SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_007475570.1 NCBI__GCF_000170735.1:WP_007475570.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 14 hits to proteins with known functional sites (download)

1ct9A Crystal structure of asparagine synthetase b from escherichia coli (see paper)
26% identity, 72% coverage: 23:473/630 of query aligns to 26:463/497 of 1ct9A

query
sites
1ct9A
I
 
L
Q
 
M
N
 
R
Y
 
H
R
 
R
G
 
G
P
 
P
D
 
D
D
 
W
Y
 
S
G
 
G
L
 
I
Y
 
Y
F
 
A
D
 
S
N
 
D
G
 
N
V
 
A
H
 
I
L
 
L
G
 
A
H
 
H
N
 
E
R
|
R
L
|
L
S
 
S
I
|
I
L
x
V
D
 
D
L
 
V
S
 
-
D
 
N
A
 
A
G
 
G
H
 
A
Q
 
Q
P
 
P
F
 
L
I
 
Y
S
 
N
E
 
Q
D
 
Q
E
 
K
N
 
T
Y
 
H
V
 
V
I
 
L
V
 
A
Y
 
V
N
|
N
G
|
G
E
|
E
V
 
I
Y
 
Y
N
 
N
F
 
H
K
 
Q
Q
 
A
I
 
L
R
 
R
K
 
A
E
 
E
L
 
Y
E
 
-
K
 
-
L
 
-
G
 
G
E
 
D
R
 
R
-
 
Y
-
 
Q
F
 
F
K
 
Q
S
 
T
N
 
G
S
 
S
D
|
D
T
 
C
E
 
E
V
 
V
I
 
I
L
 
L
K
 
A
S
 
L
Y
 
Y
I
 
Q
H
 
E
W
 
K
G
 
G
I
 
P
E
 
E
K
 
-
S
 
F
I
 
L
E
 
D
K
 
D
F
 
L
R
 
Q
G
 
G
M
 
M
F
 
F
A
 
A
F
 
F
A
 
A
I
 
L
Y
 
Y
D
 
D
K
 
S
L
 
E
N
 
K
K
 
D
K
 
A
I
 
Y
I
 
L
L
 
I
V
 
G
R
 
R
D
 
D
R
 
H
A
 
L
G
 
G
V
 
I
K
 
I
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
Y
 
M
-
 
G
Y
 
Y
I
 
D
D
 
E
G
 
H
N
 
G
E
 
Q
F
 
L
V
 
Y
F
 
V
A
 
A
S
 
S
E
 
E
L
 
M
K
 
K
S
 
A
I
 
L
C
 
-
Q
 
-
Y
 
-
P
 
-
F
 
-
F
 
-
K
 
-
K
 
-
E
 
-
L
 
-
N
 
-
K
 
-
N
 
-
I
 
-
L
 
-
P
 
-
Y
 
-
Y
 
-
F
 
-
Q
 
-
F
 
-
G
 
-
Y
 
-
I
 
V
P
 
P
A
 
-
P
 
-
F
 
-
S
 
-
I
 
V
Y
 
C
K
 
R
N
 
T
C
 
I
Y
 
K
K
 
E
L
 
F
E
 
P
P
 
A
G
 
G
H
 
S
Y
 
Y
L
 
L
-
 
W
E
 
S
Y
 
Q
D
 
D
L
 
G
N
 
E
N
 
I
N
 
R
R
 
S
Y
 
Y
H
 
Y
I
 
H
T
 
R
K
 
D
Y
 
W
W
 
F
D
 
D
I
 
Y
D
 
D
N
 
A
C
 
V
Y
 
-
L
 
-
Q
 
-
E
 
-
K
 
K
I
 
D
D
 
N
A
 
V
N
 
T
E
 
D
K
 
K
E
 
-
I
 
-
L
 
-
N
 
N
D
 
E
L
 
L
E
 
R
N
 
Q
I
 
A
L
 
L
E
 
E
E
 
D
S
 
S
F
 
V
N
 
K
L
 
S
R
 
H
M
 
L
I
 
M
A
 
S
D
 
D
V
 
V
P
 
P
V
 
Y
G
 
G
V
 
V
F
x
L
L
|
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
I
 
L
D
 
D
S
|
S
S
 
S
L
 
I
V
 
I
T
 
S
A
 
A
I
 
I
L
 
-
S
 
T
K
 
K
K
 
K
Y
 
Y
K
 
A
L
 
L
N
 
H
T
 
S
F
 
F
T
x
A
I
x
V
G
 
G
F
 
L
D
 
P
D
 
G
K
 
S
R
 
-
Y
 
-
D
 
P
E
x
D
A
 
L
S
 
K
H
 
A
A
 
A
K
 
Q
I
 
E
V
 
V
A
 
A
N
 
N
Y
 
H
F
 
L
K
 
G
T
 
T
N
 
V
H
 
H
N
 
H
E
 
E
L
 
I
Y
 
H
I
 
F
N
 
T
E
 
V
T
 
Q
M
 
E
M
 
G
L
 
L
K
 
D
K
 
A
I
 
I
E
 
R
K
 
D
L
 
V
P
 
I
Y
 
Y
Y
 
H
-
 
I
-
 
E
-
 
T
Y
 
Y
D
 
D
E
 
V
P
x
T
F
 
T
G
 
I
D
x
R
S
 
A
S
 
S
S
 
T
I
 
P
P
 
M
T
 
Y
M
 
L
L
x
M
V
 
S
S
 
R
E
 
K
L
 
I
A
 
K
K
 
A
K
 
M
Q
 
G
V
 
I
T
 
K
V
 
M
S
 
V
L
 
L
S
|
S
A
x
G
D
x
E
G
 
G
G
 
S
D
 
D
E
 
E
I
 
V
F
 
F
C
 
G
G
 
G
Y
 
Y
-
 
L
-
 
Y
-
 
F
-
 
H
-
 
K
-
 
A
-
 
P
-
 
N
-
 
A
-
 
K
-
 
E
-
 
L
-
 
H
-
 
E
-
 
E
-
 
T
-
 
V
S
 
R
K
 
K
Y
 
L
F
 
L
A
 
A
L
 
L
N
 
H
K
x
M
I
 
Y
N
 
D
R
 
C
L
 
A
F
 
R
S
 
A
N
 
N
K
 
K
L
 
A
K
 
M
K
 
S
K
 
A
F
 
W
-
 
G
I
 
V
K
 
E
L
 
A
S
 
R
V
 
V
N
 
P
L
 
F
L
 
L
E
 
D
E
 
K
N
 
K
I
 
F
V
 
L
E
 
D
K
 
V
L
 
A
N
 
M
E
 
R
L
 
I
L
 
N
P
 
P
-
 
Q
-
 
D
-
 
K
-
 
M
S
 
C
K
 
K
I
 
M
K
 
E
Q
 
K
R
 
H
N
 
I
I
 
L
K
 
R
D
 
E
K
 
C
F
 
F
N
 
E
K
 
A
F
 
Y
K
 
L
R
 
P
A
 
A
I
 
S
N
 
V
S
 
A
N
 
W
S
 
R
F
 
Q
E
 
K
D
 
E
M
 
Q
F
 
F
L
 
S
E
 
D
A
 
G
T
 
V
S
 
G
Y
 
Y
S
 
S
D
 
W
K
 
I
N
 
D
I
 
T
V
 
L
R
 
K
S
 
E
I
 
V
L
 
A
N
 
A
I
 
Q
D
 
Q
I
 
V
N
 
S
K
 
D
K
 
Q
A
 
Q
F
 
L
N
 
E
K
 
T
F
 
A
K
 
R
F
 
F

Sites not aligning to the query:

P22106 Asparagine synthetase B [glutamine-hydrolyzing]; AS-B; EC 6.3.5.4 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
29% identity, 62% coverage: 1:392/630 of query aligns to 1:377/554 of P22106

query
sites
P22106
M
|
M
C
|
C
G
 
S
I
 
I
V
 
F
G
 
G
F
 
V
I
 
F
N
 
D
K
 
I
E
 
K
K
 
T
R
 
D
F
 
A
D
 
V
V
 
E
L
 
L
N
 
R
N
 
K
M
 
K
L
 
A
L
 
L
-
 
E
-
 
L
-
 
S
-
 
R
I
 
L
Q
 
M
N
 
R
Y
x
H
R
 
R
G
 
G
P
 
P
D
|
D
D
 
W
Y
 
S
G
 
G
L
 
I
Y
 
Y
F
 
A
D
 
S
N
 
D
G
 
N
V
 
A
H
 
I
L
 
L
G
 
A
H
 
H
N
 
E
R
 
R
L
 
L
S
 
S
I
 
I
L
 
V
D
 
D
L
 
V
S
 
-
D
 
N
A
 
A
G
 
G
H
 
A
Q
 
Q
P
 
P
F
 
L
I
 
Y
S
 
N
E
 
Q
D
 
Q
E
 
K
N
 
T
Y
 
H
V
 
V
I
 
L
V
 
A
Y
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
I
Y
 
Y
N
 
N
F
x
H
K
 
Q
Q
 
A
I
 
L
R
 
R
K
 
A
E
 
E
L
 
Y
E
 
-
K
 
-
L
 
-
G
 
G
E
 
D
R
 
R
-
 
Y
-
 
Q
F
 
F
K
 
Q
S
 
T
N
 
G
S
 
S
D
 
D
T
 
C
E
 
E
V
 
V
I
 
I
L
 
L
K
x
A
S
 
L
Y
 
Y
I
 
Q
H
 
E
W
 
K
G
 
G
I
 
P
E
 
E
K
 
-
S
 
F
I
 
L
E
 
D
K
 
D
F
 
L
R
 
Q
G
 
G
M
 
M
F
 
F
A
 
A
F
 
F
A
 
A
I
 
L
Y
 
Y
D
 
D
K
 
S
L
 
E
N
 
K
K
 
D
K
 
A
I
 
Y
I
 
L
L
 
I
V
 
G
R
 
R
D
 
D
R
 
H
A
 
L
G
 
G
V
 
I
K
 
I
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
Y
 
M
-
 
G
Y
 
Y
I
 
D
D
 
E
G
 
H
N
 
G
E
 
Q
F
 
L
V
 
Y
F
 
V
A
 
A
S
 
S
E
 
E
L
 
M
K
 
K
S
 
A
I
 
L
C
 
-
Q
 
-
Y
 
-
P
 
-
F
 
-
F
 
-
K
 
-
K
 
-
E
 
-
L
 
-
N
 
-
K
 
-
N
 
-
I
 
-
L
 
-
P
 
-
Y
 
-
Y
 
-
F
 
-
Q
 
-
F
 
-
G
 
-
Y
 
-
I
 
V
P
 
P
A
 
-
P
 
-
F
 
-
S
 
-
I
 
V
Y
 
C
K
 
R
N
 
T
C
 
I
Y
 
K
K
 
E
L
 
F
E
 
P
P
 
A
G
 
G
H
 
S
Y
 
Y
L
 
L
-
 
W
E
 
S
Y
 
Q
D
 
D
L
 
G
N
 
E
N
 
I
N
 
R
R
 
S
Y
 
Y
H
 
Y
I
 
H
T
 
R
K
 
D
Y
 
W
W
 
F
D
 
D
I
 
Y
D
 
D
N
 
A
C
 
V
Y
 
-
L
 
-
Q
 
-
E
 
-
K
 
K
I
 
D
D
 
N
A
 
V
N
 
T
E
 
D
K
 
K
E
 
-
I
 
-
L
 
-
N
 
N
D
 
E
L
 
L
E
 
R
N
 
Q
I
 
A
L
 
L
E
 
E
E
 
D
S
 
S
F
 
V
N
 
K
L
 
S
R
 
H
M
 
L
I
 
M
A
 
S
D
 
D
V
 
V
P
 
P
V
 
Y
G
 
G
V
 
V
F
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
I
 
L
D
 
D
S
 
S
S
 
S
L
 
I
V
 
I
T
 
S
A
 
A
I
 
I
L
 
-
S
 
T
K
 
K
K
 
K
Y
 
Y
-
 
A
-
 
A
-
 
R
-
 
R
-
 
V
-
 
E
-
 
D
-
 
Q
-
 
E
-
 
R
-
 
S
-
 
E
-
 
A
-
 
W
-
 
W
-
 
P
K
 
Q
L
 
L
N
 
H
T
 
S
F
 
F
T
 
A
I
 
V
G
 
G
F
 
L
D
 
P
D
 
G
K
 
S
R
 
-
Y
 
-
D
 
P
E
 
D
A
 
L
S
 
K
H
 
A
A
 
A
K
 
Q
I
 
E
V
 
V
A
 
A
N
 
N
Y
 
H
F
 
L
K
 
G
T
 
T
N
 
V
H
 
H
N
 
H
E
 
E
L
 
I
Y
 
H
I
 
F
N
 
T
E
 
V
T
 
Q
M
 
E
M
 
G
L
 
L
K
 
D
K
 
A
I
 
I
E
 
R
K
 
D
L
 
V
P
 
I
Y
 
Y
Y
 
H
-
 
I
-
 
E
-
 
T
Y
 
Y
D
 
D
E
 
V
P
 
T
F
 
T
G
 
I
D
 
R
S
 
A
S
 
S
S
 
T
I
 
P
P
 
M
T
 
Y
M
 
L
L
 
M
V
 
S
S
 
R
E
 
K
L
 
I
A
 
K
K
 
A
K
 
M
Q
 
G
V
 
I
T
 
K
V
 
M
S
 
V
L
 
L
S
 
S
A
 
G
D
x
E
G
 
G
G
 
S
D
 
D
E
 
E
I
 
V
F
 
F
C
 
G
G
 
G
Y
 
Y
S
 
L
K
 
Y
Y
 
F
F
 
H
A
 
K
L
 
A
N
 
P
K
 
N
I
 
A
N
 
K
R
 
E
L
 
L
F
 
H
S
 
E
N
 
E
K
 
T
L
 
V
K
 
R
K
 
K

P78753 Probable asparagine synthetase [glutamine-hydrolyzing]; Glutamine-dependent asparagine synthetase; EC 6.3.5.4 from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
29% identity, 59% coverage: 1:373/630 of query aligns to 1:365/557 of P78753

query
sites
P78753
M
 
M
C
 
C
G
 
G
I
 
I
V
 
L
G
 
A
F
 
V
I
 
H
N
 
H
K
 
V
E
 
A
K
 
E
R
 
D
F
 
I
D
 
E
V
 
A
L
 
F
N
 
K
N
 
P
M
 
K
L
 
A
L
 
L
I
 
H
Q
 
L
N
 
S
-
 
K
-
 
Q
-
 
L
-
 
R
Y
 
H
R
 
R
G
 
G
P
 
P
D
 
D
D
 
W
Y
 
S
G
 
G
L
 
K
Y
 
A
F
 
I
D
 
R
N
 
N
G
 
Q
V
 
T
H
 
I
L
 
L
G
 
C
H
 
H
N
 
E
R
 
R
L
 
L
S
 
A
I
 
I
L
 
V
D
 
G
L
 
V
S
 
-
D
 
E
A
 
S
G
 
G
H
 
A
Q
 
Q
P
 
P
F
 
L
I
 
V
S
 
S
E
 
D
D
 
D
E
 
G
N
 
K
Y
 
L
V
 
V
I
 
L
V
 
T
Y
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
I
Y
 
Y
N
 
N
F
 
H
K
 
L
Q
 
K
I
 
L
R
 
R
K
 
E
E
 
N
L
 
L
E
 
-
K
 
K
L
 
G
G
 
N
E
 
Y
R
 
K
F
 
F
K
 
K
S
 
T
N
 
Y
S
 
S
D
 
D
T
 
C
E
 
E
V
 
V
I
 
I
L
 
L
K
 
Y
S
 
L
Y
 
Y
I
 
R
H
 
E
W
 
H
G
 
G
I
 
-
E
 
P
K
 
A
S
 
C
I
 
A
E
 
N
K
 
M
F
 
L
R
 
D
G
 
G
M
 
M
F
 
F
A
 
S
F
 
W
A
 
V
I
 
L
Y
 
Y
D
 
D
K
 
Q
L
 
D
N
 
K
K
 
D
K
 
K
I
 
V
I
 
V
L
 
A
V
 
A
R
 
R
D
 
D
R
 
P
A
 
I
G
 
G
V
 
I
K
 
T
P
 
T
L
 
L
Y
 
Y
Y
 
Q
Y
 
G
I
 
F
D
 
S
G
 
S
N
 
D
E
 
S
-
 
P
-
 
D
-
 
T
F
 
A
V
 
Y
F
 
F
A
 
A
S
 
S
E
 
E
L
 
L
K
 
K
S
 
A
I
 
L
C
 
-
Q
 
-
Y
 
H
P
 
P
F
 
V
F
 
C
K
 
D
K
 
K
E
 
I
L
 
I
N
 
-
K
 
-
N
 
-
I
 
-
L
 
-
P
 
-
Y
 
-
Y
 
-
F
 
-
Q
 
-
F
 
-
G
 
-
Y
 
-
I
 
-
P
 
-
A
 
-
P
 
-
F
 
-
S
 
-
I
 
-
Y
 
-
K
 
-
N
 
-
C
 
-
Y
 
-
K
 
A
L
 
F
E
 
P
P
 
P
G
 
G
H
 
H
Y
 
Y
L
 
Y
E
 
D
Y
 
S
D
 
E
L
 
T
N
 
K
N
 
Q
N
 
T
-
 
V
R
 
R
Y
 
Y
H
 
F
I
 
K
T
 
P
K
 
S
Y
 
W
W
 
W
D
 
D
I
 
-
D
 
-
N
 
-
C
 
-
Y
 
-
L
 
-
Q
 
E
E
 
N
K
 
K
I
 
I
D
 
P
A
 
S
N
 
N
E
 
P
K
 
V
E
 
D
I
 
-
L
 
Y
N
 
K
D
 
L
L
 
L
E
 
R
N
 
E
I
 
T
L
 
L
E
 
E
E
 
A
S
 
S
F
 
V
N
 
R
L
 
K
R
 
R
M
 
L
I
 
M
A
 
A
D
 
E
V
 
V
P
 
P
V
 
Y
G
 
G
V
 
V
F
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
I
 
L
D
 
D
S
 
S
S
 
S
L
 
L
V
 
I
T
 
A
A
 
S
I
 
I
L
 
A
S
 
A
K
 
R
K
 
E
Y
 
T
-
 
E
-
 
K
-
 
L
-
 
A
-
 
N
-
 
S
-
 
T
-
 
S
-
 
Q
-
 
S
-
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
R
-
 
T
-
 
I
-
 
T
-
 
A
-
 
W
-
 
P
K
 
K
L
 
L
N
 
H
T
 
S
F
 
F
T
 
A
I
 
I
G
 
G
F
 
L
D
 
P
D
 
G
K
 
S
R
 
-
Y
 
-
D
 
P
E
 
D
A
 
L
S
 
L
H
 
A
A
 
A
K
 
R
I
 
K
V
 
V
A
 
A
N
 
D
Y
 
F
F
 
L
K
 
H
T
 
T
N
 
F
H
 
H
N
 
H
E
 
E
L
 
H
Y
 
T
I
 
F
N
 
T
E
 
I
T
 
D
M
 
E
M
 
G
L
 
L
K
 
D
K
 
A
I
 
L
E
 
R
K
 
D
L
 
V
P
 
I
Y
 
Y
Y
 
H
Y
 
L
D
 
E
-
 
T
-
 
Y
E
 
D
P
 
V
F
 
T
G
 
T
D
 
I
S
 
R
S
 
A
S
 
S
I
 
T
P
 
P
T
 
M
M
 
Y
L
 
L
V
 
L
S
 
S
E
 
R
L
 
K
A
 
I
K
 
K
K
 
A
Q
 
Q
-
 
G
V
 
V
T
 
K
V
 
M
S
 
V
L
 
L
S
 
S
A
 
G
D
 
E
G
 
G
G
 
S
D
 
D
E
 
E
I
 
I
F
 
F
C
 
G
G
 
G
Y
 
Y

Sites not aligning to the query:

P08243 Asparagine synthetase [glutamine-hydrolyzing]; Cell cycle control protein TS11; Glutamine-dependent asparagine synthetase; EC 6.3.5.4 from Homo sapiens (Human) (see 7 papers)
28% identity, 59% coverage: 1:373/630 of query aligns to 1:374/561 of P08243

query
sites
P08243
M
 
M
C
|
C
G
 
G
I
 
I
V
 
W
G
x
A
F
 
L
I
 
F
N
 
G
K
 
S
E
 
D
K
 
D
R
 
C
F
 
L
D
 
S
V
 
V
L
 
Q
N
 
C
N
 
L
M
 
S
L
 
A
L
 
M
I
 
K
Q
 
I
N
 
A
Y
 
H
R
 
R
G
 
G
P
 
P
D
 
D
D
 
A
Y
 
F
G
 
R
L
 
F
Y
 
E
F
 
N
D
 
V
N
 
N
G
 
G
-
 
Y
-
 
T
-
 
N
V
 
C
H
 
C
L
 
F
G
 
G
H
 
F
N
 
H
R
 
R
L
 
L
S
 
A
I
 
V
L
 
V
D
 
D
L
 
-
S
 
P
D
 
L
A
 
F
G
 
G
H
 
M
Q
 
Q
P
 
P
F
 
I
I
 
R
S
 
V
E
 
K
D
 
K
E
 
Y
N
 
P
Y
 
Y
V
 
L
-
 
W
I
 
L
V
 
C
Y
 
Y
N
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
I
Y
 
Y
N
 
N
F
 
H
K
 
K
Q
 
K
I
 
M
R
 
Q
K
 
Q
E
 
H
L
 
F
E
 
E
K
 
F
L
 
-
G
 
-
E
 
-
R
 
E
F
 
Y
K
 
Q
S
 
T
N
 
K
S
 
V
D
 
D
T
 
G
E
 
E
V
 
I
I
 
I
L
 
L
K
 
H
S
 
L
Y
 
Y
I
 
D
H
 
K
W
 
G
G
 
G
I
 
I
E
 
E
K
 
Q
S
 
T
I
 
I
E
 
C
K
 
M
F
 
L
R
 
D
G
 
G
M
 
V
F
 
F
A
 
A
F
 
F
A
 
V
I
 
L
Y
 
L
D
 
D
K
 
T
L
 
A
N
 
N
K
 
K
K
 
K
I
 
V
I
 
F
L
 
L
V
 
G
R
 
R
D
 
D
R
 
T
A
 
Y
G
 
G
V
 
V
K
 
R
P
 
P
L
 
L
Y
 
F
Y
 
K
Y
 
A
I
 
M
D
 
T
G
 
E
N
 
D
E
 
G
F
 
F
V
 
L
-
 
A
F
 
V
A
 
C
S
 
S
E
 
E
L
 
A
K
 
K
S
 
G
I
 
L
C
 
V
Q
 
T
Y
 
L
-
 
K
-
 
H
-
 
S
-
 
A
-
 
T
P
 
P
F
 
F
F
 
L
K
 
K
K
 
V
E
 
E
L
 
-
N
 
-
K
 
-
N
 
-
I
 
-
L
 
-
P
 
-
Y
 
-
Y
 
-
F
 
-
Q
 
-
F
 
-
G
 
-
Y
 
-
I
 
-
P
 
-
A
 
-
P
 
P
F
 
F
S
 
L
I
 
-
Y
 
-
K
 
-
N
 
-
C
 
-
Y
 
-
K
 
-
L
 
-
E
 
-
P
 
P
G
 
G
H
 
H
Y
 
Y
L
 
E
E
 
V
Y
 
L
D
 
D
L
 
L
N
 
K
N
 
P
N
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
V
-
 
A
R
 
S
Y
 
V
H
 
E
I
 
M
T
 
V
K
 
K
Y
 
Y
W
 
H
D
 
H
I
 
C
D
 
R
N
 
D
C
x
V
Y
 
P
L
 
L
Q
 
H
E
 
A
K
 
L
I
 
Y
D
 
D
A
 
N
N
 
V
E
 
E
K
 
K
-
 
L
-
 
F
-
 
P
-
 
G
-
 
F
-
 
E
-
 
I
-
 
E
E
 
T
I
 
V
L
 
K
N
 
N
D
 
N
L
 
L
E
 
R
N
 
I
I
 
L
L
 
F
E
 
N
E
 
N
S
 
A
F
 
V
N
 
K
L
 
K
R
 
R
M
 
L
I
 
M
A
 
T
D
 
D
V
 
R
P
 
R
V
 
I
G
 
G
V
 
C
F
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
I
 
L
D
 
D
S
 
S
S
 
S
L
 
L
V
 
V
T
 
A
A
 
A
I
 
T
L
 
L
S
 
L
K
 
K
-
 
Q
-
 
L
-
 
K
-
 
E
-
 
A
-
 
Q
-
 
V
K
 
Q
Y
 
Y
K
 
P
L
 
L
N
 
Q
T
 
T
F
 
F
T
 
A
I
 
I
G
 
G
F
 
M
D
 
E
D
 
D
K
 
S
R
 
-
Y
 
-
D
 
P
E
 
D
A
 
L
S
 
L
H
 
A
A
 
A
K
 
R
I
 
K
V
 
V
A
 
A
N
 
D
Y
 
H
F
 
I
K
 
G
T
 
S
N
 
E
H
 
H
N
 
Y
E
 
E
L
 
V
Y
 
L
I
 
F
N
 
N
E
 
S
T
 
E
M
 
E
M
 
G
L
 
I
K
 
Q
K
 
A
I
 
L
E
 
D
K
 
E
L
 
V
P
 
I
Y
 
F
Y
 
S
Y
 
L
D
 
E
-
 
T
-
 
Y
E
 
D
P
 
I
F
 
T
G
 
T
D
 
V
S
 
R
S
 
A
S
 
S
I
 
V
P
 
G
T
 
M
M
 
Y
L
 
L
V
 
I
S
 
S
E
 
K
L
 
Y
A
 
I
K
 
R
K
 
K
Q
 
N
V
 
T
-
 
D
-
 
S
T
 
V
V
 
V
S
 
I
L
x
F
S
 
S
A
 
G
D
 
E
G
 
G
G
 
S
D
 
D
E
 
E
I
 
L
F
 
T
C
 
Q
G
 
G
Y
 
Y

Sites not aligning to the query:

6gq3A Human asparagine synthetase (asns) in complex with 6-diazo-5-oxo-l- norleucine (don) at 1.85 a resolution (see paper)
28% identity, 59% coverage: 2:373/630 of query aligns to 1:361/509 of 6gq3A

query
sites
6gq3A
C
|
C
G
 
G
I
 
I
V
x
W
G
 
A
F
 
L
I
 
F
N
 
G
K
 
S
E
 
D
K
 
D
R
 
C
F
 
L
D
 
S
V
 
V
L
 
Q
N
 
C
N
 
L
M
 
S
L
 
A
L
 
M
I
 
K
Q
 
I
N
 
A
Y
 
H
R
 
R
G
 
G
P
 
P
D
 
D
D
 
A
Y
 
F
G
 
R
L
 
F
Y
 
E
F
 
N
D
 
V
N
 
N
G
 
G
-
 
Y
-
 
T
-
 
N
V
 
C
H
 
C
L
 
F
G
 
G
H
 
F
N
 
H
R
|
R
L
|
L
S
 
A
I
x
V
L
x
V
D
 
D
L
 
-
S
 
P
D
 
L
A
 
F
G
 
G
H
 
M
Q
 
Q
P
 
P
F
 
I
I
 
R
S
 
V
E
 
K
D
 
K
E
 
Y
N
 
P
Y
 
Y
V
 
L
-
 
W
I
 
L
V
 
C
Y
|
Y
N
|
N
G
|
G
E
|
E
V
 
I
Y
 
Y
N
 
N
F
 
H
K
 
K
Q
 
K
I
 
M
R
 
Q
K
 
Q
E
 
H
L
 
F
E
 
E
K
 
F
L
 
-
G
 
-
E
 
-
R
 
E
F
 
Y
K
 
Q
S
 
T
N
 
K
S
x
V
D
|
D
T
 
G
E
 
E
V
 
I
I
 
I
L
 
L
K
 
H
S
 
L
Y
 
Y
I
 
D
H
 
K
W
 
G
G
 
G
I
 
I
E
 
E
K
 
Q
S
 
T
I
 
I
E
 
C
K
 
M
F
 
L
R
 
D
G
 
G
M
 
V
F
 
F
A
 
A
F
 
F
A
 
V
I
 
L
Y
 
L
D
 
D
K
 
T
L
 
A
N
 
N
K
 
K
K
 
K
I
 
V
I
 
F
L
 
L
V
 
G
R
 
R
D
 
D
R
 
T
A
 
Y
G
 
G
V
 
V
K
 
R
P
 
P
L
 
L
Y
 
F
Y
 
K
Y
 
A
I
 
M
D
 
T
G
 
E
N
 
D
E
 
G
F
 
F
V
 
L
-
 
A
F
 
V
A
 
C
S
 
S
E
 
E
L
 
A
K
 
K
S
 
G
I
 
L
C
 
V
Q
 
T
Y
 
L
-
 
K
-
 
H
-
 
S
-
 
A
-
 
T
P
 
P
F
 
F
F
 
L
K
 
K
K
 
V
E
 
E
L
 
-
N
 
-
K
 
-
N
 
-
I
 
-
L
 
-
P
 
-
Y
 
-
Y
 
-
F
 
-
Q
 
-
F
 
-
G
 
-
Y
 
-
I
 
-
P
 
-
A
 
-
P
 
P
F
 
F
S
 
L
I
 
-
Y
 
-
K
 
-
N
 
-
C
 
-
Y
 
-
K
 
-
L
 
-
E
 
-
P
 
P
G
 
G
H
 
H
Y
 
Y
L
 
E
E
 
V
Y
 
L
D
 
D
L
 
L
N
 
K
N
 
P
N
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
V
-
 
A
R
 
S
Y
 
V
H
 
E
I
 
M
T
 
V
K
 
K
Y
 
Y
W
 
H
D
 
H
I
 
C
D
 
R
N
 
D
C
 
V
Y
 
F
L
 
P
Q
 
G
E
 
F
K
 
E
I
 
I
D
 
E
A
 
T
N
 
-
E
 
-
K
 
-
E
 
-
I
 
V
L
 
K
N
 
N
D
 
N
L
 
L
E
 
R
N
 
I
I
 
L
L
 
F
E
 
N
E
 
N
S
 
A
F
 
V
N
 
K
L
 
K
R
 
R
M
 
L
I
 
M
A
 
T
D
 
D
V
 
R
P
 
R
V
 
I
G
 
G
V
 
C
F
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
I
 
L
D
 
D
S
 
S
S
 
S
L
 
L
V
 
V
T
 
A
A
 
A
I
 
T
L
 
L
S
 
L
K
 
K
-
 
Q
-
 
L
-
 
K
-
 
E
-
 
A
-
 
Q
-
 
V
K
 
Q
Y
 
Y
K
 
P
L
 
L
N
 
Q
T
 
T
F
 
F
T
 
A
I
 
I
G
 
G
F
 
M
D
 
E
D
 
D
K
 
S
R
 
-
Y
 
-
D
 
P
E
 
D
A
 
L
S
 
L
H
 
A
A
 
A
K
 
R
I
 
K
V
 
V
A
 
A
N
 
D
Y
 
H
F
 
I
K
 
G
T
 
S
N
 
E
H
 
H
N
 
Y
E
 
E
L
 
V
Y
 
L
I
 
F
N
 
N
E
 
S
T
 
E
M
 
E
M
 
G
L
 
I
K
 
Q
K
 
A
I
 
L
E
 
D
K
 
E
L
 
V
P
 
I
Y
 
F
Y
 
S
Y
 
L
D
 
E
-
 
T
-
 
Y
E
 
D
P
 
I
F
x
T
G
 
T
D
 
V
S
x
R
S
 
A
S
 
S
I
 
V
P
 
G
T
 
M
M
 
Y
L
 
L
V
 
I
S
 
S
E
 
K
L
 
Y
A
 
I
K
 
R
K
 
K
Q
 
N
V
 
T
-
 
D
-
 
S
T
 
V
V
 
V
S
 
I
L
 
F
S
 
S
A
 
G
D
 
E
G
 
G
G
 
S
D
 
D
E
 
E
I
 
L
F
 
T
C
 
Q
G
 
G
Y
 
Y

1mb9A Beta-lactam synthetase complexed with atp (see paper)
24% identity, 44% coverage: 57:332/630 of query aligns to 46:299/485 of 1mb9A

query
sites
1mb9A
H
 
H
Q
 
A
P
 
P
F
 
S
I
 
V
S
 
A
E
 
P
D
 
D
E
 
R
N
 
A
Y
 
V
V
 
A
-
 
R
-
 
S
-
 
L
-
 
T
-
 
G
-
 
A
-
 
P
-
 
T
-
 
T
I
 
A
V
 
V
Y
 
L
N
x
A
G
|
G
E
 
E
V
 
I
Y
 
Y
N
 
N
F
 
R
K
 
D
Q
 
E
I
 
L
R
 
-
K
 
-
E
 
-
L
 
L
E
 
S
K
 
V
L
 
L
G
 
P
E
 
A
R
 
G
F
 
P
K
 
A
S
 
P
N
 
E
S
 
G
D
 
D
T
 
A
E
 
E
V
 
L
I
 
V
L
 
L
K
 
R
S
 
L
Y
 
-
I
 
-
H
 
-
W
 
-
G
 
-
I
 
L
E
 
E
K
 
R
-
 
Y
S
 
D
I
 
L
E
 
H
K
 
A
F
 
F
R
 
R
-
 
L
-
 
V
-
 
N
G
 
G
M
 
R
F
 
F
A
 
A
F
 
T
A
 
V
I
 
V
Y
 
-
D
 
-
K
 
R
L
 
T
N
 
G
K
 
D
K
 
R
I
 
V
I
 
L
L
 
L
V
 
A
R
 
T
D
 
D
R
 
H
A
 
A
G
 
G
V
 
S
K
 
V
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
Y
 
T
Y
 
C
I
 
V
D
 
A
G
 
P
N
 
G
E
 
E
F
 
V
V
 
R
F
 
A
A
 
S
S
 
T
E
 
E
L
 
A
K
 
K
S
 
A
I
 
L
C
 
A
Q
 
A
Y
 
F
P
 
P
F
 
L
F
 
A
K
 
D
K
 
A
E
 
R
L
 
R
N
 
V
K
 
A
N
 
G
I
 
L
L
 
-
P
 
-
Y
 
-
Y
 
-
F
 
-
Q
 
-
F
 
-
G
 
-
Y
 
-
I
 
-
P
 
-
A
 
-
P
 
-
F
 
-
S
 
-
I
 
-
Y
 
-
K
 
T
N
 
G
C
 
V
Y
 
Y
K
 
Q
L
 
V
E
 
P
P
 
A
G
 
G
H
 
A
Y
 
V
L
 
M
E
 
D
Y
 
I
D
 
D
L
 
L
N
 
G
N
 
S
N
 
G
R
 
T
Y
 
A
H
 
V
I
 
T
T
 
H
K
 
R
Y
 
T
W
 
W
D
 
-
I
 
-
D
 
-
N
 
T
C
 
P
Y
 
G
L
 
L
Q
 
S
E
 
R
K
 
R
I
 
I
D
 
-
A
 
L
N
 
P
E
 
E
K
 
G
E
 
E
I
 
A
L
 
V
N
 
A
D
 
A
L
 
V
E
 
R
N
 
A
I
 
A
L
 
L
E
 
E
E
 
K
S
 
A
F
 
V
N
 
A
L
 
Q
R
 
R
M
 
V
I
 
T
-
 
P
A
 
G
D
 
D
V
 
T
P
 
P
V
 
L
G
 
-
V
 
V
F
x
V
L
|
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
I
 
I
D
|
D
S
|
S
S
 
S
L
 
G
V
 
V
T
 
A
A
 
A
I
 
C
L
 
A
S
 
H
K
 
R
K
 
A
Y
 
A
-
 
G
K
 
E
L
 
L
N
 
D
T
 
T
F
 
V
T
x
S
I
x
M
G
 
G
F
 
T
D
 
D
D
 
T
K
 
S
R
 
-
Y
 
-
D
 
N
E
 
E
A
 
F
S
 
R
H
 
E
A
 
A
K
 
R
I
 
A
V
 
V
A
 
V
N
 
D
Y
 
H
F
 
L
K
 
R
T
 
T
N
 
R
H
 
H
N
 
R
E
 
E
L
 
I
Y
 
T
I
 
I
N
 
P
E
 
T
T
 
T
M
 
E
M
 
L
L
 
L
K
 
A
K
 
-
I
 
-
E
 
-
K
 
Q
L
 
L
P
 
P
Y
 
Y

Sites not aligning to the query:

1mbzA Beta-lactam synthetase with trapped intermediate (see paper)
24% identity, 44% coverage: 57:332/630 of query aligns to 45:300/496 of 1mbzA

query
sites
1mbzA
H
 
H
Q
 
A
P
 
P
F
 
S
I
 
V
S
 
A
E
 
P
D
 
D
E
 
R
N
 
A
Y
 
V
V
 
A
-
 
R
-
 
S
-
 
L
-
 
T
-
 
G
-
 
A
-
 
P
-
 
T
-
 
T
I
 
A
V
 
V
Y
 
L
N
x
A
G
|
G
E
 
E
V
 
I
Y
 
Y
N
 
N
F
 
R
K
 
D
Q
 
E
I
 
L
R
 
-
K
 
-
E
 
-
L
 
L
E
 
S
K
 
V
L
 
L
G
 
P
E
 
A
R
 
G
F
 
P
K
 
A
S
 
P
N
 
E
S
 
G
D
 
D
T
 
A
E
 
E
V
 
L
I
 
V
L
 
L
K
 
R
S
 
L
Y
 
-
I
 
-
H
 
-
W
 
-
G
 
-
I
 
L
E
 
E
K
 
R
-
 
Y
S
 
D
I
 
L
E
 
H
K
 
A
F
 
F
R
 
R
-
 
L
-
 
V
-
 
N
G
 
G
M
 
R
F
 
F
A
 
A
F
 
T
A
 
V
I
 
V
Y
 
-
D
 
-
K
 
R
L
 
T
N
 
G
K
 
D
K
 
R
I
 
V
I
 
L
L
 
L
V
 
A
R
 
T
D
 
D
R
 
H
A
 
A
G
 
G
V
 
S
K
 
V
P
 
P
L
 
L
Y
 
Y
Y
 
T
Y
 
C
I
 
V
D
 
A
G
 
P
N
 
G
E
 
E
F
 
V
V
 
R
F
 
A
A
 
S
S
 
T
E
 
E
L
 
A
K
 
K
S
 
A
I
 
L
C
 
A
Q
 
A
Y
 
H
P
 
G
F
 
F
F
 
P
K
 
L
K
 
A
E
 
D
L
 
A
N
 
R
K
 
R
N
 
-
I
 
-
L
 
-
P
 
-
Y
 
-
Y
 
-
F
 
-
Q
 
-
F
 
-
G
 
-
Y
 
-
I
 
-
P
 
-
A
 
-
P
 
-
F
 
V
S
 
A
I
 
G
Y
 
L
K
 
T
N
 
G
C
 
V
Y
 
Y
K
 
Q
L
 
V
E
 
P
P
 
A
G
 
G
H
 
A
Y
 
V
L
 
M
E
 
D
Y
 
I
D
 
D
L
 
L
N
 
G
N
 
S
N
 
G
R
 
T
Y
 
A
H
 
V
I
 
T
T
 
H
K
 
R
Y
 
T
W
 
W
D
 
-
I
 
-
D
 
-
N
 
T
C
 
P
Y
 
G
L
 
L
Q
 
S
E
 
R
K
 
R
I
 
I
D
 
-
A
 
L
N
 
P
E
 
E
K
 
G
E
 
E
I
 
A
L
 
V
N
 
A
D
 
A
L
 
V
E
 
R
N
 
A
I
 
A
L
 
L
E
 
E
E
 
K
S
 
A
F
 
V
N
 
A
L
 
Q
R
 
R
M
 
V
I
 
T
-
 
P
A
 
G
D
 
D
V
 
T
P
 
P
V
 
L
G
 
-
V
 
V
F
x
V
L
|
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
I
 
I
D
|
D
S
|
S
S
 
S
L
 
G
V
 
V
T
 
A
A
 
A
I
 
C
L
 
A
S
 
H
K
 
R
K
 
A
Y
 
A
-
 
G
K
 
E
L
 
L
N
 
D
T
 
T
F
 
V
T
x
S
I
x
M
G
 
G
F
 
T
D
 
D
D
 
T
K
 
S
R
 
-
Y
 
-
D
 
N
E
 
E
A
 
F
S
 
R
H
 
E
A
 
A
K
 
R
I
 
A
V
 
V
A
 
V
N
 
D
Y
 
H
F
 
L
K
 
R
T
 
T
N
 
R
H
 
H
N
 
R
E
 
E
L
 
I
Y
 
T
I
 
I
N
 
P
E
 
T
T
 
T
M
 
E
M
 
L
L
 
L
K
 
A
K
 
-
I
 
-
E
 
-
K
 
Q
L
 
L
P
 
P
Y
 
Y

Sites not aligning to the query:

1q19A Carbapenam synthetase (see paper)
39% identity, 18% coverage: 261:372/630 of query aligns to 240:352/500 of 1q19A

query
sites
1q19A
V
 
V
G
 
G
V
 
I
F
x
P
L
|
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
I
 
L
D
|
D
S
|
S
S
 
S
L
 
L
V
 
V
T
 
T
A
 
A
I
 
L
L
 
A
S
 
S
K
 
R
K
 
H
Y
 
F
-
 
K
K
 
K
L
 
L
N
 
N
T
 
T
F
 
Y
T
x
S
I
|
I
G
 
G
F
 
-
D
 
-
D
 
T
K
 
E
R
 
L
Y
 
S
D
 
N
E
 
E
A
 
F
S
 
E
H
 
F
A
 
S
K
 
Q
I
 
Q
V
 
V
A
 
A
N
 
D
Y
 
A
F
 
L
K
 
G
T
 
T
N
 
H
H
 
H
N
 
Q
E
 
M
L
 
K
Y
 
I
I
 
L
N
 
S
E
 
E
T
 
T
M
 
E
M
 
V
L
 
I
K
 
N
K
 
G
I
 
I
E
 
I
K
 
E
L
 
-
P
 
S
Y
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
D
 
N
E
 
E
P
 
I
F
 
F
-
 
D
G
 
G
D
x
L
S
 
S
S
 
A
S
x
E
I
 
I
P
 
Q
T
 
S
M
 
G
L
 
L
-
 
F
-
 
N
V
 
V
S
 
Y
E
 
R
L
 
Q
A
 
A
K
 
Q
K
 
G
Q
 
Q
V
 
V
T
 
S
V
 
C
S
 
M
L
 
L
S
x
T
A
x
G
D
x
Y
G
|
G
G
 
S
D
|
D
E
x
L
I
 
L
F
 
F
C
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Q9XB61 Carbapenam-3-carboxylate synthase; Carbapenam-3-carboxylate ligase; EC 6.3.3.6 from Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum (Erwinia carotovora subsp. carotovora) (see 3 papers)
26% identity, 45% coverage: 89:372/630 of query aligns to 74:353/503 of Q9XB61

query
sites
Q9XB61
G
 
G
E
 
E
R
 
A
F
 
Y
K
 
L
S
 
A
N
 
N
S
 
-
D
 
D
T
 
A
E
 
E
V
 
L
I
 
L
L
 
A
K
 
L
S
 
L
Y
 
F
I
 
T
H
 
R
W
 
L
G
 
G
I
 
-
E
 
A
K
 
N
S
 
A
I
 
L
E
 
A
K
 
L
F
 
A
R
 
E
G
 
G
M
 
D
F
 
F
A
 
C
F
 
F
A
 
F
I
 
I
Y
 
-
D
 
D
K
 
E
L
 
P
N
 
N
K
 
G
K
 
E
I
 
L
I
 
T
L
 
V
V
 
I
R
 
T
D
 
E
R
 
S
A
 
R
G
 
G
V
 
F
K
 
S
P
 
P
L
 
V
Y
 
H
Y
 
V
Y
 
-
I
 
V
D
 
Q
G
 
G
N
 
K
E
 
K
F
 
A
V
 
W
F
 
M
A
 
T
S
 
N
E
 
S
L
 
L
K
 
K
S
 
L
I
 
V
C
 
T
Q
 
A
Y
 
A
P
 
E
-
 
G
-
 
E
-
 
G
-
 
A
-
 
L
F
 
W
F
 
F
K
 
E
K
 
E
E
 
E
L
 
-
N
 
-
K
 
-
N
 
-
I
 
-
L
 
-
P
 
A
Y
 
L
Y
 
V
F
 
C
Q
 
Q
F
 
S
G
 
L
Y
 
M
I
 
R
P
 
A
A
 
D
P
 
T
F
 
Y
S
 
T
I
 
P
Y
 
V
K
 
K
N
 
N
C
 
A
Y
 
Q
K
 
R
L
 
L
E
 
K
P
 
P
G
 
G
-
 
A
-
 
V
H
 
H
Y
 
V
L
 
L
E
 
T
Y
 
H
D
 
D
L
 
-
N
 
-
N
 
S
N
 
E
R
 
G
Y
 
Y
H
 
S
I
 
F
T
 
V
K
 
E
Y
 
S
W
 
R
D
 
T
I
 
L
D
 
T
N
 
T
C
 
P
Y
 
A
L
 
S
Q
 
N
E
 
Q
K
 
L
I
 
L
D
 
A
A
 
L
N
 
P
E
 
R
K
 
E
E
 
P
I
 
L
L
 
L
N
 
A
D
 
L
L
 
I
E
 
D
N
 
R
I
 
Y
L
 
L
E
 
N
E
 
A
S
 
P
F
 
L
N
 
E
L
 
D
R
 
L
M
 
A
I
 
P
A
 
R
D
 
F
V
 
D
P
 
T
V
 
V
G
 
G
V
 
I
F
x
P
L
|
L
S
|
S
G
|
G
G
|
G
I
x
L
D
|
D
S
|
S
S
 
S
L
 
L
V
 
V
T
 
T
A
 
A
I
 
L
L
 
A
S
 
S
K
 
R
K
 
H
Y
 
F
-
 
K
K
 
K
L
 
L
N
 
N
T
 
T
F
 
Y
T
 
S
I
|
I
G
 
G
F
 
-
D
 
-
D
 
T
K
 
E
R
 
L
Y
 
S
D
 
N
E
 
E
A
 
F
S
 
E
H
 
F
A
 
S
K
 
Q
I
 
Q
V
 
V
A
 
A
N
 
D
Y
 
A
F
 
L
K
 
G
T
 
T
N
 
H
H
 
H
N
 
Q
E
 
M
L
 
K
Y
 
I
I
 
L
N
 
S
E
 
E
T
 
T
M
 
E
M
 
V
L
 
I
K
 
N
K
 
G
I
 
I
E
 
I
K
 
E
L
 
-
P
 
S
Y
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
D
 
N
E
 
E
P
 
I
F
 
F
-
 
D
G
 
G
D
 
L
S
 
S
S
 
A
S
 
E
I
 
I
P
 
Q
T
 
S
M
 
G
L
 
L
-
 
F
-
 
N
V
 
V
S
 
Y
E
 
R
L
 
Q
A
 
A
K
 
Q
K
 
G
Q
 
Q
V
 
V
T
 
S
V
 
C
S
 
M
L
 
L
S
 
T
A
x
G
D
x
Y
G
|
G
G
x
S
D
|
D
E
 
L
I
 
L
F
 
F
C
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

1ao0A Glutamine phosphoribosylpyrophosphate (prpp) amidotransferase from b. Subtilis complexed with adp and gmp (see paper)
26% identity, 25% coverage: 2:159/630 of query aligns to 1:190/455 of 1ao0A

query
sites
1ao0A
C
|
C
G
 
G
I
 
V
V
 
F
G
 
G
F
 
I
I
 
W
N
 
G
K
 
H
E
 
E
K
 
E
R
 
A
F
 
P
D
 
Q
V
 
I
L
 
T
N
 
Y
N
 
Y
M
 
G
L
 
L
L
 
H
I
 
S
Q
 
L
N
 
Q
Y
x
H
R
 
R
G
|
G
P
 
Q
D
 
E
D
 
G
Y
 
A
G
 
G
L
 
I
Y
 
V
F
 
A
D
 
T
N
 
D
G
 
G
-
 
E
-
 
K
-
 
L
-
 
T
V
 
A
H
 
H
L
 
K
G
 
G
H
 
Q
N
 
G
R
 
L
L
 
I
S
 
T
I
 
E
L
 
V
-
 
F
-
 
Q
-
 
N
-
 
G
D
 
E
L
 
L
S
 
S
D
 
K
A
 
V
-
 
K
-
 
G
-
 
K
-
 
G
-
 
A
-
 
I
G
 
G
H
 
H
-
 
V
-
 
R
-
 
Y
-
 
A
-
 
T
-
 
G
-
 
Y
-
 
E
-
 
N
-
 
V
Q
 
Q
P
 
P
F
 
L
I
 
L
S
 
F
E
 
R
D
 
S
E
 
Q
N
 
N
-
 
N
-
 
G
-
 
S
Y
 
L
V
 
A
I
 
L
V
 
A
Y
 
H
N
|
N
G
|
G
E
 
N
V
 
L
Y
 
V
N
 
N
F
 
A
K
 
T
Q
 
Q
I
 
L
R
 
K
K
 
Q
E
 
Q
L
 
L
E
 
E
K
 
N
L
 
Q
G
 
G
E
 
S
R
 
I
F
 
F
K
 
Q
S
 
T
N
 
S
S
 
S
D
 
D
T
 
T
E
 
E
V
 
V
-
 
L
-
 
A
-
 
H
I
 
L
L
 
I
K
 
K
S
 
R
Y
 
S
I
 
G
H
 
H
W
 
F
G
 
T
-
 
L
-
 
K
-
 
D
-
 
Q
I
 
I
E
 
K
K
 
N
S
 
S
I
 
L
E
 
S
K
 
M
F
 
L
R
 
K
G
 
G
M
 
A
F
 
Y
A
 
A
F
 
F
A
 
L
I
 
I
Y
 
M
D
 
T
K
 
E
L
 
-
N
 
-
K
 
T
K
 
E
I
 
M
I
 
I
L
 
V
V
 
A
R
 
L
D
 
D
R
 
P
A
 
N
G
 
G
V
 
L
K
 
R
P
 
P
L
 
L
Y
 
S
Y
 
I
Y
 
G
I
 
M
D
 
M
G
 
G
N
 
D
E
 
A
F
 
Y
V
 
V
F
 
V
A
 
A
S
 
S
E
 
E

Sites not aligning to the query:

P00497 Amidophosphoribosyltransferase; ATase; Glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase; GPATase; EC 2.4.2.14 from Bacillus subtilis (strain 168) (see 5 papers)
30% identity, 16% coverage: 58:159/630 of query aligns to 96:205/476 of P00497

query
sites
P00497
Q
 
Q
P
 
P
F
 
L
I
 
L
S
 
F
E
 
R
D
 
S
E
 
Q
N
 
N
-
 
N
-
 
G
-
 
S
Y
 
L
V
 
A
I
 
L
V
 
A
Y
 
H
N
 
N
G
 
G
E
 
N
V
 
L
Y
 
V
N
 
N
F
 
A
K
 
T
Q
 
Q
I
 
L
R
 
K
K
 
Q
E
 
Q
L
 
L
E
 
E
K
 
N
L
 
Q
G
 
G
E
 
S
R
 
I
F
 
F
K
 
Q
S
 
T
N
 
S
S
 
S
D
 
D
T
 
T
E
 
E
V
 
V
-
 
L
-
 
A
-
 
H
I
 
L
L
 
I
K
 
K
S
 
R
Y
 
S
I
 
G
H
 
H
W
 
F
G
 
T
-
 
L
-
 
K
-
 
D
-
 
Q
I
 
I
E
 
K
K
 
N
S
 
S
I
 
L
E
 
S
K
 
M
F
 
L
R
 
K
G
 
G
M
 
A
F
 
Y
A
 
A
F
 
F
A
 
L
I
 
I
Y
 
M
D
 
T
K
 
E
L
 
-
N
 
-
K
 
T
K
 
E
I
 
M
I
 
I
L
 
V
V
 
A
R
 
L
D
 
D
R
 
P
A
 
N
G
 
G
V
 
L
K
 
R
P
 
P
L
 
L
Y
 
S
Y
 
I
Y
 
G
I
 
M
D
 
M
G
 
G
N
 
D
E
 
A
F
 
Y
V
 
V
F
 
V
A
 
A
S
 
S
E
 
E

Sites not aligning to the query:

1gph1 Structure of the allosteric regulatory enzyme of purine biosynthesis (see paper)
30% identity, 16% coverage: 58:159/630 of query aligns to 85:194/465 of 1gph1

query
sites
1gph1
Q
 
Q
P
 
P
F
 
L
I
 
L
S
 
F
E
 
R
D
 
S
E
 
Q
N
 
N
-
 
N
-
 
G
-
 
S
Y
 
L
V
 
A
I
 
L
V
 
A
Y
 
H
N
 
N
G
 
G
E
 
N
V
 
L
Y
 
V
N
 
N
F
 
A
K
 
T
Q
 
Q
I
 
L
R
 
K
K
 
Q
E
 
Q
L
 
L
E
 
E
K
 
N
L
 
Q
G
 
G
E
 
S
R
 
I
F
 
F
K
 
Q
S
 
T
N
 
S
S
 
S
D
 
D
T
 
T
E
 
E
V
 
V
-
 
L
-
 
A
-
 
H
I
 
L
L
 
I
K
 
K
S
 
R
Y
 
S
I
 
G
H
 
H
W
 
F
G
 
T
-
 
L
-
 
K
-
 
D
-
 
Q
I
 
I
E
 
K
K
 
N
S
 
S
I
 
L
E
 
S
K
 
M
F
 
L
R
 
K
G
 
G
M
 
A
F
 
Y
A
 
A
F
 
F
A
 
L
I
 
I
Y
 
M
D
 
T
K
 
E
L
 
-
N
 
-
K
 
T
K
 
E
I
 
M
I
 
I
L
 
V
V
 
A
R
 
L
D
 
D
R
 
P
A
 
N
G
 
G
V
 
L
K
 
R
P
 
P
L
 
L
Y
 
S
Y
 
I
Y
 
G
I
 
M
D
 
M
G
 
G
N
 
D
E
 
A
F
 
Y
V
 
V
F
 
V
A
 
A
S
 
S
E
 
E

Sites not aligning to the query:

Q9STG9 Amidophosphoribosyltransferase 2, chloroplastic; AtATase2; AtPURF2; PRPP2; Glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase 2; AtGPRAT2; Protein CHLOROPLAST IMPORT APPARATUS 1; Protein DIFFERENTIAL DEVELOPMENT OF VASCULAR ASSOCIATED CELLS; EC 2.4.2.14 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see 2 papers)
29% identity, 22% coverage: 40:179/630 of query aligns to 153:298/561 of Q9STG9

query
sites
Q9STG9
V
 
I
H
 
A
L
 
I
G
 
G
H
 
H
N
 
V
R
 
R
L
 
Y
S
 
S
I
 
T
L
 
A
D
 
G
L
 
S
S
 
S
D
 
M
A
 
L
G
 
K
H
 
N
-
 
V
Q
 
Q
P
 
P
F
 
F
I
 
V
S
 
A
E
 
G
D
 
Y
E
 
R
-
 
F
-
 
G
N
 
S
Y
 
V
V
 
G
I
 
V
V
 
A
Y
x
H
N
 
N
G
 
G
E
 
N
V
 
L
Y
 
V
N
 
N
F
 
Y
K
 
T
Q
 
K
I
 
L
R
 
R
K
 
A
E
 
D
L
 
L
E
 
E
K
 
E
L
 
N
G
 
G
E
 
S
R
 
I
F
 
F
K
 
N
S
 
T
N
 
S
S
 
S
D
 
D
T
 
T
E
 
E
V
 
V
I
 
V
L
 
L
-
 
H
-
 
L
-
 
I
-
 
A
-
 
I
-
 
S
-
 
K
K
 
A
S
 
R
Y
 
P
I
 
F
H
 
F
W
 
M
G
 
R
I
 
I
E
 
V
K
 
D
S
 
A
I
 
C
E
 
E
K
 
K
F
 
L
R
 
Q
G
 
G
M
 
A
F
 
Y
A
 
S
-
 
M
-
 
V
F
 
F
A
 
V
I
 
T
Y
 
E
D
 
D
K
 
K
L
 
L
N
 
-
K
 
-
K
 
-
I
 
-
I
 
V
L
 
A
V
 
V
R
 
R
D
 
D
R
 
P
A
 
H
G
 
G
V
 
F
K
x
R
P
|
P
L
 
L
Y
 
V
Y
 
M
Y
 
G
I
 
R
D
 
R
G
 
S
N
 
N
-
 
G
E
 
A
F
 
V
V
 
V
F
 
F
A
 
A
S
 
S
E
 
E
L
 
-
K
 
-
S
 
-
I
 
T
C
 
C
Q
 
A
Y
 
L
P
 
D
F
 
L
F
 
I
K
 
E
K
 
A
E
 
T
L
 
Y
N
 
E
K
 
R
N
 
E
I
 
V
L
 
Y
P
 
P

Sites not aligning to the query:

6lbpA Structure of the glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase from arabidopsis thaliana (see paper)
29% identity, 22% coverage: 40:179/630 of query aligns to 67:212/460 of 6lbpA

query
sites
6lbpA
V
 
I
H
 
A
L
 
I
G
 
G
H
 
H
N
 
V
R
 
R
L
 
Y
S
 
S
I
 
T
L
 
A
D
 
G
L
 
S
S
 
S
D
 
M
A
 
L
G
 
K
H
 
N
-
 
V
Q
 
Q
P
 
P
F
 
F
I
 
V
S
 
A
E
 
G
D
 
Y
E
 
R
-
 
F
-
 
G
N
 
S
Y
 
V
V
 
G
I
 
V
V
 
A
Y
 
H
N
|
N
G
|
G
E
 
N
V
 
L
Y
 
V
N
 
N
F
 
Y
K
 
T
Q
 
K
I
 
L
R
 
R
K
 
A
E
 
D
L
 
L
E
 
E
K
 
E
L
 
N
G
 
G
E
 
S
R
 
I
F
 
F
K
 
N
S
 
T
N
 
S
S
 
S
D
 
D
T
 
T
E
 
E
V
 
V
I
 
V
L
 
L
-
 
H
-
 
L
-
 
I
-
 
A
-
 
I
-
 
S
-
 
K
K
 
A
S
 
R
Y
 
P
I
 
F
H
 
F
W
 
M
G
 
R
I
 
I
E
 
V
K
 
D
S
 
A
I
 
C
E
 
E
K
 
K
F
 
L
R
 
Q
G
 
G
M
 
A
F
 
Y
A
 
S
-
 
M
-
 
V
F
 
F
A
 
V
I
 
T
Y
 
E
D
 
D
K
 
K
L
 
L
N
 
-
K
 
-
K
 
-
I
 
-
I
 
V
L
 
A
V
 
V
R
 
R
D
 
D
R
 
P
A
 
H
G
 
G
V
 
F
K
 
R
P
 
P
L
 
L
Y
 
V
Y
 
M
Y
 
G
I
 
R
D
 
R
G
 
S
N
 
N
-
 
G
E
 
A
F
 
V
V
 
V
F
 
F
A
 
A
S
 
S
E
 
E
L
 
-
K
 
-
S
 
-
I
 
T
C
 
C
Q
 
A
Y
 
L
P
 
D
F
 
L
F
 
I
K
 
E
K
 
A
E
 
T
L
 
Y
N
 
E
K
 
R
N
 
E
I
 
V
L
 
Y
P
 
P

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_007475570.1 NCBI__GCF_000170735.1:WP_007475570.1
MCGIVGFINKEKRFDVLNNMLLIQNYRGPDDYGLYFDNGVHLGHNRLSILDLSDAGHQPF
ISEDENYVIVYNGEVYNFKQIRKELEKLGERFKSNSDTEVILKSYIHWGIEKSIEKFRGM
FAFAIYDKLNKKIILVRDRAGVKPLYYYIDGNEFVFASELKSICQYPFFKKELNKNILPY
YFQFGYIPAPFSIYKNCYKLEPGHYLEYDLNNNRYHITKYWDIDNCYLQEKIDANEKEIL
NDLENILEESFNLRMIADVPVGVFLSGGIDSSLVTAILSKKYKLNTFTIGFDDKRYDEAS
HAKIVANYFKTNHNELYINETMMLKKIEKLPYYYDEPFGDSSSIPTMLVSELAKKQVTVS
LSADGGDEIFCGYSKYFALNKINRLFSNKLKKKFIKLSVNLLEENIVEKLNELLPSKIKQ
RNIKDKFNKFKRAINSNSFEDMFLEATSYSDKNIVRSILNIDINKKAFNKFKFLPQLSLL
ENLMRIDYKTFLVDDVLVKVDRATMSVSLEGREPLLDHKISEYLGKIPIELKYKNNQGKY
LAKQILYKYIPKEIIDKPKSGFQIPLEKWIKEDLKLLVNHYISKEKIDKEIFNIDEILQI
KKEVFNGKVKNLSLLWFVLMYQMWKEKWFE

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory