SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_005458675.1 NCBI__GCF_000244975.1:WP_005458675.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3dwgA Crystal structure of a sulfur carrier protein complex found in the cysteine biosynthetic pathway of mycobacterium tuberculosis (see paper)
75% identity, 100% coverage: 1:316/316 of query aligns to 3:325/325 of 3dwgA

query
sites
3dwgA
M
 
M
A
 
T
R
 
R
Y
 
Y
A
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
D
 
Q
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
N
T
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
Q
R
 
R
L
 
L
S
 
S
P
 
P
S
 
R
-
 
W
-
 
D
-
 
D
-
 
G
-
 
R
-
 
D
-
 
G
P
 
P
E
 
H
V
 
V
R
 
R
L
 
L
W
 
W
A
 
A
K
 
K
L
 
L
E
 
E
D
 
D
R
 
R
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
I
 
I
K
|
K
D
 
D
R
 
R
P
 
P
A
 
A
L
 
V
A
 
R
M
 
M
I
 
I
E
 
E
A
 
Q
A
 
A
E
 
E
R
 
A
D
 
D
G
 
G
I
 
L
L
 
L
K
 
R
S
 
P
G
 
G
D
 
A
T
 
T
I
 
I
L
 
L
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
G
 
G
N
|
N
T
 
T
G
 
G
I
 
I
S
 
S
L
 
L
A
 
A
M
 
M
A
 
A
A
 
A
K
 
R
L
 
L
K
 
K
G
 
G
Y
 
Y
G
 
R
M
 
L
V
 
I
C
 
C
V
 
V
M
 
M
P
 
P
E
 
E
N
 
N
T
 
T
S
 
S
E
 
V
E
 
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
Q
 
E
A
 
L
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
R
 
Q
I
 
I
V
 
I
Y
 
F
S
 
S
P
 
A
A
 
A
A
 
E
G
 
G
G
 
G
S
 
S
N
 
N
E
 
T
A
 
A
V
 
V
R
 
A
R
 
T
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
A
A
 
T
N
 
N
P
 
P
D
 
S
W
 
W
V
 
V
M
 
M
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
N
 
N
P
 
P
A
 
A
N
 
N
A
 
T
D
 
D
A
 
S
H
 
H
Y
 
Y
Y
 
C
G
 
G
T
 
T
G
 
G
P
 
P
E
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
A
D
 
D
L
 
L
P
 
P
T
 
E
L
 
I
T
 
T
H
 
H
F
 
F
V
 
V
G
 
A
G
 
G
L
 
L
G
|
G
T
|
T
T
|
T
G
|
G
T
|
T
L
 
L
V
 
M
G
 
G
V
 
T
G
 
G
R
 
R
Y
 
F
L
 
L
R
 
R
E
 
E
H
 
H
K
 
V
P
 
A
D
 
N
V
 
V
Q
 
K
V
 
I
I
 
V
A
 
A
A
 
A
E
 
E
P
 
P
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
E
 
E
L
 
G
V
 
V
Y
 
Y
G
 
A
L
 
L
R
 
R
N
 
N
L
 
M
D
 
D
E
 
E
G
 
G
F
 
F
V
 
V
P
 
P
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
E
 
E
V
 
I
L
 
L
S
 
T
G
 
A
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
V
 
V
G
 
G
A
 
A
Y
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
V
R
 
R
R
 
R
T
 
T
R
 
R
E
 
E
L
 
L
L
 
V
E
 
H
K
 
T
E
 
E
G
 
G
I
 
I
F
 
F
A
 
A
G
 
G
I
 
I
S
|
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
L
H
 
H
A
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
V
A
 
G
N
 
A
K
 
G
V
 
A
L
 
L
K
 
A
K
 
A
G
 
G
G
 
E
S
 
R
A
 
A
D
 
D
I
 
I
A
 
A
F
 
L
V
 
V
V
 
V
A
|
A
D
|
D
A
 
A
G
 
G
W
 
W
K
 
K
Y
 
Y
L
 
L
S
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
S
 
A
G
 
G
S
 
S
L
 
L
D
 
D
E
 
D
A
 
A
A
 
E
E
 
T
R
 
A
L
 
L
D
 
E
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
W
 
W
A
 
A

P9WP53 O-phosphoserine sulfhydrylase; OPS sulfhydrylase; CysO-thiocarboxylate-dependent cysteine synthase; Cysteine synthase B; CSase B; O-phosphoserine-specific cysteine synthase; [CysO sulfur-carrier protein]-thiocarboxylate-dependent cysteine synthase; EC 2.5.1.113 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see 3 papers)
75% identity, 100% coverage: 1:316/316 of query aligns to 1:323/323 of P9WP53

query
sites
P9WP53
M
 
M
A
 
T
R
 
R
Y
 
Y
A
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
D
 
Q
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
N
T
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
Q
R
 
R
L
 
L
S
 
S
P
 
P
S
 
R
-
 
W
-
 
D
-
 
D
-
 
G
-
 
R
-
 
D
-
 
G
P
 
P
E
 
H
V
 
V
R
 
R
L
 
L
W
 
W
A
 
A
K
 
K
L
 
L
E
 
E
D
 
D
R
 
R
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
I
 
I
K
 
K
D
 
D
R
 
R
P
 
P
A
 
A
L
 
V
A
 
R
M
 
M
I
 
I
E
 
E
A
 
Q
A
 
A
E
 
E
R
 
A
D
 
D
G
 
G
I
 
L
L
 
L
K
 
R
S
 
P
G
 
G
D
 
A
T
 
T
I
 
I
L
 
L
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
G
 
G
N
|
N
T
 
T
G
 
G
I
 
I
S
 
S
L
 
L
A
 
A
M
 
M
A
 
A
A
 
A
K
 
R
L
 
L
K
 
K
G
 
G
Y
 
Y
G
 
R
M
 
L
V
 
I
C
 
C
V
 
V
M
 
M
P
 
P
E
 
E
N
 
N
T
 
T
S
 
S
E
 
V
E
 
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
Q
 
E
A
 
L
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
R
 
Q
I
 
I
V
 
I
Y
 
F
S
 
S
P
 
A
A
 
A
A
 
E
G
 
G
G
 
G
S
 
S
N
 
N
E
 
T
A
 
A
V
 
V
R
 
A
R
 
T
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
A
A
 
T
N
 
N
P
 
P
D
 
S
W
 
W
V
 
V
M
 
M
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
N
 
N
P
 
P
A
 
A
N
 
N
A
 
T
D
 
D
A
 
S
H
 
H
Y
 
Y
Y
 
C
G
 
G
T
 
T
G
 
G
P
 
P
E
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
A
D
 
D
L
 
L
P
 
P
T
 
E
L
 
I
T
 
T
H
 
H
F
 
F
V
 
V
G
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
T
 
T
L
 
L
V
 
M
G
 
G
V
 
T
G
 
G
R
 
R
Y
 
F
L
 
L
R
 
R
E
 
E
H
 
H
K
 
V
P
 
A
D
 
N
V
 
V
Q
 
K
V
 
I
I
 
V
A
 
A
A
 
A
E
 
E
P
 
P
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
E
 
E
L
 
G
V
 
V
Y
 
Y
G
 
A
L
 
L
R
|
R
N
 
N
L
 
M
D
 
D
E
 
E
G
 
G
F
 
F
V
 
V
P
 
P
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
E
 
E
V
 
I
L
 
L
S
 
T
G
 
A
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
V
 
V
G
 
G
A
 
A
Y
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
V
R
 
R
R
 
R
T
 
T
R
 
R
E
 
E
L
 
L
L
 
V
E
 
H
K
 
T
E
 
E
G
 
G
I
 
I
F
 
F
A
 
A
G
 
G
I
 
I
S
|
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
L
H
 
H
A
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
V
A
 
G
N
 
A
K
 
G
V
 
A
L
 
L
K
 
A
K
 
A
G
 
G
G
 
E
S
 
R
A
 
A
D
 
D
I
 
I
A
 
A
F
 
L
V
 
V
V
 
V
A
 
A
D
 
D
A
 
A
G
 
G
W
 
W
K
 
K
Y
 
Y
L
 
L
S
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
S
 
A
G
 
G
S
 
S
L
 
L
D
 
D
E
 
D
A
 
A
A
 
E
E
 
T
R
 
A
L
 
L
D
 
E
G
|
G
Q
|
Q
L
|
L
W
|
W
A
|
A

5i7rA Mycobacterium tuberculosis cysm in complex with the urea-scaffold inhibitor 2 [3-(3-([1,1'-biphenyl]-3-yl)ureido)benzoic acid] (see paper)
71% identity, 99% coverage: 2:315/316 of query aligns to 1:306/306 of 5i7rA

query
sites
5i7rA
A
 
A
R
 
R
Y
 
Y
A
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
D
 
Q
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
N
T
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
Q
R
 
R
L
 
L
S
 
S
P
 
P
S
 
R
-
 
W
-
 
D
-
 
D
-
 
G
-
 
R
-
 
D
-
 
G
P
 
P
E
 
H
V
 
V
R
 
R
L
 
L
W
 
W
A
 
A
K
 
K
L
 
L
E
 
E
D
 
D
R
 
R
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
I
 
I
K
|
K
D
 
D
R
 
R
P
 
P
A
 
A
L
 
V
A
 
R
M
 
M
I
 
I
E
 
E
A
 
Q
A
 
A
E
 
E
R
 
A
D
 
D
G
 
G
I
 
L
L
 
L
K
 
R
S
 
P
G
 
G
D
 
A
T
 
T
I
 
I
L
 
L
E
 
E
P
 
P
T
|
T
S
|
S
G
 
G
N
|
N
T
|
T
G
 
G
I
 
I
S
 
S
L
 
L
A
 
A
M
 
M
A
 
A
A
 
A
K
 
R
L
 
L
K
 
K
G
 
G
Y
 
Y
G
 
R
M
 
L
V
 
I
C
 
C
V
 
V
M
 
M
P
 
P
E
 
E
N
 
N
T
 
T
S
 
S
E
 
V
E
 
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
Q
 
E
A
 
L
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
R
 
Q
I
 
I
V
 
I
Y
 
F
S
 
S
P
 
A
A
 
A
A
 
E
G
 
G
G
 
G
S
 
S
N
 
N
E
 
T
A
 
A
V
 
V
R
 
A
R
 
T
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
A
A
 
T
N
 
N
P
 
P
D
 
S
W
 
W
V
 
V
M
 
M
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
Y
|
Y
G
 
G
N
 
N
P
 
P
A
 
A
N
 
N
A
 
T
D
 
D
A
 
S
H
 
H
Y
 
Y
Y
 
C
G
 
G
T
 
T
G
 
G
P
 
P
E
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
A
D
 
D
L
 
L
P
 
P
T
 
E
L
 
I
T
 
T
H
 
H
F
 
F
V
 
V
G
 
A
G
 
G
L
 
L
G
|
G
T
|
T
T
|
T
G
 
G
T
|
T
L
 
L
V
 
M
G
 
G
V
 
T
G
 
G
R
 
R
Y
 
F
L
 
L
R
 
R
E
 
E
H
 
H
K
 
V
P
 
A
D
 
N
V
 
V
Q
 
K
V
 
I
I
 
V
A
 
A
A
 
A
E
 
E
P
|
P
R
 
-
Y
 
-
G
 
-
E
 
-
L
 
-
V
 
-
Y
 
-
G
 
-
L
 
-
R
 
-
N
 
-
L
 
-
D
 
-
E
 
-
G
 
-
F
 
F
V
 
V
P
 
P
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
E
 
E
V
 
I
L
 
L
S
 
T
G
 
A
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
V
 
V
G
 
G
A
 
A
Y
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
V
R
 
R
R
 
R
T
 
T
R
 
R
E
 
E
L
 
L
L
 
V
E
 
H
K
 
T
E
 
E
G
 
G
I
 
I
F
 
F
A
 
A
G
 
G
I
 
I
S
|
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
L
H
 
H
A
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
V
A
 
G
N
 
A
K
 
G
V
 
A
L
 
L
K
 
A
K
 
A
G
 
G
G
 
E
S
 
R
A
 
A
D
 
D
I
 
I
A
 
A
F
 
L
V
 
V
V
 
V
A
|
A
D
|
D
A
 
A
G
 
G
W
 
W
K
 
K
Y
 
Y
L
 
L
S
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
S
 
A
G
 
G
S
 
S
L
 
L
D
 
D
E
 
D
A
 
A
A
 
E
E
 
T
R
 
A
L
 
L
D
 
E
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
W
 
W

5i7oB Mycobacterium tuberculosis cysm in complex with the urea-scaffold inhibitor 7 [3-(3-(4-chlorophenyl)ureido)benzoic acid] (see paper)
72% identity, 95% coverage: 2:302/316 of query aligns to 1:295/295 of 5i7oB

query
sites
5i7oB
A
 
A
R
 
R
Y
 
Y
A
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
D
 
Q
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
N
T
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
Q
R
 
R
L
 
L
S
 
S
P
 
P
S
 
R
-
 
W
-
 
D
-
 
D
-
 
G
-
 
R
-
 
D
-
 
G
P
 
P
E
 
H
V
 
V
R
 
R
L
 
L
W
 
W
A
 
A
K
 
K
L
 
L
E
 
E
D
 
D
R
 
R
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
I
 
I
K
|
K
D
 
D
R
 
R
P
 
P
A
 
A
L
 
V
A
 
R
M
 
M
I
 
I
E
 
E
A
 
Q
A
 
A
E
 
E
R
 
A
D
 
D
G
 
G
I
 
L
L
 
L
K
 
R
S
 
P
G
 
G
D
 
A
T
 
T
I
 
I
L
 
L
E
 
E
P
 
P
T
|
T
S
|
S
G
 
G
N
|
N
T
|
T
G
 
G
I
 
I
S
 
S
L
 
L
A
 
A
M
 
M
A
 
A
A
 
A
K
 
R
L
 
L
K
 
K
G
 
G
Y
 
Y
G
 
R
M
 
L
V
 
I
C
 
C
V
 
V
M
 
M
P
 
P
E
 
E
N
 
N
T
 
T
S
 
S
E
 
V
E
 
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
Q
 
E
A
 
L
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
R
 
Q
I
 
I
V
 
I
Y
 
F
S
 
S
P
 
A
A
 
A
A
 
E
G
 
G
G
 
G
S
 
S
N
 
N
E
 
T
A
 
A
V
 
V
R
 
A
R
 
T
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
A
A
 
T
N
 
N
P
 
P
D
 
S
W
 
W
V
 
V
M
 
M
L
 
L
Y
 
Y
Q
|
Q
Y
|
Y
G
 
G
N
 
N
P
 
P
A
 
A
N
 
N
A
 
T
D
 
D
A
 
S
H
 
H
Y
 
Y
Y
 
C
G
 
G
T
 
T
G
 
G
P
 
P
E
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
A
D
 
D
L
 
L
P
 
P
T
 
E
L
 
I
T
 
T
H
 
H
F
 
F
V
 
V
G
 
A
G
 
G
L
 
L
G
|
G
T
|
T
T
|
T
G
 
G
T
|
T
L
 
L
V
 
M
G
 
G
V
 
T
G
 
G
R
 
R
Y
 
F
L
 
L
R
 
R
E
 
E
H
 
H
K
 
V
P
 
A
D
 
N
V
 
V
Q
 
K
V
 
I
I
 
V
A
 
A
A
|
A
E
|
E
P
 
P
R
 
R
Y
 
-
G
 
-
E
 
-
L
 
-
V
 
-
Y
 
-
G
 
-
L
 
-
R
 
-
N
 
-
L
 
-
D
 
-
E
 
-
G
 
G
F
 
F
V
 
V
P
 
P
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
E
 
E
V
 
I
L
 
L
S
 
T
G
 
A
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
V
 
V
G
 
G
A
 
A
Y
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
V
R
 
R
R
 
R
T
 
T
R
 
R
E
 
E
L
 
L
L
 
V
E
 
H
K
 
T
E
 
E
G
 
G
I
 
I
F
 
F
A
 
A
G
 
G
I
 
I
S
|
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
L
H
 
H
A
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
V
A
 
G
N
 
A
K
 
G
V
 
A
L
 
L
K
 
A
K
 
A
G
 
G
G
 
E
S
 
R
A
 
A
D
 
D
I
 
I
A
 
A
F
 
L
V
 
V
V
 
V
A
|
A
D
|
D
A
 
A
G
 
G
W
 
W
K
 
K
Y
 
Y
L
 
L
S
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
S
 
A
G
 
G
S
 
S

5iw8A Mycobacterium tuberculosis cysm in complex with the urea-scaffold inhibitor 4 [5-(3-([1,1'-biphenyl]-3-yl)ureido)-2-hydroxybenzoic acid] (see paper)
71% identity, 96% coverage: 3:306/316 of query aligns to 1:295/299 of 5iw8A

query
sites
5iw8A
R
 
R
Y
 
Y
A
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
D
 
Q
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
N
T
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
Q
R
 
R
L
 
L
S
 
S
P
 
P
S
 
R
-
 
W
-
 
D
-
 
D
-
 
G
-
 
R
-
 
D
-
 
G
P
 
P
E
 
H
V
 
V
R
 
R
L
 
L
W
 
W
A
 
A
K
 
K
L
 
L
E
 
E
D
 
D
R
 
R
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
I
 
I
K
|
K
D
 
D
R
 
R
P
 
P
A
 
A
L
 
V
A
 
R
M
 
M
I
 
I
E
 
E
A
 
Q
A
 
A
E
 
E
R
 
A
D
 
D
G
 
G
I
 
L
L
 
L
K
 
R
S
 
P
G
 
G
D
 
A
T
 
T
I
 
I
L
 
L
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
G
|
G
N
|
N
T
|
T
G
 
G
I
 
I
S
 
S
L
 
L
A
 
A
M
 
M
A
 
A
A
 
A
K
 
R
L
 
L
K
 
K
G
 
G
Y
 
Y
G
 
R
M
 
L
V
 
I
C
 
C
V
 
V
M
 
M
P
 
P
E
 
E
N
 
N
T
 
T
S
 
S
E
 
V
E
 
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
Q
 
E
A
 
L
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
R
 
Q
I
 
I
V
 
I
Y
 
F
S
 
S
P
 
A
A
 
A
A
 
E
G
 
G
G
 
G
S
 
S
N
 
N
E
 
T
A
 
A
V
 
V
R
 
A
R
 
T
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
A
A
 
T
N
 
N
P
 
P
D
 
S
W
 
W
V
 
V
M
 
M
L
 
L
Y
 
Y
Q
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
N
 
N
P
 
P
A
 
A
N
 
N
A
 
T
D
 
D
A
 
S
H
 
H
Y
 
Y
Y
 
C
G
 
G
T
 
T
G
 
G
P
 
P
E
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
A
D
 
D
L
 
L
P
 
P
T
 
E
L
 
I
T
 
T
H
 
H
F
 
F
V
 
V
G
 
A
G
 
G
L
 
L
G
|
G
T
|
T
T
|
T
G
 
G
T
|
T
L
 
L
V
 
M
G
 
G
V
 
T
G
 
G
R
 
R
Y
 
F
L
 
L
R
 
R
E
 
E
H
 
H
K
 
V
P
 
A
D
 
N
V
 
V
Q
 
K
V
 
I
I
 
V
A
 
A
A
 
A
E
 
E
P
|
P
R
 
R
Y
 
Y
G
 
-
E
 
-
L
 
-
V
 
-
Y
 
-
G
 
-
L
 
-
R
 
-
N
 
-
L
 
-
D
 
-
E
 
-
G
 
-
F
 
-
V
 
-
P
 
-
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
E
 
E
V
 
I
L
 
L
S
 
T
G
 
A
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
V
 
V
G
 
G
A
 
A
Y
 
V
D
 
D
A
|
A
L
 
V
R
 
R
R
 
R
T
 
T
R
 
R
E
 
E
L
 
L
L
 
V
E
 
H
K
 
T
E
 
E
G
 
G
I
 
I
F
 
F
A
 
A
G
 
G
I
 
I
S
|
S
T
 
T
G
 
G
A
|
A
V
 
V
L
 
L
H
 
H
A
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
V
A
 
G
N
 
A
K
 
G
V
 
A
L
 
L
K
 
A
K
 
A
G
 
G
G
 
E
S
 
R
A
 
A
D
 
D
I
 
I
A
 
A
F
 
L
V
 
V
V
 
V
A
|
A
D
|
D
A
 
A
G
 
G
W
 
W
K
 
K
Y
 
Y
L
 
L
S
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
S
 
A
G
 
G
S
 
S
L
 
L
D
 
D
E
 
D
A
 
A

5i7aB Mycobacterium tuberculosis cysm in complex with the urea-scaffold inhibitor 1 [3-(3-(3,4-dichlorophenyl)ureido)benzoic acid] (see paper)
72% identity, 94% coverage: 3:300/316 of query aligns to 1:292/292 of 5i7aB

query
sites
5i7aB
R
 
R
Y
 
Y
A
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
D
 
Q
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
N
T
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
Q
R
 
R
L
 
L
S
 
S
P
 
P
S
 
R
-
 
W
-
 
D
-
 
D
-
 
G
-
 
R
-
 
D
-
 
G
P
 
P
E
 
H
V
 
V
R
 
R
L
 
L
W
 
W
A
 
A
K
 
K
L
 
L
E
 
E
D
 
D
R
 
R
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
I
 
I
K
|
K
D
 
D
R
 
R
P
 
P
A
 
A
L
 
V
A
 
R
M
 
M
I
 
I
E
 
E
A
 
Q
A
 
A
E
 
E
R
 
A
D
 
D
G
 
G
I
 
L
L
 
L
K
 
R
S
 
P
G
 
G
D
 
A
T
 
T
I
 
I
L
 
L
E
 
E
P
 
P
T
|
T
S
|
S
G
 
G
N
|
N
T
|
T
G
 
G
I
 
I
S
 
S
L
 
L
A
 
A
M
 
M
A
 
A
A
 
A
K
 
R
L
 
L
K
 
K
G
 
G
Y
 
Y
G
 
R
M
 
L
V
 
I
C
 
C
V
 
V
M
 
M
P
 
P
E
 
E
N
 
N
T
 
T
S
 
S
E
 
V
E
 
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
Q
 
E
A
 
L
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
R
 
Q
I
 
I
V
 
I
Y
 
F
S
 
S
P
 
A
A
 
A
A
 
E
G
 
G
G
 
G
S
 
S
N
 
N
E
 
T
A
 
A
V
 
V
R
 
A
R
 
T
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
A
A
 
T
N
 
N
P
 
P
D
 
S
W
 
W
V
 
V
M
 
M
L
 
L
Y
 
Y
Q
|
Q
Y
|
Y
G
 
G
N
 
N
P
 
P
A
 
A
N
 
N
A
 
T
D
 
D
A
 
S
H
 
H
Y
 
Y
Y
 
C
G
 
G
T
 
T
G
 
G
P
 
P
E
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
A
D
 
D
L
 
L
P
 
P
T
 
E
L
 
I
T
 
T
H
 
H
F
 
F
V
 
V
G
 
A
G
|
G
L
 
L
G
|
G
T
|
T
T
|
T
G
 
G
T
|
T
L
 
L
V
 
M
G
 
G
V
 
T
G
 
G
R
 
R
Y
 
F
L
 
L
R
 
R
E
 
E
H
 
H
K
 
V
P
 
A
D
 
N
V
 
V
Q
 
K
V
 
I
I
 
V
A
 
A
A
|
A
E
|
E
P
|
P
R
 
R
Y
 
-
G
 
-
E
 
-
L
 
-
V
 
-
Y
 
-
G
 
-
L
 
-
R
 
-
N
 
-
L
 
-
D
 
-
E
 
-
G
 
G
F
 
F
V
 
V
P
 
P
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
E
 
E
V
 
I
L
 
L
S
 
T
G
 
A
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
V
 
V
G
 
G
A
 
A
Y
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
V
R
 
R
R
 
R
T
 
T
R
 
R
E
 
E
L
 
L
L
 
V
E
 
H
K
 
T
E
 
E
G
 
G
I
 
I
F
 
F
A
 
A
G
 
G
I
 
I
S
|
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
L
H
 
H
A
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
V
A
 
G
N
 
A
K
 
G
V
 
A
L
 
L
K
 
A
K
 
A
G
 
G
G
 
E
S
 
R
A
 
A
D
 
D
I
 
I
A
 
A
F
 
L
V
 
V
V
 
V
A
|
A
D
|
D
A
 
A
G
 
G
W
 
W
K
 
K
Y
 
Y
L
 
L
S
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
S
 
A

5i7hB Mycobacterium tuberculosis cysm in complex with the urea-scaffold inhibitor 6 [3-(3-(4-bromophenyl)ureido)benzoic acid] (see paper)
72% identity, 95% coverage: 2:300/316 of query aligns to 1:291/291 of 5i7hB

query
sites
5i7hB
A
 
A
R
 
R
Y
 
Y
A
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
D
 
Q
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
N
T
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
Q
R
 
R
L
 
L
S
 
S
P
 
P
S
 
R
-
 
W
-
 
D
-
 
D
-
 
G
-
 
D
-
 
G
P
 
P
E
 
H
V
 
V
R
 
R
L
 
L
W
 
W
A
 
A
K
 
K
L
 
L
E
 
E
D
 
D
R
 
R
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
I
 
I
K
|
K
D
 
D
R
 
R
P
 
P
A
 
A
L
 
V
A
 
R
M
 
M
I
 
I
E
 
E
A
 
Q
A
 
A
E
 
E
R
 
A
D
 
D
G
 
G
I
 
L
L
 
L
K
 
R
S
 
P
G
 
G
D
 
A
T
 
T
I
 
I
L
 
L
E
 
E
P
 
P
T
|
T
S
|
S
G
 
G
N
|
N
T
|
T
G
 
G
I
 
I
S
 
S
L
 
L
A
 
A
M
 
M
A
 
A
A
 
A
K
 
R
L
 
L
K
 
K
G
 
G
Y
 
Y
G
 
R
M
 
L
V
 
I
C
 
C
V
 
V
M
 
M
P
 
P
E
 
E
N
 
N
T
 
T
S
 
S
E
 
V
E
 
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
Q
 
E
A
 
L
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
R
 
Q
I
 
I
V
 
I
Y
 
F
S
 
S
P
 
A
A
 
A
A
 
E
G
 
G
G
 
G
S
 
S
N
 
N
E
 
T
A
 
A
V
 
V
R
 
A
R
 
T
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
A
A
 
T
N
 
N
P
 
P
D
 
S
W
 
W
V
 
V
M
 
M
L
 
L
Y
 
Y
Q
|
Q
Y
|
Y
G
 
G
N
 
N
P
 
P
A
 
A
N
 
N
A
 
T
D
 
D
A
 
S
H
 
H
Y
 
Y
Y
 
C
G
 
G
T
 
T
G
 
G
P
 
P
E
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
A
D
 
D
L
 
L
P
 
P
T
 
E
L
 
I
T
 
T
H
 
H
F
 
F
V
 
V
G
 
A
G
 
G
L
 
L
G
|
G
T
|
T
T
|
T
G
 
G
T
|
T
L
 
L
V
 
M
G
 
G
V
 
T
G
 
G
R
 
R
Y
 
F
L
 
L
R
 
R
E
 
E
H
 
H
K
 
V
P
 
A
D
 
N
V
 
V
Q
 
K
V
 
I
I
 
V
A
 
A
A
|
A
E
|
E
P
|
P
R
 
R
Y
 
-
G
 
-
E
 
-
L
 
-
V
 
-
Y
 
-
G
 
-
L
 
-
R
 
-
N
 
-
L
 
-
D
 
-
E
 
-
G
 
-
F
 
F
V
 
V
P
 
P
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
E
 
E
V
 
I
L
 
L
S
 
T
G
 
A
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
V
 
V
G
 
G
A
 
A
Y
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
V
R
 
R
R
 
R
T
 
T
R
 
R
E
 
E
L
 
L
L
 
V
E
 
H
K
 
T
E
 
E
G
 
G
I
 
I
F
 
F
A
 
A
G
 
G
I
 
I
S
|
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
L
H
 
H
A
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
V
A
 
G
N
 
A
K
 
G
V
 
A
L
 
L
K
 
A
K
 
A
G
 
G
G
 
E
S
 
R
A
 
A
D
 
D
I
 
I
A
 
A
F
 
L
V
 
V
V
 
V
A
|
A
D
|
D
A
 
A
G
 
G
W
 
W
K
 
K
Y
 
Y
L
 
L
S
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
S
 
A

5i6dB Mycobacterium tuberculosis cysm in complex with the urea-scaffold inhibitor 5 [3-(3-(p-tolyl)ureido) benzoic acid] (see paper)
72% identity, 94% coverage: 3:300/316 of query aligns to 1:287/287 of 5i6dB

query
sites
5i6dB
R
 
R
Y
 
Y
A
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
D
 
Q
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
N
T
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
Q
R
 
R
L
 
L
S
 
S
P
 
P
S
 
R
-
 
W
-
 
D
-
 
G
P
 
P
E
 
H
V
 
V
R
 
R
L
 
L
W
 
W
A
 
A
K
 
K
L
 
L
E
 
E
D
 
D
R
 
R
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
I
 
I
K
|
K
D
 
D
R
 
R
P
 
P
A
 
A
L
 
V
A
 
R
M
 
M
I
 
I
E
 
E
A
 
Q
A
 
A
E
 
E
R
 
A
D
 
D
G
 
G
I
 
L
L
 
L
K
 
R
S
 
P
G
 
G
D
 
A
T
 
T
I
 
I
L
 
L
E
 
E
P
 
P
T
|
T
S
|
S
G
 
G
N
|
N
T
|
T
G
 
G
I
 
I
S
 
S
L
 
L
A
 
A
M
 
M
A
 
A
A
 
A
K
 
R
L
 
L
K
 
K
G
 
G
Y
 
Y
G
 
R
M
 
L
V
 
I
C
 
C
V
 
V
M
 
M
P
 
P
E
 
E
N
 
N
T
 
T
S
 
S
E
 
V
E
 
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
Q
 
E
A
 
L
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
R
 
Q
I
 
I
V
 
I
Y
 
F
S
 
S
P
 
A
A
 
A
A
 
E
G
 
G
G
 
G
S
 
S
N
 
N
E
 
T
A
 
A
V
 
V
R
 
A
R
 
T
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
A
A
 
T
N
 
N
P
 
P
D
 
S
W
 
W
V
 
V
M
 
M
L
 
L
Y
 
Y
Q
|
Q
Y
|
Y
G
 
G
N
 
N
P
 
P
A
 
A
N
 
N
A
 
T
D
 
D
A
 
S
H
 
H
Y
 
Y
Y
 
C
G
 
G
T
 
T
G
 
G
P
 
P
E
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
A
D
 
D
L
 
L
P
 
P
T
 
E
L
 
I
T
 
T
H
 
H
F
 
F
V
 
V
G
 
A
G
 
G
L
 
L
G
|
G
T
|
T
T
|
T
G
 
G
T
|
T
L
 
L
V
 
M
G
 
G
V
 
T
G
 
G
R
 
R
Y
 
F
L
 
L
R
 
R
E
 
E
H
 
H
K
 
V
P
 
A
D
 
N
V
 
V
Q
 
K
V
 
I
I
 
V
A
 
A
A
 
A
E
|
E
P
|
P
R
 
R
Y
 
-
G
 
-
E
 
-
L
 
-
V
 
-
Y
 
-
G
 
-
L
 
-
R
 
-
N
 
-
L
 
-
D
 
-
E
 
-
G
 
-
F
 
F
V
 
V
P
 
P
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
E
 
E
V
 
I
L
 
L
S
 
T
G
 
A
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
V
 
V
G
 
G
A
 
A
Y
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
V
R
 
R
R
 
R
T
 
T
R
 
R
E
 
E
L
 
L
L
 
V
E
 
H
K
 
T
E
 
E
G
 
G
I
 
I
F
 
F
A
 
A
G
 
G
I
 
I
S
|
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
L
H
 
H
A
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
V
A
 
G
N
 
A
K
 
G
V
 
A
L
 
L
K
 
A
K
 
A
G
 
G
G
 
E
S
 
R
A
 
A
D
 
D
I
 
I
A
 
A
F
 
L
V
 
V
V
 
V
A
|
A
D
|
D
A
 
A
G
 
G
W
 
W
K
 
K
Y
 
Y
L
 
L
S
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
S
 
A

5iwcA Mycobacterium tuberculosis cysm in complex with the urea-scaffold inhibitor 3 [4-(3-([1,1'-biphenyl]-3-yl)ureido)-2-hydroxybenzoic acid] (see paper)
70% identity, 98% coverage: 2:311/316 of query aligns to 1:297/297 of 5iwcA

query
sites
5iwcA
A
 
A
R
 
R
Y
 
Y
A
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
D
 
Q
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
N
T
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
Q
R
 
R
L
 
L
S
 
S
P
 
P
S
 
R
-
 
W
-
 
D
-
 
D
-
 
G
-
 
R
-
 
D
-
 
G
P
 
P
E
 
H
V
 
V
R
 
R
L
 
L
W
 
W
A
 
A
K
 
K
L
 
L
E
 
E
D
 
D
R
 
R
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
I
 
I
K
|
K
D
 
D
R
 
R
P
 
P
A
 
A
L
 
V
A
 
R
M
 
M
I
 
I
E
 
E
A
 
Q
A
 
A
E
 
E
R
 
A
D
 
D
G
 
G
I
 
L
L
 
L
K
 
R
S
 
P
G
 
G
D
 
A
T
 
T
I
 
I
L
 
L
E
 
E
P
 
P
T
|
T
S
 
S
G
 
G
N
|
N
T
|
T
G
 
G
I
 
I
S
 
S
L
 
L
A
 
A
M
 
M
A
 
A
A
 
A
K
 
R
L
 
L
K
 
K
G
 
G
Y
 
Y
G
 
R
M
 
L
V
 
I
C
 
C
V
 
V
M
 
M
P
 
P
E
 
E
N
 
N
T
 
T
S
 
S
E
 
V
E
 
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
Q
 
E
A
 
L
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
R
 
Q
I
 
I
V
 
I
Y
 
F
S
 
S
P
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
G
 
-
S
 
S
N
 
N
E
 
T
A
 
A
V
 
V
R
 
A
R
 
T
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
A
A
 
T
N
 
N
P
 
P
D
 
S
W
 
W
V
 
V
M
 
M
L
 
L
Y
 
Y
Q
|
Q
Y
 
Y
G
 
G
N
 
N
P
 
P
A
 
A
N
 
N
A
 
T
D
 
D
A
 
S
H
 
H
Y
 
Y
Y
 
C
G
 
G
T
 
T
G
 
G
P
 
P
E
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
A
D
 
D
L
 
L
P
 
P
T
 
E
L
 
I
T
 
T
H
 
H
F
 
F
V
 
V
G
 
A
G
 
G
L
 
L
G
|
G
T
|
T
T
|
T
G
|
G
T
|
T
L
 
L
V
 
M
G
 
G
V
 
T
G
 
G
R
 
R
Y
 
F
L
 
L
R
 
R
E
 
E
H
 
H
K
 
V
P
 
A
D
 
N
V
 
V
Q
 
K
V
 
I
I
 
V
A
 
A
A
 
A
E
 
E
P
|
P
R
 
R
Y
 
Y
G
 
-
E
 
-
L
 
-
V
 
-
Y
 
-
G
 
-
L
 
-
R
 
-
N
 
-
L
 
-
D
 
-
E
 
-
G
 
-
F
 
-
V
 
-
P
 
P
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
E
 
E
V
 
I
L
 
L
S
 
T
G
 
A
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
V
 
V
G
 
G
A
 
A
Y
 
V
D
 
D
A
|
A
L
 
V
R
 
R
R
 
R
T
 
T
R
 
R
E
 
E
L
 
L
L
 
V
E
 
H
K
 
T
E
 
E
G
 
G
I
 
I
F
 
F
A
 
A
G
 
G
I
 
I
S
|
S
T
 
T
G
 
G
A
|
A
V
 
V
L
 
L
H
 
H
A
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
V
A
 
G
N
 
A
K
 
G
V
 
A
L
 
L
K
 
A
K
 
A
G
 
G
G
 
E
S
 
R
A
 
A
D
 
D
I
 
I
A
 
A
F
 
L
V
 
V
V
 
V
A
|
A
D
|
D
A
 
A
G
 
G
W
 
W
K
 
K
Y
 
Y
L
 
L
S
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
S
 
A
G
 
G
S
 
S
L
 
L
D
 
D
E
 
D
A
 
A
A
 
E
E
 
T
R
 
A
L
 
L
D
 
E

5i6dA Mycobacterium tuberculosis cysm in complex with the urea-scaffold inhibitor 5 [3-(3-(p-tolyl)ureido) benzoic acid] (see paper)
70% identity, 95% coverage: 3:301/316 of query aligns to 1:285/285 of 5i6dA

query
sites
5i6dA
R
 
R
Y
 
Y
A
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
D
 
Q
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
N
T
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
Q
R
 
R
L
 
L
S
 
S
P
 
P
S
 
R
-
 
W
-
 
D
-
 
D
-
 
G
-
 
R
-
 
D
-
 
G
P
 
P
E
 
H
V
 
V
R
 
R
L
 
L
W
 
W
A
 
A
K
 
K
L
 
L
E
 
E
D
 
D
R
 
R
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
I
 
I
K
|
K
D
 
D
R
 
R
P
 
P
A
 
A
L
 
V
A
 
R
M
 
M
I
 
I
E
 
E
A
 
Q
A
 
A
E
 
E
R
 
A
D
 
D
G
 
G
I
 
L
L
 
L
K
 
R
S
 
P
G
 
G
D
 
A
T
 
T
I
 
I
L
 
L
E
 
E
P
 
P
T
|
T
S
|
S
G
 
G
N
|
N
T
|
T
G
 
G
I
 
I
S
 
S
L
 
L
A
 
A
M
 
M
A
 
A
A
 
A
K
 
R
L
 
L
K
 
K
G
 
G
Y
 
Y
G
 
R
M
 
L
V
 
I
C
 
C
V
 
V
M
 
M
P
 
P
E
 
E
N
 
N
T
 
T
S
 
S
E
 
V
E
 
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
Q
 
E
A
 
L
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
R
 
Q
I
 
I
V
 
I
Y
 
F
S
 
S
P
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
G
 
-
S
 
-
N
 
-
E
 
T
A
 
A
V
 
V
R
 
A
R
 
T
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
A
A
 
T
N
 
N
P
 
P
D
 
S
W
 
W
V
 
V
M
 
M
L
 
L
Y
 
Y
Q
|
Q
Y
|
Y
G
 
G
N
 
N
P
 
P
A
 
A
N
 
N
A
 
T
D
 
D
A
 
S
H
 
H
Y
 
Y
Y
 
C
G
 
G
T
 
T
G
 
G
P
 
P
E
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
A
D
 
D
L
 
L
P
 
P
T
 
E
L
 
I
T
 
T
H
 
H
F
 
F
V
 
V
G
 
A
G
 
G
L
 
L
G
|
G
T
|
T
T
|
T
G
 
G
T
|
T
L
 
L
V
 
M
G
 
G
V
 
T
G
 
G
R
 
R
Y
 
F
L
 
L
R
 
R
E
 
E
H
 
H
K
 
V
P
 
A
D
 
N
V
 
V
Q
 
K
V
 
I
I
 
V
A
 
A
A
|
A
E
|
E
P
|
P
R
 
R
Y
 
-
G
 
-
E
 
-
L
 
-
V
 
-
Y
 
-
G
 
-
L
 
-
R
 
-
N
 
-
L
 
-
D
 
-
E
 
-
G
 
-
F
 
F
V
 
V
P
 
P
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
E
 
E
V
 
I
L
 
L
S
 
T
G
 
A
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
V
 
V
G
 
G
A
 
A
Y
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
V
R
 
R
R
 
R
T
 
T
R
 
R
E
 
E
L
 
L
L
 
V
E
 
H
K
 
T
E
 
E
G
 
G
I
 
I
F
 
F
A
 
A
G
 
G
I
 
I
S
|
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
L
H
 
H
A
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
V
A
 
G
N
 
A
K
 
G
V
 
A
L
 
L
K
 
A
K
 
A
G
 
G
G
 
E
S
 
R
A
 
A
D
 
D
I
 
I
A
 
A
F
 
L
V
 
V
V
 
V
A
|
A
D
|
D
A
 
A
G
 
G
W
 
W
K
 
K
Y
 
Y
L
 
L
S
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
S
 
A
G
 
G

5i7aA Mycobacterium tuberculosis cysm in complex with the urea-scaffold inhibitor 1 [3-(3-(3,4-dichlorophenyl)ureido)benzoic acid] (see paper)
70% identity, 94% coverage: 3:299/316 of query aligns to 1:281/281 of 5i7aA

query
sites
5i7aA
R
 
R
Y
 
Y
A
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
D
 
Q
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
N
T
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
Q
R
 
R
L
 
L
S
 
S
P
 
P
S
 
R
-
 
W
-
 
D
-
 
D
-
 
G
-
 
R
-
 
D
-
 
G
P
 
P
E
 
H
V
 
V
R
 
R
L
 
L
W
 
W
A
 
A
K
 
K
L
 
L
E
 
E
D
 
D
R
 
R
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
I
 
I
K
|
K
D
 
D
R
 
R
P
 
P
A
 
A
L
 
V
A
 
R
M
 
M
I
 
I
E
 
E
A
 
Q
A
 
A
E
 
E
R
 
A
D
 
D
G
 
G
I
 
L
L
 
L
K
 
R
S
 
P
G
 
G
D
 
A
T
 
T
I
 
I
L
 
L
E
 
E
P
 
P
T
|
T
S
|
S
G
 
G
N
|
N
T
|
T
G
 
G
I
 
I
S
 
S
L
 
L
A
 
A
M
 
M
A
 
A
A
 
A
K
 
R
L
 
L
K
 
K
G
 
G
Y
 
Y
G
 
R
M
 
L
V
 
I
C
 
C
V
 
V
M
 
M
P
 
P
E
 
E
N
 
N
T
 
T
S
 
S
E
 
V
E
 
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
Q
 
E
A
 
L
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
R
 
Q
I
 
I
V
 
I
Y
 
F
S
 
S
P
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
G
 
-
S
 
-
N
 
-
E
 
-
A
 
A
V
 
V
R
 
A
R
 
T
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
A
A
 
T
N
 
N
P
 
P
D
 
S
W
 
W
V
 
V
M
 
M
L
 
L
Y
 
Y
Q
|
Q
Y
|
Y
G
 
G
N
 
N
P
 
P
A
 
A
N
 
N
A
 
T
D
 
D
A
 
S
H
 
H
Y
 
Y
Y
 
C
G
 
G
T
 
T
G
 
G
P
 
P
E
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
A
D
 
D
L
 
L
P
 
P
T
 
E
L
 
I
T
 
T
H
 
H
F
 
F
V
 
V
G
 
A
G
 
G
L
 
L
G
|
G
T
|
T
T
|
T
G
|
G
T
|
T
L
 
L
V
 
M
G
 
G
V
 
T
G
 
G
R
 
R
Y
 
F
L
 
L
R
 
R
E
 
E
H
 
H
K
 
V
P
 
A
D
 
N
V
 
V
Q
 
K
V
 
I
I
 
V
A
 
A
A
|
A
E
|
E
P
|
P
R
 
R
Y
 
-
G
 
-
E
 
-
L
 
-
V
 
-
Y
 
-
G
 
-
L
 
-
R
 
-
N
 
-
L
 
-
D
 
-
E
 
-
G
 
-
F
 
-
V
 
V
P
 
P
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
E
 
E
V
 
I
L
 
L
S
 
T
G
 
A
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
V
 
V
G
 
G
A
 
A
Y
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
V
R
 
R
R
 
R
T
 
T
R
 
R
E
 
E
L
 
L
L
 
V
E
 
H
K
 
T
E
 
E
G
 
G
I
 
I
F
 
F
A
 
A
G
 
G
I
 
I
S
|
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
L
H
 
H
A
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
V
A
 
G
N
 
A
K
 
G
V
 
A
L
 
L
K
 
A
K
 
A
G
 
G
G
 
E
S
 
R
A
 
A
D
 
D
I
 
I
A
 
A
F
 
L
V
 
V
V
 
V
A
|
A
D
|
D
A
 
A
G
 
G
W
 
W
K
 
K
Y
 
Y
L
 
L
S
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y

5i7oA Mycobacterium tuberculosis cysm in complex with the urea-scaffold inhibitor 7 [3-(3-(4-chlorophenyl)ureido)benzoic acid] (see paper)
69% identity, 94% coverage: 3:299/316 of query aligns to 1:280/280 of 5i7oA

query
sites
5i7oA
R
 
R
Y
 
Y
A
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
D
 
Q
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
N
T
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
Q
R
 
R
L
 
L
S
 
S
P
 
P
S
 
R
-
 
W
-
 
D
-
 
D
-
 
G
-
 
R
-
 
D
-
 
G
P
 
P
E
 
H
V
 
V
R
 
R
L
 
L
W
 
W
A
 
A
K
 
K
L
 
L
E
 
E
D
 
D
R
 
R
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
I
 
I
K
|
K
D
 
D
R
 
R
P
 
P
A
 
A
L
 
V
A
 
R
M
 
M
I
 
I
E
 
E
A
 
Q
A
 
A
E
 
E
R
 
A
D
 
D
G
 
G
I
 
L
L
 
L
K
 
R
S
 
P
G
 
G
D
 
A
T
 
T
I
 
I
L
 
L
E
 
E
P
 
P
T
|
T
S
|
S
G
 
G
N
|
N
T
|
T
G
 
G
I
 
I
S
 
S
L
 
L
A
 
A
M
 
M
A
 
A
A
 
A
K
 
R
L
 
L
K
 
K
G
 
G
Y
 
Y
G
 
R
M
 
L
V
 
I
C
 
C
V
 
V
M
 
M
P
 
P
E
 
E
N
 
N
T
 
T
S
 
S
E
 
V
E
 
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
Q
 
E
A
 
L
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
R
 
Q
I
 
I
V
 
I
Y
 
F
S
 
-
P
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
G
 
-
S
 
-
N
 
-
E
 
-
A
 
A
V
 
V
R
 
A
R
 
T
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
A
A
 
T
N
 
N
P
 
P
D
 
S
W
 
W
V
 
V
M
 
M
L
 
L
Y
 
Y
Q
|
Q
Y
|
Y
G
 
G
N
 
N
P
 
P
A
 
A
N
 
N
A
 
T
D
 
D
A
 
S
H
 
H
Y
 
Y
Y
 
C
G
 
G
T
 
T
G
 
G
P
 
P
E
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
A
D
 
D
L
 
L
P
 
P
T
 
E
L
 
I
T
 
T
H
 
H
F
 
F
V
 
V
G
 
A
G
|
G
L
|
L
G
|
G
T
|
T
T
|
T
G
 
G
T
|
T
L
 
L
V
 
M
G
 
G
V
 
T
G
 
G
R
 
R
Y
 
F
L
 
L
R
 
R
E
 
E
H
 
H
K
 
V
P
 
A
D
 
N
V
 
V
Q
 
K
V
 
I
I
 
V
A
 
A
A
|
A
E
|
E
P
|
P
R
 
R
Y
 
-
G
 
-
E
 
-
L
 
-
V
 
-
Y
 
-
G
 
-
L
 
-
R
 
-
N
 
-
L
 
-
D
 
-
E
 
-
G
 
-
F
 
-
V
 
V
P
 
P
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
E
 
E
V
 
I
L
 
L
S
 
T
G
 
A
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
V
 
V
G
 
G
A
 
A
Y
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
V
R
 
R
R
 
R
T
 
T
R
 
R
E
 
E
L
 
L
L
 
V
E
 
H
K
 
T
E
 
E
G
 
G
I
 
I
F
 
F
A
 
A
G
 
G
I
 
I
S
|
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
L
H
 
H
A
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
V
A
 
G
N
 
A
K
 
G
V
 
A
L
 
L
K
 
A
K
 
A
G
 
G
G
 
E
S
 
R
A
 
A
D
 
D
I
 
I
A
 
A
F
 
L
V
 
V
V
 
V
A
|
A
D
|
D
A
 
A
G
 
G
W
 
W
K
 
K
Y
 
Y
L
 
L
S
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y

5i7hA Mycobacterium tuberculosis cysm in complex with the urea-scaffold inhibitor 6 [3-(3-(4-bromophenyl)ureido)benzoic acid] (see paper)
69% identity, 94% coverage: 3:299/316 of query aligns to 1:280/280 of 5i7hA

query
sites
5i7hA
R
 
R
Y
 
Y
A
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
D
 
Q
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
N
T
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
Q
R
 
R
L
 
L
S
 
S
P
 
P
S
 
R
-
 
W
-
 
D
-
 
D
-
 
G
-
 
R
-
 
D
-
 
G
P
 
P
E
 
H
V
 
V
R
 
R
L
 
L
W
 
W
A
 
A
K
 
K
L
 
L
E
 
E
D
 
D
R
 
R
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
I
 
I
K
|
K
D
 
D
R
 
R
P
 
P
A
 
A
L
 
V
A
 
R
M
 
M
I
 
I
E
 
E
A
 
Q
A
 
A
E
 
E
R
 
A
D
 
D
G
 
G
I
 
L
L
 
L
K
 
R
S
 
P
G
 
G
D
 
A
T
 
T
I
 
I
L
 
L
E
 
E
P
 
P
T
|
T
S
|
S
G
 
G
N
|
N
T
|
T
G
 
G
I
 
I
S
 
S
L
 
L
A
 
A
M
 
M
A
 
A
A
 
A
K
 
R
L
 
L
K
 
K
G
 
G
Y
 
Y
G
 
R
M
 
L
V
 
I
C
 
C
V
 
V
M
 
M
P
 
P
E
 
E
N
 
N
T
 
T
S
 
S
E
 
V
E
 
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
Q
 
E
A
 
L
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
R
 
Q
I
 
I
V
 
I
Y
 
F
S
 
-
P
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
G
 
-
S
 
-
N
 
-
E
 
-
A
 
A
V
 
V
R
 
A
R
 
T
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
A
A
 
T
N
 
N
P
 
P
D
 
S
W
 
W
V
 
V
M
 
M
L
 
L
Y
 
Y
Q
|
Q
Y
|
Y
G
 
G
N
 
N
P
 
P
A
 
A
N
 
N
A
 
T
D
 
D
A
 
S
H
 
H
Y
 
Y
Y
 
C
G
 
G
T
 
T
G
 
G
P
 
P
E
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
A
D
 
D
L
 
L
P
 
P
T
 
E
L
 
I
T
 
T
H
 
H
F
 
F
V
 
V
G
 
A
G
 
G
L
|
L
G
|
G
T
|
T
T
|
T
G
|
G
T
|
T
L
 
L
V
 
M
G
 
G
V
 
T
G
 
G
R
 
R
Y
 
F
L
 
L
R
 
R
E
 
E
H
 
H
K
 
V
P
 
A
D
 
N
V
 
V
Q
 
K
V
 
I
I
 
V
A
 
A
A
|
A
E
|
E
P
|
P
R
 
R
Y
 
-
G
 
-
E
 
-
L
 
-
V
 
-
Y
 
-
G
 
-
L
 
-
R
 
-
N
 
-
L
 
-
D
 
-
E
 
-
G
 
-
F
 
-
V
 
V
P
 
P
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
E
 
E
V
 
I
L
 
L
S
 
T
G
 
A
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
V
 
V
G
 
G
A
 
A
Y
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
V
R
 
R
R
 
R
T
 
T
R
 
R
E
 
E
L
 
L
L
 
V
E
 
H
K
 
T
E
 
E
G
 
G
I
 
I
F
 
F
A
 
A
G
 
G
I
 
I
S
|
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
L
H
 
H
A
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
V
A
 
G
N
 
A
K
 
G
V
 
A
L
 
L
K
 
A
K
 
A
G
 
G
G
 
E
S
 
R
A
 
A
D
 
D
I
 
I
A
 
A
F
 
L
V
 
V
V
 
V
A
|
A
D
|
D
A
 
A
G
 
G
W
 
W
K
 
K
Y
 
Y
L
 
L
S
 
S
T
 
T
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y

P16703 Cysteine synthase B; CSase B; O-acetylserine (thiol)-lyase B; OAS-TL B; O-acetylserine sulfhydrylase B; EC 2.5.1.47 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
41% identity, 93% coverage: 5:299/316 of query aligns to 2:292/303 of P16703

query
sites
P16703
A
 
S
S
 
T
L
 
L
L
 
E
D
 
Q
A
 
T
L
 
I
G
 
G
G
 
N
T
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
V
G
 
K
L
 
L
P
 
Q
R
 
R
L
 
M
S
 
G
P
 
P
S
 
D
P
 
N
E
 
G
V
 
S
R
 
E
L
 
V
W
 
W
A
 
L
K
 
K
L
 
L
E
 
E
D
 
G
R
 
N
N
 
N
P
 
P
T
 
A
G
 
G
S
 
S
I
 
V
K
 
K
D
 
D
R
 
R
P
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
S
M
 
M
I
 
I
E
 
V
A
 
E
A
 
A
E
 
E
R
 
K
D
 
R
G
 
G
I
 
E
L
 
I
K
 
K
S
 
P
G
 
G
D
 
D
T
 
V
I
 
L
L
 
I
E
 
E
P
 
A
T
 
T
S
 
S
G
 
G
N
|
N
T
 
T
G
 
G
I
 
I
S
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
A
 
I
A
 
A
K
 
A
L
 
L
K
 
K
G
 
G
Y
 
Y
G
 
R
M
 
M
V
 
K
C
 
L
V
 
L
M
 
M
P
 
P
E
 
D
N
 
N
T
 
M
S
 
S
E
 
Q
E
 
E
R
 
R
R
 
R
Q
 
A
L
 
A
L
 
M
Q
 
R
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
R
 
E
I
 
L
V
 
I
Y
 
L
S
 
V
P
 
T
A
 
K
A
 
E
G
 
Q
G
 
G
S
 
M
N
 
E
E
 
G
A
 
A
V
 
R
R
 
D
R
 
L
A
 
A
K
 
L
E
 
E
L
 
M
A
 
A
K
 
N
A
 
R
N
 
G
P
 
-
D
 
E
W
 
G
V
 
K
M
 
L
L
 
L
Y
 
D
Q
 
Q
Y
 
F
G
 
N
N
 
N
P
 
P
A
 
D
N
 
N
A
 
P
D
 
Y
A
 
A
H
 
H
Y
 
Y
Y
 
T
G
 
T
T
 
T
G
 
G
P
 
P
E
 
E
L
 
I
L
 
W
K
 
Q
D
 
Q
L
 
T
-
 
G
P
 
G
T
 
R
L
 
I
T
 
T
H
 
H
F
 
F
V
 
V
G
 
S
G
 
S
L
 
M
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
T
 
T
L
 
I
V
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
S
R
 
R
Y
 
F
L
 
M
R
 
R
E
 
E
H
 
Q
K
 
S
P
 
K
D
 
P
V
 
V
Q
 
T
V
 
I
I
 
V
A
 
G
A
 
L
E
 
Q
P
 
P
R
 
E
Y
 
E
G
 
G
E
 
S
L
 
S
V
 
I
Y
 
P
G
 
G
L
 
I
R
 
R
N
 
R
L
 
W
D
 
P
E
 
T
G
 
E
F
 
Y
V
 
L
P
 
P
E
 
G
L
 
I
Y
 
F
D
 
N
P
 
A
E
 
S
V
 
L
L
 
V
S
 
D
G
 
E
R
 
V
Y
 
L
S
 
D
V
 
I
G
 
H
A
 
Q
Y
 
R
D
 
D
A
 
A
L