SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_009125592.1 NCBI__GCF_000195635.1:WP_009125592.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 19 hits to proteins with known functional sites (download)

Q9NQR4 Omega-amidase NIT2; Nitrilase homolog 2; EC 3.5.1.3 from Homo sapiens (Human) (see 2 papers)
30% identity, 56% coverage: 223:510/510 of query aligns to 2:275/276 of Q9NQR4

query
sites
Q9NQR4
T
 
T
T
 
S
V
 
F
R
 
R
V
 
L
G
 
A
L
 
L
V
 
I
Q
 
Q
W
 
L
Q
 
Q
M
 
I
R
 
S
T
 
S
Y
 
I
K
 
K
T
 
S
L
 
-
D
 
D
D
 
N
L
 
V
F
 
T
E
 
R
Q
 
A
V
 
C
E
 
S
F
 
F
F
 
I
V
 
R
D
 
E
A
 
A
V
 
A
S
 
T
D
 
Q
Y
 
-
K
 
G
S
 
A
D
 
K
F
 
I
I
 
V
L
 
S
F
 
L
P
 
P
E
|
E
Y
 
C
F
 
F
N
 
N
A
 
S
P
 
P
L
 
Y
M
 
G
A
 
A
K
 
K
F
 
Y
N
 
F
N
 
P
E
 
E
G
 
-
E
 
Y
S
 
A
Q
 
E
A
 
K
I
 
I
R
 
P
G
 
G
L
 
E
A
 
S
T
 
T
Y
 
-
T
 
-
E
 
-
E
 
-
I
 
-
R
 
-
E
 
Q
R
 
K
F
 
L
V
 
S
K
 
E
L
 
V
A
 
A
I
 
K
S
 
E
Y
 
C
N
 
S
I
 
I
N
 
Y
I
 
L
I
 
I
T
 
G
G
 
G
S
 
S
M
 
I
P
 
P
L
 
E
I
 
-
K
 
E
D
 
D
D
 
A
G
 
G
L
 
K
L
 
L
Y
 
Y
N
 
N
V
 
T
G
 
C
F
 
A
L
 
V
C
 
F
R
 
G
R
 
P
D
 
D
G
 
G
S
 
T
Y
 
L
-
 
L
E
 
A
M
 
K
Y
 
Y
E
 
R
K
|
K
I
 
I
H
 
H
V
 
L
-
x
F
-
x
D
-
x
I
-
x
D
T
x
V
P
|
P
D
x
G
E
x
K
I
|
I
-
x
T
-
x
F
-
x
Q
K
x
E
S
 
S
W
 
K
G
 
T
L
 
L
S
 
S
G
 
P
G
 
G
K
 
D
S
 
S
I
 
F
Q
 
S
T
 
T
F
 
F
D
 
D
T
 
T
D
 
P
C
 
Y
A
 
C
K
 
R
I
 
V
G
 
G
V
 
L
L
 
G
I
 
I
C
|
C
Y
 
Y
D
 
D
V
 
M
E
 
R
F
 
F
P
 
A
E
 
E
L
 
L
S
 
A
R
 
Q
I
 
I
M
 
Y
A
 
A
D
 
Q
Q
 
R
G
 
G
M
 
C
Q
 
Q
I
 
L
L
 
L
F
 
V
V
 
Y
P
 
P
F
 
G
L
 
A
T
 
F
D
 
N
T
 
L
Q
 
T
N
 
T
A
 
G
Y
 
P
S
 
A
R
 
H
V
 
W
K
 
E
V
 
L
C
 
L
A
 
Q
H
 
R
A
 
S
R
 
R
A
 
A
I
 
V
E
 
D
N
 
N
E
 
Q
C
 
V
F
 
Y
V
 
V
V
 
A
I
 
T
A
 
A
G
 
S
S
 
P
V
 
A
G
 
R
N
 
D
L
 
D
P
 
K
R
 
A
V
 
S
H
 
Y
N
 
-
M
 
-
D
 
-
I
 
V
Q
 
A
Y
 
W
A
 
G
Q
 
H
S
 
S
G
 
T
V
 
V
F
 
V
T
 
N
P
 
P
C
 
W
D
 
G
F
 
E
A
x
V
F
 
L
P
 
A
T
 
K
D
 
A
G
 
G
K
 
-
R
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
T
 
-
P
 
-
N
 
T
T
 
E
E
 
E
M
 
A
I
 
I
L
 
V
V
 
Y
S
 
S
D
 
D
V
 
I
D
 
D
L
 
L
D
 
K
L
 
K
L
 
L
N
 
A
E
 
E
L
 
I
H
 
R
T
 
Q
Y
 
-
G
 
-
S
 
Q
V
 
I
R
 
P
N
 
V
L
 
F
K
 
R
D
 
Q
R
 
K
R
 
R
S
 
S
D
 
D
L
 
L
Y
 
Y
E
 
A
V
 
V
K
 
E
M
 
M
K
 
K
K
 
K

4hg5A Structural insights into yeast nit2: wild-type yeast nit2 in complex with oxaloacetate (see paper)
23% identity, 50% coverage: 248:504/510 of query aligns to 25:303/304 of 4hg5A

query
sites
4hg5A
E
 
E
F
 
L
F
 
I
V
 
S
D
 
E
A
 
A
V
 
I
S
 
Q
D
 
K
Y
 
-
K
 
K
S
 
A
D
 
D
F
 
V
I
 
V
L
 
F
F
 
L
P
 
P
E
 
E
-
 
A
-
 
S
-
 
D
Y
 
Y
F
 
L
N
 
S
A
 
Q
-
 
N
P
 
P
L
 
L
M
 
H
A
 
S
K
 
R
F
 
Y
N
 
L
N
 
A
E
 
Q
G
 
K
E
 
S
S
 
P
Q
 
K
A
 
F
I
 
I
R
 
R
G
 
Q
L
 
L
-
 
Q
A
 
S
T
 
S
Y
 
I
T
 
T
E
 
D
E
 
L
I
 
V
R
 
R
E
 
D
R
 
N
F
 
S
V
 
R
K
 
N
L
 
I
A
 
D
I
 
V
S
 
S
Y
 
I
N
 
G
I
 
V
N
 
H
I
 
L
I
 
P
T
 
P
G
 
S
S
 
E
M
 
Q
P
 
D
L
 
L
I
 
L
K
 
E
D
 
G
D
 
N
G
 
D
L
 
R
L
 
V
Y
 
R
N
|
N
V
 
V
G
 
L
F
 
L
L
 
Y
C
 
I
R
 
D
R
 
H
D
 
E
G
 
G
S
 
K
-
 
I
Y
 
L
E
 
Q
M
 
E
Y
 
Y
E
 
Q
K
|
K
I
 
L
H
 
H
V
 
L
-
x
F
-
 
D
-
 
V
-
 
D
-
 
V
-
 
P
-
 
N
T
 
G
P
 
P
D
 
I
E
 
L
I
 
K
K
x
E
S
 
S
W
 
K
G
 
S
L
 
V
S
 
Q
G
 
P
G
 
G
K
 
K
S
 
A
I
 
I
-
 
P
Q
 
D
T
 
I
F
 
I
D
 
E
T
 
S
D
 
P
C
 
L
A
 
G
K
 
K
I
 
L
G
 
G
V
 
S
L
 
A
I
 
I
C
|
C
Y
|
Y
D
 
D
V
 
I
E
x
R
F
 
F
P
 
P
E
 
E
L
 
F
S
 
S
R
 
L
I
 
K
M
 
L
A
 
R
D
 
S
Q
 
M
G
 
G
M
 
A
Q
 
E
I
 
I
L
 
L
F
 
C
V
 
F
P
 
P
F
 
S
L
 
A
T
x
F
D
x
T
T
 
I
Q
 
K
N
x
T
A
 
G
Y
 
E
S
 
A
R
 
H
V
 
W
K
 
E
V
 
L
C
 
L
A
 
G
H
 
R
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
V
E
 
D
N
 
T
E
 
Q
C
 
C
F
 
Y
V
 
V
V
 
L
I
 
M
A
 
P
G
 
G
S
 
Q
V
 
V
G
 
G
N
 
-
L
 
-
P
 
-
R
 
-
V
 
M
H
 
H
N
 
D
M
 
L
-
 
S
D
 
D
I
 
P
Q
 
E
Y
 
W
A
 
E
Q
 
K
S
 
Q
G
 
S
V
 
H
F
 
M
T
 
S
P
 
A
C
 
L
D
 
E
F
 
K
A
 
S
F
 
S
-
 
R
-
 
R
-
 
E
-
 
S
-
 
W
-
 
G
-
 
H
-
 
S
-
 
M
-
 
V
-
 
I
-
 
D
P
 
P
T
 
W
D
 
G
G
 
K
K
 
I
R
 
I
A
 
A
E
 
H
A
 
A
T
 
D
P
 
P
N
 
S
T
 
T
-
 
V
-
 
G
E
 
P
M
 
Q
I
 
L
L
 
I
V
 
L
S
 
A
D
 
D
V
 
L
D
 
D
L
 
R
D
 
E
L
 
L
L
 
L
N
 
Q
E
 
E
L
 
I
H
 
R
T
 
N
Y
 
K
G
 
M
S
 
P
V
 
L
R
 
W
N
 
N
L
 
-
K
 
-
D
 
Q
R
 
R
R
 
R
S
 
D
D
 
D
L
 
L
Y
 
F

4hg3A Structural insights into yeast nit2: wild-type yeast nit2 in complex with alpha-ketoglutarate (see paper)
23% identity, 50% coverage: 248:504/510 of query aligns to 25:303/304 of 4hg3A

query
sites
4hg3A
E
 
E
F
 
L
F
 
I
V
 
S
D
 
E
A
 
A
V
 
I
S
 
Q
D
 
K
Y
 
-
K
 
K
S
 
A
D
 
D
F
 
V
I
 
V
L
 
F
F
 
L
P
 
P
E
 
E
-
 
A
-
 
S
-
 
D
Y
 
Y
F
 
L
N
 
S
A
 
Q
-
 
N
P
 
P
L
 
L
M
 
H
A
 
S
K
 
R
F
 
Y
N
 
L
N
 
A
E
 
Q
G
 
K
E
 
S
S
 
P
Q
 
K
A
 
F
I
 
I
R
 
R
G
 
Q
L
 
L
-
 
Q
A
 
S
T
 
S
Y
 
I
T
 
T
E
 
D
E
 
L
I
 
V
R
 
R
E
 
D
R
 
N
F
 
S
V
 
R
K
 
N
L
 
I
A
 
D
I
 
V
S
 
S
Y
 
I
N
 
G
I
 
V
N
 
H
I
 
L
I
 
P
T
 
P
G
 
S
S
 
E
M
 
Q
P
 
D
L
 
L
I
 
L
K
 
E
D
 
G
D
 
N
G
 
D
L
 
R
L
 
V
Y
 
R
N
|
N
V
 
V
G
 
L
F
 
L
L
 
Y
C
 
I
R
 
D
R
 
H
D
 
E
G
 
G
S
 
K
-
 
I
Y
 
L
E
 
Q
M
 
E
Y
 
Y
E
 
Q
K
|
K
I
 
L
H
 
H
V
 
L
-
x
F
-
 
D
-
 
V
-
 
D
-
 
V
-
 
P
-
 
N
T
 
G
P
 
P
D
 
I
E
 
L
I
 
K
K
x
E
S
 
S
W
 
K
G
 
S
L
 
V
S
 
Q
G
 
P
G
 
G
K
 
K
S
 
A
I
 
I
-
 
P
Q
 
D
T
 
I
F
 
I
D
 
E
T
 
S
D
 
P
C
 
L
A
 
G
K
 
K
I
 
L
G
 
G
V
 
S
L
 
A
I
 
I
C
|
C
Y
|
Y
D
 
D
V
 
I
E
x
R
F
 
F
P
 
P
E
 
E
L
 
F
S
 
S
R
 
L
I
 
K
M
 
L
A
 
R
D
 
S
Q
 
M
G
 
G
M
 
A
Q
 
E
I
 
I
L
 
L
F
 
C
V
 
F
P
 
P
F
 
S
L
 
A
T
x
F
D
x
T
T
 
I
Q
 
K
N
x
T
A
 
G
Y
 
E
S
 
A
R
 
H
V
 
W
K
 
E
V
 
L
C
 
L
A
 
G
H
 
R
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
V
E
 
D
N
 
T
E
 
Q
C
 
C
F
 
Y
V
 
V
V
 
L
I
 
M
A
 
P
G
 
G
S
 
Q
V
 
V
G
 
G
N
 
-
L
 
-
P
 
-
R
 
-
V
 
M
H
 
H
N
 
D
M
 
L
-
 
S
D
 
D
I
 
P
Q
 
E
Y
 
W
A
 
E
Q
 
K
S
 
Q
G
 
S
V
 
H
F
 
M
T
 
S
P
 
A
C
 
L
D
 
E
F
 
K
A
 
S
F
 
S
-
 
R
-
 
R
-
 
E
-
 
S
-
 
W
-
 
G
-
 
H
-
 
S
-
 
M
-
 
V
-
 
I
-
 
D
P
 
P
T
 
W
D
 
G
G
 
K
K
 
I
R
 
I
A
 
A
E
 
H
A
 
A
T
 
D
P
 
P
N
 
S
T
 
T
-
 
V
-
 
G
E
 
P
M
 
Q
I
 
L
L
 
I
V
 
L
S
 
A
D
 
D
V
 
L
D
 
D
L
 
R
D
 
E
L
 
L
L
 
L
N
 
Q
E
 
E
L
 
I
H
 
R
T
 
N
Y
 
K
G
 
M
S
 
P
V
 
L
R
 
W
N
 
N
L
 
-
K
 
-
D
 
Q
R
 
R
R
 
R
S
 
D
D
 
D
L
 
L
Y
 
F

P47016 Deaminated glutathione amidase; dGSH amidase; Nitrilase homolog 1; EC 3.5.1.128 from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) (see paper)
23% identity, 50% coverage: 248:504/510 of query aligns to 28:306/307 of P47016

query
sites
P47016
E
 
E
F
 
L
F
 
I
V
 
S
D
 
E
A
 
A
V
 
I
S
 
Q
D
 
K
Y
 
-
K
 
K
S
 
A
D
 
D
F
 
V
I
 
V
L
 
F
F
 
L
P
 
P
E
 
E
-
 
A
-
 
S
-
 
D
Y
 
Y
F
 
L
N
 
S
A
 
Q
-
 
N
P
 
P
L
 
L
M
 
H
A
 
S
K
 
R
F
 
Y
N
 
L
N
 
A
E
 
Q
G
 
K
E
 
S
S
 
P
Q
 
K
A
 
F
I
 
I
R
 
R
G
 
Q
L
 
L
-
 
Q
A
 
S
T
 
S
Y
 
I
T
 
T
E
 
D
E
 
L
I
 
V
R
 
R
E
 
D
R
 
N
F
 
S
V
 
R
K
 
N
L
 
I
A
 
D
I
 
V
S
 
S
Y
 
I
N
 
G
I
 
V
N
 
H
I
 
L
I
 
P
T
 
P
G
 
S
S
 
E
M
 
Q
P
 
D
L
 
L
I
 
L
K
 
E
D
 
G
D
 
N
G
 
D
L
 
R
L
 
V
Y
 
R
N
 
N
V
 
V
G
 
L
F
 
L
L
 
Y
C
 
I
R
 
D
R
 
H
D
 
E
G
 
G
S
 
K
-
 
I
Y
 
L
E
 
Q
M
 
E
Y
 
Y
E
 
Q
K
 
K
I
 
L
H
 
H
V
 
L
-
 
F
-
 
D
-
 
V
-
 
D
-
 
V
-
 
P
-
 
N
T
 
G
P
 
P
D
 
I
E
 
L
I
 
K
K
 
E
S
 
S
W
 
K
G
 
S
L
 
V
S
 
Q
G
 
P
G
 
G
K
 
K
S
 
A
I
 
I
-
 
P
Q
 
D
T
 
I
F
 
I
D
 
E
T
 
S
D
 
P
C
 
L
A
 
G
K
 
K
I
 
L
G
 
G
V
 
S
L
 
A
I
 
I
C
|
C
Y
 
Y
D
 
D
V
 
I
E
x
R
F
 
F
P
 
P
E
 
E
L
 
F
S
 
S
R
 
L
I
 
K
M
 
L
A
 
R
D
 
S
Q
 
M
G
 
G
M
 
A
Q
 
E
I
 
I
L
 
L
F
 
C
V
 
F
P
 
P
F
 
S
L
 
A
T
 
F
D
 
T
T
 
I
Q
 
K
N
x
T
A
 
G
Y
 
E
S
 
A
R
 
H
V
 
W
K
 
E
V
 
L
C
 
L
A
 
G
H
 
R
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
V
E
 
D
N
 
T
E
 
Q
C
 
C
F
 
Y
V
 
V
V
 
L
I
 
M
A
 
P
G
 
G
S
 
Q
V
 
V
G
 
G
N
 
-
L
 
-
P
 
-
R
 
-
V
 
M
H
 
H
N
 
D
M
 
L
-
 
S
D
 
D
I
 
P
Q
 
E
Y
 
W
A
 
E
Q
 
K
S
 
Q
G
 
S
V
 
H
F
 
M
T
 
S
P
 
A
C
 
L
D
 
E
F
 
K
A
 
S
F
 
S
-
 
R
-
 
R
-
 
E
-
 
S
-
 
W
-
 
G
-
 
H
-
 
S
-
 
M
-
 
V
-
 
I
-
 
D
P
 
P
T
 
W
D
 
G
G
 
K
K
 
I
R
 
I
A
 
A
E
 
H
A
 
A
T
 
D
P
 
P
N
 
S
T
 
T
-
 
V
-
 
G
E
 
P
M
 
Q
I
 
L
L
 
I
V
 
L
S
 
A
D
 
D
V
 
L
D
 
D
L
 
R
D
 
E
L
 
L
L
 
L
N
 
Q
E
 
E
L
 
I
H
 
R
T
 
N
Y
 
K
G
 
M
S
 
P
V
 
L
R
 
W
N
 
N
L
 
-
K
 
-
D
 
Q
R
 
R
R
 
R
S
 
D
D
 
D
L
 
L
Y
 
F

4hgdA Structural insights into yeast nit2: c169s mutant of yeast nit2 in complex with an endogenous peptide-like ligand (see paper)
23% identity, 50% coverage: 248:504/510 of query aligns to 24:299/299 of 4hgdA

query
sites
4hgdA
E
 
E
F
 
L
F
 
I
V
 
S
D
 
E
A
 
A
V
 
I
S
 
Q
D
 
K
Y
 
-
K
 
K
S
 
A
D
 
D
F
 
V
I
 
V
L
 
F
F
 
L
P
 
P
E
|
E
-
 
A
-
 
S
-
 
D
Y
 
Y
F
 
L
N
 
S
A
 
Q
-
 
N
P
 
P
L
 
L
M
 
H
A
 
S
K
 
R
F
 
Y
N
 
L
N
 
A
E
 
Q
G
 
K
E
 
S
S
 
P
Q
 
K
A
 
F
I
 
I
R
 
R
G
 
Q
L
 
L
-
 
Q
A
 
S
T
 
S
Y
 
I
T
 
T
E
 
D
E
 
L
I
 
V
R
 
R
E
 
D
R
 
N
F
 
S
V
 
R
K
 
N
L
 
I
A
 
D
I
 
V
S
 
S
Y
 
I
N
 
G
I
 
V
N
 
H
I
 
L
I
 
P
T
 
P
G
 
S
S
 
E
M
 
Q
P
 
D
L
 
L
I
 
L
K
 
E
D
 
G
D
 
N
G
 
D
L
 
R
L
 
V
Y
 
R
N
 
N
V
 
V
G
 
L
F
 
L
L
 
Y
C
 
I
R
 
D
R
 
H
D
 
E
G
 
G
S
 
K
-
 
I
Y
 
L
E
 
Q
M
 
E
Y
 
Y
E
 
Q
K
|
K
I
 
L
H
 
H
V
 
L
-
x
F
-
 
D
-
 
V
-
 
D
T
 
V
P
 
P
D
 
N
E
 
P
I
 
I
-
 
L
-
 
K
K
x
E
S
 
S
W
 
K
G
 
S
L
 
V
S
 
Q
G
 
P
G
 
G
K
 
K
S
 
A
I
 
I
-
 
P
Q
 
D
T
 
I
F
 
I
D
 
E
T
 
S
D
 
P
C
 
L
A
 
G
K
 
K
I
 
L
G
 
G
V
 
S
L
 
A
I
 
I
C
x
S
Y
|
Y
D
 
D
V
 
I
E
x
R
F
 
F
P
 
P
E
 
E
L
 
F
S
 
S
R
 
L
I
 
K
M
 
L
A
 
R
D
 
S
Q
 
M
G
 
G
M
 
A
Q
 
E
I
 
I
L
 
L
F
 
C
V
 
F
P
 
P
F
 
S
L
x
A
T
x
F
D
 
T
T
 
I
Q
 
K
N
x
T
A
 
G
Y
 
E
S
 
A
R
 
H
V
 
W
K
 
E
V
 
L
C
 
L
A
 
G
H
 
R
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
V
E
 
D
N
 
T
E
 
Q
C
 
C
F
 
Y
V
 
V
V
 
L
I
 
M
A
 
P
G
 
G
S
 
Q
V
 
V
G
 
G
N
 
-
L
 
-
P
 
-
R
 
-
V
 
M
H
 
H
N
 
D
M
 
L
-
 
S
D
 
D
I
 
P
Q
 
E
Y
 
W
A
 
E
Q
 
K
S
 
Q
G
 
S
V
 
H
F
 
M
T
 
S
P
 
A
C
 
L
D
 
E
F
 
K
A
 
R
F
x
R
P
 
E
T
 
S
D
 
W
G
 
G
K
 
H
R
 
S
-
 
M
-
 
V
-
 
I
-
 
D
-
 
P
-
 
W
-
 
G
-
 
K
-
 
I
-
 
I
A
 
A
E
 
H
A
 
A
T
 
D
P
 
P
N
 
S
T
 
T
-
 
V
-
 
G
E
 
P
M
 
Q
I
 
L
L
 
I
V
 
L
S
 
A
D
 
D
V
 
L
D
 
D
L
 
R
D
 
E
L
 
L
L
 
L
N
 
Q
E
 
E
L
 
I
H
 
R
T
 
N
Y
 
K
G
 
M
S
 
P
V
 
L
R
 
W
N
 
N
L
 
-
K
 
-
D
 
Q
R
 
R
R
 
R
S
 
D
D
 
D
L
 
L
Y
 
F

Q94JV5 Deaminated glutathione amidase, chloroplastic/cytosolic; dGSH amidase; Nitrilase-like protein 2; Protein nitrilase 1 homolog; AtNit1; Protein Nit1 homolog; EC 3.5.1.128 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
25% identity, 55% coverage: 212:489/510 of query aligns to 24:294/307 of Q94JV5

query
sites
Q94JV5
Q
|
Q
P
x
I
P
|
P
T
x
L
Q
x
T
E
x
M
F
 
A
V
 
T
N
 
T
P
 
V
K
 
N
T
 
K
T
 
T
V
 
V
R
 
R
V
 
V
G
 
A
L
 
A
V
 
A
Q
 
Q
W
 
-
Q
 
-
M
 
M
R
 
T
T
 
S
Y
 
V
K
 
N
T
 
D
L
 
L
D
 
M
D
 
T
L
 
N
F
 
F
E
 
A
Q
 
T
V
 
C
E
 
S
F
 
R
F
 
L
V
 
V
D
 
Q
A
 
E
V
 
A
S
 
A
D
 
L
Y
 
A
K
 
G
S
 
A
D
 
K
F
 
L
I
 
I
L
 
C
F
 
F
P
 
P
E
 
E
Y
 
N
F
 
F
N
 
S
A
 
-
P
 
-
L
 
-
M
 
-
A
 
-
K
 
-
F
 
F
N
 
V
N
 
G
E
 
D
G
 
K
E
 
E
S
 
G
Q
 
E
A
 
S
I
 
V
R
 
K
G
 
I
L
 
A
A
 
E
T
 
P
Y
 
L
T
 
D
E
 
G
E
 
P
I
 
V
R
 
M
E
 
E
R
 
R
F
 
Y
V
 
C
K
 
S
L
 
L
A
 
A
I
 
R
S
 
D
Y
 
S
N
 
N
I
 
I
N
 
W
I
 
L
I
 
S
T
 
L
G
 
G
S
 
G
M
 
F
P
 
Q
L
 
E
I
 
R
K
 
F
D
 
D
D
 
D
G
 
T
L
 
H
L
 
L
Y
 
C
N
 
N
V
 
T
G
 
H
F
 
V
L
 
V
C
 
I
R
 
D
R
 
D
D
 
A
G
 
G
S
 
M
Y
 
I
-
 
R
E
 
D
M
 
T
Y
 
Y
E
 
Q
K
 
K
I
 
M
H
 
H
V
 
L
T
 
F
P
 
D
D
 
V
E
 
D
I
 
V
-
 
P
-
 
G
-
 
G
-
 
S
-
 
S
-
 
Y
-
 
K
-
 
E
K
 
S
S
 
S
W
 
F
G
 
T
L
 
V
S
 
P
G
 
G
G
 
T
K
 
K
S
 
-
I
 
I
Q
 
V
T
 
S
F
 
V
D
 
D
T
 
S
D
 
P
C
 
V
A
 
G
K
 
R
I
 
L
G
 
G
V
 
L
L
 
T
I
 
V
C
 
C
Y
 
Y
D
 
D
V
 
L
E
 
R
F
 
F
P
 
P
E
 
K
L
 
I
-
 
Y
S
 
Q
R
 
Q
I
 
L
M
 
R
A
 
F
D
 
E
Q
 
Q
G
 
K
M
 
A
Q
 
Q
I
 
V
L
 
L
F
 
L
V
 
V
P
 
P
F
 
-
L
 
-
T
 
-
D
 
-
T
 
-
Q
 
-
N
 
S
A
 
A
Y
 
F
S
 
T
R
 
K
V
 
V
K
 
T
V
 
G
C
 
E
A
 
A
H
 
H
-
 
W
-
 
E
-
 
I
-
 
L
-
 
L
-
 
R
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
I
E
 
E
N
 
T
E
 
Q
C
 
C
F
 
Y
V
 
V
V
 
I
I
 
A
A
 
A
G
 
A
S
 
Q
V
 
A
G
 
G
N
 
K
L
 
-
P
 
-
R
 
-
V
 
-
H
 
H
N
 
N
M
 
E
D
 
K
I
 
R
Q
 
E
-
 
S
Y
 
Y
A
 
G
Q
 
D
S
 
T
G
 
L
V
 
I
F
 
I
T
 
D
P
 
P
C
 
W
D
 
-
F
 
-
A
 
-
F
 
-
P
 
-
T
 
-
D
 
-
G
 
G
K
 
T
R
 
V
A
 
V
E
 
G
A
 
R
T
 
L
P
 
P
N
 
D
-
 
R
-
 
V
T
 
S
E
 
T
M
 
G
I
 
I
L
 
V
V
 
V
S
 
A
D
 
D
V
 
I
D
 
D
L
 
F
D
 
S
L
 
L
L
 
I
N
 
D
E
 
S
L
 
V
H
 
R
T
 
T

Sites not aligning to the query:

5h8jB Crystal structure of medicago truncatula n-carbamoylputrescine amidohydrolase (mtcpa) in complex with cadaverine (see paper)
33% identity, 36% coverage: 325:506/510 of query aligns to 99:286/297 of 5h8jB

query
sites
5h8jB
Y
 
Y
N
|
N
V
 
S
G
 
I
F
 
A
L
 
I
C
 
I
R
 
D
R
 
A
D
 
D
G
 
G
S
 
T
-
 
D
Y
 
L
E
 
G
M
 
I
Y
 
Y
E
 
R
K
|
K
I
 
S
H
 
H
V
 
I
T
 
-
P
 
P
D
 
D
-
 
G
-
 
P
-
 
G
-
x
Y
E
 
E
I
 
E
K
 
K
S
 
F
W
 
Y
G
 
F
L
 
N
S
 
P
G
 
G
G
 
D
K
 
T
S
 
G
I
 
F
Q
 
K
T
 
V
F
 
F
D
 
Q
T
 
T
D
 
K
C
 
Y
A
 
A
K
 
K
I
 
I
G
 
G
V
 
V
L
 
A
I
 
I
C
|
C
Y
 
W
D
 
D
V
 
Q
E
 
W
F
 
F
P
 
P
E
 
E
L
 
A
S
 
A
R
 
R
I
 
A
M
 
M
A
 
A
D
 
L
Q
 
Q
G
 
G
M
 
A
Q
 
E
I
 
I
L
 
L
F
 
F
V
 
Y
P
 
P
F
 
T
L
x
A
-
 
I
-
 
G
-
 
S
-
x
E
-
 
P
-
 
H
-
 
D
-
 
Q
-
 
S
T
 
I
D
 
D
T
 
S
Q
 
R
N
 
D
A
 
H
Y
 
W
S
 
K
R
 
R
V
 
V
K
 
-
V
 
M
C
 
Q
A
 
G
H
 
H
A
 
A
R
 
G
A
 
A
I
 
-
E
 
-
N
 
N
E
 
L
C
 
V
F
 
P
V
 
L
V
 
V
I
 
A
A
 
S
G
 
N
S
 
R
V
 
I
G
 
G
N
 
N
L
 
-
P
 
-
R
 
-
V
 
-
H
 
E
N
 
I
M
 
I
D
 
E
I
 
T
Q
 
E
Y
 
H
A
 
G
Q
 
K
S
 
S
G
 
E
V
 
I
-
 
K
F
 
F
T
 
Y
P
 
G
C
 
N
D
 
S
F
 
F
-
 
I
A
 
A
F
 
G
P
 
P
T
 
T
D
 
G
G
 
E
K
 
I
R
 
V
A
 
S
E
 
I
A
 
A
T
 
D
P
 
D
N
 
K
T
 
E
E
 
E
M
 
A
I
 
V
L
 
L
V
 
I
S
 
A
D
 
E
V
 
F
D
 
N
L
 
L
D
 
D
L
 
K
L
 
I
N
 
K
E
 
S
L
 
M
-
 
R
H
 
H
T
 
C
Y
 
W
G
 
G
S
 
V
V
 
F
R
 
R
N
 
-
L
 
-
K
 
-
D
 
D
R
 
R
R
 
R
S
 
P
D
 
D
L
 
L
Y
 
Y
E
 
K
V
 
V

Sites not aligning to the query:

5h8iC Crystal structure of medicago truncatula n-carbamoylputrescine amidohydrolase (mtcpa) in complex with n-(dihydroxymethyl)putrescine (see paper)
33% identity, 36% coverage: 325:506/510 of query aligns to 103:290/301 of 5h8iC

query
sites
5h8iC
Y
 
Y
N
|
N
V
 
S
G
 
I
F
 
A
L
 
I
C
 
I
R
 
D
R
 
A
D
 
D
G
 
G
S
 
T
-
 
D
Y
 
L
E
 
G
M
 
I
Y
 
Y
E
 
R
K
|
K
I
 
S
H
 
H
V
 
I
T
 
-
P
|
P
D
 
D
-
 
G
-
 
P
-
 
G
-
x
Y
E
 
E
I
x
E
K
 
K
S
 
F
W
 
Y
G
 
F
L
 
N
S
 
P
G
 
G
G
 
D
K
 
T
S
 
G
I
 
F
Q
 
K
T
 
V
F
 
F
D
 
Q
T
 
T
D
 
K
C
 
Y
A
 
A
K
 
K
I
 
I
G
 
G
V
 
V
L
 
A
I
 
I
C
|
C
Y
x
W
D
 
D
V
 
Q
E
 
W
F
 
F
P
 
P
E
 
E
L
 
A
S
 
A
R
 
R
I
 
A
M
 
M
A
 
A
D
 
L
Q
 
Q
G
 
G
M
 
A
Q
 
E
I
 
I
L
 
L
F
 
F
V
 
Y
P
 
P
F
 
T
L
x
A
-
 
I
-
 
G
-
 
S
-
x
E
-
 
P
-
 
H
-
 
D
-
 
Q
-
 
S
T
 
I
D
 
D
T
 
S
Q
 
R
N
 
D
A
 
H
Y
 
W
S
 
K
R
 
R
V
 
V
K
 
-
V
 
M
C
 
Q
A
 
G
H
 
H
A
 
A
R
 
G
A
 
A
I
 
-
E
 
-
N
 
N
E
 
L
C
 
V
F
 
P
V
 
L
V
 
V
I
 
A
A
 
S
G
 
N
S
 
R
V
 
I
G
 
G
N
 
N
L
 
-
P
 
-
R
 
-
V
 
-
H
 
E
N
 
I
M
 
I
D
 
E
I
 
T
Q
 
E
Y
 
H
A
 
G
Q
 
K
S
 
S
G
 
E
V
 
I
-
 
K
F
 
F
T
 
Y
P
 
G
C
 
N
D
 
S
F
 
F
-
 
I
A
 
A
F
 
G
P
 
P
T
 
T
D
 
G
G
 
E
K
 
I
R
 
V
A
 
S
E
 
I
A
 
A
T
 
D
P
 
D
N
 
K
T
 
E
E
 
E
M
 
A
I
 
V
L
 
L
V
 
I
S
 
A
D
 
E
V
 
F
D
 
N
L
 
L
D
 
D
L
 
K
L
 
I
N
 
K
E
 
S
L
 
M
-
 
R
H
 
H
T
 
C
Y
 
W
G
 
G
S
 
V
V
 
F
R
 
R
N
 
-
L
 
-
K
 
-
D
 
D
R
 
R
R
 
R
S
 
P
D
 
D
L
 
L
Y
 
Y
E
 
K
V
 
V

Sites not aligning to the query:

7uciA Sxta methyltransferase and decarboxylase didomain in complex with mn2+ and sah (see paper)
24% identity, 33% coverage: 39:207/510 of query aligns to 520:683/686 of 7uciA

query
sites
7uciA
T
 
T
H
 
H
K
 
-
Q
 
E
I
 
I
E
 
R
K
 
R
L
 
R
I
 
L
R
 
E
I
 
L
F
 
N
P
 
P
E
 
Q
G
 
G
Q
 
N
I
 
L
V
 
V
T
 
L
V
 
I
V
 
I
D
 
E
E
 
D
Q
 
Q
I
 
I
V
 
I
G
 
G
C
 
A
A
 
I
L
 
Y
S
 
S
I
 
Q
I
 
T
V
 
I
N
 
T
Y
 
S
D
 
T
D
 
E
V
 
A
K
 
L
N
 
E
D
 
N
H
 
V
T
 
K
Y
 
Y
A
 
A
Q
 
Q
V
 
V
T
 
P
G
 
-
K
 
-
E
 
-
T
 
-
F
 
-
N
 
T
T
 
L
H
 
H
N
 
T
P
 
P
K
 
Q
G
 
G
N
 
S
I
 
V
L
 
I
Y
 
Q
G
 
L
I
 
L
E
 
A
V
 
L
F
 
N
I
 
I
H
 
L
P
 
P
K
 
E
Y
 
F
R
 
Q
G
 
A
L
 
R
R
 
G
L
 
L
A
 
G
R
 
N
R
 
E
M
 
L
Y
 
R
E
 
D
Y
 
F
R
 
M
K
 
L
E
 
Y
L
 
Y
C
 
C
E
 
-
T
 
T
L
 
L
-
 
K
-
 
G
N
 
G
L
 
I
K
 
E
A
 
S
I
 
V
M
 
V
F
 
G
G
 
V
G
 
T
R
 
R
I
 
C
P
 
R
N
 
N
Y
 
Y
Y
 
V
K
 
N
Y
 
Y
A
 
S
D
 
-
Q
 
Q
I
 
M
R
 
P
P
 
M
K
 
M
E
 
E
Y
 
Y
I
 
L
D
 
K
-
 
L
K
 
H
V
 
N
K
 
E
Q
 
Q
K
 
R
E
 
Q
I
 
L
F
 
L
D
 
D
P
 
P
V
 
I
L
 
V
T
 
G
F
 
F
Q
 
H
L
 
V
S
 
S
N
 
G
D
 
G
F
 
A
H
 
E
V
 
I
R
 
R
K
 
G
V
 
I
M
 
I
R
 
A
N
 
N
Y
 
Y
L
 
R
P
 
P
N
 
E
D
 
D
E
 
T
E
 
D
S
 
N
K
 
L
H
 
G
Y
 
M
A
 
G
C
 
I
L
 
L
L
 
I
Q
 
E
W
 
Y
D
 
N

Sites not aligning to the query:

5h8lB Crystal structure of medicago truncatula n-carbamoylputrescine amidohydrolase (mtcpa) c158s mutant in complex with putrescine (see paper)
32% identity, 36% coverage: 325:506/510 of query aligns to 100:287/298 of 5h8lB

query
sites
5h8lB
Y
 
Y
N
|
N
V
 
S
G
 
I
F
 
A
L
 
I
C
 
I
R
 
D
R
 
A
D
 
D
G
 
G
S
 
T
-
 
D
Y
 
L
E
 
G
M
 
I
Y
 
Y
E
 
R
K
|
K
I
 
S
H
 
H
V
 
I
T
 
-
P
 
P
D
 
D
-
 
G
-
 
P
-
 
G
-
x
Y
E
 
E
I
x
E
K
 
K
S
 
F
W
 
Y
G
 
F
L
 
N
S
 
P
G
 
G
G
 
D
K
 
T
S
 
G
I
 
F
Q
 
K
T
 
V
F
 
F
D
 
Q
T
 
T
D
 
K
C
 
Y
A
 
A
K
 
K
I
 
I
G
 
G
V
 
V
L
 
A
I
 
I
C
x
S
Y
 
W
D
 
D
V
 
Q
E
 
W
F
 
F
P
 
P
E
 
E
L
 
A
S
 
A
R
 
R
I
 
A
M
 
M
A
 
A
D
 
L
Q
 
Q
G
 
G
M
 
A
Q
 
E
I
 
I
L
 
L
F
 
F
V
 
Y
P
 
P
F
 
T
L
x
A
-
 
I
-
 
G
-
 
S
-
x
E
-
 
P
-
 
H
-
 
D
-
 
Q
-
 
S
T
 
I
D
 
D
T
 
S
Q
 
R
N
 
D
A
 
H
Y
 
W
S
 
K
R
 
R
V
 
V
K
 
-
V
 
M
C
 
Q
A
 
G
H
 
H
A
 
A
R
 
G
A
 
A
I
 
-
E
 
-
N
 
N
E
 
L
C
 
V
F
 
P
V
 
L
V
 
V
I
 
A
A
 
S
G
 
N
S
 
R
V
 
I
G
 
G
N
 
N
L
 
-
P
 
-
R
 
-
V
 
-
H
 
E
N
 
I
M
 
I
D
 
E
I
 
T
Q
 
E
Y
 
H
A
 
G
Q
 
K
S
 
S
G
 
E
V
 
I
-
 
K
F
 
F
T
 
Y
P
 
G
C
 
N
D
 
S
F
 
F
-
 
I
A
 
A
F
 
G
P
 
P
T
 
T
D
 
G
G
 
E
K
 
I
R
 
V
A
 
S
E
 
I
A
 
A
T
 
D
P
 
D
N
 
K
T
 
E
E
 
E
M
 
A
I
 
V
L
 
L
V
 
I
S
 
A
D
 
E
V
 
F
D
 
N
L
 
L
D
 
D
L
 
K
L
 
I
N
 
K
E
 
S
L
 
M
-
 
R
H
 
H
T
 
C
Y
 
W
G
 
G
S
 
V
V
 
F
R
 
R
N
 
-
L
 
-
K
 
-
D
 
D
R
 
R
R
 
R
S
 
P
D
 
D
L
 
L
Y
 
Y
E
 
K
V
 
V

Sites not aligning to the query:

6ypaB The c146a variant of an amidase from pyrococcus horikoshii with bound glutaramide
25% identity, 55% coverage: 225:504/510 of query aligns to 9:267/269 of 6ypaB

query
sites
6ypaB
V
 
V
R
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
Y
V
 
I
Q
 
Q
W
 
M
Q
 
E
M
 
P
R
 
K
T
 
I
Y
 
L
K
 
E
T
 
-
L
 
L
D
 
D
D
 
K
L
 
N
F
 
Y
E
 
S
Q
 
K
V
 
A
E
 
E
F
 
K
F
 
L
V
 
I
D
 
K
A
 
E
V
 
A
S
 
S
D
 
K
Y
 
E
K
 
G
S
 
A
D
 
K
F
 
L
I
 
V
L
 
V
F
 
L
P
 
P
E
|
E
Y
 
L
F
 
F
N
 
D
A
 
T
P
 
-
L
 
-
M
 
-
A
 
-
K
 
G
F
 
Y
N
 
N
N
 
F
E
 
E
G
 
S
E
 
R
S
 
E
Q
 
E
A
 
V
I
 
F
R
 
D
G
 
V
L
 
A
A
 
Q
T
 
Q
Y
 
I
T
 
P
E
 
E
-
 
G
E
 
E
I
 
T
R
 
T
E
 
T
R
 
F
F
 
L
V
 
M
K
 
E
L
 
L
A
 
A
I
 
R
S
 
E
Y
 
L
N
 
G
I
 
L
N
 
Y
I
 
I
I
 
V
T
 
A
G
 
G
S
 
T
M
 
A
P
 
E
L
 
-
I
 
-
K
 
K
D
 
S
D
 
G
G
 
N
L
 
Y
L
 
L
Y
 
Y
N
 
N
V
 
S
G
 
A
F
 
V
L
 
V
C
 
V
R
 
G
R
 
P
D
 
R
G
 
G
S
 
Y
Y
 
I
E
 
G
M
 
K
Y
 
Y
E
 
R
K
|
K
I
 
I
H
 
H
V
 
L
T
x
F
P
 
Y
D
 
R
E
|
E
I
 
-
K
 
K
S
 
V
W
 
F
G
 
F
L
 
E
S
 
P
G
 
G
G
 
D
K
 
L
S
 
G
I
 
F
Q
 
K
T
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
I
D
 
G
C
 
F
A
 
A
K
 
K
I
 
V
G
 
G
V
 
V
L
 
M
I
 
I
C
x
A
Y
x
F
D
 
D
V
x
W
E
 
F
F
 
F
P
 
P
E
 
E
L
 
S
S
 
A
R
 
R
I
 
T
M
 
L
A
 
A
D
 
L
Q
 
K
G
 
G
M
 
A
Q
 
E
I
 
I
L
 
I
F
 
A
V
 
H
P
 
P
F
 
A
L
x
N
T
x
L
D
x
V
T
x
M
Q
 
P
N
 
Y
A
 
A
Y
 
P
S
 
R
R
 
A
V
 
M
K
 
P
V
 
I
C
 
-
A
 
-
H
 
-
A
 
-
R
 
R
A
 
A
I
 
L
E
 
E
N
 
N
E
 
R
C
 
V
F
 
Y
V
 
T
V
 
I
I
 
T
A
 
A
G
 
D
S
 
R
V
 
V
G
 
G
N
 
-
L
 
-
P
 
-
R
 
-
V
 
-
H
 
E
N
 
E
M
 
R
D
 
G
I
 
L
Q
 
K
Y
 
F
A
 
I
Q
 
G
S
 
K
G
 
S
V
 
L
F
 
-
T
 
-
P
 
-
C
 
-
D
 
-
F
 
I
A
 
A
F
 
S
P
 
P
T
 
K
D
 
A
G
 
E
K
 
V
R
 
L
A
 
S
E
 
I
A
 
A
T
 
S
P
 
E
N
 
T
T
 
E
E
 
E
M
 
E
I
 
I
L
 
G
V
 
V
S
 
V
D
 
E
V
 
I
D
 
D
L
 
L
D
 
N
L
 
L
-
 
A
-
 
R
-
 
N
-
 
K
-
 
R
L
 
L
N
 
N
E
 
D
L
 
M
H
 
N
T
 
D
Y
 
I
G
 
-
S
 
-
V
 
-
R
 
-
N
 
-
L
 
F
K
 
K
D
 
D
R
 
R
R
 
R
S
 
E
D
 
E
L
 
Y
Y
 
Y

7ovgA The c146a variant of an amidase from pyrococcus horikoshii with bound acetamide (see paper)
25% identity, 55% coverage: 225:504/510 of query aligns to 3:261/263 of 7ovgA

query
sites
7ovgA
V
 
V
R
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
Y
V
 
I
Q
 
Q
W
 
M
Q
 
E
M
 
P
R
 
K
T
 
I
Y
 
L
K
 
E
T
 
-
L
 
L
D
 
D
D
 
K
L
 
N
F
 
Y
E
 
S
Q
 
K
V
 
A
E
 
E
F
 
K
F
 
L
V
 
I
D
 
K
A
 
E
V
 
A
S
 
S
D
 
K
Y
 
E
K
 
G
S
 
A
D
 
K
F
 
L
I
 
V
L
 
V
F
 
L
P
 
P
E
|
E
Y
 
L
F
 
F
N
 
D
A
 
T
P
 
-
L
 
-
M
 
-
A
 
-
K
 
G
F
 
Y
N
 
N
N
 
F
E
 
E
G
 
S
E
 
R
S
 
E
Q
 
E
A
 
V
I
 
F
R
 
D
G
 
V
L
 
A
A
 
Q
T
 
Q
Y
 
I
T
 
P
E
 
E
-
 
G
E
 
E
I
 
T
R
 
T
E
 
T
R
 
F
F
 
L
V
 
M
K
 
E
L
 
L
A
 
A
I
 
R
S
 
E
Y
 
L
N
 
G
I
 
L
N
 
Y
I
 
I
I
 
V
T
 
A
G
 
G
S
 
T
M
 
A
P
 
E
L
 
-
I
 
-
K
 
K
D
 
S
D
 
G
G
 
N
L
 
Y
L
 
L
Y
 
Y
N
 
N
V
 
S
G
 
A
F
 
V
L
 
V
C
 
V
R
 
G
R
 
P
D
 
R
G
 
G
S
 
Y
Y
 
I
E
 
G
M
 
K
Y
 
Y
E
 
R
K
|
K
I
 
I
H
 
H
V
 
L
T
x
F
P
 
Y
D
 
R
E
 
E
I
 
-
K
 
K
S
 
V
W
 
F
G
 
F
L
 
E
S
 
P
G
 
G
G
 
D
K
 
L
S
 
G
I
 
F
Q
 
K
T
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
I
D
 
G
C
 
F
A
 
A
K
 
K
I
 
V
G
 
G
V
 
V
L
 
M
I
 
I
C
x
A
Y
x
F
D
 
D
V
 
W
E
 
F
F
 
F
P
 
P
E
 
E
L
 
S
S
 
A
R
 
R
I
 
T
M
 
L
A
 
A
D
 
L
Q
 
K
G
 
G
M
 
A
Q
 
E
I
 
I
L
 
I
F
 
A
V
 
H
P
 
P
F
 
A
L
x
N
T
 
L
D
 
V
T
 
M
Q
 
P
N
 
Y
A
 
A
Y
 
P
S
 
R
R
 
A
V
 
M
K
 
P
V
 
I
C
 
-
A
 
-
H
 
-
A
 
-
R
 
R
A
 
A
I
 
L
E
 
E
N
 
N
E
 
R
C
 
V
F
 
Y
V
 
T
V
 
I
I
 
T
A
 
A
G
 
D
S
 
R
V
 
V
G
 
G
N
 
-
L
 
-
P
 
-
R
 
-
V
 
-
H
 
E
N
 
E
M
 
R
D
 
G
I
 
L
Q
 
K
Y
 
F
A
 
I
Q
 
G
S
 
K
G
 
S
V
 
L
F
 
-
T
 
-
P
 
-
C
 
-
D
 
-
F
 
I
A
 
A
F
 
S
P
 
P
T
 
K
D
 
A
G
 
E
K
 
V
R
 
L
A
 
S
E
 
I
A
 
A
T
 
S
P
 
E
N
 
T
T
 
E
E
 
E
M
 
E
I
 
I
L
 
G
V
 
V
S
 
V
D
 
E
V
 
I
D
 
D
L
 
L
D
 
N
L
 
L
-
 
A
-
 
R
-
 
N
-
 
K
-
 
R
L
 
L
N
 
N
E
 
D
L
 
M
H
 
N
T
 
D
Y
 
I
G
 
-
S
 
-
V
 
-
R
 
-
N
 
-
L
 
F
K
 
K
D
 
D
R
 
R
R
 
R
S
 
E
D
 
E
L
 
Y
Y
 
Y

3klcB Crystal structure of hyperthermophilic nitrilase (see paper)
24% identity, 55% coverage: 225:504/510 of query aligns to 1:259/261 of 3klcB

query
sites
3klcB
V
 
V
R
 
K
V
 
V
G
 
A
L
 
Y
V
 
V
Q
 
Q
W
 
M
Q
 
N
M
 
P
R
 
Q
T
 
I
Y
 
L
K
 
E
T
 
P
L
 
-
D
 
D
D
 
K
L
 
N
F
 
Y
E
 
S
Q
 
K
V
 
A
E
 
E
F
 
K
F
 
L
V
 
I
D
 
K
A
 
E
V
 
A
S
 
S
D
 
K
Y
 
Q
K
 
G
S
 
A
D
 
Q
F
 
L
I
 
V
L
 
V
F
 
L
P
 
P
E
|
E
Y
 
L
F
 
F
N
 
D
A
 
T
P
 
-
L
 
-
M
 
-
A
 
-
K
 
G
F
 
Y
N
 
N
N
 
F
E
 
E
G
 
T
E
 
R
S
 
E
Q
 
E
A
 
V
I
 
F
R
 
E
G
 
I
L
 
A
A
 
Q
T
 
K
Y
 
I
T
 
P
E
 
E
-
 
G
E
 
E
I
 
T
R
 
T
E
 
T
R
 
F
F
 
L
V
 
M
K
 
D
L
 
V
A
 
A
I
 
R
S
 
D
Y
 
T
N
 
G
I
 
V
N
 
Y
I
 
I
I
 
V
T
 
A
G
 
G
S
 
T
M
 
A
P
 
E
L
 
-
I
 
-
K
 
K
D
 
D
D
 
G
G
 
D
L
 
V
L
 
L
Y
 
Y
N
|
N
V
 
S
G
 
A
F
 
V
L
 
V
C
 
V
R
 
G
R
 
P
D
 
R
G
 
G
S
x
F
Y
 
I
E
 
G
M
x
K
Y
 
Y
E
 
R
K
|
K
I
 
I
H
 
H
V
 
L
T
 
F
P
 
Y
D
 
R
E
|
E
I
 
-
K
 
K
S
 
F
W
 
F
G
 
F
L
 
E
S
 
P
G
 
G
G
 
D
K
 
L
S
 
G
I
 
F
Q
 
R
T
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
L
D
 
G
C
 
F
A
 
M
K
 
K
I
 
V
G
 
G
V
 
V
L
 
M
I
 
I
C
|
C
Y
 
F
D
 
D
V
 
W
E
 
F
F
 
F
P
 
P
E
|
E
L
 
S
S
 
A
R
 
R
I
 
T
M
 
L
A
 
A
D
 
L
Q
 
K
G
 
G
M
 
A
Q
 
D
I
 
V
L
 
I
F
 
A
V
 
H
P
 
P
F
 
A
L
x
N
T
x
L
D
 
V
T
x
M
Q
 
P
N
 
Y
A
 
A
Y
 
P
S
 
R
R
 
A
V
 
M
K
 
P
V
 
I
C
 
-
A
 
-
H
 
-
A
 
-
R
 
R
A
 
A
I
 
L
E
 
E
N
 
N
E
 
K
C
 
V
F
 
Y
V
 
T
V
 
V
I
 
T
A
 
A
G
 
D
S
 
R
V
 
V
G
 
G
N
 
-
L
 
-
P
 
-
R
 
-
V
 
-
H
 
E
N
 
E
M
 
R
D
 
G
I
 
L
Q
 
K
Y
 
F
A
 
I
Q
 
G
S
 
K
G
 
S
V
 
L
F
 
-
T
 
-
P
 
-
C
 
-
D
 
-
F
 
I
A
 
A
F
 
S
P
 
P
T
 
K
D
 
A
G
 
E
K
 
V
R
 
L
A
 
S
E
 
M
A
 
A
T
 
S
P
 
E
N
 
T
T
 
E
E
 
E
M
 
E
I
 
V
L
 
G
V
 
V
S
 
A
D
 
E
V
 
I
D
 
D
L
 
L
D
 
S
L
 
L
L
 
V
N
 
R
E
 
N
L
 
K
H
 
R
T
 
I
Y
 
N
G
 
D
S
 
L
V
 
N
R
 
D
N
 
I
L
 
F
K
 
K
D
 
D
R
|
R
R
 
R
S
x
E
D
 
E
L
 
Y
Y
 
Y

Sites not aligning to the query:

3klcA Crystal structure of hyperthermophilic nitrilase (see paper)
24% identity, 55% coverage: 225:504/510 of query aligns to 1:259/261 of 3klcA

query
sites
3klcA
V
 
V
R
 
K
V
 
V
G
 
A
L
 
Y
V
 
V
Q
 
Q
W
 
M
Q
 
N
M
 
P
R
 
Q
T
 
I
Y
 
L
K
x
E
T
 
P
L
 
-
D
|
D
D
x
K
L
 
N
F
 
Y
E
 
S
Q
 
K
V
 
A
E
 
E
F
 
K
F
 
L
V
 
I
D
 
K
A
 
E
V
 
A
S
 
S
D
 
K
Y
 
Q
K
 
G
S
 
A
D
 
Q
F
 
L
I
 
V
L
 
V
F
 
L
P
 
P
E
|
E
Y
 
L
F
 
F
N
 
D
A
 
T
P
 
-
L
 
-
M
 
-
A
 
-
K
 
G
F
 
Y
N
 
N
N
 
F
E
 
E
G
 
T
E
 
R
S
 
E
Q
 
E
A
 
V
I
 
F
R
 
E
G
 
I
L
 
A
A
 
Q
T
 
K
Y
 
I
T
 
P
E
 
E
-
 
G
E
 
E
I
 
T
R
 
T
E
 
T
R
 
F
F
 
L
V
 
M
K
 
D
L
 
V
A
 
A
I
 
R
S
 
D
Y
 
T
N
 
G
I
 
V
N
 
Y
I
 
I
I
 
V
T
 
A
G
 
G
S
 
T
M
 
A
P
 
E
L
 
-
I
 
-
K
 
K
D
 
D
D
 
G
G
 
D
L
 
V
L
 
L
Y
 
Y
N
|
N
V
 
S
G
 
A
F
 
V
L
 
V
C
 
V
R
x
G
R
x
P
D
x
R
G
 
G
S
x
F
Y
x
I
E
x
G
M
x
K
Y
 
Y
E
 
R
K
|
K
I
 
I
H
 
H
V
 
L
T
 
F
P
 
Y
D
 
R
E
|
E
I
 
-
K
 
K
S
 
F
W
 
F
G
 
F
L
 
E
S
 
P
G
 
G
G
 
D
K
 
L
S
 
G
I
 
F
Q
 
R
T
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
L
D
 
G
C
 
F
A
 
M
K
 
K
I
 
V
G
 
G
V
 
V
L
 
M
I
 
I
C
|
C
Y
 
F
D
 
D
V
 
W
E
 
F
F
 
F
P
 
P
E
 
E
L
 
S
S
 
A
R
 
R
I
 
T
M
 
L
A
 
A
D
 
L
Q
 
K
G
 
G
M
 
A
Q
 
D
I
 
V
L
 
I
F
 
A
V
 
H
P
 
P
F
 
A
L
x
N
T
x
L
D
 
V
T
x
M
Q
 
P
N
 
Y
A
 
A
Y
 
P
S
 
R
R
 
A
V
 
M
K
 
P
V
 
I
C
 
-
A
 
-
H
 
-
A
 
-
R
 
R
A
 
A
I
 
L
E
 
E
N
 
N
E
 
K
C
 
V
F
 
Y
V
 
T
V
 
V
I
 
T
A
 
A
G
 
D
S
 
R
V
 
V
G
 
G
N
 
-
L
 
-
P
 
-
R
 
-
V
 
-
H
 
E
N
 
E
M
 
R
D
 
G
I
 
L
Q
 
K
Y
 
F
A
 
I
Q
 
G
S
 
K
G
 
S
V
 
L
F
 
-
T
 
-
P
 
-
C
 
-
D
 
-
F
 
I
A
 
A
F
 
S
P
 
P
T
 
K
D
 
A
G
 
E
K
 
V
R
 
L
A
 
S
E
 
M
A
 
A
T
 
S
P
 
E
N
 
T
T
 
E
E
 
E
M
 
E
I
 
V
L
 
G
V
 
V
S
 
A
D
 
E
V
 
I
D
 
D
L
 
L
D
 
S
L
 
L
L
 
V
N
 
R
E
 
N
L
 
K
H
 
R
T
 
I
Y
 
N
G
 
D
S
 
L
V
 
N
R
 
D
N
 
I
L
 
F
K
 
K
D
 
D
R
 
R
R
 
R
S
 
E
D
 
E
L
 
Y
Y
 
Y

Q9UYV8 Nitrilase; PaNit; EC 3.5.5.1 from Pyrococcus abyssi (strain GE5 / Orsay) (see paper)
24% identity, 55% coverage: 225:504/510 of query aligns to 2:260/262 of Q9UYV8

query
sites
Q9UYV8
V
 
V
R
 
K
V
 
V
G
 
A
L
 
Y
V
 
V
Q
 
Q
W
 
M
Q
 
N
M
 
P
R
 
Q
T
 
I
Y
 
L
K
 
E
T
 
P
L
 
-
D
 
D
D
 
K
L
 
N
F
 
Y
E
 
S
Q
 
K
V
 
A
E
 
E
F
 
K
F
 
L
V
 
I
D
 
K
A
 
E
V
 
A
S
 
S
D
 
K
Y
 
Q
K
 
G
S
 
A
D
 
Q
F
 
L
I
 
V
L
 
V
F
 
L
P
 
P
E
 
E
Y
 
L
F
 
F
N
 
D
A
 
T
P
 
-
L
 
-
M
 
-
A
 
-
K
 
G
F
 
Y
N
 
N
N
 
F
E
 
E
G
 
T
E
 
R
S
 
E
Q
 
E
A
 
V
I
 
F
R
 
E
G
 
I
L
 
A
A
 
Q
T
 
K
Y
 
I
T
 
P
E
 
E
-
 
G
E
 
E
I
 
T
R
 
T
E
 
T
R
 
F
F
 
L
V
 
M
K
 
D
L
 
V
A
 
A
I
 
R
S
 
D
Y
 
T
N
 
G
I
 
V
N
 
Y
I
 
I
I
 
V
T
 
A
G
 
G
S
 
T
M
 
A
P
 
E
L
 
-
I
 
-
K
 
K
D
 
D
D
 
G
G
 
D
L
 
V
L
 
L
Y
 
Y
N
 
N
V
 
S
G
 
A
F
 
V
L
 
V
C
 
V
R
 
G
R
 
P
D
 
R
G
 
G
S
 
F
Y
 
I
E
 
G
M
 
K
Y
 
Y
E
 
R
K
 
K
I
 
I
H
 
H
V
 
L
T
 
F
P
 
Y
D
 
R
E
 
E
I
 
-
K
 
K
S
 
F
W
 
F
G
 
F
L
 
E
S
 
P
G
 
G
G
 
D
K
 
L
S
 
G
I
 
F
Q
 
R
T
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
L
D
 
G
C
 
F
A
 
M
K
 
K
I
 
V
G
 
G
V
 
V
L
 
M
I
 
I
C
|
C
Y
 
F
D
 
D
V
 
W
E
 
F
F
 
F
P
 
P
E
 
E
L
 
S
S
 
A
R
 
R
I
 
T
M
 
L
A
 
A
D
 
L
Q
 
K
G
 
G
M
 
A
Q
 
D
I
 
V
L
 
I
F
 
A
V
 
H
P
 
P
F
 
A
L
 
N
T
 
L
D
 
V
T
 
M
Q
 
P
N
 
Y
A
 
A
Y
 
P
S
 
R
R
 
A
V
 
M
K
 
P
V
 
I
C
 
-
A
 
-
H
 
-
A
 
-
R
 
R
A
 
A
I
 
L
E
 
E
N
 
N
E
 
K
C
 
V
F
 
Y
V
 
T
V
 
V
I
 
T
A
 
A
G
 
D
S
 
R
V
 
V
G
 
G
N
 
-
L
 
-
P
 
-
R
 
-
V
 
-
H
 
E
N
 
E
M
 
R
D
 
G
I
 
L
Q
 
K
Y
 
F
A
 
I
Q
 
G
S
 
K
G
 
S
V
 
L
F
 
-
T
 
-
P
 
-
C
 
-
D
 
-
F
 
I
A
 
A
F
 
S
P
 
P
T
 
K
D
 
A
G
 
E
K
 
V
R
 
L
A
 
S
E
 
M
A
 
A
T
 
S
P
 
E
N
 
T
T
 
E
E
 
E
M
 
E
I
 
V
L
 
G
V
 
V
S
 
A
D
 
E
V
 
I
D
 
D
L
 
L
D
 
Y
L
 
L
L
 
V
N
 
R
E
 
N
L
 
K
H
 
R
T
 
I
Y
 
N
G
 
D
S
 
L
V
 
N
R
 
D
N
 
I
L
 
F
K
 
K
D
 
D
R
 
R
R
 
R
S
 
E
D
 
E
L
 
Y
Y
 
Y

P46011 Bifunctional nitrilase/nitrile hydratase NIT4; Cyanoalanine nitrilase; Nitrilase 4; EC 3.5.5.1; EC 3.5.5.4; EC 4.2.1.65 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
26% identity, 41% coverage: 222:429/510 of query aligns to 33:246/355 of P46011

query
sites
P46011
K
 
S
T
 
S
T
 
I
V
 
V
R
 
R
V
 
A
G
 
T
L
 
V
V
 
V
Q
 
Q
W
 
A
Q
 
S
M
 
T
R
 
V
T
 
F
Y
 
Y
K
 
D
T
 
T
L
 
P
D
 
A
D
 
T
L
 
L
F
 
-
E
 
D
Q
 
K
V
 
A
E
 
E
F
 
R
F
 
L
V
 
L
D
 
S
A
 
E
V
 
A
S
 
A
D
 
E
Y
 
N
K
 
G
S
 
S
D
 
Q
F
 
L
I
 
V
L
 
V
F
 
F
P
 
P
E
 
E
Y
 
A
F
 
F
-
 
I
-
 
G
N
 
G
A
 
Y
P
 
P
L
 
R
M
 
G
A
 
S
K
 
T
F
 
F
N
 
E
N
 
L
E
 
A
G
 
I
E
 
G
S
 
S
Q
 
R
A
 
T
I
 
A
R
 
K
G
 
G
L
 
R
A
 
D
T
 
D
Y
 
F
T
 
R
E
 
K
-
 
Y
-
 
H
-
 
A
-
 
S
-
 
A
-
 
I
-
 
D
-
 
V
-
 
P
-
 
G
-
 
P
E
 
E
I
 
V
R
 
-
E
 
E
R
 
R
F
 
L
V
 
A
K
 
L
L
 
M
A
 
A
I
 
K
S
 
K
Y
 
Y
N
 
K
I
 
V
N
 
Y
I
 
L
I
 
V
T
 
M
G
 
G
S
 
-
M
 
-
P
 
-
L
 
V
I
 
I
K
 
E
D
 
R
D
 
E
G
 
G
-
 
Y
-
 
T
L
 
L
L
 
Y
Y
 
C
N
 
T
V
 
V
G
 
L
F
 
F
L
 
F
C
 
D
R
 
S
R
 
Q
D
 
G
G
 
L
S
 
F
Y
 
L
E
 
G
M
 
K
Y
 
H
E
 
R
K
 
K
I
 
L
H
 
M
V
 
P
T
 
T
P
 
A
D
 
L
E
 
E
I
 
R
K
 
C
S
 
I
W
 
W
G
 
G
L
 
F
S
 
G
G
 
D
G
 
G
K
 
S
S
 
T
I
 
I
Q
 
P
T
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
T
D
 
P
C
 
I
A
 
G
K
 
K
I
 
I
G
 
G
V
 
A
L
 
A
I
 
I
C
|
C
Y
 
W
D
 
E
V
 
N
E
 
R
F
 
M
P
 
P
E
 
S
L
 
L
S
 
R
R
 
T
I
 
A
M
 
M
A
 
Y
D
 
A
Q
 
K
G
 
G
M
 
I
Q
 
E
I
 
I
L
 
Y
F
 
C
V
 
A
P
 
P
F
 
-
L
 
T
T
 
A
D
 
D
T
 
S
Q
 
R
N
 
E
A
 
T
Y
 
W
S
 
-
R
 
-
V
 
L
K
 
A
V
 
S
C
 
M
A
 
T
H
 
H
A
 
I
R
 
-
A
 
A
I
 
L
E
 
E
N
 
G
E
 
G
C
 
C
F
 
F
V
 
V
V
 
L
I
 
S
A
 
A

2refA Crystal structure of the loading gnatl domain of cura from lyngbya majuscula soaked with malonyl-coa (see paper)
23% identity, 39% coverage: 7:207/510 of query aligns to 5:199/203 of 2refA

query
sites
2refA
N
 
N
K
 
Y
V
 
Y
Q
 
N
I
 
L
R
 
R
N
 
H
L
 
P
Q
 
K
I
 
I
E
 
E
D
 
D
Y
 
L
D
 
R
Q
 
D
L
 
L
A
 
I
Q
 
A
S
 
L
F
 
E
T
 
T
R
 
L
V
 
C
Y
 
W
S
 
S
D
 
E
G
 
N
S
 
L
D
 
Q
V
 
V
F
 
-
W
 
-
T
 
D
H
 
N
K
 
E
Q
 
E
I
 
I
E
 
Y
K
 
R
L
 
R
I
 
I
R
 
F
I
 
K
F
 
I
P
 
P
E
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
I
 
F
V
 
I
T
 
L
V
 
E
V
 
L
D
 
E
E
 
D
Q
 
K
I
 
I
V
 
V
G
 
G
C
 
A
A
 
I
L
 
Y
S
 
S
I
 
Q
I
 
R
V
 
I
N
 
D
Y
 
N
D
 
P
D
 
Q
V
 
L
K
 
L
N
 
D
D
 
N
H
 
K
T
 
T
Y
 
C
A
 
T
Q
 
Q
V
 
V
T
 
P
G
 
L
K
 
-
E
 
-
T
 
-
F
 
-
N
 
-
T
 
L
H
 
H
N
 
T
P
 
E
K
 
S
G
 
G
N
 
V
I
 
V
L
 
V
Y
 
Q
G
x
L
I
x
L
E
x
A
V
|
V
F
 
N
I
 
I
H
 
L
P
 
P
K
 
E
Y
 
L
R
x
Q
G
x
N
L
x
Q
R
x
G
L
 
L
A
x
G
R
x
D
R
 
R
M
 
L
Y
 
L
E
 
E
Y
 
F
R
 
M
K
 
L
E
 
Q
L
 
Y
C
 
C
E
 
A
T
 
Q
L
 
I
N
 
S
-
 
G
L
 
V
K
 
E
A
 
K
I
 
V
M
 
V
F
 
A
G
 
V
G
x
T
R
 
L
I
 
C
P
 
R
N
 
N
Y
 
Y
Y
 
P
K
 
D
Y
 
Y
A
 
S
D
 
P
Q
 
-
I
 
M
R
 
P
P
 
M
K
 
A
E
 
E
Y
 
Y
I
 
I
D
 
H
K
 
Q
V
 
K
K
 
N
Q
 
E
K
 
S
E
 
G
I
 
L
F
 
L
-
 
V
D
 
D
P
 
P
V
x
L
L
 
L
T
x
R
F
|
F
Q
x
H
L
 
Q
S
 
I
N
 
H
D
 
G
F
 
A
H
 
K
V
 
I
R
 
E
K
 
K
V
 
L
M
 
L
R
 
P
N
 
G
Y
 
Y
L
 
R
P
 
P
N
 
K
D
 
D
E
 
W
E
 
E
S
 
N
K
 
Q
H
 
T
Y
 
C
A
 
G
C
 
V
L
 
L
L
 
V
Q
 
S
W
 
Y
D
 
D

4izuA The e41q mutant of the amidase from nesterenkonia sp. An1 showing the result of michael addition of acrylamide at the active site cysteine
30% identity, 18% coverage: 340:433/510 of query aligns to 110:202/254 of 4izuA

query
sites
4izuA
Y
 
Y
E
 
Q
K
|
K
I
 
V
H
 
Q
V
 
L
T
x
Y
P
 
G
D
 
P
E
 
E
I
 
E
K
 
K
S
 
A
W
 
A
G
 
F
L
 
V
S
 
P
G
 
G
G
 
E
K
 
Q
S
 
P
I
 
P
Q
 
P
T
 
V
F
 
L
D
 
S
T
 
W
D
 
G
C
 
G
A
 
R
K
 
Q
I
 
L
G
 
S
V
 
L
L
 
L
I
 
V
C
|
C
Y
|
Y
D
 
D
V
 
V
E
 
E
F
 
F
P
 
P
E
 
E
L
 
M
S
 
V
R
 
R
I
 
A
M
 
A
A
 
A
D
 
A
Q
 
R
G
 
G
M
 
A
Q
 
Q
I
 
L
L
 
V
F
 
L
V
 
V
P
 
P
F
 
T
L
 
A
T
 
L
D
 
-
T
 
A
Q
 
G
N
 
D
A
 
E
Y
 
T
S
 
S
R
 
V
V
 
P
K
 
G
V
 
I
C
 
L
A
 
L
H
 
P
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
V
E
 
E
N
 
N
E
 
G
C
 
I
F
 
T
V
 
L
V
 
A
I
 
Y
A
 
A
G
 
N
S
 
H
V
 
C
G
 
G

Sites not aligning to the query:

4iztA The e41q mutant of the amidase from nesterenkonia sp. An1 showing covalent addition of the acetamide moiety of fluoroacetamide at the active site cysteine
30% identity, 18% coverage: 340:433/510 of query aligns to 118:210/263 of 4iztA

query
sites
4iztA
Y
 
Y
E
 
Q
K
 
K
I
 
V
H
 
Q
V
 
L
T
x
Y
P
 
G
D
 
P
E
 
E
I
 
E
K
 
K
S
 
A
W
 
A
G
 
F
L
 
V
S
 
P
G
 
G
G
 
E
K
 
Q
S
 
P
I
 
P
Q
 
P
T
 
V
F
 
L
D
 
S
T
 
W
D
 
G
C
 
G
A
 
R
K
 
Q
I
 
L
G
 
S
V
 
L
L
 
L
I
 
V
C
 
C
Y
 
Y
D
 
D
V
 
V
E
|
E
F
 
F
P
 
P
E
 
E
L
 
M
S
 
V
R
 
R
I
 
A
M
 
A
A
 
A
D
 
A
Q
 
R
G
 
G
M
 
A
Q
 
Q
I
 
L
L
 
V
F
 
L
V
 
V
P
 
P
F
 
T
L
x
A
T
x
L
D
 
-
T
 
A
Q
 
G
N
 
D
A
 
E
Y
 
T
S
 
S
R
 
V
V
 
P
K
 
G
V
 
I
C
 
L
A
 
L
H
 
P
A
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
V
E
 
E
N
 
N
E
 
G
C
 
I
F
 
T
V
 
L
V
 
A
I
 
Y
A
 
A
G
 
N
S
 
H
V
 
C
G
 
G