SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_009141774.1 NCBI__GCF_000225705.1:WP_009141774.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1gldG Cation promoted association (cpa) of a regulatory and target protein is controlled by phosphorylation (see paper)
56% identity, 95% coverage: 21:509/514 of query aligns to 1:483/489 of 1gldG

query
sites
1gldG
S
 
K
Y
 
Y
I
 
I
M
 
V
A
 
A
L
 
L
D
|
D
S
 
Q
G
 
G
T
|
T
T
 
T
S
 
S
V
 
S
R
|
R
A
 
A
I
 
V
I
 
V
V
 
M
D
 
D
E
 
H
Y
 
D
D
 
A
C
 
N
I
 
I
V
 
I
A
 
S
Q
 
V
A
 
S
S
 
Q
R
 
R
A
 
E
I
 
F
S
 
E
T
 
Q
T
 
I
Y
 
Y
P
 
P
Q
 
K
P
 
P
G
 
G
W
 
W
V
 
V
E
 
E
Q
 
H
D
 
D
P
 
P
M
 
M
E
 
E
I
 
I
L
 
W
A
 
A
S
 
T
Q
 
Q
I
 
S
A
 
S
V
 
T
M
 
L
M
 
V
E
 
E
V
 
V
Q
 
L
F
 
A
K
 
K
S
 
A
G
 
D
I
 
I
H
 
S
S
 
S
D
 
D
S
 
Q
I
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
I
G
 
G
I
 
I
T
 
T
N
 
N
Q
 
Q
R
|
R
E
|
E
T
 
T
T
 
T
V
 
I
V
 
V
W
 
W
D
 
E
R
 
K
D
 
E
S
 
T
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
I
 
I
Y
 
Y
N
 
N
A
 
A
I
 
I
G
 
V
W
 
W
Q
 
Q
C
 
C
R
 
R
R
 
R
T
 
T
A
 
A
P
 
E
I
 
I
A
 
C
D
 
E
A
 
H
L
 
L
V
 
K
H
 
R
E
 
D
G
 
G
M
 
L
D
 
E
Q
 
D
T
 
Y
I
 
I
R
 
R
E
 
S
K
 
N
T
 
T
G
 
G
L
 
L
K
 
V
P
 
I
D
 
D
A
 
P
Y
|
Y
F
 
F
S
 
S
G
 
G
T
 
T
K
 
K
V
 
V
K
 
K
W
 
W
I
 
I
L
 
L
D
 
D
N
 
H
V
 
V
S
 
E
G
 
G
A
 
S
R
 
R
E
 
E
A
 
R
A
 
A
A
 
R
A
 
R
G
 
G
Q
 
E
L
 
L
M
 
L
F
 
F
G
 
G
T
 
T
I
 
V
D
 
D
T
 
T
W
 
W
L
 
L
I
 
I
Y
 
W
N
 
K
L
 
M
T
 
T
G
 
Q
G
 
G
M
 
R
V
 
V
Y
 
H
A
 
V
T
 
T
D
 
D
Y
 
Y
T
 
T
N
 
N
A
 
A
S
 
S
R
 
R
T
 
T
M
 
M
L
 
L
F
 
F
N
 
N
I
 
I
H
 
H
T
 
T
L
 
L
E
 
D
W
 
W
D
 
D
D
 
D
E
 
K
L
 
M
L
 
L
E
 
E
A
 
V
L
 
L
D
 
D
I
 
I
P
 
P
R
 
R
S
 
E
M
 
M
L
 
L
P
 
P
E
 
E
V
 
V
R
 
R
W
 
R
S
 
S
S
 
S
G
 
E
D
 
V
F
 
Y
G
 
G
R
 
Q
V
 
-
S
 
-
S
 
-
E
 
-
I
 
-
M
 
-
T
 
T
H
 
N
T
 
I
P
 
I
P
 
P
I
 
I
T
 
S
G
 
G
V
 
I
A
 
A
G
 
G
D
|
D
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
S
 
A
F
 
L
F
 
F
G
 
G
H
 
Q
C
 
L
C
 
C
F
 
V
E
 
K
P
 
E
G
 
G
Q
 
M
T
 
A
K
 
K
N
 
N
T
 
T
Y
 
Y
G
|
G
T
|
T
G
 
G
C
 
C
F
|
F
M
 
M
L
 
L
M
 
M
N
 
N
T
 
T
G
 
G
D
 
E
E
 
K
V
 
A
V
 
V
H
 
K
S
 
S
K
 
E
N
 
N
G
 
G
L
 
L
L
 
L
S
 
T
T
 
T
I
 
I
G
 
A
I
 
C
A
 
G
E
 
P
N
 
T
G
 
G
K
 
E
I
 
V
S
 
N
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
G
S
 
A
I
 
V
F
 
F
H
 
M
A
 
A
G
|
G
S
 
A
T
 
S
I
 
I
Q
 
Q
W
 
W
L
 
L
R
 
R
D
 
D
K
 
E
L
 
M
G
 
K
I
 
L
I
 
I
A
 
N
D
 
D
A
|
A
G
 
Y
E
 
D
T
 
S
A
 
E
A
 
Y
I
 
F
A
 
A
R
 
T
S
 
K
L
 
V
S
 
Q
S
 
N
N
 
T
N
 
N
G
 
G
C
 
V
Y
 
Y
L
 
V
V
 
V
P
 
P
A
 
A
F
 
F
S
 
T
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
P
 
P
W
 
Y
W
 
W
D
 
D
P
 
P
D
 
Y
S
 
A
R
 
R
G
 
G
L
 
A
I
 
I
C
 
F
G
 
G
L
 
L
T
 
T
A
 
R
G
 
G
S
 
V
D
 
N
R
 
A
A
 
N
T
 
H
L
 
I
V
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
T
C
 
L
E
 
E
S
 
S
M
 
I
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
Q
T
 
T
Y
 
R
D
 
D
V
 
V
L
 
L
R
 
E
S
 
A
M
 
M
E
 
Q
A
 
A
D
 
D
A
 
S
G
 
G
R
 
I
K
 
R
L
 
L
S
 
H
G
 
A
L
 
L
S
 
R
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
x
G
A
|
A
S
 
V
R
 
A
N
|
N
E
 
N
F
 
F
I
 
L
M
 
M
Q
 
Q
F
 
F
Q
 
Q
A
 
S
D
 
D
L
 
I
L
 
L
G
 
G
I
 
T
P
 
R
I
 
V
T
 
E
Q
 
R
S
 
P
E
 
E
S
 
V
I
 
R
E
 
E
T
 
V
T
 
T
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
V
G
 
G
Y
 
F
W
 
W
E
 
Q
D
 
N
R
 
L
D
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
Q
Q
 
E
N
 
K
R
 
A
N
 
V
L
 
I
G
 
E
K
 
R
C
 
E
F
 
F
E
 
R
P
 
P
A
 
G
G
 
I
N
 
E
P
 
T
V
 
T
E
 
E
L
 
R
A
 
N
R
 
Y
V
 
R
L
 
Y
S
 
A
G
 
G
W
 
W
H
 
K
D
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
K
R
 
R
S
 
A

1glcG Cation promoted association (cpa) of a regulatory and target protein is controlled by phosphorylation (see paper)
56% identity, 95% coverage: 21:509/514 of query aligns to 1:483/489 of 1glcG

query
sites
1glcG
S
 
K
Y
 
Y
I
 
I
M
 
V
A
 
A
L
 
L
D
 
D
S
 
Q
G
 
G
T
|
T
T
 
T
S
 
S
V
 
S
R
 
R
A
 
A
I
 
V
I
 
V
V
 
M
D
 
D
E
 
H
Y
 
D
D
 
A
C
 
N
I
 
I
V
 
I
A
 
S
Q
 
V
A
 
S
S
 
Q
R
 
R
A
 
E
I
 
F
S
 
E
T
 
Q
T
 
I
Y
 
Y
P
 
P
Q
 
K
P
 
P
G
 
G
W
 
W
V
 
V
E
 
E
Q
 
H
D
 
D
P
 
P
M
 
M
E
 
E
I
 
I
L
 
W
A
 
A
S
 
T
Q
 
Q
I
 
S
A
 
S
V
 
T
M
 
L
M
 
V
E
 
E
V
 
V
Q
 
L
F
 
A
K
 
K
S
 
A
G
 
D
I
 
I
H
 
S
S
 
S
D
 
D
S
 
Q
I
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
I
G
 
G
I
 
I
T
 
T
N
 
N
Q
 
Q
R
|
R
E
|
E
T
 
T
T
 
T
V
 
I
V
 
V
W
 
W
D
 
E
R
 
K
D
 
E
S
 
T
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
I
 
I
Y
 
Y
N
 
N
A
 
A
I
 
I
G
 
V
W
|
W
Q
 
Q
C
 
C
R
 
R
R
 
R
T
 
T
A
 
A
P
 
E
I
 
I
A
 
C
D
 
E
A
 
H
L
 
L
V
 
K
H
 
R
E
 
D
G
 
G
M
 
L
D
 
E
Q
 
D
T
 
Y
I
 
I
R
 
R
E
 
S
K
 
N
T
 
T
G
 
G
L
 
L
K
 
V
P
 
I
D
 
D
A
 
P
Y
|
Y
F
 
F
S
 
S
G
 
G
T
 
T
K
 
K
V
 
V
K
 
K
W
 
W
I
 
I
L
 
L
D
 
D
N
 
H
V
 
V
S
 
E
G
 
G
A
 
S
R
 
R
E
 
E
A
 
R
A
 
A
A
 
R
A
 
R
G
 
G
Q
 
E
L
 
L
M
 
L
F
 
F
G
 
G
T
 
T
I
 
V
D
 
D
T
 
T
W
 
W
L
 
L
I
 
I
Y
 
W
N
 
K
L
 
M
T
 
T
G
 
Q
G
 
G
M
 
R
V
 
V
Y
 
H
A
 
V
T
 
T
D
 
D
Y
 
Y
T
 
T
N
 
N
A
 
A
S
 
S
R
 
R
T
 
T
M
 
M
L
 
L
F
 
F
N
 
N
I
 
I
H
 
H
T
 
T
L
 
L
E
 
D
W
 
W
D
 
D
D
 
D
E
 
K
L
 
M
L
 
L
E
 
E
A
 
V
L
 
L
D
 
D
I
 
I
P
 
P
R
 
R
S
 
E
M
 
M
L
 
L
P
 
P
E
 
E
V
 
V
R
 
R
W
 
R
S
 
S
S
 
S
G
 
E
D
 
V
F
 
Y
G
 
G
R
 
Q
V
 
-
S
 
-
S
 
-
E
 
-
I
 
-
M
 
-
T
 
T
H
 
N
T
 
I
P
 
I
P
 
P
I
 
I
T
 
S
G
 
G
V
 
I
A
 
A
G
 
G
D
|
D
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
S
 
A
F
 
L
F
 
F
G
 
G
H
 
Q
C
 
L
C
 
C
F
 
V
E
 
K
P
 
E
G
 
G
Q
 
M
T
 
A
K
 
K
N
 
N
T
 
T
Y
 
Y
G
|
G
T
|
T
G
 
G
C
 
C
F
|
F
M
 
M
L
 
L
M
 
M
N
 
N
T
 
T
G
 
G
D
 
E
E
 
K
V
 
A
V
 
V
H
 
K
S
 
S
K
 
E
N
 
N
G
 
G
L
 
L
L
 
L
S
 
T
T
 
T
I
 
I
G
 
A
I
 
C
A
 
G
E
 
P
N
 
T
G
 
G
K
 
E
I
 
V
S
 
N
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
G
S
 
A
I
 
V
F
 
F
H
 
M
A
 
A
G
|
G
S
 
A
T
 
S
I
 
I
Q
 
Q
W
 
W
L
 
L
R
 
R
D
 
D
K
 
E
L
 
M
G
 
K
I
 
L
I
 
I
A
 
N
D
 
D
A
|
A
G
 
Y
E
 
D
T
 
S
A
 
E
A
 
Y
I
 
F
A
 
A
R
 
T
S
 
K
L
 
V
S
 
Q
S
 
N
N
 
T
N
 
N
G
 
G
C
 
V
Y
 
Y
L
 
V
V
 
V
P
 
P
A
 
A
F
 
F
S
 
T
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
P
 
P
W
 
Y
W
 
W
D
 
D
P
 
P
D
 
Y
S
 
A
R
 
R
G
 
G
L
 
A
I
 
I
C
 
F
G
 
G
L
 
L
T
 
T
A
 
R
G
 
G
S
 
V
D
 
N
R
 
A
A
 
N
T
 
H
L
 
I
V
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
T
C
 
L
E
 
E
S
 
S
M
 
I
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
Q
T
 
T
Y
 
R
D
 
D
V
 
V
L
 
L
R
 
E
S
 
A
M
 
M
E
 
Q
A
 
A
D
 
D
A
 
S
G
 
G
R
 
I
K
 
R
L
 
L
S
 
H
G
 
A
L
 
L
S
 
R
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
x
G
A
|
A
S
 
V
R
 
A
N
|
N
E
 
N
F
 
F
I
 
L
M
 
M
Q
 
Q
F
 
F
Q
 
Q
A
 
S
D
 
D
L
 
I
L
 
L
G
 
G
I
 
T
P
 
R
I
 
V
T
 
E
Q
 
R
S
 
P
E
 
E
S
 
V
I
 
R
E
 
E
T
 
V
T
 
T
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
V
G
 
G
Y
 
F
W
 
W
E
 
Q
D
 
N
R
 
L
D
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
Q
Q
 
E
N
 
K
R
 
A
N
 
V
L
 
I
G
 
E
K
 
R
C
 
E
F
 
F
E
 
R
P
 
P
A
 
G
G
 
I
N
 
E
P
 
T
V
 
T
E
 
E
L
 
R
A
 
N
R
 
Y
V
 
R
L
 
Y
S
 
A
G
 
G
W
 
W
H
 
K
D
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
K
R
 
R
S
 
A

1glbG Structure of the regulatory complex of escherichia coli iiiglc with glycerol kinase (see paper)
56% identity, 95% coverage: 21:509/514 of query aligns to 1:483/489 of 1glbG

query
sites
1glbG
S
 
K
Y
 
Y
I
 
I
M
 
V
A
 
A
L
 
L
D
 
D
S
 
Q
G
 
G
T
 
T
T
 
T
S
 
S
V
 
S
R
|
R
A
 
A
I
 
V
I
 
V
V
 
M
D
 
D
E
 
H
Y
 
D
D
 
A
C
 
N
I
 
I
V
 
I
A
 
S
Q
 
V
A
 
S
S
 
Q
R
 
R
A
 
E
I
 
F
S
 
E
T
 
Q
T
 
I
Y
 
Y
P
 
P
Q
 
K
P
 
P
G
 
G
W
 
W
V
 
V
E
 
E
Q
 
H
D
 
D
P
 
P
M
 
M
E
 
E
I
 
I
L
 
W
A
 
A
S
 
T
Q
 
Q
I
 
S
A
 
S
V
 
T
M
 
L
M
 
V
E
 
E
V
 
V
Q
 
L
F
 
A
K
 
K
S
 
A
G
 
D
I
 
I
H
 
S
S
 
S
D
 
D
S
 
Q
I
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
I
G
 
G
I
 
I
T
 
T
N
 
N
Q
 
Q
R
|
R
E
|
E
T
 
T
T
 
T
V
 
I
V
 
V
W
 
W
D
 
E
R
 
K
D
 
E
S
 
T
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
I
 
I
Y
 
Y
N
 
N
A
 
A
I
 
I
G
 
V
W
|
W
Q
 
Q
C
 
C
R
 
R
R
 
R
T
 
T
A
 
A
P
 
E
I
 
I
A
 
C
D
 
E
A
 
H
L
 
L
V
 
K
H
 
R
E
 
D
G
 
G
M
 
L
D
 
E
Q
 
D
T
 
Y
I
 
I
R
 
R
E
 
S
K
 
N
T
 
T
G
 
G
L
 
L
K
 
V
P
 
I
D
 
D
A
 
P
Y
|
Y
F
 
F
S
 
S
G
 
G
T
 
T
K
 
K
V
 
V
K
 
K
W
 
W
I
 
I
L
 
L
D
 
D
N
 
H
V
 
V
S
 
E
G
 
G
A
 
S
R
 
R
E
 
E
A
 
R
A
 
A
A
 
R
A
 
R
G
 
G
Q
 
E
L
 
L
M
 
L
F
 
F
G
 
G
T
 
T
I
 
V
D
 
D
T
 
T
W
 
W
L
 
L
I
 
I
Y
 
W
N
 
K
L
 
M
T
 
T
G
 
Q
G
 
G
M
 
R
V
 
V
Y
 
H
A
 
V
T
 
T
D
 
D
Y
 
Y
T
 
T
N
 
N
A
 
A
S
 
S
R
 
R
T
 
T
M
 
M
L
 
L
F
 
F
N
 
N
I
 
I
H
 
H
T
 
T
L
 
L
E
 
D
W
 
W
D
 
D
D
 
D
E
 
K
L
 
M
L
 
L
E
 
E
A
 
V
L
 
L
D
 
D
I
 
I
P
 
P
R
 
R
S
 
E
M
 
M
L
 
L
P
 
P
E
 
E
V
 
V
R
 
R
W
 
R
S
 
S
S
 
S
G
 
E
D
 
V
F
 
Y
G
 
G
R
 
Q
V
 
-
S
 
-
S
 
-
E
 
-
I
 
-
M
 
-
T
 
T
H
 
N
T
 
I
P
 
I
P
 
P
I
 
I
T
 
S
G
 
G
V
 
I
A
 
A
G
 
G
D
|
D
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
S
 
A
F
 
L
F
 
F
G
 
G
H
 
Q
C
 
L
C
 
C
F
 
V
E
 
K
P
 
E
G
 
G
Q
 
M
T
 
A
K
 
K
N
 
N
T
 
T
Y
 
Y
G
|
G
T
|
T
G
 
G
C
 
C
F
|
F
M
 
M
L
 
L
M
 
M
N
 
N
T
 
T
G
 
G
D
 
E
E
 
K
V
 
A
V
 
V
H
 
K
S
 
S
K
 
E
N
 
N
G
 
G
L
 
L
L
 
L
S
 
T
T
 
T
I
 
I
G
 
A
I
 
C
A
 
G
E
 
P
N
 
T
G
 
G
K
 
E
I
 
V
S
 
N
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
G
S
 
A
I
 
V
F
 
F
H
 
M
A
 
A
G
|
G
S
 
A
T
 
S
I
|
I
Q
 
Q
W
 
W
L
 
L
R
 
R
D
 
D
K
 
E
L
 
M
G
 
K
I
 
L
I
 
I
A
 
N
D
 
D
A
|
A
G
 
Y
E
 
D
T
 
S
A
 
E
A
 
Y
I
 
F
A
 
A
R
 
T
S
 
K
L
 
V
S
 
Q
S
 
N
N
 
T
N
 
N
G
 
G
C
 
V
Y
 
Y
L
 
V
V
 
V
P
 
P
A
 
A
F
 
F
S
 
T
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
P
 
P
W
 
Y
W
 
W
D
 
D
P
 
P
D
 
Y
S
 
A
R
 
R
G
 
G
L
 
A
I
 
I
C
 
F
G
 
G
L
 
L
T
 
T
A
 
R
G
 
G
S
 
V
D
 
N
R
 
A
A
 
N
T
 
H
L
 
I
V
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
T
C
 
L
E
 
E
S
 
S
M
 
I
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
Q
T
 
T
Y
 
R
D
 
D
V
 
V
L
 
L
R
 
E
S
 
A
M
 
M
E
 
Q
A
 
A
D
 
D
A
 
S
G
 
G
R
 
I
K
 
R
L
 
L
S
 
H
G
 
A
L
 
L
S
 
R
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
x
G
A
|
A
S
 
V
R
 
A
N
|
N
E
 
N
F
 
F
I
 
L
M
 
M
Q
 
Q
F
 
F
Q
 
Q
A
 
S
D
 
D
L
 
I
L
 
L
G
 
G
I
 
T
P
 
R
I
 
V
T
 
E
Q
 
R
S
 
P
E
 
E
S
 
V
I
 
R
E
 
E
T
 
V
T
 
T
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
V
G
 
G
Y
 
F
W
 
W
E
 
Q
D
 
N
R
 
L
D
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
Q
Q
 
E
N
 
K
R
 
A
N
 
V
L
 
I
G
 
E
K
 
R
C
 
E
F
 
F
E
 
R
P
 
P
A
 
G
G
 
I
N
 
E
P
 
T
V
 
T
E
 
E
L
 
R
A
 
N
R
 
Y
V
 
R
L
 
Y
S
 
A
G
 
G
W
 
W
H
 
K
D
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
K
R
 
R
S
 
A

1gllO Escherichia coli glycerol kinase mutant with bound atp analog showing substantial domain motion (see paper)
56% identity, 95% coverage: 21:509/514 of query aligns to 3:488/494 of 1gllO

query
sites
1gllO
S
 
K
Y
 
Y
I
 
I
M
 
V
A
 
A
L
 
L
D
 
D
S
 
Q
G
 
G
T
|
T
T
|
T
S
 
S
V
 
S
R
 
R
A
 
A
I
 
V
I
 
V
V
 
M
D
 
D
E
 
H
Y
 
D
D
 
A
C
 
N
I
 
I
V
 
I
A
 
S
Q
 
V
A
 
S
S
 
Q
R
 
R
A
 
E
I
 
F
S
 
E
T
 
Q
T
 
I
Y
 
Y
P
 
P
Q
 
K
P
 
P
G
 
G
W
 
W
V
 
V
E
 
E
Q
 
H
D
 
D
P
 
P
M
 
M
E
 
E
I
 
I
L
 
W
A
 
A
S
 
T
Q
 
Q
I
 
S
A
 
W
V
 
T
M
 
L
M
 
V
E
 
E
V
 
V
Q
 
L
F
 
A
K
 
K
S
 
A
G
 
D
I
 
I
H
 
S
S
 
S
D
 
D
S
 
Q
I
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
I
G
 
G
I
 
I
T
 
T
N
 
N
Q
 
Q
R
|
R
E
|
E
T
 
T
T
 
T
V
 
I
V
 
V
W
 
W
D
 
E
R
 
K
D
 
E
S
 
T
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
I
 
I
Y
 
Y
N
 
N
A
 
A
I
 
I
G
 
V
W
 
W
Q
 
Q
C
 
C
R
 
R
R
 
R
T
 
T
A
 
A
P
 
E
I
 
I
A
 
C
D
 
E
A
 
H
L
 
L
V
 
K
H
 
R
E
 
D
G
 
G
M
 
L
D
 
E
Q
 
D
T
 
Y
I
 
I
R
 
R
E
 
S
K
 
N
T
 
T
G
 
G
L
 
L
K
 
V
P
 
I
D
 
D
A
 
P
Y
|
Y
F
 
F
S
 
S
G
 
G
T
 
T
K
 
K
V
 
V
K
 
K
W
 
W
I
 
I
L
 
L
D
 
D
N
 
H
V
 
V
S
 
E
G
 
G
A
 
S
R
 
R
E
 
E
A
 
R
A
 
A
A
 
R
A
 
R
G
 
G
Q
 
E
L
 
L
M
 
L
F
 
F
G
 
G
T
 
T
I
 
V
D
 
D
T
 
T
W
 
W
L
 
L
I
 
I
Y
 
W
N
 
K
L
 
M
T
 
T
G
 
Q
G
 
G
M
 
R
V
 
V
Y
 
H
A
 
V
T
 
T
D
 
D
Y
 
Y
T
 
T
N
 
N
A
 
A
S
 
S
R
 
R
T
 
T
M
 
M
L
 
L
F
 
F
N
 
N
I
 
I
H
 
H
T
 
T
L
 
L
E
 
D
W
 
W
D
 
D
D
 
D
E
 
K
L
 
M
L
 
L
E
 
E
A
 
V
L
 
L
D
 
D
I
 
I
P
 
P
R
 
R
S
 
E
M
 
M
L
 
L
P
 
P
E
 
E
V
 
V
R
 
R
W
 
R
S
 
S
S
 
S
G
 
E
D
 
V
F
 
Y
G
 
G
R
 
Q
V
 
-
S
 
-
S
 
T
E
 
N
I
 
I
M
 
G
T
 
T
H
 
R
T
 
I
P
 
-
P
 
P
I
 
I
T
 
S
G
 
G
V
 
I
A
 
A
G
 
G
D
|
D
Q
|
Q
Q
 
Q
A
 
A
S
 
A
F
 
L
F
 
F
G
 
G
H
 
Q
C
 
L
C
 
C
F
 
V
E
 
K
P
 
E
G
 
G
Q
 
M
T
 
A
K
 
K
N
 
N
T
 
T
Y
 
Y
G
|
G
T
|
T
G
 
G
C
 
C
F
|
F
M
 
M
L
 
L
M
 
M
N
 
N
T
 
T
G
 
G
D
 
E
E
 
K
V
 
A
V
 
V
H
 
K
S
 
S
K
 
E
N
 
N
G
 
G
L
 
L
L
 
L
S
 
T
T
 
T
I
 
I
G
 
A
I
 
C
A
 
G
E
 
P
N
 
T
G
 
G
K
 
E
I
 
V
S
 
N
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
G
S
 
A
I
 
V
F
 
F
H
 
M
A
 
A
G
|
G
S
 
A
T
 
S
I
|
I
Q
|
Q
W
 
W
L
 
L
R
 
R
D
 
D
K
 
E
L
 
M
G
 
K
I
 
L
I
 
I
A
 
N
D
 
D
A
|
A
G
 
Y
E
 
D
T
 
S
A
 
E
A
 
Y
I
 
F
A
 
A
R
 
T
S
 
K
L
 
V
S
 
Q
S
 
N
N
 
T
N
 
N
G
 
G
C
 
V
Y
 
Y
L
 
V
V
 
V
P
 
P
A
 
A
F
 
F
S
 
T
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
P
 
P
W
 
Y
W
 
W
D
 
D
P
 
P
D
 
Y
S
 
A
R
 
R
G
 
G
L
 
A
I
 
I
C
 
F
G
 
G
L
 
L
T
 
T
A
 
R
G
 
G
S
 
V
D
 
N
R
 
A
A
 
N
T
 
H
L
 
I
V
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
T
C
 
L
E
 
E
S
 
S
M
 
I
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
Q
T
 
T
Y
 
R
D
 
D
V
 
V
L
 
L
R
 
E
S
 
A
M
 
M
E
 
Q
A
 
A
D
 
D
A
 
S
G
 
G
R
 
I
K
 
R
L
 
L
S
 
H
G
 
A
L
 
L
S
 
R
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
x
G
A
 
A
S
 
V
R
 
A
N
|
N
E
 
N
F
 
F
I
 
L
M
 
M
Q
 
Q
F
 
F
Q
 
Q
A
 
S
D
 
D
L
 
I
L
 
L
G
 
G
I
 
T
P
 
R
I
 
V
T
 
E
Q
 
R
S
 
P
E
 
E
S
 
V
I
 
R
E
 
E
T
 
V
T
 
T
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
V
G
 
G
Y
 
F
W
 
W
E
 
Q
D
 
N
R
 
L
D
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
Q
Q
 
E
N
 
K
R
 
A
N
 
V
L
 
I
G
 
E
K
 
R
C
 
E
F
 
F
E
 
R
P
 
P
A
 
G
G
 
I
N
 
E
P
 
T
V
 
T
E
 
E
L
 
R
A
 
N
R
 
Y
V
 
R
L
 
Y
S
 
A
G
 
G
W
 
W
H
 
K
D
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
K
R
 
R
S
 
A

1gljO Escherichia coli glycerol kinase mutant with bound atp analog showing substantial domain motion (see paper)
56% identity, 95% coverage: 21:509/514 of query aligns to 3:488/494 of 1gljO

query
sites
1gljO
S
 
K
Y
 
Y
I
 
I
M
 
V
A
 
A
L
 
L
D
 
D
S
 
Q
G
 
G
T
|
T
T
|
T
S
 
S
V
 
S
R
 
R
A
 
A
I
 
V
I
 
V
V
 
M
D
 
D
E
 
H
Y
 
D
D
 
A
C
 
N
I
 
I
V
 
I
A
 
S
Q
 
V
A
 
S
S
 
Q
R
 
R
A
 
E
I
 
F
S
 
E
T
 
Q
T
 
I
Y
 
Y
P
 
P
Q
 
K
P
 
P
G
 
G
W
 
W
V
 
V
E
 
E
Q
 
H
D
 
D
P
 
P
M
 
M
E
 
E
I
 
I
L
 
W
A
 
A
S
 
T
Q
 
Q
I
 
S
A
 
W
V
 
T
M
 
L
M
 
V
E
 
E
V
 
V
Q
 
L
F
 
A
K
 
K
S
 
A
G
 
D
I
 
I
H
 
S
S
 
S
D
 
D
S
 
Q
I
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
I
G
 
G
I
 
I
T
 
T
N
 
N
Q
 
Q
R
|
R
E
|
E
T
 
T
T
 
T
V
 
I
V
 
V
W
 
W
D
 
E
R
 
K
D
 
E
S
 
T
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
I
 
I
Y
 
Y
N
 
N
A
 
A
I
 
I
G
 
V
W
|
W
Q
 
Q
C
 
C
R
 
R
R
 
R
T
 
T
A
 
A
P
 
E
I
 
I
A
 
C
D
 
E
A
 
H
L
 
L
V
 
K
H
 
R
E
 
D
G
 
G
M
 
L
D
 
E
Q
 
D
T
 
Y
I
 
I
R
 
R
E
 
S
K
 
N
T
 
T
G
 
G
L
 
L
K
 
V
P
 
I
D
 
D
A
 
P
Y
|
Y
F
 
F
S
 
S
G
 
G
T
 
T
K
 
K
V
 
V
K
 
K
W
 
W
I
 
I
L
 
L
D
 
D
N
 
H
V
 
V
S
 
E
G
 
G
A
 
S
R
 
R
E
 
E
A
 
R
A
 
A
A
 
R
A
 
R
G
 
G
Q
 
E
L
 
L
M
 
L
F
 
F
G
 
G
T
 
T
I
 
V
D
 
D
T
 
T
W
 
W
L
 
L
I
 
I
Y
 
W
N
 
K
L
 
M
T
 
T
G
 
Q
G
 
G
M
 
R
V
 
V
Y
 
H
A
 
V
T
 
T
D
 
D
Y
 
Y
T
 
T
N
 
N
A
 
A
S
 
S
R
 
R
T
 
T
M
 
M
L
 
L
F
 
F
N
 
N
I
 
I
H
 
H
T
 
T
L
 
L
E
 
D
W
 
W
D
 
D
D
 
D
E
 
K
L
 
M
L
 
L
E
 
E
A
 
V
L
 
L
D
 
D
I
 
I
P
 
P
R
 
R
S
 
E
M
 
M
L
 
L
P
 
P
E
 
E
V
 
V
R
 
R
W
 
R
S
 
S
S
 
S
G
 
E
D
 
V
F
 
Y
G
 
G
R
 
Q
V
 
-
S
 
-
S
 
T
E
 
N
I
 
I
M
 
G
T
 
T
H
 
R
T
 
I
P
 
-
P
 
P
I
 
I
T
 
S
G
 
G
V
 
I
A
 
A
G
 
G
D
|
D
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
S
 
A
F
 
L
F
 
F
G
 
G
H
 
Q
C
 
L
C
 
C
F
 
V
E
 
K
P
 
E
G
 
G
Q
 
M
T
 
A
K
 
K
N
 
N
T
 
T
Y
 
Y
G
|
G
T
|
T
G
 
G
C
 
C
F
|
F
M
 
M
L
 
L
M
 
M
N
 
N
T
 
T
G
 
G
D
 
E
E
 
K
V
 
A
V
 
V
H
 
K
S
 
S
K
 
E
N
 
N
G
 
G
L
 
L
L
 
L
S
 
T
T
 
T
I
 
I
G
 
A
I
 
C
A
 
G
E
 
P
N
 
T
G
 
G
K
 
E
I
 
V
S
 
N
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
G
S
 
A
I
 
V
F
 
F
H
 
M
A
 
A
G
|
G
S
 
A
T
 
S
I
 
I
Q
|
Q
W
 
W
L
 
L
R
 
R
D
 
D
K
 
E
L
 
M
G
 
K
I
 
L
I
 
I
A
 
N
D
 
D
A
|
A
G
 
Y
E
 
D
T
 
S
A
 
E
A
 
Y
I
 
F
A
 
A
R
 
T
S
 
K
L
 
V
S
 
Q
S
 
N
N
 
T
N
 
N
G
 
G
C
 
V
Y
 
Y
L
 
V
V
 
V
P
 
P
A
 
A
F
 
F
S
 
T
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
P
 
P
W
 
Y
W
 
W
D
 
D
P
 
P
D
 
Y
S
 
A
R
 
R
G
 
G
L
 
A
I
 
I
C
 
F
G
 
G
L
 
L
T
 
T
A
 
R
G
 
G
S
 
V
D
 
N
R
 
A
A
 
N
T
 
H
L
 
I
V
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
T
C
 
L
E
 
E
S
 
S
M
 
I
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
Q
T
 
T
Y
 
R
D
 
D
V
 
V
L
 
L
R
 
E
S
 
A
M
 
M
E
 
Q
A
 
A
D
 
D
A
 
S
G
 
G
R
 
I
K
 
R
L
 
L
S
 
H
G
 
A
L
 
L
S
 
R
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
x
G
A
|
A
S
 
V
R
 
A
N
 
N
E
 
N
F
 
F
I
 
L
M
 
M
Q
 
Q
F
 
F
Q
 
Q
A
 
S
D
 
D
L
 
I
L
 
L
G
 
G
I
 
T
P
 
R
I
 
V
T
 
E
Q
 
R
S
 
P
E
 
E
S
 
V
I
 
R
E
 
E
T
 
V
T
 
T
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
V
G
 
G
Y
 
F
W
 
W
E
 
Q
D
 
N
R
 
L
D
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
Q
Q
 
E
N
 
K
R
 
A
N
 
V
L
 
I
G
 
E
K
 
R
C
 
E
F
 
F
E
 
R
P
 
P
A
 
G
G
 
I
N
 
E
P
 
T
V
 
T
E
 
E
L
 
R
A
 
N
R
 
Y
V
 
R
L
 
Y
S
 
A
G
 
G
W
 
W
H
 
K
D
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
K
R
 
R
S
 
A

1bwfO Escherichia coli glycerol kinase mutant with bound atp analog showing substantial domain motion (see paper)
56% identity, 95% coverage: 21:509/514 of query aligns to 3:488/494 of 1bwfO

query
sites
1bwfO
S
 
K
Y
 
Y
I
 
I
M
 
V
A
 
A
L
 
L
D
 
D
S
 
Q
G
 
G
T
|
T
T
|
T
S
 
S
V
 
S
R
 
R
A
 
A
I
 
V
I
 
V
V
 
M
D
 
D
E
 
H
Y
 
D
D
 
A
C
 
N
I
 
I
V
 
I
A
 
S
Q
 
V
A
 
S
S
 
Q
R
 
R
A
 
E
I
 
F
S
 
E
T
 
Q
T
 
I
Y
 
Y
P
 
P
Q
 
K
P
 
P
G
 
G
W
 
W
V
 
V
E
 
E
Q
 
H
D
 
D
P
 
P
M
 
M
E
 
E
I
 
I
L
 
W
A
 
A
S
 
T
Q
 
Q
I
 
S
A
 
W
V
 
T
M
 
L
M
 
V
E
 
E
V
 
V
Q
 
L
F
 
A
K
 
K
S
 
A
G
 
D
I
 
I
H
 
S
S
 
S
D
 
D
S
 
Q
I
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
I
G
 
G
I
 
I
T
 
T
N
 
N
Q
 
Q
R
|
R
E
|
E
T
 
T
T
 
T
V
 
I
V
 
V
W
 
W
D
 
E
R
 
K
D
 
E
S
 
T
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
I
 
I
Y
 
Y
N
 
N
A
 
A
I
 
I
G
 
V
W
|
W
Q
 
Q
C
 
C
R
 
R
R
 
R
T
 
T
A
 
A
P
 
E
I
 
I
A
 
C
D
 
E
A
 
H
L
 
L
V
 
K
H
 
R
E
 
D
G
 
G
M
 
L
D
 
E
Q
 
D
T
 
Y
I
 
I
R
 
R
E
 
S
K
 
N
T
 
T
G
 
G
L
 
L
K
 
V
P
 
I
D
 
D
A
 
P
Y
|
Y
F
 
F
S
 
S
G
 
G
T
 
T
K
 
K
V
 
V
K
 
K
W
 
W
I
 
I
L
 
L
D
 
D
N
 
H
V
 
V
S
 
E
G
 
G
A
 
S
R
 
R
E
 
E
A
 
R
A
 
A
A
 
R
A
 
R
G
 
G
Q
 
E
L
 
L
M
 
L
F
 
F
G
 
G
T
 
T
I
 
V
D
 
D
T
 
T
W
 
W
L
 
L
I
 
I
Y
 
W
N
 
K
L
 
M
T
 
T
G
 
Q
G
 
G
M
 
R
V
 
V
Y
 
H
A
 
V
T
 
T
D
 
D
Y
 
Y
T
 
T
N
 
N
A
 
A
S
 
S
R
 
R
T
 
T
M
 
M
L
 
L
F
 
F
N
 
N
I
 
I
H
 
H
T
 
T
L
 
L
E
 
D
W
 
W
D
 
D
D
 
D
E
 
K
L
 
M
L
 
L
E
 
E
A
 
V
L
 
L
D
 
D
I
 
I
P
 
P
R
 
R
S
 
E
M
 
M
L
 
L
P
 
P
E
 
E
V
 
V
R
 
R
W
 
R
S
 
S
S
 
S
G
 
E
D
 
V
F
 
Y
G
 
G
R
 
Q
V
 
-
S
 
-
S
 
T
E
 
N
I
 
I
M
 
G
T
 
T
H
 
R
T
 
I
P
 
-
P
 
P
I
 
I
T
 
S
G
 
G
V
 
I
A
 
A
G
 
G
D
|
D
Q
|
Q
Q
 
Q
A
 
A
S
 
A
F
 
L
F
 
F
G
 
G
H
 
Q
C
 
L
C
 
C
F
 
V
E
 
K
P
 
E
G
 
G
Q
 
M
T
 
A
K
 
K
N
 
N
T
 
T
Y
 
Y
G
 
G
T
|
T
G
 
G
C
 
C
F
|
F
M
 
M
L
 
L
M
 
M
N
 
N
T
 
T
G
 
G
D
 
E
E
 
K
V
 
A
V
 
V
H
 
K
S
 
S
K
 
E
N
 
N
G
 
G
L
 
L
L
 
L
S
 
T
T
 
T
I
 
I
G
 
A
I
 
C
A
 
G
E
 
P
N
 
T
G
 
G
K
 
E
I
 
V
S
 
N
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
G
S
 
A
I
 
V
F
 
F
H
 
M
A
 
A
G
|
G
S
 
A
T
 
S
I
|
I
Q
|
Q
W
 
W
L
 
L
R
 
R
D
 
D
K
 
E
L
 
M
G
 
K
I
 
L
I
 
I
A
 
N
D
 
D
A
|
A
G
 
Y
E
 
D
T
 
S
A
 
E
A
 
Y
I
 
F
A
 
A
R
 
T
S
 
K
L
 
V
S
 
Q
S
 
N
N
 
T
N
 
N
G
 
G
C
 
V
Y
 
Y
L
 
V
V
 
V
P
 
P
A
 
A
F
 
F
S
 
T
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
P
 
P
W
 
Y
W
 
W
D
 
D
P
 
P
D
 
Y
S
 
A
R
 
R
G
 
G
L
 
A
I
 
I
C
 
F
G
 
G
L
 
L
T
 
T
A
 
R
G
 
G
S
 
V
D
 
N
R
 
A
A
 
N
T
 
H
L
 
I
V
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
T
C
 
L
E
 
E
S
 
S
M
 
I
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
Q
T
 
T
Y
 
R
D
 
D
V
 
V
L
 
L
R
 
E
S
 
A
M
 
M
E
 
Q
A
 
A
D
 
D
A
 
S
G
 
G
R
 
I
K
 
R
L
 
L
S
 
H
G
 
A
L
 
L
S
 
R
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
x
G
A
 
A
S
 
V
R
 
A
N
|
N
E
 
N
F
 
F
I
 
L
M
 
M
Q
 
Q
F
 
F
Q
 
Q
A
 
S
D
 
D
L
 
I
L
 
L
G
 
G
I
 
T
P
 
R
I
 
V
T
 
E
Q
 
R
S
 
P
E
 
E
S
 
V
I
 
R
E
 
E
T
 
V
T
 
T
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
V
G
 
G
Y
 
F
W
 
W
E
 
Q
D
 
N
R
 
L
D
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
Q
Q
 
E
N
 
K
R
 
A
N
 
V
L
 
I
G
 
E
K
 
R
C
 
E
F
 
F
E
 
R
P
 
P
A
 
G
G
 
I
N
 
E
P
 
T
V
 
T
E
 
E
L
 
R
A
 
N
R
 
Y
V
 
R
L
 
Y
S
 
A
G
 
G
W
 
W
H
 
K
D
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
K
R
 
R
S
 
A

1bu6Y Crystal structures of escherichia coli glycerol kinase and the mutant a65t in an inactive tetramer: conformational changes and implications for allosteric regulation (see paper)
56% identity, 95% coverage: 21:509/514 of query aligns to 3:492/499 of 1bu6Y

query
sites
1bu6Y
S
 
K
Y
 
Y
I
 
I
M
 
V
A
 
A
L
 
L
D
 
D
S
 
Q
G
 
G
T
 
T
T
 
T
S
 
S
V
 
S
R
 
R
A
 
A
I
 
V
I
 
V
V
 
M
D
 
D
E
 
H
Y
 
D
D
 
A
C
 
N
I
 
I
V
 
I
A
 
S
Q
 
V
A
 
S
S
 
Q
R
 
R
A
 
E
I
 
F
S
 
E
T
 
Q
T
 
I
Y
 
Y
P
 
P
Q
 
K
P
 
P
G
 
G
W
 
W
V
 
V
E
 
E
Q
 
H
D
 
D
P
 
P
M
 
M
E
 
E
I
 
I
L
 
W
A
 
A
S
 
T
Q
 
Q
I
 
S
A
 
S
V
 
T
M
 
L
M
 
V
E
 
E
V
 
V
Q
 
L
F
 
T
K
 
K
S
 
A
G
 
D
I
 
I
H
 
S
S
 
S
D
 
D
S
 
Q
I
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
I
G
 
G
I
 
I
T
 
T
N
 
N
Q
|
Q
R
|
R
E
|
E
T
 
T
T
 
T
V
 
I
V
 
V
W
 
W
D
 
E
R
 
K
D
 
E
S
 
T
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
I
 
I
Y
 
Y
N
 
N
A
 
A
I
 
I
G
 
V
W
|
W
Q
 
Q
C
 
C
R
 
R
R
 
R
T
 
T
A
 
A
P
 
E
I
 
I
A
 
C
D
 
E
A
 
H
L
 
L
V
 
K
H
 
R
E
 
D
G
 
G
M
 
L
D
 
E
Q
 
D
T
 
Y
I
 
I
R
 
R
E
 
S
K
 
N
T
 
T
G
 
G
L
 
L
K
 
V
P
 
I
D
 
D
A
 
P
Y
|
Y
F
 
F
S
 
S
G
 
G
T
 
T
K
 
K
V
 
V
K
 
K
W
 
W
I
 
I
L
 
L
D
 
D
N
 
H
V
 
V
S
 
E
G
 
G
A
 
S
R
 
R
E
 
E
A
 
R
A
 
A
A
 
R
A
 
R
G
 
G
Q
 
E
L
 
L
M
 
L
F
 
F
G
 
G
T
 
T
I
 
V
D
 
D
T
 
T
W
 
W
L
 
L
I
 
I
Y
 
W
N
 
K
L
 
M
T
 
T
G
 
Q
G
 
G
M
 
R
V
 
V
Y
 
H
A
 
V
T
 
T
D
 
D
Y
 
Y
T
 
T
N
 
N
A
 
A
S
 
S
R
 
R
T
 
T
M
 
M
L
 
L
F
 
F
N
 
N
I
 
I
H
 
H
T
 
T
L
 
L
E
 
D
W
 
W
D
 
D
D
 
D
E
 
K
L
 
M
L
 
L
E
 
E
A
 
V
L
 
L
D
 
D
I
 
I
P
 
P
R
 
R
S
 
E
M
 
M
L
 
L
P
 
P
E
 
E
V
 
V
R
 
R
W
 
R
S
 
S
S
 
S
G
 
E
D
 
V
F
 
Y
G
 
G
R
 
Q
V
 
T
S
 
N
S
 
I
E
 
G
I
 
G
M
 
K
T
 
G
H
 
G
T
 
T
P
 
R
-
 
I
P
 
P
I
 
I
T
 
S
G
 
G
V
 
I
A
 
A
G
 
G
D
|
D
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
S
 
A
F
 
L
F
 
F
G
 
G
H
 
Q
C
 
L
C
 
C
F
 
V
E
 
K
P
 
E
G
 
G
Q
 
M
T
 
A
K
 
K
N
 
N
T
 
T
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
G
 
G
C
 
C
F
 
F
M
 
M
L
 
L
M
 
M
N
 
N
T
 
T
G
 
G
D
 
E
E
 
K
V
 
A
V
 
V
H
 
K
S
 
S
K
 
E
N
 
N
G
 
G
L
 
L
L
 
L
S
 
T
T
 
T
I
 
I
G
 
A
I
 
C
A
 
G
E
 
P
N
 
T
G
 
G
K
 
E
I
 
V
S
 
N
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
G
S
 
A
I
 
V
F
 
F
H
 
M
A
 
A
G
 
G
S
 
A
T
 
S
I
 
I
Q
 
Q
W
 
W
L
 
L
R
 
R
D
 
D
K
 
E
L
 
M
G
 
K
I
 
L
I
 
I
A
 
N
D
 
D
A
 
A
G
 
Y
E
 
D
T
 
S
A
 
E
A
 
Y
I
 
F
A
 
A
R
 
T
S
 
K
L
 
V
S
 
Q
S
 
N
N
 
T
N
 
N
G
 
G
C
 
V
Y
 
Y
L
 
V
V
 
V
P
 
P
A
 
A
F
 
F
S
 
T
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
P
 
P
W
 
Y
W
 
W
D
 
D
P
 
P
D
 
Y
S
 
A
R
 
R
G
 
G
L
 
A
I
 
I
C
 
F
G
 
G
L
 
L
T
 
T
A
 
R
G
 
G
S
 
V
D
 
N
R
 
A
A
 
N
T
 
H
L
 
I
V
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
T
C
 
L
E
 
E
S
 
S
M
 
I
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
Q
T
 
T
Y
 
R
D
 
D
V
 
V
L
 
L
R
 
E
S
 
A
M
 
M
E
 
Q
A
 
A
D
 
D
A
 
S
G
 
G
R
 
I
K
 
R
L
 
L
S
 
H
G
 
A
L
 
L
S
 
R
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
G
A
 
A
S
 
V
R
 
A
N
 
N
E
 
N
F
 
F
I
 
L
M
 
M
Q
 
Q
F
 
F
Q
 
Q
A
 
S
D
 
D
L
 
I
L
 
L
G
 
G
I
 
T
P
 
R
I
 
V
T
 
E
Q
 
R
S
 
P
E
 
E
S
 
V
I
 
R
E
 
E
T
 
V
T
 
T
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
V
G
 
G
Y
 
F
W
 
W
E
 
Q
D
 
N
R
 
L
D
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
Q
Q
 
E
N
 
K
R
 
A
N
 
V
L
 
I
G
 
E
K
 
R
C
 
E
F
 
F
E
 
R
P
 
P
A
 
G
G
 
I
N
 
E
P
 
T
V
 
T
E
 
E
L
 
R
A
 
N
R
 
Y
V
 
R
L
 
Y
S
 
A
G
 
G
W
 
W
H
 
K
D
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
K
R
 
R
S
 
A

P0A6F3 Glycerol kinase; ATP:glycerol 3-phosphotransferase; Glycerokinase; GK; EC 2.7.1.30 from Escherichia coli (strain K12) (see 10 papers)
56% identity, 95% coverage: 21:509/514 of query aligns to 5:494/502 of P0A6F3

query
sites
P0A6F3
S
 
K
Y
 
Y
I
 
I
M
 
V
A
 
A
L
 
L
D
 
D
S
 
Q
G
 
G
T
|
T
T
 
T
S
 
S
V
 
S
R
|
R
A
 
A
I
 
V
I
 
V
V
 
M
D
 
D
E
 
H
Y
 
D
D
 
A
C
 
N
I
 
I
V
 
I
A
 
S
Q
 
V
A
 
S
S
 
Q
R
 
R
A
 
E
I
 
F
S
 
E
T
 
Q
T
 
I
Y
 
Y
P
 
P
Q
 
K
P
 
P
G
 
G
W
 
W
V
 
V
E
 
E
Q
 
H
D
 
D
P
 
P
M
 
M
E
 
E
I
 
I
L
 
W
A
 
A
S
 
T
Q
 
Q
I
 
S
A
x
S
V
 
T
M
 
L
M
 
V
E
 
E
V
 
V
Q
 
L
F
x
A
K
 
K
S
 
A
G
 
D
I
 
I
H
 
S
S
 
S
D
 
D
S
 
Q
I
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
I
G
 
G
I
 
I
T
 
T
N
 
N
Q
 
Q
R
|
R
E
|
E
T
 
T
T
 
T
V
 
I
V
 
V
W
 
W
D
 
E
R
 
K
D
 
E
S
 
T
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
I
 
I
Y
 
Y
N
 
N
A
 
A
I
 
I
G
 
V
W
 
W
Q
 
Q
C
 
C
R
 
R
R
 
R
T
 
T
A
 
A
P
 
E
I
 
I
A
 
C
D
 
E
A
 
H
L
 
L
V
 
K
H
 
R
E
 
D
G
 
G
M
 
L
D
 
E
Q
 
D
T
 
Y
I
 
I
R
 
R
E
 
S
K
 
N
T
 
T
G
 
G
L
 
L
K
 
V
P
 
I
D
 
D
A
 
P
Y
|
Y
F
 
F
S
 
S
G
 
G
T
 
T
K
 
K
V
 
V
K
 
K
W
 
W
I
 
I
L
 
L
D
 
D
N
 
H
V
 
V
S
 
E
G
 
G
A
 
S
R
 
R
E
 
E
A
 
R
A
 
A
A
 
R
A
 
R
G
 
G
Q
 
E
L
 
L
M
 
L
F
 
F
G
 
G
T
 
T
I
 
V
D
 
D
T
 
T
W
 
W
L
 
L
I
 
I
Y
 
W
N
 
K
L
 
M
T
 
T
G
 
Q
G
 
G
M
 
R
V
 
V
Y
 
H
A
 
V
T
 
T
D
 
D
Y
 
Y
T
 
T
N
 
N
A
 
A
S
 
S
R
 
R
T
 
T
M
 
M
L
 
L
F
 
F
N
 
N
I
 
I
H
 
H
T
 
T
L
 
L
E
 
D
W
 
W
D
 
D
D
 
D
E
 
K
L
 
M
L
 
L
E
 
E
A
 
V
L
 
L
D
 
D
I
 
I
P
 
P
R
 
R
S
 
E
M
 
M
L
 
L
P
 
P
E
 
E
V
 
V
R
 
R
W
 
R
S
 
S
S
 
S
G
 
E
D
 
V
F
 
Y
G
 
G
R
 
Q
V
 
T
S
 
N
S
 
I
E
x
G
I
 
G
M
x
K
T
 
G
H
x
G
T
 
T
P
x
R
-
 
I
P
 
P
I
 
I
T
 
S
G
 
G
V
 
I
A
 
A
G
 
G
D
|
D
Q
|
Q
Q
 
Q
A
 
A
S
 
A
F
 
L
F
 
F
G
 
G
H
 
Q
C
 
L
C
 
C
F
 
V
E
 
K
P
 
E
G
 
G
Q
 
M
T
 
A
K
 
K
N
 
N
T
 
T
Y
 
Y
G
 
G
T
|
T
G
 
G
C
 
C
F
 
F
M
 
M
L
 
L
M
 
M
N
 
N
T
 
T
G
 
G
D
 
E
E
 
K
V
 
A
V
 
V
H
 
K
S
 
S
K
 
E
N
 
N
G
 
G
L
 
L
L
 
L
S
 
T
T
 
T
I
 
I
G
 
A
I
 
C
A
 
G
E
 
P
N
 
T
G
 
G
K
 
E
I
 
V
S
 
N
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
E
 
E
G
|
G
S
 
A
I
 
V
F
 
F
H
 
M
A
 
A
G
|
G
S
 
A
T
 
S
I
 
I
Q
 
Q
W
 
W
L
 
L
R
 
R
D
 
D
K
 
E
L
 
M
G
 
K
I
 
L
I
 
I
A
 
N
D
 
D
A
 
A
G
 
Y
E
 
D
T
 
S
A
 
E
A
 
Y
I
 
F
A
 
A
R
 
T
S
 
K
L
 
V
S
 
Q
S
 
N
N
 
T
N
 
N
G
 
G
C
 
V
Y
 
Y
L
 
V
V
 
V
P
 
P
A
 
A
F
 
F
S
 
T
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
P
 
P
W
 
Y
W
 
W
D
 
D
P
 
P
D
 
Y
S
 
A
R
 
R
G
 
G
L
 
A
I
 
I
C
 
F
G
 
G
L
 
L
T
 
T
A
 
R
G
 
G
S
 
V
D
 
N
R
 
A
A
 
N
T
 
H
L
 
I
V
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
T
C
 
L
E
 
E
S
 
S
M
 
I
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
Q
T
 
T
Y
 
R
D
 
D
V
 
V
L
 
L
R
 
E
S
 
A
M
 
M
E
 
Q
A
 
A
D
 
D
A
 
S
G
 
G
R
 
I
K
 
R
L
 
L
S
 
H
G
 
A
L
 
L
S
 
R
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
x
G
A
 
A
S
 
V
R
 
A
N
|
N
E
 
N
F
 
F
I
 
L
M
 
M
Q
 
Q
F
 
F
Q
 
Q
A
 
S
D
 
D
L
 
I
L
 
L
G
 
G
I
 
T
P
 
R
I
 
V
T
 
E
Q
 
R
S
 
P
E
 
E
S
 
V
I
 
R
E
 
E
T
 
V
T
 
T
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
V
G
 
G
Y
 
F
W
 
W
E
 
Q
D
 
N
R
 
L
D
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
Q
Q
 
E
N
 
K
R
 
A
N
 
V
L
 
I
G
 
E
K
 
R
C
 
E
F
 
F
E
 
R
P
 
P
A
 
G
G
x
I
N
 
E
P
 
T
V
 
T
E
|
E
L
x
R
A
 
N
R
 
Y
V
 
R
L
 
Y
S
 
A
G
 
G
W
 
W
H
 
K
D
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
K
R
 
R
S
 
A

Sites not aligning to the query:

1glfO Crystal structures of escherichia coli glycerol kinase and the mutant a65t in an inactive tetramer: conformational changes and implications for allosteric regulation (see paper)
56% identity, 95% coverage: 21:509/514 of query aligns to 3:492/498 of 1glfO

query
sites
1glfO
S
 
K
Y
 
Y
I
 
I
M
 
V
A
 
A
L
 
L
D
 
D
S
 
Q
G
 
G
T
 
T
T
 
T
S
 
S
V
 
S
R
|
R
A
 
A
I
 
V
I
 
V
V
 
M
D
 
D
E
 
H
Y
 
D
D
 
A
C
 
N
I
 
I
V
 
I
A
 
S
Q
 
V
A
 
S
S
 
Q
R
 
R
A
 
E
I
 
F
S
 
E
T
 
Q
T
 
I
Y
 
Y
P
 
P
Q
 
K
P
 
P
G
 
G
W
 
W
V
 
V
E
 
E
Q
 
H
D
 
D
P
 
P
M
 
M
E
 
E
I
 
I
L
 
W
A
 
A
S
 
T
Q
 
Q
I
 
S
A
 
S
V
 
T
M
 
L
M
 
V
E
 
E
V
 
V
Q
 
L
F
 
A
K
 
K
S
 
A
G
 
D
I
 
I
H
 
S
S
 
S
D
 
D
S
 
Q
I
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
I
G
 
G
I
 
I
T
 
T
N
 
N
Q
 
Q
R
|
R
E
|
E
T
 
T
T
 
T
V
 
I
V
 
V
W
 
W
D
 
E
R
 
K
D
 
E
S
 
T
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
I
 
I
Y
 
Y
N
 
N
A
 
A
I
 
I
G
 
V
W
 
W
Q
 
Q
C
 
C
R
 
R
R
 
R
T
 
T
A
 
A
P
 
E
I
 
I
A
 
C
D
 
E
A
 
H
L
 
L
V
 
K
H
 
R
E
 
D
G
 
G
M
 
L
D
 
E
Q
 
D
T
 
Y
I
 
I
R
 
R
E
 
S
K
 
N
T
 
T
G
 
G
L
 
L
K
 
V
P
 
I
D
 
D
A
 
P
Y
|
Y
F
 
F
S
 
S
G
 
G
T
 
T
K
 
K
V
 
V
K
 
K
W
 
W
I
 
I
L
 
L
D
 
D
N
 
H
V
 
V
S
 
E
G
 
G
A
 
S
R
 
R
E
 
E
A
 
R
A
 
A
A
 
R
A
 
R
G
 
G
Q
 
E
L
 
L
M
 
L
F
 
F
G
 
G
T
 
T
I
 
V
D
 
D
T
 
T
W
 
W
L
 
L
I
 
I
Y
 
W
N
 
K
L
 
M
T
 
T
G
 
Q
G
 
G
M
 
R
V
 
V
Y
 
H
A
 
V
T
 
T
D
 
D
Y
 
Y
T
 
T
N
 
N
A
 
A
S
 
S
R
 
R
T
 
T
M
 
M
L
 
L
F
 
F
N
 
N
I
 
I
H
 
H
T
 
T
L
 
L
E
 
D
W
 
W
D
 
D
D
 
D
E
 
K
L
 
M
L
 
L
E
 
E
A
 
V
L
 
L
D
 
D
I
 
I
P
 
P
R
 
R
S
 
E
M
 
M
L
 
L
P
 
P
E
 
E
V
 
V
R
 
R
W
 
R
S
 
S
S
 
S
G
 
E
D
 
V
F
 
Y
G
 
G
R
 
Q
V
 
T
S
 
N
S
 
I
E
 
G
I
 
G
M
 
K
T
x
G
H
x
G
T
 
T
P
x
R
-
 
I
P
 
P
I
 
I
T
 
S
G
 
G
V
 
I
A
 
A
G
 
G
D
|
D
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
S
 
A
F
 
L
F
 
F
G
 
G
H
 
Q
C
 
L
C
 
C
F
 
V
E
 
K
P
 
E
G
 
G
Q
 
M
T
 
A
K
 
K
N
 
N
T
 
T
Y
 
Y
G
|
G
T
|
T
G
 
G
C
 
C
F
 
F
M
 
M
L
 
L
M
 
M
N
 
N
T
 
T
G
 
G
D
 
E
E
 
K
V
 
A
V
 
V
H
 
K
S
 
S
K
 
E
N
 
N
G
 
G
L
 
L
L
 
L
S
 
T
T
 
T
I
 
I
G
 
A
I
 
C
A
 
G
E
 
P
N
 
T
G
 
G
K
 
E
I
 
V
S
 
N
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
G
S
 
A
I
 
V
F
 
F
H
 
M
A
 
A
G
|
G
S
 
A
T
 
S
I
 
I
Q
 
Q
W
 
W
L
 
L
R
 
R
D
 
D
K
 
E
L
 
M
G
 
K
I
 
L
I
 
I
A
 
N
D
 
D
A
 
A
G
 
Y
E
 
D
T
 
S
A
 
E
A
 
Y
I
 
F
A
 
A
R
 
T
S
 
K
L
 
V
S
 
Q
S
 
N
N
 
T
N
 
N
G
 
G
C
 
V
Y
 
Y
L
 
V
V
 
V
P
 
P
A
 
A
F
 
F
S
 
T
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
P
 
P
W
 
Y
W
 
W
D
 
D
P
 
P
D
 
Y
S
 
A
R
 
R
G
 
G
L
 
A
I
 
I
C
 
F
G
 
G
L
 
L
T
 
T
A
 
R
G
 
G
S
 
V
D
 
N
R
 
A
A
 
N
T
 
H
L
 
I
V
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
T
C
 
L
E
 
E
S
 
S
M
 
I
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
Q
T
 
T
Y
 
R
D
 
D
V
 
V
L
 
L
R
 
E
S
 
A
M
 
M
E
 
Q
A
 
A
D
 
D
A
 
S
G
 
G
R
 
I
K
 
R
L
 
L
S
 
H
G
 
A
L
 
L
S
 
R
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
x
G
A
|
A
S
 
V
R
 
A
N
 
N
E
 
N
F
 
F
I
 
L
M
 
M
Q
 
Q
F
 
F
Q
 
Q
A
 
S
D
 
D
L
 
I
L
 
L
G
 
G
I
 
T
P
 
R
I
 
V
T
 
E
Q
 
R
S
 
P
E
 
E
S
 
V
I
 
R
E
 
E
T
 
V
T
 
T
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
V
G
 
G
Y
 
F
W
 
W
E
 
Q
D
 
N
R
 
L
D
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
Q
Q
 
E
N
 
K
R
 
A
N
 
V
L
 
I
G
 
E
K
 
R
C
 
E
F
 
F
E
 
R
P
 
P
A
 
G
G
 
I
N
 
E
P
 
T
V
 
T
E
 
E
L
 
R
A
 
N
R
 
Y
V
 
R
L
 
Y
S
 
A
G
 
G
W
 
W
H
 
K
D
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
K
R
 
R
S
 
A

1bo5O Crystal structure of the complex between escherichia coli glycerol kinase and the allosteric regulator fructose 1,6-bisphosphate. (see paper)
56% identity, 95% coverage: 21:509/514 of query aligns to 3:492/498 of 1bo5O

query
sites
1bo5O
S
 
K
Y
 
Y
I
 
I
M
 
V
A
 
A
L
 
L
D
 
D
S
 
Q
G
 
G
T
 
T
T
 
T
S
 
S
V
 
S
R
 
R
A
 
A
I
 
V
I
 
V
V
 
M
D
 
D
E
 
H
Y
 
D
D
 
A
C
 
N
I
 
I
V
 
I
A
 
S
Q
 
V
A
 
S
S
 
Q
R
 
R
A
 
E
I
 
F
S
 
E
T
 
Q
T
 
I
Y
 
Y
P
 
P
Q
 
K
P
 
P
G
 
G
W
 
W
V
 
V
E
 
E
Q
 
H
D
 
D
P
 
P
M
 
M
E
 
E
I
 
I
L
 
W
A
 
A
S
 
T
Q
 
Q
I
 
S
A
 
S
V
 
T
M
 
L
M
 
V
E
 
E
V
 
V
Q
 
L
F
 
A
K
 
K
S
 
A
G
 
D
I
 
I
H
 
S
S
 
S
D
 
D
S
 
Q
I
 
I
A
 
A
A
 
A
I
 
I
G
 
G
I
 
I
T
 
T
N
 
N
Q
 
Q
R
|
R
E
|
E
T
 
T
T
 
T
V
 
I
V
 
V
W
 
W
D
 
E
R
 
K
D
 
E
S
 
T
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
I
 
I
Y
 
Y
N
 
N
A
 
A