SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_005457821.1 NCBI__GCF_000244975.1:WP_005457821.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1xxxA Crystal structure of dihydrodipicolinate synthase (dapa, rv2753c) from mycobacterium tuberculosis (see paper)
60% identity, 84% coverage: 17:303/341 of query aligns to 8:294/296 of 1xxxA

query
sites
1xxxA
F
 
L
G
 
G
R
 
T
V
 
L
L
 
L
T
 
T
A
 
A
M
 
M
V
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
F
T
 
S
A
 
G
E
 
D
G
 
G
A
 
S
V
 
L
D
 
D
L
 
T
K
 
A
R
 
T
A
 
A
Q
 
A
E
 
R
L
 
L
A
 
A
V
 
N
H
 
H
L
 
L
V
 
V
E
 
D
L
 
Q
G
 
G
N
 
C
D
 
D
G
 
G
L
 
L
V
 
V
V
 
V
N
 
S
G
 
G
T
|
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
S
 
S
P
 
P
T
 
T
T
 
T
T
 
T
D
 
D
A
 
G
E
 
E
K
 
K
A
 
I
D
 
E
L
 
L
V
 
L
R
 
R
A
 
A
V
 
V
V
 
L
E
 
E
A
 
A
V
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
R
A
 
A
T
 
R
V
 
V
V
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
T
N
 
Y
N
 
D
T
 
T
T
 
A
H
 
H
S
 
S
V
 
I
E
 
R
M
 
L
A
 
A
K
 
K
Q
 
A
A
 
C
E
 
A
K
 
A
S
 
E
G
 
G
A
 
A
H
 
H
G
 
G
L
 
L
L
 
L
V
 
V
V
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
S
 
S
R
 
K
P
 
P
T
 
P
Q
 
Q
A
 
R
G
 
G
L
 
L
Y
 
Q
A
 
A
H
 
H
F
 
F
T
 
T
T
 
A
V
 
V
A
 
A
D
 
D
A
 
A
T
 
T
E
 
E
L
 
L
P
 
P
V
 
M
M
 
L
L
 
L
Y
|
Y
D
 
D
I
 
I
P
 
P
P
 
G
R
|
R
S
 
S
I
 
A
V
 
V
P
 
P
I
 
I
E
 
E
V
 
P
D
 
D
T
 
T
L
 
I
R
 
R
R
 
A
L
 
L
A
|
A
E
 
S
H
|
H
P
 
P
R
 
N
V
x
I
L
 
V
A
 
G
V
 
V
K
|
K
D
 
D
A
 
A
K
 
K
G
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
H
A
 
S
G
 
G
S
 
A
E
 
Q
V
 
I
I
 
M
A
 
A
N
 
D
T
 
T
H
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
G
 
A
L
 
L
N
 
N
L
 
L
P
 
P
W
 
W
L
 
L
S
 
A
V
 
M
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
G
V
 
F
V
x
I
S
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
A
H
 
H
V
 
L
V
 
A
A
 
A
G
 
G
R
 
Q
I
 
L
R
 
R
A
 
E
M
 
L
I
 
L
D
 
S
A
 
A
Y
 
F
E
 
G
D
 
S
G
 
G
D
 
D
T
 
I
S
 
A
T
 
T
A
 
A
R
 
R
T
 
K
N
 
I
H
 
N
R
 
I
G
 
A
M
 
V
I
 
A
P
 
P
V
 
L
Y
 
C
R
 
N
A
 
A
F
 
M
S
 
S
R
 
R
V
 
L
G
 
G
G
 
G
V
 
V
V
 
T
F
 
L
A
 
S
K
 
K
T
 
A
A
 
G
L
 
L
R
 
R
L
 
L
R
 
Q
G
 
G
M
 
I
D
 
D
V
 
V
G
 
G
E
 
D
P
 
P
R
 
R
L
 
L
P
 
P
M
 
Q
V
 
V
S
 
A
A
 
A
P
 
T
E
 
P
E
 
E
L
 
Q
V
 
I
R
 
D
A
 
A
I
 
L
A
 
A
D
 
A
D
 
D
L
 
M
T
 
R
Q
 
A
A
 
A
G
 
S
V
 
V

P9WP25 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase; HTPA synthase; EC 4.3.3.7 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
60% identity, 84% coverage: 17:303/341 of query aligns to 12:298/300 of P9WP25

query
sites
P9WP25
F
 
L
G
 
G
R
 
T
V
 
L
L
 
L
T
 
T
A
 
A
M
 
M
V
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
F
T
 
S
A
 
G
E
 
D
G
 
G
A
 
S
V
 
L
D
 
D
L
 
T
K
 
A
R
 
T
A
 
A
Q
 
A
E
 
R
L
 
L
A
 
A
V
 
N
H
 
H
L
 
L
V
 
V
E
 
D
L
 
Q
G
 
G
N
 
C
D
 
D
G
 
G
L
 
L
V
 
V
V
 
V
N
 
S
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
S
 
S
P
 
P
T
 
T
T
 
T
T
 
T
D
 
D
A
 
G
E
 
E
K
 
K
A
 
I
D
 
E
L
 
L
V
 
L
R
 
R
A
 
A
V
 
V
V
 
L
E
 
E
A
 
A
V
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
R
A
 
A
T
 
R
V
 
V
V
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
T
N
 
Y
N
 
D
T
 
T
T
 
A
H
 
H
S
 
S
V
 
I
E
 
R
M
 
L
A
 
A
K
 
K
Q
 
A
A
 
C
E
 
A
K
 
A
S
 
E
G
 
G
A
 
A
H
 
H
G
 
G
L
 
L
L
 
L
V
 
V
V
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
Y
S
 
S
R
 
K
P
 
P
T
 
P
Q
 
Q
A
 
R
G
 
G
L
 
L
Y
 
Q
A
 
A
H
 
H
F
 
F
T
 
T
T
 
A
V
 
V
A
 
A
D
 
D
A
 
A
T
 
T
E
 
E
L
 
L
P
 
P
V
 
M
M
 
L
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
I
 
I
P
 
P
P
 
G
R
 
R
S
 
S
I
 
A
V
 
V
P
 
P
I
 
I
E
 
E
V
 
P
D
 
D
T
 
T
L
 
I
R
 
R
R
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
S
H
 
H
P
 
P
R
 
N
V
 
I
L
 
V
A
 
G
V
 
V
K
|
K
D
 
D
A
 
A
K
 
K
G
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
H
A
 
S
G
 
G
S
 
A
E
 
Q
V
 
I
I
 
M
A
 
A
N
 
D
T
 
T
H
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
G
 
A
L
 
L
N
 
N
L
 
L
P
 
P
W
 
W
L
 
L
S
x
A
V
 
M
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
G
V
 
F
V
 
I
S
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
A
H
 
H
V
 
L
V
 
A
A
 
A
G
 
G
R
 
Q
I
 
L
R
 
R
A
 
E
M
 
L
I
 
L
D
 
S
A
 
A
Y
 
F
E
 
G
D
 
S
G
 
G
D
 
D
T
 
I
S
 
A
T
 
T
A
 
A
R
 
R
T
 
K
N
 
I
H
 
N
R
 
I
G
 
A
M
 
V
I
 
A
P
 
P
V
 
L
Y
 
C
R
 
N
A
 
A
F
 
M
S
 
S
R
 
R
V
 
L
G
 
G
G
 
G
V
 
V
V
 
T
F
 
L
A
 
S
K
 
K
T
 
A
A
 
G
L
 
L
R
 
R
L
 
L
R
 
Q
G
 
G
M
 
I
D
 
D
V
 
V
G
 
G
E
 
D
P
 
P
R
 
R
L
 
L
P
 
P
M
 
Q
V
 
V
S
 
A
A
 
A
P
 
T
E
 
P
E
 
E
L
 
Q
V
 
I
R
 
D
A
 
A
I
 
L
A
 
A
D
 
A
D
 
D
L
 
M
T
 
R
Q
 
A
A
 
A
G
 
S
V
 
V

5j5dA Crystal structure of dihydrodipicolinate synthase from mycobacterium tuberculosis in complex with alpha-ketopimelic acid (see paper)
60% identity, 84% coverage: 17:303/341 of query aligns to 9:295/297 of 5j5dA

query
sites
5j5dA
F
 
L
G
 
G
R
 
T
V
 
L
L
 
L
T
 
T
A
|
A
M
 
M
V
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
F
T
 
S
A
 
G
E
 
D
G
 
G
A
 
S
V
 
L
D
 
D
L
 
T
K
 
A
R
 
T
A
 
A
Q
 
A
E
 
R
L
 
L
A
 
A
V
 
N
H
 
H
L
 
L
V
 
V
E
 
D
L
 
Q
G
 
G
N
 
C
D
 
D
G
 
G
L
 
L
V
 
V
V
 
V
N
 
S
G
 
G
T
|
T
T
|
T
G
 
G
E
 
E
S
 
S
P
 
P
T
 
T
T
 
T
T
 
T
D
 
D
A
 
G
E
 
E
K
 
K
A
 
I
D
 
E
L
 
L
V
 
L
R
 
R
A
 
A
V
 
V
V
 
L
E
 
E
A
 
A
V
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
R
A
 
A
T
 
R
V
 
V
V
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
T
N
 
Y
N
 
D
T
 
T
T
 
A
H
 
H
S
 
S
V
 
I
E
 
R
M
 
L
A
 
A
K
 
K
Q
 
A
A
 
C
E
 
A
K
 
A
S
 
E
G
 
G
A
 
A
H
 
H
G
 
G
L
 
L
L
 
L
V
 
V
V
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
S
 
S
R
 
K
P
 
P
T
 
P
Q
 
Q
A
 
R
G
 
G
L
 
L
Y
 
Q
A
 
A
H
 
H
F
 
F
T
 
T
T
 
A
V
 
V
A
 
A
D
 
D
A
 
A
T
 
T
E
 
E
L
 
L
P
 
P
V
 
M
M
 
L
L
 
L
Y
|
Y
D
 
D
I
 
I
P
 
P
P
 
G
R
|
R
S
 
S
I
 
A
V
 
V
P
 
P
I
 
I
E
 
E
V
 
P
D
 
D
T
 
T
L
 
I
R
 
R
R
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
S
H
 
H
P
 
P
R
 
N
V
 
I
L
 
V
A
 
G
V
 
V
K
|
K
D
 
D
A
 
A
K
 
K
G
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
H
A
 
S
G
 
G
S
 
A
E
 
Q
V
 
I
I
 
M
A
 
A
N
 
D
T
 
T
H
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
Y
 
Y
S
 
S
G
|
G
D
 
D
D
 
D
G
 
A
L
 
L
N
 
N
L
 
L
P
 
P
W
 
W
L
 
L
S
 
A
V
 
M
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
G
V
 
F
V
x
I
S
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
A
H
 
H
V
 
L
V
 
A
A
 
A
G
 
G
R
 
Q
I
 
L
R
 
R
A
 
E
M
 
L
I
 
L
D
 
S
A
 
A
Y
 
F
E
 
G
D
 
S
G
 
G
D
 
D
T
 
I
S
 
A
T
 
T
A
 
A
R
 
R
T
 
K
N
 
I
H
 
N
R
 
I
G
 
A
M
 
V
I
 
A
P
 
P
V
 
L
Y
 
C
R
 
N
A
 
A
F
 
M
S
 
S
R
 
R
V
 
L
G
 
G
G
 
G
V
 
V
V
 
T
F
 
L
A
 
S
K
 
K
T
 
A
A
 
G
L
 
L
R
 
R
L
 
L
R
 
Q
G
 
G
M
 
I
D
 
D
V
 
V
G
 
G
E
 
D
P
 
P
R
 
R
L
 
L
P
 
P
M
 
Q
V
 
V
S
 
A
A
 
A
P
 
T
E
 
P
E
 
E
L
 
Q
V
 
I
R
 
D
A
 
A
I
 
L
A
 
A
D
 
A
D
 
D
L
 
M
T
 
R
Q
 
A
A
 
A
G
 
S
V
 
V

3l21B The crystal structure of a dimeric mutant of dihydrodipicolinate synthase (dapa, rv2753c) from mycobacterium tuberculosis - dhdps- a204r
60% identity, 84% coverage: 17:303/341 of query aligns to 7:293/295 of 3l21B

query
sites
3l21B
F
 
L
G
 
G
R
 
T
V
 
L
L
 
L
T
 
T
A
 
A
M
 
M
V
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
F
T
 
S
A
 
G
E
 
D
G
 
G
A
 
S
V
 
L
D
 
D
L
 
T
K
 
A
R
 
T
A
 
A
Q
 
A
E
 
R
L
 
L
A
 
A
V
 
N
H
 
H
L
 
L
V
 
V
E
 
D
L
 
Q
G
 
G
N
 
C
D
 
D
G
 
G
L
 
L
V
 
V
V
 
V
N
 
S
G
 
G
T
|
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
S
 
S
P
 
P
T
 
T
T
 
T
T
 
T
D
 
D
A
 
G
E
 
E
K
 
K
A
 
I
D
 
E
L
 
L
V
 
L
R
 
R
A
 
A
V
 
V
V
 
L
E
 
E
A
 
A
V
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
R
A
 
A
T
 
R
V
 
V
V
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
T
N
 
Y
N
 
D
T
 
T
T
 
A
H
 
H
S
 
S
V
 
I
E
 
R
M
 
L
A
 
A
K
 
K
Q
 
A
A
 
C
E
 
A
K
 
A
S
 
E
G
 
G
A
 
A
H
 
H
G
 
G
L
 
L
L
 
L
V
 
V
V
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
S
 
S
R
 
K
P
 
P
T
 
P
Q
 
Q
A
 
R
G
 
G
L
 
L
Y
 
Q
A
 
A
H
 
H
F
 
F
T
 
T
T
 
A
V
 
V
A
 
A
D
 
D
A
 
A
T
 
T
E
 
E
L
 
L
P
 
P
V
 
M
M
 
L
L
 
L
Y
|
Y
D
 
D
I
 
I
P
 
P
P
 
G
R
|
R
S
 
S
I
 
A
V
 
V
P
 
P
I
 
I
E
 
E
V
 
P
D
 
D
T
 
T
L
 
I
R
 
R
R
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
S
H
 
H
P
 
P
R
 
N
V
 
I
L
 
V
A
 
G
V
 
V
K
|
K
D
 
D
A
 
A
K
 
K
G
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
H
A
 
S
G
 
G
S
 
A
E
 
Q
V
 
I
I
 
M
A
 
A
N
 
D
T
 
T
H
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
G
 
A
L
 
L
N
 
N
L
 
L
P
 
P
W
 
W
L
 
L
S
 
R
V
 
M
G
 
G
A
 
A
T
|
T
G
 
G
V
 
F
V
x
I
S
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
A
H
 
H
V
 
L
V
 
A
A
 
A
G
 
G
R
 
Q
I
 
L
R
 
R
A
 
E
M
 
L
I
x
L
D
 
S
A
 
A
Y
 
F
E
 
G
D
 
S
G
 
G
D
 
D
T
 
I
S
 
A
T
 
T
A
 
A
R
 
R
T
 
K
N
 
I
H
 
N
R
 
I
G
 
A
M
 
V
I
 
A
P
 
P
V
 
L
Y
 
C
R
 
N
A
 
A
F
 
M
S
 
S
R
 
R
V
 
L
G
 
G
G
 
G
V
 
V
V
 
T
F
 
L
A
 
S
K
 
K
T
 
A
A
 
G
L
 
L
R
 
R
L
 
L
R
 
Q
G
 
G
M
 
I
D
 
D
V
 
V
G
 
G
E
 
D
P
 
P
R
 
R
L
 
L
P
 
P
M
 
Q
V
 
V
S
 
A
A
 
A
P
 
T
E
 
P
E
 
E
L
 
Q
V
 
I
R
 
D
A
 
A
I
 
L
A
 
A
D
 
A
D
 
D
L
 
M
T
 
R
Q
 
A
A
 
A
G
 
S
V
 
V

5ktlA Dihydrodipicolinate synthase from the industrial and evolutionarily important cyanobacteria anabaena variabilis. (see paper)
42% identity, 82% coverage: 17:294/341 of query aligns to 5:285/295 of 5ktlA

query
sites
5ktlA
F
 
F
G
 
G
R
 
T
V
 
V
L
 
L
T
 
T
A
 
A
M
 
M
V
 
I
T
 
T
P
 
P
F
 
F
T
 
K
A
 
A
E
 
D
G
 
G
A
 
S
V
 
V
D
 
N
L
 
Y
K
 
A
R
 
V
A
 
A
Q
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
A
V
 
A
H
 
H
L
 
L
V
 
V
E
 
D
L
 
N
G
 
G
N
 
T
D
 
D
G
 
T
L
 
L
V
 
V
V
 
V
N
 
C
G
 
G
T
|
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
S
|
S
P
 
P
T
 
T
T
x
L
T
 
S
D
 
W
A
 
D
E
 
E
K
x
E
A
 
Y
D
 
N
L
 
L
V
 
F
R
 
V
A
x
E
V
 
V
V
 
L
E
x
Q
A
 
T
V
 
V
G
 
A
D
 
G
R
 
K
A
 
A
T
 
K
V
 
V
V
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
C
G
 
G
T
 
S
N
 
N
N
 
S
T
 
T
T
 
K
H
 
E
S
 
A
V
 
I
E
 
A
M
 
A
A
 
T
K
 
Q
Q
 
K
A
 
A
E
 
A
K
 
K
S
 
I
G
 
G
A
 
V
H
 
H
G
 
G
L
 
T
L
 
L
V
 
Q
V
 
V
T
 
V
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
S
 
N
R
 
K
P
 
P
T
 
P
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
A
 
Q
H
 
H
F
 
F
T
 
Q
T
 
A
V
 
I
A
 
A
D
 
Q
A
 
A
T
 
C
-
 
P
E
 
D
L
 
L
P
 
P
V
 
L
M
 
L
L
 
L
Y
|
Y
D
 
N
I
 
V
P
 
P
P
 
G
R
|
R
S
 
T
I
 
G
V
 
Q
P
 
N
I
 
L
E
 
S
V
 
P
D
 
E
T
 
T
L
 
V
R
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
E
H
 
I
P
 
D
R
 
N
V
 
I
L
 
I
A
 
G
V
 
V
K
|
K
D
 
E
A
 
A
K
 
S
G
 
G
D
 
N
L
 
L
L
 
D
A
 
Q
G
 
A
S
 
G
E
 
E
V
 
I
I
 
R
A
 
R
N
 
S
T
 
T
-
 
P
-
 
K
H
 
E
L
 
F
A
 
Q
Y
 
I
Y
 
Y
S
 
A
G
 
G
D
 
D
D
 
D
G
 
S
L
 
L
N
 
T
L
 
L
P
 
P
W
 
L
L
 
L
S
 
A
V
 
I
G
 
G
A
 
A
T
 
K
G
 
G
V
 
V
V
|
V
S
 
S
V
 
V
I
 
A
G
 
S
H
 
H
V
 
L
V
 
V
A
 
G
G
 
N
R
 
Q
I
 
L
R
 
Q
A
 
Q
M
 
M
I
 
I
D
 
Q
A
 
A
Y
 
F
E
 
N
D
 
S
G
 
G
D
 
Q
T
 
V
S
 
T
T
 
V
A
 
A
R
 
S
T
 
D
N
 
I
H
 
H
R
 
L
G
 
R
M
 
L
I
 
L
P
 
P
V
 
L
Y
 
F
R
 
K
A
 
A
F
 
L
S
 
F
R
 
I
V
 
T
G
 
T
G
 
N
V
 
P
V
 
I
F
 
P
A
 
I
K
 
K
T
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
K
L
 
L
R
 
Q
G
 
G
M
 
W
D
 
E
V
 
V
G
 
G
E
 
S
P
 
T
R
 
R
L
 
P
P
 
P
M
 
L
V
 
S
S
 
D
A
 
A
P
 
D
E
 
A
E
 
E
L
 
V
V
 
S
R
 
Q
A
 
K
I
 
L

5ud6C Crystal structure of dhdps from cyanidioschyzon merolae with lysine bound
43% identity, 82% coverage: 17:294/341 of query aligns to 4:292/299 of 5ud6C

query
sites
5ud6C
F
 
F
G
 
G
R
 
R
V
 
V
L
 
I
T
 
T
A
 
A
M
 
L
V
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
F
T
 
K
A
 
L
E
 
T
G
 
G
A
 
V
-
 
E
V
 
V
D
 
D
L
 
Y
K
 
G
R
 
V
A
 
A
Q
 
E
E
 
S
L
 
L
A
 
A
V
 
A
H
 
H
L
 
L
V
 
A
E
 
E
L
 
N
G
 
G
N
 
S
D
 
D
G
 
A
L
 
I
V
 
I
V
 
V
N
x
A
G
 
G
T
|
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
S
|
S
P
x
A
T
 
T
T
 
L
T
 
T
D
x
W
A
 
S
E
 
E
K
x
E
A
 
Y
D
 
E
L
 
L
V
 
F
R
 
R
A
 
V
V
 
V
V
 
K
E
 
S
A
 
A
V
 
V
-
 
A
G
 
G
D
 
T
R
 
K
A
 
C
T
 
R
V
 
V
V
 
I
A
 
A
G
|
G
A
 
A
G
 
G
T
 
S
N
|
N
N
 
S
T
 
T
T
 
E
H
x
E
S
 
A
V
 
I
E
 
E
M
 
A
A
 
T
K
 
K
Q
 
K
A
 
S
E
 
A
K
 
K
S
 
L
G
 
G
A
 
L
H
 
D
G
 
G
L
 
T
L
 
L
V
 
Q
V
 
V
T
 
V
P
 
P
Y
|
Y
Y
|
Y
S
 
N
R
 
K
P
 
P
T
 
P
Q
 
Q
A
 
Q
G
 
G
L
 
I
Y
 
M
A
 
A
H
 
H
F
 
F
T
 
R
T
 
A
V
 
I
A
 
A
D
 
N
A
 
A
T
 
A
-
 
P
E
 
D
L
 
L
P
 
P
V
 
M
M
 
M
L
 
L
Y
|
Y
D
 
N
I
 
I
P
 
P
P
 
G
R
|
R
S
 
T
I
 
G
V
 
I
P
 
N
I
 
M
E
 
T
V
 
A
D
 
E
T
 
T
L
 
S
R
 
I
R
 
K
L
 
L
A
 
A
E
 
E
H
 
M
-
 
C
P
 
P
R
 
N
V
 
I
L
 
V
A
 
A
V
 
L
K
|
K
D
 
E
A
 
A
K
 
S
G
 
G
D
 
N
L
 
L
L
 
E
A
 
Q
G
 
F
S
 
A
E
 
R
V
 
I
I
 
R
A
 
R
N
 
A
T
 
T
H
 
S
-
 
P
-
 
D
L
 
F
A
 
A
Y
 
L
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
G
 
A
L
 
L
N
 
T
L
 
L
P
 
P
W
 
L
L
 
L
S
 
S
V
 
L
G
 
G
A
 
G
T
 
N
G
 
G
V
 
V
V
|
V
S
 
S
V
 
V
I
 
A
G
 
S
H
 
H
V
 
F
V
 
I
A
 
G
G
 
P
R
 
E
I
 
I
R
 
Q
A
 
R
M
 
M
I
 
I
D
 
E
A
 
H
Y
 
F
E
 
V
D
 
D
-
 
L
G
 
G
D
 
N
T
 
P
S
 
E
T
 
E
A
 
A
R
 
F
T
 
R
N
 
I
H
 
H
R
 
C
G
 
R
M
 
Y
I
 
M
P
 
D
V
 
L
Y
 
F
R
 
E
A
 
A
F
 
L
S
 
F
R
 
V
V
 
M
G
 
A
G
 
N
V
 
P
V
 
I
F
 
P
A
 
A
K
 
K
T
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
R
L
 
L
R
 
L
G
 
G
M
 
W
D
 
P
V
 
V
G
 
G
E
 
P
P
 
T
R
 
R
L
 
L
P
 
P
M
 
L
V
 
T
-
 
D
-
 
I
-
 
T
-
 
A
S
 
S
A
 
A
P
 
E
E
 
Q
E
 
Q
L
 
L
V
 
R
R
 
Q
A
 
A
I
 
M

4fhaA Structure of dihydrodipicolinate synthase from streptococcus pneumoniae,bound to pyruvate and lysine
36% identity, 81% coverage: 19:294/341 of query aligns to 9:286/307 of 4fhaA

query
sites
4fhaA
R
 
K
V
 
I
L
 
I
T
 
T
A
 
A
M
 
F
V
 
I
T
 
T
P
 
P
F
 
F
T
 
H
A
 
E
E
 
D
G
 
G
A
 
S
V
 
I
D
 
N
L
 
F
K
 
D
R
 
A
A
 
I
Q
 
P
E
 
A
L
 
L
A
 
I
V
 
E
H
 
H
L
 
L
V
 
L
E
 
A
L
 
H
G
 
H
N
 
T
D
 
D
G
 
G
L
 
I
V
 
L
V
 
L
N
 
A
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
A
E
 
E
S
|
S
P
|
P
T
 
T
T
x
L
T
 
T
D
x
H
A
 
D
E
 
E
K
x
E
A
 
L
D
 
E
L
 
L
V
 
F
R
 
A
A
 
A
V
 
V
V
 
Q
E
 
K
A
 
V
V
 
V
G
 
N
D
 
G
R
 
R
A
 
V
T
 
P
V
 
L
V
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
V
G
 
G
T
 
T
N
 
N
N
 
D
T
 
T
T
 
R
H
 
D
S
 
S
V
 
I
E
 
E
M
 
F
A
 
V
K
 
K
Q
 
E
-
 
V
A
 
A
E
 
E
K
 
F
S
 
G
G
 
G
A
 
F
H
 
A
G
 
A
L
 
G
L
 
L
V
 
A
V
 
I
T
 
V
P
 
P
Y
|
Y
Y
 
Y
S
 
N
R
 
K
P
 
P
T
 
S
Q
 
Q
A
 
E
G
 
G
L
 
M
Y
 
Y
A
 
Q
H
 
H
F
 
F
T
 
K
T
 
A
V
 
I
A
 
A
D
 
D
A
 
A
T
 
S
E
 
D
L
 
L
P
 
P
V
 
I
M
 
I
L
 
I
Y
 
Y
D
 
N
I
 
I
P
 
P
P
 
G
R
 
R
S
 
V
I
 
V
V
 
V
P
 
E
I
 
L
E
 
T
V
 
P
D
 
E
T
 
T
L
 
M
R
 
L
R
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
D
H
 
H
P
 
P
R
 
N
V
 
I
L
 
I
A
 
G
V
 
V
K
 
K
D
 
E
A
 
C
K
 
T
G
 
S
D
 
-
L
 
L
L
 
A
A
 
N
G
 
M
S
 
A
E
 
Y
V
 
L
I
 
I
A
 
E
N
 
H
T
 
K
-
 
P
-
 
E
H
 
E
L
 
F
A
 
L
Y
 
I
Y
 
Y
S
 
T
G
 
G
D
 
E
D
 
D
G
 
G
L
 
D
N
 
A
L
 
F
P
 
H
W
 
A
L
 
M
S
 
N
V
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
D
G
 
G
V
 
V
V
 
I
S
 
S
V
 
V
I
 
A
G
 
S
H
 
H
V
 
T
V
 
N
A
 
G
G
 
D
R
 
E
I
 
M
R
 
H
A
 
E
M
 
M
I
 
F
D
 
T
A
 
A
Y
 
I
E
 
A
D
 
E
G
 
S
D
 
D
T
 
M
S
 
K
T
 
K
A
 
A
R
 
A
T
 
A
N
 
I
H
 
Q
R
 
R
G
 
K
M
 
F
I
 
I
P
 
P
V
 
K
Y
 
V
R
 
N
A
 
A
F
 
L
S
 
F
R
 
S
V
 
Y
G
 
P
G
 
S
V
 
P
V
 
A
F
 
P
A
 
V
K
 
K
T
 
A
A
 
I
L
 
L
R
 
N
L
 
Y
R
 
M
G
 
G
M
 
F
D
 
E
V
 
A
G
 
G
E
 
P
P
 
T
R
 
R
L
 
L
P
 
P
M
 
L
V
 
V
S
 
P
A
 
A
P
 
P
E
 
E
E
 
E
L
 
D
V
 
V
R
 
K
A
 
R
I
 
I

Q9X1K9 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase; HTPA synthase; EC 4.3.3.7 from Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / DSM 3109 / JCM 10099 / NBRC 100826 / MSB8) (see paper)
35% identity, 84% coverage: 17:303/341 of query aligns to 2:293/294 of Q9X1K9

query
sites
Q9X1K9
F
 
F
G
 
R
R
 
G
V
 
V
L
 
G
T
 
T
A
 
A
M
 
I
V
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
F
T
 
-
A
 
K
E
 
N
G
 
G
A
 
E
V
 
L
D
 
D
L
 
L
K
 
E
R
 
S
A
 
Y
Q
 
E
E
 
R
L
 
L
A
 
V
V
 
R
H
 
Y
L
 
Q
V
 
L
E
 
E
L
 
N
G
 
G
N
 
V
D
 
N
G
 
A
L
 
L
V
 
I
V
 
V
N
 
L
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
S
 
S
P
 
P
T
 
T
T
 
V
T
 
N
D
 
E
A
 
D
E
 
E
K
 
R
A
 
E
D
 
K
L
 
L
V
 
V
R
 
S
A
 
R
V
 
T
V
 
L
E
 
E
A
 
I
V
 
V
G
 
D
D
 
G
R
 
K
A
 
I
T
 
P
V
 
V
V
 
I
A
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
T
N
 
N
N
 
S
T
 
T
T
 
E
H
 
K
S
 
T
V
 
L
E
 
K
M
 
L
A
 
V
K
 
K
Q
 
Q
A
 
A
E
 
E
K
 
K
S
 
L
G
 
G
A
 
A
H
 
N
G
 
G
L
 
V
L
 
L
V
 
V
V
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
Y
S
 
N
R
 
K
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
A
 
E
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
A
 
Q
H
 
H
F
 
Y
T
 
K
T
 
Y
V
 
I
A
 
S
D
 
E
A
 
R
T
 
T
E
 
D
L
 
L
P
 
G
V
 
I
M
 
V
L
 
V
Y
 
Y
D
 
N
I
 
V
P
 
P
P
 
G
R
 
R
S
 
T
I
 
G
V
 
V
P
 
N
I
 
V
E
 
L
V
 
P
D
 
E
T
 
T
L
 
A
R
 
A
R
 
R
L
 
I
-
 
A
A
 
A
E
 
D
H
 
L
P
 
K
R
 
N
V
 
V
L
 
V
A
 
G
V
 
I
K
 
K
D
 
E
A
 
A
K
 
N
G
 
P
D
|
D
L
x
I
L
x
D
A
 
Q
G
 
I
S
 
D
E
 
R
V
 
T
I
 
V
-
 
S
-
 
L
-
 
T
-
 
K
-
 
Q
A
 
A
N
 
R
T
 
S
H
 
D
L
 
F
A
 
M
Y
 
V
Y
 
W
S
 
S
G
 
G
D
 
N
D
 
D
G
 
D
L
 
R
N
 
T
L
 
F
P
 
Y
W
 
L
L
 
L
S
 
C
V
 
A
G
 
G
A
 
G
T
 
D
G
 
G
V
 
V
V
 
I
S
 
S
V
 
V
I
 
V
G
 
S
H
 
N
V
 
V
V
 
A
A
 
P
G
 
K
R
 
Q
I
 
M
R
 
V
A
 
E
M
 
L
I
 
C
D
 
A
A
 
E
Y
 
Y
E
 
F
D
 
S
G
 
G
D
 
N
T
 
L
S
 
E
T
 
K
A
 
S
R
 
R
T
 
E
N
 
V
H
 
H
R
 
R
G
 
K
M
 
L
I
 
R
P
 
P
V
 
L
Y
 
M
R
 
K
A
 
A
F
 
L
S
 
F
R
 
V
V
 
E
G
 
T
G
 
N
V
 
P
V
 
I
F
 
P
A
 
V
K
 
K
T
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
N
L
 
L
R
 
M
G
 
G
M
 
F
D
 
I
V
 
E
G
 
N
E
 
E
P
 
L
R
 
R
L
 
L
P
 
P
M
 
L
V
 
V
S
 
P
A
 
A
P
 
S
E
 
E
E
 
K
L
 
T
V
 
V
R
 
E
A
 
L
I
 
L
A
 
R
D
 
N
D
 
V
L
 
L
T
 
K
Q
 
E
A
 
S
G
 
G
V
 
L

1o5kA Crystal structure of dihydrodipicolinate synthase (tm1521) from thermotoga maritima at 1.80 a resolution
35% identity, 84% coverage: 17:303/341 of query aligns to 3:294/295 of 1o5kA

query
sites
1o5kA
F
 
F
G
 
R
R
 
G
V
 
V
L
 
G
T
 
T
A
 
A
M
 
I
V
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
F
T
 
-
A
 
K
E
 
N
G
 
G
A
 
E
V
 
L
D
 
D
L
 
L
K
 
E
R
 
S
A
 
Y
Q
 
E
E
 
R
L
 
L
A
 
V
V
 
R
H
 
Y
L
 
Q
V
 
L
E
 
E
L
 
N
G
 
G
N
 
V
D
 
N
G
 
A
L
 
L
V
 
I
V
 
V
N
 
L
G
 
G
T
|
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
S
 
S
P
 
P
T
 
T
T
 
V
T
 
N
D
 
E
A
 
D
E
 
E
K
 
R
A
 
E
D
 
K
L
 
L
V
 
V
R
 
S
A
 
R
V
 
T
V
 
L
E
|
E
A
 
I
V
 
V
G
x
D
D
 
G
R
 
K
A
 
I
T
 
P
V
 
V
V
 
I
A
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
T
N
 
N
N
 
S
T
 
T
T
 
E
H
 
K
S
 
T
V
 
L
E
 
K
M
 
L
A
 
V
K
 
K
Q
 
Q
A
 
A
E
 
E
K
 
K
S
 
L
G
 
G
A
 
A
H
 
N
G
 
G
L
 
V
L
 
L
V
 
V
V
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
S
 
N
R
 
K
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
A
 
E
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
A
 
Q
H
 
H
F
 
Y
T
 
K
T
 
Y
V
 
I
A
 
S
D
 
E
A
 
R
T
 
T
E
 
D
L
 
L
P
 
G
V
 
I
M
 
V
L
 
V
Y
|
Y
D
 
N
I
 
V
P
 
P
P
 
G
R
|
R
S
 
T
I
 
G
V
 
V
P
 
N
I
 
V
E
 
L
V
 
P
D
 
E
T
 
T
L
 
A
R
 
A
R
 
R
L
 
I
-
 
A
A
 
A
E
 
D
H
 
L
P
 
K
R
 
N
V
 
V
L
 
V
A
 
G
V
 
I
K
|
K
D
 
E
A
 
A
K
 
N
G
 
P
D
 
D
L
 
I
L
 
D
A
 
Q
G
 
I
S
 
D
E
 
R
V
 
T
I
 
V
-
 
S
-
 
L
-
 
T
-
 
K
-
 
Q
A
 
A
N
 
R
T
 
S
H
 
D
L
 
F
A
 
M
Y
 
V
Y
 
W
S
 
S
G
 
G
D
 
N
D
 
D
G
 
D
L
 
R
N
 
T
L
 
F
P
 
Y
W
 
L
L
 
L
S
 
C
V
 
A
G
 
G
A
 
G
T
 
D
G
 
G
V
 
V
V
x
I
S
 
S
V
 
V
I
 
V
G
 
S
H
 
N
V
 
V
V
 
A
A
 
P
G
 
K
R
 
Q
I
 
M
R
 
V
A
 
E
M
 
L
I
 
C
D
 
A
A
 
E
Y
 
Y
E
 
F
D
 
S
G
 
G
D
 
N
T
 
L
S
 
E
T
 
K
A
 
S
R
 
R
T
 
E
N
 
V
H
 
H
R
 
R
G
 
K
M
 
L
I
 
R
P
 
P
V
 
L
Y
 
M
R
 
K
A
 
A
F
 
L
S
 
F
R
 
V
V
 
E
G
 
T
G
 
N
V
 
P
V
 
I
F
 
P
A
 
V
K
 
K
T
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
N
L
 
L
R
 
M
G
 
G
M
 
F
D
 
I
V
 
E
G
 
N
E
 
E
P
 
L
R
 
R
L
 
L
P
 
P
M
 
L
V
 
V
S
 
P
A
 
A
P
 
S
E
 
E
E
 
K
L
 
T
V
 
V
R
 
E
A
 
L
I
 
L
A
 
R
D
 
N
D
 
V
L
 
L
T
 
K
Q
 
E
A
 
S
G
 
G
V
 
L

4i7wA Agrobacterium tumefaciens dhdps with lysine and pyruvate
38% identity, 84% coverage: 17:303/341 of query aligns to 2:292/294 of 4i7wA

query
sites
4i7wA
F
 
F
G
 
K
R
 
G
V
 
S
L
 
I
T
 
P
A
 
A
M
 
L
V
 
I
T
 
T
P
 
P
F
 
F
T
 
T
A
 
D
E
 
N
G
 
G
A
 
A
V
 
V
D
 
D
L
 
-
K
 
-
R
 
-
A
 
E
Q
 
Q
E
 
A
L
 
F
A
 
A
V
 
A
H
 
H
L
 
V
-
 
E
-
 
W
-
 
Q
V
 
I
E
 
A
L
 
E
G
 
G
N
 
S
D
 
N
G
 
G
L
 
L
V
 
V
V
 
P
N
 
V
G
 
G
T
|
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
S
|
S
P
|
P
T
 
T
T
x
L
T
 
S
D
 
H
A
 
D
E
 
E
K
x
H
A
 
K
D
 
R
L
 
V
V
 
V
R
 
E
A
 
L
V
 
C
V
 
I
E
 
E
A
 
V
V
 
A
G
 
A
D
 
K
R
 
R
A
 
V
T
 
P
V
 
V
V
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
S
N
|
N
N
 
N
T
 
T
T
 
D
H
x
E
S
 
A
V
 
I
E
 
E
M
 
L
A
 
A
K
 
L
Q
 
H
A
 
A
E
 
Q
K
 
D
S
 
A
G
 
G
A
 
A
H
 
D
G
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
V
V
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
|
Y
Y
|
Y
S
 
N
R
 
K
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
A
 
K
G
 
G
L
 
L
Y
 
F
A
 
A
H
 
H
F
 
F
T
 
S
T
 
A
V
 
V
A
 
A
D
 
E
A
 
A
T
 
V
E
 
K
L
 
L
P
 
P
V
 
I
M
 
V
L
 
I
Y
|
Y
D
 
N
I
 
I
P
 
P
P
 
P
R
|
R
S
 
S
I
 
V
V
 
V
P
 
D
I
 
M
E
 
S
V
 
P
D
 
E
T
 
T
L
 
M
R
 
G
R
 
A
L
 
L
A
 
V
E
 
K
-
 
A
H
 
H
P
 
K
R
 
N
V
 
I
L
 
V
A
 
G
V
 
V
K
|
K
D
 
D
A
 
A
K
 
T
G
 
G
D
 
K
L
 
L
L
 
D
A
 
R
G
 
V
S
 
S
E
 
E
-
 
Q
-
 
R
V
 
I
I
 
S
A
 
C
N
 
G
T
 
K
H
 
D
L
 
F
A
 
I
Y
 
Q
Y
 
L
S
 
S
G
 
G
D
 
E
D
 
D
G
 
S
L
 
T
N
 
A
L
 
L
P
 
G
W
 
F
L
 
N
S
 
A
V
 
H
G
 
G
A
 
G
T
 
V
G
 
G
V
 
C
V
x
I
S
 
S
V
 
V
I
 
S
G
 
A
H
 
N
V
 
V
V
 
A
A
 
P
G
 
R
R
 
L
I
 
C
R
 
S
A
 
E
M
 
F
I
 
Q
D
 
A
A
 
A
Y
 
M
E
 
L
D
 
A
G
 
G
D
 
D
T
 
Y
S
 
A
T
 
K
A
 
A
R
 
L
T
 
E
N
 
Y
H
 
Q
R
 
D
G
 
R
M
 
L
I
 
M
P
 
P
V
 
L
Y
 
H
R
 
R
A
 
A
F
 
I
S
 
F
R
 
M
V
 
E
G
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
C
F
 
G
A
 
T
K
 
K
T
 
Y
A
 
A
L
 
L
-
 
S
R
 
K
L
 
T
R
 
R
G
 
G
M
 
C
D
 
N
V
 
-
G
 
R
E
 
K
P
 
V
R
 
R
L
 
S
P
 
P
M
 
L
V
 
M
S
 
S
A
 
T
P
 
L
E
 
E
E
 
P
L
 
A
V
 
T
R
 
E
A
 
A
I
 
A
A
 
I
D
 
D
-
 
A
D
 
A
L
 
L
T
 
K
Q
 
H
A
 
A
G
 
G
V
 
L

Q8UGL3 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase; HTPA synthase; EC 4.3.3.7 from Agrobacterium fabrum (strain C58 / ATCC 33970) (Agrobacterium tumefaciens (strain C58)) (see paper)
38% identity, 84% coverage: 17:303/341 of query aligns to 2:292/294 of Q8UGL3

query
sites
Q8UGL3
F
 
F
G
 
K
R
 
G
V
 
S
L
 
I
T
 
P
A
 
A
M
 
L
V
 
I
T
 
T
P
 
P
F
 
F
T
 
T
A
 
D
E
 
N
G
 
G
A
 
S
V
 
V
D
 
D
L
 
E
K
 
K
R
 
-
A
 
-
Q
 
-
E
 
A
L
 
F
A
 
A
V
 
A
H
 
H
L
 
V
-
 
E
-
 
W
-
 
Q
V
 
I
E
 
A
L
 
E
G
 
G
N
 
S
D
 
N
G
 
G
L
 
L
V
 
V
V
 
P
N
 
V
G
 
G
T
 
T
T
|
T
G
 
G
E
 
E
S
 
S
P
|
P
T
 
T
T
 
L
T
 
S
D
 
H
A
 
D
E
 
E
K
x
H
A
 
K
D
 
R
L
 
V
V
 
V
R
 
E
A
 
L
V
 
C
V
 
I
E
 
E
A
 
V
V
 
A
G
 
A
D
 
K
R
 
R
A
 
V
T
 
P
V
 
V
V
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
S
N
|
N
N
 
N
T
 
T
T
 
D
H
x
E
S
 
A
V
 
I
E
 
E
M
 
L
A
 
A
K
 
L
Q
 
H
A
 
A
E
 
Q
K
 
E
S
 
A
G
 
G
A
 
A
H
 
D
G
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
V
V
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
|
Y
Y
 
Y
S
 
N
R
 
K
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
A
 
K
G
 
G
L
 
L
Y
 
F
A
 
A
H
 
H
F
 
F
T
 
S
T
 
A
V
 
V
A
 
A
D
 
E
A
 
A
T
 
V
E
 
K
L
 
L
P
 
P
V
 
I
M
 
V
L
 
I
Y
 
Y
D
 
N
I
 
I
P
 
P
P
 
P
R
 
R
S
 
S
I
 
V
V
 
V
P
 
D
I
 
M
E
 
S
V
 
P
D
 
E
T
 
T
L
 
M
R
 
G
R
 
A
L
 
L
A
 
V
E
 
K
-
 
A
H
 
H
P
 
K
R
 
N
V
 
I
L
 
I
A
 
G
V
 
V
K
|
K
D
 
D
A
 
A
K
 
T
G
 
G
D
 
K
L
 
L
L
 
D
A
 
R
G
 
V
S
 
S
E
 
E
-
 
Q
-
 
R
V
 
I
I
 
S
A
 
C
N
 
G
T
 
K
H
 
D
L
 
F
A
 
V
Y
 
Q
Y
 
L
S
 
S
G
 
G
D
 
E
D
 
D
G
 
G
L
 
T
N
 
A
L
 
L
P
 
G
W
 
F
L
 
N
S
 
A
V
 
H
G
 
G
A
 
G
T
 
V
G
 
G
V
 
C
V
 
I
S
 
S
V
 
V
I
 
T
G
 
A
H
 
N
V
 
V
V
 
A
A
 
P
G
 
R
R
 
L
I
 
C
R
 
S
A
 
E
M
 
F
I
 
Q
D
 
A
A
 
A
Y
 
M
E
 
L
D
 
A
G
 
G
D
 
D
T
 
Y
S
 
A
T
 
K
A
 
A
R
 
L
T
 
E
N
 
Y
H
 
Q
R
 
D
G
 
R
M
 
L
I
 
M
P
 
P
V
 
L
Y
 
H
R
 
R
A
 
A
F
 
I
S
 
F
R
 
M
V
 
E
G
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
C
F
 
G
A
 
T
K
 
K
T
 
Y
A
 
A
L
 
L
-
 
S
R
 
K
L
 
T
R
 
R
G
 
G
M
 
G
D
 
N
V
 
-
G
 
R
E
 
R
P
 
V
R
 
R
L
 
S
P
 
P
M
 
L
V
 
M
S
 
S
A
 
T
P
 
L
E
 
E
E
 
P
L
 
A
V
 
T
R
 
E
A
 
A
I
 
A
A
 
I
D
 
D
-
 
A
D
 
A
L
 
L
T
 
K
Q
 
H
A
 
A
G
 
G
V
 
L

Q07607 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase; HTPA synthase; Protein MosA; EC 4.3.3.7 from Rhizobium meliloti (Ensifer meliloti) (Sinorhizobium meliloti) (see paper)
35% identity, 85% coverage: 17:305/341 of query aligns to 2:292/292 of Q07607

query
sites
Q07607
F
 
F
G
 
E
R
 
G
V
 
S
L
 
I
T
 
T
A
 
A
M
 
L
V
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
F
T
 
-
A
 
A
E
 
D
G
 
D
A
 
R
V
 
I
D
 
D
L
 
E
K
 
V
R
 
A
A
 
L
Q
 
H
E
 
D
L
 
L
A
 
V
V
 
E
H
 
W
L
 
Q
V
 
I
E
 
E
L
 
E
G
 
G
N
 
S
D
 
F
G
 
G
L
 
L
V
 
V
V
 
P
N
 
C
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
S
 
S
P
 
P
T
 
T
T
 
L
T
 
S
D
 
K
A
 
S
E
 
E
K
 
H
A
 
E
D
 
Q
L
 
V
V
 
V
R
 
E
A
 
I
V
 
T
V
 
I
E
 
K
A
 
T
V
 
A
G
 
N
D
 
G
R
 
R
A
 
V
T
 
P
V
 
V
V
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
S
N
 
N
N
 
S
T
 
T
T
 
A
H
 
E
S
 
A
V
 
I
E
 
A
M
 
F
A
 
V
K
 
R
Q
 
H
A
 
A
E
 
Q
K
 
N
S
 
A
G
 
G
A
 
A
H
 
D
G
 
G
L
 
V
L
 
L
V
 
I
V
 
V
T
 
S
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
Y
S
 
N
R
 
K
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
A
 
E
G
 
G
L
 
I
Y
 
Y
A
 
Q
H
 
H
F
 
F
T
 
K
T
 
A
V
 
I
A
 
D
D
 
A
A
 
A
T
 
S
E
 
T
L
 
I
P
 
P
V
 
I
M
 
I
L
 
V
Y
 
Y
D
 
N
I
 
I
P
 
P
P
 
G
R
 
R
S
 
S
I
 
A
V
 
I
P
 
E
I
 
I
E
 
H
V
 
V
D
 
E
T
 
T
L
 
L
R
 
A
R
 
R
L
 
I
A
 
F
E
 
E
H
 
D
-
 
C
P
 
P
R
 
N
V
 
V
L
 
K
A
 
G
V
 
V
K
|
K
D
 
D
A
 
A
K
 
T
G
 
G
D
 
N
L
 
L
L
 
L
A
 
R
G
 
P
S
 
S
-
 
L
-
 
E
E
 
R
V
 
M
I
 
A
A
 
C
N
 
G
T
 
E
H
 
D
L
 
F
A
 
N
Y
 
L
Y
 
L
S
 
T
G
 
G
D
 
E
D
 
D
G
 
G
L
 
T
N
 
A
L
 
L
P
 
G
W
 
Y
L
 
M
S
 
A
V
 
H
G
 
G
A
 
G
T
 
H
G
 
G
V
 
C
V
 
I
S
 
S
V
 
V
I
 
T
G
 
A
H
 
N
V
 
V
V
 
A
A
 
P
G
 
A
R
 
L
I
 
C
R
 
A
A
 
D
M
 
F
I
 
Q
D
 
Q
A
 
A
Y
 
C
E
 
L
D
 
N
G
 
G
D
 
D
T
 
F
S
 
A
T
 
A
A
 
A
R
 
L
T
 
K
N
 
L
H
 
Q
R
 
D
G
 
R
M
 
L
I
 
M
P
 
P
V
 
L
Y
 
H
R
 
R
A
 
A
F
 
L
S
 
F
R
 
L
V
 
E
G
 
T
G
 
N
V
 
P
V
 
A
F
 
G
A
 
A
K
 
K
T
 
Y
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
L
 
R
R
 
L
G
 
G
M
 
R
D
 
M
V
 
R
G
 
G
E
 
D
P
 
L
R
 
R
L
 
L
P
 
P
M
 
L
V
 
V
S
 
T
A
 
I
P
 
S
E
 
P
E
 
S
L
 
F
V
 
Q
R
 
E
A
 
E
I
 
I
A
 
D
D
 
D
D
 
A
L
 
M
T
 
R
Q
 
H
A
 
A
G
 
G
V
 
I
P
 
L
L
 
L

3di1B Crystal structure of the staphylococcus aureus dihydrodipicolinate synthase-pyruvate complex (see paper)
38% identity, 65% coverage: 17:237/341 of query aligns to 5:227/291 of 3di1B

query
sites
3di1B
F
 
F
G
 
E
R
 
G
V
 
V
L
 
G
T
 
V
A
|
A
M
 
L
V
 
T
T
 
T
P
 
P
F
 
F
T
 
T
A
 
-
E
 
N
G
 
N
A
 
K
V
 
V
D
 
N
L
 
I
K
 
E
R
 
A
A
 
L
Q
 
K
E
 
T
L
 
H
A
 
V
V
 
N
H
 
F
L
 
L
V
 
L
E
 
E
L
 
N
G
 
N
N
 
A
D
 
Q
G
 
A
L
 
I
V
 
I
V
 
V
N
 
N
G
|
G
T
|
T
T
|
T
G
 
A
E
 
E
S
 
S
P
 
P
T
 
T
T
 
L
T
 
T
D
 
T
A
 
D
E
 
E
K
 
K
A
 
E
D
 
R
L
 
I
V
 
L
R
 
K
A
 
T
V
 
V
V
 
I
E
 
D
A
 
L
V
 
V
G
 
D
D
 
K
R
 
R
A
 
V
T
 
P
V
 
V
V
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
G
T
 
T
N
 
N
N
 
D
T
 
T
T
 
E
H
 
K
S
 
S
V
 
I
E
 
Q
M
 
A
A
 
S
K
 
I
Q
 
Q
A
 
A
E
 
K
K
 
A
S
 
L
G
 
G
A
 
A
H
 
D
G
 
A
L
 
I
L
 
M
V
 
L
V
 
I
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
S
 
N
R
 
K
P
 
T
T
 
N
Q
 
Q
A
 
R
G
 
G
L
 
L
Y
 
V
A
 
K
H
 
H
F
 
F
T
 
E
T
 
A
V
 
I
A
 
A
D
 
D
A
 
A
T
 
V
E
 
K
L
 
L
P
 
P
V
 
V
M
 
V
L
 
L
Y
|
Y
D
 
N
I
 
V
P
 
P
P
 
S
R
|
R
S
 
T
I
 
N
V
 
M
P
 
T
I
 
I
E
 
E
V
 
P
D
 
E
T
 
T
L
 
V
R
 
E
R
 
I
L
 
L
A
 
S
E
 
Q
H
 
H
P
 
P
R
 
Y
V
 
I
L
 
V
A
 
A
V
 
L
K
|
K
D
 
D
A
 
A
K
 
T
G
 
N
D
 
D
L
 
F
L
 
E
A
 
Y
G
 
L
S
 
E
E
 
E
V
 
V
-
 
K
-
 
K
-
 
R
I
 
I
A
 
D
N
 
T
T
 
N
H
 
S
L
 
F
A
 
A
Y
 
L
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
D
 
N
D
 
D
G
 
D
L
 
N
N
 
V
L
 
V
P
 
E
W
 
Y
L
 
Y
S
 
Q
V
 
R
G
 
G
A
 
G
T
 
Q
G
 
G
V
 
V
V
x
I
S
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
A
H
 
N
V
 
V
V
 
I
A
 
P
G
 
K
R
 
E
I
 
F
R
 
Q
A
 
A
M
 
L
I
 
Y
D
 
D
A
 
A
Y
 
Q
E
 
Q
D
 
S
G
 
G

Q5HG25 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase; HTPA synthase; EC 4.3.3.7 from Staphylococcus aureus (strain COL) (see paper)
38% identity, 65% coverage: 17:237/341 of query aligns to 5:227/295 of Q5HG25

query
sites
Q5HG25
F
 
F
G
 
E
R
 
G
V
 
V
L
 
G
T
 
V
A
 
A
M
 
L
V
 
T
T
 
T
P
 
P
F
 
F
T
 
T
A
 
-
E
 
N
G
 
N
A
 
K
V
 
V
D
 
N
L
 
I
K
 
E
R
 
A
A
 
L
Q
 
K
E
 
T
L
 
H
A
 
V
V
 
N
H
 
F
L
 
L
V
 
L
E
 
E
L
 
N
G
 
N
N
 
A
D
 
Q
G
 
A
L
 
I
V
 
I
V
 
V
N
 
N
G
 
G
T
 
T
T
|
T
G
 
A
E
 
E
S
 
S
P
 
P
T
 
T
T
 
L
T
 
T
D
 
T
A
 
D
E
 
E
K
 
K
A
 
E
D
 
R
L
 
I
V
 
L
R
 
K
A
 
T
V
 
V
V
 
I
E
 
D
A
 
L
V
 
V
G
 
D
D
 
K
R
 
R
A
 
V
T
 
P
V
 
V
V
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
G
T
 
T
N
 
N
N
 
D
T
 
T
T
 
E
H
 
K
S
 
S
V
 
I
E
 
Q
M
 
A
A
 
S
K
 
I
Q
 
Q
A
 
A
E
 
K
K
 
A
S
 
L
G
 
G
A
 
A
H
 
D
G
 
A
L
 
I
L
 
M
V
 
L
V
 
I
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
Y
S
 
N
R
 
K
P
 
T
T
 
N
Q
 
Q
A
 
R
G
 
G
L
 
L
Y
 
V
A
 
K
H
 
H
F
 
F
T
 
E
T
 
A
V
 
I
A
 
A
D
 
D
A
 
A
T
 
V
E
 
K
L
 
L
P
 
P
V
 
V
M
 
V
L
 
L
Y
 
Y
D
 
N
I
 
V
P
 
P
P
 
S
R
 
R
S
 
T
I
 
N
V
 
M
P
 
T
I
 
I
E
 
E
V
 
P
D
 
E
T
 
T
L
 
V
R
 
E
R
 
I
L
 
L
A
 
S
E
 
Q
H
 
H
P
 
P
R
 
Y
V
 
I
L
 
V
A
 
A
V
 
L
K
|
K
D
 
D
A
 
A
K
 
T
G
 
N
D
 
D
L
 
F
L
 
E
A
 
Y
G
 
L
S
 
E
E
 
E
V
 
V
-
 
K
-
 
K
-
 
R
I
 
I
A
 
D
N
 
T
T
 
N
H
 
S
L
 
F
A
 
A
Y
 
L
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
D
 
N
D
 
D
G
 
D
L
 
N
N
 
V
L
 
V
P
 
E
W
 
Y
L
 
Y
S
 
Q
V
 
R
G
 
G
A
 
G
T
 
Q
G
 
G
V
 
V
V
 
I
S
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
A
H
 
N
V
 
V
V
 
I
A
 
P
G
 
K
R
 
E
I
 
F
R
 
Q
A
 
A
M
 
L
I
 
Y
D
 
D
A
 
A
Y
 
Q
E
 
Q
D
 
S
G
 
G

4dxvA Crystal structure of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii complexed with mg and cl ions at 1.80 a resolution
33% identity, 83% coverage: 21:303/341 of query aligns to 6:290/291 of 4dxvA

query
sites
4dxvA
L
 
I
T
 
V
A
 
A
M
 
I
V
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
T
 
L
A
 
K
E
 
D
G
 
G
A
 
G
V
 
V
D
 
D
L
 
W
K
 
K
R
 
S
A
 
L
Q
 
E
E
 
K
L
 
L
A
 
V
V
 
E
H
 
W
L
 
H
V
 
I
E
 
E
L
 
Q
G
 
G
N
 
T
D
 
N
G
 
S
L
 
I
V
 
V
V
 
A
N
 
V
G
 
G
T
|
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
S
 
A
P
 
S
T
 
T
T
 
L
T
 
S
D
 
M
A
 
E
E
 
E
K
 
H
A
 
T
D
 
Q
L
 
V
V
 
I
R
 
K
A
 
E
V
 
I
V
 
I
E
 
R
A
 
V
V
 
A
G
 
N
D
 
K
R
 
R
A
 
I
T
 
P
V
 
I
V
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
G
T
 
A
N
 
N
N
 
S
T
 
T
T
 
R
H
 
E
S
 
A
V
 
I
E
 
E
M
 
L
A
 
T
K
 
K
Q
 
A
A
 
A
E
 
K
K
 
D
S
 
L
G
 
G
A
 
A
H
 
D
G
 
A
L
 
A
L
 
L
V
 
L
V
 
V
T
|
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
S
 
N
R
 
K
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
A
 
E
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
A
 
Q
H
 
H
F
 
Y
T
 
K
T
 
A
V
 
I
A
 
A
D
 
E
A
 
A
T
 
V
E
 
E
L
 
L
P
 
P
V
 
L
M
 
I
L
 
L
Y
|
Y
D
x
N
I
x
V
P
|
P
P
 
G
R
|
R
S
x
T
I
 
G
V
 
V
P
 
D
I
 
L
E
 
S
V
 
N
D
 
D
T
 
T
L
 
A
R
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
E
H
 
I
P
 
P
R
 
N
V
 
I
L
 
V
A
 
G
V
 
I
K
|
K
D
 
D
A
 
A
K
 
T
G
 
G
D
 
D
L
 
V
L
 
P
A
 
R
G
 
G
S
 
K
E
 
A
V
 
L
I
 
I
-
 
D
-
 
A
A
 
L
N
 
N
T
 
G
H
 
K
L
 
M
A
 
A
Y
 
V
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
G
 
E
L
 
T
N
 
A
L
 
W
P
 
E
W
 
L
L
 
M
S
 
L
V
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
D
G
 
G
V
 
N
V
x
I
S
 
S
V
 
V
I
 
T
G
 
A
H
 
N
V
 
I
V
 
A
A
 
P
G
 
K
R
 
A
I
 
M
R
 
S
A
 
E
M
 
V
I
 
C
D
 
A
A
 
V
Y
 
A
E
 
I
D
 
A
G
 
K
D
 
D
T
 
E
S
 
Q
T
 
Q
A
 
A
R
 
K
T
 
T
N
 
L
H
 
N
R
 
N
G
 
K
M
 
I
I
 
A
P
 
N
V
 
L
Y
 
H
R
 
N
A
 
I
F
 
L
S
 
F
R
 
C
V
 
E
G
 
S
G
 
N
V
 
P
V
 
I
F
 
P
A
 
V
K
 
K
T
 
W
A
 
A
L
 
L
R
 
H
L
 
E
R
 
M
G
 
G
M
 
L
D
 
I
V
 
D
G
 
T
E
 
G
P
 
I
R
 
R
L
 
L
P
 
P
M
 
L
V
 
T
S
 
P
A
 
L
P
 
A
E
 
E
E
 
Q
L
 
Y
V
 
R
R
 
E
A
 
P
I
 
L
A
 
R
D
 
N
D
 
A
L
 
L
T
 
K
Q
 
D
A
 
A
G
 
G
V
 
I

3u8gA Crystal structure of the complex of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with oxalic acid at 1.80 a resolution
33% identity, 83% coverage: 21:303/341 of query aligns to 6:290/291 of 3u8gA

query
sites
3u8gA
L
 
I
T
 
V
A
|
A
M
 
I
V
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
T
 
L
A
 
K
E
 
D
G
 
G
A
 
G
V
 
V
D
 
D
L
 
W
K
 
K
R
 
S
A
 
L
Q
 
E
E
 
K
L
 
L
A
 
V
V
 
E
H
 
W
L
 
H
V
 
I
E
 
E
L
 
Q
G
 
G
N
 
T
D
 
N
G
 
S
L
 
I
V
 
V
V
 
A
N
 
V
G
|
G
T
|
T
T
|
T
G
 
G
E
 
E
S
 
A
P
 
S
T
 
T
T
 
L
T
 
S
D
 
M
A
 
E
E
 
E
K
 
H
A
 
T
D
 
Q
L
 
V
V
 
I
R
 
K
A
 
E
V
 
I
V
 
I
E
 
R
A
 
V
V
 
A
G
 
N
D
 
K
R
 
R
A
 
I
T
 
P
V
 
I
V
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
G
T
 
A
N
 
N
N
 
S
T
 
T
T
 
R
H
 
E
S
 
A
V
 
I
E
 
E
M
 
L
A
 
T
K
 
K
Q
 
A
A
 
A
E
 
K
K
 
D
S
 
L
G
 
G
A
 
A
H
 
D
G
 
A
L
 
A
L
|
L
V
 
L
V
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
S
 
N
R
 
K
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
A
 
E
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
A
 
Q
H
 
H
F
 
Y
T
 
K
T
 
A
V
 
I
A
 
A
D
 
E
A
 
A
T
 
V
E
 
E
L
 
L
P
 
P
V
 
L
M
 
I
L
 
L
Y
|
Y
D
 
N
I
 
V
P
 
P
P
 
G
R
|
R
S
 
T
I
 
G
V
 
V
P
 
D
I
 
L
E
 
S
V
 
N
D
 
D
T
 
T
L
 
A
R
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
E
H
 
I
P
 
P
R
 
N
V
 
I
L
 
V
A
 
G
V
 
I
K
|
K
D
 
D
A
 
A
K
 
T
G
 
G
D
 
D
L
 
V
L
 
P
A
 
R
G
 
G
S
 
K
E
 
A
V
 
L
I
 
I
-
 
D
-
 
A
A
 
L
N
 
N
T
 
G
H
 
K
L
 
M
A
 
A
Y
 
V
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
G
 
E
L
 
T
N
 
A
L
 
W
P
 
E
W
 
L
L
 
M
S
 
L
V
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
D
G
 
G
V
 
N
V
x
I
S
 
S
V
 
V
I
 
T
G
 
A
H
 
N
V
 
I
V
 
A
A
 
P
G
 
K
R
 
A
I
 
M
R
 
S
A
 
E
M
 
V
I
 
C
D
 
A
A
 
V
Y
 
A
E
 
I
D
 
A
G
 
K
D
 
D
T
 
E
S
 
Q
T
 
Q
A
 
A
R
 
K
T
 
T
N
 
L
H
 
N
R
 
N
G
 
K
M
 
I
I
 
A
P
 
N
V
 
L
Y
 
H
R
 
N
A
 
I
F
 
L
S
 
F
R
 
C
V
 
E
G
 
S
G
 
N
V
 
P
V
 
I
F
 
P
A
 
V
K
 
K
T
 
W
A
 
A
L
 
L
R
 
H
L
 
E
R
 
M
G
 
G
M
 
L
D
 
I
V
 
D
G
 
T
E
 
G
P
 
I
R
 
R
L
 
L
P
 
P
M
 
L
V
 
T
S
 
P
A
 
L
P
 
A
E
 
E
E
 
Q
L
 
Y
V
 
R
R
 
E
A
 
P
I
 
L
A
 
R
D
 
N
D
 
A
L
 
L
T
 
K
Q
 
D
A
 
A
G
 
G
V
 
I

3tdfA Crystal structure of the complex of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with 2-ketobutanoic acid at 1.99 a resolution
33% identity, 83% coverage: 21:303/341 of query aligns to 6:290/291 of 3tdfA

query
sites
3tdfA
L
 
I
T
 
V
A
|
A
M
 
I
V
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
T
 
L
A
 
K
E
 
D
G
 
G
A
 
G
V
 
V
D
 
D
L
 
W
K
 
K
R
 
S
A
 
L
Q
 
E
E
 
K
L
 
L
A
 
V
V
 
E
H
 
W
L
 
H
V
 
I
E
 
E
L
 
Q
G
 
G
N
 
T
D
 
N
G
 
S
L
 
I
V
 
V
V
 
A
N
 
V
G
 
G
T
|
T
T
|
T
G
 
G
E
 
E
S
 
A
P
 
S
T
 
T
T
 
L
T
 
S
D
 
M
A
 
E
E
 
E
K
 
H
A
 
T
D
 
Q
L
 
V
V
 
I
R
 
K
A
 
E
V
 
I
V
 
I
E
 
R
A
 
V
V
 
A
G
 
N
D
 
K
R
 
R
A
 
I
T
 
P
V
 
I
V
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
G
T
 
A
N
 
N
N
 
S
T
 
T
T
 
R
H
 
E
S
 
A
V
 
I
E
 
E
M
 
L
A
 
T
K
 
K
Q
 
A
A
 
A
E
 
K
K
 
D
S
 
L
G
 
G
A
 
A
H
 
D
G
 
A
L
 
A
L
 
L
V
 
L
V
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
S
 
N
R
 
K
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
A
 
E
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
A
 
Q
H
 
H
F
 
Y
T
 
K
T
 
A
V
 
I
A
 
A
D
 
E
A
 
A
T
 
V
E
 
E
L
 
L
P
 
P
V
 
L
M
 
I
L
 
L
Y
|
Y
D
 
N
I
 
V
P
 
P
P
 
G
R
|
R
S
 
T
I
 
G
V
 
V
P
 
D
I
 
L
E
 
S
V
 
N
D
 
D
T
 
T
L
 
A
R
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
E
H
 
I
P
 
P
R
 
N
V
 
I
L
 
V
A
 
G
V
 
I
K
|
K
D
 
D
A
 
A
K
 
T
G
 
G
D
 
D
L
 
V
L
 
P
A
 
R
G
 
G
S
 
K
E
 
A
V
 
L
I
 
I
-
 
D
-
 
A
A
 
L
N
 
N
T
 
G
H
 
K
L
 
M
A
 
A
Y
 
V
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
G
 
E
L
 
T
N
 
A
L
 
W
P
 
E
W
 
L
L
 
M
S
 
L
V
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
D
G
 
G
V
 
N
V
x
I
S
 
S
V
 
V
I
 
T
G
 
A
H
 
N
V
 
I
V
 
A
A
 
P
G
 
K
R
 
A
I
 
M
R
 
S
A
 
E
M
 
V
I
 
C
D
 
A
A
 
V
Y
 
A
E
 
I
D
 
A
G
 
K
D
 
D
T
 
E
S
 
Q
T
 
Q
A
 
A
R
 
K
T
 
T
N
 
L
H
 
N
R
 
N
G
 
K
M
 
I
I
 
A
P
 
N
V
 
L
Y
 
H
R
 
N
A
 
I
F
 
L
S
 
F
R
 
C
V
 
E
G
 
S
G
 
N
V
 
P
V
 
I
F
 
P
A
 
V
K
 
K
T
 
W
A
 
A
L
 
L
R
 
H
L
 
E
R
 
M
G
 
G
M
 
L
D
 
I
V
 
D
G
 
T
E
 
G
P
 
I
R
 
R
L
 
L
P
 
P
M
 
L
V
 
T
S
 
P
A
 
L
P
 
A
E
 
E
E
 
Q
L
 
Y
V
 
R
R
 
E
A
 
P
I
 
L
A
 
R
D
 
N
D
 
A
L
 
L
T
 
K
Q
 
D
A
 
A
G
 
G
V
 
I

3tceA Crystal structure of the complex of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with 5-hydroxylysine at 2.6 a resolution
33% identity, 83% coverage: 21:303/341 of query aligns to 6:290/291 of 3tceA

query
sites
3tceA
L
 
I
T
 
V
A
 
A
M
 
I
V
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
T
 
L
A
 
K
E
 
D
G
 
G
A
 
G
V
 
V
D
 
D
L
 
W
K
 
K
R
 
S
A
 
L
Q
 
E
E
 
K
L
 
L
A
 
V
V
 
E
H
 
W
L
 
H
V
 
I
E
 
E
L
 
Q
G
 
G
N
 
T
D
 
N
G
 
S
L
 
I
V
 
V
V
 
A
N
 
V
G
 
G
T
|
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
S
 
A
P
x
S
T
 
T
T
x
L
T
 
S
D
 
M
A
 
E
E
 
E
K
x
H
A
 
T
D
 
Q
L
 
V
V
 
I
R
 
K
A
 
E
V
 
I
V
 
I
E
 
R
A
 
V
V
 
A
G
 
N
D
 
K
R
 
R
A
 
I
T
 
P
V
 
I
V
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
G
T
 
A
N
 
N
N
 
S
T
 
T
T
 
R
H
 
E
S
 
A
V
 
I
E
 
E
M
 
L
A
 
T
K
 
K
Q
 
A
A
 
A
E
 
K
K
 
D
S
 
L
G
 
G
A
 
A
H
 
D
G
 
A
L
 
A
L
 
L
V
 
L
V
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
|
Y
Y
|
Y
S
 
N
R
 
K
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
A
 
E
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
A
 
Q
H
 
H
F
 
Y
T
 
K
T
 
A
V
 
I
A
 
A
D
 
E
A
 
A
T
 
V
E
 
E
L
 
L
P
 
P
V
 
L
M
 
I
L
 
L
Y
|
Y
D
 
N
I
 
V
P
 
P
P
 
G
R
|
R
S
 
T
I
 
G
V
 
V
P
 
D
I
 
L
E
 
S
V
 
N
D
 
D
T
 
T
L
 
A
R
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
E
H
 
I
P
 
P
R
 
N
V
 
I
L
 
V
A
 
G
V
 
I
K
|
K
D
 
D
A
 
A
K
 
T
G
 
G
D
 
D
L
 
V
L
 
P
A
 
R
G
 
G
S
 
K
E
 
A
V
 
L
I
 
I
-
 
D
-
 
A
A
 
L
N
 
N
T
 
G
H
 
K
L
 
M
A
 
A
Y
 
V
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
G
 
E
L
 
T
N
 
A
L
 
W
P
 
E
W
 
L
L
 
M
S
 
L
V
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
D
G
 
G
V
 
N
V
x
I
S
 
S
V
 
V
I
 
T
G
 
A
H
 
N
V
 
I
V
 
A
A
 
P
G
 
K
R
 
A
I
 
M
R
 
S
A
 
E
M
 
V
I
 
C
D
 
A
A
 
V
Y
 
A
E
 
I
D
 
A
G
 
K
D
 
D
T
 
E
S
 
Q
T
 
Q
A
 
A
R
 
K
T
 
T
N
 
L
H
 
N
R
 
N
G
 
K
M
 
I
I
 
A
P
 
N
V
 
L
Y
 
H
R
 
N
A
 
I
F
 
L
S
 
F
R
 
C
V
 
E
G
 
S
G
 
N
V
 
P
V
 
I
F
 
P
A
 
V
K
 
K
T
 
W
A
 
A
L
 
L
R
 
H
L
 
E
R
 
M
G
 
G
M
 
L
D
 
I
V
 
D
G
 
T
E
 
G
P
 
I
R
 
R
L
 
L
P
 
P
M
 
L
V
 
T
S
 
P
A
 
L
P
 
A
E
 
E
E
 
Q
L
 
Y
V
 
R
R
 
E
A
 
P
I
 
L
A
 
R
D
 
N
D
 
A
L
 
L
T
 
K
Q
 
D
A
 
A
G
 
G
V
 
I

3rk8A Crystal structure of the chloride inhibited dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii complexed with pyruvate at 1.8 a resolution
33% identity, 83% coverage: 21:303/341 of query aligns to 6:290/291 of 3rk8A

query
sites
3rk8A
L
 
I
T
 
V
A
 
A
M
 
I
V
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
T
 
L
A
 
K
E
 
D
G
 
G
A
 
G
V
 
V
D
 
D
L
 
W
K
 
K
R
 
S
A
 
L
Q
 
E
E
 
K
L
 
L
A
 
V
V
 
E
H
 
W
L
 
H
V
 
I
E
 
E
L
 
Q
G
 
G
N
 
T
D
 
N
G
 
S
L
 
I
V
 
V
V
 
A
N
 
V
G
 
G
T
|
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
S
 
A
P
 
S
T
 
T
T
 
L
T
 
S
D
 
M
A
 
E
E
 
E
K
 
H
A
 
T
D
 
Q
L
 
V
V
 
I
R
 
K
A
 
E
V
 
I
V
 
I
E
 
R
A
 
V
V
 
A
G
 
N
D
 
K
R
 
R
A
 
I
T
 
P
V
 
I
V
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
G
T
 
A
N
 
N
N
 
S
T
 
T
T
 
R
H
 
E
S
 
A
V
 
I
E
 
E
M
 
L
A
 
T
K
 
K
Q
 
A
A
 
A
E
 
K
K
 
D
S
 
L
G
 
G
A
 
A
H
 
D
G
 
A
L
 
A
L
 
L
V
 
L
V
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
S
 
N
R
 
K
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
A
 
E
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
A
 
Q
H
 
H
F
 
Y
T
 
K
T
 
A
V
 
I
A
 
A
D
 
E
A
 
A
T
 
V
E
 
E
L
 
L
P
 
P
V
 
L
M
 
I
L
 
L
Y
|
Y
D
 
N
I
 
V
P
 
P
P
 
G
R
|
R
S
 
T
I
 
G
V
 
V
P
 
D
I
 
L
E
 
S
V
 
N
D
 
D
T
 
T
L
 
A
R
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
E
H
 
I
P
 
P
R
 
N
V
 
I
L
 
V
A
 
G
V
 
I
K
|
K
D
 
D
A
 
A
K
 
T
G
 
G
D
 
D
L
 
V
L
 
P
A
 
R
G
 
G
S
 
K
E
 
A
V
 
L
I
 
I
-
 
D
-
 
A
A
 
L
N
 
N
T
 
G
H
 
K
L
 
M
A
 
A
Y
 
V
Y
 
Y
S
 
S
G
|
G
D
 
D
D
 
D
G
 
E
L
 
T
N
 
A
L
 
W
P
 
E
W
 
L
L
 
M
S
 
L
V
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
D
G
 
G
V
 
N
V
x
I
S
 
S
V
 
V
I
 
T
G
 
A
H
 
N
V
 
I
V
 
A
A
 
P
G
 
K
R
 
A
I
 
M
R
 
S
A
 
E
M
 
V
I
 
C
D
 
A
A
 
V
Y
 
A
E
 
I
D
 
A
G
 
K
D
 
D
T
 
E
S
 
Q
T
 
Q
A
 
A
R
 
K
T
 
T
N
 
L
H
 
N
R
 
N
G
 
K
M
 
I
I
 
A
P
 
N
V
 
L
Y
 
H
R
 
N
A
 
I
F
 
L
S
x
F
R
 
C
V
 
E
G
 
S
G
 
N
V
 
P
V
 
I
F
 
P
A
 
V
K
 
K
T
 
W
A
 
A
L
 
L
R
 
H
L
 
E
R
 
M
G
 
G
M
 
L
D
 
I
V
 
D
G
 
T
E
 
G
P
 
I
R
 
R
L
 
L
P
 
P
M
 
L
V
 
T
S
 
P
A
 
L
P
 
A
E
 
E
E
 
Q
L
 
Y
V
 
R
R
 
E
A
 
P
I
 
L
A
 
R
D
 
N
D
 
A
L
 
L
T
 
K
Q
 
D
A
 
A
G
 
G
V
 
I

3pueB Crystal structure of the complex of dhydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with lysine at 2.6a resolution
33% identity, 83% coverage: 21:303/341 of query aligns to 6:290/291 of 3pueB

query
sites
3pueB
L
 
I
T
 
V
A
 
A
M
 
I
V
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
T
 
L
A
 
K
E
 
D
G
 
G
A
 
G
V
 
V
D
 
D
L
 
W
K
 
K
R
 
S
A
 
L
Q
 
E
E
 
K
L
 
L
A
 
V
V
 
E
H
 
W
L
 
H
V
 
I
E
 
E
L
 
Q
G
 
G
N
 
T
D
 
N
G
 
S
L
 
I
V
 
V
V
 
A
N
 
V
G
 
G
T
|
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
S
 
A
P
 
S
T
 
T
T
 
L
T
 
S
D
 
M
A
 
E
E
 
E
K
 
H
A
 
T
D
 
Q
L
 
V
V
 
I
R
 
K
A
 
E
V
 
I
V
 
I
E
 
R
A
 
V
V
 
A
G
 
N
D
 
K
R
 
R
A
 
I
T
 
P
V
 
I
V
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
G
T
 
A
N
 
N
N
 
S
T
 
T
T
 
R
H
 
E
S
 
A
V
 
I
E
 
E
M
 
L
A
 
T
K
 
K
Q
 
A
A
 
A
E
 
K
K
 
D
S
 
L
G
 
G
A
 
A
H
 
D
G
 
A
L
 
A
L
 
L
V
 
L
V
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
S
 
N
R
 
K
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
A
 
E
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
A
 
Q
H
 
H
F
 
Y
T
 
K
T
 
A
V
 
I
A
 
A
D
 
E
A
 
A
T
 
V
E
 
E
L
 
L
P
 
P
V
 
L
M
 
I
L
 
L
Y
|
Y
D
 
N
I
 
V
P
 
P
P
 
G
R
|
R
S
 
T
I
 
G
V
 
V
P
 
D
I
 
L
E
 
S
V
 
N
D
 
D
T
 
T
L
 
A
R
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
E
H
 
I
P
 
P
R
 
N
V
 
I
L
 
V
A
 
G
V
 
I
K
|
K
D
 
D
A
 
A
K
 
T
G
 
G
D
 
D
L
 
V
L
 
P
A
 
R
G
 
G
S
 
K
E
 
A
V
 
L
I
 
I
-
 
D
-
 
A
A
 
L
N
 
N
T
 
G
H
 
K
L
 
M
A
 
A
Y
 
V
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
G
 
E
L
 
T
N
 
A
L
 
W
P
 
E
W
 
L
L
 
M
S
 
L
V
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
D
G
 
G
V
 
N
V
x
I
S
 
S
V
 
V
I
 
T
G
 
A
H
 
N
V
 
I
V
 
A
A
 
P
G
 
K
R
 
A
I
 
M
R
 
S
A
 
E
M
 
V
I
 
C
D
 
A
A
 
V
Y
 
A
E
 
I
D
 
A
G
 
K
D
 
D
T
 
E
S
 
Q
T
 
Q
A
 
A
R
 
K
T
 
T
N
 
L
H
 
N
R
 
N
G
 
K
M
 
I
I
 
A
P
 
N
V
 
L
Y
 
H
R
 
N
A
 
I
F
 
L
S
x
F
R
 
C
V
 
E
G
 
S
G
x
N
V
 
P
V
 
I
F
 
P
A
 
V
K
 
K
T
 
W
A
 
A
L
 
L
R
 
H
L
 
E
R
 
M
G
 
G
M
 
L
D
 
I
V
 
D
G
 
T
E
 
G
P
 
I
R
 
R
L
 
L
P
 
P
M
 
L
V
 
T
S
 
P
A
 
L
P
 
A
E
 
E
E
 
Q
L
 
Y
V
 
R
R
 
E
A
 
P
I
 
L
A
 
R
D
 
N
D
 
A
L
 
L
T
 
K
Q
 
D
A
 
A
G
 
G
V
 
I

Query Sequence

>WP_005457821.1 NCBI__GCF_000244975.1:WP_005457821.1
MSIAPPTPPTAAPGRPFGRVLTAMVTPFTAEGAVDLKRAQELAVHLVELGNDGLVVNGTT
GESPTTTDAEKADLVRAVVEAVGDRATVVAGAGTNNTTHSVEMAKQAEKSGAHGLLVVTP
YYSRPTQAGLYAHFTTVADATELPVMLYDIPPRSIVPIEVDTLRRLAEHPRVLAVKDAKG
DLLAGSEVIANTHLAYYSGDDGLNLPWLSVGATGVVSVIGHVVAGRIRAMIDAYEDGDTS
TARTNHRGMIPVYRAFSRVGGVVFAKTALRLRGMDVGEPRLPMVSAPEELVRAIADDLTQ
AGVPLETSPAGDWAGSRVAQADSAAAYVTPTTHTSVGTIQR

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory