SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_007474013.1 NCBI__GCF_000170735.1:WP_007474013.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5z20F The ternary structure of d-lactate dehydrogenase from pseudomonas aeruginosa with nadh and oxamate (see paper)
28% identity, 98% coverage: 1:303/310 of query aligns to 8:336/336 of 5z20F

query
sites
5z20F
M
 
M
K
 
R
I
 
I
A
 
L
F
 
F
F
 
F
D
 
S
I
 
S
K
 
Q
P
 
A
Y
 
Y
E
 
D
R
 
S
E
 
E
F
 
S
F
 
F
E
 
Q
K
 
A
S
 
S
L
 
N
K
 
H
D
 
R
K
 
H
N
 
G
V
 
F
E
 
E
L
 
L
F
 
H
F
 
F
F
 
Q
E
 
Q
K
 
A
T
 
H
V
 
L
K
 
Q
-
 
A
E
 
D
V
 
T
L
 
A
E
 
V
K
 
L
P
 
A
M
 
Q
N
 
G
F
 
F
D
 
E
V
 
V
I
 
V
S
 
C
V
 
A
F
 
F
Y
 
V
T
 
N
S
 
D
K
 
D
I
 
L
D
 
S
K
 
R
D
 
P
V
 
V
L
 
L
N
 
E
K
 
R
L
 
L
P
 
A
-
 
A
-
 
G
N
 
G
L
 
T
K
 
R
Y
 
L
I
 
V
Q
 
A
T
 
L
R
 
R
S
 
S
T
 
A
G
 
G
V
 
Y
D
 
N
H
 
H
L
 
V
D
 
D
L
 
L
V
 
A
E
 
A
I
 
A
Y
 
E
K
 
A
R
 
L
G
 
G
I
 
L
I
 
P
A
 
V
S
 
V
N
 
H
V
 
V
V
 
P
G
 
A
Y
|
Y
A
x
S
G
 
P
P
 
H
C
 
A
V
 
V
G
 
A
E
 
E
F
 
H
A
 
A
Y
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
I
L
 
L
E
 
T
A
 
L
I
 
N
R
 
R
K
 
R
L
 
L
Y
 
H
V
 
R
A
 
A
I
 
Y
V
 
N
R
 
R
L
 
T
K
 
R
W
 
E
G
 
G
C
 
D
R
 
F
E
 
S
Y
 
L
E
 
H
D
 
G
L
 
L
K
 
T
G
 
G
I
 
F
E
 
D
I
 
L
E
 
H
G
 
G
K
 
K
T
 
R
I
 
V
G
 
G
I
 
V
L
 
I
G
 
G
L
 
T
G
|
G
T
x
Q
I
|
I
G
 
G
T
 
E
Q
 
T
M
 
F
A
 
A
K
 
R
I
 
I
A
 
M
K
 
A
G
 
G
F
 
F
N
 
G
A
 
C
K
 
E
T
 
L
I
 
L
G
 
A
L
x
Y
N
x
D
R
x
P
S
 
Y
Y
 
P
K
 
N
K
 
P
E
 
R
F
 
I
D
 
Q
D
 
A
L
 
L
V
 
G
D
 
G
E
 
R
F
 
Y
T
 
L
Q
 
A
N
 
-
L
 
L
D
 
D
Y
 
A
V
 
L
L
 
L
E
 
A
K
 
E
S
 
S
D
 
D
F
 
I
L
 
V
F
 
S
I
 
L
A
 
H
L
x
C
P
|
P
L
 
L
T
 
T
P
 
A
S
 
D
T
|
T
K
 
R
N
 
H
L
 
L
I
 
I
N
 
D
K
 
A
E
 
Q
N
 
R
I
 
L
K
 
A
K
 
T
F
 
M
K
 
K
-
 
P
G
 
G
K
 
A
V
 
M
I
 
L
V
 
I
N
 
N
P
x
T
A
x
G
R
|
R
A
 
G
E
 
A
I
 
L
I
 
V
E
 
N
E
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
L
-
 
I
-
 
E
-
 
A
-
 
L
-
 
K
-
 
S
-
 
G
-
 
Q
-
 
L
-
 
G
-
 
Y
-
 
L
-
 
G
-
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
Y
R
 
E
-
 
E
-
x
E
-
 
A
-
 
D
-
 
I
-
 
F
-
 
F
-
 
E
-
 
D
K
 
R
F
 
S
D
 
D
G
 
Q
I
 
P
I
 
L
A
 
Q
A
 
D
D
 
D
V
 
V
L
 
L
P
 
A
N
 
R
W
 
-
D
 
-
L
 
L
A
 
L
K
 
S
K
 
F
E
 
P
N
 
N
I
 
V
I
 
V
A
 
V
T
 
T
P
 
A
H
|
H
M
 
Q
A
|
A
Y
 
F
Y
 
L
T
 
T
E
 
R
E
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
A
R
 
A
I
 
I
M
 
A
Q
 
D
I
 
T
S
 
T
L
 
L
E
 
D
N
 
N
L
 
I
L
 
A
D
 
A
F
 
W
L
 
Q
D
 
D
G
 
G
K
 
-
T
 
T
P
 
P
R
 
R
N
 
N
C
 
R
L
 
V
R
 
R
V
 
A

3kb6B Crystal structure of d-lactate dehydrogenase from aquifex aeolicus complexed with NAD and lactic acid (see paper)
28% identity, 95% coverage: 1:294/310 of query aligns to 1:320/334 of 3kb6B

query
sites
3kb6B
M
 
M
K
 
N
I
 
V
A
 
L
F
 
F
F
 
T
D
 
S
I
 
V
K
 
P
P
 
Q
Y
 
E
E
 
D
R
 
V
E
 
P
F
 
F
F
 
Y
E
 
Q
K
 
E
S
 
A
L
 
L
K
 
K
D
 
D
K
 
L
N
 
S
V
 
L
E
 
K
L
 
I
F
 
Y
F
 
T
F
 
T
E
 
D
K
 
-
T
 
-
V
 
V
K
 
S
E
 
K
V
 
V
L
 
P
E
 
E
K
 
N
P
 
E
M
 
L
N
 
K
-
 
K
F
 
A
D
 
E
V
 
L
I
 
I
S
 
S
V
 
V
F
|
F
Y
 
V
T
 
Y
S
 
D
K
 
K
I
 
L
D
 
T
K
 
E
D
 
E
V
 
L
L
 
L
N
 
S
K
 
K
L
 
M
P
 
P
N
 
R
L
 
L
K
 
K
Y
 
L
I
 
I
Q
 
H
T
 
T
R
 
R
S
|
S
T
x
V
G
|
G
V
 
F
D
 
D
H
 
H
L
 
I
D
 
D
L
 
L
V
 
D
E
 
Y
I
 
C
Y
 
K
K
 
K
R
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
L
A
 
V
S
 
T
N
 
H
V
 
I
V
 
P
G
 
A
Y
|
Y
A
x
S
G
 
P
P
 
E
C
 
S
V
|
V
G
 
A
E
 
E
F
 
H
A
 
T
Y
 
F
G
 
A
L
 
M
L
 
I
L
 
L
E
 
T
A
 
L
I
 
V
R
 
K
K
 
R
L
 
L
Y
 
K
V
 
R
A
 
I
I
 
E
V
 
D
R
 
R
L
 
V
-
 
K
K
 
K
W
 
L
G
 
N
C
 
F
R
 
S
E
 
Q
Y
 
D
E
 
S
D
 
E
L
 
I
K
 
L
G
 
A
I
 
R
E
 
E
I
 
L
E
 
N
G
 
R
K
 
L
T
 
T
I
 
L
G
 
G
I
 
V
L
 
I
G
 
G
L
 
T
G
|
G
T
x
R
I
|
I
G
 
G
T
 
S
Q
 
R
M
 
V
A
 
A
K
 
M
I
 
Y
A
 
G
K
 
L
G
 
A
F
 
F
N
 
G
A
 
M
K
 
K
T
 
V
I
 
L
G
 
C
L
 
Y
N
x
D
R
x
V
S
 
V
Y
 
K
K
 
R
K
 
E
E
 
D
F
 
L
D
 
K
D
 
E
L
 
K
V
 
G
D
 
C
E
 
V
F
 
Y
T
 
T
Q
 
-
N
 
S
L
 
L
D
 
D
Y
 
E
V
 
L
L
 
L
E
 
K
K
 
E
S
 
S
D
 
D
F
 
V
L
 
I
F
 
S
I
 
L
A
 
H
L
 
V
P
|
P
L
 
Y
T
 
T
P
 
K
S
 
E
T
 
T
K
 
H
N
 
H
L
 
M
I
 
I
N
 
N
K
 
E
E
 
E
N
 
R
I
 
I
K
 
S
K
 
L
F
 
M
K
 
K
-
 
D
G
 
G
K
 
V
V
 
Y
I
 
L
V
 
I
N
 
N
P
x
T
A
|
A
R
|
R
A
 
G
E
 
K
I
 
V
I
 
V
E
 
D
E
 
T
D
 
D
-
 
A
V
 
L
Y
 
Y
R
 
R
-
 
A
-
 
Y
-
 
Q
-
 
R
-
 
G
K
 
K
F
 
F
D
 
S
G
 
G
I
 
-
I
 
L
A
 
G
A
 
L
D
|
D
V
 
V
L
 
F
P
 
E
N
 
D
-
x
E
-
 
E
-
 
I
-
 
L
-
 
I
-
 
L
-
 
K
-
 
K
-
 
Y
-
 
T
-
 
E
-
 
G
-
 
K
-
 
A
-
 
T
-
 
D
-
 
K
-
 
N
-
 
L
-
 
K
-
 
I
W
 
L
D
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
C
K
 
K
E
 
D
N
 
N
I
 
V
I
 
I
A
 
I
T
 
T
P
 
P
H
|
H
M
 
I
A
|
A
Y
|
Y
Y
 
Y
T
 
T
E
 
D
E
 
K
A
 
S
L
 
L
K
 
E
R
 
R
I
 
I
M
 
R
Q
 
E
I
 
E
S
 
T
L
 
V
E
 
K
N
 
V
L
 
V
L
 
K
D
 
A
F
 
F
L
 
V
D
 
K
G
 
G

5z21B The ternary structure of d-lactate dehydrogenase from fusobacterium nucleatum with nadh and oxamate (see paper)
31% identity, 95% coverage: 2:295/310 of query aligns to 3:323/331 of 5z21B

query
sites
5z21B
K
 
K
I
 
I
A
 
I
F
 
F
F
 
F
D
 
D
I
 
I
K
 
K
P
 
D
Y
 
Y
E
 
D
R
 
K
E
 
E
F
 
F
F
 
F
E
 
K
K
 
K
S
 
Y
L
 
G
K
 
A
D
 
D
K
 
Y
N
 
N
V
 
F
E
 
E
L
 
M
F
 
T
F
 
F
F
 
L
E
 
K
-
 
V
K
 
R
T
 
L
V
 
T
K
 
E
E
 
E
V
 
T
L
 
A
E
 
N
K
 
L
P
 
T
M
 
K
N
 
G
F
 
Y
D
 
D
V
 
V
I
 
V
S
 
C
V
 
G
F
 
F
Y
 
A
T
 
N
S
 
D
K
 
N
I
 
I
D
 
N
K
 
K
D
 
E
V
 
T
L
 
I
N
 
D
K
 
I
L
 
M
P
 
A
-
 
E
-
 
N
N
 
G
L
 
I
K
 
K
Y
 
L
I
 
L
Q
 
A
T
 
M
R
 
R
S
 
C
T
 
A
G
 
G
V
 
F
D
 
N
H
 
N
L
 
V
D
 
S
L
 
L
V
 
K
E
 
D
I
 
V
Y
 
N
K
 
E
R
 
R
G
 
F
I
 
K
I
 
V
A
 
V
S
 
R
N
 
-
V
 
V
V
 
P
G
 
A
Y
|
Y
A
x
S
G
 
P
P
 
H
C
 
A
V
x
I
G
 
A
E
 
E
F
 
Y
A
 
T
Y
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
I
L
 
L
E
 
A
A
 
V
I
 
N
R
 
R
K
 
K
L
 
I
Y
 
N
V
 
K
A
 
A
I
 
Y
V
 
V
R
 
R
L
 
T
K
 
R
W
 
E
G
 
G
C
 
N
R
 
F
E
 
S
Y
 
I
E
 
N
D
 
G
L
 
L
K
 
M
G
 
G
I
 
I
E
 
D
I
 
L
E
 
Y
G
 
E
K
 
K
T
 
T
I
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
I
G
 
G
L
 
T
G
|
G
T
x
K
I
|
I
G
 
G
T
 
Q
Q
 
I
M
 
L
A
 
I
K
 
K
I
 
I
A
 
L
K
 
R
G
 
G
F
 
F
N
 
D
A
 
M
K
 
K
T
 
V
I
 
I
G
 
A
L
 
Y
N
x
D
R
x
L
-
 
F
S
 
P
Y
 
N
K
 
Q
K
 
K
E
 
V
F
 
A
D
 
D
D
 
E
L
 
L
V
 
G
D
 
F
E
 
E
F
 
Y
T
 
V
Q
 
-
N
 
S
L
 
L
D
 
D
Y
 
E
V
 
L
L
 
Y
E
 
A
K
 
N
S
 
S
D
 
D
F
 
I
L
 
I
F
 
S
I
 
L
A
 
N
L
 
C
P
|
P
L
 
L
T
 
T
P
 
K
S
 
D
T
|
T
K
 
K
N
 
Y
L
 
M
I
 
I
N
 
N
K
 
R
E
 
R
N
 
S
I
 
M
K
 
L
K
 
K
F
 
M
K
 
K
-
 
D
G
 
G
K
 
V
V
 
I
I
 
L
V
 
V
N
 
N
P
x
T
A
x
G
R
|
R
A
 
G
E
 
M
I
 
L
I
 
I
E
 
D
-
 
S
-
 
A
-
 
D
-
 
L
-
 
V
E
 
E
D
 
A
V
 
L
Y
 
K
R
 
D
K
 
K
F
 
K
D
 
I
G
 
G
I
 
A
I
 
V
A
 
A
A
 
L
D
|
D
V
 
V
L
 
Y
P
 
E
N
 
E
W
x
E
D
 
E
-
 
N
-
 
Y
-
 
F
-
 
F
-
 
E
-
 
D
-
 
K
-
 
S
-
 
T
-
 
Q
-
 
V
-
 
I
-
 
E
-
 
D
-
 
D
-
 
I
-
 
L
-
 
G
-
 
R
L
 
L
A
 
L
K
 
S
K
 
F
E
 
Y
N
 
N
I
 
V
I
 
L
A
 
I
T
 
T
P
 
S
H
|
H
M
 
Q
A
 
A
Y
|
Y
Y
 
F
T
 
T
E
 
K
E
 
E
A
 
A
L
 
V
K
 
G
R
 
A
I
 
I
M
 
T
Q
 
V
I
 
T
S
 
T
L
 
L
E
 
N
N
 
N
L
 
I
L
 
K
D
 
D
F
 
F
L
 
V
D
 
E
G
 
G
K
 
R

4zgsA Identification of the pyruvate reductase of chlamydomonas reinhardtii (see paper)
27% identity, 93% coverage: 6:292/310 of query aligns to 16:335/346 of 4zgsA

query
sites
4zgsA
F
 
Y
D
 
S
I
 
T
K
 
T
P
 
Q
Y
 
Y
E
 
V
R
 
K
E
 
D
F
 
F
F
 
L
E
 
A
K
 
G
S
 
P
L
 
M
K
 
Q
D
 
K
K
 
V
N
 
F
V
 
T
E
 
D
L
 
T
F
 
Y
F
 
F
F
 
V
E
 
E
K
 
P
T
 
P
V
 
L
-
 
D
K
 
K
E
 
D
V
 
T
L
 
A
E
 
Q
K
 
L
P
 
A
M
 
R
N
 
G
F
 
Y
D
 
D
V
 
V
I
 
A
S
 
V
V
 
L
F
 
F
Y
 
V
T
 
N
S
 
D
K
 
R
I
 
A
D
 
D
K
 
A
D
 
S
V
 
V
L
 
I
N
 
K
K
 
E
L
 
L
P
 
A
-
 
K
-
 
A
N
 
G
L
 
V
K
 
K
Y
 
L
I
 
I
Q
 
A
T
 
L
R
 
R
S
 
C
T
 
A
G
 
G
V
 
F
D
 
D
H
 
R
L
 
V
D
 
D
L
 
L
V
 
H
E
 
A
I
 
C
Y
 
A
K
 
E
R
 
H
G
 
G
I
 
V
I
 
R
A
 
V
S
 
V
N
 
R
V
 
V
V
 
P
G
 
T
Y
|
Y
A
x
S
G
 
P
P
 
E
C
 
S
V
 
V
G
 
A
E
 
E
F
 
H
A
 
A
Y
 
V
G
 
A
L
 
L
L
 
I
L
 
F
E
 
A
A
 
L
I
 
N
R
 
R
K
 
H
L
 
L
Y
 
T
V
 
D
A
 
A
I
 
Y
V
 
I
R
 
R
L
 
V
K
 
R
W
 
M
G
 
G
C
 
N
R
 
Y
E
 
S
Y
 
L
E
 
S
D
 
G
L
 
L
K
 
V
G
 
G
I
 
V
E
 
E
I
 
M
E
 
R
G
 
H
K
 
K
T
 
V
I
 
V
G
 
G
I
 
V
L
 
V
G
 
G
L
 
T
G
|
G
T
x
A
I
|
I
G
 
G
T
 
Q
Q
 
Q
M
 
A
A
 
A
K
 
R
I
 
I
A
 
L
K
 
K
G
 
G
F
 
I
N
 
G
A
 
C
K
 
K
T
 
V
I
 
F
G
 
A
L
 
Y
N
x
D
R
 
I
S
 
K
Y
 
P
K
 
N
K
 
P
E
 
A
F
 
V
D
 
E
D
 
A
L
 
M
V
 
G
D
 
I
E
 
P
F
 
Y
T
 
V
Q
 
-
N
 
S
L
 
L
D
 
D
Y
 
E
V
 
L
L
 
L
E
 
A
K
 
M
S
 
S
D
 
D
F
 
I
L
 
V
F
 
T
I
 
L
A
 
H
L
x
C
P
|
P
L
 
L
T
x
L
P
 
P
S
|
S
T
|
T
K
 
R
N
 
Q
L
 
L
I
 
I
N
 
N
K
 
K
E
 
E
N
 
S
I
 
I
K
 
Q
K
 
K
F
 
M
-
 
K
K
 
K
G
 
G
K
 
V
V
 
M
I
 
L
V
 
I
N
 
N
P
 
V
A
x
S
R
|
R
A
 
G
E
 
G
I
 
L
I
 
I
E
 
D
E
 
S
-
 
A
-
 
A
-
 
L
-
 
F
-
 
D
-
 
A
-
 
L
-
 
E
-
 
S
-
 
G
-
 
Q
-
 
I
-
 
G
-
 
A
-
 
L
-
 
G
-
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
Y
R
 
E
K
 
N
F
x
E
D
 
G
G
 
G
I
 
L
I
 
F
A
 
F
A
 
V
D
 
D
-
 
H
-
 
T
-
 
K
-
 
F
-
 
D
-
 
P
-
 
S
-
 
V
V
 
R
L
 
M
P
 
Q
N
 
K
W
 
W
D
 
D
-
 
R
-
 
Q
-
 
F
-
 
R
-
 
T
L
 
L
A
 
L
K
 
S
K
 
Y
E
 
P
N
 
Q
I
 
V
I
 
L
A
 
V
T
 
T
P
 
P
H
|
H
M
 
T
A
 
A
Y
x
F
Y
 
L
T
 
T
E
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
N
R
 
N
I
 
I
M
 
C
Q
 
T
I
 
T
S
 
T
L
 
I
E
 
Q
N
 
N
L
 
I
L
 
A
D
 
D
F
 
Y
L
 
V

5aovA Ternary crystal structure of pyrococcus furiosus glyoxylate hydroxypyruvate reductase in presence of glyoxylate (see paper)
29% identity, 85% coverage: 35:297/310 of query aligns to 37:317/334 of 5aovA

