SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_007690515.1 NCBI__GCF_000336675.1:WP_007690515.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4dxvA Crystal structure of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii complexed with mg and cl ions at 1.80 a resolution
24% identity, 90% coverage: 11:291/312 of query aligns to 1:276/291 of 4dxvA

query
sites
4dxvA
S
 
T
L
 
I
R
 
Q
G
 
G
V
 
S
A
 
I
T
 
V
G
 
A
V
 
I
L
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
D
 
L
A
 
K
D
 
D
Q
 
G
G
 
G
I
 
V
E
 
D
Y
 
W
E
 
K
K
 
S
I
 
L
A
 
E
E
 
K
N
 
L
V
 
V
E
 
E
S
 
W
L
 
H
S
 
I
D
 
E
A
 
Q
G
 
G
V
 
T
G
 
N
V
 
S
F
 
I
L
 
V
A
 
A
A
 
V
A
 
G
N
x
T
I
 
T
S
 
G
E
 
E
Y
 
A
H
 
S
T
 
T
L
 
L
S
 
S
V
 
M
D
 
E
E
 
E
R
 
H
I
 
T
A
 
Q
V
 
V
T
 
I
E
 
K
A
 
E
A
 
I
V
 
I
D
 
R
A
 
V
L
 
A
P
 
N
S
 
K
S
 
R
A
 
I
C
 
P
V
 
I
L
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
G
 
A
N
 
N
L
 
S
A
 
T
-
 
R
E
 
E
A
 
A
R
 
I
E
 
E
L
 
L
V
 
T
A
 
K
A
 
A
Y
 
A
D
 
K
R
 
D
I
 
L
G
 
G
V
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
A
M
 
L
V
 
L
M
 
V
P
x
T
P
 
P
D
 
Y
F
x
Y
T
 
N
Y
 
K
I
 
P
H
 
T
E
 
Q
Q
 
E
G
 
G
L
 
L
L
 
Y
R
 
Q
Y
 
H
Y
 
Y
E
 
K
K
 
A
L
 
I
S
 
A
A
 
E
N
 
A
T
 
V
E
 
E
T
 
L
P
 
P
L
 
L
V
 
I
P
 
L
Y
|
Y
V
x
N
R
x
V
G
x
P
F
 
G
E
x
R
P
x
T
S
 
G
V
 
V
S
 
D
Y
 
L
L
 
S
D
 
N
D
 
D
-
 
T
-
 
A
-
 
V
-
 
R
L
 
L
T
 
A
R
 
E
V
 
I
D
 
P
G
 
N
L
 
I
V
 
V
G
 
G
I
 
I
K
|
K
-
 
D
-
 
A
-
 
T
-
 
G
-
 
D
-
 
V
-
 
P
-
 
R
-
 
G
Y
 
K
A
 
A
I
 
L
P
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
L
K
 
N
L
 
G
G
 
K
A
 
M
G
 
A
V
 
V
E
 
Y
A
 
S
G
 
G
A
 
D
D
 
D
D
 
E
V
 
T
V
 
A
W
 
W
V
 
-
D
 
-
G
 
-
L
 
-
A
 
-
E
 
-
P
 
-
H
 
-
A
 
-
P
 
-
S
 
E
F
 
L
W
 
M
V
 
L
E
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
D
G
 
G
F
 
N
S
x
I
A
 
S
G
 
V
V
 
T
S
 
A
N
 
N
F
 
I
R
 
A
P
 
P
E
 
K
I
 
A
G
 
M
L
 
S
A
 
E
L
 
V
L
 
C
D
 
A
A
 
V
L
 
A
T
 
I
E
 
A
E
 
K
D
 
D
W
 
E
G
 
Q
R
 
Q
A
 
A
R
 
K
A
 
T
L
 
L
K
 
N
N
 
N
A
 
K
C
 
I
L
 
A
P
 
N
Y
 
L
Q
 
H
N
 
N
F
 
I
R
 
L
T
 
-
E
 
-
T
 
F
G
 
C
R
 
E
N
 
S
N
 
N
E
 
P
I
 
I
P
 
P
D
 
-
A
 
-
I
 
-
S
 
-
V
 
-
P
 
-
A
 
-
V
 
V
K
 
K
K
 
W
G
 
A
L
 
L
E
 
H
L
 
E
A
 
M
G
 
G
L
 
L
H
 
I
G
 
D
G
 
T
N
 
G
V
 
I
R
 
R
D
 
L
P
 
P
I
 
L
R
 
T
P
 
P
L
 
L
S
 
A
S
 
E
E
 
Q

3u8gA Crystal structure of the complex of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with oxalic acid at 1.80 a resolution
24% identity, 90% coverage: 11:291/312 of query aligns to 1:276/291 of 3u8gA

query
sites
3u8gA
S
 
T
L
 
I
R
 
Q
G
 
G
V
 
S
A
 
I
T
 
V
G
x
A
V
 
I
L
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
D
 
L
A
 
K
D
 
D
Q
 
G
G
 
G
I
 
V
E
 
D
Y
 
W
E
 
K
K
 
S
I
 
L
A
 
E
E
 
K
N
 
L
V
 
V
E
 
E
S
 
W
L
 
H
S
 
I
D
 
E
A
 
Q
G
 
G
V
 
T
G
 
N
V
 
S
F
 
I
L
 
V
A
 
A
A
 
V
A
x
G
N
x
T
I
x
T
S
 
G
E
 
E
Y
 
A
H
 
S
T
 
T
L
 
L
S
 
S
V
 
M
D
 
E
E
 
E
R
 
H
I
 
T
A
 
Q
V
 
V
T
 
I
E
 
K
A
 
E
A
 
I
V
 
I
D
 
R
A
 
V
L
 
A
P
 
N
S
 
K
S
 
R
A
 
I
C
 
P
V
 
I
L
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
G
 
A
N
 
N
L
 
S
A
 
T
-
 
R
E
 
E
A
 
A
R
 
I
E
 
E
L
 
L
V
 
T
A
 
K
A
 
A
Y
 
A
D
 
K
R
 
D
I
 
L
G
 
G
V
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
A
M
x
L
V
 
L
M
 
V
P
 
T
P
 
P
D
 
Y
F
x
Y
T
 
N
Y
 
K
I
 
P
H
 
T
E
 
Q
Q
 
E
G
 
G
L
 
L
L
 
Y
R
 
Q
Y
 
H
Y
 
Y
E
 
K
K
 
A
L
 
I
S
 
A
A
 
E
N
 
A
T
 
V
E
 
E
T
 
L
P
 
P
L
 
L
V
 
I
P
 
L
Y
|
Y
V
 
N
R
 
V
G
 
P
F
 
G
E
x
R
P
 
T
S
 
G
V
 
V
S
 
D
Y
 
L
L
 
S
D
 
N
D
 
D
-
 
T
-
 
A
-
 
V
-
 
R
L
 
L
T
 
A
R
 
E
V
 
I
D
 
P
G
 
N
L
 
I
V
 
V
G
 
G
I
 
I
K
|
K
-
 
D
-
 
A
-
 
T
-
 
G
-
 
D
-
 
V
-
 
P
-
 
R
-
 
G
Y
 
K
A
 
A
I
 
L
P
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
L
K
 
N
L
 
G
G
 
K
A
 
M
G
 
A
V
 
V
E
 
Y
A
 
S
G
 
G
A
 
D
D
 
D
D
 
E
V
 
T
V
 
A
W
 
W
V
 
-
D
 
-
G
 
-
L
 
-
A
 
-
E
 
-
P
 
-
H
 
-
A
 
-
P
 
-
S
 
E
F
 
L
W
 
M
V
 
L
E
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
D
G
 
G
F
 
N
S
x
I
A
 
S
G
 
V
V
 
T
S
 
A
N
 
N
F
 
I
R
 
A
P
 
P
E
 
K
I
 
A
G
 
M
L
 
S
A
 
E
L
 
V
L
 
C
D
 
A
A
 
V
L
 
A
T
 
I
E
 
A
E
 
K
D
 
D
W
 
E
G
 
Q
R
 
Q
A
 
A
R
 
K
A
 
T
L
 
L
K
 
N
N
 
N
A
 
K
C
 
I
L
 
A
P
 
N
Y
 
L
Q
 
H
N
 
N
F
 
I
R
 
L
T
 
-
E
 
-
T
 
F
G
 
C
R
 
E
N
 
S
N
 
N
E
 
P
I
 
I
P
 
P
D
 
-
A
 
-
I
 
-
S
 
-
V
 
-
P
 
-
A
 
-
V
 
V
K
 
K
K
 
W
G
 
A
L
 
L
E
 
H
L
 
E
A
 
M
G
 
G
L
 
L
H
 
I
G
 
D
G
 
T
N
 
G
V
 
I
R
 
R
D
 
L
P
 
P
I
 
L
R
 
T
P
 
P
L
 
L
S
 
A
S
 
E
E
 
Q

3tdfA Crystal structure of the complex of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with 2-ketobutanoic acid at 1.99 a resolution
24% identity, 90% coverage: 11:291/312 of query aligns to 1:276/291 of 3tdfA

query
sites
3tdfA
S
 
T
L
 
I
R
 
Q
G
 
G
V
 
S
A
 
I
T
 
V
G
x
A
V
 
I
L
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
D
 
L
A
 
K
D
 
D
Q
 
G
G
 
G
I
 
V
E
 
D
Y
 
W
E
 
K
K
 
S
I
 
L
A
 
E
E
 
K
N
 
L
V
 
V
E
 
E
S
 
W
L
 
H
S
 
I
D
 
E
A
 
Q
G
 
G
V
 
T
G
 
N
V
 
S
F
 
I
L
 
V
A
 
A
A
 
V
A
 
G
N
x
T
I
x
T
S
 
G
E
 
E
Y
 
A
H
 
S
T
 
T
L
 
L
S
 
S
V
 
M
D
 
E
E
 
E
R
 
H
I
 
T
A
 
Q
V
 
V
T
 
I
E
 
K
A
 
E
A
 
I
V
 
I
D
 
R
A
 
V
L
 
A
P
 
N
S
 
K
S
 
R
A
 
I
C
 
P
V
 
I
L
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
G
 
A
N
 
N
L
 
S
A
 
T
-
 
R
E
 
E
A
 
A
R
 
I
E
 
E
L
 
L
V
 
T
A
 
K
A
 
A
Y
 
A
D
 
K
R
 
D
I
 
L
G
 
G
V
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
A
M
 
L
V
 
L
M
 
V
P
 
T
P
 
P
D
 
Y
F
x
Y
T
 
N
Y
 
K
I
 
P
H
 
T
E
 
Q
Q
 
E
G
 
G
L
 
L
L
 
Y
R
 
Q
Y
 
H
Y
 
Y
E
 
K
K
 
A
L
 
I
S
 
A
A
 
E
N
 
A
T
 
V
E
 
E
T
 
L
P
 
P
L
 
L
V
 
I
P
 
L
Y
|
Y
V
 
N
R
 
V
G
 
P
F
 
G
E
x
R
P
 
T
S
 
G
V
 
V
S
 
D
Y
 
L
L
 
S
D
 
N
D
 
D
-
 
T
-
 
A
-
 
V
-
 
R
L
 
L
T
 
A
R
 
E
V
 
I
D
 
P
G
 
N
L
 
I
V
 
V
G
 
G
I
 
I
K
|
K
-
 
D
-
 
A
-
 
T
-
 
G
-
 
D
-
 
V
-
 
P
-
 
R
-
 
G
Y
 
K
A
 
A
I
 
L
P
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
L
K
 
N
L
 
G
G
 
K
A
 
M
G
 
A
V
 
V
E
 
Y
A
 
S
G
 
G
A
 
D
D
 
D
D
 
E
V
 
T
V
 
A
W
 
W
V
 
-
D
 
-
G
 
-
L
 
-
A
 
-
E
 
-
P
 
-
H
 
-
A
 
-
P
 
-
S
 
E
F
 
L
W
 
M
V
 
L
E
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
D
G
 
G
F
 
N
S
x
I
A
 
S
G
 
V
V
 
T
S
 
A
N
 
N
F
 
I
R
 
A
P
 
P
E
 
K
I
 
A
G
 
M
L
 
S
A
 
E
L
 
V
L
 
C
D
 
A
A
 
V
L
 
A
T
 
I
E
 
A
E
 
K
D
 
D
W
 
E
G
 
Q
R
 
Q
A
 
A
R
 
K
A
 
T
L
 
L
K
 
N
N
 
N
A
 
K
C
 
I
L
 
A
P
 
N
Y
 
L
Q
 
H
N
 
N
F
 
I
R
 
L
T
 
-
E
 
-
T
 
F
G
 
C
R
 
E
N
 
S
N
 
N
E
 
P
I
 
I
P
 
P
D
 
-
A
 
-
I
 
-
S
 
-
V
 
-
P
 
-
A
 
-
V
 
V
K
 
K
K
 
W
G
 
A
L
 
L
E
 
H
L
 
E
A
 
M
G
 
G
L
 
L
H
 
I
G
 
D
G
 
T
N
 
G
V
 
I
R
 
R
D
 
L
P
 
P
I
 
L
R
 
T
P
 
P
L
 
L
S
 
A
S
 
E
E
 
Q

3tceA Crystal structure of the complex of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with 5-hydroxylysine at 2.6 a resolution
24% identity, 90% coverage: 11:291/312 of query aligns to 1:276/291 of 3tceA

query
sites
3tceA
S
 
T
L
 
I
R
 
Q
G
 
G
V
 
S
A
 
I
T
 
V
G
 
A
V
 
I
L
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
D
 
L
A
 
K
D
 
D
Q
 
G
G
 
G
I
 
V
E
 
D
Y
 
W
E
 
K
K
 
S
I
 
L
A
 
E
E
 
K
N
 
L
V
 
V
E
 
E
S
 
W
L
 
H
S
 
I
D
 
E
A
 
Q
G
 
G
V
 
T
G
 
N
V
 
S
F
 
I
L
 
V
A
 
A
A
 
V
A
 
G
N
x
T
I
 
T
S
 
G
E
 
E
Y
 
A
H
x
S
T
 
T
L
|
L
S
 
S
V
 
M
D
 
E
E
 
E
R
x
H
I
 
T
A
 
Q
V
 
V
T
 
I
E
 
K
A
 
E
A
 
I
V
 
I
D
 
R
A
 
V
L
 
A
P
 
N
S
 
K
S
 
R
A
 
I
C
 
P
V
 
I
L
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
G
 
A
N
 
N
L
 
S
A
 
T
-
 
R
E
 
E
A
 
A
R
 
I
E
 
E
L
 
L
V
 
T
A
 
K
A
 
A
Y
 
A
D
 
K
R
 
D
I
 
L
G
 
G
V
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
A
M
 
L
V
 
L
M
 
V
P
 
T
P
 
P
D
x
Y
F
x
Y
T
 
N
Y
 
K
I
 
P
H
 
T
E
 
Q
Q
 
E
G
 
G
L
 
L
L
 
Y
R
 
Q
Y
 
H
Y
 
Y
E
 
K
K
 
A
L
 
I
S
 
A
A
 
E
N
 
A
T
 
V
E
 
E
T
 
L
P
 
P
L
 
L
V
 
I
P
 
L
Y
|
Y
V
 
N
R
 
V
G
 
P
F
 
G
E
x
R
P
 
T
S
 
G
V
 
V
S
 
D
Y
 
L
L
 
S
D
 
N
D
 
D
-
 
T
-
 
A
-
 
V
-
 
R
L
 
L
T
 
A
R
 
E
V
 
I
D
 
P
G
 
N
L
 
I
V
 
V
G
 
G
I
 
I
K
|
K
-
 
D
-
 
A
-
 
T
-
 
G
-
 
D
-
 
V
-
 
P
-
 
R
-
 
G
Y
 
K
A
 
A
I
 
L
P
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
L
K
 
N
L
 
G
G
 
K
A
 
M
G
 
A
V
 
V
E
 
Y
A
 
S
G
 
G
A
 
D
D
 
D
D
 
E
V
 
T
V
 
A
W
 
W
V
 
-
D
 
-
G
 
-
L
 
-
A
 
-
E
 
-
P
 
-
H
 
-
A
 
-
P
 
-
S
 
E
F
 
L
W
 
M
V
 
L
E
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
D
G
 
G
F
 
N
S
x
I
A
 
S
G
 
V
V
 
T
S
 
A
N
 
N
F
 
I
R
 
A
P
 
P
E
 
K
I
 
A
G
 
M
L
 
S
A
 
E
L
 
V
L
 
C
D
 
A
A
 
V
L
 
A
T
 
I
E
 
A
E
 
K
D
 
D
W
 
E
G
 
Q
R
 
Q
A
 
A
R
 
K
A
 
T
L
 
L
K
 
N
N
 
N
A
 
K
C
 
I
L
 
A
P
 
N
Y
 
L
Q
 
H
N
 
N
F
 
I
R
 
L
T
 
-
E
 
-
T
 
F
G
 
C
R
 
E
N
 
S
N
 
N
E
 
P
I
 
I
P
 
P
D
 
-
A
 
-
I
 
-
S
 
-
V
 
-
P
 
-
A
 
-
V
 
V
K
 
K
K
 
W
G
 
A
L
 
L
E
 
H
L
 
E
A
 
M
G
 
G
L
 
L
H
 
I
G
 
D
G
 
T
N
 
G
V
 
I
R
 
R
D
 
L
P
 
P
I
 
L
R
 
T
P
 
P
L
 
L
S
 
A
S
 
E
E
 
Q

3rk8A Crystal structure of the chloride inhibited dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii complexed with pyruvate at 1.8 a resolution
24% identity, 90% coverage: 11:291/312 of query aligns to 1:276/291 of 3rk8A

query
sites
3rk8A
S
 
T
L
 
I
R
 
Q
G
 
G
V
 
S
A
 
I
T
 
V
G
 
A
V
 
I
L
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
D
 
L
A
 
K
D
 
D
Q
 
G
G
 
G
I
 
V
E
 
D
Y
 
W
E
 
K
K
 
S
I
 
L
A
 
E
E
 
K
N
 
L
V
 
V
E
 
E
S
 
W
L
 
H
S
 
I
D
 
E
A
 
Q
G
 
G
V
 
T
G
 
N
V
 
S
F
 
I
L
 
V
A
 
A
A
 
V
A
 
G
N
x
T
I
 
T
S
 
G
E
 
E
Y
 
A
H
 
S
T
 
T
L
 
L
S
 
S
V
 
M
D
 
E
E
 
E
R
 
H
I
 
T
A
 
Q
V
 
V
T
 
I
E
 
K
A
 
E
A
 
I
V
 
I
D
 
R
A
 
V
L
 
A
P
 
N
S
 
K
S
 
R
A
 
I
C
 
P
V
 
I
L
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
G
 
A
N
 
N
L
 
S
A
 
T
-
 
R
E
 
E
A
 
A
R
 
I
E
 
E
L
 
L
V
 
T
A
 
K
A
 
A
Y
 
A
D
 
K
R
 
D
I
 
L
G
 
G
V
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
A
M
 
L
V
 
L
M
 
V
P
 
T
P
 
P
D
 
Y
F
x
Y
T
 
N
Y
 
K
I
 
P
H
 
T
E
 
Q
Q
 
E
G
 
G
L
 
L
L
 
Y
R
 
Q
Y
 
H
Y
 
Y
E
 
K
K
 
A
L
 
I
S
 
A
A
 
E
N
 
A
T
 
V
E
 
E
T
 
L
P
 
P
L
 
L
V
 
I
P
 
L
Y
|
Y
V
 
N
R
 
V
G
 
P
F
 
G
E
x
R
P
 
T
S
 
G
V
 
V
S
 
D
Y
 
L
L
 
S
D
 
N
D
 
D
-
 
T
-
 
A
-
 
V
-
 
R
L
 
L
T
 
A
R
 
E
V
 
I
D
 
P
G
 
N
L
 
I
V
 
V
G
 
G
I
 
I
K
|
K
-
 
D
-
 
A
-
 
T
-
 
G
-
 
D
-
 
V
-
 
P
-
 
R
-
 
G
Y
 
K
A
 
A
I
 
L
P
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
L
K
 
N
L
 
G
G
 
K
A
 
M
G
 
A
V
 
V
E
 
Y
A
 
S
G
|
G
A
 
D
D
 
D
D
 
E
V
 
T
V
 
A
W
 
W
V
 
-
D
 
-
G
 
-
L
 
-
A
 
-
E
 
-
P
 
-
H
 
-
A
 
-
P
 
-
S
 
E
F
 
L
W
 
M
V
 
L
E
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
D
G
 
G
F
 
N
S
x
I
A
 
S
G
 
V
V
 
T
S
 
A
N
 
N
F
 
I
R
 
A
P
 
P
E
 
K
I
 
A
G
 
M
L
 
S
A
 
E
L
 
V
L
 
C
D
 
A
A
 
V
L
 
A
T
 
I
E
 
A
E
 
K
D
 
D
W
 
E
G
 
Q
R
 
Q
A
 
A
R
 
K
A
 
T
L
 
L
K
 
N
N
 
N
A
 
K
C
 
I
L
 
A
P
 
N
Y
 
L
Q
 
H
N
 
N
F
 
I
R
 
L
T
 
-
E
 
-
T
x
F
G
 
C
R
 
E
N
 
S
N
 
N
E
 
P
I
 
I
P
 
P
D
 
-
A
 
-
I
 
-
S
 
-
V
 
-
P
 
-
A
 
-
V
 
V
K
 
K
K
 
W
G
 
A
L
 
L
E
 
H
L
 
E
A
 
M
G
 
G
L
 
L
H
 
I
G
 
D
G
 
T
N
 
G
V
 
I
R
 
R
D
 
L
P
 
P
I
 
L
R
 
T
P
 
P
L
 
L
S
 
A
S
 
E
E
 
Q

3pueB Crystal structure of the complex of dhydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with lysine at 2.6a resolution
24% identity, 90% coverage: 11:291/312 of query aligns to 1:276/291 of 3pueB

query
sites
3pueB
S
 
T
L
 
I
R
 
Q
G
 
G
V
 
S
A
 
I
T
 
V
G
 
A
V
 
I
L
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
D
 
L
A
 
K
D
 
D
Q
 
G
G
 
G
I
 
V
E
 
D
Y
 
W
E
 
K
K
 
S
I
 
L
A
 
E
E
 
K
N
 
L
V
 
V
E
 
E
S
 
W
L
 
H
S
 
I
D
 
E
A
 
Q
G
 
G
V
 
T
G
 
N
V
 
S
F
 
I
L
 
V
A
 
A
A
 
V
A
 
G
N
x
T
I
 
T
S
 
G
E
 
E
Y
 
A
H
 
S
T
 
T
L
 
L
S
 
S
V
 
M
D
 
E
E
 
E
R
 
H
I
 
T
A
 
Q
V
 
V
T
 
I
E
 
K
A
 
E
A
 
I
V
 
I
D
 
R
A
 
V
L
 
A
P
 
N
S
 
K
S
 
R
A
 
I
C
 
P
V
 
I
L
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
G
 
A
N
 
N
L
 
S
A
 
T
-
 
R
E
 
E
A
 
A
R
 
I
E
 
E
L
 
L
V
 
T
A
 
K
A
 
A
Y
 
A
D
 
K
R
 
D
I
 
L
G
 
G
V
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
A
M
 
L
V
 
L
M
 
V
P
 
T
P
 
P
D
 
Y
F
x
Y
T
 
N
Y
 
K
I
 
P
H
 
T
E
 
Q
Q
 
E
G
 
G
L
 
L
L
 
Y
R
 
Q
Y
 
H
Y
 
Y
E
 
K
K
 
A
L
 
I
S
 
A
A
 
E
N
 
A
T
 
V
E
 
E
T
 
L
P
 
P
L
 
L
V
 
I
P
 
L
Y
|
Y
V
 
N
R
 
V
G
 
P
F
 
G
E
x
R
P
 
T
S
 
G
V
 
V
S
 
D
Y
 
L
L
 
S
D
 
N
D
 
D
-
 
T
-
 
A
-
 
V
-
 
R
L
 
L
T
 
A
R
 
E
V
 
I
D
 
P
G
 
N
L
 
I
V
 
V
G
 
G
I
 
I
K
|
K
-
 
D
-
 
A
-
 
T
-
 
G
-
 
D
-
 
V
-
 
P
-
 
R
-
 
G
Y
 
K
A
 
A
I
 
L
P
 
I
D
 
D
A
 
A
V
 
L
K
 
N
L
 
G
G
 
K
A
 
M
G
 
A
V
 
V
E
 
Y
A
 
S
G
 
G
A
 
D
D
 
D
D
 
E
V
 
T
V
 
A
W
 
W
V
 
-
D
 
-
G
 
-
L
 
-
A
 
-
E
 
-
P
 
-
H
 
-
A
 
-
P
 
-
S
 
E
F
 
L
W
 
M
V
 
L
E
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
D
G
 
G
F
 
N
S
x
I
A
 
S
G
 
V
V
 
T
S
 
A
N
 
N
F
 
I
R
 
A
P
 
P
E
 
K
I
 
A
G
 
M
L
 
S
A
 
E
L
 
V
L
 
C
D
 
A
A
 
V
L
 
A
T
 
I
E
 
A
E
 
K
D
 
D
W
 
E
G
 
Q
R
 
Q
A
 
A
R
 
K
A
 
T
L
 
L
K
 
N
N
 
N
A
 
K
C
 
I
L
 
A
P
 
N
Y
 
L
Q
 
H
N
 
N
F
 
I
R
 
L
T
 
-
E
 
-
T
x
F
G
 
C
R
 
E
N
 
S
N
|
N
E
 
P
I
 
I
P
 
P
D
 
-
A
 
-
I
 
-
S
 
-
V
 
-
P
 
-
A
 
-
V
 
V
K
 
K
K
 
W
G
 
A
L
 
L
E
 
H
L
 
E
A
 
M
G
 
G
L
 
L
H
 
I
G
 
D
G
 
T
N
 
G
V
 
I
R
 
R
D
 
L
P
 
P
I
 
L
R
 
T
P
 
P
L
 
L
S
 
A
S
 
E
E
 
Q

3na8A Crystal structure of a putative dihydrodipicolinate synthetase from pseudomonas aeruginosa
26% identity, 90% coverage: 11:291/312 of query aligns to 2:278/291 of 3na8A

query
sites
3na8A
S
 
S
L
 
I
R
 
H
G
 
G
V
 
I
A
 
I
T
 
G
G
 
Y
V
 
T
L
 
I
T
 
T
P
 
P
F
 
F
D
 
A
A
 
A
D
 
D
Q
 
G
G
 
G
I
 
L
E
 
D
Y
 
L
E
 
P
K
 
A
I
 
L
A
 
G
E
 
R
N
 
S
V
 
I
E
 
E
S
 
R
L
 
L
S
 
I
D
 
D
A
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
H
V
 
A
F
 
I
L
 
A
A
 
P
A
 
L
A
 
G
N
x
S
I
 
T
S
 
G
E
 
E
Y
 
G
H
 
A
T
 
Y
L
 
L
S
 
S
V
 
D
D
 
P
E
 
E
R
 
W
I
 
D
A
 
E
V
 
V
T
 
V
E
 
D
A
 
F
A
 
T
V
 
L
D
 
K
A
 
T
L
 
V
P
 
A
S
 
H
S
 
R
A
 
V
C
 
P
V
 
T
L
 
I
A
 
V
G
 
S
V
 
V
G
 
-
G
 
S
N
 
D
L
 
L
A
 
T
E
 
T
A
 
A
R
 
K
E
 
T
L
 
V
V
 
R
A
 
R
A
 
A
Y
 
Q
-
 
F
-
 
A
D
 
E
R
 
S
I
 
L
G
 
G
V
 
A
D
 
E
A
 
A
L
 
V
M
 
M
V
 
V
M
 
L
P
 
P
P
 
I
D
 
S
F
x
Y
T
 
W
Y
 
K
I
 
L
H
 
N
E
 
E
Q
 
A
G
 
E
L
 
V
L
 
F
R
 
Q
Y
 
H
Y
 
Y
E
 
R
K
 
A
L
 
V
S
 
G
A
 
E
N
 
A
T
 
I
E
 
G
T
 
V
P
 
P
L
 
V
V
 
M
P
 
L
Y
|
Y
-
 
N
-
 
N
-
 
P
-
 
G
V
x
T
R
 
S
G
 
G
F
 
I
E
 
D
P
 
M
S
 
S
V
 
V
S
 
E
Y
 
L
L
 
I
D
 
L
D
 
R
L
 
I
T
x
V
R
 
R
-
 
E
V
|
V
D
|
D
G
 
N
L
x
V
V
 
T
G
 
M
I
 
V
K
|
K
Y
 
E
A
 
S
I
 
T
P
 
G
D
 
D
A
 
I
V
 
Q
K
 
R
L
 
M
G
 
H
A
 
K
G
 
L
V
 
R
E
 
L
A
 
L
G
 
G
A
 
E
D
 
G
D
 
R
V
 
V
V
 
P
W
 
F
V
 
Y
D
 
N
G
 
G
L
 
-
A
 
C
E
 
N
P
 
P
H
 
L
A
 
A
P
 
L
S
 
E
F
 
A
W
 
F
V
 
V
E
 
A
G
 
G
A
 
A
E
 
K
G
 
G
F
 
W
S
x
C
A
 
S
G
 
A
V
 
A
S
 
P
N
 
N
F
 
L
R
 
I
P
 
P
E
 
T
I
 
L
G
 
N
L
 
G
A
 
Q
L
 
L
L
 
Y
D
 
Q
A
 
A
L
 
V
T
 
L
E
 
D
E
 
G
D
 
D
W
 
L
G
 
E
R
 
K
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
K
 
F
N
 
Y
A
 
R
C
 
Q
L
 
L
P
 
P
Y
 
L
Q
 
L
N
 
D
F
 
F
R
 
I
T
 
L
E
 
R
T
 
R
G
 
G
R
 
-
N
 
-
N
 
-
E
 
-
I
 
L
P
 
P
D
 
T
A
 
T
I
 
I
S
 
-
V
 
-
P
 
-
A
 
-
V
 
-
K
 
K
K
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
G
L
 
L
A
 
S
G
 
G
L
 
L
H
 
E
G
 
V
G
 
G
N
 
A
V
 
P
R
 
R
D
 
L
P
 
P
I
 
V
R
 
Q
P
 
A
L
 
L
S
 
D
S
 
T
E
 
E

4pfmA Shewanella benthica dhdps with lysine and pyruvate
26% identity, 90% coverage: 12:291/312 of query aligns to 3:278/295 of 4pfmA

query
sites
4pfmA
L
 
I
R
 
N
G
 
G
V
 
S
A
 
I
T
 
V
G
 
A
V
 
L
L
 
I
T
 
T
P
 
P
F
 
L
D
 
N
A
 
S
D
 
D
Q
 
G
G
 
T
I
 
V
E
 
D
Y
 
Y
E
 
T
K
 
S
I
 
L
A
 
E
E
 
K
N
 
L
V
 
V
E
 
E
S
 
Y
L
 
H
S
 
I
D
 
T
A
 
E
G
 
G
V
 
T
G
 
D
V
 
A
F
 
I
L
 
V
A
 
A
A
 
V
A
 
G
N
x
T
I
 
T
S
 
G
E
 
E
Y
x
S
H
x
A
T
 
T
L
|
L
S
 
P
V
 
I
D
 
S
E
 
E
R
x
H
I
 
I
A
 
A
V
 
V
T
 
V
E
 
G
A
 
Q
A
 
T
V
 
V
D
 
K
A
 
F
L
 
A
P
 
S
S
 
G
S
 
R
A
 
I
C
 
P
V
 
V
L
 
I
A
 
G
G
 
G
V
 
N
G
 
G
G
 
A
N
|
N
-
 
A
L
 
T
A
 
A
E
|
E
A
 
A
R
 
I
E
 
E
L
 
L
V
 
T
A
 
K
A
 
A
Y
 
Q
D
 
N
R
 
K
I
 
L
G
 
G
V
 
V
D
 
A
A
 
A
L
 
M
M
 
L
V
 
G
M
 
V
P
 
T
P
 
P
D
x
Y
F
x
Y
T
 
N
Y
 
K
I
 
P
H
 
S
E
 
P
Q
 
K
G
 
G
L
 
L
L
 
I
R
 
A
Y
 
H
Y
 
Y
E
 
T
K
 
A
L
 
V
S
 
A
A
 
A
N
 
S
T
 
T
E
 
D
T
 
I
P
 
P
L
 
Q
V
 
I
P
 
L
Y
|
Y
V
 
N
R
 
V
G
 
P
F
 
G
E
x
R
P
 
T
S
 
A
V
 
V
S
 
D
Y
 
M
L
 
L
D
 
P
D
 
E
-
 
T
-
 
I
-
 
A
-
 
Q
L
 
L
T
 
V
R
 
E
V
 
V
D
 
P
G
 
N
L
 
I
V
 
I
G
 
G
I
 
V
K
|
K
Y
 
D
A
 
A
I
 
T
P
 
G
D
 
D
A
 
V
V
 
A
K
 
R
L
 
V
G
 
K
A
 
Q
G
 
L
V
 
R
E
 
D
A
 
L
G
 
C
A
 
G
D
 
N
D
 
D
V
 
F
V
 
L
W
 
L
V
 
Y
D
 
S
G
 
G
L
 
-
A
 
D
E
 
D
P
 
A
H
 
T
A
 
A
P
 
R
S
 
E
F
 
F
W
 
L
V
 
T
E
 
L
G
 
G
A
 
G
E
 
D
G
 
G
F
 
V
S
x
I
A
 
S
G
 
V
V
 
A
S
 
N
N
 
N
F
 
I
R
 
V
P
 
P
E
 
K
I
 
L
G
 
F
L
 
K
A
 
L
L
 
M
L
 
C
D
 
D
A
 
A
L
 
A
T
 
L
E
 
A
E
 
G
D
 
D
W
 
T
G
 
Q
R
 
A
A
 
A
R
 
M
A
 
A
L
 
A
K
 
E
N
 
D
A
 
Q
C
 
I
L
 
K
P
 
G
Y
 
L
Q
 
-
N
 
-
F
 
F
R
 
S
T
 
A
E
 
L
T
 
F
G
 
C
R
 
E
N
 
A
N
 
N
E
 
P
I
 
I
P
 
P
D
 
-
A
 
-
I
 
V
S
 
K
V
 
W
P
 
A
A
 
A
V
 
H
K
 
K
K
 
M
G
 
G
L
 
L
E
 
-
L
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
I
H
 
S
G
 
Q
G
 
G
N
 
D
V
 
I
R
 
R
D
 
L
P
 
P
I
 
L
R
 
T
P
 
E
L
 
L
S
 
S
S
 
T
E
 
E

4ur8A Crystal structure of keto-deoxy-d-galactarate dehydratase complexed with 2-oxoadipic acid (see paper)
25% identity, 96% coverage: 3:302/312 of query aligns to 1:299/304 of 4ur8A

query
sites
4ur8A
L
 
M
S
 
D
P
 
P
A
 
E
E
 
Q
V
 
I
R
 
K
E
 
T
S
 
A
L
 
L
-
 
G
R
 
S
G
 
G
V
 
L
A
 
L
T
 
S
G
x
F
V
 
P
L
 
V
T
 
T
P
 
H
F
 
F
D
 
D
A
 
A
D
 
E
Q
 
G
G
 
R
I
 
F
E
 
A
Y
 
A
E
 
D
K
 
S
I
 
Y
A
 
R
E
 
E
N
 
H
V
 
V
E
 
E
S
 
W
L
 
L
S
 
A
D
 
G
A
 
Y
G
 
K
V
 
A
G
 
P
V
 
V
F
 
L
L
 
F
A
 
A
A
 
A
A
 
G
N
x
G
I
x
T
S
 
G
E
 
E
Y
 
F
H
 
F
T
 
S
L
 
L
S
 
K
V
 
P
D
 
D
E
 
E
R
 
-
I
 
I
A
 
P
V
 
T
T
 
I
E
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
A
D
 
K
A
 
E
L
 
V
P
 
A
S
 
G
S
 
E
A
 
T
C
 
A
V
 
I
L
 
V
A
 
S
G
 
G
V
 
C
G
 
G
G
 
Y
N
 
G
L
 
T
A
 
E
E
 
I
A
 
A
R
 
V
E
 
D
L
 
I
V
 
A
A
 
R
A
 
S
Y
 
V
D
 
E
R
 
K
I
 
V
G
 
G
V
 
A
D
 
D
A
 
G
L
 
I
M
 
L
V
 
L
M
 
L
P
 
P
P
 
H
D
 
Y
F
x
L
T
 
I
Y
 
D
I
 
A
H
 
P
E
 
Q
Q
 
E
G
 
G
L
 
L
L
 
Y
R
 
A
Y
 
H
Y
 
I
E
 
K
K
 
K
L
 
V
S
 
C
A
 
Q
N
 
S
T
 
V
E
 
G
T
 
I
P
 
G
L
 
V
V
 
M
P
 
V
Y
|
Y
V
 
N
R
 
R
G
 
-
F
 
-
E
 
D
P
 
N
S
 
S
V
 
V
S
 
L
Y
 
Q
L
 
A
D
 
D
D
 
T
L
 
L
T
 
A
R
 
R
V
 
L
-
 
C
-
 
D
-
 
E
-
 
C
D
 
P
G
 
N
L
 
L
V
 
V
G
 
G
I
 
F
K
|
K
Y
 
D
A
 
G
I
 
T
P
 
G
D
 
D
A
 
I
V
 
G
K
 
L
L
 
V
G
 
R
A
 
Q
G
 
I
V
 
T
E
 
A
A
 
K
G
 
M
A
 
G
D
 
D
D
 
R
V
 
L
V
 
M
W
 
Y
V
 
L
D
 
G
G
 
G
L
 
M
-
 
P
-
 
T
A
 
A
E
 
E
P
 
L
H
 
F
A
 
A
P
 
E
S
 
A
F
 
Y
W
 
L
V
 
G
E
 
A
G
 
G
A
 
F
E
 
T
G
 
T
F
 
Y
S
|
S
A
 
S
G
 
A
V
 
V
S
 
F
N
 
N
F
 
F
R
 
V
P
 
P
E
 
G
I
 
L
G
 
A
L
 
N
A
 
E
L
 
F
L
 
Y
D
 
A
A
 
A
L
 
L
T
 
R
E
 
A
E
 
G
D
 
E
W
 
R
G
 
A
R
 
T
A
 
C
-
 
E
R
 
R
A
 
I
L
 
L
K
 
V
N
 
D
A
 
F
C
 
F
L
 
Y
P
 
P
Y
 
F
Q
 
M
N
 
A
F
 
I
R
 
R
T
 
N
E
 
R
T
 
A
G
 
-
R
 
-
N
 
-
N
 
-
E
 
-
I
 
-
P
 
-
D
 
K
A
 
G
I
 
Y
S
 
A
V
 
V
P
 
S
A
 
A
V
 
V
K
 
K
K
 
A
G
 
G
L
 
V
E
 
R
L
 
L
A
 
Q
G
 
G
L
 
F
H
 
N
G
 
A
G
 
G
N
 
P
V
 
V
R
 
R
D
 
A
P
 
P
I
 
L
R
 
K
P
 
D
L
 
L
S
 
T
S
 
N
E
 
E
D
 
E
E
 
I
A
 
G
R
 
M
A
 
L
E
 
E
E
 
A
L
 
L
Y
 
I
-
 
G
T
 
T
H
 
H

5hwnB Crystal structure of keto-deoxy-d-galactarate dehydratase complexed with pyruvate (see paper)
25% identity, 96% coverage: 3:302/312 of query aligns to 1:299/310 of 5hwnB

query
sites
5hwnB
L
 
M
S
 
D
P
 
P
A
 
E
E
 
Q
V
 
I
R
 
K
E
 
T
S
 
A
L
 
L
-
 
G
R
 
S
G
 
G
V
 
L
A
 
L
T
 
S
G
x
F
V
 
P
L
 
V
T
 
T
P
 
H
F
 
F
D
 
D
A
 
A
D
 
E
Q
 
G
G
 
R
I
 
F
E
 
A
Y
 
A
E
 
D
K
 
S
I
 
Y
A
 
R
E
 
E
N
 
H
V
 
V
E
 
E
S
 
W
L
 
L
S
 
A
D
 
G
A
 
Y
G
 
K
V
 
A
G
 
P
V
 
V
F
 
L
L
 
F
A
 
A
A
 
A
A
 
G
N
x
G
I
x
T
S
 
G
E
 
E
Y
 
F
H
 
F
T
 
S
L
 
L
S
 
K
V
 
P
D
 
D
E
 
E
R
 
-
I
 
I
A
 
P
V
 
T
T
 
I
E
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
A
D
 
K
A
 
E
L
 
V
P
 
A
S
 
G
S
 
E
A
 
T
C
 
A
V
 
I
L
 
V
A
 
S
G
 
G
V
 
C
G
 
G
G
 
Y
N
 
G
L
 
T
A
 
E
E
 
I
A
 
A
R
 
V
E
 
D
L
 
I
V
 
A
A
 
R
A
 
S
Y
 
V
D
 
E
R
 
K
I
 
V
G
 
G
V
 
A
D
 
D
A
 
G
L
 
I
M
 
L
V
 
L
M
 
L
P
 
P
P
 
H
D
 
Y
F
x
L
T
 
I
Y
 
D
I
 
A
H
 
P
E
 
Q
Q
 
E
G
 
G
L
 
L
L
 
Y
R
 
A
Y
 
H
Y
 
I
E
 
K
K
 
K
L
 
V
S
 
C
A
 
Q
N
 
S
T
 
V
E
 
G
T
 
I
P
 
G
L
 
V
V
 
M
P
 
V
Y
|
Y
V
 
N
R
 
R
G
 
-
F
 
-
E
 
D
P
 
N
S
 
S
V
 
V
S
 
L
Y
 
Q
L
 
A
D
 
D
D
 
T
L
 
L
T
 
A
R
 
R
V
 
L
-
 
C
-
 
D
-
 
E
-
 
C
D
 
P
G
 
N
L
 
L
V
 
V
G
 
G
I
 
F
K
|
K
Y
 
D
A
 
G
I
 
T
P
 
G
D
 
D
A
 
I
V
 
G
K
 
L
L
 
V
G
 
R
A
 
Q
G
 
I
V
 
T
E
 
A
A
 
K
G
 
M
A
 
G
D
 
D
D
 
R
V
 
L
V
 
M
W
 
Y
V
 
L
D
 
G
G
 
G
L
 
M
-
 
P
-
 
T
A
 
A
E
 
E
P
 
L
H
 
F
A
 
A
P
 
E
S
 
A
F
 
Y
W
 
L
V
 
G
E
 
A
G
 
G
A
 
F
E
 
T
G
 
T
F
 
Y
S
|
S
A
 
S
G
 
A
V
 
V
S
 
F
N
 
N
F
 
F
R
 
V
P
 
P
E
 
G
I
 
L
G
 
A
L
 
N
A
 
E
L
 
F
L
 
Y
D
 
A
A
 
A
L
 
L
T
 
R
E
 
A
E
 
G
D
 
E
W
 
R
G
 
A
R
 
T
A
 
C
-
 
E
R
 
R
A
 
I
L
 
L
K
 
V
N
 
D
A
 
F
C
 
F
L
 
Y
P
 
P
Y
 
F
Q
 
M
N
 
A
F
 
I
R
 
R
T
 
N
E
 
R
T
 
A
G
 
-
R
 
-
N
 
-
N
 
-
E
 
-
I
 
-
P
 
-
D
 
K
A
 
G
I
 
Y
S
 
A
V
 
V
P
 
S
A
 
A
V
 
V
K
 
K
K
 
A
G
 
G
L
 
V
E
 
R
L
 
L
A
 
Q
G
 
G
L
 
F
H
 
N
G
 
A
G
 
G
N
 
P
V
 
V
R
 
R
D
 
A
P
 
P
I
 
L
R
 
K
P
 
D
L
 
L
S
 
T
S
 
N
E
 
E
D
 
E
E
 
I
A
 
G
R
 
M
A
 
L
E
 
E
E
 
A
L
 
L
Y
 
I
-
 
G
T
 
T
H
 
H

Q86XE5 4-hydroxy-2-oxoglutarate aldolase, mitochondrial; Dihydrodipicolinate synthase-like; DHDPS-like protein; Probable 2-keto-4-hydroxyglutarate aldolase; Probable KHG-aldolase; Protein 569272; EC 4.1.3.16 from Homo sapiens (Human) (see paper)
23% identity, 90% coverage: 14:293/312 of query aligns to 37:314/327 of Q86XE5

query
sites
Q86XE5
G
 
G
V
 
I
A
 
Y
T
 
P
G
 
P
V
 
V
L
 
T
T
 
T
P
 
P
F
 
F
D
 
T
A
 
A
D
 
T
Q
 
A
G
 
E
I
 
V
E
 
D
Y
 
Y
E
 
G
K
 
K
I
 
L
A
 
E
E
 
E
N
 
N
V
 
L
E
 
H
S
 
K
L
 
L
S
 
G
D
 
T
A
 
F
G
 
P
V
 
F
G
 
R
V
 
G
F
 
F
L
 
V
A
 
V
A
 
Q
A
 
G
N
x
S
I
x
N
S
 
G
E
 
E
Y
 
F
H
 
P
T
 
F
L
 
L
S
 
T
V
 
S
D
 
S
E
 
E
R
 
R
I
 
L
A
 
E
V
 
V
T
 
V
E
 
S
A
 
R
A
 
V
V
 
R
D
 
Q
A
 
A
L
 
M
P
 
P
S
 
K
S
 
N
A
 
R
C
 
L
V
 
L
L
 
L
A
 
A
G
 
G
V
 
S
G
 
G
G
 
C
N
 
E
L
 
S
A
 
T
E
 
Q
A
 
A
R
 
T
-
 
V
E
 
E
L
 
M
V
 
T
A
 
V
A
 
S
Y
 
M
D
 
A
R
 
Q
I
 
V
G
 
G
V
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
A
M
 
M
V
 
V
M
 
V
P
 
T
P
 
P
D
 
C
F
x
Y
T
 
Y
-
 
R
-
 
G
Y
 
R
I
 
M
H
 
S
E
 
S
Q
 
A
G
 
A
L
 
L
L
 
I
R
 
H
Y
 
H
Y
 
Y
E
 
T
K
 
K
L
 
V
S
 
A
A
 
D
N
 
L
T
 
S
E
 
P
T
 
I
P
 
P
L
 
V
V
 
V
P
 
L
Y
|
Y
V
 
S
-
 
V
-
 
P
-
 
A
-
 
N
R
 
T
G
 
G
F
 
L
E
 
D
P
 
L
S
 
P
V
 
V
S
 
D
Y
 
A
L
 
V
D
 
V
D
 
T
L
 
L
T
 
S
R
 
Q
V
 
H
D
 
P
G
 
N
L
 
I
V
 
V
G
 
G
I
 
M
K
|
K
Y
 
D
A
x
S
I
 
G
P
 
G
D
 
D
A
 
V
V
 
T
K
 
R
L
 
I
G
 
G
A
 
L
G
 
I
V
 
V
E
 
H
A
 
K
G
 
T
A
 
R
D
 
K
D
 
Q
V
 
D
V
 
F
W
 
Q
V
 
V
D
 
L
G
 
A
L
 
G
A
 
S
E
 
A
P
 
G
H
 
F
A
 
L
P
 
M
S
 
A
F
 
S
W
 
Y
V
 
A
E
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
V
G
 
G
F
 
G
S
 
V
A
 
C
G
 
A
V
 
L
S
 
A
N
 
N
F
 
V
R
 
L
P
 
G
E
 
A
I
 
Q
G
 
V
L
 
C
A
 
Q
L
 
L
L
 
E
D
 
R
A
 
L
L
 
C
T
 
C
E
 
T
E
 
G
D
 
Q
W
 
W
G
 
E
R
 
D
A
 
A
R
 
Q
A
 
K
L
 
L
K
 
Q
N
 
H
A
 
R
C
 
L
L
 
I
P
 
E
Y
 
-
Q
 
-
N
 
-
F
 
-
R
 
-
T
 
-
E
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
P
N
 
N
N
 
A
E
 
A
I
 
V
P
 
T
D
 
R
A
 
R
I
 
F
S
 
G
V
 
I
P
 
P
A
 
G
V
 
L
K
 
K
K
 
K
G
 
I
L
 
M
E
 
D
L
 
W
A
 
F
G
 
G
L
 
Y
H
 
Y
G
 
G
G
 
G
N
 
P
V
 
C
R
 
R
D
 
A
P
 
P
I
 
L
R
 
Q
P
 
E
L
 
L
S
 
S
S
 
P
E
 
A
D
 
E
E
 
E

Q9S4K9 N-acetylneuraminate lyase; NAL; Neu5Ac lyase; N-acetylneuraminate pyruvate-lyase; N-acetylneuraminic acid aldolase; Sialate lyase; Sialic acid aldolase; Sialic acid lyase; EC 4.1.3.3 from Clostridium perfringens (strain 13 / Type A) (see paper)
24% identity, 92% coverage: 12:299/312 of query aligns to 1:283/288 of Q9S4K9

query
sites
Q9S4K9
L
 
M
R
 
K
G
 
G
V
 
I
A
 
Y
T
 
S
G
 
A
V
 
L
L
 
L
T
 
V
P
 
S
F
 
F
D
 
D
A
 
K
D
 
D
Q
 
G
G
 
N
I
 
I
E
 
N
-
 
E
-
 
K
-
 
G
-
 
L
Y
 
R
E
 
E
K
 
I
I
 
I
A
 
R
E
 
H
N
 
N
V
 
I
E
 
D
S
 
V
L
 
C
S
 
K
D
 
I
A
 
D
G
 
G
V
 
L
G
 
Y
V
 
V
F
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
G
A
 
G
N
 
S
I
 
T
S
 
G
E
 
E
Y
 
N
H
 
F
T
 
M
L
 
L
S
 
S
V
 
T
D
 
D
E
 
E
R
 
K
I
 
K
A
 
R
V
 
I
T
 
F
E
 
E
A
 
I
A
 
A
V
 
M
D
 
D
A
 
E
L
 
A
P
 
K
S
 
G
S
 
Q
A
 
V
C
 
K
V
 
L
L
 
I
A
 
A
G
 
Q
V
 
V
G
 
G
G
 
S
-
 
V
N
 
N
L
 
L
A
 
K
E
 
E
A
 
A
R
 
V
E
 
E
L
 
L
V
 
A
A
 
K
A
 
F
Y
 
T
D
 
T
R
 
D
I
 
L
G
 
G
V
 
Y
D
 
D
A
 
A
L
 
I
M
 
S
V
 
A
M
 
V
P
 
T
P
 
P
D
 
F
F
 
Y
T
 
Y
Y
 
K
I
 
F
H
 
D
E
 
F
Q
 
N
G
 
E
L
 
I
L
 
K
R
 
H
Y
 
Y
Y
 
Y
E
 
E
K
 
T
L
 
I
S
 
I
A
 
N
N
 
S
T
 
V
E
 
D
T
 
N
P
 
K
L
 
L
-
 
I
-
 
I
-
x
Y
-
 
S
V
 
I
P
 
P
Y
 
F
V
 
L
R
 
T
G
 
G
F
 
V
E
 
N
P
 
M
S
 
S
V
 
I
S
 
E
Y
 
Q
L
 
F
D
 
A
D
 
E
L
 
L
T
 
F
R
 
E
V
 
N
D
 
D
G
 
K
L
 
I
V
 
I
G
 
G
I
 
V
K
|
K
Y
 
F
A
 
T
I
 
A
P
 
A
D
 
D
A
 
F
V
 
Y
K
 
L
L
 
L
G
 
E
A
 
R
G
 
M
V
 
R
E
 
K
A
 
A
G
 
F
A
 
P
D
 
D
D
 
K
V
 
L
V
 
I
W
 
F
V
 
A
D
 
-
G
 
G
L
 
F
A
x
D
E
|
E
P
 
M
H
 
M
A
 
L
P
 
P
S
 
A
-
 
T
-
 
V
F
 
L
W
 
G
V
 
V
E
 
D
G
 
G
A
 
A
E
 
I
G
 
G
F
 
S
S
 
T
A
 
F
G
 
N
V
 
V
S
 
N
N
 
G
F
 
V
R
 
R
P
 
A
E
 
R
I
 
-
G
 
-
L
 
-
A
 
Q
L
 
I
L
 
F
D
 
E
A
 
A
L
 
A
T
 
Q
E
 
K
E
 
G
D
 
D
W
 
I
G
 
E
R
 
T
A
 
A
R
 
L
A
 
E
L
 
V
K
 
Q
N
 
H
A
 
V
C
 
T
L
 
-
P
 
-
Y
 
-
Q
 
-
N
 
-
F
 
-
R
 
-
T
 
-
E
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
-
N
 
N
N
 
D
E
 
L
I
 
I
P
 
T
D
 
D
A
 
I
I
 
L
S
 
N
-
 
N
-
 
G
-
 
L
V
 
Y
P
 
Q
A
 
T
V
 
I
K
 
K
K
 
L
G
 
I
L
 
L
E
 
Q
L
 
E
A
 
Q
G
 
G
L
 
V
H
 
D
G
 
A
G
 
G
N
 
Y
V
 
C
R
 
R
D
 
Q
P
 
P
I
 
M
R
 
K
P
 
E
L
 
A
S
 
T
S
 
E
E
 
E
D
 
M
E
 
I
A
 
A
R
 
K
A
 
A
E
 
K
E
 
E
L
 
I

4ptnA Crystal structure of yage, a kdg aldolase protein in complex with magnesium cation coordinated l-glyceraldehyde (see paper)
26% identity, 80% coverage: 12:262/312 of query aligns to 3:262/298 of 4ptnA

query
sites
4ptnA
L
 
F
R
 
T
G
 
G
V
 
I
A
 
I
T
 
P
G
x
P
V
 
V
L
 
S
T
 
T
P
 
I
F
 
F
D
 
T
A
 
A
D
 
D
Q
 
G
G
 
Q
I
 
L
E
 
D
Y
 
K
E
 
P
K
 
G
I
 
T
A
 
A
E
 
A
N
 
L
V
 
I
E
 
D
S
 
D
L
 
L
S
 
I
D
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
-
 
D
G
 
G
V
 
L
F
 
F
L
 
F
A
 
L
A
 
G
A
x
S
N
x
G
I
 
-
S
 
G
E
 
E
Y
 
F
H
 
S
T
 
Q
L
 
L
S
 
G
V
 
A
D
 
E
E
 
E
R
 
R
I
 
K
A
 
A
V
 
I
T
 
A
E
 
R
A
 
F
A
 
A
V
 
I
D
 
D
A
 
H
L
 
V
P
 
D
S
 
R
S
 
R
A
 
V
C
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
I
G
 
G
V
 
T
G
 
G
G
 
G
-
 
T
N
 
N
L
 
A
A
 
R
E
 
E
A
 
T
R
 
I
E
 
E
L
 
L
V
 
S
A
 
Q
A
 
H
Y
 
A
D
 
Q
R
 
Q
I
 
A
G
 
G
V
 
A
D
 
D
A
 
G
L
 
I
M
 
V
V
 
V
M
 
I
P
 
N
P
 
P
D
 
Y
F
x
Y
T
 
W
Y
 
K
I
 
V
H
 
S
E
 
E
Q
 
A
G
 
N
L
 
L
L
 
I
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
F
E
 
E
K
 
Q
L
 
V
S
 
A
A
 
D
N
 
S
T
 
V
E
 
T
T
 
L
P
 
P
L
 
V
V
 
M
-
 
L
-
x
Y
-
 
N
-
 
F
P
 
P
Y
 
A
V
x
L
R
 
T
G
 
G
F
 
Q
E
 
D
P
 
L
S
 
T
V
 
P
S
 
A
Y
 
L
L
 
V
D
 
K
D
 
T
L
 
L
T
 
A
-
 
D
R
 
S
V
 
R
D
 
S
G
 
N
L
 
I
V
 
I
G
 
G
I
 
I
K
|
K
Y
 
D
A
 
T
I
 
I
P
 
D
D
 
S
A
 
V
V
 
A
K
 
H
L
 
L
G
 
R
A
 
S
G
 
M
V
 
I
E
 
H
A
 
T
-
 
V
-
 
K
G
 
G
A
 
A
D
 
H
D
 
P
V
 
H
V
 
F
W
 
T
V
 
V
D
 
L
G
 
C
L
x
G
A
x
Y
E
 
D
P
 
D
H
 
H
A
 
L
P
 
F
S
 
N
F
 
T
W
 
L
V
 
L
E
 
L
G
 
G
A
 
G
E
 
D
G
 
G
F
 
A
S
x
I
A
 
S
G
x
A
V
 
S
S
 
G
N
 
N
F
 
F
R
 
A
P
 
P
E
 
Q
I
 
V
G
 
S
L
 
V
A
 
N
L
 
L
L
 
L
D
 
K
A
 
A
L
 
W
T
 
R
E
 
D
E
 
G
D
 
D
W
 
V
G
 
A
R
 
K
A
 
A
R
 
A
A
 
G
L
 
Y
K
 
H
N
 
Q
A
 
T
C
 
L
L
 
L
P
 
Q
Y
 
I
-
 
P
Q
 
Q
N
 
M
F
 
Y
R
 
Q
T
 
L
E
 
D
T
 
T
G
 
P
R
 
F
N
 
V
N
 
N
E
 
V
I
 
I
P
 
K
D
 
E
A
 
A
I
 
I

4onvA Crystal structure of yage, a kdg aldolase protein in complex with 2- keto-3-deoxy gluconate
26% identity, 80% coverage: 12:262/312 of query aligns to 3:262/298 of 4onvA

query
sites
4onvA
L
 
F
R
 
T
G
 
G
V
 
I
A
 
I
T
 
P
G
x
P
V
 
V
L
 
S
T
 
T
P
 
I
F
 
F
D
 
T
A
 
A
D
 
D
Q
 
G
G
 
Q
I
 
L
E
 
D
Y
 
K
E
 
P
K
 
G
I
 
T
A
 
A
E
 
A
N
 
L
V
 
I
E
 
D
S
 
D
L
 
L
S
 
I
D
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
-
 
D
G
 
G
V
 
L
F
|
F
L
 
F
A
 
L
A
x
G
A
x
S
N
 
G
I
 
-
S
 
G
E
 
E
Y
 
F
H
 
S
T
 
Q
L
 
L
S
 
G
V
 
A
D
 
E
E
 
E
R
 
R
I
 
K
A
 
A
V
 
I
T
 
A
E
 
R
A
 
F
A
 
A
V
 
I
D
 
D
A
 
H
L
 
V
P
 
D
S
 
R
S
 
R
A
 
V
C
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
I
G
 
G
V
 
T
G
 
G
G
 
G
-
 
T
N
 
N
L
 
A
A
 
R
E
 
E
A
 
T
R
 
I
E
 
E
L
 
L
V
 
S
A
 
Q
A
 
H
Y
 
A
D
 
Q
R
 
Q
I
 
A
G
 
G
V
 
A
D
 
D
A
 
G
L
 
I
M
 
V
V
 
V
M
 
I
P
 
N
P
 
P
D
 
Y
F
x
Y
T
 
W
Y
 
K
I
 
V
H
 
S
E
 
E
Q
 
A
G
 
N
L
 
L
L
 
I
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
F
E
 
E
K
 
Q
L
 
V
S
 
A
A
 
D
N
 
S
T
 
V
E
 
T
T
 
L
P
 
P
L
 
V
V
 
M
-
 
L
-
x
Y
-
 
N
-
 
F
P
 
P
Y
 
A
V
x
L
R
 
T
G
 
G
F
 
Q
E
 
D
P
 
L
S
 
T
V
 
P
S
 
A
Y
 
L
L
 
V
D
 
K
D
 
T
L
 
L
T
 
A
-
 
D
R
 
S
V
 
R
D
 
S
G
 
N
L
 
I
V
 
I
G
 
G
I
 
I
K
|
K
Y
 
D
A
 
T
I
 
I
P
 
D
D
 
S
A
 
V
V
 
A
K
 
H
L
 
L
G
 
R
A
 
S
G
 
M
V
 
I
E
 
H
A
 
T
-
 
V
-
 
K
G
 
G
A
 
A
D
 
H
D
 
P
V
 
H
V
 
F
W
 
T
V
 
V
D
 
L
G
 
C
L
x
G
A
x
Y
E
 
D
P
 
D
H
 
H
A
 
L
P
 
F
S
 
N
F
 
T
W
 
L
V
 
L
E
 
L
G
 
G
A
 
G
E
 
D
G
 
G
F
 
A
S
x
I
A
x
S
G
 
A
V
 
S
S
 
G
N
 
N
F
 
F
R
 
A
P
 
P
E
 
Q
I
 
V
G
 
S
L
 
V
A
 
N
L
 
L
L
 
L
D
 
K
A
 
A
L
 
W
T
 
R
E
 
D
E
 
G
D
 
D
W
 
V
G
 
A
R
 
K
A
 
A
R
 
A
A
 
G
L
 
Y
K
 
H
N
 
Q
A
 
T
C
 
L
L
 
L
P
 
Q
Y
 
I
-
 
P
Q
 
Q
N
 
M
F
 
Y
R
 
Q
T
 
L
E
 
D
T
 
T
G
 
P
R
 
F
N
 
V
N
 
N
E
 
V
I
 
I
P
 
K
D
 
E
A
 
A
I
 
I

4oe7D Crystal structure of yage, a kdg aldolase protein, in complex with aldol condensed product of pyruvate and glyoxal
26% identity, 80% coverage: 12:262/312 of query aligns to 3:262/298 of 4oe7D

query
sites
4oe7D
L
 
F
R
 
T
G
 
G
V
 
I
A
 
I
T
 
P
G
x
P
V
 
V
L
 
S
T
 
T
P
 
I
F
 
F
D
 
T
A
 
A
D
 
D
Q
 
G
G
 
Q
I
 
L
E
 
D
Y
 
K
E
 
P
K
 
G
I
 
T
A
 
A
E
 
A
N
 
L
V
 
I
E
 
D
S
 
D
L
 
L
S
 
I
D
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
-
 
D
G
 
G
V
 
L
F
 
F
L
 
F
A
 
L
A
x
G
A
x
S
N
x
G
I
 
-
S
 
G
E
 
E
Y
 
F
H
 
S
T
 
Q
L
 
L
S
 
G
V
 
A
D
 
E
E
 
E
R
 
R
I
 
K
A
 
A
V
 
I
T
 
A
E
 
R
A
 
F
A
 
A
V
 
I
D
 
D
A
 
H
L
 
V
P
 
D
S
 
R
S
 
R
A
 
V
C
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
I
G
 
G
V
 
T
G
 
G
G
 
G
-
 
T
N
 
N
L
 
A
A
 
R
E
 
E
A
 
T
R
 
I
E
 
E
L
 
L
V
 
S
A
 
Q
A
 
H
Y
 
A
D
 
Q
R
 
Q
I
 
A
G
 
G
V
 
A
D
 
D
A
 
G
L
 
I
M
 
V
V
 
V
M
 
I
P
 
N
P
 
P
D
 
Y
F
x
Y
T
 
W
Y
 
K
I
 
V
H
 
S
E
 
E
Q
 
A
G
 
N
L
 
L
L
 
I
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
F
E
 
E
K
 
Q
L
 
V
S
 
A
A
 
D
N
 
S
T
 
V
E
 
T
T
 
L
P
 
P
L
 
V
V
 
M
-
 
L
-
x
Y
-
 
N
-
x
F
P
 
P
Y
 
A
V
x
L
R
 
T
G
 
G
F
 
Q
E
 
D
P
 
L
S
 
T
V
 
P
S
 
A
Y
 
L
L
 
V
D
 
K
D
 
T
L
 
L
T
 
A
-
 
D
R
 
S
V
 
R
D
 
S
G
 
N
L
 
I
V
 
I
G
 
G
I
 
I
K
|
K
Y
 
D
A
x
T
I
 
I
P
 
D
D
 
S
A
 
V
V
 
A
K
 
H
L
 
L
G
 
R
A
 
S
G
 
M
V
 
I
E
 
H
A
 
T
-
 
V
-
 
K
G
 
G
A
 
A
D
 
H
D
 
P
V
 
H
V
 
F
W
 
T
V
 
V
D
 
L
G
 
C
L
x
G
A
 
Y
E
 
D
P
 
D
H
 
H
A
 
L
P
 
F
S
 
N
F
 
T
W
 
L
V
 
L
E
 
L
G
 
G
A
 
G
E
 
D
G
 
G
F
 
A
S
x
I
A
 
S
G
 
A
V
 
S
S
 
G
N
 
N
F
 
F
R
 
A
P
 
P
E
 
Q
I
 
V
G
 
S
L
 
V
A
 
N
L
 
L
L
 
L
D
 
K
A
 
A
L
 
W
T
 
R
E
 
D
E
 
G
D
 
D
W
 
V
G
 
A
R
 
K
A
 
A
R
 
A
A
 
G
L
 
Y
K
 
H
N
 
Q
A
 
T
C
 
L
L
 
L
P
 
Q
Y
 
I
-
 
P
Q
 
Q
N
 
M
F
 
Y
R
 
Q
T
 
L
E
 
D
T
 
T
G
 
P
R
 
F
N
 
V
N
 
N
E
 
V
I
 
I
P
 
K
D
 
E
A
 
A
I
 
I

4oe7B Crystal structure of yage, a kdg aldolase protein, in complex with aldol condensed product of pyruvate and glyoxal
26% identity, 80% coverage: 12:262/312 of query aligns to 3:262/298 of 4oe7B

query
sites
4oe7B
L
 
F
R
 
T
G
 
G
V
 
I
A
 
I
T
 
P
G
x
P
V
 
V
L
 
S
T
 
T
P
 
I
F
 
F
D
 
T
A
 
A
D
 
D
Q
 
G
G
 
Q
I
 
L
E
 
D
Y
 
K
E
 
P
K
 
G
I
 
T
A
 
A
E
 
A
N
 
L
V
 
I
E
 
D
S
 
D
L
 
L
S
 
I
D
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
-
 
D
G
 
G
V
 
L
F
 
F
L
 
F
A
 
L
A
x
G
A
x
S
N
x
G
I
 
-
S
 
G
E
 
E
Y
 
F
H
 
S
T
 
Q
L
 
L
S
 
G
V
 
A
D
 
E
E
 
E
R
 
R
I
 
K
A
 
A
V
 
I
T
 
A
E
 
R
A
 
F
A
 
A
V
 
I
D
 
D
A
 
H
L
 
V
P
 
D
S
 
R
S
 
R
A
 
V
C
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
I
G
 
G
V
 
T
G
 
G
G
 
G
-
 
T
N
 
N
L
 
A
A
 
R
E
 
E
A
 
T
R
 
I
E
 
E
L
 
L
V
 
S
A
 
Q
A
 
H
Y
 
A
D
 
Q
R
 
Q
I
 
A
G
 
G
V
 
A
D
 
D
A
 
G
L
 
I
M
 
V
V
 
V
M
 
I
P
 
N
P
 
P
D
 
Y
F
x
Y
T
 
W
Y
 
K
I
 
V
H
 
S
E
 
E
Q
 
A
G
 
N
L
 
L
L
 
I
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
F
E
 
E
K
 
Q
L
 
V
S
 
A
A
 
D
N
 
S
T
 
V
E
 
T
T
 
L
P
 
P
L
 
V
V
 
M
-
 
L
-
x
Y
-
 
N
-
x
F
P
 
P
Y
 
A
V
x
L
R
 
T
G
 
G
F
 
Q
E
 
D
P
 
L
S
 
T
V
 
P
S
 
A
Y
 
L
L
 
V
D
 
K
D
 
T
L
 
L
T
 
A
-
 
D
R
 
S
V
 
R
D
 
S
G
 
N
L
 
I
V
 
I
G
 
G
I
 
I
K
|
K
Y
 
D
A
x
T
I
 
I
P
 
D
D
 
S
A
 
V
V
 
A
K
 
H
L
 
L
G
 
R
A
 
S
G
 
M
V
 
I
E
 
H
A
 
T
-
 
V
-
 
K
G
 
G
A
 
A
D
 
H
D
 
P
V
 
H
V
 
F
W
 
T
V
 
V
D
 
L
G
 
C
L
x
G
A
 
Y
E
 
D
P
 
D
H
 
H
A
 
L
P
 
F
S
 
N
F
 
T
W
 
L
V
 
L
E
 
L
G
 
G
A
 
G
E
 
D
G
 
G
F
 
A
S
x
I
A
 
S
G
 
A
V
 
S
S
 
G
N
 
N
F
 
F
R
 
A
P
 
P
E
 
Q
I
 
V
G
 
S
L
 
V
A
 
N
L
 
L
L
 
L
D
 
K
A
 
A
L
 
W
T
 
R
E
 
D
E
 
G
D
 
D
W
 
V
G
 
A
R
 
K
A
 
A
R
 
A
A
 
G
L
 
Y
K
 
H
N
 
Q
A
 
T
C
 
L
L
 
L
P
 
Q
Y
 
I
-
 
P
Q
 
Q
N
 
M
F
 
Y
R
 
Q
T
 
L
E
 
D
T
 
T
G
 
P
R
 
F
N
 
V
N
 
N
E
 
V
I
 
I
P
 
K
D
 
E
A
 
A
I
 
I

4oe7A Crystal structure of yage, a kdg aldolase protein, in complex with aldol condensed product of pyruvate and glyoxal
26% identity, 80% coverage: 12:262/312 of query aligns to 3:262/298 of 4oe7A

query
sites
4oe7A
L
 
F
R
 
T
G
 
G
V
 
I
A
 
I
T
 
P
G
x
P
V
 
V
L
 
S
T
 
T
P
 
I
F
 
F
D
 
T
A
 
A
D
 
D
Q
 
G
G
 
Q
I
 
L
E
 
D
Y
 
K
E
 
P
K
 
G
I
 
T
A
 
A
E
 
A
N
 
L
V
 
I
E
 
D
S
 
D
L
 
L
S
 
I
D
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
-
 
D
G
 
G
V
 
L
F
 
F
L
 
F
A
 
L
A
x
G
A
x
S
N
x
G
I
 
-
S
 
G
E
 
E
Y
 
F
H
 
S
T
 
Q
L
 
L
S
 
G
V
 
A
D
 
E
E
 
E
R
 
R
I
 
K
A
 
A
V
 
I
T
 
A
E
 
R
A
 
F
A
 
A
V
 
I
D
 
D
A
 
H
L
 
V
P
 
D
S
 
R
S
 
R
A
 
V
C
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
I
G
 
G
V
 
T
G
 
G
G
 
G
-
 
T
N
 
N
L
 
A
A
 
R
E
 
E
A
 
T
R
 
I
E
 
E
L
 
L
V
 
S
A
 
Q
A
 
H
Y
 
A
D
 
Q
R
 
Q
I
 
A
G
 
G
V
 
A
D
 
D
A
 
G
L
 
I
M
 
V
V
 
V
M
 
I
P
 
N
P
 
P
D
 
Y
F
x
Y
T
 
W
Y
 
K
I
 
V
H
 
S
E
 
E
Q
 
A
G
 
N
L
 
L
L
 
I
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
F
E
 
E
K
 
Q
L
 
V
S
 
A
A
 
D
N
 
S
T
 
V
E
 
T
T
 
L
P
 
P
L
 
V
V
 
M
-
 
L
-
x
Y
-
 
N
-
 
F
P
 
P
Y
 
A
V
x
L
R
 
T
G
 
G
F
 
Q
E
 
D
P
 
L
S
 
T
V
 
P
S
 
A
Y
 
L
L
 
V
D
 
K
D
 
T
L
 
L
T
 
A
-
 
D
R
 
S
V
 
R
D
 
S
G
 
N
L
 
I
V
 
I
G
 
G
I
 
I
K
|
K
Y
 
D
A
 
T
I
 
I
P
 
D
D
 
S
A
 
V
V
 
A
K
 
H
L
 
L
G
 
R
A
 
S
G
 
M
V
 
I
E
 
H
A
 
T
-
 
V
-
 
K
G
 
G
A
 
A
D
 
H
D
 
P
V
 
H
V
 
F
W
 
T
V
 
V
D
 
L
G
 
C
L
 
G
A
 
Y
E
 
D
P
 
D
H
 
H
A
 
L
P
 
F
S
 
N
F
 
T
W
 
L
V
 
L
E
 
L
G
 
G
A
 
G
E
 
D
G
 
G
F
 
A
S
x
I
A
 
S
G
 
A
V
 
S
S
 
G
N
 
N
F
 
F
R
 
A
P
 
P
E
 
Q
I
 
V
G
 
S
L
 
V
A
 
N
L
 
L
L
 
L
D
 
K
A
 
A
L
 
W
T
 
R
E
 
D
E
 
G
D
 
D
W
 
V
G
 
A
R
 
K
A
 
A
R
 
A
A
 
G
L
 
Y
K
 
H
N
 
Q
A
 
T
C
 
L
L
 
L
P
 
Q
Y
 
I
-
 
P
Q
 
Q
N
 
M
F
 
Y
R
 
Q
T
 
L
E
 
D
T
 
T
G
 
P
R
 
F
N
 
V
N
 
N
E
 
V
I
 
I
P
 
K
D
 
E
A
 
A
I
 
I

3nevA Crystal structure of yage, a prophage protein from e. Coli k12 in complex with kdgal (see paper)
26% identity, 80% coverage: 12:262/312 of query aligns to 3:262/298 of 3nevA

query
sites
3nevA
L
 
F
R
 
T
G
 
G
V
 
I
A
 
I
T
 
P
G
x
P
V
 
V
L
 
S
T
 
T
P
 
I
F
 
F
D
 
T
A
 
A
D
 
D
Q
 
G
G
 
Q
I
 
L
E
 
D
Y
 
K
E
 
P
K
 
G
I
 
T
A
 
A
E
 
A
N
 
L
V
 
I
E
 
D
S
 
D
L
 
L
S
 
I
D
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
-
 
D
G
 
G
V
 
L
F
 
F
L
 
F
A
 
L
A
x
G
A
x
S
N
x
G
I
 
-
S
 
G
E
 
E
Y
 
F
H
 
S
T
 
Q
L
 
L
S
 
G
V
 
A
D
 
E
E
 
E
R
 
R
I
 
K
A
 
A
V
 
I
T
 
A
E
 
R
A
 
F
A
 
A
V
 
I
D
 
D
A
 
H
L
 
V
P
 
D
S
 
R
S
 
R
A
 
V
C
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
I
G
 
G
V
 
T
G
 
G
G
 
G
-
 
T
N
 
N
L
 
A
A
 
R
E
 
E
A
 
T
R
 
I
E
 
E
L
 
L
V
 
S
A
 
Q
A
 
H
Y
 
A
D
 
Q
R
 
Q
I
 
A
G
 
G
V
 
A
D
 
D
A
 
G
L
 
I
M
 
V
V
 
V
M
 
I
P
 
N
P
 
P
D
 
Y
F
x
Y
T
 
W
Y
 
K
I
 
V
H
 
S
E
 
E
Q
 
A
G
 
N
L
 
L
L
 
I
R
 
R
Y
 
Y
Y
 
F
E
 
E
K
 
Q
L
 
V
S
 
A
A
 
D
N
 
S
T
 
V
E
 
T
T
 
L
P
 
P
L
 
V
V
 
M
-
 
L
-
x
Y
-
 
N
-
x
F
P
 
P
Y
 
A
V
x
L
R
 
T
G
 
G
F
 
Q
E
 
D
P
 
L
S
 
T
V
 
P
S
 
A
Y
 
L
L
 
V
D
 
K
D
 
T
L
 
L
T
 
A
-
 
D
R
 
S
V
 
R
D
 
S
G
 
N
L
 
I
V
 
I
G
 
G
I
 
I
K
|
K
Y
 
D
A
x
T
I
 
I
P
 
D
D
 
S
A
 
V
V
 
A
K
 
H
L
 
L
G
 
R
A
 
S
G
 
M
V
 
I
E
 
H
A
 
T
-
 
V
-
 
K
G
 
G
A
 
A
D
 
H
D
 
P
V
 
H
V
 
F
W
 
T
V
 
V
D
 
L
G
 
C
L
x
G
A
 
Y
E
 
D
P
 
D
H
 
H
A
 
L
P
 
F
S
 
N
F
 
T
W
 
L
V
 
L
E
 
L
G
 
G
A
 
G
E
 
D
G
 
G
F
 
A
S
x
I
A
 
S
G
x
A
V
 
S
S
 
G
N
 
N
F
 
F
R
 
A
P
 
P
E
 
Q
I
 
V
G
 
S
L
 
V
A
 
N
L
 
L
L
 
L
D
 
K
A
 
A
L
 
W
T
 
R
E
 
D
E
 
G
D
 
D
W
 
V
G
 
A
R
 
K
A
 
A
R
 
A
A
 
G
L
 
Y
K
 
H
N
 
Q
A
 
T
C
 
L
L
 
L
P
 
Q
Y
 
I
-
 
P
Q
 
Q
N
 
M
F
 
Y
R
 
Q
T
 
L
E
 
D
T
 
T
G
 
P
R
 
F
N
 
V
N
 
N
E
 
V
I
 
I
P
 
K
D
 
E
A
 
A
I
 
I

8u8wA Crystal structure of n-acetylneuraminate lyase (nana) from klebsiella aerogenes (pyruvate and halides bound)
26% identity, 92% coverage: 12:297/312 of query aligns to 6:285/297 of 8u8wA

query
sites
8u8wA
L
 
L
R
 
R
G
 
G
V
 
V
A
 
M
T
 
P
G
x
A
V
 
L
L
 
L
T
 
T
P
 
P
F
 
F
D
 
D
A
 
A
D
 
Q
Q
 
Q
G
 
N
I
 
I
E
 
D
Y
 
R
E
 
A
K
 
S
I
 
L
A
 
R
E
 
R
N
 
L
V
 
V
E
 
R
S
 
F
L
 
N
S
 
I
D
 
E
A
 
Q
G
 
G
V
 
V
G
 
D
V
 
G
F
 
V
L
 
Y
A
 
V
A
 
G
A
x
G
N
x
S
I
x
T
S
 
G
E
 
E
Y
 
A
H
 
F
T
 
V
L
 
Q
S
 
S
V
 
L
D
 
S
E
 
E
R
 
R
I
 
E
A
 
E
V
 
V
T
 
L
E
 
E
A
 
I
A
 
V
V
 
A
D
 
E
A
 
E
L
 
A
P
 
K
S
 
G
S
 
K
A
 
I
C
 
T
V
 
L
L
 
I
A
 
A
G
 
H
V
 
V
G
 
G
G
 
C
-
 
V
N
 
S
L
 
T
A
 
A
E
 
E
A
 
S
R
 
Q
E
 
Q
L
 
L
V
 
A
A
 
A
A
 
A
Y
 
A
D
 
K
R
 
R
I
 
Y
G
 
G
V
 
F
D
 
D
A
 
A
L
 
V
-
 
S
M
 
A
V
 
V
M
 
T
P
 
P
P
 
F
D
 
Y
F
 
Y
T
 
P
Y
 
F
I
 
S
H
 
F
E
 
E
Q
 
E
G
 
H
L
 
C
L
 
D
R
 
H
Y
 
Y
Y
 
R
E
 
A
K
 
I
L
 
I
S
 
D
A
 
S
N
 
A
T
 
D
E
 
G
T
 
I
P
 
P
L
 
M
V
 
V
P
 
V
Y
|
Y
-
 
N
-
 
I
-
 
P
-
 
A
V
 
L
R
 
S
G
 
G
F
 
V
E
 
K
P
 
L
S
 
T
V
 
L
S
 
E
Y
 
Q
L
 
I
D
 
N
D
 
Q
L
 
L
T
 
V
R
 
T
V
 
L
D
 
P
G
 
G
L
 
V
V
 
G
G
 
A
I
 
L
K
|
K
Y
 
Q
A
 
T
I
 
S
P
 
G
D
 
D
A
 
L
V
 
Y
K
 
Q
L
 
M
G
 
-
A
 
E
G
 
Q
V
 
I
E
 
R
A
 
R
G
 
A
A
 
H
D
 
P
D
 
E
V
 
L
V
 
V
W
 
L
V
 
Y
D
 
N
G
 
G
L
 
Y
A
 
D
E
 
E
P
 
I
H
 
F
A
 
A
P
 
-
S
 
S
F
 
G
W
 
L
V
 
L
E
 
A
G
 
G
A
 
A
E
 
D
G
 
G
F
 
G
S
 
I
A
 
G
G
 
S
V
 
T
S
 
Y
N
 
N
F
 
I
R
 
M
P
 
A
E
 
W
I
 
R
G
 
Y
L
 
L
A
 
G
L
 
I
L
 
V
D
 
Q
A
 
A
L
 
L
T
 
K
E
 
E
E
 
G
D
 
D
W
 
T
G
 
A
R
 
K
A
 
A
R
 
Q
A
 
Q
L
 
L
K
 
Q
N
 
H
A
 
E
C
 
C
L
 
-
P
 
-
Y
 
-
Q
 
-
N
 
-
F
 
-
R
 
-
T
 
-
E
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
-
N
 
-
N
 
N
E
 
K
I
 
V
P
 
I
D
 
D
A
 
L
I
 
L
S
 
V
V
 
K
P
 
V
A
 
G
V
 
V
K
 
F
K
 
R
G
 
G
L
 
L
E
 
K
L
 
T
A
 
V
G
 
-
L
 
L
H
 
H
G
 
Y
G
 
M
N
 
D
V
 
V
-
 
L
-
 
S
-
 
V
-
 
P
-
 
L
-
 
C
R
 
R
D
 
K
P
 
P
I
 
F
R
 
A
P
 
P
L
 
V
S
 
-
S
 
-
E
 
E
D
 
D
E
 
K
A
 
F
R
 
Q
A
 
A
E
 
E

7mjfA Crystal structure of candidatus liberibacter solanacearum dihydrodipicolinate synthase with pyruvate and succinic semi-aldehyde bound in active site
25% identity, 73% coverage: 19:247/312 of query aligns to 9:242/296 of 7mjfA

query
sites
7mjfA
V
 
L
L
 
I
T
 
T
P
 
P
F
 
F
D
 
T
A
 
K
D
 
D
Q
 
N
G
 
L
I
 
I
E
 
D
Y
 
E
E
 
D
K
 
S
I
 
F
A
 
V
E
 
D
N
 
H
V
 
I
E
 
E
S
 
W
L
 
Q
S
 
I
D
 
S
A
 
E
G
 
G
V
 
S
G
 
S
V
 
G
F
 
L
L
 
V
A
 
P
A
 
A
A
 
G
N
x
T
I
x
T
S
 
G
E
 
E
Y
 
S
H
 
S
T
 
T
L
 
L
S
 
S
V
 
Y
D
 
E
E
 
E
R
 
H
I
 
C
A
 
R
V
 
V
T
 
V
E
 
E
A
 
L
A
 
C
V
 
V
D
 
K
A
 
T
L
 
A
P
 
A
S
 
G
S
 
R
A
 
V
C
 
P
V
 
V
L
 
M
A
 
A
G
 
G
V
 
A
G
 
G
-
 
S
G
 
N
N
 
N
L
 
T
A
 
K
E
 
E
A
 
S
R
 
I
E
 
E
L
 
L
V
 
A
A
 
Q
A
 
Y
Y
 
A
D
 
Q
R
 
N
I
 
T
G
 
G
V
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
L
M
 
L
V
 
V
M
 
V
P
 
V
P
 
P
D
 
Y
F
 
Y
T
 
N
Y
 
K
I
 
P
H
 
N
E
 
K
Q
 
K
G
 
G
L
 
L
L
 
L
R
 
A
Y
 
H
Y
 
F
E
 
G
K
 
S
L
 
I
S
 
A
A
 
N
N
 
A
T
 
V
E
 
S
T
 
L
P
 
P
L
 
I
V
 
Y
P
 
I
Y
|
Y
V
 
N
R
 
N
G
 
P
-
 
S
-
x
R
-
 
T
-
 
V
F
 
I
E
 
E
P
 
M
S
 
D
V
 
V
S
 
D
Y
 
T
L
 
M
D
 
A
D
 
E
L
 
L
T
 
V
R
 
K
V
 
T
-
 
Y
D
 
S
G
 
N
L
 
I
V
 
V
G
 
G
I
 
V
K
|
K
Y
 
D
A
 
A
I
 
-
P
 
T
D
 
G
A
 
R
V
 
I
K
 
E
L
 
L
G
 
A
A
 
S
G
 
G
V
 
Q
E
 
R
-
 
I
A
 
A
G
 
C
A
 
G
D
 
S
D
 
D
V
 
F
V
 
I
W
 
Q
V
 
L
D
 
S
G
|
G
L
 
-
A
 
D
E
 
D
P
 
S
H
 
S
A
 
A
P
 
L
S
 
G
F
 
F
W
 
N
V
 
V
E
 
H
G
 
G
A
 
G
E
 
V
G
 
G
F
 
C
S
 
I
A
 
S
G
 
V
V
 
T
S
 
A
N
 
N
F
 
V
R
 
A
P
 
P
E
 
R
I
 
I
G
 
C
L
 
A
A
 
E
L
 
F
L
 
Q
D
 
K
A
 
A
L
 
I
T
 
S
E
 
E
E
 
G
D
 
D
W
 
Y
G
 
R
R
 
Q
A
 
A
R
 
L
A
 
E
L
 
Y
K
 
Q
N
 
D
A
 
K
C
 
L
L
 
F
P
 
P
Y
 
L
Q
 
H
N
 
Q

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_007690515.1 NCBI__GCF_000336675.1:WP_007690515.1
MPLSPAEVRESLRGVATGVLTPFDADQGIEYEKIAENVESLSDAGVGVFLAAANISEYHT
LSVDERIAVTEAAVDALPSSACVLAGVGGNLAEARELVAAYDRIGVDALMVMPPDFTYIH
EQGLLRYYEKLSANTETPLVPYVRGFEPSVSYLDDLTRVDGLVGIKYAIPDAVKLGAGVE
AGADDVVWVDGLAEPHAPSFWVEGAEGFSAGVSNFRPEIGLALLDALTEEDWGRARALKN
ACLPYQNFRTETGRNNEIPDAISVPAVKKGLELAGLHGGNVRDPIRPLSSEDEARAEELY
THLDDDIARLVE

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory