SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_008486132.1 NCBI__GCF_000299915.1:WP_008486132.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 16 hits to proteins with known functional sites (download)

3uf6A The crystal structure of a possible phosphate acetyl/butaryl transferase (from listeria monocytogenes egd-e) in complex with cod (3'-dephosphocoenzyme a)
38% identity, 60% coverage: 178:457/467 of query aligns to 12:283/285 of 3uf6A

query
sites
3uf6A
T
 
S
A
 
S
L
 
F
V
 
V
H
 
F
P
 
A
V
 
V
N
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
D
L
 
D
A
 
E
A
 
V
A
 
V
L
 
L
E
 
E
-
 
T
-
 
I
-
 
R
-
 
L
A
 
A
A
 
L
A
 
K
E
 
Q
N
 
K
L
 
L
I
 
G
E
 
K
P
 
F
V
 
L
L
 
L
V
 
F
G
 
G
P
 
K
K
 
K
E
 
E
R
 
D
I
 
K
L
 
T
A
 
L
A
 
T
A
 
A
R
 
N
D
 
E
N
 
S
N
 
-
I
 
-
D
 
-
I
 
-
S
 
V
P
 
T
W
 
W
Q
 
-
L
 
-
I
 
I
D
 
Q
V
 
T
E
 
D
H
 
T
S
 
A
H
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
Q
K
 
G
A
 
A
V
 
I
E
 
L
L
 
A
A
 
V
A
 
K
S
 
N
G
 
K
Q
 
E
V
 
A
A
 
D
A
 
I
I
 
L
M
 
V
K
 
K
G
 
G
A
 
F
L
 
I
H
 
P
S
x
T
D
 
A
E
 
T
L
 
L
L
 
M
G
 
H
A
 
H
V
 
V
V
 
L
K
 
K
G
 
K
S
 
E
G
 
N
G
 
G
L
 
L
R
 
R
T
 
T
E
 
D
R
 
Q
R
 
L
I
 
L
S
 
S
H
 
Q
A
 
I
Y
 
A
I
 
I
M
 
F
E
 
D
V
 
I
R
 
P
G
 
T
Y
 
Y
P
 
H
K
 
K
P
 
P
L
 
L
I
 
L
I
 
I
T
 
T
D
 
D
A
 
C
A
|
A
I
x
M
N
 
N
I
 
V
A
 
A
P
 
P
T
 
K
L
 
T
E
 
K
E
 
E
K
 
K
A
 
I
D
 
A
I
 
I
C
 
T
Q
 
E
N
 
N
A
 
A
I
 
L
T
 
A
L
 
V
W
 
A
H
 
H
T
 
Q
L
 
I
F
 
G
G
 
I
H
 
T
H
 
N
R
 
-
L
 
-
P
 
P
K
 
K
V
 
I
A
 
A
L
 
L
L
 
L
S
 
S
A
 
A
V
 
V
E
 
E
T
 
E
V
 
V
T
 
T
S
 
A
R
 
K
M
 
M
A
 
P
S
 
S
T
 
T
L
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
Q
C
 
E
L
 
V
C
 
V
K
 
Q
M
 
H
A
 
F
D
 
G
R
 
-
G
 
N
Q
 
Q
I
 
I
S
 
S
G
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
V
D
 
S
G
 
G
P
 
P
L
 
L
A
 
A
L
 
L
D
 
D
N
 
V
A
 
A
I
 
I
S
 
S
P
 
K
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
L
E
 
H
K
 
K
G
 
G
I
 
I
D
 
T
S
 
D
P
 
S
V
 
S
A
 
A
G
 
G
D
 
E
A
 
A
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
I
V
 
A
P
 
P
D
 
N
I
 
I
E
 
E
A
 
T
G
 
G
N
 
N
M
 
A
L
 
L
A
x
Y
K
|
K
Q
 
S
L
 
L
T
 
V
F
 
Y
L
 
F
G
 
A
Q
 
G
A
 
A
N
 
K
A
 
V
A
 
G
G
x
S
I
 
A
V
 
V
L
 
V
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
P
 
P
I
 
I
I
 
V
L
x
I
T
 
S
S
|
S
R
 
R
A
 
N
D
 
D
S
 
S
L
 
P
R
 
E
T
 
N
R
 
K
L
 
L
L
 
A
S
 
S
C
 
F
A
 
I
T
 
L
A
 
T
V
 
V
F
 
R
L
 
L

3u9eB The crystal structure of a possible phosphate acetyl/butaryl transferase (from listeria monocytogenes egd-e) in complex with coa.
38% identity, 60% coverage: 178:457/467 of query aligns to 14:285/288 of 3u9eB

query
sites
3u9eB
T
 
S
A
 
S
L
 
F
V
 
V
H
 
F
P
 
A
V
 
V
N
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
D
L
 
D
A
 
E
A
 
V
A
 
V
L
 
L
E
 
E
-
 
T
-
 
I
-
 
R
-
 
L
A
 
A
A
 
L
A
 
K
E
 
Q
N
 
K
L
 
L
I
 
G
E
 
K
P
 
F
V
 
L
L
 
L
V
 
F
G
 
G
P
 
K
K
 
K
E
 
E
R
 
D
I
 
K
L
 
T
A
 
L
A
 
T
A
 
A
R
 
N
D
 
E
N
 
S
N
 
-
I
 
-
D
 
-
I
 
-
S
 
V
P
 
T
W
 
W
Q
 
-
L
 
-
I
 
I
D
 
Q
V
 
T
E
 
D
H
 
T
S
 
A
H
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
Q
K
 
G
A
 
A
V
 
I
E
 
L
L
 
A
A
 
V
A
 
K
S
 
N
G
 
K
Q
 
E
V
 
A
A
 
D
A
 
I
I
 
L
M
 
V
K
 
K
G
 
G
A
 
F
L
 
I
H
 
P
S
x
T
D
x
A
E
 
T
L
 
L
L
 
M
G
 
H
A
 
H
V
 
V
V
x
L
K
|
K
G
 
K
S
 
E
G
 
N
G
 
G
L
 
L
R
|
R
T
 
T
E
 
D
R
 
Q
R
x
L
I
x
L
S
 
S
H
 
Q
A
 
I
Y
 
A
I
 
I
M
 
F
E
 
D
V
 
I
R
 
P
G
 
T
Y
 
Y
P
 
H
K
 
K
P
 
P
L
 
L
I
 
L
I
 
I
T
 
T
D
 
D
A
 
C
A
 
A
I
x
M
N
 
N
I
 
V
A
 
A
P
 
P
T
 
K
L
 
T
E
 
K
E
 
E
K
 
K
A
 
I
D
 
A
I
 
I
C
 
T
Q
 
E
N
 
N
A
 
A
I
 
L
T
 
A
L
 
V
W
 
A
H
 
H
T
 
Q
L
 
I
F
 
G
G
 
I
H
 
T
H
 
N
R
 
-
L
 
-
P
 
P
K
 
K
V
 
I
A
 
A
L
 
L
L
 
L
S
 
S
A
 
A
V
 
V
E
 
E
T
x
E
V
 
V
T
 
T
S
 
A
R
 
K
M
 
M
A
 
P
S
 
S
T
 
T
L
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
Q
C
 
E
L
 
V
C
 
V
K
 
Q
M
 
H
A
 
F
D
 
G
R
 
-
G
 
N
Q
 
Q
I
 
I
S
 
S
G
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
V
D
 
S
G
 
G
P
 
P
L
 
L
A
 
A
L
 
L
D
 
D
N
 
V
A
 
A
I
 
I
S
 
S
P
 
K
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
L
E
 
H
K
|
K
G
 
G
I
 
I
D
 
T
S
 
D
P
 
S
V
 
S
A
 
A
G
 
G
D
 
E
A
 
A
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
I
V
 
A
P
 
P
D
 
N
I
 
I
E
 
E
A
 
T
G
 
G
N
|
N
M
 
A
L
 
L
A
 
Y
K
|
K
Q
 
S
L
 
L
T
 
V
F
 
Y
L
 
F
G
 
A
Q
 
G
A
 
A
N
 
K
A
 
V
A
 
G
G
 
S
I
 
A
V
 
V
L
 
V
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
P
 
P
I
 
I
I
 
V
L
x
I
T
x
S
S
|
S
R
|
R
A
 
N
D
|
D
S
 
S
L
 
P
R
 
E
T
 
N
R
 
K
L
 
L
L
 
A
S
 
S
C
 
F
A
 
I
T
 
L
A
 
T
V
 
V
F
 
R
L
 
L

P86397 Hydroxyacyl-thioester dehydratase type 2, mitochondrial; HsHTD2; 3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase; EC 4.2.1.59 from Homo sapiens (Human) (see paper)
36% identity, 28% coverage: 14:142/467 of query aligns to 36:163/168 of P86397

query
sites
P86397
L
 
I
A
 
K
L
 
V
G
 
G
Q
 
D
S
 
R
A
 
A
S
 
E
L
 
L
T
 
R
R
 
R
T
 
A
L
 
F
T
 
T
Q
 
Q
H
 
T
D
 
D
I
 
V
D
 
A
L
 
T
F
 
F
A
 
S
V
 
E
M
 
L
S
 
T
G
 
G
D
|
D
V
 
V
N
 
N
P
 
P
A
 
L
H
|
H
M
 
L
N
 
N
P
 
E
D
 
D
Y
 
F
A
 
A
K
 
K
A
 
H
S
 
T
L
 
K
F
 
F
H
 
G
G
 
N
V
 
T
I
 
I
G
 
V
H
 
H
G
 
G
M
 
V
W
 
L
S
 
I
G
 
N
A
 
G
L
 
L
I
 
I
S
 
S
T
 
A
V
 
L
L
 
L
G
 
G
T
 
T
Q
 
K
L
 
M
P
 
P
G
 
G
P
 
P
G
 
G
T
 
C
I
 
V
Y
 
F
L
 
L
G
 
S
Q
 
Q
D
 
E
I
 
I
R
 
S
F
 
F
L
 
P
K
 
A
P
 
P
V
 
L
H
 
Y
V
 
I
G
 
G
D
 
E
T
 
V
I
 
V
T
 
L
V
 
A
T
 
S
L
 
A
T
 
E
V
 
V
K
 
K
H
 
K
K
 
L
A
 
K
T
 
R
G
 
F
K
 
I
P
 
A
L
 
I
V
 
I
E
 
A
F
 
V
D
 
S
C
 
C
Q
 
S
C
 
V
H
 
I
N
 
E
G
 
S
K
 
K
G
 
-
E
 
K
L
 
T
V
 
V
V
 
M
A
 
E
G
 
G
T
 
W
A
 
V
T
 
K
V
 
V
L
 
M
A
 
V
P
 
P

Sites not aligning to the query:

O32472 (R)-specific enoyl-CoA hydratase; EC 4.2.1.119 from Aeromonas caviae (Aeromonas punctata) (see 2 papers)
39% identity, 28% coverage: 14:142/467 of query aligns to 6:134/134 of O32472

query
sites
O32472
L
 
L
A
 
E
L
 
V
G
 
G
Q
 
Q
S
 
K
A
 
A
S
 
R
L
 
L
T
 
S
R
 
K
T
 
R
L
 
F
T
 
G
Q
 
A
H
 
A
D
 
E
I
 
V
D
 
A
L
 
A
F
 
F
A
 
A
V
 
A
M
 
L
S
 
S
G
 
E
D
|
D
V
 
F
N
 
N
P
 
P
A
 
L
H
|
H
M
 
L
N
 
D
P
 
P
D
 
A
Y
 
F
A
 
A
K
 
A
A
 
T
S
 
T
L
 
A
F
 
F
H
 
E
G
 
R
V
 
P
I
 
I
G
 
V
H
 
H
G
 
G
M
 
M
W
 
L
S
 
L
G
 
A
A
 
S
L
 
L
I
 
F
S
|
S
T
 
G
V
 
L
L
 
L
G
 
G
T
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
P
 
P
G
 
G
P
 
K
G
 
G
T
 
S
I
 
I
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
D
 
S
I
 
L
R
 
S
F
 
F
L
 
K
K
 
L
P
 
P
V
 
V
H
 
F
V
 
V
G
 
G
D
 
D
T
 
E
I
 
V
T
 
T
V
 
A
T
 
E
L
 
V
T
 
E
V
 
V
K
 
T
H
 
A
K
 
L
A
 
R
T
 
E
G
 
D
K
 
K
P
 
P
L
 
I
V
 
A
E
 
T
F
 
L
D
 
T
C
 
T
Q
 
R
C
 
I
H
 
F
N
 
T
G
 
Q
K
 
G
G
 
G
E
 
A
L
 
L
V
 
A
V
 
V
A
 
T
G
 
G
T
 
E
A
 
A
T
 
V
V
 
V
L
 
K
A
 
L
P
 
P

Sites not aligning to the query:

1xcoD Crystal structure of a phosphotransacetylase from bacillus subtilis in complex with acetylphosphate (see paper)
27% identity, 57% coverage: 176:440/467 of query aligns to 19:306/325 of 1xcoD

query
sites
1xcoD
V
 
V
K
 
K
T
 
I
A
 
V
L
 
F
V
 
P
H
 
E
P
 
G
V
 
L
N
 
D
G
 
E
A
 
R
A
 
I
L
 
L
A
 
E
A
 
A
A
 
V
L
 
S
E
 
K
A
 
L
A
 
A
A
 
G
E
 
N
N
 
K
L
 
V
I
 
L
E
 
N
P
 
P
V
 
I
L
 
V
V
 
I
G
 
G
P
 
N
K
 
E
E
 
N
R
 
E
I
 
I
L
 
Q
A
 
A
A
 
K
A
 
A
R
 
K
D
 
E
N
 
L
N
 
N
I
 
L
D
 
T
I
 
L
S
 
G
P
 
G
W
 
V
Q
 
K
L
 
I
I
 
Y
D
 
D
V
 
-
E
 
P
H
 
H
S
 
T
H
 
Y
A
 
E
A
 
G
-
 
M
-
 
E
-
 
D
-
 
L
-
 
V
-
 
Q
-
 
A
-
 
F
-
 
V
-
 
E
-
x
R
-
x
R
A
 
K
A
 
G
K
|
K
A
 
A
V
 
T
E
 
E
-
 
E
-
 
Q
-
 
A
-
 
R
-
 
K
-
 
A
-
 
L
-
 
L
-
 
D
-
 
E
-
 
N
-
 
Y
-
 
F
-
 
G
-
 
T
-
 
M
L
 
L
A
 
V
A
 
Y
S
 
K
G
 
G
Q
 
L
V
 
A
A
 
D
A
 
G
I
 
L
M
 
V
K
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
A
H
 
H
S
 
S
-
x
T
-
 
A
D
 
D
E
 
T
L
 
V
L
 
R
G
 
P
A
 
A
-
 
L
-
 
Q
V
 
I
V
 
I
K
|
K
G
 
T
S
 
K
G
 
E
G
 
G
L
 
V
R
 
K
T
 
-
E
 
-
R
 
-
R
 
K
I
 
T
S
 
S
H
 
G
A
 
V
Y
 
F
I
 
I
M
 
M
E
 
-
V
 
A
R
 
R
G
 
G
Y
 
-
P
 
E
K
 
E
P
 
Q
L
 
Y
I
 
V
I
 
F
T
 
A
D
 
D
A
 
C
A
 
A
I
 
I
N
 
N
I
 
I
A
 
A
P
 
P
T
 
-
L
 
-
E
 
-
E
 
D
K
 
S
A
 
Q
D
 
D
I
 
L
C
 
A
Q
 
E
N
 
I
A
 
A
I
 
I
T
 
E
L
 
S
W
 
A
H
 
N
T
 
T
L
 
A
F
 
K
G
 
M
H
 
F
H
 
D
R
 
I
L
 
E
P
 
P
K
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
M
L
 
L
S
 
S
A
 
F
V
 
S
E
 
T
T
 
K
V
 
G
T
 
S
S
 
A
R
 
K
M
 
S
A
 
D
S
 
E
T
 
T
L
 
E
D
 
K
A
 
V
A
 
A
C
 
D
L
 
A
C
 
V
K
 
K
M
 
I
A
 
A
D
 
-
R
 
K
G
 
E
Q
 
K
I
 
A
S
 
P
G
 
E
A
 
L
L
 
T
L
 
L
D
 
D
G
 
G
P
 
E
L
 
F
A
 
Q
L
 
F
D
 
D
N
 
A
A
 
A
I
 
F
S
 
V
P
 
P
Q
 
S
A
 
V
A
 
A
R
 
E
E
 
K
K
 
K
G
 
A
I
 
P
D
 
D
S
 
S
P
 
E
V
 
I
A
 
K
G
 
G
D
 
D
A
 
A
D
 
N
I
 
V
L
 
F
V
 
V
V
 
F
P
 
P
D
 
S
I
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
N
 
N
M
 
I
L
 
G
A
x
Y
K
|
K
Q
 
I
L
 
A
T
 
Q
F
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
N
A
 
F
N
 
E
A
 
A
A
 
V
G
 
G
I
 
P
V
 
I
L
 
L
-
 
Q
G
 
G
A
 
L
R
x
N
V
 
M
P
 
P
I
 
V
I
 
N
L
 
D
T
 
L
S
|
S
R
|
R

A0A3Q7HWE4 3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase FERN, mitochondrial; 3-hydroxyl-ACP dehydratase FERN; Protein FERN-LIKE; SlFERN; EC 4.2.1.59 from Solanum lycopersicum (Tomato) (Lycopersicon esculentum) (see paper)
27% identity, 28% coverage: 14:143/467 of query aligns to 23:152/165 of A0A3Q7HWE4

query
sites
A0A3Q7HWE4
L
 
L
A
 
K
L
 
I
G
 
G
Q
 
S
S
 
V
A
 
L
S
 
K
L
 
Q
T
 
A
R
 
R
T
 
T
L
 
F
T
 
A
Q
 
D
H
 
D
D
 
D
I
 
V
D
 
L
L
 
G
F
 
Y
A
 
S
V
 
K
M
 
L
S
 
T
G
 
H
D
 
D
V
 
A
N
 
N
P
 
P
A
 
L
H
 
H
M
 
F
N
 
D
P
 
A
D
 
E
Y
 
C
A
 
A
K
 
K
A
 
N
S
 
A
L
 
G
F
 
F
H
 
T
G
 
D
V
 
C
I
 
L
G
 
V
H
 
P
G
 
G
M
 
M
W
 
L
S
 
V
G
 
A
A
 
S
L
 
L
I
 
F
S
 
P
T
 
R
V
 
I
L
 
I
G
 
A
T
 
A
Q
 
H
L
 
F
P
 
-
G
 
-
P
 
P
G
 
G
T
 
A
I
 
I
Y
 
Y
L
 
V
G
 
S
Q
 
Q
D
 
T
I
 
L
R
 
H
F
 
F
L
 
K
K
 
L
P
 
P
V
 
V
H
 
Y
V
 
I
G
 
G
D
 
D
T
 
E
I
 
I
T
 
I
-
 
A
-
 
E
V
 
V
T
 
Q
L
 
A
T
 
V
V
 
S
K
 
I
H
 
R
K
 
Q
A
 
I
T
 
K
G
 
N
K
 
K
P
 
Y
L
 
I
V
 
A
E
 
K
F
 
L
D
 
S
C
 
T
Q
 
K
C
|
C
H
 
I
N
 
K
G
 
R
K
 
D
G
 
G
E
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
I
A
 
D
G
 
G
T
 
E
A
 
A
T
 
T
V
 
A
L
 
M
A
 
L
P
 
P
T
 
S

P38503 Phosphate acetyltransferase; Phosphotransacetylase; EC 2.3.1.8 from Methanosarcina thermophila (see 2 papers)
32% identity, 43% coverage: 241:440/467 of query aligns to 108:310/333 of P38503

query
sites
P38503
A
 
A
V
 
V
E
 
M
L
 
M
A
 
A
A
 
K
S
 
L
G
 
G
Q
 
E
V
 
V
A
 
D
A
 
G
I
 
V
M
 
V
K
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
A
H
 
H
S
 
S
-
 
S
-
 
S
D
 
D
E
 
T
L
 
L
L
 
R
G
 
P
A
 
A
V
 
V
-
 
Q
-
 
I
V
 
V
K
 
K
G
 
T
S
 
A
G
 
K
G
 
G
L
 
A
R
 
A
T
 
L
E
 
A
R
 
-
R
 
-
I
 
-
S
 
S
H
 
A
A
 
F
Y
 
F
I
 
I
M
 
I
E
 
S
V
 
V
-
 
P
-
 
D
-
x
C
-
 
E
R
 
Y
G
 
G
Y
 
S
P
 
D
K
 
G
P
 
T
L
 
F
I
 
L
I
 
F
T
 
A
D
 
D
A
 
S
A
 
G
I
 
M
N
 
V
I
 
E
A
 
M
P
 
P
T
 
S
L
 
V
E
 
E
E
 
D
K
 
V
A
 
A
D
 
N
I
 
I
C
 
A
Q
 
V
N
 
I
A
 
S
I
 
A
T
 
K
L
 
T
W
 
F
H
 
E
T
 
L
L
 
L
F
 
V
G
 
-
H
 
-
H
 
Q
R
 
D
L
 
V
P
 
P
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
M
L
 
L
S
 
S
A
 
Y
V
 
S
E
 
T
T
 
K
V
 
G
T
 
S
S
 
A
R
 
K
M
 
S
A
 
K
S
 
L
T
 
T
L
 
E
D
 
A
A
 
T
A
 
I
C
 
A
L
 
S
C
 
T
K
 
K
M
 
L
A
 
A
D
 
Q
R
 
E
G
 
L
Q
 
A
I
 
P
S
 
D
G
 
I
A
 
A
L
 
I
L
 
-
D
 
D
G
 
G
P
 
E
L
 
L
A
 
Q
L
 
V
D
 
D
N
 
A
A
 
A
I
 
I
S
 
V
P
 
P
Q
 
K
A
 
V
A
 
A
R
 
A
E
 
S
K
 
K
G
 
A
I
 
P
D
 
G
S
 
S
P
 
P
V
 
V
A
 
A
G
 
G
D
 
K
A
 
A
D
 
N
I
 
V
L
 
F
V
 
I
V
 
F
P
 
P
D
 
D
I
 
L
E
 
N
A
 
C
G
 
G
N
 
N
M
 
I
L
 
A
A
 
Y
K
 
K
Q
 
I
L
 
A
T
 
Q
F
 
R
L
 
L
G
 
A
Q
 
K
A
 
A
N
 
E
A
 
A
A
 
Y
G
 
G
-
 
P
I
 
I
V
 
T
L
 
Q
G
 
G
A
 
L
R
 
A
V
 
K
P
 
P
I
 
I
I
 
N
L
 
D
T
 
L
S
 
S
R
 
R

Sites not aligning to the query:

2af3C Phosphotransacetylase from methanosarcina thermophila soaked with coenzyme a (see paper)
32% identity, 43% coverage: 241:440/467 of query aligns to 107:309/332 of 2af3C

query
sites
2af3C
A
 
A
V
 
V
E
 
M
L
 
M
A
 
A
A
 
K
S
 
L
G
 
G
Q
 
E
V
 
V
A
 
D
A
 
G
I
 
V
M
 
V
K
 
S
G
 
G
A
 
A
L
 
A
H
 
H
S
 
S
-
x
S
-
 
S
D
 
D
E
 
T
L
|
L
L
 
R
G
 
P
A
 
A
V
|
V
-
 
Q
-
 
I
V
 
V
K
 
K
G
 
T
S
 
A
G
 
K
G
 
G
L
 
A
R
 
A
T
x
L
E
x
A
R
 
-
R
 
-
I
 
-
S
 
S
H
 
A
A
 
F
Y
 
F
I
 
I
M
 
I
E
 
S
V
 
V
-
 
P
-
 
D
-
 
C
-
 
E
R
 
Y
G
 
G
Y
 
S
P
 
D
K
 
G
P
 
T
L
 
F
I
 
L
I
 
F
T
 
A
D
 
D
A
 
S
A
x
G
I
x
M
N
x
V
I
x
E
A
 
M
P
 
P
T
 
S
L
 
V
E
 
E
E
 
D
K
 
V
A
 
A
D
 
N
I
 
I
C
 
A
Q
 
V
N
 
I
A
 
S
I
 
A
T
 
K
L
 
T
W
 
F
H
 
E
T
 
L
L
 
L
F
 
V
G
 
-
H
 
-
H
 
Q
R
 
D
L
 
V
P
 
P
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
M
L
 
L
S
 
S
A
 
Y
V
 
S
E
 
T
T
 
K
V
 
G
T
 
S
S
 
A
R
 
K
M
 
S
A
 
K
S
 
L
T
 
T
L
 
E
D
 
A
A
 
T
A
 
I
C
 
A
L
 
S
C
 
T
K
 
K
M
 
L
A
 
A
D
 
Q
R
 
E
G
 
L
Q
 
A
I
 
P
S
 
D
G
 
I
A
 
A
L
 
I
L
 
-
D
 
D
G
 
G
P
 
E
L
 
L
A
 
Q
L
 
V
D
 
D
N
 
A
A
 
A
I
 
I
S
 
V
P
 
P
Q
 
K
A
 
V
A
 
A
R
 
A
E
 
S
K
 
K
G
 
A
I
 
P
D
 
G
S
 
S
P
 
P
V
 
V
A
 
A
G
 
G
D
 
K
A
 
A
D
 
N
I
 
V
L
 
F
V
 
I
V
 
F
P
 
P
D
 
D
I
 
L
E
 
N
A
 
C
G
 
G
N
|
N
M
 
I
L
 
A
A
x
Y
K
|
K
Q
 
I
L
 
A
T
x
Q
F
 
R
L
 
L
G
 
A
Q
 
K
A
 
A
N
 
E
A
 
A
A
 
Y
G
|
G
-
x
P
I
 
I
V
x
T
L
 
Q
G
 
G
A
 
L
R
 
A
V
 
K
P
 
P
I
 
I
I
 
N
L
x
D
T
x
L
S
|
S
R
 
R

Sites not aligning to the query:

P77455 Bifunctional protein PaaZ; EC 3.3.2.12; EC 1.2.1.91 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
37% identity, 22% coverage: 11:115/467 of query aligns to 531:637/681 of P77455

query
sites
P77455
F
 
F
D
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
Q
L
 
P
G
 
G
Q
 
D
S
 
S
A
 
L
-
 
L
S
 
T
L
 
P
T
 
R
R
 
R
T
 
T
L
 
M
T
 
T
Q
 
E
H
 
A
D
 
D
I
 
I
D
 
V
L
 
N
F
 
F
A
 
A
V
 
C
M
 
L
S
 
S
G
 
G
D
 
D
V
 
H
N
 
F
P
 
Y
A
 
A
H
 
H
M
 
M
N
 
D
P
 
K
D
 
I
Y
 
A
A
 
A
K
 
A
A
 
E
S
 
S
L
 
I
F
 
F
H
 
G
G
 
E
V
 
R
I
 
V
G
 
V
H
 
H
G
 
G
M
 
Y
W
 
F
S
 
V
G
 
L
A
 
S
L
 
A
I
 
A
S
 
A
T
 
G
V
 
L
L
 
F
G
 
V
T
 
D
Q
 
A
L
 
G
P
 
V
G
 
G
P
 
P
G
 
V
T
 
I
I
 
A
Y
 
N
L
 
Y
G
 
G
-
 
L
Q
 
E
D
 
S
I
 
L
R
 
R
F
 
F
L
 
I
K
 
E
P
 
P
V
 
V
H
 
K
V
 
P
G
 
G
D
 
D
T
 
T
I
 
I
T
 
Q
V
 
V
T
 
R
L
 
L
T
 
T
V
 
C
K
 
K
H
 
R
K
 
K
A
 
T
T
 
L
G
 
K
K
 
K

Sites not aligning to the query:

6jqoA Structure of paaz, a bifunctional enzyme in complex with NADP+ and ccoa (see paper)
37% identity, 22% coverage: 11:115/467 of query aligns to 530:636/678 of 6jqoA

query
sites
6jqoA
F
 
F
D
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
Q
L
 
P
G
 
G
Q
 
D
S
 
S
A
 
L
-
 
L
S
 
T
L
 
P
T
 
R
R
 
R
T
 
T
L
 
M
T
 
T
Q
 
E
H
 
A
D
 
D
I
 
I
D
 
V
L
 
N
F
 
F
A
 
A
V
 
C
M
 
L
S
 
S
G
 
G
D
 
D
V
 
H
N
 
F
P
 
Y
A
 
A
H
 
H
M
 
M
N
 
D
P
 
K
D
 
I
Y
 
A
A
 
A
K
 
A
A
 
E
S
 
S
L
 
I
F
 
F
H
 
G
G
 
E
V
 
R
I
 
V
G
 
V
H
 
H
G
 
G
M
 
Y
W
 
F
S
 
V
G
 
L
A
 
S
L
 
A
I
 
A
S
 
A
T
 
G
V
 
L
L
 
F
G
 
V
T
 
D
Q
 
A
L
 
G
P
 
V
G
 
G
P
 
P
G
 
V
T
 
I
I
 
A
Y
 
N
L
 
Y
G
 
G
-
 
L
Q
 
E
D
 
S
I
 
L
R
 
R
F
 
F
L
 
I
K
 
E
P
 
P
V
 
V
H
 
K
V
 
P
G
 
G
D
 
D
T
 
T
I
 
I
T
 
Q
V
 
V
T
 
R
L
 
L
T
 
T
V
 
C
K
 
K
H
 
R
K
 
K
A
 
T
T
 
L
G
 
K
K
 
K

Sites not aligning to the query:

6jqnA Structure of paaz, a bifunctional enzyme in complex with NADP+ and ocoa (see paper)
37% identity, 22% coverage: 11:115/467 of query aligns to 530:636/678 of 6jqnA

query
sites
6jqnA
F
 
F
D
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
Q
L
 
P
G
 
G
Q
 
D
S
 
S
A
 
L
-
 
L
S
 
T
L
 
P
T
 
R
R
 
R
T
 
T
L
 
M
T
 
T
Q
 
E
H
 
A
D
 
D
I
 
I
D
 
V
L
 
N
F
 
F
A
 
A
V
 
C
M
 
L
S
 
S
G
 
G
D
 
D
V
 
H
N
x
F
P
 
Y
A
 
A
H
|
H
M
 
M
N
 
D
P
 
K
D
 
I
Y
 
A
A
 
A
K
 
A
A
 
E
S
 
S
L
 
I
F
|
F
H
 
G
G
 
E
V
 
R
I
 
V
G
 
V
H
 
H
G
|
G
M
 
Y
W
 
F
S
 
V
G
 
L
A
 
S
L
 
A
I
 
A
S
 
A
T
 
G
V
 
L
L
 
F
G
x
V
T
 
D
Q
 
A
L
 
G
P
 
V
G
 
G
P
 
P
G
 
V
T
 
I
I
x
A
Y
x
N
L
x
Y
G
 
G
-
 
L
Q
 
E
D
 
S
I
 
L
R
 
R
F
|
F
L
x
I
K
 
E
P
 
P
V
 
V
H
 
K
V
 
P
G
 
G
D
 
D
T
 
T
I
 
I
T
 
Q
V
 
V
T
 
R
L
 
L
T
 
T
V
 
C
K
 
K
H
 
R
K
 
K
A
 
T
T
 
L
G
 
K
K
 
K

Sites not aligning to the query:

6jqmA Structure of paaz with NADPH (see paper)
37% identity, 22% coverage: 11:115/467 of query aligns to 530:636/678 of 6jqmA

query
sites
6jqmA
F
 
F
D
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
Q
L
 
P
G
 
G
Q
 
D
S
 
S
A
 
L
-
 
L
S
 
T
L
 
P
T
 
R
R
 
R
T
 
T
L
 
M
T
 
T
Q
 
E
H
 
A
D
 
D
I
 
I
D
 
V
L
 
N
F
 
F
A
 
A
V
 
C
M
 
L
S
 
S
G
 
G
D
 
D
V
 
H
N
 
F
P
 
Y
A
 
A
H
 
H
M
 
M
N
 
D
P
 
K
D
 
I
Y
 
A
A
 
A
K
 
A
A
 
E
S
 
S
L
 
I
F
 
F
H
 
G
G
 
E
V
 
R
I
 
V
G
 
V
H
 
H
G
 
G
M
 
Y
W
 
F
S
 
V
G
 
L
A
 
S
L
 
A
I
 
A
S
 
A
T
 
G
V
 
L
L
 
F
G
 
V
T
 
D
Q
 
A
L
 
G
P
 
V
G
 
G
P
 
P
G
 
V
T
 
I
I
 
A
Y
 
N
L
 
Y
G
 
G
-
 
L
Q
 
E
D
 
S
I
 
L
R
 
R
F
 
F
L
 
I
K
 
E
P
 
P
V
 
V
H
 
K
V
 
P
G
 
G
D
 
D
T
 
T
I
 
I
T
 
Q
V
 
V
T
 
R
L
 
L
T
 
T
V
 
C
K
 
K
H
 
R
K
 
K
A
 
T
T
 
L
G
 
K
K
 
K

Sites not aligning to the query:

Q8ZND6 Phosphate acetyltransferase; Phosphotransacetylase; EC 2.3.1.222; EC 2.3.1.8 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
30% identity, 35% coverage: 299:463/467 of query aligns to 553:714/714 of Q8ZND6

query
sites
Q8ZND6
D
 
D
A
 
C
A
 
A
I
 
I
N
 
N
I
 
P
A
 
D
P
 
P
T
 
T
L
 
A
E
 
E
E
 
Q
K
 
L
A
 
A
D
 
E
I
 
I
C
 
-
Q
 
-
N
 
-
A
 
A
I
 
I
T
 
Q
L
 
S
W
 
A
H
 
D
T
 
S
L
 
A
F
 
I
G
 
A
H
 
F
H
 
G
R
 
I
L
 
E
P
 
P
K
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
M
L
 
L
S
 
S
A
 
-
V
 
Y
E
 
S
T
 
T
V
 
G
T
 
T
S
 
S
R
 
G
M
 
A
A
 
G
S
 
S
T
 
D
L
 
V
D
 
E
A
 
K
A
 
V
C
 
R
L
 
E
C
 
A
K
 
T
M
 
R
A
 
L
D
 
A
R
 
Q
G
 
E
Q
 
K
I
 
R
S
 
P
G
 
D
A
 
L
L
 
M
L
 
I
D
 
D
G
 
G
P
 
P
L
 
L
A
 
Q
L
 
Y
D
 
D
N
 
A
A
 
A
I
 
V
S
 
M
P
 
A
Q
 
D
A
 
V
A
 
A
R
 
K
E
 
S
K
 
K
G
 
A
I
 
P
D
 
N
S
 
S
P
 
P
V
 
V
A
 
A
G
 
G
D
 
R
A
 
A
D
 
T
I
 
V
L
 
F
V
 
I
V
 
F
P
 
P
D
 
D
I
 
L
E
 
N
A
 
T
G
 
G
N
 
N
M
 
T
L
 
T
A
 
Y
K
 
K
Q
 
A
L
 
V
T
 
Q
F
 
R
L
 
S
G
 
A
Q
 
D
A
 
L
N
 
I
A
 
S
A
 
I
G
 
G
I
 
P
V
 
M
L
 
L
-
 
Q
G
 
G
A
 
M
R
 
R
V
 
K
P
 
P
I
 
V
I
 
N
L
 
D
T
 
L
S
 
S
R
 
R
A
 
G
D
 
A
S
 
L
L
 
V
R
 
D
T
 
D
R
 
I
L
 
V
L
 
Y
S
 
T
C
 
I
A
 
A
T
 
L
A
 
T
V
 
A
F
 
I
L
 
Q
S
 
A
A
 
S
A
 
Q
R
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q

Sites not aligning to the query:

4v8lD Structure of the Mycobacterial Fatty Acid Synthase (see paper)
34% identity, 26% coverage: 30:149/467 of query aligns to 1205:1323/2822 of 4v8lD

query
sites
4v8lD
D
 
D
I
 
M
D
 
R
L
 
P
F
 
F
A
 
A
V
 
V
M
 
V
S
 
S
G
 
G
D
 
D
V
 
H
N
 
N
P
 
P
A
 
I
H
 
H
M
 
T
N
 
D
P
 
R
D
 
A
Y
 
A
A
 
A
K
 
L
A
 
L
S
 
A
L
 
G
F
 
L
H
 
E
G
 
G
V
 
P
I
 
I
G
 
V
H
 
H
G
 
G
M
 
M
W
 
W
-
 
L
S
 
S
G
 
A
A
 
A
L
 
A
I
 
Q
S
 
H
T
 
V
V
 
V
L
 
T
G
 
A
T
 
T
Q
 
D
-
 
G
L
 
K
P
 
P
G
 
V
P
 
P
G
 
P
T
 
A
I
 
K
Y
 
L
L
 
I
G
 
G
Q
 
W
D
 
T
I
 
A
R
 
R
F
 
F
L
 
L
K
 
G
P
 
M
V
 
V
H
 
K
V
 
P
G
 
G
D
 
D
T
 
Q
I
 
V
T
 
D
V
 
F
T
 
R
L
 
V
T
 
D
V
 
R
K
 
V
H
 
G
K
 
I
A
 
D
T
 
V
G
 
G
K
 
A
P
 
E
L
 
V
V
 
L
E
 
E
F
 
V
D
 
S
C
 
A
Q
 
R
C
 
I
H
 
G
N
 
S
G
 
-
K
 
-
G
 
-
E
 
E
L
 
L
V
 
V
V
 
M
A
 
A
G
 
A
T
 
T
A
 
A
T
 
R
V
 
L
L
 
A
A
 
A
P
 
P
T
 
K
E
 
T
H
 
V
L
 
Y
R
 
A
L
 
F
P
 
P

Sites not aligning to the query:

6ioxA Crystal structure of porphyromonas gingivalis phosphotransacetylase in complex with acetyl-coa (see paper)
31% identity, 32% coverage: 295:445/467 of query aligns to 173:321/339 of 6ioxA

query
sites
6ioxA
L
 
L
I
 
L
I
 
V
T
 
A
D
 
D
A
 
C
A
|
A
I
x
V
N
 
I
I
 
P
A
 
N
P
 
P
T
 
T
L
 
A
E
 
D
E
 
E
K
 
L
A
 
A
D
 
Q
I
 
I
C
 
-
Q
 
-
N
 
-
A
 
A
I
 
V
T
 
A
L
 
T
W
 
A
H
 
R
T
 
T
L
 
A
F
 
K
G
 
A
H
 
I
H
 
A
R
 
D
L
 
I
-
 
E
P
 
P
K
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
M
L
 
L
S
 
S
A
 
F
V
 
S
E
 
T
T
 
K
V
 
G
T
 
S
S
 
A
R
 
K
M
 
H
A
 
E
S
 
M
T
 
T
L
 
D
D
 
K
A
 
V
A
 
V
C
 
E
L
 
A
C
 
T
K
 
R
M
 
M
A
 
A
D
 
Q
R
 
E
G
 
-
Q
 
M
I
 
A
S
 
P
G
 
D
A
 
L
L
 
L
L
 
I
D
 
D
G
 
G
P
 
E
L
 
M
A
 
Q
L
 
A
D
 
D
N
 
A
A
 
A
I
 
L
S
 
V
P
 
E
Q
 
R
A
 
V
A
 
A
R
 
A
E
 
L
K
 
K
G
 
A
I
 
P
D
 
G
S
 
S
P
 
N
V
 
V
A
 
A
G
 
G
D
 
K
A
 
A
D
 
N
I
 
V
L
 
L
V
 
V
V
 
F
P
 
P
D
 
T
I
 
L
E
 
E
A
 
V
G
 
G
N
 
N
M
 
I
L
 
A
A
 
Y
K
 
K
Q
 
L
L
 
V
T
 
E
F
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
H
A
 
A
N
 
E
A
 
A
A
 
V
G
 
G
I
 
P
V
 
I
L
 
L
-
 
Q
G
 
G
A
 
M
R
 
A
V
 
A
P
 
P
I
 
V
I
 
N
L
 
D
T
 
L
S
 
S
R
 
R
A
 
G
D
 
C
S
 
S
L
 
V
R
 
E

Sites not aligning to the query:

6zngF Maeb full-length acetyl-coa bound state (see paper)
27% identity, 29% coverage: 293:429/467 of query aligns to 582:713/753 of 6zngF

query
sites
6zngF
K
 
K
P
 
F
L
 
L
I
 
V
I
 
L
T
 
A
D
 
D
A
 
T
A
x
T
I
x
V
N
|
N
I
x
L
A
 
N
P
 
P
T
 
T
L
 
A
E
 
E
E
 
Q
K
 
C
A
 
A
D
 
Q
I
 
I
C
 
A
Q
 
L
N
 
Q
A
 
A
I
 
A
T
 
K
L
 
I
W
 
V
H
 
E
T
 
-
L
 
Y
F
 
F
G
 
G
H
 
I
H
 
E
R
 
-
L
 
-
P
 
P
K
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
M
L
 
L
S
 
S
-
x
Y
-
 
S
-
 
N
-
 
F
-
 
S
A
 
G
V
 
A
E
 
E
T
 
G
V
 
T
T
 
P
S
 
R
R
 
K
M
 
M
A
 
K
S
 
K
T
 
A
L
 
A
D
 
E
A
 
I
A
 
A
C
 
-
L
 
-
C
 
-
K
 
-
M
 
-
A
 
-
D
 
-
R
 
R
G
 
S
Q
 
L
I
 
R
S
 
P
G
 
D
A
 
L
L
 
M
L
 
I
D
 
E
G
 
G
P
 
D
L
 
M
A
x
Q
L
 
A
D
 
D
N
 
T
A
 
A
I
 
V
S
 
N
P
 
P
Q
 
E
A
 
I
A
 
M
R
 
E
E
 
R
K
 
L
G
 
F
I
 
P
D
 
F
S
 
S
P
 
G
V
 
L
A
 
K
G
 
G
D
 
G
A
 
A
D
 
N
I
 
V
L
 
L
V
 
V
V
 
F
P
 
P
D
 
N
I
x
L
E
 
E
A
 
S
G
 
S
N
|
N
M
 
I
L
 
A
A
 
Y
K
 
K
Q
 
L
L
 
I
T
 
Q
F
 
Q
L
 
I
G
 
G
Q
 
K
A
 
A
N
 
E
A
 
V
A
 
I
G
 
G
I
 
P
V
 
F
L
 
L

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_008486132.1 NCBI__GCF_000299915.1:WP_008486132.1
MDAQPLCNLTFDELALGQSASLTRTLTQHDIDLFAVMSGDVNPAHMNPDYAKASLFHGVI
GHGMWSGALISTVLGTQLPGPGTIYLGQDIRFLKPVHVGDTITVTLTVKHKATGKPLVEF
DCQCHNGKGELVVAGTATVLAPTEHLRLPRPVLPQVELYQDHYQDILARCRTLGAVKTAL
VHPVNGAALAAALEAAAENLIEPVLVGPKERILAAARDNNIDISPWQLIDVEHSHAAAAK
AVELAASGQVAAIMKGALHSDELLGAVVKGSGGLRTERRISHAYIMEVRGYPKPLIITDA
AINIAPTLEEKADICQNAITLWHTLFGHHRLPKVALLSAVETVTSRMASTLDAACLCKMA
DRGQISGALLDGPLALDNAISPQAAREKGIDSPVAGDADILVVPDIEAGNMLAKQLTFLG
QANAAGIVLGARVPIILTSRADSLRTRLLSCATAVFLSAARQQGDLK

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory