SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_008496776.1 NCBI__GCF_000342445.1:WP_008496776.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P30750 Methionine import ATP-binding protein MetN; EC 7.4.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
50% identity, 100% coverage: 1:342/343 of query aligns to 1:343/343 of P30750

query
sites
P30750
M
 
M
I
 
I
Q
 
K
F
 
L
E
 
S
G
 
N
V
 
I
A
 
T
K
 
K
T
 
V
Y
 
F
Q
 
H
S
 
Q
G
 
G
K
 
T
Q
 
R
E
 
T
I
 
I
H
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
N
G
 
N
I
 
V
D
 
S
L
 
L
T
 
H
V
 
V
E
 
P
T
 
A
G
 
G
E
 
Q
I
 
I
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
F
 
A
S
|
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
L
I
 
I
R
 
R
T
 
C
V
 
V
N
 
N
L
 
L
L
 
L
E
 
E
R
 
R
P
 
P
S
 
T
K
 
E
G
 
G
R
 
S
V
 
V
L
 
L
I
 
V
H
 
D
G
 
G
K
 
Q
D
 
E
I
 
L
S
 
T
T
 
T
L
 
L
S
 
S
S
 
E
K
 
S
E
 
E
I
 
L
R
 
T
T
 
K
I
 
A
R
 
R
K
 
R
D
 
Q
I
 
I
G
 
G
M
 
M
I
 
I
F
 
F
Q
 
Q
H
 
H
F
 
F
N
 
N
L
 
L
L
 
L
N
 
S
S
 
S
K
 
R
T
 
T
V
 
V
F
 
F
H
 
G
N
 
N
V
 
V
A
 
A
M
 
L
P
 
P
L
 
L
L
 
E
L
 
L
A
 
D
K
 
N
T
 
T
P
 
P
K
 
K
A
 
D
D
 
E
I
 
V
E
 
K
K
 
R
Q
 
R
V
 
V
K
 
T
D
 
E
L
 
L
L
 
L
D
 
S
F
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
G
D
 
D
Q
 
K
A
 
H
Q
 
D
K
 
S
Y
 
Y
P
 
P
D
 
S
Q
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
I
 
V
G
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
S
N
 
N
P
 
P
S
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
L
C
 
C
D
 
D
E
|
E
A
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
A
T
 
T
T
 
T
K
 
R
S
 
S
I
 
I
L
 
L
D
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
K
K
 
D
I
 
I
N
 
N
K
 
R
E
 
R
Y
 
L
N
 
G
I
 
L
T
 
T
I
 
I
L
 
L
L
 
L
I
 
I
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
G
 
D
V
 
V
I
 
V
R
 
K
E
 
R
I
 
I
C
 
C
N
 
D
K
 
C
V
 
V
A
 
A
V
 
V
L
 
I
E
 
S
E
 
N
G
 
G
K
 
E
V
 
L
I
 
I
E
 
E
Q
 
Q
G
 
D
T
 
T
V
 
V
F
 
S
E
 
E
V
 
V
F
 
F
S
 
S
N
 
H
P
 
P
Q
 
K
Q
 
T
A
 
P
T
 
L
T
 
A
K
 
Q
R
 
K
F
 
F
V
 
I
R
 
Q
S
 
S
V
 
T
M
 
L
N
 
H
D
 
L
E
 
D
L
 
I
P
 
P
E
 
E
S
 
D
L
 
Y
L
 
Q
A
 
E
Q
 
R
I
 
L
H
 
Q
-
 
A
E
 
E
P
 
P
H
 
F
S
 
T
D
 
D
H
 
C
T
 
V
-
 
P
I
 
M
F
 
L
R
 
R
L
 
L
Q
 
E
F
 
F
T
 
T
G
 
G
N
 
Q
S
 
S
V
|
V
G
x
D
T
x
A
P
|
P
V
x
L
M
x
L
S
 
S
R
 
E
V
 
T
S
 
A
R
 
R
N
 
R
F
 
F
N
 
N
V
 
V
D
 
N
L
 
N
N
|
N
V
x
I
L
 
I
F
 
S
G
 
A
N
 
Q
I
 
M
T
 
D
E
 
Y
L
 
A
Q
 
G
G
 
G
V
 
V
P
 
K
Y
 
F
G
 
G
N
 
I
L
 
M
I
 
L
V
 
T
E
 
E
F
 
M
S
 
H
G
 
G
E
 
T
L
 
Q
K
 
Q
E
 
D
I
 
T
E
 
Q
R
 
A
A
 
A
I
 
I
T
 
A
S
 
W
I
 
L
R
 
Q
D
 
E
N
 
H
N
 
H
I
 
V
H
 
K
I
 
V
E
 
-
E
 
E
V
 
V
T
 
L
H
 
G
Y
 
Y
V
 
V

3tuzC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 semet soak crystal form (see paper)
50% identity, 100% coverage: 1:342/343 of query aligns to 2:344/344 of 3tuzC

query
sites
3tuzC
M
 
M
I
 
I
Q
 
K
F
 
L
E
 
S
G
 
N
V
 
I
A
 
T
K
 
K
T
 
V
Y
x
F
Q
 
H
S
x
Q
G
 
G
K
 
T
Q
 
R
E
 
T
I
 
I
H
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
N
G
 
N
I
 
V
D
 
S
L
 
L
T
 
H
V
 
V
E
 
P
T
 
A
G
 
G
E
 
Q
I
 
I
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
F
 
A
S
 
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
L
I
 
I
R
 
R
T
 
C
V
 
V
N
 
N
L
 
L
L
 
L
E
 
E
R
 
R
P
 
P
S
 
T
K
 
E
G
 
G
R
 
S
V
 
V
L
 
L
I
 
V
H
 
D
G
 
G
K
 
Q
D
 
E
I
 
L
S
 
T
T
 
T
L
 
L
S
 
S
S
 
E
K
 
S
E
 
E
I
 
L
R
 
T
T
 
K
I
 
A
R
 
R
K
 
R
D
 
Q
I
 
I
G
 
G
M
 
M
I
 
I
F
 
F
Q
 
Q
H
 
H
F
 
F
N
 
N
L
 
L
L
 
L
N
 
S
S
 
S
K
 
R
T
 
T
V
 
V
F
 
F
H
 
G
N
 
N
V
 
V
A
 
A
M
 
L
P
 
P
L
 
L
L
 
E
L
 
L
A
 
D
K
 
N
T
 
T
P
 
P
K
 
K
A
 
D
D
 
E
I
 
V
E
 
K
K
 
R
Q
 
R
V
 
V
K
 
T
D
 
E
L
 
L
L
 
L
D
 
S
F
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
G
D
 
D
Q
 
K
A
 
H
Q
 
D
K
 
S
Y
 
Y
P
 
P
D
 
S
Q
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
I
 
V
G
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
S
N
 
N
P
 
P
S
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
L
C
 
C
D
 
D
E
 
Q
A
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
A
T
 
T
T
 
T
K
 
R
S
 
S
I
 
I
L
 
L
D
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
K
K
 
D
I
 
I
N
 
N
K
 
R
E
 
R
Y
 
L
N
 
G
I
 
L
T
 
T
I
 
I
L
 
L
L
 
L
I
 
I
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
G
 
D
V
 
V
I
 
V
R
 
K
E
 
R
I
 
I
C
 
C
N
 
D
K
 
C
V
 
V
A
 
A
V
 
V
L
 
I
E
 
S
E
 
N
G
 
G
K
 
E
V
 
L
I
 
I
E
 
E
Q
 
Q
G
 
D
T
 
T
V
 
V
F
 
S
E
 
E
V
 
V
F
 
F
S
 
S
N
 
H
P
 
P
Q
 
K
Q
 
T
A
 
P
T
 
L
T
 
A
K
 
Q
R
 
K
F
 
F
V
 
I
R
 
Q
S
 
S
V
 
T
M
 
L
N
 
H
D
 
L
E
 
D
L
 
I
P
 
P
E
 
E
S
 
D
L
 
Y
L
 
Q
A
 
E
Q
 
R
I
 
L
H
 
Q
-
 
A
E
 
E
P
 
P
H
 
F
S
 
T
D
 
D
H
 
C
T
 
V
-
 
P
I
 
M
F
 
L
R
 
R
L
 
L
Q
 
E
F
|
F
T
 
T
G
 
G
N
 
Q
S
 
S
V
|
V
G
 
D
T
x
A
P
|
P
V
x
L
M
x
L
S
 
S
R
 
E
V
 
T
S
 
A
R
 
R
N
 
R
F
 
F
N
 
N
V
 
V
D
 
N
L
 
N
N
 
N
V
 
I
L
 
I
F
 
S
G
 
A
N
 
Q
I
 
M
T
 
D
E
 
Y
L
 
A
Q
 
G
G
 
G
V
 
V
P
 
K
Y
 
F
G
|
G
N
 
I
L
x
M
I
 
L
V
 
T
E
 
E
F
 
M
S
 
H
G
 
G
E
 
T
L
 
Q
K
 
Q
E
 
D
I
 
T
E
 
Q
R
 
A
A
 
A
I
 
I
T
 
A
S
 
W
I
 
L
R
 
Q
D
 
E
N
 
H
N
 
H
I
 
V
H
 
K
I
 
V
E
 
-
E
 
E
V
 
V
T
 
L
H
 
G
Y
 
Y
V
 
V

3tuiC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 native crystal form (see paper)
50% identity, 100% coverage: 1:342/343 of query aligns to 2:344/344 of 3tuiC

query
sites
3tuiC
M
 
M
I
 
I
Q
 
K
F
 
L
E
 
S
G
 
N
V
 
I
A
 
T
K
 
K
T
 
V
Y
x
F
Q
 
H
S
 
Q
G
 
G
K
 
T
Q
 
R
E
 
T
I
 
I
H
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
N
G
 
N
I
 
V
D
 
S
L
 
L
T
 
H
V
 
V
E
 
P
T
 
A
G
 
G
E
 
Q
I
 
I
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
F
 
A
S
 
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
L
I
 
I
R
 
R
T
 
C
V
 
V
N
 
N
L
 
L
L
 
L
E
 
E
R
 
R
P
 
P
S
 
T
K
 
E
G
 
G
R
 
S
V
 
V
L
 
L
I
 
V
H
 
D
G
 
G
K
 
Q
D
 
E
I
 
L
S
 
T
T
 
T
L
 
L
S
 
S
S
 
E
K
 
S
E
 
E
I
 
L
R
 
T
T
 
K
I
 
A
R
 
R
K
 
R
D
 
Q
I
 
I
G
 
G
M
 
M
I
 
I
F
 
F
Q
 
Q
H
 
H
F
 
F
N
 
N
L
 
L
L
 
L
N
 
S
S
 
S
K
 
R
T
 
T
V
 
V
F
 
F
H
 
G
N
 
N
V
 
V
A
 
A
M
 
L
P
 
P
L
 
L
L
 
E
L
 
L
A
 
D
K
 
N
T
 
T
P
 
P
K
 
K
A
 
D
D
 
E
I
 
V
E
 
K
K
 
R
Q
 
R
V
 
V
K
 
T
D
 
E
L
 
L
L
 
L
D
 
S
F
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
G
D
 
D
Q
 
K
A
 
H
Q
 
D
K
 
S
Y
 
Y
P
 
P
D
 
S
Q
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
I
 
V
G
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
S
N
 
N
P
 
P
S
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
L
C
 
C
D
 
D
E
 
Q
A
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
A
T
 
T
T
 
T
K
 
R
S
 
S
I
 
I
L
 
L
D
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
K
K
 
D
I
 
I
N
 
N
K
 
R
E
 
R
Y
 
L
N
 
G
I
 
L
T
 
T
I
 
I
L
 
L
L
 
L
I
 
I
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
G
 
D
V
 
V
I
 
V
R
 
K
E
 
R
I
 
I
C
 
C
N
 
D
K
 
C
V
 
V
A
 
A
V
 
V
L
 
I
E
 
S
E
 
N
G
 
G
K
 
E
V
 
L
I
 
I
E
 
E
Q
 
Q
G
 
D
T
 
T
V
 
V
F
 
S
E
 
E
V
 
V
F
 
F
S
 
S
N
 
H
P
 
P
Q
 
K
Q
 
T
A
 
P
T
 
L
T
 
A
K
 
Q
R
 
K
F
 
F
V
 
I
R
 
Q
S
 
S
V
 
T
M
 
L
N
 
H
D
 
L
E
 
D
L
 
I
P
 
P
E
 
E
S
 
D
L
 
Y
L
 
Q
A
 
E
Q
 
R
I
 
L
H
 
Q
-
 
A
E
 
E
P
 
P
H
 
F
S
 
T
D
 
D
H
 
C
T
 
V
-
 
P
I
 
M
F
 
L
R
 
R
L
 
L
Q
 
E
F
 
F
T
 
T
G
 
G
N
 
Q
S
 
S
V
 
V
G
 
D
T
 
A
P
 
P
V
 
L
M
 
L
S
 
S
R
 
E
V
 
T
S
 
A
R
 
R
N
 
R
F
 
F
N
 
N
V
 
V
D
 
N
L
 
N
N
 
N
V
 
I
L
 
I
F
 
S
G
 
A
N
 
Q
I
 
M
T
 
D
E
 
Y
L
 
A
Q
 
G
G
 
G
V
 
V
P
 
K
Y
 
F
G
 
G
N
 
I
L
 
M
I
 
L
V
 
T
E
 
E
F
 
M
S
 
H
G
 
G
E
 
T
L
 
Q
K
 
Q
E
 
D
I
 
T
E
 
Q
R
 
A
A
 
A
I
 
I
T
 
A
S
 
W
I
 
L
R
 
Q
D
 
E
N
 
H
N
 
H
I
 
V
H
 
K
I
 
V
E
 
-
E
 
E
V
 
V
T
 
L
H
 
G
Y
 
Y
V
 
V

6cvlD Crystal structure of the escherichia coli atpgs-bound metni methionine abc transporter in complex with its metq binding protein (see paper)
49% identity, 100% coverage: 1:342/343 of query aligns to 2:344/344 of 6cvlD

query
sites
6cvlD
M
 
M
I
 
I
Q
 
K
F
 
L
E
 
S
G
 
N
V
 
I
A
 
T
K
 
K
T
 
V
Y
x
F
Q
 
H
S
x
Q
G
 
G
K
 
T
Q
 
R
E
 
T
I
|
I
H
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
N
G
 
N
I
 
V
D
 
S
L
 
L
T
 
H
V
 
V
E
 
P
T
 
A
G
 
G
E
 
Q
I
 
I
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
F
 
A
S
|
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
L
I
 
I
R
 
R
T
 
C
V
 
V
N
 
N
L
 
L
L
 
L
E
 
E
R
 
R
P
 
P
S
 
T
K
 
E
G
 
G
R
 
S
V
 
V
L
 
L
I
 
V
H
 
D
G
 
G
K
 
Q
D
 
E
I
 
L
S
 
T
T
 
T
L
 
L
S
 
S
S
 
E
K
 
S
E
 
E
I
 
L
R
 
T
T
 
K
I
 
A
R
 
R
K
 
R
D
 
Q
I
 
I
G
 
G
M
 
M
I
 
I
F
 
F
Q
 
Q
H
 
H
F
 
F
N
 
N
L
 
L
L
 
L
N
 
S
S
 
S
K
 
R
T
 
T
V
 
V
F
 
F
H
 
G
N
 
N
V
 
V
A
 
A
M
 
L
P
 
P
L
 
L
L
 
E
L
 
L
A
 
D
K
 
N
T
 
T
P
 
P
K
 
K
A
 
D
D
 
E
I
 
V
E
 
K
K
 
R
Q
 
R
V
 
V
K
 
T
D
 
E
L
 
L
L
 
L
D
 
S
F
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
G
D
 
D
Q
 
K
A
 
H
Q
 
D
K
 
S
Y
 
Y
P
 
P
D
 
S
Q
x
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
Q
|
Q
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
I
 
V
G
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
S
N
 
N
P
 
P
S
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
L
C
 
C
D
 
D
E
 
Q
A
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
A
T
 
T
T
 
T
K
 
R
S
 
S
I
 
I
L
 
L
D
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
K
K
 
D
I
 
I
N
 
N
K
 
R
E
 
R
Y
 
L
N
 
G
I
 
L
T
 
T
I
 
I
L
 
L
L
 
L
I
 
I
T
 
T
H
|
H
E
 
E
M
 
M
G
 
D
V
 
V
I
 
V
R
 
K
E
 
R
I
 
I
C
 
C
N
 
D
K
 
C
V
 
V
A
 
A
V
 
V
L
 
I
E
 
S
E
 
N
G
 
G
K
 
E
V
 
L
I
 
I
E
 
E
Q
 
Q
G
 
D
T
 
T
V
 
V
F
 
S
E
 
E
V
 
V
F
 
F
S
 
S
N
 
H
P
 
P
Q
 
K
Q
 
T
A
 
P
T
 
L
T
 
A
K
 
Q
R
 
K
F
 
F
V
 
I
R
 
Q
S
 
S
V
 
T
M
 
L
N
 
H
D
 
L
E
 
D
L
 
I
P
 
P
E
 
E
S
 
D
L
 
Y
L
 
Q
A
 
E
Q
 
R
I
 
L
H
 
Q
-
 
A
E
 
E
P
 
P
H
 
F
S
 
T
D
 
D
H
 
C
T
 
V
-
 
P
I
 
M
F
 
L
R
 
R
L
 
L
Q
 
E
F
 
F
T
 
T
G
 
G
N
 
Q
S
 
S
V
 
V
G
 
D
T
 
A
P
 
P
V
 
L
M
 
L
S
 
S
R
 
E
V
 
T
S
 
A
R
 
R
N
 
R
F
 
F
N
 
N
V
 
V
D
 
N
L
 
N
N
 
A
V
 
I
L
 
I
F
 
S
G
 
A
N
 
Q
I
 
M
T
 
D
E
 
Y
L
 
A
Q
 
G
G
 
G
V
 
V
P
 
K
Y
 
F
G
 
G
N
 
I
L
 
M
I
 
L
V
 
T
E
 
E
F
 
M
S
 
H
G
 
G
E
 
T
L
 
Q
K
 
Q
E
 
D
I
 
T
E
 
Q
R
 
A
A
 
A
I
 
I
T
 
A
S
 
W
I
 
L
R
 
Q
D
 
E
N
 
H
N
 
H
I
 
V
H
 
K
I
 
V
E
 
-
E
 
E
V
 
V
T
 
L
H
 
G
Y
 
Y
V
 
V

4u00A Crystal structure of ttha1159 in complex with adp (see paper)
43% identity, 67% coverage: 18:246/343 of query aligns to 15:241/241 of 4u00A

query
sites
4u00A
I
 
L
H
 
H
A
x
V
L
 
L
N
 
K
G
 
G
I
 
I
D
 
H
L
 
L
T
 
E
V
 
V
E
 
A
T
 
P
G
 
G
E
 
E
I
 
K
Y
 
L
G
 
V
V
 
I
I
 
I
G
 
G
F
 
P
S
|
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
L
I
 
I
R
 
R
T
 
T
V
 
I
N
 
N
L
 
R
L
 
L
E
 
E
R
 
D
P
 
F
S
 
Q
K
 
E
G
 
G
R
 
E
V
 
V
L
 
V
I
 
V
H
 
D
G
 
G
K
 
-
D
 
-
I
 
L
S
 
S
T
 
V
L
 
K
S
 
D
S
 
D
K
 
R
E
 
A
I
 
L
R
 
R
T
 
E
I
 
I
R
 
R
K
 
R
D
 
E
I
 
V
G
 
G
M
 
M
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
Q
F
 
F
N
 
N
L
 
L
L
 
F
N
 
P
S
 
H
K
 
M
T
 
T
V
 
V
F
 
L
H
 
E
N
 
N
V
 
V
A
 
T
M
 
L
-
 
A
P
 
P
L
 
M
L
 
R
L
 
V
A
 
R
K
 
R
T
 
W
P
 
P
K
 
R
A
 
E
D
 
K
I
 
A
E
 
E
K
 
K
Q
 
K
V
 
A
K
 
L
D
 
E
L
 
L
L
 
L
D
 
E
F
 
R
V
 
V
G
 
G
L
 
I
A
 
L
D
 
D
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
R
K
 
K
Y
 
Y
P
 
P
D
 
A
Q
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
I
 
V
G
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
M
N
 
E
P
 
P
S
 
K
V
 
I
L
 
M
L
 
L
C
 
F
D
 
D
E
 
E
A
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
E
T
 
M
T
 
V
K
 
G
S
 
E
I
 
V
L
 
L
D
 
D
L
 
V
L
 
M
K
 
R
K
 
D
I
 
L
N
 
-
K
 
A
E
 
Q
Y
 
G
N
 
G
I
 
M
T
 
T
I
 
M
L
 
V
L
 
V
I
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
G
 
G
V
 
F
I
 
A
R
 
R
E
 
E
I
 
V
C
 
A
N
 
D
K
 
R
V
 
V
A
 
V
V
 
F
L
 
M
E
 
D
E
 
G
G
 
G
K
 
Q
V
 
I
I
 
V
E
 
E
Q
 
E
G
 
G
T
 
R
V
 
P
F
 
E
E
 
E
V
 
I
F
 
F
S
 
T
N
 
R
P
 
P
Q
 
K
Q
 
E
A
 
E
T
 
R
T
 
T
K
 
R
R
 
S
F
 
F
V
 
L
R
 
Q
S
 
R
V
 
V
M
 
L
N
 
H

Sites not aligning to the query:

4ymuJ Crystal structure of an amino acid abc transporter complex with arginines and atps (see paper)
41% identity, 71% coverage: 1:245/343 of query aligns to 1:240/240 of 4ymuJ

query
sites
4ymuJ
M
 
M
I
 
I
Q
 
F
F
 
V
E
 
N
G
 
D
V
 
V
A
 
Y
K
 
K
T
 
N
Y
x
F
Q
 
G
S
 
S
G
 
-
K
 
-
Q
 
-
E
 
-
I
 
L
H
 
E
A
x
V
L
 
L
N
 
K
G
 
G
I
 
V
D
 
T
L
 
L
T
 
K
V
 
V
E
 
N
T
 
K
G
 
G
E
 
E
I
 
V
Y
 
V
G
 
V
V
 
I
I
 
I
G
 
G
F
 
P
S
|
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
L
I
 
L
R
 
R
T
 
C
V
 
I
N
 
N
L
 
L
L
 
L
E
 
E
R
 
E
P
 
P
S
 
T
K
 
K
G
 
G
R
 
E
V
 
V
L
 
F
I
 
I
H
 
D
G
 
G
K
 
V
D
 
K
I
 
I
S
 
N
T
 
N
L
 
-
S
 
G
S
 
K
K
 
V
E
 
N
I
 
I
R
 
N
T
 
K
I
 
V
R
 
R
K
 
Q
D
 
K
I
 
V
G
 
G
M
 
M
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
H
F
 
F
N
 
N
L
 
L
L
 
F
N
 
P
S
 
H
K
 
L
T
 
T
V
 
A
F
 
I
H
 
E
N
 
N
V
 
I
A
 
T
M
 
L
-
 
A
P
 
P
L
 
V
L
 
K
L
 
V
A
 
K
K
 
K
T
 
M
P
 
N
K
 
K
A
 
K
D
 
E
I
 
A
E
 
E
K
 
E
Q
 
L
V
 
A
K
 
V
D
 
D
L
 
L
L
 
L
D
 
A
F
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
L
D
 
D
Q
 
K
A
 
K
Q
 
D
K
 
Q
Y
 
Y
P
 
P
D
 
I
Q
 
K
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
I
 
L
G
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
M
N
 
Q
P
 
P
S
 
E
V
 
V
L
 
M
L
 
L
C
 
F
D
 
D
E
|
E
A
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
E
T
 
M
T
 
V
K
 
K
S
 
E
I
 
V
L
 
L
D
 
N
L
 
V
L
 
M
K
 
K
K
 
Q
I
 
L
N
 
A
K
 
N
E
 
E
Y
 
-
N
 
G
I
 
M
T
 
T
I
 
M
L
 
V
L
 
V
I
 
V
T
 
T
H
|
H
E
 
E
M
 
M
G
 
G
V
 
F
I
 
A
R
 
R
E
 
E
I
 
V
C
 
G
N
 
D
K
 
R
V
 
V
A
 
I
V
 
F
L
 
M
E
 
D
E
 
D
G
 
G
K
 
V
V
 
I
I
 
V
E
 
E
Q
 
E
G
 
G
T
 
T
V
 
P
F
 
E
E
 
E
V
 
I
F
 
F
S
 
Y
N
 
R
P
 
A
Q
 
K
Q
 
N
A
 
E
T
 
R
T
 
T
K
 
R
R
 
E
F
 
F
V
 
L
R
 
S
S
 
K
V
 
I
M
 
L

3c4jA Abc protein artp in complex with atp-gamma-s
40% identity, 71% coverage: 1:244/343 of query aligns to 3:241/242 of 3c4jA

query
sites
3c4jA
M
 
M
I
 
I
Q
 
D
F
 
V
E
 
H
G
 
Q
V
 
L
A
 
K
K
 
K
T
 
S
Y
x
F
Q
 
G
S
 
S
G
 
-
K
 
-
Q
 
-
E
 
-
I
 
L
H
 
E
A
x
V
L
 
L
N
 
K
G
 
G
I
 
I
D
 
N
L
 
V
T
 
H
V
 
I
E
 
R
T
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
V
Y
 
V
G
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
F
 
P
S
|
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
F
I
 
L
R
 
R
T
 
C
V
 
L
N
 
N
L
 
L
L
 
L
E
 
E
R
 
D
P
 
F
S
 
D
K
 
E
G
 
G
R
 
E
V
 
I
L
 
I
I
 
I
H
 
D
G
 
G
K
 
I
D
 
N
I
 
L
S
 
K
T
 
A
L
 
K
S
 
D
S
 
T
K
 
N
E
 
-
I
 
L
R
 
N
T
 
K
I
 
V
R
 
R
K
 
E
D
 
E
I
 
V
G
 
G
M
 
M
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
R
F
 
F
N
 
N
L
 
L
L
 
F
N
 
P
S
 
H
K
 
M
T
 
T
V
 
V
F
 
L
H
 
N
N
 
N
V
 
I
A
 
T
M
 
L
-
 
A
P
 
P
L
 
M
L
 
K
L
 
V
A
 
R
K
 
K
T
 
W
P
 
P
K
 
R
A
 
E
D
 
K
I
 
A
E
 
E
K
 
A
Q
 
K
V
 
A
K
 
M
D
 
E
L
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
K
D
 
D
Q
 
K
A
 
A
Q
 
H
K
 
A
Y
 
Y
P
 
P
D
 
D
Q
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
A
Q
 
Q
R
 
R
I
 
V
G
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
M
N
 
E
P
 
P
S
 
K
V
 
I
L
 
M
L
 
L
C
 
F
D
 
D
E
 
E
A
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
E
T
 
M
T
 
V
K
 
G
S
 
E
I
 
V
L
 
L
D
 
S
L
 
V
L
 
M
K
 
K
K
 
Q
I
 
L
N
 
A
K
 
N
E
 
E
Y
 
-
N
 
G
I
 
M
T
 
T
I
 
M
L
 
V
L
 
V
I
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
G
 
G
V
 
F
I
 
A
R
 
R
E
 
E
I
 
V
C
 
G
N
 
D
K
 
R
V
 
V
A
 
L
V
 
F
L
 
M
E
 
D
E
 
G
G
 
G
K
 
Y
V
 
I
I
 
I
E
 
E
Q
 
E
G
 
G
T
 
K
V
 
P
F
 
E
E
 
D
V
 
L
F
 
F
S
 
D
N
 
R
P
 
P
Q
 
Q
Q
 
H
A
 
E
T
 
R
T
 
T
K
 
K
R
 
A
F
 
F
V
 
L
R
 
S
S
 
K
V
 
V

3c41J Abc protein artp in complex with amp-pnp/mg2+
40% identity, 71% coverage: 1:244/343 of query aligns to 3:241/242 of 3c41J

query
sites
3c41J
M
 
M
I
 
I
Q
 
D
F
 
V
E
 
H
G
 
Q
V
 
L
A
 
K
K
 
K
T
 
S
Y
x
F
Q
 
G
S
 
S
G
 
-
K
 
-
Q
 
-
E
 
-
I
 
L
H
 
E
A
x
V
L
 
L
N
 
K
G
 
G
I
 
I
D
 
N
L
 
V
T
 
H
V
 
I
E
 
R
T
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
V
Y
 
V
G
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
F
 
P
S
|
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
F
I
 
L
R
 
R
T
 
C
V
 
L
N
 
N
L
 
L
L
 
L
E
 
E
R
 
D
P
 
F
S
 
D
K
 
E
G
 
G
R
 
E
V
 
I
L
 
I
I
 
I
H
 
D
G
 
G
K
 
I
D
 
N
I
 
L
S
 
K
T
 
A
L
 
K
S
 
D
S
 
T
K
 
N
E
 
-
I
 
L
R
 
N
T
 
K
I
 
V
R
 
R
K
 
E
D
 
E
I
 
V
G
 
G
M
 
M
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
R
F
 
F
N
 
N
L
 
L
L
 
F
N
 
P
S
 
H
K
 
M
T
 
T
V
 
V
F
 
L
H
 
N
N
 
N
V
 
I
A
 
T
M
 
L
-
 
A
P
 
P
L
 
M
L
 
K
L
 
V
A
 
R
K
 
K
T
 
W
P
 
P
K
 
R
A
 
E
D
 
K
I
 
A
E
 
E
K
 
A
Q
 
K
V
 
A
K
 
M
D
 
E
L
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
K
D
 
D
Q
 
K
A
 
A
Q
 
H
K
 
A
Y
 
Y
P
 
P
D
 
D
Q
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
A
Q
 
Q
R
 
R
I
 
V
G
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
M
N
 
E
P
 
P
S
 
K
V
 
I
L
 
M
L
 
L
C
 
F
D
|
D
E
 
E
A
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
E
T
 
M
T
 
V
K
 
G
S
 
E
I
 
V
L
 
L
D
 
S
L
 
V
L
 
M
K
 
K
K
 
Q
I
 
L
N
 
A
K
 
N
E
 
E
Y
 
-
N
 
G
I
 
M
T
 
T
I
 
M
L
 
V
L
 
V
I
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
G
 
G
V
 
F
I
 
A
R
 
R
E
 
E
I
 
V
C
 
G
N
 
D
K
 
R
V
 
V
A
 
L
V
 
F
L
 
M
E
 
D
E
 
G
G
 
G
K
 
Y
V
 
I
I
 
I
E
 
E
Q
 
E
G
 
G
T
 
K
V
 
P
F
 
E
E
 
D
V
 
L
F
 
F
S
 
D
N
 
R
P
 
P
Q
 
Q
Q
 
H
A
 
E
T
 
R
T
 
T
K
 
K
R
 
A
F
 
F
V
 
L
R
 
S
S
 
K
V
 
V

2olkA Abc protein artp in complex with adp-beta-s
40% identity, 71% coverage: 1:244/343 of query aligns to 3:241/242 of 2olkA

query
sites
2olkA
M
 
M
I
 
I
Q
 
D
F
 
V
E
 
H
G
 
Q
V
 
L
A
 
K
K
 
K
T
 
S
Y
x
F
Q
 
G
S
 
S
G
 
-
K
 
-
Q
 
-
E
 
-
I
 
L
H
 
E
A
x
V
L
 
L
N
 
K
G
 
G
I
 
I
D
 
N
L
 
V
T
 
H
V
 
I
E
 
R
T
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
V
Y
 
V
G
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
F
 
P
S
|
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
F
I
 
L
R
 
R
T
 
C
V
 
L
N
 
N
L
 
L
L
 
L
E
 
E
R
 
D
P
 
F
S
 
D
K
 
E
G
 
G
R
 
E
V
 
I
L
 
I
I
 
I
H
 
D
G
 
G
K
 
I
D
 
N
I
 
L
S
 
K
T
 
A
L
 
K
S
 
D
S
 
T
K
 
N
E
 
-
I
 
L
R
 
N
T
 
K
I
 
V
R
 
R
K
 
E
D
 
E
I
 
V
G
 
G
M
 
M
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
R
F
 
F
N
 
N
L
 
L
L
 
F
N
 
P
S
 
H
K
 
M
T
 
T
V
 
V
F
 
L
H
 
N
N
 
N
V
 
I
A
 
T
M
 
L
-
 
A
P
 
P
L
 
M
L
 
K
L
 
V
A
 
R
K
 
K
T
 
W
P
 
P
K
 
R
A
 
E
D
 
K
I
 
A
E
 
E
K
 
A
Q
 
K
V
 
A
K
 
M
D
 
E
L
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
K
D
 
D
Q
 
K
A
 
A
Q
 
H
K
 
A
Y
 
Y
P
 
P
D
 
D
Q
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
A
Q
 
Q
R
 
R
I
 
V
G
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
M
N
 
E
P
 
P
S
 
K
V
 
I
L
 
M
L
 
L
C
 
F
D
 
D
E
 
E
A
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
E
T
 
M
T
 
V
K
 
G
S
 
E
I
 
V
L
 
L
D
 
S
L
 
V
L
 
M
K
 
K
K
 
Q
I
 
L
N
 
A
K
 
N
E
 
E
Y
 
-
N
 
G
I
 
M
T
 
T
I
 
M
L
 
V
L
 
V
I
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
G
 
G
V
 
F
I
 
A
R
 
R
E
 
E
I
 
V
C
 
G
N
 
D
K
 
R
V
 
V
A
 
L
V
 
F
L
 
M
E
 
D
E
 
G
G
 
G
K
 
Y
V
 
I
I
 
I
E
 
E
Q
 
E
G
 
G
T
 
K
V
 
P
F
 
E
E
 
D
V
 
L
F
 
F
S
 
D
N
 
R
P
 
P
Q
 
Q
Q
 
H
A
 
E
T
 
R
T
 
T
K
 
K
R
 
A
F
 
F
V
 
L
R
 
S
S
 
K
V
 
V

2oljA Abc protein artp in complex with adp/mg2+
40% identity, 71% coverage: 1:244/343 of query aligns to 3:241/242 of 2oljA

query
sites
2oljA
M
 
M
I
 
I
Q
 
D
F
 
V
E
 
H
G
 
Q
V
 
L
A
 
K
K
 
K
T
 
S
Y
x
F
Q
 
G
S
 
S
G
 
-
K
 
-
Q
 
-
E
 
-
I
 
L
H
 
E
A
x
V
L
 
L
N
 
K
G
 
G
I
 
I
D
 
N
L
 
V
T
 
H
V
 
I
E
 
R
T
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
V
Y
 
V
G
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
F
 
P
S
|
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
F
I
 
L
R
 
R
T
 
C
V
 
L
N
 
N
L
 
L
L
 
L
E
 
E
R
 
D
P
 
F
S
 
D
K
 
E
G
 
G
R
 
E
V
 
I
L
 
I
I
 
I
H
 
D
G
 
G
K
 
I
D
 
N
I
 
L
S
 
K
T
 
A
L
 
K
S
 
D
S
 
T
K
 
N
E
 
-
I
 
L
R
 
N
T
 
K
I
 
V
R
 
R
K
 
E
D
 
E
I
 
V
G
 
G
M
 
M
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
R
F
 
F
N
 
N
L
 
L
L
 
F
N
 
P
S
 
H
K
 
M
T
 
T
V
 
V
F
 
L
H
 
N
N
 
N
V
 
I
A
 
T
M
 
L
-
 
A
P
 
P
L
 
M
L
 
K
L
 
V
A
 
R
K
 
K
T
 
W
P
 
P
K
 
R
A
 
E
D
 
K
I
 
A
E
 
E
K
 
A
Q
 
K
V
 
A
K
 
M
D
 
E
L
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
K
D
 
D
Q
 
K
A
 
A
Q
 
H
K
 
A
Y
 
Y
P
 
P
D
 
D
Q
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
A
Q
 
Q
R
 
R
I
 
V
G
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
M
N
 
E
P
 
P
S
 
K
V
 
I
L
 
M
L
 
L
C
 
F
D
 
D
E
 
E
A
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
E
T
 
M
T
 
V
K
 
G
S
 
E
I
 
V
L
 
L
D
 
S
L
 
V
L
 
M
K
 
K
K
 
Q
I
 
L
N
 
A
K
 
N
E
 
E
Y
 
-
N
 
G
I
 
M
T
 
T
I
 
M
L
 
V
L
 
V
I
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
G
 
G
V
 
F
I
 
A
R
 
R
E
 
E
I
 
V
C
 
G
N
 
D
K
 
R
V
 
V
A
 
L
V
 
F
L
 
M
E
 
D
E
 
G
G
 
G
K
 
Y
V
 
I
I
 
I
E
 
E
Q
 
E
G
 
G
T
 
K
V
 
P
F
 
E
E
 
D
V
 
L
F
 
F
S
 
D
N
 
R
P
 
P
Q
 
Q
Q
 
H
A
 
E
T
 
R
T
 
T
K
 
K
R
 
A
F
 
F
V
 
L
R
 
S
S
 
K
V
 
V

8w6iD Cryo-em structure of escherichia coli str k12 ftsex complex with atp- gamma-s in peptidisc
42% identity, 64% coverage: 1:219/343 of query aligns to 1:215/219 of 8w6iD

query
sites
8w6iD
M
 
M
I
 
I
Q
 
R
F
 
F
E
 
E
G
 
H
V
 
V
A
 
S
K
 
K
T
 
A
Y
|
Y
Q
 
L
S
 
G
G
 
G
K
 
R
Q
 
Q
E
 
-
I
 
-
H
 
-
A
 
A
L
 
L
N
 
Q
G
 
G
I
 
V
D
 
T
L
 
F
T
 
H
V
 
M
E
 
Q
T
 
P
G
 
G
E
 
E
I
 
M
Y
 
A
G
 
F
V
 
L
I
 
T
G
 
G
F
 
H
S
|
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
L
I
 
L
R
 
K
T
 
L
V
 
I
N
 
C
L
 
G
L
 
I
E
 
E
R
 
R
P
 
P
S
 
S
K
 
A
G
 
G
R
 
K
V
 
I
L
 
W
I
 
F
H
 
S
G
 
G
K
 
H
D
 
D
I
 
I
S
 
T
T
 
R
L
 
L
S
 
K
S
 
N
K
 
R
E
 
E
I
 
V
R
 
P
T
 
F
I
 
L
R
 
R
K
 
R
D
 
Q
I
 
I
G
 
G
M
 
M
I
 
I
F
 
F
Q
|
Q
H
 
D
F
 
H
N
 
H
L
 
L
L
 
L
N
 
M
S
 
D
K
 
R
T
 
T
V
 
V
F
 
Y
H
 
D
N
 
N
V
 
V
A
 
A
M
 
I
P
 
P
L
 
L
L
 
I
L
 
I
A
 
A
K
 
G
T
 
A
P
 
S
K
 
G
A
 
D
D
 
D
I
 
I
E
 
R
K
 
R
Q
 
R
V
 
V
K
 
S
D
 
A
L
 
A
L
 
L
D
 
D
F
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
L
D
 
D
Q
x
K
A
 
A
Q
 
K
K
 
N
Y
 
F
P
 
P
D
 
I
Q
|
Q
L
 
L
S
|
S
G
|
G
G
|
G
Q
x
E
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
I
 
V
G
 
G
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
V
A
 
V
T
 
N
N
 
K
P
 
P
S
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
L
C
 
A
D
 
D
E
 
E
A
 
P
T
 
T
S
 
G
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
D
Q
 
A
T
 
L
T
 
S
K
 
E
S
 
G
I
 
I
L
 
L
D
 
R
L
 
L
L
 
F
K
 
E
K
 
E
I
 
F
N
 
N
K
 
R
E
 
-
Y
 
V
N
 
G
I
 
V
T
 
T
I
 
V
L
 
L
L
 
M
I
 
A
T
 
T
H
|
H
E
 
D
M
 
I
G
 
N
V
 
L
I
 
I
R
 
S
E
 
R
I
 
R
C
 
S
N
 
Y
K
 
R
V
 
M
A
 
L
V
 
T
L
 
L
E
 
S
E
 
D
G
 
G
K
 
H
V
 
L

P0A9R7 Cell division ATP-binding protein FtsE from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
42% identity, 64% coverage: 1:219/343 of query aligns to 1:215/222 of P0A9R7

query
sites
P0A9R7
M
 
M
I
 
I
Q
 
R
F
 
F
E
 
E
G
 
H
V
 
V
A
 
S
K
 
K
T
 
A
Y
 
Y
Q
 
L
S
 
G
G
 
G
K
 
R
Q
 
Q
E
 
-
I
 
-
H
 
-
A
 
A
L
 
L
N
 
Q
G
 
G
I
 
V
D
 
T
L
 
F
T
 
H
V
 
M
E
 
Q
T
 
P
G
 
G
E
 
E
I
 
M
Y
 
A
G
 
F
V
 
L
I
 
T
G
 
G
F
 
H
S
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
|
K
S
 
S
S
 
T
L
 
L
I
 
L
R
 
K
T
 
L
V
 
I
N
x
C
L
 
G
L
 
I
E
 
E
R
 
R
P
 
P
S
 
S
K
 
A
G
 
G
R
 
K
V
 
I
L
 
W
I
 
F
H
 
S
G
 
G
K
 
H
D
 
D
I
 
I
S
 
T
T
 
R
L
 
L
S
 
K
S
 
N
K
 
R
E
 
E
I
 
V
R
 
P
T
 
F
I
 
L
R
 
R
K
 
R
D
 
Q
I
 
I
G
 
G
M
 
M
I
 
I
F
 
F
Q
 
Q
H
 
D
F
 
H
N
 
H
L
 
L
L
 
L
N
 
M
S
 
D
K
 
R
T
 
T
V
 
V
F
 
Y
H
 
D
N
 
N
V
 
V
A
 
A
M
 
I
P
 
P
L
 
L
L
 
I
L
 
I
A
 
A
K
 
G
T
 
A
P
 
S
K
 
G
A
 
D
D
 
D
I
 
I
E
 
R
K
 
R
Q
 
R
V
 
V
K
 
S
D
 
A
L
 
A
L
 
L
D
 
D
F
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
L
D
 
D
Q
 
K
A
 
A
Q
 
K
K
 
N
Y
 
F
P
 
P
D
 
I
Q
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
I
 
V
G
 
G
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
V
A
 
V
T
 
N
N
 
K
P
 
P
S
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
L
C
 
A
D
 
D
E
 
E
A
 
P
T
 
T
S
 
G
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
D
Q
 
A
T
 
L
T
 
S
K
 
E
S
 
G
I
 
I
L
 
L
D
 
R
L
 
L
L
 
F
K
 
E
K
 
E
I
 
F
N
 
N
K
 
R
E
 
-
Y
 
V
N
 
G
I
 
V
T
 
T
I
 
V
L
 
L
L
 
M
I
 
A
T
 
T
H
 
H
E
 
D
M
 
I
G
 
N
V
 
L
I
 
I
R
 
S
E
 
R
I
 
R
C
 
S
N
 
Y
K
 
R
V
 
M
A
 
L
V
 
T
L
 
L
E
 
S
E
 
D
G
 
G
K
 
H
V
 
L

8hd0A Cell divisome spg hydrolysis machinery ftsex-envc
42% identity, 64% coverage: 1:219/343 of query aligns to 1:215/218 of 8hd0A

query
sites
8hd0A
M
 
M
I
 
I
Q
 
R
F
 
F
E
 
E
G
 
H
V
 
V
A
 
S
K
 
K
T
 
A
Y
|
Y
Q
 
L
S
 
G
G
 
G
K
x
R
Q
 
Q
E
 
-
I
 
-
H
 
-
A
|
A
L
 
L
N
 
Q
G
 
G
I
 
V
D
 
T
L
 
F
T
 
H
V
 
M
E
 
Q
T
 
P
G
 
G
E
 
E
I
 
M
Y
 
A
G
 
F
V
 
L
I
 
T
G
 
G
F
 
H
S
 
S
G
 
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
L
I
 
L
R
 
K
T
 
L
V
 
I
N
 
C
L
 
G
L
 
I
E
 
E
R
 
R
P
 
P
S
 
S
K
 
A
G
 
G
R
 
K
V
 
I
L
 
W
I
 
F
H
 
S
G
 
G
K
 
H
D
 
D
I
 
I
S
 
T
T
 
R
L
 
L
S
 
K
S
 
N
K
 
R
E
 
E
I
 
V
R
 
P
T
 
F
I
 
L
R
 
R
K
 
R
D
 
Q
I
 
I
G
 
G
M
 
M
I
 
I
F
 
F
Q
 
Q
H
 
D
F
 
H
N
 
H
L
 
L
L
 
L
N
 
M
S
 
D
K
 
R
T
 
T
V
 
V
F
 
Y
H
 
D
N
 
N
V
 
V
A
 
A
M
 
I
P
 
P
L
 
L
L
 
I
L
 
I
A
 
A
K
 
G
T
 
A
P
 
S
K
 
G
A
 
D
D
 
D
I
 
I
E
 
R
K
 
R
Q
 
R
V
 
V
K
 
S
D
 
A
L
 
A
L
 
L
D
 
D
F
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
L
D
 
D
Q
 
K
A
 
A
Q
 
K
K
 
N
Y
 
F
P
 
P
D
 
I
Q
 
Q
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
Q
 
E
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
I
 
V
G
 
G
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
V
A
 
V
T
 
N
N
 
K
P
 
P
S
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
L
C
 
A
D
 
D
E
 
Q
A
 
P
T
 
T
S
 
G
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
D
Q
 
A
T
 
L
T
 
S
K
 
E
S
 
G
I
 
I
L
 
L
D
 
R
L
 
L
L
 
F
K
 
E
K
 
E
I
 
F
N
 
N
K
 
R
E
 
-
Y
 
V
N
 
G
I
 
V
T
 
T
I
 
V
L
 
L
L
 
M
I
 
A
T
 
T
H
 
H
E
 
D
M
 
I
G
 
N
V
 
L
I
 
I
R
 
S
E
 
R
I
 
R
C
 
S
N
 
Y
K
 
R
V
 
M
A
 
L
V
 
T
L
 
L
E
 
S
E
 
D
G
 
G
K
 
H
V
 
L

8j5qD Cryo-em structure of mycobacterium tuberculosis oppabcd in the pre- translocation state (see paper)
36% identity, 71% coverage: 1:244/343 of query aligns to 348:602/611 of 8j5qD

query
sites
8j5qD
M
 
V
I
 
V
Q
 
R
F
 
V
E
 
R
G
 
H
V
 
L
A
 
V
K
 
K
T
 
T
Y
 
Y
Q
 
R
S
 
L
G
 
A
K
 
K
Q
 
G
-
 
V
-
 
V
-
 
L
-
 
R
-
 
R
-
 
A
-
 
I
-
 
G
E
 
E
I
 
V
H
 
R
A
 
A
L
 
V
N
 
D
G
 
G
I
 
I
D
 
S
L
 
L
T
 
E
V
 
L
E
 
R
T
 
Q
G
 
G
E
 
R
I
 
T
Y
 
L
G
 
G
V
 
I
I
 
V
G
 
G
F
 
E
S
 
S
G
 
G
A
 
S
G
 
G
K
 
K
S
 
S
S
 
T
L
 
T
I
 
L
R
 
H
T
 
E
V
 
I
N
 
L
L
 
E
L
 
L
E
 
A
R
 
A
P
 
P
S
 
Q
K
 
S
G
 
G
R
 
S
V
 
I
L
 
E
I
 
V
H
 
L
G
 
G
K
 
T
D
 
D
I
 
V
S
 
A
T
 
T
L
 
L
S
 
G
S
 
T
K
 
A
E
 
E
I
 
R
R
 
R
T
 
S
I
 
L
R
 
R
K
 
R
D
 
D
I
 
I
G
 
Q
M
 
V
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
D
-
 
P
-
 
V
F
 
A
N
 
S
L
 
L
L
 
D
N
 
P
S
 
R
K
 
L
T
 
P
V
 
V
F
 
F
H
 
D
N
 
L
V
 
I
A
 
A
M
 
E
P
 
P
L
 
L
L
 
Q
L
 
A
A
 
N
K
 
G
T
 
F
P
 
G
K
 
K
A
 
N
D
 
E
I
 
T
E
 
H
K
 
A
Q
 
R
V
 
V
K
 
A
D
 
E
L
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
I
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
R
-
 
H
D
 
G
Q
 
D
A
 
A
Q
 
S
K
 
R
Y
 
Y
P
 
P
D
 
A
Q
 
E
L
 
F
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
I
 
I
G
 
G
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
L
N
 
Q
P
 
P
S
 
K
V
 
I
L
 
L
L
 
A
C
 
L
D
 
D
E
 
E
A
 
P
T
 
V
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
V
Q
 
S
T
 
I
T
 
Q
K
 
A
S
 
G
I
 
I
L
 
I
D
 
N
L
 
L
L
 
L
K
 
L
K
 
D
I
 
L
N
 
Q
K
 
E
E
 
Q
Y
 
F
N
 
G
I
 
L
T
 
S
I
 
Y
L
 
L
L
 
F
I
 
V
T
 
S
H
 
H
E
 
D
M
 
L
G
 
S
V
 
V
I
 
V
R
 
K
E
 
H
I
 
L
C
 
A
N
 
H
K
 
Q
V
 
V
A
 
A
V
 
V
L
 
M
E
 
L
E
 
A
G
 
G
K
 
T
V
 
V
I
 
V
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
T
 
D
V
 
S
F
 
E
E
 
E
V
 
V
F
 
F
S
 
G
N
 
N
P
 
P
Q
 
K
Q
 
H
A
 
E
T
 
Y
T
 
T
K
 
R
R
 
R
F
 
L
V
 
L
R
 
G
S
 
A
V
 
V

Sites not aligning to the query:

8i6rB Cryo-em structure of pseudomonas aeruginosa ftse(e163q)x/envc complex with atp in peptidisc (see paper)
37% identity, 64% coverage: 1:220/343 of query aligns to 1:216/222 of 8i6rB

query
sites
8i6rB
M
 
M
I
 
I
Q
 
R
F
 
F
E
 
E
G
 
Q
V
 
V
A
 
G
K
 
K
T
 
R
Y
|
Y
Q
 
P
S
 
N
G
 
G
K
x
H
Q
 
V
E
 
G
I
 
L
H
 
H
A
 
E
L
 
-
N
 
-
G
 
-
I
 
V
D
 
S
L
 
F
T
 
R
V
 
V
E
 
H
T
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
I
Y
 
L
G
 
F
V
 
V
I
 
T
G
 
G
F
 
H
S
|
S
G
 
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
L
I
 
L
R
 
R
T
 
L
V
 
I
N
 
L
L
 
A
L
 
M
E
 
E
R
 
R
P
 
P
S
 
T
K
 
S
G
 
G
R
 
K
V
 
L
L
 
L
I
 
L
H
 
G
G
 
G
K
 
Q
D
 
D
I
 
L
S
 
G
T
 
R
L
 
I
S
 
T
S
 
T
K
 
A
E
 
Q
I
 
I
R
 
P
T
 
F
I
 
L
R
 
R
K
 
R
D
 
Q
I
 
I
G
 
G
M
 
V
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
N
F
 
H
N
 
Q
L
 
L
L
 
L
N
 
T
S
 
D
K
 
R
T
 
T
V
 
V
F
 
A
H
 
D
N
 
N
V
 
I
A
 
A
M
 
L
P
 
P
L
 
L
L
 
Q
L
 
I
A
 
L
K
 
G
T
 
M
P
 
P
K
 
K
A
 
P
D
 
E
I
 
I
E
 
A
K
 
K
Q
 
R
V
 
V
K
 
A
D
 
S
L
 
A
L
 
L
D
 
E
F
 
R
V
 
V
G
 
N
L
 
L
A
 
K
D
 
E
Q
 
K
A
 
G
Q
 
E
K
 
A
Y
 
L
P
 
P
D
 
S
Q
x
D
L
 
L
S
|
S
G
x
T
G
|
G
Q
|
Q
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
I
 
V
G
 
G
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
V
T
 
H
N
 
Q
P
 
P
S
 
A
V
 
L
L
 
L
L
 
L
C
 
A
D
 
D
E
 
Q
A
 
P
T
 
T
S
 
G
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
R
T
 
L
T
 
A
K
 
S
S
 
E
I
 
I
L
 
M
D
 
G
L
 
V
L
 
F
K
 
E
K
 
D
I
 
I
N
 
N
K
 
R
E
 
-
Y
 
L
N
 
G
I
 
T
T
 
T
I
 
V
L
 
L
L
 
I
I
 
A
T
 
S
H
 
H
E
 
D
M
 
L
G
 
A
V
 
L
I
 
I
R
 
A
E
 
R
I
 
M
C
 
R
N
 
H
K
 
R
V
 
M
A
 
L
V
 
T
L
 
L
E
 
Q
E
 
R
G
 
G
K
 
R
V
 
I
I
 
I

7ahhC Opua inhibited inward-facing, sbd docked (see paper)
37% identity, 62% coverage: 28:241/343 of query aligns to 49:263/382 of 7ahhC

query
sites
7ahhC
V
 
I
E
 
N
T
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
I
Y
 
F
G
 
V
V
 
I
I
 
M
G
 
G
F
 
L
S
 
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
 
S
S
 
T
L
 
L
I
 
L
R
 
R
T
 
L
V
 
L
N
 
N
L
 
R
L
 
L
E
 
I
R
 
E
P
 
P
S
 
T
K
 
S
G
 
G
R
 
K
V
 
I
L
 
F
I
 
I
H
 
D
G
 
N
K
 
Q
D
 
D
I
 
V
S
 
A
T
 
T
L
 
L
S
 
N
S
 
K
K
 
E
E
 
D
I
 
L
R
 
L
T
 
Q
I
 
V
R
 
R
-
 
R
K
 
K
D
 
T
I
 
M
G
 
S
M
 
M
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
N
F
 
F
N
 
G
L
 
L
L
 
F
N
 
P
S
 
H
K
 
R
T
 
T
V
 
I
F
 
L
H
 
E
N
 
N
V
 
T
A
 
E
M
 
Y
P
 
G
L
 
L
L
 
E
L
 
V
A
 
Q
K
 
N
T
 
V
P
 
P
K
 
K
A
 
E
D
 
E
I
 
R
E
 
R
K
 
K
Q
 
R
V
 
A
K
 
E
D
 
K
L
 
A
L
 
L
D
 
D
F
 
N
V
 
A
G
 
N
L
 
L
A
 
L
D
 
D
Q
 
F
A
 
K
Q
 
D
K
 
Q
Y
 
Y
P
 
P
D
 
K
Q
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
I
 
V
G
 
G
I
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
N
N
 
D
P
 
P
S
 
E
V
 
I
L
 
L
L
 
L
C
 
M
D
|
D
E
|
E
A
 
A
T
 
F
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
L
T
 
I
T
 
R
K
 
R
S
 
E
I
 
M
L
 
Q
D
 
D
L
 
E
L
 
L
K
 
L
K
 
E
I
 
L
N
 
Q
K
 
A
E
 
K
Y
 
F
N
 
Q
I
 
K
T
 
T
I
 
I
L
 
I
L
 
F
I
 
V
T
 
S
H
 
H
E
 
D
M
 
L
G
 
N
V
 
E
I
 
A
R
 
L
E
 
R
I
 
I
C
 
G
N
 
D
K
 
R
V
 
I
A
 
A
V
 
I
L
 
M
E
 
K
E
 
D
G
 
G
K
 
K
V
 
I
I
 
M
E
 
Q
Q
 
I
G
 
G
T
 
T
V
 
G
F
 
E
E
 
E
V
 
I
F
 
L
S
 
T
N
 
N
P
 
P
Q
 
A
Q
 
N
A
 
D
T
 
Y
T
 
V
K
 
K
R
 
T
F
 
F
V
 
V

Sites not aligning to the query:

7aheC Opua inhibited inward facing (see paper)
37% identity, 62% coverage: 28:241/343 of query aligns to 49:263/382 of 7aheC

query
sites
7aheC
V
 
I
E
 
N
T
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
I
Y
 
F
G
 
V
V
 
I
I
 
M
G
 
G
F
 
L
S
 
S
G
 
G
A
 
S
G
 
G
K
 
K
S
 
S
S
 
T
L
 
L
I
 
L
R
 
R
T
 
L
V
 
L
N
 
N
L
 
R
L
 
L
E
 
I
R
 
E
P
 
P
S
 
T
K
 
S
G
 
G
R
 
K
V
 
I
L
 
F
I
 
I
H
 
D
G
 
N
K
 
Q
D
 
D
I
 
V
S
 
A
T
 
T
L
 
L
S
 
N
S
 
K
K
 
E
E
 
D
I
 
L
R
 
L
T
 
Q
I
 
V
R
 
R
-
 
R
K
 
K
D
 
T
I
 
M
G
 
S
M
 
M
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
N
F
 
F
N
 
G
L
 
L
L
 
F
N
 
P
S
 
H
K
 
R
T
 
T
V
 
I
F
 
L
H
 
E
N
 
N
V
 
T
A
 
E
M
 
Y
P
 
G
L
 
L
L
 
E
L
 
V
A
 
Q
K
 
N
T
 
V
P
 
P
K
 
K
A
 
E
D
 
E
I
 
R
E
 
R
K
 
K
Q
 
R
V
 
A
K
 
E
D
 
K
L
 
A
L
 
L
D
 
D
F
 
N
V
 
A
G
 
N
L
 
L
A
 
L
D
 
D
Q
 
F
A
 
K
Q
 
D
K
 
Q
Y
 
Y
P
 
P
D
 
K
Q
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
I
 
V
G
 
G
I
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
N
N
 
D
P
 
P
S
 
E
V
 
I
L
 
L
L
 
L
C
 
M
D
 
D
E
 
E
A
 
A
T
 
F
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
L
T
 
I
T
 
R
K
 
R
S
 
E
I
 
M
L
 
Q
D
 
D
L
 
E
L
 
L
K
 
L
K
 
E
I
 
L
N
 
Q
K
 
A
E
 
K
Y
 
F
N
 
Q
I
 
K
T
 
T
I
 
I
L
 
I
L
 
F
I
 
V
T
 
S
H
 
H
E
 
D
M
 
L
G
 
N
V
 
E
I
 
A
R
 
L
E
 
R
I
 
I
C
 
G
N
 
D
K
 
R
V
 
I
A
 
A
V
 
I
L
 
M
E
 
K
E
 
D
G
 
G
K
 
K
V
 
I
I
 
M
E
 
Q
Q
 
I
G
 
G
T
 
T
V
 
G
F
 
E
E
 
E
V
 
I
F
 
L
S
 
T
N
 
N
P
 
P
Q
 
A
Q
 
N
A
 
D
T
 
Y
T
 
V
K
 
K
R
 
T
F
 
F
V
 
V

Sites not aligning to the query:

8j5tD Cryo-em structure of mycobacterium tuberculosis oppabcd in the catalytic intermediate state (see paper)
36% identity, 71% coverage: 1:244/343 of query aligns to 348:602/608 of 8j5tD

query
sites
8j5tD
M
 
V
I
 
V
Q
 
R
F
 
V
E
 
R
G
 
H
V
 
L
A
 
V
K
 
K
T
 
T
Y
|
Y
Q
 
R
S
 
L
G
 
A
K
 
K
Q
 
G
-
 
V
-
 
V
-
 
L
-
 
R
-
 
R
-
 
A
-
 
I
-
 
G
E
 
E
I
 
V
H
 
R
A
 
A
L
 
V
N
 
D
G
 
G
I
 
I
D
 
S
L
 
L
T
 
E
V
 
L
E
 
R
T
 
Q
G
 
G
E
 
R
I
 
T
Y
 
L
G
 
G
V
 
I
I
 
V
G
 
G
F
 
E
S
|
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
T
I
 
L
R
 
H
T
 
E
V
 
I
N
 
L
L
 
E
L
 
L
E
 
A
R
 
A
P
 
P
S
 
Q
K
 
S
G
 
G
R
 
S
V
 
I
L
 
E
I
 
V
H
 
L
G
 
G
K
 
T
D
 
D
I
 
V
S
 
A
T
 
T
L
 
L
S
 
G
S
 
T
K
 
A
E
 
E
I
 
R
R
 
R
T
 
S
I
 
L
R
 
R
K
 
R
D
 
D
I
 
I
G
 
Q
M
 
V
I
 
V
F
 
F
Q
|
Q
H
 
D
-
 
P
-
 
V
F
 
A
N
 
S
L
 
L
L
 
D
N
 
P
S
 
R
K
 
L
T
 
P
V
 
V
F
 
F
H
 
D
N
 
L
V
 
I
A
 
A
M
 
E
P
 
P
L
 
L
L
 
Q
L
 
A
A
 
N
K
 
G
T
 
F
P
 
G
K
 
K
A
 
N
D
 
E
I
 
T
E
 
H
K
 
A
Q
 
R
V
 
V
K
 
A
D
 
E
L
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
I
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
R
-
 
H
D
 
G
Q
 
D
A
 
A
Q
 
S
K
x
R
Y
 
Y
P
 
P
D
 
A
Q
x
E
L
 
F
S
|
S
G
 
G
G
|
G
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
I
 
I
G
 
G
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
L
N
 
Q
P
 
P
S
 
K
V
 
I
L
 
L
L
 
A
C
 
L
D
 
D
E
 
D
A
 
P
T
 
V
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
V
Q
 
S
T
 
I
T
 
Q
K
 
A
S
 
G
I
 
I
L
 
I
D
 
N
L
 
L
L
 
L
K
 
L
K
 
D
I
 
L
N
 
Q
K
 
E
E
 
Q
Y
 
F
N
 
G
I
 
L
T
 
S
I
 
Y
L
 
L
L
 
F
I
 
V
T
 
S
H
|
H
E
 
D
M
 
L
G
 
S
V
 
V
I
 
V
R
 
K
E
 
H
I
 
L
C
 
A
N
 
H
K
 
Q
V
 
V
A
 
A
V
 
V
L
 
M
E
 
L
E
 
A
G
 
G
K
 
T
V
 
V
I
 
V
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
T
 
D
V
 
S
F
 
E
E
 
E
V
 
V
F
 
F
S
 
G
N
 
N
P
 
P
Q
 
K
Q
 
H
A
 
E
T
 
Y
T
 
T
K
 
R
R
 
R
F
 
L
V
 
L
R
 
G
S
 
A
V
 
V

Sites not aligning to the query:

8j5sD Cryo-em structure of mycobacterium tuberculosis oppabcd in the pre- catalytic intermediate state (see paper)
36% identity, 71% coverage: 1:244/343 of query aligns to 348:602/608 of 8j5sD

query
sites
8j5sD
M
 
V
I
 
V
Q
 
R
F
 
V
E
 
R
G
 
H
V
 
L
A
 
V
K
 
K
T
 
T
Y
|
Y
Q
 
R
S
 
L
G
 
A
K
 
K
Q
 
G
-
 
V
-
 
V
-
 
L
-
 
R
-
 
R
-
 
A
-
 
I
-
 
G
E
 
E
I
 
V
H
 
R
A
|
A
L
 
V
N
 
D
G
 
G
I
 
I
D
 
S
L
 
L
T
 
E
V
 
L
E
 
R
T
 
Q
G
 
G
E
 
R
I
 
T
Y
 
L
G
 
G
V
 
I
I
 
V
G
 
G
F
 
E
S
 
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
L
 
T
I
 
L
R
 
H
T
 
E
V
 
I
N
 
L
L
 
E
L
 
L
E
 
A
R
 
A
P
 
P
S
 
Q
K
 
S
G
 
G
R
 
S
V
 
I
L
 
E
I
 
V
H
 
L
G
 
G
K
 
T
D
 
D
I
 
V
S
 
A
T
 
T
L
 
L
S
 
G
S
 
T
K
 
A
E
 
E
I
 
R
R
 
R
T
 
S
I
 
L
R
 
R
K
 
R
D
 
D
I
 
I
G
 
Q
M
 
V
I
 
V
F
 
F
Q
|
Q
H
 
D
-
 
P
-
 
V
F
 
A
N
 
S
L
 
L
L
 
D
N
 
P
S
 
R
K
 
L
T
 
P
V
 
V
F
 
F
H
 
D
N
 
L
V
 
I
A
 
A
M
 
E
P
 
P
L
 
L
L
 
Q
L
 
A
A
 
N
K
 
G
T
 
F
P
 
G
K
 
K
A
 
N
D
 
E
I
 
T
E
 
H
K
 
A
Q
 
R
V
 
V
K
 
A
D
 
E
L
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
I
V
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
R
-
 
H
D
 
G
Q
 
D
A
 
A
Q
 
S
K
 
R
Y
 
Y
P
 
P
D
 
A
Q
 
E
L
 
F
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
I
 
I
G
 
G
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
L
N
 
Q
P
 
P
S
 
K
V
 
I
L
 
L
L
 
A
C
 
L
D
 
D
E
 
D
A
 
P
T
 
V
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
V
Q
 
S
T
 
I
T
 
Q
K
 
A
S
 
G
I
 
I
L
 
I
D
 
N
L
 
L
L
 
L
K
 
L
K
 
D
I
 
L
N
 
Q
K
 
E
E
 
Q
Y
 
F
N
 
G
I
 
L
T
 
S
I
 
Y
L
 
L
L
 
F
I
 
V
T
 
S
H
 
H
E
 
D
M
 
L
G
 
S
V
 
V
I
 
V
R
 
K
E
 
H
I
 
L
C
 
A
N
 
H
K
 
Q
V
 
V
A
 
A
V
 
V
L
 
M
E
 
L
E
 
A
G
 
G
K
 
T
V
 
V
I
 
V
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
T
 
D
V
 
S
F
 
E
E
 
E
V
 
V
F
 
F
S
 
G
N
 
N
P
 
P
Q
 
K
Q
 
H
A
 
E
T
 
Y
T
 
T
K
 
R
R
 
R
F
 
L
V
 
L
R
 
G
S
 
A
V
 
V

Sites not aligning to the query:

8tzjA Cryo-em structure of vibrio cholerae ftse/ftsx complex (see paper)
39% identity, 59% coverage: 1:204/343 of query aligns to 2:201/220 of 8tzjA

query
sites
8tzjA
M
 
V
I
 
I
Q
 
R
F
 
F
E
 
Q
G
 
Q
V
 
V
A
 
S
K
 
K
T
 
A
Y
|
Y
Q
 
R
S
 
G
G
 
G
K
x
R
Q
 
Q
E
 
-
I
 
-
H
 
-
A
|
A
L
 
L
N
 
Q
G
 
K
I
 
V
D
 
D
L
 
F
T
 
H
V
 
L
E
 
R
T
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
M
Y
 
A
G
 
F
V
 
L
I
 
G
G
 
G
F
 
H
S
 
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
 
T
L
 
L
I
 
L
R
 
K
T
 
L
V
 
I
N
 
C
L
 
A
L
 
I
E
 
E
R
 
R
P
 
P
S
 
T
K
 
D
G
 
G
R
 
K
V
 
I
L
 
S
I
 
F
H
 
N
G
 
G
K
 
H
D
 
D
I
 
I
S
 
T
T
 
R
L
 
I
S
 
P
S
 
N
K
 
K
E
 
D
I
 
I
R
 
P
T
 
F
I
 
L
R
 
R
K
 
R
D
 
N
I
 
I
G
 
G
M
 
I
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
H
 
D
F
 
H
N
 
R
L
 
L
L
 
L
N
 
M
S
 
D
K
 
R
T
 
S
V
 
I
F
 
Y
H
 
D
N
 
N
V
 
V
A
 
A
M
 
L
P
 
P
L
 
M
L
 
R
L
 
I
A
 
E
K
 
S
T
 
I
P
 
S
K
 
E
A
 
N
D
 
E
I
 
I
E
 
K
K
 
R
Q
 
R
V
 
V
K
 
S
D
 
A
L
 
A
L
 
L
D
 
D
F
 
K
V
 
T
G
 
G
L
 
L
A
 
L
D
 
D
Q
 
K
A
 
A
Q
 
R
K
 
C
Y
 
L
P
 
P
D
 
S
Q
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
I
 
V
G
 
G
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
V
A
 
V
T
 
N
N
 
R
P
 
P
S
 
T
V
 
L
L
 
L
L
 
L
C
 
A
D
 
D
E
 
E
A
 
P
T
 
T
S
 
G
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
E
T
 
L
T
 
S
K
 
S
S
 
R
I
 
V
L
 
L
D
 
R
L
 
L
L
 
F
K
 
E
K
 
E
I
 
F
N
 
N
K
 
R
E
 
A
Y
 
-
N
 
G
I
 
V
T
 
T
I
 
I
L
 
L
L
 
L
I
 
A
T
 
T
H
 
H
E
 
D
M
 
I
G
 
H
V
 
L
I
 
V

Query Sequence

>WP_008496776.1 NCBI__GCF_000342445.1:WP_008496776.1
MIQFEGVAKTYQSGKQEIHALNGIDLTVETGEIYGVIGFSGAGKSSLIRTVNLLERPSKG
RVLIHGKDISTLSSKEIRTIRKDIGMIFQHFNLLNSKTVFHNVAMPLLLAKTPKADIEKQ
VKDLLDFVGLADQAQKYPDQLSGGQKQRIGIARALATNPSVLLCDEATSALDPQTTKSIL
DLLKKINKEYNITILLITHEMGVIREICNKVAVLEEGKVIEQGTVFEVFSNPQQATTKRF
VRSVMNDELPESLLAQIHEPHSDHTIFRLQFTGNSVGTPVMSRVSRNFNVDLNVLFGNIT
ELQGVPYGNLIVEFSGELKEIERAITSIRDNNIHIEEVTHYVS

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory