SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_009142100.1 NCBI__GCF_000225705.1:WP_009142100.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 4 hits to proteins with known functional sites (download)

4im7A Crystal structure of fructuronate reductase (ydfi) from e. Coli cft073 (efi target efi-506389) complexed with nadh and d-mannonate
32% identity, 69% coverage: 134:508/540 of query aligns to 112:451/483 of 4im7A

query
sites
4im7A
P
 
P
E
 
Q
L
 
I
Q
 
A
M
 
I
A
 
V
T
 
S
F
 
L
T
|
T
I
|
I
T
|
T
E
 
E
K
 
K
G
|
G
Y
 
Y
A
 
F
L
 
H
R
 
S
N
 
P
A
 
A
A
 
T
G
 
G
E
 
Q
L
 
L
F
 
M
-
 
L
-
 
D
-
 
H
P
 
P
Y
 
M
V
 
V
A
 
V
K
 
A
E
 
D
I
 
V
A
 
Q
D
 
N
G
 
-
P
 
P
A
 
H
G
 
Q
A
 
P
A
 
K
S
 
T
T
 
A
M
 
T
G
 
G
I
 
V
V
 
I
A
 
V
A
 
E
L
 
A
L
 
L
L
 
A
A
 
R
R
 
R
Y
 
K
T
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
L
A
 
P
P
 
A
I
 
F
A
 
T
L
 
V
V
 
M
S
 
S
T
 
C
D
|
D
N
|
N
F
 
M
S
 
P
Q
 
E
N
 
N
G
 
G
R
 
H
R
 
V
F
 
M
R
 
R
D
 
D
A
 
V
V
 
V
L
 
T
T
 
S
V
 
Y
A
 
A
Q
 
Q
G
 
A
W
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
K
 
-
V
 
I
Q
 
D
Q
 
V
G
 
K
Y
 
L
V
 
A
D
 
Q
Y
 
W
L
 
I
M
 
-
D
 
-
K
 
E
D
 
D
R
 
N
V
 
V
S
 
T
F
 
F
P
 
P
W
 
S
S
 
T
M
 
M
I
x
V
D
|
D
R
|
R
I
 
I
T
x
V
P
 
P
N
 
-
P
 
-
A
 
-
P
 
A
A
 
V
T
 
T
E
 
E
E
 
-
A
 
-
L
 
-
K
 
-
A
 
-
Q
 
-
G
 
-
W
 
-
D
 
D
D
 
T
L
 
L
Q
 
A
L
 
K
I
 
I
P
 
E
T
 
Q
G
 
L
S
 
T
G
 
G
V
 
V
S
 
R
F
 
D
A
 
A
G
 
A
F
 
G
A
 
V
N
 
A
T
 
C
E
 
E
R
 
P
T
 
F
C
 
R
Y
 
Q
L
 
W
V
 
V
V
 
I
E
 
E
D
 
D
S
 
N
F
 
F
P
 
V
N
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
P
K
 
E
L
 
W
E
 
E
A
 
K
G
 
A
G
 
G
V
 
A
I
 
E
L
 
L
T
 
V
D
 
-
R
 
-
E
 
S
T
 
D
V
 
V
D
 
L
R
 
P
A
 
Y
D
 
E
T
 
E
M
 
M
K
|
K
V
 
L
T
 
R
A
 
-
C
 
M
L
 
L
N
|
N
P
 
G
L
 
S
H
|
H
T
 
S
A
 
F
L
 
L
A
 
A
V
 
Y
F
 
L
G
 
G
C
 
Y
L
 
L
L
 
A
G
 
G
Y
 
Y
T
 
Q
K
 
H
I
 
I
A
 
N
D
 
D
E
 
C
M
 
M
A
 
E
N
 
D
P
 
E
H
 
H
L
 
Y
R
 
R
R
 
H
L
 
A
V
 
A
E
 
Y
R
 
T
L
 
L
G
 
M
Y
 
L
D
 
Q
E
 
E
G
 
Q
M
 
A
P
 
P
V
 
T
V
 
L
V
 
K
S
 
V
P
 
Q
G
 
G
V
 
V
I
 
-
E
 
D
P
 
L
K
 
Q
D
 
D
F
 
Y
I
 
A
D
 
N
T
 
R
L
 
L
I
 
I
T
 
-
H
 
E
R
 
R
L
 
Y
P
 
S
N
 
N
P
 
P
A
 
A
L
 
L
P
 
R
D
 
H
A
 
R
P
 
T
Q
 
W
R
 
Q
I
 
I
A
 
A
Q
 
M
D
 
D
T
 
G
S
 
S
Q
 
Q
K
|
K
M
 
L
P
 
P
I
 
Q
R
|
R
Y
 
M
G
 
L
H
 
D
T
 
S
I
 
V
N
 
R
A
 
W
Y
 
H
A
 
L
A
 
A
A
 
H
G
 
D
L
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
S
K
 
K
L
 
F
E
 
D
C
 
L
I
 
L
P
 
A
L
 
L
V
 
G
I
 
V
A
 
A
G
 
G
W
 
W
L
 
M
R
 
R
Y
 
Y
L
 
V
L
 
G
A
 
G
V
 
V
D
 
D
D
 
E
E
 
Q
G
 
G
A
 
N
A
 
P
F
 
I
T
 
E
P
 
I
S
 
S
P
 
-
D
 
D
P
 
P
M
 
L
L
 
L
D
 
P
Q
 
V
L
 
I
Q
 
Q
D
 
K
L
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
G
 
-
G
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
A
V
 
V
T
 
Q
D
 
S
A
 
S
A
 
A
A
 
E
V
 
G
H
 
T
A
 
A
A
 
R
V
 
V
E
 
Q
P
 
S
I
 
L
L
 
L
S
 
A
N
 
I
A
 
K
E
 
A
I
 
I
F
 
F
D
 
G
C
 
D
D
 
D
L
 
L

Sites not aligning to the query:

7rk5B Mannitol-2-dehydrogenase bound to nadh from aspergillus fumigatus
26% identity, 88% coverage: 4:479/540 of query aligns to 3:451/501 of 7rk5B

query
sites
7rk5B
L
 
L
K
 
K
H
 
L
W
 
N
Q
 
S
D
 
R
S
 
N
A
 
L
Q
 
S
Q
 
Q
L
 
I
A
 
A
A
 
A
M
 
A
G
 
G
-
 
G
-
 
A
-
 
L
V
 
V
R
 
K
L
 
I
P
 
P
Q
 
T
A
 
Y
N
 
Q
V
 
R
E
 
G
A
 
R
T
 
A
R
 
V
R
 
K
A
 
E
G
 
G
I
 
I
E
 
-
Q
 
-
P
 
-
R
 
-
W
 
-
I
 
V
H
 
H
F
 
I
G
|
G
G
x
V
G
|
G
N
x
G
L
x
F
Y
 
H
R
 
R
A
 
A
F
 
H
H
 
L
A
 
A
Q
 
V
V
 
Y
A
 
I
Q
 
D
D
 
Q
V
 
L
I
 
M
D
 
Q
A
 
K
G
 
H
G
 
G
M
 
V
D
 
N
R
 
D
G
 
Y
V
 
A
V
 
I
V
 
C
V
 
G
E
 
V
T
 
G
F
 
L
Q
|
Q
P
 
P
F
 
F
T
x
D
V
 
S
D
 
A
Q
 
M
V
 
R
Y
 
D
R
 
A
P
 
L
Y
 
A
N
 
S
C
 
Q
D
 
D
I
 
H
L
 
L
Q
 
Y
V
 
T
I
 
L
M
 
I
D
 
E
E
 
R
D
 
S
-
 
A
-
 
K
G
 
G
T
 
S
L
 
F
D
 
A
Q
 
H
R
 
V
I
 
I
L
 
G
S
 
S
C
 
I
T
 
N
A
 
S
G
 
-
A
 
Y
L
 
L
F
 
F
G
 
A
N
 
P
P
 
D
Q
 
N
R
 
R
A
 
-
E
 
-
D
 
-
Y
 
-
Q
 
E
Q
 
A
L
 
V
V
 
I
R
 
A
Y
 
K
F
 
M
E
 
A
S
 
H
P
 
P
E
 
D
L
 
T
Q
 
K
M
 
I
A
 
V
T
 
S
F
 
L
T
|
T
I
|
I
T
 
T
E
 
E
K
 
S
G
 
G
Y
 
Y
A
 
Y
L
 
Y
R
 
N
N
 
E
A
 
N
A
 
T
G
 
H
E
 
E
L
 
L
-
 
Q
-
 
S
-
 
E
F
 
H
P
 
P
Y
 
D
V
 
I
A
 
Q
K
 
F
E
 
D
I
 
L
A
 
D
D
 
P
G
 
A
P
 
N
A
 
E
G
 
K
A
 
A
A
 
P
-
 
R
S
 
T
T
 
T
M
 
F
G
 
G
I
 
F
V
 
L
A
 
Y
A
 
A
L
 
G
L
 
L
L
 
T
A
 
R
R
 
R
Y
 
Y
T
 
Q
A
 
Q
G
 
G
A
 
L
A
 
K
P
 
P
I
 
F
A
 
T
L
 
V
V
 
M
S
 
S
T
 
C
D
|
D
N
|
N
F
 
M
S
 
Q
Q
 
K
N
 
N
G
 
G
R
 
S
R
 
I
F
 
T
R
 
R
D
 
H
A
 
M
V
 
L
L
 
E
T
 
S
V
 
F
A
 
A
Q
 
R
-
 
L
-
 
R
-
 
N
-
 
P
-
 
E
-
 
V
-
 
A
G
 
E
W
 
W
L
 
I
A
 
A
A
 
-
G
 
-
K
 
-
V
 
-
Q
 
E
Q
 
E
G
 
G
Y
 
-
V
 
-
D
 
-
Y
 
-
L
 
-
M
 
-
D
 
-
K
 
-
D
 
-
R
 
-
V
 
-
S
 
A
F
 
F
P
 
P
W
 
N
S
 
A
M
 
M
I
 
V
D
 
D
R
 
R
I
|
I
T
|
T
P
 
P
N
 
Q
P
 
T
A
 
S
P
 
E
A
 
T
T
 
D
E
 
K
E
 
T
A
 
A
L
 
L
K
 
A
A
 
E
Q
 
K
G
 
-
W
 
-
D
 
-
D
 
-
L
 
-
Q
 
-
L
 
-
I
 
-
P
 
-
T
 
-
G
 
-
S
 
F
G
 
G
V
 
I
S
 
V
F
 
D
A
 
S
G
 
W
F
 
P
A
 
V
N
 
V
T
 
T
E
 
E
R
 
P
T
 
F
C
 
T
Y
 
Q
L
 
W
V
 
V
V
 
I
E
 
E
D
 
D
S
 
Q
F
 
F
P
 
S
N
 
D
G
 
G
R
 
R
P
 
P
K
 
P
L
 
F
E
 
E
A
 
K
G
 
V
G
 
G
V
 
V
I
 
Q
L
 
V
T
 
V
D
 
-
R
 
K
E
 
H
T
 
A
V
 
V
D
 
E
R
 
Q
A
 
F
D
 
E
T
 
K
M
 
H
K
 
K
V
 
L
T
 
R
A
 
-
C
 
L
L
 
L
N
 
N
P
 
G
L
 
S
H
 
H
T
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
G
V
 
Y
F
 
P
G
 
G
C
 
Q
L
 
L
L
 
A
G
 
G
Y
 
F
T
 
Q
K
 
Y
I
 
V
A
 
H
D
 
E
E
 
V
M
 
M
A
 
A
N
 
N
P
 
P
H
 
L
L
 
F
R
 
R
R
 
K
L
 
F
V
 
V
E
 
W
R
 
Q
L
 
M
G
 
M
Y
 
Q
D
 
E
E
 
E
G
 
V
M
 
K
P
 
P
V
 
L
V
 
L
V
 
P
S
 
E
P
 
I
G
 
P
V
 
G
I
 
V
E
 
D
P
 
I
K
 
D
D
 
E
F
 
Y
I
 
C
D
 
N
T
 
T
L
 
L
I
 
I
T
 
-
H
 
E
R
 
R
L
 
F
P
 
T
N
 
N
P
 
P
A
 
T
L
 
I
P
 
M
D
 
D
A
 
Q
P
 
L
Q
 
P
R
 
R
I
 
I
A
 
C
Q
 
L
D
 
N
T
 
A
S
 
S
Q
 
G
K
 
K
M
 
I
P
 
P
I
 
-
R
 
-
Y
 
-
G
 
Q
H
 
F
T
 
I
I
 
M
N
 
P
A
 
S
Y
 
I
A
 
A
A
 
E
A
 
A
G
 
I
L
 
W
D
 
E
A
 
T
G
 
G
K
 
P
L
 
F
E
 
R
C
 
R
I
 
L
P
 
C
L
 
F
V
 
V
I
 
A
A
 
A
G
 
A
W
 
W
L
 
F
R
 
H
Y
 
Y
L
 
I
L
 
K
A
 
G
V
 
V
D
 
D
D
 
D
E
 
R
G
 
G
A
 
K
A
 
P
F
 
F
T
 
E
P
 
-
S
 
V
P
 
V
D
 
D
P
 
P
M
 
M
L
 
R
D
 
E
Q
 
E
L
 
L
Q
 
Q
D
 
A
L
 
K
L
 
A
A
 
R
Q
 
A
G
 
G
G
 
G

1m2wA Pseudomonas fluorescens mannitol 2-dehydrogenase ternary complex with NAD and d-mannitol (see paper)
30% identity, 85% coverage: 19:476/540 of query aligns to 15:439/492 of 1m2wA

query
sites
1m2wA
V
 
V
R
 
K
L
 
L
P
 
P
Q
 
A
A
 
Y
N
 
T
V
 
L
E
 
A
A
 
D
T
 
T
R
 
R
R
 
Q
A
 
-
G
 
G
I
 
I
E
 
A
Q
 
-
P
 
-
R
 
-
W
 
-
I
 
-
H
 
H
F
 
I
G
|
G
G
x
V
G
|
G
N
x
G
L
x
F
Y
 
H
R
 
R
A
 
A
F
 
H
H
 
Q
A
 
A
Q
 
Y
V
 
Y
A
 
T
Q
 
D
D
 
A
V
 
L
I
 
M
D
 
N
A
 
T
G
 
G
-
 
E
G
 
G
M
 
L
D
 
D
R
 
W
G
 
S
V
 
I
-
 
C
-
 
G
V
 
V
V
 
G
V
 
L
E
x
R
T
 
S
F
 
E
Q
x
D
P
 
R
F
 
K
T
 
A
V
 
R
D
 
D
Q
 
D
V
 
L
Y
 
A
R
 
G
P
 
Q
Y
 
D
N
 
Y
C
 
L
D
 
F
I
 
T
L
 
L
Q
 
Y
V
 
E
I
 
L
M
 
G
D
 
D
E
 
T
D
 
D
G
 
D
T
 
T
L
 
-
D
 
E
Q
 
V
R
 
R
I
 
V
L
 
I
S
 
G
C
 
S
T
 
I
A
 
S
G
 
D
A
 
M
L
 
L
F
 
L
G
 
-
N
 
-
P
 
-
Q
 
-
R
 
-
A
 
A
E
 
E
D
 
D
Y
 
S
Q
 
A
Q
 
Q
-
 
A
L
 
L
V
 
I
R
 
D
Y
 
K
F
 
L
E
 
A
S
 
S
P
 
P
E
 
E
L
 
I
Q
 
R
M
 
I
A
 
V
T
 
S
F
 
L
T
|
T
I
|
I
T
|
T
E
|
E
K
 
G
G
 
G
Y
 
Y
A
 
C
L
 
I
R
 
D
N
 
D
A
 
S
A
 
N
G
 
G
E
 
E
L
 
F
-
 
M
-
 
A
-
 
H
F
 
L
P
 
P
Y
 
Q
V
 
I
A
 
Q
K
 
H
E
 
D
I
 
L
A
 
A
D
 
H
G
 
-
P
 
P
A
 
S
G
 
S
A
 
P
A
 
K
S
 
T
T
 
V
M
 
F
G
 
G
I
 
F
V
 
I
A
 
C
A
 
A
L
 
A
L
 
L
L
 
T
A
 
Q
R
 
R
Y
 
R
T
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
I
A
 
P
P
 
A
I
 
F
A
 
T
L
 
V
V
 
M
S
 
S
T
 
C
D
|
D
N
|
N
F
 
L
S
 
P
Q
 
H
N
 
N
G
 
G
R
 
A
R
 
V
F
 
T
R
 
R
D
 
K
A
 
A
V
 
L
L
 
L
T
 
A
V
 
F
A
 
A
Q
 
A
G
 
-
W
 
-
L
 
L
A
 
H
A
 
N
G
 
A
K
 
E
V
 
L
Q
 
H
Q
 
-
G
 
-
Y
 
-
V
 
-
D
 
D
Y
 
W
L
 
I
M
 
-
D
 
-
K
 
K
D
 
A
R
 
H
V
 
V
S
 
S
F
 
F
P
 
P
W
 
N
S
 
A
M
 
M
I
 
V
D
|
D
R
|
R
I
|
I
T
|
T
P
 
-
N
 
-
P
 
-
A
 
-
P
 
P
A
 
M
T
 
T
E
 
S
E
 
T
A
 
A
L
 
H
K
 
R
A
 
L
Q
 
Q
G
 
L
W
 
H
D
 
D
D
 
E
L
 
-
Q
 
-
L
 
-
I
 
-
P
 
-
T
 
-
G
 
-
S
 
H
G
 
G
V
 
I
S
 
D
F
 
D
A
 
A
G
 
W
F
 
P
A
 
V
N
 
V
T
 
C
E
 
E
R
 
P
T
 
F
C
 
V
Y
 
Q
L
 
W
V
 
V
V
 
L
E
 
E
D
 
D
S
 
K
F
 
F
P
 
V
N
 
N
G
 
G
R
 
R
P
 
P
K
 
A
L
 
W
E
 
E
A
 
K
G
 
V
G
 
G
V
 
V
I
 
Q
L
 
F
T
 
T
D
 
D
R
 
-
E
 
-
T
 
D
V
 
V
D
 
T
R
 
P
A
 
Y
D
 
E
T
 
E
M
 
M
K
|
K
V
 
I
T
 
-
A
 
G
C
 
L
L
 
L
N
|
N
P
 
G
L
 
S
H
|
H
T
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
T
V
 
Y
F
 
L
G
 
G
C
 
F
L
 
L
L
 
K
G
 
G
Y
 
Y
T
 
R
K
 
F
I
 
V
A
 
H
D
 
E
E
 
T
M
 
M
A
 
N
N
 
D
P
 
P
-
 
L
H
 
F
L
 
V
R
 
A
R
 
Y
L
 
M
V
 
R
E
 
A
R
 
Y
L
 
M
G
 
D
Y
 
L
D
 
D
E
 
V
G
 
T
M
 
P
P
 
N
V
 
L
V
 
A
V
 
P
S
 
V
P
 
P
G
 
G
V
 
-
I
 
I
E
 
D
P
 
L
K
 
T
D
 
D
F
 
Y
I
 
K
D
 
Q
T
 
T
L
 
L
I
 
V
T
 
D
H
 
-
R
 
R
L
 
F
P
 
S
N
 
N
P
 
Q
A
 
A
L
 
I
P
 
A
D
 
D
A
 
Q
P
 
L
Q
 
E
R
|
R
I
x
V
A
 
C
Q
 
S
D
 
D
T
 
G
S
 
S
Q
 
S
K
|
K
M
 
F
P
 
P
I
 
K
R
 
F
Y
 
T
G
 
V
H
 
P
T
 
T
I
 
I
N
 
N
A
 
R
Y
 
L
A
 
I
A
 
A
A
 
-
G
 
-
L
 
-
D
 
D
A
 
G
G
 
R
K
 
E
L
 
T
E
 
E
C
 
R
I
 
A
P
 
A
L
 
L
V
 
V
I
 
V
A
 
A
G
 
A
W
 
W
L
 
A
R
 
L
Y
 
Y
L
 
L
L
 
K
A
 
G
V
 
V
D
 
D
D
 
E
E
 
N
G
 
G
A
 
V
A
 
S
F
 
Y
T
 
T
P
 
-
S
 
I
P
 
P
D
 
D
P
 
P
M
 
R
L
 
A
D
 
E
Q
 
F
L
 
C
Q
 
Q
D
 
G
L
 
L
L
 
V
A
 
S

1lj8A Crystal structure of mannitol dehydrogenase in complex with NAD (see paper)
30% identity, 85% coverage: 19:476/540 of query aligns to 15:439/492 of 1lj8A

query
sites
1lj8A
V
 
V
R
 
K
L
 
L
P
 
P
Q
 
A
A
 
Y
N
 
T
V
 
L
E
 
A
A
 
D
T
 
T
R
 
R
R
 
Q
A
 
-
G
 
G
I
 
I
E
 
A
Q
 
-
P
 
-
R
 
-
W
 
-
I
 
-
H
 
H
F
 
I
G
|
G
G
x
V
G
|
G
N
x
G
L
x
F
Y
 
H
R
 
R
A
 
A
F
 
H
H
 
Q
A
 
A
Q
 
Y
V
 
Y
A
 
T
Q
 
D
D
 
A
V
 
L
I
 
M
D
 
N
A
 
T
G
 
G
-
 
E
G
 
G
M
 
L
D
 
D
R
 
W
G
 
S
V
 
I
-
 
C
-
 
G
V
 
V
V
 
G
V
 
L
E
x
R
T
 
S
F
 
E
Q
x
D
P
 
R
F
 
K
T
 
A
V
 
R
D
 
D
Q
 
D
V
 
L
Y
 
A
R
 
G
P
 
Q
Y
 
D
N
 
Y
C
 
L
D
 
F
I
 
T
L
 
L
Q
 
Y
V
 
E
I
 
L
M
 
G
D
 
D
E
 
T
D
 
D
G
 
D
T
 
T
L
 
-
D
 
E
Q
 
V
R
 
R
I
 
V
L
 
I
S
 
G
C
 
S
T
 
I
A
 
S
G
 
D
A
 
M
L
 
L
F
 
L
G
 
-
N
 
-
P
 
-
Q
 
-
R
 
-
A
 
A
E
 
E
D
 
D
Y
 
S
Q
 
A
Q
 
Q
-
 
A
L
 
L
V
 
I
R
 
D
Y
 
K
F
 
L
E
 
A
S
 
S
P
 
P
E
 
E
L
 
I
Q
 
R
M
 
I
A
 
V
T
 
S
F
 
L
T
 
T
I
|
I
T
|
T
E
|
E
K
 
G
G
 
G
Y
 
Y
A
 
C
L
 
I
R
 
D
N
 
D
A
 
S
A
 
N
G
 
G
E
 
E
L
 
F
-
 
M
-
 
A
-
 
H
F
 
L
P
 
P
Y
 
Q
V
 
I
A
 
Q
K
 
H
E
 
D
I
 
L
A
 
A
D
 
H
G
 
-
P
 
P
A
 
S
G
 
S
A
 
P
A
 
K
S
 
T
T
 
V
M
 
F
G
 
G
I
 
F
V
 
I
A
 
C
A
 
A
L
 
A
L
 
L
L
 
T
A
 
Q
R
 
R
Y
 
R
T
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
I
A
 
P
P
 
A
I
 
F
A
 
T
L
 
V
V
 
M
S
 
S
T
 
C
D
|
D
N
|
N
F
 
L
S
 
P
Q
 
H
N
 
N
G
 
G
R
 
A
R
 
V
F
 
T
R
 
R
D
 
K
A
 
A
V
 
L
L
 
L
T
 
A
V
 
F
A
 
A
Q
 
A
G
 
-
W
 
-
L
 
L
A
 
H
A
 
N
G
 
A
K
 
E
V
 
L
Q
 
H
Q
 
-
G
 
-
Y
 
-
V
 
-
D
 
D
Y
 
W
L
 
I
M
 
-
D
 
-
K
 
K
D
 
A
R
 
H
V
 
V
S
 
S
F
 
F
P
 
P
W
 
N
S
 
A
M
 
M
I
 
V
D
 
D
R
|
R
I
|
I
T
|
T
P
 
-
N
 
-
P
 
-
A
 
-
P
 
P
A
 
M
T
 
T
E
 
S
E
 
T
A
 
A
L
 
H
K
 
R
A
 
L
Q
 
Q
G
 
L
W
 
H
D
 
D
D
 
E
L
 
-
Q
 
-
L
 
-
I
 
-
P
 
-
T
 
-
G
 
-
S
 
H
G
 
G
V
 
I
S
 
D
F
 
D
A
 
A
G
 
W
F
 
P
A
 
V
N
 
V
T
 
C
E
 
E
R
 
P
T
 
F
C
 
V
Y
 
Q
L
 
W
V
 
V
V
 
L
E
 
E
D
 
D
S
 
K
F
 
F
P
 
V
N
 
N
G
 
G
R
 
R
P
 
P
K
 
A
L
 
W
E
 
E
A
 
K
G
 
V
G
 
G
V
 
V
I
 
Q
L
 
F
T
 
T
D
 
D
R
 
-
E
 
-
T
 
D
V
 
V
D
 
T
R
 
P
A
 
Y
D
 
E
T
 
E
M
 
M
K
 
K
V
 
I
T
 
-
A
 
G
C
 
L
L
 
L
N
 
N
P
 
G
L
 
S
H
 
H
T
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
T
V
 
Y
F
 
L
G
 
G
C
 
F
L
 
L
L
 
K
G
 
G
Y
 
Y
T
 
R
K
 
F
I
 
V
A
 
H
D
 
E
E
 
T
M
 
M
A
 
N
N
 
D
P
 
P
-
 
L
H
 
F
L
 
V
R
 
A
R
 
Y
L
 
M
V
 
R
E
 
A
R
 
Y
L
 
M
G
 
D
Y
 
L
D
 
D
E
 
V
G
 
T
M
 
P
P
 
N
V
 
L
V
 
A
V
 
P
S
 
V
P
 
P
G
 
G
V
 
-
I
 
I
E
 
D
P
 
L
K
 
T
D
 
D
F
 
Y
I
 
K
D
 
Q
T
 
T
L
 
L
I
 
V
T
 
D
H
 
-
R
 
R
L
 
F
P
 
S
N
 
N
P
 
Q
A
 
A
L
 
I
P
 
A
D
 
D
A
 
Q
P
 
L
Q
 
E
R
|
R
I
 
V
A
 
C
Q
 
S
D
 
D
T
 
G
S
 
S
Q
 
S
K
 
K
M
 
F
P
 
P
I
 
K
R
 
F
Y
 
T
G
 
V
H
 
P
T
 
T
I
 
I
N
 
N
A
 
R
Y
 
L
A
 
I
A
 
A
A
 
-
G
 
-
L
 
-
D
 
D
A
 
G
G
 
R
K
 
E
L
 
T
E
 
E
C
 
R
I
 
A
P
 
A
L
 
L
V
 
V
I
 
V
A
 
A
G
 
A
W
 
W
L
 
A
R
 
L
Y
 
Y
L
 
L
L
 
K
A
 
G
V
 
V
D
 
D
D
 
E
E
 
N
G
 
G
A
 
V
A
 
S
F
 
Y
T
 
T
P
 
-
S
 
I
P
 
P
D
 
D
P
 
P
M
 
R
L
 
A
D
 
E
Q
 
F
L
 
C
Q
 
Q
D
 
G
L
 
L
L
 
V
A
 
S

Query Sequence

>WP_009142100.1 NCBI__GCF_000225705.1:WP_009142100.1
MVSLKHWQDSAQQLAAMGVRLPQANVEATRRAGIEQPRWIHFGGGNLYRAFHAQVAQDVI
DAGGMDRGVVVVETFQPFTVDQVYRPYNCDILQVIMDEDGTLDQRILSCTAGALFGNPQR
AEDYQQLVRYFESPELQMATFTITEKGYALRNAAGELFPYVAKEIADGPAGAASTMGIVA
ALLLARYTAGAAPIALVSTDNFSQNGRRFRDAVLTVAQGWLAAGKVQQGYVDYLMDKDRV
SFPWSMIDRITPNPAPATEEALKAQGWDDLQLIPTGSGVSFAGFANTERTCYLVVEDSFP
NGRPKLEAGGVILTDRETVDRADTMKVTACLNPLHTALAVFGCLLGYTKIADEMANPHLR
RLVERLGYDEGMPVVVSPGVIEPKDFIDTLITHRLPNPALPDAPQRIAQDTSQKMPIRYG
HTINAYAAAGLDAGKLECIPLVIAGWLRYLLAVDDEGAAFTPSPDPMLDQLQDLLAQGGV
ALGVTDAAAVHAAVEPILSNAEIFDCDLYQAGLGEKIEQYFCELNAGPGAVARVLAERMA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory