SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_007155382.1 NCBI__GCF_000170835.1:WP_007155382.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5gtlA NADPH complex structure of aldehyde dehydrogenase from bacillus cereus
42% identity, 95% coverage: 24:495/497 of query aligns to 18:488/491 of 5gtlA

query
sites
5gtlA
Q
 
K
M
 
M
T
 
F
I
 
I
N
 
N
G
 
G
K
 
E
F
 
F
V
 
V
K
 
S
G
 
A
Q
 
I
S
 
G
G
 
G
K
 
K
T
 
T
Y
 
F
T
 
E
T
 
T
I
 
Y
N
 
N
P
 
P
S
 
A
T
 
T
D
 
E
Q
 
D
P
 
V
L
 
L
A
 
A
D
 
V
V
 
V
P
 
C
F
 
E
A
 
A
T
 
Q
A
 
E
E
 
E
D
 
D
V
 
I
K
 
D
S
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
K
S
 
A
A
 
A
K
 
R
A
 
S
A
 
A
F
 
F
P
 
E
G
 
S
-
 
G
-
 
P
W
 
W
K
 
A
K
 
E
L
 
M
H
 
T
V
 
T
D
 
A
E
 
E
R
 
R
G
 
A
K
 
H
M
 
L
L
 
I
K
 
Y
A
 
K
L
 
L
S
 
A
R
 
D
A
 
L
V
 
I
R
 
E
E
 
E
R
 
H
A
 
R
E
 
E
M
 
E
F
 
L
G
 
A
M
 
Q
L
 
L
D
 
E
A
 
A
L
 
L
D
 
D
C
 
N
G
 
G
N
 
K
P
 
P
Y
 
Y
Q
 
Q
-
 
V
A
 
A
M
 
L
V
 
D
D
 
D
D
 
D
A
 
I
N
 
S
K
 
A
G
 
T
A
 
V
G
 
E
L
 
N
L
 
Y
E
 
R
H
 
Y
F
 
Y
S
 
A
N
 
G
L
 
W
G
 
T
M
 
T
E
 
K
L
 
I
K
 
I
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
V
 
I
P
 
P
T
 
I
P
 
S
G
 
K
G
 
D
G
 
Y
L
 
L
N
 
N
Y
 
Y
T
 
T
R
 
R
L
 
H
E
 
E
P
 
P
F
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
V
A
 
G
R
 
Q
I
|
I
L
 
I
P
|
P
F
 
W
N
|
N
H
 
F
P
 
P
I
 
L
S
 
V
F
 
M
A
 
S
V
 
S
G
 
W
K
 
K
I
 
M
A
 
G
S
 
A
A
 
A
L
 
L
I
 
A
A
 
T
G
 
G
N
 
C
T
 
T
V
 
I
V
 
V
M
 
L
K
|
K
I
 
P
A
|
A
D
x
E
Q
|
Q
T
 
T
P
 
P
L
 
L
S
 
S
A
 
L
L
 
L
L
 
Y
F
 
A
G
 
A
K
 
K
L
 
L
I
 
F
Q
 
K
E
 
E
H
 
A
-
 
G
L
 
F
P
 
P
P
 
N
G
 
G
V
 
V
V
 
V
N
 
N
V
 
F
I
 
V
T
 
P
G
 
G
D
 
F
G
|
G
A
 
P
T
 
E
T
 
A
G
|
G
A
 
A
S
 
A
L
 
I
V
 
V
S
 
N
H
 
H
P
 
H
D
 
D
I
 
I
H
 
D
R
 
K
I
 
V
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
|
G
S
|
S
V
 
T
A
 
V
T
|
T
G
 
G
N
 
K
L
 
Y
I
 
I
S
 
M
Q
 
R
Q
 
Q
A
 
S
G
 
A
-
 
E
-
 
M
I
 
I
A
 
K
V
 
H
L
 
V
S
 
T
L
 
L
E
|
E
L
|
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
N
 
S
P
 
P
L
 
N
I
 
I
I
 
I
Y
 
L
P
 
E
D
 
D
V
 
A
D
 
D
V
 
L
Q
 
E
K
 
E
V
 
A
A
 
I
D
 
N
A
 
G
A
 
A
V
 
F
A
 
Q
G
 
G
M
 
I
N
 
M
F
 
Y
T
 
-
R
 
-
S
 
N
Q
 
H
G
 
G
Q
 
Q
S
 
N
C
|
C
G
 
S
S
 
A
N
 
G
S
 
S
R
 
R
V
 
V
F
 
F
V
 
V
H
 
H
R
 
R
D
 
K
L
 
H
H
 
Y
D
 
E
E
 
T
F
 
V
V
 
V
S
 
D
E
 
A
V
 
L
V
 
V
K
 
K
R
 
M
V
 
A
E
 
N
K
 
N
I
 
V
K
 
K
V
 
L
G
 
G
H
 
A
A
 
G
D
 
M
A
 
E
D
 
K
D
 
E
T
 
T
E
 
E
M
 
M
G
 
G
P
 
P
V
 
L
V
 
V
T
 
S
R
 
K
Q
 
K
H
 
Q
Y
 
Q
D
 
E
R
 
R
V
 
V
M
 
L
H
 
N
Y
 
Y
I
 
I
D
 
E
S
 
Q
A
 
G
K
 
K
S
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
T
L
 
V
M
 
A
T
 
A
G
 
G
G
 
G
G
 
E
H
 
R
A
 
A
K
 
-
G
 
-
E
 
-
D
 
-
L
 
L
A
 
E
D
 
K
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
I
 
V
E
 
K
P
 
P
T
 
T
V
 
V
F
 
F
D
 
T
E
 
D
V
 
V
T
 
T
H
 
D
D
 
D
M
 
M
T
 
T
I
 
I
A
 
V
R
 
K
E
 
E
E
|
E
I
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
M
 
V
S
 
V
I
 
V
L
 
L
V
 
P
W
 
F
D
 
D
D
 
S
E
 
T
A
 
E
S
 
E
M
 
V
M
 
I
E
 
E
Q
 
R
V
 
A
N
 
N
G
 
N
V
 
S
E
 
S
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
C
 
A
A
 
A
N
 
G
V
 
V
W
 
W
T
 
T
N
 
Q
D
 
N
I
 
I
S
 
K
T
 
T
A
 
G
L
 
H
R
 
Q
V
 
V
G
 
A
D
 
N
D
 
K
I
 
L
E
 
K
A
 
A
G
 
G
Y
 
T
V
 
V
W
 
W
I
 
I
N
 
N
G
 
D
H
 
Y
G
 
N
G
 
L
K
 
E
R
 
N
F
 
-
K
 
A
G
 
A
A
 
A
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
Y
K
 
K
N
 
Q
S
 
S
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
E
|
E
H
 
L
D
 
G
T
 
S
S
 
Y
E
 
A
I
 
L
R
 
D
S
 
N
F
 
Y
T
 
T
Q
 
E
E
 
V
K
 
K
N
 
S
I
 
V
N
 
W
V
 
V

5gtkA NAD+ complex structure of aldehyde dehydrogenase from bacillus cereus
42% identity, 95% coverage: 24:495/497 of query aligns to 18:488/491 of 5gtkA

query
sites
5gtkA
Q
 
K
M
 
M
T
 
F
I
 
I
N
 
N
G
 
G
K
 
E
F
 
F
V
 
V
K
 
S
G
 
A
Q
 
I
S
 
G
G
 
G
K
 
K
T
 
T
Y
 
F
T
 
E
T
 
T
I
 
Y
N
 
N
P
 
P
S
 
A
T
 
T
D
 
E
Q
 
D
P
 
V
L
 
L
A
 
A
D
 
V
V
 
V
P
 
C
F
 
E
A
 
A
T
 
Q
A
 
E
E
 
E
D
 
D
V
 
I
K
 
D
S
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
K
S
 
A
A
 
A
K
 
R
A
 
S
A
 
A
F
 
F
P
 
E
G
 
S
-
 
G
-
 
P
W
 
W
K
 
A
K
 
E
L
 
M
H
 
T
V
 
T
D
 
A
E
 
E
R
 
R
G
 
A
K
 
H
M
 
L
L
 
I
K
 
Y
A
 
K
L
 
L
S
 
A
R
 
D
A
 
L
V
 
I
R
 
E
E
 
E
R
 
H
A
 
R
E
 
E
M
 
E
F
 
L
G
 
A
M
 
Q
L
 
L
D
 
E
A
 
A
L
 
L
D
 
D
C
 
N
G
 
G
N
 
K
P
 
P
Y
 
Y
Q
 
Q
-
 
V
A
 
A
M
 
L
V
 
D
D
 
D
D
 
D
A
 
I
N
 
S
K
 
A
G
 
T
A
 
V
G
 
E
L
 
N
L
 
Y
E
 
R
H
 
Y
F
 
Y
S
 
A
N
 
G
L
 
W
G
 
T
M
 
T
E
 
K
L
 
I
K
 
I
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
V
 
I
P
 
P
T
 
I
P
 
S
G
 
K
G
 
D
G
 
Y
L
 
L
N
 
N
Y
 
Y
T
 
T
R
 
R
L
 
H
E
 
E
P
 
P
F
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
V
A
 
G
R
 
Q
I
|
I
L
x
I
P
|
P
F
x
W
N
|
N
H
 
F
P
 
P
I
 
L
S
 
V
F
 
M
A
 
S
V
 
S
G
 
W
K
 
K
I
 
M
A
 
G
S
 
A
A
 
A
L
 
L
I
 
A
A
 
T
G
 
G
N
 
C
T
 
T
V
 
I
V
 
V
M
 
L
K
|
K
I
 
P
A
 
A
D
x
E
Q
 
Q
T
 
T
P
 
P
L
 
L
S
 
S
A
 
L
L
 
L
L
 
Y
F
 
A
G
 
A
K
 
K
L
 
L
I
 
F
Q
 
K
E
 
E
H
 
A
-
 
G
L
 
F
P
 
P
P
 
N
G
 
G
V
 
V
V
 
V
N
 
N
V
 
F
I
 
V
T
 
P
G
 
G
D
 
F
G
|
G
A
 
P
T
 
E
T
 
A
G
|
G
A
|
A
S
 
A
L
 
I
V
 
V
S
 
N
H
 
H
P
 
H
D
 
D
I
 
I
H
 
D
R
 
K
I
 
V
A
 
A
F
|
F
T
 
T
G
|
G
S
|
S
V
 
T
A
 
V
T
|
T
G
 
G
N
 
K
L
x
Y
I
 
I
S
 
M
Q
 
R
Q
 
Q
A
 
S
G
 
A
-
 
E
-
 
M
I
 
I
A
 
K
V
 
H
L
 
V
S
 
T
L
 
L
E
|
E
L
|
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
N
 
S
P
 
P
L
 
N
I
 
I
I
 
I
Y
 
L
P
 
E
D
 
D
V
 
A
D
 
D
V
 
L
Q
 
E
K
 
E
V
 
A
A
 
I
D
 
N
A
 
G
A
 
A
V
 
F
A
 
Q
G
 
G
M
 
I
N
 
M
F
 
Y
T
 
-
R
 
-
S
 
N
Q
 
H
G
 
G
Q
 
Q
S
 
N
C
|
C
G
 
S
S
 
A
N
 
G
S
 
S
R
 
R
V
 
V
F
 
F
V
 
V
H
 
H
R
 
R
D
 
K
L
 
H
H
 
Y
D
 
E
E
 
T
F
 
V
V
 
V
S
 
D
E
 
A
V
 
L
V
 
V
K
 
K
R
 
M
V
 
A
E
 
N
K
 
N
I
 
V
K
 
K
V
 
L
G
 
G
H
 
A
A
 
G
D
 
M
A
 
E
D
 
K
D
 
E
T
 
T
E
 
E
M
 
M
G
 
G
P
 
P
V
 
L
V
 
V
T
 
S
R
 
K
Q
 
K
H
x
Q
Y
 
Q
D
 
E
R
|
R
V
 
V
M
 
L
H
 
N
Y
 
Y
I
 
I
D
 
E
S
 
Q
A
 
G
K
 
K
S
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
T
L
 
V
M
 
A
T
 
A
G
 
G
G
 
G
G
 
E
H
 
R
A
 
A
K
 
-
G
 
-
E
 
-
D
 
-
L
 
L
A
 
E
D
 
K
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
I
 
V
E
 
K
P
 
P
T
 
T
V
 
V
F
 
F
D
 
T
E
 
D
V
 
V
T
 
T
H
 
D
D
 
D
M
 
M
T
 
T
I
 
I
A
 
V
R
 
K
E
 
E
E
|
E
I
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
M
 
V
S
 
V
I
 
V
L
 
L
V
 
P
W
 
F
D
 
D
D
 
S
E
 
T
A
 
E
S
 
E
M
 
V
M
 
I
E
 
E
Q
 
R
V
 
A
N
 
N
G
 
N
V
 
S
E
 
S
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
C
 
A
A
 
A
N
 
G
V
 
V
W
 
W
T
 
T
N
 
Q
D
 
N
I
 
I
S
 
K
T
 
T
A
 
G
L
 
H
R
 
Q
V
 
V
G
 
A
D
 
N
D
 
K
I
 
L
E
 
K
A
 
A
G
 
G
Y
 
T
V
 
V
W
 
W
I
 
I
N
 
N
G
 
D
H
 
Y
G
 
N
G
 
L
K
 
E
R
 
N
F
 
-
K
 
A
G
 
A
A
 
A
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
Y
K
 
K
N
 
Q
S
 
S
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
E
|
E
H
 
L
D
 
G
T
 
S
S
 
Y
E
 
A
I
 
L
R
 
D
S
 
N
F
 
Y
T
 
T
Q
 
E
E
 
V
K
 
K
N
 
S
I
 
V
N
 
W
V
 
V

8skfA Crystal structure of betaine aldehyde dehydrogenase (betb) from klebsiella aerogenes (lattice translocation disorder)
44% identity, 95% coverage: 24:495/497 of query aligns to 15:488/497 of 8skfA

query
sites
8skfA
Q
 
Q
M
 
L
T
 
Y
I
 
I
N
 
H
G
 
G
K
 
K
F
 
F
V
 
V
K
 
A
G
 
A
Q
 
T
S
 
S
G
 
G
K
 
K
T
 
T
Y
 
F
T
 
E
T
|
T
I
|
I
N
 
N
P
 
P
S
 
A
T
 
T
D
 
G
Q
 
E
P
 
V
L
 
L
A
 
A
D
 
T
V
 
V
P
 
Q
F
 
A
A
 
A
T
 
G
A
 
R
E
 
E
D
 
D
V
 
V
K
 
D
S
 
R
A
 
A
V
 
V
A
 
K
S
 
S
A
 
A
K
 
Q
A
 
Q
A
 
G
F
 
Q
P
 
K
G
 
V
W
 
W
K
 
A
K
 
A
L
 
M
H
 
S
V
 
A
D
 
M
E
 
A
R
 
R
G
 
S
K
 
R
M
 
I
L
 
L
K
 
R
A
 
K
L
 
A
S
 
V
R
 
D
A
 
I
V
 
L
R
 
R
E
 
E
R
 
R
A
 
N
E
 
D
M
 
E
F
 
L
G
 
A
M
 
R
L
 
L
D
 
E
A
 
T
L
 
L
D
|
D
C
 
T
G
 
G
N
 
K
P
 
P
Y
 
L
-
 
S
Q
 
E
A
 
T
M
 
A
V
 
A
D
 
V
D
 
D
A
 
I
N
 
V
K
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
D
L
 
V
L
 
L
E
 
E
H
 
Y
F
 
Y
S
 
A
N
 
G
L
 
L
G
 
I
M
 
P
E
 
A
L
 
L
K
 
E
G
 
G
Q
 
S
T
 
Q
V
 
I
P
 
P
T
 
L
P
 
R
G
 
D
G
 
S
G
 
S
L
 
F
N
 
V
Y
 
Y
T
 
T
R
 
R
L
 
R
E
 
E
P
 
P
F
 
L
G
 
G
V
 
V
V
 
V
A
 
A
R
 
G
I
|
I
L
x
G
P
x
A
F
x
W
N
 
N
H
 
Y
P
 
P
I
 
I
S
 
Q
F
 
I
A
 
A
V
 
L
G
 
W
K
 
K
I
 
S
A
 
A
S
 
P
A
 
A
L
 
L
I
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
N
T
 
A
V
 
M
V
 
I
M
 
F
K
|
K
I
 
P
A
 
S
D
x
E
Q
x
V
T
 
T
P
 
P
L
 
L
S
 
T
A
 
A
L
 
L
L
 
K
F
 
L
G
 
A
K
 
E
L
 
I
I
 
Y
Q
 
R
E
 
E
H
 
A
-
 
G
L
 
L
P
 
P
P
 
D
G
 
G
V
 
V
V
 
F
N
 
N
V
 
V
I
 
L
T
 
P
G
 
G
D
 
I
G
|
G
A
 
A
T
 
E
T
 
T
G
|
G
A
 
Q
S
 
Y
L
 
L
V
 
T
S
 
E
H
 
H
P
 
P
D
 
D
I
 
I
H
 
A
R
 
K
I
 
I
A
 
S
F
 
F
T
|
T
G
|
G
S
x
G
V
 
V
A
 
A
T
x
S
G
 
G
N
 
K
L
x
K
I
 
V
-
 
M
-
 
A
-
 
N
S
 
S
Q
 
A
Q
 
A
A
 
S
G
 
S
I
 
L
A
 
K
V
 
E
L
 
V
S
 
T
L
 
M
E
|
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
N
 
S
P
 
P
L
 
L
I
 
I
I
 
I
Y
 
A
P
 
E
D
 
D
V
 
A
D
 
N
V
 
L
Q
 
D
K
 
L
V
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
I
A
 
A
V
 
M
A
 
M
G
 
A
M
 
-
N
 
N
F
 
F
T
 
Y
R
 
-
S
 
S
Q
 
S
G
 
G
Q
 
Q
S
 
V
C
|
C
G
 
T
S
 
N
N
 
G
S
 
T
R
 
R
V
 
V
F
 
F
V
 
V
H
 
P
R
 
A
D
 
K
L
 
F
H
 
K
D
 
A
E
 
E
F
 
F
V
 
E
S
 
H
E
 
K
V
 
I
V
 
L
K
 
E
R
 
R
V
 
V
E
 
G
K
 
R
I
 
I
K
 
R
V
 
A
G
 
G
H
 
D
A
 
L
D
 
F
A
 
A
D
 
D
D
 
D
T
 
T
E
 
N
M
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
L
V
 
V
T
 
S
R
 
F
Q
 
P
H
 
H
Y
 
R
D
 
Q
R
 
N
V
 
V
M
 
L
H
 
R
Y
 
Y
I
 
I
D
 
E
S
 
S
A
 
G
K
 
K
S
 
S
E
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
R
L
 
L
M
 
L
T
 
C
G
 
G
G
 
G
G
 
D
H
 
V
A
 
L
K
 
K
G
 
G
E
 
E
D
 
G
L
 
F
A
 
D
D
 
N
G
 
G
Y
 
A
F
 
W
I
 
V
E
 
A
P
 
P
T
 
T
V
 
V
F
 
F
D
 
T
E
 
D
V
 
C
T
 
T
H
 
D
D
 
D
M
 
M
T
 
T
I
 
I
A
 
V
R
 
R
E
 
E
E
 
E
I
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
M
 
M
S
 
S
I
 
I
L
 
L
V
 
S
W
 
Y
D
 
D
D
 
D
E
 
E
A
 
A
S
 
E
M
 
V
M
 
I
E
 
R
Q
 
R
V
 
A
N
 
N
G
 
A
V
 
T
E
 
E
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
C
 
A
A
 
A
N
 
G
V
 
V
W
 
V
T
 
T
N
 
P
D
 
D
I
 
L
S
 
N
T
 
R
A
 
A
L
 
H
R
 
R
V
 
I
G
 
I
D
 
H
D
 
Q
I
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
Y
 
I
V
 
C
W
 
W
I
 
I
N
 
N
G
 
S
H
 
W
G
 
G
G
 
E
K
 
S
R
 
P
F
 
A
K
 
E
G
 
-
A
 
M
P
 
P
F
 
V
G
 
G
G
 
G
V
 
Y
K
 
K
N
 
H
S
 
S
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
E
 
E
H
 
N
D
 
G
T
 
V
S
 
M
E
 
T
I
 
L
R
 
Q
S
 
S
F
 
Y
T
 
T
Q
 
Q
E
 
V
K
 
K
N
 
S
I
 
I
N
 
Q
V
 
V

8vr1A Crystal structure of betaine aldehyde dehydrogenase (betb) from klebsiella aerogenes (ctp bound)
44% identity, 95% coverage: 24:495/497 of query aligns to 6:479/488 of 8vr1A

query
sites
8vr1A
Q
 
Q
M
 
L
T
 
Y
I
 
I
N
 
H
G
 
G
K
 
K
F
 
F
V
 
V
K
 
A
G
 
A
Q
 
T
S
 
S
G
 
G
K
 
K
T
 
T
Y
 
F
T
 
E
T
 
T
I
 
I
N
 
N
P
 
P
S
 
A
T
 
T
D
 
G
Q
 
E
P
 
V
L
 
L
A
 
A
D
 
T
V
 
V
P
 
Q
F
 
A
A
 
A
T
 
G
A
 
R
E
 
E
D
 
D
V
 
V
K
 
D
S
 
R
A
 
A
V
 
V
A
 
K
S
 
S
A
 
A
K
 
Q
A
 
Q
A
 
G
F
 
Q
P
 
K
G
 
V
W
 
W
K
 
A
K
 
A
L
 
M
H
 
S
V
 
A
D
 
M
E
 
A
R
 
R
G
 
S
K
 
R
M
 
I
L
 
L
K
 
R
A
 
K
L
 
A
S
 
V
R
 
D
A
 
I
V
 
L
R
 
R
E
 
E
R
 
R
A
 
N
E
 
D
M
 
E
F
 
L
G
 
A
M
 
R
L
 
L
D
 
E
A
 
T
L
 
L
D
 
D
C
 
T
G
 
G
N
 
K
P
 
P
Y
 
L
-
 
S
Q
 
E
A
 
T
M
 
A
V
 
A
D
 
V
D
 
D
A
 
I
N
 
V
K
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
D
L
 
V
L
 
L
E
 
E
H
 
Y
F
 
Y
S
 
A
N
 
G
L
 
L
G
 
I
M
 
P
E
 
A
L
 
L
K
 
E
G
 
G
Q
 
S
T
 
Q
V
 
I
P
 
P
T
 
L
P
 
R
G
 
D
G
 
S
G
 
S
L
 
F
N
 
V
Y
 
Y
T
 
T
R
 
R
L
 
R
E
 
E
P
 
P
F
 
L
G
 
G
V
 
V
V
 
V
A
 
A
R
 
G
I
 
I
L
 
G
P
 
A
F
x
W
N
 
N
H
 
Y
P
 
P
I
 
I
S
 
Q
F
 
I
A
 
A
V
 
L
G
 
W
K
 
K
I
 
S
A
 
A
S
 
P
A
 
A
L
 
L
I
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
N
T
 
A
V
 
M
V
 
I
M
 
F
K
 
K
I
 
P
A
 
S
D
 
E
Q
 
V
T
 
T
P
 
P
L
 
L
S
 
T
A
 
A
L
 
L
L
 
K
F
 
L
G
 
A
K
 
E
L
 
I
I
 
Y
Q
 
R
E
 
E
H
 
A
-
 
G
L
 
L
P
 
P
P
 
D
G
 
G
V
 
V
V
 
F
N
 
N
V
 
V
I
 
L
T
 
P
G
 
G
D
 
I
G
 
G
A
 
A
T
 
E
T
 
T
G
 
G
A
 
Q
S
 
Y
L
 
L
V
 
T
S
 
E
H
 
H
P
 
P
D
 
D
I
 
I
H
 
A
R
 
K
I
 
I
A
 
S
F
 
F
T
 
T
G
|
G
S
x
G
V
 
V
A
|
A
T
x
S
G
 
G
N
 
K
L
 
K
I
 
V
-
 
M
-
 
A
-
 
N
S
 
S
Q
 
A
Q
 
A
A
 
S
G
 
S
I
 
L
A
 
K
V
 
E
L
 
V
S
 
T
L
 
M
E
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
N
 
S
P
 
P
L
 
L
I
 
I
I
 
I
Y
 
A
P
 
E
D
 
D
V
 
A
D
 
N
V
 
L
Q
 
D
K
 
L
V
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
I
A
 
A
V
 
M
A
 
M
G
 
A
M
 
-
N
 
N
F
 
F
T
 
Y
R
 
-
S
 
S
Q
 
S
G
 
G
Q
 
Q
S
 
V
C
 
C
G
 
T
S
 
N
N
 
G
S
 
T
R
 
R
V
 
V
F
 
F
V
 
V
H
 
P
R
 
A
D
 
K
L
 
F
H
 
K
D
 
A
E
 
E
F
 
F
V
 
E
S
 
H
E
 
K
V
 
I
V
 
L
K
 
E
R
 
R
V
 
V
E
 
G
K
 
R
I
 
I
K
 
R
V
 
A
G
 
G
H
 
D
A
 
L
D
 
F
A
 
A
D
 
D
D
 
D
T
 
T
E
 
N
M
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
L
V
 
V
T
 
S
R
 
F
Q
 
P
H
 
H
Y
 
R
D
 
Q
R
 
N
V
 
V
M
 
L
H
 
R
Y
 
Y
I
 
I
D
 
E
S
 
S
A
 
G
K
 
K
S
 
S
E
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
R
L
 
L
M
 
L
T
 
C
G
 
G
G
 
G
G
 
D
H
 
V
A
 
L
K
 
K
G
 
G
E
 
E
D
 
G
L
 
F
A
 
D
D
 
N
G
 
G
Y
 
A
F
 
W
I
 
V
E
 
A
P
 
P
T
 
T
V
 
V
F
 
F
D
 
T
E
 
D
V
 
C
T
 
T
H
 
D
D
 
D
M
 
M
T
 
T
I
 
I
A
 
V
R
 
R
E
 
E
E
|
E
I
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
M
 
M
S
 
S
I
 
I
L
 
L
V
 
S
W
 
Y
D
 
D
D
 
D
E
 
E
A
 
A
S
 
E
M
 
V
M
 
I
E
 
R
Q
 
R
V
 
A
N
 
N
G
 
A
V
 
T
E
 
E
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
C
 
A
A
 
A
N
 
G
V
 
V
W
 
V
T
 
T
N
 
P
D
 
D
I
 
L
S
 
N
T
 
R
A
 
A
L
 
H
R
 
R
V
 
I
G
 
I
D
 
H
D
 
Q
I
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
Y
 
I
V
 
C
W
 
W
I
 
I
N
 
N
G
 
S
H
 
W
G
 
G
G
 
E
K
 
S
R
 
P
F
 
A
K
 
E
G
 
-
A
 
M
P
 
P
F
 
V
G
 
G
G
 
G
V
 
Y
K
 
K
N
 
H
S
 
S
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
E
 
E
H
 
N
D
 
G
T
 
V
S
 
M
E
 
T
I
 
L
R
 
Q
S
 
S
F
 
Y
T
 
T
Q
 
Q
E
 
V
K
 
K
N
 
S
I
 
I
N
 
Q
V
 
V

8vr0A Crystal structure of betaine aldehyde dehydrogenase (betb) from klebsiella aerogenes (gmp bound)
44% identity, 95% coverage: 24:495/497 of query aligns to 6:479/488 of 8vr0A

query
sites
8vr0A
Q
 
Q
M
 
L
T
 
Y
I
 
I
N
 
H
G
 
G
K
 
K
F
 
F
V
 
V
K
 
A
G
 
A
Q
 
T
S
 
S
G
 
G
K
 
K
T
 
T
Y
 
F
T
 
E
T
 
T
I
 
I
N
 
N
P
 
P
S
 
A
T
 
T
D
 
G
Q
 
E
P
 
V
L
 
L
A
 
A
D
 
T
V
 
V
P
 
Q
F
 
A
A
 
A
T
 
G
A
 
R
E
 
E
D
 
D
V
 
V
K
 
D
S
 
R
A
 
A
V
 
V
A
 
K
S
 
S
A
 
A
K
 
Q
A
 
Q
A
 
G
F
 
Q
P
 
K
G
 
V
W
 
W
K
 
A
K
 
A
L
 
M
H
 
S
V
 
A
D
 
M
E
 
A
R
 
R
G
 
S
K
 
R
M
 
I
L
 
L
K
 
R
A
 
K
L
 
A
S
 
V
R
 
D
A
 
I
V
 
L
R
 
R
E
 
E
R
 
R
A
 
N
E
 
D
M
 
E
F
 
L
G
 
A
M
 
R
L
 
L
D
 
E
A
 
T
L
 
L
D
 
D
C
 
T
G
 
G
N
 
K
P
 
P
Y
 
L
-
 
S
Q
 
E
A
 
T
M
 
A
V
 
A
D
 
V
D
 
D
A
 
I
N
 
V
K
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
D
L
 
V
L
 
L
E
 
E
H
 
Y
F
 
Y
S
 
A
N
 
G
L
 
L
G
 
I
M
 
P
E
 
A
L
 
L
K
 
E
G
 
G
Q
 
S
T
 
Q
V
 
I
P
 
P
T
 
L
P
 
R
G
 
D
G
 
S
G
 
S
L
 
F
N
 
V
Y
 
Y
T
 
T
R
 
R
L
 
R
E
 
E
P
 
P
F
 
L
G
 
G
V
 
V
V
 
V
A
 
A
R
 
G
I
 
I
L
 
G
P
 
A
F
x
W
N
 
N
H
 
Y
P
 
P
I
 
I
S
 
Q
F
 
I
A
 
A
V
 
L
G
 
W
K
 
K
I
 
S
A
 
A
S
 
P
A
 
A
L
 
L
I
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
N
T
 
A
V
 
M
V
 
I
M
 
F
K
 
K
I
 
P
A
 
S
D
 
E
Q
 
V
T
 
T
P
 
P
L
 
L
S
 
T
A
 
A
L
 
L
L
 
K
F
 
L
G
 
A
K
 
E
L
 
I
I
 
Y
Q
 
R
E
 
E
H
 
A
-
 
G
L
 
L
P
 
P
P
 
D
G
 
G
V
 
V
V
 
F
N
 
N
V
 
V
I
 
L
T
 
P
G
 
G
D
 
I
G
 
G
A
 
A
T
 
E
T
 
T
G
 
G
A
 
Q
S
 
Y
L
 
L
V
 
T
S
 
E
H
 
H
P
 
P
D
 
D
I
 
I
H
 
A
R
 
K
I
 
I
A
 
S
F
 
F
T
 
T
G
|
G
S
x
G
V
 
V
A
 
A
T
 
S
G
 
G
N
 
K
L
 
K
I
 
V
-
 
M
-
 
A
-
 
N
S
 
S
Q
 
A
Q
 
A
A
 
S
G
 
S
I
 
L
A
 
K
V
 
E
L
 
V
S
 
T
L
 
M
E
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
N
 
S
P
 
P
L
 
L
I
 
I
I
 
I
Y
 
A
P
 
E
D
 
D
V
 
A
D
 
N
V
 
L
Q
 
D
K
 
L
V
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
I
A
 
A
V
 
M
A
 
M
G
 
A
M
 
-
N
 
N
F
 
F
T
 
Y
R
 
-
S
 
S
Q
 
S
G
 
G
Q
 
Q
S
 
V
C
 
C
G
 
T
S
 
N
N
 
G
S
 
T
R
 
R
V
 
V
F
 
F
V
 
V
H
 
P
R
 
A
D
 
K
L
 
F
H
 
K
D
 
A
E
 
E
F
 
F
V
 
E
S
 
H
E
 
K
V
 
I
V
 
L
K
 
E
R
 
R
V
 
V
E
 
G
K
 
R
I
 
I
K
 
R
V
 
A
G
 
G
H
 
D
A
 
L
D
 
F
A
 
A
D
 
D
D
 
D
T
 
T
E
 
N
M
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
L
V
 
V
T
 
S
R
 
F
Q
 
P
H
|
H
Y
 
R
D
 
Q
R
 
N
V
 
V
M
 
L
H
 
R
Y
 
Y
I
 
I
D
 
E
S
 
S
A
 
G
K
 
K
S
 
S
E
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
R
L
 
L
M
 
L
T
 
C
G
 
G
G
 
G
G
 
D
H
 
V
A
 
L
K
 
K
G
 
G
E
 
E
D
 
G
L
 
F
A
 
D
D
 
N
G
 
G
Y
 
A
F
 
W
I
 
V
E
 
A
P
 
P
T
 
T
V
 
V
F
 
F
D
 
T
E
 
D
V
 
C
T
 
T
H
 
D
D
 
D
M
 
M
T
 
T
I
 
I
A
 
V
R
 
R
E
 
E
E
|
E
I
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
M
 
M
S
 
S
I
 
I
L
 
L
V
 
S
W
 
Y
D
 
D
D
 
D
E
 
E
A
 
A
S
 
E
M
 
V
M
 
I
E
 
R
Q
 
R
V
 
A
N
 
N
G
 
A
V
 
T
E
 
E
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
C
 
A
A
 
A
N
 
G
V
 
V
W
 
V
T
 
T
N
 
P
D
 
D
I
 
L
S
 
N
T
 
R
A
 
A
L
 
H
R
 
R
V
 
I
G
 
I
D
 
H
D
 
Q
I
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
Y
 
I
V
 
C
W
 
W
I
 
I
N
 
N
G
 
S
H
 
W
G
 
G
G
 
E
K
 
S
R
 
P
F
 
A
K
 
E
G
 
-
A
 
M
P
 
P
F
 
V
G
 
G
G
 
G
V
 
Y
K
 
K
N
 
H
S
 
S
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
E
 
E
H
 
N
D
 
G
T
 
V
S
 
M
E
 
T
I
 
L
R
 
Q
S
 
S
F
 
Y
T
 
T
Q
 
Q
E
 
V
K
 
K
N
 
S
I
 
I
N
 
Q
V
 
V

8vqzA Crystal structure of betaine aldehyde dehydrogenase (betb) from klebsiella aerogenes (cmp bound)
44% identity, 95% coverage: 24:495/497 of query aligns to 6:479/488 of 8vqzA

query
sites
8vqzA
Q
 
Q
M
 
L
T
 
Y
I
 
I
N
 
H
G
 
G
K
 
K
F
 
F
V
 
V
K
 
A
G
 
A
Q
 
T
S
 
S
G
 
G
K
 
K
T
 
T
Y
 
F
T
 
E
T
 
T
I
 
I
N
 
N
P
 
P
S
 
A
T
 
T
D
 
G
Q
 
E
P
 
V
L
 
L
A
 
A
D
 
T
V
 
V
P
 
Q
F
 
A
A
 
A
T
 
G
A
 
R
E
 
E
D
 
D
V
 
V
K
 
D
S
 
R
A
 
A
V
 
V
A
 
K
S
 
S
A
 
A
K
 
Q
A
 
Q
A
 
G
F
 
Q
P
 
K
G
 
V
W
 
W
K
 
A
K
 
A
L
 
M
H
 
S
V
 
A
D
 
M
E
 
A
R
 
R
G
 
S
K
 
R
M
 
I
L
 
L
K
 
R
A
 
K
L
 
A
S
 
V
R
 
D
A
 
I
V
 
L
R
 
R
E
 
E
R
 
R
A
 
N
E
 
D
M
 
E
F
 
L
G
 
A
M
 
R
L
 
L
D
 
E
A
 
T
L
 
L
D
 
D
C
 
T
G
 
G
N
 
K
P
 
P
Y
 
L
-
 
S
Q
 
E
A
 
T
M
 
A
V
 
A
D
 
V
D
 
D
A
 
I
N
 
V
K
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
D
L
 
V
L
 
L
E
 
E
H
 
Y
F
 
Y
S
 
A
N
 
G
L
 
L
G
 
I
M
 
P
E
 
A
L
 
L
K
 
E
G
 
G
Q
 
S
T
 
Q
V
 
I
P
 
P
T
 
L
P
 
R
G
 
D
G
 
S
G
 
S
L
 
F
N
 
V
Y
 
Y
T
 
T
R
 
R
L
 
R
E
 
E
P
 
P
F
 
L
G
 
G
V
 
V
V
 
V
A
 
A
R
 
G
I
 
I
L
 
G
P
 
A
F
x
W
N
 
N
H
 
Y
P
 
P
I
 
I
S
 
Q
F
 
I
A
 
A
V
 
L
G
 
W
K
 
K
I
 
S
A
 
A
S
 
P
A
 
A
L
 
L
I
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
N
T
 
A
V
 
M
V
 
I
M
 
F
K
 
K
I
 
P
A
 
S
D
 
E
Q
 
V
T
 
T
P
 
P
L
 
L
S
 
T
A
 
A
L
 
L
L
 
K
F
 
L
G
 
A
K
 
E
L
 
I
I
 
Y
Q
 
R
E
 
E
H
 
A
-
 
G
L
 
L
P
 
P
P
 
D
G
 
G
V
 
V
V
 
F
N
 
N
V
 
V
I
 
L
T
 
P
G
 
G
D
 
I
G
 
G
A
 
A
T
 
E
T
 
T
G
 
G
A
 
Q
S
 
Y
L
 
L
V
 
T
S
 
E
H
 
H
P
 
P
D
 
D
I
 
I
H
 
A
R
 
K
I
 
I
A
 
S
F
 
F
T
 
T
G
|
G
S
x
G
V
 
V
A
 
A
T
 
S
G
 
G
N
 
K
L
 
K
I
 
V
-
 
M
-
 
A
-
 
N
S
 
S
Q
 
A
Q
 
A
A
 
S
G
 
S
I
 
L
A
 
K
V
 
E
L
 
V
S
 
T
L
 
M
E
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
N
 
S
P
 
P
L
 
L
I
 
I
I
 
I
Y
 
A
P
 
E
D
 
D
V
 
A
D
 
N
V
 
L
Q
 
D
K
 
L
V
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
I
A
 
A
V
 
M
A
 
M
G
 
A
M
 
-
N
 
N
F
 
F
T
 
Y
R
 
-
S
 
S
Q
 
S
G
 
G
Q
 
Q
S
 
V
C
 
C
G
 
T
S
 
N
N
 
G
S
 
T
R
 
R
V
 
V
F
 
F
V
 
V
H
 
P
R
 
A
D
 
K
L
 
F
H
 
K
D
 
A
E
 
E
F
 
F
V
 
E
S
 
H
E
 
K
V
 
I
V
 
L
K
 
E
R
 
R
V
 
V
E
 
G
K
 
R
I
 
I
K
 
R
V
 
A
G
 
G
H
 
D
A
 
L
D
 
F
A
 
A
D
 
D
D
 
D
T
 
T
E
 
N
M
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
L
V
 
V
T
 
S
R
 
F
Q
 
P
H
|
H
Y
 
R
D
 
Q
R
x
N
V
 
V
M
 
L
H
 
R
Y
 
Y
I
 
I
D
 
E
S
 
S
A
 
G
K
 
K
S
 
S
E
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
R
L
 
L
M
 
L
T
 
C
G
 
G
G
 
G
G
 
D
H
 
V
A
 
L
K
 
K
G
 
G
E
 
E
D
 
G
L
 
F
A
 
D
D
 
N
G
 
G
Y
 
A
F
 
W
I
 
V
E
 
A
P
 
P
T
 
T
V
 
V
F
 
F
D
 
T
E
 
D
V
 
C
T
 
T
H
 
D
D
 
D
M
 
M
T
 
T
I
 
I
A
 
V
R
 
R
E
 
E
E
|
E
I
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
M
 
M
S
 
S
I
 
I
L
 
L
V
 
S
W
 
Y
D
 
D
D
 
D
E
 
E
A
 
A
S
 
E
M
 
V
M
 
I
E
 
R
Q
 
R
V
 
A
N
 
N
G
 
A
V
 
T
E
 
E
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
C
 
A
A
 
A
N
 
G
V
 
V
W
 
V
T
 
T
N
 
P
D
 
D
I
 
L
S
 
N
T
 
R
A
 
A
L
 
H
R
 
R
V
 
I
G
 
I
D
 
H
D
 
Q
I
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
Y
 
I
V
 
C
W
 
W
I
 
I
N
 
N
G
 
S
H
 
W
G
 
G
G
 
E
K
 
S
R
 
P
F
 
A
K
 
E
G
 
-
A
 
M
P
 
P
F
 
V
G
 
G
G
 
G
V
 
Y
K
 
K
N
 
H
S
 
S
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
E
 
E
H
 
N
D
 
G
T
 
V
S
 
M
E
 
T
I
 
L
R
 
Q
S
 
S
F
 
Y
T
 
T
Q
 
Q
E
 
V
K
 
K
N
 
S
I
 
I
N
 
Q
V
 
V

8vqwC Crystal structure of betaine aldehyde dehydrogenase (betb) from klebsiella aerogenes (coa bound)
44% identity, 95% coverage: 24:495/497 of query aligns to 6:479/488 of 8vqwC

query
sites
8vqwC
Q
 
Q
M
 
L
T
 
Y
I
 
I
N
 
H
G
 
G
K
 
K
F
 
F
V
 
V
K
 
A
G
 
A
Q
 
T
S
 
S
G
 
G
K
 
K
T
 
T
Y
 
F
T
 
E
T
 
T
I
 
I
N
 
N
P
 
P
S
 
A
T
 
T
D
 
G
Q
 
E
P
 
V
L
 
L
A
 
A
D
 
T
V
 
V
P
 
Q
F
 
A
A
 
A
T
 
G
A
 
R
E
 
E
D
 
D
V
 
V
K
 
D
S
 
R
A
 
A
V
 
V
A
 
K
S
 
S
A
 
A
K
 
Q
A
 
Q
A
 
G
F
 
Q
P
 
K
G
 
V
W
 
W
K
 
A
K
 
A
L
 
M
H
 
S
V
 
A
D
 
M
E
 
A
R
 
R
G
 
S
K
 
R
M
 
I
L
 
L
K
 
R
A
 
K
L
 
A
S
 
V
R
 
D
A
 
I
V
 
L
R
 
R
E
 
E
R
 
R
A
 
N
E
 
D
M
 
E
F
 
L
G
 
A
M
 
R
L
 
L
D
 
E
A
 
T
L
 
L
D
 
D
C
 
T
G
 
G
N
 
K
P
 
P
Y
 
L
-
 
S
Q
 
E
A
 
T
M
 
A
V
 
A
D
 
V
D
 
D
A
 
I
N
 
V
K
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
D
L
 
V
L
 
L
E
 
E
H
 
Y
F
 
Y
S
 
A
N
 
G
L
 
L
G
 
I
M
 
P
E
 
A
L
 
L
K
 
E
G
 
G
Q
 
S
T
 
Q
V
 
I
P
 
P
T
 
L
P
 
R
G
 
D
G
 
S
G
 
S
L
 
F
N
 
V
Y
 
Y
T
 
T
R
 
R
L
 
R
E
 
E
P
 
P
F
 
L
G
 
G
V
 
V
V
 
V
A
 
A
R
 
G
I
|
I
L
 
G
P
 
A
F
x
W
N
 
N
H
 
Y
P
 
P
I
 
I
S
 
Q
F
 
I
A
 
A
V
 
L
G
 
W
K
 
K
I
 
S
A
 
A
S
 
P
A
 
A
L
 
L
I
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
N
T
 
A
V
 
M
V
 
I
M
 
F
K
|
K
I
 
P
A
x
S
D
x
E
Q
 
V
T
 
T
P
 
P
L
 
L
S
 
T
A
 
A
L
 
L
L
 
K
F
 
L
G
 
A
K
 
E
L
 
I
I
 
Y
Q
 
R
E
 
E
H
 
A
-
 
G
L
 
L
P
 
P
P
 
D
G
 
G
V
 
V
V
 
F
N
 
N
V
 
V
I
 
L
T
 
P
G
 
G
D
 
I
G
|
G
A
 
A
T
 
E
T
 
T
G
|
G
A
 
Q
S
 
Y
L
 
L
V
 
T
S
 
E
H
 
H
P
 
P
D
 
D
I
 
I
H
 
A
R
 
K
I
 
I
A
 
S
F
|
F
T
 
T
G
|
G
S
x
G
V
 
V
A
 
A
T
x
S
G
 
G
N
 
K
L
 
K
I
 
V
-
 
M
-
 
A
-
 
N
S
 
S
Q
 
A
Q
 
A
A
 
S
G
 
S
I
 
L
A
 
K
V
 
E
L
 
V
S
 
T
L
 
M
E
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
N
 
S
P
 
P
L
 
L
I
 
I
I
 
I
Y
 
A
P
 
E
D
 
D
V
 
A
D
 
N
V
 
L
Q
 
D
K
 
L
V
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
I
A
 
A
V
 
M
A
 
M
G
 
A
M
 
-
N
 
N
F
 
F
T
 
Y
R
 
-
S
 
S
Q
 
S
G
 
G
Q
 
Q
S
 
V
C
 
C
G
 
T
S
 
N
N
 
G
S
 
T
R
 
R
V
 
V
F
 
F
V
 
V
H
 
P
R
 
A
D
 
K
L
 
F
H
 
K
D
 
A
E
 
E
F
 
F
V
 
E
S
 
H
E
 
K
V
 
I
V
 
L
K
 
E
R
 
R
V
 
V
E
 
G
K
 
R
I
 
I
K
 
R
V
 
A
G
 
G
H
 
D
A
 
L
D
 
F
A
 
A
D
 
D
D
 
D
T
 
T
E
 
N
M
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
L
V
 
V
T
 
S
R
 
F
Q
 
P
H
|
H
Y
 
R
D
 
Q
R
 
N
V
 
V
M
 
L
H
 
R
Y
 
Y
I
 
I
D
 
E
S
 
S
A
 
G
K
 
K
S
 
S
E
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
R
L
 
L
M
 
L
T
 
C
G
 
G
G
 
G
G
 
D
H
 
V
A
 
L
K
 
K
G
 
G
E
 
E
D
 
G
L
 
F
A
 
D
D
 
N
G
 
G
Y
 
A
F
 
W
I
 
V
E
 
A
P
 
P
T
 
T
V
 
V
F
 
F
D
 
T
E
 
D
V
 
C
T
 
T
H
 
D
D
 
D
M
 
M
T
 
T
I
 
I
A
 
V
R
 
R
E
 
E
E
 
E
I
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
M
 
M
S
 
S
I
 
I
L
 
L
V
 
S
W
 
Y
D
 
D
D
 
D
E
 
E
A
 
A
S
 
E
M
 
V
M
 
I
E
 
R
Q
 
R
V
 
A
N
 
N
G
 
A
V
 
T
E
 
E
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
C
 
A
A
 
A
N
 
G
V
 
V
W
 
V
T
 
T
N
 
P
D
 
D
I
 
L
S
 
N
T
 
R
A
 
A
L
 
H
R
 
R
V
 
I
G
 
I
D
 
H
D
 
Q
I
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
Y
 
I
V
 
C
W
 
W
I
 
I
N
 
N
G
 
S
H
 
W
G
 
G
G
 
E
K
 
S
R
 
P
F
 
A
K
 
E
G
 
-
A
 
M
P
 
P
F
 
V
G
 
G
G
 
G
V
 
Y
K
 
K
N
 
H
S
 
S
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
E
 
E
H
 
N
D
 
G
T
 
V
S
 
M
E
 
T
I
 
L
R
 
Q
S
 
S
F
 
Y
T
 
T
Q
 
Q
E
 
V
K
 
K
N
 
S
I
 
I
N
 
Q
V
 
V

8vj3A Crystal structure of betaine aldehyde dehydrogenase (betb) from klebsiella aerogenes (fad bound)
44% identity, 95% coverage: 24:495/497 of query aligns to 6:479/488 of 8vj3A

query
sites
8vj3A
Q
 
Q
M
 
L
T
 
Y
I
 
I
N
 
H
G
 
G
K
 
K
F
 
F
V
 
V
K
 
A
G
 
A
Q
 
T
S
 
S
G
 
G
K
 
K
T
 
T
Y
 
F
T
 
E
T
 
T
I
 
I
N
 
N
P
 
P
S
 
A
T
 
T
D
 
G
Q
 
E
P
 
V
L
 
L
A
 
A
D
 
T
V
 
V
P
 
Q
F
 
A
A
 
A
T
 
G
A
 
R
E
 
E
D
 
D
V
 
V
K
 
D
S
 
R
A
 
A
V
 
V
A
 
K
S
 
S
A
 
A
K
 
Q
A
 
Q
A
 
G
F
 
Q
P
 
K
G
 
V
W
 
W
K
 
A
K
 
A
L
 
M
H
 
S
V
 
A
D
 
M
E
 
A
R
 
R
G
 
S
K
 
R
M
 
I
L
 
L
K
 
R
A
 
K
L
 
A
S
 
V
R
 
D
A
 
I
V
 
L
R
 
R
E
 
E
R
 
R
A
 
N
E
 
D
M
 
E
F
 
L
G
 
A
M
 
R
L
 
L
D
 
E
A
 
T
L
 
L
D
 
D
C
 
T
G
 
G
N
 
K
P
 
P
Y
 
L
-
 
S
Q
 
E
A
 
T
M
 
A
V
 
A
D
 
V
D
 
D
A
 
I
N
 
V
K
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
D
L
 
V
L
 
L
E
 
E
H
 
Y
F
 
Y
S
 
A
N
 
G
L
 
L
G
 
I
M
 
P
E
 
A
L
 
L
K
 
E
G
 
G
Q
 
S
T
 
Q
V
 
I
P
 
P
T
 
L
P
 
R
G
 
D
G
 
S
G
 
S
L
 
F
N
 
V
Y
 
Y
T
 
T
R
 
R
L
 
R
E
 
E
P
 
P
F
 
L
G
 
G
V
 
V
V
 
V
A
 
A
R
 
G
I
|
I
L
x
G
P
 
A
F
x
W
N
 
N
H
 
Y
P
 
P
I
 
I
S
 
Q
F
 
I
A
 
A
V
 
L
G
 
W
K
 
K
I
 
S
A
 
A
S
 
P
A
 
A
L
 
L
I
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
N
T
 
A
V
 
M
V
 
I
M
 
F
K
|
K
I
 
P
A
x
S
D
x
E
Q
 
V
T
 
T
P
 
P
L
 
L
S
 
T
A
 
A
L
 
L
L
 
K
F
 
L
G
 
A
K
 
E
L
 
I
I
 
Y
Q
 
R
E
 
E
H
 
A
-
 
G
L
 
L
P
 
P
P
 
D
G
 
G
V
 
V
V
 
F
N
 
N
V
 
V
I
 
L
T
 
P
G
 
G
D
 
I
G
|
G
A
 
A
T
 
E
T
 
T
G
|
G
A
 
Q
S
 
Y
L
 
L
V
 
T
S
 
E
H
 
H
P
 
P
D
 
D
I
 
I
H
 
A
R
 
K
I
 
I
A
 
S
F
|
F
T
 
T
G
 
G
S
 
G
V
 
V
A
 
A
T
x
S
G
 
G
N
 
K
L
 
K
I
 
V
-
 
M
-
 
A
-
 
N
S
 
S
Q
 
A
Q
 
A
A
 
S
G
 
S
I
 
L
A
 
K
V
 
E
L
 
V
S
 
T
L
 
M
E
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
N
 
S
P
 
P
L
 
L
I
 
I
I
 
I
Y
 
A
P
 
E
D
 
D
V
 
A
D
 
N
V
 
L
Q
 
D
K
 
L
V
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
I
A
 
A
V
 
M
A
 
M
G
 
A
M
 
-
N
 
N
F
 
F
T
 
Y
R
 
-
S
 
S
Q
 
S
G
 
G
Q
 
Q
S
 
V
C
 
C
G
 
T
S
 
N
N
 
G
S
 
T
R
 
R
V
 
V
F
 
F
V
 
V
H
 
P
R
 
A
D
 
K
L
 
F
H
 
K
D
 
A
E
 
E
F
 
F
V
 
E
S
 
H
E
 
K
V
 
I
V
 
L
K
 
E
R
 
R
V
 
V
E
 
G
K
 
R
I
 
I
K
 
R
V
 
A
G
 
G
H
 
D
A
 
L
D
 
F
A
 
A
D
 
D
D
 
D
T
 
T
E
 
N
M
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
L
V
 
V
T
 
S
R
 
F
Q
 
P
H
 
H
Y
 
R
D
 
Q
R
 
N
V
 
V
M
 
L
H
 
R
Y
 
Y
I
 
I
D
 
E
S
 
S
A
 
G
K
 
K
S
 
S
E
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
R
L
 
L
M
 
L
T
 
C
G
 
G
G
 
G
G
 
D
H
 
V
A
 
L
K
 
K
G
 
G
E
 
E
D
 
G
L
 
F
A
 
D
D
 
N
G
 
G
Y
 
A
F
 
W
I
 
V
E
 
A
P
 
P
T
 
T
V
 
V
F
 
F
D
 
T
E
 
D
V
 
C
T
 
T
H
 
D
D
 
D
M
 
M
T
 
T
I
 
I
A
 
V
R
 
R
E
 
E
E
 
E
I
 
I
F
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
M
 
M
S
 
S
I
 
I
L
 
L
V
 
S
W
 
Y
D
 
D
D
 
D
E
 
E
A
 
A
S
 
E
M
 
V
M
 
I
E
 
R
Q
 
R
V
 
A
N
 
N
G
 
A
V
 
T
E
 
E
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
C
 
A
A
 
A
N
 
G
V
 
V
W
 
V
T
 
T
N
 
P
D
 
D
I
 
L
S
 
N
T
 
R
A
 
A
L
 
H
R
 
R
V
 
I
G
 
I
D
 
H
D
 
Q
I
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
Y
 
I
V
 
C
W
 
W
I
 
I
N
 
N
G
 
S
H
 
W
G
 
G
G
 
E
K
 
S
R
 
P
F
 
A
K
 
E
G
 
-
A
 
M
P
 
P
F
 
V
G
 
G
G
 
G
V
 
Y
K
 
K
N
 
H
S
 
S
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
E
 
E
H
 
N
D
 
G
T
 
V
S
 
M
E
 
T
I
 
L
R
 
Q
S
 
S
F
 
Y
T
 
T
Q
 
Q
E
 
V
K
 
K
N
 
S
I
 
I
N
 
Q
V
 
V

8uzoA Crystal structure of betaine aldehyde dehydrogenase (betb) from klebsiella aerogenes (adp bound)
44% identity, 95% coverage: 24:495/497 of query aligns to 6:479/488 of 8uzoA

query
sites
8uzoA
Q
 
Q
M
 
L
T
 
Y
I
 
I
N
 
H
G
 
G
K
 
K
F
 
F
V
 
V
K
 
A
G
 
A
Q
 
T
S
 
S
G
 
G
K
 
K
T
 
T
Y
 
F
T
 
E
T
 
T
I
 
I
N
 
N
P
 
P
S
 
A
T
 
T
D
 
G
Q
 
E
P
 
V
L
 
L
A
 
A
D
 
T
V
 
V
P
 
Q
F
 
A
A
 
A
T
 
G
A
 
R
E
 
E
D
 
D
V
 
V
K
 
D
S
 
R
A
 
A
V
 
V
A
 
K
S
 
S
A
 
A
K
 
Q
A
 
Q
A
 
G
F
 
Q
P
 
K
G
 
V
W
 
W
K
 
A
K
 
A
L
 
M
H
 
S
V
 
A
D
 
M
E
 
A
R
 
R
G
 
S
K
 
R
M
 
I
L
 
L
K
 
R
A
 
K
L
 
A
S
 
V
R
 
D
A
 
I
V
 
L
R
 
R
E
 
E
R
 
R
A
 
N
E
 
D
M
 
E
F
 
L
G
 
A
M
 
R
L
 
L
D
 
E
A
 
T
L
 
L
D
 
D
C
 
T
G
 
G
N
 
K
P
 
P
Y
 
L
-
 
S
Q
 
E
A
 
T
M
 
A
V
 
A
D
 
V
D
 
D
A
 
I
N
 
V
K
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
D
L
 
V
L
 
L
E
 
E
H
 
Y
F
 
Y
S
 
A
N
 
G
L
 
L
G
 
I
M
 
P
E
 
A
L
 
L
K
 
E
G
 
G
Q
 
S
T
 
Q
V
 
I
P
 
P
T
 
L
P
 
R
G
 
D
G
 
S
G
 
S
L
 
F
N
 
V
Y
 
Y
T
 
T
R
 
R
L
 
R
E
 
E
P
 
P
F
 
L
G
 
G
V
 
V
V
 
V
A
 
A
R
 
G
I
|
I
L
x
G
P
 
A
F
 
W
N
 
N
H
 
Y
P
 
P
I
 
I
S
 
Q
F
 
I
A
 
A
V
 
L
G
 
W
K
 
K
I
 
S
A
 
A
S
 
P
A
 
A
L
 
L
I
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
N
T
 
A
V
 
M
V
 
I
M
 
F
K
|
K
I
 
P
A
 
S
D
 
E
Q
 
V
T
 
T
P
 
P
L
 
L
S
 
T
A
 
A
L
 
L
L
 
K
F
 
L
G
 
A
K
 
E
L
 
I
I
 
Y
Q
 
R
E
 
E
H
 
A
-
 
G
L
 
L
P
 
P
P
 
D
G
 
G
V
 
V
V
 
F
N
 
N
V
 
V
I
 
L
T
 
P
G
 
G
D
 
I
G
|
G
A
 
A
T
 
E
T
 
T
G
|
G
A
 
Q
S
 
Y
L
 
L
V
 
T
S
 
E
H
 
H
P
 
P
D
 
D
I
 
I
H
 
A
R
 
K
I
 
I
A
 
S
F
|
F
T
 
T
G
|
G
S
x
G
V
 
V
A
 
A
T
x
S
G
 
G
N
 
K
L
 
K
I
x
V
-
 
M
-
 
A
-
 
N
S
 
S
Q
 
A
Q
 
A
A
 
S
G
 
S
I
 
L
A
 
K
V
 
E
L
 
V
S
 
T
L
 
M
E
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
N
 
S
P
 
P
L
 
L
I
 
I
I
 
I
Y
 
A
P
 
E
D
 
D
V
 
A
D
 
N
V
 
L
Q
 
D
K
 
L
V
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
I
A
 
A
V
 
M
A
 
M
G
 
A
M
 
-
N
 
N
F
 
F
T
 
Y
R
 
-
S
 
S
Q
 
S
G
 
G
Q
 
Q
S
 
V
C
 
C
G
 
T
S
 
N
N
 
G
S
 
T
R
 
R
V
 
V
F
 
F
V
 
V
H
 
P
R
 
A
D
 
K
L
 
F
H
 
K
D
 
A
E
 
E
F
 
F
V
 
E
S
 
H
E
 
K
V
 
I
V
 
L
K
 
E
R
 
R
V
 
V
E
 
G
K
 
R
I
 
I
K
 
R
V
 
A
G
 
G
H
 
D
A
 
L
D
 
F
A
 
A
D
 
D
D
 
D
T
 
T
E
 
N
M
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
L
V
 
V
T
 
S
R
 
F
Q
 
P
H
 
H
Y
 
R
D
 
Q
R
 
N
V
 
V
M
 
L
H
 
R
Y
 
Y
I
 
I
D
 
E
S
 
S
A
 
G
K
 
K
S
 
S
E
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
R
L
 
L
M
 
L
T
 
C
G
 
G
G
 
G
G
 
D
H
 
V
A
 
L
K
 
K
G
 
G
E
 
E
D
 
G
L
 
F
A
 
D
D
 
N
G
 
G
Y
 
A
F
 
W
I
 
V
E
 
A
P
 
P
T
 
T
V
 
V
F
 
F
D
 
T
E
 
D
V
 
C
T
 
T
H
 
D
D
 
D
M
 
M
T
 
T
I
 
I
A
 
V
R
 
R
E
 
E
E
 
E
I
 
I
F
 
F
G
 
G
P
 
P
V
 
V
M
 
M
S
 
S
I
 
I
L
 
L
V
 
S
W
 
Y
D
 
D
D
 
D
E
 
E
A
 
A
S
 
E
M
 
V
M
 
I
E
 
R
Q
 
R
V
 
A
N
 
N
G
 
A
V
 
T
E
 
E
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
C
 
A
A
 
A
N
 
G
V
 
V
W
 
V
T
 
T
N
 
P
D
 
D
I
 
L
S
 
N
T
 
R
A
 
A
L
 
H
R
 
R
V
 
I
G
 
I
D
 
H
D
 
Q
I
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
Y
 
I
V
 
C
W
 
W
I
 
I
N
 
N
G
 
S
H
 
W
G
 
G
G
 
E
K
 
S
R
 
P
F
 
A
K
 
E
G
 
-
A
 
M
P
 
P
F
 
V
G
 
G
G
 
G
V
 
Y
K
 
K
N
 
H
S
 
S
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
E
 
E
H
 
N
D
 
G
T
 
V
S
 
M
E
 
T
I
 
L
R
 
Q
S
 
S
F
 
Y
T
 
T
Q
 
Q
E
 
V
K
 
K
N
 
S
I
 
I
N
 
Q
V
 
V

8uznA Crystal structure of betaine aldehyde dehydrogenase (betb) from klebsiella aerogenes (amp bound)
44% identity, 95% coverage: 24:495/497 of query aligns to 6:479/488 of 8uznA

query
sites
8uznA
Q
 
Q
M
 
L
T
 
Y
I
 
I
N
 
H
G
 
G
K
 
K
F
 
F
V
 
V
K
 
A
G
 
A
Q
 
T
S
 
S
G
 
G
K
 
K
T
 
T
Y
 
F
T
 
E
T
 
T
I
 
I
N
 
N
P
 
P
S
 
A
T
 
T
D
 
G
Q
 
E
P
 
V
L
 
L
A
 
A
D
 
T
V
 
V
P
 
Q
F
 
A
A
 
A
T
 
G
A
 
R
E
 
E
D
 
D
V
 
V
K
 
D
S
 
R
A
 
A
V
 
V
A
 
K
S
 
S
A
 
A
K
 
Q
A
 
Q
A
 
G
F
 
Q
P
 
K
G
 
V
W
 
W
K
 
A
K
 
A
L
 
M
H
 
S
V
 
A
D
 
M
E
 
A
R
 
R
G
 
S
K
 
R
M
 
I
L
 
L
K
 
R
A
 
K
L
 
A
S
 
V
R
 
D
A
 
I
V
 
L
R
 
R
E
 
E
R
 
R
A
 
N
E
 
D
M
 
E
F
 
L
G
 
A
M
 
R
L
 
L
D
 
E
A
 
T
L
 
L
D
 
D
C
 
T
G
 
G
N
 
K
P
 
P
Y
 
L
-
 
S
Q
 
E
A
 
T
M
 
A
V
 
A
D
 
V
D
 
D
A
 
I
N
 
V
K
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
D
L
 
V
L
 
L
E
 
E
H
 
Y
F
 
Y
S
 
A
N
 
G
L
 
L
G
 
I
M
 
P
E
 
A
L
 
L
K
 
E
G
 
G
Q
 
S
T
 
Q
V
 
I
P
 
P
T
 
L
P
 
R
G
 
D
G
 
S
G
 
S
L
 
F
N
 
V
Y
 
Y
T
 
T
R
 
R
L
 
R
E
 
E
P
 
P
F
 
L
G
 
G
V
 
V
V
 
V
A
 
A
R
 
G
I
|
I
L
x
G
P
 
A
F
 
W
N
 
N
H
 
Y
P
 
P
I
 
I
S
 
Q
F
 
I
A
 
A
V
 
L
G
 
W
K
 
K
I
 
S
A
 
A
S
 
P
A
 
A
L
 
L
I
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
N
T
 
A
V
 
M
V
 
I
M
 
F
K
|
K
I
 
P
A
x
S
D
x
E
Q
 
V
T
 
T
P
 
P
L
 
L
S
 
T
A
 
A
L
 
L
L
 
K
F
 
L
G
 
A
K
 
E
L
 
I
I
 
Y
Q
 
R
E
 
E
H
 
A
-
 
G
L
 
L
P
 
P
P
 
D
G
 
G
V
 
V
V
 
F
N
 
N
V
 
V
I
 
L
T
 
P
G
 
G
D
 
I
G
|
G
A
 
A
T
 
E
T
 
T
G
|
G
A
 
Q
S
 
Y
L
 
L
V
 
T
S
 
E
H
 
H
P
 
P
D
 
D
I
 
I
H
 
A
R
 
K
I
 
I
A
 
S
F
|
F
T
 
T
G
 
G
S
x
G
V
 
V
A
 
A
T
x
S
G
 
G
N
 
K
L
x
K
I
 
V
-
 
M
-
 
A
-
 
N
S
 
S
Q
 
A
Q
 
A
A
 
S
G
 
S
I
 
L
A
 
K
V
 
E
L
 
V
S
 
T
L
 
M
E
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
N
 
S
P
 
P
L
 
L
I
 
I
I
 
I
Y
 
A
P
 
E
D
 
D
V
 
A
D
 
N
V
 
L
Q
 
D
K
 
L