SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_008203445.1 NCBI__GCF_000166275.1:WP_008203445.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 13 hits to proteins with known functional sites (download)

2ri1A Crystal structure of glucosamine 6-phosphate deaminase (nagb) with glcn6p from s. Mutans (see paper)
33% identity, 71% coverage: 62:244/256 of query aligns to 53:231/235 of 2ri1A

query
sites
2ri1A
I
 
L
Q
 
D
W
 
F
E
 
S
K
 
D
V
 
M
V
 
V
A
 
S
M
 
I
H
 
N
M
 
L
D
|
D
E
 
E
Y
 
Y
I
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
S
P
 
A
E
 
D
S
 
D
P
 
K
Q
 
Q
F
 
S
F
 
Y
S
 
A
K
 
Y
Y
 
F
L
 
M
V
 
K
E
 
Q
N
 
N
L
 
L
F
 
F
S
 
A
K
 
A
V
 
K
P
 
P
F
 
F
K
 
K
E
 
K
V
 
S
H
 
Y
L
 
L
I
 
P
Q
 
N
T
 
G
Q
 
L
G
 
A
K
 
A
Q
 
D
-
 
L
E
 
A
L
 
K
E
 
E
I
 
T
K
 
E
W
 
Y
Y
 
Y
S
 
D
N
 
Q
L
 
I
L
 
L
K
 
A
K
 
Q
A
 
Y
P
 
P
I
 
I
D
 
D
I
 
L
V
 
Q
C
 
I
L
 
L
G
 
G
I
 
I
G
 
G
E
 
R
N
|
N
G
 
A
H
|
H
I
 
I
A
 
G
F
 
F
N
 
N
D
x
E
P
 
P
P
 
G
V
 
T
A
 
A
N
 
-
F
 
F
Q
 
S
D
 
S
P
 
Q
V
 
T
F
 
H
I
 
-
K
 
-
E
 
-
V
 
-
L
 
L
L
 
V
D
 
D
Q
 
L
A
 
T
C
 
P
R
 
S
T
 
T
Q
 
I
Q
 
A
V
 
A
N
 
N
D
 
S
G
 
R
C
 
F
F
 
F
E
 
E
S
 
K
L
 
A
D
 
E
K
 
D
V
 
V
P
 
P
R
 
K
K
 
Q
A
 
A
L
 
I
T
 
S
L
 
M
T
 
G
I
 
L
P
 
A
A
 
S
L
 
I
M
 
M
S
 
S
G
 
A
D
 
K
N
 
M
L
 
I
F
 
L
C
 
L
V
 
M
V
 
A
L
 
F
G
 
G
K
 
E
N
 
E
K
|
K
S
 
A
E
 
E
A
 
A
V
 
V
K
 
A
N
 
A
T
 
M
L
 
V
T
 
K
G
 
G
P
 
P
L
 
V
S
 
T
E
 
E
T
 
E
C
 
I
P
 
P
A
 
A
S
 
S
I
 
I
L
 
L
M
 
Q
T
 
T
H
 
H
P
 
P
Q
 
K
C
 
V
K
 
I
F
 
L
Y
 
I
F
 
V
D
 
D
A
 
E
D
 
K
A
 
A

Sites not aligning to the query:

2bkxA Structure and kinetics of a monomeric glucosamine-6-phosphate deaminase: missing link of the nagb superfamily (see paper)
33% identity, 76% coverage: 56:249/256 of query aligns to 50:242/242 of 2bkxA

query
sites
2bkxA
L
 
L
A
 
H
N
 
Q
S
 
T
K
 
E
K
 
N
I
 
L
Q
 
S
W
 
F
E
 
Q
K
 
N
V
 
I
V
 
T
A
 
T
M
 
V
H
 
N
M
 
L
D
|
D
E
 
E
Y
 
Y
I
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
S
P
 
S
E
 
D
S
 
D
P
 
P
Q
 
N
F
 
S
F
 
Y
S
 
H
K
 
F
Y
 
Y
L
 
M
V
 
N
E
 
D
N
 
R
L
 
F
F
 
F
S
 
Q
K
 
H
V
 
I
P
 
D
F
 
S
K
 
K
-
 
P
E
 
S
V
 
R
H
 
H
L
 
F
I
 
I
Q
 
P
T
 
N
Q
 
G
G
 
N
K
 
A
Q
 
D
E
 
D
L
 
L
E
 
E
I
 
A
-
 
E
-
 
C
K
 
R
W
 
R
Y
 
Y
S
 
E
N
 
Q
L
 
L
L
 
V
K
 
D
K
 
S
-
 
L
A
 
G
P
 
D
I
 
T
D
 
D
I
 
I
V
 
Q
C
 
L
L
 
L
G
|
G
I
 
I
G
 
G
E
 
R
N
|
N
G
 
G
H
|
H
I
 
I
A
x
G
F
 
F
N
 
N
D
x
E
P
 
P
P
 
G
V
 
T
A
 
S
N
 
-
F
 
F
Q
 
K
D
 
S
P
 
R
V
 
T
F
 
H
I
 
V
K
 
-
E
 
-
V
 
V
L
 
T
L
 
L
D
 
N
Q
 
E
A
 
-
C
 
-
R
 
Q
T
 
T
Q
 
R
Q
 
Q
V
 
A
N
 
N
D
 
A
G
x
R
C
 
Y
F
 
F
E
 
P
S
 
S
L
 
I
D
 
D
K
 
S
V
 
V
P
 
P
R
 
K
K
 
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
L
 
M
T
 
G
I
 
I
P
 
Q
A
 
T
L
 
I
M
 
L
S
 
S
G
 
S
D
 
K
N
 
R
L
 
I
F
 
L
C
 
L
V
 
L
V
 
I
L
 
S
G
 
G
K
 
K
N
 
S
K
|
K
S
 
A
E
 
E
A
 
A
V
 
V
K
 
R
N
 
K
T
 
L
L
 
L
T
 
E
G
 
G
P
 
N
L
 
I
S
 
S
E
 
E
T
 
D
C
 
F
P
 
P
A
 
A
S
 
S
I
 
A
L
 
L
M
 
H
T
 
L
H
 
H
P
 
S
Q
 
D
C
 
V
K
 
T
F
 
V
Y
 
L
F
 
I
D
 
D
A
 
R
D
 
E
A
 
A
V
 
A
S
 
S
K
 
L
L
 
R
P
 
P

Sites not aligning to the query:

2bkvB Structure and kinetics of a monomeric glucosamine-6-phosphate deaminase: missing link of the nagb superfamily (see paper)
33% identity, 76% coverage: 56:249/256 of query aligns to 50:242/242 of 2bkvB

query
sites
2bkvB
L
 
L
A
 
H
N
 
Q
S
 
T
K
 
E
K
 
N
I
 
L
Q
 
S
W
 
F
E
 
Q
K
 
N
V
 
I
V
 
T
A
 
T
M
 
V
H
 
N
M
 
L
D
|
D
E
 
E
Y
 
Y
I
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
S
P
 
S
E
 
D
S
 
D
P
 
P
Q
 
N
F
 
S
F
 
Y
S
 
H
K
 
F
Y
 
Y
L
 
M
V
 
N
E
 
D
N
 
R
L
 
F
F
 
F
S
 
Q
K
 
H
V
 
I
P
 
D
F
 
S
K
 
K
-
 
P
E
 
S
V
 
R
H
 
H
L
 
F
I
 
I
Q
 
P
T
 
N
Q
 
G
G
 
N
K
 
A
Q
 
D
E
 
D
L
 
L
E
 
E
I
 
A
-
 
E
-
 
C
K
 
R
W
 
R
Y
 
Y
S
 
E
N
 
Q
L
 
L
L
 
V
K
 
D
K
 
S
-
 
L
A
 
G
P
 
D
I
 
T
D
 
D
I
 
I
V
 
Q
C
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
I
G
 
G
E
 
R
N
|
N
G
 
G
H
|
H
I
 
I
A
 
G
F
 
F
N
 
N
D
x
E
P
 
P
P
 
G
V
 
T
A
 
S
N
 
-
F
 
F
Q
 
K
D
 
S
P
 
R
V
 
T
F
 
H
I
 
V
K
 
-
E
 
-
V
 
V
L
 
T
L
 
L
D
 
N
Q
 
E
A
 
-
C
 
-
R
 
Q
T
 
T
Q
 
R
Q
 
Q
V
 
A
N
 
N
D
 
A
G
 
R
C
 
Y
F
 
F
E
 
P
S
 
S
L
 
I
D
 
D
K
 
S
V
 
V
P
 
P
R
 
K
K
 
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
L
 
M
T
 
G
I
 
I
P
 
Q
A
 
T
L
 
I
M
 
L
S
 
S
G
 
S
D
 
K
N
 
R
L
 
I
F
 
L
C
 
L
V
 
L
V
 
I
L
 
S
G
 
G
K
 
K
N
 
S
K
|
K
S
 
A
E
 
E
A
 
A
V
 
V
K
 
R
N
 
K
T
 
L
L
 
L
T
 
E
G
 
G
P
 
N
L
 
I
S
 
S
E
 
E
T
 
D
C
 
F
P
 
P
A
 
A
S
 
S
I
 
A
L
 
L
M
 
H
T
 
L
H
 
H
P
 
S
Q
 
D
C
 
V
K
 
T
F
 
V
Y
 
L
F
 
I
D
 
D
A
 
R
D
 
E
A
 
A
V
 
A
S
 
S
K
 
L
L
 
R
P
 
P

Sites not aligning to the query:

O35000 Glucosamine-6-phosphate deaminase 1; GlcN6P deaminase 1; GNPDA 1; Glucosamine-6-phosphate isomerase 1; EC 3.5.99.6 from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
33% identity, 76% coverage: 56:249/256 of query aligns to 50:242/242 of O35000

query
sites
O35000
L
 
L
A
 
H
N
 
Q
S
 
T
K
 
E
K
 
N
I
 
L
Q
 
S
W
 
F
E
 
Q
K
 
N
V
 
I
V
 
T
A
 
T
M
 
V
H
 
N
M
 
L
D
|
D
E
 
E
Y
 
Y
I
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
S
P
 
S
E
 
D
S
 
D
P
 
P
Q
 
N
F
 
S
F
 
Y
S
 
H
K
 
F
Y
 
Y
L
 
M
V
 
N
E
 
D
N
 
R
L
 
F
F
 
F
S
 
Q
K
 
H
V
 
I
P
 
D
F
 
S
K
 
K
-
 
P
E
 
S
V
 
R
H
 
H
L
 
F
I
 
I
Q
 
P
T
 
N
Q
 
G
G
 
N
K
 
A
Q
 
D
E
 
D
L
 
L
E
 
E
I
 
A
-
 
E
-
 
C
K
 
R
W
 
R
Y
 
Y
S
 
E
N
 
Q
L
 
L
L
 
V
K
 
D
K
 
S
-
 
L
A
 
G
P
 
D
I
 
T
D
 
D
I
 
I
V
 
Q
C
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
I
G
 
G
E
 
R
N
 
N
G
 
G
H
|
H
I
 
I
A
x
G
F
 
F
N
 
N
D
 
E
P
 
P
P
 
G
V
 
T
A
 
S
N
 
-
F
 
F
Q
 
K
D
 
S
P
 
R
V
 
T
F
 
H
I
 
V
K
 
-
E
 
-
V
 
V
L
 
T
L
 
L
D
 
N
Q
 
E
A
 
-
C
 
-
R
 
Q
T
 
T
Q
 
R
Q
 
Q
V
 
A
N
 
N
D
 
A
G
x
R
C
 
Y
F
 
F
E
 
P
S
 
S
L
 
I
D
 
D
K
 
S
V
 
V
P
 
P
R
 
K
K
 
K
A
 
A
L
 
L
T
 
T
L
 
M
T
 
G
I
 
I
P
 
Q
A
 
T
L
 
I
M
 
L
S
 
S
G
 
S
D
 
K
N
 
R
L
 
I
F
 
L
C
 
L
V
 
L
V
 
I
L
 
S
G
 
G
K
 
K
N
 
S
K
|
K
S
 
A
E
 
E
A
 
A
V
 
V
K
 
R
N
 
K
T
 
L
L
 
L
T
 
E
G
 
G
P
 
N
L
 
I
S
 
S
E
 
E
T
 
D
C
 
F
P
 
P
A
 
A
S
 
S
I
 
A
L
 
L
M
 
H
T
 
L
H
 
H
P
 
S
Q
 
D
C
 
V
K
 
T
F
 
V
Y
 
L
F
 
I
D
 
D
A
 
R
D
 
E
A
 
A
V
 
A
S
 
S
K
 
L
L
 
R
P
 
P

Sites not aligning to the query:

5hj5B Crystal structure of tertiary complex of glucosamine-6-phosphate deaminase from vibrio cholerae with beta-d-glucose-6-phosphate and fructose-6-phosphate
26% identity, 74% coverage: 59:248/256 of query aligns to 58:247/267 of 5hj5B

query
sites
5hj5B
S
 
A
K
 
G
K
 
E
I
 
V
Q
 
S
W
 
F
E
 
K
K
 
H
V
 
V
V
 
V
A
 
T
M
 
F
H
 
N
M
 
M
D
|
D
E
 
E
Y
 
Y
I
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
A
P
 
A
E
 
D
S
 
H
P
 
P
Q
 
E
F
 
S
F
 
Y
S
 
R
K
 
S
Y
 
F
L
 
M
V
 
Y
E
 
N
N
 
N
L
 
F
F
 
F
S
 
N
K
 
H
V
 
I
P
 
D
F
 
I
K
 
Q
E
 
E
V
 
E
H
 
N
L
 
I
I
 
N
Q
 
L
T
 
L
Q
 
N
G
 
G
K
 
N
-
 
T
-
 
D
-
 
D
Q
 
H
E
 
E
L
 
A
E
 
E
I
 
C
K
 
K
W
 
R
Y
 
Y
S
 
E
N
 
D
L
 
K
L
 
I
K
 
K
K
 
S
-
 
Y
A
 
G
P
 
K
I
 
I
D
 
N
I
 
L
V
 
F
C
 
M
L
 
G
G
|
G
I
x
V
G
 
G
E
 
N
N
x
D
G
 
G
H
|
H
I
 
I
A
|
A
F
 
F
N
 
N
D
x
E
P
 
P
P
 
-
V
 
A
A
 
S
N
 
S
F
 
L
Q
 
S
D
 
S
P
 
R
V
 
T
F
 
R
I
 
I
K
 
K
E
 
T
V
 
L
L
 
T
L
 
E
D
 
D
Q
 
T
A
 
R
C
 
I
R
 
A
T
 
N
Q
 
S
Q
x
R
V
 
F
N
 
F
D
 
D
G
 
G
C
 
-
F
 
-
E
 
-
S
 
D
L
 
I
D
 
N
K
 
Q
V
 
V
P
 
P
R
 
K
K
 
Y
A
 
A
L
 
L
T
 
T
L
 
I
T
 
G
I
 
V
P
 
G
A
 
T
L
 
L
M
 
L
S
 
D
G
 
A
D
 
Q
N
 
E
L
 
I
F
 
M
C
 
I
V
 
L
V
 
V
L
 
T
G
 
G
K
 
H
N
 
N
K
|
K
S
 
A
E
 
L
A
 
A
V
 
L
K
 
Q
N
 
A
T
 
A
L
 
V
T
 
E
G
 
G
P
 
S
L
 
V
S
 
N
E
 
H
T
 
L
C
 
W
P
 
T
A
 
V
S
 
S
I
 
A
L
 
L
M
 
Q
T
 
L
H
 
H
P
 
P
Q
 
K
C
 
A
K
 
V
F
 
I
Y
 
V
F
 
C
D
 
D
A
 
E
D
 
P
A
 
S
V
 
T
S
 
Q
K
 
E
L
 
L

Sites not aligning to the query:

2wu1A Glucosamine-6-phosphate deaminase complexed with the allosteric activator n-acetyl-glucoamine-6-phosphate both in the active and allosteric sites.
26% identity, 75% coverage: 56:248/256 of query aligns to 55:247/266 of 2wu1A

query
sites
2wu1A
L
 
M
A
 
H
N
 
K
S
 
A
K
 
G
K
 
Q
I
 
V
Q
 
S
W
 
F
E
 
K
K
 
H
V
 
V
V
 
V
A
 
T
M
 
F
H
 
N
M
 
M
D
|
D
E
 
E
Y
 
Y
I
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
P
P
 
K
E
 
E
S
 
H
P
 
P
Q
 
E
F
 
S
F
 
Y
S
 
Y
K
 
S
Y
 
F
L
 
M
V
 
H
E
 
R
N
 
N
L
 
F
F
 
F
S
 
D
K
 
H
V
 
V
-
 
D
-
 
I
P
 
P
F
 
A
K
 
E
E
 
N
V
 
I
H
 
N
L
 
L
I
 
L
Q
 
N
T
 
G
Q
 
N
G
 
A
K
 
P
Q
 
D
-
 
I
E
 
D
L
 
A
E
 
E
I
 
C
K
 
R
W
 
Q
Y
 
Y
S
 
E
N
 
E
L
 
K
L
 
I
K
 
R
K
 
S
-
 
Y
A
 
G
P
 
K
I
 
I
D
 
H
I
 
L
V
 
F
C
 
M
L
 
G
G
 
G
I
x
V
G
|
G
E
x
N
N
x
D
G
 
G
H
|
H
I
 
I
A
 
A
F
 
F
N
 
N
D
x
E
P
 
-
P
 
P
V
 
A
A
 
S
N
 
S
F
 
L
Q
 
A
D
 
S
P
 
R
V
 
T
F
 
R
I
 
I
K
 
K
E
 
T
V
 
L
L
 
T
L
 
H
D
 
D
Q
 
-
A
 
-
C
 
-
R
 
-
T
 
T
Q
 
R
Q
 
V
V
x
A
N
|
N
D
 
S
G
x
R
C
 
F
F
 
F
E
 
D
S
 
N
-
 
D
L
 
V
D
 
N
K
 
Q
V
 
V
P
 
P
R
 
K
K
 
Y
A
 
A
L
 
L
T
 
T
L
 
V
T
 
G
I
 
V
P
 
G
A
 
T
L
 
L
M
 
L
S
 
D
G
 
A
D
 
E
N
 
E
L
 
V
F
 
M
C
 
I
V
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
K
 
S
N
 
Q
K
|
K
S
 
A
E
 
L
A
 
A
V
 
L
K
 
Q
N
 
A
T
 
A
L
 
V
T
 
E
G
 
G
P
 
C
L
 
V
S
 
N
E
 
H
T
 
M
C
 
W
P
 
T
A
 
I
S
 
S
I
 
C
L
 
L
M
 
Q
T
 
L
H
 
H
P
 
P
Q
 
K
C
 
A
K
 
I
F
 
M
Y
 
V
F
 
C
D
 
D
A
 
E
D
 
P
A
 
S
V
 
T
S
 
M
K
 
E
L
 
L

Sites not aligning to the query:

1horA Structure and catalytic mechanism of glucosamine 6-phosphate deaminase from escherichia coli at 2.1 angstroms resolution (see paper)
26% identity, 75% coverage: 56:248/256 of query aligns to 55:247/266 of 1horA

query
sites
1horA
L
 
M
A
 
H
N
 
K
S
 
A
K
 
G
K
 
Q
I
 
V
Q
 
S
W
 
F
E
 
K
K
 
H
V
 
V
V
 
V
A
 
T
M
 
F
H
 
N
M
|
M
D
|
D
E
 
E
Y
 
Y
I
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
P
P
 
K
E
 
E
S
 
H
P
 
P
Q
 
E
F
 
S
F
 
Y
S
 
Y
K
 
S
Y
 
F
L
 
M
V
 
H
E
 
R
N
 
N
L
 
F
F
 
F
S
 
D
K
 
H
V
 
V
-
 
D
-
 
I
P
 
P
F
 
A
K
 
E
E
 
N
V
 
I
H
 
N
L
 
L
I
 
L
Q
 
N
T
 
G
Q
 
N
G
 
A
K
 
P
Q
 
D
-
 
I
E
 
D
L
 
A
E
 
E
I
 
C
K
 
R
W
 
Q
Y
 
Y
S
 
E
N
 
E
L
 
K
L
 
I
K
 
R
K
 
S
-
 
Y
A
 
G
P
 
K
I
 
I
D
 
H
I
 
L
V
 
F
C
 
M
L
 
G
G
|
G
I
x
V
G
 
G
E
 
N
N
x
D
G
 
G
H
|
H
I
 
I
A
|
A
F
|
F
N
 
N
D
x
E
P
 
-
P
 
P
V
 
A
A
 
S
N
 
S
F
 
L
Q
 
A
D
 
S
P
 
R
V
 
T
F
 
R
I
 
I
K
 
K
E
 
T
V
 
L
L
 
T
L
 
H
D
 
D
Q
 
-
A
 
-
C
 
-
R
 
-
T
 
T
Q
 
R
Q
 
V
V
 
A
N
 
N
D
 
S
G
 
R
C
 
F
F
 
F
E
 
D
S
 
N
-
 
D
L
 
V
D
 
N
K
 
Q
V
 
V
P
 
P
R
 
K
K
 
Y
A
 
A
L
 
L
T
 
T
L
 
V
T
 
G
I
 
V
P
 
G
A
 
T
L
 
L
M
 
L
S
 
D
G
 
A
D
 
E
N
 
E
L
 
V
F
 
M
C
 
I
V
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
K
 
S
N
 
Q
K
|
K
S
 
A
E
 
L
A
 
A
V
 
L
K
 
Q
N
 
A
T
 
A
L
 
V
T
 
E
G
 
G
P
 
C
L
 
V
S
 
N
E
 
H
T
 
M
C
 
W
P
 
T
A
 
I
S
 
S
I
 
C
L
 
L
M
 
Q
T
 
L
H
 
H
P
 
P
Q
 
K
C
 
A
K
 
I
F
 
M
Y
 
V
F
 
C
D
 
D
A
 
E
D
 
P
A
 
S
V
 
T
S
 
M
K
 
E
L
 
L

Sites not aligning to the query:

1fqoA Glucosamine 6-phosphate deaminase complexed with the substrate of the reverse reaction fructose 6-phosphate (open form) (see paper)
26% identity, 75% coverage: 56:248/256 of query aligns to 55:247/266 of 1fqoA

query
sites
1fqoA
L
 
M
A
 
H
N
 
K
S
 
A
K
 
G
K
 
Q
I
 
V
Q
 
S
W
 
F
E
 
K
K
 
H
V
 
V
V
 
V
A
 
T
M
 
F
H
 
N
M
|
M
D
|
D
E
 
E
Y
 
Y
I
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
P
P
 
K
E
 
E
S
 
H
P
 
P
Q
 
E
F
 
S
F
 
Y
S
 
Y
K
 
S
Y
 
F
L
 
M
V
 
H
E
 
R
N
 
N
L
 
F
F
 
F
S
 
D
K
 
H
V
 
V
-
 
D
-
 
I
P
 
P
F
 
A
K
 
E
E
 
N
V
 
I
H
 
N
L
 
L
I
 
L
Q
 
N
T
 
G
Q
 
N
G
 
A
K
 
P
Q
 
D
-
 
I
E
 
D
L
 
A
E
 
E
I
 
C
K
 
R
W
 
Q
Y
 
Y
S
 
E
N
 
E
L
 
K
L
 
I
K
 
R
K
 
S
-
 
Y
A
 
G
P
 
K
I
 
I
D
 
H
I
 
L
V
 
F
C
 
M
L
 
G
G
|
G
I
x
V
G
 
G
E
 
N
N
x
D
G
 
G
H
|
H
I
 
I
A
|
A
F
 
F
N
 
N
D
x
E
P
 
-
P
 
P
V
 
A
A
x
S
N
x
S
F
 
L
Q
 
A
D
 
S
P
 
R
V
 
T
F
x
R
I
|
I
K
|
K
E
 
T
V
 
L
L
 
T
L
 
H
D
 
D
Q
 
-
A
 
-
C
 
-
R
 
-
T
 
T
Q
 
R
Q
 
V
V
 
A
N
 
N
D
 
S
G
 
R
C
 
F
F
 
F
E
 
D
S
 
N
-
 
D
L
 
V
D
 
N
K
 
Q
V
 
V
P
 
P
R
 
K
K
 
Y
A
 
A
L
 
L
T
 
T
L
 
V
T
 
G
I
 
V
P
 
G
A
 
T
L
 
L
M
 
L
S
 
D
G
 
A
D
 
E
N
 
E
L
 
V
F
 
M
C
 
I
V
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
K
 
S
N
 
Q
K
|
K
S
 
A
E
 
L
A
 
A
V
 
L
K
 
Q
N
 
A
T
 
A
L
 
V
T
 
E
G
 
G
P
 
C
L
 
V
S
 
N
E
 
H
T
 
M
C
 
W
P
 
T
A
 
I
S
 
S
I
 
C
L
 
L
M
 
Q
T
 
L
H
 
H
P
 
P
Q
 
K
C
 
A
K
 
I
F
 
M
Y
 
V
F
 
C
D
 
D
A
 
E
D
 
P
A
 
S
V
 
T
S
 
M
K
 
E
L
 
L

Sites not aligning to the query:

1deaA Structure and catalytic mechanism of glucosamine 6-phosphate deaminase from escherichia coli at 2.1 angstroms resolution (see paper)
26% identity, 75% coverage: 56:248/256 of query aligns to 55:247/266 of 1deaA

query
sites
1deaA
L
 
M
A
 
H
N
 
K
S
 
A
K
 
G
K
 
Q
I
 
V
Q
 
S
W
 
F
E
 
K
K
 
H
V
 
V
V
 
V
A
 
T
M
 
F
H
 
N
M
 
M
D
|
D
E
 
E
Y
 
Y
I
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
P
P
 
K
E
 
E
S
 
H
P
 
P
Q
 
E
F
 
S
F
 
Y
S
 
Y
K
 
S
Y
 
F
L
 
M
V
 
H
E
 
R
N
 
N
L
 
F
F
 
F
S
 
D
K
 
H
V
 
V
-
 
D
-
 
I
P
 
P
F
 
A
K
 
E
E
 
N
V
 
I
H
 
N
L
 
L
I
 
L
Q
 
N
T
 
G
Q
 
N
G
 
A
K
 
P
Q
 
D
-
 
I
E
 
D
L
 
A
E
 
E
I
 
C
K
 
R
W
 
Q
Y
 
Y
S
 
E
N
 
E
L
 
K
L
 
I
K
 
R
K
 
S
-
 
Y
A
 
G
P
 
K
I
 
I
D
 
H
I
 
L
V
 
F
C
 
M
L
 
G
G
 
G
I
 
V
G
 
G
E
 
N
N
x
D
G
 
G
H
|
H
I
 
I
A
 
A
F
 
F
N
 
N
D
x
E
P
 
-
P
 
P
V
 
A
A
 
S
N
 
S
F
 
L
Q
 
A
D
 
S
P
 
R
V
 
T
F
 
R
I
 
I
K
 
K
E
 
T
V
 
L
L
 
T
L
 
H
D
 
D
Q
 
-
A
 
-
C
 
-
R
 
-
T
 
T
Q
 
R
Q
 
V
V
 
A
N
 
N
D
 
S
G
x
R
C
 
F
F
 
F
E
 
D
S
 
N
-
 
D
L
 
V
D
 
N
K
 
Q
V
 
V
P
 
P
R
 
K
K
 
Y
A
 
A
L
 
L
T
 
T
L
 
V
T
 
G
I
 
V
P
 
G
A
 
T
L
 
L
M
 
L
S
 
D
G
 
A
D
 
E
N
 
E
L
 
V
F
 
M
C
 
I
V
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
K
 
S
N
 
Q
K
 
K
S
 
A
E
 
L
A
 
A
V
 
L
K
 
Q
N
 
A
T
 
A
L
 
V
T
 
E
G
 
G
P
 
C
L
 
V
S
 
N
E
 
H
T
 
M
C
 
W
P
 
T
A
 
I
S
 
S
I
 
C
L
 
L
M
 
Q
T
 
L
H
 
H
P
 
P
Q
 
K
C
 
A
K
 
I
F
 
M
Y
 
V
F
 
C
D
 
D
A
 
E
D
 
P
A
 
S
V
 
T
S
 
M
K
 
E
L
 
L

Sites not aligning to the query:

P0A759 Glucosamine-6-phosphate deaminase; GlcN6P deaminase; GNPDA; Glucosamine-6-phosphate isomerase; EC 3.5.99.6 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
26% identity, 75% coverage: 56:248/256 of query aligns to 55:247/266 of P0A759

query
sites
P0A759
L
 
M
A
 
H
N
 
K
S
 
A
K
 
G
K
 
Q
I
 
V
Q
 
S
W
 
F
E
 
K
K
 
H
V
 
V
V
 
V
A
 
T
M
 
F
H
 
N
M
 
M
D
|
D
E
 
E
Y
 
Y
I
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
P
P
 
K
E
 
E
S
 
H
P
 
P
Q
 
E
F
 
S
F
 
Y
S
 
Y
K
 
S
Y
 
F
L
 
M
V
 
H
E
 
R
N
 
N
L
 
F
F
 
F
S
 
D
K
 
H
V
 
V
-
 
D
-
 
I
P
 
P
F
 
A
K
 
E
E
 
N
V
 
I
H
 
N
L
 
L
I
 
L
Q
 
N
T
 
G
Q
 
N
G
 
A
K
 
P
Q
 
D
-
 
I
E
 
D
L
 
A
E
 
E
I
x
C
K
 
R
W
 
Q
Y
 
Y
S
 
E
N
 
E
L
 
K
L
 
I
K
 
R
K
 
S
-
 
Y
A
 
G
P
 
K
I
 
I
D
 
H
I
 
L
V
 
F
C
 
M
L
 
G
G
 
G
I
 
V
G
 
G
E
 
N
N
x
D
G
 
G
H
|
H
I
 
I
A
 
A
F
 
F
N
 
N
D
x
E
P
 
-
P
 
P
V
 
A
A
 
S
N
 
S
F
 
L
Q
 
A
D
 
S
P
 
R
V
 
T
F
 
R
I
 
I
K
 
K
E
 
T
V
 
L
L
 
T
L
 
H
D
 
D
Q
 
-
A
 
-
C
 
-
R
 
-
T
 
T
Q
 
R
Q
 
V
V
 
A
N
 
N
D
 
S
G
 
R
C
 
F
F
 
F
E
 
D
S
 
N
-
 
D
L
 
V
D
 
N
K
 
Q
V
 
V
P
 
P
R
 
K
K
 
Y
A
 
A
L
 
L
T
 
T
L
 
V
T
 
G
I
 
V
P
 
G
A
 
T
L
 
L
M
 
L
S
 
D
G
 
A
D
 
E
N
 
E
L
 
V
F
 
M
C
 
I
V
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
K
 
S
N
 
Q
K
 
K
S
 
A
E
 
L
A
 
A
V
 
L
K
 
Q
N
 
A
T
 
A
L
 
V
T
 
E
G
 
G
P
x
C
L
 
V
S
 
N
E
 
H
T
 
M
C
 
W
P
 
T
A
 
I
S
 
S
I
 
C
L
 
L
M
 
Q
T
 
L
H
 
H
P
 
P
Q
 
K
C
 
A
K
 
I
F
 
M
Y
 
V
F
x
C
D
 
D
A
 
E
D
 
P
A
 
S
V
 
T
S
 
M
K
 
E
L
 
L

3hn6A Crystal structure of glucosamine-6-phosphate deaminase from borrelia burgdorferi
27% identity, 75% coverage: 56:248/256 of query aligns to 58:250/271 of 3hn6A

query
sites
3hn6A
L
 
L
A
 
N
N
 
K
S
 
N
K
 
K
K
 
K
I
 
I
Q
 
S
W
 
F
E
 
Q
K
 
N
V
 
V
V
 
I
A
 
T
M
 
F
H
 
N
M
 
M
D
|
D
E
 
E
Y
 
Y
I
 
I
G
 
G
L
 
I
P
 
E
P
 
E
E
 
N
S
 
H
P
 
P
Q
 
E
F
 
S
F
 
Y
S
 
H
K
 
S
Y
 
F
L
 
M
V
 
W
E
 
N
N
 
N
L
 
F
F
 
F
S
 
S
K
 
H
V
 
I
P
 
D
F
 
I
K
 
K
E
 
K
V
 
E
H
 
N
L
 
I
I
 
N
Q
 
I
T
 
L
Q
 
N
G
 
G
K
 
N
Q
 
A
E
 
-
L
 
-
E
 
-
I
 
-
K
 
-
W
 
-
Y
 
-
S
 
S
N
 
N
L
 
L
L
 
K
K
 
K
K
 
E
-
 
C
-
 
E
-
 
E
-
 
Y
-
 
E
-
 
K
-
 
K
-
 
I
-
 
K
-
 
S
-
 
F
A
 
G
P
 
G
I
 
I
D
 
M
I
 
L
V
 
F
C
 
V
L
 
G
G
 
G
I
 
I
G
 
G
E
 
P
N
x
D
G
 
G
H
|
H
I
 
I
A
 
A
F
 
F
N
 
N
D
x
E
P
 
P
P
 
G
V
 
-
A
 
S
N
 
S
F
 
L
Q
 
T
D
 
S
P
 
R
V
 
T
F
 
R
I
 
I
K
 
K
E
 
T
V
 
L
L
 
T
L
 
Q
D
 
D
Q
 
T
A
 
I
C
 
I
R
 
A
T
 
N
Q
 
S
Q
 
R
V
 
F
N
 
F
D
 
E
G
 
G
C
 
-
F
 
-
E
 
-
S
 
D
L
 
V
D
 
N
K
 
K
V
 
V
P
 
P
R
 
K
K
 
N
A
 
A
L
 
L
T
 
T
L
 
V
T
 
G
I
 
I
P
 
G
A
 
T
L
 
I
M
 
M
S
 
D
G
 
S
D
 
Q
N
 
E
L
 
V
F
 
L
C
 
I
V
 
I
V
 
V
L
 
N
G
 
G
K
 
H
N
 
N
K
 
K
S
 
A
E
x
R
A
 
A
V
 
L
K
|
K
N
x
H
T
 
A
L
 
I
T
 
E
G
 
K
P
 
G
L
 
V
S
 
N
E
 
H
T
 
M
C
 
W
P
 
T
A
 
I
S
 
S
I
 
A
L
 
L
M
 
Q
T
 
L
H
 
H
P
 
K
Q
 
N
C
 
A
K
 
I
F
 
I
Y
 
V
F
 
S
D
 
D
A
 
K
D
 
N
A
 
A
V
 
T
S
 
Y
K
 
E
L
 
L

1ne7A Human glucosamine-6-phosphate deaminase isomerase at 1.75 a resolution complexed with n-acetyl-glucosamine-6-phosphate and 2-deoxy-2-amino- glucitol-6-phosphate (see paper)
25% identity, 77% coverage: 52:248/256 of query aligns to 52:247/281 of 1ne7A

query
sites
1ne7A
M
 
L
L
 
I
N
 
E
Y
 
Y
L
 
Y
A
 
K
N
 
N
S
 
G
K
 
D
K
 
-
I
 
L
Q
 
S
W
 
F
E
 
K
K
 
Y
V
 
V
V
 
K
A
 
T
M
 
F
H
 
N
M
|
M
D
|
D
E
 
E
Y
 
Y
I
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
P
P
 
R
E
 
D
S
 
H
P
 
P
Q
 
E
F
 
S
F
 
Y
S
 
H
K
 
S
Y
 
F
L
 
M
V
 
W
E
 
N
N
 
N
L
 
F
F
 
F
S
 
K
K
 
H
V
 
I
P
 
D
F
 
I
-
 
H
-
 
P
K
 
E
E
 
N
V
 
T
H
 
H
L
 
I
I
 
L
Q
 
D
T
 
G
Q
 
N
G
 
A
K
 
V
Q
 
D
-
 
L
E
 
Q
L
 
A
E
 
E
I
 
C
K
 
D
W
 
A
Y
 
F
S
 
E
N
 
E
L
 
K
L
 
I
K
 
K
K
 
A
A
 
A
P
 
G
-
 
G
I
 
I
D
 
E
I
 
L
V
 
F
C
 
V
L
 
G
G
 
G
I
 
I
G
 
G
E
 
P
N
x
D
G
 
G
H
|
H
I
 
I
A
|
A
F
 
F
N
 
N
D
x
E
P
 
P
P
 
G
V
 
-
A
x
S
N
x
S
F
 
L
Q
 
V
D
 
S
P
 
R
V
 
T
F
x
R
I
x
V
K
|
K
E
x
T
V
 
L
L
 
A
L
 
M
D
 
D
Q
 
T
A
 
I
C
 
L
R
 
A
T
 
N
Q
 
A
Q
 
R
V
 
F
N
 
F
D
 
D
G
 
G
C
 
-
F
 
-
E
 
-
S
 
E
L
 
L
D
 
T
K
 
K
V
 
V
P
 
P
R
 
T
K
 
M
A
 
A
L
 
L
T
 
T
L
 
V
T
 
G
I
 
V
P
 
G
A
 
T
L
 
V
M
 
M
S
 
D
G
 
A
D
 
R
N
 
E
L
 
V
F
 
M
C
 
I
V
 
L
V
 
I
L
 
T
G
 
G
K
 
A
N
 
H
K
|
K
S
 
A
E
 
F
A
 
A
V
 
L
K
 
Y
N
 
K
T
 
A
L
 
I
T
 
E
G
 
E
P
 
G
L
 
V
S
 
N
E
 
H
T
 
M
C
 
W
P
 
T
A
 
V
S
 
S
I
 
A
L
 
F
M
 
Q
T
 
Q
H
 
H
P
 
P
Q
 
R
C
 
T
K
 
V
F
 
F
Y
 
V
F
 
C
D
 
D
A
 
E
D
 
D
A
 
A
V
 
T
S
 
L
K
 
E
L
 
L

Sites not aligning to the query:

P46926 Glucosamine-6-phosphate isomerase 1; Glucosamine-6-phosphate deaminase 1; GNPDA 1; GlcN6P deaminase 1; Oscillin; EC 3.5.99.6 from Homo sapiens (Human) (see paper)
25% identity, 77% coverage: 52:248/256 of query aligns to 52:247/289 of P46926

query
sites
P46926
M
 
L
L
 
I
N
 
E
Y
 
Y
L
 
Y
A
 
K
N
 
N
S
 
G
K
 
D
K
 
-
I
 
L
Q
 
S
W
 
F
E
 
K
K
 
Y
V
 
V
V
 
K
A
 
T
M
 
F
H
 
N
M
 
M
D
 
D
E
 
E
Y
 
Y
I
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
P
P
 
R
E
 
D
S
 
H
P
 
P
Q
 
E
F
 
S
F
 
Y
S
 
H
K
 
S
Y
 
F
L
 
M
V
 
W
E
 
N
N
 
N
L
 
F
F
 
F
S
 
K
K
 
H
V
 
I
P
 
D
F
 
I
-
 
H
-
 
P
K
 
E
E
 
N
V
 
T
H
 
H
L
 
I
I
 
L
Q
 
D
T
 
G
Q
 
N
G
 
A
K
 
V
Q
 
D
-
 
L
E
 
Q
L
 
A
E
 
E
I
 
C
K
 
D
W
 
A
Y
 
F
S
 
E
N
 
E
L
 
K
L
 
I
K
 
K
K
 
A
A
 
A
P
 
G
-
 
G
I
 
I
D
 
E
I
 
L
V
 
F
C
 
V
L
 
G
G
 
G
I
 
I
G
 
G
E
 
P
N
 
D
G
 
G
H
 
H
I
 
I
A
 
A
F
 
F
N
 
N
D
 
E
P
 
P
P
 
G
V
 
-
A
 
S
N
 
S
F
 
L
Q
 
V
D
 
S
P
 
R
V
 
T
F
 
R
I
 
V
K
 
K
E
 
T
V
 
L
L
 
A
L
 
M
D
 
D
Q
 
T
A
 
I
C
 
L
R
 
A
T
 
N
Q
 
A
Q
 
R
V
 
F
N
 
F
D
 
D
G
 
G
C
 
-
F
 
-
E
 
-
S
 
E
L
 
L
D
 
T
K
 
K
V
 
V
P
 
P
R
 
T
K
 
M
A
 
A
L
 
L
T
 
T
L
 
V
T
 
G
I
 
V
P
 
G
A
 
T
L
 
V
M
 
M
S
 
D
G
 
A
D
 
R
N
 
E
L
 
V
F
 
M
C
 
I
V
 
L
V
 
I
L
 
T
G
 
G
K
 
A
N
 
H
K
 
K
S
 
A
E
 
F
A
 
A
V
 
L
K
 
Y
N
 
K
T
 
A
L
 
I
T
 
E
G
 
E
P
 
G
L
 
V
S
 
N
E
 
H
T
 
M
C
 
W
P
 
T
A
 
V
S
 
S
I
 
A
L
 
F
M
 
Q
T
 
Q
H
 
H
P
 
P
Q
 
R
C
 
T
K
 
V
F
 
F
Y
 
V
F
 
C
D
 
D
A
 
E
D
 
D
A
 
A
V
 
T
S
 
L
K
 
E
L
 
L

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_008203445.1 NCBI__GCF_000166275.1:WP_008203445.1
MKEIQQEIQVFSTRDLTWKSAGEAVEKCIVDLQERQEEIRMVFAAAPSQTGMLNYLANSK
KIQWEKVVAMHMDEYIGLPPESPQFFSKYLVENLFSKVPFKEVHLIQTQGKQELEIKWYS
NLLKKAPIDIVCLGIGENGHIAFNDPPVANFQDPVFIKEVLLDQACRTQQVNDGCFESLD
KVPRKALTLTIPALMSGDNLFCVVLGKNKSEAVKNTLTGPLSETCPASILMTHPQCKFYF
DADAVSKLPQFHFTTN

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory