SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_008197806.1 NCBI__GCF_000166275.1:WP_008197806.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2z1qB Crystal structure of acyl coa dehydrogenase
46% identity, 99% coverage: 6:594/594 of query aligns to 6:547/549 of 2z1qB

query
sites
2z1qB
K
 
K
G
 
G
G
 
G
E
 
G
F
 
W
L
 
L
I
 
L
K
 
E
E
 
-
T
 
-
L
 
V
A
 
P
Q
 
E
D
 
R
V
 
V
F
 
Y
I
 
T
P
 
P
E
 
E
Q
 
D
Y
 
F
T
 
D
E
 
E
E
 
S
Q
 
V
K
 
K
M
 
E
M
 
I
A
 
A
Q
 
R
A
 
T
C
 
T
Q
 
R
D
 
T
F
 
F
I
 
V
D
 
E
T
 
R
E
 
E
I
 
V
T
 
L
P
 
P
K
 
L
I
 
L
E
 
E
E
 
R
I
 
M
D
 
E
S
 
H
M
 
G
K
 
E
N
 
L
P
 
E
D
 
L
L
 
N
V
 
V
P
 
P
S
 
-
I
 
L
F
 
M
K
 
R
K
 
K
A
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
A
I
 
I
S
 
D
V
 
V
P
 
P
E
 
E
E
 
E
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
M
 
L
G
 
D
M
 
L
N
 
P
F
 
K
V
 
V
T
 
I
S
 
S
M
 
T
L
 
V
I
 
V
A
 
A
D
 
E
I
 
E
I
 
L
G
 
S
S
 
G
A
 
S
G
 
G
S
 
G
F
 
F
S
 
S
T
 
V
T
 
T
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
H
 
H
T
 
T
G
 
S
I
 
I
G
 
G
T
 
T
L
 
L
P
 
P
I
 
L
L
 
V
Y
 
Y
Y
 
F
G
 
G
S
 
T
E
 
E
E
 
E
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
R
K
 
K
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
K
 
K
L
 
L
A
 
A
T
 
S
G
 
G
E
 
E
W
 
W
A
 
I
A
 
A
C
 
A
Y
|
Y
C
 
C
L
|
L
T
|
T
E
 
E
P
 
P
D
 
G
A
 
S
G
|
G
S
|
S
D
 
D
A
 
A
N
 
L
S
 
A
G
 
A
K
 
K
T
 
T
K
 
R
A
 
A
T
 
T
L
 
L
T
 
S
E
 
E
D
 
D
G
 
G
K
 
K
H
 
H
Y
 
Y
L
 
I
I
 
L
N
 
N
G
 
G
Q
 
V
K
 
K
M
 
Q
W
|
W
I
 
I
S
|
S
N
 
N
A
 
A
G
 
G
F
 
F
A
 
A
D
 
H
L
 
L
F
 
F
I
 
T
V
 
V
F
 
F
A
 
A
K
 
K
I
 
V
E
 
D
E
 
-
D
 
G
K
 
E
N
 
H
L
 
F
T
 
T
A
 
A
F
 
F
I
 
L
V
 
V
E
 
E
K
 
R
S
 
D
F
 
T
G
 
P
G
 
G
I
 
L
T
 
S
M
 
F
N
 
G
E
 
P
E
 
E
E
 
E
K
 
K
K
 
K
M
 
M
G
 
G
I
 
I
K
 
K
G
 
A
S
 
S
S
 
S
T
 
T
R
 
R
Q
 
Q
V
 
V
F
 
I
F
 
L
N
 
E
D
 
D
C
 
V
K
 
K
V
 
V
P
 
P
V
 
V
E
 
E
N
 
N
M
 
V
L
 
L
S
 
G
D
 
E
R
 
I
Q
 
G
N
 
K
G
 
G
F
 
H
K
 
K
I
 
I
A
 
A
V
 
F
N
 
N
I
 
V
L
 
L
N
 
N
I
 
V
G
|
G
R
 
R
I
 
Y
K
 
K
L
 
L
G
 
G
S
 
A
G
 
G
I
 
A
L
 
V
G
 
G
G
 
G
V
 
A
R
 
K
T
 
R
V
 
A
T
 
L
T
 
E
K
 
L
A
 
S
I
 
A
N
 
Q
Y
 
Y
S
 
A
T
 
T
E
 
Q
R
|
R
K
 
V
Q
 
Q
F
|
F
G
 
G
V
 
R
S
 
P
I
|
I
N
 
G
S
 
R
F
|
F
G
 
G
A
 
L
V
x
I
K
 
Q
S
 
Q
M
 
K
L
 
L
A
 
G
E
 
E
M
 
M
A
 
A
I
 
S
R
 
R
T
 
I
Y
 
Y
V
 
A
S
 
A
E
 
E
S
 
S
L
 
A
C
 
V
Y
 
Y
R
 
R
A
 
T
G
 
V
Q
 
G
D
 
L
I
 
I
E
 
D
D
 
E
Q
 
A
I
 
L
N
 
L
E
 
-
F
 
-
I
 
-
T
 
-
D
 
-
G
 
G
M
 
K
P
 
K
E
 
G
N
 
P
E
 
E
A
 
A
K
 
V
L
 
M
K
 
A
G
 
G
V
 
I
E
 
E
M
 
E
F
 
Y
A
 
A
M
 
V
E
 
E
C
 
A
A
 
S
I
 
I
A
 
I
K
 
K
I
 
V
H
 
L
G
 
G
S
 
S
E
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
V
 
V
D
 
D
Q
 
E
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
I
 
I
Y
x
H
G
|
G
G
 
G
M
 
Y
G
 
G
Y
 
Y
S
 
S
A
 
Q
E
 
E
A
 
Y
P
 
P
M
 
I
E
 
E
R
 
R
A
 
A
Y
 
Y
R
 
R
D
 
D
A
 
A
R
 
R
I
 
I
A
 
N
R
 
R
I
 
I
Y
x
F
E
|
E
G
 
G
T
 
T
N
 
N
E
 
E
I
|
I
N
 
N
R
 
R
M
 
L
L
 
L
M
 
I
I
 
P
G
|
G
M
 
M
L
 
L
L
 
L
K
 
R
R
 
R
A
 
A
M
 
E
K
 
P
G
 
E
E
 
D
V
 
L
N
 
E
L
 
L
F
 
H
E
 
Q
P
 
-
A
 
-
M
 
-
A
 
-
V
 
-
S
 
-
A
 
-
E
 
-
L
 
-
T
 
-
S
 
-
V
 
-
P
 
-
S
 
-
F
 
-
E
 
-
S
 
-
I
 
-
D
 
-
T
 
-
S
 
-
E
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
-
E
 
-
V
 
-
L
 
V
K
 
Q
K
 
N
L
 
L
K
 
K
K
 
K
V
 
L
F
 
A
L
 
L
M
 
M
V
 
V
G
 
A
G
 
G
K
 
L
A
 
A
A
 
V
M
 
Q
A
 
K
L
 
Y
Q
 
G
E
 
Q
K
 
G
I
 
V
E
 
E
D
 
E
E
 
E
Q
|
Q
E
 
E
I
 
V
M
 
L
M
 
G
N
 
A
L
 
V
A
 
A
D
 
D
V
 
I
M
 
L
I
 
I
E
 
D
I
 
A
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
E
 
E
S
 
S
A
 
A
I
 
L
L
 
L
R
 
R
T
 
A
E
 
R
K
 
R
L
 
L
V
 
G
S
 
G
L
 
L
K
 
A
S
 
P
E
 
-
A
 
-
E
 
-
C
 
-
S
 
-
H
 
-
Q
 
-
I
 
-
A
 
V
M
 
L
S
 
A
Q
 
R
V
 
I
Y
 
Y
L
 
L
S
 
A
E
 
Q
A
 
A
I
 
L
D
 
D
K
 
R
I
 
A
Q
 
Q
S
 
A
A
 
G
A
 
A
K
 
L
E
 
S
A
 
V
I
 
L
A
 
P
S
 
R
F
 
L
T
 
V
K
 
E
G
 
G
D
 
D
E
 
E
Q
 
A
K
 
R
V
 
V
M
 
V
L
 
Y
M
 
S
G
 
A
L
 
A
K
 
R
R
 
R
F
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
R
D
 
E
L
 
P
V
 
G
N
 
D
T
 
L
K
 
V
K
 
A
L
 
L
R
 
R
R
 
R
Q
 
Q
I
 
A
A
 
A
D
 
E
Y
 
A
M
 
V
I
 
L
D
 
E
Q
 
A
G
 
G
K
 
G
Y
 
Y
P
 
P
F
 
I

3owaC Crystal structure of acyl-coa dehydrogenase complexed with fad from bacillus anthracis
44% identity, 99% coverage: 5:592/594 of query aligns to 2:585/587 of 3owaC

query
sites
3owaC
I
 
V
K
 
K
G
 
G
G
 
G
E
 
S
F
 
F
L
 
L
I
 
V
K
 
D
E
 
E
T
 
I
L
 
T
A
 
I
Q
 
D
D
 
Q
V
 
V
F
 
F
I
 
T
P
 
P
E
 
E
Q
 
D
Y
 
F
T
 
S
E
 
S
E
 
E
Q
 
H
K
 
K
M
 
M
M
 
I
A
 
A
Q
 
K
A
 
T
C
 
T
Q
 
E
D
 
D
F
 
F
I
 
I
D
 
V
T
 
N
E
 
E
I
 
V
T
 
L
P
 
P
K
 
E
I
 
L
E
 
E
E
 
Y
I
 
L
D
 
E
S
 
Q
M
 
H
K
 
E
N
 
F
P
 
-
D
 
D
L
 
R
V
 
S
P
 
V
S
 
R
I
 
L
F
 
L
K
 
K
K
 
E
A
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
A
S
 
D
V
 
V
P
 
P
E
 
E
E
 
E
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
M
 
I
G
 
G
M
 
L
N
 
D
F
 
K
V
 
V
T
 
S
S
 
S
M
 
A
L
 
L
I
 
I
A
 
A
D
 
E
I
 
K
I
 
F
G
 
S
S
 
R
A
 
A
G
 
G
S
 
G
F
 
F
S
 
A
T
 
I
T
 
T
Y
 
H
G
 
G
A
 
A
H
 
H
T
 
V
G
 
G
I
 
I
G
 
G
T
 
S
L
 
L
P
 
P
I
 
I
L
 
V
Y
 
L
Y
 
F
G
 
G
S
 
N
E
 
E
E
 
E
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
K
K
 
K
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
K
 
L
L
 
L
A
 
A
T
 
T
G
 
G
E
 
E
W
 
K
A
 
L
A
 
A
C
 
A
Y
|
Y
C
 
A
L
|
L
T
|
T
E
 
E
P
 
P
D
 
G
A
 
S
G
|
G
S
|
S
D
 
D
A
 
A
N
 
L
S
 
G
G
 
A
K
 
K
T
 
T
K
 
T
A
 
A
T
 
R
L
 
L
T
 
N
E
 
A
D
 
E
G
 
G
K
 
T
H
 
H
Y
 
Y
L
 
V
I
 
L
N
 
N
G
 
G
Q
 
E
K
 
K
M
 
Q
W
|
W
I
|
I
S
x
T
N
 
N
A
 
S
G
 
A
F
 
F
A
 
A
D
 
D
L
 
V
F
 
F
I
 
I
V
 
V
F
 
Y
A
 
A
K
 
K
I
 
I
E
 
D
E
 
-
D
 
G
K
 
E
N
 
H
L
 
F
T
 
S
A
 
A
F
 
F
I
 
I
V
 
V
E
 
E
K
 
K
S
 
D
F
 
Y
G
 
A
G
 
G
I
 
V
T
 
S
M
 
T
N
 
S
E
 
P
E
 
E
E
 
E
K
 
K
K
 
K
M
 
M
G
 
G
I
 
I
K
 
K
G
 
C
S
 
S
S
 
S
T
 
T
R
 
R
Q
 
T
V
 
L
F
 
I
F
 
L
N
 
E
D
 
D
C
 
A
K
 
L
V
 
V
P
 
P
V
 
K
E
 
E
N
 
N
M
 
L
L
 
L
S
 
G
D
 
E
R
 
I
Q
 
G
N
 
K
G
 
G
F
 
H
K
 
I
I
 
I
A
 
A
V
 
F
N
 
N
I
 
I
L
 
L
N
 
N
I
 
I
G
|
G
R
 
R
I
 
Y
K
 
K
L
 
L
G
 
G
S
 
V
G
 
G
I
 
T
L
 
V
G
 
G
G
 
S
V
 
A
R
 
K
T
 
R
V
 
A
T
 
V
T
 
E
K
 
I
A
 
S
I
 
A
N
 
Q
Y
 
Y
S
 
A
T
 
N
E
 
Q
R
|
R
K
 
Q
Q
 
Q
F
|
F
G
 
K
V
 
Q
S
 
P
I
|
I
N
 
A
S
 
R
F
|
F
G
 
P
A
 
L
V
 
I
K
 
Q
S
 
E
M
 
K
L
 
L
A
 
A
E
 
N
M
 
M
A
 
A
I
 
A
R
 
K
T
 
T
Y
 
Y
V
 
A
S
 
A
E
 
E
S
 
S
L
 
S
C
 
V
Y
 
Y
R
 
R
A
 
T
G
 
V
Q
 
G
D
 
L
I
 
F
E
 
E
D
 
S
Q
 
R
I
 
M
N
 
S
E
 
T
F
 
L
I
 
S
T
 
E
D
 
E
G
 
E
M
 
V
P
 
K
E
 
D
N
 
G
E
 
K
A
 
A
K
 
V
L
 
A
K
 
A
G
 
S
V
 
I
E
 
A
M
 
E
F
 
Y
A
 
A
M
 
I
E
 
E
C
 
C
A
 
S
I
 
L
A
 
N
K
 
K
I
 
V
H
 
F
G
 
G
S
 
S
E
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
V
 
T
V
 
V
D
 
D
Q
 
E
G
 
G
V
 
V
Q
|
Q
I
|
I
Y
 
H
G
 
G
G
|
G
M
 
Y
G
 
G
Y
 
F
S
 
M
A
 
A
E
 
E
A
 
Y
P
 
E
M
 
I
E
 
E
R
 
R
A
 
M
Y
 
Y
R
 
R
D
 
D
A
 
S
R
 
R
I
|
I
A
 
N
R
 
R
I
 
I
Y
x
F
E
|
E
G
 
G
T
|
T
N
 
N
E
|
E
I
|
I
N
 
N
R
 
R
M
x
L
L
 
I
M
 
V
I
 
P
G
|
G
M
 
T
L
 
F
L
 
L
K
 
R
R
 
K
A
 
A
M
 
M
K
 
K
G
 
G
E
 
E
V
 
L
N
 
P
L
 
L
F
 
L
E
 
Q
P
 
K
A
 
A
M
 
Q
A
 
K
V
 
L
S
 
Q
A
 
E
E
 
E
L
 
L
T
 
M
S
 
M
V
 
M
P
 
M
S
 
P
F
 
E
E
 
E
S
 
V
I
 
G
D
 
D
T
 
-
S
 
-
E
 
E
L
 
P
F
 
L
A
 
A
A
 
L
E
 
Q
K
 
K
E
 
Y
V
 
L
L
 
V
K
 
N
K
 
N
L
 
A
K
 
K
K
 
K
V
 
I
F
 
G
L
 
L
M
 
M
V
 
V
G
 
A
G
 
G
K
 
L
A
 
A
A
 
A
M
 
Q
A
 
K
L
 
Y
Q
 
G
E
 
K
K
 
A
I
 
L
E
 
D
D
 
K
E
 
E
Q
|
Q
E
 
E
I
 
I
M
 
L
M
 
V
N
 
N
L
 
I
A
 
A
D
 
D
V
 
I
M
 
V
I
 
S
E
 
N
I
 
L
Y
 
Y
A
 
A
A
 
M
E
 
E
S
 
S
A
 
A
I
 
V
L
 
L
R
 
R
T
 
T
E
 
E
K
 
K
L
 
A
V
 
I
S
 
K
L
 
T
K
 
T
S
 
G
E
 
L
A
 
E
E
 
K
C
 
N
S
 
K
H
 
Q
Q
 
K
I
 
V
A
 
L
M
 
Y
S
 
T
Q
 
E
V
 
V
Y
 
F
L
 
C
S
 
Q
E
 
E
A
 
A
I
 
F
D
 
N
K
 
E
I
 
I
Q
 
E
S
 
A
A
 
H
A
 
A
K
 
K
E
 
E
A
 
T
I
 
L
A
 
I
S
 
A
F
 
V
T
 
E
K
 
N
G
 
G
D
 
D
E
 
M
Q
 
L
K
 
R
V
 
M
M
 
M
L
 
L
M
 
S
G
 
S
L
 
L
K
 
R
R
 
K
F
 
L
T
 
T
K
 
R
A
 
H
D
 
T
L
 
P
V
 
L
N
 
N
T
 
V
K
 
I
K
 
P
L
 
K
R
 
K
R
 
R
Q
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
A
Y
 
K
M
 
I
I
 
L
D
 
E
Q
 
D
G
 
E
K
 
R
Y
 
Y

8pheA Acad9-wt in complex with ecsit-cter (see paper)
38% identity, 82% coverage: 50:536/594 of query aligns to 43:505/551 of 8pheA

query
sites
8pheA
E
 
E
E
 
E
I
 
V
D
 
D
S
 
S
M
 
R
K
 
K
N
 
I
-
 
D
-
 
Q
-
 
E
-
 
G
-
 
K
-
 
I
P
 
P
D
 
D
L
 
-
V
 
-
P
 
-
S
 
E
I
 
T
F
 
L
K
 
E
K
 
K
A
 
L
G
 
K
E
 
S
L
 
L
G
 
G
L
 
L
L
 
F
G
 
G
I
 
L
S
 
Q
V
 
V
P
 
P
E
 
E
E
 
E
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
M
 
L
G
 
G
M
 
F
N
 
S
F
 
N
V
 
T
T
 
M
S
 
Y
M
 
S
L
 
R
I
 
L
A
 
G
D
 
E
I
 
I
I
 
I
G
 
S
S
 
M
A
 
D
G
 
G
S
 
S
F
 
I
S
 
T
T
 
V
T
 
T
Y
 
L
G
 
A
A
 
A
H
 
H
T
 
Q
G
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
L
L
 
K
P
 
G
I
 
I
L
 
I
Y
 
L
Y
 
A
G
 
G
S
 
T
E
 
E
E
 
E
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
A
K
 
K
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
K
 
K
L
 
L
A
 
A
T
 
S
G
 
G
E
 
E
W
 
H
A
 
I
A
 
A
C
 
A
Y
 
F
C
 
C
L
|
L
T
 
T
E
 
E
P
 
P
D
 
A
A
 
S
G
 
G
S
 
S
D
|
D
A
 
A
N
x
A
S
|
S
G
x
I
K
 
R
T
 
S
K
 
R
A
 
A
T
 
T
L
 
L
T
 
S
E
 
E
D
 
D
G
 
K
K
 
K
H
 
H
Y
 
Y
L
 
I
I
 
L
N
 
N
G
 
G
Q
 
S
K
 
K
M
 
V
W
 
W
I
 
I
S
 
T
N
 
N
A
 
G
G
 
G
F
 
L
A
 
A
D
 
N
L
 
I
F
 
F
I
 
T
V
 
V
F
 
F
A
 
A
K
 
K
I
 
T
E
 
E
-
 
V
-
 
V
-
 
D
-
 
S
-
 
D
-
 
G
-
 
S
-
 
V
E
x
K
D
 
D
K
 
K
N
 
-
L
x
I
T
 
T
A
 
A
F
 
F
I
 
I
V
 
V
E
 
E
K
 
R
S
 
D
F
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
V
T
 
T
M
 
N
N
 
G
E
 
K
E
 
P
E
 
E
K
 
D
K
 
K
M
 
L
G
 
G
I
 
I
K
 
R
G
 
G
S
 
S
S
 
N
T
 
T
R
 
C
Q
 
E
V
 
V
F
 
H
F
 
F
N
 
E
D
 
N
C
 
T
K
 
K
V
 
I
P
 
P
V
 
V
E
 
E
N
 
N
M
 
I
L
 
L
S
 
G
D
 
E
R
 
V
Q
 
G
N
 
D
G
 
G
F
|
F
K
 
K
I
 
V
A
 
A
V
x
M
N
 
N
I
 
I
L
 
L
N
 
N
I
 
S
G
 
G
R
 
R
I
 
F
K
 
S
L
 
M
G
 
G
S
 
S
G
 
V
I
 
V
L
 
A
G
 
G
G
 
L
V
 
L
R
 
K
T
 
R
V
 
L
T
 
I
T
 
E
K
 
M
A
 
T
I
 
A
N
 
E
Y
 
Y
S
 
A
T
 
C
E
 
T
R
 
R
K
 
K
Q
 
Q
F
|
F
G
x
N
V
 
K
S
 
R
I
 
L
N
 
S
S
 
E
F
 
F
G
 
G
A
 
L
V
 
I
K
 
Q
S
 
E
M
 
K
L
 
F
A
 
A
E
 
L
M
 
M
A
 
A
I
 
Q
R
 
K
T
 
A
Y
 
Y
V
 
V
S
 
M
E
 
E
S
 
S
L
 
M
C
 
T
Y
 
Y
R
 
-
A
 
-
G
 
-
Q
 
-
D
 
-
I
 
-
E
 
-
D
 
-
Q
 
-
I
 
-
N
 
-
E
 
-
F
 
-
I
 
L
T
 
T
D
 
A
G
 
G
M
 
M
P
 
L
E
 
D
N
 
Q
E
 
-
A
 
-
K
 
-
L
 
-
K
 
P
G
 
G
V
 
F
E
 
P
M
 
D
F
 
C
A
 
S
M
 
I
E
 
E
C
 
A
A
 
A
I
 
M
A
 
V
K
 
K
I
 
V
H
 
F
G
 
S
S
 
S
E
 
E
V
 
A
L
 
A
D
 
W
Y
 
Q
V
 
C
V
 
V
D
 
S
Q
 
E
G
 
A
V
 
L
Q
 
Q
I
 
I
Y
 
L
G
 
G
G
 
G
M
 
L
G
 
G
Y
 
Y
S
 
T
A
 
R
E
 
D
A
 
Y
P
 
P
M
 
Y
E
 
E
R
 
R
A
 
I
Y
 
L
R
 
R
D
 
D
A
 
T
R
 
R
I
 
I
A
 
L
R
 
L
I
 
I
Y
 
F
E
 
E
G
 
G
T
 
T
N
 
N
E
 
E
I
|
I
N
 
L
R
 
R
M
 
M
L
x
Y
-
 
I
-
 
A
M
x
L
I
 
T
G
 
G
M
 
L
-
x
Q
-
 
H
-
 
A
-
 
G
-
 
R
-
 
I
L
 
L
L
 
T
K
 
T
R
 
R
A
 
I
M
 
H
K
 
H
G
 
G
E
 
V
V
 
V
N
 
H
L
 
-
F
 
-
E
 
-
P
 
P
A
 
S
M
 
L
A
 
A
V
 
D
S
 
S
A
 
A
E
 
N
L
 
-
T
 
-
S
 
-
V
 
-
P
 
-
S
 
K
F
 
F
E
 
E
S
 
-
I
 
-
D
 
E
T
 
N
S
 
T
E
 
Y
L
 
C
F
 
F
A
 
G
A
 
R
E
 
T
K
 
V
E
 
E
V
 
T
L
 
L
K
 
-
K
 
-
L
 
-
K
 
-
K
 
-
V
 
-
F
 
-
L
 
L
M
 
L
V
 
R
G
 
F
G
 
G
K
|
K
A
 
T
A
 
I
M
|
M
A
 
-
L
 
-
Q
 
-
E
 
-
K
 
-
I
 
-
E
 
-
D
 
E
E
 
E
Q
 
Q
E
 
L
I
 
V
M
 
L
M
 
K
N
 
R
L
 
V
A
 
A
D
 
N
V
 
I
M
 
L
I
 
I
E
 
N
I
 
L
Y
 
Y
A
 
G
A
 
M
E
 
T
S
 
A
A
 
V
I
 
L
L
 
S
R
 
R
T
 
A
E
 
S
K
 
R
L
 
S
V
 
I
S
 
R
L
 
I
K
 
G
S
 
L
E
 
R
A
 
N
E
 
H
C
 
-
S
 
D
H
 
H
Q
 
E
I
 
V
A
 
L
M
 
L
S
 
A
Q
 
N
V
 
T
Y
 
F
L
 
C
S
 
V
E
 
E
A
 
A

8phfA Cryo-em structure of human acad9-s191a (see paper)
37% identity, 82% coverage: 50:536/594 of query aligns to 43:501/547 of 8phfA

query
sites
8phfA
E
 
E
E
 
E
I
 
V
D
 
D
S
 
S
M
 
R
K
 
K
N
 
I
-
 
D
-
 
Q
-
 
E
-
 
G
-
 
K
-
 
I
P
 
P
D
 
D
L
 
-
V
 
-
P
 
-
S
 
E
I
 
T
F
 
L
K
 
E
K
 
K
A
 
L
G
 
K
E
 
S
L
 
L
G
 
G
L
 
L
L
 
F
G
 
G
I
 
L
S
 
Q
V
 
V
P
 
P
E
 
E
E
 
E
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
M
 
L
G
 
G
M
 
F
N
 
S
F
 
N
V
 
T
T
 
M
S
 
Y
M
 
S
L
 
R
I
 
L
A
 
G
D
 
E
I
 
I
I
 
I
G
 
S
S
 
M
A
 
D
G
 
G
S
 
S
F
 
I
S
 
T
T
 
V
T
 
T
Y
 
L
G
 
A
A
 
A
H
 
H
T
 
Q
G
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
L
L
 
K
P
 
G
I
 
I
L
 
I
Y
 
L
Y
 
A
G
 
G
S
 
T
E
 
E
E
 
E
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
A
K
 
K
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
K
 
K
L
 
L
A
 
A
T
 
S
G
 
G
E
 
E
W
 
H
A
 
I
A
 
A
C
 
A
Y
 
F
C
 
C
L
 
L
T
|
T
E
 
E
P
 
P
D
 
A
A
 
S
G
 
G
S
 
S
D
 
D
A
 
A
N
 
A
S
 
A
G
 
I
K
 
R
T
 
S
K
 
R
A
 
A
T
 
T
L
 
L
T
 
S
E
 
E
D
 
D
G
 
K
K
 
K
H
 
H
Y
 
Y
L
 
I
I
 
L
N
 
N
G
 
G
Q
 
S
K
 
K
M
 
V
W
|
W
I
 
I
S
 
T
N
 
N
A
 
G
G
 
G
F
 
L
A
 
A
D
 
N
L
 
I
F
 
F
I
 
T
V
 
V
F
 
F
A
 
A
K
 
K
I
 
T
E
 
E
-
 
V
-
 
V
-
 
D
-
 
S
-
 
D
-
 
G
-
 
S
-
 
V
E
 
K
D
 
D
K
 
K
N
 
-
L
 
I
T
 
T
A
 
A
F
 
F
I
 
I
V
 
V
E
 
E
K
 
R
S
 
D
F
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
V
T
 
T
M
 
N
N
 
G
E
 
K
E
 
P
E
 
E
K
 
D
K
|
K
M
 
L
G
 
G
I
 
I
K
 
R
G
 
G
S
 
S
S
 
N
T
 
T
R
 
C
Q
 
E
V
 
V
F
 
H
F
 
F
N
 
E
D
 
N
C
 
T
K
 
K
V
 
I
P
 
P
V
 
V
E
 
E
N
 
N
M
 
I
L
 
L
S
 
G
D
 
E
R
 
V
Q
 
G
N
 
D
G
 
G
F
 
F
K
 
K
I
 
V
A
 
A
V
 
M
N
 
N
I
 
I
L
 
L
N
 
N
I
 
S
G
 
G
R
 
R
I
 
F
K
 
S
L
 
M
G
 
G
S
 
S
G
 
V
I
 
V
L
 
A
G
 
G
G
 
L
V
 
L
R
 
K
T
 
R
V
 
L
T
 
I
T
 
E
K
 
M
A
 
T
I
 
A
N
 
E
Y
 
Y
S
 
A
T
 
C
E
 
T
R
|
R
K
 
K
Q
|
Q
F
|
F
G
 
N
V
 
K
S
 
R
I
 
L
N
 
S
S
 
E
F
|
F
G
 
G
A
x
L
V
x
I
K
 
Q
S
 
E
M
 
K
L
 
F
A
 
A
E
 
L
M
 
M
A
 
A
I
 
Q
R
 
K
T
 
A
Y
 
Y
V
 
V
S
 
M
E
 
E
S
 
S
L
 
M
C
 
T
Y
 
Y
R
 
-
A
 
-
G
 
-
Q
 
-
D
 
-
I
 
-
E
 
-
D
 
-
Q
 
-
I
 
-
N
 
-
E
 
-
F
 
-
I
 
L
T
 
T
D
 
A
G
 
G
M
 
M
P
 
L
E
 
D
N
 
Q
E
 
-
A
 
-
K
 
-
L
 
-
K
 
P
G
 
G
V
 
F
E
 
P
M
 
D
F
 
C
A
 
S
M
 
I
E
 
E
C
 
A
A
 
A
I
 
M
A
 
V
K
 
K
I
 
V
H
 
F
G
 
S
S
 
S
E
 
E
V
 
A
L
 
A
D
 
W
Y
 
Q
V
 
C
V
 
V
D
 
S
Q
 
E
G
 
A
V
 
L
Q
 
Q
I
|
I
Y
 
L
G
|
G
G
|
G
M
 
L
G
 
G
Y
 
Y
S
 
T
A
 
R
E
 
D
A
 
Y
P
 
P
M
 
Y
E
 
E
R
 
R
A
 
I
Y
 
L
R
 
R
D
 
D
A
 
T
R
 
R
I
 
I
A
 
L
R
 
L
I
 
I
Y
x
F
E
 
E
G
 
G
T
 
T
N
 
N
E
|
E
I
 
I
N
 
L
R
 
R
M
|
M
L
 
Y
M
 
I
I
 
A
G
 
L
M
 
T
L
 
G
L
 
L
K
 
Q
R
 
H
A
 
A
M
 
G
K
 
R
G
 
I
E
 
L
V
 
T
N
 
H
-
 
G
L
 
V
F
 
V
E
 
H
P
 
P
A
 
S
M
 
L
A
 
A
V
 
D
S
 
S
A
 
A
E
 
N
L
 
-
T
 
-
S
 
-
V
 
-
P
 
-
S
 
K
F
 
F
E
 
E
S
 
-
I
 
-
D
 
E
T
 
N
S
 
T
E
 
Y
L
 
C
F
 
F
A
 
G
A
 
R
E
 
T
K
 
V
E
 
E
V
 
T
L
 
L
K
 
-
K
 
-
L
 
-
K
 
-
K
 
-
V
 
-
F
 
-
L
 
L
M
 
L
V
 
R
G
 
F
G
 
G
K
 
K
A
 
T
A
 
I
M
 
M
A
 
-
L
 
-
Q
 
-
E
 
-
K
 
-
I
 
-
E
 
-
D
 
E
E
 
E
Q
|
Q
E
 
L
I
 
V
M
 
L
M
 
K
N
 
R
L
 
V
A
 
A
D
 
N
V
 
I
M
 
L
I
 
I
E
 
N
I
 
L
Y
 
Y
A
 
G
A
 
M
E
 
T
S
 
A
A
 
V
I
 
L
L
 
S
R
 
R
T
 
A
E
 
S
K
 
R
L
 
S
V
 
I
S
 
R
L
 
I
K
 
G
S
 
L
E
 
R
A
 
N
E
 
H
C
 
-
S
 
D
H
 
H
Q
 
E
I
 
V
A
 
L
M
 
L
S
 
A
Q
 
N
V
 
T
Y
 
F
L
 
C
S
 
V
E
 
E
A
 
A

3b96A Structural basis for substrate fatty-acyl chain specificity: crystal structure of human very-long-chain acyl-coa dehydrogenase (see paper)
36% identity, 84% coverage: 70:570/594 of query aligns to 70:539/554 of 3b96A

query
sites
3b96A
E
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
A
L
 
F
G
 
G
I
 
L
S
 
Q
V
 
V
P
 
P
E
 
S
E
 
E
Y
 
L
G
 
G
G
 
G
M
 
V
G
 
G
M
 
L
N
 
C
F
 
N
V
 
T
T
 
Q
S
 
Y
M
 
A
L
 
R
I
 
L
A
x
V
D
 
E
I
 
I
I
 
V
G
 
G
S
 
M
A
 
H
G
 
D
-
 
L
S
 
G
F
 
V
S
x
G
T
 
I
T
 
T
Y
 
L
G
 
G
A
 
A
H
 
H
T
 
Q
G
 
S
I
 
I
G
 
G
T
 
F
L
 
K
P
 
G
I
 
I
L
 
L
Y
 
L
Y
 
F
G
 
G
S
 
T
E
 
K
E
 
A
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
E
K
 
K
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
K
 
K
L
 
L
A
 
A
T
 
S
G
 
G
E
 
E
W
 
T
A
 
V
A
 
A
C
 
A
Y
x
F
C
 
C
L
|
L
T
|
T
E
 
E
P
 
P
D
 
S
A
 
S
G
|
G
S
|
S
D
 
D
A
 
A
N
 
A
S
 
S
G
 
I
K
 
R
T
 
T
K
 
S
A
 
A
T
 
V
L
 
P
T
 
S
E
 
P
D
 
C
G
 
G
K
 
K
H
 
Y
Y
 
Y
L
 
T
I
 
L
N
 
N
G
 
G
Q
 
S
K
 
K
M
 
L
W
|
W
I
|
I
S
|
S
N
 
N
A
 
G
G
 
G
F
 
L
A
 
A
D
 
D
L
 
I
F
 
F
I
 
T
V
 
V
F
 
F
A
 
A
K
 
K
I
 
T
E
 
P
E
 
V
-
 
T
-
 
D
-
 
P
-
 
A
-
 
T
-
 
G
-
 
A
-
 
V
D
 
K
K
 
E
N
 
K
L
 
I
T
 
T
A
 
A
F
 
F
I
 
V
V
 
V
E
 
E
K
 
R
S
 
G
F
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
I
T
 
T
M
 
H
N
 
G
E
 
P
E
 
P
E
 
E
K
 
K
K
 
K
M
 
M
G
 
G
I
 
I
K
 
K
G
 
A
S
 
S
S
 
N
T
 
T
R
 
A
Q
 
E
V
 
V
F
 
F
F
 
F
N
 
D
D
 
G
C
 
V
K
 
R
V
 
V
P
 
P
V
 
S
E
 
E
N
 
N
M
 
V
L
 
L
S
 
G
D
 
E
R
 
V
Q
 
G
N
 
S
G
 
G
F
 
F
K
 
K
I
 
V
A
 
A
V
 
M
N
 
H
I
 
I
L
|
L
N
 
N
I
 
N
G
|
G
R
 
R
I
 
F
K
 
G
L
 
M
G
 
A
S
 
A
G
 
A
I
 
L
L
 
A
G
 
G
G
 
T
V
 
M
R
 
R
T
 
G
V
 
I
T
 
I
T
 
A
K
 
K
A
 
A
I
 
V
N
 
D
Y
 
H
S
 
A
T
 
T
E
 
N
R
 
R
K
 
T
Q
 
Q
F
 
F
G
 
G
V
 
E
S
 
K
I
 
I
N
 
H
S
 
N
F
 
F
G
 
G
A
 
L
V
 
I
K
 
Q
S
 
E
M
 
K
L
 
L
A
 
A
E
 
R
M
 
M
A
 
V
I
 
M
R
 
L
T
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
S
 
T
E
 
E
S
 
S
L
 
M
C
 
A
Y
 
Y
R
 
M
A
 
V
G
 
S
Q
 
A
D
 
N
I
 
M
E
 
D
D
 
-
Q
 
-
I
 
-
N
 
-
E
 
-
F
 
-
I
 
-
T
 
-
D
 
-
G
 
-
M
 
-
P
 
-
E
 
-
N
 
-
E
 
-
A
 
-
K
 
-
L
 
-
K
 
Q
G
 
G
V
 
A
E
 
T
M
 
D
F
 
F
A
 
Q
M
 
I
E
 
E
C
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
S
K
 
K
I
 
I
H
 
F
G
 
G
S
 
S
E
 
E
V
 
A
L
 
A
D
 
W
Y
 
K
V
 
V
V
 
T
D
 
D
Q
 
E
G
 
C
V
 
I
Q
 
Q
I
 
I
Y
 
M
G
 
G
G
 
G
M
 
M
G
 
G
Y
 
F
S
 
M
A
 
K
E
 
E
A
 
P
P
 
G
M
 
V
E
 
E
R
 
R
A
 
V
Y
 
L
R
 
R
D
 
D
A
 
L
R
 
R
I
|
I
A
 
F
R
 
R
I
 
I
Y
x
F
E
|
E
G
 
G
T
|
T
N
 
N
E
x
D
I
|
I
N
 
L
R
 
R
M
 
L
L
 
F
M
 
V
I
 
A
-
x
L
-
 
Q
-
 
G
-
 
C
-
 
M
-
 
D
-
 
K
G
 
G
M
 
K
L
 
E
L
 
L
K
 
S
R
 
L
A
 
S
M
 
L
K
 
S
G
 
G
E
 
-
V
 
-
N
 
-
L
 
L
F
 
V
E
 
H
P
 
P
A
 
E
M
 
L
A
 
S
V
 
R
S
 
S
A
 
G
E
 
E
L
 
L
T
 
-
S
 
A
V
 
V
P
 
R
S
 
A
F
 
L
E
 
E
S
 
Q
I
 
F
D
 
A
T
 
T
S
 
-
E
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
V
A
 
V
E
 
E
K
 
A
E
 
K
V
 
L
L
 
I
K
 
K
K
 
H
L
 
K
K
 
K
K
 
-
V
 
-
F
 
-
L
 
-
M
 
-
V
 
-
G
 
-
G
 
-
K
 
-
A
 
-
A
 
-
M
 
-
A
 
-
L
 
-
Q
 
-
E
 
-
K
 
G
I
 
I
E
 
V
D
 
N
E
 
E
Q
|
Q
E
 
F
I
 
L
M
 
L
M
 
Q
N
 
R
L
 
L
A
 
A
D
 
D
V
 
G
M
 
A
I
 
I
E
 
D
I
 
L
Y
 
Y
A
 
A
A
 
M
E
 
V
S
 
V
A
 
V
I
 
L
L
 
S
R
 
R
T
 
A
E
 
S
K
 
R
L
 
S
V
 
L
S
 
S
L
 
-
K
 
E
S
 
G
E
 
H
A
 
P
E
 
T
C
 
A
S
 
Q
H
 
H
Q
 
E
I
 
K
A
 
M
M
 
L
S
 
C
Q
 
D
V
 
T
Y
 
W
L
 
C
S
 
I
E
 
E
A
 
A
I
 
A
D
 
A
K
 
R
I
 
I
Q
 
-
S
 
-
A
 
-
A
 
-
K
 
R
E
 
E
A
 
G
I
 
M
A
 
A
S
 
A
F
 
L
T
 
Q
K
 
S
G
 
D
D
 
P
E
 
W
Q
 
Q
K
 
Q
V
 
E
M
 
L
L
 
Y
M
 
R
G
 
N
L
 
F
K
 
K
R
 
S
F
 
I
T
 
S
K
 
K
A
 
A

2uxwA Crystal structure of human very long chain acyl-coa dehydrogenase (acadvl)
36% identity, 84% coverage: 70:570/594 of query aligns to 70:552/567 of 2uxwA

query
sites
2uxwA
E
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
A
L
 
F
G
 
G
I
 
L
S
 
Q
V
 
V
P
 
P
E
 
S
E
 
E
Y
 
L
G
 
G
G
 
G
M
 
V
G
 
G
M
 
L
N
 
C
F
 
N
V
 
T
T
 
Q
S
 
Y
M
 
A
L
 
R
I
 
L
A
x
V
D
 
E
I
 
I
I
 
V
G
 
G
S
 
M
A
 
H
G
 
D
-
 
L
S
 
G
F
 
V
S
x
G
T
 
I
T
 
T
Y
x
L
G
 
G
A
 
A
H
 
H
T
 
Q
G
 
S
I
 
I
G
 
G
T
 
F
L
 
K
P
 
G
I
 
I
L
 
L
Y
 
L
Y
 
F
G
 
G
S
 
T
E
 
K
E
 
A
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
E
K
 
K
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
K
 
K
L
 
L
A
 
A
T
 
S
G
 
G
E
 
E
W
 
T
A
 
V
A
 
A
C
 
A
Y
x
F
C
 
C
L
|
L
T
|
T
E
 
E
P
 
P
D
 
S
A
 
S
G
|
G
S
|
S
D
 
D
A
 
A
N
 
A
S
 
S
G
 
I
K
 
R
T
 
T
K
 
S
A
 
A
T
 
V
L
 
P
T
 
S
E
 
P
D
 
C
G
 
G
K
 
K
H
 
Y
Y
 
Y
L
 
T
I
 
L
N
 
N
G
 
G
Q
 
S
K
 
K
M
 
L
W
|
W
I
|
I
S
|
S
N
 
N
A
 
G
G
 
G
F
 
L
A
 
A
D
 
D
L
 
I
F
 
F
I
 
T
V
 
V
F
 
F
A
 
A
K
 
K
I
 
T
E
 
P
E
 
V
-
 
T
-
 
D
-
 
P
-
 
A
-
 
T
-
 
G
-
 
A
-
 
V
D
 
K
K
 
E
N
 
K
L
 
I
T
 
T
A
 
A
F
 
F
I
 
V
V
 
V
E
 
E
K
 
R
S
 
G
F
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
I
T
 
T
M
 
H
N
 
G
E
 
P
E
 
P
E
 
E
K
 
K
K
 
K
M
 
M
G
 
G
I
 
I
K
 
K
G
 
A
S
 
S
S
 
N
T
 
T
R
 
A
Q
 
E
V
 
V
F
 
F
F
 
F
N
 
D
D
 
G
C
 
V
K
 
R
V
 
V
P
 
P
V
 
S
E
 
E
N
 
N
M
 
V
L
 
L
S
 
G
D
 
E
R
 
V
Q
 
G
N
 
S
G
 
G
F
 
F
K
 
K
I
 
V
A
 
A
V
 
M
N
 
H
I
 
I
L
|
L
N
 
N
I
 
N
G
|
G
R
 
R
I
 
F
K
 
G
L
 
M
G
 
A
S
 
A
G
 
A
I
 
L
L
 
A
G
 
G
G
 
T
V
 
M
R
 
R
T
 
G
V
 
I
T
 
I
T
 
A
K
 
K
A
 
A
I
 
V
N
 
D
Y
 
H
S
 
A
T
 
T
E
 
N
R
 
R
K
 
T
Q
 
Q
F
 
F
G
 
G
V
 
E
S
 
K
I
 
I
N
 
H
S
 
N
F
 
F
G
 
G
A
 
L
V
 
I
K
 
Q
S
 
E
M
 
K
L
 
L
A
 
A
E
 
R
M
 
M
A
 
V
I
 
M
R
 
L
T
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
S
 
T
E
 
E
S
 
S
L
 
M
C
 
A
Y
 
Y
R
 
M
A
 
V
G
 
S
Q
 
A
D
 
N
I
 
M
E
 
D
D
 
-
Q
 
-
I
 
-
N
 
-
E
 
-
F
 
-
I
 
-
T
 
-
D
 
-
G
 
-
M
 
-
P
 
-
E
 
-
N
 
-
E
 
-
A
 
-
K
 
-
L
 
-
K
 
Q
G
 
G
V
 
A
E
 
T
M
 
D
F
 
F
A
 
Q
M
 
I
E
 
E
C
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
S
K
 
K
I
 
I
H
 
F
G
 
G
S
 
S
E
 
E
V
 
A
L
 
A
D
 
W
Y
 
K
V
 
V
V
 
T
D
 
D
Q
 
E
G
 
C
V
 
I
Q
 
Q
I
 
I
Y
 
M
G
 
G
G
 
G
M
 
M
G
 
G
Y
 
F
S
 
M
A
 
K
E
 
E
A
 
P
P
 
G
M
 
V
E
 
E
R
 
R
A
 
V
Y
 
L
R
 
R
D
 
D
A
 
L
R
 
R
I
 
I
A
 
F
R
 
R
I
 
I
Y
x
F
E
|
E
G
|
G
T
|
T
N
 
N
E
x
D
I
|
I
N
 
L
R
 
R
M
 
L
L
 
F
M
 
V
I
 
A
G
 
-
M
 
-
L
 
-
L
|
L
K
 
Q
R
 
G
A
 
C
M
 
M
K
 
D
G
 
K
E
 
G
V
 
K
N
 
E
L
 
L
F
 
S
E
 
G
P
 
L
A
 
G
M
 
S
A
 
A
V
 
L
S
 
K
A
 
N
E
 
P
L
 
F
T
 
G
S
 
S
V
 
G
P
 
L
S
 
S
F
 
L
E
 
S
S
 
G
I
 
L
D
 
V
T
 
H
S
 
P
E
 
E
L
 
L
F
 
S
A
 
R
A
 
S
E
 
G
K
 
E
E
 
L
V
 
A
L
 
V
K
 
R
K
 
A
L
 
L
K
 
E
K
 
Q
V
 
F
F
 
A
L
 
T
M
 
V
V
 
V
G
 
E
G
 
A
K
 
K
A
 
-
A
 
L
M
 
I
A
 
K
L
 
H
Q
 
K
E
 
K
K
 
G
I
 
I
E
 
V
D
 
N
E
 
E
Q
|
Q
E
 
F
I
 
L
M
 
L
M
 
Q
N
 
R
L
 
L
A
 
A
D
 
D
V
 
G
M
 
A
I
 
I
E
 
D
I
 
L
Y
 
Y
A
 
A
A
 
M
E
 
V
S
 
V
A
 
V
I
 
L
L
 
S
R
 
R
T
 
A
E
 
S
K
 
R
L
 
S
V
 
L
S
 
S
L
 
-
K
 
E
S
 
G
E
 
H
A
 
P
E
 
T
C
 
A
S
 
Q
H
 
H
Q
 
E
I
 
K
A
 
M
M
 
L
S
 
C
Q
 
D
V
 
T
Y
 
W
L
 
C
S
 
I
E
 
E
A
 
A
I
 
A
D
 
A
K
 
R
I
 
I
Q
 
-
S
 
-
A
 
-
A
 
-
K
 
R
E
 
E
A
 
G
I
 
M
A
 
A
S
 
A
F
 
L
T
 
Q
K
 
S
G
 
D
D
 
P
E
 
W
Q
 
Q
K
 
Q
V
 
E
M
 
L
L
 
Y
M
 
R
G
 
N
L
 
F
K
 
K
R
 
S
F
 
I
T
 
S
K
 
K
A
 
A

Sites not aligning to the query:

Q9H845 Complex I assembly factor ACAD9, mitochondrial; Acyl-CoA dehydrogenase family member 9; ACAD-9; EC 1.3.8.- from Homo sapiens (Human) (see 4 papers)
35% identity, 82% coverage: 50:536/594 of query aligns to 80:575/621 of Q9H845

query
sites
Q9H845
E
 
E
E
 
E
I
 
V
D
 
D
S
 
S
M
 
R
K
 
K
N
 
I
-
 
D
-
 
Q
-
 
E
-
 
G
-
 
K
-
 
I
P
 
P
D
 
D
L
 
-
V
 
-
P
 
-
S
 
E
I
 
T
F
 
L
K
 
E
K
 
K
A
 
L
G
 
K
E
 
S
L
 
L
G
 
G
L
 
L
L
 
F
G
 
G
I
 
L
S
 
Q
V
 
V
P
 
P
E
 
E
E
 
E
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
M
 
L
G
 
G
M
 
F
N
 
S
F
 
N
V
 
T
T
 
M
S
 
Y
M
 
S
L
 
R
I
 
L
A
 
G
D
 
E
I
 
I
I
 
I
G
 
S
S
 
M
A
 
D
G
 
G
S
 
S
F
 
I
S
 
T
T
 
V
T
 
T
Y
 
L
G
 
A
A
 
A
H
 
H
T
 
Q
G
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
L
L
 
K
P
 
G
I
 
I
L
 
I
Y
 
L
Y
 
A
G
 
G
S
 
T
E
 
E
E
 
E
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
A
K
 
K
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
K
 
K
L
 
L
A
 
A
T
 
S
G
 
G
E
 
E
W
 
H
A
 
I
A
 
A
C
 
A
Y
 
F
C
 
C
L
 
L
T
 
T
E
 
E
P
 
P
D
 
A
A
 
S
G
 
G
S
 
S
D
 
D
A
 
A
N
 
A
S
 
S
G
 
I
K
x
R
T
 
S
K
 
R
A
 
A
T
 
T
L
 
L
T
 
S
E
 
E
D
 
D
G
 
K
K
 
K
H
 
H
Y
 
Y
L
 
I
I
 
L
N
 
N
G
 
G
Q
 
S
K
 
K
M
 
V
W
 
W
I
 
I
S
 
T
N
 
N
A
 
G
G
 
G
F
 
L
A
 
A
D
 
N
L
 
I
F
 
F
I
 
T
V
 
V
F
 
F
A
 
A
K
 
K
I
 
T
E
 
E
-
 
V
-
 
V
-
 
D
-
x
S
-
 
D
-
 
G
-
 
S
-
 
V
E
 
K
D
 
D
K
 
K
N
 
-
L
 
I
T
 
T
A
 
A
F
 
F
I
 
I
V
 
V
E
 
E
K
 
R
S
 
D
F
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
V
T
 
T
M
 
N
N
 
G
E
 
K
E
 
P
E
 
E
K
 
D
K
 
K
M
 
L
G
 
G
I
 
I
K
 
R
G
 
G
S
 
S
S
 
N
T
 
T
R
 
C
Q
 
E
V
 
V
F
 
H
F
 
F
N
 
E
D
 
N
C
 
T
K
 
K
V
 
I
P
 
P
V
 
V
E
 
E
N
 
N
M
 
I
L
 
L
S
 
G
D
 
E
R
 
V
Q
 
G
N
 
D
G
 
G
F
 
F
K
 
K
I
 
V
A
 
A
V
 
M
N
 
N
I
 
I
L
 
L
N
 
N
I
 
S
G
|
G
R
 
R
I
 
F
K
 
S
L
 
M
G
 
G
S
 
S
G
 
V
I
 
V
L
 
A
G
 
G
G
 
L
V
 
L
R
 
K
T
 
R
V
 
L
T
 
I
T
 
E
K
 
M
A
 
T
I
 
A
N
 
E
Y
 
Y
S
x
A
T
 
C
E
 
T
R
 
R
K
 
K
Q
 
Q
F
 
F
G
 
N
V
 
K
S
 
R
I
 
L
N
 
S
S
 
E
F
 
F
G
 
G
A
 
L
V
 
I
K
 
Q
S
 
E
M
 
K
L
 
F
A
 
A
E
 
L
M
 
M
A
 
A
I
 
Q
R
 
K
T
 
A
Y
 
Y
V
 
V
S
 
M
E
 
E
S
 
S
L
 
M
C
 
T
Y
 
Y
R
 
-
A
 
-
G
 
-
Q
 
-
D
 
-
I
 
-
E
 
-
D
 
-
Q
 
-
I
 
-
N
 
-
E
 
-
F
 
-
I
 
L
T
 
T
D
 
A
G
 
G
M
 
M
P
 
L
E
 
D
N
 
Q
E
 
-
A
 
-
K
 
-
L
 
-
K
 
P
G
 
G
V
 
F
E
 
P
M
 
D
F
 
C
A
 
S
M
 
I
E
 
E
C
 
A
A
 
A
I
 
M
A
 
V
K
 
K
I
 
V
H
 
F
G
 
S
S
 
S
E
 
E
V
 
A
L
 
A
D
 
W
Y
 
Q
V
 
C
V
 
V
D
 
S
Q
 
E
G
 
A
V
 
L
Q
 
Q
I
 
I
Y
 
L
G
 
G
G
 
G
M
 
L
G
 
G
Y
 
Y
S
 
T
A
 
R
E
 
D
A
 
Y
P
 
P
M
 
Y
E
|
E
R
 
R
A
 
I
Y
 
L
R
 
R
D
 
D
A
 
T
R
 
R
I
 
I
A
 
L
R
 
L
I
 
I
Y
 
F
E
|
E
G
 
G
T
 
T
N
 
N
E
 
E
I
 
I
N
 
L
R
 
R
M
 
M
L
 
Y
M
 
I
I
 
A
G
 
L
M
 
T
L
 
G
L
 
L
K
 
Q
-
 
H
-
 
A
-
 
G
R
 
R
A
 
I
M
 
L
K
 
T
G
 
T
E
 
R
V
 
I
N
 
H
L
 
E
F
 
L
E
 
K
P
 
Q
A
 
A
M
 
-
A
 
K
V
 
V
S
 
S
A
 
T
E
 
V
L
 
M
T
 
D
S
 
T
V
 
V
-
 
G
-
 
R
-
 
R
-
 
L
-
 
R
-
 
D
-
 
S
-
 
L
-
 
G
-
 
R
-
 
T
-
 
V
-
 
D
-
 
L
-
 
G
-
 
L
-
 
T
-
 
G
-
 
N
-
 
H
-
 
G
-
 
V
-
 
V
-
 
H
P
 
P
S
 
S
F
 
L
E
 
A
S
 
-
I
 
-
D
 
D
T
 
S
S
 
A
E
 
N
L
 
K
F
 
F
A
 
E
A
 
E
E
 
N
K
 
T
E
 
Y
V
 
C
L
 
F
K
 
G
K
 
R
L
 
T
K
 
V
K
 
E
V
 
T
F
 
L
L
 
L
M
 
L
V
 
R
G
 
F
G
 
G
K
 
K
A
 
T
A
 
I
M
 
M
A
 
-
L
 
-
Q
 
-
E
 
-
K
 
-
I
 
-
E
 
-
D
 
E
E
 
E
Q
 
Q
E
 
L
I
 
V
M
 
L
M
 
K
N
 
R
L
 
V
A
 
A
D
 
N
V
 
I
M
 
L
I
 
I
E
 
N
I
 
L
Y
 
Y
A
 
G
A
 
M
E
 
T
S
 
A
A
 
V
I
 
L
L
 
S
R
 
R
T
 
A
E
 
S
K
 
R
L
 
S
V
 
I
S
 
R
L
 
I
K
 
G
S
 
L
E
 
R
A
 
N
E
 
H
C
 
-
S
 
D
H
 
H
Q
 
E
I
 
V
A
 
L
M
 
L
S
 
A
Q
 
N
V
 
T
Y
 
F
L
 
C
S
 
V
E
 
E
A
 
A

Sites not aligning to the query:

P50544 Very long-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial; MVLCAD; VLCAD; EC 1.3.8.9 from Mus musculus (Mouse) (see paper)
33% identity, 95% coverage: 8:574/594 of query aligns to 77:645/656 of P50544

query
sites
P50544
G
 
G
E
 
M
F
 
F
L
 
K
I
 
G
K
 
Q
E
 
L
T
 
T
L
 
I
A
 
D
Q
 
Q
D
 
V
V
 
F
F
 
P
I
 
Y
P
 
P
E
 
S
Q
 
V
Y
 
L
T
 
S
E
 
E
E
 
E
Q
 
Q
K
 
-
M
 
-
M
 
-
A
 
A
Q
 
Q
A
 
F
C
 
L
Q
 
K
D
 
E
F
 
L
I
 
V
D
 
G
T
 
P
E
 
-
I
 
V
T
 
A
P
 
R
K
 
F
I
 
F
E
 
E
E
 
E
I
 
V
D
 
N
S
 
D
M
 
P
K
 
A
N
 
K
P
 
N
D
 
D
L
 
A
V
 
L
P
 
E
S
 
K
I
 
V
-
 
E
-
 
D
-
 
D
-
 
T
F
 
L
K
 
Q
K
 
G
A
 
L
G
 
K
E
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
A
L
 
F
G
 
G
I
 
L
S
 
Q
V
 
V
P
 
P
E
 
S
E
 
E
Y
 
L
G
 
G
G
 
G
M
 
L
G
 
G
M
 
L
N
 
S
F
 
N
V
 
T
T
 
Q
S
 
Y
M
 
A
L
 
R
I
 
L
A
 
A
D
 
E
I
 
I
I
 
V
G
 
G
S
 
M
A
 
H
G
 
D
-
 
L
S
 
G
F
 
V
S
 
S
T
 
V
T
 
T
Y
 
L
G
 
G
A
 
A
H
 
H
T
 
Q
G
 
S
I
 
I
G
 
G
T
 
F
L
 
K
P
 
G
I
 
I
L
 
L
Y
 
L
Y
 
Y
G
 
G
S
 
T
E
 
K
E
 
A
Q
 
Q
K
 
R
Q
 
E
K
 
K
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
K
 
R
L
 
V
A
 
A
T
 
S
G
 
G
E
 
Q
W
 
A
A
 
L
A
 
A
C
 
A
Y
 
F
C
 
C
L
 
L
T
 
T
E
 
E
P
 
P
D
 
S
A
 
S
G
 
G
S
 
S
D
 
D
A
 
V
N
 
A
S
 
S
G
 
I
K
 
R
T
 
S
K
 
S
A
 
A
T
 
I
L
 
P
T
 
S
E
 
P
D
x
C
G
 
G
K
 
K
H
 
Y
Y
 
Y
L
 
T
I
 
L
N
 
N
G
 
G
Q
 
S
K
 
K
M
 
I
W
 
W
I
 
I
S
 
S
N
 
N
A
 
G
G
 
G
F
 
L
A
 
A
D
 
D
L
 
I
F
 
F
I
 
T
V
 
V
F
 
F
A
 
A
K
 
K
I
 
T
E
 
P
-
 
I
-
 
K
-
 
D
-
 
A
-
 
A
-
 
T
-
 
G
-
 
A
E
 
V
D
 
K
K
 
E
N
 
K
L
 
I
T
 
T
A
 
A
F
 
F
I
 
V
V
 
V
E
 
E
K
 
R
S
 
S
F
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
V
T
 
T
M
 
H
N
 
G
E
 
L
E
 
P
E
 
E
K
 
K
K
 
K
M
 
M
G
 
G
I
 
I
K
 
K
G
 
A
S
 
S
S
 
N
T
 
T
R
 
S
Q
 
E
V
 
V
F
 
Y
F
 
F
N
 
D
D
 
G
C
 
V
K
 
K
V
 
V
P
 
P
V
 
S
E
 
E
N
 
N
M
 
V
L
 
L
S
 
G
D
 
E
R
 
V
Q
 
G
N
 
D
G
 
G
F
 
F
K
 
K
I
 
V
A
 
A
V
 
V
N
 
N
I
 
I
L
 
L
N
 
N
I
 
N
G
 
G
R
 
R
I
 
F
K
 
G
L
 
M
G
 
A
S
 
A
G
 
T
I
 
L
L
 
A
G
 
G
G
 
T
V
 
M
R
 
K
T
 
S
V
 
L
T
 
I
T
 
A
K
 
K
A
 
A
I
 
V
N
 
D
Y
 
H
S
 
A
T
 
T
E
 
N
R
 
R
K
 
T
Q
 
Q
F
 
F
G
 
G
V
 
D
S
 
K
I
 
I
N
 
H
S
 
N
F
 
F
G
 
G
A
 
V
V
 
I
K
 
Q
S
 
E
M
 
K
L
 
L
A
 
A
E
 
R
M
 
M
A
 
A
I
 
I
R
 
L
T
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
S
 
T
E
 
E
S
 
S
L
 
M
C
 
A
Y
 
Y
R
 
M
A
 
L
G
 
S
Q
 
A
D
 
N
I
 
M
E
 
D
D
 
-
Q
 
-
I
 
-
N
 
-
E
 
-
F
 
-
I
 
-
T
 
-
D
 
-
G
 
-
M
 
-
P
 
-
E
 
-
N
 
-
E
 
-
A
 
-
K
 
-
L
 
-
K
 
Q
G
 
G
V
 
F
E
 
K
M
 
D
F
 
F
A
 
Q
M
 
I
E
 
E
C
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
S
K
 
K
I
 
I
H
 
F
G
 
C
S
 
S
E
 
E
V
 
A
L
 
A
D
 
W
Y
 
K
V
 
V
V
 
A
D
 
D
Q
 
E
G
 
C
V
 
I
Q
 
Q
I
 
I
Y
 
M
G
 
G
G
 
G
M
 
M
G
 
G
Y
 
F
S
 
M
A
 
K
E
 
E
A
 
P
P
 
G
M
 
V
E
 
E
R
 
R
A
 
V
Y
 
L
R
 
R
D
 
D
A
 
I
R
 
R
I
 
I
A
 
F
R
 
R
I
 
I
Y
 
F
E
 
E
G
 
G
T
 
A
N
 
N
E
 
D
I
 
I
N
 
L
R
 
R
M
 
L
L
 
F
M
 
V
-
 
A
-
 
L
-
 
Q
-
 
G
-
 
C
-
 
M
-
 
D
-
 
K
-
 
G
-
 
K
-
 
E
-
 
L
-
 
T
-
 
G
I
 
L
G
 
G
M
 
N
L
 
A
L
 
L
K
 
K
R
 
N
A
 
P
M
 
F
K
 
-
G
 
G
E
 
N
V
 
V
N
 
G
L
 
L
F
 
L
-
 
M
-
 
G
-
 
E
-
 
A
E
 
G
P
 
K
A
 
Q
M
 
L
A
 
R
V
 
R
S
 
R
A
 
T
E
 
G
L
 
I
T
 
G
S
 
S
V
 
G
P
 
L
S
 
S
F
 
L
E
 
S
S
 
G
I
 
I
D
 
V
T
 
H
S
 
P
E
 
E
L
 
L
F
 
S
A
 
R
A
 
S
E
 
G
K
 
E
E
 
L
V
 
A
L
 
V
K
 
Q
K
 
A
L
 
L
K
 
D
K
 
Q
V
 
F
F
 
A
L
 
T
M
 
V
V
 
V
G
 
E
G
 
A
K
 
K
A
 
-
A
 
L
M
 
V
A
 
K
L
 
H
Q
 
K
E
 
K
K
 
G
I
 
I
E
 
V
D
 
N
E
 
E
Q
 
Q
E
 
F
I
 
L
M
 
L
M
 
Q
N
 
R
L
 
L
A
 
A
D
 
D
V
 
G
M
 
A
I
 
I
E
 
D
I
 
L
Y
 
Y
A
 
A
A
 
M
E
 
V
S
 
V
A
 
V
I
 
L
L
 
S
R
 
R
T
 
A
E
 
S
K
 
R
L
 
S
V
 
L
S
 
S
L
 
-
K
 
E
S
 
G
E
 
Y
A
 
P
E
 
T
C
 
A
S
 
Q
H
 
H
Q
 
E
I
 
K
A
 
M
M
 
L
S
 
C
Q
 
D
V
 
S
Y
 
W
L
 
C
S
 
I
E
 
E
A
 
A
I
 
A
D
 
T
K
 
R
I
 
I
Q
 
-
S
 
-
A
 
-
A
 
-
K
 
R
E
 
E
A
 
N
I
 
M
A
 
A
S
 
S
F
 
L
T
 
Q
K
 
S
G
 
S
D
 
P
E
 
Q
Q
 
H
K
 
Q
V
 
E
M
 
L
L
 
F
M
 
R
G
 
N
L
 
F
K
 
R
R
 
S
F
 
I
T
 
S
K
 
K
A
 
A
D
 
M
L
 
V
V
 
E
N
 
N

7s7gA Crystal structure analysis of human vlcad (see paper)
35% identity, 84% coverage: 70:570/594 of query aligns to 70:556/571 of 7s7gA

query
sites
7s7gA
E
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
A
L
 
F
G
 
G
I
 
L
S
 
Q
V
 
V
P
 
P
E
 
S
E
 
E
Y
 
L
G
 
G
G
 
G
M
 
V
G
 
G
M
 
L
N
 
C
F
 
N
V
 
T
T
 
Q
S
 
Y
M
 
A
L
 
R
I
 
L
A
 
V
D
 
E
I
 
I
I
 
V
G
 
G
S
 
M
A
 
H
G
 
D
-
 
L
S
 
G
F
 
V
S
 
G
T
 
I
T
 
T
Y
 
L
G
 
G
A
 
A
H
 
H
T
 
Q
G
 
S
I
 
I
G
 
G
T
 
F
L
 
K
P
 
G
I
 
I
L
 
L
Y
 
L
Y
 
F
G
 
G
S
 
T
E
 
K
E
 
A
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
E
K
 
K
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
K
 
K
L
 
L
A
 
A
T
 
S
G
 
G
E
 
E
W
 
T
A
 
V
A
 
A
C
 
A
Y
x
F
C
 
C
L
|
L
T
|
T
E
 
E
P
 
P
D
 
S
A
 
S
G
|
G
S
|
S
D
 
D
A
 
A
N
 
A
S
 
S
G
 
I
K
 
R
T
 
T
K
 
S
A
 
A
T
 
V
L
 
P
T
 
S
E
 
P
D
 
C
G
 
G
K
 
K
H
 
Y
Y
 
Y
L
 
T
I
 
L
N
 
N
G
 
G
Q
 
S
K
 
K
M
 
L
W
|
W
I
|
I
S
|
S
N
 
N
A
 
G
G
 
G
F
 
L
A
 
A
D
 
D
L
 
I
F
 
F
I
 
T
V
 
V
F
 
F
A
 
A
K
 
K
I
 
T
E
 
P
E
 
V
-
 
T
-
 
D
-
 
P
-
 
A
-
 
T
-
 
G
-
 
A
-
 
V
D
 
K
K
 
E
N
 
K
L
 
I
T
 
T
A
 
A
F
 
F
I
 
V
V
 
V
E
 
E
K
 
R
S
 
G
F
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
I
T
 
T
M
 
H
N
 
G
E
 
P
E
 
P
E
 
E
K
 
K
K
 
K
M
 
M
G
 
G
I
 
I
K
 
K
G
 
A
S
 
S
S
 
N
T
 
T
R
 
A
Q
 
E
V
 
V
F
 
F
F
 
F
N
 
D
D
 
G
C
 
V
K
 
R
V
 
V
P
 
P
V
 
S
E
 
E
N
 
N
M
 
V
L
 
L
S
 
G
D
 
E
R
 
V
Q
 
G
N
 
S
G
 
G
F
 
F
K
 
K
I
 
V
A
 
A
V
 
M
N
 
H
I
 
I
L
 
L
N
 
N
I
 
N
G
 
G
R
 
R
I
 
F
K
 
G
L
 
M
G
 
A
S
 
A
G
 
A
I
 
L
L
 
A
G
 
G
G
 
T
V
 
M
R
 
R
T
 
G
V
 
I
T
 
I
T
 
A
K
 
K
A
 
A
I
 
V
N
 
D
Y
 
H
S
 
A
T
 
T
E
 
N
R
 
R
K
 
T
Q
 
Q
F
 
F
G
 
G
V
 
E
S
 
K
I
 
I
N
 
H
S
 
N
F
 
F
G
 
G
A
 
L
V
 
I
K
 
Q
S
 
E
M
 
K
L
 
L
A
 
A
E
 
R
M
 
M
A
 
V