L
 
L
D
 
S
T
x
K
L
 
M
T
 
T
E
 
V
P
 
D
E
 
Q
W
 
F
Y
 
Q
R
 
Q
D
 
V
L
 
I
D
 
N
T
 
V
N
|
N
L
 
L
R
 
T
G
 
G
T
 
V
F
 
F
L
 
-
Y
 
H
C
 
C
R
 
T
A
 
Q
A
 
A
V
 
V
H
 
L
P
 
P
H
 
Y
M
 
M
A
 
A
G
 
E
Q
 
Q
G
 
G
S
 
K
G
 
G
R
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
x
T
S
 
S
S
|
S
I
 
V
S
 
T
G
 
G
I
 
T
M
 
Y
G
 
G
G
x
N
P
x
V
R
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
G
 
-
G
 
G
R
x
Q
S
 
T
G
 
N
P
 
-
A
 
-
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
A
 
G
L
 
M
T
 
T
K
 
K
W
 
T
L
 
W
A
 
A
K
 
K
E
 
E
V
 
L
G
 
A
P
 
R
Y
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
N
C
 
V
N
 
N
S
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
P
x
F
I
x
T
A
 
E
T
|
T
A
 
A
L
x
M
T
 
V
S
 
A
N
 
E
V
 
V
T
 
P
Y
 
E
A
 
K
L
 
V
D
 
I
D
 
E
Q
x
K
V
 
M
-
 
K
-
 
A
-
 
Q
-
 
V
-
 
P
I
 
M
K
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
D
V
 
I
G
 
A
A
 
N
A
 
A
V
 
Y
A
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
H
G
 
E
A
 
S
A
 
D
Y
 
Y
V
 
V
T
 
N
G
 
G
Q
 
H
V
 
V
L
 
L
S
 
H
V
 
V
C
 
D
G
 
G
G
 
G

P73574 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; EC 1.1.1.100 from Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa) (see paper)
43% identity, 96% coverage: 6:251/255 of query aligns to 4:243/247 of P73574

query
sites
P73574
L
 
L
T
 
T
G
 
A
R
 
Q
V
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
x
A
A
 
S
R
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
K
A
 
A
T
 
T
A
 
A
R
 
L
V
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
A
Q
 
T
G
 
G
A
 
M
D
 
K
V
 
V
L
 
-
V
 
V
V
 
V
D
 
N
L
 
Y
A
 
A
D
 
Q
P
 
S
V
 
S
D
 
T
V
 
A
A
 
A
S
 
D
A
 
A
L
 
V
R
 
V
E
 
A
E
 
E
F
 
I
-
 
I
-
 
A
P
 
N
G
 
G
Q
 
G
R
 
E
F
 
A
A
 
I
S
 
A
R
 
V
R
 
Q
V
 
A
D
 
N
V
 
V
R
 
A
D
 
N
E
 
A
D
 
D
D
 
E
V
 
V
R
 
D
R
 
Q
S
 
L
V
 
I
D
 
K
E
 
T
L
 
T
V
 
L
D
 
D
G
 
K
F
 
F
G
 
S
R
 
R
I
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
T
 
I
A
 
T
S
 
R
R
 
D
S
 
T
G
 
L
L
 
L
D
 
L
T
 
R
L
 
M
T
 
K
E
 
L
P
 
E
E
 
D
W
 
W
Y
 
Q
R
 
A
D
 
V
L
 
I
D
 
D
T
 
L
N
 
N
L
 
L
R
 
T
G
 
G
T
 
V
F
 
F
L
 
L
Y
 
-
C
 
C
R
 
T
A
 
K
A
 
A
V
 
V
H
 
S
P
 
K
H
 
L
M
 
M
A
 
L
G
 
K
Q
 
Q
G
 
K
S
 
S
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
I
S
 
T
S
 
S
I
 
V
S
 
A
G
 
G
I
 
M
M
 
M
G
 
G
G
 
N
P
|
P
R
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
G
 
-
G
 
G
R
 
Q
S
 
A
G
 
N
P
 
-
A
 
-
Y
 
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
A
 
G
L
 
F
T
 
T
K
 
K
W
 
T
L
 
V
A
 
A
K
 
K
E
 
E
V
 
L
G
 
A
P
 
S
Y
 
R
G
 
G
I
 
V
T
 
T
C
 
V
N
 
N
S
 
A
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
P
x
F
I
 
I
A
 
A
T
 
T
A
 
D
L
 
M
T
 
T
S
 
E
N
 
N
V
 
L
T
x
N
Y
 
A
A
 
E
L
 
P
D
 
I
D
 
L
Q
 
Q
V
 
F
I
 
I
-
 
P
-
 
L
K
 
A
R
 
R
M
 
Y
G
 
G
T
 
Q
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
V
G
 
A
A
 
G
A
 
T
V
 
I
A
 
R
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
T
-
 
D
P
 
P
G
 
A
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
V
 
T
L
 
F
S
 
N
V
 
V
C
 
D
G
 
G
G
 
G

Q9KJF1 (2S)-[(R)-hydroxy(phenyl)methyl]succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; (S,R)-2-(alpha-hydroxybenzyl)succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; EC 1.1.1.429 from Thauera aromatica (see 2 papers)
37% identity, 98% coverage: 6:254/255 of query aligns to 3:245/248 of Q9KJF1

query
sites
Q9KJF1
L
 
I
T
 
Q
G
 
N
R
 
R
V
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
S
A
 
A
R
x
S
G
 
G
I
 
M
G
 
G
A
 
K
A
 
Q
T
 
T
A
 
A
R
 
L
V
 
R
L
 
F
A
 
A
G
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
D
 
A
V
 
V
L
 
V
V
 
I
V
 
N
D
|
D
L
 
I
A
 
-
D
 
-
P
 
D
V
 
A
D
 
E
V
 
K
A
 
V
S
 
R
A
 
A
L
 
T
R
 
V
E
 
D
E
 
E
F
 
F
P
 
S
-
 
A
-
 
R
G
 
G
Q
 
H
R
 
R
F
 
V
A
 
L
S
 
G
R
 
A
R
 
V
V
 
A
D
|
D
V
x
I
R
 
G
D
 
N
E
 
K
D
 
A
D
 
A
V
 
V
R
 
D
R
 
G
S
 
M
V
 
V
D
 
K
E
 
Q
L
 
T
V
 
I
D
 
D
G
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
T
 
M
A
 
E
S
 
R
R
 
A
S
 
G
G
 
A
L
 
L
D
 
R
T
 
K
L
 
L
T
 
S
E
 
E
P
 
A
E
 
D
W
 
W
Y
 
D
R
 
V
D
 
T
L
 
I
D
 
N
T
 
V
N
 
N
L
 
L
R
 
K
G
 
G
T
 
T
F
 
F
L
 
L
Y
 
-
C
 
C
R
 
T
A
 
Q
A
 
A
V
 
V
H
 
H
P
 
G
H
 
H
M
 
M
A
 
V
G
 
E
Q
 
N
G
 
K
S
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
 
I
S
 
A
S
 
S
I
 
R
S
 
A
G
 
W
I
 
L
M
 
-
G
 
-
G
 
-
P
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
G
 
G
G
 
G
R
 
A
S
 
G
G
 
Q
P
 
T
A
 
P
Y
|
Y
A
 
S
A
 
S
S
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
V
A
 
G
L
 
M
T
 
T
K
 
R
W
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
I
E
 
E
V
 
L
G
 
G
P
 
R
Y
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
C
 
V
N
 
N
S
 
C
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
L
I
 
I
A
 
H
T
 
T
A
 
P
L
 
M
T
 
W
S
 
D
N
 
E
V
 
L
-
 
P
-
 
E
-
 
K
-
 
D
-
 
Q
T
 
Q
Y
 
F
A
 
L
L
 
L
D
 
S
D
 
R
Q
 
Q
V
 
P
I
 
T
K
 
G
R
 
K
M
 
L
G
 
G
T
 
E
P
 
P
E
 
D
E
 
D
V
 
I
G
 
A
A
 
N
A
 
T
V
 
L
A
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
D
P
 
D
G
 
D
A
 
S
A
 
G
Y
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
S
 
Y
V
 
V
C
 
C
G
 
G
G
 
G
A
 
R
A
 
S
I
 
L

Sites not aligning to the query:

7pcsB Structure of the heterotetrameric sdr family member bbscd (see paper)
37% identity, 98% coverage: 6:254/255 of query aligns to 2:244/247 of 7pcsB

query
sites
7pcsB
L
 
I
T
 
Q
G
 
N
R
 
R
V
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
S
A
 
A
R
 
S
G
 
G
I
x
M
G
 
G
A
 
K
A
 
Q
T
 
T
A
 
A
R
 
L
V
 
R
L
 
F
A
 
A
G
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
D
 
A
V
 
V
L
 
V
V
 
I
V
 
N
D
|
D
L
x
I
A
 
-
D
 
-
P
 
D
V
 
A
D
 
E
V
 
K
A
 
V
S
 
R
A
 
A
L
 
T
R
 
V
E
 
D
E
 
E
F
 
F
P
 
S
-
 
A
-
 
R
G
 
G
Q
 
H
R
 
R
F
 
V
A
 
L
S
 
G
R
 
A
R
 
V
V
 
A
D
 
D
V
x
I
R
 
G
D
 
N
E
 
K
D
 
A
D
 
A
V
 
V
R
 
D
R
 
G
S
 
M
V
 
V
D
 
K
E
 
Q
L
 
T
V
 
I
D
 
D
G
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
T
 
M
A
 
E
S
 
R
R
 
A
S
 
G
G
 
A
L
 
L
D
 
R
T
 
K
L
 
L
T
 
S
E
 
E
P
 
A
E
 
D
W
 
W
Y
 
D
R
 
V
D
 
T
L
 
I
D
 
N
T
 
V
N
 
N
L
 
L
R
 
K
G
 
G
T
 
T
F
 
F
L
 
L
Y
 
-
C
 
C
R
 
T
A
 
Q
A
 
A
V
 
V
H
 
H
P
 
G
H
 
H
M
 
M
A
 
V
G
 
E
Q
 
N
G
 
K
S
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
x
I
S
 
A
S
|
S
I
 
R
S
 
A
G
 
W
I
 
L
M
 
-
G
 
-
G
 
-
P
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
G
 
G
G
 
G
R
 
A
S
 
G
G
 
Q
P
 
T
A
 
P
Y
|
Y
A
 
S
A
 
S
S
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
V
A
 
G
L
 
M
T
 
T
K
 
R
W
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
I
E
 
E
V
 
L
G
 
G
P
 
R
Y
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
C
 
V
N
 
N
S
 
C
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
L
I
|
I
A
 
H
T
 
T
A
 
P
L
 
M
T
 
W
S
 
D
N
 
E
V
 
L
-
 
P
-
 
E
-
 
K
-
 
D
-
 
Q
T
 
Q
Y
 
F
A
 
L
L
 
L
D
 
S
D
 
R
Q
 
Q
V
 
P
I
 
T
K
 
G
R
 
K
M
 
L
G
 
G
T
 
E
P
 
P
E
 
D
E
 
D
V
 
I
G
 
A
A
 
N
A
 
T
V
 
L
A
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
D
P
 
D
G
 
D
A
 
S
A
 
G
Y
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
S
 
Y
V
 
V
C
 
C
G
 
G
G
 
G
A
 
R
A
 
S
I
 
L

3osuA Crystal structure of the 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase, fabg, from staphylococcus aureus
40% identity, 94% coverage: 12:251/255 of query aligns to 8:243/246 of 3osuA

query
sites
3osuA
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
A
 
S
R
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
A
 
R
A
 
S
T
 
I
A
 
A
R
 
L
V
 
Q
L
 
L
A
 
A
G
 
E
Q
 
E
G
 
G
A
 
Y
D
 
N
V
 
V
L
 
-
V
 
A
V
 
V
D
 
N
L
 
Y
A
 
A
D
 
G
P
 
S
V
 
K
D
 
E
V
 
K
A
 
A
S
 
E
A
 
A
L
 
V
R
 
V
E
 
E
E
 
E
F
 
I
P
 
K
G
 
A
Q
 
K
-
 
G
-
 
V
-
 
D
R
 
S
F
 
F
A
 
A
S
 
I
R
 
Q
R
 
-
V
 
A
D
 
N
V
 
V
R
 
A
D
 
D
E
 
A
D
 
D
D
 
E
V
 
V
R
 
K
R
 
A
S
 
M
V
 
I
D
 
K
E
 
E
L
 
V
V
 
V
D
 
S
G
 
Q
F
 
F
G
 
G
R
 
S
I
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
T
 
I
A
 
T
S
 
R
R
 
D
S
 
N
G
 
L
L
 
L
D
 
M
T
 
R
L
 
M
T
 
K
E
 
E
P
 
Q
E
 
E
W
 
W
Y
 
D
R
 
D
D
 
V
L
 
I
D
 
D
T
 
T
N
 
N
L
 
L
R
 
K
G
 
G
T
 
V
F
 
F
L
 
-
Y
 
N
C
 
C
R
 
I
A
 
Q
A
 
K
V
 
A
H
 
T
P
 
P
H
 
Q
M
 
M
A
 
L
G
 
R
Q
 
Q
G
 
R
S
 
S
G
 
G
R
 
A
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
L
S
 
S
S
|
S
I
 
V
S
 
V
G
 
G
I
 
A
M
 
V
G
 
G
G
 
N
P
 
P
R
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
G
E
x
Q
G
 
A
G
 
N
G
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
P
 
-
A
 
-
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
S
 
T
K
|
K
G
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
A
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
W
 
S
L
 
A
A
 
A
K
 
R
E
 
E
V
 
L
G
 
A
P
 
S
Y
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
C
 
V
N
 
N
S
 
A
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
F
I
 
I
A
 
V
T
 
S
A
 
D
L
 
M
T
 
T
S
 
D
N
 
A
V
 
L
T
 
S
Y
 
D
A
 
E
L
 
L
D
 
K
D
 
E
Q
 
Q
V
 
M
I
 
L
K
 
T
-
 
Q
-
 
I
-
 
P
-
 
L
-
 
A
R
 
R
M
 
F
G
 
G
T
 
Q
P
 
D
E
 
T
E
 
D
V
 
I
G
 
A
A
 
N
A
 
T
V
 
V
A
 
A
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
D
G
 
K
A
 
A
A
 
K
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
V
 
T
L
 
I
S
 
H
V
 
V
C
 
N
G
 
G
G
 
G

3sj7A Structure of beta-ketoacetyl-coa reductase (fabg) from staphylococcus aureus complex with NADPH (see paper)
40% identity, 94% coverage: 12:251/255 of query aligns to 5:236/239 of 3sj7A

query
sites
3sj7A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
x
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
A
 
S
T
 
I
A
 
A
R
 
L
V
 
Q
L
 
L
A
 
A
G
 
E
Q
 
E
G
 
G
A
 
Y
D
 
N
V
 
V
L
 
-
V
 
A
V
 
V
D
x
N
L
x
Y
A
|
A
D
x
G
P
x
S
V
 
K
D
 
E
V
 
K
A
 
A
S
 
E
A
 
A
L
 
V
R
 
V
E
 
E
E
 
E
F
 
I
P
 
K
G
 
A
Q
 
K
-
 
G
-
 
V
-
 
D
R
 
S
F
 
F
A
 
A
S
 
I
R
 
Q
R
 
-
V
x
A
D
x
N
V
|
V
R
 
A
D
 
D
E
 
A
D
 
D
D
 
E
V
 
V
R
 
K
R
 
A
S
 
M
V
 
I
D
 
K
E
 
E
L
 
V
V
 
V
D
 
S
G
 
Q
F
 
F
G
 
G
R
 
S
I
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
T
 
I
A
 
T
S
 
R
R
 
D
S
 
N
G
 
L
L
 
L
D
 
M
T
 
R
L
 
M
T
 
K
E
 
E
P
 
Q
E
 
E
W
 
W
Y
 
D
R
 
D
D
 
V
L
 
I
D
 
D
T
|
T
N
 
N
L
 
L
R
 
K
G
 
G
T
 
V
F
 
F
L
 
-
Y
 
N
C
 
C
R
 
I
A
 
Q
A
 
K
V
 
A
H
 
T
P
 
P
H
 
Q
M
 
M
A
 
L
G
 
R
Q
 
Q
G
 
R
S
 
S
G
 
G
R
 
A
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
L
S
 
S
S
|
S
I
 
V
S
 
V
G
 
G
I
 
A
M
 
V
G
 
G
G
 
N
P
 
P
R
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
G
 
-
G
 
G
R
x
Q
S
 
A
G
 
N
P
 
-
A
 
-
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
S
 
T
K
|
K
G
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
A
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
W
 
S
L
 
A
A
 
A
K
 
R
E
 
E
V
 
L
G
 
A
P
 
S
Y
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
C
 
V
N
 
N
S
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
P
 
F
I
 
I
A
 
V
T
 
S
A
 
D
L
 
M
T
 
T
S
 
D
N
 
E
V
 
L
T
 
K
Y
 
E
A
 
Q
L
 
M
D
 
L
D
 
T
Q
 
Q
V
 
I
-
 
P
I
 
L
K
 
A
R
 
R
M
 
F
G
 
G
T
 
Q
P
 
D
E
 
T
E
 
D
V
 
I
G
 
A
A
 
N
A
 
T
V
 
V
A
 
A
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
D
G
 
K
A
 
A
A
 
K
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
V
 
T
L
 
I
S
 
H
V
 
V
C
 
N
G
 
G
G
 
G

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
37% identity, 96% coverage: 6:251/255 of query aligns to 3:244/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
L
 
L
T
 
Q
G
 
G
R
 
K
V
 
V
V
 
A
L
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
x
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
A
 
D
T
 
I
A
 
A
R
 
I
V
 
N
L
 
L
A
 
A
G
 
K
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
N
V
 
I
L
 
F
V
 
F
V
x
N
D
x
Y
L
x
N
A
x
G
D
x
S
P
 
P
V
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
E
D
 
E
V
 
T
A
 
A
S
 
K
A
 
L
L
 
V
R
 
A
E
 
E
E
 
H
F
 
-
P
 
-
G
 
G
Q
 
V
R
 
E
F
 
V
A
 
E
S
 
A
R
 
M
R
 
K
V
 
A
D
x
N
V
|
V
R
 
A
D
 
I
E
 
A
D
 
E
D
 
D
V
 
V
R
 
D
R
 
A
S
 
F
V
 
F
D
 
K
E
 
Q
L
 
A
V
 
I
D
 
E
G
 
R
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
T
x
I
A
 
T
S
 
R
R
 
D
S
 
N
G
 
L
L
 
L
D
 
M
T
 
R
L
 
M
T
 
K
E
 
E
P
 
D
E
 
E
W
 
W
Y
 
D
R
 
D
D
 
V
L
 
I
D
 
N
T
x
I
N
 
N
L
 
L
R
 
K
G
 
G
T
 
T
F
 
F
L
 
L
Y
 
-
C
 
C
R
 
T
A
 
K
A
 
A
V
 
V
H
 
S
P
 
R
H
 
T
M
 
M
A
 
M
G
 
K
Q
 
Q
G
 
R
S
 
A
G
 
G
R
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
M
S
 
A
S
|
S
I
 
V
S
 
V
G
 
G
I
 
L
M
 
I
G
 
G
G
 
-
P
 
-
R
 
-
S
 
N
G
 
A
G
 
G
E
x
Q
G
 
A
G
 
N
G
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
P
 
-
A
 
-
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
A
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
W
 
T
L
 
T
A
 
A
K
 
R
E
 
E
V
 
L
G
 
A
P
 
P
Y
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
N
C
 
V
N
 
N
S
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
P
 
F
I
|
I
A
 
T
T
|
T
A
 
D
L
 
M
T
 
T
S
 
D
N
 
K
V
 
L
T
 
D
Y
 
E
A
 
K
L
 
T
D
 
K
D
 
E
Q
 
A
V
 
M
I
 
L
K
 
A
R
 
Q
M
 
I
-
 
P
-
 
L
-
 
G
-
 
A
-
 
Y
G
 
G
T
 
T
P
 
T
E
 
E
E
 
D
V
 
I
G
 
A
A
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
D
G
 
A
A
 
S
A
 
K
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
V
 
T
L
 
L
S
 
S
V
 
V
C
 
D
G
 
G
G
 
G

3op4A Crystal structure of putative 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase from vibrio cholerae o1 biovar eltor str. N16961 in complex with NADP+ (see paper)
38% identity, 97% coverage: 4:251/255 of query aligns to 4:243/247 of 3op4A

query
sites
3op4A
F
 
M
D
 
N
L
 
L
T
 
E
G
 
G
R
 
K
V
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
x
S
R
|
R
G
 
G
I
|
I
G
 
G
A
 
K
A
 
A
T
 
I
A
 
A
R
 
E
V
 
L
L
 
L
A
 
A
G
 
E
Q
 
R
G
 
G
A
 
A
D
 
K
V
 
V
L
 
-
V
 
-
V
 
I
D
 
G
L
 
T
A
 
A
D
x
T
P
 
S
V
 
E
D
 
S
V
 
G
A
 
A
S
 
Q
A
 
A
L
 
I
R
 
-
E
 
S
E
 
D
F
 
Y
P
 
L
G
 
G
Q
 
D
R
 
N
F
 
G
A
 
K
S
 
G
R
 
M
R
 
A
V
 
L
D
x
N
V
|
V
R
 
T
D
 
N
E
 
P
D
 
E
D
 
S
V
 
I
R
 
E
R
 
A
S
 
V
V
 
L
D
 
K
E
 
A
L
 
I
V
 
T
D
 
D
G
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
G
I
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
T
x
I
A
 
T
S
 
R
R
 
D
S
 
N
G
 
L
L
 
L
D
 
M
T
 
R
L
 
M
T
 
K
E
 
E
P
 
E
E
 
E
W
 
W
Y
 
S
R
 
D
D
 
I
L
 
M
D
 
E
T
 
T
N
 
N
L
 
L
R
 
T
G
 
S
T
 
I
F
 
F
L
 
R
Y
 
L
C
 
S
R
 
K
A
 
A
A
 
V
V
 
L
H
 
R
P
 
G
H
 
M
M
 
M
A
 
K
G
 
K
Q
 
R
G
 
-
S
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
|
V
S
 
G
S
|
S
I
 
V
S
 
V
G
 
G
I
 
T
M
 
M
G
 
G
G
 
-
P
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
N
S
 
A
G
 
G
P
 
Q
A
 
A
-
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
A
 
G
L
 
F
T
 
T
K
 
K
W
 
S
L
 
M
A
 
A
K
 
R
E
 
E
V
 
V
G
 
A
P
 
S
Y
 
R
G
 
G
I
 
V
T
 
T
C
 
V
N
 
N
S
 
T
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
P
 
F
I
|
I
A
 
E
T
|
T
A
 
-
L
 
-
T
 
-
S
 
-
N
 
D
V
x
M
T
 
T
Y
 
K
A
 
A
L
 
L
D
 
N
D
 
D
Q
 
E
V
 
Q
I
 
R
K
 
T
-
 
A
-
 
T
-
 
L
-
 
A
-
 
Q
-
 
V
-
 
P
-
 
A
-
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
G
T
 
D
P
 
P
E
 
R
E
 
E
V
 
I
G
 
A
A
 
S
A
 
A
V
 
V
A
 
A
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
P
G
 
E
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
V
 
T
L
 
L
S
 
H
V
 
V
C
 
N
G
 
G
G
 
G

4i08A Crystal structure of beta-ketoacyl-acyl carrier protein reductase (fabg) from vibrio cholerae in complex with NADPH (see paper)
39% identity, 97% coverage: 4:251/255 of query aligns to 4:239/243 of 4i08A

query
sites
4i08A
F
 
M
D
 
N
L
 
L
T
 
E
G
 
G
R
 
K
V
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
x
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
K
A
 
A
T
 
I
A
 
A
R
 
E
V
 
L
L
 
L
A
 
A
G
 
E
Q
 
R
G
 
G
A
 
A
D
 
K
V
 
V
L
 
-
V
 
-
V
 
I
D
 
G
L
 
T
A
 
A
D
x
T
P
 
S
V
 
E
D
 
S
V
 
G
A
 
A
S
 
Q
A
 
A
L
 
I
R
 
-
E
 
S
E
 
D
F
 
Y
P
 
L
G
 
G
Q
 
D
R
 
N
F
 
G
A
 
K
S
 
G
R
 
M
R
 
A
V
 
L
D
x
N
V
|
V
R
 
T
D
 
N
E
 
P
D
 
E
D
 
S
V
 
I
R
 
E
R
 
A
S
 
V
V
 
L
D
 
K
E
 
A
L
 
I
V
 
T
D
 
D
G
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
G
I
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
T
 
I
A
 
T
S
 
R
R
 
D
S
 
N
G
 
L
L
 
L
D
 
M
T
 
R
L
 
M
T
 
K
E
 
E
P
 
E
E
 
E
W
 
W
Y
 
S
R
 
D
D
 
I
L
 
M
D
 
E
T
 
T
N
|
N
L
 
L
R
 
T
G
 
S
T
 
I
F
 
F
L
 
R
Y
 
L
C
 
S
R
 
K
A
 
A
A
 
V
V
 
L
H
 
R
P
 
G
H
 
M
M
 
M
A
 
K
G
 
K
Q
 
R
G
 
-
S
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
V
S
x
G
S
|
S
I
 
V
S
 
V
G
 
G
I
 
T
M
 
M
G
 
G
G
 
-
P
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
N
S
 
A
G
 
G
P
x
Q
A
 
A
-
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
A
 
G
L
 
F
T
 
T
K
 
K
W
 
S
L
 
M
A
 
A
K
 
R
E
 
E
V
 
V
G
 
A
P
 
S
Y
 
R
G
 
G
I
 
V
T
 
T
C
 
V
N
 
N
S
 
T
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
P
 
F
I
 
I
A
 
E
T
|
T
A
 
D
L
 
M
T
 
N
S
 
D
N
 
E
V
 
Q
T
 
R
Y
 
T
A
 
A
L
 
T
D
 
L
D
 
A
Q
 
Q
V
 
V
-
 
P
I
 
A
K
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
G
T
 
D
P
 
P
E
 
R
E
 
E
V
 
I
G
 
A
A
 
S
A
 
A
V
 
V
A
 
A
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
P
G
 
E
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
V
 
T
L
 
L
S
 
H
V
 
V
C
 
N
G
 
G
G
 
G

2d1yA Crystal structure of tt0321 from thermus thermophilus hb8 (see paper)
40% identity, 96% coverage: 6:251/255 of query aligns to 3:235/240 of 2d1yA

query
sites
2d1yA
L
 
F
T
 
A
G
 
G
R
 
K
V
 
G
V
 
V
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
A
 
A
T
 
I
A
 
A
R
 
Q
V
 
A
L
 
F
A
 
A
G
 
R
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
L
V
 
V
L
 
A
V
 
L
V
 
C
D
|
D
L
|
L
-
x
R
A
 
P
D
 
E
P
 
G
V
 
K
D
 
E
V
 
V
A
 
A
S
 
E
A
 
A
L
 
I
R
 
G
E
 
G
E
 
A
F
 
F
P
 
-
G
 
-
Q
 
-
R
 
-
F
 
-
A
 
-
S
 
-
R
 
F
R
 
Q
V
|
V
D
|
D
V
x
L
R
 
E
D
 
D
E
 
E
D
 
R
D
 
E
V
 
R
R
 
V
R
 
R
S
 
F
V
 
V
D
 
E
E
 
E
L
 
A
V
 
A
D
 
Y
G
 
A
F
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
x
A
T
x
I
A
 
A
S
 
A
R
 
P
S
 
G
G
 
S
L
 
A
D
 
L
T
 
T
L
 
V
T
 
R
E
 
L
P
 
P
E
 
E
W
 
W
Y
 
R
R
 
R
D
 
V
L
 
L
D
 
E
T
 
V
N
 
N
L
 
L
R
 
T
G
 
A
T
 
P
F
 
-
L
 
M
Y
 
H
C
 
L
R
 
S
A
 
A
A
 
L
V
 
A
H
 
A
P
 
R
H
 
E
M
 
M
A
 
R
G
 
K
Q
 
V
G
 
G
S
 
G
G
 
G
R
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
|
V
S
 
A
S
|
S
I
 
V
S
 
Q
G
 
G
I
 
L
M
 
F
G
 
-
G
 
-
P
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
G
 
A
G
 
E
R
 
Q
S
 
E
G
x
N
P
 
A
A
 
A
Y
|
Y
A
 
N
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
G
 
G
V
 
L
I
 
V
A
 
N
L
 
L
T
 
T
K
 
R
W
 
S
L
 
L
A
 
A
K
 
L
E
 
D
V
 
L
G
 
A
P
 
P
Y
 
L
G
 
R
I
 
I
T
 
R
C
 
V
N
 
N
S
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
P
 
A
I
|
I
A
 
A
T
 
-
A
 
-
L
 
-
T
|
T
S
 
E
N
x
A
V
|
V
T
 
L
Y
 
E
A
 
A
L
 
I
-
 
A
-
 
R
-
 
R
-
 
D
-
 
W
-
 
E
D
 
D
D
 
L
Q
 
H
V
 
A
I
 
L
K
 
R
R
 
R
M
 
L
G
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
V
G
 
A
A
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
E
G
 
K
A
 
A
A
 
S
Y
 
F
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
V
 
I
L
 
L
S
 
P
V
 
V
C
 
D
G
 
G
G
 
G

4nbtA Crystal structure of fabg from acholeplasma laidlawii (see paper)
37% identity, 96% coverage: 6:251/255 of query aligns to 3:236/239 of 4nbtA

query
sites
4nbtA
L
 
L
T
 
E
G
 
G
R
 
K
V
 
V
V
 
A
L
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
R
x
K
G
|
G
I
x
L
G
 
G
A
 
Q
A
 
A
T
 
I
A
 
A
R
 
L
V
 
A
L
 
Y
A
 
A
G
 
E
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
K
V
 
V
L
 
I
V
 
A
V
 
G
D
|
D
L
|
L
A
 
G
D
 
D
P
 
-
V
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
-
S
 
-
A
 
-
L
 
L
R
 
T
E
 
Y
E
 
S
F
 
H
P
 
P
G
 
-
Q
 
-
R
 
N
F
 
V
A
 
E
S
 
G
R
 
M
R
 
Y
V
x
L
D
x
N
V
|
V
R
 
T
D
 
D
E
 
V
D
 
T
D
 
G
V
 
V
R
 
E
R
 
K
S
 
F
V
 
Y
D
 
Q
E
 
S
L
 
V
V
 
I
D
 
D
G
 
K
F
 
Y
G
 
G
R
 
K
I
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
T
 
I
A
 
T
S
 
K
R
 
D
S
 
A
G
 
M
L
 
T
D
 
R
T
 
K
L
 
M
T
 
T
E
 
E
P
 
A
E
 
Q
W
 
W
Y
 
D
R
 
A
D
 
V
L
 
I
D
 
D
T
 
V
N
 
N
L
 
L
R
 
K
G
 
G
T
 
V
F
 
F
L
 
N
Y
 
L
C
 
T
R
 
R
A
 
-
A
 
L
V
 
V
H
 
G
P
 
P
H
 
Q
M
 
M
A
 
Q
G
 
T
Q
 
N
G
 
G
S
 
Y
G
 
G
R
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
x
I
S
 
S
S
|
S
I
 
V
S
 
V
G
 
G
I
 
V
M
 
F
G
 
G
G
 
N
P
 
I
R
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
G
 
-
G
 
G
R
 
Q
S
 
A
G
 
N
P
 
-
A
 
-
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
T
K
|
K
G
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
A
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
M
W
 
T
L
 
W
A
 
A
K
 
K
E
 
E
V
 
F
G
 
A
P
 
L
Y
 
K
G
 
G
-
 
A
-
 
N
I
 
V
T
 
R
C
 
V
N
 
N
S
 
A
V
 
I
A
 
A
P
|
P
G
|
G
P
 
Y
I
|
I
A
 
M
T
|
T
A
 
D
L
 
I
T
 
L
S
 
K
N
 
T
V
 
V
T
 
P
Y
 
Q
A
 
D
L
 
L
D
 
L
D
 
D
Q
 
K
-
 
F
-
 
A
-
 
A
-
 
L
-
 
T
V
 
M
I
 
L
K
 
N
R
 
R
M
 
L
G
 
G
T
 
Q
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
I
G
 
A
A
 
K
A
 
V
V
 
A
A
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
D
G
 
D
A
 
A
A
 
S
Y
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
V
 
T
L
 
I
S
 
N
V
 
V
C
 
N
G
 
G
G
 
G

6d9yB Crystal structure of a short chain dehydrogenase/reductase sdr from burkholderia phymatum with partially occupied NAD
37% identity, 99% coverage: 1:253/255 of query aligns to 2:249/251 of 6d9yB

query
sites
6d9yB
M
 
M
T
 
N
V
 
R
F
 
I
D
 
D
L
 
L
T
 
E
G
 
G
R
 
R
V
 
V
V
 
V
L
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
R
|
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
T
 
V
A
 
A
R
 
Q
V
 
R
L
 
A
A
 
L
G
 
R
Q
 
S
G
 
G
A
 
A
D
 
A
V
 
V
L
 
A
V
 
L
V
 
W
D
|
D
L
|
L
A
 
-
D
 
D
P
 
A
V
 
E
D
 
R
V
 
L
A
 
A
S
 
R
A
 
S
L
 
E
R
 
R
E
 
E
E
 
L
F
 
A
P
 
E
G
 
L
Q
 
G
R
 
K
F
 
V
A
 
C
S
 
A
R
 
V
R
 
T
V
|
V
D
|
D
V
x
Q
R
 
T
D
 
K
E
 
E
D
 
A
D
 
Q
V
 
I
R
 
E
R
 
A
S
 
A
V
 
V
D
 
G
E
 
K
L
 
T
V
 
L
D
 
A
G
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
A
I
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
 
C
A
|
A
G
 
G
T
 
I
A
 
T
S
 
G
R
 
G
S
 
N
G
 
G
L
 
T
D
 
T
T
 
W
L
 
E
T
 
L
E
 
E
P
 
P
E
 
D
-
 
V
W
 
W
Y
 
R
R
 
Q
D
 
V
L
 
I
D
 
D
T
 
V
N
 
N
L
 
L
R
 
I
G
 
G
T
 
P
F
 
Y
L
 
L
Y
 
V
C
 
C
R
 
R
A
 
A
A
 
V
V
 
V
H
 
-
P
 
P
H
 
Q
M
 
M
A
 
L
G
 
K
Q
 
Q
G
 
G
S
 
Y
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
 
I
S
 
A
S
|
S
I
 
V
S
 
A
G
 
G
I
 
K
M
 
E
G
 
G
G
 
N
P
 
P
R
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
S
 
N
G
 
A
P
 
S
A
 
H
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
A
G
 
G
V
 
L
I
 
I
A
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
W
 
S
L
 
L
A
 
G
K
 
K
E
 
E
V
 
L
G
 
A
P
 
T
Y
 
K
G
 
N
I
 
I
T
 
L
C
 
V
N
 
N
S
 
A
V
 
V
A
 
T
P
|
P
G
x
A
P
x
A
I
x
A
A
 
K
T
|
T
A
 
E
L
 
I
-
 
F
-
 
D
-
 
S
-
 
M
-
 
K
T
 
Q
S
 
E
N
 
H
V
 
I
T
 
D
Y
 
Y
A
 
M
L
 
L
D
 
S
D
 
K
Q
 
I
V
 
P
I
 
M
K
 
N
R
 
R
M
 
F
G
 
L
T
 
L
P
 
P
E
 
D
E
 
E
V
 
A
G
 
A
A
 
S
A
 
L
V
 
I
A
 
L
Y
 
W
L
 
L
A
 
G
S
 
S
P
 
E
G
 
D
A
 
C
A
 
A
Y
 
F
V
 
S
T
 
T
G
 
G
Q
 
S
V
 
V
L
 
F
S
 
D
V
 
L
C
 
S
G
 
G
G
 
G
A
 
R
A
 
A

4dmmB 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase from synechococcus elongatus pcc 7942 in complex with NADP
41% identity, 96% coverage: 6:251/255 of query aligns to 3:236/240 of 4dmmB

query
sites
4dmmB
L
 
L
T
 
T
G
 
D
R
 
R
V
 
I
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
x
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
A
 
A
T
 
I
A
 
A
R
 
L
V
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
A
Q
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
K
V
 
V
L
 
-
V
 
A
V
 
V
D
 
N
L
 
Y
A
|
A
D
x
S
P
x
S
V
 
A
-
 
G
-
 
A
D
 
A
V
 
D
A
 
E
S
 
V
A
 
V
L
 
A
R
 
A
E
 
I
E
 
A
F
 
A
P
 
A
G
 
G
Q
 
G
R
 
E
F
 
A
A
 
F
S
 
A
R
 
V
R
 
K
V
x
A
D
|
D
V
|
V
R
 
S
D
 
Q
E
 
E
D
 
S
D
 
E
V
 
V
R
 
E
R
 
A
S
 
L
V
 
F
D
 
A
E
 
A
L
 
V
V
 
I
D
 
E
G
 
R
F
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
T
 
I
A
 
T
S
 
R
R
 
D
S
 
T
G
 
L
L
 
L
D
 
L
T
 
R
L
 
M
T
 
K
E
 
R
P
 
D
E
 
D
W
 
W
Y
 
Q
R
 
S
D
 
V
L
 
L
D
 
D
T
x
L
N
 
N
L
 
L
R
 
G
G
 
G
T
 
V
F
 
F
L
 
L
Y
 
C
C
 
S
R
 
R
A
 
A
A
 
A
V
 
A
H
 
K
P
 
I
H
 
-
M
 
M
A
 
L
G
 
K
Q
 
Q
G
 
R
S
 
S
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
x
I
S
 
A
S
|
S
I
 
V
S
 
V
G
 
G
I
 
E
M
 
M
G
 
G
G
 
N
P
 
P
R
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
G
E
x
Q
G
 
A
G
 
N
G
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
P
 
-
A
 
-
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
A
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
W
 
T
L
 
V
A
 
A
K
 
K
E
 
E
V
 
L
G
 
A
P
 
S
Y
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
C
 
V
N
 
N
S
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
P
 
F
I
|
I
A
 
A
T
|
T
A
 
D
L
x
M
T
 
T
S
 
S
N
 
-
V
 
-
T
 
-
Y
 
-
A
 
L
L
 
L
D
 
E
D
 
V
Q
 
I
V
 
P
I
 
L
K
 
G
R
 
R
M
 
Y
G
 
G
T
 
E
P
 
A
E
 
A
E
 
E
V
 
V
G
 
A
A
 
G
A
 
V
V
 
V
A
 
R
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
A
-
 
D
P
 
P
G
 
A
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
L
 
I
S
 
N
V
 
I
C
 
D
G
 
G
G
 
G

7krmC Putative fabg bound to nadh from acinetobacter baumannii
37% identity, 98% coverage: 6:254/255 of query aligns to 3:243/244 of 7krmC

query
sites
7krmC
L
 
L
T
 
Q
G
 
G
R
 
K
V
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
A
-
x
S
-
 
E
R
 
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
A
 
A
T
 
T
A
 
A
R
 
E
V
 
I
L
 
F
A
 
A
G
 
Q
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
D
 
K
V
 
V
L
 
I
V
 
I
V
 
V
D
|
D
L
|
L
-
 
D
-
 
L
A
 
A
D
 
Q
P
 
S
V
 
Q
D
 
N
V
 
A
A
 
A
S
 
K
A
 
A
L
 
L
R
 
G
E
 
E
E
 
G
F
 
H
P
 
M
G
 
G
Q
 
-
R
 
-
F
 
-
A
 
-
S
 
-
R
 
L
R
 
A
V
x
A
D
x
N
V
|
V
R
 
A
D
 
N
E
 
E
D
 
E
D
 
Q
V
 
V
R
 
K
R
 
A
S
 
A
V
 
V
D
 
E
E
 
Q
L
 
A
V
 
L
D
 
Q
G
 
H
F
 
Y
G
 
G
R
 
K
I
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
T
 
I
A
 
T
S
 
Q
R
 
P
S
 
I
G
 
K
L
 
T
D
 
L
T
 
D
L
 
I
T
 
Q
E
 
R
P
 
S
E
 
D
W
 
Y
Y
 
D
R
 
R
D
 
V
L
 
L
D
 
D
T
x
V
N
 
S
L
 
L
R
 
R
G
 
G
T
 
T
F
 
L
L
 
I
Y
 
M
C
 
S
R
 
Q
A
 
A
A
 
V
V
 
I
H
 
-
P
 
P
H
 
S
M
 
M
A
 
K
G
 
A
Q
 
N
G
 
G
S
 
G
G
 
G
R
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
C
V
 
L
S
 
S
S
|
S
I
 
V
S
 
S
G
 
A
I
 
Q
M
 
R
G
 
G
G
 
G
P
 
G
R
 
I
S
 
F
G
 
G
G
 
-
E
 
-
G
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
G
P
 
P
A
 
H
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
L
A
 
G
L
 
L
T
 
A
K
 
K
W
 
A
L
 
M
A
 
A
K
 
R
E
 
E
V
 
F
G
 
G
P
 
G
Y
 
D
G
 
Q
I
 
I
T
 
R
C
 
V
N
 
N
S
 
S
V
 
L
A
 
T
P
 
P
G
 
G
P
 
L
I
|
I
A
 
Q
T
|
T
A
 
D
L
 
M
T
 
N
S
 
D
N
 
D
V
 
R
T
 
R
Y
 
H
A
 
D
L
 
I
D
 
L
D
 
A
Q
 
G
V
 
I
-
 
P
I
 
L
K
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
G
T
 
K
P
 
A
E
 
Q
E
 
D
V
 
V
G
 
A
A
 
N
A
 
A
V
 
A
A
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
D
G
 
L
A
 
S
A
 
A
Y
 
Y
V
 
L
T
 
T
G
 
G
Q
 
V
V
 
T
L
 
L
S
 
D
V
 
V
C
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
M
A
 
L
I
 
I

4wecA Crystal structure of a short chain dehydrogenase from mycobacterium smegmatis
37% identity, 96% coverage: 6:251/255 of query aligns to 8:249/258 of 4wecA

query
sites
4wecA
L
 
L
T
 
A
G
 
G
R
 
K
V
 
V
V
 
A
L
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
|
A
R
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
A
 
A
T
 
T
A
 
G
R
 
R
V
 
R
L
 
L
A
 
R
G
 
A
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
T
V
 
V
L
 
V
V
 
V
V
 
G
D
|
D
L
x
I
A
 
-
D
 
D
P
 
P
V
 
T
D
 
-
V
 
T
A
 
G
S
 
K
A
 
A
L
 
A
R
 
A
E
 
D
E
 
E
F
 
L
P
 
E
G
 
G
Q
 
L
R
 
F
F
 
V
A
 
P
S
 
-
R
 
-
R
 
-
V
|
V
D
|
D
V
|
V
R
 
S
D
 
E
E
 
Q
D
 
E
D
 
A
V
 
V
R
 
D
R
 
N
S
 
L
V
 
F
D
 
D
E
 
T
L
 
A
V
 
A
D
 
S
G
 
T
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
A
V
 
F
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
T
 
I
A
 
S
S
 
P
R
 
P
S
 
E
G
 
-
L
 
-
D
 
D
T
 
D
L
 
L
T
 
I
E
 
E
-
 
N
-
 
T
-
 
D
-
 
L
P
 
P
E
 
A
W
 
W
Y
 
Q
R
 
R
D
 
V
L
 
Q
D
 
D
T
 
I
N
 
N
L
 
L
R
 
K
G
 
S
T
 
V
F
 
Y
L
 
L
Y
 
S
C
 
C
R
 
R
A
 
A
A
 
A
V
 
L
H
 
R
P
 
-
H
 
H
M
 
M
A
 
V
G
 
P
Q
 
A
G
 
G
S
 
K
G
 
G
R
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
x
T
S
 
A
S
|
S
I
 
F
S
 
V
G
 
A
I
 
V
M
 
M
G
 
G
G
 
S
P
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
G
 
-
G
 
A
R
 
T
S
 
S
G
x
Q
P
 
I
A
 
S
Y
|
Y
A
 
T
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
G
 
G
V
 
V
I
 
L
A
 
A
L
 
M
T
 
S
K
 
R
W
 
E
L
 
L
A
 
G
K
 
V
E
 
Q
V
 
Y
G
 
A
P
 
R
Y
 
Q
G
 
G
I
 
I
T
 
R
C
 
V
N
 
N
S
 
A
V
 
L
A
 
C
P
|
P
G
 
G
P
|
P
I
x
V
A
 
N
T
 
T
A
 
P
L
 
L
T
 
L
S
 
Q
N
 
E
V
 
L
T
 
-
Y
 
F
A
 
A
L
 
K
D
 
D
D
 
P
Q
 
E
-
 
R
-
 
A
-
 
A
-
 
R
-
 
R
-
 
L
-
 
V
-
 
H
-
 
I
V
 
P
I
 
L
K
 
G
R
 
R
M
 
F
G
 
A
T
 
E
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
L
G
 
A
A
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
A
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
D
G
 
D
A
 
A
A
 
S
Y
 
F
V
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
S
V
 
T
L
 
F
S
 
L
V
 
V
C
 
D
G
 
G
G
 
G

7tzpG Crystal structure of putataive short-chain dehydrogenase/reductase (fabg) from klebsiella pneumoniae subsp. Pneumoniae ntuh-k2044 in complex with nadh (see paper)
35% identity, 97% coverage: 4:251/255 of query aligns to 4:244/247 of 7tzpG

query
sites
7tzpG
F
 
M
D
 
K
L
 
L
T
 
A
G
 
S
R
 
K
V
 
T
V
 
A
L
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
A
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
F
A
 
G
T
 
I
A
 
A
R
 
Q
V
 
V
L
 
L
A
 
A
G
 
R
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
R
V
 
V
L
 
I
V
 
I
V
 
A
D
|
D
L
x
R
-
 
D
A
 
A
D
 
H
P
 
G
V
 
E
D
 
A
V
 
A
A
 
A
S
 
A
A
 
S
L
 
L
R
 
R
E
 
E
E
 
S
F
 
G
P
 
A
G
 
Q
Q
 
A
R
 
L
F
 
F
A
 
I
S
 
S
R
 
-
R
 
-
V
x
C
D
 
N
V
x
I
R
 
A
D
 
E
E
 
K
D
 
T
D
 
Q
V
 
V
R
 
E
R
 
A
S
 
L
V
 
F
D
 
S
E
 
Q
L
 
A
V
 
E
D
 
E
G
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
P
I
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
T
x
I
A
 
N
S
 
R
R
 
D
S
 
A
G
 
M
L
 
L
D
 
H
T
 
K
L
 
L
T
 
T
E
 
E
P
 
A
E
 
D
W
 
W
Y
 
D
R
 
T
D
 
V
L
 
I
D
 
D
T
x
V
N
 
N
L
 
L
R
 
K
G
 
G
T
 
T
F
 
F
L
 
L
Y
 
-
C
 
C
R
 
M
A
 
Q
A
 
Q
V
 
A
H
 
A
P
 
I
H
 
R
M
 
M
A
 
R
G
 
E
Q
 
R
G
 
G
S
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
I
S
 
A
S
 
S
I
 
A
S
 
S
G
 
W
I
 
L
M
 
-
G
 
-
G
 
-
P
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
G
 
G
G
 
N
R
 
V
S
 
G
G
 
Q
P
 
T
A
 
N
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
V
A
 
G
L
 
M
T
 
T
K
 
K
W
 
T
L
 
A
A
 
C
K
 
R
E
 
E
V
 
L
G
 
A
P
 
K
Y
 
K
G
 
G
I
 
V
T
 
T
C
 
V
N
 
N
S
 
A
V
 
I
A
 
C
P
 
P
G
 
G
P
 
F
I
|
I
A
 
D
T
|
T
A
 
D
L
 
M
T
|
T
S
 
R
N
 
G
V
 
V
T
 
P
Y
 
E
A
 
N
L
 
V
D
 
W
D
 
Q
Q
 
I
V
 
M
I
 
V
K
 
S
R
 
K
M
 
I
-
 
P
-
 
A
-
 
G
-
 
Y
-
 
A
G
 
G
T
 
E
P
 
A
E
 
K
E
 
D
V
 
V
G
 
G
A
 
E
A
 
C
V
 
V
A
 
A
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
R
Y
 
Y
V
 
I
T
 
N
G
 
G
Q
 
E
V
 
V
L
 
I
S
 
N
V
 
V
C
 
G
G
 
G
G
 
G

Q9L9F8 Short-chain reductase protein NovJ; Novobiocin biosynthesis protein J; EC 1.1.1.- from Streptomyces niveus (Streptomyces spheroides) (see paper)
39% identity, 95% coverage: 10:251/255 of query aligns to 18:260/262 of Q9L9F8

query
sites
Q9L9F8
V
 
V
V
 
A
L
 
M
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
A
 
G
R
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
A
T
 
T
A
 
A
R
 
E
V
 
R
L
 
L
A
 
A
G
 
A
Q
 
E
G
 
G
A
 
M
D
 
A
V
 
V
L
 
I
V
 
V
V
 
V
D
 
D
L
 
R
A
 
T
D
 
E
P
 
Q
V
 
D
D
 
T
V
 
R
A
 
A
S
 
T
A
 
V
L
 
A
R
 
A
E
 
I
E
 
R
F
 
T
P
 
A
G
 
G
Q
 
G
R
 
R
F
 
A
A
 
R
S
 
G
R
 
I
R
 
G
V
 
C
D
 
D
V
 
V
R
 
A
D
 
V
E
 
A
D
 
Q
D
 
A
V
 
V
R
 
T
R
 
A
S
 
A
V
 
V
D
 
A
E
 
T
L
 
A
V
 
V
D
 
E
G
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
C
A
 
A
G
 
G
T
 
I
A
 
N
S
 
R
R
 
D
S
 
R
G
 
L
L
 
L
D
 
L
T
 
T
L
 
M
T
 
G
E
 
D
P
 
Q
E
 
E
W
 
W
Y
 
D
R
 
T
D
 
V
L
 
L
D
 
D
T
 
V
N
 
N
L
 
L
R
 
G
G
 
G
T
 
T
F
 
-
L
 
M
Y
 
R
C
 
C
R
 
S
A
 
F
A
 
A
V
 
V
H
 
G
P
 
R
H
 
H
M
 
M
A
 
R
G
 
R
Q
 
Q
G
 
G
S
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
F
S
 
S
S
|
S
I
 
V
S
 
A
G
 
-
I
 
-
M
 
-
G
 
-
G
 
-
P
 
-
R
 
-
S
 
A
G
 
R
G
 
G
E
 
N
G
 
A
G
 
G
G
 
Q
R
 
T
S
 
N
G
 
-
P
 
-
A
 
-
Y
|
Y
A
 
A
A
 
T
S
 
A
K
|
K
G
 
G
G
 
A
V
 
I
I
 
A
A
 
G
L
 
F
T
 
T
K
 
R
W
 
T
L
 
L
A
 
A
K
 
A
E
 
E
V
 
L
G
 
G
P
 
P
Y
 
H
G
 
G
I
 
V
T
 
T
C
 
V
N
 
N
S
 
A
V
 
I
A
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
F
I
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
P
L
 
M
T
 
V
-
 
D
-
 
E
-
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
R
-
 
L
-
 
G
-
 
G
-
 
D
-
 
R
-
 
D
S
 
S
N
 
V
V
 
M
T
 
S
Y
 
E
A
 
A
L
 
A
D
 
K
D
 
S
Q
 
S
V
 
A
I
 
V
K
 
G
R
 
R
M
 
I
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
I
G
 
A
A
 
A
A
 
T
V
 
V
A
 
V
Y
 
F
L
 
V
A
 
A
S
 
R
P
 
P
G
 
E
A
 
S
A
 
G
Y
 
Y
V
 
L
T
 
T
G
 
G
Q
 
E
V
 
T
L
 
V
S
 
H
V
 
V
C
 
D
G
 
G
G
 
G

1nfqA Rv2002 gene product from mycobacterium tuberculosis (see paper)
38% identity, 98% coverage: 6:255/255 of query aligns to 4:240/244 of 1nfqA

query
sites
1nfqA
L
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
K
V
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
S
G
 
G
G
 
G
A
 
A
R
|
R
G
|
G
I
x
M
G
 
G
A
 
A
A
 
S
T
 
H
A
 
V
R
 
R
V
 
A
L
 
M
A
 
V
G
 
A
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
K
V
 
V
L
 
V
V
 
F
V
 
G
D
|
D
L
 
I
A
x
L
D
 
D
P
 
E
V
 
-
D
 
E
V
 
G
A
 
K
S
 
A
A
 
M
L
 
A
R
 
A
E
 
E
E
 
L
F
 
A
P
 
D
G
 
A
Q
 
A
R
 
R
F
 
Y
A
 
V
S
 
-
R
 
-
R
 
H
V
x
L
D
|
D
V
|
V
R
 
T
D
 
Q
E
 
P
D
 
A
D
 
Q
V
 
W
R
 
K
R
 
A
S
 
A
V
 
V
D
 
D
E
 
T
L
 
A
V
 
V
D
 
T
G
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
G
I
 
L
D
 
H
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
T
 
I
A
x
L
S
 
N
R
 
I
S
 
G
G
 
T
L
 
I
D
 
E
T
 
D
L
 
Y
T
 
A
E
 
L
P
 
T
E
 
E
W
 
W
Y
 
Q
R
 
R
D
 
I
L
 
L
D
 
D
T
 
V
N
 
N
L
 
L
R
 
T
G
 
G
T
 
V
F
 
F
L
 
L
Y
 
G
C
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
V
V
 
V
H
 
K
P
 
P
H
 
-
M
 
M
A
 
K
G
 
E
Q
 
A
G
 
G
S
 
R
G
 
G
R
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
x
I
S
 
S
S
|
S
I
 
I
S
x
E
G
 
G
I
 
L
M
 
A
G
 
G
G
 
T
P
 
V
R
 
A
S
x
C
G
 
H
G
 
G
E
 
-
G
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
P
 
-
A
 
-
Y
|
Y
A
 
T
A
 
A
S
 
T
K
|
K
G
 
F
G
 
A
V
 
V
I
 
R
A
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
W
 
S
L
 
T
A
 
A
K
 
L
E
 
E
V
 
L
G
 
G
P
 
P
Y
 
S
G
 
G
I
 
I
T
 
R
C
 
V
N
 
N
S
 
S
V
 
I
A
 
H
P
|
P
G
 
G
P
 
L
I
x
V
A
 
K
T
|
T
A
x
P
L
x
M
T
|
T
S
 
D
N
 
W
V
|
V
T
 
P
Y
 
E
A
 
D
L
x
I
D
x
F
D
 
Q
Q
 
T
V
 
A
I
 
L
K
 
G
R
 
R
M
 
A
G
 
A
T
 
E
P
 
P
E
 
V
E
 
E
V
 
V
G
 
S
A
 
N
A
 
L
V
 
V
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
D
G
 
E
A
 
S
A
 
S
Y
 
Y
V
 
S
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
V
 
E
L
 
F
S
 
V
V
 
V
C
 
D
G
 
G
G
 
G
A
 
T
A
 
V
I
 
A
G
 
G

1nffA Crystal structure of rv2002 gene product from mycobacterium tuberculosis (see paper)
38% identity, 98% coverage: 6:255/255 of query aligns to 4:240/244 of 1nffA

query
sites
1nffA
L
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
K
V
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
S
G
|
G
G
 
G
A
 
A
R
|
R
G
|
G
I
x
M
G
 
G
A
 
A
A
 
S
T
 
H
A
 
V
R
 
R
V
 
A
L
 
M
A
 
V
G
 
A
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
K
V
 
V
L
 
V
V
 
F
V
 
G
D
|
D
L
x
I
A
x
L
D
 
D
P
 
E
V
 
-
D
 
E
V
 
G
A
 
K
S
 
A
A
 
M
L
 
A
R
 
A
E
 
E
E
 
L
F
 
A
P
 
D
G
 
A
Q
 
A
R
 
R
F
 
Y
A
 
V
S
 
-
R
 
-
R
 
H
V
x
L
D
|
D
V
|
V
R
 
T
D
 
Q
E
 
P
D
 
A
D
 
Q
V
 
W
R
 
K
R
 
A
S
 
A
V
 
V
D
 
D
E
 
T
L
 
A
V
 
V
D
 
T
G
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
G
I
 
L
D
 
H
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
T
x
I
A
 
L
S
 
N
R
 
I
S
 
G
G
 
T
L
 
I
D
 
E
T
 
D
L
 
Y
T
 
A
E
 
L
P
 
T
E
 
E
W
 
W
Y
 
Q
R
 
R
D
 
I
L
 
L
D
 
D
T
 
V
N
 
N
L
 
L
R
 
T
G
 
G
T
 
V
F
 
F
L
 
L
Y
 
G
C
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
V
V
 
V
H
 
K
P
 
P
H
 
-
M
 
M
A
 
K
G
 
E
Q
 
A
G
 
G
S
 
R
G
 
G
R
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
x
I
S
 
S
S
|
S
I
 
I
S
 
E
G
 
G
I
 
L
M
 
A
G
 
G
G
 
T
P
 
V
R
 
A
S
 
C
G
 
H
G
 
G
E
 
-
G
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
P
 
-
A
 
-
Y
|
Y
A
 
T
A
 
A
S
 
T
K
|
K
G
 
F
G
 
A
V
 
V
I
 
R
A
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
W
 
S
L
 
T
A
 
A
K
 
L
E
 
E
V
 
L
G
 
G
P
 
P
Y
 
S
G
 
G
I
 
I
T
 
R
C
 
V
N
 
N
S
 
S
V
 
I
A
 
H
P
|
P
G
 
G
P
 
L
I
x
V
A
 
K
T
|
T
A
x
P
L
x
M
T
|
T
S
 
D
N
 
W
V
 
V
T
 
P
Y
 
E
A
 
D
L
 
I
D
 
F
D
 
Q
Q
 
T
V
 
A
I
 
L
K
 
G
R
 
R
M
 
A
G
 
A
T
 
E
P
 
P
E
 
V
E
 
E
V
 
V
G
 
S
A
 
N
A
 
L
V
 
V
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
D
G
 
E
A
 
S
A
 
S
Y
 
Y
V
 
S
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
V
 
E
L
 
F
S
 
V
V
 
V
C
 
D
G
 
G
G
 
G
A
 
T
A
 
V
I
 
A
G
 
G

P9WGT1 3-alpha-(or 20-beta)-hydroxysteroid dehydrogenase; NADH-dependent 3alpha, 20beta-hydroxysteroid dehydrogenase; EC 1.1.1.53 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
38% identity, 98% coverage: 6:255/255 of query aligns to 5:241/260 of P9WGT1

query
sites
P9WGT1
L
 
L
T
x
I
G
 
G
R
 
K
V
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
S
G
 
G
G
 
G
A
 
A
R
|
R
G
|
G
I
x
M
G
 
G
A
 
A
A
 
S
T
 
H
A
 
V
R
 
R
V
 
A
L
 
M
A
 
V
G
 
A
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
K
V
 
V
L
 
V
V
 
F
V
 
G
D
|
D
L
 
I
A
 
L
D
 
D
P
 
E
V
 
-
D
 
E
V
 
G
A
 
K
S
 
A
A
x
V
L
 
A
R
 
A
E
 
E
E
 
L
F
 
A
P
 
D
G
 
A
Q
 
A
R
 
R
F
 
Y
A
 
V
S
 
-
R
 
-
R
 
H
V
 
L
D
|
D
V
|
V
R
 
T
D
 
Q
E
 
P
D
 
A
D
 
Q
V
 
W
R
x
T
R
 
A
S
 
A
V
 
V
D
 
D
E
 
T
L
 
A
V
 
V
D
 
T
G
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
G
I
 
L
D
 
H
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
T
 
I
A
 
L
S
 
N
R
 
I
S
 
G
G
 
T
L
 
I
D
 
E
T
 
D
L
 
Y
T
 
A
E
 
L
P
 
T
E
 
E
W
 
W
Y
 
Q
R
 
R
D
 
I
L
 
L
D
 
D
T
 
V
N
 
N
L
 
L
R
 
T
G
 
G
T
 
V
F
 
F
L
 
L
Y
 
G
C
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
V
V
 
V
H
 
K
P
 
P
H
 
-
M
 
M
A
 
K
G
 
E
Q
 
A
G
 
G
S
 
R
G
 
G
R
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
I
S
 
S
S
|
S
I
 
I
S
 
E
G
 
G
I
 
L
M
 
A
G
 
G
G
 
T
P
 
V
R
 
A
S
 
C
G
 
H
G
 
G
E
 
-
G
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
-
P
 
-
A
 
-
Y
|
Y
A
 
T
A
 
A
S
 
T
K
|
K
G
 
F
G
 
A
V
 
V
I
 
R
A
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
W
 
S
L
 
T
A
 
A
K
 
L
E
 
E
V
 
L
G
 
G
P
 
P
Y
 
S
G
 
G
I
 
I
T
 
R
C
 
V
N
 
N
S
 
S
V
 
I
A
 
H
P
|
P
G
|
G
P
x
L
I
x
V
A
x
K
T
|
T
A
x
P
L
x
M
T
|
T
S
 
D
N
 
W
V
 
V
T
 
P
Y
 
E
A
 
D
L
 
I
D
 
F
D
 
Q
Q
 
T
V
 
A
I
 
L
K
 
G
R
 
R
M
 
A
G
 
A
T
 
E
P
 
P
E
 
V
E
 
E
V
 
V
G
 
S
A
 
N
A
 
L
V
 
V
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
D
G
 
E
A
 
S
A
 
S
Y
 
Y
V
 
S
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
V
 
E
L
 
F
S
 
V
V
 
V
C
 
D
G
 
G
G
 
G
A
 
T
A
 
V
I
 
A
G
 
G

Query Sequence

>WP_005456138.1 NCBI__GCF_000244975.1:WP_005456138.1
MTVFDLTGRVVLVTGGARGIGAATARVLAGQGADVLVVDLADPVDVASALREEFPGQRFA
SRRVDVRDEDDVRRSVDELVDGFGRIDVLVNNAGTASRSGLDTLTEPEWYRDLDTNLRGT
FLYCRAAVHPHMAGQGSGRIVNVSSISGIMGGPRSGGEGGGRSGPAYAASKGGVIALTKW
LAKEVGPYGITCNSVAPGPIATALTSNVTYALDDQVIKRMGTPEEVGAAVAYLASPGAAY
VTGQVLSVCGGAAIG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory