SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_008485428.1 NCBI__GCF_000299915.1:WP_008485428.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4mvaA 1.43 angstrom resolution crystal structure of triosephosphate isomerase (tpia) from escherichia coli in complex with acetyl phosphate. (see paper)
52% identity, 100% coverage: 1:249/250 of query aligns to 1:249/255 of 4mvaA

query
sites
4mvaA
M
 
M
R
 
R
R
 
H
P
 
P
L
 
L
V
 
V
M
 
M
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
L
 
L
H
 
N
G
 
G
S
 
S
K
 
R
A
 
H
S
 
M
V
 
V
E
 
H
K
 
E
L
 
L
L
 
V
V
 
S
E
 
N
L
 
L
M
 
R
V
 
K
K
 
E
A
 
L
N
 
A
E
 
G
V
 
V
E
 
A
G
 
G
V
 
C
E
 
A
I
 
V
A
 
A
V
 
I
C
 
A
P
 
P
P
 
P
L
 
E
V
 
M
F
 
Y
V
 
I
G
 
D
Q
 
M
A
 
A
E
 
K
R
 
R
L
 
E
L
 
A
R
 
E
Y
 
G
S
 
S
Q
 
H
I
 
I
A
 
M
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
I
 
V
D
 
D
V
 
L
N
 
N
R
 
L
Q
 
S
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
T
A
 
S
A
 
A
D
 
A
M
 
M
L
 
L
G
 
K
E
 
D
F
 
I
G
 
G
V
 
A
R
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
L
 
I
V
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
A
 
T
M
 
Y
H
 
H
H
 
K
E
 
E
N
 
S
D
 
D
D
 
E
L
 
L
V
 
I
A
 
A
R
 
K
K
 
K
F
 
F
E
 
A
A
 
V
V
 
L
K
 
K
A
 
E
A
 
Q
G
 
G
L
 
L
I
 
T
P
 
P
V
 
V
L
 
L
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
Q
 
E
A
 
A
E
 
E
R
 
N
N
 
E
N
 
A
G
 
G
E
 
K
T
 
T
K
 
E
D
 
E
V
 
V
I
 
C
G
 
A
H
 
R
Q
 
Q
L
 
I
Q
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
L
K
 
K
R
 
T
C
 
Q
G
 
G
R
 
A
K
 
A
A
 
A
F
 
F
D
 
E
N
 
G
A
 
A
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
S
 
T
G
 
G
Q
 
K
A
 
S
A
 
A
S
 
T
P
 
P
V
 
A
D
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
K
 
A
V
 
V
H
 
H
E
 
K
F
 
F
I
 
I
R
 
R
A
 
D
Q
 
H
V
 
I
A
 
A
A
 
K
Q
 
V
D
 
D
P
 
A
A
 
N
S
 
I
A
 
A
Q
 
E
A
 
Q
L
 
V
R
 
I
I
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
N
A
 
A
S
 
S
N
 
N
A
 
A
Q
 
A
A
 
E
L
 
L
F
 
F
M
 
A
M
 
Q
D
 
P
D
 
D
V
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
D
 
K
A
 
A
Q
 
D
E
 
A
F
 
F
S
 
A
G
 
V
I
 
I
F
 
V
N
 
K
A
 
A
A
 
A

B1XB85 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Escherichia coli (strain K12 / DH10B) (see paper)
52% identity, 100% coverage: 1:249/250 of query aligns to 1:249/255 of B1XB85

query
sites
B1XB85
M
 
M
R
 
R
R
 
H
P
 
P
L
 
L
V
 
V
M
 
M
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
L
 
L
H
 
N
G
 
G
S
 
S
K
 
R
A
 
H
S
 
M
V
 
V
E
 
H
K
 
E
L
 
L
L
 
V
V
 
S
E
 
N
L
 
L
M
 
R
V
 
K
K
 
E
A
 
L
N
 
A
E
 
G
V
 
V
E
 
A
G
 
G
V
 
C
E
 
A
I
 
V
A
 
A
V
 
I
C
 
A
P
 
P
P
 
P
L
 
E
V
 
M
F
 
Y
V
 
I
G
 
D
Q
 
M
A
 
A
E
 
K
R
 
R
L
 
E
L
 
A
R
 
E
Y
 
G
S
 
S
Q
 
H
I
 
I
A
 
M
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
I
 
V
D
 
D
V
 
L
N
 
N
R
 
L
Q
 
S
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
T
A
 
S
A
 
A
D
 
A
M
 
M
L
 
L
G
 
K
E
 
D
F
 
I
G
 
G
V
 
A
R
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
L
 
I
V
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
A
 
T
M
 
Y
H
 
H
H
 
K
E
 
E
N
 
S
D
 
D
D
 
E
L
 
L
V
 
I
A
 
A
R
 
K
K
 
K
F
 
F
E
 
A
A
 
V
V
 
L
K
 
K
A
 
E
A
 
Q
G
 
G
L
 
L
I
 
T
P
 
P
V
 
V
L
 
L
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
Q
 
E
A
 
A
E
 
E
R
 
N
N
 
E
N
 
A
G
 
G
E
 
K
T
 
T
K
 
E
D
 
E
V
 
V
I
 
C
G
 
A
H
 
R
Q
 
Q
L
 
I
Q
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
L
K
 
K
R
 
T
C
 
Q
G
 
G
R
 
A
K
 
A
A
 
A
F
 
F
D
 
E
N
 
G
A
 
A
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
S
 
T
G
 
G
Q
 
K
A
 
S
A
 
A
S
 
T
P
 
P
V
 
A
D
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
K
 
A
V
 
V
H
 
H
E
 
K
F
 
F
I
 
I
R
 
R
A
 
D
Q
 
H
V
 
I
A
 
A
A
 
K
Q
 
V
D
 
D
P
 
A
A
 
N
S
 
I
A
 
A
Q
 
E
A
 
Q
L
 
V
R
 
I
I
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
N
A
 
A
S
 
S
N
 
N
A
 
A
Q
 
A
A
 
E
L
 
L
F
 
F
M
 
A
M
 
Q
D
 
P
D
 
D
V
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
D
 
K
A
 
A
Q
 
D
E
 
A
F
 
F
S
 
A
G
 
V
I
 
I
F
 
V
N
 
K
A
 
A
A
 
A

P50921 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Moritella marina (Vibrio marinus) (see paper)
53% identity, 95% coverage: 1:238/250 of query aligns to 1:240/256 of P50921

query
sites
P50921
M
 
M
R
 
R
R
 
H
P
 
P
L
 
V
V
 
V
M
 
M
G
 
G
N
|
N
W
|
W
K
|
K
L
 
L
H
 
N
G
 
G
S
 
S
K
 
K
A
 
E
S
 
M
V
 
V
E
 
V
K
 
D
L
 
L
L
 
L
V
 
N
E
 
G
L
 
L
M
 
N
V
 
A
K
 
E
A
 
L
N
 
E
E
 
G
V
 
V
E
 
T
G
 
G
V
 
V
E
 
D
I
 
V
A
 
A
V
 
V
C
 
A
P
 
P
P
 
P
L
 
A
V
 
L
F
 
F
V
 
V
G
 
D
Q
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
R
L
 
T
L
 
L
R
 
T
Y
 
E
-
 
A
-
 
G
S
 
S
Q
 
A
I
 
I
A
 
I
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
I
 
T
D
 
D
V
 
L
N
 
N
R
 
N
Q
 
S
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
D
V
 
M
A
 
S
A
 
P
D
 
A
M
 
M
L
 
L
G
 
K
E
 
E
F
 
F
G
 
G
V
 
A
R
 
T
Y
 
H
V
 
I
L
 
I
V
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
A
 
E
M
 
Y
H
 
H
H
 
A
E
 
E
N
 
S
D
 
D
D
 
E
L
 
F
V
 
V
A
 
A
R
 
K
K
 
K
F
 
F
E
 
A
A
 
F
V
 
L
K
 
K
A
 
E
A
 
N
G
 
G
L
 
L
I
 
T
P
 
P
V
 
V
L
 
L
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
S
Q
 
D
A
 
A
E
 
Q
R
 
N
N
 
E
N
 
A
G
 
G
E
 
E
T
 
T
K
 
M
D
 
A
V
 
V
I
 
C
G
 
A
H
 
R
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
I
K
 
N
R
 
T
C
 
Q
G
 
G
R
 
V
K
 
E
A
 
A
F
 
L
D
 
E
N
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
S
 
T
G
 
G
Q
 
K
A
 
A
A
 
A
S
 
T
P
 
A
V
 
E
D
 
D
A
 
A
Q
 
Q
K
 
R
V
 
I
H
 
H
E
 
A
F
 
Q
I
 
I
R
 
R
A
 
A
Q
 
H
V
 
I
A
 
A
A
 
E
Q
 
K
D
 
S
P
 
E
A
 
A
S
 
V
A
 
A
Q
 
K
A
 
N
L
 
V
R
 
V
I
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
A
 
P
S
 
E
N
 
N
A
 
A
Q
 
A
A
 
A
L
 
Y
F
 
F
M
 
A
M
 
Q
D
 
P
D
 
D
V
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
x
A
L
 
L
D
 
D

1aw1A Triosephosphate isomerase of vibrio marinus complexed with 2- phosphoglycolate (see paper)
52% identity, 95% coverage: 2:238/250 of query aligns to 1:239/255 of 1aw1A

query
sites
1aw1A
R
 
R
R
 
H
P
 
P
L
 
V
V
 
V
M
 
M
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
L
 
L
H
 
N
G
 
G
S
 
S
K
 
K
A
 
E
S
 
M
V
 
V
E
 
V
K
 
D
L
 
L
L
 
L
V
 
N
E
 
G
L
 
L
M
 
N
V
 
A
K
 
E
A
 
L
N
 
E
E
 
G
V
 
V
E
 
T
G
 
G
V
 
V
E
 
D
I
 
V
A
 
A
V
 
V
C
 
A
P
 
P
P
 
P
L
 
A
V
 
L
F
 
F
V
 
V
G
 
D
Q
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
R
L
 
T
L
 
L
R
 
T
Y
 
E
-
 
A
-
 
G
S
 
S
Q
 
A
I
 
I
A
 
I
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
I
 
T
D
 
D
V
 
L
N
 
N
R
 
N
Q
 
S
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
D
V
 
M
A
 
S
A
 
P
D
 
A
M
 
M
L
 
L
G
 
K
E
 
E
F
 
F
G
 
G
V
 
A
R
 
T
Y
 
H
V
 
I
L
 
I
V
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
A
 
E
M
 
Y
H
 
H
H
 
A
E
 
E
N
 
S
D
 
D
D
 
E
L
 
F
V
 
V
A
 
A
R
 
K
K
 
K
F
 
F
E
 
A
A
 
F
V
 
L
K
 
K
A
 
E
A
 
N
G
 
G
L
 
L
I
 
T
P
 
P
V
 
V
L
 
L
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
S
Q
 
D
A
 
A
E
 
Q
R
 
N
N
 
E
N
 
A
G
 
G
E
 
E
T
 
T
K
 
M
D
 
A
V
 
V
I
 
C
G
 
A
H
 
R
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
I
K
 
N
R
 
T
C
 
Q
G
 
G
R
 
V
K
 
E
A
 
A
F
 
L
D
 
E
N
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
S
 
T
G
 
G
Q
 
K
A
 
A
A
 
A
S
 
T
P
 
A
V
 
E
D
 
D
A
 
A
Q
 
Q
K
 
R
V
 
I
H
 
H
E
 
A
F
 
Q
I
 
I
R
 
R
A
 
A
Q
 
H
V
 
I
A
 
A
A
 
E
Q
 
K
D
 
S
P
 
E
A
 
A
S
 
V
A
 
A
Q
 
K
A
 
N
L
 
V
R
 
V
I
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
A
 
P
S
 
E
N
 
N
A
 
A
Q
 
A
A
 
A
L
 
Y
F
 
F
M
 
A
M
 
Q
D
 
P
D
 
D
V
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
A
L
|
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
A
L
 
L
D
 
D

P36204 Bifunctional PGK/TIM; EC 2.7.2.3; EC 5.3.1.1 from Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / DSM 3109 / JCM 10099 / NBRC 100826 / MSB8) (see paper)
44% identity, 94% coverage: 2:237/250 of query aligns to 402:638/654 of P36204

query
sites
P36204
R
 
R
R
 
K
P
 
L
L
 
I
V
 
L
M
 
A
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
L
 
M
H
 
H
G
 
K
S
 
T
K
 
I
A
 
S
S
 
E
V
 
A
E
 
K
K
 
K
L
 
F
L
 
V
V
 
S
E
 
L
L
 
L
M
 
V
V
 
N
K
 
E
A
 
L
N
 
H
E
 
D
V
 
V
E
 
K
G
 
E
V
 
F
E
 
E
I
 
I
A
 
V
V
 
V
C
 
C
P
 
P
P
 
P
L
 
F
V
 
T
F
 
A
V
 
L
G
 
S
Q
 
E
A
 
V
E
 
G
R
 
E
L
 
I
L
 
L
R
 
S
Y
 
G
S
 
R
Q
 
N
I
 
I
A
 
K
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
I
 
V
D
 
F
V
 
Y
N
 
E
R
 
D
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
A
 
S
A
 
P
D
 
L
M
 
M
L
 
L
G
 
Q
E
 
E
F
 
I
G
 
G
V
 
V
R
 
E
Y
 
Y
V
 
V
L
 
I
V
 
V
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
A
 
R
M
 
I
H
 
F
H
 
K
E
 
E
N
 
D
D
 
D
D
 
E
L
 
F
V
 
I
A
 
N
R
 
R
K
 
K
F
 
V
E
 
K
A
 
A
V
 
V
K
 
L
A
 
E
A
 
K
G
 
G
L
 
M
I
 
T
P
 
P
V
 
I
L
 
L
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
Q
 
L
A
 
E
E
 
E
R
 
R
N
 
E
N
 
K
G
 
G
E
 
L
T
 
T
K
 
F
D
 
C
V
 
V
I
 
V
G
 
E
H
 
K
Q
 
Q
L
 
V
Q
 
R
A
 
E
V
 
G
V
 
F
K
 
Y
R
 
G
C
 
L
G
 
D
R
 
K
K
 
E
A
 
E
F
 
A
D
 
K
N
 
R
A
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
S
 
T
G
 
G
Q
 
R
A
 
V
A
 
A
S
 
T
P
 
P
V
 
Q
D
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
K
 
E
V
 
V
H
 
H
E
 
A
F
 
F
I
 
I
R
 
R
A
 
K
Q
 
L
V
 
L
A
 
S
A
 
E
Q
 
M
-
 
Y
D
 
D
P
 
E
A
 
E
S
 
T
A
 
A
Q
 
G
A
 
S
L
 
I
R
 
R
I
 
I
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
I
K
 
K
A
 
P
S
 
D
N
 
N
A
 
F
Q
 
L
A
 
G
L
 
L
F
 
I
M
 
V
M
 
Q
D
 
K
D
 
D
V
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
G
L
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L

Sites not aligning to the query:

P00942 Triosephosphate isomerase; TIM; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) (see 2 papers)
45% identity, 99% coverage: 2:248/250 of query aligns to 3:246/248 of P00942

query
sites
P00942
R
 
R
R
 
T
P
 
F
L
 
F
V
 
V
M
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
F
K
|
K
L
 
L
H
 
N
G
 
G
S
 
S
K
 
K
A
 
Q
S
 
S
V
 
I
E
 
-
K
 
K
L
 
E
L
 
I
V
 
V
E
 
E
L
 
R
M
 
L
V
 
N
K
 
T
A
 
A
N
 
S
E
 
I
V
 
P
E
 
E
G
 
N
V
 
V
E
 
E
I
 
V
A
 
V
V
 
I
C
 
C
P
 
P
P
 
P
L
 
A
V
 
T
F
 
Y
V
 
L
G
 
D
Q
 
Y
A
 
S
E
 
V
R
 
S
L
 
L
L
 
V
R
 
K
Y
 
K
S
 
P
Q
 
Q
I
 
V
A
 
T
L
 
V
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
I
 
A
D
 
Y
V
 
L
N
 
K
R
 
A
Q
 
S
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
N
A
 
S
A
 
V
D
 
D
M
 
Q
L
 
I
G
 
K
E
 
D
F
 
V
G
 
G
V
 
A
R
 
K
Y
 
W
V
 
V
L
 
I
V
 
L
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
A
 
S
M
 
Y
H
 
F
H
 
H
E
 
E
N
 
D
D
 
D
D
 
K
L
 
F
V
 
I
A
 
A
R
 
D
K
 
K
F
 
T
E
 
K
A
 
F
V
 
A
K
 
L
A
 
G
A
 
Q
G
 
G
L
 
V
I
 
G
P
 
V
V
 
I
L
 
L
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
Q
 
L
A
 
E
E
 
E
R
 
K
N
 
K
N
 
A
G
 
G
E
 
K
T
 
T
K
 
L
D
 
D
V
 
V
I
 
V
G
 
E
H
 
R
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
N
A
 
A
V
 
V
V
 
L
K
 
E
R
 
E
C
 
V
G
 
-
R
 
-
K
 
K
A
 
D
F
 
W
D
 
T
N
 
N
A
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
S
 
T
G
 
G
Q
 
L
A
 
A
A
 
A
S
 
T
P
 
P
V
 
E
D
 
D
A
 
A
Q
 
Q
K
 
D
V
 
I
H
 
H
E
 
A
F
 
S
I
 
I
R
 
R
A
 
K
Q
 
F
V
 
L
A
 
A
A
 
S
Q
 
K
-
 
L
-
 
G
D
 
D
P
 
K
A
 
A
S
 
A
A
 
S
Q
 
E
A
 
-
L
 
L
R
 
R
I
 
I
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
A
K
 
N
A
 
G
S
 
S
N
 
N
A
 
A
Q
 
V
A
 
T
L
 
F
F
 
K
M
 
D
M
 
K
D
 
A
D
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
F
L
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
D
 
K
A
 
P
Q
 
-
E
 
E
F
 
F
S
 
V
G
 
D
I
 
I
F
 
I
N
 
N
A
 
S

Sites not aligning to the query:

3ypiA Electrophilic catalysis in triosephosphase isomerase: the role of histidine-95 (see paper)
45% identity, 99% coverage: 2:248/250 of query aligns to 2:245/247 of 3ypiA

query
sites
3ypiA
R
 
R
R
 
T
P
 
F
L
 
F
V
 
V
M
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
F
K
|
K
L
 
L
H
 
N
G
 
G
S
 
S
K
 
K
A
 
Q
S
 
S
V
 
I
E
 
-
K
 
K
L
 
E
L
 
I
V
 
V
E
 
E
L
 
R
M
 
L
V
 
N
K
 
T
A
 
A
N
 
S
E
 
I
V
 
P
E
 
E
G
 
N
V
 
V
E
 
E
I
 
V
A
 
V
V
 
I
C
 
C
P
 
P
P
 
P
L
 
A
V
 
T
F
 
Y
V
 
L
G
 
D
Q
 
Y
A
 
S
E
 
V
R
 
S
L
 
L
L
 
V
R
 
K
Y
 
K
S
 
P
Q
 
Q
I
 
V
A
 
T
L
 
V
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
I
 
A
D
 
Y
V
 
L
N
 
K
R
 
A
Q
 
S
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
N
A
 
S
A
 
V
D
 
D
M
 
Q
L
 
I
G
 
K
E
 
D
F
 
V
G
 
G
V
 
A
R
 
K
Y
 
W
V
 
V
L
 
I
V
 
L
G
 
G
H
x
Q
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
A
 
S
M
 
Y
H
 
F
H
 
H
E
 
E
N
 
D
D
 
D
D
 
K
L
 
F
V
 
I
A
 
A
R
 
D
K
 
K
F
 
T
E
 
K
A
 
F
V
 
A
K
 
L
A
 
G
A
 
Q
G
 
G
L
 
V
I
 
G
P
 
V
V
 
I
L
 
L
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
Q
 
L
A
 
E
E
 
E
R
 
K
N
 
K
N
 
A
G
 
G
E
 
K
T
 
T
K
 
L
D
 
D
V
 
V
I
 
V
G
 
E
H
 
R
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
N
A
 
A
V
 
V
V
 
L
K
 
E
R
 
E
C
 
V
G
 
-
R
 
-
K
 
K
A
 
D
F
 
W
D
 
T
N
 
N
A
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
S
 
T
G
 
G
Q
 
L
A
 
A
A
 
A
S
 
T
P
 
P
V
 
E
D
 
D
A
 
A
Q
 
Q
K
 
D
V
 
I
H
 
H
E
 
A
F
 
S
I
 
I
R
 
R
A
 
K
Q
 
F
V
 
L
A
 
A
A
 
S
Q
 
K
-
 
L
-
 
G
D
 
D
P
 
K
A
 
A
S
 
A
A
 
S
Q
 
E
A
 
-
L
 
L
R
 
R
I
 
I
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
A
K
 
N
A
 
G
S
 
S
N
 
N
A
 
A
Q
 
V
A
 
T
L
 
F
F
 
K
M
 
D
M
 
K
D
 
A
D
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
F
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
D
 
K
A
 
P
Q
 
-
E
 
E
F
 
F
S
 
V
G
 
D
I
 
I
F
 
I
N
 
N
A
 
S

6neeB Crystal structure of a reconstructed ancestor of triosephosphate isomerase from eukaryotes (see paper)
43% identity, 99% coverage: 2:248/250 of query aligns to 4:250/252 of 6neeB

query
sites
6neeB
R
 
R
R
 
K
P
 
F
L
 
F
V
 
V
M
 
G
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
|
K
L
 
M
H
 
N
G
 
G
S
 
T
K
 
L
A
 
E
S
 
S
V
 
I
E
 
-
K
 
K
L
 
A
L
 
L
V
 
V
E
 
E
L
 
T
M
 
L
V
 
N
K
 
S
A
 
A
N
 
Q
E
 
L
V
 
D
E
 
P
G
 
N
V
 
T
E
 
E
I
 
V
A
 
V
V
 
V
C
 
A
P
 
P
P
 
P
L
 
A
V
 
I
F
 
Y
V
 
L
G
 
P
Q
 
F
A
 
A
-
 
R
E
 
S
R
 
K
L
 
L
L
 
K
R
 
K
Y
 
P
S
 
K
Q
 
E
I
 
I
A
 
Q
L
 
V
G
 
A
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
I
 
C
D
 
Y
V
 
T
N
 
K
R
 
P
Q
 
N
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
A
 
S
A
 
A
D
 
E
M
 
M
L
 
L
G
 
K
E
 
D
F
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
P
Y
 
W
V
 
V
L
 
I
V
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
A
 
T
M
 
I
H
 
F
H
 
G
E
 
E
N
 
S
D
 
D
D
 
E
L
 
L
V
 
I
A
 
A
R
 
E
K
 
K
F
 
V
E
 
K
A
 
Y
V
 
A
K
 
L
A
 
D
A
 
Q
G
 
G
L
 
L
I
 
K
P
 
V
V
 
I
L
 
A
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
Q
 
L
A
 
E
E
 
E
R
 
R
N
 
E
N
 
A
G
 
G
E
 
K
T
 
T
K
 
M
D
 
E
V
 
V
I
 
V
G
 
A
H
 
R
Q
 
Q
-
 
I
L
 
L
Q
 
K
A
 
A
V
 
I
V
 
A
K
 
D
R
 
K
C
 
I
G
 
-
R
 
-
K
 
K
A
 
D
F
 
W
D
 
S
N
 
N
A
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
 
G
S
 
T
G
 
G
Q
 
K
A
 
V
A
 
A
S
 
T
P
 
P
V
 
E
D
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
K
 
E
V
 
V
H
 
H
E
 
A
F
 
A
I
 
L
R
 
R
A
 
K
Q
 
W
V
 
L
A
 
K
A
 
E
Q
 
N
-
 
V
D
 
S
P
 
P
A
 
E
S
 
V
A
 
A
Q
 
E
A
 
S
L
 
T
R
 
R
I
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
K
 
N
A
 
A
S
 
A
N
 
N
A
 
C
Q
 
K
A
 
E
L
 
L
F
 
A
M
 
K
M
 
Q
D
 
P
D
 
D
V
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
F
L
|
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
D
 
K
A
 
A
Q
 
P
E
 
E
F
 
F
S
 
V
G
 
D
I
 
I
F
 
I
N
 
N
A
 
A

4ff7B Structure of c126s mutant of saccharomyces cerevisiae triosephosphate isomerase (see paper)
45% identity, 99% coverage: 2:248/250 of query aligns to 2:245/247 of 4ff7B

query
sites
4ff7B
R
 
R
R
 
T
P
 
F
L
 
F
V
 
V
M
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
F
K
|
K
L
 
L
H
 
N
G
 
G
S
 
S
K
 
K
A
 
Q
S
 
S
V
 
I
E
 
-
K
 
K
L
 
E
L
 
I
V
 
V
E
 
E
L
 
R
M
 
L
V
 
N
K
 
T
A
 
A
N
 
S
E
 
I
V
 
P
E
 
E
G
 
N
V
 
V
E
 
E
I
 
V
A
 
V
V
 
I
C
 
C
P
 
P
P
 
P
L
 
A
V
 
T
F
 
Y
V
 
L
G
 
D
Q
 
Y
A
 
S
E
 
V
R
 
S
L
 
L
L
 
V
R
 
K
Y
 
K
S
 
P
Q
 
Q
I
 
V
A
 
T
L
 
V
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
I
 
A
D
 
Y
V
 
L
N
 
K
R
x
A
Q
x
S
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
N
A
 
S
A
 
V
D
 
D
M
 
Q
L
 
I
G
 
K
E
 
D
F
 
V
G
 
G
V
 
A
R
 
K
Y
 
W
V
 
V
L
 
I
V
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
A
 
S
M
 
Y
H
 
F
H
 
H
E
 
E
N
 
D
D
 
D
D
 
K
L
 
F
V
 
I
A
 
A
R
 
D
K
 
K
F
 
T
E
 
K
A
x
F
V
 
A
K
 
L
A
 
G
A
 
Q
G
 
G
L
 
V
I
 
G
P
 
V
V
 
I
L
 
L
C
 
S
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
Q
 
L
A
 
E
E
 
E
R
 
K
N
 
K
N
 
A
G
 
G
E
 
K
T
 
T
K
 
L
D
 
D
V
 
V
I
 
V
G
 
E
H
 
R
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
N
A
 
A
V
 
V
V
 
L
K
 
E
R
 
E
C
 
V
G
 
-
R
 
-
K
 
K
A
 
D
F
 
W
D
 
T
N
 
N
A
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
S
 
T
G
 
G
Q
 
L
A
 
A
A
 
A
S
 
T
P
 
P
V
 
E
D
 
D
A
 
A
Q
 
Q
K
 
D
V
 
I
H
 
H
E
 
A
F
 
S
I
 
I
R
 
R
A
 
K
Q
 
F
V
 
L
A
 
A
A
 
S
Q
 
K
-
 
L
-
 
G
D
 
D
P
 
K
A
 
A
S
 
A
A
 
S
Q
 
E
A
 
-
L
 
L
R
 
R
I
 
I
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
A
K
 
N
A
 
G
S
 
S
N
 
N
A
 
A
Q
 
V
A
 
T
L
 
F
F
 
K
M
 
D
M
 
K
D
 
A
D
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
F
L
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
D
 
K
A
 
P
Q
 
-
E
 
E
F
 
F
S
 
V
G
 
D
I
 
I
F
 
I
N
 
N
A
 
S

4ff7A Structure of c126s mutant of saccharomyces cerevisiae triosephosphate isomerase (see paper)
45% identity, 99% coverage: 2:248/250 of query aligns to 2:245/247 of 4ff7A

query
sites
4ff7A
R
 
R
R
 
T
P
 
F
L
 
F
V
 
V
M
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
F
K
|
K
L
 
L
H
 
N
G
 
G
S
 
S
K
 
K
A
 
Q
S
 
S
V
 
I
E
 
-
K
 
K
L
 
E
L
 
I
V
 
V
E
 
E
L
 
R
M
 
L
V
 
N
K
 
T
A
 
A
N
 
S
E
 
I
V
 
P
E
 
E
G
 
N
V
 
V
E
 
E
I
 
V
A
 
V
V
 
I
C
 
C
P
 
P
P
 
P
L
 
A
V
 
T
F
 
Y
V
 
L
G
 
D
Q
 
Y
A
 
S
E
 
V
R
 
S
L
 
L
L
 
V
R
 
K
Y
 
K
S
 
P
Q
 
Q
I
 
V
A
 
T
L
 
V
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
I
 
A
D
 
Y
V
 
L
N
 
K
R
 
A
Q
 
S
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
N
A
 
S
A
 
V
D
 
D
M
 
Q
L
 
I
G
 
K
E
 
D
F
 
V
G
 
G
V
 
A
R
 
K
Y
 
W
V
 
V
L
 
I
V
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
A
 
S
M
 
Y
H
 
F
H
 
H
E
 
E
N
 
D
D
 
D
D
 
K
L
 
F
V
 
I
A
 
A
R
 
D
K
 
K
F
 
T
E
 
K
A
 
F
V
 
A
K
 
L
A
 
G
A
 
Q
G
 
G
L
 
V
I
 
G
P
 
V
V
 
I
L
 
L
C
 
S
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
Q
 
L
A
 
E
E
 
E
R
 
K
N
 
K
N
 
A
G
 
G
E
 
K
T
 
T
K
 
L
D
 
D
V
 
V
I
 
V
G
 
E
H
 
R
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
N
A
 
A
V
 
V
V
 
L
K
 
E
R
 
E
C
 
V
G
 
-
R
 
-
K
 
K
A
 
D
F
 
W
D
 
T
N
 
N
A
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
S
 
T
G
 
G
Q
 
L
A
 
A
A
 
A
S
 
T
P
 
P
V
 
E
D
 
D
A
 
A
Q
 
Q
K
 
D
V
 
I
H
 
H
E
 
A
F
 
S
I
 
I
R
 
R
A
 
K
Q
 
F
V
 
L
A
 
A
A
 
S
Q
 
K
-
 
L
-
 
G
D
 
D
P
 
K
A
 
A
S
 
A
A
 
S
Q
 
E
A
 
-
L
 
L
R
 
R
I
 
I
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
A
K
 
N
A
 
G
S
 
S
N
 
N
A
 
A
Q
 
V
A
 
T
L
 
F
F
 
K
M
 
D
M
 
K
D
 
A
D
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
F
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
D
 
K
A
 
P
Q
 
-
E
 
E
F
 
F
S
 
V
G
 
D
I
 
I
F
 
I
N
 
N
A
 
S

8w06B Crystal structure of the reconstruction of the ancestral triosephosphate isomerase of the last opisthokont common ancestor obtained by maximum likelihood with pgh (see paper)
43% identity, 99% coverage: 2:248/250 of query aligns to 4:248/251 of 8w06B

query
sites
8w06B
R
 
R
R
 
K
P
 
F
L
 
F
V
 
V
M
 
G
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
|
K
L
 
M
H
 
N
G
 
G
S
 
T
K
 
I
A
 
E
S
 
S
V
 
I
E
 
-
K
 
K
L
 
S
L
 
L
V
 
V
E
 
E
L
 
T
M
 
L
V
 
N
K
 
N
A
 
A
N
 
E
E
 
L
V
 
D
E
 
D
G
 
N
V
 
T
E
 
E
I
 
V
A
 
V
V
 
V
C
 
A
P
 
P
P
 
P
L
 
A
V
 
I
F
 
Y
V
 
L
G
 
P
Q
 
L
A
 
V
E
 
R
R
 
Q
L
 
S
L
 
L
R
 
R
Y
 
-
S
 
K
Q
 
D
I
 
I
A
 
Q
L
 
V
G
 
A
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
I
 
C
D
 
Y
V
 
T
N
 
K
R
 
A
Q
 
S
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
A
 
S
A
 
A
D
 
E
M
 
M
L
 
L
G
 
K
E
 
D
F
 
L
G
 
G
V
 
I
R
 
P
Y
 
W
V
 
V
L
 
I
V
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
A
 
Q
M
 
I
H
 
F
H
 
G
E
 
E
N
 
S
D
 
D
D
 
E
L
 
F
V
 
V
A
 
A
R
 
E
K
 
K
F
 
T
E
 
K
A
 
Y
V
 
A
K
 
L
A
 
D
A
 
N
G
 
G
L
 
L
I
 
K
P
 
V
V
 
I
L
 
L
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
Q
 
L
A
 
E
E
 
E
R
 
R
N
 
E
N
 
A
G
 
G
E
 
K
T
 
T
K
 
M
D
 
D
V
 
V
I
 
V
G
 
T
H
 
R
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
K
A
 
A
V
 
I
V
 
A
K
 
D
R
 
K
C
 
I
G
 
S
R
 
E
K
 
S
A
 
D
F
 
W
D
 
S
N
 
K
A
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
S
 
T
G
 
G
Q
 
K
A
 
V
A
 
A
S
 
T
P
 
P
V
 
E
D
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
K
 
E
V
 
V
H
 
H
E
 
A
F
 
E
I
 
I
R
 
R
A
 
K
Q
 
W
V
 
L
A
 
A
A
 
E
Q
 
N
D
 
V
P
 
S
A
 
A
S
 
E
-
 
V
A
 
A
Q
 
E
A
 
S
L
 
T
R
 
R
I
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
N
A
 
G
S
 
G
N
 
N
A
 
C
Q
 
K
A
 
E
L
 
L
F
 
A
M
 
K
M
 
Q
D
 
P
D
 
D
V
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
F
L
|
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
D
 
K
A
 
P
Q
 
-
E
 
E
F
 
F
S
 
V
G
 
D
I
 
I
F
 
I
N
 
N
A
 
A

1ci1B Crystal structure of triosephosphate isomerase from trypanosoma cruzi in hexane (see paper)
42% identity, 99% coverage: 3:249/250 of query aligns to 4:248/249 of 1ci1B

query
sites
1ci1B
R
 
Q
P
 
P
L
 
I
V
 
A
M
 
A
G
 
A
N
|
N
W
 
W
K
|
K
L
 
C
H
 
N
G
 
G
S
 
S
K
 
-
A
 
-
S
 
-
V
 
-
E
 
E
K
 
S
L
 
L
L
 
L
V
 
V
E
 
P
L
 
L
M
 
I
V
 
E
K
 
T
A
 
L
N
 
N
E
 
A
V
 
A
-
 
T
-
 
F
-
 
D
E
 
H
G
 
D
V
 
V
E
 
Q
I
 
C
A
 
V
V
 
V
C
 
A
P
 
P
P
 
T
L
 
F
V
 
L
F
 
H
V
 
I
G
 
P
Q
 
M
A
 
T
E
 
K
R
 
A
L
 
R
L
 
L
R
 
T
Y
 
N
S
 
P
Q
 
K
I
 
F
A
 
Q
L
 
I
G
 
A
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
I
 
-
D
 
A
V
 
I
N
 
T
R
 
R
Q
 
S
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
V
A
 
S
A
 
L
D
 
Q
M
 
I
L
 
L
G
 
K
E
 
D
F
 
Y
G
 
G
V
 
I
R
 
S
Y
 
W
V
 
V
L
 
V
V
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
A
 
L
M
 
Y
H
 
Y
H
 
G
E
 
E
N
 
T
D
 
N
D
 
E
L
 
I
V
 
V
A
 
A
R
 
E
K
 
K
F
 
V
E
 
A
A
 
Q
V
 
A
K
 
C
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
F
I
 
H
P
 
V
V
 
I
L
 
V
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
Q
 
N
A
 
E
E
 
E
R
|
R
N
 
E
N
 
A
G
 
G
E
 
R
T
|
T
K
 
A
D
 
A
V
 
V
I
 
V
G
 
L
H
 
T
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
A
A
 
A
V
 
V
V
 
A
K
 
Q
R
 
K
C
 
L
G
 
S
R
 
K
K
 
E
A
 
A
F
 
W
D
 
S
N
 
R
A
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
S
 
T
G
 
G
Q
 
K
A
 
V
A
 
A
S
 
T
P
 
P
V
 
Q
D
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
K
x
E
V
 
V
H
 
H
E
 
E
F
 
L
I
 
L
R
 
R
A
 
R
Q
 
W
V
 
V
A
 
R
A
 
S
Q
 
K
D
 
L
P
 
G
A
 
T
S
 
D
-
 
I
A
 
A
Q
 
A
A
 
Q
L
 
L
R
 
R
I
 
I
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
T
A
 
A
S
 
K
N
 
N
A
 
A
Q
 
R
A
 
T
L
 
L
F
 
Y
M
 
Q
M
 
M
D
 
R
D
 
D
V
 
I
D
 
N
G
 
G
A
 
F
L
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
D
 
K
A
 
P
Q
 
-
E
 
E
F
 
F
S
 
V
G
 
E
I
 
I
F
 
I
N
 
E
A
 
A
A
 
T

6ooiC Crystal structure of triosephosphate isomerase from schistosoma mansoni in complex with 2pg (see paper)
41% identity, 99% coverage: 2:248/250 of query aligns to 8:253/255 of 6ooiC

query
sites
6ooiC
R
 
R
R
 
K
P
 
F
L
 
F
V
 
V
M
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
L
 
M
H
 
N
G
 
G
S
 
S
K
 
R
A
 
D
S
 
D
V
 
N
E
 
D
K
 
K
L
 
L
L
 
L
V
 
-
E
 
K
L
 
L
M
 
L
V
 
S
K
 
E
A
 
A
N
 
H
E
 
F
V
 
D
E
 
D
G
 
N
V
 
T
E
 
E
I
 
V
A
 
L
V
 
I
C
 
A
P
 
P
P
 
P
L
 
S
V
 
V
F
 
F
V
 
L
G
 
H
Q
 
E
A
 
I
E
 
R
R
 
K
L
 
S
L
 
L
R
 
K
Y
 
-
S
 
K
Q
 
E
I
 
I
A
 
H
L
 
V
G
 
A
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
I
 
C
D
 
Y
V
 
K
N
 
V
R
 
S
Q
 
K
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
A
 
S
A
 
P
D
 
A
M
 
M
L
 
I
G
 
R
E
 
D
F
 
I
G
 
G
V
 
C
R
 
D
Y
 
W
V
 
V
L
 
I
V
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
A
 
N
M
 
I
H
 
F
H
 
G
E
 
E
N
 
S
D
 
D
D
 
E
L
 
L
V
 
I
A
 
A
R
 
E
K
 
K
F
 
V
E
 
Q
A
 
H
V
 
A
K
 
L
A
 
A
A
 
E
G
 
G
L
 
L
I
 
S
P
 
V
V
 
I
L
 
A
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
Q
 
L
A
 
S
E
 
E
R
 
R
N
 
E
N
 
S
G
 
N
E
 
K
T
 
T
K
 
E
D
 
E
V
 
V
I
 
C
G
 
V
H
 
R
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
K
A
 
A
V
 
I
V
 
A
K
 
N
R
 
K
C
 
I
G
 
K
R
 
S
-
 
A
K
 
D
A
 
E
F
 
W
D
 
K
N
 
R
A
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
S
 
T
G
 
G
Q
 
K
A
 
V
A
 
A
S
 
T
P
 
P
V
 
Q
D
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
K
 
E
V
 
V
H
 
H
E
 
N
F
 
F
I
 
L
R
 
R
A
 
K
Q
 
W
V
 
F
A
 
K
A
 
T
Q
 
N
D
 
A
P
 
P
A
 
N
S
 
G
A
 
V
-
 
D
Q
 
E
A
 
K
L
 
I
R
 
R
I
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
K
 
T
A
 
A
S
 
A
N
 
N
A
 
C
Q
 
K
A
 
E
L
 
L
F
 
A
M
 
Q
M
 
Q
D
 
H
D
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
F
L
|
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
D
 
K
A
 
P
Q
 
-
E
 
E
F
 
F
S
 
T
G
 
E
I
 
I
F
 
C
N
 
K
A
 
A

P00943 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Geobacillus stearothermophilus (Bacillus stearothermophilus) (see 2 papers)
39% identity, 97% coverage: 1:242/250 of query aligns to 1:243/253 of P00943

query
sites
P00943
M
 
M
R
 
R
R
 
K
P
 
P
L
 
I
V
 
I
M
 
A
G
 
G
N
|
N
W
|
W
K
|
K
L
 
M
H
|
H
G
x
K
S
 
T
K
 
L
A
 
A
S
 
E
V
 
A
E
 
V
K
 
Q
L
 
F
L
 
V
V
 
E
E
 
D
L
 
V
M
 
K
V
 
G
K
 
H
A
 
V
N
 
P
E
 
P
V
 
A
E
 
D
G
 
E
V
 
V
E
 
I
I
 
S
A
 
V
V
 
V
C
 
C
P
 
A
P
 
P
L
 
F
V
 
L
F
 
F
V
 
L
G
 
D
Q
 
R
A
 
L
E
 
V
R
 
Q
L
 
A
L
 
A
R
 
D
Y
 
G
S
 
T
Q
 
D
I
 
L
A
 
K
L
 
I
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
T
I
 
M
D
 
H
V
 
F
N
 
A
R
 
D
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
F
 
Y
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
V
A
 
S
A
 
P
D
 
V
M
 
M
L
 
L
G
 
K
E
 
D
F
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
T
Y
 
Y
V
 
V
L
 
I
V
 
L
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
A
 
Q
M
 
M
H
 
F
H
 
A
E
 
E
N
 
T
D
 
D
D
 
E
L
 
T
V
 
V
A
 
N
R
 
K
K
 
K
F
 
V
E
 
L
A
 
A
V
 
A
K
 
F
A
 
T
A
 
R
G
 
G
L
 
L
I
 
I
P
 
P
V
 
I
L
 
I
C
 
C
V
 
C
G
 
G
E
 
E
T
 
S
Q
 
L
A
 
E
E
 
E
R
 
R
N
 
E
N
 
A
G
 
G
E
 
Q
T
 
T
K
 
N
D
 
A
V
 
V
I
 
V
G
 
A
H
 
S
Q
 
Q
L
 
V
Q
 
E
A
 
K
V
 
A
V
 
L
K
 
A
R
 
G
C
 
L
G
 
T
R
 
P
K
 
E
A
 
Q
F
 
V
D
 
K
N
 
Q
A
 
A
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
S
 
T
G
 
G
Q
 
K
A
 
S
A
 
S
S
 
T
P
 
P
V
 
E
D
 
D
A
 
A
Q
 
N
K
 
S
V
 
V
H
 
C
E
 
G
F
 
H
I
 
I
R
 
R
A
 
S
Q
 
V
V
 
V
A
 
S
A
 
R
Q
 
L
-
 
F
D
 
G
P
 
P
A
 
E
S
 
A
A
 
A
Q
 
E
A
 
A
L
 
I
R
 
R
I
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
A
 
P
S
 
D
N
 
N
A
 
I
Q
 
R
A
 
D
L
 
F
F
 
L
M
 
A
M
 
Q
D
 
Q
D
 
Q
V
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
P
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
D
 
E
A
 
P
Q
 
A
E
 
S
F
 
F

P27876 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
38% identity, 97% coverage: 1:242/250 of query aligns to 1:243/253 of P27876

query
sites
P27876
M
 
M
R
 
R
R
 
K
P
 
P
L
 
I
V
 
I
M
 
A
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
L
 
M
H
 
N
G
 
K
S
 
T
K
 
L
A
 
G
S
 
E
V
 
A
E
 
V
K
 
S
L
 
F
L
 
V
V
 
E
E
 
E
L
 
V
M
 
K
V
 
S
K
 
S
A
 
I
N
 
P
E
 
A
V
 
A
E
 
D
G
 
K
V
 
A
E
 
E
I
 
A
A
 
V
V
 
V
C
 
C
P
 
A
P
 
P
L
 
A
V
 
L
F
 
F
V
 
L
G
 
E
Q
 
K
A
 
L
E
 
A
R
 
S
L
 
A
L
 
V
R
 
K
Y
 
G
S
 
T
Q
 
D
I
 
L
A
 
K
L
 
V
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
I
 
M
D
 
H
V
 
F
N
 
E
R
 
E
Q
 
S
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
A
 
S
A
 
P
D
 
V
M
 
A
L
 
L
G
 
K
E
 
D
F
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
D
Y
 
Y
V
 
C
L
 
V
V
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
A
 
E
M
 
M
H
 
F
H
 
A
E
 
E
N
 
T
D
 
D
D
 
E
L
 
T
V
 
V
A
 
N
R
 
K
K
 
K
F
 
A
E
 
H
A
 
A
V
 
A
K
 
F
A
 
K
A
 
H
G
 
G
L
 
I
I
 
V
P
 
P
V
 
I
L
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
Q
 
L
A
 
E
E
 
E
R
 
R
N
 
E
N
 
A
G
 
G
E
 
K
T
 
T
K
 
N
D
 
D
V
 
L
I
 
V
G
 
A
H
 
D
Q
 
Q
L
 
V
Q
 
K
A
 
K
V
 
G
V
 
L
K
 
A
R
 
G
C
 
L
G
 
S
R
 
E
K
 
E
A
 
Q
F
 
V
D
 
A
N
 
A
A
 
S
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
S
 
T
G
 
G
Q
 
K
A
 
S
A
 
S
S
 
T
P
 
A
V
 
K
D
 
D
A
 
A
Q
 
N
K
 
D
V
 
V
H
 
C
E
 
A
F
 
H
I
 
I
R
 
R
A
 
K
Q
 
T
V
 
V
A
 
A
A
 
E
Q
 
S
-
 
F
D
 
S
P
 
Q
A
 
E
S
 
A
A
 
A
Q
 
D
A
 
K
L
 
L
R
 
R
I
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
A
 
P
S
 
A
N
 
N
A
 
I
Q
 
K
A
 
E
L
 
Y
F
 
M
M
 
A
M
 
E
D
 
S
D
 
D
V
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
D
 
E
A
 
P
Q
 
Q
E
 
S
F
 
F

3uwvA Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with 2-phosphoglyceric acid (see paper)
37% identity, 100% coverage: 1:249/250 of query aligns to 3:254/255 of 3uwvA

query
sites
3uwvA
M
 
M
R
 
R
R
 
T
P
 
P
L
 
I
V
 
I
M
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
L
 
M
H
 
N
G
 
K
S
 
T
K
 
V
A
 
Q
S
 
E
V
 
A
E
 
K
K
 
D
L
 
F
L
 
V
V
 
N
E
 
A
L
 
L
M
 
P
V
 
T
K
 
L
A
 
P
N
 
D
E
 
S
V
 
K
E
 
E
G
 
-
V
 
V
E
 
E
I
 
S
A
 
V
V
 
I
C
 
C
P
 
A
P
 
P
L
 
A
V
 
I
F
 
Q
V
 
L
G
 
D
Q
 
A
A
 
L
E
 
T
R
 
T
L
 
A
L
 
V
R
 
K
Y
 
E
S
 
G
Q
 
K
-
 
A
-
 
Q
-
 
G
I
 
L
A
 
E
L
 
I
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
I
 
T
D
 
Y
V
 
F
N
 
E
R
 
D
Q
 
N
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
T
A
 
S
A
 
P
D
 
V
M
 
A
L
 
L
G
 
A
E
 
D
F
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
K
Y
 
Y
V
 
V
L
 
V
V
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
A
 
E
M
 
L
H
 
F
H
 
H
E
 
E
N
 
T
D
 
D
D
 
E
L
 
E
V
 
I
A
 
N
R
 
K
K
 
K
F
 
A
E
 
H
A
 
A
V
 
I
K
 
F
A
 
K
A
 
H
G
 
G
L
 
M
I
 
T
P
 
P
V
 
I
L
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
Q
 
D
A
 
E
E
 
E
R
 
R
N
 
E
N
 
S
G
 
G
E
 
K
T
 
A
K
 
N
D
 
D
V
 
V
I
 
V
G
 
G
H
 
E
Q
 
Q
L
 
V
Q
 
K
A
 
K
V
 
A
V
 
V
K
 
A
R
 
G
C
 
L
G
 
S
R
 
E
K
 
D
A
 
Q
F
 
L
D
 
K
N
 
S
A
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
S
 
T
G
 
G
Q
 
K
A
 
S
A
 
S
S
 
T
P
 
S
V
 
E
D
 
D
A
 
A
Q
 
N
K
 
E
V
 
M
H
 
C
E
 
A
F
 
F
I
 
V
R
 
R
A
 
Q
Q
 
T
V
 
I
A
 
A
A
 
-
Q
 
-
D
 
D
P
 
L
A
 
S
S
 
S
-
 
K
-
 
E
-
 
V
A
 
S
Q
 
E
A
 
A
L
 
T
R
 
R
I
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
|
K
A
 
P
S
 
N
N
 
N
A
 
I
Q
 
K
A
 
E
L
 
Y
F
 
M
M
 
A
M
 
Q
D
 
T
D
 
D
V
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
D
 
K
A
 
V
Q
 
E
E
 
D
F
 
F
S
 
V
G
 
Q
I
 
L
F
 
L
N
 
E
A
 
G
A
 
A

3uwzA Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with glycerol-2-phosphate (see paper)
37% identity, 100% coverage: 1:249/250 of query aligns to 2:253/254 of 3uwzA

query
sites
3uwzA
M
 
M
R
 
R
R
 
T
P
 
P
L
 
I
V
 
I
M
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
L
 
M
H
 
N
G
 
K
S
 
T
K
 
V
A
 
Q
S
 
E
V
 
A
E
 
K
K
 
D
L
 
F
L
 
V
V
 
N
E
 
A
L
 
L
M
 
P
V
 
T
K
 
L
A
 
P
N
 
D
E
 
S
V
 
K
E
 
E
G
 
-
V
 
V
E
 
E
I
 
S
A
 
V
V
 
I
C
 
C
P
 
A
P
 
P
L
 
A
V
 
I
F
 
Q
V
 
L
G
 
D
Q
 
A
A
 
L
E
 
T
R
 
T
L
 
A
L
 
V
R
 
K
Y
 
E
S
 
G
Q
 
K
-
 
A
-
 
Q
-
 
G
I
 
L
A
 
E
L
 
I
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
I
 
T
D
 
Y
V
 
F
N
 
E
R
 
D
Q
 
N
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
T
A
 
S
A
 
P
D
 
V
M
 
A
L
 
L
G
 
A
E
 
D
F
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
K
Y
 
Y
V
 
V
L
 
V
V
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
A
 
E
M
 
L
H
 
F
H
 
H
E
 
E
N
 
T
D
 
D
D
 
E
L
 
E
V
 
I
A
 
N
R
 
K
K
 
K
F
 
A
E
 
H
A
 
A
V
 
I
K
 
F
A
 
K
A
 
H
G
 
G
L
 
M
I
 
T
P
 
P
V
 
I
L
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
Q
 
D
A
 
E
E
 
E
R
 
R
N
 
E
N
 
S
G
 
G
E
 
K
T
 
A
K
 
N
D
 
D
V
 
V
I
 
V
G
 
G
H
 
E
Q
 
Q
L
 
V
Q
 
K
A
 
K
V
 
A
V
 
V
K
 
A
R
 
G
C
 
L
G
 
S
R
 
E
K
 
D
A
 
Q
F
 
L
D
 
K
N
 
S
A
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
S
 
T
G
 
G
Q
 
K
A
 
S
A
 
S
S
 
T
P
 
S
V
 
E
D
 
D
A
 
A
Q
 
N
K
 
E
V
 
M
H
 
C
E
 
A
F
 
F
I
 
V
R
 
R
A
 
Q
Q
 
T
V
 
I
A
 
A
A
 
-
Q
 
-
D
 
D
P
 
L
A
 
S
S
 
S
-
 
K
-
 
E
-
 
V
A
 
S
Q
 
E
A
 
A
L
 
T
R
 
R
I
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
|
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
A
 
P
S
 
N
N
 
N
A
 
I
Q
 
K
A
 
E
L
 
Y
F
 
M
M
 
A
M
 
Q
D
 
T
D
 
D
V
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
D
 
K
A
 
V
Q
 
E
E
 
D
F
 
F
S
 
V
G
 
Q
I
 
L
F
 
L
N
 
E
A
 
G
A
 
A

3uwwA Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with 3-phosphoglyceric acid (see paper)
37% identity, 100% coverage: 1:249/250 of query aligns to 2:253/254 of 3uwwA

query
sites
3uwwA
M
 
M
R
 
R
R
 
T
P
 
P
L
 
I
V
 
I
M
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
L
 
M
H
 
N
G
 
K
S
 
T
K
 
V
A
 
Q
S
 
E
V
 
A
E
 
K
K
 
D
L
 
F
L
 
V
V
 
N
E
 
A
L
 
L
M
 
P
V
 
T
K
 
L
A
 
P
N
 
D
E
 
S
V
 
K
E
 
E
G
 
-
V
 
V
E
 
E
I
 
S
A
 
V
V
 
I
C
 
C
P
 
A
P
 
P
L
 
A
V
 
I
F
 
Q
V
 
L
G
 
D
Q
 
A
A
 
L
E
 
T
R
 
T
L
 
A
L
 
V
R
 
K
Y
 
E
S
 
G
Q
 
K
-
 
A
-
 
Q
-
 
G
I
 
L
A
 
E
L
 
I
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
I
 
T
D
 
Y
V
 
F
N
 
E
R
 
D
Q
 
N
G
 
G
A
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
T
A
 
S
A
 
P
D
 
V
M
 
A
L
 
L
G
 
A
E
 
D
F
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
K
Y
 
Y
V
 
V
L
 
V
V
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
A
 
E
M
 
L
H
 
F
H
 
H
E
 
E
N
 
T
D
 
D
D
 
E
L
 
E
V
 
I
A
 
N
R
 
K
K
 
K
F
 
A
E
 
H
A
 
A
V
 
I
K
 
F
A
 
K
A
 
H
G
 
G
L
 
M
I
 
T
P
 
P
V
 
I
L
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
Q
 
D
A
 
E
E
 
E
R
 
R
N
 
E
N
 
S
G
 
G
E
 
K
T
 
A
K
 
N
D
 
D
V
 
V
I
 
V
G
 
G
H
 
E
Q
 
Q
L
 
V
Q
 
K
A
 
K
V
 
A
V
 
V
K
 
A
R
 
G
C
 
L
G
 
S
R
 
E
K
 
D
A
 
Q
F
 
L
D
 
K
N
 
S
A
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
S
 
T
G
 
G
Q
 
K
A
 
S
A
 
S
S
 
T
P
 
S
V
 
E
D
 
D
A
 
A
Q
 
N
K
 
E
V
 
M
H
 
C
E
 
A
F
 
F
I
 
V
R
 
R
A
 
Q
Q
 
T
V
 
I
A
 
A
A
 
-
Q
 
-
D
 
D
P
 
L
A
 
S
S
 
S
-
 
K
-
 
E
-
 
V
A
 
S
Q
 
E
A
 
A
L
 
T
R
 
R
I
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
A
 
P
S
 
N
N
 
N
A
 
I
Q
 
K
A
 
E
L
 
Y
F
 
M
M
 
A
M
 
Q
D
 
T
D
 
D
V
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
D
 
K
A
 
V
Q
 
E
E
 
D
F
 
F
S
 
V
G
 
Q
I
 
L
F
 
L
N
 
E
A
 
G
A
 
A

3uwuA Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with glycerol-3-phosphate (see paper)
37% identity, 100% coverage: 1:249/250 of query aligns to 1:252/253 of 3uwuA

query
sites
3uwuA
M
 
M
R
 
R
R
 
T
P
 
P
L
 
I
V
 
I
M
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
L
 
M
H
 
N
G
 
K
S
 
T
K
 
V
A
 
Q
S
 
E
V
 
A
E
 
K