SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_007153414.1 NCBI__GCF_000170835.1:WP_007153414.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 9 hits to proteins with known functional sites (download)

5odcI Heterodisulfide reductase / [nife]-hydrogenase complex from methanothermococcus thermolithotrophicus at 2.3 a resolution (see paper)
31% identity, 26% coverage: 1:105/402 of query aligns to 7:107/173 of 5odcI

query
sites
5odcI
M
 
L
Q
 
N
T
 
K
N
 
N
L
 
L
V
 
A
Q
 
S
Q
 
Q
F
 
I
-
 
I
-
 
E
A
 
A
N
 
G
T
 
T
P
 
P
-
 
I
E
 
P
G
 
G
Q
 
D
E
 
D
A
 
V
E
 
V
S
 
S
I
 
S
L
 
L
R
 
K
A
 
A
C
|
C
V
x
Y
H
x
Q
C
|
C
G
|
G
F
 
T
C
|
C
T
 
T
A
 
G
T
 
S
C
|
C
P
|
P
T
 
S
Y
 
-
Q
 
-
E
 
-
L
 
-
N
 
-
D
 
G
E
 
R
R
 
R
D
 
T
G
 
S
P
x
Y
R
|
R
G
x
T
R
 
R
I
 
K
Y
 
V
L
 
I
M
 
R
K
 
K
M
 
A
F
 
L
L
 
L
E
 
G
G
 
M
E
 
D
E
 
D
V
 
V
T
 
L
E
 
D
K
 
S
S
 
-
R
 
-
E
 
D
H
x
D
L
 
I
D
 
W
R
 
K
C
|
C
L
x
T
T
|
T
C
|
C
R
x
Y
S
 
T
C
|
C
E
 
Y
T
 
E
T
 
R
C
|
C
P
 
P
S
 
R
G
 
D
V
|
V
K
 
K
Y
 
V
G
 
T
R
 
E
L
 
I
V
 
I
D
 
K
I
 
T
S
 
I
R
 
R
G
 
N
L
 
L
M
 
A
E
 
A
Q
 
Q
E
 
K

5odcC Heterodisulfide reductase / [nife]-hydrogenase complex from methanothermococcus thermolithotrophicus at 2.3 a resolution (see paper)
31% identity, 26% coverage: 1:105/402 of query aligns to 7:107/184 of 5odcC

query
sites
5odcC
M
 
L
Q
 
N
T
 
K
N
 
N
L
 
L
V
 
A
Q
 
S
Q
 
Q
F
 
I
-
 
I
-
 
E
A
 
A
N
 
G
T
 
T
P
 
P
-
 
I
E
 
P
G
 
G
Q
 
D
E
 
D
A
 
V
E
 
V
S
 
S
I
 
S
L
 
L
R
 
K
A
 
A
C
|
C
V
x
Y
H
x
Q
C
|
C
G
|
G
F
 
T
C
|
C
T
 
T
A
 
G
T
 
S
C
|
C
P
|
P
T
 
S
Y
 
-
Q
 
-
E
 
-
L
 
-
N
 
-
D
 
G
E
 
R
R
 
R
D
 
T
G
 
S
P
x
Y
R
 
R
G
x
T
R
 
R
I
 
K
Y
 
V
L
 
I
M
 
R
K
 
K
M
 
A
F
 
L
L
 
L
E
 
G
G
 
M
E
 
D
E
 
D
V
 
V
T
 
L
E
 
D
K
 
S
S
 
-
R
 
-
E
 
D
H
 
D
L
 
I
D
 
W
R
 
K
C
|
C
L
x
T
T
|
T
C
|
C
R
x
Y
S
 
T
C
|
C
E
 
Y
T
 
E
T
 
R
C
|
C
P
|
P
S
 
R
G
 
D
V
|
V
K
 
K
Y
 
V
G
 
T
R
 
E
L
 
I
V
 
I
D
 
K
I
 
T
S
 
I
R
 
R
G
 
N
L
 
L
M
 
A
E
 
A
Q
 
Q
E
 
K

5odqB Heterodisulfide reductase / [nife]-hydrogenase complex from methanothermococcus thermolithotrophicus soaked with bromoethanesulfonate. (see paper)
24% identity, 55% coverage: 174:394/402 of query aligns to 8:246/291 of 5odqB

query
sites
5odqB
G
|
G
C
|
C
V
 
I
Q
 
M
P
 
P
S
 
N
A
 
R
T
 
Y
P
 
A
N
 
G
T
 
V
N
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
T
A
 
R
R
 
T
V
 
V
L
 
M
Y
 
E
K
 
K
L
 
L
G
 
G
V
 
V
T
 
E
M
 
L
V
 
V
E
 
D
A
 
M
P
 
T
E
 
G
A
 
A
G
 
S
C
|
C
C
|
C
G
 
P
A
 
A
V
 
P
N
x
G
H
 
V
H
 
F
L
 
G
S
 
S
E
 
F
H
 
D
E
 
Q
Q
 
K
A
 
T
-
 
W
L
 
L
N
 
T
A
 
L
M
 
A
R
 
A
R
 
R
N
 
N
I
 
L
D
 
-
A
 
-
W
 
-
W
 
C
P
 
I
A
 
A
I
 
E
E
 
E
A
 
M
G
 
G
A
 
V
E
 
D
A
 
-
I
 
I
I
 
V
M
 
T
T
 
V
A
x
C
S
 
N
G
|
G
C
|
C
G
 
Y
A
 
G
M
 
S
V
 
L
Q
 
F
E
 
E
Y
 
A
G
 
A
H
 
H
L
 
L
L
 
L
K
 
H
D
 
D
D
 
N
P
 
K
-
 
E
-
 
A
-
 
L
-
 
N
M
 
F
Y
 
V
A
 
N
A
 
E
K
 
K
A
 
L
Q
 
D
K
 
K
V
 
V
-
 
G
-
 
K
-
 
E
-
 
Y
-
 
K
S
 
G
D
 
N
M
 
V
T
 
K
I
 
V
D
 
R
L
 
H
G
 
F
A
 
A
F
 
E
L
 
L
L
 
I
K
 
Y
Q
 
N
D
 
D
L
 
I
-
 
G
-
 
V
-
 
D
-
 
K
-
 
I
-
 
A
E
 
E
K
 
K
L
 
V
K
 
E
V
 
R
P
 
P
Q
 
L
G
 
N
A
 
I
G
 
N
-
 
V
K
 
G
V
 
V
A
 
H
F
 
Y
H
x
G
C
|
C
-
x
H
-
 
F
-
 
L
-
 
K
P
 
P
C
 
T
T
 
D
L
 
V
Q
 
K
H
 
H
-
 
L
-
 
G
A
 
S
M
 
A
Q
 
E
Q
 
R
N
 
P
G
 
V
V
 
M
V
 
L
D
 
D
Q
 
E
V
 
I
L
 
V
R
 
E
R
 
A
V
 
T
G
 
G
I
 
A
D
 
K
L
 
S
A
 
V
E
 
P
T
 
Y
K
 
A
E
 
D
K
 
K
H
 
M
L
 
M
C
|
C
C
|
C
G
 
G
S
 
A
A
x
G
G
 
G
T
 
G
Y
 
V
S
x
R
I
 
A
L
 
R
Q
 
E
P
 
L
K
 
E
L
 
L
S
 
S
Q
 
L
R
 
D
L
 
M
L
 
T
N
 
N
N
 
E
K
 
K
L
 
I
R
 
E
A
 
N
L
 
M
T
 
I
V
 
K
D
 
A
N
 
G
P
 
A
D
 
D
R
 
C
I
 
T
V
 
V
T
 
N
A
 
V
N
x
C
I
 
P
G
x
F
C
|
C
Q
 
H
M
x
L
H
 
Q
L
 
F
E
 
D
T
 
-
K
 
R
A
 
G
Q
 
Q
V
 
I
P
 
E
V
 
I
Q
 
K

5odhH Heterodisulfide reductase / [nife]-hydrogenase complex from methanothermococcus thermolithotrophicus soaked with heterodisulfide for 3.5 minutes (see paper)
24% identity, 55% coverage: 174:394/402 of query aligns to 8:246/291 of 5odhH

query
sites
5odhH
G
|
G
C
|
C
V
 
I
Q
 
M
P
 
P
S
 
N
A
 
R
T
 
Y
P
 
A
N
 
G
T
 
V
N
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
T
A
 
R
R
 
T
V
 
V
L
 
M
Y
 
E
K
 
K
L
 
L
G
 
G
V
 
V
T
 
E
M
 
L
V
 
V
E
 
D
A
 
M
P
 
T
E
 
G
A
 
A
G
 
S
C
|
C
C
|
C
G
 
P
A
|
A
V
x
P
N
x
G
H
 
V
H
 
F
L
 
G
S
 
S
E
 
F
H
 
D
E
 
Q
Q
 
K
A
 
T
-
 
W
L
 
L
N
 
T
A
 
L
M
 
A
R
 
A
R
 
R
N
 
N
I
 
L
D
 
-
A
 
-
W
 
-
W
 
C
P
 
I
A
 
A
I
 
E
E
 
E
A
 
M
G
 
G
A
 
V
E
 
D
A
 
-
I
 
I
I
 
V
M
 
T
T
 
V
A
x
C
S
 
N
G
|
G
C
|
C
G
 
Y
A
 
G
M
 
S
V
 
L
Q
 
F
E
 
E
Y
 
A
G
 
A
H
 
H
L
 
L
L
 
L
K
 
H
D
 
D
D
 
N
P
 
K
-
 
E
-
 
A
-
 
L
-
 
N
M
 
F
Y
 
V
A
 
N
A
 
E
K
 
K
A
 
L
Q
 
D
K
 
K
V
 
V
-
 
G
-
 
K
-
 
E
-
 
Y
-
 
K
S
 
G
D
 
N
M
 
V
T
 
K
I
 
V
D
 
R
L
 
H
G
 
F
A
 
A
F
 
E
L
 
L
L
 
I
K
 
Y
Q
 
N
D
 
D
L
 
I
-
 
G
-
 
V
-
 
D
-
 
K
-
 
I
-
 
A
E
 
E
K
 
K
L
 
V
K
 
E
V
 
R
P
 
P
Q
 
L
G
 
N
A
 
I
G
 
N
-
 
V
K
 
G
V
 
V
A
 
H
F
 
Y
H
 
G
C
|
C
-
x
H
-
 
F
-
 
L
-
 
K
P
 
P
C
 
T
T
 
D
L
 
V
Q
 
K
H
 
H
-
 
L
-
 
G
A
 
S
M
 
A
Q
 
E
Q
 
R
N
 
P
G
 
V
V
 
M
V
 
L
D
 
D
Q
 
E
V
 
I
L
 
V
R
 
E
R
 
A
V
 
T
G
 
G
I
 
A
D
 
K
L
 
S
A
 
V
E
 
P
T
 
Y
K
 
A
E
 
D
K
 
K
H
 
M
L
 
M
C
|
C
C
|
C
G
 
G
S
 
A
A
x
G
G
|
G
T
 
G
Y
 
V
S
x
R
I
 
A
L
 
R
Q
 
E
P
 
L
K
 
E
L
 
L
S
 
S
Q
 
L
R
 
D
L
 
M
L
 
T
N
 
N
N
 
E
K
 
K
L
 
I
R
 
E
A
 
N
L
 
M
T
 
I
V
 
K
D
 
A
N
 
G
P
 
A
D
 
D
R
 
C
I
 
T
V
 
V
T
 
N
A
 
V
N
x
C
I
 
P
G
x
F
C
|
C
Q
 
H
M
 
L
H
 
Q
L
 
F
E
 
D
T
 
-
K
x
R
A
 
G
Q
 
Q
V
 
I
P
 
E
V
 
I
Q
 
K

5odhB Heterodisulfide reductase / [nife]-hydrogenase complex from methanothermococcus thermolithotrophicus soaked with heterodisulfide for 3.5 minutes (see paper)
24% identity, 55% coverage: 174:394/402 of query aligns to 8:246/291 of 5odhB

query
sites
5odhB
G
|
G
C
|
C
V
x
I
Q
 
M
P
 
P
S
 
N
A
 
R
T
 
Y
P
 
A
N
 
G
T
 
V
N
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
T
A
 
R
R
 
T
V
 
V
L
 
M
Y
 
E
K
 
K
L
 
L
G
 
G
V
 
V
T
 
E
M
 
L
V
 
V
E
 
D
A
 
M
P
 
T
E
 
G
A
 
A
G
 
S
C
|
C
C
|
C
G
 
P
A
 
A
V
x
P
N
x
G
H
 
V
H
 
F
L
 
G
S
 
S
E
 
F
H
 
D
E
 
Q
Q
 
K
A
 
T
-
 
W
L
 
L
N
 
T
A
 
L
M
 
A
R
 
A
R
 
R
N
 
N
I
 
L
D
 
-
A
 
-
W
 
-
W
 
C
P
 
I
A
 
A
I
 
E
E
 
E
A
 
M
G
 
G
A
 
V
E
 
D
A
 
-
I
 
I
I
 
V
M
 
T
T
 
V
A
x
C
S
 
N
G
|
G
C
|
C
G
 
Y
A
 
G
M
 
S
V
 
L
Q
 
F
E
 
E
Y
 
A
G
 
A
H
 
H
L
 
L
L
 
L
K
 
H
D
 
D
D
 
N
P
 
K
-
 
E
-
 
A
-
 
L
-
 
N
M
 
F
Y
 
V
A
 
N
A
 
E
K
 
K
A
 
L
Q
 
D
K
 
K
V
 
V
-
 
G
-
 
K
-
 
E
-
 
Y
-
 
K
S
 
G
D
 
N
M
 
V
T
 
K
I
 
V
D
 
R
L
 
H
G
 
F
A
 
A
F
 
E
L
 
L
L
 
I
K
 
Y
Q
 
N
D
 
D
L
 
I
-
 
G
-
 
V
-
 
D
-
 
K
-
 
I
-
 
A
E
 
E
K
 
K
L
 
V
K
 
E
V
 
R
P
 
P
Q
 
L
G
 
N
A
 
I
G
 
N
-
 
V
K
 
G
V
 
V
A
 
H
F
 
Y
H
x
G
C
|
C
-
x
H
-
 
F
-
 
L
-
 
K
P
 
P
C
 
T
T
 
D
L
 
V
Q
 
K
H
 
H
-
 
L
-
 
G
A
 
S
M
 
A
Q
 
E
Q
 
R
N
 
P
G
 
V
V
 
M
V
 
L
D
 
D
Q
 
E
V
 
I
L
 
V
R
 
E
R
 
A
V
 
T
G
 
G
I
 
A
D
 
K
L
 
S
A
 
V
E
 
P
T
 
Y
K
 
A
E
 
D
K
 
K
H
 
M
L
 
M
C
|
C
C
|
C
G
 
G
S
 
A
A
 
G
G
 
G
T
 
G
Y
 
V
S
 
R
I
 
A
L
 
R
Q
 
E
P
 
L
K
 
E
L
 
L
S
 
S
Q
 
L
R
 
D
L
 
M
L
 
T
N
 
N
N
 
E
K
 
K
L
 
I
R
 
E
A
 
N
L
 
M
T
 
I
V
 
K
D
 
A
N
 
G
P
 
A
D
 
D
R
 
C
I
 
T
V
 
V
T
 
N
A
 
V
N
x
C
I
 
P
G
x
F
C
|
C
Q
 
H
M
 
L
H
 
Q
L
 
F
E
 
D
T
 
-
K
 
R
A
 
G
Q
 
Q
V
 
I
P
 
E
V
 
I
Q
 
K

5odcB Heterodisulfide reductase / [nife]-hydrogenase complex from methanothermococcus thermolithotrophicus at 2.3 a resolution (see paper)
24% identity, 55% coverage: 174:394/402 of query aligns to 8:246/291 of 5odcB

query
sites
5odcB
G
|
G
C
|
C
V
x
I
Q
 
M
P
 
P
S
 
N
A
 
R
T
 
Y
P
 
A
N
 
G
T
 
V
N
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
T
A
 
R
R
 
T
V
 
V
L
 
M
Y
 
E
K
 
K
L
 
L
G
 
G
V
 
V
T
 
E
M
 
L
V
 
V
E
 
D
A
 
M
P
 
T
E
 
G
A
 
A
G
 
S
C
|
C
C
|
C
G
 
P
A
 
A
V
 
P
N
 
G
H
 
V
H
 
F
L
 
G
S
 
S
E
 
F
H
 
D
E
 
Q
Q
 
K
A
 
T
-
 
W
L
 
L
N
 
T
A
 
L
M
 
A
R
 
A
R
 
R
N
 
N
I
 
L
D
 
-
A
 
-
W
 
-
W
 
C
P
 
I
A
 
A
I
 
E
E
 
E
A
 
M
G
 
G
A
 
V
E
 
D
A
 
-
I
 
I
I
 
V
M
 
T
T
 
V
A
x
C
S
x
N
G
|
G
C
|
C
G
 
Y
A
 
G
M
 
S
V
 
L
Q
 
F
E
 
E
Y
 
A
G
 
A
H
 
H
L
 
L
L
 
L
K
 
H
D
 
D
D
 
N
P
 
K
-
 
E
-
 
A
-
 
L
-
 
N
M
 
F
Y
 
V
A
 
N
A
 
E
K
 
K
A
 
L
Q
 
D
K
 
K
V
 
V
-
 
G
-
 
K
-
 
E
-
 
Y
-
 
K
S
 
G
D
 
N
M
 
V
T
 
K
I
 
V
D
 
R
L
 
H
G
 
F
A
 
A
F
 
E
L
 
L
L
 
I
K
 
Y
Q
 
N
D
 
D
L
 
I
-
 
G
-
 
V
-
 
D
-
 
K
-
 
I
-
 
A
E
 
E
K
 
K
L
 
V
K
 
E
V
 
R
P
 
P
Q
 
L
G
 
N
A
 
I
G
 
N
-
 
V
K
 
G
V
 
V
A
 
H
F
 
Y
H
x
G
C
|
C
-
 
H
-
 
F
-
 
L
-
 
K
P
 
P
C
 
T
T
 
D
L
 
V
Q
 
K
H
 
H
-
 
L
-
 
G
A
 
S
M
 
A
Q
 
E
Q
 
R
N
 
P
G
 
V
V
 
M
V
 
L
D
 
D
Q
 
E
V
 
I
L
 
V
R
 
E
R
 
A
V
 
T
G
 
G
I
 
A
D
 
K
L
 
S
A
 
V
E
 
P
T
 
Y
K
 
A
E
 
D
K
 
K
H
 
M
L
 
M
C
|
C
C
|
C
G
 
G
S
 
A
A
x
G
G
 
G
T
 
G
Y
 
V
S
 
R
I
 
A
L
 
R
Q
 
E
P
 
L
K
 
E
L
 
L
S
 
S
Q
 
L
R
 
D
L
 
M
L
 
T
N
 
N
N
 
E
K
 
K
L
 
I
R
 
E
A
 
N
L
 
M
T
 
I
V
 
K
D
 
A
N
 
G
P
 
A
D
 
D
R
 
C
I
 
T
V
 
V
T
 
N
A
 
V
N
x
C
I
 
P
G
x
F
C
|
C
Q
 
H
M
 
L
H
 
Q
L
 
F
E
 
D
T
 
-
K
 
R
A
 
G
Q
 
Q
V
 
I
P
 
E
V
 
I
Q
 
K

7bkbB Formate dehydrogenase - heterodisulfide reductase - formylmethanofuran dehydrogenase complex from methanospirillum hungatei (hexameric, composite structure) (see paper)
25% identity, 56% coverage: 174:400/402 of query aligns to 9:268/296 of 7bkbB

query
sites
7bkbB
G
|
G
C
|
C
V
 
I
Q
 
A
P
 
P
S
 
N
A
 
R
T
 
Y
P
 
P
N
 
G
T
 
C
N
 
E
A
 
A
A
 
S
A
 
A
A
 
I
R
 
K
V
 
T
L
 
S
Y
 
E
K
 
K
L
 
V
G
 
G
V
 
I
T
 
K
M
 
L
V
 
L
E
 
P
A
 
L
P
 
K
E
 
G
A
 
A
G
 
S
C
|
C
C
|
C
G
 
P
A
 
A
V
 
P
N
 
G
H
 
A
H
 
F
L
 
G
S
 
S
E
 
I
H
 
D
E
 
L
Q
 
N
A
 
V
L
 
W
N
 
Y
A
 
A
M
 
M
-
 
A
R
 
A
R
 
R
N
 
N
I
 
L
D
 
-
A
 
-
W
 
-
W
 
-
P
 
V
A
 
L
I
 
A
E
 
E
A
 
E
G
 
M
A
 
K
E
 
K
A
 
D
I
 
I
I
 
A
M
 
L
T
 
I
A
x
C
S
 
N
G
 
G
C
|
C
G
 
Y
A
 
K
M
 
S
V
 
I
Q
 
W
E
 
E
Y
 
V
G
 
N
H
 
H
L
 
I
L
 
L
K
 
K
D
 
H
D
 
N
P
 
D
M
 
E
Y
 
L
A
 
R
A
 
D
K
 
N
A
 
V
Q
 
N
K
 
E
V
 
V
-
 
L
-
 
A
-
 
E
S
 
I
D
 
D
M
 
M
-
 
Q
-
 
F
-
 
K
-
 
G
T
 
T
I
 
I
D
 
D
L
 
V
G
 
W
-
 
H
-
 
L
A
 
A
F
 
E
L
 
L
L
 
Y
K
 
Y
Q
 
D
D
 
D
-
 
K
-
 
V
-
 
C
-
 
G
L
 
V
E
 
Q
K
 
K
L
 
I
K
 
K
-
 
D
-
 
S
-
 
V
-
 
T
V
 
T
P
 
P
Q
 
L
G
 
S
A
 
G
G
 
A
K
 
K
V
 
V
A
 
A
F
 
A
H
 
H
C
 
Y
P
x
G
C
|
C
T
 
H
L
 
L
Q
 
M
H
 
K
A
 
P
M
 
K
Q
 
K
Q
 
E
N
 
R
G
 
H
V
 
F
V
 
G
D
 
D
-
 
T
-
 
E
-
 
N
-
 
P
-
 
M
-
 
W
-
 
F
-
 
E
Q
 
E
V
 
L
L
 
I
R
 
G
R
 
A
V
 
L
G
 
G
I
 
A
D
 
E
L
 
P
A
 
I
E
 
Q
T
 
Y
K
 
R
E
 
N
K
 
K
H
 
M
L
 
Q
C
|
C
C
|
C
G
 
G
S
 
A
A
 
G
G
 
G
T
 
G
Y
 
V
S
 
R
I
 
G
L
 
Y
Q
 
D
P
 
I
K
 
V
L
 
H
S
 
A
Q
 
L
R
 
D
L
 
I
L
 
T
N
 
N
N
 
E
K
 
K
L
 
L
R
 
I
A
 
N
L
 
I
T
 
Q
V
 
E
D
 
A
N
 
G
P
 
A
D
 
D
R
 
A
I
 
I
V
 
T
T
 
E
A
 
L
N
x
C
I
 
P
G
x
F
C
|
C
Q
 
Q
M
 
L
-
 
Q
-
 
F
-
 
D
-
 
R
-
 
G
H
 
Q
L
 
I
E
 
E
T
 
I
K
 
K
A
 
E
Q
 
K
-
 
F
-
 
G
-
 
D
-
 
V
-
 
Y
-
 
N
V
 
I
P
 
P
V
 
V
Q
 
L
H
 
H
W
 
Y
I
 
N
E
 
E
L
 
L
L
 
L

Q007T0 Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial; Iron-sulfur subunit of complex II; Ip; EC 1.3.5.1 from Sus scrofa (Pig) (see paper)
26% identity, 24% coverage: 7:102/402 of query aligns to 168:270/280 of Q007T0

query
sites
Q007T0
Q
 
Q
Q
 
Q
F
 
Y
A
 
L
N
 
Q
T
 
S
P
 
I
E
 
E
G
 
E
Q
 
R
E
 
E
A
 
K
E
 
L
S
 
D
I
 
G
L
 
L
R
 
Y
A
 
E
C
|
C
V
 
I
H
 
L
C
|
C
G
 
A
F
 
C
C
|
C
T
 
S
A
 
T
T
 
S
C
|
C
P
 
P
T
 
S
Y
 
Y
Q
 
W
E
x
W
L
 
N
N
 
G
D
 
D
E
 
K
R
 
Y
D
 
L
G
 
G
P
 
P
R
 
A
G
 
V
R
 
L
I
 
M
Y
 
Q
L
 
A
M
 
Y
K
 
R
M
 
W
F
 
M
L
 
I
E
 
D
G
 
S
-
 
R
E
 
D
E
 
D
V
 
F
T
 
T
E
 
E
K
 
E
S
 
R
R
 
L
E
 
A
H
 
K
L
 
L
D
 
Q
-
 
D
-
 
P
-
 
F
-
 
S
-
 
L
-
 
Y
R
 
R
C
|
C
L
 
H
T
 
T
C
 
I
R
 
M
S
 
N
C
|
C
E
 
T
T
 
G
T
 
T
C
|
C
P
 
P
S
 
K
G
 
G
V
 
L
K
 
N
Y
 
P
G
 
G
R
 
K
L
 
A
V
 
I
D
 
A
I
 
E
S
 
I
R
 
K
G
 
K
L
 
M
M
 
M

Sites not aligning to the query:

8gs8B Cryo-em structure of the human respiratory complex ii (see paper)
26% identity, 24% coverage: 7:102/402 of query aligns to 134:236/239 of 8gs8B

query
sites
8gs8B
Q
 
Q
Q
 
Q
F
 
Y
A
 
L
N
 
Q
T
 
S
P
 
I
E
 
E
G
 
E
Q
 
R
E
 
E
A
 
K
E
 
L
S
 
D
I
 
G
L
 
L
R
 
Y
A
 
E
C
|
C
V
 
I
H
 
L
C
|
C
G
 
A
F
 
C
C
|
C
T
 
S
A
 
T
T
 
S
C
|
C
P
|
P
T
 
S
Y
 
Y
Q
 
W
E
x
W
L
 
N
N
 
G
D
 
D
E
 
K
R
x
Y
D
 
L
G
 
G
P
|
P
R
x
A
G
 
V
R
 
L
I
 
M
Y
 
Q
L
 
A
M
 
Y
K
 
R
M
 
W
F
 
M
L
 
I
E
 
D
G
 
S
-
 
R
E
 
D
E
 
D
V
 
F
T
 
T
E
 
E
K
 
E
S
 
R
R
 
L
E
 
A
H
 
K
L
 
L
D
 
Q
-
 
D
-
 
P
-
 
F
-
 
S
-
 
L
-
 
Y
R
 
R
C
|
C
L
x
H
T
|
T
C
x
I
R
x
M
S
x
N
C
|
C
E
 
T
T
 
R
T
 
T
C
|
C
P
 
P
S
 
K
G
 
G
V
 
L
K
 
N
Y
 
P
G
 
G
R
 
K
L
 
A
V
 
I
D
 
A
I
 
E
S
 
I
R
 
K
G
 
K
L
 
M
M
 
M

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_007153414.1 NCBI__GCF_000170835.1:WP_007153414.1
MQTNLVQQFANTPEGQEAESILRACVHCGFCTATCPTYQELNDERDGPRGRIYLMKMFLE
GEEVTEKSREHLDRCLTCRSCETTCPSGVKYGRLVDISRGLMEQEMPRPPKERWIRWSLA
RVLPNRRLFGILLRMGQLFRPVLPSVLSTKVPPRKKASPWPAASHDRIVLALAGCVQPSA
TPNTNAAAARVLYKLGVTMVEAPEAGCCGAVNHHLSEHEQALNAMRRNIDAWWPAIEAGA
EAIIMTASGCGAMVQEYGHLLKDDPMYAAKAQKVSDMTIDLGAFLLKQDLEKLKVPQGAG
KVAFHCPCTLQHAMQQNGVVDQVLRRVGIDLAETKEKHLCCGSAGTYSILQPKLSQRLLN
NKLRALTVDNPDRIVTANIGCQMHLETKAQVPVQHWIELLDA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory