SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_007691604.1 NCBI__GCF_000336675.1:WP_007691604.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 10 hits to proteins with known functional sites (download)

2afbA Crystal structure of 2-dehydro-3- deoxygluconokinase (ec 2.7.1.45) (tm0067) from thermotoga maritima at 2.05 a resolution (see paper)
24% identity, 96% coverage: 4:305/314 of query aligns to 8:327/329 of 2afbA

query
sites
2afbA
L
 
V
L
 
V
A
 
T
L
 
F
G
 
G
V
 
E
S
 
I
V
 
M
L
 
L
E
 
R
L
 
L
T
 
S
P
 
P
P
 
P
E
 
D
H
 
H
R
 
K
R
 
R
L
 
I
E
 
F
T
 
Q
A
 
T
E
 
D
R
 
S
F
 
F
A
 
D
A
 
V
G
 
T
V
 
Y
A
 
G
G
 
G
P
 
A
E
 
E
S
 
A
N
 
N
T
 
V
T
 
A
I
 
A
A
 
F
A
 
L
S
 
A
R
 
Q
L
 
M
G
 
G
A
 
L
D
 
D
A
 
A
A
 
Y
W
 
F
V
 
V
S
 
T
K
 
K
L
 
L
P
 
P
G
 
N
N
 
N
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
D
R
 
A
V
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
H
L
 
L
R
 
R
R
 
K
H
 
F
G
 
G
V
 
V
E
 
K
T
 
T
A
 
D
V
 
Y
S
 
I
W
 
A
A
 
R
E
 
G
T
 
G
G
 
N
R
 
R
Q
 
I
G
 
G
L
 
I
A
 
Y
F
 
F
T
 
L
E
 
E
R
 
I
A
 
G
G
 
A
D
 
S
P
 
Q
R
 
R
G
 
P
G
 
S
M
 
K
T
 
V
L
 
V
H
 
Y
D
 
D
R
 
R
-
 
A
N
 
H
A
 
S
P
 
A
V
 
I
A
 
S
S
 
E
M
 
A
Q
 
K
P
 
R
A
 
E
D
 
D
L
 
F
P
 
D
-
 
W
A
 
E
T
 
K
A
 
I
T
 
L
E
 
D
R
 
G
A
 
A
S
 
R
M
 
W
V
 
F
L
 
H
T
 
F
S
 
S
G
 
G
A
 
I
T
 
T
A
 
P
T
 
P
L
 
L
S
 
G
E
 
K
T
 
E
L
 
L
T
 
P
E
 
L
T
 
I
T
 
L
R
 
E
T
 
D
V
 
A
F
 
L
E
 
K
E
 
V
C
 
A
A
 
N
A
 
E
G
 
K
E
 
G
T
 
V
T
 
T
T
 
V
V
 
S
C
 
C
S
 
D
L
 
L
S
 
N
-
 
Y
R
 
R
P
 
A
R
 
R
V
 
L
V
 
W
E
 
T
S
 
K
G
 
E
S
 
E
V
 
A
C
 
Q
E
 
K
A
 
V
L
 
M
S
 
I
P
 
P
L
 
F
L
 
M
A
 
E
A
 
Y
T
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
L
L
 
I
T
 
A
T
 
N
E
 
E
A
 
E
G
 
D
A
 
I
A
 
E
A
 
K
F
 
V
-
 
L
-
 
G
-
 
I
-
 
S
-
 
V
-
 
E
-
 
G
V
 
L
D
 
N
R
 
R
A
 
E
T
 
A
P
 
Y
T
 
A
E
 
K
T
 
I
A
 
A
H
 
E
A
 
E
L
 
V
A
 
T
A
 
R
G
 
K
H
 
Y
G
 
N
F
 
F
E
 
K
T
 
T
V
 
V
-
 
G
V
 
I
L
 
T
V
 
L
R
 
R
A
 
E
D
 
S
L
 
I
G
 
S
A
 
A
V
 
T
V
 
V
-
 
N
-
 
Y
W
 
W
-
 
S
-
 
V
-
 
M
-
 
V
-
 
F
-
 
E
-
 
N
-
 
G
-
 
Q
-
 
P
-
 
H
H
 
F
D
 
S
N
 
N
R
 
R
V
 
Y
D
 
E
D
 
I
H
 
H
D
 
-
V
 
-
P
 
-
A
 
-
T
 
-
D
 
-
A
 
I
V
 
V
D
 
D
D
 
R
R
 
V
G
 
G
A
 
A
F
 
G
D
 
D
A
 
S
L
 
F
C
 
A
G
 
G
G
 
A
F
 
L
L
 
I
A
 
Y
R
 
G
R
 
S
I
 
L
A
 
M
G
 
G
E
 
F
S
 
D
P
 
S
D
 
Q
R
 
K
A
 
K
L
 
A
A
 
E
A
 
F
G
 
A
V
 
A
A
 
A
C
 
A
G
 
S
A
 
C
L
 
L
A
 
K
R
 
H
T
 
T
V
 
I
A
 
P
G
 
G
P
 
D
V
 
F
P
 
V
T
 
V
V
 
L
D
 
S
P
 
I
A
 
E
A
 
E
V
 
I
E
|
E
R
 
K
C
 
L
A
 
A

Sites not aligning to the query:

Q97U29 2-dehydro-3-deoxygluconokinase/2-dehydro-3-deoxygalactonokinase; 2-dehydro-3-deoxyglucono/galactono-kinase; 2-keto-3-deoxy-galactonokinase; 2-keto-3-deoxygluconokinase; 3-deoxy-2-oxo-D-gluconate kinase; KDG kinase; KDGal kinase; EC 2.7.1.178 from Saccharolobus solfataricus (strain ATCC 35092 / DSM 1617 / JCM 11322 / P2) (Sulfolobus solfataricus) (see paper)
24% identity, 93% coverage: 1:291/314 of query aligns to 1:293/313 of Q97U29

query
sites
Q97U29
M
 
M
A
 
V
D
 
D
L
 
V
L
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
E
S
 
P
V
 
L
L
 
I
E
 
Q
L
 
F
T
 
N
P
 
S
P
 
F
E
 
N
H
 
P
R
 
G
R
 
P
L
 
L
E
 
R
T
 
F
A
 
V
E
 
N
R
 
Y
F
 
F
A
 
E
A
 
K
G
 
H
V
 
V
A
 
A
G
|
G
P
x
S
E
|
E
S
x
L
N
|
N
T
 
F
T
 
C
I
 
I
A
 
A
A
 
V
S
 
V
R
 
R
L
 
N
G
 
H
A
 
L
D
 
S
A
 
C
A
 
S
W
 
L
V
 
I
S
 
A
K
 
R
L
 
V
P
 
G
G
 
N
N
 
D
P
 
E
L
 
F
G
 
G
R
 
K
R
 
N
V
 
I
A
 
I
G
 
E
A
 
Y
L
 
S
R
 
R
R
 
A
H
 
Q
G
 
G
V
 
I
E
 
D
T
 
T
A
 
S
-
 
H
V
 
I
S
 
K
W
 
V
A
 
D
E
 
N
T
 
E
G
 
S
R
 
F
Q
 
T
G
 
G
L
 
I
A
x
Y
F
 
F
T
 
I
E
 
Q
R
 
R
A
 
-
G
 
G
D
 
Y
P
 
P
-
 
I
-
 
P
-
 
M
R
 
K
G
 
S
G
 
E
M
 
L
T
 
V
L
x
Y
H
x
Y
D
x
R
R
 
K
N
 
G
A
 
S
P
 
A
V
 
G
A
 
S
S
 
R
M
 
L
Q
 
S
P
 
P
A
 
E
D
 
D
L
 
I
P
 
N
A
 
E
T
 
N
A
 
Y
T
 
V
E
 
R
R
 
N
A
 
S
S
 
R
M
 
L
V
 
V
L
 
H
T
 
S
S
 
T
G
 
G
A
 
I
T
 
T
A
 
L
T
 
A
L
 
I
S
 
S
E
 
D
T
 
N
L
 
A
T
 
K
E
 
E
T
 
A
T
 
V
R
 
I
T
 
K
V
 
A
F
 
F
E
 
E
E
 
L
C
 
A
A
 
K
A
 
S
G
 
R
E
 
S
T
 
L
T
 
D
T
 
T
V
x
N
C
x
I
S
 
-
L
 
-
S
 
-
R
|
R
P
 
P
R
 
K
V
 
L
V
 
W
E
 
S
S
 
S
-
 
L
G
 
E
S
 
K
V
 
A
C
 
K
E
 
E
A
 
T
L
 
I
S
 
L
P
 
S
L
 
I
L
 
L
A
 
K
A
 
K
T
 
Y
D
 
D
-
 
I
-
 
E
V
 
V
L
 
L
L
 
I
T
 
T
T
 
D
E
 
P
A
 
D
G
 
D
A
 
T
A
 
K
A
 
I
F
 
L
V
 
L
D
 
D
R
 
V
A
 
T
T
 
D
P
 
P
T
 
D
E
 
E
T
 
-
A
 
A
H
 
Y
A
 
R
L
 
K
A
 
Y
A
 
K
G
 
E
H
 
L
G
 
G
F
 
V
E
 
K
T
 
V
V
 
L
V
 
L
L
 
Y
V
x
K
R
x
L
A
x
G
D
x
S
L
x
K
G
|
G
A
 
A
V
 
I
V
 
A
W
 
Y
H
 
K
D
 
D
N
 
N
-
 
V
-
 
K
-
 
A
R
 
F
V
 
K
D
 
D
D
 
A
H
 
Y
D
 
K
V
 
V
P
 
P
A
 
V
T
 
E
D
 
D
A
 
P
V
 
T
D
 
-
D
 
-
R
 
-
G
|
G
A
|
A
F
x
G
D
|
D
A
 
A
L
 
M
C
 
A
G
 
G
G
 
T
F
 
F
L
 
V
A
 
S
R
 
L
R
 
Y
I
 
L
A
 
Q
G
 
G
E
 
K
S
 
D
P
 
I
D
 
E
R
 
Y
A
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
H
G
 
G
V
 
I
A
 
A
C
 
A
G
 
S
A
 
T
L
 
L
A
 
V
R
 
I
T
 
T
V
 
V
A
 
R
G
 
G

Sites not aligning to the query:

2varA Crystal structure of sulfolobus solfataricus 2-keto-3-deoxygluconate kinase complexed with 2-keto-3-deoxygluconate (see paper)
23% identity, 92% coverage: 3:291/314 of query aligns to 2:292/311 of 2varA

query
sites
2varA
D
 
D
L
 
V
L
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
E
S
 
P
V
x
L
L
 
I
E
 
Q
L
 
F
T
 
N
P
 
S
P
 
F
E
 
N
H
 
P
R
 
G
R
 
P
L
 
L
E
 
R
T
 
F
A
 
V
E
 
N
R
 
Y
F
 
F
A
 
E
A
 
K
G
 
H
V
 
V
A
 
A
G
|
G
P
x
S
E
 
E
S
 
L
N
 
N
T
 
F
T
 
C
I
 
I
A
 
A
A
 
V
S
 
V
R
 
R
L
 
N
G
 
H
A
 
L
D
 
S
A
 
C
A
 
S
W
 
L
V
 
I
S
 
A
K
 
R
L
 
V
P
 
G
G
 
N
N
 
D
P
 
E
L
 
F
G
 
G
R
 
K
R
 
N
V
 
I
A
 
I
G
 
E
A
 
Y
L
 
S
R
 
R
R
 
A
H
 
Q
G
 
G
V
 
I
E
 
D
T
 
T
A
 
S
-
 
H
V
 
I
S
 
K
W
 
V
A
 
D
E
 
N
T
 
E
G
 
S
R
 
F
Q
 
T
G
 
G
L
 
I
A
x
Y
F
 
F
T
 
I
E
 
Q
R
 
R
A
 
-
G
 
G
D
 
Y
P
 
P
-
 
I
-
 
P
-
 
M
R
 
K
G
 
S
G
 
E
M
x
L
T
 
V
L
x
Y
H
 
Y
D
x
R
R
 
K
N
 
G
A
 
S
P
 
A
V
 
G
A
 
S
S
 
R
M
 
L
Q
 
S
P
 
P
A
 
E
D
 
D
L
 
I
P
 
N
A
 
E
T
 
N
A
 
Y
T
 
V
E
 
R
R
 
N
A
 
S
S
 
R
M
 
L
V
 
V
L
 
H
T
 
S
S
 
T
G
 
G
A
x
I
T
 
T
A
 
L
T
 
A
L
 
I
S
 
S
E
 
D
T
 
N
L
 
A
T
 
K
E
 
E
T
 
A
T
 
V
R
 
I
T
 
K
V
 
A
F
 
F
E
 
E
E
 
L
C
 
A
A
 
K
A
 
S
G
 
R
E
 
S
T
 
L
T
 
D
T
 
T
V
 
N
C
 
I
S
 
-
L
 
-
S
 
-
R
|
R
P
 
P
R
 
K
V
 
L
V
 
W
E
 
S
S
 
S
-
 
L
G
 
E
S
 
K
V
 
A
C
 
K
E
 
E
A
 
T
L
 
I
S
 
L
P
 
S
L
 
I
L
 
L
A
 
K
A
 
K
T
 
Y
D
 
D
-
 
I
-
 
E
V
 
V
L
 
L
L
 
I
T
 
T
T
 
D
E
 
P
A
 
D
G
 
D
A
 
T
A
 
K
A
 
I
F
 
L
V
 
L
D
 
D
R
 
V
A
 
T
T
 
D
P
 
P
T
 
D
E
 
E
T
 
-
A
 
A
H
 
Y
A
 
R
L
 
K
A
 
Y
A
 
K
G
 
E
H
 
L
G
 
G
F
 
V
E
 
K
T
 
V
V
 
L
V
 
L
L
 
Y
V
x
K
R
 
L
A
x
G
D
x
S
L
 
K
G
|
G
A
 
A
V
 
I
V
 
A
W
 
Y
H
 
K
D
 
D
N
 
N
-
 
V
-
 
K
-
 
A
R
 
F
V
 
K
D
 
D
D
 
A
H
 
Y
D
 
K
V
 
V
P
 
P
A
 
V
T
 
E
D
 
D
A
 
P
V
x
T
D
 
-
D
 
-
R
 
-
G
|
G
A
|
A
F
x
G
D
|
D
A
 
A
L
x
M
C
 
A
G
 
G
G
 
T
F
 
F
L
 
V
A
 
S
R
 
L
R
 
Y
I
 
L
A
 
Q
G
 
G
E
 
K
S
 
D
P
 
I
D
 
E
R
 
Y
A
 
S
L
 
L
A
 
A
A
 
H
G
 
G
V
x
I
A
 
A
C
 
A
G
x
S
A
 
T
L
 
L
A
 
V
R
x
I
T
 
T
V
 
V
A
 
R
G
 
G

Sites not aligning to the query:

2dcnA Crystal structure of 2-keto-3-deoxygluconate kinase from sulfolobus tokodaii complexed with 2-keto-6-phosphogluconate (alpha-furanose form)
24% identity, 92% coverage: 2:291/314 of query aligns to 1:290/308 of 2dcnA

query
sites
2dcnA
A
 
A
D
 
K
L
 
L
L
 
I
A
 
T
L
 
L
G
 
G
V
 
E
S
 
I
V
 
L
L
 
I
E
 
E
L
 
F
T
 
N
P
 
A
P
 
L
E
 
S
H
 
P
R
 
G
R
 
P
L
 
L
E
 
R
T
 
H
A
 
V
E
 
S
R
 
Y
F
 
F
A
 
E
A
 
K
G
 
H
V
 
V
A
 
A
G
|
G
P
 
S
E
 
E
S
 
A
N
 
N
T
 
Y
T
 
C
I
 
V
A
 
A
A
 
F
S
 
I
R
 
K
L
 
Q
G
 
G
A
 
N
D
 
E
A
 
C
A
 
G
W
 
I
V
 
I
S
 
A
K
 
K
L
 
V
P
 
G
G
 
D
N
 
D
P
 
E
L
 
F
G
 
G
R
 
Y
R
 
N
V
 
A
A
 
I
G
 
E
A
 
W
L
 
L
R
 
R
R
 
G
H
 
Q
G
 
G
V
 
V
E
 
D
T
 
V
A
 
S
-
 
H
V
 
M
S
 
K
W
 
I
A
 
D
E
 
P
T
 
S
G
 
A
R
 
P
Q
 
T
G
 
G
L
 
I
A
x
F
F
 
F
T
 
I
E
 
Q
R
 
R
A
 
H
G
 
Y
D
 
P
-
 
V
P
 
P
R
 
L
G
 
K
G
 
S
M
 
E
T
 
S
L
 
I
H
x
Y
D
 
Y
R
|
R
N
 
K
A
 
G
P
 
S
V
 
A
A
 
G
S
 
S
-
 
K
M
 
L
Q
 
S
P
 
P
A
 
E
D
 
D
L
 
V
P
 
D
A
 
E
T
 
E
A
 
Y
T
 
V
E
 
K
R
 
S
A
 
A
S
 
D
M
 
L
V
 
V
L
 
H
T
 
S
S
 
S
G
 
G
A
x
I
T
 
T
A
 
L
T
 
A
L
 
I
S
 
S
E
 
S
T
 
T
L
 
A
T
 
K
E
 
E
T
 
A
T
 
V
R
 
Y
T
 
K
V
 
A
F
 
F
E
 
E
E
 
I
C
 
A
A
 
S
A
 
N
G
 
R
E
 
S
T
 
F
T
 
D
T
 
T
V
 
N
C
 
I
S
x
R
L
 
L
S
 
K
R
 
L
P
 
W
R
 
S
V
 
A
V
 
E
E
 
E
S
 
A
G
 
K
-
 
R
S
 
E
V
 
I
C
 
L
E
 
K
A
 
L
L
 
L
S
 
S
P
 
K
L
 
F
L
 
-
A
 
-
A
 
H
T
 
L
D
 
K
V
 
F
L
 
L
L
 
I
T
 
T
T
x
D
E
 
T
A
 
D
G
 
D
A
 
S
A
 
K
A
 
I
F
 
I
V
 
L
D
 
G
R
 
E
A
 
S
T
 
D
P
 
P
T
 
D
E
 
K
T
 
A
A
 
A
H
 
K
A
 
A
L
 
F
A
 
S
A
 
D
G
 
Y
H
 
A
G
 
-
F
 
-
E
 
E
T
 
I
V
 
I
V
 
V
L
 
M
V
x
K
R
 
L
A
x
G
D
x
P
L
 
K
G
|
G
A
 
A
V
 
I
V
 
V
W
 
Y
H
 
Y
D
 
D
N
 
G
R
 
K
V
 
K
-
 
Y
-
 
Y
-
 
S
D
 
S
D
 
G
H
 
Y
D
 
Q
V
 
V
P
 
P
A
x
V
T
 
E
D
 
D
A
 
V
V
x
T
D
 
-
D
 
-
R
 
-
G
|
G
A
|
A
F
x
G
D
|
D
A
 
A
L
 
L
C
 
G
G
 
G
G
 
T
F
 
F
L
 
L
A
 
S
R
 
L
R
 
Y
I
 
Y
A
 
K
G
 
G
E
 
F
S
 
E
P
 
M
D
 
E
R
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
D
A
 
Y
G
 
A
V
x
I
A
 
V
C
 
A
G
x
S
A
 
T
L
 
L
A
 
N
R
x
V
T
 
M
V
 
I
A
 
R
G
 
G

Sites not aligning to the query:

8cqxA Ribokinase from t.Sp mutant a92g
27% identity, 84% coverage: 34:296/314 of query aligns to 37:288/300 of 8cqxA

query
sites
8cqxA
G
 
G
P
 
K
E
 
G
S
 
A
N
 
N
T
 
Q
T
 
A
I
 
V
A
 
A
A
 
I
S
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
G
D
 
K
A
 
V
A
 
R
W
 
M
V
 
L
S
 
G
K
 
R
L
 
V
P
 
G
G
 
E
N
 
D
P
 
P
L
 
F
G
 
G
R
 
Q
R
 
A
V
 
L
A
 
K
G
 
S
A
 
G
L
 
L
R
 
A
R
 
Q
H
 
E
G
 
G
V
 
V
E
 
D
T
 
V
A
 
A
V
 
W
S
 
V
W
 
L
A
 
E
E
 
T
T
 
P
G
 
G
R
 
P
Q
 
S
G
 
G
L
 
T
A
 
G
F
 
F
T
 
I
E
 
L
R
 
V
A
 
-
G
 
-
D
 
D
P
 
P
R
 
E
G
 
G
G
 
Q
M
 
N
T
 
Q
L
 
I
H
 
A
D
 
V
R
 
A
N
 
P
A
 
G
P
 
A
V
 
N
A
 
A
S
 
R
M
 
L
Q
 
V
P
 
P
A
 
E
D
 
D
L
 
L
P
 
P
A
 
A
T
 
T
A
 
A
T
 
F
E
 
Q
R
 
G
A
 
V
S
 
G
M
 
V
V
 
V
L
 
L
T
 
L
S
 
Q
G
 
-
A
 
-
T
 
-
A
 
-
T
 
-
L
 
-
S
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
L
T
 
E
E
 
I
T
 
P
T
 
L
R
 
E
T
 
T
V
 
V
F
 
V
E
 
R
E
 
A
C
 
A
A
 
A
A
 
L
G
 
G
E
 
R
T
 
K
T
 
A
T
 
G
V
 
A
C
 
-
S
 
-
L
 
-
S
 
-
R
 
-
P
 
-
R
 
R
V
 
I
V
 
L
E
 
L
S
 
N
G
 
A
S
 
A
V
 
P
C
 
A
E
 
H
A
 
A
L
 
L
-
 
P
S
 
S
P
 
E
L
 
I
L
 
L
A
 
Q
A
 
S
T
 
V
D
 
D
V
 
L
L
 
L
L
 
L
T
 
V
T
x
N
E
 
E
A
 
V
G
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
Q
F
 
L
V
 
T
D
 
E
R
 
A
A
 
S
T
 
P
P
 
P
T
 
R
E
 
T
T
 
P
A
 
E
H
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
L
G
 
A
H
 
R
G
 
Q
F
 
L
E
 
R
-
 
G
-
 
R
-
 
A
-
 
P
-
 
Q
-
 
A
T
 
Q
V
 
V
V
 
V
L
 
L
V
x
T
R
 
L
A
x
G
D
x
A
L
 
Q
G
|
G
A
 
A
V
 
-
V
 
V
W
 
W
H
 
S
D
 
G
N
 
T
R
 
E
V
 
E
D
 
S
D
 
H
H
 
F
D
 
P
V
 
A
P
 
F
A
 
P
T
 
V
D
 
R
A
 
A
V
 
V
D
|
D
D
 
T
R
x
T
G
 
A
A
 
A
F
 
G
D
 
D
A
 
A
L
x
F
C
 
A
G
 
G
G
 
A
F
 
L
L
 
A
A
 
L
R
 
G
R
 
L
I
 
A
A
 
E
G
 
G
E
 
Q
S
 
N
P
 
M
D
 
R
R
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
R
A
 
F
G
 
A
V
x
N
A
 
A
C
 
A
G
|
G
A
|
A
L
 
L
A
|
A
R
x
T
T
 
T
V
 
R
A
 
P
G
 
G
P
 
A
V
 
Q
P
 
P
T
x
S
V
 
L

1v1aA 2-keto-3-deoxygluconate kinase from thermus thermophilus with bound 2- keto-3-deoxygluconate and adp (see paper)
25% identity, 86% coverage: 1:269/314 of query aligns to 1:264/301 of 1v1aA

query
sites
1v1aA
M
 
M
A
 
L
D
 
E
L
 
V
L
 
V
A
 
T
L
 
A
G
 
G
V
 
E
S
 
P
V
x
L
L
 
V
E
 
A
L
 
L
T
 
V
P
 
P
P
 
Q
E
 
E
H
 
P
R
 
G
R
 
H
L
 
L
E
 
R
T
 
G
A
 
K
E
 
R
R
 
L
F
 
L
A
 
E
A
 
V
G
 
Y
V
 
V
A
 
G
G
|
G
P
x
A
E
 
E
S
 
V
N
|
N
T
 
V
T
 
A
I
 
V
A
 
A
A
 
L
S
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
V
D
 
K
A
 
V
A
 
G
W
 
F
V
 
V
S
 
G
K
 
R
L
 
V
P
 
G
G
 
E
N
 
D
P
 
E
L
 
L
G
 
G
R
 
A
R
 
M
V
 
V
A
 
E
G
 
E
A
 
R
L
 
L
R
 
R
R
 
A
H
 
E
G
 
G
V
 
V
E
 
D
T
 
L
A
 
T
V
 
H
S
 
F
W
 
R
A
 
R
E
 
A
T
 
P
G
 
G
R
 
F
Q
 
T
G
 
G
L
 
L
A
x
Y
F
 
L
T
 
R
E
 
E
R
 
Y
A
 
L
G
 
P
D
 
L
P
 
G
R
 
Q
G
 
G
G
 
R
M
 
V
T
 
F
L
 
Y
H
 
Y
D
x
R
R
 
K
N
 
G
A
 
S
P
 
A
V
 
G
A
 
S
S
 
A
M
 
L
Q
 
A
P
 
P
A
 
G
D
 
A
L
 
F
P
 
D
A
 
P
T
 
D
A
 
Y
T
 
L
E
 
E
R
 
G
A
 
V
S
 
R
M
 
F
V
 
L
L
 
H
T
 
L
S
 
S
G
 
G
A
 
I
T
 
T
A
 
P
T
 
A
L
 
L
S
 
S
E
 
P
T
 
E
L
 
A
T
 
R
E
 
A
T
 
F
T
 
S
R
 
L
T
 
W
V
 
A
F
 
M
E
 
E
E
 
E
C
 
A
A
 
K
A
 
R
G
 
R
E
 
G
T
 
V
T
 
R
T
 
V
V
 
S
C
 
L
S
 
D
L
 
V
S
 
N
R
 
Y
P
x
R
R
 
Q
V
 
T
V
 
L
E
 
W
S
 
S
G
 
P
S
 
E
V
 
E
C
 
A
E
 
R
A
 
G
-
 
F
L
 
L
S
 
E
P
 
R
L
 
A
L
 
L
A
 
P
A
 
G
T
 
V
D
 
D
V
 
L
L
 
L
L
 
F
T
 
L
T
 
S
E
 
E
A
 
E
G
 
E
A
 
A
A
 
E
A
 
L
F
 
L
V
 
F
D
 
G
R
 
R
A
 
V
T
 
-
P
 
-
T
 
E
E
 
E
T
 
A
A
 
L
H
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
S
A
 
A
G
 
-
H
 
-
G
 
-
F
 
-
E
 
P
T
 
E
V
 
V
V
 
V
L
 
L
V
x
K
R
 
R
A
x
G
D
x
A
L
 
K
G
 
G
A
 
A
V
 
W
V
 
A
W
 
F
H
 
V
D
 
D
N
 
G
R
 
R
V
 
R
D
 
V
D
 
E
H
 
G
D
 
S
V
 
A
P
 
F
A
 
A
T
 
V
D
 
E
A
 
A
V
 
V
D
 
D
D
 
P
R
 
V
G
|
G
A
|
A
F
x
G
D
|
D
A
 
A
L
 
F
C
 
A
G
 
A
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
R
 
G
R
 
A
I
 
V
A
 
W
G
 
G

Sites not aligning to the query:

1v1bA 2-keto-3-deoxygluconate kinase from thermus thermophilus with bound atp (see paper)
25% identity, 86% coverage: 1:269/314 of query aligns to 1:264/300 of 1v1bA

query
sites
1v1bA
M
 
M
A
 
L
D
 
E
L
 
V
L
 
V
A
 
T
L
 
A
G
 
G
V
 
E
S
 
P
V
 
L
L
 
V
E
 
A
L
 
L
T
 
V
P
 
P
P
 
Q
E
 
E
H
 
P
R
 
G
R
 
H
L
 
L
E
 
R
T
 
G
A
 
K
E
 
R
R
 
L
F
 
L
A
 
E
A
 
V
G
 
Y
V
 
V
A
 
G
G
 
G
P
 
A
E
 
E
S
 
V
N
 
N
T
 
V
T
 
A
I
 
V
A
 
A
A
 
L
S
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
V
D
 
K
A
 
V
A
 
G
W
 
F
V
 
V
S
 
G
K
 
R
L
 
V
P
 
G
G
 
E
N
 
D
P
 
E
L
 
L
G
 
G
R
 
A
R
 
M
V
 
V
A
 
E
G
 
E
A
 
R
L
 
L
R
 
R
R
 
A
H
 
E
G
 
G
V
 
V
E
 
D
T
 
L
A
 
T
V
 
H
S
 
F
W
 
R
A
 
R
E
 
A
T
 
P
G
 
G
R
 
F
Q
 
T
G
 
G
L
 
L
A
 
Y
F
 
L
T
 
R
E
 
E
R
 
Y
A
 
L
G
 
P
D
 
L
P
 
G
R
 
Q
G
 
G
G
 
R
M
 
V
T
 
F
L
 
Y
H
 
Y
D
 
R
R
 
K
N
 
G
A
 
S
P
 
A
V
 
G
A
 
S
S
 
A
M
 
L
Q
 
A
P
 
P
A
 
G
D
 
A
L
 
F
P
 
D
A
 
P
T
 
D
A
 
Y
T
 
L
E
 
E
R
 
G
A
 
V
S
 
R
M
 
F
V
 
L
L
 
H
T
 
L
S
 
S
G
 
G
A
 
I
T
 
T
A
 
P
T
 
A
L
 
L
S
 
S
E
 
P
T
 
E
L
 
A
T
 
R
E
 
A
T
 
F
T
 
S
R
 
L
T
 
W
V
 
A
F
 
M
E
 
E
E
 
E
C
 
A
A
 
K
A
 
R
G
 
R
E
 
G
T
 
V
T
 
R
T
 
V
V
 
S
C
 
L
S
 
D
L
 
V
S
 
N
R
 
Y
P
 
R
R
 
Q
V
 
T
V
 
L
E
 
W
S
 
S
G
 
P
S
 
E
V
 
E
C
 
A
E
 
R
A
 
G
-
 
F
L
 
L
S
 
E
P
 
R
L
 
A
L
 
L
A
 
P
A
 
G
T
 
V
D
 
D
V
 
L
L
 
L
L
 
F
T
 
L
T
 
S
E
 
E
A
 
E
G
 
E
A
 
A
A
 
E
A
 
L
F
 
L
V
 
F
D
 
G
R
 
R
A
 
V
T
 
-
P
 
-
T
 
E
E
 
E
T
 
A
A
 
L
H
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
S
A
 
A
G
 
-
H
 
-
G
 
-
F
 
-
E
 
P
T
 
E
V
 
V
V
 
V
L
 
L
V
x
K
R
 
R
A
x
G
D
 
A
L
 
K
G
 
G
A
 
A
V
 
W
V
 
A
W
 
F
H
 
V
D
 
D
N
 
G
R
 
R
V
 
R
D
 
V
D
 
E
H
 
G
D
 
S
V
x
A
P
x
F
A
 
A
T
x
V
D
 
E
A
 
A
V
 
V
D
 
D
D
 
P
R
 
V
G
|
G
A
|
A
F
x
G
D
|
D
A
 
A
L
 
F
C
 
A
G
 
A
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
R
 
G
R
 
A
I
 
V
A
 
W
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3ktnA Crystal structure of a putative 2-keto-3-deoxygluconate kinase from enterococcus faecalis
24% identity, 92% coverage: 6:294/314 of query aligns to 6:317/340 of 3ktnA

query
sites
3ktnA
A
 
A
L
 
F
G
 
G
V
 
E
S
 
V
V
 
M
L
 
L
E
 
R
L
 
F
T
 
T
P
 
P
P
 
P
E
 
E
H
 
Y
R
 
L
R
 
M
L
 
L
E
 
E
T
 
Q
A
 
T
E
 
E
R
 
Q
F
 
L
A
 
R
A
 
M
G
 
N
V
 
F
A
 
V
G
 
G
P
 
T
E
 
G
S
 
V
N
 
N
T
 
L
T
 
L
I
 
A
A
 
N
A
 
L
S
 
A
R
 
H
L
 
F
G
 
Q
A
 
L
D
 
E
A
 
T
A
 
A
W
 
L
V
 
I
S
 
T
K
 
K
L
 
L
P
 
P
G
 
A
N
 
N
P
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
E
R
 
A
V
 
G
A
 
K
G
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
R
R
 
K
H
 
L
G
 
G
V
 
I
E
 
S
T
 
D
A
 
-
V
 
-
S
 
Q
W
 
W
A
 
V
-
 
G
E
 
E
T
 
K
G
 
G
R
 
D
Q
 
H
-
 
I
G
 
G
L
 
S
A
 
F
F
 
F
T
 
A
E
 
E
R
 
M
A
 
G
G
 
Y
D
 
G
P
 
I
R
 
R
-
 
P
G
 
T
G
 
Q
M
 
V
T
 
T
L
 
Y
H
 
Q
D
 
N
R
 
R
N
 
H
A
 
Q
P
 
S
-
 
A
-
 
F
-
 
G
V
 
I
A
 
S
S
 
E
M
 
A
Q
 
K
P
 
D
A
 
Y
D
 
D
L
 
F
P
 
E
A
 
A
T
 
F
A
 
L
T
 
A
E
 
E
R
 
-
A
 
V
S
 
D
M
 
M
V
 
V
L
 
H
T
 
I
S
 
C
G
 
G
A
 
-
T
 
-
A
 
-
T
 
-
L
 
I
S
 
S
E
 
L
T
 
S
L
 
L
T
 
T
E
 
E
T
 
K
T
 
T
R
 
R
-
 
D
-
 
A
-
 
A
T
 
L
V
 
I
F
 
L
E
 
A
E
 
Q
C
 
K
A
 
A
A
 
H
G
 
A
E
 
Y
T
 
Q
T
 
K
T
 
K
V
 
V
C
 
C
-
 
F
-
 
D
S
 
F
L
 
N
S
 
Y
R
 
R
P
 
P
R
 
S
V
 
L
V
 
N
E
 
T
S
 
A
G
 
N
S
 
S
V
 
A
C
 
L
-
 
F
-
 
M
-
 
R
E
 
Q
A
 
Q
L
 
Y
S
 
E
P
 
R
L
 
I
L
 
L
A
 
P
A
 
Y
T
 
C
D
 
D
V
 
I
L
 
V
L
 
F
T
 
G
T
 
S
E
 
R
A
 
R
G
 
D
A
 
L
A
 
V
-
 
E
-
 
L
-
 
L
A
 
G
F
 
F
V
 
I
D
 
P
R
 
R
-
 
E
-
 
D
-
 
L
-
 
E
-
 
G
-
 
E
A
 
A
T
 
Q
P
 
E
T
 
T
E
 
E
T
 
L
A
 
I
H
 
Q
A
 
R
L
 
F
A
 
M
A
 
S
G
 
Q
H
 
Y
G
 
N
F
 
L
E
 
E
T
 
W
V
 
F
V
 
A
-
 
G
-
 
T
-
 
T
-
 
R
-
 
S
-
 
H
-
 
S
L
 
Q
V
 
N
R
 
Q
A
 
N
D
 
Y
L
 
L
G
 
S
A
 
G
V
 
Y
V
 
L
W
 
Y
H
 
T
D
 
Q
N
 
N
R
 
E
V
 
Y
D
 
Q
D
 
Q
H
 
S
D
 
E
V
 
K
P
 
R
A
 
P
T
 
L
D
 
L
A
 
N
V
 
L
D
|
D
D
x
R
R
x
I
G
 
G
A
|
A
F
 
G
D
 
D
A
 
A
L
 
Y
C
 
A
G
 
A
G
 
G
F
 
I
L
 
L
A
 
Y
R
 
G
R
 
Y
I
 
S
A
 
Q
G
 
N
E
 
W
S
 
S
P
 
L
D
 
E
R
 
K
A
 
A
L
 
V
A
 
T
A
 
F
G
 
A
V
 
T
A
 
V
C
 
N
G
 
G
A
 
V
L
 
L
A
|
A
R
 
H
T
 
T
V
 
I
A
 
Q
G
 
G
P
 
D
V
 
I
P
 
P

Q53W83 2-dehydro-3-deoxygluconokinase; 2-keto-3-deoxygluconokinase; 3-deoxy-2-oxo-D-gluconate kinase; KDG kinase; EC 2.7.1.45 from Thermus thermophilus (strain ATCC 27634 / DSM 579 / HB8) (see paper)
25% identity, 86% coverage: 1:269/314 of query aligns to 1:264/309 of Q53W83

query
sites
Q53W83
M
 
M
A
 
L
D
 
E
L
 
V
L
 
V
A
 
T
L
 
A
G
 
G
V
 
E
S
 
P
V
 
L
L
 
V
E
 
A
L
 
L
T
 
V
P
 
P
P
 
Q
E
 
E
H
 
P
R
 
G
R
 
H
L
 
L
E
 
R
T
 
G
A
 
K
E
 
R
R
 
L
F
 
L
A
 
E
A
 
V
G
 
Y
V
 
V
A
 
G
G
|
G
P
x
A
E
|
E
S
x
V
N
|
N
T
 
V
T
 
A
I
 
V
A
 
A
A
 
L
S
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
V
D
 
K
A
 
V
A
 
G
W
 
F
V
 
V
S
 
G
K
 
R
L
 
V
P
 
G
G
 
E
N
 
D
P
 
E
L
 
L
G
 
G
R
 
A
R
 
M
V
 
V
A
 
E
G
 
E
A
 
R
L
 
L
R
 
R
R
 
A
H
 
E
G
 
G
V
 
V
E
 
D
T
 
L
A
 
T
V
 
H
S
 
F
W
 
R
A
 
R
E
 
A
T
 
P
G
 
G
R
 
F
Q
 
T
G
 
G
L
 
L
A
 
Y
F
 
L
T
 
R
E
 
E
R
 
Y
A
 
L
G
 
P
D
 
L
P
 
G
R
 
Q
G
 
G
G
 
R
M
 
V
T
 
F
L
x
Y
H
x
Y
D
x
R
R
 
K
N
 
G
A
 
S
P
 
A
V
 
G
A
 
S
S
 
A
M
 
L
Q
 
A
P
 
P
A
 
G
D
 
A
L
 
F
P
 
D
A
 
P
T
 
D
A
 
Y
T
 
L
E
 
E
R
 
G
A
 
V
S
 
R
M
 
F
V
 
L
L
 
H
T
 
L
S
 
S
G
 
G
A
 
I
T
 
T
A
 
P
T
 
A
L
 
L
S
 
S
E
 
P
T
 
E
L
 
A
T
 
R
E
 
A
T
 
F
T
 
S
R
 
L
T
 
W
V
 
A
F
 
M
E
 
E
E
 
E
C
 
A
A
 
K
A
 
R
G
 
R
E
 
G
T
 
V
T
 
R
T
 
V
V
 
S
C
 
L
S
 
D
L
 
V
S
 
N
R
 
Y
P
x
R
R
 
Q
V
 
T
V
 
L
E
 
W
S
 
S
G
 
P
S
 
E
V
 
E
C
 
A
E
 
R
A
 
G
-
 
F
L
 
L
S
 
E
P
 
R
L
 
A
L
 
L
A
 
P
A
 
G
T
 
V
D
 
D
V
 
L
L
 
L
L
 
F
T
 
L
T
x
S
E
 
E
A
 
E
G
 
E
A
 
A
A
 
E
A
 
L
F
 
L
V
 
F
D
 
G
R
 
R
A
 
V
T
 
-
P
 
-
T
 
E
E
 
E
T
 
A
A
 
L
H
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
S
A
 
A
G
 
-
H
 
-
G
 
-
F
 
-
E
 
P
T
 
E
V
 
V
V
 
V
L
 
L
V
x
K
R
|
R
A
x
G
D
x
A
L
x
K
G
|
G
A
|
A
V
 
W
V
 
A
W
 
F
H
 
V
D
 
D
N
 
G
R
 
R
V
 
R
D
 
V
D
 
E
H
 
G
D
 
S
V
 
A
P
 
F
A
 
A
T
 
V
D
 
E
A
 
A
V
 
V
D
 
D
D
 
P
R
 
V
G
|
G
A
|
A
F
x
G
D
|
D
A
 
A
L
 
F
C
 
A
G
 
A
G
 
G
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
R
 
G
R
 
A
I
 
V
A
 
W
G
 
G

Sites not aligning to the query:

6znxC Ribokinase from thermus species
28% identity, 84% coverage: 34:296/314 of query aligns to 24:253/265 of 6znxC

query
sites
6znxC
G
 
G
P
 
K
E
 
G
S
 
A
N
 
N
T
 
Q
T
 
A
I
 
V
A
 
A
A
 
I
S
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
G
D
 
K
A
 
V
A
 
R
W
 
M
V
 
L
S
 
G
K
 
R
L
 
V
P
 
G
G
 
E
N
 
D
P
 
P
L
 
F
G
 
G
R
 
Q
R
 
A
V
 
L
A
 
K
G
 
S
A
 
G
L
 
L
R
 
A
R
 
Q
H
 
E
G
 
G
V
 
V
E
 
D
T
 
V
A
 
A
V
 
W
S
 
V
W
 
L
A
 
E
E
 
T
T
 
P
G
 
G
R
 
P
Q
 
S
G
 
G
L
 
T
A
 
A
F
 
F
T
 
V
E
 
-
R
 
-
A
 
-
G
 
-
D
 
D
P
 
P
R
 
E
G
 
G
G
 
Q
M
 
N
T
 
Q
L
 
I
H
 
A
D
 
V
R
 
A
N
 
P
A
 
G
P
 
A
V
 
N
A
 
A
S
 
R
M
 
L
Q
 
V
P
 
P
A
 
E
D
 
D
L
 
L
P
 
P
A
 
A
T
 
T
A
 
A
T
 
F
E
 
Q
R
 
G
A
 
V
S
 
G
M
 
V
V
 
V
L
 
L
T
 
L
S
 
Q
G
 
-
A
 
-
T
 
-
A
 
-
T
 
-
L
 
-
S
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
L
T
 
E
E
 
I
T
 
P
T
 
L
R
 
E
T
 
T
V
 
V
F
 
V
E
 
R
E
 
A
C
 
A
A
 
A
A
 
L
G
 
G
E
 
R
T
 
K
T
 
A
T
 
G
V
 
A
C
 
-
S
 
-
L
 
-
S
 
-
R
 
-
P
 
-
R
 
R
V
 
I
V
 
L
E
 
L
S
 
N
G
 
A
S
 
A
V
 
P
C
 
A
E
 
H
A
 
A
L
 
L
-
 
P
S
 
S
P
 
E
L
 
I
L
 
L
A
 
Q
A
 
S
T
 
V
D
 
D
V
 
L
L
 
L
L
 
L
T
 
V
T
x
N
E
 
E
A
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
F
 
-
V
 
-
D
 
-
R
 
-
A
 
-
T
 
-
P
 
-
T
 
V
E
 
E
T
 
A
A
 
A
H
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
R
G
 
Q
H
 
L
G
 
R
F
 
G
E
 
A
T
 
Q
V
 
V
V
 
V
L
 
L
V
x
L
R
x
G
A
 
A
D
 
Q
L
 
-
G
 
-
A
 
G
V
 
A
V
 
V
W
 
W
H
 
S
D
 
G
N
 
-
R
 
-
V
 
-
D
 
E
D
 
E
H
 
S
D
 
H
V
 
F
P
 
P
A
 
A
-
 
F
-
 
P
T
 
V
D
 
R
A
 
A
V
 
V
D
 
D
D
 
T
R
 
T
G
 
A
A
 
A
F
 
G
D
 
D
A
 
A
L
x
F
C
 
A
G
 
G
G
 
A
F
 
L
L
 
A
A
 
L
R
 
G
R
 
L
I
 
A
A
 
E
G
 
G
E
 
Q
S
 
N
P
 
M
D
 
R
R
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
R
A
 
F
G
 
A
V
x
N
A
 
A
C
 
A
G
|
G
A
|
A
L
 
L
A
 
A
R
x
T
T
 
T
V
 
R
A
 
P
G
 
G
P
 
A
V
 
Q
P
 
P
T
 
S
V
 
L

Query Sequence

>WP_007691604.1 NCBI__GCF_000336675.1:WP_007691604.1
MADLLALGVSVLELTPPEHRRLETAERFAAGVAGPESNTTIAASRLGADAAWVSKLPGNP
LGRRVAGALRRHGVETAVSWAETGRQGLAFTERAGDPRGGMTLHDRNAPVASMQPADLPA
TATERASMVLTSGATATLSETLTETTRTVFEECAAGETTTVCSLSRPRVVESGSVCEALS
PLLAATDVLLTTEAGAAAFVDRATPTETAHALAAGHGFETVVLVRADLGAVVWHDNRVDD
HDVPATDAVDDRGAFDALCGGFLARRIAGESPDRALAAGVACGALARTVAGPVPTVDPAA
VERCADSMDGSTVE

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory