SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_007694352.1 NCBI__GCF_000336675.1:WP_007694352.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 14 hits to proteins with known functional sites (download)

3a9hA Crystal structure of pqq-dependent sugar dehydrogenase holo-form (see paper)
39% identity, 64% coverage: 182:504/507 of query aligns to 5:333/338 of 3a9hA

query
sites
3a9hA
T
 
K
V
 
I
D
 
S
T
 
E
V
 
V
A
 
A
T
 
S
N
 
D
L
 
L
E
 
E
I
 
V
P
 
P
W
 
W
G
 
S
A
 
I
A
 
A
F
 
P
R
 
L
G
 
G
D
 
G
T
 
G
L
 
R
Y
 
Y
F
 
L
-
 
V
T
 
T
E
 
E
R
 
R
P
 
P
G
 
G
R
 
R
I
 
L
M
 
V
K
 
L
V
 
I
E
 
S
S
 
P
G
 
S
S
 
G
G
 
K
E
 
K
L
 
L
V
 
V
A
 
A
D
 
S
F
 
F
T
 
D
D
 
-
P
 
-
T
 
-
R
 
-
A
 
V
N
 
A
G
 
N
Y
 
V
G
 
G
E
|
E
G
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
L
A
 
A
F
 
L
H
 
H
P
 
P
D
 
E
D
 
F
P
 
P
D
 
K
T
 
K
A
 
S
Y
 
W
A
 
V
Y
 
Y
-
 
L
-
 
Y
-
 
A
Q
 
S
T
 
Y
Y
 
F
V
 
A
D
 
E
G
 
G
D
 
G
E
 
H
A
 
I
A
 
R
N
 
N
R
 
R
I
 
V
L
 
I
E
 
R
-
 
G
-
 
R
L
 
L
D
 
D
A
 
G
A
 
S
S
 
T
G
 
F
F
 
K
S
 
L
S
 
K
S
 
E
V
 
V
-
 
K
-
 
T
L
 
L
F
 
I
D
 
D
G
 
G
I
 
I
E
 
P
G
 
G
A
 
A
D
 
Y
G
 
I
H
|
H
D
 
N
G
 
G
G
 
G
R
 
R
L
 
I
A
 
R
I
 
F
D
 
G
G
 
P
D
 
D
-
 
G
A
 
M
L
 
L
Y
 
Y
A
 
I
T
 
T
V
 
T
G
 
G
D
|
D
T
 
A
K
 
A
E
 
D
P
 
P
Q
 
R
S
 
L
A
 
A
Q
 
Q
D
 
D
P
 
L
S
 
S
S
 
S
L
 
L
S
 
A
G
 
G
V
 
K
V
 
I
I
 
L
R
 
R
L
 
V
T
 
D
L
 
E
D
 
E
G
 
G
E
 
R
P
 
P
H
 
P
P
 
A
D
 
D
N
 
N
P
 
P
F
 
F
D
 
P
G
 
-
D
 
-
E
 
-
G
 
-
H
 
N
P
 
S
A
 
P
V
 
I
Y
 
W
T
 
S
Y
 
Y
G
 
G
H
 
H
R
|
R
N
|
N
P
 
P
Q
|
Q
G
 
G
L
 
I
A
 
D
F
 
W
R
 
H
-
 
R
-
 
A
D
 
S
G
 
G
E
 
V
V
 
M
Y
 
V
S
 
A
T
 
T
E
 
E
H
|
H
G
 
G
P
 
P
D
x
V
H
 
G
D
 
H
D
 
D
E
|
E
I
 
V
N
 
N
V
 
I
L
 
I
E
 
L
A
 
K
G
 
G
S
 
G
N
 
N
Y
|
Y
G
 
G
W
 
W
P
 
P
R
 
L
A
 
A
S
x
T
G
 
G
T
x
K
E
 
A
S
x
G
E
x
R
G
 
G
E
 
E
F
|
F
V
|
V
G
x
D
-
 
P
A
 
V
I
 
I
A
 
D
A
 
T
Y
 
G
T
 
S
P
 
E
T
|
T
I
 
W
A
 
A
P
 
P
G
 
S
S
 
G
A
 
A
T
 
S
F
 
F
Y
 
V
D
 
H
G
 
G
P
 
D
I
 
M
-
 
F
S
 
P
Q
 
G
W
 
L
Q
 
R
G
 
G
D
 
W
L
 
L
F
 
L
F
 
I
G
 
A
T
 
C
L
|
L
S
x
R
G
 
G
E
 
S
H
 
M
L
 
L
H
 
A
R
 
A
V
 
V
R
 
N
L
 
F
-
 
G
D
 
D
G
 
N
H
 
M
D
 
E
A
 
V
V
 
R
E
 
K
E
 
I
E
 
S
R
 
T
L
 
F
Y
 
F
E
 
K
G
 
N
E
 
V
Y
 
F
G
 
G
R
|
R
I
 
L
R
|
R
T
 
D
A
 
V
F
 
V
T
 
I
G
 
D
P
 
D
D
 
D
D
 
G
H
 
G
L
 
I
Y
 
L
L
 
I
A
 
S
T
 
T
S
 
S
N
 
N
R
 
R
D
 
D
G
 
G
R
|
R
G
 
G
S
 
S
P
 
L
V
 
R
A
 
A
S
 
G
D
 
D
D
 
D
R
 
K
I
 
I
L
 
L
R
 
K
I
 
I

3a9gA Crystal structure of pqq-dependent sugar dehydrogenase apo-form (see paper)
39% identity, 64% coverage: 182:504/507 of query aligns to 5:333/338 of 3a9gA

query
sites
3a9gA
T
 
K
V
 
I
D
 
S
T
 
E
V
 
V
A
 
A
T
 
S
N
 
D
L
 
L
E
 
E
I
 
V
P
 
P
W
 
W
G
 
S
A
 
I
A
 
A
F
 
P
R
 
L
G
 
G
D
 
G
T
 
G
L
 
R
Y
 
Y
F
 
L
-
 
V
T
 
T
E
 
E
R
 
R
P
 
P
G
 
G
R
 
R
I
 
L
M
 
V
K
 
L
V
 
I
E
 
S
S
 
P
G
 
S
S
 
G
G
 
K
E
 
K
L
 
L
V
 
V
A
 
A
D
 
S
F
 
F
T
 
D
D
 
-
P
 
-
T
 
-
R
 
-
A
 
V
N
 
A
G
 
N
Y
 
V
G
 
G
E
 
E
G
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
L
A
 
A
F
 
L
H
 
H
P
 
P
D
 
E
D
 
F
P
 
P
D
 
K
T
 
K
A
 
S
Y
 
W
A
 
V
Y
 
Y
-
 
L
-
 
Y
-
 
A
Q
 
S
T
 
Y
Y
 
F
V
 
A
D
 
E
G
 
G
D
 
G
E
 
H
A
 
I
A
 
R
N
 
N
R
 
R
I
 
V
L
 
I
E
 
R
-
 
G
-
 
R
L
 
L
D
 
D
A
 
G
A
 
S
S
 
T
G
 
F
F
 
K
S
 
L
S
 
K
S
 
E
V
 
V
-
 
K
-
 
T
L
 
L
F
 
I
D
 
D
G
 
G
I
 
I
E
 
P
G
 
G
A
 
A
D
 
Y
G
 
I
H
|
H
D
 
N
G
 
G
G
 
G
R
 
R
L
 
I
A
 
R
I
 
F
D
 
G
G
 
P
D
 
D
-
 
G
A
 
M
L
 
L
Y
 
Y
A
 
I
T
 
T
V
 
T
G
 
G
D
|
D
T
 
A
K
 
A
E
 
D
P
 
P
Q
x
R
S
 
L
A
 
A
Q
 
Q
D
|
D
P
 
L
S
 
S
S
 
S
L
 
L
S
 
A
G
 
G
V
 
K
V
 
I
I
 
L
R
 
R
L
 
V
T
 
D
L
 
E
D
 
E
G
 
G
E
 
R
P
 
P
H
 
P
P
 
A
D
 
D
N
 
N
P
 
P
F
 
F
D
 
P
G
 
-
D
 
-
E
 
-
G
 
-
H
 
N
P
 
S
A
 
P
V
 
I
Y
 
W
T
 
S
Y
 
Y
G
 
G
H
 
H
R
|
R
N
 
N
P
 
P
Q
 
Q
G
 
G
L
 
I
A
 
D
F
 
W
R
 
H
-
 
R
-
 
A
D
 
S
G
 
G
E
 
V
V
 
M
Y
 
V
S
 
A
T
 
T
E
 
E
H
 
H
G
 
G
P
 
P
D
 
V
H
 
G
D
 
H
D
 
D
E
|
E
I
 
V
N
 
N
V
 
I
L
 
I
E
 
L
A
 
K
G
 
G
S
 
G
N
 
N
Y
|
Y
G
 
G
W
 
W
P
 
P
R
 
L
A
 
A
S
x
T
G
 
G
T
x
K
E
 
A
S
x
G
E
x
R
G
 
G
E
 
E
F
|
F
V
|
V
G
x
D
-
 
P
A
 
V
I
 
I
A
 
D
A
 
T
Y
 
G
T
 
S
P
 
E
T
 
T
I
 
W
A
 
A
P
 
P
G
 
S
S
 
G
A
 
A
T
 
S
F
 
F
Y
 
V
D
 
H
G
 
G
P
 
D
I
 
M
-
 
F
S
 
P
Q
 
G
W
 
L
Q
 
R
G
 
G
D
 
W
L
 
L
F
 
L
F
 
I
G
 
A
T
 
C
L
 
L
S
 
R
G
 
G
E
 
S
H
 
M
L
 
L
H
 
A
R
 
A
V
 
V
R
 
N
L
 
F
-
 
G
D
 
D
G
 
N
H
 
M
D
 
E
A
 
V
V
 
R
E
 
K
E
 
I
E
 
S
R
 
T
L
 
F
Y
 
F
E
 
K
G
 
N
E
 
V
Y
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
L
R
 
R
T
 
D
A
 
V
F
 
V
T
 
I
G
 
D
P
 
D
D
 
D
D
 
G
H
 
G
L
 
I
Y
 
L
L
 
I
A
 
S
T
 
T
S
 
S
N
 
N
R
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
R
G
 
G
S
 
S
P
 
L
V
 
R
A
 
A
S
 
G
D
 
D
D
 
D
R
 
K
I
 
I
L
 
L
R
 
K
I
 
I

2ismB Crystal structure of the putative oxidoreductase (glucose dehydrogenase) (ttha0570) from thermus theromophilus hb8
39% identity, 64% coverage: 181:504/507 of query aligns to 2:332/333 of 2ismB

query
sites
2ismB
V
 
L
T
 
R
V
 
V
D
 
E
T
 
E
V
 
V
A
 
V
T
 
G
N
 
G
L
 
L
E
 
E
I
 
V
P
 
P
W
 
W
G
 
A
A
 
L
A
 
A
F
 
F
R
 
L
G
 
P
D
 
D
T
 
G
-
 
G
L
 
M
Y
 
L
F
 
I
T
 
A
E
 
E
R
 
R
P
 
P
G
 
G
R
 
R
I
 
I
M
 
R
K
 
L
V
 
F
E
 
R
S
 
E
G
 
G
S
 
R
G
 
L
E
 
S
L
 
T
V
 
Y
A
 
A
D
 
E
F
 
L
T
 
S
D
 
V
P
 
Y
T
 
H
R
 
R
A
 
-
N
 
-
G
 
-
Y
 
-
G
 
G
E
 
E
G
 
S
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
L
A
 
A
F
 
L
H
 
H
P
 
P
D
 
R
D
 
F
P
 
P
D
 
Q
T
 
E
-
 
P
-
 
Y
A
 
V
Y
 
Y
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
R
T
 
T
Y
 
V
V
 
A
D
 
E
G
 
G
D
 
G
E
 
-
A
 
L
A
 
R
N
 
N
R
 
Q
I
 
V
L
 
V
E
 
R
L
 
L
D
 
R
-
 
H
-
 
L
A
 
G
A
 
E
S
 
R
G
 
G
F
 
V
S
 
L
S
 
D
S
 
R
V
 
V
L
 
V
F
 
L
D
 
D
G
 
G
I
 
I
E
 
P
G
 
A
A
 
R
D
 
P
G
 
H
-
 
G
-
 
L
H
|
H
D
 
S
G
 
G
G
 
G
R
 
R
L
 
I
A
 
A
I
 
F
D
 
G
G
 
P
D
 
D
A
 
G
-
 
M
L
 
L
Y
 
Y
A
 
V
T
 
T
V
 
T
G
 
G
D
x
E
T
 
V
K
 
Y
E
 
E
P
 
R
Q
 
E
S
 
L
A
 
A
Q
 
Q
D
 
D
P
 
L
S
 
A
S
 
S
L
 
L
S
 
G
G
 
G
V
 
K
V
 
I
I
 
L
R
 
R
L
 
L
T
 
T
L
 
P
D
 
E
G
 
G
E
 
E
P
 
P
H
 
A
P
 
P
D
 
G
N
 
N
P
 
P
F
 
F
D
 
L
G
 
G
D
 
R
E
 
R
G
 
G
-
 
A
H
 
R
P
 
P
A
 
E
V
 
V
Y
 
Y
T
 
S
Y
 
L
G
 
G
H
 
H
R
|
R
N
 
N
P
 
P
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
A
 
A
F
 
W
-
 
H
-
 
P
R
 
K
D
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
L
Y
 
F
S
 
S
T
 
S
E
 
E
H
 
H
G
 
G
P
 
P
D
 
S
H
 
G
D
 
E
-
 
Q
-
 
G
-
 
Y
-
 
G
-
 
H
D
 
D
E
|
E
I
 
V
N
 
N
V
 
L
L
 
I
E
 
V
A
 
P
G
 
G
S
 
G
N
 
N
Y
|
Y
G
 
G
W
 
W
P
 
P
R
 
R
A
 
V
S
x
V
G
 
G
T
x
R
E
 
G
S
x
N
E
 
D
G
 
P
E
 
R
F
 
Y
V
 
R
G
 
D
A
 
P
I
 
L
A
 
Y
A
 
F
Y
 
W
T
 
P
P
 
Q
T
 
G
I
 
F
A
 
P
P
 
P
G
 
G
S
 
N
A
 
L
T
 
A
F
 
F
Y
 
F
D
 
-
G
 
-
P
 
-
I
 
-
S
 
-
Q
 
-
W
 
-
Q
 
R
G
 
G
D
 
D
L
 
L
F
 
Y
F
 
V
G
 
A
T
 
G
L
 
L
S
 
R
G
 
G
E
 
Q
H
 
A
L
 
L
H
 
L
R
 
R
V
 
L
R
 
V
L
 
L
D
 
E
G
 
G
H
 
E
-
 
R
-
 
G
-
 
R
-
 
W
D
 
R
A
 
V
V
 
L
E
 
R
E
 
V
E
 
E
R
 
T
L
 
A
Y
 
L
E
 
S
G
 
G
E
 
-
Y
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
L
R
 
R
T
 
E
A
 
V
F
 
Q
T
 
V
G
 
G
P
 
P
D
 
D
D
 
G
H
 
A
L
 
L
Y
 
Y
L
 
V
A
 
T
T
 
T
S
 
S
N
 
N
R
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
R
G
 
G
S
 
Q
P
 
V
V
 
R
A
 
P
S
 
G
D
 
D
D
 
D
R
 
R
I
 
V
L
 
L
R
 
R
I
 
L

3dasA Structure of the pqq-bound form of aldose sugar dehydrogenase (adh) from streptomyces coelicolor
37% identity, 64% coverage: 182:504/507 of query aligns to 10:331/334 of 3dasA

query
sites
3dasA
T
 
V
V
 
L
D
 
R
T
 
T
V
 
V
A
 
A
T
 
T
N
 
G
L
 
L
E
 
N
I
 
S
P
 
P
W
 
W
G
 
G
A
 
L
A
 
A
F
 
P
R
 
L
-
 
P
-
 
G
G
 
G
D
 
D
T
 
L
L
 
L
Y
 
V
F
 
S
T
 
S
E
 
R
R
 
D
P
 
E
G
 
A
R
 
T
I
 
I
M
 
T
K
 
R
V
 
V
E
 
D
S
 
A
G
 
K
S
 
T
G
 
G
E
 
R
L
 
K
V
 
T
A
 
-
D
 
E
F
 
L
T
 
G
D
 
E
P
 
V
T
 
P
R
 
G
A
 
V
N
 
S
G
 
P
Y
 
S
G
 
G
E
|
E
G
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
I
A
 
A
F
 
L
H
 
S
P
 
P
D
 
D
-
 
Y
-
 
A
D
 
S
P
 
D
D
 
H
T
 
M
A
 
V
Y
 
Y
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
F
T
 
T
Y
 
S
V
 
A
D
 
S
G
 
D
D
 
N
E
 
R
A
 
I
A
 
V
N
 
R
R
 
M
I
 
L
L
 
Y
E
 
D
L
 
E
D
 
K
A
 
K
A
 
P
S
 
S
G
 
G
-
 
E
-
 
Q
-
 
L
F
 
G
S
 
A
S
 
P
S
 
D
V
 
T
L
 
V
F
 
F
D
 
R
G
 
G
I
 
I
E
 
P
G
 
K
A
 
G
D
 
V
G
 
I
H
|
H
D
 
N
G
 
G
G
 
G
R
 
R
L
 
I
A
 
A
I
 
F
D
 
G
G
 
P
D
 
D
A
 
K
-
 
M
L
 
L
Y
 
Y
A
 
A
T
 
G
V
 
T
G
 
G
D
x
E
T
 
S
K
 
G
E
 
D
P
 
T
Q
 
G
S
 
L
A
 
S
Q
 
Q
D
 
D
P
 
R
S
 
K
S
 
S
L
 
L
S
 
G
G
 
G
V
 
K
V
 
I
I
 
L
R
 
R
L
 
M
T
 
T
L
 
P
D
 
D
G
 
G
E
 
E
P
 
P
H
 
A
P
 
P
D
 
G
N
 
N
P
 
P
F
 
F
D
 
P
G
 
G
D
 
S
E
 
-
G
 
-
H
 
-
P
 
-
A
 
P
V
 
V
Y
 
Y
T
 
S
Y
 
Y
G
 
G
H
 
H
R
|
R
N
|
N
P
 
V
Q
|
Q
G
 
G
L
 
L
A
 
A
F
 
W
R
 
D
D
 
D
G
x
K
E
 
Q
-
 
R
V
 
L
Y
 
F
S
 
A
T
 
S
E
 
E
H
x
F
G
|
G
P
x
Q
D
 
D
H
 
T
D
 
W
D
 
D
E
|
E
I
 
L
N
 
N
V
 
A
L
 
I
E
 
K
A
 
P
G
 
G
S
 
D
N
 
N
Y
|
Y
G
 
G
W
 
W
P
 
P
R
 
E
A
 
A
S
x
E
G
 
G
T
x
K
E
 
G
S
x
G
E
 
G
G
 
S
E
 
G
F
 
F
V
 
H
G
 
D
A
 
P
I
 
V
A
 
A
A
 
Q
Y
 
W
T
 
S
P
 
T
T
x
D
I
 
E
A
 
A
P
x
S
G
 
P
S
 
S
A
 
G
T
 
I
F
 
A
Y
 
Y
D
 
A
G
 
-
P
 
-
I
 
-
S
 
-
Q
 
-
W
 
-
Q
 
E
G
 
G
D
 
S
L
 
V
F
 
W
F
 
M
G
 
A
T
 
G
L
 
L
S
x
R
G
|
G
E
|
E
H
 
R
L
 
L
H
 
W
R
 
R
V
 
I
R
 
P
L
 
L
D
x
K
G
|
G
H
 
T
D
 
A
A
 
A
V
 
A
E
 
A
E
 
D
E
 
P
R
 
Q
L
 
A
Y
 
F
-
 
L
E
 
E
G
 
G
E
 
E
Y
 
Y
G
 
G
R
|
R
I
 
L
R
|
R
T
 
T
A
 
V
F
 
A
T
 
P
G
 
A
P
 
G
D
 
G
D
 
D
H
 
K
L
 
L
Y
 
W
L
 
L
A
 
V
T
 
T
S
 
S
N
 
N
R
 
T
D
 
D
G
 
G
R
|
R
G
 
G
S
 
D
P
 
A
V
 
K
A
 
G
S
 
G
D
 
D
D
 
D
R
 
R
I
 
I
L
 
L
R
 
E
I
 
L

7cdyA Crystal structure of glucose dehydrogenase
35% identity, 61% coverage: 182:491/507 of query aligns to 2:339/346 of 7cdyA

query
sites
7cdyA
T
 
T
V
 
V
D
 
S
T
 
Q
V
 
L
A
 
Q
T
 
D
N
 
G
L
 
L
E
 
E
I
 
H
P
 
P
W
 
W
G
 
S
A
 
L
A
 
A
F
 
F
R
 
L
G
 
P
-
 
A
-
 
E
D
 
Q
T
 
G
L
 
L
Y
 
L
F
 
I
T
 
T
E
 
E
R
 
R
P
 
P
G
 
G
R
 
R
I
 
L
M
 
R
K
 
L
V
 
W
E
 
Q
S
 
Q
G
 
D
S
 
K
G
 
G
E
 
-
L
 
L
V
 
S
A
 
P
D
 
P
F
 
I
T
 
A
D
 
G
P
 
V
T
 
P
R
 
Q
A
 
V
N
 
Y
G
 
A
Y
 
E
G
 
G
E
 
Q
G
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
E
L
 
V
A
 
L
F
 
P
H
 
A
P
 
P
D
 
D
D
 
F
P
 
A
D
 
A
T
 
S
A
 
R
Y
 
R
A
 
V
Y
 
Y
Q
 
L
T
 
S
Y
 
F
V
 
A
D
 
E
-
 
P
-
 
G
-
 
E
G
 
G
D
 
G
E
 
K
A
 
A
A
 
G
N
 
T
R
 
A
I
 
V
-
 
G
-
 
Y
-
 
G
-
 
R
L
 
L
E
 
S
L
 
D
D
 
D
A
 
D
A
 
A
S
 
R
G
 
L
F
 
E
S
 
N
S
 
F
S
 
K
V
 
V
L
 
I
F
 
F
-
 
R
-
 
Q
D
 
Q
G
 
P
I
 
K
E
 
L
G
 
S
A
 
V
D
 
G
G
 
N
H
 
H
D
 
F
G
 
G
G
 
G
R
 
K
L
 
L
A
 
A
I
 
F
D
 
D
G
 
R
D
 
Q
A
 
G
-
 
Y
L
 
L
Y
 
F
A
 
I
T
 
A
V
 
L
G
 
G
D
 
E
T
 
N
K
 
N
E
 
Q
P
 
R
Q
 
P
S
 
T
A
 
A
Q
 
Q
D
 
E
P
 
T
S
 
D
S
 
K
L
 
L
S
 
Q
G
 
G
V
 
K
V
 
L
I
 
V
R
 
R
L
 
L
T
 
T
L
 
A
D
 
E
G
 
G
E
 
A
P
 
V
H
 
P
P
 
P
D
 
D
N
 
N
P
 
P
F
 
W
D
 
V
G
 
G
D
 
Q
E
 
A
G
 
G
-
 
K
H
 
R
P
 
P
A
 
E
V
 
V
Y
 
W
T
 
S
Y
 
Y
G
 
G
H
 
H
R
 
R
N
 
N
P
 
P
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
A
 
A
F
 
L
R
 
N
-
 
P
-
 
W
D
 
S
G
 
G
E
 
A
V
 
I
Y
 
W
S
 
E
T
 
H
E
 
E
H
 
H
G
 
G
P
 
P
D
 
R
H
 
G
D
 
G
D
 
D
E
|
E
I
 
L
N
 
N
V
 
I
L
 
P
E
 
L
A
 
P
G
 
G
S
 
K
N
 
N
Y
|
Y
G
 
G
W
 
W
P
 
P
R
 
L
A
 
A
-
 
T
-
 
Y
-
 
G
-
 
I
-
 
N
-
 
Y
S
 
S
G
 
G
T
 
Q
-
 
P
-
 
I
-
 
P
E
 
E
S
 
A
E
 
K
G
 
G
E
 
E
F
 
R
V
 
V
G
 
P
A
 
G
I
 
T
-
 
E
-
 
Q
A
 
P
A
 
L
Y
 
H
T
 
Y
P
 
W
T
 
R
I
 
V
A
 
S
P
 
P
G
 
G
S
 
L
A
 
S
-
 
G
-
 
M
T
 
A
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
G
 
G
P
 
Q
-
 
R
I
 
F
S
 
P
Q
 
A
W
 
W
Q
 
R
G
 
H
D
 
S
L
 
L
F
 
F
F
 
I
G
 
G
T
 
A
L
 
L
S
 
A
G
 
Q
E
 
K
H
 
A
L
 
L
H
 
I
R
 
R
V
 
L
R
 
T
L
 
L
D
 
E
G
 
G
H
 
D
D
 
K
A
 
V
V
 
V
E
 
A
E
 
E
E
 
E
R
 
R
L
 
L
Y
 
L
E
 
G
G
 
D
E
 
R
Y
 
G
G
 
E
R
 
R
I
 
I
R
 
R
T
 
E
A
 
V
F
 
R
T
 
S
G
 
G
P
 
P
D
 
D
D
 
G
H
 
Y
L
 
L
Y
 
Y
L
 
L
A
 
L
T
 
T
S
 
D
N
 
E
R
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
K

7cgzA Glucose dehydrogenase
34% identity, 61% coverage: 182:491/507 of query aligns to 2:314/321 of 7cgzA

query
sites
7cgzA
T
 
T
V
 
V
D
 
S
T
 
Q
V
 
L
A
 
Q
T
 
D
N
 
G
L
 
L
E
 
E
I
 
H
P
 
P
W
 
W
G
 
S
A
 
L
A
 
A
F
 
F
R
 
L
G
 
P
-
 
A
-
 
E
D
 
Q
T
 
G
L
 
L
Y
 
L
F
 
I
T
 
T
E
 
E
R
 
R
P
 
P
G
 
G
R
 
R
I
 
L
M
 
R
K
 
L
V
 
W
E
 
Q
S
 
Q
G
 
D
S
 
K
G
 
G
E
 
-
L
 
L
V
 
S
A
 
P
D
 
P
F
 
I
T
 
A
D
 
G
P
 
V
T
 
P
R
 
Q
A
 
V
N
 
Y
G
 
A
Y
 
E
G
 
G
E
 
Q
G
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
E
L
 
V
A
 
L
F
 
P
H
 
A
P
 
P
D
 
D
D
 
F
P
 
A
D
 
A
T
 
S
A
 
R
Y
 
R
A
 
V
Y
 
Y
Q
 
L
T
 
S
Y
 
F
V
 
A
D
 
E
-
 
P
-
 
G
-
 
E
G
 
G
D
 
G
E
 
K
A
 
A
A
 
G
N
 
T
R
 
A
I
 
V
-
 
G
-
 
Y
-
 
G
-
 
R
L
 
L
E
 
S
L
 
D
D
 
D
A
 
D
A
 
A
S
 
R
G
 
L
F
 
E
S
 
N
S
 
F
S
 
K
V
 
V
L
 
I
F
 
F
-
 
R
-
 
Q
D
 
Q
G
 
P
I
 
K
E
 
L
G
 
S
A
 
V
D
 
G
G
 
N
H
 
H
D
 
F
G
 
G
G
 
G
R
 
K
L
 
L
A
 
A
I
 
F
D
 
D
G
 
R
D
 
Q
A
 
G
-
 
Y
L
 
L
Y
 
F
A
 
I
T
 
A
V
 
L
G
 
G
D
 
E
T
 
N
K
 
N
E
 
Q
P
 
R
Q
 
P
S
 
T
A
 
A
Q
 
Q
D
 
E
P
 
T
S
 
D
S
 
K
L
 
L
S
 
Q
G
 
G
V
 
K
V
 
L
I
 
V
R
 
R
L
 
L
T
 
T
L
 
A
D
 
E
G
 
G
E
 
A
P
 
V
H
 
P
P
 
P
D
 
D
N
 
N
P
 
P
F
 
W
D
 
V
G
 
G
D
 
Q
E
 
A
G
 
G
-
 
K
H
 
R
P
 
P
A
 
E
V
 
V
Y
 
W
T
 
S
Y
 
Y
G
 
G
H
 
H
R
 
R
N
 
N
P
 
P
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
A
 
A
F
 
L
R
 
N
-
 
P
-
 
W
D
 
S
G
 
G
E
 
A
V
 
I
Y
 
W
S
 
E
T
 
H
E
 
E
H
 
H
G
 
G
P
 
P
D
 
R
H
 
G
D
 
G
D
 
D
E
|
E
I
 
L
N
 
N
V
 
I
L
 
P
E
 
L
A
 
P
G
 
G
S
 
K
N
 
N
Y
|
Y
G
 
G
W
 
-
P
 
-
R
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
-
T
 
T
E
 
E
S
 
Q
E
 
P
G
 
L
E
 
H
F
 
Y
V
 
W
G
 
-
A
 
-
I
 
-
A
 
-
A
 
-
Y
 
-
T
 
-
P
 
-
T
 
R
I
 
V
A
 
S
P
 
P
G
 
G
S
 
L
A
 
S
-
 
G
-
 
M
T
 
A
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
G
 
G
P
 
Q
-
 
R
I
 
F
S
 
P
Q
 
A
W
 
W
Q
 
R
G
 
H
D
 
S
L
 
L
F
 
F
F
 
I
G
 
G
T
 
A
L
 
L
S
 
A
G
 
Q
E
 
K
H
 
A
L
 
L
H
 
I
R
 
R
V
 
L
R
 
T
L
 
L
D
 
E
G
 
G
H
 
D
D
 
K
A
 
V
V
 
V
E
 
A
E
 
E
E
 
E
R
 
R
L
 
L
Y
 
L
E
 
G
G
 
D
E
 
R
Y
 
G
G
 
E
R
 
R
I
 
I
R
 
R
T
 
E
A
 
V
F
 
R
T
 
S
G
 
G
P
 
P
D
 
D
D
 
G
H
 
Y
L
 
L
Y
 
Y
L
 
L
A
 
L
T
 
T
S
 
D
N
 
E
R
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
K

P75804 Aldose sugar dehydrogenase YliI; Asd; Soluble aldose sugar dehydrogenase YliI; EC 1.1.5.- from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
31% identity, 62% coverage: 176:490/507 of query aligns to 20:362/371 of P75804

query
sites
P75804
S
 
A
G
 
A
P
 
P
V
 
A
P
 
T
V
 
V
T
 
N
V
 
V
D
 
E
T
 
V
V
 
L
A
 
Q
T
 
D
N
 
K
L
 
L
E
 
D
I
 
H
P
 
P
W
 
W
G
 
A
A
 
L
A
 
A
F
 
F
R
 
L
G
 
P
D
 
D
T
 
N
-
 
H
-
 
G
L
 
M
Y
 
L
F
 
I
T
 
T
E
 
L
R
 
R
P
 
G
G
 
G
R
 
E
I
 
L
M
 
R
K
 
H
V
 
W
E
 
Q
S
 
A
G
 
G
S
 
K
G
 
G
E
 
-
L
 
L
V
 
S
A
 
A
D
 
P
F
 
L
T
 
S
D
 
G
P
 
V
T
 
P
R
 
D
A
 
V
N
 
W
G
 
A
Y
 
H
G
 
G
E
x
Q
G
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
D
L
 
V
A
 
V
F
 
L
H
 
A
P
 
P
D
 
D
D
 
F
P
 
A
D
 
Q
T
 
S
A
 
R
Y
 
R
A
 
I
Y
 
W
Q
 
L
T
 
S
Y
 
Y
-
 
S
-
 
E
V
 
V
D
 
G
G
 
D
D
 
D
E
 
G
A
 
K
A
 
A
N
 
G
R
 
T
I
 
A
L
 
V
-
 
G
-
 
Y
-
 
G
-
 
R
-
 
L
-
 
S
-
 
D
E
 
D
L
 
L
D
 
S
A
 
K
A
 
V
S
 
T
G
 
D
F
 
F
S
 
R
S
 
T
S
 
V
V
 
F
L
 
R
F
 
Q
D
 
M
G
 
P
I
 
K
E
 
L
G
 
S
A
 
T
D
 
G
G
 
N
H
 
H
D
 
F
G
 
G
G
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
V
I
 
F
D
 
D
G
 
G
D
 
K
A
 
G
-
 
Y
L
 
L
Y
 
F
A
 
I
T
 
A
V
 
L
G
 
G
D
 
E
T
 
N
K
 
N
E
 
Q
P
 
R
Q
 
P
S
 
T
A
 
A
Q
 
Q
D
 
D
P
 
L
S
 
D
S
 
K
L
 
L
S
 
Q
G
 
G
V
 
K
V
 
L
I
 
V
R
 
R
L
 
L
T
 
T
L
 
D
D
 
Q
G
 
G
E
 
E
P
 
I
H
 
P
P
 
D
D
 
D
N
 
N
P
 
P
F
 
F
D
 
I
G
 
K
D
 
E
E
 
S
G
 
G
H
 
A
P
 
R
A
 
A
-
 
E
V
 
I
Y
 
W
T
 
S
Y
 
Y
G
 
G
H
 
I
R
 
R
N
 
N
P
 
P
Q
 
Q
G
 
G
L
 
M
A
 
A
F
 
M
R
 
N
-
 
P
-
 
W
D
 
S
G
 
N
E
 
A
V
 
L
Y
 
W
S
 
L
T
 
N
E
 
E
H
 
H
G
 
G
P
 
P
D
 
R
H
 
G
D
 
G
D
 
D
E
|
E
I
 
I
N
 
N
V
 
I
L
 
P
E
 
Q
A
 
K
G
 
G
S
 
K
N
 
N
Y
|
Y
G
 
G
W
 
W
P
 
P
R
 
L
A
 
A
S
 
T
G
 
W
-
 
G
-
 
I
-
 
N
-
x
Y
-
 
S
-
 
G
-
 
F
-
 
K
-
 
I
T
 
P
E
 
E
S
 
A
E
 
K
G
 
G
E
 
E
F
 
I
V
 
V
G
 
A
A
 
G
-
 
T
-
 
E
-
 
Q
-
 
P
I
 
V
A
 
F
A
 
Y
Y
 
W
T
 
K
P
 
D
T
 
S
I
 
P
A
 
A
P
 
V
G
 
S
S
 
G
A
 
M
T
 
A
F
 
F
Y
 
Y
D
 
N
G
 
S
-
 
D
P
 
K
I
 
F
S
 
P
Q
 
Q
W
 
W
Q
 
Q
G
 
Q
D
 
K
L
 
L
F
 
F
F
 
I
G
 
G
T
 
A
L
 
L
S
 
K
G
 
D
E
 
K
H
 
D
L
 
V
H
 
I
R
 
V
V
 
M
R
 
S
L
 
V
D
 
N
G
 
G
H
 
D
D
 
K
A
 
V
V
 
T
E
 
E
E
 
D
E
 
G
R
 
R
L
 
I
Y
 
L
E
 
T
G
 
D
E
 
R
Y
 
G
G
 
Q
R
 
R
I
 
I
R
 
R
T
 
D
A
 
V
F
 
R
T
 
T
G
 
G
P
 
P
D
 
D
D
 
G
H
 
Y
L
 
L
Y
 
Y
L
 
V
A
 
L
T
 
T
S
 
D
N
 
E
R
 
S
D
 
S
G
 
G

2g8sA Crystal structure of the soluble aldose sugar dehydrogenase (asd) from escherichia coli in the apo-form (see paper)
31% identity, 61% coverage: 181:490/507 of query aligns to 3:340/348 of 2g8sA

query
sites
2g8sA
V
 
V
T
 
N
V
 
V
D
 
E
T
 
V
V
 
L
A
 
Q
T
 
D
N
 
K
L
 
L
E
 
D
I
 
H
P
 
P
W
 
W
G
 
A
A
 
L
A
 
A
F
 
F
R
 
L
G
 
P
D
 
D
T
 
N
-
 
H
-
 
G
L
 
M
Y
 
L
F
 
I
T
 
T
E
 
L
R
 
R
P
 
G
G
 
G
R
 
E
I
 
L
M
 
R
K
 
H
V
 
W
E
 
Q
S
 
A
G
 
G
S
 
K
G
 
G
E
 
-
L
 
L
V
 
S
A
 
A
D
 
P
F
 
L
T
 
S
D
 
G
P
 
V
T
 
P
R
 
D
A
 
V
N
 
W
G
 
A
Y
 
H
G
 
G
E
 
Q
G
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
D
L
 
V
A
 
V
F
 
L
H
 
A
P
 
P
D
 
D
D
 
F
P
 
A
D
 
Q
T
 
S
A
 
R
Y
 
R
A
 
I
Y
 
W
Q
 
L
T
 
S
Y
 
Y
-
 
S
-
 
E
V
 
V
D
 
G
G
 
D
D
 
D
E
 
G
A
 
K
A
 
A
N
 
G
R
 
T
I
 
A
L
 
V
-
 
G
-
 
Y
-
 
G
-
 
R
-
 
L
-
 
S
-
 
D
E
 
D
L
 
L
D
 
S
A
 
K
A
 
V
S
 
T
G
 
D
F
 
F
S
 
R
S
 
T
S
 
V
V
 
F
L
 
R
F
 
Q
D
 
M
G
 
P
I
 
K
E
 
L
G
 
S
A
 
T
D
 
G
G
 
N
H
|
H
D
 
F
G
 
G
G
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
V
I
 
F
D
 
D
G
 
G
D
 
K
A
 
G
-
 
Y
L
 
L
Y
 
F
A
 
I
T
 
A
V
 
L
G
 
G
D
x
E
T
 
N
K
 
N
E
 
Q
P
 
R
Q
 
P
S
 
T
A
 
A
Q
 
Q
D
 
D
P
 
L
S
 
D
S
 
K
L
 
L
S
 
Q
G
 
G
V
 
K
V
 
L
I
 
V
R
 
R
L
 
L
T
 
T
L
 
D
D
 
Q
G
 
G
E
 
E
P
 
I
H
 
P
P
 
D
D
 
D
N
 
N
P
 
P
F
 
F
D
 
I
G
 
K
D
 
E
E
 
S
G
 
G
H
 
V
P
 
R
A
 
A
-
 
E
V
 
I
Y
 
W
T
 
S
Y
 
Y
G
 
G
H
 
I
R
|
R
N
 
N
P
 
P
Q
 
Q
G
 
G
L
 
M
A
 
A
F
 
M
R
 
N
-
 
P
-
 
W
D
 
S
G
 
N
E
 
A
V
 
L
Y
 
W
S
 
L
T
 
N
E
 
E
H
 
H
G
 
G
P
 
P
D
 
R
H
 
G
D
 
G
D
 
D
E
|
E
I
 
I
N
 
N
V
 
I
L
 
P
E
 
Q
A
 
K
G
 
G
S
 
K
N
 
N
Y
|
Y
G
 
G
W
 
W
P
 
P
R
 
L
A
 
A
S
x
T
G
 
W
-
x
G
-
 
I
-
x
N
-
 
Y
-
 
S
-
 
G
-
 
F
-
 
K
-
 
I
T
 
P
E
 
E
S
 
A
E
 
K
G
 
G
E
 
E
F
 
I
V
 
V
G
 
A
A
 
G
-
 
T
-
 
E
-
 
Q
-
 
P
I
 
V
A
 
F
A
 
Y
Y
 
W
T
 
K
P
 
D
T
 
S
I
 
P
A
 
A
P
 
V
G
 
S
S
 
G
A
 
M
T
 
A
F
 
F
Y
 
Y
D
 
N
G
 
S
-
 
D
P
 
K
I
 
F
S
 
P
Q
 
Q
W
 
W
Q
 
Q
G
 
Q
D
 
K
L
 
L
F
 
F
F
 
I
G
 
G
T
 
A
L
 
L
S
 
K
G
 
D
E
 
K
H
 
D
L
 
V
H
 
I
R
 
V
V
 
M
R
 
S
L
 
V
D
 
N
G
 
G
H
 
D
D
 
K
A
 
V
V
 
T
E
 
E
E
 
D
E
 
G
R
 
R
L
 
I
Y
 
L
E
 
T
G
 
D
E
 
R
Y
 
G
G
 
Q
R
 
R
I
 
I
R
 
R
T
 
D
A
 
V
F
 
R
T
 
T
G
 
G
P
 
P
D
 
D
D
 
G
H
 
Y
L
 
L
Y
 
Y
L
 
V
A
 
L
T
 
T
S
 
D
N
 
E
R
 
S
D
 
S
G
 
G

1cq1A Soluble quinoprotein glucose dehydrogenase from acinetobacter calcoaceticus in complex with pqqh2 and glucose (see paper)
33% identity, 46% coverage: 168:399/507 of query aligns to 4:264/444 of 1cq1A

query
sites
1cq1A
V
 
L
D
 
T
P
 
P
D
 
S
S
 
Q
F
 
F
G
 
A
S
 
K
S
 
A
G
 
K
P
 
S
V
 
E
P
 
N
V
 
F
T
 
D
V
 
K
D
 
K
T
 
V
V
 
I
A
 
L
T
 
S
N
 
N
L
 
L
E
 
N
I
 
K
P
 
P
-
 
H
-
 
A
-
 
L
-
 
L
W
 
W
G
 
G
A
 
P
A
 
-
F
 
-
R
 
-
G
 
D
D
 
N
T
 
Q
L
 
I
Y
 
W
F
 
L
T
 
T
E
 
E
R
 
R
P
 
A
-
 
T
G
 
G
R
 
K
I
 
I
M
 
L
K
 
R
V
 
V
E
 
N
S
 
P
G
 
E
S
 
S
G
 
G
E
 
S
L
 
V
V
 
K
A
 
T
D
 
V
F
 
F
T
 
Q
D
 
V
P
 
P
T
 
E
R
 
I
A
 
V
N
 
N
-
 
D
G
 
A
Y
 
D
G
 
G
E
x
Q
G
 
N
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
F
A
 
A
F
 
F
H
 
H
P
 
P
D
 
D
D
 
F
P
 
K
D
 
N
T
 
N
A
 
P
Y
 
Y
A
 
I
Y
 
Y
Q
 
I
T
 
S
Y
 
G
V
 
T
D
 
F
G
 
K
D
 
N
E
 
P
A
 
K
A
 
P
N
 
N
R
 
Q
I
 
T
L
 
I
E
 
I
L
 
R
D
 
R
A
 
Y
A
 
T
S
 
Y
G
 
N
F
 
K
S
 
S
S
 
T
S
 
D
V
 
T
L
 
L
-
 
E
-
 
K
-
 
P
-
 
V
-
 
D
-
 
L
F
 
L
D
 
A
G
 
G
I
 
L
E
 
P
G
 
S
A
 
S
D
 
K
G
x
D
H
|
H
D
 
Q
G
 
S
G
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
V
I
 
I
D
 
G
G
 
P
D
 
D
-
 
Q
A
 
K
L
 
I
Y
 
Y
A
 
Y
T
 
T
V
 
I
G
 
G
D
|
D
-
 
Q
-
 
G
-
 
R
-
 
N
-
x
Q
-
 
L
-
 
A
-
 
Y
-
 
L
-
 
F
-
 
L
-
 
P
-
 
N
-
 
Q
-
 
A
-
 
Q
-
 
H
-
 
T
-
 
P
T
 
T
K
 
Q
E
 
Q
P
 
E
Q
 
L
S
 
N
A
 
G
Q
 
K
D
 
D
P
 
Y
S
 
H
S
 
T
L
 
Y
S
 
M
G
 
G
V
 
K
V
 
V
I
 
L
R
 
R
L
 
L
T
 
N
L
 
L
D
 
D
G
 
G
E
 
S
P
 
I
H
 
P
P
 
K
D
 
D
N
 
N
P
 
P
-
 
S
F
 
F
D
 
N
G
 
G
D
 
V
E
 
V
G
 
S
H
 
H
P
 
-
A
 
-
V
 
I
Y
 
Y
T
 
T
Y
 
L
G
 
G
H
 
H
R
|
R
N
|
N
P
 
P
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
A
 
A
F
 
F
R
 
T
-
 
P
D
 
N
G
 
G
E
 
K
V
 
L
Y
 
L
S
 
Q
T
 
S
E
 
E
H
x
Q
G
|
G
P
|
P
D
 
N
H
 
S
D
 
D
D
 
D
E
|
E
I
 
I
N
 
N
V
 
L
L
 
I
E
 
V
A
 
K
G
 
G
S
 
G
N
 
N
Y
|
Y
G
 
G
W
 
W
P
 
P
R
 
N
A
 
V
S
x
A
G
 
G

Sites not aligning to the query:

1c9uA Crystal structure of the soluble quinoprotein glucose dehydrogenase in complex with pqq (see paper)
33% identity, 46% coverage: 168:399/507 of query aligns to 4:264/444 of 1c9uA

query
sites
1c9uA
V
 
L
D
 
T
P
 
P
D
 
S
S
 
Q
F
 
F
G
 
A
S
 
K
S
 
A
G
 
K
P
 
S
V
 
E
P
 
N
V
 
F
T
 
D
V
 
K
D
 
K
T
 
V
V
 
I
A
 
L
T
 
S
N
 
N
L
 
L
E
 
N
I
 
K
P
 
P
-
 
H
-
 
A
-
 
L
-
 
L
W
 
W
G
 
G
A
 
P
A
 
-
F
 
-
R
 
-
G
 
D
D
 
N
T
 
Q
L
 
I
Y
 
W
F
 
L
T
 
T
E
 
E
R
 
R
P
 
A
-
 
T
G
 
G
R
 
K
I
 
I
M
 
L
K
 
R
V
 
V
E
 
N
S
 
P
G
 
E
S
 
S
G
 
G
E
 
S
L
 
V
V
 
K
A
 
T
D
 
V
F
 
F
T
 
Q
D
 
V
P
 
P
T
 
E
R
 
I
A
 
V
N
 
N
-
 
D
G
 
A
Y
 
D
G
 
G
E
x
Q
G
 
N
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
F
A
 
A
F
 
F
H
 
H
P
 
P
D
 
D
D
 
F
P
 
K
D
 
N
T
 
N
A
 
P
Y
 
Y
A
 
I
Y
 
Y
Q
 
I
T
 
S
Y
 
G
V
 
T
D
 
F
G
 
K
D
 
N
E
 
P
A
 
K
A
 
P
N
 
N
R
 
Q
I
 
T
L
 
I
E
 
I
L
 
R
D
 
R
A
 
Y
A
 
T
S
 
Y
G
 
N
F
 
K
S
 
S
S
 
T
S
 
D
V
 
T
L
 
L
-
 
E
-
 
K
-
 
P
-
 
V
-
 
D
-
 
L
F
 
L
D
 
A
G
 
G
I
 
L
E
 
P
G
 
S
A
 
S
D
 
K
G
 
D
H
|
H
D
 
Q
G
 
S
G
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
V
I
 
I
D
 
G
G
 
P
D
 
D
-
 
Q
A
 
K
L
 
I
Y
 
Y
A
 
Y
T
 
T
V
 
I
G
 
G
D
|
D
-
 
Q
-
 
G
-
 
R
-
 
N
-
 
Q
-
 
L
-
 
A
-
 
Y
-
 
L
-
 
F
-
 
L
-
 
P
-
 
N
-
 
Q
-
 
A
-
 
Q
-
 
H
-
 
T
-
 
P
T
 
T
K
 
Q
E
 
Q
P
 
E
Q
 
L
S
 
N
A
 
G
Q
 
K
D
 
D
P
 
Y
S
 
H
S
 
T
L
 
Y
S
 
M
G
 
G
V
 
K
V
 
V
I
 
L
R
 
R
L
 
L
T
 
N
L
 
L
D
 
D
G
 
G
E
 
S
P
 
I
H
 
P
P
 
K
D
 
D
N
 
N
P
 
P
-
 
S
F
 
F
D
 
N
G
 
G
D
 
V
E
 
V
G
 
S
H
 
H
P
 
-
A
 
-
V
 
I
Y
 
Y
T
 
T
Y
 
L
G
 
G
H
 
H
R
|
R
N
|
N
P
 
P
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
A
 
A
F
 
F
R
 
T
-
 
P
D
 
N
G
 
G
E
 
K
V
 
L
Y
 
L
S
 
Q
T
 
S
E
 
E
H
x
Q
G
|
G
P
|
P
D
 
N
H
 
S
D
 
D
D
 
D
E
|
E
I
 
I
N
 
N
V
 
L
L
 
I
E
 
V
A
 
K
G
 
G
S
 
G
N
 
N
Y
|
Y
G
 
G
W
 
W
P
 
P
R
 
N
A
 
V
S
x
A
G
 
G

Sites not aligning to the query:

1cruA Soluble quinoprotein glucose dehydrogenase from acinetobacter calcoaceticus in complex with pqq and methylhydrazine (see paper)
33% identity, 46% coverage: 168:399/507 of query aligns to 4:268/448 of 1cruA

query
sites
1cruA
V
 
L
D
 
T
P
 
P
D
 
S
S
 
Q
F
 
F
G
 
A
S
 
K
S
 
A
G
 
K
P
 
S
V
 
E
P
 
N
V
 
F
T
 
D
V
 
K
D
 
K
T
 
V
V
 
I
A
 
L
T
 
S
N
 
N
L
 
L
E
 
N
I
 
K
P
 
P
-
 
H
-
 
A
-
 
L
-
 
L
W
 
W
G
 
G
A
 
P
A
 
-
F
 
-
R
 
-
G
 
D
D
 
N
T
 
Q
L
 
I
Y
 
W
F
 
L
T
 
T
E
 
E
R
 
R
P
 
A
-
 
T
G
 
G
R
 
K
I
 
I
M
 
L
K
 
R
V
 
V
E
 
N
S
 
P
G
 
E
S
 
S
G
 
G
E
 
S
L
 
V
V
 
K
A
 
T
D
 
V
F
 
F
T
 
Q
D
 
V
P
 
P
T
 
E
R
 
I
A
 
V
N
 
N
-
 
D
G
 
A
Y
 
D
G
 
G
E
x
Q
G
 
N
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
F
A
 
A
F
 
F
H
 
H
P
 
P
D
 
D
D
 
F
P
 
K
D
 
N
T
 
N
A
 
P
Y
 
Y
A
 
I
Y
 
Y
Q
 
I
-
 
S
-
 
G
T
 
T
Y
 
F
V
 
K
D
 
N
-
 
P
-
 
K
G
 
S
D
 
K
E
 
E
A
 
L
A
 
P
N
 
N
R
 
Q
I
 
T
L
 
I
E
 
I
L
 
R
D
 
R
A
 
Y
A
 
T
S
 
Y
G
 
N
F
 
K
S
 
S
S
 
T
S
 
D
V
 
T
L
 
L
-
 
E
-
 
K
-
 
P
-
 
V
-
 
D
-
 
L
F
 
L
D
 
A
G
 
G
I
 
L
E
 
P
G
 
S
A
 
S
D
 
K
G
 
D
H
|
H
D
 
Q
G
 
S
G
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
V
I
 
I
D
 
G
G
 
P
D
 
D
-
 
Q
A
 
K
L
 
I
Y
 
Y
A
 
Y
T
 
T
V
 
I
G
 
G
D
|
D
-
 
Q
-
 
G
-
 
R
-
 
N
-
 
Q
-
 
L
-
 
A
-
 
Y
-
 
L
-
 
F
-
 
L
-
 
P
-
 
N
-
 
Q
-
 
A
-
 
Q
-
 
H
-
 
T
-
 
P
T
 
T
K
 
Q
E
 
Q
P
 
E
Q
 
L
S
 
N
A
 
G
Q
 
K
D
 
D
P
 
Y
S
 
H
S
 
T
L
 
Y
S
 
M
G
 
G
V
 
K
V
 
V
I
 
L
R
 
R
L
 
L
T
 
N
L
 
L
D
 
D
G
 
G
E
 
S
P
 
I
H
 
P
P
 
K
D
 
D
N
 
N
P
 
P
-
 
S
F
 
F
D
 
N
G
 
G
D
 
V
E
 
V
G
 
S
H
 
H
P
 
-
A
 
-
V
 
I
Y
 
Y
T
 
T
Y
 
L
G
 
G
H
 
H
R
|
R
N
|
N
P
 
P
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
A
 
A
F
 
F
R
 
T
-
 
P
D
 
N
G
 
G
E
 
K
V
 
L
Y
 
L
S
 
Q
T
 
S
E
 
E
H
x
Q
G
|
G
P
|
P
D
 
N
H
 
S
D
 
D
D
 
D
E
|
E
I
 
I
N
 
N
V
 
L
L
 
I
E
 
V
A
 
K
G
 
G
S
 
G
N
 
N
Y
|
Y
G
 
G
W
 
W
P
 
P
R
 
N
A
 
V
S
x
A
G
 
G

Sites not aligning to the query:

P13650 Quinoprotein glucose dehydrogenase B; Glucose dehydrogenase B [pyrroloquinoline-quinone]; Soluble glucose dehydrogenase; s-GDH; EC 1.1.5.2 from Acinetobacter calcoaceticus (see paper)
32% identity, 46% coverage: 168:399/507 of query aligns to 28:294/478 of P13650

query
sites
P13650
V
 
L
D
 
T
P
 
P
D
 
S
S
 
Q
F
 
F
G
 
A
S
 
K
S
 
A
G
 
K
P
 
S
V
 
E
P
 
N
V
 
F
T
 
D
V
 
K
D
 
K
T
 
V
V
 
I
A
 
L
T
 
S
N
 
N
L
 
L
E
 
N
I
 
K
P
 
P
-
 
H
-
 
A
-
 
L
-
 
L
W
 
W
G
 
G
A
 
P
A
 
-
F
 
-
R
 
-
G
 
D
D
 
N
T
 
Q
L
 
I
Y
 
W
F
 
L
T
 
T
E
 
E
R
 
R
P
 
A
-
 
T
G
 
G
R
 
K
I
 
I
M
 
L
K
 
R
V
 
V
E
 
N
S
 
P
G
 
E
S
 
S
G
 
G
E
 
S
L
 
V
V
 
K
A
 
T
D
 
V
F
 
F
T
 
Q
D
 
V
P
 
P
T
 
E
R
 
I
A
 
V
N
 
N
-
 
D
G
 
A
Y
 
D
G
 
G
E
x
Q
G
 
N
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
F
A
 
A
F
 
F
H
 
H
P
 
P
D
 
D
D
 
F
P
 
K
D
 
N
T
 
N
A
 
P
Y
 
Y
A
 
I
Y
 
Y
Q
 
I
T
 
S
-
 
G
-
 
T
-
 
F
-
 
K
-
 
N
-
 
P
-
 
K
Y
 
S
V
 
T
D
 
D
G
 
K
D
 
E
E
 
L
A
 
P
A
 
N
N
 
Q
R
 
T
I
 
I
L
 
I
E
 
R
L
 
R
D
 
Y
A
 
T
A
 
Y
S
 
N
G
 
K
F
 
S
S
 
T
S
 
D
S
 
T
V
 
L
-
 
E
-
 
K
-
 
P
-
 
V
-
 
D
L
 
L
F
 
L
D
 
A
G
 
G
I
 
L
E
 
P
G
 
S
A
 
S
D
 
K
G
x
D
H
 
H
D
 
Q
G
 
S
G
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
V
I
 
I
D
 
G
G
 
P
D
 
D
-
 
Q
A
 
K
L
 
I
Y
 
Y
A
 
Y
T
 
T
V
 
I
G
 
G
D
 
D
-
 
Q
-
 
G
-
 
R
-
 
N
-
x
Q
-
 
L
-
 
A
-
 
Y
-
 
L
-
 
F
-
 
L
-
 
P
-
 
N
-
 
Q
-
 
A
-
 
Q
-
 
H
-
 
T
-
 
P
T
 
T
K
 
Q
E
 
Q
P
 
E
Q
 
L
S
 
N
A
 
G
Q
 
K
D
 
D
P
 
Y
S
 
H
S
 
T
L
 
Y
S
 
M
G
 
G
V
 
K
V
 
V
I
 
L
R
 
R
L
 
L
T
 
N
L
 
L
D
 
D
G
 
G
E
 
S
P
 
I
H
 
P
P
 
K
D
 
D
N
 
N
P
 
P
-
 
S
F
 
F
D
 
N
G
 
G
D
 
V
E
 
V
G
 
S
H
 
H
P
 
-
A
 
-
V
 
I
Y
 
Y
T
 
T
Y
 
L
G
 
G
H
 
H
R
|
R
N
 
N
P
 
P
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
A
 
A
F
 
F
R
 
T
-
 
P
D
 
N
G
 
G
E
 
K
V
 
L
Y
 
L
S
 
Q
T
 
S
E
 
E
H
 
Q
G
|
G
P
|
P
D
 
N
H
 
S
D
 
D
D
 
D
E
|
E
I
 
I
N
 
N
V
 
L
L
 
I
E
 
V
A
 
K
G
 
G
S
 
G
N
 
N
Y
|
Y
G
 
G
W
 
W
P
 
P
R
 
N
A
 
V
S
x
A
G
 
G

Sites not aligning to the query:

8re0A Quinoprotein glucose dehydrogenase B (see paper)
32% identity, 46% coverage: 168:399/507 of query aligns to 4:270/452 of 8re0A

query
sites
8re0A
V
 
L
D
 
T
P
 
P
D
 
S
S
 
Q
F
 
F
G
 
A
S
 
K
S
 
A
G
 
K
P
 
S
V
 
E
P
 
N
V
 
F
T
 
D
V
 
K
D
 
K
T
 
V
V
 
I
A
 
L
T
 
S
N
 
N
L
 
L
E
 
N
I
 
K
P
 
P
-
 
H
-
 
A
-
 
L
-
 
L
W
 
W
G
 
G
A
 
P
A
 
-
F
 
-
R
 
-
G
 
D
D
 
N
T
 
Q
L
 
I
Y
 
W
F
 
L
T
 
T
E
 
E
R
 
R
P
 
A
-
 
T
G
 
G
R
 
K
I
 
I
M
 
L
K
 
R
V
 
V
E
 
N
S
 
P
G
 
E
S
 
S
G
 
G
E
 
S
L
 
V
V
 
K
A
 
T
D
 
V
F
 
F
T
 
Q
D
 
V
P
 
P
T
 
E
R
 
I
A
 
V
N
 
N
-
 
D
G
 
A
Y
 
D
G
 
G
E
 
Q
G
 
N
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
F
A
 
A
F
 
F
H
 
H
P
 
P
D
 
D
D
 
F
P
 
K
D
 
N
T
 
N
A
 
P
Y
 
Y
A
 
I
Y
 
Y
Q
 
I
T
 
S
-
 
G
-
 
T
-
 
F
-
 
K
-
 
N
-
 
P
-
 
K
Y
 
S
V
 
T
D
 
D
G
 
K
D
 
E
E
 
L
A
 
P
A
 
N
N
 
Q
R
 
T
I
 
I
L
 
I
E
 
R
L
 
R
D
 
Y
A
 
T
A
 
Y
S
 
N
G
 
K
F
 
S
S
 
T
S
 
D
S
 
T
V
 
L
-
 
E
-
 
K
-
 
P
-
 
V
-
 
D
L
 
L
F
 
L
D
 
A
G
 
G
I
 
L
E
 
P
G
 
S
A
 
S
D
 
K
G
 
D
H
 
H
D
 
Q
G
 
S
G
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
V
I
 
I
D
 
G
G
 
P
D
 
D
-
 
Q
A
 
K
L
 
I
Y
 
Y
A
 
Y
T
 
T
V
 
I
G
 
G
D
 
D
-
 
Q
-
 
G
-
 
R
-
 
N
-
 
Q
-
 
L
-
 
A
-
 
Y
-
 
L
-
 
F
-
 
L
-
 
P
-
 
N
-
 
Q
-
 
A
-
 
Q
-
 
H
-
 
T
-
 
P
T
 
T
K
 
Q
E
 
Q
P
 
E
Q
 
L
S
 
N
A
 
G
Q
 
K
D
 
D
P
 
Y
S
 
H
S
 
T
L
 
Y
S
 
M
G
 
G
V
 
K
V
 
V
I
 
L
R
 
R
L
 
L
T
 
N
L
 
L
D
 
D
G
 
G
E
 
S
P
 
I
H
 
P
P
 
K
D
 
D
N
 
N
P
 
P
-
 
S
F
 
F
D
 
N
G
 
G
D
 
V
E
 
V
G
 
S
H
 
H
P
 
-
A
 
-
V
 
I
Y
 
Y
T
 
T
Y
 
L
G
 
G
H
 
H
R
|
R
N
 
N
P
 
P
Q
|
Q
G
 
G
L
 
L
A
 
A
F
 
F
R
 
T
-
 
P
D
 
N
G
 
G
E
 
K
V
 
L
Y
 
L
S
 
Q
T
 
S
E
 
E
H
x
Q
G
|
G
P
|
P
D
 
N
H
 
S
D
 
D
D
 
D
E
|
E
I
 
I
N
 
N
V
 
L
L
 
I
E
 
V
A
 
K
G
 
G
S
 
G
N
 
N
Y
|
Y
G
 
G
W
 
W
P
 
P
R
 
N
A
 
V
S
x
A
G
 
G

Sites not aligning to the query:

5minB Apo form of the soluble pqq-dependent glucose dehydrogenase from acinetobacter calcoaceticus
32% identity, 46% coverage: 168:399/507 of query aligns to 4:270/453 of 5minB

query
sites
5minB
V
 
L
D
 
T
P
 
P
D
 
S
S
 
Q
F
 
F
G
 
A
S
 
K
S
 
A
G
 
K
P
 
S
V
 
E
P
 
N
V
 
F
T
 
D
V
 
K
D
 
K
T
 
V
V
 
I
A
 
L
T
 
S
N
 
N
L
 
L
E
 
N
I
 
K
P
 
P
-
 
H
-
 
A
-
 
L
-
 
L
W
 
W
G
 
G
A
 
P
A
 
-
F
 
-
R
 
-
G
 
D
D
 
N
T
 
Q
L
 
I
Y
 
W
F
 
L
T
 
T
E
 
E
R
 
R
P
 
A
-
 
T
G
 
G
R
 
K
I
 
I
M
 
L
K
 
R
V
 
V
E
 
N
S
 
P
G
 
E
S
 
S
G
 
G
E
 
S
L
 
V
V
 
K
A
 
T
D
 
V
F
 
F
T
 
Q
D
 
V
P
 
P
T
 
E
R
 
I
A
 
V
N
 
N
-
 
D
G
 
A
Y
 
D
G
 
G
E
 
Q
G
 
N
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
F
A
 
A
F
 
F
H
 
H
P
 
P
D
 
D
D
 
F
P
 
K
D
 
N
T
 
N
A
 
P
Y
 
Y
A
 
I
Y
 
Y
Q
 
I
T
 
S
-
 
G
-
 
T
-
 
F
-
 
K
-
 
N
-
 
P
-
 
K
-
 
S
-
 
T
-
 
D
-
 
K
Y
 
A
V
 
L
D
 
P
G
 
N
D
 
Q
E
 
T
A
 
I
A
 
I
N
 
R
R
 
R
I
 
Y
L
 
T
E
 
Y
L
 
N
D
 
K
A
 
S
A
 
T
S
 
D
G
 
T
F
 
L
S
 
E
S
 
K
S
 
P
V
 
V
-
 
D
L
 
L
F
 
L
D
 
A
G
 
G
I
 
L
E
 
P
G
 
S
A
 
S
D
 
K
G
 
D
H
|
H
D
 
Q
G
 
S
G
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
V
I
 
I
D
 
G
G
 
P
D
 
D
-
 
Q
A
 
K
L
 
I
Y
 
Y
A
 
Y
T
 
T
V
 
I
G
 
G
D
|
D
-
 
Q
-
 
G
-
 
R
-
 
N
-
 
Q
-
 
L
-
 
A
-
 
Y
-
 
L
-
 
F
-
 
L
-
 
P
-
 
N
-
 
Q
-
 
A
-
 
Q
-
 
H
-
 
T
-
 
P
T
 
T
K
 
Q
E
 
Q
P
 
E
Q
 
L
S
 
N
A
 
G
Q
 
K
D
 
D
P
 
Y
S
 
H
S
 
T
L
 
Y
S
 
M
G
 
G
V
 
K
V
 
V
I
 
L
R
 
R
L
 
L
T
 
N
L
 
L
D
 
D
G
 
G
E
 
S
P
 
I
H
 
P
P
 
K
D
 
D
N
 
N
P
 
P
-
 
S
F
 
F
D
 
N
G
 
G
D
 
V
E
 
V
G
 
S
H
 
H
P
 
-
A
 
-
V
 
I
Y
 
Y
T
 
T
Y
 
L
G
 
G
H
 
H
R
|
R
N
 
N
P
 
P
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
A
 
A
F
 
F
R
 
T
-
 
P
D
 
N
G
 
G
E
 
K
V
 
L
Y
 
L
S
 
Q
T
 
S
E
 
E
H
 
Q
G
 
G
P
 
P
D
 
N
H
 
S
D
 
D
D
 
D
E
|
E
I
 
I
N
 
N
V
 
L
L
 
I
E
 
V
A
 
K
G
 
G
S
 
G
N
 
N
Y
|
Y
G
 
G
W
 
W
P
 
P
R
 
N
A
 
V
S
x
A
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_007694352.1 NCBI__GCF_000336675.1:WP_007694352.1
MSDTDERAFYRFTVSERIEARWEADLTEADYPDGVDGRTASGAVAERGADNFHFAGDVVT
FALDGPATVYMNGDEIDTEERWNSELPNTLLLESEDTERATYEFDVSGDLEAGVLADLTN
AEVPDSVEGSHASGAVAGGGTDDFRFSGRVTRFSSDGPLRVFRNGSEVDPDSFGSSGPVP
VTVDTVATNLEIPWGAAFRGDTLYFTERPGRIMKVESGSGELVADFTDPTRANGYGEGGL
LGLAFHPDDPDTAYAYQTYVDGDEAANRILELDAASGFSSSVLFDGIEGADGHDGGRLAI
DGDALYATVGDTKEPQSAQDPSSLSGVVIRLTLDGEPHPDNPFDGDEGHPAVYTYGHRNP
QGLAFRDGEVYSTEHGPDHDDEINVLEAGSNYGWPRASGTESEGEFVGAIAAYTPTIAPG
SATFYDGPISQWQGDLFFGTLSGEHLHRVRLDGHDAVEEERLYEGEYGRIRTAFTGPDDH
LYLATSNRDGRGSPVASDDRILRIRPD

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory