SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_007705058.1 NCBI__GCF_001277175.1:WP_007705058.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 1 hits to proteins with known functional sites (download)

P69831 PTS system galactitol-specific EIIC component; EIIC-Gat; Galactitol permease IIC component from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
86% identity, 99% coverage: 1:451/457 of query aligns to 1:451/451 of P69831

query
sites
P69831
M
|
M
F
 
F
S
 
S
E
 
E
I
 
V
M
 
M
R
 
R
Y
 
Y
I
 
I
L
 
L
D
 
D
L
 
L
G
 
G
P
 
P
T
 
T
V
 
V
M
 
M
L
 
L
P
 
P
V
 
I
V
 
V
I
 
I
I
 
I
I
 
I
F
 
F
S
 
S
K
 
K
L
 
I
L
 
L
G
 
G
M
 
M
K
 
K
A
 
A
G
 
G
E
 
D
C
 
C
F
 
F
R
 
K
S
 
A
G
 
G
L
 
L
H
 
H
I
 
I
G
 
G
I
 
I
G
 
G
F
 
F
V
 
V
G
 
G
I
 
I
G
 
G
L
 
L
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
L
M
 
M
L
 
L
D
 
D
S
 
S
I
 
I
G
 
G
P
 
P
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
M
 
M
A
 
A
E
 
E
H
 
N
F
 
F
E
 
D
I
 
L
N
 
N
L
 
L
H
 
H
V
 
V
V
 
V
D
 
D
V
 
V
G
 
G
W
 
W
P
 
P
G
 
G
S
 
S
S
 
S
P
 
P
M
 
M
T
 
T
W
 
W
A
 
A
S
 
S
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
A
I
 
I
P
 
P
I
 
I
A
 
A
I
 
I
V
 
L
V
 
V
N
 
N
I
 
V
A
 
A
M
 
M
L
 
L
L
 
L
T
 
T
R
 
R
M
 
M
T
 
T
R
 
R
V
 
V
V
 
V
N
 
N
V
 
V
D
 
D
I
 
I
W
 
W
N
 
N
I
 
I
W
 
W
H
 
H
M
 
M
T
 
T
F
 
F
T
 
T
G
 
G
A
 
A
M
 
L
L
 
L
H
 
H
L
 
L
A
 
A
T
 
T
G
 
G
S
 
S
Y
 
W
W
 
M
I
 
I
G
 
G
I
 
M
L
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
V
A
 
I
H
 
H
A
 
A
A
 
A
F
 
F
V
 
V
Y
 
Y
K
 
K
L
 
L
G
 
G
D
 
D
W
 
W
F
 
F
A
 
A
K
 
R
D
 
D
T
 
T
R
 
R
D
 
N
Y
 
F
F
 
F
G
 
E
L
 
L
E
 
E
G
 
G
M
 
I
A
 
A
I
 
I
P
 
P
H
 
H
G
 
G
T
 
T
S
 
S
A
 
A
Y
 
Y
L
 
M
G
 
G
P
 
P
I
 
I
A
 
A
V
 
V
L
 
L
V
 
V
D
 
D
T
 
A
L
 
I
I
 
I
D
 
E
K
 
K
I
 
I
P
 
P
G
 
G
L
 
V
N
 
N
R
 
R
I
 
I
H
 
K
F
 
F
S
 
S
A
 
A
D
 
D
D
 
D
V
 
I
Q
 
Q
K
 
R
R
 
K
F
 
F
G
 
G
P
 
P
F
 
F
G
 
G
E
 
E
P
 
P
V
 
V
T
 
T
V
 
V
G
 
G
F
 
F
V
 
V
M
 
M
G
 
G
L
 
L
V
 
I
I
 
I
G
 
G
L
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
V
 
V
K
 
K
G
 
G
V
 
V
L
 
L
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
K
T
 
T
A
 
A
A
 
A
V
 
V
M
 
M
L
 
L
L
 
L
M
 
M
P
 
P
R
 
R
V
 
V
I
 
I
K
 
K
P
 
P
I
 
I
M
 
M
D
 
D
G
 
G
L
 
L
T
 
T
P
 
P
I
 
I
A
 
A
K
 
K
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
K
 
S
R
 
R
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
K
 
K
F
 
F
G
 
G
S
 
G
Q
 
Q
E
 
E
F
 
F
L
 
L
I
 
I
G
 
G
L
 
L
D
 
D
P
 
P
A
 
A
L
 
L
L
 
L
L
 
L
G
 
G
H
 
H
T
 
T
S
 
A
V
 
V
V
 
V
S
 
S
A
 
A
S
 
S
L
 
L
I
 
I
F
 
F
I
 
I
P
 
P
L
 
L
T
 
T
I
 
I
L
 
L
I
 
I
A
 
A
V
 
V
V
 
C
V
 
V
P
 
P
G
 
G
N
 
N
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
P
 
P
F
 
F
G
 
G
D
 
D
L
 
L
A
 
A
T
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
F
 
F
V
 
V
A
 
A
M
 
M
A
 
A
V
 
V
A
 
A
V
 
V
H
 
H
Q
 
R
G
 
G
N
 
N
L
 
L
F
 
F
R
 
R
T
 
T
L
 
L
I
 
I
S
 
S
G
 
G
V
 
V
I
 
I
I
 
I
M
 
M
S
 
S
M
 
I
T
 
T
L
 
L
W
 
W
I
 
I
A
 
A
T
 
T
Q
 
Q
T
 
T
I
 
I
G
 
G
L
 
L
H
 
H
T
 
T
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
A
 
A
N
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
A
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
V
 
V
A
 
A
S
 
S
M
 
M
D
 
D
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
S
 
S
P
 
P
V
 
I
T
 
T
W
 
W
L
 
L
L
 
L
I
 
I
Q
 
Q
L
 
V
C
 
F
T
 
S
W
 
P
Q
 
Q
N
 
N
V
 
I
A
 
P
G
 
G
F
 
F
V
 
I
V
 
I
I
 
I
G
 
G
V
 
A
I
 
I
Y
 
Y
L
 
L
A
 
T
G
 
G
V
 
I
L
 
F
L
 
M
T
 
T
W
 
W
R
 
R
R
 
R
A
 
A
R
 
R
A
 
G
F
 
F
V
 
I
A
 
K
V
 
Q
E
 
E
K
 
K
A
 
V
A
 
V
A
 
L
R
 
A
E
 
E

Query Sequence

>WP_007705058.1 NCBI__GCF_001277175.1:WP_007705058.1
MFSEIMRYILDLGPTVMLPVVIIIFSKLLGMKAGECFRSGLHIGIGFVGIGLVIGLMLDS
IGPAAKAMAEHFEINLHVVDVGWPGSSPMTWASQIALVAIPIAIVVNIAMLLTRMTRVVN
VDIWNIWHMTFTGAMLHLATGSYWIGILGVAAHAAFVYKLGDWFAKDTRDYFGLEGMAIP
HGTSAYLGPIAVLVDTLIDKIPGLNRIHFSADDVQKRFGPFGEPVTVGFVMGLVIGLLAG
YDVKGVLQLAVKTAAVMLLMPRVIKPIMDGLTPIAKQARKRLQAKFGSQEFLIGLDPALL
LGHTSVVSASLIFIPLTILIAVVVPGNQVLPFGDLATIGFFVAMAVAVHQGNLFRTLISG
VIIMSMTLWIATQTIGLHTQLAANAGALKAGGQVASMDQGGSPVTWLLIQLCTWQNVAGF
VVIGVIYLAGVLLTWRRARAFVAVEKAAAREAGTTVS

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory