SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_008202629.1 NCBI__GCF_000166275.1:WP_008202629.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P07821 Iron(3+)-hydroxamate import ATP-binding protein FhuC; Ferric hydroxamate uptake protein C; Ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC; Iron(III)-hydroxamate import ATP-binding protein FhuC; EC 7.2.2.16 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
30% identity, 70% coverage: 9:234/322 of query aligns to 15:236/265 of P07821

query
sites
P07821
R
 
R
D
 
N
L
 
I
S
 
S
L
 
F
G
 
R
Y
 
V
P
 
P
K
 
G
G
 
-
D
 
-
T
 
-
Q
 
-
K
 
R
L
 
T
I
 
L
L
 
L
E
 
H
G
 
P
L
 
L
D
 
S
F
 
L
E
 
T
L
 
F
N
 
P
A
 
A
G
 
G
E
 
K
L
 
V
T
 
T
C
 
G
L
 
L
L
 
I
G
 
G
P
 
H
N
 
N
G
 
G
V
 
S
G
 
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
I
 
L
K
 
K
G
 
M
I
 
L
L
 
G
G
 
R
D
 
H
L
 
Q
P
 
P
A
 
P
W
 
S
K
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
I
T
 
L
I
 
L
Q
 
D
G
 
A
T
 
Q
N
 
P
V
 
L
S
 
E
N
 
S
I
 
W
P
 
S
N
 
S
L
 
K
E
 
A
L
 
F
A
 
A
K
 
R
K
 
K
L
 
V
S
 
A
V
 
Y
V
 
L
L
 
P
T
 
Q
E
 
Q
P
 
L
T
 
P
F
 
P
P
 
A
G
 
E
N
 
G
M
 
M
T
 
T
V
 
V
S
 
R
Q
 
E
L
 
L
V
 
V
S
 
A
L
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
Y
P
 
P
H
 
W
T
 
H
G
 
G
W
 
A
S
 
L
G
 
G
K
 
R
L
 
F
D
 
G
K
 
A
T
 
A
D
 
D
K
 
R
E
 
E
Q
 
K
V
 
V
E
 
E
K
 
E
A
 
A
L
 
I
D
 
S
L
 
L
T
 
V
K
 
G
I
 
L
G
 
K
Y
 
P
L
 
L
K
 
A
D
 
H
E
 
R
R
 
L
I
 
V
T
 
D
E
 
S
I
 
L
S
 
S
D
 
G
G
 
G
Q
 
E
R
 
R
Q
 
Q
K
 
R
A
 
A
M
 
W
I
 
I
A
 
A
R
 
M
A
 
L
L
 
V
A
 
A
Q
 
Q
D
 
D
G
 
S
E
 
R
I
 
C
M
 
L
I
 
L
L
 
L
D
|
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
A
 
S
H
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
I
V
 
A
N
 
H
R
 
Q
Y
 
V
E
 
D
I
 
V
M
 
L
H
 
S
L
 
L
L
 
V
Q
 
H
E
 
R
I
 
L
C
 
S
H
 
Q
Q
 
E
E
 
R
Q
 
G
K
 
L
A
 
T
I
 
V
L
 
I
V
 
A
V
 
V
T
 
L
H
 
H
D
 
D
L
 
I
E
 
N
I
 
M
A
 
A
L
 
A
E
 
R
T
 
Y
A
 
C
D
 
D
R
 
Y
F
 
L
W
 
V
L
 
A
L
 
L
N
 
R
C
 
G
G
 
G
I
 
E
P
 
M
L
 
I
I
 
A
S
 
Q
G
 
G
L
 
T
P
 
P
E
 
A
E
 
E
L
 
I
V
 
M

4ymuJ Crystal structure of an amino acid abc transporter complex with arginines and atps (see paper)
32% identity, 67% coverage: 24:238/322 of query aligns to 16:228/240 of 4ymuJ

query
sites
4ymuJ
I
x
V
L
 
L
E
 
K
G
 
G
L
 
V
D
 
T
F
 
L
E
 
K
L
 
V
N
 
N
A
 
K
G
 
G
E
 
E
L
 
V
T
 
V
C
 
V
L
 
I
L
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
V
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
I
 
L
K
 
R
G
 
C
I
 
I
L
 
N
G
 
L
D
 
L
L
 
E
P
 
E
A
 
P
W
 
T
K
 
K
G
 
G
E
 
E
L
 
V
T
 
F
I
 
I
Q
 
D
G
 
G
T
 
V
N
 
K
V
 
I
S
 
N
N
 
N
-
 
G
-
 
K
I
 
V
P
 
N
N
 
I
L
 
N
E
 
K
L
 
V
A
 
R
K
 
Q
K
 
K
L
 
V
S
 
G
V
 
M
V
 
V
L
 
F
T
 
Q
E
 
H
P
 
F
T
 
N
F
 
L
P
 
F
G
 
P
N
 
H
M
 
L
T
 
T
V
 
A
S
 
I
Q
 
E
L
 
N
V
 
I
S
 
T
L
 
L
G
 
A
R
 
P
T
 
V
P
 
-
H
 
-
T
 
-
G
 
-
W
 
-
S
 
-
G
 
-
K
 
K
L
 
V
D
 
K
K
 
K
T
 
M
D
 
N
K
 
K
E
 
K
Q
 
E
V
 
A
E
 
E
K
 
E
-
 
L
A
 
A
L
 
V
D
 
D
L
 
L
-
 
L
T
 
A
K
 
K
I
 
V
G
 
G
Y
 
L
L
 
L
-
 
D
-
 
K
K
 
K
D
 
D
E
 
Q
R
 
Y
I
 
P
T
 
I
E
 
K
I
 
L
S
 
S
D
 
G
G
 
G
Q
 
Q
R
 
K
Q
 
Q
K
 
R
A
 
L
M
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
M
D
 
Q
G
 
P
E
 
E
I
 
V
M
 
M
I
 
L
L
 
F
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
A
 
S
H
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
P
V
 
E
N
 
M
R
 
V
Y
 
K
E
 
E
I
 
V
M
 
L
H
 
N
L
 
V
L
 
M
Q
 
K
E
 
Q
I
 
L
C
 
A
H
 
N
Q
 
-
E
 
E
Q
 
G
K
 
M
A
 
T
I
 
M
L
 
V
V
 
V
V
 
V
T
 
T
H
|
H
D
 
E
L
 
M
E
 
G
I
 
F
A
 
A
L
 
R
E
 
E
T
 
V
A
 
G
D
 
D
R
 
R
F
 
V
W
 
I
L
 
F
L
 
M
N
 
D
C
 
D
G
 
G
I
 
V
P
 
I
L
 
V
I
 
E
S
 
E
G
 
G
L
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
E
L
 
I
V
 
F
L
 
Y
S
 
R
G
 
A
K
 
K

Sites not aligning to the query:

4u00A Crystal structure of ttha1159 in complex with adp (see paper)
33% identity, 65% coverage: 24:233/322 of query aligns to 17:223/241 of 4u00A

query
sites
4u00A
I
x
V
L
 
L
E
 
K
G
 
G
L
 
I
D
 
H
F
 
L
E
 
E
L
 
V
N
 
A
A
 
P
G
 
G
E
 
E
L
 
K
T
 
L
C
 
V
L
 
I
L
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
V
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
I
 
I
K
 
R
G
 
T
I
 
I
L
 
N
G
 
R
D
 
L
L
 
E
P
 
D
A
 
F
W
 
Q
K
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
V
T
 
V
I
 
V
Q
 
D
G
 
G
T
 
L
N
 
S
V
 
V
S
 
K
N
 
D
I
 
D
P
 
R
N
 
A
L
 
L
-
 
R
E
 
E
L
 
I
A
 
R
K
 
R
K
 
E
L
 
V
S
 
G
V
 
M
V
 
V
L
 
F
T
 
Q
E
 
Q
P
 
F
T
 
N
F
 
L
P
 
F
G
 
P
N
 
H
M
 
M
T
 
T
V
 
V
S
 
L
Q
 
E
L
 
N
V
 
V
S
 
T
L
 
L
G
 
A
R
 
P
T
 
M
P
 
R
H
 
V
T
 
R
G
 
R
W
 
W
S
 
P
G
 
-
K
 
-
L
 
R
D
 
E
K
 
K
T
 
A
D
 
E
K
 
K
E
 
-
Q
 
-
V
 
-
E
 
-
K
 
K
A
 
A
L
 
L
D
 
E
L
 
L
-
 
L
T
 
E
K
 
R
I
 
V
G
 
G
Y
 
I
L
 
L
K
 
D
D
 
Q
E
 
A
R
 
R
I
 
K
-
 
Y
-
 
P
T
 
A
E
 
Q
I
 
L
S
 
S
D
 
G
G
 
G
Q
 
Q
R
 
Q
Q
 
Q
K
 
R
A
 
V
M
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
M
D
 
E
G
 
P
E
 
K
I
 
I
M
 
M
I
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
S
H
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
P
V
 
E
N
 
M
R
 
V
Y
 
G
E
 
E
I
 
V
M
 
L
H
 
D
L
 
V
L
 
M
Q
 
R
E
 
D
I
 
L
C
 
A
H
 
-
Q
 
Q
E
 
G
Q
 
G
K
 
M
A
 
T
I
 
M
L
 
V
V
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
E
L
 
M
E
 
G
I
 
F
A
 
A
L
 
R
E
 
E
T
 
V
A
 
A
D
 
D
R
 
R
F
 
V
W
 
V
L
 
F
L
 
M
N
 
D
C
 
G
G
 
G
I
 
Q
P
 
I
L
 
V
I
 
E
S
 
E
G
 
G
L
 
R
P
 
P
E
 
E
E
 
E
L
 
I

Sites not aligning to the query:

5xu1B Structure of a non-canonical abc transporter from streptococcus pneumoniae r6 (see paper)
31% identity, 69% coverage: 3:223/322 of query aligns to 1:219/226 of 5xu1B

query
sites
5xu1B
K
 
K
A
 
Q
V
 
L
I
 
I
I
 
S
G
 
L
R
 
K
D
 
N
L
 
I
S
 
F
L
 
R
G
 
S
Y
 
Y
P
 
R
K
 
N
G
 
G
D
 
D
T
 
Q
Q
 
E
K
 
L
L
 
Q
I
 
V
L
 
L
E
 
K
G
 
N
L
 
I
D
 
N
F
 
L
E
 
E
L
 
V
N
 
N
A
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
F
T
 
V
C
 
A
L
 
I
L
 
M
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
 
G
V
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
 
T
L
 
L
I
 
M
K
 
N
G
 
T
I
 
I
-
 
G
L
 
M
G
 
L
D
 
D
L
 
T
P
 
P
A
 
T
W
 
-
K
 
S
G
 
G
E
 
E
L
 
Y
T
 
Y
I
 
L
Q
 
E
G
 
G
T
 
Q
N
 
E
V
 
V
S
 
A
N
 
G
I
 
L
P
 
G
N
 
E
L
 
K
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
K
 
K
-
 
V
-
 
R
-
 
N
-
 
Q
K
 
Q
L
 
I
S
 
G
V
 
F
V
 
V
L
 
F
T
 
Q
E
 
Q
P
 
F
T
 
F
F
 
L
P
 
L
G
 
S
N
 
K
M
 
L
T
 
N
V
 
A
S
 
L
Q
 
Q
L
 
N
V
 
V
S
 
E
L
 
L
G
 
P
R
 
L
T
 
I
P
 
-
H
 
-
T
 
-
G
 
-
W
 
Y
S
 
A
G
 
G
K
 
V
L
 
S
D
 
S
K
 
S
T
 
K
D
 
R
K
 
R
E
 
K
Q
 
L
V
 
A
E
 
E
K
 
E
A
 
Y
L
 
L
D
 
D
L
 
K
T
 
V
K
 
E
I
 
L
G
 
T
Y
 
E
L
 
R
K
 
S
D
 
H
E
 
H
R
 
L
I
 
P
T
 
S
E
 
E
I
 
L
S
 
S
D
 
G
G
 
G
Q
 
Q
R
 
K
Q
 
Q
K
 
R
A
 
V
M
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
V
Q
 
N
D
 
N
G
 
P
E
 
S
I
 
I
M
 
I
I
 
L
L
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
G
H
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
T
V
 
K
N
 
T
R
 
G
Y
 
N
E
 
Q
I
 
I
M
 
M
H
 
Q
L
 
L
L
 
L
Q
 
V
E
 
D
I
 
L
C
 
-
H
 
N
Q
 
K
E
 
E
Q
 
G
K
 
K
A
 
T
I
 
I
L
 
I
V
 
M
V
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
E
L
 
P
E
 
E
I
 
I
A
 
A
L
 
-
E
 
A
T
 
Y
A
 
A
D
 
K
R
 
R
F
 
Q
W
 
I
L
 
V
L
 
I
N
 
R
C
 
D
G
 
G
I
 
V

8wm7C Cryo-em structure of cyanobacterial nitrate/nitrite transporter nrtbcd in complex with signalling protein pii (see paper)
30% identity, 63% coverage: 21:222/322 of query aligns to 19:213/658 of 8wm7C

query
sites
8wm7C
Q
 
R
K
x
Y
L
 
I
I
 
A
L
 
L
E
 
K
G
 
N
L
 
I
D
 
E
F
 
L
E
 
K
L
 
I
N
 
K
A
 
Q
G
 
G
E
 
E
L
 
F
T
 
V
C
 
S
L
 
L
L
 
I
G
 
G
P
 
H
N
 
S
G
|
G
V
x
C
G
|
G
K
 
K
S
|
S
T
 
T
L
 
L
I
 
L
K
 
N
G
 
I
I
 
I
L
 
A
G
 
G
D
 
L
L
 
D
P
 
R
A
 
A
W
 
S
K
 
I
G
 
G
E
 
G
L
 
V
T
 
T
I
 
L
Q
 
E
G
 
G
T
 
R
N
 
E
V
 
I
S
 
R
N
 
-
I
 
-
P
 
-
N
 
-
L
 
-
E
 
E
L
 
P
A
 
S
K
 
P
K
 
D
L
 
R
S
 
M
V
 
V
V
 
V
L
 
F
T
 
Q
E
 
N
P
 
Y
T
 
S
F
 
L
P
 
L
G
 
P
N
 
W
M
 
L
T
 
T
V
 
V
S
 
R
Q
 
E
L
 
N
V
 
V
S
 
A
L
 
L
G
 
A
R
 
-
T
 
-
P
 
V
H
 
D
T
 
E
G
 
V
W
 
Y
S
 
Q
G
 
G
K
 
K
L
 
S
D
 
K
K
 
G
T
 
E
D
 
R
K
 
R
E
 
A
Q
 
I
V
 
I
E
 
E
K
 
E
A
 
H
L
 
I
D
 
D
L
 
M
T
 
V
K
 
G
I
 
L
G
 
R
Y
 
L
L
 
A
K
 
A
D
 
N
E
 
K
R
 
R
I
 
P
T
 
S
E
 
E
I
 
L
S
 
S
D
 
G
G
 
G
Q
 
M
R
 
K
Q
 
Q
K
 
R
A
 
V
M
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
T
D
 
R
G
 
P
E
 
K
I
 
L
M
 
L
I
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
F
A
 
G
H
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
A
V
 
L
N
 
T
R
 
R
Y
 
G
E
 
S
I
 
L
M
 
Q
H
 
E
L
 
Q
L
 
L
Q
 
M
E
 
K
I
 
I
C
 
C
H
 
N
Q
 
E
E
 
H
Q
 
Q
K
 
I
A
 
T
I
 
C
L
 
V
V
 
M
V
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
D
L
 
V
E
 
D
I
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
L
T
 
L
A
 
S
D
 
D
R
 
R
F
 
V
W
 
V
L
 
M
L
 
L
N
 
T
C
 
N
G
 
G

Sites not aligning to the query:

8w9mC Cryo-em structure of the cyanobacterial nitrate transporter nrtbcd in complex with atp (see paper)
29% identity, 64% coverage: 16:222/322 of query aligns to 15:213/256 of 8w9mC

query
sites
8w9mC
P
 
P
K
 
N
G
 
G
D
 
G
T
 
-
Q
 
R
K
x
Y
L
 
I
I
 
A
L
 
L
E
 
K
G
 
N
L
 
I
D
 
E
F
 
L
E
 
K
L
 
I
N
 
K
A
 
Q
G
 
G
E
 
E
L
 
F
T
 
V
C
 
S
L
 
L
L
 
I
G
 
G
P
 
H
N
x
S
G
|
G
V
 
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
I
 
L
K
 
N
G
 
I
I
 
I
L
 
A
G
 
G
D
 
L
L
 
D
P
 
R
A
 
A
W
 
S
K
 
I
G
 
G
E
 
G
L
 
V
T
 
T
I
 
L
Q
 
E
G
 
G
T
 
R
N
 
E
V
 
I
S
 
R
N
 
-
I
 
-
P
 
-
N
 
-
L
 
-
E
 
E
L
 
P
A
 
S
K
 
P
K
 
D
L
 
R
S
 
M
V
 
V
V
 
V
L
 
F
T
x
Q
E
 
N
P
 
Y
T
 
S
F
 
L
P
 
L
G
 
P
N
 
W
M
 
L
T
 
T
V
 
V
S
 
R
Q
 
E
L
 
N
V
 
V
S
 
A
L
 
L
G
 
A
R
 
-
T
 
-
P
 
V
H
 
D
T
 
E
G
 
V
W
 
Y
S
 
Q
G
 
G
K
 
K
L
 
S
D
 
K
K
 
G
T
 
E
D
 
R
K
 
R
E
 
A
Q
 
I
V
 
I
E
 
E
K
 
E
A
 
H
L
 
I
D
 
D
L
 
M
T
 
V
K
 
G
I
 
L
G
 
R
Y
 
L
L
 
A
K
 
A
D
 
N
E
x
K
R
 
R
I
 
P
T
 
S
E
|
E
I
 
L
S
|
S
D
 
G
G
|
G
Q
 
M
R
 
K
Q
 
Q
K
 
R
A
 
V
M
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
T
D
 
R
G
 
P
E
 
K
I
 
L
M
 
L
I
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
F
A
 
G
H
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
A
V
 
L
N
 
T
R
 
R
Y
 
G
E
 
S
I
 
L
M
 
Q
H
 
E
L
 
Q
L
 
L
Q
 
M
E
 
K
I
 
I
C
 
C
H
 
N
Q
 
E
E
 
H
Q
 
Q
K
 
I
A
 
T
I
 
C
L
 
V
V
 
M
V
 
V
T
 
T
H
|
H
D
 
D
L
 
V
E
 
D
I
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
L
T
 
L
A
 
S
D
 
D
R
 
R
F
 
V
W
 
V
L
 
M
L
 
L
N
 
T
C
 
N
G
 
G

Sites not aligning to the query:

6z67B Ftse structure of streptococcus pneumoniae in complex with amppnp at 2.4 a resolution (see paper)
29% identity, 68% coverage: 4:222/322 of query aligns to 2:215/229 of 6z67B

query
sites
6z67B
A
 
S
V
 
I
I
 
I
I
 
E
G
 
M
R
 
R
D
 
D
L
 
V
S
 
V
L
 
K
G
 
K
Y
|
Y
P
 
D
K
 
N
G
|
G
D
 
T
T
 
T
Q
x
A
K
 
-
L
 
-
I
 
-
L
 
L
E
 
R
G
 
G
L
 
V
D
 
S
F
 
V
E
 
S
L
 
V
N
 
Q
A
 
P
G
 
G
E
 
E
L
 
F
T
 
A
C
 
Y
L
 
I
L
 
V
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
V
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
I
 
I
K
 
R
G
 
S
I
 
L
L
 
Y
G
 
R
D
 
E
L
 
V
P
 
K
A
 
I
W
 
D
K
 
K
G
 
G
E
 
S
L
 
L
T
 
S
I
 
V
Q
 
A
G
 
G
T
 
F
N
 
N
V
 
L
S
 
V
N
 
K
I
 
I
P
 
K
N
 
K
L
 
K
E
 
D
-
 
V
-
 
P
-
 
L
L
 
L
A
 
R
K
 
R
K
 
S
L
 
V
S
 
G
V
 
V
V
 
V
L
 
F
T
 
Q
E
 
D
P
 
Y
T
 
K
F
 
L
P
 
L
G
 
P
N
 
K
M
 
K
T
 
T
V
 
V
S
 
Y
Q
 
E
L
 
N
V
 
I
S
 
A
L
 
Y
G
 
A
R
 
M
T
 
E
P
 
-
H
 
-
T
 
-
G
 
-
W
 
V
S
 
I
G
 
G
K
 
E
L
 
N
D
 
R
K
 
R
T
 
N
D
 
I
K
 
K
E
 
R
Q
 
R
V
 
V
E
 
M
K
 
E
A
 
V
L
 
L
D
 
D
L
 
L
T
 
V
K
 
G
I
 
L
G
 
K
Y
 
H
L
 
K
K
 
V
D
 
R
E
 
S
R
 
F
I
 
P
T
 
N
E
 
E
I
 
L
S
 
S
D
 
G
G
 
G
Q
 
E
R
 
Q
Q
 
Q
K
 
R
A
 
I
M
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
V
Q
 
N
D
 
N
G
 
P
E
 
K
I
 
V
M
 
L
I
 
I
L
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
G
H
 
N
L
 
L
D
 
D
L
 
P
V
 
D
N
 
N
R
 
S
Y
 
W
E
 
E
I
 
I
M
 
M
H
 
N
L
 
L
L
 
L
Q
 
E
E
 
R
I
 
I
C
 
N
H
 
L
Q
 
Q
E
 
-
Q
 
G
K
 
T
A
 
T
I
 
I
L
 
L
V
 
M
V
 
A
T
 
T
H
 
H
D
 
N
L
 
S
E
 
Q
I
 
I
A
 
V
L
 
N
E
 
T
T
 
L
A
 
R
D
 
H
R
 
R
F
 
V
W
 
I
L
 
A
L
 
I
N
 
E
C
 
N
G
 
G

6z4wA Ftse structure from streptococcus pneumoniae in complex with adp (space group p 1) (see paper)
29% identity, 68% coverage: 4:222/322 of query aligns to 2:215/230 of 6z4wA

query
sites
6z4wA
A
 
S
V
 
I
I
 
I
I
 
E
G
 
M
R
 
R
D
 
D
L
 
V
S
 
V
L
 
K
G
 
K
Y
|
Y
P
 
D
K
 
N
G
 
G
D
x
T
T
 
T
Q
x
A
K
 
-
L
 
-
I
 
-
L
 
L
E
 
R
G
 
G
L
 
V
D
 
S
F
 
V
E
 
S
L
 
V
N
 
Q
A
 
P
G
 
G
E
 
E
L
 
F
T
 
A
C
 
Y
L
 
I
L
 
V
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
|
G
V
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
I
 
I
K
 
R
G
 
S
I
 
L
L
 
Y
G
 
R
D
 
E
L
 
V
P
 
K
A
 
I
W
 
D
K
 
K
G
 
G
E
 
S
L
 
L
T
 
S
I
 
V
Q
 
A
G
 
G
T
 
F
N
 
N
V
 
L
S
 
V
N
 
K
I
 
I
P
 
K
N
 
K
L
 
K
E
 
D
-
 
V
-
 
P
-
 
L
L
 
L
A
 
R
K
 
R
K
 
S
L
 
V
S
 
G
V
 
V
V
 
V
L
 
F
T
 
Q
E
 
D
P
 
Y
T
 
K
F
 
L
P
 
L
G
 
P
N
 
K
M
 
K
T
 
T
V
 
V
S
 
Y
Q
 
E
L
 
N
V
 
I
S
 
A
L
 
Y
G
 
A
R
 
-
T
 
-
P
 
-
H
 
-
T
 
M
G
 
E
W
 
V
S
 
I
G
 
G
K
 
E
L
 
N
D
 
R
K
 
R
T
 
N
D
 
I
K
 
K
E
 
R
Q
 
R
V
 
V
E
 
M
K
 
E
A
 
V
L
 
L
D
 
D
L
 
L
T
 
V
K
 
G
I
 
L
G
 
K
Y
 
H
L
 
K
K
 
V
D
 
R
E
 
S
R
 
F
I
 
P
T
 
N
E
 
E
I
 
L
S
 
S
D
 
G
G
 
G
Q
 
E
R
 
Q
Q
 
Q
K
 
R
A
 
I
M
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
V
Q
 
N
D
 
N
G
 
P
E
 
K
I
 
V
M
 
L
I
 
I
L
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
G
H
 
N
L
 
L
D
 
D
L
 
P
V
 
D
N
 
N
R
 
S
Y
 
W
E
 
E
I
 
I
M
 
M
H
 
N
L
 
L
L
 
L
Q
 
E
E
 
R
I
 
I
C
 
N
H
 
L
Q
 
Q
E
 
-
Q
 
G
K
 
T
A
 
T
I
 
I
L
 
L
V
 
M
V
 
A
T
 
T
H
 
H
D
 
N
L
 
S
E
 
Q
I
 
I
A
 
V
L
 
N
E
 
T
T
 
L
A
 
R
D
 
H
R
 
R
F
 
V
W
 
I
L
 
A
L
 
I
N
 
E
C
 
N
G
 
G

A0A0H2ZM82 Cell division ATP-binding protein FtsE from Streptococcus pneumoniae serotype 2 (strain D39 / NCTC 7466) (see paper)
29% identity, 68% coverage: 4:222/322 of query aligns to 2:215/230 of A0A0H2ZM82

query
sites
A0A0H2ZM82
A
 
S
V
 
I
I
 
I
I
 
E
G
 
M
R
 
R
D
 
D
L
 
V
S
 
V
L
 
K
G
 
K
Y
 
Y
P
 
D
K
 
N
G
 
G
D
 
T
T
 
T
Q
 
A
K
 
-
L
 
-
I
 
-
L
 
L
E
 
R
G
 
G
L
 
V
D
 
S
F
 
V
E
 
S
L
 
V
N
 
Q
A
 
P
G
 
G
E
 
E
L
 
F
T
 
A
C
 
Y
L
 
I
L
 
V
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
 
G
V
 
A
G
 
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
L
 
F
I
 
I
K
 
R
G
 
S
I
 
L
L
 
Y
G
 
R
D
 
E
L
 
V
P
 
K
A
 
I
W
 
D
K
 
K
G
 
G
E
 
S
L
 
L
T
 
S
I
 
V
Q
 
A
G
 
G
T
 
F
N
 
N
V
 
L
S
 
V
N
 
K
I
 
I
P
 
K
N
 
K
L
 
K
E
 
D
-
 
V
-
 
P
-
 
L
L
 
L
A
 
R
K
 
R
K
 
S
L
 
V
S
 
G
V
 
V
V
 
V
L
 
F
T
 
Q
E
 
D
P
 
Y
T
 
K
F
 
L
P
 
L
G
 
P
N
 
K
M
 
K
T
 
T
V
 
V
S
 
Y
Q
 
E
L
 
N
V
 
I
S
 
A
L
 
Y
G
 
A
R
 
-
T
 
-
P
 
-
H
 
-
T
 
M
G
 
E
W
 
V
S
 
I
G
 
G
K
 
E
L
 
N
D
 
R
K
 
R
T
 
N
D
 
I
K
 
K
E
 
R
Q
 
R
V
 
V
E
 
M
K
 
E
A
 
V
L
 
L
D
 
D
L
 
L
T
 
V
K
 
G
I
 
L
G
 
K
Y
 
H
L
 
K
K
 
V
D
 
R
E
 
S
R
 
F
I
 
P
T
 
N
E
 
E
I
 
L
S
 
S
D
 
G
G
 
G
Q
 
E
R
 
Q
Q
 
Q
K
 
R
A
 
I
M
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
V
Q
 
N
D
 
N
G
 
P
E
 
K
I
 
V
M
 
L
I
 
I
L
 
A
D
|
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
A
 
G
H
 
N
L
 
L
D
 
D
L
 
P
V
 
D
N
 
N
R
 
S
Y
 
W
E
 
E
I
 
I
M
 
M
H
 
N
L
 
L
L
 
L
Q
 
E
E
 
R
I
 
I
C
 
N
H
 
L
Q
 
Q
E
 
-
Q
 
G
K
 
T
A
 
T
I
 
I
L
 
L
V
 
M
V
 
A
T
 
T
H
 
H
D
 
N
L
 
S
E
 
Q
I
 
I
A
 
V
L
 
N
E
 
T
T
 
L
A
 
R
D
 
H
R
 
R
F
 
V
W
 
I
L
 
A
L
 
I
N
 
E
C
 
N
G
 
G

3c4jA Abc protein artp in complex with atp-gamma-s
31% identity, 65% coverage: 24:233/322 of query aligns to 18:225/242 of 3c4jA

query
sites
3c4jA
I
x
V
L
 
L
E
 
K
G
 
G
L
 
I
D
 
N
F
 
V
E
 
H
L
 
I
N
 
R
A
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
V
T
 
V
C
 
V
L
 
V
L
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
V
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
I
 
L
K
 
R
-
 
C
-
 
L
G
 
N
I
 
L
L
 
L
G
 
E
D
 
D
L
 
F
P
 
D
A
 
-
W
 
-
K
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
I
T
 
I
I
 
I
Q
 
D
G
 
G
T
 
I
N
 
N
V
 
L
-
 
K
S
 
A
N
 
K
I
 
D
P
 
T
N
 
N
L
 
L
-
 
N
E
 
K
L
 
V
A
 
R
K
 
E
K
 
E
L
 
V
S
 
G
V
 
M
V
 
V
L
 
F
T
 
Q
E
 
R
P
 
F
T
 
N
F
 
L
P
 
F
G
 
P
N
 
H
M
 
M
T
 
T
V
 
V
S
 
L
Q
 
N
L
 
N
V
 
I
S
 
T
L
 
L
G
 
A
R
 
P
T
 
M
P
 
K
H
 
V
T
 
R
G
 
K
W
 
W
S
 
P
G
 
-
K
 
-
L
 
-
D
 
-
K
 
-
T
 
-
D
 
-
K
 
R
E
 
E
Q
 
K
V
 
A
E
 
E
-
 
A
K
 
K
A
 
A
L
 
M
D
 
E
L
 
L
T
 
L
K
 
D
I
 
K
G
 
V
Y
 
G
L
 
L
K
 
K
D
 
D
E
 
K
R
 
A
I
 
H
T
 
A
-
 
Y
-
 
P
-
 
D
E
 
S
I
 
L
S
 
S
D
 
G
G
 
G
Q
 
Q
R
 
A
Q
 
Q
K
 
R
A
 
V
M
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
M
D
 
E
G
 
P
E
 
K
I
 
I
M
 
M
I
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
S
H
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
P
V
 
E
N
 
M
R
 
V
Y
 
G
E
 
E
I
 
V
M
 
L
H
 
S
L
 
V
L
 
M
Q
 
K
E
 
Q
I
 
L
C
 
A
H
 
N
Q
 
-
E
 
E
Q
 
G
K
 
M
A
 
T
I
 
M
L
 
V
V
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
E
L
 
M
E
 
G
I
 
F
A
 
A
L
 
R
E
 
E
T
 
V
A
 
G
D
 
D
R
 
R
F
 
V
W
 
L
L
 
F
L
 
M
N
 
D
C
 
G
G
 
G
I
 
Y
P
 
I
L
 
I
I
 
E
S
 
E
G
 
G
L
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
D
L
 
L

Sites not aligning to the query:

3c41J Abc protein artp in complex with amp-pnp/mg2+
31% identity, 65% coverage: 24:233/322 of query aligns to 18:225/242 of 3c41J

query
sites
3c41J
I
x
V
L
 
L
E
 
K
G
 
G
L
 
I
D
 
N
F
 
V
E
 
H
L
 
I
N
 
R
A
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
V
T
 
V
C
 
V
L
 
V
L
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
V
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
I
 
L
K
 
R
-
 
C
-
 
L
G
 
N
I
 
L
L
 
L
G
 
E
D
 
D
L
 
F
P
 
D
A
 
-
W
 
-
K
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
I
T
 
I
I
 
I
Q
 
D
G
 
G
T
 
I
N
 
N
V
 
L
-
 
K
S
 
A
N
 
K
I
 
D
P
 
T
N
 
N
L
 
L
-
 
N
E
 
K
L
 
V
A
 
R
K
 
E
K
 
E
L
 
V
S
 
G
V
 
M
V
 
V
L
 
F
T
 
Q
E
 
R
P
 
F
T
 
N
F
 
L
P
 
F
G
 
P
N
 
H
M
 
M
T
 
T
V
 
V
S
 
L
Q
 
N
L
 
N
V
 
I
S
 
T
L
 
L
G
 
A
R
 
P
T
 
M
P
 
K
H
 
V
T
 
R
G
 
K
W
 
W
S
 
P
G
 
-
K
 
-
L
 
-
D
 
-
K
 
-
T
 
-
D
 
-
K
 
R
E
 
E
Q
 
K
V
 
A
E
 
E
-
 
A
K
 
K
A
 
A
L
 
M
D
 
E
L
 
L
T
 
L
K
 
D
I
 
K
G
 
V
Y
 
G
L
 
L
K
 
K
D
 
D
E
 
K
R
 
A
I
 
H
T
 
A
-
 
Y
-
 
P
-
 
D
E
 
S
I
 
L
S
 
S
D
 
G
G
 
G
Q
 
Q
R
 
A
Q
 
Q
K
 
R
A
 
V
M
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
M
D
 
E
G
 
P
E
 
K
I
 
I
M
 
M
I
 
L
L
 
F
D
|
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
S
H
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
P
V
 
E
N
 
M
R
 
V
Y
 
G
E
 
E
I
 
V
M
 
L
H
 
S
L
 
V
L
 
M
Q
 
K
E
 
Q
I
 
L
C
 
A
H
 
N
Q
 
-
E
 
E
Q
 
G
K
 
M
A
 
T
I
 
M
L
 
V
V
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
E
L
 
M
E
 
G
I
 
F
A
 
A
L
 
R
E
 
E
T
 
V
A
 
G
D
 
D
R
 
R
F
 
V
W
 
L
L
 
F
L
 
M
N
 
D
C
 
G
G
 
G
I
 
Y
P
 
I
L
 
I
I
 
E
S
 
E
G
 
G
L
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
D
L
 
L

Sites not aligning to the query:

2olkA Abc protein artp in complex with adp-beta-s
31% identity, 65% coverage: 24:233/322 of query aligns to 18:225/242 of 2olkA

query
sites
2olkA
I
x
V
L
 
L
E
 
K
G
 
G
L
 
I
D
 
N
F
 
V
E
 
H
L
 
I
N
 
R
A
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
V
T
 
V
C
 
V
L
 
V
L
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
V
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
I
 
L
K
 
R
-
 
C
-
 
L
G
 
N
I
 
L
L
 
L
G
 
E
D
 
D
L
 
F
P
 
D
A
 
-
W
 
-
K
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
I
T
 
I
I
 
I
Q
 
D
G
 
G
T
 
I
N
 
N
V
 
L
-
 
K
S
 
A
N
 
K
I
 
D
P
 
T
N
 
N
L
 
L
-
 
N
E
 
K
L
 
V
A
 
R
K
 
E
K
 
E
L
 
V
S
 
G
V
 
M
V
 
V
L
 
F
T
 
Q
E
 
R
P
 
F
T
 
N
F
 
L
P
 
F
G
 
P
N
 
H
M
 
M
T
 
T
V
 
V
S
 
L
Q
 
N
L
 
N
V
 
I
S
 
T
L
 
L
G
 
A
R
 
P
T
 
M
P
 
K
H
 
V
T
 
R
G
 
K
W
 
W
S
 
P
G
 
-
K
 
-
L
 
-
D
 
-
K
 
-
T
 
-
D
 
-
K
 
R
E
 
E
Q
 
K
V
 
A
E
 
E
-
 
A
K
 
K
A
 
A
L
 
M
D
 
E
L
 
L
T
 
L
K
 
D
I
 
K
G
 
V
Y
 
G
L
 
L
K
 
K
D
 
D
E
 
K
R
 
A
I
 
H
T
 
A
-
 
Y
-
 
P
-
 
D
E
 
S
I
 
L
S
 
S
D
 
G
G
 
G
Q
 
Q
R
 
A
Q
 
Q
K
 
R
A
 
V
M
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
M
D
 
E
G
 
P
E
 
K
I
 
I
M
 
M
I
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
S
H
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
P
V
 
E
N
 
M
R
 
V
Y
 
G
E
 
E
I
 
V
M
 
L
H
 
S
L
 
V
L
 
M
Q
 
K
E
 
Q
I
 
L
C
 
A
H
 
N
Q
 
-
E
 
E
Q
 
G
K
 
M
A
 
T
I
 
M
L
 
V
V
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
E
L
 
M
E
 
G
I
 
F
A
 
A
L
 
R
E
 
E
T
 
V
A
 
G
D
 
D
R
 
R
F
 
V
W
 
L
L
 
F
L
 
M
N
 
D
C
 
G
G
 
G
I
 
Y
P
 
I
L
 
I
I
 
E
S
 
E
G
 
G
L
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
D
L
 
L

Sites not aligning to the query:

2oljA Abc protein artp in complex with adp/mg2+
31% identity, 65% coverage: 24:233/322 of query aligns to 18:225/242 of 2oljA

query
sites
2oljA
I
x
V
L
 
L
E
 
K
G
 
G
L
 
I
D
 
N
F
 
V
E
 
H
L
 
I
N
 
R
A
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
V
T
 
V
C
 
V
L
 
V
L
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
V
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
I
 
L
K
 
R
-
 
C
-
 
L
G
 
N
I
 
L
L
 
L
G
 
E
D
 
D
L
 
F
P
 
D
A
 
-
W
 
-
K
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
I
T
 
I
I
 
I
Q
 
D
G
 
G
T
 
I
N
 
N
V
 
L
-
 
K
S
 
A
N
 
K
I
 
D
P
 
T
N
 
N
L
 
L
-
 
N
E
 
K
L
 
V
A
 
R
K
 
E
K
 
E
L
 
V
S
 
G
V
 
M
V
 
V
L
 
F
T
 
Q
E
 
R
P
 
F
T
 
N
F
 
L
P
 
F
G
 
P
N
 
H
M
 
M
T
 
T
V
 
V
S
 
L
Q
 
N
L
 
N
V
 
I
S
 
T
L
 
L
G
 
A
R
 
P
T
 
M
P
 
K
H
 
V
T
 
R
G
 
K
W
 
W
S
 
P
G
 
-
K
 
-
L
 
-
D
 
-
K
 
-
T
 
-
D
 
-
K
 
R
E
 
E
Q
 
K
V
 
A
E
 
E
-
 
A
K
 
K
A
 
A
L
 
M
D
 
E
L
 
L
T
 
L
K
 
D
I
 
K
G
 
V
Y
 
G
L
 
L
K
 
K
D
 
D
E
 
K
R
 
A
I
 
H
T
 
A
-
 
Y
-
 
P
-
 
D
E
 
S
I
 
L
S
 
S
D
 
G
G
 
G
Q
 
Q
R
 
A
Q
 
Q
K
 
R
A
 
V
M
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
M
D
 
E
G
 
P
E
 
K
I
 
I
M
 
M
I
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
S
H
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
P
V
 
E
N
 
M
R
 
V
Y
 
G
E
 
E
I
 
V
M
 
L
H
 
S
L
 
V
L
 
M
Q
 
K
E
 
Q
I
 
L
C
 
A
H
 
N
Q
 
-
E
 
E
Q
 
G
K
 
M
A
 
T
I
 
M
L
 
V
V
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
E
L
 
M
E
 
G
I
 
F
A
 
A
L
 
R
E
 
E
T
 
V
A
 
G
D
 
D
R
 
R
F
 
V
W
 
L
L
 
F
L
 
M
N
 
D
C
 
G
G
 
G
I
 
Y
P
 
I
L
 
I
I
 
E
S
 
E
G
 
G
L
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
D
L
 
L

Sites not aligning to the query:

4f4cA The crystal structure of the multi-drug transporter (see paper)
38% identity, 48% coverage: 24:177/322 of query aligns to 427:580/1250 of 4f4cA

query
sites
4f4cA
I
 
I
L
 
L
E
 
R
G
 
G
L
 
M
D
 
N
F
 
L
E
 
R
L
 
V
N
 
N
A
 
A
G
 
G
E
 
Q
L
 
T
T
 
V
C
 
A
L
 
L
L
 
V
G
 
G
P
 
S
N
 
S
G
 
G
V
 
C
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
L
 
I
I
 
I
K
 
S
G
 
L
I
 
L
L
 
L
G
 
R
D
 
Y
L
 
Y
P
 
D
A
 
V
W
 
L
K
 
K
G
 
G
E
 
K
L
 
I
T
 
T
I
 
I
Q
 
D
G
 
G
T
 
V
N
 
D
V
 
V
S
 
R
N
 
D
I
 
I
P
 
-
N
 
N
L
 
L
E
 
E
-
 
F
L
 
L
A
 
R
K
 
K
K
 
N
L
 
V
S
 
A
V
 
V
V
 
V
L
 
S
T
 
Q
E
 
E
P
 
P
T
 
A
F
 
L
P
 
F
G
 
-
N
 
N
M
 
C
T
 
T
V
 
I
S
 
E
Q
 
E
L
 
N
V
 
I
S
 
S
L
 
L
G
 
G
R
 
K
T
 
E
P
 
G
H
 
I
T
 
T
G
 
-
W
 
R
S
 
E
G
 
E
K
 
M
L
 
V
D
 
A
K
 
A
T
 
C
D
 
K
K
 
M
E
 
A
Q
 
N
V
 
A
E
 
E
K
 
K
A
 
F
L
 
I
D
 
K
L
 
T
T
 
L
K
 
P
I
 
N
G
 
G
Y
 
Y
-
 
N
-
 
T
L
 
L
K
 
V
D
 
G
E
 
D
R
 
R
I
 
G
T
 
T
E
 
Q
I
 
L
S
 
S
D
 
G
G
 
G
Q
 
Q
R
 
K
Q
 
Q
K
 
R
A
 
I
M
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
V
Q
 
R
D
 
N
G
 
P
E
 
K
I
 
I
M
 
L
I
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
A
T
 
T
A
 
S
H
 
A
L
 
L
D
 
D

Sites not aligning to the query:

P19566 Maltose/maltodextrin import ATP-binding protein MalK; EC 7.5.2.1 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
26% identity, 69% coverage: 28:248/322 of query aligns to 22:229/369 of P19566

query
sites
P19566
L
 
I
D
 
N
F
 
L
E
 
D
L
 
I
N
 
H
A
 
D
G
 
G
E
 
E
L
 
F
T
 
V
C
 
V
L
 
F
L
 
V
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
 
G
V
 
C
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
I
 
L
K
 
R
G
 
M
I
 
I
L
 
A
G
 
G
D
 
L
L
 
E
P
 
T
A
 
I
W
 
T
K
 
S
G
 
G
E
 
D
L
 
L
T
 
F
I
 
I
Q
 
G
G
 
E
T
 
T
N
 
R
V
 
M
S
 
N
N
 
D
I
 
I
P
 
P
N
 
P
L
 
A
E
 
E
L
 
-
A
 
-
K
 
R
K
 
G
L
 
V
S
 
G
V
 
M
V
 
V
L
 
F
T
 
Q
E
 
S
P
 
Y
T
 
A
F
x
L
P
 
Y
G
 
P
N
 
H
M
 
L
T
 
S
V
 
V
S
 
A
Q
 
E
L
 
N
V
 
M
S
 
S
L
 
F
G
 
G
R
 
-
T
 
-
P
 
-
H
 
-
T
 
L
G
 
K
W
 
L
S
 
A
G
 
G
K
 
A
L
 
K
D
 
K
K
 
E
T
 
V
D
 
M
K
 
N
E
 
Q
Q
 
R
V
 
V
E
 
N
K
 
Q
A
 
V
L
 
A
D
 
E
L
 
V
T
 
L
K
 
Q
I
 
L
G
 
A
Y
 
H
L
 
L
K
 
L
D
 
E
E
 
R
R
 
K
I
 
P
T
 
K
E
 
A
I
 
L
S
 
S
D
 
G
G
 
G
Q
 
Q
R
 
R
Q
 
Q
K
 
R
A
 
V
M
 
A
I
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
V
Q
 
A
D
 
E
G
 
P
E
 
R
I
 
V
M
 
F
I
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
|
P
T
 
L
A
 
S
H
 
N
L
 
L
D
|
D
L
 
A
V
 
A
N
 
L
R
 
R
Y
 
V
E
 
Q
I
 
M
M
 
R
H
 
I
L
 
E
L
 
I
Q
 
S
E
 
R
I
 
L
C
 
H
H
 
K
Q
 
R
E
 
L
Q
 
G
K
 
R
A
 
T
I
 
M
L
 
I
V
 
Y
V
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
D
L
 
Q
E
 
V
I
 
E
A
 
A
L
 
M
E
 
T
T
 
L
A
 
A
D
 
D
R
 
K
F
 
I
W
 
V
L
 
V
L
 
L
N
 
D
C
 
A
G
 
G
I
 
R
P
 
V
L
 
A
I
 
Q
S
 
V
G
 
G
L
 
K
P
 
P
E
 
L
E
 
E
L
 
L
V
 
Y
L
 
-
S
 
-
G
 
-
K
 
-
I
 
-
N
 
-
S
 
-
L
 
H
L
 
Y
P
 
P
G
 
A
D
 
D
K
 
R
F
 
F

Sites not aligning to the query:

8j5qD Cryo-em structure of mycobacterium tuberculosis oppabcd in the pre- translocation state (see paper)
26% identity, 66% coverage: 10:222/322 of query aligns to 8:230/611 of 8j5qD

query
sites
8j5qD
D
 
D
L
 
L
S
 
A
L
 
V
G
 
T
Y
 
F
P
 
R
K
 
T
G
 
D
D
 
G
T
 
D
Q
 
P
K
 
V
L
 
T
I
 
A
L
 
V
E
 
R
G
 
G
L
 
I
D
 
S
F
 
Y
E
 
R
L
 
V
N
 
E
A
 
P
G
 
G
E
 
E
L
 
V
T
 
V
C
 
A
L
 
M
L
 
V
G
 
G
P
 
E
N
 
S
G
 
G
V
 
S
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
A
L
 
A
I
 
A
K
 
M
G
 
A
I
 
V
L
 
V
G
 
G
D
 
L
L
 
L
P
 
P
A
 
E
W
 
Y
-
 
A
-
 
Q
-
 
V
K
 
R
G
 
G
E
 
S
L
 
V
T
 
R
I
 
L
Q
 
Q
G
 
G
T
 
T
N
 
E
V
 
L
S
 
L
N
 
G
I
 
L
P
 
A
N
 
D
L
 
N
E
 
A
L
 
M
A
 
S
-
 
R
-
 
F
-
 
R
-
 
G
K
 
K
K
 
A
L
 
I
S
 
G
V
 
T
V
 
V
L
 
F
T
 
Q
E
 
D
P
 
P
-
 
M
-
 
S
T
 
A
F
 
L
P
 
T
G
 
P
N
 
V
M
 
Y
T
 
T
V
 
V
S
 
G
Q
 
D
L
 
Q
V
 
I
S
 
A
L
 
E
G
 
A
R
 
I
T
 
E
P
 
V
H
 
H
T
 
Q
G
 
P
W
 
R
S
 
V
G
 
G
K
 
K
L
 
-
D
 
-
K
 
K
T
 
A
D
 
A
K
 
R
E
 
R
Q
 
R
V
 
A
E
 
V
K
 
E
A
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
T
 
-
K
 
-
I
 
V
G
 
G
Y
 
I
L
 
S
K
 
Q
D
 
P
E
 
Q
R
 
R
I
 
R
T
 
S
-
 
R
-
 
A
-
 
F
-
 
P
-
 
H
E
 
E
I
 
L
S
 
S
D
 
G
G
 
G
Q
 
E
R
 
R
Q
 
Q
K
 
R
A
 
V
M
 
V
I
 
I
A
 
A
R
 
I
A
 
A
L
 
I
A
 
A
Q
 
N
D
 
D
G
 
P
E
 
D
I
 
L
M
 
L
I
 
I
L
 
C
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
A
 
T
H
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
V
V
 
T
N
 
V
R
 
Q
Y
 
A
E
 
Q
I
 
I
M
 
L
H
 
D
L
 
V
L
 
L
Q
 
K
E
 
A
I
 
A
C
 
R
H
 
D
Q
 
V
E
 
T
Q
 
G
K
 
A
A
 
G
I
 
V
L
 
L
V
 
I
V
 
I
T
 
T
H
 
H
D
 
D
L
 
L
E
 
G
I
 
V
A
 
V
L
 
A
E
 
E
T
 
F
A
 
A
D
 
D
R
 
R
F
 
A
W
 
L
L
 
V
L
 
M
N
 
Y
C
 
A
G
 
G

Sites not aligning to the query:

7ahhC Opua inhibited inward-facing, sbd docked (see paper)
30% identity, 64% coverage: 29:234/322 of query aligns to 46:251/382 of 7ahhC

query
sites
7ahhC
D
 
N
F
 
F
E
 
E
L
 
I
N
 
N
A
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
I
T
 
F
C
 
V
L
 
I
L
 
M
G
 
G
P
 
L
N
 
S
G
|
G
V
 
S
G
|
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
I
 
L
K
 
R
G
 
L
I
 
L
L
 
N
G
 
R
D
 
L
L
 
I
P
 
E
A
 
P
W
 
T
K
 
S
G
 
G
E
 
K
L
 
I
T
 
F
I
 
I
Q
 
D
G
 
N
T
 
Q
N
 
D
V
 
V
S
 
A
N
 
T
I
 
L
P
 
N
N
 
K
L
 
E
E
 
D
L
 
L
-
 
L
-
 
Q
-
 
V
-
 
R
A
 
R
K
 
K
K
 
T
L
 
M
S
 
S
V
 
M
V
 
V
L
 
F
T
 
Q
E
 
-
P
 
-
T
 
-
F
 
-
P
 
-
G
 
-
N
 
-
M
 
-
T
 
-
V
 
-
S
 
-
Q
 
-
L
 
-
V
 
-
S
 
N
L
 
F
G
 
G
R
 
L
T
 
F
P
 
P
H
 
H
-
 
R
-
 
T
-
 
I
-
 
L
-
 
E
-
 
N
T
 
T
G
 
E
W
 
Y
S
 
G
G
 
L
K
 
E
L
 
V
D
 
Q
K
 
N
T
 
V
D
 
P
K
 
K
E
 
E
Q
 
E
-
 
R
-
 
R
-
 
K
-
 
R
V
 
A
E
 
E
K
 
K
A
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
N
T
 
A
K
 
N
I
 
L
G
 
L
Y
 
D
L
 
F
K
 
K
D
 
D
E
 
Q
R
 
Y
I
 
P
T
 
K
E
 
Q
I
 
L
S
 
S
D
 
G
G
 
G
Q
 
M
R
 
Q
Q
 
Q
K
 
R
A
 
V
M
 
G
I
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
N
D
 
D
G
 
P
E
 
E
I
 
I
M
 
L
I
 
L
L
 
M
D
|
D
E
|
E
P
 
A
T
 
F
A
 
S
H
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
P
V
 
L
N
 
I
R
 
R
Y
 
R
E
 
E
I
 
M
M
 
Q
H
 
D
L
 
E
L
 
L
Q
 
L
E
 
E
I
 
L
C
 
Q
H
 
A
Q
 
K
E
 
F
Q
 
Q
K
 
K
A
 
T
I
 
I
L
 
I
V
 
F
V
 
V
T
 
S
H
 
H
D
 
D
L
 
L
E
 
N
I
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
R
T
 
I
A
 
G
D
 
D
R
 
R
F
 
I
W
 
A
L
 
I
L
 
M
N
 
K
C
 
D
G
 
G
I
 
K
P
 
I
L
 
M
I
 
Q
S
 
I
G
 
G
L
 
T
P
 
G
E
 
E
E
 
E
L
 
I
V
 
L

Sites not aligning to the query:

7aheC Opua inhibited inward facing (see paper)
30% identity, 64% coverage: 29:234/322 of query aligns to 46:251/382 of 7aheC

query
sites
7aheC
D
 
N
F
 
F
E
 
E
L
 
I
N
 
N
A
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
I
T
 
F
C
 
V
L
 
I
L
 
M
G
 
G
P
 
L
N
 
S
G
 
G
V
 
S
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
I
 
L
K
 
R
G
 
L
I
 
L
L
 
N
G
 
R
D
 
L
L
 
I
P
 
E
A
 
P
W
 
T
K
 
S
G
 
G
E
 
K
L
 
I
T
 
F
I
 
I
Q
 
D
G
 
N
T
 
Q
N
 
D
V
 
V
S
 
A
N
 
T
I
 
L
P
 
N
N
 
K
L
 
E
E
 
D
L
 
L
-
 
L
-
 
Q
-
 
V
-
 
R
A
 
R
K
 
K
K
 
T
L
 
M
S
 
S
V
 
M
V
 
V
L
 
F
T
 
Q
E
 
-
P
 
-
T
 
-
F
 
-
P
 
-
G
 
-
N
 
-
M
 
-
T
 
-
V
 
-
S
 
-
Q
 
-
L
 
-
V
 
-
S
 
N
L
 
F
G
 
G
R
 
L
T
 
F
P
 
P
H
 
H
-
 
R
-
 
T
-
 
I
-
 
L
-
 
E
-
 
N
T
 
T
G
 
E
W
 
Y
S
 
G
G
 
L
K
 
E
L
 
V
D
 
Q
K
 
N
T
 
V
D
 
P
K
 
K
E
 
E
Q
 
E
-
 
R
-
 
R
-
 
K
-
 
R
V
 
A
E
 
E
K
 
K
A
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
N
T
 
A
K
 
N
I
 
L
G
 
L
Y
 
D
L
 
F
K
 
K
D
 
D
E
 
Q
R
 
Y
I
 
P
T
 
K
E
 
Q
I
 
L
S
 
S
D
 
G
G
 
G
Q
 
M
R
 
Q
Q
 
Q
K
 
R
A
 
V
M
 
G
I
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
N
D
 
D
G
 
P
E
 
E
I
 
I
M
 
L
I
 
L
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
A
T
 
F
A
 
S
H
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
P
V
 
L
N
 
I
R
 
R
Y
 
R
E
 
E
I
 
M
M
 
Q
H
 
D
L
 
E
L
 
L
Q
 
L
E
 
E
I
 
L
C
 
Q
H
 
A
Q
 
K
E
 
F
Q
 
Q
K
 
K
A
 
T
I
 
I
L
 
I
V
 
F
V
 
V
T
 
S
H
 
H
D
 
D
L
 
L
E
 
N
I
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
R
T
 
I
A
 
G
D
 
D
R
 
R
F
 
I
W
 
A
L
 
I
L
 
M
N
 
K
C
 
D
G
 
G
I
 
K
P
 
I
L
 
M
I
 
Q
S
 
I
G
 
G
L
 
T
P
 
G
E
 
E
E
 
E
L
 
I
V
 
L

Sites not aligning to the query:

7ahdC Opua (e190q) occluded (see paper)
30% identity, 64% coverage: 29:234/322 of query aligns to 46:251/260 of 7ahdC

query
sites
7ahdC
D
 
N
F
 
F
E
 
E
L
 
I
N
 
N
A
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
I
T
 
F
C
 
V
L
 
I
L
 
M
G
 
G
P
 
L
N
x
S
G
|
G
V
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
I
 
L
K
 
R
G
 
L
I
 
L
L
 
N
G
 
R
D
 
L
L
 
I
P
 
E
A
 
P
W
 
T
K
 
S
G
 
G
E
 
K
L
 
I
T
 
F
I
 
I
Q
 
D
G
 
N
T
 
Q
N
 
D
V
 
V
S
 
A
N
 
T
I
 
L
P
 
N
N
 
K
L
 
E
E
 
D
L
 
L
-
 
L
-
 
Q
-
 
V
-
 
R
A
 
R
K
 
K
K
 
T
L
 
M
S
 
S
V
 
M
V
 
V
L
 
F
T
x
Q
E
 
-
P
 
-
T
 
-
F
 
-
P
 
-
G
 
-
N
 
-
M
 
-
T
 
-
V
 
-
S
 
-
Q
 
-
L
 
-
V
 
-
S
 
N
L
 
F
G
 
G
R
 
L
T
 
F
P
 
P
H
 
H
-
 
R
-
 
T
-
 
I
-
 
L
-
 
E
-
 
N
T
 
T
G
 
E
W
 
Y
S
 
G
G
 
L
K
 
E
L
 
V
D
 
Q
K
 
N
T
 
V
D
 
P
K
 
K
E
 
E
Q
 
E
-
 
R
-
 
R
-
 
K
-
 
R
V
 
A
E
 
E
K
 
K
A
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
N
T
 
A
K
 
N
I
 
L
G
 
L
Y
 
D
L
 
F
K
 
K
D
 
D
E
 
Q
R
 
Y
I
 
P
T
x
K
E
x
Q
I
 
L
S
|
S
D
 
G
G
|
G
Q
x
M
R
 
Q
Q
 
Q
K
 
R
A
 
V
M
 
G
I
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
N
D
 
D
G
 
P
E
 
E
I
 
I
M
 
L
I
 
L
L
 
M
D
 
D
E
x
Q
P
 
A
T
 
F
A
 
S
H
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
P
V
 
L
N
 
I
R
 
R
Y
 
R
E
 
E
I
 
M
M
 
Q
H
 
D
L
 
E
L
 
L
Q
 
L
E
 
E
I
 
L
C
 
Q
H
 
A
Q
 
K
E
 
F
Q
 
Q
K
 
K
A
 
T
I
 
I
L
 
I
V
 
F
V
 
V
T
 
S
H
|
H
D
 
D
L
 
L
E
 
N
I
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
R
T
 
I
A
 
G
D
 
D
R
 
R
F
 
I
W
 
A
L
 
I
L
 
M
N
 
K
C
 
D
G
 
G
I
 
K
P
 
I
L
 
M
I
 
Q
S
 
I
G
 
G
L
 
T
P
 
G
E
 
E
E
 
E
L
 
I
V
 
L

Sites not aligning to the query:

1jj7A Crystal structure of thE C-terminal atpase domain of human tap1 (see paper)
29% identity, 70% coverage: 9:234/322 of query aligns to 15:239/251 of 1jj7A

query
sites
1jj7A
R
 
Q
D
 
D
L
 
V
S
 
S
L
 
F
G
 
A
Y
|
Y
P
 
P
K
 
N
G
 
-
D
 
R
T
 
P
Q
 
D
K
 
V
L
 
L
I
x
V
L
 
L
E
 
Q
G
 
G
L
 
L
D
 
T
F
 
F
E
 
T
L
 
L
N
 
R
A
 
P
G
 
G
E
 
E
L
 
V
T
 
T
C
 
A
L
 
L
L
 
V
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
V
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
V
I
 
A
K
 
A
G
 
L
I
 
L
L
 
Q
G
 
N
D
 
L
L
 
Y
P
 
Q
A
 
P
W
 
T
K
 
G
G
 
G
E
 
Q
L
 
L
T
 
L
I
 
L
Q
 
D
G
 
G
T
 
K
N
 
P
V
 
L
S
 
P
N
 
Q
I
 
Y
P
 
E
N
 
H
L
 
R
E
 
Y
L
 
L
A
 
H
K
 
R
K
 
Q
L
 
V
S
 
A
V
 
A
V
 
V
L
 
G
T
 
Q
E
 
E
P
 
P
T
 
Q
F
 
V
P
 
F
G
 
G
N
 
R
M
 
-
T
 
S
V
 
L
S
 
Q
Q
 
E
L
 
N
V
 
I
S
 
A
L
 
Y
G
 
G
R
 
L
T
 
T
P
 
Q
H
 
K
T
 
P
G
 
T
W
 
M
S
 
E
G
 
E
K
 
I
L
 
T
D
 
A
K
 
A
T
 
A
D
 
V
K
 
K
E
 
S
Q
 
G
V
 
A
E
 
H
K
 
S
A
 
F
L
 
I
D
 
S
L
 
G
T
 
L
K
 
P
I
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
L
 
D
K
 
T
-
 
E
-
 
V
D
 
D
E
 
E
R
 
A
I
 
G
T
 
S
E
 
Q
I
 
L
S
 
S
D
 
G
G
 
G
Q
 
Q
R
 
R
Q
 
Q
K
 
A
A
 
V
M
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
I
Q
 
R
D
 
K
G
 
P
E
 
C
I
 
V
M
 
L
I
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
D
P
 
A
T
 
T
A
 
S
H
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
A
V
 
N
N
 
S
R
 
Q
Y
 
L
E
 
Q
I
 
V
M
 
E
H
 
Q
L
 
L
L
 
L
Q
 
Y
E
 
E
I
 
S
C
 
P
H
 
E
Q
 
R
E
 
Y
Q
 
S
K
 
R
A
 
S
I
 
V
L
 
L
V
 
L
V
 
I
T
 
T
H
 
Q
D
 
H
L
 
L
E
 
S
I
 
L
A
 
-
L
 
V
E
 
E
T
 
Q
A
 
A
D
 
D
R
 
H
F
 
I
W
 
L
L
 
F
L
 
L
N
 
E
C
 
G
G
 
G
I
 
A
P
 
I
L
 
R
I
 
E
S
 
G
G
 
G
L
 
T
P
 
H
E
 
Q
E
 
Q
L
 
L
V
 
M

Query Sequence

>WP_008202629.1 NCBI__GCF_000166275.1:WP_008202629.1
MKKAVIIGRDLSLGYPKGDTQKLILEGLDFELNAGELTCLLGPNGVGKSTLIKGILGDLP
AWKGELTIQGTNVSNIPNLELAKKLSVVLTEPTFPGNMTVSQLVSLGRTPHTGWSGKLDK
TDKEQVEKALDLTKIGYLKDERITEISDGQRQKAMIARALAQDGEIMILDEPTAHLDLVN
RYEIMHLLQEICHQEQKAILVVTHDLEIALETADRFWLLNCGIPLISGLPEELVLSGKIN
SLLPGDKFHFDPEKGKIEKKALPPSWEIIGDPSSVFWIQKALLKRQIPSLDQVIEVKNTP
FQIKFNGKIFDSLESFFENLKI

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory