SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_008807487.1 NCBI__GCF_000025465.1:WP_008807487.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P04036 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductase; HTPA reductase; EC 1.17.1.8 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
92% identity, 100% coverage: 1:273/273 of query aligns to 1:273/273 of P04036

query
sites
P04036
M
 
M
H
 
H
D
 
D
A
 
A
Q
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
G
|
G
A
 
A
G
 
G
G
|
G
R
|
R
M
|
M
G
 
G
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
I
 
I
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
L
 
L
Q
 
A
M
 
L
E
 
E
G
 
G
V
 
V
A
 
Q
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
E
|
E
R
|
R
E
 
E
G
 
G
S
 
S
S
 
S
L
 
L
V
 
L
G
 
G
S
 
S
D
 
D
A
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
A
 
T
G
 
G
V
 
V
A
 
T
V
 
V
Q
 
Q
S
 
S
S
 
S
L
 
L
T
 
D
A
 
A
V
 
V
K
 
K
D
 
D
D
 
D
F
 
F
D
 
D
V
 
V
L
 
F
I
 
I
D
 
D
F
 
F
T
|
T
R
|
R
P
 
P
E
 
E
G
 
G
T
 
T
L
 
L
N
 
N
H
 
H
L
 
L
A
 
A
F
 
F
C
 
C
R
 
R
E
 
Q
H
 
H
G
 
G
K
 
K
G
 
G
M
 
M
V
 
V
I
 
I
G
|
G
T
|
T
T
|
T
G
 
G
F
 
F
D
 
D
D
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
K
Q
 
Q
A
 
A
I
 
I
R
 
R
D
 
D
A
 
A
A
 
A
Q
 
A
E
 
D
I
 
I
A
 
A
I
 
I
V
 
V
F
 
F
A
|
A
A
|
A
N
|
N
F
|
F
S
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
N
V
 
V
L
 
M
L
 
L
K
 
K
L
 
L
L
 
L
E
 
E
K
 
K
A
 
A
A
 
A
K
 
K
V
 
V
M
 
M
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
T
 
T
D
 
D
I
 
I
E
 
E
I
 
I
I
 
I
E
 
E
A
 
A
H
|
H
H
 
H
R
 
R
H
 
H
K
|
K
V
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
G
 
G
E
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A
G
 
H
A
 
A
L
 
L
N
 
D
K
 
K
D
 
D
L
 
L
K
 
K
E
 
D
C
 
C
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
S
 
S
R
 
R
E
 
E
G
 
G
H
 
H
T
 
T
G
 
G
E
 
E
R
 
R
V
 
V
P
 
P
G
 
G
T
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
A
T
 
T
V
 
V
R
 
R
A
 
A
G
 
G
D
 
D
I
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
E
H
 
H
T
 
T
A
 
A
M
 
M
F
 
F
A
 
A
D
 
D
I
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
H
 
H
K
 
K
A
 
A
S
 
S
S
 
S
R
|
R
M
 
M
T
 
T
F
|
F
A
 
A
N
 
N
G
 
G
A
 
A
V
 
V
R
 
R
S
 
S
A
 
A
L
 
L
W
 
W
L
 
L
K
 
S
D
 
G
K
 
K
K
 
E
N
 
S
G
 
G
L
 
L
F
 
F
D
 
D
M
 
M
R
 
R
D
 
D
V
 
V
L
 
L
D
 
D
L
 
L
N
 
N
S
 
N
L
 
L

1drwA Escherichia coli dhpr/nhdh complex (see paper)
92% identity, 100% coverage: 2:273/273 of query aligns to 1:272/272 of 1drwA

query
sites
1drwA
H
 
H
D
 
D
A
 
A
Q
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
G
|
G
A
 
A
G
 
G
G
|
G
R
|
R
M
|
M
G
 
G
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
I
 
I
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
L
 
L
Q
 
A
M
 
L
E
 
E
G
 
G
V
 
V
A
 
Q
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
E
|
E
R
|
R
E
 
E
G
 
G
S
 
S
S
 
S
L
 
L
V
 
L
G
 
G
S
 
S
D
 
D
A
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
A
 
T
G
 
G
V
 
V
A
 
T
V
 
V
Q
 
Q
S
 
S
S
 
S
L
 
L
T
 
D
A
 
A
V
 
V
K
 
K
D
 
D
D
 
D
F
 
F
D
 
D
V
 
V
L
 
F
I
 
I
D
 
D
F
|
F
T
|
T
R
|
R
P
 
P
E
 
E
G
 
G
T
 
T
L
 
L
N
 
N
H
 
H
L
 
L
A
 
A
F
 
F
C
 
C
R
 
R
E
 
Q
H
 
H
G
 
G
K
 
K
G
 
G
M
 
M
V
 
V
I
 
I
G
|
G
T
|
T
T
|
T
G
 
G
F
 
F
D
 
D
D
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
K
Q
 
Q
A
 
A
I
 
I
R
 
R
D
 
D
A
 
A
A
 
A
Q
 
A
E
 
D
I
 
I
A
 
A
I
 
I
V
 
V
F
 
F
A
 
A
A
|
A
N
|
N
F
|
F
S
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
N
V
 
V
L
 
M
L
 
L
K
 
K
L
 
L
L
 
L
E
 
E
K
 
K
A
 
A
A
 
A
K
 
K
V
 
V
M
 
M
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
T
 
T
D
 
D
I
 
I
E
 
E
I
 
I
I
 
I
E
 
E
A
 
A
H
|
H
H
 
H
R
 
R
H
 
H
K
|
K
V
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
G
 
G
E
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A
G
 
H
A
 
A
L
 
L
N
 
D
K
 
K
D
 
D
L
 
L
K
 
K
E
 
D
C
 
C
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
S
 
S
R
 
R
E
 
E
G
 
G
H
 
H
T
 
T
G
 
G
E
 
E
R
 
R
V
 
V
P
 
P
G
 
G
T
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
A
T
 
T
V
 
V
R
 
R
A
 
A
G
 
G
D
 
D
I
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
E
H
 
H
T
 
T
A
 
A
M
 
M
F
 
F
A
 
A
D
 
D
I
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
H
 
H
K
 
K
A
 
A
S
 
S
S
 
S
R
 
R
M
 
M
T
 
T
F
|
F
A
 
A
N
 
N
G
 
G
A
 
A
V
 
V
R
 
R
S
 
S
A
 
A
L
 
L
W
 
W
L
 
L
K
 
S
D
 
G
K
 
K
K
 
E
N
 
S
G
 
G
L
 
L
F
 
F
D
 
D
M
 
M
R
 
R
D
 
D
V
 
V
L
 
L
D
 
D
L
 
L
N
 
N
S
 
N
L
 
L

1dihA Three-dimensional structure of e. Coli dihydrodipicolinate reductase (see paper)
92% identity, 100% coverage: 2:273/273 of query aligns to 1:272/272 of 1dihA

query
sites
1dihA
H
 
H
D
 
D
A
 
A
Q
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
G
|
G
A
 
A
G
 
G
G
|
G
R
|
R
M
|
M
G
 
G
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
I
 
I
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
L
 
L
Q
 
A
M
 
L
E
 
E
G
 
G
V
 
V
A
 
Q
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
R
|
R
E
 
E
G
 
G
S
 
S
S
 
S
L
 
L
V
 
L
G
 
G
S
 
S
D
 
D
A
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
A
 
T
G
 
G
V
 
V
A
 
T
V
 
V
Q
 
Q
S
 
S
S
 
S
L
 
L
T
 
D
A
 
A
V
 
V
K
 
K
D
 
D
D
 
D
F
 
F
D
 
D
V
 
V
L
 
F
I
 
I
D
 
D
F
|
F
T
|
T
R
|
R
P
 
P
E
 
E
G
|
G
T
 
T
L
 
L
N
 
N
H
 
H
L
 
L
A
 
A
F
 
F
C
 
C
R
 
R
E
 
Q
H
 
H
G
 
G
K
 
K
G
 
G
M
 
M
V
 
V
I
 
I
G
|
G
T
 
T
T
|
T
G
 
G
F
 
F
D
 
D
D
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
K
Q
 
Q
A
 
A
I
 
I
R
 
R
D
 
D
A
 
A
A
 
A
Q
 
A
E
 
D
I
 
I
A
 
A
I
 
I
V
 
V
F
 
F
A
 
A
A
 
A
N
|
N
F
|
F
S
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
N
V
 
V
L
 
M
L
 
L
K
 
K
L
 
L
L
 
L
E
 
E
K
 
K
A
 
A
A
 
A
K
 
K
V
 
V
M
 
M
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
T
 
T
D
 
D
I
 
I
E
 
E
I
 
I
I
 
I
E
 
E
A
 
A
H
|
H
H
 
H
R
 
R
H
 
H
K
|
K
V
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
G
 
G
E
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A
G
 
H
A
 
A
L
 
L
N
 
D
K
 
K
D
 
D
L
 
L
K
 
K
E
 
D
C
 
C
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
S
 
S
R
 
R
E
 
E
G
 
G
H
 
H
T
 
T
G
 
G
E
 
E
R
 
R
V
 
V
P
 
P
G
 
G
T
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
A
T
 
T
V
 
V
R
 
R
A
 
A
G
 
G
D
 
D
I
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
E
H
 
H
T
 
T
A
 
A
M
 
M
F
 
F
A
 
A
D
 
D
I
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
H
 
H
K
 
K
A
 
A
S
 
S
S
 
S
R
|
R
M
 
M
T
 
T
F
|
F
A
 
A
N
 
N
G
 
G
A
 
A
V
 
V
R
 
R
S
 
S
A
 
A
L
 
L
W
 
W
L
 
L
K
 
S
D
 
G
K
 
K
K
 
E
N
 
S
G
 
G
L
 
L
F
 
F
D
 
D
M
 
M
R
 
R
D
 
D
V
 
V
L
 
L
D
 
D
L
 
L
N
 
N
S
 
N
L
 
L

1drvA Escherichia coli dhpr/acnadh complex (see paper)
91% identity, 99% coverage: 4:273/273 of query aligns to 1:270/270 of 1drvA

query
sites
1drvA
A
 
A
Q
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
G
|
G
A
 
A
G
 
G
G
|
G
R
|
R
M
|
M
G
 
G
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
I
 
I
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
L
 
L
Q
 
A
M
 
L
E
 
E
G
 
G
V
 
V
A
 
Q
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
E
|
E
R
 
R
E
 
E
G
 
G
S
 
S
S
 
S
L
 
L
V
 
L
G
 
G
S
 
S
D
 
D
A
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
A
 
T
G
 
G
V
 
V
A
 
T
V
 
V
Q
 
Q
S
 
S
S
 
S
L
 
L
T
 
D
A
 
A
V
 
V
K
 
K
D
 
D
D
 
D
F
 
F
D
 
D
V
 
V
L
 
F
I
 
I
D
 
D
F
|
F
T
|
T
R
|
R
P
 
P
E
 
E
G
|
G
T
 
T
L
 
L
N
 
N
H
 
H
L
 
L
A
 
A
F
 
F
C
 
C
R
 
R
E
 
Q
H
 
H
G
 
G
K
 
K
G
 
G
M
 
M
V
 
V
I
 
I
G
|
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
F
 
F
D
 
D
D
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
K
Q
 
Q
A
 
A
I
 
I
R
 
R
D
 
D
A
 
A
A
 
A
Q
 
A
E
 
D
I
 
I
A
 
A
I
 
I
V
 
V
F
 
F
A
 
A
A
|
A
N
 
N
F
|
F
S
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
N
V
 
V
L
 
M
L
 
L
K
 
K
L
 
L
L
 
L
E
 
E
K
 
K
A
 
A
A
 
A
K
 
K
V
 
V
M
 
M
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
T
 
T
D
 
D
I
 
I
E
 
E
I
 
I
I
 
I
E
 
E
A
 
A
H
|
H
H
 
H
R
 
R
H
 
H
K
|
K
V
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
G
 
G
E
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A
G
 
H
A
 
A
L
 
L
N
 
D
K
 
K
D
 
D
L
 
L
K
 
K
E
 
D
C
 
C
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
S
 
S
R
 
R
E
 
E
G
 
G
H
 
H
T
 
T
G
 
G
E
 
E
R
 
R
V
 
V
P
 
P
G
 
G
T
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
A
T
 
T
V
 
V
R
 
R
A
 
A
G
 
G
D
 
D
I
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
E
H
 
H
T
 
T
A
 
A
M
 
M
F
 
F
A
 
A
D
 
D
I
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
H
 
H
K
 
K
A
 
A
S
 
S
S
 
S
R
|
R
M
 
M
T
 
T
F
 
F
A
 
A
N
 
N
G
 
G
A
 
A
V
 
V
R
 
R
S
 
S
A
 
A
L
 
L
W
 
W
L
 
L
K
 
S
D
 
G
K
 
K
K
 
E
N
 
S
G
 
G
L
 
L
F
 
F
D
 
D
M
 
M
R
 
R
D
 
D
V
 
V
L
 
L
D
 
D
L
 
L
N
 
N
S
 
N
L
 
L

1druA Escherichia coli dhpr/nadh complex (see paper)
91% identity, 99% coverage: 4:273/273 of query aligns to 1:270/270 of 1druA

query
sites
1druA
A
 
A
Q
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
G
|
G
A
 
A
G
 
G
G
|
G
R
|
R
M
|
M
G
 
G
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
I
 
I
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
L
 
L
Q
 
A
M
 
L
E
 
E
G
 
G
V
 
V
A
 
Q
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
E
|
E
R
|
R
E
 
E
G
 
G
S
 
S
S
 
S
L
 
L
V
 
L
G
 
G
S
 
S
D
 
D
A
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
A
 
T
G
 
G
V
 
V
A
 
T
V
 
V
Q
 
Q
S
 
S
S
 
S
L
 
L
T
 
D
A
 
A
V
 
V
K
 
K
D
 
D
D
 
D
F
 
F
D
 
D
V
 
V
L
 
F
I
 
I
D
 
D
F
|
F
T
|
T
R
|
R
P
 
P
E
 
E
G
|
G
T
 
T
L
 
L
N
 
N
H
 
H
L
 
L
A
 
A
F
 
F
C
 
C
R
 
R
E
 
Q
H
 
H
G
 
G
K
 
K
G
 
G
M
 
M
V
 
V
I
 
I
G
|
G
T
|
T
T
|
T
G
 
G
F
 
F
D
 
D
D
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
K
Q
 
Q
A
 
A
I
 
I
R
 
R
D
 
D
A
 
A
A
 
A
Q
 
A
E
 
D
I
 
I
A
 
A
I
 
I
V
 
V
F
 
F
A
 
A
A
|
A
N
|
N
F
|
F
S
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
N
V
 
V
L
 
M
L
 
L
K
 
K
L
 
L
L
 
L
E
 
E
K
 
K
A
 
A
A
 
A
K
 
K
V
 
V
M
 
M
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
T
 
T
D
 
D
I
 
I
E
 
E
I
 
I
I
 
I
E
 
E
A
 
A
H
|
H
H
 
H
R
 
R
H
 
H
K
|
K
V
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
G
 
G
E
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A
G
 
H
A
 
A
L
 
L
N
 
D
K
 
K
D
 
D
L
 
L
K
 
K
E
 
D
C
 
C
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
S
 
S
R
 
R
E
 
E
G
 
G
H
 
H
T
 
T
G
 
G
E
 
E
R
 
R
V
 
V
P
 
P
G
 
G
T
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
A
T
 
T
V
 
V
R
 
R
A
 
A
G
 
G
D
 
D
I
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
E
H
 
H
T
 
T
A
 
A
M
 
M
F
 
F
A
 
A
D
 
D
I
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
H
 
H
K
 
K
A
 
A
S
 
S
S
 
S
R
 
R
M
 
M
T
 
T
F
|
F
A
 
A
N
 
N
G
 
G
A
 
A
V
 
V
R
 
R
S
 
S
A
 
A
L
 
L
W
 
W
L
 
L
K
 
S
D
 
G
K
 
K
K
 
E
N
 
S
G
 
G
L
 
L
F
 
F
D
 
D
M
 
M
R
 
R
D
 
D
V
 
V
L
 
L
D
 
D
L
 
L
N
 
N
S
 
N
L
 
L

1arzA Escherichia coli dihydrodipicolinate reductase in complex with nadh and 2,6 pyridine dicarboxylate (see paper)
91% identity, 99% coverage: 4:273/273 of query aligns to 1:270/270 of 1arzA

query
sites
1arzA
A
 
A
Q
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
R
 
R
M
 
M
G
 
G
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
I
 
I
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
L
 
L
Q
 
A
M
 
L
E
 
E
G
 
G
V
 
V
A
 
Q
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
R
 
R
E
 
E
G
 
G
S
 
S
S
 
S
L
 
L
V
 
L
G
 
G
S
 
S
D
 
D
A
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
A
 
T
G
 
G
V
 
V
A
 
T
V
 
V
Q
 
Q
S
 
S
S
 
S
L
 
L
T
 
D
A
 
A
V
 
V
K
 
K
D
 
D
D
 
D
F
 
F
D
 
D
V
 
V
L
 
F
I
 
I
D
 
D
F
 
F
T
 
T
R
 
R
P
 
P
E
 
E
G
 
G
T
 
T
L
 
L
N
 
N
H
 
H
L
 
L
A
 
A
F
 
F
C
 
C
R
 
R
E
 
Q
H
 
H
G
 
G
K
 
K
G
 
G
M
 
M
V
 
V
I
 
I
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
F
 
F
D
 
D
D
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
K
Q
 
Q
A
 
A
I
 
I
R
 
R
D
 
D
A
 
A
A
 
A
Q
 
A
E
 
D
I
 
I
A
 
A
I
 
I
V
 
V
F
 
F
A
 
A
A
 
A
N
 
N
F
 
F
S
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
N
V
 
V
L
 
M
L
 
L
K
 
K
L
 
L
L
 
L
E
 
E
K
 
K
A
 
A
A
 
A
K
 
K
V
 
V
M
 
M
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
T
 
T
D
 
D
I
 
I
E
 
E
I
 
I
I
 
I
E
 
E
A
 
A
H
|
H
H
|
H
R
 
R
H
 
H
K
|
K
V
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
G
 
G
E
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A
G
 
H
A
 
A
L
 
L
N
 
D
K
 
K
D
 
D
L
 
L
K
 
K
E
 
D
C
 
C
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
S
 
S
R
 
R
E
 
E
G
 
G
H
 
H
T
 
T
G
 
G
E
 
E
R
 
R
V
 
V
P
 
P
G
 
G
T
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
A
T
 
T
V
 
V
R
 
R
A
 
A
G
 
G
D
 
D
I
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
E
H
 
H
T
 
T
A
 
A
M
 
M
F
 
F
A
 
A
D
 
D
I
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
H
 
H
K
 
K
A
 
A
S
 
S
S
 
S
R
 
R
M
 
M
T
 
T
F
 
F
A
 
A
N
 
N
G
 
G
A
 
A
V
 
V
R
 
R
S
 
S
A
 
A
L
 
L
W
 
W
L
 
L
K
 
S
D
 
G
K
 
K
K
 
E
N
 
S
G
 
G
L
 
L
F
 
F
D
 
D
M
 
M
R
 
R
D
 
D
V
 
V
L
 
L
D
 
D
L
 
L
N
 
N
S
 
N
L
 
L

1arzB Escherichia coli dihydrodipicolinate reductase in complex with nadh and 2,6 pyridine dicarboxylate (see paper)
91% identity, 99% coverage: 5:273/273 of query aligns to 1:269/269 of 1arzB

query
sites
1arzB
Q
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
G
|
G
A
 
A
G
|
G
G
|
G
R
|
R
M
|
M
G
 
G
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
I
 
I
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
L
 
L
Q
 
A
M
 
L
E
 
E
G
 
G
V
 
V
A
 
Q
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
E
|
E
R
 
R
E
 
E
G
 
G
S
 
S
S
 
S
L
 
L
V
 
L
G
 
G
S
 
S
D
 
D
A
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
A
 
T
G
 
G
V
 
V
A
 
T
V
 
V
Q
 
Q
S
 
S
S
 
S
L
 
L
T
 
D
A
 
A
V
 
V
K
 
K
D
 
D
D
 
D
F
 
F
D
 
D
V
 
V
L
 
F
I
 
I
D
 
D
F
|
F
T
|
T
R
|
R
P
 
P
E
 
E
G
|
G
T
 
T
L
 
L
N
 
N
H
|
H
L
 
L
A
 
A
F
 
F
C
 
C
R
 
R
E
 
Q
H
 
H
G
 
G
K
 
K
G
 
G
M
 
M
V
 
V
I
 
I
G
|
G
T
 
T
T
|
T
G
 
G
F
 
F
D
 
D
D
 
E
A
 
A
G
 
G
K
 
K
Q
 
Q
A
 
A
I
 
I
R
 
R
D
 
D
A
 
A
A
 
A
Q
 
A
E
 
D
I
 
I
A
 
A
I
 
I
V
 
V
F
 
F
A
 
A
A
|
A
N
|
N
F
|
F
S
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
N
V
 
V
L
 
M
L
 
L
K
 
K
L
 
L
L
 
L
E
 
E
K
 
K
A
 
A
A
 
A
K
 
K
V
 
V
M
 
M
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
T
 
T
D
 
D
I
 
I
E
 
E
I
 
I
I
 
I
E
 
E
A
 
A
H
|
H
H
|
H
R
 
R
H
 
H
K
|
K
V
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
|
S
G
|
G
T
|
T
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
G
 
G
E
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A
G
 
H
A
 
A
L
 
L
N
 
D
K
 
K
D
 
D
L
 
L
K
 
K
E
 
D
C
 
C
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
S
 
S
R
 
R
E
 
E
G
 
G
H
 
H
T
 
T
G
 
G
E
 
E
R
 
R
V
 
V
P
 
P
G
 
G
T
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
A
T
 
T
V
 
V
R
 
R
A
 
A
G
 
G
D
 
D
I
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
E
H
 
H
T
 
T
A
 
A
M
 
M
F
 
F
A
 
A
D
 
D
I
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
H
 
H
K
 
K
A
 
A
S
 
S
S
 
S
R
 
R
M
 
M
T
 
T
F
|
F
A
 
A
N
 
N
G
 
G
A
 
A
V
 
V
R
 
R
S
 
S
A
 
A
L
 
L
W
 
W
L
 
L
K
 
S
D
 
G
K
 
K
K
 
E
N
 
S
G
 
G
L
 
L
F
 
F
D
 
D
M
 
M
R
 
R
D
 
D
V
 
V
L
 
L
D
 
D
L
 
L
N
 
N
S
 
N
L
 
L

5tejB Structure of 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductase from vibrio vulnificus with 2,5 furan dicarboxylic and nadh (see paper)
63% identity, 98% coverage: 6:273/273 of query aligns to 2:269/269 of 5tejB

query
sites
5tejB
I
 
V
R
 
R
V
 
I
A
 
A
I
 
V
A
 
A
G
|
G
A
 
A
G
 
A
G
|
G
R
|
R
M
|
M
G
 
G
R
 
R
Q
 
N
L
 
L
I
 
V
Q
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
H
Q
 
H
M
 
N
E
 
P
G
 
V
V
 
A
A
 
K
L
 
V
G
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
S
E
|
E
R
|
R
E
 
P
G
 
E
S
 
S
S
 
S
L
 
L
V
 
V
G
 
G
S
 
V
D
 
D
A
 
L
G
 
G
E
 
E
L
 
L
A
 
C
G
 
G
A
 
E
G
 
G
K
 
K
A
 
F
G
 
D
V
 
V
A
 
V
V
 
V
Q
 
C
S
 
D
S
 
D
L
 
L
T
 
A
A
 
K
V
 
Q
K
 
I
D
 
D
D
 
Q
F
 
F
D
 
D
V
 
V
L
 
I
I
 
I
D
 
D
F
|
F
T
|
T
R
 
A
P
 
P
E
 
A
G
x
S
T
 
T
L
 
L
N
 
N
H
 
N
L
 
L
A
 
A
F
 
L
C
 
C
R
 
Q
E
 
Q
H
 
Y
G
 
G
K
 
K
G
 
S
M
 
I
V
 
V
I
 
I
G
|
G
T
 
T
T
|
T
G
 
G
F
 
F
D
 
T
D
 
E
A
 
E
G
 
Q
K
 
R
Q
 
E
A
 
Q
I
 
I
R
 
D
D
 
L
A
 
V
A
 
A
Q
 
Q
E
 
Q
I
 
V
A
 
P
I
 
V
V
 
V
F
 
M
A
 
A
A
x
P
N
|
N
F
x
Y
S
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
N
V
 
L
L
 
V
L
 
F
K
 
K
L
 
L
L
 
L
E
 
E
K
 
K
A
 
A
A
 
A
K
 
K
V
 
V
M
 
M
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
T
 
C
D
 
D
I
 
I
E
 
E
I
 
I
I
 
V
E
 
E
A
 
A
H
|
H
H
|
H
R
 
R
H
 
H
K
|
K
V
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
|
S
G
|
G
T
|
T
A
 
A
L
 
I
A
 
G
M
 
M
G
 
G
E
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
M
N
 
G
K
 
N
D
 
K
L
 
L
K
 
S
E
 
D
C
 
V
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
S
 
A
R
 
R
E
 
E
G
 
G
H
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
E
R
 
R
V
 
T
P
 
K
G
 
D
T
 
E
I
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
A
T
 
T
V
 
I
R
 
R
A
 
A
G
 
G
D
 
D
I
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
E
H
 
H
T
 
T
A
 
A
M
 
M
F
 
F
A
 
A
D
 
D
I
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
V
E
 
E
I
 
I
T
 
T
H
 
H
K
 
K
A
 
A
S
 
T
S
 
D
R
 
R
M
 
M
T
 
T
F
|
F
A
 
A
N
 
N
G
 
G
A
 
A
V
 
V
R
 
K
S
 
A
A
 
A
L
 
V
W
 
W
L
 
L
K
 
H
D
 
E
K
 
K
K
 
P
N
 
A
G
 
G
L
 
F
F
 
Y
D
 
T
M
 
M
R
 
T
D
 
D
V
 
V
L
 
L
D
 
G
L
 
L
N
 
N
S
 
D
L
 
L

5tejA Structure of 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductase from vibrio vulnificus with 2,5 furan dicarboxylic and nadh (see paper)
63% identity, 98% coverage: 6:273/273 of query aligns to 2:269/269 of 5tejA

query
sites
5tejA
I
 
V
R
 
R
V
 
I
A
 
A
I
 
V
A
 
A
G
|
G
A
 
A
G
 
A
G
|
G
R
|
R
M
|
M
G
 
G
R
 
R
Q
 
N
L
 
L
I
 
V
Q
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
H
Q
 
H
M
 
N
E
 
P
G
 
V
V
 
A
A
 
K
L
 
V
G
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
S
E
|
E
R
|
R
E
 
P
G
 
E
S
 
S
S
 
S
L
 
L
V
 
V
G
 
G
S
 
V
D
 
D
A
 
L
G
 
G
E
 
E
L
 
L
A
 
C
G
 
G
A
 
E
G
 
G
K
 
K
A
 
F
G
 
D
V
 
V
A
 
V
V
 
V
Q
 
C
S
 
D
S
 
D
L
 
L
T
 
A
A
 
K
V
 
Q
K
 
I
D
 
D
D
 
Q
F
 
F
D
 
D
V
 
V
L
 
I
I
 
I
D
 
D
F
|
F
T
|
T
R
 
A
P
 
P
E
 
A
G
x
S
T
 
T
L
 
L
N
 
N
H
 
N
L
 
L
A
 
A
F
 
L
C
 
C
R
 
Q
E
 
Q
H
 
Y
G
 
G
K
 
K
G
 
S
M
 
I
V
 
V
I
 
I
G
|
G
T
 
T
T
|
T
G
 
G
F
 
F
D
 
T
D
 
E
A
 
E
G
 
Q
K
 
R
Q
 
E
A
 
Q
I
 
I
R
 
D
D
 
L
A
 
V
A
 
A
Q
 
Q
E
 
Q
I
 
V
A
 
P
I
 
V
V
 
V
F
 
M
A
 
A
A
x
P
N
 
N
F
 
Y
S
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
N
V
 
L
L
 
V
L
 
F
K
 
K
L
 
L
L
 
L
E
 
E
K
 
K
A
 
A
A
 
A
K
 
K
V
 
V
M
 
M
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
T
 
C
D
 
D
I
 
I
E
 
E
I
 
I
I
 
V
E
 
E
A
 
A
H
|
H
H
 
H
R
 
R
H
 
H
K
|
K
V
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
I
A
 
G
M
 
M
G
 
G
E
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
M
N
 
G
K
 
N
D
 
K
L
 
L
K
 
S
E
 
D
C
 
V
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
S
 
A
R
 
R
E
 
E
G
 
G
H
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
E
R
 
R
V
 
T
P
 
K
G
 
D
T
 
E
I
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
A
T
 
T
V
 
I
R
 
R
A
 
A
G
 
G
D
 
D
I
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
E
H
 
H
T
 
T
A
 
A
M
 
M
F
 
F
A
 
A
D
 
D
I
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
V
E
 
E
I
 
I
T
 
T
H
 
H
K
 
K
A
 
A
S
 
T
S
 
D
R
 
R
M
 
M
T
 
T
F
 
F
A
 
A
N
 
N
G
 
G
A
 
A
V
 
V
R
 
K
S
 
A
A
 
A
L
 
V
W
 
W
L
 
L
K
 
H
D
 
E
K
 
K
K
 
P
N
 
A
G
 
G
L
 
F
F
 
Y
D
 
T
M
 
M
R
 
T
D
 
D
V
 
V
L
 
L
D
 
G
L
 
L
N
 
N
S
 
D
L
 
L

5temA Structure of 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductase from vibrio vulnificus with 2,6 pyridine dicarboxylic and nadh (see paper)
63% identity, 97% coverage: 6:270/273 of query aligns to 2:266/266 of 5temA

query
sites
5temA
I
 
V
R
 
R
V
 
I
A
 
A
I
 
V
A
 
A
G
|
G
A
 
A
G
 
A
G
|
G
R
|
R
M
|
M
G
 
G
R
 
R
Q
 
N
L
 
L
I
 
V
Q
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
H
Q
 
H
M
 
N
E
 
P
G
 
V
V
 
A
A
 
K
L
 
V
G
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
S
E
|
E
R
|
R
E
 
P
G
 
E
S
 
S
S
 
S
L
 
L
V
 
V
G
 
G
S
 
V
D
 
D
A
 
L
G
 
G
E
 
E
L
 
L
A
 
C
G
 
G
A
 
E
G
 
G
K
 
K
A
 
F
G
 
D
V
 
V
A
 
V
V
 
V
Q
 
C
S
 
D
S
 
D
L
 
L
T
 
A
A
 
K
V
 
Q
K
 
I
D
 
D
D
 
Q
F
 
F
D
 
D
V
 
V
L
 
I
I
 
I
D
 
D
F
|
F
T
|
T
R
 
A
P
 
P
E
 
A
G
x
S
T
 
T
L
 
L
N
 
N
H
 
N
L
 
L
A
 
A
F
 
L
C
 
C
R
 
Q
E
 
Q
H
 
Y
G
 
G
K
 
K
G
 
S
M
 
I
V
 
V
I
 
I
G
|
G
T
 
T
T
|
T
G
 
G
F
 
F
D
 
T
D
 
E
A
 
E
G
 
Q
K
 
R
Q
 
E
A
 
Q
I
 
I
R
 
D
D
 
L
A
 
V
A
 
A
Q
 
Q
E
 
Q
I
 
V
A
 
P
I
 
V
V
 
V
F
 
M
A
 
A
A
x
P
N
|
N
F
x
Y
S
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
N
V
 
L
L
 
V
L
 
F
K
 
K
L
 
L
L
 
L
E
 
E
K
 
K
A
 
A
A
 
A
K
 
K
V
 
V
M
 
M
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
T
 
C
D
 
D
I
 
I
E
 
E
I
 
I
I
 
V
E
 
E
A
 
A
H
|
H
H
|
H
R
 
R
H
 
H
K
|
K
V
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
|
S
G
|
G
T
|
T
A
 
A
L
 
I
A
 
G
M
 
M
G
 
G
E
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
M
N
 
G
K
 
N
D
 
K
L
 
L
K
 
S
E
 
D
C
 
V
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
S
 
A
R
 
R
E
 
E
G
 
G
H
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
E
R
 
R
V
 
T
P
 
K
G
 
D
T
 
E
I
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
A
T
 
T
V
 
I
R
 
R
A
 
A
G
 
G
D
 
D
I
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
E
H
 
H
T
 
T
A
 
A
M
 
M
F
 
F
A
 
A
D
 
D
I
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
V
E
 
E
I
 
I
T
 
T
H
 
H
K
 
K
A
 
A
S
 
T
S
 
D
R
 
R
M
 
M
T
 
T
F
|
F
A
 
A
N
 
N
G
 
G
A
 
A
V
 
V
R
 
K
S
 
A
A
 
A
L
 
V
W
 
W
L
 
L
K
 
H
D
 
E
K
 
K
K
 
P
N
 
A
G
 
G
L
 
F
F
 
Y
D
 
T
M
 
M
R
 
T
D
 
D
V
 
V
L
 
L
D
 
G
L
 
L

4ywjA Crystal structure of 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductase (htpa reductase) from pseudomonas aeruginosa
64% identity, 97% coverage: 7:271/273 of query aligns to 3:268/268 of 4ywjA

query
sites
4ywjA
R
 
R
V
 
I
A
 
A
I
 
V
A
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
A
G
|
G
R
|
R
M
|
M
G
 
G
R
 
K
Q
 
N
L
 
L
I
 
I
Q
 
E
A
 
A
A
 
V
L
 
Q
Q
 
Q
M
 
T
E
 
G
G
 
G
V
 
A
A
 
A
-
 
G
L
 
L
G
 
T
A
 
A
A
 
A
L
 
V
E
x
D
R
|
R
E
 
P
G
 
D
S
 
S
S
 
T
L
 
L
V
 
V
G
 
G
S
 
A
D
 
D
A
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
L
G
 
G
K
 
R
A
 
I
G
 
G
V
 
V
A
 
P
V
 
L
Q
 
S
S
 
G
S
 
D
L
 
L
T
 
G
A
 
K
V
 
V
K
 
C
D
 
E
D
 
E
F
 
F
D
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
I
D
 
D
F
|
F
T
|
T
R
 
H
P
 
P
E
 
S
G
x
V
T
 
T
L
 
L
N
 
K
H
 
N
L
 
I
A
 
E
F
 
Q
C
 
C
R
 
R
E
 
K
H
 
A
G
 
R
K
 
R
G
 
A
M
 
M
V
 
V
I
 
I
G
|
G
T
 
T
T
|
T
G
 
G
F
 
F
D
 
S
D
 
A
A
 
D
G
 
E
K
 
K
Q
 
L
A
 
L
I
 
L
R
 
A
D
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
K
E
 
D
I
 
I
A
 
P
I
 
I
V
 
V
F
 
F
A
 
A
A
|
A
N
|
N
F
|
F
S
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
N
V
 
L
L
 
C
L
 
L
K
 
K
L
 
L
L
 
L
E
 
D
K
 
T
A
 
A
A
 
A
K
 
R
V
 
V
M
 
L
G
 
G
D
 
D
Y
 
E
T
 
V
D
 
D
I
 
I
E
 
E
I
 
I
I
 
I
E
 
E
A
 
A
H
|
H
H
 
H
R
 
R
H
 
H
K
|
K
V
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
L
A
 
R
M
 
M
G
 
G
E
 
E
A
 
V
I
 
V
A
 
A
G
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
G
K
 
R
D
 
D
L
 
L
K
 
Q
E
 
E
C
 
V
A
 
A
V
 
V
Y
 
Y
S
 
G
R
 
R
E
 
E
G
 
G
H
 
Q
T
 
T
G
 
G
E
 
A
R
 
R
V
 
A
P
 
R
G
 
E
T
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
A
T
 
T
V
 
V
R
 
R
A
 
A
G
 
G
D
 
D
I
 
V
V
 
V
G
 
G
E
 
D
H
 
H
T
 
T
A
 
V
M
 
L
F
 
F
A
 
A
D
 
A
I
 
E
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
V
E
 
E
I
 
I
T
 
T
H
 
H
K
 
K
A
 
A
S
 
S
S
 
S
R
|
R
M
 
M
T
 
T
F
|
F
A
 
A
N
 
R
G
 
G
A
 
A
V
 
V
R
 
R
S
 
A
A
 
A
L
 
L
W
 
W
L
 
L
K
 
E
D
 
G
K
 
K
K
 
E
N
 
N
G
 
G
L
 
L
F
 
Y
D
 
D
M
 
M
R
 
Q
D
 
D
V
 
V
L
 
L
D
 
G
L
 
L
N
 
R

3ijpB Crystal structure of dihydrodipicolinate reductase from bartonella henselae at 2.0a resolution (see paper)
44% identity, 97% coverage: 6:271/273 of query aligns to 2:267/267 of 3ijpB

query
sites
3ijpB
I
 
M
R
 
R
V
 
L
A
 
T
I
 
V
A
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
N
G
 
G
R
 
R
M
 
M
G
 
G
R
 
R
Q
 
E
L
 
L
I
 
I
Q
 
T
A
 
A
A
x
I
L
x
Q
Q
 
R
M
x
R
E
 
K
G
 
D
V
|
V
A
x
E
L
 
L
G
 
C
A
 
A
A
 
V
L
 
L
E
 
V
R
 
R
E
 
K
G
 
G
S
 
S
S
 
S
L
 
F
V
 
V
G
 
D
S
 
K
D
 
D
A
 
A
G
 
S
E
 
I
L
 
L
A
 
I
G
 
G
A
 
S
G
 
D
K
 
F
A
 
L
G
 
G
V
 
V
A
 
R
V
 
I
Q
 
T
S
 
D
S
 
D
L
 
P
T
 
E
A
 
S
V
 
A
K
 
F
D
 
S
D
 
N
F
 
T
D
 
E
V
 
G
L
 
I
I
 
L
D
 
D
F
 
F
T
 
S
R
 
Q
P
 
P
E
 
Q
G
 
A
T
 
S
L
 
V
N
 
L
H
 
Y
L
 
A
A
 
N
F
 
Y
C
 
A
R
 
A
E
 
Q
H
 
K
G
 
S
K
 
L
G
 
I
M
 
H
V
 
I
I
 
I
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
F
 
F
D
 
S
D
 
K
A
 
T
G
 
E
K
 
E
Q
 
A
A
 
Q
I
 
I
R
 
A
D
 
D
A
 
F
A
 
A
Q
 
K
E
 
Y
I
 
T
A
 
T
I
 
I
V
 
V
F
 
K
A
 
S
A
 
G
N
 
N
F
 
M
S
 
S
V
 
L
G
 
G
V
 
V
N
 
N
V
 
L
L
 
L
L
 
A
K
 
N
L
 
L
L
 
V
E
 
K
K
 
R
A
 
A
A
 
A
K
 
K
V
 
A
M
 
L
G
 
D
D
 
D
Y
 
D
T
 
F
D
 
D
I
 
I
E
 
E
I
 
I
I
 
Y
E
 
E
A
 
M
H
|
H
H
 
H
R
 
A
H
 
N
K
|
K
V
 
V
D
 
D
A
 
S
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
L
A
 
L
M
 
L
G
 
G
E
 
Q
A
 
A
I
 
A
A
 
A
G
 
E
A
 
G
L
 
R
N
 
N
K
 
I
D
 
M
L
 
L
K
 
K
E
 
N
C
 
V
A
 
S
V
 
V
Y
 
N
S
 
G
R
 
R
E
 
S
G
 
G
H
 
H
T
 
T
G
 
G
E
 
K
R
 
R
V
 
E
P
 
K
G
 
G
T
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
A
T
 
C
V
 
S
R
 
R
A
 
G
G
 
G
D
 
T
I
 
V
V
 
I
G
 
G
E
 
D
H
 
H
T
 
S
A
 
I
M
 
T
F
 
F
A
 
A
D
 
G
I
 
E
G
 
N
E
 
E
R
 
R
I
 
I
E
 
V
I
 
L
T
 
S
H
 
H
K
 
I
A
 
A
S
 
Q
S
 
E
R
 
R
M
 
S
T
 
I
F
 
F
A
 
A
N
 
N
G
 
G
A
 
A
V
 
L
R
 
K
S
 
A
A
 
A
L
 
L
W
 
W
L
 
A
K
 
K
D
 
N
K
 
H
K
 
E
N
 
N
G
 
G
L
 
L
F
 
Y
D
 
S
M
 
M
R
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
D
 
G
L
 
L
N
 
N

3ijpA Crystal structure of dihydrodipicolinate reductase from bartonella henselae at 2.0a resolution (see paper)
43% identity, 97% coverage: 6:270/273 of query aligns to 2:266/266 of 3ijpA

query
sites
3ijpA
I
 
M
R
 
R
V
 
L
A
 
T
I
 
V
A
 
V
G
|
G
A
 
A
G
x
N
G
|
G
R
|
R
M
|
M
G
 
G
R
 
R
Q
 
E
L
 
L
I
 
I
Q
 
T
A
 
A
A
x
I
L
x
Q
Q
 
R
M
x
R
E
 
K
G
 
D
V
|
V
A
 
E
L
 
L
G
 
C
A
 
A
A
 
V
L
 
L
E
 
V
R
|
R
E
 
K
G
 
G
S
 
S
S
 
S
L
 
F
V
 
V
G
 
D
S
 
K
D
 
D
A
 
A
G
 
S
E
 
I
L
 
L
A
 
I
G
 
G
A
 
S
G
 
D
K
 
F
A
 
L
G
 
G
V
 
V
A
 
R
V
 
I
Q
 
T
S
 
D
S
 
D
L
 
P
T
 
E
A
 
S
V
 
A
K
 
F
D
 
S
D
 
N
F
 
T
D
 
E
V
 
G
L
 
I
I
 
L
D
 
D
F
|
F
T
x
S
R
x
Q
P
 
P
E
 
Q
G
x
A
T
 
S
L
 
V
N
 
L
H
 
Y
L
 
A
A
 
N
F
 
Y
C
 
A
R
 
A
E
 
Q
H
 
K
G
 
S
K
 
L
G
 
I
M
 
H
V
 
I
I
 
I
G
|
G
T
 
T
T
|
T
G
 
G
F
 
F
D
 
S
D
 
K
A
 
T
G
 
E
K
 
E
Q
 
A
A
 
Q
I
 
I
R
 
A
D
 
D
A
 
F
A
 
A
Q
 
K
E
 
Y
I
 
T
A
 
T
I
 
I
V
 
V
F
 
K
A
 
S
A
x
G
N
|
N
F
x
M
S
 
S
V
 
L
G
 
G
V
 
V
N
 
N
V
 
L
L
 
L
L
 
A
K
 
N
L
 
L
L
 
V
E
 
K
K
 
R
A
 
A
A
 
A
K
 
K
V
 
A
M
 
L
G
 
D
D
 
D
Y
 
D
T
 
F
D
 
D
I
 
I
E
 
E
I
 
I
I
 
Y
E
 
E
A
 
M
H
|
H
H
 
H
R
 
A
H
 
N
K
|
K
V
 
V
D
 
D
A
 
S
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
L
A
 
L
M
 
L
G
 
G
E
 
Q
A
 
A
I
 
A
A
 
A
G
 
E
A
 
G
L
 
R
N
 
N
K
 
I
D
 
M
L
 
L
K
 
K
E
 
N
C
 
V
A
 
S
V
 
V
Y
 
N
S
 
G
R
 
R
E
 
S
G
 
G
H
 
H
T
 
T
G
 
G
E
 
K
R
 
R
V
 
E
P
 
K
G
 
G
T
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
A
T
 
C
V
 
S
R
 
R
A
 
G
G
 
G
D
 
T
I
 
V
V
 
I
G
 
G
E
 
D
H
 
H
T
 
S
A
 
I
M
 
T
F
 
F
A
 
A
D
 
G
I
 
E
G
 
N
E
 
E
R
 
R
I
 
I
E
 
V
I
 
L
T
 
S
H
 
H
K
 
I
A
 
A
S
 
Q
S
 
E
R
 
R
M
 
S
T
 
I
F
|
F
A
 
A
N
 
N
G
 
G
A
 
A
V
 
L
R
 
K
S
 
A
A
 
A
L
 
L
W
 
W
L
 
A
K
 
K
D
 
N
K
 
H
K
 
E
N
 
N
G
 
G
L
 
L
F
 
Y
D
 
S
M
 
M
R
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
D
 
G
L
 
L

1vm6B Crystal structure of dihydrodipicolinate reductase (tm1520) from thermotoga maritima at 2.27 a resolution
33% identity, 98% coverage: 2:268/273 of query aligns to 2:217/218 of 1vm6B

query
sites
1vm6B
H
 
H
D
 
H
A
 
H
Q
 
H
I
 
M
R
 
K
V
 
Y
A
 
G
I
 
I
A
 
V
G
|
G
A
 
Y
G
x
S
G
|
G
R
|
R
M
|
M
G
 
G
R
 
Q
Q
 
E
L
 
-
I
 
I
Q
 
Q
A
 
K
A
 
V
L
 
F
Q
 
S
M
 
E
E
 
K
G
 
G
V
 
H
A
 
E
L
 
L
G
 
V
A
 
L
A
 
K
L
 
V
E
x
D
R
x
V
E
 
N
G
 
G
S
 
V
S
 
E
L
 
-
V
 
-
G
 
-
S
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
E
L
 
L
A
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
K
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
-
A
 
-
V
 
-
Q
 
-
S
 
-
S
 
-
L
 
-
T
 
-
A
 
-
V
 
-
K
 
-
D
 
D
D
 
S
F
 
P
D
 
D
V
 
V
L
 
V
I
 
I
D
 
D
F
|
F
T
x
S
R
x
S
P
 
P
E
|
E
G
x
A
T
 
L
L
 
P
N
 
K
H
 
T
L
 
V
A
 
D
F
 
L
C
 
C
R
 
K
E
 
K
H
 
Y
G
 
R
K
 
A
G
 
G
M
 
L
V
 
V
I
 
L
G
|
G
T
 
T
T
|
T
G
 
A
F
 
L
D
 
K
D
 
E
A
 
E
G
 
H
K
 
L
Q
 
Q
A
 
M
I
 
L
R
 
R
D
 
E
A
 
L
A
 
S
Q
 
K
E
 
E
I
 
V
A
 
P
I
 
V
V
 
V
F
 
Q
A
 
A
A
x
Y
N
|
N
F
|
F
S
 
S
V
 
I
G
 
G
V
 
I
N
 
N
V
 
V
L
 
L
L
 
K
K
 
R
L
 
F
L
 
L
E
 
S
K
 
E
A
 
L
A
 
V
K
 
K
V
 
V
M
 
L
G
 
E
D
 
D
Y
 
W
T
 
-
D
 
D
I
 
V
E
 
E
I
 
I
I
 
V
E
 
E
A
 
T
H
|
H
H
 
H
R
 
R
H
 
F
K
|
K
V
 
K
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
I
A
 
L
M
 
L
G
 
E
E
 
S
A
 
A
I
 
L
A
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
N
 
-
K
 
-
D
 
-
L
 
-
K
 
-
E
 
-
C
 
-
A
 
-
V
 
-
Y
 
-
S
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
-
H
 
-
T
 
-
G
 
G
E
 
K
R
 
S
V
 
V
P
 
P
G
 
-
T
 
-
I
 
-
G
 
-
F
 
I
A
 
H
T
 
S
V
 
L
R
 
R
A
 
V
G
 
G
D
 
G
I
 
V
V
 
P
G
 
G
E
 
D
H
 
H
T
 
V
A
 
V
M
 
V
F
 
F
A
 
G
D
 
N
I
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
T
I
 
I
E
 
E
I
 
I
T
 
K
H
 
H
K
 
R
A
 
A
S
 
I
S
 
S
R
 
R
M
 
T
T
 
V
F
|
F
A
 
A
N
 
I
G
 
G
A
 
A
V
 
L
R
 
K
S
 
A
A
 
A
L
 
E
W
 
F
L
 
L
K
 
V
D
 
G
K
 
K
K
 
D
N
 
P
G
 
G
L
 
M
F
 
Y
D
 
S
M
 
F
R
 
E
D
 
E
V
 
V
L
 
I

Q9X1K8 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductase; HTPA reductase; EC 1.17.1.8 from Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / DSM 3109 / JCM 10099 / NBRC 100826 / MSB8) (see paper)
37% identity, 73% coverage: 71:268/273 of query aligns to 40:212/216 of Q9X1K8

query
sites
Q9X1K8
D
 
D
D
 
S
F
 
P
D
 
D
V
 
V
L
 
V
I
 
I
D
 
D
F
 
F
T
 
S
R
 
S
P
 
P
E
 
E
G
 
A
T
 
L
L
 
P
N
 
K
H
 
T
L
 
V
A
 
D
F
 
L
C
 
C
R
 
K
E
 
K
H
 
Y
G
 
R
K
 
A
G
 
G
M
 
L
V
 
V
I
 
L
G
|
G
T
|
T
T
|
T
G
 
A
F
 
L
D
 
K
D
 
E
A
 
E
G
 
H
K
 
L
Q
 
Q
A
 
M
I
 
L
R
 
R
D
 
E
A
 
L
A
 
S
Q
 
K
E
 
E
I
 
V
A
 
P
I
 
V
V
 
V
F
 
Q
A
|
A
A
x
Y
N
|
N
F
|
F
S
 
S
V
 
I
G
 
G
V
 
I
N
 
N
V
 
V
L
 
L
L
 
K
K
 
R
L
 
F
L
 
L
E
 
S
K
 
E
A
 
L
A
 
V
K
 
K
V
 
V
M
 
L
G
 
E
D
 
D
Y
 
W
T
 
-
D
 
D
I
 
V
E
 
E
I
 
I
I
 
V
E
 
E
A
 
T
H
 
H
H
 
H
R
 
R
H
 
F
K
|
K
V
 
K
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
I
A
 
L
M
 
L
G
 
E
E
 
S
A
 
A
I
 
L
A
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
N
 
-
K
 
-
D
 
-
L
 
-
K
 
-
E
 
-
C
 
-
A
 
-
V
 
-
Y
 
-
S
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
-
H
 
-
T
 
-
G
 
G
E
 
K
R
 
S
V
 
V
P
 
P
G
 
-
T
 
-
I
 
-
G
 
-
F
 
I
A
 
H
T
 
S
V
 
L
R
 
R
A
 
V
G
 
G
D
 
G
I
 
V
V
 
P
G
 
G
E
 
D
H
 
H
T
 
V
A
 
V
M
 
V
F
 
F
A
 
G
D
 
N
I
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
T
I
 
I
E
 
E
I
 
I
T
 
K
H
 
H
K
 
R
A
 
A
S
 
I
S
 
S
R
 
R
M
 
T
T
 
V
F
 
F
A
 
A
N
 
I
G
 
G
A
 
A
V
 
L
R
 
K
S
 
A
A
 
A
L
 
E
W
 
F
L
 
L
K
 
V
D
 
G
K
 
K
K
 
D
N
 
P
G
 
G
L
 
M
F
 
Y
D
 
S
M
 
F
R
 
E
D
 
E
V
 
V
L
 
I

Sites not aligning to the query:

5z2fA NADPH/pda bound dihydrodipicolinate reductase from paenisporosarcina sp. Tg-14 (see paper)
27% identity, 96% coverage: 6:268/273 of query aligns to 3:265/265 of 5z2fA

query
sites
5z2fA
I
 
I
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
G
G
 
G
A
 
P
G
x
R
G
|
G
R
x
K
M
|
M
G
 
G
R
 
Q
Q
 
E
L
 
A
I
 
V
Q
 
H
A
 
T
A
 
V
L
 
M
Q
 
N
M
 
N
E
 
E
G
 
N
V
 
M
A
 
E
L
 
L
G
 
V
A
 
A
A
 
V
L
 
L
E
x
D
R
x
H
E
x
K
G
 
D
S
 
I
S
 
G
L
 
D
V
 
L
G
 
L
S
 
S
D
 
E
A
 
S
G
 
P
E
 
N
L
 
F
A
 
P
G
 
A
A
 
S
G
 
Y
K
 
E
A
 
V
G
 
P
V
 
V
A
 
F
V
 
L
Q
 
N
S
 
L
S
 
E
L
 
S
T
 
L
A
 
I
V
 
V
K
 
T
D
 
I
D
 
K
F
 
P
D
 
D
V
 
V
L
 
F
I
 
L
D
 
D
F
x
L
T
|
T
R
 
T
P
 
P
E
 
H
G
 
Q
T
 
V
L
 
F
N
 
E
H
 
H
L
 
T
A
 
M
F
 
L
C
 
C
R
 
L
E
 
Q
H
 
N
G
 
N
K
 
V
G
 
R
M
 
P
V
 
V
I
 
I
G
|
G
T
|
T
T
|
T
G
 
G
F
 
F
D
 
T
D
 
D
A
 
E
G
 
Q
K
 
L
Q
 
Q
-
 
Q
-
 
C
A
 
T
I
 
I
R
 
L
D
 
A
A
 
E
A
 
V
Q
 
N
E
 
K
I
 
L
A
 
G
I
 
C
V
 
I
F
 
V
A
 
A
A
x
P
N
|
N
F
|
F
S
 
A
V
 
I
G
 
G
V
 
A
N
 
V
V
 
L
L
 
M
L
 
M
K
 
K
L
 
F
L
 
A
E
 
S
K
 
L
A
 
A
A
 
A
K
 
A
V
 
Y
M
 
-
G
 
-
D
 
-
Y
 
F
T
 
P
D
 
D
I
 
V
E
 
E
I
 
I
I
 
I
E
 
E
A
 
M
H
|
H
H
|
H
R
 
D
H
 
Q
K
|
K
V
 
L
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
|
S
G
|
G
T
|
T
A
 
A
L
 
Y
A
 
K
M
 
T
G
 
A
E
 
Q
A
 
M
I
 
I
A
 
A
G
 
-
A
 
-
L
 
-
N
 
-
K
 
-
D
 
-
L
 
-
K
 
-
E
 
E
C
 
V
A
 
R
V
 
P
Y
 
S
S
 
H
R
 
K
E
 
Q
G
 
G
H
 
H
T
 
P
G
 
N
E
 
E
R
 
K
-
 
E
-
 
T
V
 
L
P
 
E
G
 
G
T
 
A
-
 
R
-
 
G
-
 
A
-
 
S
-
 
Y
-
 
D
-
 
G
I
 
I
G
 
P
F
 
I
A
 
H
T
 
S
V
 
V
R
 
R
A
 
L
G
 
P
D
 
G
I
 
L
V
 
I
G
x
A
E
 
H
H
 
Q
T
 
Q
A
 
I
M
 
L
F
 
F
A
 
G
D
 
G
I
 
E
G
 
G
E
 
Q
R
 
L
I
 
F
E
 
T
I
 
L
T
 
R
H
 
H
K
 
D
A
 
S
S
 
Y
S
 
N
R
 
R
M
 
Q
T
 
S
F
 
F
A
 
M
N
 
S
G
 
G
A
 
V
V
 
T
R
 
F
S
 
S
A
 
I
L
 
N
W
 
Q
L
 
V
K
 
M
D
 
E
K
 
I
K
 
K
N
 
E
G
 
L
L
 
V
F
 
Y
D
 
G
M
 
L
R
 
E
D
 
N
V
 
I
L
 
L

5z2eA Dipicolinate bound dihydrodipicolinate reductase from paenisporosarcina sp. Tg-14 (see paper)
27% identity, 96% coverage: 6:268/273 of query aligns to 3:265/265 of 5z2eA

query
sites
5z2eA
I
 
I
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
G
G
 
G
A
 
P
G
 
R
G
 
G
R
 
K
M
 
M
G
 
G
R
 
Q
Q
 
E
L
 
A
I
 
V
Q
 
H
A
 
T
A
 
V
L
 
M
Q
 
N
M
 
N
E
 
E
G
 
N
V
 
M
A
 
E
L
 
L
G
 
V
A
 
A
A
 
V
L
 
L
E
 
D
R
 
H
E
 
K
G
 
D
S
 
I
S
 
G
L
 
D
V
 
L
G
 
L
S
 
S
D
 
E
A
 
S
G
 
P
E
 
N
L
 
F
A
 
P
G
 
A
A
 
S
G
 
Y
K
 
E
A
 
V
G
 
P
V
 
V
A
 
F
V
 
L
Q
 
N
S
 
L
S
 
E
L
 
S
T
 
L
A
 
I
V
 
V
K
 
T
D
 
I
D
 
K
F
 
P
D
 
D
V
 
V
L
 
F
I
 
L
D
 
D
F
 
L
T
 
T
R
 
T
P
 
P
E
 
H
G
 
Q
T
 
V
L
 
F
N
 
E
H
 
H
L
 
T
A
 
M
F
 
L
C
 
C
R
 
L
E
 
Q
H
 
N
G
 
N
K
 
V
G
 
R
M
 
P
V
 
V
I
 
I
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
F
 
F
D
 
T
D
 
D
A
 
E
G
 
Q
K
 
L
Q
 
Q
-
 
Q
-
 
C
A
 
T
I
 
I
R
 
L
D
 
A
A
 
E
A
 
V
Q
 
N
E
 
K
I
 
L
A
 
G
I
 
C
V
 
I
F
 
V
A
 
A
A
 
P
N
 
N
F
 
F
S
 
A
V
 
I
G
 
G
V
 
A
N
 
V
V
 
L
L
 
M
L
 
M
K
 
K
L
 
F
L
 
A
E
 
S
K
 
L
A
 
A
A
 
A
K
 
A
V
 
Y
M
 
-
G
 
-
D
 
-
Y
 
F
T
 
P
D
 
D
I
 
V
E
 
E
I
 
I
I
 
I
E
 
E
A
 
M
H
|
H
H
|
H
R
 
D
H
 
Q
K
|
K
V
 
L
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
|
S
G
|
G
T
|
T
A
 
A
L
 
Y
A
 
K
M
 
T
G
 
A
E
 
Q
A
 
M
I
 
I
A
 
A
G
 
-
A
 
-
L
 
-
N
 
-
K
 
-
D
 
-
L
 
-
K
 
-
E
 
E
C
 
V
A
 
R
V
 
P
Y
 
S
S
 
H
R
 
K
E
 
Q
G
 
G
H
 
H
T
 
P
G
 
N
E
 
E
R
 
K
-
 
E
-
 
T
V
 
L
P
 
E
G
 
G
T
 
A
-
 
R
-
 
G
-
 
A
-
 
S
-
 
Y
-
 
D
-
 
G
I
 
I
G
 
P
F
 
I
A
 
H
T
 
S
V
 
V
R
 
R
A
 
L
G
 
P
D
 
G
I
 
L
V
 
I
G
 
A
E
 
H
H
 
Q
T
 
Q
A
 
I
M
 
L
F
 
F
A
 
G
D
 
G
I
 
E
G
 
G
E
 
Q
R
 
L
I
 
F
E
 
T
I
 
L
T
 
R
H
 
H
K
 
D
A
 
S
S
 
Y
S
 
N
R
 
R
M
 
Q
T
 
S
F
 
F
A
 
M
N
 
S
G
 
G
A
 
V
V
 
T
R
 
F
S
 
S
A
 
I
L
 
N
W
 
Q
L
 
V
K
 
M
D
 
E
K
 
I
K
 
K
N
 
E
G
 
L
L
 
V
F
 
Y
D
 
G
M
 
L
R
 
E
D
 
N
V
 
I
L
 
L

5eesA Crystal structure of dapb in complex with NADP+ from corynebacterium glutamicum (see paper)
30% identity, 89% coverage: 6:248/273 of query aligns to 2:225/247 of 5eesA

query
sites
5eesA
I
 
I
R
 
K
V
 
V
A
 
G
I
 
V
A
 
L
G
|
G
A
 
A
G
 
K
G
|
G
R
|
R
M
x
V
G
 
G
R
 
Q
Q
 
T
L
 
I
I
 
V
Q
 
A
A
 
A
A
 
V
L
 
N
Q
 
E
M
 
-
E
 
-
G
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
-
S
 
-
S
 
-
L
 
-
V
 
-
G
 
-
S
 
S
D
 
D
A
 
D
G
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
V
G
 
-
A
 
-
G
 
-
K
 
-
A
 
A
G
 
E
V
 
I
A
x
G
V
|
V
Q
 
D
S
 
D
S
 
D
L
 
L
T
 
S
A
 
L
V
 
L
K
 
V
D
 
D
D
 
N
-
 
G
F
 
A
D
 
E
V
 
V
L
 
V
I
 
V
D
 
D
F
|
F
T
|
T
R
 
T
P
 
P
E
 
N
G
 
A
T
 
V
L
 
M
N
 
G
H
 
N
L
 
L
A
 
E
F
 
F
C
 
C
R
 
I
E
 
N
H
 
N
G
 
G
K
 
I
G
 
S
M
 
A
V
 
V
I
 
V
G
|
G
T
 
T
T
|
T
G
 
G
F
 
F
D
 
D
D
 
D
A
 
A
G
 
R
K
 
L
Q
 
E
A
 
Q
I
 
V
R
 
R
D
 
D
A
 
W
A
 
L
Q
 
E
-
 
G
-
 
K
-
 
D
E
 
N
I
 
V
A
 
G
I
 
V
V
 
L
F
 
I
A
 
A
A
x
P
N
|
N
F
|
F
S
 
A
V
 
I
G
 
S
V
 
A
N
 
V
V
 
L
L
 
T
L
 
M
K
 
V
L
 
F
L
 
S
E
 
K
K
 
Q
A
 
A
A
 
A
K
 
R
V
 
F
M
 
-
G
 
-
D
 
-
Y
 
F
T
 
E
D
 
S
I
 
A
E
 
E
I
 
V
I
 
I
E
 
E
A
 
L
H
|
H
H
|
H
R
 
P
H
 
N
K
|
K
V
 
L
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
|
G
T
|
T
A
 
A
L
 
I
A
 
H
M
 
T
G
 
A
E
 
Q
A
 
G
I
 
I
A
 
A
G
 
A
A
 
A
-
 
R
-
 
K
-
 
E
-
 
A
-
 
G
-
 
M
-
 
D
L
 
A
N
 
Q
K
 
P
D
 
D
L
 
A
K
 
T
E
 
E
C
 
Q
A
 
A
V
 
L
Y
 
-
S
 
-
R
 
-
E
 
E
G
 
G
H
 
S
T
 
R
G
 
G
E
 
A
R
 
S
V
 
V
P
 
D
G
 
G
T
 
-
I
 
I
G
 
P
F
 
V
A
 
H
T
 
A
V
 
V
R
 
R
A
 
M
G
 
S
D
 
G
I
 
M
V
 
V
G
 
A
E
 
H
H
 
E
T
 
Q
A
 
V
M
 
I
F
 
F
A
 
G
D
 
T
I
 
Q
G
 
G
E
 
Q
R
 
T
I
 
L
E
 
T
I
 
I
T
 
K
H
 
Q
K
 
D
A
 
S
S
 
Y
S
 
D
R
 
R
M
 
N
T
 
S
F
|
F
A
 
A
N
 
P
G
 
G
A
 
V
V
 
L

5eerA Crystal structure of dapb from corynebacterium glutamicum (see paper)
30% identity, 89% coverage: 6:248/273 of query aligns to 2:225/247 of 5eerA

query
sites
5eerA
I
 
I
R
 
K
V
 
V
A
 
G
I
 
V
A
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
K
G
 
G
R
 
R
M
 
V
G
 
G
R
 
Q
Q
 
T
L
 
I
I
 
V
Q
 
A
A
 
A
A
 
V
L
 
N
Q
 
E
M
 
-
E
 
-
G
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
-
S
 
-
S
 
-
L
 
-
V
 
-
G
 
-
S
 
S
D
 
D
A
 
D
G
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
V
G
 
-
A
 
-
G
 
-
K
 
-
A
 
A
G
 
E
V
 
I
A
 
G
V
 
V
Q
 
D
S
 
D
S
 
D
L
 
L
T
 
S
A
 
L
V
 
L
K
 
V
D
 
D
D
 
N
-
 
G
F
 
A
D
 
E
V
 
V
L
 
V
I
 
V
D
 
D
F
 
F
T
 
T
R
 
T
P
 
P
E
 
N
G
 
A
T
 
V
L
 
M
N
 
G
H
 
N
L
 
L
A
 
E
F
 
F
C
 
C
R
 
I
E
 
N
H
 
N
G
 
G
K
 
I
G
 
S
M
 
A
V
 
V
I
 
V
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
F
 
F
D
 
D
D
 
D
A
 
A
G
 
R
K
 
L
Q
 
E
A
 
Q
I
 
V
R
 
R
D
 
D
A
 
W
A
 
L
Q
 
E
-
 
G
-
 
K
-
 
D
E
 
N
I
 
V
A
 
G
I
 
V
V
 
L
F
 
I
A
 
A
A
 
P
N
 
N
F
 
F
S
 
A
V
 
I
G
 
S
V
 
A
N
 
V
V
 
L
L
 
T
L
 
M
K
 
V
L
 
F
L
 
S
E
 
K
K
 
Q
A
 
A
A
 
A
K
 
R
V
 
F
M
 
-
G
 
-
D
 
-
Y
 
F
T
 
E
D
 
S
I
 
A
E
 
E
I
 
V
I
 
I
E
 
E
A
 
L
H
|
H
H
|
H
R
 
P
H
 
N
K
|
K
V
 
L
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
|
S
G
|
G
T
|
T
A
 
A
L
 
I
A
 
H
M
 
T
G
 
A
E
 
Q
A
 
G
I
 
I
A
 
A
G
 
A
A
 
A
-
 
R
-
 
K
-
 
E
-
 
A
-
 
G
-
 
M
-
 
D
L
 
A
N
 
Q
K
 
P
D
 
D
L
 
A
K
 
T
E
 
E
C
 
Q
A
 
A
V
 
L
Y
 
-
S
 
-
R
 
-
E
 
E
G
 
G
H
 
S
T
 
R
G
 
G
E
 
A
R
 
S
V
 
V
P
 
D
G
 
G
T
 
-
I
 
I
G
 
P
F
 
V
A
 
H
T
 
A
V
 
V
R
 
R
A
 
M
G
 
S
D
 
G
I
 
M
V
 
V
G
 
A
E
 
H
H
 
E
T
 
Q
A
 
V
M
 
I
F
 
F
A
 
G
D
 
T
I
 
Q
G
 
G
E
 
Q
R
 
T
I
 
L
E
 
T
I
 
I
T
 
K
H
 
Q
K
 
D
A
 
S
S
 
Y
S
 
D
R
 
R
M
 
N
T
 
S
F
 
F
A
 
A
N
 
P
G
 
G
A
 
V
V
 
L

1p9lA Structure of m. Tuberculosis dihydrodipicolinate reductase in complex with nadh and 2,6 pdc (see paper)
28% identity, 97% coverage: 6:271/273 of query aligns to 1:245/245 of 1p9lA

query
sites
1p9lA
I
 
M
R
 
R
V
 
V
A
 
G
I
 
V
A
 
L
G
|
G
A
 
A
G
 
K
G
|
G
R
x
K
M
x
V
G
 
G
R
 
T
Q
 
T
L
 
M
I
 
V
Q
 
R
A
 
A
A
 
V
L
 
A
Q
 
A
M
 
A
E
 
D
G
 
D
V
 
L
A
 
T
L
 
L
G
 
S
A
 
A
A
 
E
L
 
L
E
 
-
R
 
-
E
 
-
G
 
-
S
 
-
S
 
-
L
 
-
V
 
-
G
 
-
S
 
-
D
|
D
A
|
A
G
 
G
E
 
D
L
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
K
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
-
A
 
-
V
 
-
Q
 
-
S
 
-
S
 
P
L
 
L
T
 
S
A
 
L
V
 
L
K
 
T
D
 
D
-
 
G
D
 
N
F
 
T
D
 
E
V
 
V
L
 
V
I
 
I
D
 
D
F
|
F
T
|
T
R
 
H
P
 
P
E
 
D
G
x
V
T
 
V
L
 
M
N
 
G
H
 
N
L
 
L
A
 
E
F
 
F
C
 
L
R
 
I
E
 
D
H
 
N
G
 
G
K
 
I
G
 
H
M
 
A
V
 
V
I
 
V
G
|
G
T
 
T
T
|
T
G
 
G
F
 
F
D
 
T
D
 
A
A
 
E
G
 
R
K
 
F
Q
 
Q
A
 
Q
I
 
V
R
 
E
D
 
S
-
 
W
-
 
L
-
 
V
A
 
A
A
 
K
Q
 
P
E
 
N
I
 
T
A
 
S
I
 
V
V
 
L
F
 
I
A
 
A
A
x
P
N
|
N
F
|
F
S
 
A
V
 
I
G
 
G
V
 
A
N
 
V
V
 
L
L
 
S
L
 
M
K
 
H
L
 
F
L
 
A
E
 
K
K
 
Q
A
 
A
A
 
A
K
 
R
V
 
F
M
 
-
G
 
-
D
 
-
Y
 
F
T
 
D
D
 
S
I
 
A
E
 
E
I
 
V
I
 
I
E
 
E
A
 
L
H
|
H
H
|
H
R
 
P
H
 
H
K
|
K
V
 
A
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
|
S
G
|
G
T
|
T
A
 
A
L
 
A
A
 
R
M
 
T
G
 
A
E
 
K
A
 
L
I
 
I
A
 
A
G
 
E
A
 
A
L
 
R
N
 
K
-
 
G
-
 
L
K
 
P
D
 
P
L
 
N
K
 
P
E
 
D
C
 
A
A
 
T
V
 
S
Y
 
T
S
 
S
R
 
L
E
 
P
G
 
G
H
 
A
T
 
R
G
 
G
E
 
A
R
 
D
V
 
V
P
 
D
G
 
G
T
 
-
I
 
I
G
 
P
F
 
V
A
 
H
T
 
A
V
 
V
R
 
R
A
 
L
G
 
A
D
 
G
I
 
L
V
 
V
G
x
A
E
 
H
H
 
Q
T
 
E
A
 
V
M
 
L
F
 
F
A
 
G
D
 
T
I
 
E
G
 
G
E
 
E
R
 
T
I
 
L
E
 
T
I
 
I
T
 
R
H
 
H
K
 
D
A
 
S
S
 
L
S
 
D
R
 
R
M
 
T
T
 
S
F
|
F
A
 
V
N
 
P
G
 
G
A
 
V
V
 
L
R
 
L
S
 
A
A
 
V
L
 
R
W
 
R
L
 
I
K
 
A
D
 
E
K
 
R
K
 
P
N
 
G
G
 
L
L
 
T
F
 
V
D
 
G
M
 
L
R
 
E
D
 
P
V
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
N
 
H

Query Sequence

>WP_008807487.1 NCBI__GCF_000025465.1:WP_008807487.1
MHDAQIRVAIAGAGGRMGRQLIQAALQMEGVALGAALEREGSSLVGSDAGELAGAGKAGV
AVQSSLTAVKDDFDVLIDFTRPEGTLNHLAFCREHGKGMVIGTTGFDDAGKQAIRDAAQE
IAIVFAANFSVGVNVLLKLLEKAAKVMGDYTDIEIIEAHHRHKVDAPSGTALAMGEAIAG
ALNKDLKECAVYSREGHTGERVPGTIGFATVRAGDIVGEHTAMFADIGERIEITHKASSR
MTFANGAVRSALWLKDKKNGLFDMRDVLDLNSL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory