SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_007699692.1 NCBI__GCF_001277175.1:WP_007699692.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P0AEE5 D-galactose/methyl-galactoside binding periplasmic protein MglB; D-galactose-binding periplasmic protein; GBP; D-galactose/D-glucose-binding protein; GGBP from Escherichia coli (strain K12) (see 4 papers)
93% identity, 100% coverage: 1:331/332 of query aligns to 1:332/332 of P0AEE5

query
sites
P0AEE5
M
|
M
N
|
N
K
|
K
K
|
K
V
|
V
L
|
L
T
|
T
L
|
L
S
|
S
A
|
A
V
|
V
M
|
M
S
x
A
C
x
S
M
|
M
L
|
L
F
|
F
G
|
G
T
x
A
A
|
A
A
|
A
Q
x
H
A
|
A
A
 
A
D
 
D
-
 
T
R
 
R
I
 
I
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
Y
 
Y
K
 
K
Y
 
Y
D
 
D
D
|
D
N
 
N
F
 
F
M
 
M
S
 
S
V
 
V
V
 
V
R
 
R
K
 
K
A
 
A
I
 
I
E
 
E
K
 
Q
E
 
D
A
 
A
S
 
K
A
 
A
S
 
A
S
 
P
D
 
D
V
 
V
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
M
 
M
N
 
N
D
 
D
S
 
S
Q
 
Q
N
 
N
D
 
D
Q
 
Q
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
N
 
N
D
 
D
Q
 
Q
I
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
K
G
 
G
V
 
V
K
 
K
S
 
A
L
 
L
A
 
A
I
 
I
N
 
N
L
 
L
V
 
V
D
 
D
P
 
P
A
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
G
T
 
T
V
 
V
I
 
I
E
 
E
K
 
K
A
 
A
R
 
R
G
 
G
Q
 
Q
N
 
N
I
 
V
P
 
P
I
 
V
V
 
V
F
 
F
F
 
F
N
|
N
K
 
K
E
 
E
P
 
P
S
 
S
R
 
R
K
 
K
A
 
A
L
 
L
D
 
D
S
 
S
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
A
 
A
Y
 
Y
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
T
 
T
D
 
D
S
 
S
K
 
K
E
 
E
S
 
S
G
 
G
I
 
I
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
D
 
D
L
 
L
I
 
I
A
 
A
K
 
K
H
 
H
W
 
W
K
 
A
A
 
A
N
 
N
A
 
Q
G
 
G
W
 
W
D
|
D
L
 
L
N
|
N
K
 
K
D
|
D
G
 
G
Q
|
Q
I
 
I
Q
|
Q
Y
 
F
V
 
V
L
 
L
L
 
L
K
 
K
G
 
G
E
 
E
P
 
P
G
 
G
H
|
H
P
 
P
D
|
D
A
 
A
E
 
E
A
 
A
R
|
R
T
 
T
T
 
T
Y
 
Y
V
 
V
I
 
I
K
 
K
E
 
E
L
 
L
N
 
N
D
 
D
K
 
K
G
 
G
I
 
I
K
 
K
T
 
T
Q
 
E
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
T
 
T
A
 
A
M
 
M
W
 
W
D
 
D
T
 
T
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
K
 
K
D
 
D
K
 
K
M
 
M
D
 
D
A
 
A
W
 
W
L
 
L
S
 
S
G
 
G
P
 
P
N
 
N
A
 
A
N
 
N
K
 
K
I
 
I
E
|
E
V
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
N
 
N
N
|
N
D
 
D
A
 
A
M
 
M
A
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
A
H
 
H
N
 
N
K
 
K
S
 
S
S
 
S
V
 
I
P
 
P
V
 
V
F
 
F
G
 
G
V
 
V
D
|
D
A
 
A
L
 
L
P
 
P
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
V
 
V
K
 
K
S
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
T
 
T
V
 
V
L
 
L
N
|
N
D
 
D
A
 
A
N
 
N
N
 
N
Q
 
Q
A
 
A
K
 
K
A
 
A
T
 
T
F
 
F
D
 
D
L
 
L
A
 
A
K
 
K
N
 
N
L
 
L
A
 
A
A
 
D
G
 
G
K
 
K
G
 
G
A
 
A
A
 
A
D
 
D
G
 
G
T
 
T
N
 
N
W
 
W
K
 
K
I
 
I
E
 
D
N
 
N
K
 
K
V
 
V
V
 
V
R
 
R
I
 
V
P
 
P
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
V
 
V
D
 
D
K
 
K
D
 
D
N
 
N
L
 
L
A
 
A
E
 
E
I
 
F
T
 
S
S
 
K
K
 
K

P23905 D-galactose/methyl-galactoside binding periplasmic protein MglB; D-galactose-binding periplasmic protein; GBP; D-galactose/D-glucose-binding protein; GGBP from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see 2 papers)
90% identity, 100% coverage: 1:331/332 of query aligns to 1:332/332 of P23905

query
sites
P23905
M
 
M
N
 
N
K
 
K
K
 
K
V
 
V
L
 
L
T
 
T
L
 
L
S
 
S
A
 
A
V
 
V
M
 
M
S
 
A
C
 
S
M
 
L
L
 
L
F
 
F
G
 
G
T
 
A
A
 
H
A
 
A
Q
 
H
A
 
A
A
 
A
D
 
D
-
 
T
R
 
R
I
 
I
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
Y
 
Y
K
 
K
Y
 
Y
D
 
D
D
|
D
N
 
N
F
 
F
M
 
M
S
 
S
V
 
V
V
 
V
R
 
R
K
 
K
A
 
A
I
 
I
E
 
E
K
 
K
E
 
D
A
 
G
S
 
K
A
 
S
S
 
A
S
 
P
D
 
D
V
 
V
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
M
 
M
N
 
N
D
 
D
S
 
S
Q
 
Q
N
 
N
D
 
D
Q
 
Q
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
N
 
N
D
 
D
Q
 
Q
I
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
K
G
 
G
V
 
V
K
 
K
S
 
A
L
 
L
A
 
A
I
 
I
N
 
N
L
 
L
V
 
V
D
 
D
P
 
P
A
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
G
T
 
T
V
 
V
I
 
I
E
 
E
K
 
K
A
 
A
R
 
R
G
 
G
Q
 
Q
N
 
N
I
 
V
P
 
P
I
 
V
V
 
V
F
 
F
F
 
F
N
|
N
K
 
K
E
 
E
P
 
P
S
 
S
R
 
R
K
 
K
A
 
A
L
 
L
D
 
D
S
 
S
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
A
 
A
Y
 
Y
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
T
 
T
D
 
D
S
 
S
K
 
K
E
 
E
S
 
S
G
 
G
I
 
V
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
D
 
D
L
 
L
I
 
I
A
 
A
K
 
K
H
 
H
W
 
W
K
 
Q
A
 
A
N
 
N
A
 
Q
G
 
G
W
 
W
D
|
D
L
 
L
N
|
N
K
 
K
D
|
D
G
 
G
Q
x
K
I
 
I
Q
|
Q
Y
 
Y
V
 
V
L
 
L
L
 
L
K
 
K
G
 
G
E
 
E
P
 
P
G
 
G
H
|
H
P
 
P
D
|
D
A
 
A
E
 
E
A
 
A
R
|
R
T
 
T
T
 
T
Y
 
Y
V
 
V
I
 
V
K
 
K
E
 
E
L
 
L
N
 
N
D
 
D
K
 
K
G
 
G
I
 
I
K
 
Q
T
 
T
Q
 
E
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
T
A
 
A
M
 
M
W
 
W
D
 
D
T
 
T
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
K
 
K
D
 
D
K
 
K
M
 
M
D
 
D
A
 
A
W
 
W
L
 
L
S
 
S
G
 
G
P
 
P
N
 
N
A
 
A
N
 
N
K
 
K
I
 
I
E
|
E
V
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
N
 
N
N
|
N
D
 
D
A
 
A
M
 
M
A
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
A
H
 
H
N
 
N
K
 
K
S
 
S
S
 
S
V
 
I
P
 
P
V
 
V
F
 
F
G
 
G
V
 
V
D
|
D
A
 
A
L
 
L
P
 
P
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
V
 
V
K
 
K
S
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
M
A
 
A
G
 
G
T
 
T
V
 
V
L
 
L
N
|
N
D
 
D
A
 
A
N
 
N
N
 
N
Q
 
Q
A
 
A
K
 
K
A
 
A
T
 
T
F
 
F
D
 
D
L
 
L
A
 
A
K
 
K
N
 
N
L
 
L
A
 
A
A
 
E
G
 
G
K
 
K
G
 
G
A
 
A
A
 
A
D
 
D
G
 
G
T
 
T
N
 
S
W
 
W
K
 
K
I
 
I
E
 
E
N
 
N
K
 
K
V
 
I
V
 
V
R
 
R
I
 
V
P
 
P
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
V
 
V
D
 
D
K
 
K
D
 
D
N
 
N
L
 
L
A
 
S
E
 
E
I
 
F
T
 
T
S
 
Q
K
 
K

2gbpA Sugar and signal-transducer binding sites of the escherichia coli galactose chemoreceptor protein (see paper)
94% identity, 92% coverage: 26:331/332 of query aligns to 4:309/309 of 2gbpA

query
sites
2gbpA
R
 
R
I
 
I
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
Y
 
Y
K
 
K
Y
 
Y
D
 
D
D
|
D
N
 
N
F
 
F
M
 
M
S
 
S
V
 
V
V
 
V
R
 
R
K
 
K
A
 
A
I
 
I
E
 
E
K
 
Q
E
 
D
A
 
A
S
 
K
A
 
A
S
 
A
S
 
P
D
 
D
V
 
V
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
M
 
M
N
 
N
D
 
D
S
 
S
Q
 
Q
N
 
N
D
 
D
Q
 
Q
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
N
 
N
D
 
D
Q
 
Q
I
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
K
G
 
G
V
 
V
K
 
K
S
 
A
L
 
L
A
 
A
I
 
I
N
 
N
L
 
L
V
 
V
D
 
D
P
 
P
A
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
G
T
 
T
V
 
V
I
 
I
E
 
E
K
 
K
A
 
A
R
 
R
G
 
G
Q
 
Q
N
 
N
I
 
V
P
 
P
I
 
V
V
 
V
F
 
F
F
 
F
N
|
N
K
|
K
E
 
E
P
 
P
S
 
S
R
 
R
K
 
K
A
 
A
L
 
L
D
 
D
S
 
S
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
A
 
A
Y
 
Y
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
T
 
T
D
 
D
S
 
S
K
 
K
E
 
E
S
 
S
G
 
G
I
 
I
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
D
 
D
L
 
L
I
 
I
A
 
A
K
 
K
H
 
H
W
 
W
K
 
A
A
 
A
N
 
N
A
 
Q
G
 
G
W
 
W
D
|
D
L
 
L
N
|
N
K
 
K
D
|
D
G
 
G
Q
|
Q
I
 
I
Q
|
Q
Y
 
F
V
 
V
L
 
L
L
 
L
K
 
K
G
 
G
E
 
E
P
 
P
G
 
G
H
|
H
P
 
P
D
|
D
A
 
A
E
 
E
A
 
A
R
|
R
T
 
T
T
 
T
Y
 
Y
V
 
V
I
 
I
K
 
K
E
 
E
L
 
L
N
 
N
D
 
D
K
 
K
G
 
G
I
 
I
K
 
K
T
 
T
Q
 
E
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
T
 
T
A
 
A
M
 
M
W
|
W
D
 
D
T
 
T
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
K
 
K
D
 
D
K
 
K
M
 
M
D
 
D
A
 
A
W
 
W
L
 
L
S
 
S
G
 
G
P
 
P
N
 
N
A
 
A
N
 
N
K
 
K
I
 
I
E
|
E
V
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
N
 
N
N
|
N
D
 
D
A
 
A
M
 
M
A
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
A
H
 
H
N
 
N
K
 
K
S
 
S
S
 
S
V
 
I
P
 
P
V
 
V
F
 
F
G
 
G
V
 
V
D
|
D
A
 
A
L
 
L
P
 
P
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
V
 
V
K
 
K
S
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
T
 
T
V
 
V
L
 
L
N
|
N
D
 
D
A
 
A
N
 
N
N
 
N
Q
 
Q
A
 
A
K
 
K
A
 
A
T
 
T
F
 
F
D
 
D
L
 
L
A
 
A
K
 
K
N
 
N
L
 
L
A
 
A
A
 
D
G
 
G
K
 
K
G
 
G
A
 
A
A
 
A
D
 
D
G
 
G
T
 
T
N
 
N
W
 
W
K
 
K
I
 
I
E
 
D
N
 
N
K
 
K
V
 
V
V
 
V
R
 
R
I
 
V
P
 
P
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
V
 
V
D
 
D
K
 
K
D
 
D
N
 
N
L
 
L
A
 
A
E
 
E
I
 
F
T
 
S
S
 
K
K
 
K

2qw1A Glucose/galactose binding protein bound to 3-o-methyl d-glucose (see paper)
94% identity, 91% coverage: 26:328/332 of query aligns to 3:305/305 of 2qw1A

query
sites
2qw1A
R
 
R
I
 
I
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
Y
 
Y
K
 
K
Y
 
Y
D
 
D
D
 
D
N
 
N
F
 
F
M
 
M
S
 
S
V
 
V
V
 
V
R
 
R
K
 
K
A
 
A
I
 
I
E
 
E
K
 
Q
E
 
D
A
 
A
S
 
K
A
 
A
S
 
A
S
 
P
D
 
D
V
 
V
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
M
 
M
N
 
N
D
 
D
S
 
S
Q
 
Q
N
 
N
D
 
D
Q
 
Q
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
N
 
N
D
 
D
Q
 
Q
I
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
K
G
 
G
V
 
V
K
 
K
S
 
A
L
 
L
A
 
A
I
 
I
N
 
N
L
 
L
V
 
V
D
 
D
P
 
P
A
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
G
T
 
T
V
 
V
I
 
I
E
 
E
K
 
K
A
 
A
R
 
R
G
 
G
Q
 
Q
N
 
N
I
 
V
P
 
P
I
 
V
V
 
V
F
 
F
F
 
F
N
 
N
K
 
K
E
 
E
P
 
P
S
 
S
R
 
R
K
 
K
A
 
A
L
 
L
D
 
D
S
 
S
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
A
 
A
Y
 
Y
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
T
 
T
D
 
D
S
 
S
K
 
K
E
 
E
S
 
S
G
 
G
I
 
I
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
D
 
D
L
 
L
I
 
I
A
 
A
K
 
K
H
 
H
W
 
W
K
 
A
A
 
A
N
 
N
A
 
Q
G
 
G
W
 
W
D
|
D
L
 
L
N
|
N
K
 
K
D
|
D
G
 
G
Q
|
Q
I
 
I
Q
|
Q
Y
 
F
V
 
V
L
 
L
L
 
L
K
 
K
G
 
G
E
 
E
P
 
P
G
 
G
H
|
H
P
 
P
D
 
D
A
 
A
E
 
E
A
 
A
R
 
R
T
 
T
T
 
T
Y
 
Y
V
 
V
I
 
I
K
 
K
E
 
E
L
 
L
N
 
N
D
 
D
K
 
K
G
 
G
I
 
I
K
 
K
T
 
T
Q
 
E
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
T
 
T
A
 
A
M
 
M
W
|
W
D
 
D
T
 
T
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
K
 
K
D
 
D
K
 
K
M
 
M
D
 
D
A
 
A
W
 
W
L
 
L
S
 
S
G
 
G
P
 
P
N
 
N
A
 
A
N
 
N
K
 
K
I
 
I
E
|
E
V
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
N
 
N
N
|
N
D
 
D
A
 
A
M
 
M
A
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
A
H
 
H
N
 
N
K
 
K
S
 
S
S
 
S
V
 
I
P
 
P
V
 
V
F
 
F
G
 
G
V
 
V
D
|
D
A
 
A
L
 
L
P
 
P
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
V
 
V
K
 
K
S
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
T
 
T
V
 
V
L
 
L
N
 
N
D
 
D
A
 
A
N
 
N
N
 
N
Q
 
Q
A
 
A
K
 
K
A
 
A
T
 
T
F
 
F
D
 
D
L
 
L
A
 
A
K
 
K
N
 
N
L
 
L
A
 
A
A
 
D
G
 
G
K
 
K
G
 
G
A
 
A
A
 
A
D
 
D
G
 
G
T
 
T
N
 
N
W
 
W
K
 
K
I
 
I
E
 
D
N
 
N
K
 
K
V
 
V
V
 
V
R
 
R
I
 
V
P
 
P
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
V
 
V
D
 
D
K
 
K
D
 
D
N
 
N
L
 
L
A
 
A
E
 
E
I
 
F

8fxtA Escherichia coli periplasmic glucose-binding protein glucose complex: acrylodan conjugate attached at w183c (see paper)
94% identity, 92% coverage: 24:328/332 of query aligns to 1:305/305 of 8fxtA

query
sites
8fxtA
A
 
A
D
 
T
R
 
R
I
 
I
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
Y
|
Y
K
 
K
Y
 
Y
D
|
D
D
|
D
N
|
N
F
 
F
M
 
M
S
 
S
V
 
V
V
 
V
R
 
R
K
 
K
A
 
A
I
 
I
E
 
E
K
 
Q
E
 
D
A
 
A
S
 
K
A
 
A
S
 
A
S
 
P
D
 
D
V
 
V
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
M
 
M
N
 
N
D
|
D
S
 
S
Q
|
Q
N
|
N
D
 
D
Q
 
Q
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
N
 
N
D
 
D
Q
 
Q
I
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
K
G
 
G
V
 
V
K
 
K
S
 
A
L
 
L
A
 
A
I
 
I
N
 
N
L
 
L
V
 
V
D
 
D
P
 
P
A
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
G
T
 
T
V
 
V
I
 
I
E
 
E
K
 
K
A
 
A
R
 
R
G
 
G
Q
 
Q
N
 
N
I
 
V
P
 
P
I
 
V
V
 
V
F
 
F
F
 
F
N
|
N
K
 
K
E
 
E
P
 
P
S
 
S
R
 
R
K
 
K
A
 
A
L
 
L
D
 
D
S
 
S
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
A
 
A
Y
 
Y
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
T
 
T
D
 
D
S
 
S
K
 
K
E
 
E
S
 
S
G
 
G
I
 
I
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
D
|
D
L
 
L
I
 
I
A
 
A
K
|
K
H
 
H
W
 
W
K
 
A
A
 
A
N
 
N
A
 
Q
G
 
G
W
 
W
D
|
D
L
 
L
N
|
N
K
 
K
D
|
D
G
 
G
Q
|
Q
I
 
I
Q
|
Q
Y
 
F
V
 
V
L
 
L
L
 
L
K
 
K
G
 
G
E
|
E
P
 
P
G
 
G
H
|
H
P
 
P
D
|
D
A
 
A
E
 
E
A
 
A
R
|
R
T
 
T
T
 
T
Y
 
Y
V
 
V
I
 
I
K
 
K
E
 
E
L
 
L
N
 
N
D
 
D
K
 
K
G
 
G
I
 
I
K
 
K
T
 
T
Q
 
E
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
T
 
T
A
 
A
M
|
M
W
x
C
D
|
D
T
|
T
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
K
|
K
D
|
D
K
 
K
M
 
M
D
 
D
A
 
A
W
 
W
L
 
L
S
 
S
G
 
G
P
 
P
N
 
N
A
 
A
N
 
N
K
 
K
I
 
I
E
|
E
V
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
N
 
N
N
|
N
D
 
D
A
 
A
M
 
M
A
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
A
H
 
H
N
 
N
K
 
K
S
 
S
S
 
S
V
 
I
P
 
P
V
 
V
F
 
F
G
 
G
V
 
V
D
|
D
A
 
A
L
 
L
P
 
P
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
V
 
V
K
 
K
S
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
T
 
T
V
 
V
L
 
L
N
|
N
D
 
D
A
 
A
N
 
N
N
 
N
Q
 
Q
A
 
A
K
 
K
A
 
A
T
 
T
F
 
F
D
 
D
L
 
L
A
 
A
K
 
K
N
 
N
L
 
L
A
 
A
A
 
D
G
 
G
K
 
K
G
 
G
A
 
A
A
 
A
D
 
D
G
 
G
T
 
T
N
 
N
W
 
W
K
 
K
I
 
I
E
 
D
N
 
N
K
 
K
V
 
V
V
 
V
R
 
R
I
 
V
P
 
P
Y
 
Y
V
 
V
G
|
G
V
 
V
D
|
D
K
 
K
D
 
D
N
|
N
L
 
L
A
 
A
E
 
E
I
 
F

1gcaA The 1.7 angstroms refined x-ray structure of the periplasmic glucose(slash)galactose receptor from salmonella typhimurium (see paper)
92% identity, 92% coverage: 26:331/332 of query aligns to 4:309/309 of 1gcaA

query
sites
1gcaA
R
 
R
I
 
I
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
Y
 
Y
K
 
K
Y
 
Y
D
 
D
D
|
D
N
 
N
F
|
F
M
 
M
S
 
S
V
 
V
V
 
V
R
 
R
K
 
K
A
 
A
I
 
I
E
 
E
K
 
K
E
 
D
A
 
G
S
 
K
A
 
S
S
 
A
S
 
P
D
 
D
V
 
V
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
M
 
M
N
 
N
D
 
D
S
 
S
Q
 
Q
N
 
N
D
 
D
Q
 
Q
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
N
 
N
D
 
D
Q
 
Q
I
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
K
G
 
G
V
 
V
K
 
K
S
 
A
L
 
L
A
 
A
I
 
I
N
 
N
L
 
L
V
 
V
D
 
D
P
 
P
A
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
G
T
 
T
V
 
V
I
 
I
E
 
E
K
 
K
A
 
A
R
 
R
G
 
G
Q
 
Q
N
 
N
I
 
V
P
 
P
I
 
V
V
 
V
F
 
F
F
 
F
N
|
N
K
|
K
E
 
E
P
 
P
S
 
S
R
 
R
K
 
K
A
 
A
L
 
L
D
 
D
S
 
S
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
A
 
A
Y
 
Y
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
T
 
T
D
 
D
S
 
S
K
 
K
E
 
E
S
 
S
G
 
G
I
 
V
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
D
 
D
L
 
L
I
 
I
A
 
A
K
 
K
H
 
H
W
 
W
K
 
Q
A
 
A
N
 
N
A
 
Q
G
 
G
W
 
W
D
|
D
L
 
L
N
|
N
K
 
K
D
|
D
G
 
G
Q
x
K
I
 
I
Q
|
Q
Y
 
Y
V
 
V
L
 
L
L
 
L
K
 
K
G
 
G
E
 
E
P
 
P
G
 
G
H
|
H
P
 
P
D
|
D
A
 
A
E
 
E
A
 
A
R
|
R
T
 
T
T
 
T
Y
 
Y
V
 
V
I
 
V
K
 
K
E
 
E
L
 
L
N
 
N
D
 
D
K
 
K
G
 
G
I
 
I
K
 
Q
T
 
T
Q
 
E
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
T
A
 
A
M
 
M
W
 
W
D
 
D
T
 
T
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
K
 
K
D
 
D
K
 
K
M
 
M
D
 
D
A
 
A
W
 
W
L
 
L
S
 
S
G
 
G
P
 
P
N
 
N
A
 
A
N
 
N
K
 
K
I
 
I
E
|
E
V
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
N
 
N
N
|
N
D
 
D
A
 
A
M
 
M
A
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
A
H
 
H
N
 
N
K
 
K
S
 
S
S
 
S
V
 
I
P
 
P
V
 
V
F
 
F
G
 
G
V
 
V
D
|
D
A
 
A
L
 
L
P
 
P
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
V
 
V
K
 
K
S
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
M
A
 
A
G
 
G
T
 
T
V
 
V
L
 
L
N
|
N
D
 
D
A
 
A
N
 
N
N
 
N
Q
 
Q
A
 
A
K
 
K
A
 
A
T
 
T
F
 
F
D
 
D
L
 
L
A
 
A
K
 
K
N
 
N
L
 
L
A
 
A
A
 
E
G
 
G
K
 
K
G
 
G
A
 
A
A
 
A
D
 
D
G
 
G
T
 
T
N
 
S
W
 
W
K
 
K
I
 
I
E
 
E
N
 
N
K
 
K
V
 
I
V
 
V
R
 
R
I
 
V
P
 
P
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
V
 
V
D
 
D
K
 
K
D
 
D
N
 
N
L
 
L
A
 
S
E
 
E
I
 
F
T
 
T
S
 
Q
K
 
K

3ga5A X-ray structure of glucose/galactose receptor from salmonella typhimurium in complex with (2r)-glyceryl-beta-d-galactopyranoside (see paper)
92% identity, 92% coverage: 26:329/332 of query aligns to 2:305/305 of 3ga5A

query
sites
3ga5A
R
 
R
I
 
I
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
Y
 
Y
K
 
K
Y
 
Y
D
 
D
D
|
D
N
 
N
F
|
F
M
 
M
S
 
S
V
 
V
V
 
V
R
 
R
K
 
K
A
 
A
I
 
I
E
 
E
K
 
K
E
 
D
A
 
G
S
 
K
A
 
S
S
 
A
S
 
P
D
 
D
V
 
V
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
M
 
M
N
 
N
D
 
D
S
 
S
Q
 
Q
N
 
N
D
 
D
Q
 
Q
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
N
 
N
D
 
D
Q
 
Q
I
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
K
G
 
G
V
 
V
K
 
K
S
 
A
L
 
L
A
 
A
I
 
I
N
 
N
L
 
L
V
 
V
D
 
D
P
 
P
A
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
G
T
 
T
V
 
V
I
 
I
E
 
E
K
 
K
A
 
A
R
 
R
G
 
G
Q
 
Q
N
 
N
I
 
V
P
 
P
I
 
V
V
 
V
F
 
F
F
 
F
N
|
N
K
|
K
E
 
E
P
 
P
S
 
S
R
 
R
K
 
K
A
 
A
L
 
L
D
 
D
S
 
S
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
A
 
A
Y
 
Y
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
T
|
T
D
 
D
S
 
S
K
 
K
E
 
E
S
 
S
G
 
G
I
 
V
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
D
 
D
L
 
L
I
 
I
A
 
A
K
 
K
H
 
H
W
 
W
K
 
Q
A
 
A
N
 
N
A
 
Q
G
 
G
W
 
W
D
|
D
L
 
L
N
|
N
K
 
K
D
|
D
G
 
G
Q
x
K
I
 
I
Q
|
Q
Y
 
Y
V
 
V
L
 
L
L
 
L
K
 
K
G
 
G
E
 
E
P
 
P
G
 
G
H
|
H
P
 
P
D
|
D
A
 
A
E
 
E
A
 
A
R
|
R
T
 
T
T
 
T
Y
 
Y
V
 
V
I
 
V
K
 
K
E
 
E
L
 
L
N
 
N
D
 
D
K
 
K
G
 
G
I
 
I
K
 
Q
T
 
T
Q
 
E
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
T
A
 
A
M
 
M
W
|
W
D
 
D
T
 
T
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
K
 
K
D
 
D
K
 
K
M
 
M
D
 
D
A
 
A
W
 
W
L
 
L
S
 
S
G
 
G
P
 
P
N
 
N
A
 
A
N
 
N
K
 
K
I
 
I
E
|
E
V
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
N
 
N
N
|
N
D
 
D
A
 
A
M
 
M
A
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
A
H
 
H
N
 
N
K
 
K
S
 
S
S
 
S
V
 
I
P
 
P
V
 
V
F
 
F
G
 
G
V
 
V
D
|
D
A
 
A
L
 
L
P
 
P
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
V
 
V
K
 
K
S
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
M
A
 
A
G
 
G
T
 
T
V
 
V
L
 
L
N
|
N
D
 
D
A
 
A
N
 
N
N
 
N
Q
|
Q
A
 
A
K
 
K
A
 
A
T
 
T
F
 
F
D
 
D
L
 
L
A
 
A
K
 
K
N
 
N
L
 
L
A
 
A
A
 
E
G
 
G
K
 
K
G
 
G
A
 
A
A
 
A
D
 
D
G
 
G
T
 
T
N
 
S
W
 
W
K
 
K
I
 
I
E
 
E
N
 
N
K
 
K
V
 
I
V
 
V
R
 
R
I
 
V
P
 
P
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
V
 
V
D
 
D
K
 
K
D
 
D
N
 
N
L
 
L
A
 
S
E
 
E
I
 
F
T
 
T

5kwsA Crystal structure of galactose binding protein from yersinia pestis in the complex with beta d glucose
89% identity, 92% coverage: 23:329/332 of query aligns to 1:307/307 of 5kwsA

query
sites
5kwsA
A
 
A
A
 
E
D
 
T
R
 
R
I
 
I
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
Y
 
Y
K
 
K
Y
 
Y
D
 
D
D
|
D
N
 
N
F
 
F
M
 
M
S
 
S
V
 
V
V
 
V
R
 
R
K
 
K
A
 
A
I
 
I
E
 
E
K
 
K
E
 
D
A
 
A
S
 
K
A
 
A
S
 
S
S
 
P
D
 
E
V
 
I
Q
 
T
L
 
L
L
 
L
M
 
M
N
 
N
D
 
D
S
 
S
Q
 
Q
N
 
N
D
 
D
Q
 
Q
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
N
 
N
D
 
D
Q
 
Q
I
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
K
G
 
G
V
 
V
K
 
K
S
 
A
L
 
L
A
 
A
I
 
I
N
 
N
L
 
L
V
 
V
D
 
D
P
 
P
A
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
P
T
 
V
V
 
V
I
 
I
E
 
D
K
 
K
A
 
A
R
 
R
G
 
S
Q
 
N
N
 
D
I
 
I
P
 
P
I
 
I
V
 
V
F
 
F
F
 
Y
N
|
N
K
|
K
E
 
E
P
 
P
S
 
S
R
 
R
K
 
K
A
 
A
L
 
L
D
 
D
S
 
S
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
A
 
A
Y
 
Y
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
T
 
T
D
 
D
S
 
S
K
 
K
E
 
E
S
 
S
G
 
G
I
 
V
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
D
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
K
 
K
H
 
H
W
 
W
K
 
Q
A
 
A
N
 
N
A
 
P
G
 
E
W
 
W
D
|
D
L
 
L
N
|
N
K
 
K
D
|
D
G
 
G
Q
x
K
I
 
I
Q
|
Q
Y
 
F
V
 
V
L
 
L
L
 
L
K
 
K
G
 
G
E
 
E
P
 
P
G
 
G
H
|
H
P
 
P
D
|
D
A
 
A
E
 
E
A
 
A
R
|
R
T
 
T
T
 
T
Y
 
Y
V
 
V
I
 
I
K
 
K
E
 
T
L
 
L
N
 
N
D
 
E
K
 
K
G
 
G
I
 
L
K
 
P
T
 
T
Q
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
T
 
T
A
 
A
M
 
M
W
|
W
D
 
D
T
 
T
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
K
 
K
D
 
D
K
 
K
M
 
M
D
 
D
A
 
A
W
 
W
L
 
L
S
 
S
G
 
G
P
 
P
N
 
N
A
 
A
N
 
N
K
 
K
I
 
I
E
|
E
V
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
N
 
N
N
|
N
D
 
D
A
 
A
M
 
M
A
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
A
H
 
H
N
 
N
K
 
K
S
 
T
S
 
S
V
 
V
P
 
P
V
 
V
F
 
F
G
 
G
V
 
V
D
|
D
A
 
A
L
 
L
P
 
P
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
V
 
V
K
 
K
S
 
S
G
 
G
A
 
Q
L
 
M
A
 
A
G
 
G
T
 
T
V
 
V
L
 
L
N
|
N
D
 
D
A
 
A
N
 
N
N
 
N
Q
 
Q
A
 
A
K
 
K
A
 
A
T
 
T
F
 
F
D
 
D
L
 
L
A
 
A
K
 
K
N
 
N
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
K
 
K
G
 
P
A
 
A
A
 
A
D
 
E
G
 
G
T
 
T
N
 
T
W
 
W
K
 
K
I
 
I
E
 
E
N
 
N
K
 
K
V
 
I
V
 
V
R
 
R
I
 
I
P
 
P
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
V
 
V
D
 
D
K
 
K
D
 
D
N
 
N
L
 
L
A
 
A
E
 
E
I
 
F
T
 
T

4z0nA Crystal structure of a periplasmic solute binding protein (ipr025997) from streptobacillus moniliformis dsm-12112 (smon_0317, target efi- 511281) with bound d-galactose
61% identity, 91% coverage: 27:328/332 of query aligns to 4:305/307 of 4z0nA

query
sites
4z0nA
I
 
L
G
 
G
V
 
V
T
|
T
I
 
Y
Y
 
Y
K
 
K
Y
 
F
D
 
D
D
|
D
N
 
N
F
|
F
M
 
L
S
 
A
V
 
G
V
 
M
R
 
R
K
 
N
-
 
D
A
 
M
I
 
I
E
 
Q
K
 
I
E
 
A
A
 
K
S
 
E
A
 
K
S
 
Y
S
 
P
D
 
N
V
 
I
Q
 
E
L
 
L
L
 
L
M
 
N
N
 
N
D
 
D
S
 
S
Q
 
Q
N
 
N
D
 
S
Q
|
Q
S
|
S
K
 
I
Q
 
L
N
 
N
D
 
D
Q
 
Q
I
 
I
D
 
E
V
 
V
L
 
L
L
 
I
A
 
N
K
 
K
G
 
G
V
 
V
K
 
N
S
 
V
L
 
L
A
 
V
I
 
I
N
 
N
L
 
L
V
 
V
D
 
D
P
 
P
A
 
T
A
 
A
A
 
G
G
 
Q
T
 
S
V
 
V
I
 
I
E
 
D
K
 
K
A
 
A
R
 
K
G
 
A
Q
 
A
N
 
N
I
 
I
P
 
P
I
 
I
V
 
I
F
x
L
F
 
F
N
|
N
K
|
K
E
 
D
P
 
P
S
 
G
R
x
V
K
 
D
A
 
A
L
 
L
D
 
N
S
 
S
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
A
 
A
Y
 
W
Y
|
Y
V
 
V
G
|
G
T
 
T
D
 
T
S
 
P
K
 
K
E
 
D
S
 
S
G
 
G
I
 
I
I
 
L
Q
 
Q
G
 
G
D
 
Q
L
 
V
I
 
I
A
 
E
K
 
K
H
 
A
W
 
W
K
 
L
A
 
A
N
 
N
A
 
P
G
 
A
W
 
Y
D
|
D
L
 
L
N
|
N
K
 
G
D
|
D
G
 
G
Q
x
V
I
 
I
Q
|
Q
Y
 
Y
V
 
V
L
 
M
L
 
L
K
 
F
G
 
G
E
 
E
P
 
P
G
 
G
H
x
Q
P
 
P
D
|
D
A
 
A
E
 
E
A
 
A
R
|
R
T
 
T
T
 
K
Y
 
Y
V
 
S
I
 
I
K
 
E
E
 
Y
L
 
L
N
 
N
D
 
E
K
 
K
G
 
G
I
 
I
K
 
K
T
 
T
Q
 
E
Q
 
E
L
 
L
Q
 
H
L
 
K
D
 
D
T
 
I
A
 
A
M
 
N
W
|
W
D
 
D
T
 
A
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
K
 
K
D
 
D
K
 
K
M
|
M
D
 
D
A
 
A
W
 
W
L
 
L
S
 
S
G
 
G
P
 
P
N
 
N
A
 
A
N
 
N
K
 
K
I
 
I
E
|
E
V
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
N
 
N
N
|
N
D
 
D
A
 
G
M
 
M
A
 
A
M
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
E
 
E
A
x
S
L
 
I
K
 
K
A
 
A
H
 
V
N
 
-
K
 
K
S
 
K
S
 
E
V
 
L
P
 
P
V
 
V
F
 
F
G
 
G
V
 
V
D
|
D
A
 
A
L
 
I
P
 
Q
E
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
T
L
 
L
V
 
I
K
 
E
S
 
K
G
 
G
A
 
E
L
 
M
A
 
V
G
 
G
T
 
T
V
 
V
L
 
L
N
x
Q
D
 
D
A
 
A
N
 
T
N
 
G
Q
 
Q
A
 
A
K
 
R
A
 
A
T
 
I
F
 
L
D
 
E
L
 
L
A
 
A
K
 
N
N
 
N
L
 
I
A
 
A
A
 
N
G
 
G
K
 
K
G
 
E
A
 
P
A
 
T
D
 
E
G
 
G
T
 
T
N
 
E
W
 
W
K
 
K
I
 
L
E
 
I
N
 
D
K
 
K
V
 
A
V
 
V
R
 
R
I
 
V
P
 
P
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
V
 
V
D
 
D
K
 
K
D
 
D
N
 
N
L
 
Y
A
 
K
E
 
E
I
 
F

8fxuA Thermoanaerobacter thermosaccharolyticum periplasmic glucose-binding protein glucose complex: badan conjugate attached at f17c (see paper)
50% identity, 91% coverage: 27:327/332 of query aligns to 6:308/310 of 8fxuA

query
sites
8fxuA
I
 
I
G
 
G
V
 
V
T
 
A
I
 
I
Y
 
Y
K
 
K
Y
 
F
D
 
D
D
|
D
N
 
T
F
x
C
M
 
M
S
 
T
V
 
G
V
 
V
R
 
R
K
 
N
A
 
A
I
 
M
E
 
T
K
 
A
E
 
E
A
 
A
S
 
Q
A
 
G
S
 
K
S
 
A
D
 
-
V
 
-
Q
 
K
L
 
L
L
 
N
M
 
M
N
 
V
D
 
D
S
 
S
Q
 
Q
N
 
N
D
 
S
Q
 
Q
S
 
P
K
 
T
Q
 
Q
N
 
N
D
 
D
Q
 
Q
I
 
V
D
 
D
V
 
L
L
 
F
L
 
I
A
 
T
K
 
K
G
 
K
V
 
M
K
 
N
S
 
A
L
 
L
A
 
A
I
 
I
N
 
N
L
 
P
V
 
V
D
 
D
P
 
R
A
 
T
A
 
A
A
 
A
G
 
G
T
 
T
V
 
I
I
 
I
E
 
D
K
 
K
A
 
A
R
 
K
G
 
Q
Q
 
A
N
 
N
I
 
I
P
 
P
I
 
V
V
 
V
F
 
F
F
 
F
N
|
N
K
x
R
E
 
E
P
 
P
S
 
L
R
 
P
K
 
E
A
 
D
L
 
M
D
 
K
S
 
K
Y
 
W
D
 
D
K
 
K
A
 
V
Y
 
Y
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
T
 
A
D
 
K
S
 
A
K
 
E
E
 
Q
S
 
S
G
 
G
I
 
I
I
 
L
Q
 
Q
G
 
G
D
 
Q
L
 
I
I
 
M
A
 
A
K
 
D
H
 
Y
W
 
W
K
 
K
A
 
A
N
 
H
A
 
P
G
 
E
W
 
A
D
|
D
L
 
K
N
|
N
K
 
H
D
|
D
G
 
G
Q
x
V
I
 
M
Q
|
Q
Y
 
Y
V
 
V
L
 
M
L
 
L
K
 
M
G
 
G
E
 
Q
P
 
P
G
 
G
H
 
H
P
 
Q
D
|
D
A
 
A
E
 
I
A
 
L
R
|
R
T
 
T
T
 
Q
Y
 
Y
V
 
S
I
 
I
K
 
Q
E
 
T
L
 
V
N
 
K
D
 
D
K
 
A
G
 
G
I
 
I
K
 
K
T
 
V
Q
 
Q
Q
 
E
L
 
L
Q
 
A
L
 
K
D
 
D
T
 
Y
A
 
A
M
 
N
W
|
W
D
 
D
T
 
R
A
 
V
Q
 
T
A
 
A
K
 
H
D
 
D
K
 
K
M
 
M
D
 
A
A
 
A
W
 
W
L
 
L
S
 
S
G
 
S
P
 
-
N
 
F
A
 
G
N
 
D
K
 
K
I
 
I
E
|
E
V
 
A
V
 
V
I
 
F
A
 
A
N
 
N
N
|
N
D
 
D
A
 
D
M
 
M
A
 
A
M
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
S
-
 
A
-
 
G
-
 
Y
H
 
F
N
 
T
K
 
G
S
 
K
S
 
Y
V
 
I
P
 
P
V
 
V
F
 
V
G
 
G
V
 
V
D
|
D
A
|
A
L
x
T
P
 
A
E
 
P
A
 
G
L
 
I
A
 
Q
L
 
A
V
 
I
K
 
K
S
 
D
G
 
G
A
 
T
L
 
L
A
 
L
G
 
G
T
 
T
V
 
V
L
 
L
N
|
N
D
 
D
A
 
A
N
 
K
N
 
N
Q
 
Q
A
 
A
K
 
K
A
 
A
T
 
T
F
 
F
D
 
N
L
 
I
A
 
A
K
 
Y
N
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
Q
G
 
G
-
 
I
K
 
T
G
 
P
A
 
T
A
 
K
D
 
D
G
 
N
T
 
I
N
 
G
W
 
Y
K
 
D
I
 
I
-
 
T
E
 
D
N
 
G
K
 
K
V
 
Y
V
 
V
R
 
W
I
 
I
P
 
P
Y
 
Y
V
 
K
G
 
K
V
 
I
D
 
T
K
 
K
D
 
D
N
 
N
L
 
I
A
 
S
E
 
D

4yo7A Crystal structure of an abc transporter solute binding protein (ipr025997) from bacillus halodurans c-125 (bh2323, target efi- 511484) with bound myo-inositol
31% identity, 92% coverage: 27:331/332 of query aligns to 9:286/287 of 4yo7A

query
sites
4yo7A
I
 
I
G
 
G
V
 
V
T
 
S
I
 
I
Y
 
S
K
 
N
Y
 
L
D
|
D
D
 
E
N
 
-
F
 
F
M
 
L
S
 
T
V
 
Y
V
 
M
R
 
Q
K
 
D
A
 
A
I
 
M
E
 
K
K
 
E
E
 
E
A
 
A
S
 
A
A
 
N
S
 
Y
S
 
P
D
 
D
V
 
F
Q
 
E
L
 
F
L
 
I
M
 
F
N
 
S
D
 
D
S
 
A
Q
 
Q
N
 
N
D
 
D
Q
 
S
S
 
T
K
 
Q
Q
 
Q
N
 
M
D
 
A
Q
 
Q
I
 
V
D
 
E
V
 
N
L
 
F
L
 
I
A
 
S
K
 
R
G
 
N
V
 
V
K
 
D
S
 
A
L
 
I
A
 
I
I
 
V
N
 
N
L
 
P
V
 
V
D
 
D
P
 
T
A
 
T
A
 
S
A
 
A
G
 
V
T
 
D
V
 
I
I
 
V
E
 
N
K
 
M
A
 
V
R
 
N
G
 
D
Q
 
A
N
 
G
I
 
I
P
 
P
I
 
I
V
 
I
F
 
I
F
 
A
N
|
N
K
x
R
E
 
-
P
 
-
S
 
-
R
 
-
K
 
-
A
 
T
L
 
F
D
 
D
S
 
G
Y
 
V
D
 
D
K
 
Q
A
 
A
Y
 
T
-
 
A
Y
 
F
V
 
V
G
 
G
T
 
S
D
 
E
S
 
S
K
 
I
E
 
Q
S
 
S
G
 
G
I
 
L
I
 
L
Q
 
Q
G
 
M
D
 
E
L
 
E
I
 
V
A
 
A
K
 
K
H
 
L
W
 
-
K
 
-
A
 
-
N
 
-
A
 
-
G
 
-
W
 
-
D
 
-
L
 
L
N
 
N
K
 
N
D
 
E
G
 
G
Q
 
N
I
 
I
Q
 
-
Y
 
-
V
 
A
L
 
I
L
 
M
K
 
D
G
 
G
E
 
E
P
 
L
G
 
G
H
 
H
P
 
E
D
 
A
A
 
Q
E
 
I
A
 
M
R
|
R
T
 
T
T
 
E
-
 
G
-
 
N
-
 
K
Y
 
Q
V
 
I
I
 
I
K
 
E
E
 
E
L
 
H
N
 
D
D
 
G
K
 
L
G
 
E
I
 
V
K
 
V
T
 
L
Q
 
Q
Q
 
-
L
 
-
Q
 
-
L
 
-
D
 
G
T
 
T
A
 
A
M
 
K
W
 
F
D
 
D
T
 
R
A
 
S
Q
 
E
A
 
G
K
 
M
D
 
R
K
 
L
M
 
M
D
 
E
A
 
N
W
 
W
L
 
L
S
 
N
G
 
-
P
 
-
N
 
S
A
 
G
N
 
T
K
 
E
I
 
I
E
 
D
V
 
A
V
 
V
I
 
V
A
 
A
N
 
N
N
|
N
D
 
D
A
 
E
M
 
M
A
 
A
M
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
I
E
 
L
A
 
A
L
 
L
K
 
E
A
 
A
H
 
V
N
 
G
K
 
K
-
x
L
S
 
D
S
 
D
V
|
V
P
 
I
V
 
V
F
 
A
G
 
G
V
 
I
D
|
D
A
 
A
L
 
T
P
 
P
E
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
E
L
 
A
V
 
M
K
 
K
S
 
E
G
 
G
A
 
K
L
 
L
A
 
D
G
 
V
T
 
T
V
 
V
L
 
F
N
x
Q
D
 
D
A
 
A
N
 
K
N
 
G
Q
 
Q
A
 
G
K
 
A
A
 
T
T
 
S
F
 
V
D
 
K
L
 
V
A
 
A
K
 
V
N
 
Q
L
 
A
A
 
A
A
 
N
G
 
G
K
 
E
G
 
D
A
 
V
A
 
E
D
 
D
G
 
A
T
 
M
N
 
-
W
 
-
K
 
-
I
 
-
E
 
-
N
 
-
K
 
-
V
 
-
V
 
-
R
 
-
I
 
I
P
 
P
Y
 
Y
V
 
E
G
 
L
V
 
V
D
 
T
K
 
P
D
 
E
N
 
N
L
 
V
A
 
E
E
 
E
I
 
Y
T
 
E
S
 
A
K
 
K

6bgcA The crystal structure of the w145a variant of tpmglb-2 (tp0684) with bound glucose (see paper)
33% identity, 60% coverage: 104:302/332 of query aligns to 1:230/364 of 6bgcA

query
sites
6bgcA
G
 
G
Q
 
R
N
 
D
I
 
K
P
 
P
I
 
L
V
 
V
F
 
F
F
 
F
N
|
N
K
x
R
E
 
Q
P
 
P
S
 
S
-
 
D
-
 
P
-
 
L
-
 
T
-
 
G
-
 
K
-
 
V
-
 
D
R
 
M
K
 
A
A
 
A
L
 
M
D
 
N
S
 
W
Y
 
N
D
 
D
K
 
K
A
 
T
Y
 
Y
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
T
 
F
D
 
D
S
 
A
K
 
K
E
 
F
S
 
G
G
 
G
I
 
S
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
D
 
K
L
 
M
I
 
I
A
 
L
K
 
D
H
 
F
W
 
L
-
 
A
K
 
S
A
 
S
N
 
E
A
 
S
G
 
S
W
 
V
D
|
D
L
 
R
N
|
N
K
 
G
D
|
D
G
 
G
Q
x
I
I
 
I
Q
 
G
Y
 
Y
V
 
V
L
 
L
L
 
C
K
 
I
G
 
G
E
 
D
P
 
V
G
 
G
H
 
H
P
 
N
D
 
D
A
 
S
E
 
K
A
 
V
R
|
R
T
 
T
T
 
E
Y
 
G
V
 
I
I
 
R
K
 
R
E
 
A
L
 
L
N
 
G
D
 
T
-
 
W
-
 
T
-
 
G
-
 
S
-
 
S
-
 
D
-
 
P
-
 
G
-
 
Q
-
 
A
-
 
K
-
 
E
-
 
G
-
 
Q
-
 
A
-
 
V
-
 
V
-
 
G
-
 
G
K
 
K
G
 
S
I
 
Y
K
 
K
T
 
V
Q
 
V
Q
 
E
L
 
L
Q
 
E
-
 
G
-
 
K
-
 
A
-
 
M
-
 
T
-
 
G
L
 
T
D
 
D
T
 
G
A
 
S
M
 
T
W
 
A
D
 
N
T
 
T
A
 
N
Q
 
S
A
 
A
K
 
T
D
 
E
K
 
S
M
 
M
D
 
G
A
 
S
W
 
W
L
 
V
S
 
A
G
 
-
P
 
K
N
 
F
A
 
A
N
 
D
K
 
K
I
 
I
E
x
D
V
 
L
V
 
V
I
 
I
A
 
S
N
 
N
N
|
N
D
 
D
A
 
G
M
 
M
A
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
C
V
 
L
E
 
Q
A
 
A
L
 
-
K
 
-
A
 
S
H
 
N
N
 
Y
K
 
P
S
 
R
S
 
G
V
 
L
P
 
P
V
 
I
F
 
F
G
 
G
V
 
Y
D
|
D
A
 
A
L
 
N
P
 
A
E
 
D
A
 
A
L
 
V
A
 
E
L
 
S
V
 
V
K
 
G
S
 
K
G
 
G
A
 
E
L
 
L
A
 
T
G
 
G
T
 
T
V
 
V
L
 
S
N
x
Q
D
 
N
A
 
V
N
 
D
N
 
A
Q
 
Q
A
 
A
K
 
V
A
 
A
T
 
V
F
 
L
D
 
Q
L
 
I
A
 
I
K
 
R
N
 
N
L
 
L
A
 
L
A
 
D
G
 
G
K
 
S
G
 
S
A
 
G
A
 
E
D
 
D

Sites not aligning to the query:

6bgdA The crystal structure of the w145a variant of tpmglb-2 (tp0684) with bound ligand (see paper)
33% identity, 60% coverage: 103:302/332 of query aligns to 4:234/373 of 6bgdA

query
sites
6bgdA
R
 
R
G
 
P
Q
 
R
N
 
D
I
 
K
P
 
P
I
 
L
V
 
V
F
 
F
F
 
F
N
 
N
K
 
R
E
 
Q
P
 
P
S
 
S
-
 
D
-
 
P
-
 
L
-
 
T
-
 
G
-
 
K
-
 
V
-
 
D
R
 
M
K
 
A
A
 
A
L
 
M
D
 
N
S
 
W
Y
 
N
D
 
D
K
 
K
A
 
T
Y
 
Y
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
T
 
F
D
 
D
S
 
A
K
 
K
E
 
F
S
 
G
G
 
G
I
 
S
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
D
 
K
L
 
M
I
 
I
A
 
L
K
 
D
H
 
F
W
 
L
-
 
A
K
 
S
A
 
S
N
 
E
A
 
S
G
 
S
W
 
V
D
|
D
L
 
R
N
|
N
K
 
G
D
|
D
G
 
G
Q
x
I
I
 
I
Q
 
G
Y
 
Y
V
 
V
L
 
L
L
 
C
K
 
I
G
 
G
E
 
D
P
 
V
G
 
G
H
 
H
P
 
N
D
 
D
A
 
S
E
 
K
A
 
V
R
 
R
T
 
T
T
 
E
Y
 
G
V
 
I
I
 
R
K
 
R
E
 
A
L
 
L
N
 
G
D
 
T
-
 
W
-
 
T
-
 
G
-
 
S
-
 
S
-
 
D
-
 
P
-
 
G
-
 
Q
-
 
A
-
 
K
-
 
E
-
 
G
-
 
Q
-
 
A
-
 
V
-
 
V
-
 
G
-
 
G
K
 
K
G
 
S
I
 
Y
K
 
K
T
 
V
Q
 
V
Q
 
E
L
 
L
Q
 
E
-
 
G
-
 
K
-
 
A
-
 
M
-
 
T
-
 
G
L
 
T
D
 
D
T
 
G
A
 
S
M
 
T
W
 
A
D
 
N
T
 
T
A
 
N
Q
 
S
A
 
A
K
 
T
D
 
E
K
 
S
M
 
M
D
 
G
A
 
S
W
 
W
L
 
V
S
 
A
G
 
-
P
 
K
N
 
F
A
 
A
N
 
D
K
 
K
I
 
I
E
x
D
V
 
L
V
 
V
I
 
I
A
 
S
N
 
N
N
 
N
D
 
D
A
 
G
M
 
M
A
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
C
V
 
L
E
 
Q
A
 
A
L
 
-
K
 
-
A
 
S
H
 
N
N
 
Y
K
 
P
S
 
R
S
 
G
V
 
L
P
 
P
V
 
I
F
 
F
G
 
G
V
 
Y
D
 
D
A
 
A
L
 
N
P
 
A
E
 
D
A
 
A
L
 
V
A
 
E
L
 
S
V
 
V
K
 
G
S
 
K
G
 
G
A
 
E
L
 
L
A
 
T
G
 
G
T
 
T
V
 
V
L
 
S
N
 
Q
D
 
N
A
 
V
N
 
D
N
 
A
Q
 
Q
A
 
A
K
 
V
A
 
A
T
 
V
F
 
L
D
 
Q
L
 
I
A
 
I
K
 
R
N
 
N
L
 
L
A
 
L
A
 
D
G
 
G
K
 
S
G
 
S
A
 
G
A
 
E
D
 
D

A0QYB5 D-threitol-binding protein from Mycolicibacterium smegmatis (strain ATCC 700084 / mc(2)155) (Mycobacterium smegmatis) (see paper)
30% identity, 82% coverage: 26:298/332 of query aligns to 36:289/349 of A0QYB5

query
sites
A0QYB5
R
 
R
I
 
I
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
V
Y
|
Y
K
 
D
Y
 
M
D
 
S
D
 
-
N
 
S
F
 
F
M
 
I
S
 
T
V
 
A
V
 
G
R
 
K
K
 
E
A
 
G
I
 
M
E
 
D
K
 
A
E
 
Y
A
 
A
S
 
K
A
 
-
S
 
D
S
 
N
D
 
N
V
 
I
Q
 
E
L
 
L
L
 
I
M
 
W
N
 
N
D
 
S
S
 
A
Q
 
N
N
 
L
D
 
D
Q
 
V
S
 
S
K
 
T
Q
 
Q
N
 
A
D
 
S
Q
 
Q
I
 
V
D
 
D
V
 
S
L
 
M
L
 
I
A
 
N
K
 
Q
G
 
G
V
 
V
K
 
D
S
 
A
L
 
I
A
 
I
I
 
V
N
 
V
L
 
P
V
 
V
D
 
Q
P
 
A
A
 
D
A
 
S
A
 
L
G
 
A
T
 
P
V
 
Q
I
 
V
E
 
A
K
 
S
A
 
A
R
 
K
G
 
A
Q
 
K
N
 
G
I
 
I
P
 
P
I
 
L
V
 
V
F
 
-
F
 
-
N
 
-
K
 
-
E
 
-
P
 
P
S
 
V
R
x
N
K
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
S
 
S
Y
 
K
D
 
D
K
 
I
A
 
A
Y
 
G
Y
 
N
V
 
V
G
 
Q
T
 
P
D
 
D
S
 
D
K
 
V
E
 
A
S
 
A
G
 
G
I
 
A
I
 
Q
Q
 
E
G
 
M
D
 
Q
L
 
M
I
 
M
A
 
A
K
 
D
H
 
R
W
 
-
K
 
-
A
 
-
N
 
-
A
 
-
G
 
-
W
 
-
D
 
-
L
 
L
N
 
G
K
 
G
D
 
K
G
 
G
Q
 
N
I
 
I
Q
 
-
Y
 
-
V
 
V
L
 
I
L
 
L
K
 
Q
G
 
G
E
 
P
P
 
L
G
 
G
H
 
Q
P
 
-
D
 
S
A
 
G
E
 
E
A
 
L
R
 
D
T
x
R
T
 
S
Y
 
K
V
 
G
I
 
I
K
 
E
E
 
Q
L
 
V
N
 
L
D
 
A
K
 
K
G
 
Y
I
 
P
K
 
D
T
 
I
Q
 
K
Q
 
V
L
 
L
Q
 
A
L
 
K
D
 
D
T
 
T
A
 
A
M
 
N
W
 
W
D
 
K
T
 
R
A
 
D
Q
 
E
A
 
A
K
 
V
D
 
N
K
 
K
M
 
M
D
 
K
A
 
N
W
 
W
L
 
I
S
 
S
G
 
G
P
 
-
N
 
F
A
 
G
N
 
P
K
 
Q
I
 
I
E
 
D
V
 
G
V
 
V
I
 
V
A
 
A
N
 
Q
N
|
N
D
 
D
A
 
D
M
 
M
A
 
G
M
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
L
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
E
H
 
S
N
 
G
K
 
R
S
 
T
S
 
G
V
 
V
P
 
P
V
 
I
F
 
V
G
 
G
V
 
I
D
|
D
A
 
G
L
 
I
P
 
E
E
 
D
A
 
G
L
 
L
A
 
N
L
 
A
V
 
V
K
 
K
S
 
S
G
 
G
A
 
D
L
 
F
A
 
I
G
 
G
T
 
T
V
 
S
L
 
L
N
x
Q
D
 
N
A
 
G
N
 
T
N
 
V
Q
 
E
A
 
L
K
 
A
A
 
A
T
 
G
F
 
L
D
 
A
L
 
V
A
 
A
K
 
N
N
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
K
G
 
G
K
 
E

4rsmA Crystal structure of carbohydrate transporter msmeg_3599 from mycobacterium smegmatis str. Mc2 155, target efi-510970, in complex with d-threitol (see paper)
30% identity, 82% coverage: 26:298/332 of query aligns to 4:257/315 of 4rsmA

query
sites
4rsmA
R
 
R
I
 
I
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
V
Y
|
Y
K
 
D
Y
 
M
D
 
S
D
 
-
N
 
S
F
 
F
M
 
I
S
 
T
V
 
A
V
 
G
R
 
K
K
 
E
A
 
G
I
 
M
E
 
D
K
 
A
E
 
Y
A
 
A
S
 
K
A
 
-
S
 
D
S
 
N
D
 
N
V
 
I
Q
 
E
L
 
L
L
 
I
M
 
W
N
 
N
D
 
S
S
 
A
Q
 
N
N
 
L
D
 
D
Q
 
V
S
 
S
K
 
T
Q
 
Q
N
 
A
D
 
S
Q
 
Q
I
 
V
D
 
D
V
 
S
L
 
M
L
 
I
A
 
N
K
 
Q
G
 
G
V
 
V
K
 
D
S
 
A
L
 
I
A
 
I
I
 
V
N
 
V
L
 
P
V
 
V
D
 
Q
P
 
A
A
 
D
A
 
S
A
 
L
G
 
A
T
 
P
V
 
Q
I
 
V
E
 
A
K
 
S
A
 
A
R
 
K
G
 
A
Q
 
K
N
 
G
I
 
I
P
 
P
I
 
L
V
 
V
F
 
-
F
 
-
N
 
-
K
 
-
E
 
-
P
 
P
S
 
V
R
x
N
K
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
S
 
S
Y
 
K
D
 
D
K
 
I
A
 
A
Y
 
G
Y
 
N
V
 
V
G
 
Q
T
 
P
D
 
D
S
 
D
K
 
V
E
 
A
S
 
A
G
 
G
I
 
A
I
 
Q
Q
 
E
G
 
M
D
 
Q
L
 
M
I
 
M
A
 
A
K
 
D
H
 
R
W
 
-
K
 
-
A
 
-
N
 
-
A
 
-
G
 
-
W
 
-
D
 
-
L
 
L
N
 
G
K
 
G
D
 
K
G
 
G
Q
 
N
I
 
I
Q
 
-
Y
 
-
V
 
V
L
 
I
L
 
L
K
 
Q
G
 
G
E
 
P
P
 
L
G
 
G
H
 
Q
P
 
-
D
 
S
A
 
G
E