query
sites
5aovA
K
 
E
E
 
K
V
 
L
L
 
L
E
 
E
K
 
K
P
 
V
M
 
K
N
 
D
F
 
V
D
 
D
V
 
A
I
 
L
S
 
V
V
 
T
F
x
M
Y
x
L
T
 
S
S
 
E
K
 
R
I
 
I
D
 
D
K
 
Q
D
 
E
V
 
V
L
 
F
N
 
E
K
 
N
L
 
A
P
 
P
N
 
R
L
 
L
K
 
R
Y
 
I
I
 
V
Q
 
A
T
 
N
R
x
Y
S
x
A
T
x
V
G
|
G
V
 
Y
D
 
D
H
 
N
L
 
I
D
 
D
L
 
V
V
 
E
E
 
E
I
 
A
Y
 
T
K
 
R
R
 
R
G
 
G
I
 
I
I
 
Y
A
 
V
S
 
T
N
 
N
V
 
T
V
 
P
G
 
D
Y
 
V
A
x
L
G
 
T
P
 
N
C
 
A
V
x
T
G
 
A
E
 
D
F
 
H
A
 
A
Y
 
F
G
 
A
L
 
L
L
 
L
L
 
L
E
 
A
A
 
T
I
 
A
R
 
R
K
 
H
L
 
V
Y
 
V
V
 
K
A
 
G
I
 
D
V
 
K
R
 
F
L
 
V
K
 
R
W
 
S
G
 
G
C
 
E
R
 
W
E
 
K
Y
 
R
E
 
K
D
 
G
L
 
I
K
 
A
-
 
W
-
 
H
-
 
P
-
 
K
-
 
W
-
 
F
-
 
L
G
 
G
I
 
Y
E
 
E
I
 
L
E
 
Y
G
 
G
K
 
K
T
 
T
I
 
I
G
 
G
I
 
I
L
 
V
G
 
G
L
x
F
G
|
G
T
x
R
I
|
I
G
 
G
T
 
Q
Q
 
A
M
 
I
A
 
A
K
 
R
I
 
R
A
 
A
K
 
K
G
 
G
F
 
F
N
 
N
A
 
M
K
 
R
T
 
I
I
 
L
G
 
Y
L
 
Y
N
x
S
R
|
R
S
 
T
Y
 
R
K
 
K
K
 
S
E
 
Q
F
 
A
D
 
E
D
 
K
L
 
E
V
 
L
D
 
G
E
 
A
F
 
E
T
 
Y
Q
 
R
N
 
P
L
 
L
D
 
E
Y
 
E
V
 
V
L
 
L
E
 
K
K
 
E
S
 
S
D
 
D
F
 
F
L
 
V
F
 
I
I
 
L
A
|
A
L
x
V
P
|
P
L
 
L
T
 
T
P
 
K
S
 
E
T
|
T
K
 
M
N
 
Y
L
 
M
I
 
I
N
 
N
K
 
E
E
 
E
N
 
R
I
 
L
K
 
K
K
 
L
F
 
M
K
 
K
-
 
P
G
 
T
K
 
A
V
 
I
I
 
L
V
 
V
N
 
N
P
x
I
A
|
A
R
|
R
A
 
G
E
 
K
I
 
V
I
 
V
E
 
D
E
 
T
D
 
K
V
 
A
Y
 
L
R
 
I
K
 
K
F
 
A
-
 
L
-
 
K
D
 
E
G
 
G
I
 
W
I
 
I
A
 
A
A
 
G
D
 
A
V
 
G
L
 
L
P
x
D
-
 
V
-
 
F
-
 
E
-
 
E
-
x
E
-
 
P
-
 
Y
-
 
Y
N
 
N
W
 
E
D
 
E
L
 
L
A
 
F
K
 
S
K
 
L
E
 
D
N
 
N
I
 
V
I
 
V
A
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
M
 
I
A
x
G
Y
 
S
Y
 
A
T
 
T
E
 
F
E
 
E
A
 
A
L
 
R
K
 
E
R
 
A
I
 
M
M
 
A
Q
 
E
I
 
L
S
 
V
L
 
A
E
 
R
N
 
N
L
 
L
L
 
I
D
 
A
F
 
F
L
 
K
D
 
R
G
 
G
K
 
E
T
 
I
P
 
P

2eklA Structure of st1218 protein from sulfolobus tokodaii
29% identity, 90% coverage: 14:292/310 of query aligns to 15:306/312 of 2eklA

query
sites
2eklA
E
 
E
F
 
I
F
 
L
E
 
I
K
 
K
S
 
T
L
 
L
K
 
R
D
 
E
K
 
K
N
 
G
V
 
I
E
 
Q
L
 
V
-
 
D
F
 
Y
F
 
M
F
 
P
E
 
E
K
 
I
T
 
S
V
 
K
K
 
E
E
 
E
V
 
L
L
 
L
E
 
N
K
 
I
P
 
I
M
 
G
N
 
N
F
 
Y
D
 
D
V
 
I
I
 
I
S
 
V
V
 
V
F
 
R
Y
 
S
T
 
R
S
 
T
K
 
K
I
 
V
D
 
T
K
 
K
D
 
D
V
 
V
L
 
I
N
 
E
K
 
K
L
 
G
P
 
K
N
 
K
L
 
L
K
 
K
Y
 
I
I
 
I
Q
 
A
T
 
R
R
 
A
S
 
G
T
x
I
G
 
G
V
 
L
D
 
D
H
 
N
L
 
I
D
 
D
L
 
T
V
 
E
E
 
E
I
 
A
Y
 
E
K
 
K
R
 
R
G
 
N
I
 
I
I
 
K
A
 
V
S
 
V
N
 
Y
V
 
A
V
 
P
G
 
G
Y
 
A
A
x
S
G
 
T
P
 
D
C
 
S
V
 
A
G
 
V
E
 
E
F
 
L
A
 
T
Y
 
I
G
 
G
L
 
L
L
 
M
L
 
I
E
 
A
A
 
A
I
 
A
R
 
R
K
 
K
L
 
M
Y
 
Y
V
 
T
A
 
S
I
 
M
V
 
A
R
 
L
L
 
A
K
 
K
W
 
S
G
 
G
C
 
I
R
 
-
E
 
-
Y
 
F
E
 
K
D
 
K
L
 
I
K
 
E
G
 
G
I
 
L
E
 
E
I
 
L
E
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
I
 
I
G
 
G
I
 
I
L
 
V
G
|
G
L
 
F
G
|
G
T
x
R
I
|
I
G
 
G
T
 
T
Q
 
K
M
 
V
A
 
G
K
 
I
I
 
I
A
 
A
K
 
N
G
 
A
F
 
M
N
 
G
A
 
M
K
 
K
T
 
V
I
 
L
G
 
A
L
x
Y
N
x
D
R
x
I
S
x
L
Y
 
D
K
 
I
K
 
R
E
 
E
F
 
K
D
 
A
D
 
E
L
 
K
V
 
I
D
 
N
E
 
A
F
 
K
T
 
A
Q
 
V
N
 
S
L
 
L
D
 
E
Y
 
E
V
 
L
L
 
L
E
 
K
K
 
N
S
 
S
D
 
D
F
 
V
L
 
I
F
 
S
I
 
L
A
x
H
L
x
V
P
x
T
L
 
V
T
 
S
P
 
K
S
 
D
T
 
A
K
 
K
N
 
P
L
x
I
I
 
I
N
 
D
K
 
Y
E
 
P
N
 
Q
I
 
F
K
 
E
K
 
L
F
 
M
K
 
K
G
 
D
K
 
N
V
 
V
-
 
I
I
 
I
V
 
V
N
 
N
P
x
T
A
x
S
R
|
R
A
 
A
E
 
V
I
 
A
I
 
V
E
 
N
E
 
G
D
 
K
V
 
A
Y
 
L
R
 
L
K
 
D
F
 
Y
-
 
I
-
 
K
D
 
K
G
 
G
I
 
K
I
 
V
-
 
Y
-
 
A
-
 
Y
A
 
A
A
 
T
D
|
D
V
 
V
L
 
F
P
 
W
N
 
N
-
x
E
-
 
P
-
 
P
-
 
K
-
 
E
-
 
E
W
 
W
D
 
E
L
 
L
A
 
E
-
 
L
-
 
L
K
 
K
K
 
H
E
 
E
N
 
R
I
 
V
I
 
I
A
 
V
T
 
T
P
 
T
H
|
H
M
 
I
A
x
G
Y
 
A
Y
 
Q
T
 
T
E
 
K
E
 
E
A
 
A
L
 
Q
K
 
K
R
 
R
I
 
V
M
 
A
Q
 
E
I
 
M
S
 
T
L
 
T
E
 
Q
N
 
N
L
 
L
L
 
L
D
 
N
F
 
A
L
 
M

O43175 D-3-phosphoglycerate dehydrogenase; 3-PGDH; 2-oxoglutarate reductase; Malate dehydrogenase; EC 1.1.1.95; EC 1.1.1.399; EC 1.1.1.37 from Homo sapiens (Human) (see 3 papers)
29% identity, 90% coverage: 18:296/310 of query aligns to 21:311/533 of O43175

query
sites
O43175
K
 
K
S
 
I
L
 
L
K
 
Q
D
 
D
K
 
G
N
 
G
V
 
L
E
 
Q
L
 
V
F
 
V
F
 
E
F
 
K
E
 
Q
K
 
N
T
 
L
V
 
S
K
 
K
E
 
E
-
 
E
V
 
L
L
 
I
E
 
A
K
 
E
P
 
L
M
 
Q
N
 
D
F
 
C
D
 
E
V
 
G
I
 
L
S
 
I
V
 
V
F
 
R
Y
 
S
T
 
A
S
 
T
K
 
K
I
 
V
D
 
T
K
 
A
D
 
D
V
 
V
L
 
I
N
 
N
K
 
A
L
 
A
P
 
E
N
 
K
L
 
L
K
 
Q
Y
 
V
I
 
V
Q
 
G
T
 
R
R
 
A
S
 
G
T
|
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
H
 
N
L
 
V
D
 
D
L
 
L
V
 
E
E
 
A
I
 
A
Y
 
T
K
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
L
A
 
V
S
 
M
N
 
N
V
 
T
V
 
P
G
 
N
Y
 
G
A
 
N
G
 
S
P
 
L
C
 
S
V
 
A
G
 
A
E
 
E
F
 
L
A
 
T
Y
 
C
G
 
G
L
 
M
L
 
I
L
 
M
E
 
C
A
 
L
I
 
A
R
 
R
K
 
Q
L
 
I
Y
 
P
V
 
Q
A
 
A
I
 
T
V
 
A
R
 
S
L
 
M
K
 
K
W
 
D
G
 
G
C
 
K
R
 
W
E
 
E
Y
x
R
E
 
K
D
 
K
L
 
F
K
 
M
G
 
G
I
 
T
E
 
E
I
 
L
E
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
I
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
T
x
R
I
|
I
G
 
G
T
 
R
Q
 
E
M
 
V
A
 
A
K
 
T
I
 
R
A
 
M
K
 
Q
G
 
S
F
 
F
N
 
G
A
 
M
K
 
K
T
 
T
I
 
I
G
 
G
L
 
Y
N
x
D
R
 
P
S
 
I
Y
 
I
K
 
S
K
 
P
E
 
E
F
 
V
D
 
S
D
 
A
L
 
S
V
 
F
D
 
G
E
 
V
F
 
Q
T
 
Q
Q
 
L
N
 
P
L
 
L
D
 
E
Y
 
E
V
 
I
L
 
W
E
 
P
K
 
L
S
 
C
D
 
D
F
 
F
L
 
I
F
 
T
I
 
V
A
 
H
L
x
T
P
 
P
L
 
L
T
 
L
P
 
P
S
 
S
T
 
T
K
 
T
N
 
G
L
 
L
I
 
L
N
 
N
K
 
D
E
 
N
N
 
T
I
 
F
K
 
A
K
 
Q
F
 
C
-
 
K
K
 
K
G
 
G
K
 
V
V
 
R
I
 
V
V
 
V
N
 
N
P
x
C
A
|
A
R
|
R
A
 
G
E
 
G
I
 
I
I
 
V
E
 
D
E
 
E
D
 
G
V
 
A
Y
 
L
R
 
L
K
 
R
F
 
A
-
 
L
-
 
Q
D
 
S
G
 
G
I
 
Q
I
 
C
A
 
A
A
 
G
D
 
A
V
 
A
L
 
L
-
x
D
-
x
V
-
 
F
-
 
T
-
 
E
-
 
E
P
 
P
N
 
P
W
 
R
D
 
D
-
 
R
-
 
A
L
 
L
A
 
V
K
 
D
K
 
H
E
 
E
N
 
N
I
 
V
I
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
M
x
L
A
x
G
Y
x
A
Y
 
S
T
 
T
E
 
K
E
 
E
A
 
A
L
 
Q
K
 
S
R
 
R
I
 
C
M
 
G
Q
 
E
I
 
E
S
 
I
L
 
A
E
 
V
N
 
Q
L
 
F
L
 
V
D
 
D
F
 
M
L
 
V
D
 
K
G
 
G
K
 
K
T
 
S

Sites not aligning to the query:

4cukA Structure of salmonella d-lactate dehydrogenase in complex with nadh
26% identity, 97% coverage: 1:301/310 of query aligns to 1:328/330 of 4cukA

query
sites
4cukA
M
 
M
K
 
K
I
 
L
A
 
A
F
 
V
F
 
Y
D
 
S
I
 
T
K
 
K
P
 
Q
Y
 
Y
E
 
D
R
 
K
E
 
K
F
 
Y
F
 
L
E
 
Q
K
 
Q
S
 
V
L
 
N
K
 
E
D
 
A
K
 
F
N
 
G
V
 
F
E
 
E
L
 
L
F
 
E
F
 
F
F
 
F
E
 
D
K
 
F
T
 
L
V
 
L
K
 
T
E
 
E
V
 
K
L
 
T
E
 
A
K
 
K
P
 
T
M
 
A
N
 
N
-
 
G
F
 
C
D
 
E
V
 
A
I
 
V
S
 
C
V
 
I
F
 
F
Y
 
V
T
 
N
S
 
D
K
 
D
I
 
G
D
 
S
K
 
R
D
 
P
V
 
V
L
 
L
N
 
E
K
 
E
L
 
L
P
 
K
-
 
K
-
 
H
N
 
G
L
 
V
K
 
K
Y
 
Y
I
 
I
Q
 
A
T
 
L
R
 
R
S
 
C
T
 
A
G
 
G
V
 
F
D
 
N
H
 
N
L
 
V
D
 
D
L
 
L
V
 
D
E
 
A
I
 
A
Y
 
K
K
 
E
R
 
L
G
 
G
I
 
L
I
 
Q
A
 
V
S
 
V
N
 
R
V
 
V
V
 
P
G
 
A
Y
|
Y
A
x
S
G
 
P
P
 
E
C
 
A
V
 
V
G
 
A
E
 
E
F
 
H
A
 
A
Y
 
I
G
 
G
L
 
M
L
 
M
L
 
M
E
 
T
A
 
L
I
 
N
R
 
R
K
 
R
L
 
I
Y
 
H
V
 
R
A
 
A
I
 
Y
V
 
Q
R
 
R
L
 
T
K
 
R
W
 
D
G
 
A
C
 
N
R
 
F
E
 
S
Y
 
L
E
 
E
D
 
G
L
 
L
K
 
T
G
 
G
I
 
F
E
 
T
I
 
M
E
 
H
G
 
G
K
 
K
T
 
T
I
 
A
G
 
G
I
 
V
L
 
I
G
 
G
L
 
T
G
|
G
T
x
K
I
|
I
G
 
G
T
 
V
Q
 
A
M
 
A
A
 
L
K
 
R
I
 
I
A
 
L
K
 
K
G
 
G
F
 
F
N
 
G
A
 
M
K
 
R
T
 
L
I
 
L
G
 
A
L
x
F
N
x
D
R
x
P
S
 
Y
Y
 
P
K
 
S
K
 
T
E
 
A
F
 
A
D
 
L
D
 
D
L
 
L
V
 
G
D
 
V
E
 
E
F
 
Y
T
 
V
Q
 
-
N
 
D
L
 
L
D
 
Q
Y
 
T
V
 
L
L
 
F
E
 
A
K
 
E
S
 
S
D
 
D
F
 
V
L
 
I
F
 
S
I
 
L
A
x
H
L
x
C
P
|
P
L
 
L
T
 
T
P
 
P
S
 
E
T
x
N
K
 
Y
N
 
H
L
 
L
I
 
L
N
 
N
K
 
H
E
 
A
N
 
A
I
 
F
K
 
D
K
 
Q
F
 
M
K
 
K
-
 
N
G
 
G
K
 
V
V
 
M
I
 
I
V
 
I
N
 
N
P
x
T
A
 
S
R
|
R
A
 
G
E
 
A
I
 
L
I
 
I
E
 
D
-
 
S
-
 
Q
-
 
A
-
 
A
-
 
I
E
 
E
D
 
A
V
 
L
Y
 
K
R
 
N
K
 
Q
F
 
K
D
 
I
G
 
G
I
 
S
I
 
L
A
 
G
A
 
M
D
|
D
V
 
V
L
x
Y
P
 
E
N
 
N
-
x
E
-
 
R
-
 
D
-
 
L
-
 
F
-
 
F
-
 
E
-
 
D
-
 
K
-
 
S
-
 
V
-
 
D
-
 
V
-
 
I
-
 
Q
-
 
D
-
 
D
-
 
V
-
 
F
W
 
R
D
 
R
L
 
L
A
 
S
K
 
A
K
 
C
E
 
H
N
 
N
I
 
V
I
 
L
A
 
F
T
 
T
P
 
G
H
|
H
M
 
Q
A
|
A
Y
 
F
Y
 
L
T
 
T
E
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
I
R
 
S
I
 
I
M
 
S
Q
 
E
I
 
T
S
 
T
L
 
L
E
 
Q
N
 
N
L
 
L
L
 
S
D
 
Q
F
 
L
L
 
E
D
 
K
G
 
G
K
 
E
T
 
A
P
 
C
R
 
P
N
 
N
C
 
A
L
 
L

6rj3A Crystal structure of phgdh in complex with compound 15 (see paper)
29% identity, 85% coverage: 18:280/310 of query aligns to 15:289/297 of 6rj3A

query
sites
6rj3A
K
 
K
S
 
I
L
 
L
K
 
Q
D
 
D
K
 
G
N
 
G
V
 
L
E
 
Q
L
 
V
F
 
V
F
 
E
F
 
K
E
 
Q
K
 
N
T
 
L
V
 
S
K
 
K
E
 
E
-
 
E
V
 
L
L
 
I
E
 
A
K
 
E
P
 
L
M
 
Q
N
 
D
F
 
C
D
 
E
V
 
G
I
 
L
S
 
I
V
 
V
F
 
R
Y
 
S
T
 
A
S
 
T
K
 
K
I
 
V
D
 
T
K
 
A
D
 
D
V
 
V
L
 
I
N
 
N
K
 
A
L
 
A
P
 
E
N
 
K
L
 
L
K
 
Q
Y
 
V
I
 
V
Q
 
G
T
 
R
R
 
A
S
 
G
T
 
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
H
 
N
L
 
V
D
 
D
L
 
L
V
 
E
E
 
A
I
 
A
Y
 
T
K
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
L
A
 
V
S
 
M
N
 
N
V
 
T
V
 
P
G
 
N
Y
 
G
A
 
N
G
 
S
P
 
L
C
 
S
V
 
A
G
 
A
E
 
E
F
 
L
A
 
T
Y
 
C
G
 
G
L
 
M
L
 
I
L
 
M
E
 
C
A
 
L
I
 
A
R
 
R
K
 
Q
L
 
I
Y
 
P
V
 
Q
A
 
A
I
 
T
V
 
A
R
 
S
L
 
M
K
 
K
W
 
D
G
 
G
C
 
K
R
 
W
E
 
E
Y
 
R
E
 
K
D
 
K
L
 
F
K
 
M
G
 
G
I
 
T
E
 
E
I
 
L
E
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
I
 
L
G
 
G
I
 
I
L
|
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
T
 
R
I
 
I
G
 
G
T
 
R
Q
 
E
M
 
V
A
 
A
K
 
T
I
 
R
A
 
M
K
 
Q
G
 
S
F
 
F
N
 
G
A
 
M
K
 
K
T
 
T
I
 
I
G
 
G
L
x
Y
N
x
D
R
x
P
S
x
I
Y
x
I
K
 
S
K
 
P
E
 
E
F
 
V
D
 
S
D
 
A
L
 
S
V
 
F
D
 
G
E
 
V
F
 
Q
T
 
Q
Q
 
L
N
 
P
L
 
L
D
 
E
Y
 
E
V
 
I
L
 
W
E
 
P
K
 
L
S
 
C
D
 
D
F
 
F
L
 
I
F
 
T
I
 
V
A
x
H
L
x
T
P
|
P
L
 
L
T
 
L
P
 
P
S
 
S
T
 
T
K
 
T
N
 
G
L
|
L
I
 
L
N
 
N
K
 
D
E
 
N
N
 
T
I
 
F
K
 
A
K
 
Q
F
 
C
-
 
K
K
 
K
G
 
G
K
 
V
V
 
R
I
 
V
V
 
V
N
 
N
P
 
C
A
 
A
R
 
R
A
 
G
E
 
G
I
 
I
I
 
V
E
 
D
E
 
E
D
 
G
V
 
A
Y
 
L
R
 
L
K
 
R
F
 
A
-
 
L
-
 
Q
D
 
S
G
 
G
I
 
Q
I
 
C
A
 
A
A
 
G
D
 
A
V
 
A
L
 
L
-
 
D
-
 
V
-
 
F
-
 
T
-
 
E
-
 
E
P
 
P
N
 
P
W
 
R
D
 
D
-
 
R
-
 
A
L
 
L
A
 
V
K
 
D
K
 
H
E
 
E
N
 
N
I
 
V
I
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
M
 
L
A
 
G
Y
 
A
Y
 
S
T
 
T
E
 
K
E
 
E
A
 
A
L
 
Q
K
 
S
R
 
R
I
 
C

6plfA Crystal structure of human phgdh complexed with compound 1 (see paper)
28% identity, 89% coverage: 18:294/310 of query aligns to 17:305/305 of 6plfA

query
sites
6plfA
K
 
K
S
 
I
L
 
L
K
 
Q
D
 
D
K
 
G
N
 
G
V
 
L
E
 
Q
L
 
V
F
 
V
F
 
E
F
 
K
E
 
Q
K
 
N
T
 
L
V
 
S
K
 
K
E
 
E
-
 
E
V
 
L
L
 
I
E
 
A
K
 
E
P
 
L
M
 
Q
N
 
D
F
 
C
D
 
E
V
 
G
I
 
L
S
 
I
V
 
V
F
 
R
Y
 
S
T
 
A
S
 
T
K
 
K
I
 
V
D
 
T
K
 
A
D
 
D
V
 
V
L
 
I
N
 
N
K
 
A
L
 
A
P
 
E
N
 
K
L
 
L
K
 
Q
Y
 
V
I
 
V
Q
 
G
T
 
R
R
 
A
S
 
G
T
 
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
H
 
N
L
 
V
D
 
D
L
 
L
V
 
E
E
 
A
I
 
A
Y
 
T
K
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
L
A
 
V
S
 
M
N
 
N
V
 
T
V
 
P
G
 
N
Y
 
G
A
 
N
G
 
S
P
 
L
C
 
S
V
 
A
G
 
A
E
 
E
F
 
L
A
 
T
Y
 
C
G
 
G
L
 
M
L
 
I
L
 
M
E
 
C
A
 
L
I
 
A
R
 
R
K
 
Q
L
 
I
Y
 
P
V
 
Q
A
 
A
I
 
T
V
 
A
R
 
S
L
 
M
K
 
K
W
 
D
G
 
G
C
 
K
R
 
W
E
 
E
Y
 
R
E
 
K
D
 
K
L
 
F
K
 
M
G
 
G
I
 
T
E
 
E
I
 
L
E
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
I
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
T
 
R
I
 
I
G
 
G
T
 
R
Q
 
E
M
 
V
A
 
A
K
 
T
I
 
R
A
 
M
K
 
Q
G
 
S
F
 
F
N
 
G
A
 
M
K
 
K
T
 
T
I
 
I
G
 
G
L
x
Y
N
x
D
R
x
P
S
 
I
Y
 
I
K
 
S
K
 
P
E
 
E
F
 
V
D
 
S
D
 
A
L
 
S
V
 
F
D
 
G
E
 
V
F
 
Q
T
 
Q
Q
 
L
N
 
P
L
|
L
D
 
E
Y
 
E
V
 
I
L
 
W
E
 
P
K
 
L
S
 
C
D
 
D
F
 
F
L
 
I
F
 
T
I
 
V
A
x
H
L
x
T
P
|
P
L
 
L
T
 
L
P
 
P
S
 
S
T
 
T
K
 
T
N
 
G
L
|
L
I
 
L
N
 
N
K
 
D
E
 
N
N
 
T
I
 
F
K
 
A
K
 
Q
F
 
C
-
 
K
K
 
K
G
 
G
K
 
V
V
 
R
I
 
V
V
 
V
N
 
N
P
 
C
A
 
A
R
 
R
A
 
G
E
 
G
I
 
I
I
 
V
E
 
D
E
 
E
D
 
G
V
 
A
Y
 
L
R
 
L
K
 
R
F
 
A
-
 
L
-
 
Q
D
 
S
G
 
G
I
 
Q
I
 
C
A
 
A
A
 
G
D
 
A
V
 
A
L
 
L
-
 
D
-
 
V
-
 
F
-
 
T
-
 
E
-
 
E
P
 
P
N
 
P
W
 
R
D
 
D
-
 
R
-
 
A
L
 
L
A
 
V
K
 
D
K
 
H
E
 
E
N
 
N
I
 
V
I
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
M
 
L
A
 
G
Y
 
A
Y
 
S
T
 
T
E
 
K
E
 
E
A
 
A
L
 
Q
K
 
S
R
 
R
I
 
C
M
 
G
Q
 
E
I
 
E
S
 
I
L
 
A
E
 
V
N
 
Q
L
 
F
L
 
V
D
 
D
F
 
M
L
 
V
D
 
K
G
 
G

7ewhA Crystal structure of human phgdh in complex with homoharringtonine (see paper)
29% identity, 85% coverage: 18:280/310 of query aligns to 16:290/302 of 7ewhA

query
sites
7ewhA
K
 
K
S
 
I
L
 
L
K
 
Q
D
 
D
K
 
G
N
 
G
V
 
L
E
 
Q
L
 
V
F
 
V
F
 
E
F
 
K
E
 
Q
K
 
N
T
 
L
V
 
S
K
 
K
E
 
E
-
 
E
V
 
L
L
 
I
E
 
A
K
 
E
P
 
L
M
 
Q
N
 
D
F
 
C
D
 
E
V
 
G
I
 
L
S
 
I
V
 
V
F
 
R
Y
 
S
T
 
A
S
 
T
K
 
K
I
 
V
D
 
T
K
 
A
D
 
D
V
 
V
L
 
I
N
 
N
K
 
A
L
 
A
P
 
E
N
 
K
L
 
L
K
 
Q
Y
 
V
I
 
V
Q
 
G
T
 
R
R
 
A
S
 
G
T
 
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
H
 
N
L
 
V
D
 
D
L
 
L
V
 
E
E
 
A
I
 
A
Y
 
T
K
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
L
A
 
V
S
 
M
N
 
N
V
 
T
V
 
P
G
 
N
Y
 
G
A
 
N
G
 
S
P
 
L
C
 
S
V
 
A
G
 
A
E
 
E
F
 
L
A
 
T
Y
 
C
G
 
G
L
 
M
L
 
I
L
 
M
E
 
C
A
 
L
I
 
A
R
 
R
K
 
Q
L
 
I
Y
 
P
V
 
Q
A
 
A
I
 
T
V
 
A
R
 
S
L
 
M
K
 
K
W
 
D
G
 
G
C
 
K
R
 
W
E
 
E
Y
 
R
E
 
K
D
 
K
L
 
F
K
 
M
G
 
G
I
 
T
E
 
E
I
 
L
E
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
I
 
L
G
 
G
I
 
I
L
|
L
G
|
G
L
|
L
G
|
G
T
x
R
I
|
I
G
|
G
T
 
R
Q
 
E
M
 
V
A
 
A
K
 
T
I
 
R
A
 
M
K
 
Q
G
 
S
F
 
F
N
 
G
A
 
M
K
 
K
T
 
T
I
 
I
G
 
G
L
 
Y
N
x
D
R
 
P
S
 
I
Y
 
I
K
 
S
K
 
P
E
 
E
F
 
V
D
 
S
D
 
A
L
 
S
V
 
F
D
 
G
E
 
V
F
 
Q
T
 
Q
Q
 
L
N
 
P
L
 
L
D
 
E
Y
 
E
V
 
I
L
 
W
E
 
P
K
 
L
S
 
C
D
 
D
F
 
F
L
 
I
F
 
T
I
 
V
A
x
H
L
x
T
P
|
P
L
 
L
T
 
L
P
 
P
S
 
S
T
 
T
K
 
T
N
 
G
L
 
L
I
 
L
N
 
N
K
 
D
E
 
N
N
 
T
I
 
F
K
 
A
K
 
Q
F
 
C
-
 
K
K
 
K
G
 
G
K
 
V
V
 
R
I
 
V
V
 
V
N
 
N
P
 
C
A
 
A
R
 
R
A
 
G
E
 
G
I
 
I
I
 
V
E
 
D
E
 
E
D
 
G
V
 
A
Y
 
L
R
 
L
K
 
R
F
 
A
-
 
L
-
 
Q
D
 
S
G
 
G
I
 
Q
I
 
C
A
 
A
A
 
G
D
 
A
V
 
A
L
 
L
-
 
D
-
 
V
-
 
F
-
 
T
-
 
E
-
 
E
P
 
P
N
 
P
W
 
R
D
 
D
-
 
R
-
 
A
L
 
L
A
 
V
K
 
D
K
 
H
E
 
E
N
 
N
I
 
V
I
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
M
 
L
A
 
G
Y
 
A
Y
 
S
T
 
T
E
 
K
E
 
E
A
 
A
L
 
Q
K
 
S
R
 
R
I
 
C

6rihA Crystal structure of phgdh in complex with compound 9 (see paper)
29% identity, 85% coverage: 18:280/310 of query aligns to 16:290/302 of 6rihA

query
sites
6rihA
K
 
K
S
 
I
L
 
L
K
 
Q
D
 
D
K
 
G
N
 
G
V
 
L
E
 
Q
L
 
V
F
 
V
F
 
E
F
 
K
E
 
Q
K
 
N
T
 
L
V
 
S
K
 
K
E
 
E
-
 
E
V
 
L
L
 
I
E
 
A
K
 
E
P
 
L
M
 
Q
N
 
D
F
 
C
D
 
E
V
 
G
I
 
L
S
 
I
V
 
V
F
 
R
Y
 
S
T
 
A
S
 
T
K
 
K
I
 
V
D
 
T
K
 
A
D
 
D
V
 
V
L
 
I
N
 
N
K
 
A
L
 
A
P
 
E
N
 
K
L
 
L
K
 
Q
Y
 
V
I
 
V
Q
 
G
T
 
R
R
 
A
S
 
G
T
 
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
H
 
N
L
 
V
D
 
D
L
 
L
V
 
E
E
 
A
I
 
A
Y
 
T
K
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
L
A
 
V
S
 
M
N
 
N
V
 
T
V
 
P
G
 
N
Y
 
G
A
 
N
G
 
S
P
 
L
C
 
S
V
 
A
G
 
A
E
 
E
F
 
L
A
 
T
Y
 
C
G
 
G
L
 
M
L
 
I
L
 
M
E
 
C
A
 
L
I
 
A
R
 
R
K
 
Q
L
 
I
Y
 
P
V
 
Q
A
 
A
I
 
T
V
 
A
R
 
S
L
 
M
K
 
K
W
 
D
G
 
G
C
 
K
R
 
W
E
 
E
Y
 
R
E
 
K
D
 
K
L
 
F
K
 
M
G
 
G
I
 
T
E
 
E
I
 
L
E
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
I
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
|
G
T
 
R
I
 
I
G
 
G
T
 
R
Q
 
E
M
 
V
A
 
A
K
 
T
I
 
R
A
 
M
K
 
Q
G
 
S
F
 
F
N
 
G
A
 
M
K
 
K
T
 
T
I
 
I
G
 
G
L
x
Y
N
x
D
R
x
P
S
x
I
Y
x
I
K
 
S
K
 
P
E
 
E
F
 
V
D
 
S
D
 
A
L
 
S
V
 
F
D
 
G
E
 
V
F
 
Q
T
 
Q
Q
 
L
N
 
P
L
 
L
D
 
E
Y
 
E
V
 
I
L
 
W
E
 
P
K
 
L
S
 
C
D
 
D
F
 
F
L
 
I
F
 
T
I
 
V
A
 
H
L
x
T
P
|
P
L
 
L
T
 
L
P
 
P
S
 
S
T
 
T
K
 
T
N
 
G
L
|
L
I
 
L
N
 
N
K
 
D
E
 
N
N
 
T
I
 
F
K
 
A
K
 
Q
F
 
C
-
 
K
K
 
K
G
 
G
K
 
V
V
 
R
I
 
V
V
 
V
N
 
N
P
 
C
A
 
A
R
 
R
A
 
G
E
 
G
I
 
I
I
 
V
E
 
D
E
 
E
D
 
G
V
 
A
Y
 
L
R
 
L
K
 
R
F
 
A
-
 
L
-
 
Q
D
 
S
G
 
G
I
 
Q
I
 
C
A
 
A
A
 
G
D
 
A
V
 
A
L
 
L
-
 
D
-
 
V
-
 
F
-
 
T
-
 
E
-
 
E
P
 
P
N
 
P
W
 
R
D
 
D
-
 
R
-
 
A
L
 
L
A
 
V
K
 
D
K
 
H
E
 
E
N
 
N
I
 
V
I
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
M
 
L
A
 
G
Y
 
A
Y
 
S
T
 
T
E
 
K
E
 
E
A
 
A
L
 
Q
K
 
S
R
 
R
I
 
C

6rj5A Crystal structure of phgdh in complex with compound 39 (see paper)
29% identity, 85% coverage: 18:280/310 of query aligns to 16:290/301 of 6rj5A

query
sites
6rj5A
K
 
K
S
 
I
L
 
L
K
 
Q
D
 
D
K
 
G
N
 
G
V
 
L
E
 
Q
L
 
V
F
 
V
F
 
E
F
 
K
E
 
Q
K
 
N
T
 
L
V
 
S
K
 
K
E
 
E
-
 
E
V
 
L
L
 
I
E
 
A
K
 
E
P
 
L
M
 
Q
N
 
D
F
 
C
D
 
E
V
 
G
I
 
L
S
 
I
V
 
V
F
 
R
Y
 
S
T
 
A
S
 
T
K
 
K
I
 
V
D
 
T
K
 
A
D
 
D
V
 
V
L
 
I
N
 
N
K
 
A
L
 
A
P
 
E
N
 
K
L
 
L
K
 
Q
Y
 
V
I
 
V
Q
 
G
T
 
R
R
 
A
S
 
G
T
 
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
H
 
N
L
 
V
D
 
D
L
 
L
V
 
E
E
 
A
I
 
A
Y
 
T
K
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
L
A
 
V
S
 
M
N
 
N
V
 
T
V
 
P
G
 
N
Y
 
G
A
 
N
G
 
S
P
 
L
C
 
S
V
 
A
G
 
A
E
 
E
F
 
L
A
 
T
Y
 
C
G
 
G
L
 
M
L
 
I
L
 
M
E
 
C
A
 
L
I
 
A
R
 
R
K
 
Q
L
 
I
Y
 
P
V
 
Q
A
 
A
I
 
T
V
 
A
R
 
S
L
 
M
K
 
K
W
 
D
G
 
G
C
 
K
R
 
W
E
 
E
Y
 
R
E
 
K
D
 
K
L
 
F
K
 
M
G
 
G
I
 
T
E
 
E
I
 
L
E
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
I
 
L
G
 
G
I
 
I
L
|
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
T
 
R
I
 
I
G
 
G
T
 
R
Q
 
E
M
 
V
A
 
A
K
 
T
I
 
R
A
 
M
K
 
Q
G
 
S
F
 
F
N
 
G
A
 
M
K
 
K
T
 
T
I
 
I
G
 
G
L
x
Y
N
x
D
R
x
P
S
 
I
Y
x
I
K
 
S
K
 
P
E
 
E
F
 
V
D
 
S
D
 
A
L
 
S
V
 
F
D
 
G
E
 
V
F
 
Q
T
 
Q
Q
 
L
N
 
P
L
 
L
D
 
E
Y
 
E
V
 
I
L
 
W
E
 
P
K
 
L
S
 
C
D
 
D
F
 
F
L
 
I
F
 
T
I
 
V
A
x
H
L
x
T
P
|
P
L
 
L
T
 
L
P
 
P
S
 
S
T
 
T
K
 
T
N
 
G
L
|
L
I
 
L
N
 
N
K
 
D
E
 
N
N
 
T
I
 
F
K
 
A
K
 
Q
F
 
C
-
 
K
K
 
K
G
 
G
K
 
V
V
 
R
I
 
V
V
 
V
N
 
N
P
 
C
A
 
A
R
 
R
A
 
G
E
 
G
I
 
I
I
 
V
E
 
D
E
 
E
D
 
G
V
 
A
Y
 
L
R
 
L
K
 
R
F
 
A
-
 
L
-
 
Q
D
 
S
G
 
G
I
 
Q
I
 
C
A
 
A
A
 
G
D
 
A
V
 
A
L
 
L
-
 
D
-
 
V
-
 
F
-
 
T
-
 
E
-
 
E
P
 
P
N
 
P
W
 
R
D
 
D
-
 
R
-
 
A
L
 
L
A
 
V
K
 
D
K
 
H
E
 
E
N
 
N
I
 
V
I
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
M
 
L
A
 
G
Y
 
A
Y
 
S
T
 
T
E
 
K
E
 
E
A
 
A
L
 
Q
K
 
S
R
 
R
I
 
C

6plgA Crystal structure of human phgdh complexed with compound 15 (see paper)
29% identity, 85% coverage: 18:280/310 of query aligns to 16:290/303 of 6plgA

query
sites
6plgA
K
 
K
S
 
I
L
 
L
K
 
Q
D
 
D
K
 
G
N
 
G
V
 
L
E
 
Q
L
 
V
F
 
V
F
 
E
F
 
K
E
 
Q
K
 
N
T
 
L
V
 
S
K
 
K
E
 
E
-
 
E
V
 
L
L
 
I
E
 
A
K
 
E
P
 
L
M
 
Q
N
 
D
F
 
C
D
 
E
V
 
G
I
 
L
S
 
I
V
 
V
F
 
R
Y
 
S
T
 
A
S
 
T
K
 
K
I
 
V
D
 
T
K
 
A
D
 
D
V
 
V
L
 
I
N
 
N
K
 
A
L
 
A
P
 
E
N
 
K
L
 
L
K
 
Q
Y
 
V
I
 
V
Q
 
G
T
 
R
R
 
A
S
 
G
T
 
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
H
 
N
L
 
V
D
 
D
L
 
L
V
 
E
E
 
A
I
 
A
Y
 
T
K
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
L
A
 
V
S
 
M
N
 
N
V
 
T
V
 
P
G
 
N
Y
 
G
A
 
N
G
 
S
P
 
L
C
 
S
V
 
A
G
 
A
E
 
E
F
 
L
A
 
T
Y
 
C
G
 
G
L
 
M
L
 
I
L
 
M
E
 
C
A
 
L
I
 
A
R
 
R
K
 
Q
L
 
I
Y
 
P
V
 
Q
A
 
A
I
 
T
V
 
A
R
 
S
L
 
M
K
 
K
W
 
D
G
 
G
C
 
K
R
 
W
E
 
E
Y
 
R
E
 
K
D
 
K
L
 
F
K
 
M
G
 
G
I
 
T
E
 
E
I
 
L
E
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
I
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
|
G
T
x
R
I
 
I
G
 
G
T
 
R
Q
 
E
M
 
V
A
 
A
K
 
T
I
 
R
A
 
M
K
 
Q
G
 
S
F
 
F
N
 
G
A
 
M
K
 
K
T
 
T
I
 
I
G
 
G
L
 
Y
N
x
D
R
x
P
S
x
I
Y
x
I
K
 
S
K
 
P
E
 
E
F
 
V
D
 
S
D
 
A
L
 
S
V
 
F
D
 
G
E
 
V
F
 
Q
T
 
Q
Q
 
L
N
 
P
L
 
L
D
 
E
Y
 
E
V
 
I
L
 
W
E
 
P
K
 
L
S
 
C
D
 
D
F
 
F
L
 
I
F
 
T
I
 
V
A
x
H
L
x
T
P
 
P
L
 
L
T
x
L
P
 
P
S
 
S
T
 
T
K
 
T
N
 
G
L
 
L
I
 
L
N
 
N
K
 
D
E
 
N
N
 
T
I
 
F
K
 
A
K
 
Q
F
 
C
-
 
K
K
 
K
G
 
G
K
 
V
V
 
R
I
 
V
V
 
V
N
 
N
P
 
C
A
 
A
R
 
R
A
 
G
E
 
G
I
 
I
I
 
V
E
 
D
E
 
E
D
 
G
V
 
A
Y
 
L
R
 
L
K
 
R
F
 
A
-
 
L
-
 
Q
D
 
S
G
 
G
I
 
Q
I
 
C
A
 
A
A
 
G
D
 
A
V
 
A
L
 
L
-
 
D
-
 
V
-
 
F
-
 
T
-
 
E
-
 
E
P
 
P
N
 
P
W
 
R
D
 
D
-
 
R
-
 
A
L
 
L
A
 
V
K
 
D
K
 
H
E
 
E
N
 
N
I
 
V
I
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
M
 
L
A
 
G
Y
 
A
Y
 
S
T
 
T
E
 
K
E
 
E
A
 
A
L
 
Q
K
 
S
R
 
R
I
 
C

6cwaA Crystal structure phgdh in complex with nadh and 3-phosphoglycerate at 1.77 a resolution (see paper)
29% identity, 85% coverage: 18:280/310 of query aligns to 15:289/299 of 6cwaA

query
sites
6cwaA
K
 
K
S
 
I
L
 
L
K
 
Q
D
 
D
K
 
G
N
 
G
V
 
L
E
 
Q
L
 
V
F
 
V
F
 
E
F
 
K
E
 
Q
K
 
N
T
 
L
V
 
S
K
 
K
E
 
E
-
 
E
V
 
L
L
 
I
E
 
A
K
 
E
P
 
L
M
 
Q
N
 
D
F
 
C
D
 
E
V
 
G
I
 
L
S
 
I
V
 
V
F
 
R
Y
 
S
T
 
A
S
 
T
K
 
K
I
 
V
D
 
T
K
 
A
D
 
D
V
 
V
L
 
I
N
 
N
K
 
A
L
 
A
P
 
E
N
 
K
L
 
L
K
 
Q
Y
 
V
I
 
V
Q
 
G
T
 
R
R
 
A
S
 
G
T
 
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
H
 
N
L
 
V
D
 
D
L
 
L
V
 
E
E
 
A
I
 
A
Y
 
T
K
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
L
A
 
V
S
 
M
N
 
N
V
 
T
V
 
P
G
 
N
Y
 
G
A
x
N
G
 
S
P
 
L
C
 
S
V
x
A
G
 
A
E
 
E
F
 
L
A
 
T
Y
 
C
G
 
G
L
 
M
L
 
I
L
 
M
E
 
C
A
 
L
I
 
A
R
 
R
K
 
Q
L
 
I
Y
 
P
V
 
Q
A
 
A
I
 
T
V
 
A
R
 
S
L
 
M
K
 
K
W
 
D
G
 
G
C
 
K
R
 
W
E
 
E
Y
 
R
E
 
K
D
 
K
L
 
F
K
 
M
G
 
G
I
 
T
E
 
E
I
 
L
E
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
I
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
T
x
R
I
|
I
G
 
G
T
 
R
Q
 
E
M
 
V
A
 
A
K
 
T
I
 
R
A
 
M
K
 
Q
G
 
S
F
 
F
N
 
G
A
 
M
K
 
K
T
 
T
I
 
I
G
 
G
L
x
Y
N
x
D
R
x
P
S
x
I
Y
 
I
K
 
S
K
 
P
E
 
E
F
 
V
D
 
S
D
 
A
L
 
S
V
 
F
D
 
G
E
 
V
F
 
Q
T
 
Q
Q
 
L
N
 
P
L
 
L
D
 
E
Y
 
E
V
 
I
L
 
W
E
 
P
K
 
L
S
 
C
D
 
D
F
 
F
L
 
I
F
 
T
I
 
V
A
x
H
L
x
T
P
|
P
L
 
L
T
 
L
P
 
P
S
 
S
T
|
T
K
 
T
N
 
G
L
 
L
I
 
L
N
 
N
K
 
D
E
 
N
N
 
T
I
 
F
K
 
A
K
 
Q
F
 
C
-
 
K
K
 
K
G
 
G
K
 
V
V
 
R
I
 
V
V
 
V
N
 
N
P
x
C
A
|
A
R
|
R
A
 
G
E
 
G
I
 
I
I
 
V
E
 
D
E
 
E
D
 
G
V
 
A
Y
 
L
R
 
L
K
 
R
F
 
A
-
 
L
-
 
Q
D
 
S
G
 
G
I
 
Q
I
 
C
A
 
A
A
 
G
D
 
A
V
 
A
L
 
L
-
 
D
-
 
V
-
 
F
-
 
T
-
 
E
-
 
E
P
 
P
N
 
P
W
 
R
D
 
D
-
 
R
-
 
A
L
 
L
A
 
V
K
 
D
K
 
H
E
 
E
N
 
N
I
 
V
I
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
M
 
L
A
x
G
Y
 
A
Y
 
S
T
 
T
E
 
K
E
 
E
A
 
A
L
 
Q
K
 
S
R
 
R
I
 
C

7dkmA Phgdh covalently linked to oridonin (see paper)
29% identity, 85% coverage: 18:280/310 of query aligns to 17:291/306 of 7dkmA

query
sites
7dkmA
K
|
K
S
x
I
L
 
L
K
 
Q
D
 
D
K
 
G
N
 
G
V
 
L
E
 
Q
L
 
V
F
 
V
F
 
E
F
 
K
E
 
Q
K
 
N
T
 
L
V
 
S
K
 
K
E
 
E
-
 
E
V
 
L
L
 
I
E
 
A
K
 
E
P
 
L
M
 
Q
N
 
D
F
 
C
D
 
E
V
 
G
I
 
L
S
 
I
V
 
V
F
 
R
Y
 
S
T
 
A
S
 
T
K
 
K
I
 
V
D
 
T
K
 
A
D
 
D
V
 
V
L
 
I
N
 
N
K
 
A
L
 
A
P
 
E
N
 
K
L
 
L
K
 
Q
Y
 
V
I
 
V
Q
 
G
T
 
R
R
 
A
S
 
G
T
|
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
H
 
N
L
 
V
D
 
D
L
 
L
V
 
E
E
 
A
I
 
A
Y
 
T
K
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
L
A
 
V
S
 
M
N
 
N
V
 
T
V
 
P
G
 
N
Y
 
G
A
 
N
G
 
S
P
 
L
C
 
S
V
x
A
G
 
A
E
 
E
F
 
L
A
 
T
Y
 
C
G
 
G
L
 
M
L
 
I
L
 
M
E
 
C
A
 
L
I
 
A
R
 
R
K
 
Q
L
 
I
Y
 
P
V
 
Q
A
 
A
I
 
T
V
 
A
R
 
S
L
 
M
K
 
K
W
 
D
G
 
G
C
 
K
R
 
W
E
 
E
Y
 
R
E
 
K
D
 
K
L
 
F
K
 
M
G
 
G
I
 
T
E
 
E
I
 
L
E
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
I
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
|
G
L
 
L
G
 
G
T
x
R
I
|
I
G
 
G
T
 
R
Q
 
E
M
 
V
A
 
A
K
 
T
I
 
R
A
 
M
K
 
Q
G
 
S
F
 
F
N
 
G
A
 
M
K
 
K
T
 
T
I
 
I
G
 
G
L
x
Y
N
x
D
R
x
P
S
x
I
Y
 
I
K
 
S
K
 
P
E
 
E
F
 
V
D
 
S
D
 
A
L
 
S
V
 
F
D
 
G
E
 
V
F
 
Q
T
 
Q
Q
 
L
N
 
P
L
 
L
D
 
E
Y
 
E
V
 
I
L
 
W
E
 
P
K
 
L
S
 
C
D
 
D
F
 
F
L
 
I
F
 
T
I
 
V
A
x
H
L
x
T
P
|
P
L
 
L
T
 
L
P
 
P
S
 
S
T
|
T
K
 
T
N
 
G
L
 
L
I
 
L
N
 
N
K
 
D
E
 
N
N
 
T
I
 
F
K
 
A
K
 
Q
F
 
C
-
 
K
K
 
K
G
 
G
K
 
V
V
 
R
I
 
V
V
 
V
N
 
N
P
x
C
A
|
A
R
|
R
A
 
G
E
 
G
I
 
I
I
 
V
E
 
D
E
 
E
D
 
G
V
 
A
Y
 
L
R
 
L
K
 
R
F
 
A
-
 
L
-
 
Q
D
 
S
G
 
G
I
 
Q
I
 
C
A
 
A
A
 
G
D
 
A
V
 
A
L
 
L
-
 
D
-
 
V
-
 
F
-
 
T
-
 
E
-
 
E
P
 
P
N
 
P
W
 
R
D
 
D
-
 
R
-
 
A
L
 
L
A
 
V
K
 
D
K
 
H
E
 
E
N
 
N
I
 
V
I
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
M
 
L
A
x
G
Y
 
A
Y
 
S
T
 
T
E
 
K
E
 
E
A
 
A
L
 
Q
K
 
S
R
 
R
I
 
C

Sites not aligning to the query:

6rj2A Crystal structure of phgdh in complex with compound 40 (see paper)
29% identity, 85% coverage: 18:280/310 of query aligns to 13:287/299 of 6rj2A

query
sites
6rj2A
K
 
K
S
 
I
L
 
L
K
 
Q
D
 
D
K
 
G
N
 
G
V
 
L
E
 
Q
L
 
V
F
 
V
F
 
E
F
 
K
E
 
Q
K
 
N
T
 
L
V
 
S
K
 
K
E
 
E
-
 
E
V
 
L
L
 
I
E
 
A
K
 
E
P
 
L
M
 
Q
N
 
D
F
 
C
D
 
E
V
 
G
I
 
L
S
 
I
V
 
V
F
 
R
Y
 
S
T
 
A
S
 
T
K
 
K
I
 
V
D
 
T
K
 
A
D
 
D
V
 
V
L
 
I
N
 
N
K
 
A
L
 
A
P
 
E
N
 
K
L
 
L
K
 
Q
Y
 
V
I
 
V
Q
 
G
T
 
R
R
 
A
S
 
G
T
 
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
H
 
N
L
 
V
D
 
D
L
 
L
V
 
E
E
 
A
I
 
A
Y
 
T
K
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
L
A
 
V
S
 
M
N
 
N
V
 
T
V
 
P
G
 
N
Y
 
G
A
 
N
G
 
S
P
 
L
C
 
S
V
 
A
G
 
A
E
 
E
F
 
L
A
 
T
Y
 
C
G
 
G
L
 
M
L
 
I
L
 
M
E
 
C
A
 
L
I
 
A
R
 
R
K
 
Q
L
 
I
Y
 
P
V
 
Q
A
 
A
I
 
T
V
 
A
R
 
S
L
 
M
K
 
K
W
 
D
G
 
G
C
 
K
R
 
W
E
 
E
Y
 
R
E
 
K
D
 
K
L
 
F
K
 
M
G
 
G
I
 
T
E
 
E
I
 
L
E
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
I
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
|
G
T
 
R
I
|
I
G
 
G
T
 
R
Q
 
E
M
 
V
A
 
A
K
 
T
I
 
R
A
 
M
K
 
Q
G
 
S
F
 
F
N
 
G
A
 
M
K
 
K
T
 
T
I
 
I
G
 
G
L
x
Y
N
x
D
R
x
P
S
x
I
Y
x
I
K
 
S
K
 
P
E
 
E
F
 
V
D
 
S
D
 
A
L
 
S
V
 
F
D
 
G
E
 
V
F
 
Q
T
 
Q
Q
 
L
N
 
P
L
 
L
D
 
E
Y
 
E
V
 
I
L
 
W
E
 
P
K
 
L
S
 
C
D
 
D
F
 
F
L
 
I
F
 
T
I
 
V
A
x
H
L
x
T
P
 
P
L
 
L
T
 
L
P
 
P
S
 
S
T
 
T
K
 
T
N
 
G
L
|
L
I
 
L
N
 
N
K
 
D
E
 
N
N
 
T
I
 
F
K
 
A
K
 
Q
F
 
C
-
 
K
K
 
K
G
 
G
K
 
V
V
 
R
I
 
V
V
 
V
N
 
N
P
 
C
A
 
A
R
|
R
A
 
G
E
 
G
I
 
I
I
 
V
E
 
D
E
 
E
D
 
G
V
 
A
Y
 
L
R
 
L
K
 
R
F
 
A
-
 
L
-
 
Q
D
 
S
G
 
G
I
 
Q
I
 
C
A
 
A
A
 
G
D
 
A
V
 
A
L
 
L
-
 
D
-
 
V
-
 
F
-
 
T
-
 
E
-
 
E
P
 
P
N
 
P
W
 
R
D
 
D
-
 
R
-
 
A
L
 
L
A
 
V
K
 
D
K
 
H
E
 
E
N
 
N
I
 
V
I
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
M
 
L
A
 
G
Y
 
A
Y
 
S
T
 
T
E
 
K
E
 
E
A
 
A
L
 
Q
K
 
S
R
 
R
I
 
C

8grvA Dictyostelium discoideum lactate dehydrogenase (dicldha)with NAD
28% identity, 97% coverage: 1:301/310 of query aligns to 3:331/336 of 8grvA

query
sites
8grvA
M
 
M
K
 
K
I
 
I
A
 
T
F
 
L
F
 
F
D
 
S
I
 
S
K
 
K
P
 
P
Y
 
Y
E
 
W
R
 
V
E
 
K
F
 
W
F
 
F
E
 
N
K
 
E
S
 
-
L
 
L
K
 
N
D
 
K
K
 
F
N
 
S
V
 
Y
E
 
E
L
 
I
F
 
N
F
 
Y
F
 
V
E
 
T
K
 
S
T
 
A
-
 
C
-
 
D
V
 
I
K
 
K
E
 
S
V
 
V
L
 
N
E
 
E
K
 
A
P
 
K
M
 
G
N
 
S
F
 
-
D
 
E
V
 
A
I
 
V
S
 
C
V
 
C
F
 
F
Y
 
V
T
 
N
S
 
D
K
 
D
I
 
L
D
 
S
K
 
K
D
 
E
V
 
V
L
 
I
N
 
E
K
 
T
L
 
L
P
 
H
N
 
S
-
 
N
-
 
G
L
 
T
K
 
K
Y
 
V
I
 
I
Q
 
L
T
 
M
R
 
R
S
 
C
T
 
A
G
 
G
V
 
F
D
 
N
H
 
K
L
 
V
D
 
D
L
 
L
V
 
D
E
 
T
I
 
A
Y
 
N
K
 
K
R
 
L
G
 
G
I
 
I
I
 
P
A
 
V
S
 
L
N
 
R
V
 
V
V
 
P
G
 
A
Y
 
Y
A
 
S
G
 
P
P
 
N
C
 
A
V
|
V
G
 
S
E
 
E
F
 
Y
A
 
A
Y
 
L
G
 
S
L
 
L
L
 
I
L
 
M
E
 
A
A
 
L
I
 
N
R
 
R
K
 
K
L
 
T
Y
 
H
V
 
K
A
 
A
I
 
H
V
 
D
R
 
R
L
 
V
K
 
R
W
 
D
G
 
A
C
 
N
R
 
F
E
 
E
Y
 
I
E
 
N
D
 
G
L
 
M
K
 
E
G
 
G
I
 
F
E
 
N
I
 
M
E
 
V
G
 
S
K
 
K
T
 
V
I
 
Y
G
 
G
I
 
I
L
 
V
G
 
G
L
 
T
G
|
G
T
x
N
I
|
I
G
 
G
T
 
E
Q
 
Q
M
 
L
A
 
C
K
 
R
I
 
V
A
 
L
K
 
K
-
 
L
G
 
G
F
 
F
N
 
G
A
 
A
K
 
K
T
 
V
I
 
I
G
 
A
L
 
Y
N
x
D
R
x
I
S
x
I
Y
 
E
K
 
N
K
 
K
E
 
A
F
 
V
D
 
T
D
 
D
L
 
I
V
 
G
D
 
I
E
 
E
F
 
Y
T
 
V
Q
 
K
N
 
T
L
 
L
D
 
D
Y
 
E
V
 
I
L
 
W
E
 
K
K
 
Q
S
 
C
D
 
D
F
 
V
L
 
I
F
 
S
I
 
L
A
 
H
L
x
T
P
|
P
L
 
L
T
 
N
P
 
S
S
 
Q
T
|
T
K
 
K
N
 
Y
L
 
M
I
 
V
N
 
N
K
 
S
E
 
E
N
 
S
I
 
I
K
 
E
K
 
K
F
 
M
K
 
R
-
 
D
G
 
G
K
 
V
V
 
M
I
 
I
V
 
I
N
 
N
P
x
V
A
 
S
R
 
R
A
 
G
E
 
A
I
 
L
I
 
V
E
 
N
E
 
A
-
 
S
-
 
D
-
 
A
-
 
I
-
 
V
-
 
G
-
 
L
-
 
K
-
 
S
-
 
G
-
 
K
-
 
I
-
 
S
-
 
S
-
 
L
-
 
G
-
 
M
D
 
D
V
 
V
-
 
Y
-
 
E
-
 
N
-
 
E
-
 
T
-
 
D
-
 
Y
-
 
F
Y
 
Y
R
 
Q
K
 
D
F
 
H
D
 
N
G
 
G
-
 
S
I
 
I
I
 
I
A
 
K
A
 
D
D
 
D
V
 
N
L
 
L
P
 
S
N
 
-
W
 
-
D
 
L
L
 
L
A
 
I
K
 
S
K
 
Y
E
 
P
N
 
N
I
 
V
I
 
M
A
 
I
T
 
T
P
 
S
H
|
H
M
 
Q
A
|
A
Y
x
W
Y
 
Y
T
 
T
E
 
K
E
 
E
A
 
A
L
 
I
K
 
S
R
 
C
I
 
I
M
 
C
Q
 
G
I
 
T
S
 
S
L
 
L
E
 
Q
N
 
N
L
 
F
L
 
V
D
 
D
F
 
F
L
 
R
D
 
S
G
 
N
K
 
Q
T
 
I
P
 
K
R
 
K
N
 
S
C
 
N
L
 
L

6biiA Crystal structure of pyrococcus yayanosii glyoxylate hydroxypyruvate reductase in complex with NADP and malonate (re-refinement of 5aow) (see paper)
31% identity, 84% coverage: 37:297/310 of query aligns to 38:316/332 of 6biiA

query
sites
6biiA
V
 
L
L
 
L
E
 
E
K
 
K
P
 
V
M
 
K
N
 
D
F
 
V
D
 
D
V
 
A
I
 
L
S
 
V
V
 
T
F
 
M
Y
 
L
T
 
S
S
 
E
K
 
K
I
 
I
D
 
D
K
 
R
D
 
E
V
 
V
L
 
F
N
 
D
K
 
A
L
 
A
P
 
P
N
 
R
L
 
L
K
 
R
Y
 
I
I
 
V
Q
 
A
T
 
N
R
 
Y
S
 
A
T
x
V
G
 
G
V
 
Y
D
 
D
H
 
N
L
 
I
D
 
D
L
 
I
V
 
E
E
 
E
I
 
A
Y
 
T
K
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
I
 
Y
A
 
V
S
 
T
N
 
N
V
 
T
V
 
P
G
 
D
Y
 
V
A
x
L
G
 
T
P
 
D
C
 
A
V
x
T
G
 
A
E
 
D
F
 
L
A
 
A
Y
 
W
G
 
A
L
 
L
L
 
L
L
 
L
E
 
A
A
 
A
I
 
A
R
 
R
K
 
H
L
 
V
Y
 
V
V
 
K
A
 
G
-
 
D
-
 
K
-
 
F
I
 
V
V
 
R
R
 
S
L
 
G
K
 
E
W
 
W
G
 
K
C
 
R
R
 
R
-
 
G
-
 
I
-
 
A
-
 
W
E
 
H
Y
 
P
E
 
K
D
 
M
L
 
F
K
 
L
G
 
G
I
 
Y
E
 
D
I
 
V
E
 
Y
G
 
G
K
 
K
T
 
T
I
 
I
G
 
G
I
 
I
L
 
V
G
|
G
L
x
F
G
|
G
T
x
R
I
|
I
G
 
G
T
 
Q
Q
 
A
M
 
I
A
 
A
K
 
K
I
 
R
A
 
A
K
 
K
G
 
G
F
 
F
N
 
G
A
 
M
K
 
R
T
 
I
I
 
L
G
 
Y
L
 
T
N
x
A
R
|
R
S
|
S
Y
 
R
K
|
K
K
 
P
E
 
E
F
 
A
D
 
E
D
 
K
L
 
E
V
 
L
D
 
G
E
 
A
F
 
E
T
 
F
Q
 
K
N
 
P
L
 
L
D
 
E
Y
 
E
V
 
L
L
 
L
E
 
R
K
 
E
S
 
S
D
 
D
F
 
F
L
 
V
F
 
V
I
 
L
A
 
A
L
x
V
P
|
P
L
 
L
T
 
T
P
 
K
S
x
E
T
|
T
K
 
Y
N
 
H
L
 
M
I
 
I
N
 
N
K
 
E
E
 
E
N
 
R
I
 
L
K
 
R
K
 
L
F
 
M
K
 
K
-
 
P
G
 
T
K
 
A
V
 
V
I
 
L
V
 
V
N
 
N
P
x
V
A
|
A
R
|
R
A
 
G
E
 
K
I
 
V
I
 
V
E
 
D
E
 
T
D
 
K
V
 
A
Y
 
L
R
 
I
K
 
R
F
 
A
-
 
L
-
 
K
D
 
E
G
 
G
I
 
W
I
 
I
A
 
A
A
 
A
D
 
A
V
 
G
L
 
L
-
x
D
-
 
V
-
 
F
-
 
E
-
 
E
-
x
E
P
 
P
N
 
Y
W
 
Y
D
 
D
-
 
E
-
 
E
L
 
L
A
 
F
K
 
A
K
 
L
E
 
D
N
 
N
I
 
V
I
 
V
A
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
M
 
I
A
x
G
Y
 
S
Y
 
A
T
 
T
E
 
F
E
 
G
A
 
A
L
 
R
K
 
E
R
 
G
I
 
M
M
 
A
Q
 
E
I
 
L
S
 
V
L
 
A
E
 
K
N
 
N
L
 
L
L
 
I
D
 
A
F
 
F
L
 
K
D
 
N
G
 
G
K
 
E
T
 
V
P
 
P

6plfB Crystal structure of human phgdh complexed with compound 1 (see paper)
31% identity, 72% coverage: 58:280/310 of query aligns to 48:281/292 of 6plfB

query
sites
6plfB
D
 
D
V
 
V
L
 
I
N
 
N
K
 
A
L
 
A
P
 
E
N
 
K
L
 
L
K
 
Q
Y
 
V
I
 
V
Q
 
G
T
 
R
R
 
A
S
 
G
T
 
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
H
 
N
L
 
V
D
 
D
L
 
L
V
 
E
E
 
A
I
 
A
Y
 
T
K
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
L
A
 
V
S
 
M
N
 
N
V
 
T
V
 
P
G
 
N
Y
 
G
A
 
N
G
 
S
P
 
L
C
 
S
V
 
A
G
 
A
E
 
E
F
 
L
A
 
T
Y
 
C
G
 
G
L
 
M
L
 
I
L
 
M
E
 
C
A
 
L
I
 
A
R
 
R
K
 
Q
L
 
I
Y
 
P
V
 
Q
A
 
A
I
 
T
V
 
A
R
 
S
L
 
M
K
 
K
W
 
D
G
 
G
C
 
K
R
 
W
E
 
E
Y
 
R
E
 
K
D
 
K
L
 
F
K
 
M
G
 
G
I
 
T
E
 
E
I
 
L
E
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
I
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
T
x
R
I
 
I
G
 
G
T
 
R
Q
 
E
M
 
V
A
 
A
K
 
T
I
 
R
A
 
M
K
 
Q
G
 
S
F
 
F
N
 
G
A
 
M
K
 
K
T
 
T
I
 
I
G
 
G
L
x
Y
N
x
D
R
x
P
S
 
I
Y
x
I
K
 
S
K
 
P
E
 
E
F
 
V
D
 
S
D
 
A
L
 
S
V
 
F
D
 
G
E
 
V
F
 
Q
T
 
Q
Q
 
L
N
 
P
L
|
L
D
 
E
Y
 
E
V
 
I
L
 
W
E
 
P
K
 
L
S
 
C
D
 
D
F
 
F
L
 
I
F
 
T
I
 
V
A
 
H
L
x
T
P
|
P
L
 
L
T
 
L
P
 
P
S
|
S
T
 
T
K
 
T
N
 
G
L
|
L
I
 
L
N
 
N
K
 
D
E
 
N
N
 
T
I
 
F
K
 
A
K
 
Q
F
 
C
-
 
K
K
 
K
G
 
G
K
 
V
V
 
R
I
 
V
V
 
V
N
 
N
P
 
C
A
 
A
R
 
R
A
 
G
E
 
G
I
 
I
I
 
V
E
 
D
E
 
E
D
 
G
V
 
A
Y
 
L
R
 
L
K
 
R
F
 
A
-
 
L
-
 
Q
D
 
S
G
 
G
I
 
Q
I
 
C
A
 
A
A
 
G
D
 
A
V
 
A
L
 
L
-
 
D
-
 
V
-
 
F
-
 
T
-
 
E
-
 
E
P
 
P
N
 
P
W
 
R
D
 
D
-
 
R
-
 
A
L
 
L
A
 
V
K
 
D
K
 
H
E
 
E
N
 
N
I
 
V
I
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
M
 
L
A
 
G
Y
 
A
Y
 
S
T
 
T
E
 
K
E
 
E
A
 
A
L
 
Q
K
 
S
R
 
R
I
 
C

Query Sequence

>WP_007474013.1 NCBI__GCF_000170735.1:WP_007474013.1
MKIAFFDIKPYEREFFEKSLKDKNVELFFFEKTVKEVLEKPMNFDVISVFYTSKIDKDVL
NKLPNLKYIQTRSTGVDHLDLVEIYKRGIIASNVVGYAGPCVGEFAYGLLLEAIRKLYVA
IVRLKWGCREYEDLKGIEIEGKTIGILGLGTIGTQMAKIAKGFNAKTIGLNRSYKKEFDD
LVDEFTQNLDYVLEKSDFLFIALPLTPSTKNLINKENIKKFKGKVIVNPARAEIIEEDVY
RKFDGIIAADVLPNWDLAKKENIIATPHMAYYTEEALKRIMQISLENLLDFLDGKTPRNC
LRVYLEKEHK

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory