SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_009120567.1 NCBI__GCF_900129655.1:WP_009120567.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 16 hits to proteins with known functional sites (download)

2bkxA Structure and kinetics of a monomeric glucosamine-6-phosphate deaminase: missing link of the nagb superfamily (see paper)
41% identity, 35% coverage: 46:280/663 of query aligns to 10:239/242 of 2bkxA

query
sites
2bkxA
E
 
E
G
 
E
A
 
L
N
 
S
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
L
 
A
D
 
R
I
 
I
-
 
T
A
 
A
Q
 
D
V
 
T
I
 
I
R
 
K
D
 
E
K
 
K
Q
 
P
K
 
D
A
 
A
G
 
-
R
 
-
F
 
-
C
 
-
V
 
V
L
 
L
A
 
G
L
 
L
A
|
A
G
x
T
G
|
G
N
x
G
S
x
T
P
 
P
R
 
E
N
 
G
V
 
T
Y
 
Y
S
 
R
A
 
Q
L
 
L
V
 
I
R
 
R
M
 
L
H
 
H
K
 
Q
E
 
T
E
 
E
G
 
N
L
 
L
S
 
S
F
 
F
R
 
Q
N
 
N
V
 
I
V
 
T
V
 
T
F
 
V
N
 
N
L
 
L
Y
x
D
E
 
E
Y
 
Y
Y
 
A
P
 
G
L
 
L
A
 
S
S
 
S
D
 
D
A
 
D
V
 
P
N
 
N
S
 
S
N
 
Y
L
 
H
N
 
F
A
 
Y
L
 
M
K
 
N
E
 
D
M
 
R
L
 
F
L
 
F
D
 
Q
H
 
H
V
 
I
D
 
D
I
 
S
D
 
K
M
 
P
Q
 
S
N
 
R
V
 
H
F
 
F
S
 
I
P
 
P
N
 
N
G
 
G
T
 
N
I
 
-
A
 
-
K
 
A
D
 
D
T
 
D
I
 
L
F
 
E
E
 
A
Y
 
E
C
 
C
R
 
R
L
 
R
Y
 
Y
E
 
E
Q
 
Q
R
 
L
I
 
V
E
 
D
S
 
S
F
 
L
G
 
G
G
 
D
I
 
T
D
 
D
V
 
I
A
 
Q
V
 
L
L
 
L
G
|
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
V
x
N
G
 
G
N
x
H
I
 
I
G
|
G
F
 
F
N
 
N
E
|
E
P
 
P
G
 
G
S
 
T
R
 
S
L
 
F
N
 
K
S
 
S
T
 
R
T
 
T
R
 
H
L
 
V
I
 
V
L
 
T
L
 
L
D
 
N
S
 
E
D
 
Q
S
 
T
R
 
R
N
 
Q
E
 
A
A
 
N
S
 
A
K
x
R
M
 
Y
F
 
F
G
 
P
S
 
S
I
 
I
E
 
D
S
 
S
T
 
V
P
 
P
V
 
K
S
 
K
S
 
A
I
 
L
T
 
T
M
 
M
G
 
G
V
 
I
A
 
Q
T
 
T
I
 
I
L
 
L
S
 
S
A
 
S
K
 
K
K
 
R
V
 
I
Y
 
L
L
 
L
L
 
L
A
 
I
W
 
S
G
 
G
E
 
K
E
 
S
K
|
K
A
 
A
K
 
E
M
 
A
V
 
V
K
 
R
E
 
K
C
 
L
V
 
L
E
 
E
G
 
G
N
 
N
V
 
I
T
 
S
D
 
E
T
 
D
I
 
F
P
 
P
A
 
A
S
 
S
Y
 
A
L
 
L
Q
 
H
T
 
L
H
 
H
N
 
S
N
 
D
A
 
V
H
 
T
I
 
V
A
 
L
I
 
I
D
 
D
L
 
R
S
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
S

2bkvB Structure and kinetics of a monomeric glucosamine-6-phosphate deaminase: missing link of the nagb superfamily (see paper)
41% identity, 35% coverage: 46:280/663 of query aligns to 10:239/242 of 2bkvB

query
sites
2bkvB
E
 
E
G
 
E
A
 
L
N
 
S
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
L
 
A
D
 
R
I
 
I
-
 
T
A
 
A
Q
 
D
V
 
T
I
 
I
R
 
K
D
 
E
K
 
K
Q
 
P
K
 
D
A
 
A
G
 
-
R
 
-
F
 
-
C
 
-
V
 
V
L
 
L
A
 
G
L
 
L
A
 
A
G
 
T
G
|
G
N
x
G
S
x
T
P
 
P
R
 
E
N
 
G
V
 
T
Y
 
Y
S
 
R
A
 
Q
L
 
L
V
 
I
R
 
R
M
 
L
H
 
H
K
 
Q
E
 
T
E
 
E
G
 
N
L
 
L
S
 
S
F
 
F
R
 
Q
N
 
N
V
 
I
V
 
T
V
 
T
F
 
V
N
 
N
L
 
L
Y
x
D
E
 
E
Y
 
Y
Y
 
A
P
 
G
L
 
L
A
 
S
S
 
S
D
 
D
A
 
D
V
 
P
N
 
N
S
 
S
N
 
Y
L
 
H
N
 
F
A
 
Y
L
 
M
K
 
N
E
 
D
M
 
R
L
 
F
L
 
F
D
 
Q
H
 
H
V
 
I
D
 
D
I
 
S
D
 
K
M
 
P
Q
 
S
N
 
R
V
 
H
F
 
F
S
 
I
P
 
P
N
 
N
G
 
G
T
 
N
I
 
-
A
 
-
K
 
A
D
 
D
T
 
D
I
 
L
F
 
E
E
 
A
Y
 
E
C
 
C
R
 
R
L
 
R
Y
 
Y
E
 
E
Q
 
Q
R
 
L
I
 
V
E
 
D
S
 
S
F
 
L
G
 
G
G
 
D
I
 
T
D
 
D
V
 
I
A
 
Q
V
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
V
x
N
G
 
G
N
x
H
I
 
I
G
 
G
F
 
F
N
 
N
E
|
E
P
 
P
G
 
G
S
 
T
R
 
S
L
 
F
N
 
K
S
 
S
T
 
R
T
 
T
R
 
H
L
 
V
I
 
V
L
 
T
L
 
L
D
 
N
S
 
E
D
 
Q
S
 
T
R
 
R
N
 
Q
E
 
A
A
 
N
S
 
A
K
 
R
M
 
Y
F
 
F
G
 
P
S
 
S
I
 
I
E
 
D
S
 
S
T
 
V
P
 
P
V
 
K
S
 
K
S
 
A
I
 
L
T
 
T
M
 
M
G
 
G
V
 
I
A
 
Q
T
 
T
I
 
I
L
 
L
S
 
S
A
 
S
K
 
K
K
 
R
V
 
I
Y
 
L
L
 
L
L
 
L
A
 
I
W
 
S
G
 
G
E
 
K
E
 
S
K
|
K
A
 
A
K
 
E
M
 
A
V
 
V
K
 
R
E
 
K
C
 
L
V
 
L
E
 
E
G
 
G
N
 
N
V
 
I
T
 
S
D
 
E
T
 
D
I
 
F
P
 
P
A
 
A
S
 
S
Y
 
A
L
 
L
Q
 
H
T
 
L
H
 
H
N
 
S
N
 
D
A
 
V
H
 
T
I
 
V
A
 
L
I
 
I
D
 
D
L
 
R
S
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
S

O35000 Glucosamine-6-phosphate deaminase 1; GlcN6P deaminase 1; GNPDA 1; Glucosamine-6-phosphate isomerase 1; EC 3.5.99.6 from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
41% identity, 35% coverage: 46:280/663 of query aligns to 10:239/242 of O35000

query
sites
O35000
E
 
E
G
 
E
A
 
L
N
 
S
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
L
 
A
D
 
R
I
 
I
-
 
T
A
 
A
Q
 
D
V
 
T
I
 
I
R
 
K
D
 
E
K
 
K
Q
 
P
K
 
D
A
 
A
G
 
-
R
 
-
F
 
-
C
 
-
V
 
V
L
 
L
A
 
G
L
 
L
A
 
A
G
x
T
G
 
G
N
x
G
S
x
T
P
 
P
R
 
E
N
 
G
V
 
T
Y
 
Y
S
 
R
A
 
Q
L
 
L
V
 
I
R
 
R
M
 
L
H
 
H
K
 
Q
E
 
T
E
 
E
G
 
N
L
 
L
S
 
S
F
 
F
R
 
Q
N
 
N
V
 
I
V
 
T
V
 
T
F
 
V
N
 
N
L
 
L
Y
x
D
E
 
E
Y
 
Y
Y
 
A
P
 
G
L
 
L
A
 
S
S
 
S
D
 
D
A
 
D
V
 
P
N
 
N
S
 
S
N
 
Y
L
 
H
N
 
F
A
 
Y
L
 
M
K
 
N
E
 
D
M
 
R
L
 
F
L
 
F
D
 
Q
H
 
H
V
 
I
D
 
D
I
 
S
D
 
K
M
 
P
Q
 
S
N
 
R
V
 
H
F
 
F
S
 
I
P
 
P
N
 
N
G
 
G
T
 
N
I
 
-
A
 
-
K
 
A
D
 
D
T
 
D
I
 
L
F
 
E
E
 
A
Y
 
E
C
 
C
R
 
R
L
 
R
Y
 
Y
E
 
E
Q
 
Q
R
 
L
I
 
V
E
 
D
S
 
S
F
 
L
G
 
G
G
 
D
I
 
T
D
 
D
V
 
I
A
 
Q
V
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
V
 
N
G
 
G
N
x
H
I
 
I
G
|
G
F
 
F
N
 
N
E
 
E
P
 
P
G
 
G
S
 
T
R
 
S
L
 
F
N
 
K
S
 
S
T
 
R
T
 
T
R
 
H
L
 
V
I
 
V
L
 
T
L
 
L
D
 
N
S
 
E
D
 
Q
S
 
T
R
 
R
N
 
Q
E
 
A
A
 
N
S
 
A
K
x
R
M
 
Y
F
 
F
G
 
P
S
 
S
I
 
I
E
 
D
S
 
S
T
 
V
P
 
P
V
 
K
S
 
K
S
 
A
I
 
L
T
 
T
M
 
M
G
 
G
V
 
I
A
 
Q
T
 
T
I
 
I
L
 
L
S
 
S
A
 
S
K
 
K
K
 
R
V
 
I
Y
 
L
L
 
L
L
 
L
A
 
I
W
 
S
G
 
G
E
 
K
E
 
S
K
|
K
A
 
A
K
 
E
M
 
A
V
 
V
K
 
R
E
 
K
C
 
L
V
 
L
E
 
E
G
 
G
N
 
N
V
 
I
T
 
S
D
 
E
T
 
D
I
 
F
P
 
P
A
 
A
S
 
S
Y
 
A
L
 
L
Q
 
H
T
 
L
H
 
H
N
 
S
N
 
D
A
 
V
H
 
T
I
 
V
A
 
L
I
 
I
D
 
D
L
 
R
S
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
S

5hj5B Crystal structure of tertiary complex of glucosamine-6-phosphate deaminase from vibrio cholerae with beta-d-glucose-6-phosphate and fructose-6-phosphate
37% identity, 35% coverage: 44:275/663 of query aligns to 5:240/267 of 5hj5B

query
sites
5hj5B
P
 
P
E
 
L
E
 
K
G
 
A
A
 
A
N
 
A
Q
 
Q
I
 
V
-
 
G
-
 
K
-
 
W
-
 
A
A
 
A
L
 
A
D
 
H
I
 
I
A
 
V
Q
 
K
V
 
R
I
 
I
R
 
N
D
 
E
K
 
F
Q
 
Q
-
 
P
K
 
T
A
 
A
G
 
E
R
 
R
F
 
P
C
 
F
V
 
V
L
 
L
A
 
G
L
 
L
A
 
P
G
x
T
G
|
G
N
x
G
S
x
T
P
 
P
R
 
L
N
 
A
V
 
T
Y
 
Y
S
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
I
R
 
E
M
 
M
H
 
H
K
 
K
E
 
A
E
 
G
G
 
E
L
 
V
S
 
S
F
 
F
R
 
K
N
 
H
V
 
V
V
 
V
V
 
T
F
 
F
N
 
N
L
 
M
Y
x
D
E
 
E
Y
 
Y
Y
 
V
P
 
G
L
 
L
A
 
A
S
 
A
D
 
D
A
 
H
V
 
P
N
 
E
S
 
S
N
 
Y
L
 
R
N
 
S
A
 
F
L
 
M
K
 
Y
E
 
N
M
 
N
L
 
F
L
 
F
D
 
N
H
 
H
V
 
I
D
 
D
I
 
I
D
 
Q
M
 
E
Q
 
E
N
 
N
V
 
I
F
 
N
S
 
L
P
 
L
N
 
N
G
 
G
T
 
N
I
 
-
A
 
-
K
 
T
D
 
D
T
 
D
I
 
H
F
 
E
E
 
A
Y
 
E
C
 
C
R
 
K
L
 
R
Y
 
Y
E
 
E
Q
 
D
R
 
K
I
 
I
E
 
K
S
 
S
F
 
Y
G
 
G
G
 
K
I
 
I
D
 
N
V
 
L
A
 
F
V
 
M
L
 
G
G
|
G
I
x
V
G
 
G
R
 
N
V
x
D
G
 
G
N
x
H
I
 
I
G
x
A
F
 
F
N
 
N
E
|
E
P
 
P
G
 
A
S
 
S
R
 
S
L
 
L
N
 
S
S
 
S
T
 
R
T
 
T
R
 
R
L
 
I
I
 
K
L
 
T
L
 
L
D
 
T
S
 
E
D
 
D
S
 
T
R
 
R
N
 
I
E
 
A
A
 
N
S
 
S
K
x
R
M
 
F
F
 
F
-
 
D
G
 
G
S
 
D
I
 
I
E
 
N
S
 
Q
T
 
V
P
 
P
V
 
K
S
 
Y
S
 
A
I
 
L
T
 
T
M
 
I
G
 
G
V
 
V
A
 
G
T
 
T
I
 
L
L
 
L
S
 
D
A
 
A
K
 
Q
K
 
E
V
 
I
Y
 
M
L
 
I
L
 
L
A
 
V
W
 
T
G
 
G
E
 
H
E
 
N
K
|
K
A
 
A
K
 
L
M
 
A
V
 
L
K
 
Q
E
 
A
C
 
A
V
 
V
E
 
E
G
 
G
N
 
S
V
 
V
T
 
N
D
 
H
T
 
L
I
 
W
P
 
T
A
 
V
S
 
S
Y
 
A
L
 
L
Q
 
Q
T
 
L
H
 
H
N
 
P
N
 
K
A
 
A
H
 
V
I
 
I
A
 
V
I
 
C
D
 
D

Sites not aligning to the query:

2wu1A Glucosamine-6-phosphate deaminase complexed with the allosteric activator n-acetyl-glucoamine-6-phosphate both in the active and allosteric sites.
39% identity, 32% coverage: 62:275/663 of query aligns to 28:240/266 of 2wu1A

query
sites
2wu1A
K
 
K
Q
 
P
K
 
T
A
 
A
G
 
D
R
 
R
F
 
P
C
 
F
V
 
V
L
 
L
A
 
G
L
 
L
A
 
P
G
 
T
G
 
G
N
 
G
S
x
T
P
 
P
R
 
M
N
 
T
V
 
T
Y
 
Y
S
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
V
R
 
E
M
 
M
H
 
H
K
 
K
E
 
A
E
 
G
G
 
Q
L
 
V
S
 
S
F
 
F
R
 
K
N
 
H
V
 
V
V
 
V
V
 
T
F
 
F
N
 
N
L
 
M
Y
x
D
E
 
E
Y
 
Y
Y
 
V
P
 
G
L
 
L
A
 
P
S
 
K
D
 
E
A
 
H
V
 
P
N
 
E
S
 
S
N
 
Y
L
 
Y
N
 
S
A
 
F
L
 
M
K
 
H
E
 
R
M
 
N
L
 
F
L
 
F
D
 
D
H
 
H
V
 
V
D
 
D
I
 
I
D
 
P
M
 
A
Q
 
E
N
 
N
V
 
I
F
 
N
S
 
L
P
 
L
N
 
N
G
 
G
T
 
N
I
 
-
A
 
A
K
 
P
D
 
D
T
 
I
I
 
D
F
 
A
E
 
E
Y
 
-
C
 
C
R
 
R
L
 
Q
Y
 
Y
E
 
E
Q
 
E
R
 
K
I
 
I
E
 
R
S
 
S
F
 
Y
G
 
G
G
 
K
I
 
I
D
 
H
V
 
L
A
 
F
V
 
M
L
 
G
G
 
G
I
x
V
G
|
G
R
x
N
V
x
D
G
 
G
N
x
H
I
 
I
G
 
A
F
 
F
N
 
N
E
|
E
P
 
P
G
 
A
S
 
S
R
 
S
L
 
L
N
 
A
S
 
S
T
 
R
T
 
T
R
 
R
L
 
I
I
 
K
L
 
T
L
 
L
D
 
T
S
 
H
D
 
D
S
 
T
R
 
R
N
 
V
E
x
A
A
x
N
S
 
S
K
x
R
M
 
F
F
 
F
-
 
D
G
 
N
S
 
D
I
 
V
E
 
N
S
 
Q
T
 
V
P
 
P
V
 
K
S
 
Y
S
 
A
I
 
L
T
 
T
M
 
V
G
 
G
V
 
V
A
 
G
T
 
T
I
 
L
L
 
L
S
 
D
A
 
A
K
 
E
K
 
E
V
 
V
Y
 
M
L
 
I
L
 
L
A
 
V
W
 
L
G
 
G
E
 
S
E
 
Q
K
|
K
A
 
A
K
 
L
M
 
A
V
 
L
K
 
Q
E
 
A
C
 
A
V
 
V
E
 
E
G
 
G
N
 
C
V
 
V
T
 
N
D
 
H
T
 
M
I
 
W
P
 
T
A
 
I
S
 
S
Y
 
C
L
 
L
Q
 
Q
T
 
L
H
 
H
N
 
P
N
 
K
A
 
A
H
 
I
I
 
M
A
 
V
I
 
C
D
 
D

1horA Structure and catalytic mechanism of glucosamine 6-phosphate deaminase from escherichia coli at 2.1 angstroms resolution (see paper)
39% identity, 32% coverage: 62:275/663 of query aligns to 28:240/266 of 1horA

query
sites
1horA
K
 
K
Q
 
P
K
 
T
A
 
A
G
 
D
R
 
R
F
 
P
C
 
F
V
 
V
L
 
L
A
 
G
L
 
L
A
x
P
G
x
T
G
|
G
N
x
G
S
x
T
P
 
P
R
 
M
N
 
T
V
 
T
Y
 
Y
S
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
V
R
 
E
M
 
M
H
 
H
K
 
K
E
 
A
E
 
G
G
 
Q
L
 
V
S
 
S
F
 
F
R
 
K
N
 
H
V
 
V
V
 
V
V
 
T
F
 
F
N
 
N
L
x
M
Y
x
D
E
 
E
Y
 
Y
Y
 
V
P
 
G
L
 
L
A
 
P
S
 
K
D
 
E
A
 
H
V
 
P
N
 
E
S
 
S
N
 
Y
L
 
Y
N
 
S
A
 
F
L
 
M
K
 
H
E
 
R
M
 
N
L
 
F
L
 
F
D
 
D
H
 
H
V
 
V
D
 
D
I
 
I
D
 
P
M
 
A
Q
 
E
N
 
N
V
 
I
F
 
N
S
 
L
P
 
L
N
 
N
G
 
G
T
 
N
I
 
-
A
 
A
K
 
P
D
 
D
T
 
I
I
 
D
F
 
A
E
 
E
Y
 
-
C
 
C
R
 
R
L
 
Q
Y
 
Y
E
 
E
Q
 
E
R
 
K
I
 
I
E
 
R
S
 
S
F
 
Y
G
 
G
G
 
K
I
 
I
D
 
H
V
 
L
A
 
F
V
 
M
L
 
G
G
|
G
I
x
V
G
 
G
R
 
N
V
x
D
G
 
G
N
x
H
I
 
I
G
x
A
F
|
F
N
 
N
E
|
E
P
 
P
G
 
A
S
 
S
R
 
S
L
 
L
N
 
A
S
 
S
T
 
R
T
 
T
R
 
R
L
 
I
I
 
K
L
 
T
L
 
L
D
 
T
S
 
H
D
 
D
S
 
T
R
 
R
N
 
V
E
 
A
A
 
N
S
 
S
K
 
R
M
 
F
F
 
F
-
 
D
G
 
N
S
 
D
I
 
V
E
 
N
S
 
Q
T
 
V
P
 
P
V
 
K
S
 
Y
S
 
A
I
 
L
T
 
T
M
 
V
G
 
G
V
 
V
A
 
G
T
 
T
I
 
L
L
 
L
S
 
D
A
 
A
K
 
E
K
 
E
V
 
V
Y
 
M
L
 
I
L
 
L
A
 
V
W
 
L
G
 
G
E
 
S
E
 
Q
K
|
K
A
 
A
K
 
L
M
 
A
V
 
L
K
 
Q
E
 
A
C
 
A
V
 
V
E
 
E
G
 
G
N
 
C
V
 
V
T
 
N
D
 
H
T
 
M
I
 
W
P
 
T
A
 
I
S
 
S
Y
 
C
L
 
L
Q
 
Q
T
 
L
H
 
H
N
 
P
N
 
K
A
 
A
H
 
I
I
 
M
A
 
V
I
 
C
D
 
D

1fqoA Glucosamine 6-phosphate deaminase complexed with the substrate of the reverse reaction fructose 6-phosphate (open form) (see paper)
39% identity, 32% coverage: 62:275/663 of query aligns to 28:240/266 of 1fqoA

query
sites
1fqoA
K
 
K
Q
 
P
K
 
T
A
 
A
G
 
D
R
 
R
F
 
P
C
 
F
V
 
V
L
 
L
A
 
G
L
 
L
A
 
P
G
x
T
G
|
G
N
x
G
S
x
T
P
 
P
R
 
M
N
 
T
V
 
T
Y
 
Y
S
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
V
R
 
E
M
 
M
H
 
H
K
 
K
E
 
A
E
 
G
G
 
Q
L
 
V
S
 
S
F
 
F
R
 
K
N
 
H
V
 
V
V
 
V
V
 
T
F
 
F
N
 
N
L
x
M
Y
x
D
E
 
E
Y
 
Y
Y
 
V
P
 
G
L
 
L
A
 
P
S
 
K
D
 
E
A
 
H
V
 
P
N
 
E
S
 
S
N
 
Y
L
 
Y
N
 
S
A
 
F
L
 
M
K
 
H
E
 
R
M
 
N
L
 
F
L
 
F
D
 
D
H
 
H
V
 
V
D
 
D
I
 
I
D
 
P
M
 
A
Q
 
E
N
 
N
V
 
I
F
 
N
S
 
L
P
 
L
N
 
N
G
 
G
T
 
N
I
 
-
A
 
A
K
 
P
D
 
D
T
 
I
I
 
D
F
 
A
E
 
E
Y
 
-
C
 
C
R
 
R
L
 
Q
Y
 
Y
E
 
E
Q
 
E
R
 
K
I
 
I
E
 
R
S
 
S
F
 
Y
G
 
G
G
 
K
I
 
I
D
 
H
V
 
L
A
 
F
V
 
M
L
 
G
G
|
G
I
x
V
G
 
G
R
 
N
V
x
D
G
 
G
N
x
H
I
 
I
G
x
A
F
 
F
N
 
N
E
|
E
P
 
P
G
 
A
S
|
S
R
x
S
L
 
L
N
 
A
S
 
S
T
 
R
T
 
T
R
|
R
L
x
I
I
x
K
L
 
T
L
 
L
D
 
T
S
 
H
D
 
D
S
 
T
R
 
R
N
 
V
E
 
A
A
 
N
S
 
S
K
 
R
M
 
F
F
 
F
-
 
D
G
 
N
S
 
D
I
 
V
E
 
N
S
 
Q
T
 
V
P
 
P
V
 
K
S
 
Y
S
 
A
I
 
L
T
 
T
M
 
V
G
 
G
V
 
V
A
 
G
T
 
T
I
 
L
L
 
L
S
 
D
A
 
A
K
 
E
K
 
E
V
 
V
Y
 
M
L
 
I
L
 
L
A
 
V
W
 
L
G
 
G
E
 
S
E
 
Q
K
|
K
A
 
A
K
 
L
M
 
A
V
 
L
K
 
Q
E
 
A
C
 
A
V
 
V
E
 
E
G
 
G
N
 
C
V
 
V
T
 
N
D
 
H
T
 
M
I
 
W
P
 
T
A
 
I
S
 
S
Y
 
C
L
 
L
Q
 
Q
T
 
L
H
 
H
N
 
P
N
 
K
A
 
A
H
 
I
I
 
M
A
 
V
I
 
C
D
 
D

1deaA Structure and catalytic mechanism of glucosamine 6-phosphate deaminase from escherichia coli at 2.1 angstroms resolution (see paper)
39% identity, 32% coverage: 62:275/663 of query aligns to 28:240/266 of 1deaA

query
sites
1deaA
K
 
K
Q
 
P
K
 
T
A
 
A
G
 
D
R
 
R
F
 
P
C
 
F
V
 
V
L
 
L
A
 
G
L
 
L
A
 
P
G
 
T
G
|
G
N
x
G
S
x
T
P
 
P
R
 
M
N
 
T
V
 
T
Y
 
Y
S
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
V
R
 
E
M
 
M
H
 
H
K
 
K
E
 
A
E
 
G
G
 
Q
L
 
V
S
 
S
F
 
F
R
 
K
N
 
H
V
 
V
V
 
V
V
 
T
F
 
F
N
 
N
L
 
M
Y
x
D
E
 
E
Y
 
Y
Y
 
V
P
 
G
L
 
L
A
 
P
S
 
K
D
 
E
A
 
H
V
 
P
N
 
E
S
 
S
N
 
Y
L
 
Y
N
 
S
A
 
F
L
 
M
K
 
H
E
 
R
M
 
N
L
 
F
L
 
F
D
 
D
H
 
H
V
 
V
D
 
D
I
 
I
D
 
P
M
 
A
Q
 
E
N
 
N
V
 
I
F
 
N
S
 
L
P
 
L
N
 
N
G
 
G
T
 
N
I
 
-
A
 
A
K
 
P
D
 
D
T
 
I
I
 
D
F
 
A
E
 
E
Y
 
-
C
 
C
R
 
R
L
 
Q
Y
 
Y
E
 
E
Q
 
E
R
 
K
I
 
I
E
 
R
S
 
S
F
 
Y
G
 
G
G
 
K
I
 
I
D
 
H
V
 
L
A
 
F
V
 
M
L
 
G
G
 
G
I
 
V
G
 
G
R
 
N
V
x
D
G
 
G
N
x
H
I
 
I
G
 
A
F
 
F
N
 
N
E
|
E
P
 
P
G
 
A
S
 
S
R
 
S
L
 
L
N
 
A
S
 
S
T
 
R
T
 
T
R
 
R
L
 
I
I
 
K
L
 
T
L
 
L
D
 
T
S
 
H
D
 
D
S
 
T
R
 
R
N
 
V
E
 
A
A
 
N
S
 
S
K
x
R
M
 
F
F
 
F
-
 
D
G
 
N
S
 
D
I
 
V
E
 
N
S
 
Q
T
 
V
P
 
P
V
 
K
S
 
Y
S
 
A
I
 
L
T
 
T
M
 
V
G
 
G
V
 
V
A
 
G
T
 
T
I
 
L
L
 
L
S
 
D
A
 
A
K
 
E
K
 
E
V
 
V
Y
 
M
L
 
I
L
 
L
A
 
V
W
 
L
G
 
G
E
 
S
E
 
Q
K
 
K
A
 
A
K
 
L
M
 
A
V
 
L
K
 
Q
E
 
A
C
 
A
V
 
V
E
 
E
G
 
G
N
 
C
V
 
V
T
 
N
D
 
H
T
 
M
I
 
W
P
 
T
A
 
I
S
 
S
Y
 
C
L
 
L
Q
 
Q
T
 
L
H
 
H
N
 
P
N
 
K
A
 
A
H
 
I
I
 
M
A
 
V
I
 
C
D
 
D

P0A759 Glucosamine-6-phosphate deaminase; GlcN6P deaminase; GNPDA; Glucosamine-6-phosphate isomerase; EC 3.5.99.6 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
39% identity, 32% coverage: 62:275/663 of query aligns to 28:240/266 of P0A759

query
sites
P0A759
K
 
K
Q
 
P
K
 
T
A
 
A
G
 
D
R
 
R
F
 
P
C
 
F
V
 
V
L
 
L
A
 
G
L
 
L
A
 
P
G
 
T
G
 
G
N
 
G
S
 
T
P
 
P
R
 
M
N
 
T
V
 
T
Y
 
Y
S
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
V
R
 
E
M
 
M
H
 
H
K
 
K
E
 
A
E
 
G
G
 
Q
L
 
V
S
 
S
F
 
F
R
 
K
N
 
H
V
 
V
V
 
V
V
 
T
F
 
F
N
 
N
L
 
M
Y
x
D
E
 
E
Y
 
Y
Y
 
V
P
 
G
L
 
L
A
 
P
S
 
K
D
 
E
A
 
H
V
 
P
N
 
E
S
 
S
N
 
Y
L
 
Y
N
 
S
A
 
F
L
 
M
K
 
H
E
 
R
M
 
N
L
 
F
L
 
F
D
 
D
H
 
H
V
 
V
D
 
D
I
 
I
D
 
P
M
 
A
Q
 
E
N
 
N
V
 
I
F
 
N
S
 
L
P
 
L
N
 
N
G
 
G
T
 
N
I
 
-
A
 
A
K
 
P
D
 
D
T
 
I
I
 
D
F
 
A
E
 
E
Y
 
-
C
|
C
R
 
R
L
 
Q
Y
 
Y
E
 
E
Q
 
E
R
 
K
I
 
I
E
 
R
S
 
S
F
 
Y
G
 
G
G
 
K
I
 
I
D
 
H
V
 
L
A
 
F
V
 
M
L
 
G
G
 
G
I
 
V
G
 
G
R
 
N
V
x
D
G
 
G
N
x
H
I
 
I
G
 
A
F
 
F
N
 
N
E
|
E
P
 
P
G
 
A
S
 
S
R
 
S
L
 
L
N
 
A
S
 
S
T
 
R
T
 
T
R
 
R
L
 
I
I
 
K
L
 
T
L
 
L
D
 
T
S
 
H
D
 
D
S
 
T
R
 
R
N
 
V
E
 
A
A
 
N
S
 
S
K
 
R
M
 
F
F
 
F
-
 
D
G
 
N
S
 
D
I
 
V
E
 
N
S
 
Q
T
 
V
P
 
P
V
 
K
S
 
Y
S
 
A
I
 
L
T
 
T
M
 
V
G
 
G
V
 
V
A
 
G
T
 
T
I
 
L
L
 
L
S
 
D
A
 
A
K
 
E
K
 
E
V
 
V
Y
 
M
L
 
I
L
 
L
A
 
V
W
 
L
G
 
G
E
 
S
E
 
Q
K
 
K
A
 
A
K
 
L
M
 
A
V
 
L
K
 
Q
E
 
A
C
 
A
V
 
V
E
 
E
G
 
G
N
x
C
V
 
V
T
 
N
D
 
H
T
 
M
I
 
W
P
 
T
A
 
I
S
 
S
Y
 
C
L
 
L
Q
 
Q
T
 
L
H
 
H
N
 
P
N
 
K
A
 
A
H
 
I
I
 
M
A
 
V
I
x
C
D
 
D

2ri1A Crystal structure of glucosamine 6-phosphate deaminase (nagb) with glcn6p from s. Mutans (see paper)
38% identity, 32% coverage: 71:282/663 of query aligns to 33:235/235 of 2ri1A

query
sites
2ri1A
L
 
L
A
 
G
L
 
L
A
 
A
G
 
T
G
 
G
N
x
S
S
x
T
P
 
P
R
 
L
N
 
E
V
 
L
Y
 
Y
S
 
K
A
 
E
L
 
I
V
 
R
R
 
E
M
 
S
H
 
H
K
 
-
E
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
L
S
 
D
F
 
F
R
 
S
N
 
D
V
 
M
V
 
V
V
 
S
F
 
I
N
 
N
L
 
L
Y
x
D
E
 
E
Y
 
Y
Y
 
V
P
 
G
L
 
L
A
 
S
S
 
A
D
 
D
A
 
D
V
 
K
N
 
Q
S
 
S
N
 
Y
L
 
A
N
 
Y
A
 
F
L
 
M
K
 
K
E
 
Q
M
 
N
L
 
L
L
 
F
D
 
-
H
 
-
V
 
A
D
 
A
I
 
K
D
 
P
M
 
F
Q
 
K
N
 
K
V
 
S
F
 
Y
S
 
L
P
 
P
N
 
N
G
 
G
T
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
D
I
 
L
A
 
A
K
 
K
D
 
E
T
 
T
I
 
-
F
 
-
E
 
E
Y
 
Y
C
 
-
R
 
-
L
 
-
Y
 
Y
E
 
D
Q
 
Q
R
 
I
I
 
L
E
 
A
S
 
Q
F
 
Y
G
 
P
G
 
-
I
 
I
D
 
D
V
 
L
A
 
Q
V
 
I
L
 
L
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
V
x
N
G
 
A
N
x
H
I
 
I
G
 
G
F
 
F
N
 
N
E
|
E
P
 
P
G
 
G
S
 
T
R
 
A
L
 
F
N
 
S
S
 
S
T
 
Q
T
 
T
R
 
H
L
 
L
I
 
V
L
 
D
L
 
L
D
 
T
S
 
P
D
 
S
S
 
T
R
 
I
N
 
A
E
 
A
A
 
N
S
 
S
K
 
R
M
 
F
F
 
F
G
 
E
S
 
K
I
 
A
E
 
E
S
 
D
T
 
V
P
 
P
V
 
K
S
 
Q
S
 
A
I
 
I
T
 
S
M
 
M
G
 
G
V
 
L
A
 
A
T
 
S
I
 
I
L
 
M
S
 
S
A
 
A
K
 
K
K
 
M
V
 
I
Y
 
L
L
 
L
L
 
M
A
 
A
W
 
F
G
 
G
E
 
E
E
 
E
K
|
K
A
 
A
K
 
E
M
 
A
V
 
V
K
 
A
E
 
A
C
 
M
V
 
V
E
 
K
G
 
G
N
 
P
V
 
V
T
 
T
D
 
E
T
 
E
I
 
I
P
 
P
A
 
A
S
 
S
Y
 
I
L
 
L
Q
 
Q
T
 
T
H
 
H
N
 
P
N
 
K
A
 
V
H
 
I
I
 
L
A
 
I
I
 
V
D
 
D
L
 
E
S
 
K
A
 
A
A
 
G
A
 
A
N
 
G
L
 
I

3hn6A Crystal structure of glucosamine-6-phosphate deaminase from borrelia burgdorferi
34% identity, 35% coverage: 48:282/663 of query aligns to 20:250/271 of 3hn6A

query
sites
3hn6A
A
 
A
N
 
N
Q
 
H
I
 
V
A
 
A
L
 
Q
D
 
K
I
 
I
A
 
N
Q
 
E
V
 
F
I
 
S
R
 
P
D
 
T
K
 
K
Q
 
E
K
 
N
A
 
P
G
 
-
R
 
-
F
 
-
C
 
F
V
 
I
L
 
L
A
 
G
L
 
L
A
 
P
G
 
T
G
 
G
N
 
S
S
 
S
P
 
P
R
 
I
N
 
G
V
 
M
Y
 
Y
S
 
K
A
 
N
L
 
L
V
 
I
R
 
E
M
 
L
H
 
N
K
 
K
E
 
N
E
 
K
G
 
K
L
 
I
S
 
S
F
 
F
R
 
Q
N
 
N
V
 
V
V
 
I
V
 
T
F
 
F
N
 
N
L
 
M
Y
x
D
E
 
E
Y
 
Y
Y
 
I
P
 
G
L
 
I
A
 
E
S
 
E
D
 
N
A
 
H
V
 
P
N
 
E
S
 
S
N
 
Y
L
 
H
N
 
S
A
 
F
L
 
M
K
 
W
E
 
N
M
 
N
L
 
F
L
 
F
D
 
S
H
 
H
V
 
I
D
 
D
I
 
I
D
 
K
M
 
K
Q
 
E
N
 
N
V
 
I
F
 
N
S
 
I
P
 
L
N
 
N
G
 
G
T
 
N
I
 
A
A
 
S
K
 
-
D
 
-
T
 
N
I
 
L
F
 
K
E
 
K
Y
 
E
C
 
C
R
 
E
L
 
E
Y
 
Y
E
 
E
Q
 
K
R
 
K
I
 
I
E
 
K
S
 
S
F
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
I
D
 
M
V
 
L
A
 
F
V
 
V
L
 
G
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
P
V
x
D
G
 
G
N
x
H
I
 
I
G
 
A
F
 
F
N
 
N
E
|
E
P
 
P
G
 
G
S
 
S
R
 
S
L
 
L
N
 
T
S
 
S
T
 
R
T
 
T
R
 
R
L
 
I
I
 
K
L
 
T
L
 
L
D
 
T
S
 
Q
D
 
D
S
 
T
R
 
I
N
 
I
E
 
A
A
 
N
S
 
S
K
 
R
M
 
F
F
 
F
-
 
E
G
 
G
S
 
D
I
 
V
E
 
N
S
 
K
T
 
V
P
 
P
V
 
K
S
 
N
S
 
A
I
 
L
T
 
T
M
 
V
G
 
G
V
 
I
A
 
G
T
 
T
I
 
I
L
 
M
S
 
D
A
 
S
K
 
Q
K
 
E
V
 
V
Y
 
L
L
 
I
L
 
I
A
 
V
W
 
N
G
 
G
E
 
H
E
 
N
K
 
K
A
 
A
K
x
R
M
 
A
V
 
L
K
|
K
E
x
H
C
 
A
V
 
I
E
 
E
G
 
K
N
 
G
V
 
V
T
 
N
D
 
H
T
 
M
I
 
W
P
 
T
A
 
I
S
 
S
Y
 
A
L
 
L
Q
 
Q
T
 
L
H
 
H
N
 
K
N
 
N
A
 
A
H
 
I
I
 
I
A
 
V
I
 
S
D
 
D
L
 
K
S
 
N
A
 
A
A
 
T
A
 
Y
N
 
E
L
 
L

1ne7A Human glucosamine-6-phosphate deaminase isomerase at 1.75 a resolution complexed with n-acetyl-glucosamine-6-phosphate and 2-deoxy-2-amino- glucitol-6-phosphate (see paper)
33% identity, 33% coverage: 67:282/663 of query aligns to 33:247/281 of 1ne7A

query
sites
1ne7A
R
x
K
F
 
Y
C
 
F
V
 
T
L
 
L
A
 
G
L
 
L
A
x
P
G
 
T
G
 
G
N
 
S
S
x
T
P
 
P
R
 
L
N
 
G
V
 
C
Y
 
Y
S
 
K
A
 
K
L
 
L
V
 
I
R
 
E
M
 
Y
H
 
Y
K
 
K
E
 
N
E
 
G
G
 
D
L
 
L
S
 
S
F
 
F
R
 
K
N
 
Y
V
 
V
V
 
K
V
 
T
F
 
F
N
 
N
L
x
M
Y
x
D
E
 
E
Y
 
Y
Y
 
V
P
 
G
L
 
L
A
 
P
S
 
R
D
 
D
A
 
H
V
 
P
N
 
E
S
 
S
N
 
Y
L
 
H
N
 
S
A
 
F
L
 
M
K
 
W
E
 
N
M
 
N
L
 
F
L
 
F
D
 
K
H
 
H
V
 
I
D
 
D
I
 
I
D
 
H
M
 
P
Q
 
E
N
 
N
V
 
T
F
 
H
S
 
I
P
 
L
N
 
D
G
 
G
T
 
N
I
 
-
A
 
A
K
 
V
D
 
D
T
 
L
I
 
Q
F
 
A
E
 
E
Y
 
-
C
 
C
R
 
D
L
 
A
Y
 
F
E
 
E
Q
 
E
R
 
K
I
 
I
E
 
K
S
 
A
F
 
A
G
 
G
G
 
G
I
 
I
D
 
E
V
 
L
A
 
F
V
 
V
L
 
G
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
P
V
x
D
G
 
G
N
x
H
I
 
I
G
x
A
F
 
F
N
 
N
E
|
E
P
 
P
G
 
G
S
|
S
R
x
S
L
 
L
N
 
V
S
 
S
T
 
R
T
 
T
R
|
R
L
x
V
I
x
K
L
x
T
L
 
L
D
 
A
S
 
M
D
 
D
S
 
T
R
 
I
N
 
L
E
 
A
A
 
N
S
 
A
K
 
R
M
 
F
F
 
F
-
 
D
G
 
G
S
 
E
I
 
L
E
 
T
S
 
K
T
 
V
P
 
P
V
 
T
S
 
M
S
 
A
I
 
L
T
 
T
M
 
V
G
 
G
V
 
V
A
 
G
T
 
T
I
 
V
L
 
M
S
 
D
A
 
A
K
 
R
K
 
E
V
 
V
Y
 
M
L
 
I
L
 
L
A
 
I
W
 
T
G
 
G
E
 
A
E
 
H
K
|
K
A
 
A
K
 
F
M
 
A
V
 
L
K
 
Y
E
 
K
C
 
A
V
 
I
E
 
E
G
 
E
N
 
G
V
 
V
T
 
N
D
 
H
T
 
M
I
 
W
P
 
T
A
 
V
S
 
S
Y
 
A
L
 
F
Q
 
Q
T
 
Q
H
 
H
N
 
P
N
 
R
A
 
T
H
 
V
I
 
F
A
 
V
I
 
C
D
 
D
L
 
E
S
 
D
A
 
A
A
 
T
A
 
L
N
 
E
L
 
L

Sites not aligning to the query:

P46926 Glucosamine-6-phosphate deaminase 1; GlcN6P deaminase 1; Glucosamine-6-phosphate isomerase 1; Protein oscillin; EC 3.5.99.6 from Homo sapiens (Human) (see paper)
33% identity, 33% coverage: 67:282/663 of query aligns to 33:247/289 of P46926

query
sites
P46926
R
 
K
F
 
Y
C
 
F
V
 
T
L
 
L
A
 
G
L
 
L
A
 
P
G
 
T
G
 
G
N
 
S
S
 
T
P
 
P
R
 
L
N
 
G
V
 
C
Y
 
Y
S
 
K
A
 
K
L
 
L
V
 
I
R
 
E
M
 
Y
H
 
Y
K
 
K
E
 
N
E
 
G
G
 
D
L
 
L
S
 
S
F
 
F
R
 
K
N
 
Y
V
 
V
V
 
K
V
 
T
F
 
F
N
 
N
L
 
M
Y
 
D
E
 
E
Y
 
Y
Y
 
V
P
 
G
L
 
L
A
 
P
S
 
R
D
 
D
A
 
H
V
 
P
N
 
E
S
 
S
N
 
Y
L
 
H
N
 
S
A
 
F
L
 
M
K
 
W
E
 
N
M
 
N
L
 
F
L
 
F
D
 
K
H
 
H
V
 
I
D
 
D
I
 
I
D
 
H
M
 
P
Q
 
E
N
 
N
V
 
T
F
 
H
S
 
I
P
 
L
N
 
D
G
 
G
T
 
N
I
 
-
A
 
A
K
 
V
D
 
D
T
 
L
I
 
Q
F
 
A
E
 
E
Y
 
-
C
 
C
R
 
D
L
 
A
Y
 
F
E
 
E
Q
 
E
R
 
K
I
 
I
E
 
K
S
 
A
F
 
A
G
 
G
G
 
G
I
 
I
D
 
E
V
 
L
A
 
F
V
 
V
L
 
G
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
P
V
 
D
G
 
G
N
 
H
I
 
I
G
 
A
F
 
F
N
 
N
E
 
E
P
 
P
G
 
G
S
 
S
R
 
S
L
 
L
N
 
V
S
 
S
T
 
R
T
 
T
R
 
R
L
 
V
I
 
K
L
 
T
L
 
L
D
 
A
S
 
M
D
 
D
S
 
T
R
 
I
N
 
L
E
 
A
A
 
N
S
 
A
K
 
R
M
 
F
F
 
F
-
 
D
G
 
G
S
 
E
I
 
L
E
 
T
S
 
K
T
 
V
P
 
P
V
 
T
S
 
M
S
 
A
I
 
L
T
 
T
M
 
V
G
 
G
V
 
V
A
 
G
T
 
T
I
 
V
L
 
M
S
 
D
A
 
A
K
 
R
K
 
E
V
 
V
Y
 
M
L
 
I
L
 
L
A
 
I
W
 
T
G
 
G
E
 
A
E
 
H
K
 
K
A
 
A
K
 
F
M
 
A
V
 
L
K
 
Y
E
 
K
C
 
A
V
 
I
E
 
E
G
 
E
N
 
G
V
 
V
T
 
N
D
 
H
T
 
M
I
 
W
P
 
T
A
 
V
S
 
S
Y
 
A
L
 
F
Q
 
Q
T
 
Q
H
 
H
N
 
P
N
 
R
A
 
T
H
 
V
I
 
F
A
 
V
I
 
C
D
 
D
L
 
E
S
 
D
A
 
A
A
 
T
A
 
L
N
 
E
L
 
L

Sites not aligning to the query:

3e7fB Crystal structure of 6-phosphogluconolactonase from trypanosoma brucei complexed with 6-phosphogluconic acid (see paper)
25% identity, 33% coverage: 40:258/663 of query aligns to 8:233/263 of 3e7fB

query
sites
3e7fB
I
 
V
Y
 
H
E
 
A
S
 
T
P
 
P
E
 
Q
E
 
E
G
 
L
A
 
S
N
 
A
Q
 
A
I
 
G
A
 
C
L
 
R
D
 
K
I
 
I
A
 
V
Q
 
E
V
 
I
I
 
I
R
 
E
D
 
A
K
 
S
Q
 
G
K
 
S
A
 
Q
G
 
Q
R
 
W
F
 
P
C
 
L
V
 
S
L
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
N
x
S
S
x
T
P
 
P
R
 
K
N
 
M
V
 
T
Y
 
Y
S
 
A
A
 
-
L
 
-
V
 
-
R
 
R
M
 
L
H
|
H
K
 
D
E
 
E
E
 
H
-
 
L
-
 
N
G
 
L
L
 
L
S
 
R
F
 
E
R
 
K
N
 
R
V
 
A
V
 
L
V
 
R
F
 
F
N
 
F
L
 
M
Y
 
G
E
 
D
Y
 
E
Y
x
R
P
 
M
L
 
V
A
 
P
S
 
A
D
 
D
A
 
S
V
 
T
N
 
D
S
 
S
N
 
N
L
 
Y
N
 
N
A
 
M
L
 
A
K
 
R
E
 
E
M
 
V
L
 
L
L
 
L
D
x
H
H
x
D
V
 
I
D
 
P
I
 
D
D
 
D
M
 
L
-
 
V
-
 
F
-
 
P
-
 
F
-
 
D
Q
 
T
N
 
S
V
 
A
F
 
V
S
 
T
P
 
P
N
 
S
G
 
A
T
 
E
I
 
A
A
 
T
K
 
S
D
 
A
T
 
D
I
 
A
F
 
M
E
 
R
Y
 
V
C
 
A
R
 
E
L
 
A
Y
 
Y
E
 
G
Q
 
K
R
 
Q
I
 
L
E
 
A
S
 
S
F
 
L
G
 
L
G
 
P
I
 
L
-
 
K
-
 
S
-
 
V
-
 
G
-
 
E
-
 
A
-
 
G
-
 
P
-
 
K
-
 
V
-
 
P
-
 
V
-
 
F
D
 
D
V
 
V
A
 
V
V
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
L
G
 
G
R
 
S
V
 
D
G
 
G
N
x
H
I
 
T
G
 
A
F
 
S
N
 
I
E
 
F
P
 
P
G
 
G
S
 
S
R
 
Q
L
 
A
N
 
E
S
 
K
T
 
E
T
 
T
R
 
-
L
 
-
I
 
-
L
 
-
L
 
-
D
 
-
S
 
-
D
 
D
S
 
G
R
 
K
N
 
V
E
 
V
A
 
V
S
 
S
K
 
V
M
 
G
F
 
F
G
 
P
S
 
S
I
 
E
E
 
T
S
x
M
T
 
K
P
 
P
-
 
K
V
 
V
S
 
W
S
x
R
I
 
V
T
 
T
M
 
L
G
 
S
V
 
P
A
 
A
T
 
T
I
 
I
L
 
M
S
 
Q
A
 
A
K
 
R
K
 
N
V
 
V
Y
 
I
L
 
V
L
 
L
A
 
A
W
 
T
G
 
G
E
 
A
E
 
E
K
|
K
A
 
-
K
 
-
M
 
-
V
 
-
K
 
K
E
 
W
C
 
V
V
 
V
E
 
D
G
 
G
N
 
I
V
 
L
T
 
A
D
 
D
T
 
T

3eb9A Crystal structure of 6-phosphogluconolactonase from trypanosoma brucei complexed with citrate (see paper)
25% identity, 33% coverage: 40:258/663 of query aligns to 8:233/260 of 3eb9A

query
sites
3eb9A
I
 
V
Y
 
H
E
 
A
S
 
T
P
 
P
E
 
Q
E
 
E
G
 
L
A
 
S
N
 
A
Q
 
A
I
 
G
A
 
C
L
 
R
D
 
K
I
 
I
A
 
V
Q
 
E
V
 
I
I
 
I
R
 
E
D
 
A
K
 
S
Q
 
G
K
 
S
A
 
Q
G
 
Q
R
 
W
F
 
P
C
 
L
V
 
S
L
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
N
 
S
S
 
T
P
 
P
R
 
K
N
 
M
V
 
T
Y
 
Y
S
 
A
A
 
-
L
 
-
V
 
-
R
 
R
M
 
L
H
|
H
K
 
D
E
 
E
E
 
H
-
 
L
-
 
N
G
 
L
L
 
L
S
 
R
F
 
E
R
 
K
N
 
R
V
 
A
V
 
L
V
 
R
F
 
F
N
 
F
L
 
M
Y
 
G
E
 
D
Y
 
E
Y
 
R
P
 
M
L
 
V
A
 
P
S
 
A
D
 
D
A
 
S
V
 
T
N
 
D
S
 
S
N
 
N
L
 
Y
N
 
N
A
 
M
L
 
A
K
 
R
E
 
E
M
 
V
L
 
L
L
 
L
D
x
H
H
x
D
V
 
I
D
 
P
I
 
D
D
 
D
M
 
L
-
 
V
-
 
F
-
 
P
-
 
F
-
 
D
Q
 
T
N
 
S
V
 
A
F
 
V
S
 
T
P
 
P
N
 
S
G
 
A
T
 
E
I
 
A
A
 
T
K
 
S
D
 
A
T
 
D
I
 
A
F
 
M
E
 
R
Y
 
V
C
 
A
R
 
E
L
 
A
Y
 
Y
E
 
G
Q
 
K
R
 
Q
I
 
L
E
 
A
S
 
S
F
 
L
G
 
L
G
 
P
I
 
L
-
 
K
-
 
S
-
 
V
-
 
G
-
 
E
-
 
A
-
 
G
-
 
P
-
 
K
-
 
V
-
 
P
-
 
V
-
 
F
D
 
D
V
 
V
A
 
V
V
 
L
L
 
L
G
|
G
I
 
L
G
 
G
R
 
S
V
 
D
G
 
G
N
x
H
I
 
T
G
x
A
F
 
S
N
 
I
E
 
F
P
 
P
G
 
G
S
 
S
R
 
Q
L
 
A
N
 
E
S
 
K
T
 
E
T
 
T
R
 
-
L
 
-
I
 
-
L
 
-
L
 
-
D
 
-
S
 
-
D
 
D
S
 
G
R
 
K
N
 
V
E
 
V
A
 
V
S
 
S
K
 
V
M
 
G
F
 
F
G
 
P
S
 
S
I
 
E
E
 
T
S
 
M
T
 
K
P
 
P
-
 
K
V
 
V
S
 
W
S
 
R
I
 
V
T
 
T
M
 
L
G
 
S
V
 
P
A
 
A
T
 
T
I
 
I
L
 
M
S
 
Q
A
 
A
K
 
R
K
 
N
V
 
V
Y
 
I
L
 
V
L
 
L
A
 
A
W
 
T
G
 
G
E
 
A
E
 
E
K
 
K
A
 
-
K
 
-
M
 
-
V
 
-
K
 
K
E
 
W
C
 
V
V
 
V
E
 
D
G
 
G
N
 
I
V
 
L
T
 
A
D
 
D
T
 
T

8bgoG N,n-diacetylchitobiose deacetylase from pyrococcus chitonophagus with substrate n,n-diacetylchitobiose (see paper)
44% identity, 7% coverage: 378:425/663 of query aligns to 36:83/271 of 8bgoG

query
sites
8bgoG
K
 
K
R
 
K
V
 
V
V
 
L
V
 
C
F
 
I
S
 
E
P
 
P
H
|
H
P
 
P
D
 
D
D
|
D
D
 
C
V
 
V
I
 
I
S
 
G
M
 
M
G
 
G
G
 
G
T
 
T
I
 
I
R
 
K
R
 
R
L
 
L
V
 
T
E
 
D
Q
 
R
K
 
G
H
 
I
D
 
E
V
 
V
H
 
I
V
 
Y
A
 
I
Y
 
C
E
 
M
T
 
T
S
 
D
G
 
G
N
 
Y
I
 
M
A
 
G
V
 
T
G
 
T
D
 
D
E
 
E
E
 
N
V
 
I

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_009120567.1 NCBI__GCF_900129655.1:WP_009120567.1
MKTNLSSQITLNRVSPRYYRPENAFERSVLTRLEKIPTDIYESPEEGANQIALDIAQVIR
DKQKAGRFCVLALAGGNSPRNVYSALVRMHKEEGLSFRNVVVFNLYEYYPLASDAVNSNL
NALKEMLLDHVDIDMQNVFSPNGTIAKDTIFEYCRLYEQRIESFGGIDVAVLGIGRVGNI
GFNEPGSRLNSTTRLILLDSDSRNEASKMFGSIESTPVSSITMGVATILSAKKVYLLAWG
EEKAKMVKECVEGNVTDTIPASYLQTHNNAHIAIDLSAAANLTRIQRPWLVTSCEWNDKL
IRSAIVWLCQLTGKPILKLTNKDYNENGLSELLALYGSAYNVNIKIFNDLQHTITGWPGG
KPNADDTYRPERAKPYPKRVVVFSPHPDDDVISMGGTIRRLVEQKHDVHVAYETSGNIAV
GDEEVIRFLHFINGFNQLFNNSEDQVINEKYTEIRNYLKDKKDGDMDTRDILTIKGLIRR
GEARTACTYNNIPLDHCHFLDLPFYETGKIQKNPISEADVEIVRNLLREVKPHQIFVAGD
LADPHGTHRVCTDAVFAAIDLEKEEGAKWLKDCRIWMYRGAWAEWEIENIEMAVPISPEE
LRAKRNSILKHQSQMESAPFLGNDERLFWQRSEDRNRGTAALYDSLGLASYEAMEAFVEY
IPL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory