SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_008859401.1 NCBI__GCF_000242435.1:WP_008859401.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1wwkA Crystal structure of phosphoglycerate dehydrogenase from pyrococcus horikoshii ot3
39% identity, 88% coverage: 32:307/314 of query aligns to 24:304/304 of 1wwkA

query
sites
1wwkA
T
 
V
L
 
I
W
 
Y
D
 
E
S
 
E
L
 
Y
P
 
P
E
 
-
N
 
D
Q
 
E
E
 
D
D
 
R
L
 
L
G
 
V
N
 
E
R
 
L
I
 
V
S
 
K
K
 
D
A
 
V
D
 
E
L
 
A
V
 
I
V
 
I
I
 
V
A
 
R
N
 
S
Y
 
K
P
 
P
-
 
K
L
 
V
K
 
T
K
 
R
E
 
R
A
 
V
L
 
I
D
 
E
K
 
S
A
 
A
S
 
P
S
 
K
L
 
L
K
 
K
Y
 
V
L
 
I
C
 
A
V
 
R
A
 
A
F
 
G
T
 
V
G
 
G
V
 
L
D
 
D
H
 
N
V
 
I
D
 
D
I
 
V
D
 
E
T
 
A
C
 
A
R
 
K
E
 
E
K
 
K
G
 
G
I
 
I
A
 
E
V
 
V
S
 
V
N
 
N
C
 
A
A
 
P
G
 
A
Y
 
A
S
|
S
T
 
S
E
 
R
S
 
S
V
|
V
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
A
I
 
V
G
 
G
M
 
L
M
 
M
L
 
F
S
 
S
L
 
V
Y
 
A
R
 
R
K
 
K
L
 
I
A
 
A
E
 
F
G
 
A
K
 
D
D
 
R
A
 
K
A
 
M
T
 
R
H
 
E
G
 
G
K
 
V
T
 
W
G
 
A
A
 
K
G
 
K
-
 
E
L
 
A
R
 
M
G
 
G
I
 
I
E
 
E
I
 
L
K
 
E
D
 
G
R
 
K
T
 
T
V
 
I
G
 
G
I
 
I
I
 
I
G
|
G
T
x
F
G
|
G
A
x
R
I
|
I
G
 
G
Y
 
Y
R
 
Q
T
 
V
A
 
A
N
 
K
L
 
I
A
 
A
K
 
N
A
 
A
F
 
L
G
 
G
A
 
M
K
 
N
V
 
I
I
 
L
G
 
L
Y
|
Y
N
x
D
R
x
P
S
 
Y
H
 
P
S
 
N
H
 
E
D
 
E
D
 
R
I
 
A
T
 
K
-
 
E
-
 
V
-
 
N
-
 
G
-
 
K
Y
 
F
T
 
V
N
 
D
L
 
L
N
 
E
T
 
T
L
 
L
L
 
L
Q
 
K
T
 
E
S
 
S
D
 
D
I
 
V
V
 
V
S
 
T
I
 
I
H
 
H
L
x
V
P
|
P
L
 
L
T
 
V
I
 
E
D
 
S
T
|
T
K
 
Y
H
 
H
F
 
L
I
 
I
D
 
N
K
 
E
D
 
E
K
 
R
L
 
L
S
 
K
L
 
L
M
 
M
K
 
K
K
 
K
D
 
T
A
 
A
I
 
I
L
 
L
I
 
I
N
 
N
T
|
T
A
x
S
R
|
R
G
 
G
G
 
P
I
 
V
I
 
V
D
 
D
N
 
T
E
 
N
A
 
A
L
 
L
A
 
V
E
 
K
A
 
A
L
 
L
K
 
K
K
 
E
G
 
G
E
 
W
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
D
 
E
M
 
-
E
 
E
P
x
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
E
 
K
D
 
D
Y
 
H
P
 
P
L
 
L
L
 
T
S
 
K
A
 
F
P
 
D
H
 
N
T
 
V
V
 
V
L
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
I
G
|
G
F
 
A
D
 
S
T
 
T
E
 
V
E
 
E
A
 
A
M
 
Q
E
 
E
R
 
R
R
 
A
A
 
G
A
 
V
I
 
E
V
 
V
A
 
A
D
 
E
N
 
K
L
 
V
K
 
V
S
 
K
F
 
I
V
 
L
E
 
K
G
 
G

3kb6B Crystal structure of d-lactate dehydrogenase from aquifex aeolicus complexed with NAD and lactic acid (see paper)
35% identity, 85% coverage: 46:312/314 of query aligns to 38:325/334 of 3kb6B

query
sites
3kb6B
N
 
N
R
 
E
I
 
L
S
 
K
K
 
K
A
 
A
D
 
E
L
 
L
V
 
I
V
 
S
I
 
V
A
x
F
N
 
V
Y
 
Y
-
 
D
P
 
K
L
 
L
K
 
T
K
 
E
E
 
E
A
 
L
L
 
L
D
 
S
K
 
K
A
 
M
S
 
P
S
 
R
L
 
L
K
 
K
Y
 
L
L
 
I
C
 
H
V
 
T
A
 
R
F
x
S
T
x
V
G
|
G
V
 
F
D
 
D
H
 
H
V
 
I
D
 
D
I
 
L
D
 
D
T
 
Y
C
 
C
R
 
K
E
 
K
K
 
K
G
 
G
I
 
I
A
 
L
V
 
V
S
 
T
N
 
H
C
 
I
A
 
P
G
 
A
Y
|
Y
S
|
S
T
 
P
E
 
E
S
 
S
V
|
V
A
 
A
E
 
E
L
 
H
A
 
T
I
 
F
G
 
A
M
 
M
M
 
I
L
 
L
S
 
T
L
 
L
Y
 
V
R
 
K
K
 
R
L
 
L
A
 
K
E
 
R
G
 
I
K
 
E
D
 
D
A
 
R
A
 
V
T
 
K
-
 
K
-
 
L
H
 
N
G
 
F
K
 
S
T
 
Q
G
 
D
A
 
S
G
 
E
L
 
I
R
 
L
G
 
A
I
 
R
E
 
E
I
 
L
K
 
N
D
 
R
R
 
L
T
 
T
V
 
L
G
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
|
G
A
x
R
I
|
I
G
 
G
Y
 
S
R
 
R
T
 
V
A
 
A
N
 
M
L
 
Y
A
 
G
K
 
L
A
 
A
F
 
F
G
 
G
A
 
M
K
 
K
V
 
V
I
 
L
G
 
C
Y
 
Y
N
x
D
R
x
V
S
 
V
H
 
K
S
 
R
H
 
E
D
 
D
-
 
L
-
 
K
-
 
E
-
 
K
D
 
G
I
 
C
T
 
V
Y
 
Y
T
 
T
N
 
S
L
 
L
N
 
D
T
 
E
L
 
L
L
 
L
Q
 
K
T
 
E
S
 
S
D
 
D
I
 
V
V
 
I
S
 
S
I
 
L
H
 
H
L
 
V
P
|
P
L
 
Y
T
 
T
I
 
K
D
 
E
T
 
T
K
 
H
H
 
H
F
 
M
I
 
I
D
 
N
K
 
E
D
 
E
K
 
R
L
 
I
S
 
S
L
 
L
M
 
M
K
 
K
K
 
D
D
 
G
A
 
V
I
 
Y
L
 
L
I
 
I
N
 
N
T
|
T
A
|
A
R
|
R
G
 
G
G
 
K
I
 
V
I
 
V
D
 
D
N
 
T
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
Y
E
 
R
A
 
A
L
 
Y
K
 
Q
K
 
R
G
 
G
E
 
K
I
 
F
A
 
S
G
 
G
A
 
L
G
 
G
I
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
-
 
E
D
 
D
M
x
E
E
 
E
P
 
I
P
 
L
L
 
I
P
 
L
E
 
K
D
 
K
Y
 
Y
-
 
T
-
 
E
-
 
G
-
 
K
-
 
A
-
 
T
-
 
D
-
 
K
-
 
N
-
 
L
-
 
K
-
 
I
-
 
L
P
 
E
L
 
L
L
 
A
S
 
C
A
 
K
P
 
D
H
 
N
T
 
V
V
 
I
L
 
I
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
I
G
x
A
F
x
Y
D
 
Y
T
 
T
E
 
D
E
 
K
A
 
S
M
 
L
E
 
E
R
 
R
R
 
I
A
 
R
A
 
E
I
 
E
V
 
T
A
 
V
D
 
K
N
 
V
L
 
V
K
 
K
S
 
A
F
 
F
V
 
V
E
 
K
G
 
G
K
 
D
Q
 
L
K
 
E
N
 
Q
I
 
I

6p2iA Acyclic imino acid reductase (bsp5) in complex with NADPH and d-arg (see paper)
35% identity, 87% coverage: 40:313/314 of query aligns to 34:306/307 of 6p2iA

query
sites
6p2iA
N
 
N
Q
 
E
E
 
E
D
 
E
L
 
A
G
 
I
N
 
N
R
 
R
I
 
L
S
 
S
K
 
S
A
 
T
D
 
D
L
 
I
V
 
A
V
 
I
I
 
V
A
x
E
N
 
W
Y
 
T
P
 
S
L
 
I
K
 
T
K
 
K
E
 
E
A
 
M
L
 
I
D
 
E
K
 
K
A
 
I
S
 
S
S
 
R
L
 
L
K
 
K
Y
 
Y
L
 
L
C
 
I
V
 
T
A
 
I
F
x
T
T
|
T
G
x
S
V
 
Y
D
 
D
H
 
Y
V
 
I
D
 
D
I
 
V
D
 
N
T
 
S
C
 
L
R
 
K
E
 
D
K
 
N
G
 
E
I
 
I
A
 
M
V
 
V
S
 
S
N
 
N
C
 
C
A
 
P
G
 
Q
Y
|
Y
S
|
S
T
 
K
E
 
Q
S
 
A
V
|
V
A
 
A
E
 
E
L
 
H
A
 
V
I
 
F
G
 
A
M
 
L
M
 
L
L
 
F
S
 
A
L
 
V
Y
 
N
R
 
R
K
 
K
L
 
I
A
 
L
E
 
Q
G
 
A
K
 
D
D
 
E
A
 
T
A
 
C
T
 
R
H
 
K
G
 
G
K
 
L
T
 
S
G
 
H
-
 
I
-
 
Y
A
 
P
G
 
P
L
 
F
R
 
L
G
 
C
I
 
S
E
 
E
I
 
I
K
 
R
D
 
D
R
 
K
T
 
T
V
 
I
G
 
G
I
 
L
I
 
I
G
|
G
T
x
I
G
|
G
A
x
Q
I
|
I
G
 
G
Y
 
Q
R
 
T
T
 
V
A
 
A
N
 
E
L
 
I
A
 
A
K
 
N
A
 
A
F
 
F
G
 
Q
A
 
M
K
 
K
V
 
V
I
 
I
G
 
G
Y
 
L
N
|
N
R
x
K
S
|
S
H
 
K
S
x
R
H
 
N
-
 
V
D
 
K
D
 
G
I
 
I
T
 
Q
Y
 
Q
T
 
V
N
 
D
L
 
I
N
 
T
T
 
E
L
 
L
L
 
M
Q
 
K
T
 
K
S
 
S
D
 
D
I
 
I
V
 
I
S
 
S
I
 
L
H
|
H
L
x
I
P
|
P
L
 
R
T
 
N
I
 
A
D
 
D
T
|
T
K
 
E
H
 
I
F
 
I
I
 
L
D
 
T
K
 
E
D
 
K
K
 
L
L
 
L
S
 
S
L
 
L
M
 
M
K
 
K
K
 
P
D
 
D
A
 
A
I
 
V
L
 
L
I
 
I
N
 
N
T
|
T
A
x
C
R
 
R
G
 
G
G
 
N
I
 
L
I
 
I
D
 
D
N
 
E
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
Y
E
 
S
A
 
V
L
 
L
K
 
K
K
 
Q
G
 
N
E
 
R
I
 
I
A
 
R
G
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
L
D
 
D
V
 
-
F
 
-
D
 
-
M
 
-
E
 
D
P
 
L
P
 
T
L
 
Y
P
 
Y
E
 
K
D
 
D
Y
 
N
P
 
P
L
 
I
L
 
I
S
 
G
A
 
L
P
 
N
H
 
N
T
 
V
V
 
V
L
 
L
T
 
T
P
 
P
H
 
G
V
 
S
G
 
A
F
x
W
D
 
Y
T
 
S
E
 
Y
E
 
E
A
 
A
M
 
R
E
 
E
R
 
K
R
 
N
A
 
M
A
 
Y
I
 
E
V
 
L
A
 
I
D
 
E
N
 
N
L
 
I
K
 
E
S
 
S
F
 
Y
V
 
L
E
 
A
G
 
Q
K
 
K
Q
 
P
K
 
V
N
 
N
I
 
V
I
 
I

5aovA Ternary crystal structure of pyrococcus furiosus glyoxylate hydroxypyruvate reductase in presence of glyoxylate (see paper)
35% identity, 85% coverage: 41:308/314 of query aligns to 36:315/334 of 5aovA

query
sites
5aovA
Q
 
R
E
 
E
D
 
K
L
 
L
G
 
L
N
 
E
R
 
K
I
 
V
S
 
K
K
 
D
A
 
V
D
 
D
-
 
A
L
 
L
V
 
V
V
 
T
I
x
M
A
x
L
N
 
S
Y
 
E
P
 
R
L
 
I
K
 
D
K
 
Q
E
 
E
A
 
V
L
 
F
D
 
E
K
 
N
A
 
A
S
 
P
S
 
R
L
 
L
K
 
R
Y
 
I
L
 
V
C
 
A
V
 
N
A
x
Y
F
x
A
T
x
V
G
|
G
V
 
Y
D
 
D
H
 
N
V
 
I
D
 
D
I
 
V
D
 
E
T
 
E
C
 
A
R
 
T
E
 
R
K
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
Y
V
 
V
S
 
T
N
 
N
C
 
T
A
 
P
G
 
D
Y
 
V
S
x
L
T
 
T
E
 
N
S
 
A
V
x
T
A
 
A
E
 
D
L
 
H
A
 
A
I
 
F
G
 
A
M
 
L
M
 
L
L
 
L
S
 
A
L
 
T
Y
 
A
R
 
R
K
 
H
L
 
V
A
 
V
E
 
K
G
 
G
-
 
D
-
 
K
-
 
F
-
 
V
-
 
R
-
 
S
-
 
G
-
 
E
-
 
W
-
 
K
-
 
R
K
 
K
D
 
G
A
 
I
A
 
A
T
 
W
H
 
H
G
 
P
K
 
K
T
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
W
L
 
F
R
 
L
G
 
G
I
 
Y
E
 
E
I
 
L
K
 
Y
D
 
G
R
 
K
T
 
T
V
 
I
G
 
G
I
 
I
I
 
V
G
 
G
T
x
F
G
|
G
A
x
R
I
|
I
G
 
G
Y
 
Q
R
 
A
T
 
I
A
 
A
N
 
R
L
 
R
A
 
A
K
 
K
A
 
G
F
 
F
G
 
N
A
 
M
K
 
R
V
 
I
I
 
L
G
 
Y
Y
 
Y
N
x
S
R
|
R
-
 
T
-
 
R
-
 
K
S
 
S
H
 
Q
S
 
A
H
 
E
D
 
K
D
 
E
I
 
L
-
 
G
-
 
A
T
 
E
Y
 
Y
T
 
R
N
 
P
L
 
L
N
 
E
T
 
E
L
 
V
L
 
L
Q
 
K
T
 
E
S
 
S
D
 
D
I
 
F
V
 
V
S
 
I
I
 
L
H
x
A
L
x
V
P
|
P
L
 
L
T
 
T
I
 
K
D
 
E
T
|
T
K
 
M
H
 
Y
F
 
M
I
 
I
D
 
N
K
 
E
D
 
E
K
 
R
L
 
L
S
 
K
L
 
L
M
 
M
K
 
K
K
 
P
D
 
T
A
 
A
I
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
T
x
I
A
|
A
R
|
R
G
 
G
G
 
K
I
 
V
I
 
V
D
 
D
N
 
T
E
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
I
E
 
K
A
 
A
L
 
L
K
 
K
K
 
E
G
 
G
E
 
W
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
D
 
E
M
 
E
E
|
E
P
 
P
P
 
Y
L
 
Y
P
 
N
E
 
E
D
 
E
Y
 
-
P
 
-
L
 
L
L
 
F
S
 
S
A
 
L
P
 
D
H
 
N
T
 
V
V
 
V
L
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
I
G
|
G
F
 
S
D
 
A
T
 
T
E
 
F
E
 
E
A
 
A
M
 
R
E
 
E
R
 
A
R
 
M
A
 
A
A
 
E
I
 
L
V
 
V
A
 
A
D
 
R
N
 
N
L
 
L
K
 
I
S
 
A
F
 
F
V
 
K
E
 
R
G
 
G
K
 
E

4zgsA Identification of the pyruvate reductase of chlamydomonas reinhardtii (see paper)
35% identity, 75% coverage: 70:305/314 of query aligns to 77:335/346 of 4zgsA

query
sites
4zgsA
S
 
A
S
 
G
L
 
V
K
 
K
Y
 
L
L
 
I
C
 
A
V
 
L
A
 
R
F
 
C
T
 
A
G
 
G
V
 
F
D
 
D
H
 
R
V
 
V
D
 
D
I
 
L
D
 
H
T
 
A
C
 
C
R
 
A
E
 
E
K
 
H
G
 
G
I
 
V
A
 
R
V
 
V
S
 
V
N
 
R
C
 
V
A
 
P
G
 
T
Y
|
Y
S
|
S
T
 
P
E
 
E
S
 
S
V
 
V
A
 
A
E
 
E
L
 
H
A
 
A
I
 
V
G
 
A
M
 
L
M
 
I
L
 
F
S
 
A
L
 
L
Y
 
N
R
 
R
K
 
H
L
 
L
A
 
T
E
 
D
G
 
A
K
 
Y
D
 
I
A
 
R
A
 
V
T
 
R
H
 
M
G
 
G
K
 
N
T
 
Y
G
 
S
-
 
L
A
 
S
G
 
G
L
 
L
R
 
V
G
 
G
I
 
V
E
 
E
I
 
M
K
 
R
D
 
H
R
 
K
T
 
V
V
 
V
G
 
G
I
 
V
I
 
V
G
 
G
T
 
T
G
|
G
A
|
A
I
|
I
G
 
G
Y
 
Q
R
 
Q
T
 
A
A
 
A
N
 
R
L
 
I
A
 
L
K
 
K
A
 
G
F
 
I
G
 
G
A
 
C
K
 
K
V
 
V
I
 
F
G
 
A
Y
 
Y
-
x
D
-
 
I
-
 
K
-
 
P
N
 
N
R
 
P
S
 
A
H
 
V
S
 
E
H
 
A
D
 
M
D
 
G
I
 
I
T
 
P
Y
 
Y
T
 
V
N
 
S
L
 
L
N
 
D
T
 
E
L
 
L
L
 
L
Q
 
A
T
 
M
S
 
S
D
 
D
I
 
I
V
 
V
S
 
T
I
 
L
H
 
H
L
x
C
P
|
P
L
 
L
T
x
L
I
 
P
D
x
S
T
|
T
K
 
R
H
 
Q
F
 
L
I
 
I
D
 
N
K
 
K
D
 
E
K
 
S
L
 
I
S
 
Q
L
 
K
M
 
M
K
 
K
K
 
K
D
 
G
A
 
V
I
 
M
L
 
L
I
 
I
N
 
N
T
 
V
A
x
S
R
|
R
G
 
G
G
 
G
I
 
L
I
 
I
D
 
D
N
 
S
E
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
F
E
 
D
A
 
A
L
 
L
K
 
E
K
 
S
G
 
G
E
 
Q
I
 
I
A
 
G
G
 
A
A
 
L
G
 
G
I
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
Y
D
 
E
M
 
N
E
|
E
P
 
G
P
 
G
L
 
L
-
 
F
-
 
F
-
 
V
-
 
D
-
 
H
-
 
T
-
 
K
-
 
F
-
 
D
-
 
P
-
 
S
-
 
V
-
 
R
-
 
M
-
 
Q
-
 
K
-
 
W
-
 
D
P
 
R
E
 
Q
D
 
F
Y
 
R
P
 
T
L
 
L
L
 
L
S
 
S
A
 
Y
P
 
P
H
 
Q
T
 
V
V
 
L
L
 
V
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
T
G
 
A
F
|
F
D
 
L
T
 
T
E
 
E
E
 
E
A
 
A
M
 
L
E
 
N
R
 
N
R
 
I
A
 
C
A
 
T
I
 
T
V
 
T
A
 
I
D
 
Q
N
 
N
L
 
I
K
 
A
S
 
D
F
 
Y
V
 
V

5z20F The ternary structure of d-lactate dehydrogenase from pseudomonas aeruginosa with nadh and oxamate (see paper)
34% identity, 83% coverage: 53:313/314 of query aligns to 55:334/336 of 5z20F

query
sites
5z20F
L
 
V
V
 
C
V
 
A
I
 
F
A
 
V
N
 
N
Y
 
D
P
 
D
L
 
L
K
 
S
K
 
R
E
 
P
A
 
V
L
 
L
D
 
E
K
 
R
-
 
L
-
 
A
A
 
A
S
 
G
S
 
G
L
 
T
K
 
R
Y
 
L
L
 
V
C
 
A
V
 
L
A
 
R
F
 
S
T
 
A
G
 
G
V
 
Y
D
 
N
H
 
H
V
 
V
D
 
D
I
 
L
D
 
A
T
 
A
C
 
A
R
 
E
E
 
A
K
 
L
G
 
G
I
 
L
A
 
P
V
 
V
S
 
V
N
 
H
C
 
V
A
 
P
G
 
A
Y
|
Y
S
|
S
T
 
P
E
 
H
S
 
A
V
 
V
A
 
A
E
 
E
L
 
H
A
 
A
I
 
V
G
 
G
M
 
L
M
 
I
L
 
L
S
 
T
L
 
L
Y
 
N
R
 
R
K
 
R
L
 
L
A
 
H
E
 
R
G
 
A
K
 
Y
D
 
N
A
 
R
A
 
T
T
 
R
H
 
E
G
 
G
K
 
D
T
 
F
G
 
S
-
 
L
A
 
H
G
 
G
L
 
L
R
 
T
G
 
G
I
 
F
E
 
D
I
 
L
K
 
H
D
 
G
R
 
K
T
 
R
V
 
V
G
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
|
G
A
x
Q
I
|
I
G
 
G
Y
 
E
R
 
T
T
 
F
A
 
A
N
 
R
L
 
I
A
 
M
K
 
A
A
 
G
F
 
F
G
 
G
A
 
C
K
 
E
V
 
L
I
 
L
G
 
A
Y
|
Y
N
x
D
R
 
-
S
x
P
H
 
Y
S
 
P
H
 
N
D
 
P
D
 
R
I
 
I
T
 
Q
-
 
A
-
 
L
-
 
G
-
 
G
-
 
R
Y
 
Y
T
 
L
N
 
A
L
 
L
N
 
D
T
 
A
L
 
L
L
 
L
Q
 
A
T
 
E
S
 
S
D
 
D
I
 
I
V
 
V
S
 
S
I
 
L
H
 
H
L
x
C
P
|
P
L
 
L
T
 
T
I
 
A
D
 
D
T
|
T
K
 
R
H
 
H
F
 
L
I
 
I
D
 
D
K
 
A
D
 
Q
K
 
R
L
 
L
S
 
A
L
 
T
M
 
M
K
 
K
K
 
P
D
 
G
A
 
A
I
 
M
L
 
L
I
 
I
N
 
N
T
|
T
A
x
G
R
|
R
G
 
G
G
 
A
I
 
L
I
 
V
D
 
N
N
 
A
E
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
I
E
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
K
K
 
S
G
 
G
E
 
Q
I
 
L
A
 
G
G
 
Y
A
 
L
G
 
G
I
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
Y
D
 
E
M
 
E
E
|
E
P
 
A
-
 
D
-
 
I
-
 
F
-
 
F
-
 
E
-
 
D
-
 
R
-
 
S
-
 
D
-
 
Q
P
 
P
L
 
L
P
 
Q
E
 
D
D
 
D
Y
 
V
-
 
L
-
 
A
P
 
R
L
 
L
L
 
L
S
 
S
A
 
F
P
 
P
H
 
N
T
 
V
V
 
V
L
 
V
T
 
T
P
 
A
H
|
H
V
 
Q
G
x
A
F
 
F
D
 
L
T
 
T
E
 
R
E
 
E
A
 
A
M
 
L
E
 
A
R
 
A
R
 
I
A
 
A
A
 
D
I
 
T
V
 
T
A
 
L
D
 
D
N
 
N
L
 
I
K
 
A
S
 
A
F
 
W
V
 
Q
E
 
D
G
 
G
K
 
T
Q
 
P
K
 
R
N
 
N
I
 
R
I
 
V

2eklA Structure of st1218 protein from sulfolobus tokodaii
32% identity, 90% coverage: 18:301/314 of query aligns to 15:302/312 of 2eklA

query
sites
2eklA
D
 
E
T
 
I
L
 
L
L
 
I
A
 
K
P
 
T
L
 
L
T
 
R
G
 
E
R
 
K
G
 
G
Y
 
I
H
 
Q
L
 
V
T
 
-
L
 
-
W
 
-
D
 
D
S
 
Y
L
 
M
P
 
P
E
 
E
-
 
I
N
 
S
Q
 
K
E
 
E
D
 
E
L
 
L
G
 
L
N
 
N
R
 
I
I
 
I
S
 
G
K
 
N
A
 
Y
D
 
D
L
 
I
V
 
I
V
 
V
I
 
V
-
 
R
A
 
S
N
 
R
Y
 
T
P
 
K
L
 
V
K
 
T
K
 
K
E
 
D
A
 
V
L
 
I
D
 
E
K
 
K
A
 
G
S
 
K
S
 
K
L
 
L
K
 
K
Y
 
I
L
 
I
C
 
A
V
 
R
A
 
A
F
 
G
T
x
I
G
 
G
V
 
L
D
 
D
H
 
N
V
 
I
D
 
D
I
 
T
D
 
E
T
 
E
C
 
A
R
 
E
E
 
K
K
 
R
G
 
N
I
 
I
A
 
K
V
 
V
S
 
V
N
 
Y
C
 
A
A
 
P
G
 
G
Y
 
A
S
|
S
T
 
T
E
 
D
S
 
S
V
 
A
A
 
V
E
 
E
L
 
L
A
 
T
I
 
I
G
 
G
M
 
L
M
 
M
L
 
I
S
 
A
L
 
A
Y
 
A
R
 
R
K
 
K
L
 
M
A
 
Y
E
 
T
G
 
S
K
 
M
D
 
A
A
 
L
A
 
A
T
 
K
H
 
S
G
 
G
K
 
-
T
 
I
G
 
F
A
 
K
G
 
K
L
 
I
R
 
E
G
 
G
I
 
L
E
 
E
I
 
L
K
 
A
D
 
G
R
 
K
T
 
T
V
 
I
G
 
G
I
 
I
I
 
V
G
|
G
T
 
F
G
|
G
A
x
R
I
|
I
G
 
G
Y
 
T
R
 
K
T
 
V
A
 
G
N
 
I
L
 
I
A
 
A
K
 
N
A
 
A
F
 
M
G
 
G
A
 
M
K
 
K
V
 
V
I
 
L
G
 
A
Y
|
Y
N
x
D
-
x
I
-
x
L
-
 
D
-
 
I
R
 
R
S
 
E
H
 
K
S
 
A
H
 
E
D
 
K
-
 
I
D
 
N
I
 
A
T
 
K
Y
 
A
T
 
V
N
 
S
L
 
L
N
 
E
T
 
E
L
 
L
L
 
L
Q
 
K
T
 
N
S
 
S
D
 
D
I
 
V
V
 
I
S
 
S
I
 
L
H
|
H
L
x
V
P
x
T
L
 
V
T
 
S
I
 
K
D
 
D
T
 
A
K
 
K
H
 
P
F
x
I
I
 
I
D
 
D
K
 
Y
D
 
P
K
 
Q
L
 
F
S
 
E
L
 
L
M
 
M
K
 
K
K
 
D
D
 
N
A
 
V
I
 
I
L
 
I
I
 
V
N
 
N
T
|
T
A
x
S
R
|
R
G
 
A
G
 
V
I
 
A
I
 
V
D
 
N
N
 
G
E
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
L
E
 
D
A
 
Y
L
 
I
K
 
K
K
 
K
G
 
G
E
 
K
I
 
V
A
 
Y
G
 
A
A
 
Y
G
 
A
I
 
T
D
|
D
V
 
V
F
 
F
D
 
W
M
 
N
E
|
E
P
 
P
P
 
P
L
 
K
P
 
E
E
 
E
-
 
W
D
 
E
Y
 
L
P
 
E
L
 
L
L
 
L
S
 
K
A
 
H
P
 
E
H
 
R
T
 
V
V
 
I
L
 
V
T
 
T
P
 
T
H
|
H
V
 
I
G
|
G
F
 
A
D
 
Q
T
 
T
E
 
K
E
 
E
A
 
A
M
 
Q
E
 
K
R
 
R
R
 
V
A
 
A
A
 
E
I
 
M
V
 
T
A
 
T
D
 
Q
N
 
N
L
 
L

6ttbA Crystal structure of NAD-dependent formate dehydrogenase from staphylococcus aureus in complex with NAD
34% identity, 93% coverage: 24:314/314 of query aligns to 31:328/331 of 6ttbA

query
sites
6ttbA
L
 
L
T
 
E
G
 
E
R
 
R
G
 
G
Y
 
H
H
 
E
L
 
F
T
 
I
L
 
I
W
 
-
D
 
-
S
 
-
L
 
L
P
 
A
E
 
D
N
 
N
Q
 
G
E
 
E
D
 
D
L
 
L
G
 
D
N
 
K
R
 
H
I
 
L
S
 
P
K
 
D
A
 
M
D
 
D
L
 
V
V
 
I
V
 
I
I
 
S
A
 
A
N
 
P
-
 
F
Y
 
Y
P
 
P
-
 
A
-
 
Y
L
 
M
K
 
T
K
 
R
E
 
E
A
 
R
L
 
I
D
 
E
K
 
K
A
 
A
S
 
P
S
 
N
L
 
L
K
 
K
Y
 
L
L
 
A
C
 
I
V
 
T
A
 
A
F
 
G
T
x
V
G
 
G
V
 
S
D
 
D
H
 
H
V
 
V
D
 
D
I
 
L
D
 
A
T
 
A
C
 
A
R
 
S
E
 
E
K
 
H
G
 
N
I
 
I
A
 
G
V
 
V
S
 
V
N
 
E
C
 
V
A
 
T
G
 
G
Y
 
S
S
x
N
T
 
T
E
 
V
S
 
S
V
|
V
A
 
A
E
 
E
L
 
H
A
 
A
I
 
V
G
 
M
M
 
D
M
 
L
L
 
L
S
 
I
L
 
L
Y
 
L
R
 
R
K
 
N
L
 
Y
A
 
E
E
 
E
G
 
G
K
 
H
D
 
R
A
 
Q
A
 
S
T
 
V
H
 
E
G
 
G
K
 
E
-
 
W
-
 
N
-
 
L
T
 
S
G
 
Q
A
 
V
G
 
G
L
 
N
R
 
H
G
 
A
I
 
H
E
 
E
I
 
L
K
 
Q
D
 
H
R
 
K
T
 
T
V
 
I
G
 
G
I
 
I
I
x
F
G
 
G
T
 
F
G
|
G
A
x
R
I
|
I
G
 
G
Y
 
Q
R
 
L
T
 
V
A
 
A
N
 
E
L
 
R
A
 
L
K
 
A
A
 
P
F
 
F
G
 
N
A
 
V
K
 
T
V
 
L
I
 
Q
G
 
H
Y
|
Y
N
x
D
-
x
P
-
 
I
R
 
N
S
 
Q
H
 
Q
S
 
D
H
 
H
D
 
K
D
 
L
I
 
S
T
 
K
Y
 
F
T
 
V
N
 
S
L
 
F
N
 
D
T
 
E
L
 
L
L
 
V
Q
 
S
T
 
S
S
 
S
D
 
D
I
 
A
V
 
I
S
 
T
I
 
I
H
|
H
L
x
A
P
|
P
L
 
L
T
 
T
I
 
P
D
 
E
T
|
T
K
 
D
H
 
N
F
 
L
I
 
F
D
 
D
K
 
K
D
 
D
K
 
V
L
 
L
S
 
S
L
 
R
M
 
M
K
 
K
K
 
K
D
 
H
A
 
S
I
 
Y
L
 
L
I
 
V
N
 
N
T
|
T
A
|
A
R
|
R
G
 
G
G
 
K
I
 
I
I
 
V
D
 
N
N
 
R
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
V
E
 
E
A
 
A
L
 
L
K
 
A
K
 
S
G
 
E
E
 
H
I
 
L
A
 
Q
G
 
G
A
 
Y
G
 
A
I
 
G
D
 
D
V
 
V
F
 
W
D
 
-
M
 
Y
E
 
P
P
 
Q
P
 
P
L
 
A
P
 
P
E
 
A
D
 
D
Y
 
H
P
 
P
L
 
W
L
 
R
S
 
T
A
 
M
P
 
P
H
 
R
T
 
N
V
 
A
L
 
M
T
 
T
P
 
V
H
|
H
V
 
Y
G
x
S
F
x
G
D
 
M
T
 
T
E
 
L
E
 
E
A
 
A
M
 
Q
E
 
K
R
 
R
R
 
I
A
 
E
A
 
D
I
 
G
V
 
V
A
 
K
D
 
D
N
 
I
L
 
L
K
 
E
S
 
R
F
 
F
V
 
F
E
 
N
G
 
H
-
 
E
-
 
P
-
 
F
K
 
Q
Q
 
D
K
 
K
N
 
D
I
 
I
I
 
I
C
 
V

1dxyA Structure of d-2-hydroxyisocaproate dehydrogenase (see paper)
34% identity, 75% coverage: 69:305/314 of query aligns to 66:319/330 of 1dxyA

query
sites
1dxyA
A
 
A
S
 
Y
S
 
G
L
 
I
K
 
K
Y
 
F
L
 
L
C
 
T
V
 
I
A
 
R
F
 
N
T
x
V
G
 
G
V
 
T
D
 
D
H
 
N
V
 
I
D
 
D
I
 
M
D
 
T
T
 
A
C
 
M
R
 
K
E
 
Q
K
 
Y
G
 
G
I
 
I
A
 
R
V
 
L
S
 
S
N
 
N
C
 
V
A
 
P
G
 
A
Y
|
Y
S
|
S
T
 
P
E
 
A
S
 
A
V
 
I
A
 
A
E
 
E
L
 
F
A
 
A
I
 
L
G
 
T
M
 
D
M
 
T
L
 
L
S
 
Y
L
 
L
Y
 
L
R
 
R
K
 
N
L
 
M
A
 
G
E
 
K
G
 
V
K
 
Q
-
 
A
-
 
Q
-
 
L
D
 
Q
A
 
A
A
 
G
T
 
D
H
 
Y
G
 
E
K
 
K
T
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
F
L
 
I
R
 
-
G
 
G
I
 
K
E
 
E
I
 
L
K
 
G
D
 
Q
R
 
Q
T
 
T
V
 
V
G
 
G
I
 
V
I
 
M
G
|
G
T
 
T
G
|
G
A
x
H
I
|
I
G
 
G
Y
 
Q
R
 
V
T
 
A
A
 
I
N
 
K
L
 
L
A
 
F
K
 
K
A
 
G
F
 
F
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
I
 
I
G
 
A
Y
|
Y
N
x
D
-
x
P
-
 
Y
-
 
P
R
 
M
S
 
K
H
 
G
S
 
D
H
 
H
D
 
P
D
 
D
I
 
F
T
 
D
Y
 
Y
T
 
V
N
 
S
L
 
L
N
 
E
T
 
D
L
 
L
L
 
F
Q
 
K
T
 
Q
S
 
S
D
 
D
I
 
V
V
 
I
S
 
D
I
 
L
H
|
H
L
x
V
P
|
P
L
 
G
T
 
I
I
 
E
D
 
Q
T
x
N
K
 
T
H
 
H
F
 
I
I
 
I
D
 
N
K
 
E
D
 
A
K
 
A
L
 
F
S
 
N
L
 
L
M
 
M
K
 
K
K
 
P
D
 
G
A
 
A
I
 
I
L
 
V
I
 
I
N
 
N
T
|
T
A
|
A
R
|
R
G
 
P
G
 
N
I
 
L
I
 
I
D
 
D
N
 
T
E
 
Q
A
 
A
L
 
M
A
 
L
E
 
S
A
 
N
L
 
L
K
 
K
K
 
S
G
 
G
E
 
K
I
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
V
G
 
G
I
 
I
D
|
D
V
 
T
F
 
Y
D
 
E
M
 
Y
E
|
E
P
 
T
-
 
E
-
 
D
-
 
L
-
 
L
-
 
N
-
 
L
-
 
A
-
 
K
-
 
H
-
 
G
-
 
S
-
 
F
-
 
K
-
 
D
P
 
P
L
 
L
P
 
W
E
 
D
D
 
E
Y
 
-
P
 
-
L
 
L
L
 
L
S
 
G
A
 
M
P
 
P
H
 
N
T
 
V
V
 
V
L
 
L
T
 
S
P
 
P
H
|
H
V
 
I
G
 
A
F
x
Y
D
 
Y
T
 
T
E
 
E
E
 
T
A
 
A
M
 
V
E
 
H
R
 
N
R
 
M
A
 
V
A
 
Y
I
 
F
V
 
S
A
 
L
D
 
Q
N
 
H
L
 
L
K
 
V
S
 
D
F
 
F
V
 
L

P17584 D-2-hydroxyisocaproate dehydrogenase; D-HICDH; EC 1.1.1.- from Lacticaseibacillus paracasei (Lactobacillus paracasei) (see paper)
34% identity, 75% coverage: 69:305/314 of query aligns to 66:319/333 of P17584

query
sites
P17584
A
 
A
S
 
Y
S
 
G
L
 
I
K
 
K
Y
 
F
L
 
L
C
 
T
V
 
I
A
 
R
F
 
N
T
 
V
G
 
G
V
 
T
D
 
D
H
 
N
V
 
I
D
 
D
I
 
M
D
 
T
T
 
A
C
 
M
R
 
K
E
 
Q
K
 
Y
G
 
G
I
 
I
A
 
R
V
 
L
S
 
S
N
 
N
C
 
V
A
 
P
G
 
A
Y
 
Y
S
 
S
T
 
P
E
 
A
S
 
A
V
 
I
A
 
A
E
 
E
L
 
F
A
 
A
I
 
L
G
 
T
M
 
D
M
 
T
L
 
L
S
 
Y
L
 
L
Y
 
L
R
 
R
K
 
N
L
 
M
A
 
G
E
 
K
G
 
V
K
 
Q
-
 
A
-
 
Q
-
 
L
D
 
Q
A
 
A
A
 
G
T
 
D
H
 
Y
G
 
E
K
 
K
T
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
F
L
 
I
R
 
-
G
 
G
I
 
K
E
 
E
I
 
L
K
 
G
D
 
Q
R
 
Q
T
 
T
V
 
V
G
 
G
I
 
V
I
 
M
G
 
G
T
 
T
G
 
G
A
x
H
I
|
I
G
 
G
Y
 
Q
R
 
V
T
 
A
A
 
I
N
 
K
L
 
L
A
 
F
K
 
K
A
 
G
F
 
F
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
I
 
I
G
 
A
Y
 
Y
N
x
D
-
 
P
-
 
Y
-
 
P
R
 
M
S
 
K
H
 
G
S
 
D
H
 
H
D
 
P
D
 
D
I
 
F
T
 
D
Y
 
Y
T
 
V
N
 
S
L
 
L
N
 
E
T
 
D
L
 
L
L
 
F
Q
 
K
T
 
Q
S
 
S
D
 
D
I
 
V
V
 
I
S
 
D
I
 
L
H
 
H
L
x
V
P
 
P
L
 
G
T
 
I
I
 
E
D
 
Q
T
x
N
K
 
T
H
 
H
F
 
I
I
 
I
D
 
N
K
 
E
D
 
A
K
 
A
L
 
F
S
 
N
L
 
L
M
 
M
K
 
K
K
 
P
D
 
G
A
 
A
I
 
I
L
 
V
I
 
I
N
 
N
T
|
T
A
|
A
R
|
R
G
 
P
G
 
N
I
 
L
I
 
I
D
 
D
N
 
T
E
 
Q
A
 
A
L
 
M
A
 
L
E
 
S
A
 
N
L
 
L
K
 
K
K
 
S
G
 
G
E
 
K
I
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
V
G
 
G
I
 
I
D
|
D
V
 
T
F
 
Y
D
 
E
M
 
Y
E
 
E
P
 
T
-
 
E
-
 
D
-
 
L
-
 
L
-
 
N
-
 
L
-
 
A
-
 
K
-
 
H
-
 
G
-
 
S
-
 
F
-
 
K
-
 
D
P
 
P
L
 
L
P
 
W
E
 
D
D
 
E
Y
 
-
P
 
-
L
 
L
L
 
L
S
 
G
A
 
M
P
 
P
H
 
N
T
 
V
V
 
V
L
 
L
T
 
S
P
 
P
H
 
H
V
 
I
G
 
A
F
 
Y
D
 
Y
T
 
T
E
 
E
E
 
T
A
 
A
M
 
V
E
 
H
R
 
N
R
 
M
A
 
V
A
 
Y
I
 
F
V
 
S
A
 
L
D
 
Q
N
 
H
L
 
L
K
 
V
S
 
D
F
 
F
V
 
L

2yq5C Crystal structure of d-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase from lactobacillus delbrueckii ssp. Bulgaricus: NAD complexed form (see paper)
34% identity, 81% coverage: 60:313/314 of query aligns to 55:330/331 of 2yq5C

query
sites
2yq5C
P
 
P
L
 
V
K
 
D
K
 
E
E
 
E
A
 
V
L
 
V
-
 
Y
D
 
Q
K
 
K
A
 
L
S
 
S
S
 
E
L
 
Y
K
 
G
Y
 
V
L
 
K
C
 
C
V
 
I
A
 
G
F
 
L
-
 
R
-
 
I
T
 
V
G
 
G
V
 
F
D
 
N
H
 
T
V
 
I
D
 
N
I
 
F
D
 
D
T
 
W
C
 
T
R
 
K
E
 
K
K
 
Y
G
 
N
I
 
L
A
 
L
V
 
V
S
 
T
N
 
N
C
 
V
A
 
P
G
 
V
Y
|
Y
S
|
S
T
 
P
E
 
R
S
 
A
V
x
I
A
 
A
E
 
E
L
 
M
A
 
T
I
 
V
G
 
T
M
 
Q
M
 
A
L
 
M
S
 
Y
L
 
L
Y
 
L
R
 
R
K
 
K
L
 
I
A
 
G
E
 
E
G
 
F
K
 
R
D
 
Y
A
 
R
A
 
M
T
 
D
H
 
H
G
 
D
-
 
H
-
 
D
-
 
F
K
 
T
T
 
W
G
 
P
A
 
S
G
 
N
L
 
L
R
 
I
G
 
S
I
 
N
E
 
E
I
 
I
K
 
Y
D
 
N
R
 
L
T
 
T
V
 
V
G
 
G
I
 
L
I
 
I
G
 
G
T
x
V
G
|
G
A
x
H
I
|
I
G
 
G
Y
 
S
R
 
A
T
 
V
A
 
A
N
 
E
L
 
I
A
 
F
K
 
S
A
 
A
F
 
M
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
I
 
I
G
 
A
Y
|
Y
N
x
D
R
x
V
S
 
A
H
 
Y
S
 
N
H
 
P
D
 
E
D
 
F
-
 
E
-
 
P
-
 
F
I
 
L
T
 
T
Y
 
Y
T
 
T
N
 
D
L
 
F
N
 
D
T
 
T
L
 
V
L
 
L
Q
 
K
T
 
E
S
 
A
D
 
D
I
 
I
V
 
V
S
 
S
I
 
L
H
|
H
L
x
T
P
|
P
L
 
L
T
 
F
I
 
P
D
 
S
T
 
T
K
 
E
H
 
N
F
 
M
I
 
I
D
 
G
K
 
E
D
 
K
K
 
Q
L
 
L
S
 
K
L
 
E
M
 
M
K
 
K
K
 
K
D
 
S
A
 
A
I
 
Y
L
 
L
I
 
I
N
 
N
T
 
C
A
|
A
R
|
R
G
 
G
G
 
E
I
 
L
I
 
V
D
 
D
N
 
T
E
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
I
E
 
K
A
 
A
L
 
L
K
 
Q
K
 
D
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
I
 
L
D
|
D
V
 
T
F
 
L
D
 
A
M
 
G
E
|
E
P
 
S
P
 
S
-
 
Y
-
 
F
-
 
G
-
 
H
-
 
T
-
 
G
-
 
L
-
 
T
-
 
D
-
 
S
-
 
E
L
 
I
P
 
P
E
 
E
D
 
D
Y
 
Y
P
 
K
L
 
T
L
 
L
S
 
A
-
 
K
A
 
M
P
 
P
H
 
N
T
 
V
V
 
V
L
 
I
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
S
G
 
A
F
|
F
D
 
Y
T
 
T
E
 
E
E
 
T
A
 
S
M
 
I
E
 
R
R
 
N
R
 
M
A
 
V
A
 
Q
I
 
I
-
 
C
V
 
L
A
 
T
D
 
D
N
 
Q
L
 
L
K
 
T
S
 
I
F
 
A
V
 
K
E
 
G
G
 
G
K
 
R
Q
 
P
K
 
R
N
 
S
I
 
I
I
 
V

6biiA Crystal structure of pyrococcus yayanosii glyoxylate hydroxypyruvate reductase in complex with NADP and malonate (re-refinement of 5aow) (see paper)
34% identity, 85% coverage: 41:308/314 of query aligns to 35:314/332 of 6biiA

query
sites
6biiA
Q
 
R
E
 
E
D
 
V
L
 
L
G
 
L
N
 
E
R
 
K
I
 
V
S
 
K
K
 
D
A
 
V
D
 
D
-
 
A
L
 
L
V
 
V
V
 
T
I
 
M
A
 
L
N
 
S
Y
 
E
P
 
K
L
 
I
K
 
D
K
 
R
E
 
E
A
 
V
L
 
F
D
 
D
K
 
A
A
 
A
S
 
P
S
 
R
L
 
L
K
 
R
Y
 
I
L
 
V
C
 
A
V
 
N
A
 
Y
F
 
A
T
x
V
G
 
G
V
 
Y
D
 
D
H
 
N
V
 
I
D
 
D
I
 
I
D
 
E
T
 
E
C
 
A
R
 
T
E
 
K
K
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
Y
V
 
V
S
 
T
N
 
N
C
 
T
A
 
P
G
 
D
Y
 
V
S
x
L
T
 
T
E
 
D
S
 
A
V
x
T
A
 
A
E
 
D
L
 
L
A
 
A
I
 
W
G
 
A
M
 
L
M
 
L
L
 
L
S
 
A
L
 
A
Y
 
A
R
 
R
K
 
H
L
 
V
A
 
V
E
 
K
G
 
G
K
 
D
D
 
K
A
 
F
A
 
V
T
 
R
H
 
S
G
 
G
-
 
E
-
 
W
-
 
K
K
 
R
T
 
R
G
 
G
A
 
I
G
 
A
L
 
W
R
 
H
-
 
P
-
 
K
-
 
M
-
 
F
-
 
L
G
 
G
I
 
Y
E
 
D
I
 
V
K
 
Y
D
 
G
R
 
K
T
 
T
V
 
I
G
 
G
I
 
I
I
 
V
G
|
G
T
x
F
G
|
G
A
x
R
I
|
I
G
 
G
Y
 
Q
R
 
A
T
 
I
A
 
A
N
 
K
L
 
R
A
 
A
K
 
K
A
 
G
F
 
F
G
 
G
A
 
M
K
 
R
V
 
I
I
 
L
G
 
Y
Y
 
T
N
x
A
R
|
R
S
|
S
H
 
R
S
x
K
H
 
P
D
 
E
-
 
A
-
 
E
-
 
K
-
 
E
-
 
L
D
 
G
I
 
A
T
 
E
Y
 
F
T
 
K
N
 
P
L
 
L
N
 
E
T
 
E
L
 
L
L
 
L
Q
 
R
T
 
E
S
 
S
D
 
D
I
 
F
V
 
V
S
 
V
I
 
L
H
 
A
L
x
V
P
|
P
L
 
L
T
 
T
I
 
K
D
x
E
T
|
T
K
 
Y
H
 
H
F
 
M
I
 
I
D
 
N
K
 
E
D
 
E
K
 
R
L
 
L
S
 
R
L
 
L
M
 
M
K
 
K
K
 
P
D
 
T
A
 
A
I
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
T
x
V
A
|
A
R
|
R
G
 
G
G
 
K
I
 
V
I
 
V
D
 
D
N
 
T
E
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
I
E
 
R
A
 
A
L
 
L
K
 
K
K
 
E
G
 
G
E
 
W
I
 
I
A
 
A
G
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
D
 
E
M
 
E
E
|
E
P
 
P
P
 
Y
L
 
Y
P
 
D
E
 
E
D
 
E
Y
 
-
P
 
-
L
 
L
L
 
F
S
 
A
A
 
L
P
 
D
H
 
N
T
 
V
V
 
V
L
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
I
G
|
G
F
 
S
D
 
A
T
 
T
E
 
F
E
 
G
A
 
A
M
 
R
E
 
E
R
 
G
R
 
M
A
 
A
A
 
E
I
 
L
V
 
V
A
 
A
D
 
K
N
 
N
L
 
L
K
 
I
S
 
A
F
 
F
V
 
K
E
 
N
G
 
G
K
 
E

4xkjA A novel d-lactate dehydrogenase from sporolactobacillus sp
38% identity, 75% coverage: 60:296/314 of query aligns to 59:310/332 of 4xkjA

query
sites
4xkjA
P
 
P
L
 
A
K
 
V
K
 
Y
E
 
E
A
 
T
L
 
L
D
 
Q
K
 
K
A
 
-
S
 
N
S
 
G
L
 
L
K
 
R
Y
 
Q
L
 
L
C
 
T
V
 
S
A
 
R
F
 
T
T
 
A
G
 
G
V
 
Y
D
 
D
H
 
M
V
 
I
D
 
D
I
 
L
D
 
E
T
 
Q
C
 
A
R
 
S
E
 
E
K
 
R
G
 
G
I
 
L
A
 
V
V
 
V
S
 
T
N
 
N
C
 
V
A
 
P
G
 
A
Y
|
Y
S
|
S
T
 
P
E
 
N
S
 
S
V
|
V
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
A
I
 
L
G
 
T
M
 
Q
M
 
T
L
 
M
S
 
R
L
 
L
Y
 
I
R
 
R
K
 
N
L
 
L
-
 
P
-
 
L
-
 
F
-
 
D
A
 
A
E
 
R
G
 
G
K
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
A
T
 
E
H
 
Q
G
 
D
K
 
F
T
 
R
G
 
W
A
 
A
G
 
G
L
 
L
R
 
M
G
 
A
I
 
R
E
 
E
I
 
I
K
 
R
D
 
S
R
 
L
T
 
T
V
 
V
G
 
G
I
 
I
I
 
I
G
|
G
T
 
A
G
|
G
A
x
R
I
|
I
G
 
G
Y
 
G
R
 
T
T
 
V
A
 
A
N
 
R
L
 
L
A
 
F
K
 
K
A
 
A
F
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
T
V
 
V
I
 
I
G
 
A
Y
 
N
N
x
D
-
x
I
-
 
V
-
 
E
R
|
R
S
 
V
H
 
E
S
 
L
H
 
K
D
 
D
D
 
I
I
 
V
T
 
T
Y
 
Y
T
 
V
N
 
S
L
 
K
N
 
E
T
 
E
L
 
L
L
 
L
Q
 
Q
T
 
A
S
 
A
D
 
D
I
 
V
V
 
V
S
 
T
I
 
L
H
|
H
L
x
V
P
|
P
L
 
L
T
 
M
I
 
D
D
 
S
T
|
T
K
 
T
H
 
Q
F
 
L
I
 
I
D
 
D
K
 
A
D
 
D
K
 
A
L
 
L
S
 
A
L
 
L
M
 
M
K
 
K
K
 
N
D
 
D
A
 
A
I
 
V
L
 
L
I
 
I
N
 
N
T
x
A
A
 
S
R
|
R
G
 
G
G
 
P
I
 
V
I
 
V
D
 
D
N
 
T
E
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
I
E
 
A
A
 
A
L
 
L
K
 
Q
K
 
N
G
 
K
E
 
Q
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
A
I
 
L
D
|
D
V
 
T
F
 
L
D
 
N
-
 
G
-
x
E
-
 
E
-
 
H
-
 
F
-
 
F
-
 
N
-
 
Q
-
 
D
-
 
L
-
 
C
-
 
G
M
 
K
E
 
E
P
 
L
P
 
P
L
 
S
P
 
E
E
 
Q
D
 
L
Y
 
K
P
 
V
L
 
L
L
 
R
S
 
T
A
 
L
P
 
P
H
 
N
T
 
V
V
 
L
L
 
I
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
I
G
|
G
F
|
F
D
 
Y
T
 
T
E
 
N
E
 
K
A
 
A
M
 
V
E
 
Q
R
 
N
R
 
M
A
 
V
A
 
E
I
 
I

O43175 D-3-phosphoglycerate dehydrogenase; 3-PGDH; 2-oxoglutarate reductase; Malate dehydrogenase; EC 1.1.1.95; EC 1.1.1.399; EC 1.1.1.37 from Homo sapiens (Human) (see 3 papers)
32% identity, 82% coverage: 53:308/314 of query aligns to 51:310/533 of O43175

query
sites
O43175
L
 
L
V
 
I
V
 
V
I
 
R
A
 
S
N
 
A
Y
 
T
P
 
K
L
 
V
K
 
T
K
 
A
E
 
D
A
 
V
L
 
I
D
 
N
K
 
A
A
 
A
S
 
E
S
 
K
L
 
L
K
 
Q
Y
 
V
L
 
V
C
 
G
V
 
R
A
 
A
F
 
G
T
|
T
G
 
G
V
 
V
D
 
D
H
 
N
V
 
V
D
 
D
I
 
L
D
 
E
T
 
A
C
 
A
R
 
T
E
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
A
 
L
V
 
V
S
 
M
N
 
N
C
 
T
A
 
P
G
 
N
Y
 
G
S
 
N
T
 
S
E
 
L
S
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
T
I
 
C
G
 
G
M
 
M
M
 
I
L
 
M
S
 
C
L
 
L
Y
 
A
R
 
R
K
 
Q
L
 
I
A
 
P
E
 
Q
G
 
A
K
 
T
D
 
A
A
 
S
A
 
M
T
 
K
H
 
D
G
 
G
K
 
K
T
 
W
-
 
E
G
x
R
A
 
K
G
 
K
L
 
F
R
 
M
G
 
G
I
 
T
E
 
E
I
 
L
K
 
N
D
 
G
R
 
K
T
 
T
V
 
L
G
 
G
I
 
I
I
 
L
G
 
G
T
 
L
G
 
G
A
x
R
I
|
I
G
 
G
Y
 
R
R
 
E
T
 
V
A
 
A
N
 
T
L
 
R
A
 
M
K
 
Q
A
 
S
F
 
F
G
 
G
A
 
M
K
 
K
V
 
T
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
N
x
D
R
 
P
S
 
I
H
 
I
S
 
S
H
 
P
D
 
E
-
 
V
-
 
S
-
 
A
-
 
S
-
 
F
D
 
G
I
 
V
T
 
Q
Y
 
Q
T
 
L
N
 
P
L
 
L
N
 
E
T
 
E
L
 
I
L
 
W
Q
 
P
T
 
L
S
 
C
D
 
D
I
 
F
V
 
I
S
 
T
I
 
V
H
 
H
L
x
T
P
 
P
L
 
L
T
 
L
I
 
P
D
 
S
T
 
T
K
 
T
H
 
G
F
 
L
I
 
L
D
 
N
K
 
D
D
 
N
K
 
T
L
 
F
S
 
A
L
 
Q
M
 
C
K
 
K
K
 
K
D
 
G
A
 
V
I
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
x
C
A
|
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
I
 
I
I
 
V
D
 
D
N
 
E
E
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
K
 
Q
K
 
S
G
 
G
E
 
Q
I
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
A
I
 
L
D
|
D
V
|
V
F
 
F
D
 
T
M
 
E
E
 
E
P
 
P
P
 
-
L
 
-
P
 
P
E
 
R
D
 
D
Y
 
R
P
 
A
L
 
L
L
 
V
S
 
D
A
 
H
P
 
E
H
 
N
T
 
V
V
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
V
x
L
G
|
G
F
x
A
D
 
S
T
 
T
E
 
K
E
 
E
A
 
A
M
 
Q
E
 
S
R
 
R
R
 
C
A
 
G
A
 
E
I
 
E
V
 
I
A
 
A
D
 
V
N
 
Q
L
 
F
K
 
V
S
 
D
F
 
M
V
 
V
E
 
K
G
 
G
K
 
K

Sites not aligning to the query:

7arzA Ternary complex of NAD-dependent formate dehydrogenase from physcomitrium patens
34% identity, 78% coverage: 61:306/314 of query aligns to 85:340/361 of 7arzA

query
sites
7arzA
L
 
M
K
 
T
K
 
K
E
 
E
A
 
R
L
 
L
D
 
A
K
 
K
A
 
A
S
 
K
S
 
N
L
 
L
K
 
E
Y
 
L
L
|
L
C
x
V
V
x
T
A
 
A
F
x
G
T
x
V
G
 
G
V
 
S
D
 
D
H
 
H
V
 
I
D
 
D
I
 
L
D
 
H
T
 
A
C
 
A
R
 
A
E
 
E
K
 
K
G
 
G
I
 
L
A
 
T
V
 
V
S
 
S
N
 
E
C
 
V
A
 
T
G
 
G
Y
 
S
S
x
N
T
 
V
E
 
T
S
 
S
V
|
V
A
 
A
E
 
E
L
 
D
A
 
E
I
 
V
G
 
L
M
 
R
M
 
I
L
 
L
S
 
V
L
 
L
Y
 
V
R
 
R
K
 
N
L
 
F
A
 
A
E
 
P
G
 
G
K
 
W
D
 
K
A
 
Q
A
 
V
T
 
S
H
 
E
G
 
G
K
 
G
T
 
W
G
 
N
A
 
V
G
 
A
L
 
A
-
 
V
-
 
V
-
 
H
R
 
H
G
 
A
I
 
Y
E
 
D
I
 
L
K
 
I
D
 
D
R
 
R
T
 
T
V
 
V
G
 
G
I
 
T
I
 
V
G
 
G
T
 
G
G
|
G
A
x
R
I
|
I
G
 
G
Y
 
Q
R
 
E
T
 
L
A
 
M
N
 
K
L
 
R
A
 
L
K
 
K
A
 
G
F
 
F
G
 
G
A
 
L
K
 
K
-
 
E
-
 
M
-
 
L
-
 
Y
-
 
Y
-
x
D
-
x
R
-
 
N
V
 
S
I
 
L
G
 
G
Y
 
A
N
 
E
R
 
R
S
 
E
H
 
K
S
 
E
H
 
L
D
 
G
D
 
C
I
 
K
T
 
R
Y
 
E
T
 
T
N
 
D
L
 
L
N
 
D
T
 
T
L
 
M
L
 
L
Q
 
S
T
 
K
S
 
C
D
 
D
I
 
V
V
 
V
S
 
V
I
 
V
H
 
N
L
x
T
P
|
P
L
 
L
T
 
T
I
 
D
D
x
Q
T
 
T
K
 
R
H
 
G
F
 
L
I
 
F
D
 
N
K
 
K
D
 
E
K
 
R
L
 
I
S
 
A
L
 
K
M
 
M
K
 
K
K
 
K
D
 
G
A
 
A
I
 
Y
L
 
L
I
 
V
N
 
N
T
x
N
A
|
A
R
|
R
G
 
G
G
 
A
I
 
I
I
 
A
D
 
D
N
 
T
E
 
E
A
 
A
L
 
V
A
 
K
E
 
E
A
 
A
L
 
C
K
 
E
K
 
S
G
 
G
E
 
H
I
 
L
A
 
G
G
 
G
A
 
Y
G
 
G
I
 
G
D
|
D
V
 
V
F
 
W
D
 
N
M
 
A
E
 
Q
P
 
P
P
 
A
L
 
-
P
 
G
E
 
K
D
 
D
Y
 
H
P
 
P
L
 
W
L
 
R
S
 
Y
A
 
M
P
 
P
H
 
N
T
 
H
V
 
A
L
 
M
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
I
G
x
S
F
x
G
D
 
T
T
 
T
E
 
L
E
 
D
A
 
A
M
 
Q
E
 
K
R
 
R
R
 
F
A
 
A
A
 
A
I
 
G
V
 
T
A
 
K
D
 
D
N
 
M
L
 
I
K
 
D
S
 
R
F
 
W
V
 
L
E
 
K