SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_009124122.1 NCBI__GCF_000195635.1:WP_009124122.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5d3mA Folate ecf transporter: amppnp bound state (see paper)
27% identity, 44% coverage: 264:474/485 of query aligns to 2:210/280 of 5d3mA

query
sites
5d3mA
S
 
S
D
 
D
E
 
N
V
 
I
V
 
I
K
 
S
L
 
F
N
 
D
K
 
H
V
 
V
S
 
T
I
x
F
R
 
T
Y
 
Y
D
 
P
D
 
D
-
 
S
-
 
P
R
 
R
T
 
P
I
 
A
L
 
L
K
 
S
E
 
D
L
 
L
D
 
S
W
 
F
T
 
A
V
 
I
M
 
E
R
 
R
G
 
G
E
 
S
K
 
W
W
 
T
A
 
A
L
 
L
S
 
I
G
 
G
E
 
H
N
|
N
G
|
G
A
 
S
G
 
G
K
|
K
S
|
S
T
 
T
L
 
V
L
 
S
S
 
K
L
 
L
V
 
I
-
 
N
-
 
G
-
 
L
-
 
L
C
 
A
A
 
P
D
 
D
N
 
D
P
 
L
Q
 
D
S
 
K
Y
 
S
A
 
S
C
 
-
D
 
-
I
 
I
S
 
T
L
 
V
F
 
D
G
 
G
R
 
V
K
 
K
R
 
L
G
 
G
T
 
A
G
 
-
E
 
D
S
 
T
I
 
V
W
 
W
E
 
E
I
 
V
K
 
R
K
 
E
H
 
K
I
 
V
G
 
G
Y
 
I
V
 
V
S
 
-
P
 
-
E
 
-
M
 
-
H
 
-
R
 
-
A
 
-
Y
 
-
L
 
F
K
 
Q
N
 
N
L
 
-
P
 
P
A
 
D
I
 
N
E
 
Q
I
 
F
V
 
V
A
 
G
S
 
A
G
 
T
L
 
V
H
 
S
D
 
D
S
 
D
I
 
V
-
 
A
-
 
F
G
 
G
L
 
L
Y
 
E
K
 
N
R
 
R
-
 
A
-
 
V
P
 
P
R
 
R
E
 
P
E
 
E
Q
 
M
L
 
L
A
 
K
V
 
I
C
 
V
E
 
A
W
 
Q
W
 
A
M
 
V
D
 
A
V
 
D
F
 
V
G
 
G
I
 
M
A
 
A
G
 
D
L
 
Y
K
 
A
D
 
D
K
 
S
P
 
E
F
 
P
L
 
S
Q
 
N
L
 
L
S
 
S
S
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
K
R
 
Q
L
 
R
A
 
V
L
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
G
A
 
I
F
 
L
V
 
A
K
 
V
D
 
K
P
 
P
E
 
Q
L
 
V
L
 
I
I
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
S
L
 
T
H
 
S
G
 
M
L
 
L
D
 
D
T
 
P
Y
 
E
N
 
G
R
 
K
R
 
E
R
 
Q
V
 
I
K
 
L
K
 
D
I
 
L
I
 
V
E
 
R
A
 
K
F
 
I
C
 
K
H
 
E
R
 
D
K
 
N
D
 
N
K
 
L
T
 
T
M
 
V
I
 
I
M
 
S
V
 
I
T
 
T
H
 
H
Y
 
D
E
 
L
N
 
E
E
 
E
L
 
A
P
 
A
G
 
G
T
 
A

3nhaA Nucleotide binding domain of human abcb6 (adp mg bound structure) (see paper)
28% identity, 41% coverage: 268:466/485 of query aligns to 41:233/278 of 3nhaA

query
sites
3nhaA
V
 
I
K
 
E
L
 
F
N
 
E
K
 
N
V
 
V
S
 
H
I
 
F
R
 
S
Y
|
Y
D
 
A
D
 
D
R
 
R
T
 
E
I
x
T
L
 
L
K
 
Q
E
 
D
L
 
V
D
 
S
W
 
F
T
 
T
V
 
V
M
 
M
R
 
P
G
 
G
E
 
Q
K
 
T
W
 
L
A
 
A
L
 
L
S
 
V
G
 
G
E
 
P
N
 
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
I
L
 
L
S
 
R
L
 
L
V
 
L
C
 
F
A
 
R
D
 
F
N
 
Y
P
 
D
Q
 
I
S
 
S
Y
 
S
A
 
G
C
 
C
D
 
-
I
 
-
S
 
-
L
 
-
F
 
-
G
 
-
R
 
-
K
 
I
R
 
R
G
 
I
T
 
D
G
 
G
E
 
Q
S
 
D
I
 
I
W
 
S
E
 
Q
I
 
V
-
 
T
-
 
Q
-
 
A
-
 
S
-
 
L
K
 
R
K
 
S
H
 
H
I
 
I
G
 
G
Y
 
V
V
 
V
S
 
P
P
 
Q
E
 
D
-
 
T
-
 
V
-
 
L
M
 
F
H
 
N
R
 
D
A
 
T
Y
 
I
L
 
A
K
 
D
N
 
N
L
 
I
P
 
R
A
 
Y
I
 
G
E
 
R
I
 
V
V
 
T
-
 
A
-
 
G
-
 
N
-
 
D
-
 
E
-
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
Q
A
 
A
S
 
A
G
 
G
L
 
I
H
 
H
D
 
D
S
 
A
I
 
I
G
 
-
L
 
-
Y
 
-
K
 
-
R
 
-
P
 
-
R
 
-
E
 
-
E
 
-
Q
 
-
L
 
M
A
 
A
V
 
F
C
 
P
E
 
E
W
 
G
W
 
Y
M
 
R
D
 
T
V
 
Q
F
 
V
G
 
G
I
 
E
A
 
R
G
 
G
L
 
L
K
 
K
D
 
-
K
 
-
P
 
-
F
 
-
L
 
-
Q
 
-
L
 
L
S
 
S
S
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
K
R
 
Q
L
 
R
A
 
V
L
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
T
F
 
I
V
 
L
K
 
K
D
 
A
P
 
P
E
 
G
L
 
I
L
 
I
I
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
A
L
 
T
H
 
S
G
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
T
Y
 
S
N
 
N
R
 
E
R
 
R
R
 
A
V
 
I
K
 
Q
K
 
A
I
 
S
I
 
L
E
 
A
A
 
K
F
 
V
C
 
C
H
 
-
R
 
-
K
 
A
D
 
N
K
 
R
T
 
T
M
 
T
I
 
I
M
 
V
V
 
V
T
 
A
H
 
H

8tzjA Cryo-em structure of vibrio cholerae ftse/ftsx complex (see paper)
32% identity, 41% coverage: 267:466/485 of query aligns to 2:196/220 of 8tzjA

query
sites
8tzjA
V
 
V
V
 
I
K
 
R
L
 
F
N
 
Q
K
 
Q
V
 
V
S
 
S
I
 
K
R
 
A
Y
|
Y
-
 
R
D
 
G
D
 
G
R
|
R
T
 
Q
I
x
A
L
 
L
K
 
Q
E
 
K
L
 
V
D
 
D
W
 
F
T
 
H
V
 
L
M
 
R
R
 
R
G
 
G
E
 
E
K
 
M
W
 
A
A
 
F
L
 
L
S
 
G
G
 
G
E
 
H
N
 
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
 
T
L
 
L
L
 
L
S
 
K
L
 
L
V
 
I
C
 
C
A
 
A
-
 
I
D
 
E
N
 
R
P
 
P
Q
 
T
S
 
D
Y
 
G
A
 
K
C
 
I
D
 
S
I
 
F
S
 
N
L
 
G
F
 
H
G
 
D
R
 
I
K
 
T
R
 
R
G
 
I
T
 
P
G
 
N
E
 
K
S
 
D
I
 
I
W
 
P
E
 
F
I
 
L
K
 
R
K
 
R
H
 
N
I
 
I
G
 
G
Y
 
I
V
 
V
S
 
F
P
 
Q
E
 
D
M
 
-
H
 
H
R
 
R
A
 
L
Y
 
L
L
 
M
K
 
D
N
 
R
L
 
-
P
 
-
A
 
-
I
 
-
E
 
-
I
 
-
V
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
S
L
 
I
H
 
Y
D
 
D
S
 
N
I
 
V
G
 
A
L
 
L
Y
 
P
K
 
M
R
 
R
P
 
I
R
 
-
E
 
-
E
 
E
Q
 
S
L
 
I
A
 
S
V
 
E
C
 
N
E
 
E
W
 
I
W
 
K
M
 
R
D
 
R
V
 
V
F
 
S
G
 
A
I
 
A
-
 
L
-
 
D
-
 
K
A
 
T
G
 
G
L
 
L
K
 
L
D
 
D
K
 
K
P
 
A
F
 
R
L
 
C
-
 
L
-
 
P
-
 
S
Q
 
Q
L
 
L
S
 
S
S
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
R
 
Q
L
 
R
A
 
V
L
 
G
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
V
V
 
V
K
 
N
D
 
R
P
 
P
E
 
T
L
 
L
L
 
L
I
 
L
L
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
L
 
T
H
 
G
G
 
N
L
 
L
D
 
D
T
 
P
Y
 
E
N
 
L
R
 
S
R
 
S
R
 
R
V
 
V
K
 
L
K
 
R
I
 
L
I
 
F
E
 
E
A
 
E
F
 
F
C
 
-
H
 
N
R
 
R
K
 
A
D
 
G
K
 
V
T
 
T
M
 
I
I
 
L
M
 
L
V
 
A
T
 
T
H
 
H

8bmsA Cryo-em structure of the mutant solitary ecf module 2eq in msp2n2 lipid nanodiscs in the atpase closed and atp-bound conformation (see paper)
26% identity, 44% coverage: 264:474/485 of query aligns to 1:207/278 of 8bmsA

query
sites
8bmsA
S
 
S
D
 
D
E
 
N
V
 
I
V
 
I
K
 
S
L
 
F
N
 
D
K
 
H
V
 
V
S
 
T
I
x
F
R
 
T
Y
 
D
D
 
S
D
 
P
R
 
R
T
 
P
I
 
A
L
 
L
K
 
S
E
 
D
L
 
L
D
 
S
W
 
F
T
 
A
V
 
I
M
 
E
R
 
R
G
 
G
E
 
S
K
 
W
W
 
T
A
 
A
L
 
L
S
 
I
G
 
G
E
 
H
N
|
N
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
V
L
 
S
S
 
K
L
 
L
V
 
I
-
 
N
-
 
G
-
 
L
-
 
L
C
 
A
A
 
P
D
 
D
N
 
D
P
 
L
Q
 
D
S
 
K
Y
 
S
A
 
S
C
 
-
D
 
-
I
 
I
S
 
T
L
 
V
F
 
D
G
 
G
R
 
V
K
 
K
R
 
L
G
 
G
T
 
-
G
 
A
E
 
D
S
 
T
I
 
V
W
 
W
E
 
E
I
 
V
K
 
R
K
 
E
H
 
K
I
 
V
G
 
G
Y
 
I
V
 
V
S
 
-
P
 
-
E
 
-
M
 
-
H
 
-
R
 
-
A
 
-
Y
 
-
L
 
F
K
x
Q
N
 
N
L
 
-
P
 
P
A
 
D
I
 
N
E
 
Q
I
 
F
V
 
V
A
 
G
S
 
A
G
 
T
L
 
V
H
 
S
D
 
D
S
 
D
I
 
V
-
 
A
-
 
F
G
 
G
L
 
L
Y
 
E
K
 
N
R
 
R
-
 
A
-
 
V
P
 
P
R
 
R
E
 
P
E
 
E
Q
 
M
L
 
L
A
 
K
V
 
I
C
 
V
E
 
A
W
 
Q
W
 
A
M
 
V
D
 
A
V
 
D
F
 
V
G
 
G
I
 
M
A
 
A
G
 
D
L
x
Y
K
 
A
D
 
D
K
 
S
P
 
E
F
 
P
L
 
S
Q
x
N
L
 
L
S
|
S
S
x
G
G
|
G
E
x
Q
Q
 
K
R
 
Q
L
 
R
A
 
V
L
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
G
A
 
I
F
 
L
V
 
A
K
 
V
D
 
K
P
 
P
E
 
Q
L
 
V
L
 
I
I
 
I
L
 
L
D
 
D
E
x
Q
P
 
S
L
 
T
H
 
S
G
 
M
L
 
L
D
 
D
T
 
P
Y
 
E
N
 
G
R
 
K
R
 
E
R
 
Q
V
 
I
K
 
L
K
 
D
I
 
L
I
 
V
E
 
R
A
 
K
F
 
I
C
 
K
H
 
E
R
 
D
K
 
N
D
 
N
K
 
L
T
 
T
M
 
V
I
 
I
M
 
S
V
 
I
T
 
T
H
|
H
Y
 
D
E
 
L
N
 
E
E
 
E
L
 
A
P
 
A
G
 
G
T
 
A

4hluC Structure of the ecfa-a' heterodimer bound to adp (see paper)
28% identity, 41% coverage: 268:466/485 of query aligns to 5:191/249 of 4hluC

query
sites
4hluC
V
 
I
K
 
E
L
 
L
N
 
N
K
 
S
V
 
V
S
 
S
I
 
F
R
 
R
Y
|
Y
D
 
N
D
 
G
R
 
D
T
 
Y
I
 
V
L
 
L
K
 
K
E
 
D
L
 
V
D
 
N
W
 
A
T
 
E
V
 
F
M
 
E
R
 
T
G
 
G
E
 
K
K
 
I
W
 
Y
A
 
V
L
 
V
S
 
V
G
 
G
E
 
K
N
|
N
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
L
L
 
L
S
 
K
L
 
I
V
 
L
C
 
A
A
 
G
D
 
-
N
 
-
P
 
L
Q
 
L
S
 
A
Y
 
A
A
 
A
C
 
G
D
 
E
I
 
I
S
 
F
L
 
L
F
 
-
G
 
-
R
 
-
K
 
-
R
 
D
G
 
G
T
 
S
G
 
P
E
 
A
S
 
D
I
 
P
W
 
F
E
 
L
I
 
L
K
 
R
K
 
K
H
 
N
I
 
V
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
-
 
F
-
 
Q
-
 
N
-
 
P
S
 
S
P
 
S
E
 
Q
M
 
I
H
 
I
R
 
G
A
 
A
Y
 
T
L
 
V
K
 
E
N
 
E
L
 
D
P
 
V
A
 
A
I
 
F
E
 
S
I
 
L
V
 
E
A
 
I
S
 
M
G
 
G
L
 
L
H
 
D
D
 
E
S
 
S
I
 
-
G
 
-
L
 
-
Y
 
E
K
 
M
R
 
R
P
 
K
R
 
R
E
 
I
E
 
K
Q
 
K
L
 
V
A
 
-
V
 
-
C
 
-
E
 
-
W
 
-
W
 
-
M
 
L
D
 
E
V
 
L
F
 
V
G
 
G
I
 
L
A
 
S
G
 
G
L
 
L
K
 
A
D
 
A
K
 
A
P
 
D
F
 
P
L
 
L
Q
 
N
L
 
L
S
 
S
S
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
K
R
 
Q
L
 
R
A
 
L
L
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
S
A
 
M
F
 
L
V
 
A
K
 
R
D
 
D
P
 
T
E
 
R
L
 
F
L
 
L
I
 
A
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
L
 
V
H
 
S
G
 
M
L
 
L
D
 
D
T
 
P
Y
 
P
N
 
S
R
 
Q
R
 
R
R
 
E
V
 
I
K
 
F
K
 
Q
I
 
V
I
 
L
E
 
E
A
 
S
F
 
L
C
 
-
H
 
K
R
 
N
K
 
E
D
 
G
K
 
K
T
 
G
M
 
I
I
 
I
M
 
L
V
 
V
T
 
T
H
 
H

4zirB Crystal structure of ecfaa' heterodimer bound to amppnp (see paper)
26% identity, 41% coverage: 268:466/485 of query aligns to 4:187/247 of 4zirB

query
sites
4zirB
V
 
I
K
 
E
L
 
L
N
 
N
K
 
S
V
 
V
S
 
S
I
 
F
R
 
R
Y
|
Y
D
 
N
D
 
G
R
 
D
T
 
Y
I
x
V
L
 
L
K
 
K
E
 
D
L
 
V
D
 
N
W
 
A
T
 
E
V
 
F
M
 
E
R
 
T
G
 
G
E
 
K
K
 
I
W
 
Y
A
 
V
L
 
V
S
 
V
G
 
G
E
 
K
N
|
N
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
L
L
 
L
S
 
K
L
 
I
V
 
L
C
 
A
A
 
G
D
 
-
N
 
-
P
 
L
Q
 
L
S
 
A
Y
 
A
A
 
A
C
 
G
D
 
E
I
 
I
S
 
F
L
 
L
F
 
-
G
 
-
R
 
-
K
 
-
R
 
D
G
 
G
T
 
S
G
 
P
E
 
A
S
 
D
I
 
P
W
 
F
E
 
L
I
 
L
K
 
R
K
 
K
H
 
N
I
 
V
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
S
 
-
P
 
-
E
 
-
M
 
-
H
 
-
R
 
-
A
 
-
Y
 
-
L
 
F
K
x
Q
N
 
N
L
 
-
P
 
P
A
 
S
I
 
S
E
 
Q
I
 
I
V
 
I
A
 
G
S
 
A
G
 
T
L
 
V
H
 
E
D
 
E
S
 
D
I
 
V
G
 
A
L
 
F
Y
 
S
K
 
L
R
 
E
P
 
I
R
 
D
E
 
E
E
 
S
Q
 
E
L
 
M
-
 
R
A
 
K
V
 
R
C
 
I
E
 
K
W
 
K
W
 
V
M
 
L
D
 
E
V
 
L
F
 
V
G
 
G
I
 
L
A
 
S
G
 
G
L
 
L
K
 
A
D
 
A
K
 
A
P
 
D
F
 
P
L
 
L
Q
x
N
L
 
L
S
|
S
S
x
G
G
|
G
E
 
Q
Q
 
K
R
 
Q
L
 
R
A
 
L
L
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
S
A
 
M
F
 
L
V
 
A
K
 
R
D
 
D
P
 
T
E
 
R
L
 
F
L
 
L
I
 
A
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
L
 
V
H
 
S
G
 
M
L
 
L
D
 
D
T
 
P
Y
 
P
N
 
S
R
 
Q
R
 
R
R
 
E
V
 
I
K
 
F
K
 
Q
I
 
V
I
 
L
E
 
E
A
 
S
F
 
L
C
 
-
H
 
K
R
 
N
K
 
E
D
 
G
K
 
K
T
 
G
M
 
I
I
 
I
M
 
L
V
 
V
T
 
T
H
 
H

3nh9A Nucleotide binding domain of human abcb6 (atp bound structure) (see paper)
28% identity, 41% coverage: 268:466/485 of query aligns to 35:228/273 of 3nh9A

query
sites
3nh9A
V
 
I
K
 
E
L
 
F
N
 
E
K
 
N
V
 
V
S
 
H
I
 
F
R
 
S
Y
|
Y
-
 
A
D
 
D
D
 
G
R
 
R
T
 
E
I
 
T
L
 
L
K
 
Q
E
 
D
L
 
V
D
 
S
W
 
F
T
 
T
V
 
V
M
 
M
R
 
P
G
 
G
E
 
Q
K
 
T
W
 
L
A
 
A
L
 
L
S
 
V
G
 
G
E
 
P
N
x
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
I
L
 
L
S
x
R
L
 
L
V
 
L
C
 
F
A
 
R
D
 
F
N
 
Y
P
 
D
Q
 
I
S
 
S
Y
 
S
A
 
G
C
 
C
D
 
-
I
 
-
S
 
-
L
 
-
F
 
-
G
 
-
R
 
-
K
 
I
R
 
R
G
 
I
T
 
D
G
 
G
E
 
Q
S
 
D
I
 
I
W
 
S
E
 
Q
I
 
V
-
 
T
-
 
Q
-
 
A
-
 
S
-
 
L
K
 
R
K
 
S
H
 
H
I
 
I
G
 
G
Y
 
V
V
 
V
S
 
P
P
 
Q
E
 
D
-
 
T
-
 
V
-
 
L
M
 
F
H
 
N
R
 
D
A
 
T
Y
 
I
L
 
A
K
 
D
N
 
N
L
 
I
P
 
R
A
 
Y
I
 
G
E
 
R
I
 
V
V
 
T
A
 
A
-
 
G
-
 
N
-
 
D
-
 
E
-
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
Q
-
 
A
S
 
A
G
 
G
L
 
I
H
 
H
D
 
D
S
 
A
I
 
I
G
 
-
L
 
-
Y
 
-
K
 
-
R
 
-
P
 
-
R
 
-
E
 
-
E
 
-
Q
 
-
L
 
M
A
 
A
V
 
F
C
 
P
E
 
E
W
 
G
W
 
Y
M
 
R
D
 
T
V
 
Q
F
 
V
G
 
G
I
 
E
A
 
R
G
 
G
L
 
L
K
 
K
D
 
-
K
 
-
P
 
-
F
 
-
L
 
-
Q
 
-
L
 
L
S
 
S
S
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
K
R
 
Q
L
 
R
A
 
V
L
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
T
F
 
I
V
 
L
K
 
K
D
 
A
P
 
P
E
 
G
L
 
I
L
 
I
I
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
A
L
 
T
H
 
S
G
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
T
Y
 
S
N
 
N
R
 
E
R
 
R
R
 
A
V
 
I
K
 
Q
K
 
A
I
 
S
I
 
L
E
 
A
A
 
K
F
 
V
C
 
C
H
 
-
R
 
-
K
 
A
D
 
N
K
 
R
T
 
T
M
 
T
I
 
I
M
 
V
V
 
V
T
 
A
H
 
H

8bmpA Cryo-em structure of the folate-specific ecf transporter complex in msp2n2 lipid nanodiscs bound to atp and adp (see paper)
27% identity, 44% coverage: 264:474/485 of query aligns to 2:207/278 of 8bmpA

query
sites
8bmpA
S
 
S
D
 
D
E
 
N
V
 
I
V
 
I
K
 
S
L
 
F
N
 
D
K
 
H
V
 
V
S
 
T
I
 
-
R
 
-
Y
x
F
D
 
D
D
 
S
-
 
P
R
 
R
T
 
P
I
 
A
L
 
L
K
 
S
E
 
D
L
 
L
D
 
S
W
 
F
T
 
A
V
 
I
M
 
E
R
 
R
G
 
G
E
 
S
K
 
W
W
 
T
A
 
A
L
 
L
S
 
I
G
 
G
E
 
H
N
|
N
G
 
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
V
L
 
S
S
 
K
L
 
L
V
 
I
-
 
N
-
 
G
-
 
L
-
 
L
C
 
A
A
 
P
D
 
D
N
 
D
P
 
L
Q
 
D
S
 
K
Y
 
S
A
 
S
C
 
-
D
 
-
I
 
I
S
 
T
L
 
V
F
 
D
G
 
G
R
 
V
K
 
K
R
 
L
G
 
G
T
 
A
G
 
-
E
 
D
S
 
T
I
 
V
W
 
W
E
 
E
I
 
V
K
 
R
K
 
E
H
 
K
I
 
V
G
 
G
Y
 
I
V
 
V
S
 
-
P
 
-
E
 
-
M
 
-
H
 
-
R
 
-
A
 
-
Y
 
-
L
 
F
K
 
Q
N
 
N
L
 
-
P
 
P
A
 
D
I
 
N
E
 
Q
I
 
F
V
 
V
A
 
G
S
 
A
G
 
T
L
 
V
H
 
S
D
 
D
S
 
D
I
 
V
-
 
A
-
 
F
G
 
G
L
 
L
Y
 
E
K
 
N
R
 
R
-
 
A
-
 
V
P
 
P
R
 
R
E
 
P
E
 
E
Q
 
M
L
 
L
A
 
K
V
 
I
C
 
V
E
 
A
W
 
Q
W
 
A
M
 
V
D
 
A
V
 
D
F
 
V
G
 
G
I
 
M
A
 
A
G
 
D
L
 
Y
K
 
A
D
 
D
K
 
S
P
 
E
F
 
P
L
 
S
Q
 
N
L
 
L
S
 
S
S
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
K
R
 
Q
L
 
R
A
 
V
L
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
G
A
 
I
F
 
L
V
 
A
K
 
V
D
 
K
P
 
P
E
 
Q
L
 
V
L
 
I
I
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
S
L
 
T
H
 
S
G
 
M
L
 
L
D
 
D
T
 
P
Y
 
E
N
 
G
R
 
K
R
 
E
R
 
Q
V
 
I
K
 
L
K
 
D
I
 
L
I
 
V
E
 
R
A
 
K
F
 
I
C
 
K
H
 
E
R
 
D
K
 
N
D
 
N
K
 
L
T
 
T
M
 
V
I
 
I
M
 
S
V
 
I
T
 
T
H
 
H
Y
 
D
E
 
L
N
 
E
E
 
E
L
 
A
P
 
A
G
 
G
T
 
A

5lilA Structure of aggregatibacter actinomycetemcomitans macb bound to atpys (p21) (see paper)
27% identity, 41% coverage: 266:466/485 of query aligns to 5:201/615 of 5lilA

query
sites
5lilA
E
 
E
V
 
I
V
 
K
K
 
Q
L
 
L
N
 
N
K
 
R
V
 
Y
S
x
F
I
 
G
R
 
E
Y
 
G
D
 
E
D
 
N
R
 
R
T
 
V
-
 
H
I
x
V
L
 
L
K
 
K
E
 
D
L
 
I
D
 
S
W
 
L
T
 
S
V
 
I
M
 
E
R
 
R
G
 
G
E
 
D
K
 
F
W
 
V
A
 
A
L
 
I
S
 
M
G
 
G
E
 
Q
N
x
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
M
S
 
N
L
 
I
V
 
I
-
 
G
C
 
C
A
 
L
D
 
D
N
 
T
P
 
A
Q
 
T
S
 
G
Y
 
G
A
 
S
C
 
S
D
 
K
I
 
I
S
 
D
L
 
G
F
 
K
G
 
E
R
 
T
K
 
I
R
 
E
G
 
L
T
 
T
G
 
N
E
 
D
S
 
Q
I
 
L
W
 
S
E
 
D
I
 
L
K
 
R
-
 
S
K
 
Q
H
 
K
I
 
F
G
 
G
Y
 
F
V
 
I
S
 
F
P
x
Q
E
 
R
M
 
Y
H
 
N
R
 
-
A
 
-
Y
 
L
L
 
L
K
 
S
N
 
S
L
 
L
P
 
T
A
 
A
I
 
A
E
 
E
I
 
N
V
 
V
A
 
A
-
 
L
-
 
P
-
 
A
-
 
I
-
 
Y
S
 
A
G
 
G
L
 
M
H
 
P
D
 
Q
S
 
S
I
 
Q
G
 
R
L
 
L
Y
 
-
K
 
E
R
 
R
P
 
A
R
 
K
E
 
Q
-
 
L
-
 
L
E
 
E
Q
 
K
L
 
L
A
 
G
V
 
L
C
 
G
E
 
D
W
x
K
W
 
W
M
 
-
D
 
-
V
 
-
F
 
-
G
 
-
I
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
K
 
Q
D
 
N
K
 
K
P
 
P
F
 
N
L
 
-
Q
|
Q
L
 
L
S
|
S
S
 
G
G
|
G
E
x
Q
Q
 
Q
R
 
Q
L
 
R
A
 
V
L
 
S
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
L
V
 
M
K
 
N
D
 
G
P
 
G
E
 
E
L
 
I
L
 
I
I
 
L
L
 
A
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
L
 
T
H
 
G
G
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
S
Y
 
H
N
 
S
R
 
G
R
 
E
R
 
N
V
 
V
K
 
M
K
 
E
I
 
I
I
 
L
E
 
R
A
 
Q
F
 
L
C
 
-
H
 
H
R
 
E
K
 
E
D
 
G
K
 
H
T
 
T
M
 
I
I
 
I
M
 
M
V
 
V
T
 
T
H
 
H

5lj7A Structure of aggregatibacter actinomycetemcomitans macb bound to atp (p21) (see paper)
27% identity, 41% coverage: 266:466/485 of query aligns to 5:201/592 of 5lj7A

query
sites
5lj7A
E
 
E
V
 
I
V
 
K
K
 
Q
L
 
L
N
 
N
K
 
R
V
 
Y
S
 
F
I
 
G
R
 
E
Y
 
G
D
 
E
D
 
N
R
 
R
T
 
V
-
 
H
I
x
V
L
 
L
K
 
K
E
 
D
L
 
I
D
 
S
W
 
L
T
 
S
V
 
I
M
 
E
R
 
R
G
 
G
E
 
D
K
 
F
W
 
V
A
 
A
L
 
I
S
 
M
G
 
G
E
 
Q
N
x
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
M
S
 
N
L
 
I
V
 
I
-
 
G
C
 
C
A
 
L
D
 
D
N
 
T
P
 
A
Q
 
T
S
 
G
Y
 
G
A
 
S
C
 
S
D
 
K
I
 
I
S
 
D
L
 
G
F
 
K
G
 
E
R
 
T
K
 
I
R
 
E
G
 
L
T
 
T
G
 
N
E
 
D
S
 
Q
I
 
L
W
 
S
E
 
D
I
 
L
K
 
R
-
 
S
K
 
Q
H
 
K
I
 
F
G
 
G
Y
 
F
V
 
I
S
 
F
P
x
Q
E
 
R
M
 
Y
H
 
N
R
 
-
A
 
-
Y
 
L
L
 
L
K
 
S
N
 
S
L
 
L
P
 
T
A
 
A
I
 
A
E
 
E
I
 
N
V
 
V
A
 
A
-
 
L
-
 
P
-
 
A
-
 
I
-
 
Y
S
 
A
G
 
G
L
 
M
H
 
P
D
 
Q
S
 
S
I
 
Q
G
 
R
L
 
L
Y
 
-
K
 
E
R
 
R
P
 
A
R
 
K
E
 
Q
-
 
L
-
 
L
E
 
E
Q
 
K
L
 
L
A
 
G
V
 
L
C
 
G
E
 
D
W
x
K
W
 
W
M
 
-
D
 
-
V
 
-
F
 
-
G
 
-
I
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
K
 
Q
D
 
N
K
 
K
P
 
P
F
 
N
L
 
-
Q
|
Q
L
 
L
S
|
S
S
 
G
G
|
G
E
x
Q
Q
 
Q
R
 
Q
L
 
R
A
 
V
L
 
S
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
L
V
 
M
K
 
N
D
 
G
P
 
G
E
 
E
L
 
I
L
 
I
I
 
L
L
 
A
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
L
 
T
H
 
G
G
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
S
Y
 
H
N
 
S
R
 
G
R
 
E
R
 
N
V
 
V
K
 
M
K
 
E
I
 
I
I
 
L
E
 
R
A
 
Q
F
 
L
C
 
-
H
 
H
R
 
E
K
 
E
D
 
G
K
 
H
T
 
T
M
 
I
I
 
I
M
 
M
V
 
V
T
 
T
H
 
H

P69874 Spermidine/putrescine import ATP-binding protein PotA; EC 7.6.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
27% identity, 42% coverage: 267:470/485 of query aligns to 17:210/378 of P69874

query
sites
P69874
V
 
L
V
 
V
K
 
Q
L
 
L
N
 
A
K
 
G
V
 
I
S
 
R
I
 
K
R
x
C
Y
x
F
D
 
D
D
 
G
R
 
K
T
 
E
I
 
V
L
 
I
K
 
P
E
 
Q
L
 
L
D
 
D
W
 
L
T
 
T
V
 
I
M
 
N
R
 
N
G
 
G
E
 
E
K
x
F
W
 
L
A
 
T
L
 
L
S
 
L
G
 
G
E
 
P
N
 
S
G
 
G
A
x
C
G
 
G
K
 
K
S
 
T
T
 
T
L
 
V
L
|
L
S
 
R
L
 
L
V
 
I
C
 
A
A
 
G
D
 
-
N
 
-
P
 
-
Q
 
-
S
 
-
Y
 
-
A
 
-
C
 
L
D
 
E
I
 
T
S
 
V
L
 
D
F
 
S
G
 
G
R
 
R
K
 
I
R
 
M
G
x
L
T
 
D
G
 
N
E
 
E
S
 
D
I
 
I
W
 
T
E
 
H
I
 
V
K
 
P
K
 
A
H
 
E
I
 
N
G
 
R
Y
 
Y
V
 
V
S
 
N
P
 
T
E
 
V
M
 
F
H
 
Q
R
 
S
-
 
Y
A
 
A
Y
 
L
L
 
F
K
 
P
N
 
H
L
 
M
P
 
T
A
 
V
I
 
F
E
 
E
I
 
N
V
 
V
A
 
A
S
 
F
G
 
G
L
 
L
H
 
R
D
 
-
S
 
-
I
 
-
G
 
-
L
 
M
Y
 
Q
K
 
K
R
 
T
P
 
P
R
 
A
E
 
A
E
 
E
Q
 
I
L
 
T
A
 
P
V
 
R
C
 
V
E
 
M
W
 
E
W
 
A
M
 
L
D
 
R
V
 
M
F
x
V
G
 
Q
I
 
L
A
 
E
G
 
T
L
 
F
K
 
A
D
 
Q
K
 
R
P
 
K
F
 
P
L
 
H
Q
 
Q
L
 
L
S
 
S
S
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
Q
R
 
Q
L
 
R
A
 
V
L
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
V
V
 
V
K
 
N
D
 
K
P
 
P
E
 
R
L
 
L
L
 
L
I
 
L
L
 
L
D
|
D
E
 
E
P
 
S
L
 
L
H
 
S
G
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
Y
Y
 
K
N
 
L
R
 
R
R
 
K
R
 
Q
V
 
M
K
 
Q
K
 
N
I
 
E
I
 
L
E
 
K
A
 
A
F
 
L
C
 
Q
H
 
R
R
 
K
K
 
L
D
 
G
K
 
I
T
 
T
M
 
F
I
 
V
M
 
F
V
 
V
T
 
T
H
 
H
Y
 
D
E
 
Q
N
 
E
E
 
E

Sites not aligning to the query:

8iddA Cryo-em structure of mycobacterium tuberculosis atp bound ftsex/ripc complex in peptidisc (see paper)
30% identity, 41% coverage: 267:466/485 of query aligns to 2:197/225 of 8iddA

query
sites
8iddA
V
 
M
V
 
I
K
 
T
L
 
L
N
 
D
K
 
H
V
 
V
S
 
T
I
 
K
R
 
Q
Y
|
Y
D
 
K
D
 
S
-
 
S
-
 
A
R
 
R
T
 
P
I
 
A
L
 
L
K
 
D
E
 
D
L
 
I
D
 
N
W
 
V
T
 
K
V
 
I
M
 
D
R
 
K
G
 
G
E
 
E
K
 
F
W
 
V
A
 
F
L
 
L
S
 
I
G
 
G
E
 
P
N
x
S
G
 
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
 
T
L
 
F
L
 
M
S
 
R
L
 
L
V
 
L
-
 
L
C
 
A
A
 
A
D
 
E
N
 
T
P
 
P
Q
 
T
S
 
S
Y
 
G
A
 
D
C
 
V
D
 
R
I
 
V
S
 
S
L
 
K
F
 
F
G
 
H
R
 
V
K
 
N
R
 
K
G
 
L
T
 
R
G
 
G
E
 
R
S
 
H
I
 
V
W
 
P
E
 
K
I
 
L
K
 
R
K
 
Q
H
 
V
I
 
I
G
 
G
Y
 
C
V
 
V
S
 
F
P
 
Q
E
 
D
M
 
F
H
 
R
R
 
-
A
 
-
Y
 
L
L
 
L
K
 
Q
N
 
Q
L
 
K
P
 
T
A
 
V
I
 
Y
E
 
D
I
 
N
V
 
V
A
 
A
S
 
F
G
 
A
L
 
L
H
 
-
D
 
E
S
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
-
Y
 
-
K
 
K
R
 
R
P
 
T
R
 
D
E
 
A
E
 
I
Q
 
N
L
 
R
A
 
V
V
 
V
C
 
P
E
 
E
W
 
V
W
 
-
M
 
L
D
 
E
V
 
T
F
 
V
G
 
G
I
 
L
A
 
S
G
 
G
L
 
K
K
 
A
D
 
N
K
 
R
P
 
L
F
 
P
L
 
D
Q
 
E
L
 
L
S
 
S
S
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
R
 
Q
L
 
R
A
 
V
L
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
F
V
 
V
K
 
N
D
 
R
P
 
P
E
 
L
L
 
V
L
 
L
I
 
L
L
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
L
 
T
H
 
G
G
 
N
L
 
L
D
 
D
T
 
P
Y
 
E
N
 
T
R
 
S
R
 
R
R
 
D
V
 
I
K
 
M
K
 
D
I
 
L
I
 
L
E
 
E
A
 
R
F
 
I
C
 
-
H
 
N
R
 
R
K
 
T
D
 
G
K
 
T
T
 
T
M
 
V
I
 
L
M
 
M
V
 
A
T
 
T
H
 
H

8igqA Cryo-em structure of mycobacterium tuberculosis adp bound ftsex/ripc complex in peptidisc (see paper)
30% identity, 41% coverage: 267:466/485 of query aligns to 2:197/227 of 8igqA

query
sites
8igqA
V
 
M
V
 
I
K
 
T
L
 
L
N
 
D
K
 
H
V
 
V
S
 
T
I
 
K
R
 
Q
Y
|
Y
D
 
K
D
 
S
-
 
S
-
 
A
R
 
R
T
 
P
I
 
A
L
 
L
K
 
D
E
 
D
L
 
I
D
 
N
W
 
V
T
 
K
V
 
I
M
 
D
R
 
K
G
 
G
E
 
E
K
 
F
W
 
V
A
 
F
L
 
L
S
 
I
G
 
G
E
 
P
N
 
S
G
|
G
A
x
S
G
 
G
K
|
K
S
|
S
T
 
T
L
 
F
L
 
M
S
 
R
L
 
L
V
 
L
-
 
L
C
 
A
A
 
A
D
 
E
N
 
T
P
 
P
Q
 
T
S
 
S
Y
 
G
A
 
D
C
 
V
D
 
R
I
 
V
S
 
S
L
 
K
F
 
F
G
 
H
R
 
V
K
 
N
R
 
K
G
 
L
T
 
R
G
 
G
E
 
R
S
 
H
I
 
V
W
 
P
E
 
K
I
 
L
K
 
R
K
 
Q
H
 
V
I
 
I
G
 
G
Y
 
C
V
 
V
S
 
F
P
 
Q
E
 
D
M
 
F
H
 
R
R
 
-
A
 
-
Y
 
L
L
 
L
K
 
Q
N
 
Q
L
 
K
P
 
T
A
 
V
I
 
Y
E
 
D
I
 
N
V
 
V
A
 
A
S
 
F
G
 
A
L
 
L
H
 
-
D
 
E
S
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
-
Y
 
-
K
 
K
R
 
R
P
 
T
R
 
D
E
 
A
E
 
I
Q
 
N
L
 
R
A
 
V
V
 
V
C
 
P
E
 
E
W
 
V
W
 
-
M
 
L
D
 
E
V
 
T
F
 
V
G
 
G
I
 
L
A
 
S
G
 
G
L
 
K
K
 
A
D
 
N
K
 
R
P
 
L
F
 
P
L
 
D
Q
 
E
L
 
L
S
 
S
S
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
R
 
Q
L
 
R
A
 
V
L
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
F
V
 
V
K
 
N
D
 
R
P
 
P
E
 
L
L
 
V
L
 
L
I
 
L
L
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
L
 
T
H
 
G
G
 
N
L
 
L
D
 
D
T
 
P
Y
 
E
N
 
T
R
 
S
R
 
R
R
 
D
V
 
I
K
 
M
K
 
D
I
 
L
I
 
L
E
 
E
A
 
R
F
 
I
C
 
-
H
 
N
R
 
R
K
 
T
D
 
G
K
 
T
T
 
T
M
 
V
I
 
L
M
 
M
V
 
A
T
 
T
H
 
H

A5U7B7 Cell division ATP-binding protein FtsE from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25177 / H37Ra) (see 2 papers)
30% identity, 41% coverage: 267:466/485 of query aligns to 1:196/229 of A5U7B7

query
sites
A5U7B7
V
 
M
V
 
I
K
 
T
L
 
L
N
 
D
K
 
H
V
 
V
S
 
T
I
 
K
R
 
Q
Y
 
Y
D
 
K
D
 
S
-
 
S
-
 
A
R
 
R
T
 
P
I
 
A
L
 
L
K
 
D
E
 
D
L
 
I
D
 
N
W
 
V
T
 
K
V
 
I
M
 
D
R
 
K
G
 
G
E
 
E
K
 
F
W
 
V
A
 
F
L
 
L
S
 
I
G
 
G
E
 
P
N
 
S
G
 
G
A
 
S
G
 
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
L
 
F
L
 
M
S
 
R
L
 
L
V
 
L
-
 
L
C
 
A
A
 
A
D
 
E
N
 
T
P
 
P
Q
 
T
S
 
S
Y
 
G
A
 
D
C
 
V
D
 
R
I
 
V
S
 
S
L
 
K
F
 
F
G
 
H
R
 
V
K
 
N
R
 
K
G
 
L
T
 
R
G
 
G
E
 
R
S
 
H
I
 
V
W
 
P
E
 
K
I
 
L
K
 
R
K
 
Q
H
 
V
I
 
I
G
 
G
Y
x
C
V
 
V
S
 
F
P
 
Q
E
 
D
M
 
F
H
 
R
R
 
-
A
 
-
Y
 
L
L
 
L
K
 
Q
N
 
Q
L
 
K
P
 
T
A
 
V
I
 
Y
E
 
D
I
 
N
V
 
V
A
 
A
S
 
F
G
 
A
L
 
L
H
 
-
D
 
E
S
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
-
Y
 
-
K
 
K
R
 
R
P
 
T
R
 
D
E
 
A
E
 
I
Q
 
N
L
 
R
A
 
V
V
 
V
C
 
P
E
 
E
W
 
V
W
 
-
M
 
L
D
 
E
V
 
T
F
 
V
G
 
G
I
 
L
A
 
S
G
 
G
L
 
K
K
 
A
D
 
N
K
 
R
P
 
L
F
 
P
L
 
D
Q
 
E
L
 
L
S
 
S
S
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
R
 
Q
L
 
R
A
 
V
L
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
F
V
 
V
K
 
N
D
 
R
P
 
P
E
 
L
L
 
V
L
 
L
I
 
L
L
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
L
 
T
H
 
G
G
 
N
L
 
L
D
 
D
T
 
P
Y
 
E
N
 
T
R
 
S
R
 
R
R
 
D
V
 
I
K
 
M
K
 
D
I
 
L
I
 
L
E
 
E
A
 
R
F
 
I
C
 
-
H
 
N
R
 
R
K
 
T
D
 
G
K
 
T
T
 
T
M
 
V
I
 
L
M
 
M
V
 
A
T
 
T
H
 
H

Q9DC29 ATP-binding cassette sub-family B member 6; ABC-type heme transporter ABCB6; EC 7.6.2.5 from Mus musculus (Mouse) (see paper)
28% identity, 41% coverage: 268:466/485 of query aligns to 590:783/842 of Q9DC29

query
sites
Q9DC29
V
 
I
K
 
E
L
 
F
N
 
E
K
 
N
V
 
V
S
 
H
I
 
F
R
 
S
Y
 
Y
-
 
A
D
 
D
D
 
G
R
 
Q
T
 
E
I
 
T
L
 
L
K
 
Q
E
 
D
L
 
V
D
 
S
W
 
F
T
 
T
V
 
V
M
 
M
R
 
P
G
 
G
E
 
Q
K
 
T
W
 
V
A
 
A
L
 
L
S
 
V
G
 
G
E
 
P
N
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
L
 
I
L
 
L
S
 
R
L
 
L
V
 
L
C
 
F
A
 
R
D
 
F
N
 
Y
P
 
D
Q
 
I
S
 
S
Y
 
S
A
 
G
C
 
C
D
 
-
I
 
I
S
 
R
L
 
I
F
 
D
G
 
G
R
 
Q
K
 
D
R
 
I
G
 
S
T
 
Q
G
 
V
E
 
T
S
 
Q
I
 
I
W
 
-
E
 
S
I
 
L
K
 
R
K
 
S
H
 
H
I
 
I
G
 
G
Y
 
V
V
 
V
S
 
P
P
 
Q
E
 
D
-
 
T
-
 
V
-
 
L
M
 
F
H
 
N
R
 
D
A
 
T
Y
 
I
L
 
A
K
 
N
N
 
N
L
 
I
P
 
R
A
 
Y
I
 
G
E
 
R
I
 
V
V
 
T
A
 
A
-
 
G
-
 
D
-
 
S
-
 
E
-
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
Q
-
 
A
S
 
A
G
 
G
L
 
I
H
 
H
D
 
D
S
 
A
I
 
I
G
 
L
L
 
S
Y
 
F
K
 
P
R
 
E
P
 
G
R
 
Y
E
 
E
E
 
T
Q
 
Q
L
 
V
A
 
-
V
 
-
C
 
-
E
 
-
W
 
-
W
 
-
M
 
-
D
 
-
V
 
-
F
 
-
G
 
G
I
 
E
A
 
R
G
 
G
L
 
L
K
 
K
D
 
-
K
 
-
P
 
-
F
 
-
L
 
-
Q
 
-
L
 
L
S
 
S
S
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
K
R
 
Q
L
 
R
A
 
V
L
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
T
F
 
I
V
 
L
K
 
K
D
 
A
P
 
P
E
 
D
L
 
I
L
 
I
I
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
A
L
 
T
H
 
S
G
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
T
Y
 
S
N
 
N
R
 
E
R
 
R
R
 
A
V
 
I
K
 
Q
K
 
A
I
 
S
I
 
L
E
 
A
A
 
K
F
 
V
C
 
C
H
 
-
R
 
-
K
 
T
D
 
N
K
 
R
T
 
T
M
 
T
I
 
I
M
 
V
V
 
I
T
 
A
H
 
H

Sites not aligning to the query:

1vciA Crystal structure of the atp-binding cassette of multisugar transporter from pyrococcus horikoshii ot3 complexed with atp (see paper)
26% identity, 42% coverage: 268:470/485 of query aligns to 7:191/353 of 1vciA

query
sites
1vciA
V
 
V
K
 
K
L
 
L
N
 
E
K
 
N
V
 
L
S
 
T
I
 
K
R
 
R
Y
x
F
D
 
G
D
 
N
R
x
F
T
 
T
I
 
A
L
 
V
K
 
N
E
 
K
L
 
L
D
 
N
W
 
L
T
 
T
V
 
I
M
 
K
R
 
D
G
 
G
E
 
E
K
 
F
W
 
L
A
 
V
L
 
L
S
 
L
G
 
G
E
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
C
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
T
L
 
L
S
 
R
L
 
M
V
 
I
C
 
A
A
 
-
D
 
-
N
 
-
P
 
-
Q
 
-
S
 
-
Y
 
-
A
 
-
C
 
-
D
 
-
I
 
-
S
 
-
L
 
-
F
 
-
G
 
G
R
 
L
K
 
E
R
 
E
G
 
P
T
 
T
G
 
E
E
 
G
S
 
R
I
 
I
W
 
Y
E
 
F
I
 
G
K
 
D
K
 
R
H
 
D
I
 
V
G
 
T
Y
 
Y
V
 
L
S
 
P
P
 
P
E
 
K
M
 
D
H
 
R
R
 
N
A
 
I
Y
 
S
L
 
M
-
 
V
-
 
F
K
 
Q
N
 
H
L
 
M
P
 
T
A
 
V
I
 
Y
E
 
E
I
 
N
V
 
I
A
 
A
S
 
-
G
 
-
L
 
-
H
 
-
D
 
-
S
 
-
I
 
F
G
 
P
L
 
L
Y
 
K
K
 
K
R
 
F
P
 
P
R
 
K
E
 
D
E
 
E
Q
 
I
L
 
D
A
 
K
V
 
R
C
 
V
E
 
R
W
 
W
W
 
A
M
 
A
D
 
E
V
 
L
F
 
L
G
 
Q
I
 
I
A
 
E
G
 
E
L
 
L
K
 
L
D
 
N
K
 
R
P
 
Y
F
 
P
L
 
A
Q
 
Q
L
 
L
S
 
S
S
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
R
R
 
Q
L
 
R
A
 
V
L
 
A
L
 
V
A
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
I
V
 
V
K
 
V
D
 
E
P
 
P
E
 
D
L
 
V
L
 
L
I
 
L
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
L
 
L
H
 
S
G
 
N
L
 
L
D
 
D
T
 
A
Y
 
K
N
 
L
R
 
R
R
 
V
R
 
A
V
 
M
K
 
R
K
 
A
I
 
E
I
 
I
E
 
K
A
 
K
F
 
L
C
 
Q
H
 
Q
R
 
K
K
 
L
D
 
K
K
 
V
T
 
T
M
 
T
I
 
I
M
 
Y
V
 
V
T
 
T
H
 
H
Y
 
D
E
 
Q
N
 
V
E
 
E

8k7bA Post-occluded structure of human abcb6 w546a mutant (adp/vo4-bound) (see paper)
28% identity, 41% coverage: 268:466/485 of query aligns to 353:546/590 of 8k7bA

query
sites
8k7bA
V
 
I
K
 
E
L
 
F
N
 
E
K
 
N
V
 
V
S
 
H
I
 
F
R
 
S
Y
|
Y
-
 
A
D
 
D
D
 
G
R
 
R
T
 
E
I
 
T
L
 
L
K
 
Q
E
 
D
L
 
V
D
 
S
W
 
F
T
 
T
V
 
V
M
 
M
R
 
P
G
 
G
E
 
Q
K
 
T
W
 
L
A
 
A
L
 
L
S
 
V
G
 
G
E
 
P
N
 
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
I
L
 
L
S
 
R
L
 
L
V
 
L
C
 
F
A
 
R
D
 
F
N
 
Y
P
 
D
Q
 
I
S
 
S
Y
 
S
A
 
G
C
 
C
D
 
-
I
 
-
S
 
-
L
 
-
F
 
-
G
 
-
R
 
-
K
 
I
R
 
R
G
 
I
T
 
D
G
 
G
E
 
Q
S
 
D
I
 
I
W
 
S
E
 
Q
I
 
V
-
 
T
-
 
Q
-
 
A
-
 
S
-
 
L
K
 
R
K
 
S
H
 
H
I
 
I
G
 
G
Y
 
V
V
 
V
S
 
P
P
x
Q
E
 
D
-
 
T
-
 
V
-
 
L
M
 
F
H
 
N
R
 
D
A
 
T
Y
 
I
L
 
A
K
 
D
N
 
N
L
 
I
P
 
R
A
 
Y
I
 
G
E
 
R
I
 
V
V
 
T
A
 
A
-
 
G
-
 
N
-
 
D
-
 
E
-
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
Q
-
 
A
S
 
A
G
 
G
L
 
I
H
 
H
D
 
D
S
 
A
I
 
I
G
 
-
L
 
-
Y
 
-
K
 
-
R
 
-
P
 
-
R
 
-
E
 
-
E
 
-
Q
 
-
L
 
M
A
 
A
V
 
F
C
 
P
E
 
E
W
 
G
W
 
Y
M
 
R
D
 
T
V
 
Q
F
 
V
G
 
G
I
 
E
A
 
R
G
 
G
L
 
L
K
|
K
D
 
-
K
 
-
P
 
-
F
 
-
L
 
-
Q
 
-
L
|
L
S
|
S
S
x
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
K
R
 
Q
L
 
R
A
 
V
L
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
T
F
 
I
V
 
L
K
 
K
D
 
A
P
 
P
E
 
G
L
 
I
L
 
I
I
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
A
L
 
T
H
 
S
G
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
T
Y
 
S
N
 
N
R
 
E
R
 
R
R
 
A
V
 
I
K
 
Q
K
 
A
I
 
S
I
 
L
E
 
A
A
 
K
F
 
V
C
 
C
H
 
-
R
 
-
K
 
A
D
 
N
K
 
R
T
 
T
M
 
T
I
 
I
M
 
V
V
 
V
T
 
A
H
|
H

7dnyB Cryo-em structure of the human abcb6 (coproporphyrin iii-bound) (see paper)
28% identity, 41% coverage: 268:466/485 of query aligns to 337:530/575 of 7dnyB

query
sites
7dnyB
V
 
I
K
 
E
L
 
F
N
 
E
K
 
N
V
 
V
S
 
H
I
 
F
R
 
S
Y
 
Y
-
 
A
D
 
D
D
 
G
R
 
R
T
 
E
I
 
T
L
 
L
K
 
Q
E
 
D
L
 
V
D
 
S
W
 
F
T
 
T
V
 
V
M
 
M
R
 
P
G
 
G
E
 
Q
K
 
T
W
 
L
A
 
A
L
 
L
S
 
V
G
 
G
E
 
P
N
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
L
 
I
L
 
L
S
 
R
L
 
L
V
 
L
C
 
F
A
 
R
D
 
F
N
 
Y
P
 
D
Q
 
I
S
 
S
Y
 
S
A
 
G
C
 
C
D
 
-
I
 
-
S
 
-
L
 
-
F
 
-
G
 
-
R
 
-
K
 
I
R
 
R
G
 
I
T
 
D
G
 
G
E
 
Q
S
 
D
I
 
I
W
 
S
E
 
Q
I
 
V
-
 
T
-
 
Q
-
 
A
-
 
S
-
 
L
K
 
R
K
 
S
H
 
H
I
 
I
G
 
G
Y
 
V
V
 
V
S
 
P
P
 
Q
E
 
D
-
 
T
-
 
V
-
 
L
M
 
F
H
 
N
R
 
D
A
 
T
Y
 
I
L
 
A
K
 
D
N
 
N
L
 
I
P
 
R
A
 
Y
I
 
G
E
 
R
I
 
V
V
 
T
A
 
A
-
 
G
-
 
N
-
 
D
-
 
E
-
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
Q
-
 
A
S
 
A
G
 
G
L
 
I
H
 
H
D
 
D
S
 
A
I
 
I
G
 
-
L
 
-
Y
 
-
K
 
-
R
 
-
P
 
-
R
 
-
E
 
-
E
 
-
Q
 
-
L
 
M
A
 
A
V
 
F
C
 
P
E
 
E
W
 
G
W
 
Y
M
 
R
D
 
T
V
 
Q
F
 
V
G
 
G
I
 
E
A
 
R
G
 
G
L
 
L
K
 
K
D
 
-
K
 
-
P
 
-
F
 
-
L
 
-
Q
 
-
L
 
L
S
 
S
S
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
K
R
 
Q
L
 
R
A
 
V
L
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
T
F
 
I
V
 
L
K
 
K
D
 
A
P
 
P
E
 
G
L
 
I
L
 
I
I
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
A
L
 
T
H
 
S
G
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
T
Y
 
S
N
 
N
R
 
E
R
 
R
R
 
A
V
 
I
K
 
Q
K
 
A
I
 
S
I
 
L
E
 
A
A
 
K
F
 
V
C
 
C
H
 
-
R
 
-
K
 
A
D
 
N
K
 
R
T
 
T
M
 
T
I
 
I
M
 
V
V
 
V
T
 
A
H
 
H

Sites not aligning to the query:

8yr4A Cryo-em structure of the human abcb6 in complex with cd(ii) :phytochelatin 2 (see paper)
28% identity, 41% coverage: 268:466/485 of query aligns to 350:543/586 of 8yr4A

query
sites
8yr4A
V
 
I
K
 
E
L
 
F
N
 
E
K
 
N
V
 
V
S
 
H
I
 
F
R
 
S
Y
 
Y
-
 
A
D
 
D
D
 
G
R
 
R
T
 
E
I
 
T
L
 
L
K
 
Q
E
 
D
L
 
V
D
 
S
W
 
F
T
 
T
V
 
V
M
 
M
R
 
P
G
 
G
E
 
Q
K
 
T
W
 
L
A
 
A
L
 
L
S
 
V
G
 
G
E
 
P
N
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
L
 
I
L
 
L
S
 
R
L
 
L
V
 
L
C
 
F
A
 
R
D
 
F
N
 
Y
P
 
D
Q
 
I
S
 
S
Y
 
S
A
 
G
C
 
C
D
 
-
I
 
-
S
 
-
L
 
-
F
 
-
G
 
-
R
 
-
K
 
I
R
 
R
G
 
I
T
 
D
G
 
G
E
 
Q
S
 
D
I
 
I
W
 
S
E
 
Q
I
 
V
-
 
T
-
 
Q
-
 
A
-
 
S
-
 
L
K
 
R
K
 
S
H
 
H
I
 
I
G
 
G
Y
 
V
V
 
V
S
 
P
P
 
Q
E
 
D
-
 
T
-
 
V
-
 
L
M
 
F
H
 
N
R
 
D
A
 
T
Y
 
I
L
 
A
K
 
D
N
 
N
L
 
I
P
 
R
A
 
Y
I
 
G
E
 
R
I
 
V
V
 
T
A
 
A
-
 
G
-
 
N
-
 
D
-
 
E
-
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
Q
-
 
A
S
 
A
G
 
G
L
 
I
H
 
H
D
 
D
S
 
A
I
 
I
G
 
-
L
 
-
Y
 
-
K
 
-
R
 
-
P
 
-
R
 
-
E
 
-
E
 
-
Q
 
-
L
 
M
A
 
A
V
 
F
C
 
P
E
 
E
W
 
G
W
 
Y
M
 
R
D
 
T
V
 
Q
F
 
V
G
 
G
I
 
E
A
 
R
G
 
G
L
 
L
K
 
K
D
 
-
K
 
-
P
 
-
F
 
-
L
 
-
Q
 
-
L
 
L
S
 
S
S
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
K
R
 
Q
L
 
R
A
 
V
L
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
T
F
 
I
V
 
L
K
 
K
D
 
A
P
 
P
E
 
G
L
 
I
L
 
I
I
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
A
L
 
T
H
 
S
G
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
T
Y
 
S
N
 
N
R
 
E
R
 
R
R
 
A
V
 
I
K
 
Q
K
 
A
I
 
S
I
 
L
E
 
A
A
 
K
F
 
V
C
 
C
H
 
-
R
 
-
K
 
A
D
 
N
K
 
R
T
 
T
M
 
T
I
 
I
M
 
V
V
 
V
T
 
A
H
 
H

Sites not aligning to the query:

8w9mC Cryo-em structure of the cyanobacterial nitrate transporter nrtbcd in complex with atp (see paper)
28% identity, 47% coverage: 241:470/485 of query aligns to 1:199/256 of 8w9mC

query
sites
8w9mC
T
 
T
A
 
F
V
 
V
A
 
E
M
 
I
D
 
D
E
 
H
L
 
V
Q
 
D
Q
 
-
R
 
R
I
 
I
L
x
F
D
 
D
L
 
L
P
 
P
Y
 
N
G
 
G
S
 
-
G
 
G
N
 
R
Y
|
Y
T
 
I
S
 
A
D
 
-
E
 
-
V
 
-
V
 
-
K
 
-
L
 
-
N
 
-
K
 
-
V
 
-
S
 
-
I
 
-
R
 
-
Y
 
-
D
 
-
D
 
-
R
 
-
T
 
-
I
 
-
L
 
L
K
 
K
E
 
N
L
 
I
D
 
E
W
 
L
T
 
K
V
 
I
M
 
K
R
 
Q
G
 
G
E
 
E
K
 
F
W
 
V
A
 
S
L
 
L
S
 
I
G
 
G
E
 
H
N
x
S
G
|
G
A
 
C
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
S
 
N
L
 
I
V
 
I
C
 
A
A
 
G
D
 
L
N
 
D
P
 
R
Q
 
A
S
 
S
Y
 
I
A
 
G
C
 
-
D
 
G
I
 
V
S
 
T
L
 
L
F
 
E
G
 
G
R
 
R
K
 
-
R
 
-
G
 
-
T
 
-
G
 
-
E
 
-
S
 
-
I
 
-
W
 
-
E
 
E
I
 
I
K
 
R
K
 
E
H
 
P
I
 
-
G
 
-
Y
 
-
V
 
-
S
 
S
P
 
P
E
 
D
-
 
R
-
 
M
-
 
V
-
 
V
-
 
F
M
x
Q
H
 
N
R
 
Y
A
 
S
Y
 
L
L
 
L
K
 
P
N
 
W
L
 
L
P
 
T
A
 
V
I
 
R
E
 
E
I
 
N
V
 
V
A
 
A
S
 
L
G
 
A
L
 
V
H
 
D
D
 
E
S
 
-
I
 
-
G
 
-
L
 
V
Y
 
Y
K
 
Q
-
 
G
R
 
K
P
 
S
R
 
K
E
 
G
E
 
E
Q
 
R
L
 
R
A
 
A
V
 
I
C
 
I
E
 
E
W
 
E
W
 
H
M
 
I
D
 
D
V
 
M
F
 
V
G
 
G
I
 
L
A
 
R
G
 
L
L
 
A
K
 
A
D
 
N
K
|
K
P
 
R
F
 
P
L
 
S
Q
x
E
L
 
L
S
|
S
S
 
G
G
|
G
E
 
M
Q
 
K
R
 
Q
L
 
R
A
 
V
L
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
L
V
 
A
K
 
T
D
 
R
P
 
P
E
 
K
L
 
L
L
 
L
I
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
L
 
F
H
 
G
G
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
A
Y
 
L
N
 
T
R
 
R
R
 
G
R
 
S
V
 
L
K
 
Q
K
 
E
I
 
Q
I
 
L
E
 
M
A
 
K
F
 
I
C
 
C
H
 
N
R
 
E
K
 
H
D
 
Q
K
 
I
T
 
T
M
 
C
I
 
V
M
 
M
V
 
V
T
 
T
H
|
H
Y
 
D
E
 
V
N
 
D
E
 
E

Query Sequence

>WP_009124122.1 NCBI__GCF_000195635.1:WP_009124122.1
MAQPYTIHIAGGVVRNPLVRLARPVTLDFLAGEHIAIVGPNGAGKSLLVDMLTGKYPLRE
GELAYDFSPSATKTAYDNIKYIAFRDTYGSADANYYYQQRWNAHDQEDTPEVREMLGEVA
DSALKGQLFELFRIEPMLDKKIILLSSGELRKFQLTKTLLTAPRILIMDNPFIGLDALTR
ELLFHLLEELSRMDSLQIVLVLSMLDDIPSFITHVVPVYNMTVGEKVEREVYMQAFRGQD
TAVAMDELQQRILDLPYGSGNYTSDEVVKLNKVSIRYDDRTILKELDWTVMRGEKWALSG
ENGAGKSTLLSLVCADNPQSYACDISLFGRKRGTGESIWEIKKHIGYVSPEMHRAYLKNL
PAIEIVASGLHDSIGLYKRPREEQLAVCEWWMDVFGIAGLKDKPFLQLSSGEQRLALLAR
AFVKDPELLILDEPLHGLDTYNRRRVKKIIEAFCHRKDKTMIMVTHYENELPGTITGHLF
LKRNR

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory