SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_008198326.1 NCBI__GCF_000166275.1:WP_008198326.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6neeB Crystal structure of a reconstructed ancestor of triosephosphate isomerase from eukaryotes (see paper)
47% identity, 99% coverage: 2:252/253 of query aligns to 4:250/252 of 6neeB

query
sites
6neeB
R
 
R
K
 
K
K
 
F
I
 
F
V
 
V
A
 
G
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
M
 
G
T
 
T
F
 
L
D
 
E
E
 
S
G
 
I
Q
 
K
K
 
A
L
 
L
T
 
V
S
 
E
E
 
T
I
 
L
V
 
N
N
 
S
M
 
A
Y
 
Q
K
 
L
D
 
D
E
 
P
N
 
N
V
 
T
K
 
E
D
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
A
I
 
-
L
 
-
N
 
-
P
 
P
P
 
P
F
 
A
P
 
I
H
 
Y
I
 
L
F
 
P
P
 
F
V
 
A
K
 
R
K
 
S
L
 
K
I
 
L
G
 
K
G
 
K
V
 
P
E
 
K
G
 
E
I
 
I
S
 
Q
L
 
V
G
 
A
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
C
 
C
S
 
Y
D
 
T
K
 
K
E
 
P
A
 
N
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
S
 
S
A
 
A
K
 
E
I
 
M
I
 
L
A
 
K
S
 
D
F
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
P
Y
 
W
V
 
V
I
 
I
L
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
E
 
T
Y
 
I
F
 
F
Q
 
G
E
 
E
D
 
S
N
 
D
E
 
E
I
 
L
L
 
I
A
 
A
T
 
E
K
 
K
V
 
V
K
 
K
E
 
Y
A
 
A
L
 
L
A
 
D
N
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
P
 
V
I
 
I
F
 
A
C
 
C
C
 
I
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
D
 
E
I
 
E
R
 
R
T
 
E
A
 
A
G
 
G
T
 
K
H
 
T
E
 
M
P
 
E
N
 
V
V
 
V
K
 
A
F
 
R
Q
 
Q
L
 
I
T
 
L
Q
 
K
S
 
A
L
 
I
F
 
A
D
 
D
L
 
-
S
 
K
P
 
I
E
 
K
D
 
D
F
 
W
S
 
S
K
 
N
I
 
V
T
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
I
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
P
D
 
E
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
E
 
E
M
 
V
H
 
H
A
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
R
R
 
K
H
 
W
I
 
L
A
 
K
S
 
E
H
 
N
Y
 
V
G
 
S
K
 
P
E
 
E
I
 
V
A
 
A
D
 
E
N
 
S
T
 
T
S
 
R
I
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
|
S
C
 
V
N
 
N
P
 
A
K
 
A
N
 
N
A
 
C
Q
 
K
E
 
E
I
 
L
F
 
A
S
 
K
K
 
Q
P
 
P
D
 
D
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
F
L
|
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
S
 
A
R
 
P
D
 
E
F
 
F
V
 
V
D
 
D
I
 
I
I
 
I
K
 
N
S
 
A

P36204 Bifunctional PGK/TIM; EC 2.7.2.3; EC 5.3.1.1 from Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / DSM 3109 / JCM 10099 / NBRC 100826 / MSB8) (see paper)
45% identity, 99% coverage: 2:251/253 of query aligns to 402:647/654 of P36204

query
sites
P36204
R
 
R
K
 
K
K
 
L
I
 
I
V
 
L
A
 
A
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
M
 
M
N
 
H
M
 
K
T
 
T
F
 
I
D
 
S
E
 
E
G
 
A
Q
 
K
K
 
K
L
 
F
T
 
V
S
 
S
E
 
L
I
 
L
V
 
V
N
 
N
M
 
E
Y
 
L
K
 
H
D
 
D
E
 
-
N
 
-
V
 
V
K
 
K
D
 
E
V
 
F
V
 
E
A
 
I
I
 
V
L
 
V
N
 
C
P
 
P
P
 
P
F
 
F
P
 
T
H
 
A
I
 
L
F
 
S
P
 
E
V
 
V
K
 
G
K
 
E
L
 
I
I
 
L
G
 
S
G
 
G
V
 
-
E
 
R
G
 
N
I
 
I
S
 
K
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
C
 
V
S
 
F
D
 
Y
K
 
E
E
 
D
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
S
 
S
A
 
P
K
 
L
I
 
M
I
 
L
A
 
Q
S
 
E
F
 
I
G
 
G
V
 
V
E
 
E
Y
 
Y
V
 
V
I
 
I
L
 
V
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
E
 
R
Y
 
I
F
 
F
Q
 
K
E
 
E
D
 
D
N
 
D
E
 
E
I
 
F
L
 
I
A
 
N
T
 
R
K
 
K
V
 
V
K
 
K
E
 
A
A
 
V
L
 
L
A
 
E
N
 
K
G
 
G
L
 
M
K
 
T
P
 
P
I
 
I
F
 
L
C
 
C
C
 
V
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
D
 
E
I
 
E
R
 
R
T
 
E
A
 
K
G
 
G
T
 
L
H
 
T
E
 
F
P
 
C
N
 
V
V
 
V
K
 
E
F
 
K
Q
 
Q
L
 
V
T
 
R
Q
 
E
S
 
G
L
 
F
F
 
Y
D
 
G
L
 
L
S
 
D
P
 
K
E
 
E
D
 
E
F
 
A
S
 
K
K
 
R
I
 
V
T
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
I
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
R
T
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
P
D
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
E
 
E
M
 
V
H
 
H
A
 
A
A
 
F
L
 
I
R
 
R
R
 
K
H
 
L
I
 
L
A
 
S
S
 
E
H
 
M
Y
 
Y
G
 
D
K
 
E
E
 
E
I
 
T
A
 
A
D
 
G
N
 
S
T
 
I
S
 
R
I
 
I
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
 
S
C
 
I
N
 
K
P
 
P
K
 
D
N
 
N
A
 
F
Q
 
L
E
 
G
I
 
L
F
 
I
S
 
V
K
 
Q
P
 
K
D
 
D
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
L
I
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
S
 
E
R
 
-
D
 
S
F
 
F
V
 
I
D
 
E
I
 
L
I
 
A
K
 
R

Sites not aligning to the query:

4y96A Crystal structure of triosephosphate isomerase from gemmata obscuriglobus (see paper)
45% identity, 99% coverage: 2:252/253 of query aligns to 2:248/250 of 4y96A

query
sites
4y96A
R
 
R
K
 
K
K
 
K
I
 
F
V
 
V
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
M
 
T
T
 
T
F
 
L
D
 
A
E
 
E
G
 
A
Q
 
K
K
 
A
L
 
L
T
 
G
S
 
A
E
 
A
I
 
V
V
 
A
N
 
K
M
 
G
Y
 
V
K
 
T
D
 
D
E
 
D
N
 
R
V
 
V
K
 
-
D
 
-
V
 
T
V
 
V
A
 
A
I
 
V
L
 
F
N
 
-
P
 
P
P
 
P
F
 
Y
P
 
P
H
 
W
I
 
L
F
 
T
P
 
A
V
 
V
K
 
G
K
 
E
L
 
V
I
 
L
G
 
K
G
 
G
V
 
-
E
 
S
G
 
P
I
 
V
S
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
D
C
 
V
S
 
S
D
 
S
K
 
E
E
 
K
A
 
K
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
V
S
 
S
A
 
P
K
 
A
I
 
M
I
 
L
A
 
L
S
 
E
F
 
T
G
 
G
V
 
C
E
 
K
Y
 
Y
V
 
A
I
 
L
L
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
E
 
H
Y
 
I
F
 
I
Q
 
G
E
 
E
D
 
S
N
 
E
E
 
T
I
 
F
L
 
I
A
 
N
T
 
H
K
 
K
V
 
V
K
 
H
E
 
T
A
 
A
L
 
L
A
 
E
N
 
E
G
 
G
L
 
L
K
 
S
P
 
V
I
 
V
F
 
L
C
 
C
C
 
M
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
D
 
A
I
 
E
R
 
R
T
 
E
A
 
R
G
 
G
T
 
L
H
 
Q
E
 
E
P
 
R
N
 
V
V
 
F
K
 
Q
F
 
R
Q
 
Q
L
 
V
T
 
Y
Q
 
A
S
 
A
L
 
C
F
 
A
D
 
G
L
 
L
S
 
T
P
 
D
E
 
E
D
 
Q
F
 
F
S
 
G
K
 
R
I
 
I
T
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
I
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
P
D
 
E
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
E
 
E
M
 
A
H
 
H
A
 
A
A
 
F
L
 
V
R
 
R
R
 
S
H
 
K
I
 
L
A
 
R
S
 
L
H
 
L
Y
 
Y
G
 
G
K
 
D
E
 
K
I
 
I
A
 
A
D
 
D
N
 
S
T
 
T
S
 
P
I
 
I
L
 
V
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
C
 
V
N
 
T
P
 
P
K
 
D
N
 
N
A
 
T
Q
 
V
E
 
G
I
 
L
F
 
M
S
 
S
K
 
Q
P
 
P
D
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
S
 
A
R
 
D
D
 
S
F
 
F
V
 
L
D
 
A
I
 
I
I
 
V
K
 
K
S
 
A

3taoA Structure of mycobacterium tuberculosis triosephosphate isomerase bound to phosphoglycolohydroxamate (see paper)
45% identity, 97% coverage: 2:246/253 of query aligns to 2:247/256 of 3taoA

query
sites
3taoA
R
 
R
K
 
K
K
 
P
I
 
L
V
 
I
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
M
 
L
T
 
N
F
 
H
D
 
Y
E
 
E
G
 
A
Q
 
I
K
 
A
L
 
L
T
 
V
S
 
Q
E
 
K
I
 
I
V
 
A
N
 
F
M
 
S
Y
 
L
K
 
P
D
 
D
E
 
K
N
 
Y
V
 
Y
K
 
D
D
 
R
V
 
V
V
 
D
A
 
V
I
 
A
L
 
V
N
 
I
P
 
P
P
 
P
F
 
F
P
 
T
H
 
D
I
 
L
F
x
R
P
x
S
V
 
V
K
 
Q
K
x
T
L
 
L
I
 
V
G
 
D
G
 
G
V
 
D
E
 
K
-
 
L
G
 
R
I
 
L
S
 
T
L
 
Y
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
D
C
 
L
S
 
S
D
 
P
K
 
H
E
 
D
A
 
S
G
 
G
A
 
A
F
 
Y
T
 
T
G
 
G
E
 
D
V
 
V
S
 
S
A
 
G
K
 
A
I
 
F
I
 
L
A
 
A
S
 
K
F
 
L
G
 
G
V
 
C
E
 
S
Y
 
Y
V
 
V
I
 
V
L
 
V
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
E
 
T
Y
 
Y
F
 
H
Q
 
N
E
 
E
D
 
D
N
 
D
E
 
A
I
 
L
L
 
V
A
 
A
T
 
A
K
 
K
V
 
A
K
 
A
E
 
T
A
 
A
L
 
L
A
 
K
N
 
H
G
 
G
L
 
L
K
 
T
P
 
P
I
 
I
F
 
V
C
 
C
C
 
I
G
 
G
E
 
E
S
 
H
L
 
L
D
 
D
I
 
V
R
 
R
T
 
E
A
 
A
G
 
G
T
 
N
H
 
H
E
 
V
P
 
A
N
 
H
V
 
N
K
 
I
F
 
E
Q
 
Q
L
 
L
T
 
R
Q
 
G
S
 
S
L
 
L
F
 
A
D
 
G
L
 
L
S
 
L
P
 
A
E
 
E
D
 
Q
F
 
I
S
 
G
K
 
S
I
 
V
T
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
I
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
R
T
 
V
A
 
A
T
 
S
A
 
A
D
 
A
Q
 
D
A
 
A
Q
 
Q
E
 
E
M
 
V
H
 
C
A
 
A
A
 
A
L
 
I
R
 
R
R
 
K
H
 
E
I
 
L
A
 
A
S
 
S
H
 
L
Y
 
A
G
 
S
K
 
P
E
 
R
I
 
I
A
 
A
D
 
D
N
 
T
T
 
V
S
 
R
I
 
V
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
|
S
C
 
V
N
 
N
P
 
A
K
 
K
N
 
N
A
 
V
Q
 
G
E
 
D
I
 
I
F
 
V
S
 
A
K
 
Q
P
 
D
D
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
|
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
D
S
 
G
R
 
E
D
 
H
F
 
F

P9WG43 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see 2 papers)
45% identity, 98% coverage: 2:249/253 of query aligns to 3:251/261 of P9WG43

query
sites
P9WG43
R
 
R
K
 
K
K
 
P
I
 
L
V
 
I
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
|
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
M
 
L
T
 
N
F
 
H
D
 
Y
E
 
E
G
 
A
Q
 
I
K
 
A
L
 
L
T
 
V
S
 
Q
E
 
K
I
 
I
V
 
A
N
 
F
M
 
S
Y
 
L
K
 
P
D
 
D
E
 
K
N
 
Y
V
 
Y
K
 
D
D
 
R
V
 
V
V
 
D
A
 
V
I
 
A
L
 
V
N
 
I
P
 
P
P
 
P
F
 
F
P
 
T
H
 
D
I
 
L
F
 
R
P
 
S
V
 
V
K
 
Q
K
 
T
L
 
L
I
 
V
G
 
D
G
 
G
V
 
D
E
 
K
-
 
L
G
 
R
I
 
L
S
 
T
L
 
Y
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
D
C
 
L
S
 
S
D
 
P
K
 
H
E
 
D
A
 
S
G
 
G
A
 
A
F
 
Y
T
 
T
G
 
G
E
 
D
V
 
V
S
 
S
A
 
G
K
 
A
I
 
F
I
 
L
A
 
A
S
 
K
F
 
L
G
 
G
V
 
C
E
 
S
Y
 
Y
V
 
V
I
 
V
L
 
V
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
E
 
T
Y
 
Y
F
 
H
Q
 
N
E
 
E
D
 
D
N
 
D
E
 
A
I
 
L
L
 
V
A
 
A
T
 
A
K
 
K
V
 
A
K
 
A
E
 
T
A
 
A
L
 
L
A
 
K
N
 
H
G
 
G
L
 
L
K
 
T
P
 
P
I
 
I
F
 
V
C
 
C
C
 
I
G
 
G
E
 
E
S
 
H
L
 
L
D
 
D
I
 
V
R
 
R
T
 
E
A
 
A
G
 
G
T
 
N
H
 
H
E
 
V
P
 
A
N
 
H
V
 
N
K
 
I
F
 
E
Q
 
Q
L
 
L
T
 
R
Q
 
G
S
 
S
L
 
L
F
 
A
D
 
G
L
 
L
S
 
L
P
 
A
E
 
E
D
 
Q
F
 
I
S
 
G
K
 
S
I
 
V
T
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
I
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
R
T
 
V
A
 
A
T
 
S
A
 
A
D
 
A
Q
 
D
A
 
A
Q
 
Q
E
 
E
M
 
V
H
 
C
A
 
A
A
 
A
L
 
I
R
 
R
R
 
K
H
 
E
I
 
L
A
 
A
S
 
S
H
 
L
Y
 
A
G
 
S
K
 
P
E
 
R
I
 
I
A
 
A
D
 
D
N
 
T
T
 
V
S
 
R
I
 
V
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
C
 
V
N
 
N
P
 
A
K
 
K
N
 
N
A
 
V
Q
 
G
E
 
D
I
 
I
F
 
V
S
 
A
K
 
Q
P
 
D
D
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
D
S
 
G
R
 
E
D
 
H
F
 
F
V
 
A
D
 
T
I
 
L

P27876 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
42% identity, 99% coverage: 1:251/253 of query aligns to 1:248/253 of P27876

query
sites
P27876
M
 
M
R
 
R
K
 
K
K
 
P
I
 
I
V
 
I
A
 
A
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
M
 
M
N
 
N
M
 
K
T
 
T
F
 
L
D
 
G
E
 
E
G
 
A
Q
 
V
K
 
S
L
 
F
T
 
V
S
 
E
E
 
E
I
 
V
V
 
K
N
 
S
M
 
S
Y
 
I
K
 
P
D
 
A
E
 
A
N
 
D
V
 
K
K
 
A
D
 
E
V
 
A
V
 
V
A
 
V
I
 
C
L
 
A
N
 
-
P
 
-
P
 
-
F
 
-
P
 
P
H
 
A
I
 
L
F
 
F
P
 
-
V
 
L
K
 
E
K
 
K
L
 
L
I
 
A
G
 
S
G
 
A
V
 
V
E
 
K
G
 
G
I
 
T
S
 
D
L
 
L
-
 
K
-
 
V
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
C
 
M
S
 
H
D
 
F
K
 
E
E
 
E
A
 
S
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
S
 
S
A
 
P
K
 
V
I
 
A
I
 
L
A
 
K
S
 
D
F
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
D
Y
 
Y
V
 
C
I
 
V
L
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
E
 
E
Y
 
M
F
 
F
Q
 
A
E
 
E
D
 
T
N
 
D
E
 
E
I
 
T
L
 
V
A
 
N
T
 
K
K
 
K
V
 
A
K
 
H
E
 
A
A
 
A
L
 
F
A
 
K
N
 
H
G
 
G
L
 
I
K
 
V
P
 
P
I
 
I
F
 
I
C
 
C
C
 
V
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
D
 
E
I
 
E
R
 
R
T
 
E
A
 
A
G
 
G
T
 
K
H
 
T
E
 
N
P
 
D
N
 
L
V
 
V
K
 
A
F
 
D
Q
 
Q
L
 
V
T
 
K
Q
 
K
S
 
G
L
 
L
F
 
A
D
 
G
L
 
L
S
 
S
P
 
E
E
 
E
D
 
Q
F
 
V
S
 
A
K
 
A
I
 
S
T
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
I
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
S
A
 
S
T
 
T
A
 
A
D
 
K
Q
 
D
A
 
A
Q
 
N
E
 
D
M
 
V
H
 
C
A
 
A
A
 
H
L
 
I
R
 
R
R
 
K
H
 
T
I
 
V
A
 
A
S
 
E
H
 
S
Y
 
F
G
 
S
K
 
Q
E
 
E
I
 
A
A
 
A
D
 
D
N
 
K
T
 
L
S
 
R
I
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
C
 
V
N
 
K
P
 
P
K
 
A
N
 
N
A
 
I
Q
 
K
E
 
E
I
 
Y
F
 
M
S
 
A
K
 
E
P
 
S
D
 
D
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
E
S
 
P
R
 
Q
D
 
S
F
 
F
V
 
V
D
 
Q
I
 
L
I
 
L
K
 
E

3uwzA Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with glycerol-2-phosphate (see paper)
40% identity, 99% coverage: 1:251/253 of query aligns to 2:251/254 of 3uwzA

query
sites
3uwzA
M
 
M
R
 
R
K
 
T
K
 
P
I
 
I
V
 
I
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
M
 
K
T
 
T
F
 
V
D
 
Q
E
 
E
G
 
A
Q
 
K
K
 
D
L
 
F
T
 
V
S
 
N
E
 
A
I
 
L
V
 
P
N
 
T
M
 
L
Y
 
-
K
 
-
D
 
-
E
 
P
N
 
D
V
 
S
K
 
K
D
 
E
V
 
V
V
 
E
A
 
S
I
 
V
L
 
I
N
 
C
P
 
A
P
 
P
F
 
A
P
 
I
H
 
Q
I
 
L
F
 
D
P
 
A
V
 
L
K
 
T
K
 
T
L
 
A
I
 
V
-
 
K
-
 
E
G
 
G
G
 
K
V
 
A
E
 
Q
G
 
G
I
 
L
S
 
E
L
 
I
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
C
 
T
S
 
Y
D
 
F
K
 
E
E
 
D
A
 
N
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
T
S
 
S
A
 
P
K
 
V
I
 
A
I
 
L
A
 
A
S
 
D
F
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
K
Y
 
Y
V
 
V
I
 
V
L
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
E
 
E
Y
 
L
F
 
F
Q
 
H
E
 
E
D
 
T
N
 
D
E
 
E
I
 
E
L
 
I
A
 
N
T
 
K
K
 
K
V
 
A
K
 
H
E
 
A
A
 
I
L
 
F
A
 
K
N
 
H
G
 
G
L
 
M
K
 
T
P
 
P
I
 
I
F
 
I
C
 
C
C
 
V
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
D
D
 
E
I
 
E
R
 
R
T
 
E
A
 
S
G
 
G
T
 
K
H
 
A
E
 
N
P
 
D
N
 
V
V
 
V
K
 
G
F
 
E
Q
 
Q
L
 
V
T
 
K
Q
 
K
S
 
A
L
 
V
F
 
A
D
 
G
L
 
L
S
 
S
P
 
E
E
 
D
D
 
Q
F
 
L
S
 
K
K
 
S
I
 
V
T
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
I
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
S
A
 
S
T
 
T
A
 
S
D
 
E
Q
 
D
A
 
A
Q
 
N
E
 
E
M
 
M
H
 
C
A
 
A
A
 
F
L
 
V
R
 
R
R
 
Q
H
 
T
I
 
I
A
 
A
S
 
D
H
 
L
Y
 
S
G
 
S
K
 
K
E
 
E
I
 
V
A
 
S
D
 
E
N
 
A
T
 
T
S
 
R
I
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
|
G
G
 
G
S
|
S
C
 
V
N
 
K
P
 
P
K
 
N
N
 
N
A
 
I
Q
 
K
E
 
E
I
 
Y
F
 
M
S
 
A
K
 
Q
P
 
T
D
 
D
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
S
 
V
R
 
E
D
 
D
F
 
F
V
 
V
D
 
Q
I
 
L
I
 
L
K
 
E

3uwwA Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with 3-phosphoglyceric acid (see paper)
40% identity, 99% coverage: 1:251/253 of query aligns to 2:251/254 of 3uwwA

query
sites
3uwwA
M
 
M
R
 
R
K
 
T
K
 
P
I
 
I
V
 
I
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
M
 
K
T
 
T
F
 
V
D
 
Q
E
 
E
G
 
A
Q
 
K
K
 
D
L
 
F
T
 
V
S
 
N
E
 
A
I
 
L
V
 
P
N
 
T
M
 
L
Y
 
-
K
 
-
D
 
-
E
 
P
N
 
D
V
 
S
K
 
K
D
 
E
V
 
V
V
 
E
A
 
S
I
 
V
L
 
I
N
 
C
P
 
A
P
 
P
F
 
A
P
 
I
H
 
Q
I
 
L
F
 
D
P
 
A
V
 
L
K
 
T
K
 
T
L
 
A
I
 
V
-
 
K
-
 
E
G
 
G
G
 
K
V
 
A
E
 
Q
G
 
G
I
 
L
S
 
E
L
 
I
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
C
 
T
S
 
Y
D
 
F
K
 
E
E
 
D
A
 
N
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
T
S
 
S
A
 
P
K
 
V
I
 
A
I
 
L
A
 
A
S
 
D
F
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
K
Y
 
Y
V
 
V
I
 
V
L
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
E
 
E
Y
 
L
F
 
F
Q
 
H
E
 
E
D
 
T
N
 
D
E
 
E
I
 
E
L
 
I
A
 
N
T
 
K
K
 
K
V
 
A
K
 
H
E
 
A
A
 
I
L
 
F
A
 
K
N
 
H
G
 
G
L
 
M
K
 
T
P
 
P
I
 
I
F
 
I
C
 
C
C
 
V
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
D
D
 
E
I
 
E
R
 
R
T
 
E
A
 
S
G
 
G
T
 
K
H
 
A
E
 
N
P
 
D
N
 
V
V
 
V
K
 
G
F
 
E
Q
 
Q
L
 
V
T
 
K
Q
 
K
S
 
A
L
 
V
F
 
A
D
 
G
L
 
L
S
 
S
P
 
E
E
 
D
D
 
Q
F
 
L
S
 
K
K
 
S
I
 
V
T
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
I
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
S
A
 
S
T
 
T
A
 
S
D
 
E
Q
 
D
A
 
A
Q
 
N
E
 
E
M
 
M
H
 
C
A
 
A
A
 
F
L
 
V
R
 
R
R
 
Q
H
 
T
I
 
I
A
 
A
S
 
D
H
 
L
Y
 
S
G
 
S
K
 
K
E
 
E
I
 
V
A
 
S
D
 
E
N
 
A
T
 
T
S
 
R
I
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
C
 
V
N
 
K
P
 
P
K
 
N
N
 
N
A
 
I
Q
 
K
E
 
E
I
 
Y
F
 
M
S
 
A
K
 
Q
P
 
T
D
 
D
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
S
 
V
R
 
E
D
 
D
F
 
F
V
 
V
D
 
Q
I
 
L
I
 
L
K
 
E

3uwuA Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with glycerol-3-phosphate (see paper)
40% identity, 99% coverage: 1:251/253 of query aligns to 1:250/253 of 3uwuA

query
sites
3uwuA
M
 
M
R
 
R
K
 
T
K
 
P
I
 
I
V
 
I
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
M
 
K
T
 
T
F
 
V
D
 
Q
E
 
E
G
 
A
Q
 
K
K
 
D
L
 
F
T
 
V
S
 
N
E
 
A
I
 
L
V
 
P
N
 
T
M
 
L
Y
 
-
K
 
-
D
 
-
E
 
P
N
 
D
V
 
S
K
 
K
D
 
E
V
 
V
V
 
E
A
 
S
I
 
V
L
 
I
N
 
C
P
 
A
P
 
P
F
 
A
P
 
I
H
 
Q
I
 
L
F
 
D
P
 
A
V
 
L
K
 
T
K
 
T
L
 
A
I
 
V
-
 
K
-
 
E
G
 
G
G
 
K
V
 
A
E
 
Q
G
 
G
I
 
L
S
 
E
L
 
I
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
C
 
T
S
 
Y
D
 
F
K
 
E
E
 
D
A
 
N
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
T
S
 
S
A
 
P
K
 
V
I
 
A
I
 
L
A
 
A
S
 
D
F
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
K
Y
 
Y
V
 
V
I
 
V
L
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
E
 
E
Y
 
L
F
 
F
Q
 
H
E
 
E
D
 
T
N
 
D
E
 
E
I
 
E
L
 
I
A
 
N
T
 
K
K
 
K
V
 
A
K
 
H
E
 
A
A
 
I
L
 
F
A
 
K
N
 
H
G
 
G
L
 
M
K
 
T
P
 
P
I
 
I
F
 
I
C
 
C
C
 
V
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
D
D
 
E
I
 
E
R
 
R
T
 
E
A
 
S
G
 
G
T
 
K
H
 
A
E
 
N
P
 
D
N
 
V
V
 
V
K
 
G
F
 
E
Q
 
Q
L
 
V
T
 
K
Q
 
K
S
 
A
L
 
V
F
 
A
D
 
G
L
 
L
S
 
S
P
 
E
E
 
D
D
 
Q
F
 
L
S
 
K
K
 
S
I
 
V
T
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
I
 
I
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
S
A
 
S
T
 
T
A
 
S
D
 
E
Q
 
D
A
 
A
Q
 
N
E
 
E
M
 
M
H
 
C
A
 
A
A
 
F
L
 
V
R
 
R
R
 
Q
H
 
T
I
 
I
A
 
A
S
 
D
H
 
L
Y
 
S
G
 
S
K
 
K
E
 
E
I
 
V
A
 
S
D
 
E
N
 
A
T
 
T
S
 
R
I
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
C
 
V
N
 
K
P
 
P
K
 
N
N
 
N
A
 
I
Q
 
K
E
 
E
I
 
Y
F
 
M
S
 
A
K
 
Q
P
 
T
D
 
D
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
|
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
S
 
V
R
 
E
D
 
D
F
 
F
V
 
V
D
 
Q
I
 
L
I
 
L
K
 
E

Q6GIL6 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Staphylococcus aureus (strain MRSA252) (see paper)
40% identity, 99% coverage: 1:251/253 of query aligns to 1:250/253 of Q6GIL6

query
sites
Q6GIL6
M
 
M
R
 
R
K
 
T
K
 
P
I
 
I
V
 
I
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
|
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
M
 
K
T
 
T
F
 
V
D
 
Q
E
 
E
G
 
A
Q
 
K
K
 
D
L
 
F
T
 
V
S
 
N
E
 
A
I
 
L
V
 
P
N
 
T
M
 
L
Y
 
-
K
 
-
D
 
-
E
 
P
N
 
D
V
 
S
K
 
K
D
 
E
V
 
V
V
 
E
A
 
S
I
 
V
L
 
I
N
 
C
P
 
A
P
 
P
F
 
A
P
 
I
H
 
Q
I
 
L
F
 
D
P
 
A
V
 
L
K
 
T
K
 
T
L
 
A
I
 
V
-
 
K
-
 
E
G
 
G
G
 
K
V
 
A
E
 
Q
G
 
G
I
 
L
S
 
E
L
 
I
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
C
 
T
S
 
Y
D
 
F
K
 
E
E
 
D
A
 
N
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
T
S
 
S
A
 
P
K
 
V
I
 
A
I
 
L
A
 
A
S
 
D
F
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
K
Y
 
Y
V
 
V
I
 
V
L
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
E
 
E
Y
 
L
F
 
F
Q
 
H
E
 
E
D
 
T
N
 
D
E
 
E
I
 
E
L
 
I
A
 
N
T
 
K
K
 
K
V
 
A
K
 
H
E
 
A
A
 
I
L
 
F
A
 
K
N
 
H
G
 
G
L
 
M
K
 
T
P
 
P
I
 
I
F
 
I
C
 
C
C
 
V
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
D
D
 
E
I
 
E
R
 
R
T
 
E
A
 
S
G
 
G
T
 
K
H
 
A
E
 
N
P
 
D
N
 
V
V
 
V
K
 
G
F
 
E
Q
 
Q
L
 
V
T
 
K
Q
 
K
S
 
A
L
 
V
F
 
A
D
 
G
L
 
L
S
 
S
P
 
E
E
 
D
D
 
Q
F
 
L
S
 
K
K
 
S
I
 
V
T
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
I
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
S
A
 
S
T
 
T
A
 
S
D
 
E
Q
 
D
A
 
A
Q
 
N
E
 
E
M
 
M
H
 
C
A
 
A
A
 
F
L
 
V
R
 
R
R
 
Q
H
 
T
I
 
I
A
 
A
S
 
D
H
 
L
Y
 
S
G
 
S
K
 
K
E
 
E
I
 
V
A
 
S
D
 
E
N
 
A
T
 
T
S
 
R
I
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
C
 
V
N
 
K
P
 
P
K
 
N
N
 
N
A
 
I
Q
 
K
E
 
E
I
 
Y
F
 
M
S
 
A
K
 
Q
P
 
T
D
 
D
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
S
 
V
R
 
E
D
 
D
F
 
F
V
 
V
D
 
Q
I
 
L
I
 
L
K
 
E

3uwvA Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with 2-phosphoglyceric acid (see paper)
40% identity, 99% coverage: 1:251/253 of query aligns to 3:252/255 of 3uwvA

query
sites
3uwvA
M
 
M
R
 
R
K
 
T
K
 
P
I
 
I
V
 
I
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
M
 
K
T
 
T
F
 
V
D
 
Q
E
 
E
G
 
A
Q
 
K
K
 
D
L
 
F
T
 
V
S
 
N
E
 
A
I
 
L
V
 
P
N
 
T
M
 
L
Y
 
-
K
 
-
D
 
-
E
 
P
N
 
D
V
 
S
K
 
K
D
 
E
V
 
V
V
 
E
A
 
S
I
 
V
L
 
I
N
 
C
P
 
A
P
 
P
F
 
A
P
 
I
H
 
Q
I
 
L
F
 
D
P
 
A
V
 
L
K
 
T
K
 
T
L
 
A
I
 
V
-
 
K
-
 
E
G
 
G
G
 
K
V
 
A
E
 
Q
G
 
G
I
 
L
S
 
E
L
 
I
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
C
 
T
S
 
Y
D
 
F
K
 
E
E
 
D
A
 
N
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
T
S
 
S
A
 
P
K
 
V
I
 
A
I
 
L
A
 
A
S
 
D
F
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
K
Y
 
Y
V
 
V
I
 
V
L
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
E
 
E
Y
 
L
F
 
F
Q
 
H
E
 
E
D
 
T
N
 
D
E
 
E
I
 
E
L
 
I
A
 
N
T
 
K
K
 
K
V
 
A
K
 
H
E
 
A
A
 
I
L
 
F
A
 
K
N
 
H
G
 
G
L
 
M
K
 
T
P
 
P
I
 
I
F
 
I
C
 
C
C
 
V
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
D
D
 
E
I
 
E
R
 
R
T
 
E
A
 
S
G
 
G
T
 
K
H
 
A
E
 
N
P
 
D
N
 
V
V
 
V
K
 
G
F
 
E
Q
 
Q
L
 
V
T
 
K
Q
 
K
S
 
A
L
 
V
F
 
A
D
 
G
L
 
L
S
 
S
P
 
E
E
 
D
D
 
Q
F
 
L
S
 
K
K
 
S
I
 
V
T
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
I
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
S
A
 
S
T
 
T
A
 
S
D
 
E
Q
 
D
A
 
A
Q
 
N
E
 
E
M
 
M
H
 
C
A
 
A
A
 
F
L
 
V
R
 
R
R
 
Q
H
 
T
I
 
I
A
 
A
S
 
D
H
 
L
Y
 
S
G
 
S
K
 
K
E
 
E
I
 
V
A
 
S
D
 
E
N
 
A
T
 
T
S
 
R
I
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
C
 
V
N
x
K
P
 
P
K
 
N
N
 
N
A
 
I
Q
 
K
E
 
E
I
 
Y
F
 
M
S
 
A
K
 
Q
P
 
T
D
 
D
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
S
 
V
R
 
E
D
 
D
F
 
F
V
 
V
D
 
Q
I
 
L
I
 
L
K
 
E

P60174 Triosephosphate isomerase; TIM; Methylglyoxal synthase; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1; EC 4.2.3.3 from Homo sapiens (Human) (see 7 papers)
46% identity, 99% coverage: 2:252/253 of query aligns to 5:247/249 of P60174

query
sites
P60174
R
 
R
K
 
K
K
 
F
I
 
F
V
 
V
A
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
M
 
-
T
 
-
F
 
-
D
 
G
E
 
R
G
 
K
Q
 
Q
K
 
S
L
 
L
T
 
G
S
 
E
E
 
L
I
 
I
V
 
G
N
 
T
M
 
L
Y
 
N
K
 
A
D
 
A
E
 
K
N
 
V
V
 
P
K
 
A
D
 
D
V
 
T
V
 
E
A
 
V
I
 
V
L
 
C
N
 
A
P
 
P
P
 
P
F
 
T
P
 
A
H
 
Y
I
 
I
-
 
D
F
 
F
P
 
A
V
 
R
K
 
Q
K
 
K
L
 
L
I
 
D
G
 
-
G
 
-
V
 
-
E
 
P
G
 
K
I
 
I
S
 
A
L
 
V
G
 
A
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
C
 
C
S
 
Y
D
 
K
K
 
V
E
 
T
A
 
N
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
S
 
S
A
 
P
K
 
G
I
 
M
I
 
I
A
 
K
S
 
D
F
 
C
G
 
G
V
 
A
E
 
T
Y
 
W
V
 
V
I
 
V
L
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
E
 
H
Y
 
V
F
 
F
Q
 
G
E
|
E
D
 
S
N
 
D
E
 
E
I
 
L
L
 
I
A
 
G
T
 
Q
K
 
K
V
 
V
K
 
A
E
 
H
A
 
A
L
 
L
A
 
A
N
 
E
G
 
G
L
 
L
K
x
G
P
 
V
I
 
I
F
 
A
C
 
C
C
 
I
G
 
G
E
 
E
S
 
K
L
 
L
D
 
D
I
 
E
R
 
R
T
 
E
A
 
A
G
 
G
T
 
I
H
 
T
E
 
E
P
 
-
N
 
K
V
 
V
K
 
V
F
 
F
Q
 
E
L
 
Q
T
 
T
Q
 
K
S
 
V
L
 
I
F
 
A
D
 
D
L
 
-
S
 
N
P
 
V
E
 
K
D
 
D
F
 
W
S
 
S
K
 
K
I
 
V
T
 
V
I
 
L
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
I
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
T
A
 
A
T
 
T
A
 
P
D
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
E
 
E
M
 
V
H
 
H
A
 
E
A
 
K
L
 
L
R
 
R
R
 
G
H
 
W
I
 
L
A
 
K
S
 
S
H
 
N
Y
 
V
G
 
S
K
 
D
E
 
A
I
 
V
A
 
A
D
 
Q
N
 
S
T
 
T
S
 
R
I
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
 
S
C
 
V
N
 
T
P
 
G
K
 
A
N
 
T
A
 
C
Q
 
K
E
 
E
I
 
L
F
 
A
S
 
S
K
 
Q
P
 
P
D
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
F
L
 
L
I
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
S
 
P
R
 
-
D
 
E
F
|
F
V
 
V
D
 
D
I
 
I
I
 
I
K
 
N
S
 
A

4pocB Structure of triosephosphate isomerase wild type human enzyme. (see paper)
46% identity, 99% coverage: 2:252/253 of query aligns to 3:245/247 of 4pocB

query
sites
4pocB
R
 
R
K
 
K
K
 
F
I
 
F
V
 
V
A
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
M
 
-
T
 
-
F
 
-
D
 
G
E
 
R
G
 
K
Q
 
Q
K
 
S
L
 
L
T
 
G
S
 
E
E
 
L
I
 
I
V
 
G
N
 
T
M
 
L
Y
 
N
K
 
A
D
 
A
E
 
K
N
 
V
V
 
P
K
 
A
D
 
D
V
 
T
V
 
E
A
 
V
I
 
V
L
 
C
N
 
A
P
 
P
P
 
P
F
 
T
P
 
A
H
 
Y
I
 
I
-
 
D
F
 
F
P
 
A
V
 
R
K
 
Q
K
 
K
L
 
L
I
 
D
G
 
-
G
 
-
V
 
-
E
 
P
G
 
K
I
 
I
S
 
A
L
 
V
G
 
A
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
C
 
C
S
 
Y
D
 
K
K
 
V
E
 
T
A
 
N
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
S
 
S
A
 
P
K
 
G
I
 
M
I
 
I
A
 
K
S
 
D
F
 
C
G
 
G
V
 
A
E
 
T
Y
 
W
V
 
V
I
 
V
L
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
E
 
H
Y
 
V
F
 
F
Q
 
G
E
 
E
D
 
S
N
 
D
E
 
E
I
 
L
L
 
I
A
 
G
T
 
Q
K
 
K
V
 
V
K
 
A
E
 
H
A
 
A
L
 
L
A
 
A
N
 
E
G
 
G
L
 
L
K
 
G
P
 
V
I
 
I
F
 
A
C
 
C
C
 
I
G
 
G
E
 
E
S
 
K
L
 
L
D
 
D
I
 
E
R
 
R
T
 
E
A
 
A
G
 
G
T
 
I
H
 
T
E
 
E
P
 
-
N
 
K
V
 
V
K
 
V
F
 
F
Q
 
E
L
 
Q
T
 
T
Q
 
K
S
 
V
L
 
I
F
 
A
D
 
D
L
 
-
S
 
N
P
 
V
E
 
K
D
 
D
F
 
W
S
 
S
K
 
K
I
 
V
T
 
V
I
 
L
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
I
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
T
A
 
A
T
 
T
A
 
P
D
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
E
 
E
M
 
V
H
 
H
A
 
E
A
 
K
L
 
L
R
 
R
R
 
G
H
 
W
I
 
L
A
 
K
S
 
S
H
 
N
Y
 
V
G
 
S
K
 
D
E
 
A
I
 
V
A
 
A
D
 
Q
N
 
S
T
 
T
S
 
R
I
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
C
 
V
N
 
T
P
 
G
K
 
A
N
 
T
A
 
C
Q
 
K
E
 
E
I
 
L
F
 
A
S
 
S
K
 
Q
P
 
P
D
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
F
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
S
 
P
R
 
-
D
 
E
F
 
F
V
 
V
D
 
D
I
 
I
I
 
I
K
 
N
S
 
A

1htiB Crystal structure of recombinant human triosephosphate isomerase at 2.8 angstroms resolution. Triosephosphate isomerase related human genetic disorders and comparison with the trypanosomal enzyme (see paper)
46% identity, 99% coverage: 2:252/253 of query aligns to 4:246/248 of 1htiB

query
sites
1htiB
R
 
R
K
 
K
K
 
F
I
 
F
V
 
V
A
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
M
 
-
T
 
-
F
 
-
D
 
G
E
 
R
G
 
K
Q
 
Q
K
 
S
L
 
L
T
 
G
S
 
E
E
 
L
I
 
I
V
 
G
N
 
T
M
 
L
Y
 
N
K
 
A
D
 
A
E
 
K
N
 
V
V
 
P
K
 
A
D
 
D
V
 
T
V
 
E
A
 
V
I
 
V
L
 
C
N
 
A
P
 
P
P
 
P
F
 
T
P
 
A
H
 
Y
I
 
I
-
 
D
F
 
F
P
 
A
V
 
R
K
 
Q
K
 
K
L
 
L
I
 
D
G
 
-
G
 
-
V
 
-
E
 
P
G
 
K
I
 
I
S
 
A
L
 
V
G
 
A
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
C
 
C
S
 
Y
D
 
K
K
 
V
E
 
T
A
 
N
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
S
 
S
A
 
P
K
 
G
I
 
M
I
 
I
A
 
K
S
 
D
F
 
C
G
 
G
V
 
A
E
 
T
Y
 
W
V
 
V
I
 
V
L
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
E
 
H
Y
 
V
F
 
F
Q
 
G
E
 
E
D
 
S
N
 
D
E
 
E
I
 
L
L
 
I
A
 
G
T
 
Q
K
 
K
V
 
V
K
 
A
E
 
H
A
 
A
L
 
L
A
 
A
N
 
E
G
 
G
L
 
L
K
 
G
P
 
V
I
 
I
F
 
A
C
 
C
C
 
I
G
 
G
E
 
E
S
 
K
L
 
L
D
 
D
I
 
E
R
 
R
T
 
E
A
 
A
G
 
G
T
 
I
H
 
T
E
 
E
P
 
-
N
 
K
V
 
V
K
 
V
F
 
F
Q
 
E
L
 
Q
T
 
T
Q
 
K
S
 
V
L
 
I
F
 
A
D
 
D
L
 
-
S
 
N
P
 
V
E
 
K
D
 
D
F
 
W
S
 
S
K
 
K
I
 
V
T
 
V
I
 
L
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
I
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
T
A
 
A
T
 
T
A
 
P
D
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
E
 
E
M
 
V
H
 
H
A
 
E
A
 
K
L
 
L
R
 
R
R
 
G
H
 
W
I
 
L
A
 
K
S
 
S
H
 
N
Y
 
V
G
 
S
K
 
D
E
 
A
I
 
V
A
 
A
D
 
Q
N
 
S
T
 
T
S
 
R
I
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
|
S
C
 
V
N
 
T
P
 
G
K
 
A
N
 
T
A
 
C
Q
 
K
E
 
E
I
 
L
F
 
A
S
 
S
K
 
Q
P
 
P
D
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
F
L
|
L
I
 
V
G
|
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
S
 
P
R
 
-
D
 
E
F
 
F
V
 
V
D
 
D
I
 
I
I
 
I
K
 
N
S
 
A

P17751 Triosephosphate isomerase; TIM; Methylglyoxal synthase; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1; EC 4.2.3.3 from Mus musculus (Mouse) (see paper)
46% identity, 99% coverage: 2:252/253 of query aligns to 5:247/249 of P17751

query
sites
P17751
R
 
R
K
 
K
K
 
F
I
 
F
V
 
V
A
 
G
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
M
 
M
N
 
N
M
 
G
T
 
R
F
 
-
D
 
-
E
 
-
G
 
-
Q
 
K
K
 
K
L
 
C
T
 
L
S
 
G
E
 
E
I
 
L
V
 
I
N
 
C
M
 
T
Y
 
L
K
 
N
D
 
A
E
 
A
N
 
N
V
 
V
-
 
P
K
 
A
D
 
G
V
 
T
V
 
E
A
 
V
I
 
V
L
 
C
N
 
A
P
 
P
P
 
P
F
 
T
P
 
A
H
 
Y
I
 
I
-
 
D
F
 
F
P
 
A
V
 
R
K
 
Q
K
 
K
L
 
L
I
 
D
G
 
-
G
 
-
V
 
-
E
 
P
G
 
K
I
 
I
S
 
A
L
 
V
G
 
A
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
C
 
C
S
 
Y
D
 
K
K
 
V
E
 
T
A
 
N
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
S
 
S
A
 
P
K
 
G
I
 
M
I
 
I
A
 
K
S
 
D
F
 
L
G
 
G
V
 
A
E
 
T
Y
 
W
V
 
V
I
 
V
L
 
L
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
E
 
H
Y
 
V
F
 
F
Q
 
G
E
 
E
D
 
S
N
 
D
E
 
E
I
 
L
L
 
I
A
 
G
T
 
Q
K
 
K
V
 
V
K
 
S
E
 
H
A
 
A
L
 
L
A
 
A
N
 
E
G
 
G
L
 
L
K
 
G
P
 
V
I
 
I
F
 
A
C
 
C
C
 
I
G
 
G
E
 
E
S
 
K
L
 
L
D
 
D
I
 
E
R
 
R
T
 
E
A
 
A
G
 
G
T
 
I
H
 
T
E
 
E
P
 
-
N
 
K
V
 
V
K
 
V
F
 
F
Q
 
E
L
 
Q
T
 
T
Q
 
K
S
 
V
L
 
I
F
 
A
D
 
D
L
 
-
S
 
N
P
 
V
E
 
K
D
 
D
F
 
W
S
 
S
K
 
K
I
 
V
T
 
V
I
x
L
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
I
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
T
A
 
A
T
 
T
A
 
P
D
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
E
 
E
M
 
V
H
 
H
A
 
E
A
 
K
L
 
L
R
 
R
R
 
G
H
 
W
I
x
L
A
 
K
S
 
S
H
 
N
Y
 
V
G
 
N
K
 
D
E
 
G
I
 
V
A
 
A
D
 
Q
N
 
S
T
 
T
S
 
R
I
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
 
S
C
 
V
N
 
T
P
 
G
K
 
A
N
 
T
A
 
C
Q
 
K
E
 
E
I
 
L
F
 
A
S
 
S
K
 
Q
P
 
P
D
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
F
L
 
L
I
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
S
 
P
R
 
-
D
 
E
F
 
F
V
 
V
D
 
D
I
 
I
I
 
I
K
 
N
S
 
A

4owgA Crystal structure of rabbit muscle triosephosphate isomerase-pep complex
45% identity, 99% coverage: 2:252/253 of query aligns to 2:244/246 of 4owgA

query
sites
4owgA
R
 
R
K
 
K
K
 
F
I
 
F
V
 
V
A
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
M
 
-
T
 
-
F
 
-
D
 
G
E
 
R
G
 
K
Q
 
K
K
 
N
L
 
L
T
 
G
S
 
E
E
 
L
I
 
I
V
 
T
N
 
T
M
 
L
Y
 
N
K
 
A
D
 
A
E
 
K
N
 
V
V
 
P
K
 
A
D
 
D
V
 
T
V
 
E
A
 
V
I
 
V
L
 
C
N
 
A
P
 
P
P
 
P
F
 
T
P
 
A
H
 
Y
I
 
I
-
 
D
F
 
F
P
 
A
V
 
R
K
 
Q
K
 
K
L
 
L
I
 
D
G
 
-
G
 
-
V
 
-
E
 
P
G
 
K
I
 
I
S
 
A
L
 
V
G
 
A
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
C
 
C
S
 
Y
D
 
K
K
 
V
E
 
T
A
 
N
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
S
 
S
A
 
P
K
 
G
I
 
M
I
 
I
A
 
K
S
 
D
F
 
C
G
 
G
V
 
A
E
 
T
Y
 
W
V
 
V
I
 
V
L
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
E
 
H
Y
 
V
F
 
F
Q
 
G
E
 
E
D
 
S
N
 
D
E
 
E
I
 
L
L
 
I
A
 
G
T
 
Q
K
 
K
V
 
V
K
 
A
E
 
H
A
 
A
L
 
L
A
 
S
N
 
E
G
 
G
L
 
L
K
 
G
P
 
V
I
 
I
F
 
A
C
 
C
C
 
I
G
 
G
E
 
E
S
 
K
L
 
L
D
 
D
I
 
E
R
 
R
T
 
E
A
 
A
G
 
G
T
 
I
H
 
T
E
 
E
P
 
-
N
 
K
V
 
V
K
 
V
F
 
F
Q
 
E
L
 
Q
T
 
T
Q
 
K
S
 
V
L
 
I
F
 
A
D
 
D
L
 
-
S
 
N
P
 
V
E
 
K
D
 
D
F
 
W
S
 
S
K
 
K
I
 
V
T
 
V
I
 
L
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
I
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
T
A
 
A
T
 
T
A
 
P
D
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
E
 
E
M
 
V
H
 
H
A
 
E
A
 
K
L
 
L
R
 
R
R
 
G
H
 
W
I
 
L
A
 
K
S
 
S
H
 
N
Y
 
V
G
 
S
K
 
D
E
 
A
I
 
V
A
 
A
D
 
Q
N
 
S
T
 
T
S
 
R
I
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
|
S
C
 
V
N
 
T
P
 
G
K
 
A
N
 
T
A
 
C
Q
 
K
E
 
E
I
 
L
F
 
A
S
 
S
K
 
Q
P
 
P
D
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
F
L
|
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
S
 
P
R
 
-
D
 
E
F
 
F
V
 
V
D
 
D
I
 
I
I
 
I
K
 
N
S
 
A

P00939 Triosephosphate isomerase; TIM; Methylglyoxal synthase; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1; EC 4.2.3.3 from Oryctolagus cuniculus (Rabbit) (see 2 papers)
45% identity, 99% coverage: 2:252/253 of query aligns to 5:247/249 of P00939

query
sites
P00939
R
 
R
K
 
K
K
 
F
I
 
F
V
 
V
A
 
G
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
M
 
M
N
|
N
M
 
-
T
 
-
F
 
-
D
 
G
E
 
R
G
 
K
Q
 
K
K
 
N
L
 
L
T
 
G
S
 
E
E
 
L
I
 
I
V
 
T
N
 
T
M
 
L
Y
 
N
K
 
A
D
 
A
E
 
K
N
 
V
V
 
P
K
 
A
D
 
D
V
 
T
V
 
E
A
 
V
I
 
V
L
 
C
N
 
A
P
 
P
P
 
P
F
 
T
P
 
A
H
 
Y
I
 
I
-
 
D
F
 
F
P
 
A
V
 
R
K
 
Q
K
 
K
L
 
L
I
 
D
G
 
-
G
 
-
V
 
-
E
 
P
G
 
K
I
 
I
S
 
A
L
 
V
G
 
A
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
C
 
C
S
 
Y
D
 
K
K
 
V
E
 
T
A
x
N
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
S
 
S
A
 
P
K
 
G
I
 
M
I
 
I
A
 
K
S
 
D
F
 
C
G
 
G
V
 
A
E
 
T
Y
 
W
V
 
V
I
 
V
L
 
L
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
E
 
H
Y
 
V
F
 
F
Q
 
G
E
 
E
D
 
S
N
 
D
E
 
E
I
 
L
L
 
I
A
 
G
T
 
Q
K
 
K
V
 
V
K
 
A
E
 
H
A
 
A
L
 
L
A
 
S
N
 
E
G
 
G
L
 
L
K
 
G
P
 
V
I
 
I
F
 
A
C
 
C
C
 
I
G
 
G
E
 
E
S
 
K
L
 
L
D
 
D
I
 
E
R
 
R
T
 
E
A
 
A
G
 
G
T
 
I
H
 
T
E
 
E
P
 
-
N
 
K
V
 
V
K
 
V
F
 
F
Q
 
E
L
 
Q
T
 
T
Q
 
K
S
 
V
L
 
I
F
 
A
D
 
D
L
 
-
S
 
N
P
 
V
E
 
K
D
 
D
F
 
W
S
 
S
K
 
K
I
 
V
T
 
V
I
 
L
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
I
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
T
A
 
A
T
 
T
A
 
P
D
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
E
 
E
M
 
V
H
 
H
A
 
E
A
 
K
L
 
L
R
 
R
R
 
G
H
 
W
I
 
L
A
 
K
S
 
S
H
 
N
Y
 
V
G
 
S
K
 
D
E
 
A
I
 
V
A
 
A
D
 
Q
N
 
S
T
 
T
S
 
R
I
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
 
S
C
 
V
N
 
T
P
 
G
K
 
A
N
 
T
A
 
C
Q
 
K
E
 
E
I
 
L
F
 
A
S
 
S
K
 
Q
P
 
P
D
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
F
L
 
L
I
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
K
 
K
S
 
P
R
 
-
D
 
E
F
 
F
V
 
V
D
 
D
I
 
I
I
 
I
K
 
N
S
 
A

1r2rB Crystal structure of rabbit muscle triosephosphate isomerase (see paper)
45% identity, 99% coverage: 2:252/253 of query aligns to 3:245/247 of 1r2rB

query
sites
1r2rB
R
 
R
K
 
K
K
 
F
I
 
F
V
 
V
A
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
M
 
-
T
 
-
F
 
-
D
 
G
E
 
R
G
 
K
Q
 
K
K
 
N
L
 
L
T
 
G
S
 
E
E
 
L
I
 
I
V
 
T
N
 
T
M
 
L
Y
 
N
K
 
A
D
 
A
E
 
K
N
 
V
V
 
P
K
 
A
D
 
D
V
 
T
V
 
E
A
 
V
I
 
V
L
 
C
N
 
A
P
 
P
P
 
P
F
 
T
P
 
A
H
 
Y
I
 
I
-
 
D
F
 
F
P
 
A
V
 
R
K
 
Q
K
 
K
L
 
L
I
 
D
G
 
-
G
 
-
V
 
-
E
 
P
G
 
K
I
 
I
S
 
A
L
 
V
G
 
A
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
C
 
C
S
 
Y
D
 
K
K
 
V
E
 
T
A
 
N
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
S
 
S
A
 
P
K
 
G
I
 
M
I
 
I
A
 
K
S
 
D
F
 
C
G
 
G
V
 
A
E
 
T
Y
 
W
V
 
V
I
 
V
L
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
E
 
H
Y
 
V
F
 
F
Q
 
G
E
 
E
D
 
S
N
x
D
E
 
E
I
 
L
L
 
I
A
 
G
T
 
Q
K
 
K
V
 
V
K
 
A
E
 
H
A
 
A
L
 
L
A
 
S
N
 
E
G
 
G
L
 
L
K
 
G
P
 
V
I
 
I
F
 
A
C
 
C
C
 
I
G
 
G
E
 
E
S
 
K
L
 
L
D
 
D
I
 
E
R
 
R
T
 
E
A
 
A
G
 
G
T
 
I
H
 
T
E
 
E
P
 
-
N
 
K
V
 
V
K
 
V
F
 
F
Q
 
E
L
x
Q
T
 
T
Q
 
K
S
 
V
L
 
I
F
 
A
D
 
D
L
 
-
S
 
N
P
 
V
E
 
K
D
 
D
F
 
W
S
 
S
K
 
K
I
 
V
T
 
V
I
 
L
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
I
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
T
 
T
A
 
A
T
 
T
A
 
P
D
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
E
 
E
M
 
V
H
 
H
A
 
E
A